Формирование патологической агрессии у мышей при продолжительном опыте агрессии: поведенческие и молекулярные изменения А.С. Мутовина, А.А. Сапронова, П.С. Межевалова, К.А. Айриянц, Ю.А. Рябушкина, Р. Салман, Н.П. Бондарь Журнал высшей нервной деятельности, 2026, т.76, № 1
2025
Iron Ions Increase the Thermal Stability In Vitro and Activity In Vivo of the 447R Mutant Form of Mouse Tryptophan Hydroxylase 2 Polina D. Komleva, Ekatherina I. Terentieva, Arseniy E. Izyurov, Alexander V. Kulikov INT J MOL SCI, 2025, Том 26, № 17, Стр. 8188
Metabolomic and gene networks approaches reveal the role of mitochondrial membrane proteins in response of human melanoma cells to THz radiation Ekaterina A Butikova, Nikita V Basov, Artem D Rogachev, Evgeniy V Gaisler, Vladimir A Ivanisenko, Pavel S Demenkov, Aelita-Luiza A Makarova, Timofey V Ivanisenko, Ivan A Razumov, Daria A Kolomeyets, Sergey V Cheresiz, Olga I Solovieva, Kirill P Larionov, Yulia S Sotnikova, Yuri V Patrushev, Nikolay A Kolchanov, Andrey G Pokrovsky, Nikolay A Vinokurov, Vladimir V Kanygin, Vasiliy M Popik, Oleg A Shevchenko BBA-MOL CELL BIOL L, 2025
Компьютерная реконструкция и анализ генных сетей, контролирующих уровень тревожности у лабораторных мышей и человека Вергунов Е.Г., Савостьянов В.А., Макарова А.А., Николаева Е.И., Савостьянов А.Н. Vavilov journal of genetics and breeding, 2025, 29(1):162-170
Anthocyanins and phenolic compounds in colored wheat grain E.V. Chumanova, T.T. Efremova, K.V. Sobolev, E.A. Kosyaeva Vavilov journal of genetics and breeding, 2025, 29(3), P. 392-400
Получение гибридных линий Triticum petropavlovskyi Udacz.
et Migusch. × Triticum aestivum L. с крупной окрашенной
зерновкой и повышенным содержанием антиоксидантов Е.В. Чуманова, Т.Т. Ефремова, К.В. Соболев, Е.А. Косяева Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2025, 11(2), с. 80-87
The Single Nucleotide Substitution T → A rs2072580
Damages the CREB1 Binding Site in the Bidirectional SART3/ISCU Promoter Arina Degtyareva, Elena Antontseva, Anastasia Evseenko, Konstantin Orishchenko and Tatiana Merkulova Genes, 2025
Functional Divergence of NOTCH1 and NOTCH2 in Human Cerebral Organoids Reveals Receptor-Specific Roles in Early Corticogenesis Sophia Yakovleva, Anastasia Knyazeva, Anastasia Yunusova, Elina Allayarova, Dmitriy Lanshakov, Anna Malashicheva, Tatiana Shnaider INT J MOL SCI, 2025
Маркер-контролируемое получение гибридных форм яровой мягкой пшеницы с окрашенным зерном для селекции сортов с повышенным содержанием антоцианов в Западной Сибири Е. В. Чуманова, Т. Т. Ефремова, К. В. Соболев, Е. А. Косяева Генетика, 2025, том 61, № 8, с. 18–37
Marker-Assisted Development of Spring Bread Wheat Hybrids
with Colored Grain for Breeding of Anthocyanin-Rich Varieties
in Western Siberia E. V. Chumanovaa, T. T. Efremovaa, K. V. Soboleva, and E. A. Kosyaevaa RUSS J GENET+, 2025, Vol. 61, No. 8, pp. 917–933.
Mapping rat lncRNA Bdnf-as Elizaveta V Shaburova ,Sergey A Marchenko, Veronika B Dneprovskaya, Anna V Sborschikova, Dmitriy A Lanshakov MOL BIOL REP, 2025
Some Peculiarities of MLH1 Foci Distribution in Common Degu (Octodon degus, Rodentia: Octodontidae) Chromosomes: Presence in Pericentromeric Regions and Absence in XY Tatiana Bikchurina; Ekaterina Grishko; Daria Odnoprienko; Pavel Borodin CYTOGENET GENOME RES, 2025
Оценка активности митохондрий в нейрональных производных ИПСК, полученных от пациента с вариантом c.1492T>G гена GLUD2, страдающего болезнью Паркинсона Сорогина Д.А., Григорьева E.В., Павлова С.В., Малахова А.А., Закиян С.М. Нейрохимия, 2025, том 42, № 2, С. 246-256.
Генетический контроль и молекулярные маркеры устойчивости сахарной свеклы к патогенам Смирнова О.Г., Хакимов М.Б., Салина Е.А. Экологическая генетика, 2025, Т. 23., №3, С. 277-286
Моделирование нейродегенеративных заболеваний, вызванных протеинопатией, на культурах клеток человека Малахова А.А., Аллаярова Э.Р., Шарипова Д.В., Павлова С.В., Григорьева Е.В., Медведев С.П., Закиян С.М. Вестник ТГУ. Биология, 2025, № 69. С. 103–112.
Generation of iTAF1-36-H8.1 and iTAF1-36-H8.2 Human-Induced Pluripotent Stem Cell Lines with HAR Deletion in the CNTN6 Gene by CRISPR/Cas9 Genome-Editing Technology A. S. Chvileva, A. M. Yunusova, I. E. Pristyazhnyuk, A. V. Smirnov, A. S. Ryzhkova, P. S. Belokopytova, T. A. Shnaider RUSS J DEV BIOL+, 2025
Вариабельность минерального состава зерна твердой пшеницы (Triticum durum Desf.) в различных экологических условиях И.Н. Леонова, П.Н. Мальчиков, Н.А. Виниченко, В.В. Пискарев, М.Г. Мясникова, В.А. Апарина, Т.В. Чахеева Vavilov journal of genetics and breeding, 2025, т. 29(6), стр. 789-797
2024
Genome-wide association study revealed some new candidate genes associated with flowering and maturity time of soybean in Central and West Siberian regions of Russia Perfil`ev R, Shcherban A, Potapov D, Maksimenko K, Kiryukhin S, Gurinovich S, Panarina V, Polyudina R, Salina E Frontiers in Plant Science, 2024, 15:1463121
Biochemical, Genetic, and Grain Digital Evaluation of Soft Winter Wheat Varieties with Different Germination Index. A.V. Fedyaeva, S.D. Afonnikova, D.A. Afonnikov, O.G. Smirnova, V.N. Deeva, A.I. Pryanishnikov, E.A. Salina RUSS J PLANT PHYSL+, 2024, Volume 71, article number 56
Identification of novel loci precisely modulating pre-harvest sprouting resistance and red color components of the seed coat in T. aestivum L. Afonnikova S.D., Kiseleva A.A., Fedyaeva A.V., Komyshev E.G., Koval V.S., Afonnikov D.A., Salina E.A. Plants, 2024, т. 13, № 10, с. 1309
IPSC-derived astrocytes contribute to in vitro modeling of Parkinson’s disease caused by the GBA1 N370S mutation Yarkova E.S., Grigor’eva E.V., Medvedev S.P., Pavlova S.V., Zakian S.M., Malakhova A.A. INT J MOL SCI, 2024, 25, 327
Structural variants in the Epb41l4a locus: TAD disruption and Nrep gene misregulation as hypothetical drivers of neurodevelopmental outcomes Paul Salnikov, Alexey Korablev, Irina Serova, Polina Belokopytova, Aleksandra Yan, Yana Stepanchuk, Savelii Tikhomirov, Veniamin Fishman SCI REP-UK, 2024, Article number: 5288
Detection of ER stress in iPSC-derived neurons carrying the p.N370S mutation in the GBA1 gene Yarkova E.S., Grigor’eva E.V., Medvedev S.P., Tarasevich D.A., Pavlova S.V., Valetdinova K.R., Minina J.M., Zakian S.M., Malakhova A.A. Biomedicines, 2024, 12, 744.
Effects of different types of induced neonatal inflammation on development and behavior of C57BL/6 and BTBR mice Yuliya A. Ryabushkina, Kseniya A. Ayriyants, Anna A. Sapronova, Anastasia S. Mutovina, Maria M. Kolesnikova, Eva V. Mezhlumyan, Natalya P. Bondar*, Vasiliy V. Reshetnikov* PHYSIOL BEHAV, 2024, Volume 280, 1 June 2024, 114550
Towards Development of the 4C-Based Method Detecting Interactions of Plasmid DNA with Host Genome Alexandra P Yan, Paul A Salnikov, Maria M Gridina, Polina S Belokopytova, Veniamin S Fishman BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2024
Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks. Artemenko N.V., Genaev M.A., Epifanov R.UI., Komyshev E.G., Kruchinina Y.V., Koval V.S., Goncharov N.P. and Afonnikov D.A. Frontiers in Plant Science, 2024, т. 14, с. 1336192
Конвейер обработки гиперспектральных изображений на примере исследования зерен ячменя, содержащих меланин. Бусов И.Д., Генаев М.А., Комышев Е.Г., Коваль В.С., Зыкова Т.E., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, т. 28, № 4, С. 443-455
Catching the Big Fish in Big Data: A Meta-Analysis of Zebrafish Kidney scRNA-Seq Datasets Highlights Conserved Molecular Profiles of Macrophages and Neutrophils in Vertebrates Aleksandr V Bobrovskikh, Ulyana S Zubairova, Ludmila G Naumenko, Alexey V Doroshkov Biology, 2024, 13(10):773
Идентификация Sr генов возрастной устойчивости в отечественных сортах мягкой пшеницы методом молекулярно-генетического маркирования Е.С. Сколотнева, Ю.В. Лаприна, М.И. Киселева, В.Н. Кельбин, Т.М. Коломиец Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, №3, Том 10, 151-157
Prefrontal Cortical Projection Neurons: Involvement in Shaping Different Types of Behaviors, BDNF Expression and Transport U. S. Drozd, Ya. A. Frik, A. V. Smagin, Dmitriy Lanshakov J EVOL BIOCHEM PHYS+, 2024, 60(5)
Characterizing a Lethal CAG-ACE2 Transgenic Mouse Model for SARS-CoV-2 infection with Using Cas9-Enhanced Nanopore Sequencing Smirnov A, Nurislamov A, Galina Koncevaya G, Serova I, Kabirova E, Chuyko E, Maltceva E, Savoskin M, Zadorozhny D, Svyatchenko VA, Protopopova EV, Taranov OS, Legostaev SS, Loktev VB, Serov O, Battulin N TRANSGENIC RES, 2024, 33(5):453-466
Разнообразие митохондриальной ДНК на средневековом могильнике Заречно-Убинское-1 в Барабинской лесостепи (предварительные результаты исследования) Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Нестерова М.С., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2024, Т. XXX. – С. 808–816.
Первые данные о разнообразии митохондриальной ДНК у населения басандайской культуры (по материалам могильников Ташара-Карьер-2, Ташара-1, Ташара-14) Томилин М.А., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Нестерова М.С., Новиков А.В., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2024, Т. XXX. – С. 801–807.
Age of Cafeteria Diet Onset Influences Obesity Phenotype in Mice in a Sex-Specific Manner Nadezhda Bazhan, Antonyna Kazantseva, Anastasia Dubinina, Tatiana Jakovleva, Elena Makarova INT J MOL SCI, 2024, 25, 12436
Сверхэкспрессия нейротрофического фактора мозга (BDNF) во фронтальной коре усиливает социальный интерес у мышей линии BTBR – модели аутизма Я.П. Каминская, Т.В. Ильчибаева, А.И. Щербакова, Э.Р. Аллаярова, Н.К. Попова, В.С. Науменко, А.С. Цыбко Биохимия, 2024, том 89, вып. 8, с. 1451 – 1461
Brain-Derived Neurotrophic Factor (BDNF) in the Frontal Cortex Enhances Social Interest in the BTBR Mouse Model of Autism Yana P. Kaminskaya, Tatiana V. Ilchibaeva, Alexandra I. Shcherbakova, Elina R. Allayarova, Nina K. Popova, Vladimir S. Naumenko, Anton S. Tsybko BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2024, Vol. 89, No. 8, pp. 1509-1518
Generation and analysis of mouse embryonic stem cells with knockout of the Mcph1 (microcephalin) gene Юнусова А.М., Смирнов А.В., Шнайдер Т.А., Пристяжнюк И.Е., Кораблева С.Ю., Баттулин Н.Р. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, Sep;28(5):487-494
Generation and characterization of two induced pluripotent stem cell lines (ICGi052-A and ICGi052-B) from a patient with frontotemporal dementia with parkinsonism-17 associated with the pathological variant c.2013T>G in the MAPT gene Grigor’eva E.V., Malakhova A.A., Yarkova E.S., Minina J.M., Vyatkin Y.V., Nadtochy J.A., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Medvedev S.P., Zakian S.M. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, 28(7):679-687
Antidiabetic Effect of Dihydrobetulonic Acid Derivatives as Pparα/γ Agonists Khvostov M.V., Blokhin M.E., Borisov S.A., Fomenko V.V., Meshkova Y.V., Zhukova N.A., Nikonova, S.V., Pavlova S.V., Pogosova M.A., Medvedev S.P., Luzina O.A., Salakhutdinov N.F. SCIENTIA PHARMACEUTICA, 2024, V. 92. P. 65.
2023
Determination of the melanin and anthocyanin content in barley grains by digital image analysis using machine learning methods E.G. Komyshev, M.A. Genaev, I.D. Busov, M.V. Kozhekin, N.V. Artemenko, A.Y. Glagoleva, V.S. Koval, D.A. Afonnikov Vavilov journal of genetics and breeding, 2023
Impact of Allelic Variation in Maturity Genes E1–E4 on Soybean Adaptation to Central and West Siberian Regions of Russia Perfil’ev R., Shcherban A., Potapov D., Maksimenko K., Kiryukhin S., Gurinovich S., Panarina V., Polyudina R., Salina E. Agriculture, 2023, vol. 13, no. 6: article 1251, https://doi.org/10.3390/agriculture13061251, IF=3.408, Received: 16 May 2023, Revised: 11 June 2023, Accepted: 13 June 2023, Published: 15 June 2023
Heterologous Expression of Extracellular Proteinase pAsPs of Aspergillus pseudotamarii in Komagataella phaffii. Zadorozhny AV, Voskoboev ME, Bochkov DV, Rozanov AS, Shedko ED, Mescheryakova IA, Blinov AG, Korzhuk AV, Shlyakhtun VN, Bogacheva NV, Antonov EV, Bannikova SV, Goryachkovskaya TN, Peltek SE INT J MOL SCI, 2023, International Journal of Molecular Sciences. 2022; 23(23):15035.
Biochemical characteristics of iPSC-derived dopaminergic neurons from N370S GBA variant carriers with and without Parkinson's disease Grigor’eva E.V., Kopytova A.E., Yarkova E.S., Pavlova S.V., Sorogina D.A., Malakhova A.A., Malankhanova T.B., Baydakova G.V., Zakharova E.Y., Medvedev S.P., Pchelina S.N., Zakian S.M. INT J MOL SCI, 2023, 24(5), 4437
ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА ПРОРАСТАНИЕ ЗЕРНА НА КОРНЮ У МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ (TRITICUM AESTIVUM L.), И МЕТОДЫ ИХ ОЦЕНКИ А.В. Федяева, Е.А. Салина, В.К. Шумный Генетика, 2023, T. 59, № 1, стр. 5-17, DOI: 10.31857/S0016675823010058
Создание линии индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi043-A с помощью репрограммирования мононуклеарных клеток периферической крови пациента с болезнью Паркинсона, ассоциированной с патологическим вариантом p.G2019S LRRK2 Григорьева Е.В., Павлова С.В., Малахова А.А., Яркова Е.С., Сорогина Д.А., Минина Ю.М., Милюхина И.В., Николаев Н.А., Пчелина С.Н., Медведев С.П., Закиян С.М. Онтогенез, 2023, Т. 54. №1. С. 79–86
Создание линий индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi044-B и ICGi044-C с помощью репрограммирования мононуклеарных клеток периферической крови пациента с болезнью Паркинсона, ассоциированной с мутацией c.1492T>G в гене GLUD2 Сорогина Д.А., Григорьева Е.В., Малахова А.А., Павлова С.В., Медведев С.П., Вяткин Ю.В., Хабарова Е.А., Рзаев Дж.А., Закиян С.М. Онтогенез, 2023, Т. 54. № 1. С. 114–122
Potential Binding Sites of Pharmacological Chaperone NCGC00241607 on Mutant β-Glucocerebrosidase and Its Efficacy on Patient-Derived Cell Cultures in Gaucher and Parkinson’s Disease // International Journal of Molecular Sciences Kopytova A.E., Rychkov G.N., Cheblokov A.A., Grigor’eva E.V., Nikolaev M.A., Yarkova E.S., Sorogina D.A., Ibatullin F.M., Baydakova G.V., Izyumchenko A.D., Bogdanova D.A., Boitsov V.M., Rybakov A.V., Miliukhina I.V., Bezrukikh V.A., Salogub G.N., Zakharova E.Y., Pchelina S.N., Emelyanov A.K. INT J MOL SCI, 2023, 24, 9105
Curcumin and Its Supramolecular Complex with Disodium Glycyrrhizinate as Potential Drugs for the Liver Fluke Infection Caused by Opisthorchis felineus Maria N Lvova, Denis V Ponomarev, Alena A Tarasenko, Anna V Kovner, Galina A Minkova, Michail A Tsyganov, Meijun Li, Yan Lou, Veronica I Evseenko, Alexander V Dushkin, Irina V Sorokina, Tatiana G Tolstikova, Viatcheslav A Mordvinov, Damira F Avgustinovich Pathogens, 2023, 12(6):819
Effect of Expression of the NDB2 Heterologous Gene of Arabidopsis thaliana on Growth and Respiratory Activity of Nicotiana tabacum N. E. Korotaeva, A. M. Shigarova, A. I. Katyshev, I. V. Fedoseeva, A. V. Fedyaeva, D. V. Sauchyn, A. M. Shyshlova-Sokolovskaya, O. Yu. Urbanovich, G. B. Borovskii RUSS J PLANT PHYSL+, 2023, Т. 70. – №. 5. – С. 93.
Creation of Induced Pluripotent Stem Cells ICGi044-B and ICGi044-C Using Reprogramming of Peripheral Blood Mononuclear Cells of a Patient with Parkinson's Disease Associated with c.1492T>G Mutation in the GLUD2 Gene Sorogina D.A., Grigor’eva E.V., Malakhova A.A., Pavlova S.V., Medvedev S.P., Vyatkin Y.V., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Zakian S.M. RUSS J DEV BIOL+, 2023, Vol. 54, No. 1, pp. 104–111
Реконструкция генетической истории населения Западной Сибири: палеогенетический анализ средневековых антропологических материалов Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Томилин М.А., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Молодин В.И., Нестерова М.С., Журавлев А.А., Рыкун М.П. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2023, Т.29. - С. 806-812.
Мультидисциплинарные исследования могильника Вахрушево-1 в Новосибирском Приобье (археология, антропология, палеогенетика) Молодин В.И., Кобелева Л.С., Поздняков Д.В., Дураков И.А., Трапезов Р.О., Пилипенко А.С., Черданцев С.В. Уральский исторический вестник, 2023, N. 4(81). - С. 164-176.
Studying sex differences in responses to fibroblast growth factor 21 administration in obese mice consuming a sweet-fat diet Bazhan N.М., Jakovleva T.V., Kazantseva A.Yu., Kostina N.E., Orlov P.E., Balybina N.Yu., Baranov K.О., Makarova E.N. Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(4):333-341
Влияние длительной социальной изоляции на поведение и пластичность мозга у мышей с нокаутом гена фактора некроза опухоли. Базовкина Д.В., Устинова У.С., Адонина С.Н., Комлева П.Д., Арефьева А.Б., Москалюк В.С., Куликова Е.А. Гены и клетки, 2023, Т. 18. No 4. С. 450–453
Современное состояние этногенетических реконструкций популяций эпохи бронзы Юго-Западной Сибири (некоторые итоги и перспективы) Молодин В.И., Пилипенко А.С., Поздняков Д.В. Российская археология, 2023, N.1 - C.41-52
2022
Generation of induced pluripotent stem cell line, ICGi034-A, by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with Parkinson’s disease associated with GBA mutation Grigor’eva E.V., Drozdova E.S., Sorogina D.A., Malakhova A.A., Pavlova S.V., Vyatkin Y.V., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Medvedev S.P., Zakian S.M. STEM CELL RES, 2022, V. 59. 102651
Клонирование и экспрессия гена целлюлазы Penicillium sp. “occitanis” в K. phaffii T07, выделение и анализ свойств. Розанов А.С., Воскобоев М., Богачева Н.В., Коржук А.В., Шляхтун В.Н., Мещерякова И.А., Романцев В.А., Бочков Д.В., Задорожный А., Пельтек С.Е. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2022
Specific features of the proteomic response of thermophilic bacterium Geobacillus icigianus to terahertz irradiation. Bannikova S.V., Khlebodarova T.M., Vasilieva A., Meshcheryakova I.A., Bryanskaya A.V., Shedko E., Popik V.M., Goryachkovskaya T.N., Peltek S.E. INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 15216
Митохондрии и гибель клеток суспензионной культуры Saccharum officinarum L. при отрицательной температуре Любушкина И. В., Степанов А. В., Федяева А. В., Федосеева И. В., Побежимова Т. П., Грабельных О. И. Физиология растений, 2022
2021
The Same Metabolic Response to
FGF21 Administration in Male and
Female Obese Mice Is Accompanied
by Sex-Specific Changes in Adipose
Tissue Gene Expression Elena Makarova, Antonina Kazantseva, Anastasia Dubinina, Tatiana Jakovleva, Natalia Balybina,
Konstantin Baranov and Nadezhda Bazhan INT J MOL SCI, 2021, 22, 10561.
Fibroblast Growth Factor 21 (FGF21) Administration
Sex-Specifically Affects Blood Insulin Levels and Liver
Steatosis in Obese Ay Mice Elena Makarova, Antonina Kazantseva, Anastasia Dubinina, Elena Denisova, Tatiana Jakovleva,
Natalia Balybina, Nataliya Bgatova, Konstantin Baranov and Nadezhda Bazhan Cells, 2021, 10(12), 3440
Повышенные температуры вызывают образование АФК
и нарушения дыхания в клетках
суспензионной культуры Saccharum officinarum Любушкина, И. В., Федяева, А. В., Степанов, А. В., Грабельных, О. И. Журнал Сибирского федерального университета. Биология, 2021
Характеристика суспензионных культур клеток Arabidopsis thaliana (L.) Heynh с изменённой экспрессией гена альтернативной оксидазы митохондрий АOX1a и анализ их морозоустойчивости А. В. Степанов, С. А. Кашин, Н. С. Забанова, О. А. Федотова, А. В. Федяева, И. В. Любушкина,Т. П. Побежимова, О. И. Грабельных Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология», 2021
АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ В КЛЕТКАХ СУСПЕНЗИОННОЙ КУЛЬТУРЫ ARABIDOPSIS THALIANA С ПОНИЖЕННОЙ ЭКСПРЕССИЕЙ ГЕНА NDB2 Fedoseeva I., Katyshev A., Fedyaeva A., Stepanov A., Borovskii G. Sib J Life Sci Agric, 2021
Получение рекомбинантного штамма Komagataella phaffi – продуцента протеиназы К из Tritirachium album А. Б. Беклемишев, М. Б. Пыхтина, Я. М. Куликов, Т. Н. Горячковская, Д. В. Бочков, С. В. Сергеева, А. Р. Васильева, В. П. Романов, Д. С. Новикова, С. Е. Пельтек Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, Том 25, № 8 (2021)
Новый этап палеогенетического исследования носителей одиновской культуры (Барабинская лесостепь): первые результаты Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пристяжнюк М.С., Пилипенко И.В., Нестерова М.С., Поздняков Д.В., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2021, Т. XXVII. - С. 690-695.
Effects of Sex and Group Size on Behavior and Brain Biogenic Amines in Short-Lived Turquoise Killifish (Nothobranchius furzeri) Valentina Evsiukova, Egor Antonov, Alexander V. Kulikov ZEBRAFISH, 2021, Vol.18, No.4
2020
Pharmacological effects of fibroblast growth factor 21 are sex-specific in mice with the lethal yellow (Ay) mutation MakarovaE.N., Yakovleva T.V., Balyibina N.Yu., Baranov K.O., Denisova E.I., Dubinina A.D., Feofanova N.A., Bazhan N.M. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(2):200-208
Metagenomics dataset used to characterize microbiome in water and sediments of the lake Solenoe (Novosibirsk region, Russia) Alla V Bryanskaya, Aleksandra A Shipova, Alexei S Rozanov, Oxana A Volkova, Elena V Lazareva, Yulia E Uvarova, Tatyana N Goryachkovskaya, Sergey E Peltek Data in Brief, 2020
2019
Sex Dimorphism in the Fgf21 Gene Expression in Liver and
Adipose Tissues is Dependent on the Metabolic Condition Bazhan N., JakovlevaT., Balyibina N., Dubinina A., Denisova E., Feofanova N., Makarova E. Online journal of biological sciences, 2019, 19 (1): 28-36
2018
Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak Archaeological and Anthropological Sciences, 2018, Vol. 10, Issue 7, P. 1557-1570.
Влияние блокады синтеза простагландинов на натрийуретическую функцию почек крыс со стресс-индуцируемой гипертензией (линия НИСАГ) Дубинина А.Д., Иванова Л.Н. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2018
2017
Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки, по данным полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е.В., Спицина А.М., Богомолов А.Г., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Программные системы: теория и приложения, 2017, 8:1(32), 219–242
Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный комплекс ExpGene А. М. Спицина, А. О. Брагин, А. И. Дергилев, И. В. Чадаева, Н. Н. Твердохлеб, Э. Р. Галиева, Л. Э. Табиханова, Ю. Л. Орлов Програмные системы: теория и приложения, 2017, 8:2(33), 45–68.
Analysis of 3d chromosome contacts using sequencing technologies Thierry O., Dergilev A.I., Orlov Y.L. Acta Naturae, 2017, Том 9(1). С. 24.
Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016
Компьютерный анализ совместной локализации сайтов связывания транскрипционных факторов по данным ChIP-seq Дергилев А.И., Спицина А.М., Чадаева И.В., Свичкарев А.В., Науменко Ф.М., Кулакова Е.В., Витяев Е.Е., Чен М., Орлов Ю.Л. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(6):770-778. DOI 10.18699/VJ16.194
Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56 (II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия) А.С. Пилипенко, В.И. Молодин, Р.О. Трапезов, С.В. Черданцев, А.А. Журавлев Археология, этнография и антропология Евразии, 2016, Том 44, № 4, С. 141-149
2015
MtDNA Haplogroup A10 Lineages in Bronze Age Samples Suggest That Ancient Autochthonous Human Groups Contributed to the Specificity of the Indigenous West Siberian Population Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vyacheslav I. Molodin, Aida G. Romaschenko PloS One, 2015
Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК Спицина А.М., Орлов Ю.Л., Подколодная Н.Н., Свичкарев А.В., Дергилев А.И., Чен М., Кучин Н. В., Черных И. Г., Глинский Б. М. Программные системы: теория и приложения, 2015, 6:1(23), c. 157–174
Программы анализа геномных данных секвенирования, полученных на основе технологий ChIP-seq, ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е. В., Спицина А. М., Орлова Н. Г., Дергилев А. И., Свичкарев А. В., Сафронова Н. С., Черных И. Г., Орлов Ю. Л. Программные системы: теория и приложения, 2015, 2(25), c. 129–148
2012
Генофонд мтДНК населения восточного варианта пахомовской культуры Молодин В.И., Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2012, № 4 (52). С. 62-69.
2010
Изучение секреторной активности коры надпочечника у гипертензивных крыс линии НИСАГ Е. В. Антонов, Т. А. Морева, О. П. Черкасова, М. А. Гилинский, А. Л. Маркель, Г. С. Якобсон Бюллетень СО РАМН, 2010, 2010, 30, № 4, 68-75.
1993
SITEVIDEO: a computer system for functional site analysis and recognition. Investigation of the human splice sites. Kel A.E., Ponomarenko M.P., Likhachev .EA., Orlov Yu.L., Ischenko I.V., Milanesi L., Kolchanov N.A. Comput. Appl. Biosci., 1993, 6, 9, 617-627