Biochemical, Genetic, and Grain Digital Evaluation of Soft Winter Wheat Varieties with Different Germination Index. A.V. Fedyaeva, S.D. Afonnikova, D.A. Afonnikov, O.G. Smirnova, V.N. Deeva, A.I. Pryanishnikov, E.A. Salina RUSS J PLANT PHYSL+, 2024, Volume 71, article number 56
Identification of novel loci precisely modulating pre-harvest sprouting resistance and red color components of the seed coat in T. aestivum L. Afonnikova S.D., Kiseleva A.A., Fedyaeva A.V., Komyshev E.G., Koval V.S., Afonnikov D.A., Salina E.A. Plants, 2024, т. 13, № 10, с. 1309
Влияние стеариновой кислоты на эффективность криоконсервации эмбрионов домашней кошки (Felis silvestris catus) Брусенцев Е.Ю., Окотруб С.В., Лебедева Д.А., Окотруб К.А., Рахманова Т.А., Амстиславский С.Я. Известия РАН. Серия биологическая, 2024, № 1, с. 76–89.
Program freezing of diapausing embryos in the mouse Amstislavsky S.Ya., Okotrub S.V., Rozhkova I.N., Rakhmanova T.A., Igonina T.N., Brusentsev E.Yu., Kozeneva V.S., Lebedeva D.A., Omelchenko A.N., Okotrub K.A. THERIOGENOLOGY, 2024, 217, 1–10.
Structural variants in the Epb41l4a locus: TAD disruption and Nrep gene misregulation as hypothetical drivers of neurodevelopmental outcomes Paul Salnikov, Alexey Korablev, Irina Serova, Polina Belokopytova, Aleksandra Yan, Yana Stepanchuk, Savelii Tikhomirov, Veniamin Fishman SCI REP-UK, 2024, Article number: 5288
Detection of ER stress in iPSC-derived neurons carrying the p.N370S mutation in the GBA1 gene Yarkova E.S., Grigor’eva E.V., Medvedev S.P., Tarasevich D.A., Pavlova S.V., Valetdinova K.R., Minina J.M., Zakian S.M., Malakhova A.A. Biomedicines, 2024, 12, 744.
Effects of different types of induced neonatal inflammation on development and behavior of C57BL/6 and BTBR mice Yuliya A. Ryabushkina, Kseniya A. Ayriyants, Anna A. Sapronova, Anastasia S. Mutovina, Maria M. Kolesnikova, Eva V. Mezhlumyan, Natalya P. Bondar*, Vasiliy V. Reshetnikov* PHYSIOL BEHAV, 2024, Volume 280, 1 June 2024, 114550
Effect of cryopreservation on Odc1 and RhoA genes expression in diapausing mouse blastocysts Amstislavsky S., Brusentsev E., Lebedeva D., Rozhkova I., Rakhmanova T., Okotrub S., Kozeneva V., Igonina T., Babochkina T. REPROD DOMEST ANIM, 2024, V. 59. e14576.
Towards Development of the 4C-Based Method Detecting Interactions of Plasmid DNA with Host Genome Alexandra P Yan, Paul A Salnikov, Maria M Gridina, Polina S Belokopytova, Veniamin S Fishman BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2024
A HGF Mutation in the Familial Case of Primary Lymphedema: A Report Galina Koksharova, Natalia Kokh, Maria Gridina, Rustam Khapaev, Vadim Nimaev, Veniamin Fishman INT J MOL SCI, 2024
Effects of Chronic Social Stress on the Expression
of Neurotransmitter System–associated Genes
in the Hypothalamus of Male Mice I. L. Kovalenko, A. G. Galyamina, D. A. Smagin, N. N. Kudryavtseva RUSS J GENET+, 2024, Vol. 60, No. 6, pp. 737–746
Larval Heat Stress Affects the Lifespan and Stress Resistance of Drosophila melanogaster Adults. E. K. Karpova, E. V. Burdina, V. M. Efimov, N. E. Gruntenko. Adv. Gerontol, 2024, Vol. 13, No. 4, pp. 196–201
Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks. Artemenko N.V., Genaev M.A., Epifanov R.UI., Komyshev E.G., Kruchinina Y.V., Koval V.S., Goncharov N.P. and Afonnikov D.A. Frontiers in Plant Science, 2024, т. 14, с. 1336192
Конвейер обработки гиперспектральных изображений на примере исследования зерен ячменя, содержащих меланин. Бусов И.Д., Генаев М.А., Комышев Е.Г., Коваль В.С., Зыкова Т.E., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, т. 28, № 4, С. 443-455
Влияние гонадотропной стимуляции яичников в условиях хронического психосоциального стресса на качество ооцитов мышей Лебедева Д.А., Игонина Т.Н., Брусенцев Е.Ю., Шавшаева Н.А., Амстиславский С.Я. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2024, том 110, No 6, с. 930–944.
Митохондриальный геном Eisenia altaica (Lumbricidae, Annelida) П.А. Леонов, Г.В. Юрлова, Т.В. Полубоярова, Г.В. Васильев, А.А. Шипова, Е.В. Голованова, С.В. Шеховцов, К.С. Зубко Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, 2024 год, Том 10, №2, С. 93-98
Blood Plasma Markers in Depressed Mice under Chronic Social Defeat Stress D.A. Smagin, D.V. Bezryadnov, M.G. Zavialova, A.Yu. Abramova, S.S. Pertsov and N.N. Kudryavtseva Biomedicines, 2024, 2024, 12, 1485
Computational Reconstruction of the Transcription Factor Regulatory Network Induced by Auxin in Arabidopsis thaliana L. Омельянчук Надежда Анатольевна, Лавреха Виктория Вадимовна, Богомолов Антон Геннадьевич, Долгих Владислав Андреевич, Сидоренко Александра Дмитриевна, Землянская Елена Васильевна Plants, 2024, 13(14), 1905
Experimental approaches to controlled diapause in mammals Brusentsev E.Yu., Rakhmanova T.A., Rozhkova I.N., Okotrub S.V., Kozeneva V.S., Amstislavsky S.Ya. RUSS J ECOL+, 2024, Vol. 55, No. 4, pp. 308–318.
Probing metabolism in mouse embryos using Raman spectroscopy and deuterium tags A.N. Omelchenko, K.A. Okotrub, T.N. Igonina, T.A. Rakhmanova, S.V. Okotrub, I.N. Rozhkova, V.S. Kozeneva, S.Ya. Amstislavsky, N.V. Surovtsev SPECTROCHIM ACTA A, 2024
Genome-wide association study revealed some new candidate genes associated with flowering and maturity time of soybean in Central and West Siberian regions of Russia Perfil`ev R, Shcherban A, Potapov D, Maksimenko K, Kiryukhin S, Gurinovich S, Panarina V, Polyudina R, Salina E Frontiers in Plant Science, 2024, 15:1463121
ИЗМЕНЕНИЕ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ
ЦИТОКИНОВОГО ОТВЕТА В ГИПОТАЛАМУСЕ
ЖИВОТНЫХ ПОД ВЛИЯНИЕМ ХРОНИЧЕСКОГО
СОЦИАЛЬНОГО СТРЕССА: ДАННЫЕ RNA-seq Галямина А.Г., Коваленко И.Л., Смагин Д.А., Попова Н.А. Medical Immunology, 2024, Т. 26, № 4, стр. 217-224
Chronic psychosocial stress affects insulin-like growth factor 1 and its receptors in mouse ovaries Tatyana Igonina, Daria Lebedeva, Anton Tsybko, Irina Rozhkova, Tatyana Babochkina, Alisa Levinson and Sergei Amstislavsky REPROD FERT DEVELOP, 2024, 36
Genotype imputation in human genomic studies Berdnikova AA, Zorkoltseva IV, Tsepilov YA, Elgaeva EE Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, 28(6):628-639
Liver Fluke-Derived Molecules Accelerate Skin Repair Processes in a Mouse Model of Type 2 Diabetes Mellitus Ковнер А., Капущак Я., Запарина О., Пономарев Д., Пахарукова М. INT J MOL SCI, 2024, 2024, 25(22), 12002
2023
Mutant-Huntingtin Molecular Pathways Elucidate New Targets for Drug Repurposing Makeeva V.S., Dyrkheeva N.S., Lavrik O.I., Zakian S.M., Malakhova A.A. INT J MOL SCI, 2023, 24(23), 16798
Determination of the melanin and anthocyanin content in barley grains by digital image analysis using machine learning methods E.G. Komyshev, M.A. Genaev, I.D. Busov, M.V. Kozhekin, N.V. Artemenko, A.Y. Glagoleva, V.S. Koval, D.A. Afonnikov Vavilov journal of genetics and breeding, 2023
Impact of Allelic Variation in Maturity Genes E1–E4 on Soybean Adaptation to Central and West Siberian Regions of Russia Perfil’ev R., Shcherban A., Potapov D., Maksimenko K., Kiryukhin S., Gurinovich S., Panarina V., Polyudina R., Salina E. Agriculture, 2023, vol. 13, no. 6: article 1251, https://doi.org/10.3390/agriculture13061251, IF=3.408, Received: 16 May 2023, Revised: 11 June 2023, Accepted: 13 June 2023, Published: 15 June 2023
Finding needles in a haystack: identification of inter-specific introgressions in wheat genebank collections using low-coverage sequencing data Jens Keilwagen, Heike Lehnert, Ekaterina D. Badaeva,
Hakan Özkan, Shivali Sharma, Peter Civan, Benjamin Kilian Frontiers in Plant Science, 2023, Front. Plant Sci., Volume 14, Article 1166854, Q1, RECEIVED 15 February 2023, ACCEPTED 02 May 2023, PUBLISHED 06 June 2023
Ant13 encodes regulatory factor WD40 controlling anthocyanin and proanthocyanidin synthesis in barley (Hordeum vulgare L.) Shoeva O.Yu., Mukhanova M.A., Zakhrabekova S., Hansson M. J AGR FOOD CHEM, 2023
On the role of serotonin 5-HT1A receptor in autistic-like behavior: сross talk
of 5-HT and BDNF systems Elena M. Kondaurova , Irina I. Belokopytova , Elisabeth A. Kulikova , Nikita V. Khotskin , Tatiana
V. Ilchibaeva , Anton S. Tsybko , Nina K. Popova , Vladimir S. Naumenko BEHAV BRAIN RES, 2023, 438 (2023) 114168
Heterologous Expression of Extracellular Proteinase pAsPs of Aspergillus pseudotamarii in Komagataella phaffii. Zadorozhny AV, Voskoboev ME, Bochkov DV, Rozanov AS, Shedko ED, Mescheryakova IA, Blinov AG, Korzhuk AV, Shlyakhtun VN, Bogacheva NV, Antonov EV, Bannikova SV, Goryachkovskaya TN, Peltek SE INT J MOL SCI, 2023, International Journal of Molecular Sciences. 2022; 23(23):15035.
Biochemical characteristics of iPSC-derived dopaminergic neurons from N370S GBA variant carriers with and without Parkinson's disease Grigor’eva E.V., Kopytova A.E., Yarkova E.S., Pavlova S.V., Sorogina D.A., Malakhova A.A., Malankhanova T.B., Baydakova G.V., Zakharova E.Y., Medvedev S.P., Pchelina S.N., Zakian S.M. INT J MOL SCI, 2023, 24(5), 4437
ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА ПРОРАСТАНИЕ ЗЕРНА НА КОРНЮ У МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ (TRITICUM AESTIVUM L.), И МЕТОДЫ ИХ ОЦЕНКИ А.В. Федяева, Е.А. Салина, В.К. Шумный Генетика, 2023, T. 59, № 1, стр. 5-17, DOI: 10.31857/S0016675823010058
Создание линии индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi043-A с помощью репрограммирования мононуклеарных клеток периферической крови пациента с болезнью Паркинсона, ассоциированной с патологическим вариантом p.G2019S LRRK2 Григорьева Е.В., Павлова С.В., Малахова А.А., Яркова Е.С., Сорогина Д.А., Минина Ю.М., Милюхина И.В., Николаев Н.А., Пчелина С.Н., Медведев С.П., Закиян С.М. Онтогенез, 2023, Т. 54. №1. С. 79–86
Создание линий индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi044-B и ICGi044-C с помощью репрограммирования мононуклеарных клеток периферической крови пациента с болезнью Паркинсона, ассоциированной с мутацией c.1492T>G в гене GLUD2 Сорогина Д.А., Григорьева Е.В., Малахова А.А., Павлова С.В., Медведев С.П., Вяткин Ю.В., Хабарова Е.А., Рзаев Дж.А., Закиян С.М. Онтогенез, 2023, Т. 54. № 1. С. 114–122
Эффекты вспомогательных репродуктивных технологий на социальное поведение мышей линии BTBR – модели расстройств аутистического спектра Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Брусенцев Е.Ю., Игонина Т.Н., Рахманова Т.А., Лебедева Д.А., Яцук Т.А., Козенева В.С., Напримеров В.А., Амстиславский С.Я. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2023, Т. 109. № 3. С. 315–333.
Влияние культивирования in vitro и переноса эмбрионов на плотность нейронов и нейрогенез в головном мозге мышей линии С57BL/6J Брусенцев Е.Ю., Игонина Т.Н., Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Лебедева Д.А., Владимирова Е.В., Козенева В.С., Амстиславский С.Я. Нейрохимия, 2023, Т. 40, № 3, С. 223–233.
Elucidation of the Landscape of Alternatively Spliced Genes and Features in the Dorsal Striatum of Aggressive/Aggression-Deprived Mice in the Model of Chronic Social Conflicts. Babenko, V. Redina, O. Smagin, D. Kovalenko, I. Galyamina, A. Kudryavtseva, N. Genes, 2023, 14:599
Function and Evolution of the Loop Extrusion Machinery in Animals Evelyn Kabirova, Artem Nurislamov, Artem Shadskiy, Alexander Smirnov, Andrey Popov, Pavel Salnikov, Nariman Battulin, Veniamin Fishman INT J MOL SCI, 2023
A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells Anna Khabarova, Galina Koksharova, Pavel Salnikov, Polina Belokopytova, Roman Mungalov, Inna Pristyazhnuk, Artem Nurislamov, Maria Gridina, Veniamin Fishman CHROMOSOME RES, 2023
Short Interrupted Repeat Cassette (SIRC)—Novel Type of
Repetitive DNA Element Found in Arabidopsis thaliana Gorbenko I.V., Petrushin I.S., Shcherban A.B., Orlov Yu.L., Konstantinov Yu.M. INT J MOL SCI, 2023, 24(13), 11116
Анализ поведения и плотности нейронов в головном мозге мышей B6.CG-TG(PRNP-SNCA*A53T)23MKLE/J – модели болезни Паркинсона Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Брусенцев Е.Ю., Рахманова Т.А., Лебедева Д.А., Козенева В.С., Хоцкин Н.В., Амстиславский С.Я. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2023, Т. 109, № 9, С. 1199–1216.
Curcumin and Its Supramolecular Complex with Disodium Glycyrrhizinate as Potential Drugs for the Liver Fluke Infection Caused by Opisthorchis felineus Maria N Lvova, Denis V Ponomarev, Alena A Tarasenko, Anna V Kovner, Galina A Minkova, Michail A Tsyganov, Meijun Li, Yan Lou, Veronica I Evseenko, Alexander V Dushkin, Irina V Sorokina, Tatiana G Tolstikova, Viatcheslav A Mordvinov, Damira F Avgustinovich Pathogens, 2023, 12(6):819
Analysis of the Structural Organization and Expression of the Vrn-D1 Gene Controlling Growth Habit (Spring vs. Winter) in Aegilops tauschii Coss. Chepurnov G.Y., Ovchinnikova E.S., Blinov A.G., Chikida N.N., Belousova M.Kh., Goncharov N.P. Plants, 2023, V.12, P.3596.
Reconstruction of the regulatory hypermethylation network controlling hepatocellular carcinoma development during hepatitis C viral infection Evgeniya A. Antropova, Tamara M. Khlebodarova, Pavel S. Demenkov, Anastasiia R.
Volianskaia, Artur S. Venzel, Nikita V. Ivanisenko, Alexandr D. Gavrilenko, Timofey V.
Ivanisenko, Anna V. Adamovskaya, Polina M. Revva, Nikolay A. Kolchanov, Inna N. Lavrik
and Vladimir A. Ivanisenko J INTEGR BIOINFORM, 2023
Реконструкция и анализ регуляторной генной сети функционирования клеточной стенки листьев Arabidopsis thaliana L. при ответе на водный дефицит A.R. Volyanskaya, E.A. Antropova, U.S. Zubairova, P.S. Demenkov, A.S. Venzel, Y.L. Orlov, A.A. Makarova,
T.V. Ivanisenko, T.A. Gorshkova, A.R. Aglyamova, N.A. Kolchanov, M. Chen, V.A. Ivanisenko Vavilov journal of genetics and breeding, 2023
Экспрессия гена uidA под контролем тканеспецифичных промоторов генов ap3 и rpt2a Arabidopsis thaliana L. в трансгенной клеточной культуре Nicotiana tabacum Маренкова Т.В., Сидорчук Ю.В., Хайрулина Е.С., Кузнецов В.В., Дейнеко Е.В. БИОМИКА, 2023, Том 15, №4 , С. 253-262
Serotonin Receptors as a Potential Target
in the Treatment of Alzheimer’s Disease Dmitrii V. Eremin, Elena M. Kondaurova, Aleksander Ya. Rodnyy, Camilla A. Molobekova , Dmitrii A. Kudlay and Vladimir S. Naumenko BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2023, Vol. 88, Nos. 12-13, pp. 2023-2042
КОРРЕЛЯЦИОННЫЕ СВЯЗИ ЭКСПРЕССИИ
ГЕНА МАРКЕРА РАКА ЛЁГКИХ Eno2 И ГЕНОВ
КАНЦЕРОГЕНЕЗА И АПОПТОЗА В ГИПОТАЛАМУСЕ
МЫШЕЙ С ДЕПРЕССИВНОПОДОБНЫМ ПОВЕДЕНИЕМ Галямина А.Г., Коваленко И.Л., СмагинД.А., Кудрявцева Н.Н. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2023, Том 176, № 11 С.632-637
Cytological Analysis of Crossover Frequency and Distribution in Male Meiosis of Cardueline Finches (Fringillidae, Aves). Grishko, E.
Malinovskaya, L.
Slobodchikova, A.
Kotelnikov, A.
Torgasheva, A.
Borodin, P. Animals, 2023, 13, 3624.
Получение линий индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi022-A-3, ICGi022-A-4 и ICGi022-A-5 с внесенной в ген MYBPC3 с помощью системы CRISPR/Cas9 мутацией p.Asn515del Павлова С.В., Шаяхметова Л.Ш., Проняева К.А., Шульгина А.Е., Закиян С.М., Дементьева Е.В. RUSS J DEV BIOL+, 2023, Т. 54, № 1, С. 105–113
Effect of Expression of the NDB2 Heterologous Gene of Arabidopsis thaliana on Growth and Respiratory Activity of Nicotiana tabacum N. E. Korotaeva, A. M. Shigarova, A. I. Katyshev, I. V. Fedoseeva, A. V. Fedyaeva, D. V. Sauchyn, A. M. Shyshlova-Sokolovskaya, O. Yu. Urbanovich, G. B. Borovskii RUSS J PLANT PHYSL+, 2023, Т. 70. – №. 5. – С. 93.
Creation of Induced Pluripotent Stem Cells ICGi044-B and ICGi044-C Using Reprogramming of Peripheral Blood Mononuclear Cells of a Patient with Parkinson's Disease Associated with c.1492T>G Mutation in the GLUD2 Gene Sorogina D.A., Grigor’eva E.V., Malakhova A.A., Pavlova S.V., Medvedev S.P., Vyatkin Y.V., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Zakian S.M. RUSS J DEV BIOL+, 2023, Vol. 54, No. 1, pp. 104–111
Длительное воздействие короткого светового дня и ингибитора триптофангидроксилазы на поведение и серотониновую систему мозга Danio rerio И.Е.Сорокин, В.С.Евсюкова, А.Б.Арефьева, В.В.Сачкова, П.А.Куликов, А.В.Куликов Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2023, Т. 175 (6), с. 778-785
2022
Noncoding rare variants in PANX3 are associated with chronic back pain Nadezhda M Belonogova, Anatoly V Kirichenko, Maxim B Freidin, Frances M K Williams, Pradeep Suri, Yurii S Aulchenko, Tatiana I Axenovich, Yakov A Tsepilov PAIN, 2022, DOI: 10.1097/j.pain.0000000000002781
Dissection of Structural Reorganization of Wheat 5B Сhromosome Associated With Interspecies Кecombination Suppression Elena Salina, Alexander Muterko, Antonina Kiseleva, Zhiyong Liu, Abraham Korol Frontiers in Plant Science, 2022, Volume 13, Article 884632
Detecting major introgressions in wheat and their putative origins using coverage analysis Jens Keilwagen, Heike Lehnert, Thomas Berner, Ekaterina Badaeva, Axel Himmelbach, Andreas Börner, Benjamin Kilian SCI REP-UK, 2022, volume 12, Article number: 1908
Generation of induced pluripotent stem cell line, ICGi034-A, by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with Parkinson’s disease associated with GBA mutation Grigor’eva E.V., Drozdova E.S., Sorogina D.A., Malakhova A.A., Pavlova S.V., Vyatkin Y.V., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Medvedev S.P., Zakian S.M. STEM CELL RES, 2022, V. 59. 102651
Клонирование и экспрессия гена целлюлазы Penicillium sp. “occitanis” в K. phaffii T07, выделение и анализ свойств. Розанов А.С., Воскобоев М., Богачева Н.В., Коржук А.В., Шляхтун В.Н., Мещерякова И.А., Романцев В.А., Бочков Д.В., Задорожный А., Пельтек С.Е. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2022
Metabolomic Analysis Reveals That the Moor Frog Rana arvalis Uses Both Glucose and Glycerol as Cryoprotectants Sergei V. Shekhovtsov, Nina A. Bulakhova, Yuri P. Tsentalovich, Ekaterina A. Zelentsova, Ekaterina N. Meshcheryakova, Tatiana V. Poluboyarova, Daniil I. Berman Animals, 2022, 12(10), 1286
De novo assembly and analysis of the transcriptome of the Siberian wood frog Rana amurensis D.N. Smirnov, S.V. Shekhovtsov, A.A. Shipova, G.R. Gazizova, E.I. Shagimardanova, N.A. Bulakhova, E.N. Meshcheryakova, T.V. Poluboyarova, E.E. Khrameeva, S.E. Peltek, D.I. Berman Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, Т. 26. – №. 1. – С. 109.
Estimating range disjunction time of the Palaearctic Admirals (Limenitis L.) with COI and histone H1 genes Solovyev V.I., Dubatolov V.V., Vavilova V.Y., Kosterin O.E. ORG DIVERS EVOL, 2022
Genetic Variability of Btr1 Genes in Tetraploid Wheat
Species and Aegilops speltoides Tausch Vavilova V.Yu., Konopatskaia I. D., Blinov A.G., Kondratenko E.Ya., Kruchinina Yu.V., Goncharov N.P. RUSS J GENET+, 2022, Vol. 58, No. 6, pp. 684–697.
Generation of induced pluripotent stem cell line, ICGi033-A, by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with Huntington's disease Grigor’eva E.V., Malakhova A.A., Sorogina D.A., Pavlova S.V., Malankhanova T.B., Abramycheva N.Yu., Klyushnikov S.A., Illarioshkin S.N., Zakian S.M. STEM CELL RES, 2022, 63. 102868.
Дисфункция генов, ассоциируемых с канцерогенезом и апоптозом, развивающаяся в гипоталамусе самцов мышей под влиянием хронического социального стресса Галямина А.Г., Смагин Д.А., Коваленко И.Л., Редина О.Е., Бабенко В.Н., Кудрявцева Н.Н. Биохимия, 2022, т.87, №9, с. 1318-1333
The Dysfunction of Carcinogenesis- and Apoptosis-Associated Genes that Develops in the Hypothalamus
under Chronic Social Defeat Stress in Male Mice Anna G. Galyamina, Dmitry A. Smagin, Irina L. Kovalenko,
Olga E. Redina, Vladimir N. Babenko, and Natalia N. Kudryavtseva Biochemistry (Moscow). Suppl B., 2022, Vol. 87, No. 9, pp. 1050-1064
Mlig-SKP1 gene is required for spermatogenesis in the flatworm Macrostomum lignano Biryukov M., Dmitrieva A., Vavilova V., Ustyantsev K., Bazarova E., Sukhikh I., Berezikov E., Blinov A. INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 15110
Specific features of the proteomic response of thermophilic bacterium Geobacillus icigianus to terahertz irradiation. Bannikova S.V., Khlebodarova T.M., Vasilieva A., Meshcheryakova I.A., Bryanskaya A.V., Shedko E., Popik V.M., Goryachkovskaya T.N., Peltek S.E. INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 15216
Single-Cell DNA Methylation Analysis of Chicken Lampbrush Chromosomes Artem Nurislamov, Timofey Lagunov, Maria Gridina, Alla Krasikova, Veniamin Fishman INT J MOL SCI, 2022, 23(20):12601
Generation of iPS cell line (ICGi040-A) from skin fibroblasts of a patient with ring small supernumerary marker chromosome 4 M.M.Gridina, A.R.Nurislamov, J.M.Minina, M.E.Lopatkina, G.V.Drozdov, S.A.Vasilyev, L.I.Minaycheva, E.O.Belyaeva, T.V.Nikitina, A.A.Kashevarova, I.N.Lebedev, T.V.Karamysheva, N.B.Rubtsov, O.L.Serov STEM CELL RES, 2022, 61, 102740
Митохондрии и гибель клеток суспензионной культуры Saccharum officinarum L. при отрицательной температуре Любушкина И. В., Степанов А. В., Федяева А. В., Федосеева И. В., Побежимова Т. П., Грабельных О. И. Физиология растений, 2022
2021
Allelic Variation Analysis at the Vernalization Response and Photoperiod Genes in Russian Wheat Varieties Identified Two Novel Alleles of Vrn-B3 Berezhnaya A., Kiseleva A., Leonova I., Salina E. Biomolecules, 2021, 11(12), 1897; https://doi.org/10.3390/biom11121897, IF=4.879, Q2
Features of transcriptional dynamics of the duplicated
Vernalization-B1 gene in wheat (Triticum spp.) Muterko A., Salina E. Plant Breeding, 2021, 140(6), 1023–1031
Targeting the B1 Gene and Analysis of Its Polymorphism Associated with Awned/Awnless Trait in Russian Germplasm Collections of Common Wheat Shcherban A.B., Kuvaeva D.D., Mitrofanova O.P., Khverenets S.E., Pryanishnikov A.I., Salina, E.A. Plants, 2021, 10(11), 2285
Introducing Beneficial Alleles from Plant Genetic Resources into the Wheat Germplasm Sharma S., Schulthess A.W., Bassi F.M., Badaeva E.D.,
Neumann K., Graner A., Özkan H., Werner P., Knüpffer H., Kilian B. Biology, 2021, 10(10), 982. https://doi.org/10.3390/biology10100982
Разработка панели маркеров для генотипирования отечественных сортов сои по генам, контролирующим
срок вегетации и реакцию на фотопериод Перфильев Р.Н., Щербань А.Б., Салина Е.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(7):761-769
Продукция субтилизиновых протеаз в бактериях и дрожжах Розанов А.С., Шеховцов С.В., Богачева Н.В., Першина Е.Г., Ряполова А.В.,Бытяк Д.С., Пельтек С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(6):647-651
Biochemical response to freezing in the Siberian salamander Salamandrella keyserlingii Shekhovtsov S.V., Bulakhova, N.A., Tsentalovich Y.P., Zelentsova E.A., Meshcheryakova E.N., Poluboyarova T.V., Berman, D.I. Biology, 2021, V. 10. I. 11. no. 1172.
Morphological differences between genetic lineages of the peregrine earthworm Aporrectodea caliginosa (Savigny, 1826) Shekhovtsov S.V., Ermolov S.A., Poluboyarova T.V., Kim-Kashmenskaya M.N., Derzhinsky Ye. A., Peltek S.E. ACTA ZOOL ACAD SCI H, 2021, V. 67. № 3. P. 235–246.
Повышенные температуры вызывают образование АФК
и нарушения дыхания в клетках
суспензионной культуры Saccharum officinarum Любушкина, И. В., Федяева, А. В., Степанов, А. В., Грабельных, О. И. Журнал Сибирского федерального университета. Биология, 2021
Характеристика суспензионных культур клеток Arabidopsis thaliana (L.) Heynh с изменённой экспрессией гена альтернативной оксидазы митохондрий АOX1a и анализ их морозоустойчивости А. В. Степанов, С. А. Кашин, Н. С. Забанова, О. А. Федотова, А. В. Федяева, И. В. Любушкина,Т. П. Побежимова, О. И. Грабельных Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология», 2021
АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ В КЛЕТКАХ СУСПЕНЗИОННОЙ КУЛЬТУРЫ ARABIDOPSIS THALIANA С ПОНИЖЕННОЙ ЭКСПРЕССИЕЙ ГЕНА NDB2 Fedoseeva I., Katyshev A., Fedyaeva A., Stepanov A., Borovskii G. Sib J Life Sci Agric, 2021
Получение рекомбинантного штамма Komagataella phaffi – продуцента протеиназы К из Tritirachium album А. Б. Беклемишев, М. Б. Пыхтина, Я. М. Куликов, Т. Н. Горячковская, Д. В. Бочков, С. В. Сергеева, А. Р. Васильева, В. П. Романов, Д. С. Новикова, С. Е. Пельтек Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, Том 25, № 8 (2021)
Effects of Sex and Group Size on Behavior and Brain Biogenic Amines in Short-Lived Turquoise Killifish (Nothobranchius furzeri) Valentina Evsiukova, Egor Antonov, Alexander V. Kulikov ZEBRAFISH, 2021, Vol.18, No.4
2020
Metagenomics dataset used to characterize microbiome in water and sediments of the lake Solenoe (Novosibirsk region, Russia) Alla V Bryanskaya, Aleksandra A Shipova, Alexei S Rozanov, Oxana A Volkova, Elena V Lazareva, Yulia E Uvarova, Tatyana N Goryachkovskaya, Sergey E Peltek Data in Brief, 2020
2018
Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak Archaeological and Anthropological Sciences, 2018, Vol. 10, Issue 7, P. 1557-1570.
2017
Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016
Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56 (II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия) А.С. Пилипенко, В.И. Молодин, Р.О. Трапезов, С.В. Черданцев, А.А. Журавлев Археология, этнография и антропология Евразии, 2016, Том 44, № 4, С. 141-149
2011
Protein Structure Discovery: пакет программ для решения задач компьютерной протеомики Иванисенко В. А., Деменков П. С., Иванисенко Т. В., Колчанов Н. А. Биоорганическая химия, 2011, 2011, Т. 37, № 1, С. 22–35
Application of the ANDCell Computer System to Reconstruction and Analysis of Associative Networks Describing Potential Relationships between Myopia and Glaucoma O. A. Podkolodnaya, E. E. Yarkova, P. S. Demenkov, O. S. Konovalova, V. A. Ivanisenko, and N. A. Kolchanov Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, 2011, Vol. 1, No. 1, pp. 21–28.
Извлечение знаний из текстов научных публикаций и создание баз знаний в области нанобиотехнологии В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов Российские нанотехнологии, 2011, 2011 . Т. 6 № 7- 8, с. 14-21.
PROMEDIA – база данных химических соединений, потенциальных биомаркеров заболеваний, имеющих значение для неинвазивной диагностики Сайк О.В., Мошкин М.П., Балдин М.Н., Грузнов В.М., Козлов В.А., Самороков С.Н., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2011, №2, Т.6, С.250-263
Предсказание аллергенности белков с использованием информации о конформационных пептидах А.О. Брагин, П.С. Деменков, В.А. Иванисенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, 2011. Т. 15. № 3. С. 462-468.
Protein Structure Discovery: software package to perform computational proteomics tasks Ivanisenko VA, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Kolchanov NA RUSS J BIOORG CHEM+, 2011, Jan-Feb;37(1):22-35.
2010
Использование компьютерной системы ANDCell для реконструкции и анализа ассоциативных сетей потенциальных механизмов взаимосвязи миопии и глаукомы О.А.Подколодная, Е.Э. Яркова, П.С.Деменков, О.С.Коновалова,. В.А.Иванисенко, Н.А.Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14, № 1. — С. 106–115.
Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R J INTEGR BIOINFORM, 2010, 7(1):148. doi: 10.2390/biecoll-jib-2010-148
Веб-ориентированная система построения и исполнения комплексных запросов к реляционным источникам биологической информации на основе семантической формализации структуры данных Коротков Р.О., Деменков П.С., Иванисенко В.А. Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2010, Т. 8. № 3. С. 13-22.
База данных химических соединений, имеющих потенциальное значение для неинвазивной диагностики заболеваний Сайк О.В., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Мошкин М.П., Иванисенко В.А. В мире научных открытий, 2010, №4 (10), Часть 14. С. 102-103
2009
Анализ распределения аденозин-фосфат связывающих сайтов белков на экзонной структуре гена Медведева И. В., Деменков П. С., Иванисенко В. А. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Том 13, №1, стр. 122-127
2008
Associative Network Discovery (AND) компьютерная система для автоматической реконструкции сетей ассоциативных знаний о молекулярно-генетических взаимодействиях П.С. Деменков, Е.Э. Аман, В.А. Иванисенко Вычислительные технологии, 2008, 2, 13, 15-19
2006
Prediction of the Changes in Thermodynamic Stability of Proteins Caused by Single Amino Acid Substitutions Demenkov P.S., Aman E.E., Ivanisenko V.A. BIOPHYSICS, 2006, т. 51, выпуск N7
2004
Обнаружение эмпирической аксиоматической теории в условиях шумов. Деменков П.С. Вычислительные системы, 2004
Inheritance and chromosomal location of the genes for long glume phenotype found in Portuguese landraces of hexaploid wheat, ‘Arrancada’ Watanabe N., Goncharoiv N.P., Bannikova S.V. Journal of Genetics and Breeding, 2004, Vol. 58. P.273-278.
