Accounting System of Scientific Activity (ASSA)

Laboratories Russian Science Foundation

Extrabudgetary units

Departments

Laboratory of opisthorchiasis pathomechanism
Laboratory of wound healing mechanisms
Laboratory of Assisted Reproduction Technologies and Brain Research (code 252)
Laboratory of Condensin Biology (code 253)
Laboratory of Enzymes for Biogenic Amines (code 255)
Laboratory of Genome Stability
Laboratory of aggression neuroimmunology
Laboratory of artificial intelligence and big genomic data (t. 213)
Laboratory of atherosclerosis 3D cellular models
Laboratory of behavioral neurobiology
Laboratory of bird genomics
Laboratory of depression pharmacogenetics
Laboratory of diabetes pharmacogenomics
Laboratory of fast-evolving regions of the human genome
Laboratory of genome evolution in Macrostomidae
Laboratory of grain color genetics
Laboratory of mammalian evolutionary 3D genomics
Laboratory of metabolic stress
Laboratory of neurodegenerative disease genetics
Laboratory of neurogenomic study of immune disorders
Laboratory of novel plant protection agents
Laboratory of plant phenomics
Laboratory of proteopathy
Laboratory of protist systems biology
Laboratory of psychoneuroimmunology
Laboratory of retinopathy molecular genetics
Laboratory of symbiogenetics
Laboratory of target medication screening
Laboratory of the Genomic Selection of Plants
Laboratory of the Neurobiology of Interreceptor Interaction (code 254)
Laboratory of the paleogenetics of Medieval Siberian peoples
Laboratory of the physiological genetics of wheat (code 251)
Laboratory of the prenatal control of development
Laboratory of trematode functional genomics
Laboratory of wheat biofortification

Publications

Staff

Select the desired year interval:

2025	IgA nephropathy is associated with Opisthorchis felineus liver fluke infection: Retrospective 5-year analysis of human kidney samples. Kovner A, Kapushchak Y, Hadieva E, Persidskij M, Pakharukova M. TROP MED INT HEALTH, 2025, 2025 Feb 2. doi: 10.1111/tmi.14093.
2024	Genome-wide association study revealed some new candidate genes associated with flowering and maturity time of soybean in Central and West Siberian regions of Russia Perfil`ev R, Shcherban A, Potapov D, Maksimenko K, Kiryukhin S, Gurinovich S, Panarina V, Polyudina R, Salina E Frontiers in Plant Science, 2024, 15:1463121
	Biochemical, Genetic, and Grain Digital Evaluation of Soft Winter Wheat Varieties with Different Germination Index. A.V. Fedyaeva, S.D. Afonnikova, D.A. Afonnikov, O.G. Smirnova, V.N. Deeva, A.I. Pryanishnikov, E.A. Salina RUSS J PLANT PHYSL+, 2024, Volume 71, article number 56
	Identification of novel loci precisely modulating pre-harvest sprouting resistance and red color components of the seed coat in T. aestivum L. Afonnikova S.D., Kiseleva A.A., Fedyaeva A.V., Komyshev E.G., Koval V.S., Afonnikov D.A., Salina E.A. Plants, 2024, т. 13, № 10, с. 1309
	Effects of different types of induced neonatal inflammation on development and behavior of C57BL/6 and BTBR mice Yuliya A. Ryabushkina, Kseniya A. Ayriyants, Anna A. Sapronova, Anastasia S. Mutovina, Maria M. Kolesnikova, Eva V. Mezhlumyan, Natalya P. Bondar, Vasiliy V. Reshetnikov PHYSIOL BEHAV, 2024, Volume 280, 1 June 2024, 114550
	Towards Development of the 4C-Based Method Detecting Interactions of Plasmid DNA with Host Genome Alexandra P Yan, Paul A Salnikov, Maria M Gridina, Polina S Belokopytova, Veniamin S Fishman BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2024
	Effects of Chronic Social Stress on the Expression of Neurotransmitter System–associated Genes in the Hypothalamus of Male Mice I. L. Kovalenko, A. G. Galyamina, D. A. Smagin, N. N. Kudryavtseva RUSS J GENET+, 2024, Vol. 60, No. 6, pp. 737–746
	Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks. Artemenko N.V., Genaev M.A., Epifanov R.UI., Komyshev E.G., Kruchinina Y.V., Koval V.S., Goncharov N.P. and Afonnikov D.A. Frontiers in Plant Science, 2024, т. 14, с. 1336192
	Конвейер обработки гиперспектральных изображений на примере исследования зерен ячменя, содержащих меланин. Бусов И.Д., Генаев М.А., Комышев Е.Г., Коваль В.С., Зыкова Т.E., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, т. 28, № 4, С. 443-455
	Blood Plasma Markers in Depressed Mice under Chronic Social Defeat Stress D.A. Smagin, D.V. Bezryadnov, M.G. Zavialova, A.Yu. Abramova, S.S. Pertsov and N.N. Kudryavtseva Biomedicines, 2024, 2024, 12, 1485
	ИЗМЕНЕНИЕ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВОГО ОТВЕТА В ГИПОТАЛАМУСЕ ЖИВОТНЫХ ПОД ВЛИЯНИЕМ ХРОНИЧЕСКОГО СОЦИАЛЬНОГО СТРЕССА: ДАННЫЕ RNA-seq Галямина А.Г., Коваленко И.Л., Смагин Д.А., Попова Н.А. Medical Immunology, 2024, Т. 26, № 4, стр. 217-224
	Liver Fluke-Derived Molecules Accelerate Skin Repair Processes in a Mouse Model of Type 2 Diabetes Mellitus Ковнер А., Капущак Я., Запарина О., Пономарев Д., Пахарукова М. INT J MOL SCI, 2024, 2024, 25(22), 12002
	Идентификация Sr генов возрастной устойчивости в отечественных сортах мягкой пшеницы методом молекулярно-генетического маркирования Е.С. Сколотнева, Ю.В. Лаприна, М.И. Киселева, В.Н. Кельбин, Т.М. Коломиец Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, №3, Том 10, 151-157
	Prefrontal Cortical Projection Neurons: Involvement in Shaping Different Types of Behaviors, BDNF Expression and Transport U. S. Drozd, Ya. A. Frik, A. V. Smagin, Dmitriy Lanshakov J EVOL BIOCHEM PHYS+, 2024, 60(5)
	Effect of Biopesticide Novochizol on Development of Stem Rust Puccinia graminis f. sp. tritici in Wheat, T. aestivum L. Andrey B. Shcherban, Ekaterina S. Skolotneva, Anna V. Fedyaeva, Natalya I. Boyko, Vladislav V. Fomenko Plants, 2024, 13, 3455.
	Characterizing a Lethal CAG-ACE2 Transgenic Mouse Model for SARS-CoV-2 infection with Using Cas9-Enhanced Nanopore Sequencing Smirnov A, Nurislamov A, Galina Koncevaya G, Serova I, Kabirova E, Chuyko E, Maltceva E, Savoskin M, Zadorozhny D, Svyatchenko VA, Protopopova EV, Taranov OS, Legostaev SS, Loktev VB, Serov O, Battulin N TRANSGENIC RES, 2024, 33(5):453-466
	Принципы использования рекомбинантных аденоассоциированных вирусов в исследованиях и терапии. Марченко С.А., Ланшаков Д.А. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, 10(4):204-215
	Развитие признаков болезни Альцгеймера у крыс OXYS сопровождается снижением экспрессии дофаминового нейротрофического фактора мозга (CDNF) и не компенсируется его сверхэкспрессией Я.П.Каминская, Т.В.Ильчибаева, Т.А.Козлова, Н.Г.Колосова, В.С.Науменко, А.С.Цыбко Нейрохимия, 2024, Том 41, № 4 (2024) Страницы: 372-383
	Разнообразие митохондриальной ДНК на средневековом могильнике Заречно-Убинское-1 в Барабинской лесостепи (предварительные результаты исследования) Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Нестерова М.С., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2024, Т. XXX. – С. 808–816.
	Multi-Omics Analysis Revealed the rSNPs Potentially Involved in T2DM Pathogenic Mechanism and Metformin Response Igor S Damarov, Elena E Korbolina, Elena Y Rykova, Tatiana I Merkulova INT J MOL SCI, 2024, Int J Mol Sci. 2024 Aug 27;25(17):9297. doi: 10.3390/ijms25179297. PMID: 39273245; PMCID: PMC11394919.
	Generation and analysis of mouse embryonic stem cells with knockout of the Mcph1 (microcephalin) gene Юнусова А.М., Смирнов А.В., Шнайдер Т.А., Пристяжнюк И.Е., Кораблева С.Ю., Баттулин Н.Р. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, Sep;28(5):487-494
2023	Mutant-Huntingtin Molecular Pathways Elucidate New Targets for Drug Repurposing Makeeva V.S., Dyrkheeva N.S., Lavrik O.I., Zakian S.M., Malakhova A.A. INT J MOL SCI, 2023, 24(23), 16798
	Determination of the melanin and anthocyanin content in barley grains by digital image analysis using machine learning methods E.G. Komyshev, M.A. Genaev, I.D. Busov, M.V. Kozhekin, N.V. Artemenko, A.Y. Glagoleva, V.S. Koval, D.A. Afonnikov Vavilov journal of genetics and breeding, 2023
	Impact of Allelic Variation in Maturity Genes E1–E4 on Soybean Adaptation to Central and West Siberian Regions of Russia Perfil’ev R., Shcherban A., Potapov D., Maksimenko K., Kiryukhin S., Gurinovich S., Panarina V., Polyudina R., Salina E. Agriculture, 2023, vol. 13, no. 6: article 1251, https://doi.org/10.3390/agriculture13061251, IF=3.408, Received: 16 May 2023, Revised: 11 June 2023, Accepted: 13 June 2023, Published: 15 June 2023
	ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА ПРОРАСТАНИЕ ЗЕРНА НА КОРНЮ У МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ (TRITICUM AESTIVUM L.), И МЕТОДЫ ИХ ОЦЕНКИ А.В. Федяева, Е.А. Салина, В.К. Шумный Генетика, 2023, T. 59, № 1, стр. 5-17, DOI: 10.31857/S0016675823010058
	Elucidation of the Landscape of Alternatively Spliced Genes and Features in the Dorsal Striatum of Aggressive/Aggression-Deprived Mice in the Model of Chronic Social Conflicts. Babenko, V. Redina, O. Smagin, D. Kovalenko, I. Galyamina, A. Kudryavtseva, N. Genes, 2023, 14:599
	Short Interrupted Repeat Cassette (SIRC)—Novel Type of Repetitive DNA Element Found in Arabidopsis thaliana Gorbenko I.V., Petrushin I.S., Shcherban A.B., Orlov Yu.L., Konstantinov Yu.M. INT J MOL SCI, 2023, 24(13), 11116
	Curcumin and Its Supramolecular Complex with Disodium Glycyrrhizinate as Potential Drugs for the Liver Fluke Infection Caused by Opisthorchis felineus Maria N Lvova, Denis V Ponomarev, Alena A Tarasenko, Anna V Kovner, Galina A Minkova, Michail A Tsyganov, Meijun Li, Yan Lou, Veronica I Evseenko, Alexander V Dushkin, Irina V Sorokina, Tatiana G Tolstikova, Viatcheslav A Mordvinov, Damira F Avgustinovich Pathogens, 2023, 12(6):819
	КОРРЕЛЯЦИОННЫЕ СВЯЗИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА МАРКЕРА РАКА ЛЁГКИХ Eno2 И ГЕНОВ КАНЦЕРОГЕНЕЗА И АПОПТОЗА В ГИПОТАЛАМУСЕ МЫШЕЙ С ДЕПРЕССИВНОПОДОБНЫМ ПОВЕДЕНИЕМ Галямина А.Г., Коваленко И.Л., СмагинД.А., Кудрявцева Н.Н. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2023, Том 176, № 11 С.632-637
	Effect of Expression of the NDB2 Heterologous Gene of Arabidopsis thaliana on Growth and Respiratory Activity of Nicotiana tabacum N. E. Korotaeva, A. M. Shigarova, A. I. Katyshev, I. V. Fedoseeva, A. V. Fedyaeva, D. V. Sauchyn, A. M. Shyshlova-Sokolovskaya, O. Yu. Urbanovich, G. B. Borovskii RUSS J PLANT PHYSL+, 2023, Т. 70. – №. 5. – С. 93.
	Длительное воздействие короткого светового дня и ингибитора триптофангидроксилазы на поведение и серотониновую систему мозга Danio rerio И.Е.Сорокин, В.С.Евсюкова, А.Б.Арефьева, В.В.Сачкова, П.А.Куликов, А.В.Куликов Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2023, Т. 175 (6), с. 778-785
	Реконструкция генетической истории населения Западной Сибири: палеогенетический анализ средневековых антропологических материалов Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Томилин М.А., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Молодин В.И., Нестерова М.С., Журавлев А.А., Рыкун М.П. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2023, Т.29. - С. 806-812.
	Влияние длительной социальной изоляции на поведение и пластичность мозга у мышей с нокаутом гена фактора некроза опухоли. Базовкина Д.В., Устинова У.С., Адонина С.Н., Комлева П.Д., Арефьева А.Б., Москалюк В.С., Куликова Е.А. Гены и клетки, 2023, Т. 18. No 4. С. 450–453
2022	Дисфункция генов, ассоциируемых с канцерогенезом и апоптозом, развивающаяся в гипоталамусе самцов мышей под влиянием хронического социального стресса Галямина А.Г., Смагин Д.А., Коваленко И.Л., Редина О.Е., Бабенко В.Н., Кудрявцева Н.Н. Биохимия, 2022, т.87, №9, с. 1318-1333
	The Dysfunction of Carcinogenesis- and Apoptosis-Associated Genes that Develops in the Hypothalamus under Chronic Social Defeat Stress in Male Mice Anna G. Galyamina, Dmitry A. Smagin, Irina L. Kovalenko, Olga E. Redina, Vladimir N. Babenko, and Natalia N. Kudryavtseva Biochemistry (Moscow). Suppl B., 2022, Vol. 87, No. 9, pp. 1050-1064
	Митохондрии и гибель клеток суспензионной культуры Saccharum officinarum L. при отрицательной температуре Любушкина И. В., Степанов А. В., Федяева А. В., Федосеева И. В., Побежимова Т. П., Грабельных О. И. Физиология растений, 2022
2021	Повышенные температуры вызывают образование АФК и нарушения дыхания в клетках суспензионной культуры Saccharum officinarum Любушкина, И. В., Федяева, А. В., Степанов, А. В., Грабельных, О. И. Журнал Сибирского федерального университета. Биология, 2021
	Характеристика суспензионных культур клеток Arabidopsis thaliana (L.) Heynh с изменённой экспрессией гена альтернативной оксидазы митохондрий АOX1a и анализ их морозоустойчивости А. В. Степанов, С. А. Кашин, Н. С. Забанова, О. А. Федотова, А. В. Федяева, И. В. Любушкина,Т. П. Побежимова, О. И. Грабельных Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология», 2021
	АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ В КЛЕТКАХ СУСПЕНЗИОННОЙ КУЛЬТУРЫ ARABIDOPSIS THALIANA С ПОНИЖЕННОЙ ЭКСПРЕССИЕЙ ГЕНА NDB2 Fedoseeva I., Katyshev A., Fedyaeva A., Stepanov A., Borovskii G. Sib J Life Sci Agric, 2021
2018	Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak Archaeological and Anthropological Sciences, 2018, Vol. 10, Issue 7, P. 1557-1570.
2017	Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016	Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56 (II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия) А.С. Пилипенко, В.И. Молодин, Р.О. Трапезов, С.В. Черданцев, А.А. Журавлев Археология, этнография и антропология Евразии, 2016, Том 44, № 4, С. 141-149
2015	MtDNA Haplogroup A10 Lineages in Bronze Age Samples Suggest That Ancient Autochthonous Human Groups Contributed to the Specificity of the Indigenous West Siberian Population Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vyacheslav I. Molodin, Aida G. Romaschenko PloS One, 2015
2012	Генофонд мтДНК населения восточного варианта пахомовской культуры Молодин В.И., Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2012, № 4 (52). С. 62-69.

Accounting System of Scientific Activity (ASSA)

Laboratories Russian Science Foundation

Departments

Former employees

Plurals