Accounting System of Scientific Activity (ASSA)

Laboratories Russian Science Foundation

Extrabudgetary units

Departments

Laboratory for the development of statistical methods in heritability evaluation (t. 212)
Laboratory of opisthorchiasis pathomechanism
Laboratory of wound healing mechanisms
Laboratory of 3D Genomics
Laboratory of Amphibian Physiology
Laboratory of Experimental Pharmacology
Laboratory of Genome Stability
Laboratory of Nucleic Acid Chemistry
Laboratory of Stress Response Genetics in Arterial Hypertension
Laboratory of aggression neuroimmunology
Laboratory of artificial intelligence and big genomic data (t. 213)
Laboratory of atherosclerosis 3D cellular models
Laboratory of behavioral neurobiology
Laboratory of bird cytogenetics (t. 211)
Laboratory of bird genomics
Laboratory of computer-assisted cereal phenotyping
Laboratory of depression pharmacogenetics
Laboratory of diabetes pharmacogenomics
Laboratory of diapause and mammalian embryo cryopreservation (t. 210)
Laboratory of early ripening genetics
Laboratory of fast-evolving regions of the human genome
Laboratory of genome evolution in Macrostomidae
Laboratory of grain color genetics
Laboratory of larval stress
Laboratory of mammalian evolutionary 3D genomics
Laboratory of metabolic stress
Laboratory of modification of plastid genomes in higher plants
Laboratory of molecular mechanisms of hormonal regulation in plants
Laboratory of neurodegenerative disease genetics
Laboratory of neurogenomic study of immune disorders
Laboratory of novel plant protection agents
Laboratory of nucleic acid immunology
Laboratory of plant phenomics
Laboratory of plant protection by RNA interference
Laboratory of proteopathy
Laboratory of protist systems biology
Laboratory of psychoneuroimmunology
Laboratory of reproductive technologies and brain studies (t. 208)
Laboratory of retinopathy molecular genetics
Laboratory of symbiogenetics
Laboratory of target medication screening
Laboratory of the 3D genetics of breaks
Laboratory of the Genetic Control of Protein Content in Wheat Grain
Laboratory of the Genetic Control of Wheat Drought Resistance
Laboratory of the Genomic Selection of Plants
Laboratory of the Molecular Pathogenesis of Hypertrophic Cardiomyopathy
Laboratory of the Neurogenomics of Autism Spectrum Disorders
Laboratory of the Neurotransmitter Regulation of Neurodegenerative Diseases
Laboratory of the genetics of intervertebral disk degeneration
Laboratory of the paleogenetics of Medieval Siberian peoples
Laboratory of the prenatal control of development
Laboratory of trematode functional genomics
Laboratory of wheat biofortification
Psychosocial stress and reproduction laboratory (t. 209)

Publications

Staff

Select the desired year interval:

2024	Genome-wide association study revealed some new candidate genes associated with flowering and maturity time of soybean in Central and West Siberian regions of Russia Perfil`ev R, Shcherban A, Potapov D, Maksimenko K, Kiryukhin S, Gurinovich S, Panarina V, Polyudina R, Salina E Frontiers in Plant Science, 2024, 15:1463121
	Identification of QTLs associated with grain-filling duration and heading date in wheat A.A. Berezhnaya, A.A. Kiseleva, A.I. Stasyuk, I.N. Leonova, E.A. Salina BRAZ J BIOL, 2024, vol. 84, e279154
	Biochemical, Genetic, and Grain Digital Evaluation of Soft Winter Wheat Varieties with Different Germination Index. A.V. Fedyaeva, S.D. Afonnikova, D.A. Afonnikov, O.G. Smirnova, V.N. Deeva, A.I. Pryanishnikov, E.A. Salina RUSS J PLANT PHYSL+, 2024, Volume 71, article number 56
	Identification of novel loci precisely modulating pre-harvest sprouting resistance and red color components of the seed coat in T. aestivum L. Afonnikova S.D., Kiseleva A.A., Fedyaeva A.V., Komyshev E.G., Koval V.S., Afonnikov D.A., Salina E.A. Plants, 2024, т. 13, № 10, с. 1309
	iPSC-derived endothelial cells reveal LDLR dysfunction and dysregulated gene expression profiles in familial hypercholesterolemia Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Arssan M.A., Sleptcov A.A., Nazarenko M.S., Zarubin A.A., Zheltysheva N.V., Shevchenko V.A., Tmoyan N.A., Saaya S.B., Ezhov M.V., Kukharchuk V.V., Parfyonova Ye.V., Zakian S.M. INT J MOL SCI, 2024, 25, 689.
	Влияние стеариновой кислоты на эффективность криоконсервации эмбрионов домашней кошки (Felis silvestris catus) Брусенцев Е.Ю., Окотруб С.В., Лебедева Д.А., Окотруб К.А., Рахманова Т.А., Амстиславский С.Я. Известия РАН. Серия биологическая, 2024, № 1, с. 76–89.
	Program freezing of diapausing embryos in the mouse Amstislavsky S.Ya., Okotrub S.V., Rozhkova I.N., Rakhmanova T.A., Igonina T.N., Brusentsev E.Yu., Kozeneva V.S., Lebedeva D.A., Omelchenko A.N., Okotrub K.A. THERIOGENOLOGY, 2024, 217, 1–10.
	Effects of different types of induced neonatal inflammation on development and behavior of C57BL/6 and BTBR mice Yuliya A. Ryabushkina, Kseniya A. Ayriyants, Anna A. Sapronova, Anastasia S. Mutovina, Maria M. Kolesnikova, Eva V. Mezhlumyan, Natalya P. Bondar, Vasiliy V. Reshetnikov PHYSIOL BEHAV, 2024, Volume 280, 1 June 2024, 114550
	Effect of cryopreservation on Odc1 and RhoA genes expression in diapausing mouse blastocysts Amstislavsky S., Brusentsev E., Lebedeva D., Rozhkova I., Rakhmanova T., Okotrub S., Kozeneva V., Igonina T., Babochkina T. REPROD DOMEST ANIM, 2024, V. 59. e14576.
	Towards Development of the 4C-Based Method Detecting Interactions of Plasmid DNA with Host Genome Alexandra P Yan, Paul A Salnikov, Maria M Gridina, Polina S Belokopytova, Veniamin S Fishman BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2024
	A HGF Mutation in the Familial Case of Primary Lymphedema: A Report Galina Koksharova, Natalia Kokh, Maria Gridina, Rustam Khapaev, Vadim Nimaev, Veniamin Fishman INT J MOL SCI, 2024
	Effects of Chronic Social Stress on the Expression of Neurotransmitter System–associated Genes in the Hypothalamus of Male Mice I. L. Kovalenko, A. G. Galyamina, D. A. Smagin, N. N. Kudryavtseva RUSS J GENET+, 2024, Vol. 60, No. 6, pp. 737–746
	Larval Heat Stress Affects the Lifespan and Stress Resistance of Drosophila melanogaster Adults. E. K. Karpova, E. V. Burdina, V. M. Efimov, N. E. Gruntenko. Adv. Gerontol, 2024, Vol. 13, No. 4, pp. 196–201
	Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks. Artemenko N.V., Genaev M.A., Epifanov R.UI., Komyshev E.G., Kruchinina Y.V., Koval V.S., Goncharov N.P. and Afonnikov D.A. Frontiers in Plant Science, 2024, т. 14, с. 1336192
	Конвейер обработки гиперспектральных изображений на примере исследования зерен ячменя, содержащих меланин. Бусов И.Д., Генаев М.А., Комышев Е.Г., Коваль В.С., Зыкова Т.E., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, т. 28, № 4, С. 443-455
	Влияние гонадотропной стимуляции яичников в условиях хронического психосоциального стресса на качество ооцитов мышей Лебедева Д.А., Игонина Т.Н., Брусенцев Е.Ю., Шавшаева Н.А., Амстиславский С.Я. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2024, том 110, No 6, с. 930–944.
	Митохондриальный геном Eisenia altaica (Lumbricidae, Annelida) П.А. Леонов, Г.В. Юрлова, Т.В. Полубоярова, Г.В. Васильев, А.А. Шипова, Е.В. Голованова, С.В. Шеховцов, К.С. Зубко Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, 2024 год, Том 10, №2, С. 93-98
	Blood Plasma Markers in Depressed Mice under Chronic Social Defeat Stress D.A. Smagin, D.V. Bezryadnov, M.G. Zavialova, A.Yu. Abramova, S.S. Pertsov and N.N. Kudryavtseva Biomedicines, 2024, 2024, 12, 1485
	Computational Reconstruction of the Transcription Factor Regulatory Network Induced by Auxin in Arabidopsis thaliana L. Омельянчук Надежда Анатольевна, Лавреха Виктория Вадимовна, Богомолов Антон Геннадьевич, Долгих Владислав Андреевич, Сидоренко Александра Дмитриевна, Землянская Елена Васильевна Plants, 2024, 13(14), 1905
	Experimental approaches to controlled diapause in mammals Brusentsev E.Yu., Rakhmanova T.A., Rozhkova I.N., Okotrub S.V., Kozeneva V.S., Amstislavsky S.Ya. RUSS J ECOL+, 2024, Vol. 55, No. 4, pp. 308–318.
	Probing metabolism in mouse embryos using Raman spectroscopy and deuterium tags A.N. Omelchenko, K.A. Okotrub, T.N. Igonina, T.A. Rakhmanova, S.V. Okotrub, I.N. Rozhkova, V.S. Kozeneva, S.Ya. Amstislavsky, N.V. Surovtsev SPECTROCHIM ACTA A, 2024
	ИЗМЕНЕНИЕ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВОГО ОТВЕТА В ГИПОТАЛАМУСЕ ЖИВОТНЫХ ПОД ВЛИЯНИЕМ ХРОНИЧЕСКОГО СОЦИАЛЬНОГО СТРЕССА: ДАННЫЕ RNA-seq Галямина А.Г., Коваленко И.Л., Смагин Д.А., Попова Н.А. Medical Immunology, 2024, Т. 26, № 4, стр. 217-224
	Chronic psychosocial stress affects insulin-like growth factor 1 and its receptors in mouse ovaries Tatyana Igonina, Daria Lebedeva, Anton Tsybko, Irina Rozhkova, Tatyana Babochkina, Alisa Levinson and Sergei Amstislavsky REPROD FERT DEVELOP, 2024, 36
	Genotype imputation in human genomic studies Berdnikova AA, Zorkoltseva IV, Tsepilov YA, Elgaeva EE Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, 28(6):628-639
	Liver Fluke-Derived Molecules Accelerate Skin Repair Processes in a Mouse Model of Type 2 Diabetes Mellitus Ковнер А., Капущак Я., Запарина О., Пономарев Д., Пахарукова М. INT J MOL SCI, 2024, 2024, 25(22), 12002
	Идентификация Sr генов возрастной устойчивости в отечественных сортах мягкой пшеницы методом молекулярно-генетического маркирования Е.С. Сколотнева, Ю.В. Лаприна, М.И. Киселева, В.Н. Кельбин, Т.М. Коломиец Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, №3, Том 10, 151-157
2023	Mutant-Huntingtin Molecular Pathways Elucidate New Targets for Drug Repurposing Makeeva V.S., Dyrkheeva N.S., Lavrik O.I., Zakian S.M., Malakhova A.A. INT J MOL SCI, 2023, 24(23), 16798
	Determination of the melanin and anthocyanin content in barley grains by digital image analysis using machine learning methods E.G. Komyshev, M.A. Genaev, I.D. Busov, M.V. Kozhekin, N.V. Artemenko, A.Y. Glagoleva, V.S. Koval, D.A. Afonnikov Vavilov journal of genetics and breeding, 2023
	Impact of Allelic Variation in Maturity Genes E1–E4 on Soybean Adaptation to Central and West Siberian Regions of Russia Perfil’ev R., Shcherban A., Potapov D., Maksimenko K., Kiryukhin S., Gurinovich S., Panarina V., Polyudina R., Salina E. Agriculture, 2023, vol. 13, no. 6: article 1251, https://doi.org/10.3390/agriculture13061251, IF=3.408, Received: 16 May 2023, Revised: 11 June 2023, Accepted: 13 June 2023, Published: 15 June 2023
	Finding needles in a haystack: identification of inter-specific introgressions in wheat genebank collections using low-coverage sequencing data Jens Keilwagen, Heike Lehnert, Ekaterina D. Badaeva, Hakan Özkan, Shivali Sharma, Peter Civan, Benjamin Kilian Frontiers in Plant Science, 2023, Front. Plant Sci., Volume 14, Article 1166854, Q1, RECEIVED 15 February 2023, ACCEPTED 02 May 2023, PUBLISHED 06 June 2023
	On the role of serotonin 5-HT1A receptor in autistic-like behavior: сross talk of 5-HT and BDNF systems Elena M. Kondaurova , Irina I. Belokopytova , Elisabeth A. Kulikova , Nikita V. Khotskin , Tatiana V. Ilchibaeva , Anton S. Tsybko , Nina K. Popova , Vladimir S. Naumenko BEHAV BRAIN RES, 2023, 438 (2023) 114168
	ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА ПРОРАСТАНИЕ ЗЕРНА НА КОРНЮ У МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ (TRITICUM AESTIVUM L.), И МЕТОДЫ ИХ ОЦЕНКИ А.В. Федяева, Е.А. Салина, В.К. Шумный Генетика, 2023, T. 59, № 1, стр. 5-17, DOI: 10.31857/S0016675823010058
	Эффекты вспомогательных репродуктивных технологий на социальное поведение мышей линии BTBR – модели расстройств аутистического спектра Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Брусенцев Е.Ю., Игонина Т.Н., Рахманова Т.А., Лебедева Д.А., Яцук Т.А., Козенева В.С., Напримеров В.А., Амстиславский С.Я. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2023, Т. 109. № 3. С. 315–333.
	Влияние культивирования in vitro и переноса эмбрионов на плотность нейронов и нейрогенез в головном мозге мышей линии С57BL/6J Брусенцев Е.Ю., Игонина Т.Н., Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Лебедева Д.А., Владимирова Е.В., Козенева В.С., Амстиславский С.Я. Нейрохимия, 2023, Т. 40, № 3, С. 223–233.
	Elucidation of the Landscape of Alternatively Spliced Genes and Features in the Dorsal Striatum of Aggressive/Aggression-Deprived Mice in the Model of Chronic Social Conflicts. Babenko, V. Redina, O. Smagin, D. Kovalenko, I. Galyamina, A. Kudryavtseva, N. Genes, 2023, 14:599
	A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells Anna Khabarova, Galina Koksharova, Pavel Salnikov, Polina Belokopytova, Roman Mungalov, Inna Pristyazhnuk, Artem Nurislamov, Maria Gridina, Veniamin Fishman CHROMOSOME RES, 2023
	Short Interrupted Repeat Cassette (SIRC)—Novel Type of Repetitive DNA Element Found in Arabidopsis thaliana Gorbenko I.V., Petrushin I.S., Shcherban A.B., Orlov Yu.L., Konstantinov Yu.M. INT J MOL SCI, 2023, 24(13), 11116
	Анализ поведения и плотности нейронов в головном мозге мышей B6.CG-TG(PRNP-SNCA*A53T)23MKLE/J – модели болезни Паркинсона Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Брусенцев Е.Ю., Рахманова Т.А., Лебедева Д.А., Козенева В.С., Хоцкин Н.В., Амстиславский С.Я. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2023, Т. 109, № 9, С. 1199–1216.
	Curcumin and Its Supramolecular Complex with Disodium Glycyrrhizinate as Potential Drugs for the Liver Fluke Infection Caused by Opisthorchis felineus Maria N Lvova, Denis V Ponomarev, Alena A Tarasenko, Anna V Kovner, Galina A Minkova, Michail A Tsyganov, Meijun Li, Yan Lou, Veronica I Evseenko, Alexander V Dushkin, Irina V Sorokina, Tatiana G Tolstikova, Viatcheslav A Mordvinov, Damira F Avgustinovich Pathogens, 2023, 12(6):819
	Analysis of the Structural Organization and Expression of the Vrn-D1 Gene Controlling Growth Habit (Spring vs. Winter) in Aegilops tauschii Coss. Chepurnov G.Y., Ovchinnikova E.S., Blinov A.G., Chikida N.N., Belousova M.Kh., Goncharov N.P. Plants, 2023, V.12, P.3596.
	Reconstruction of the regulatory hypermethylation network controlling hepatocellular carcinoma development during hepatitis C viral infection Evgeniya A. Antropova, Tamara M. Khlebodarova, Pavel S. Demenkov, Anastasiia R. Volianskaia, Artur S. Venzel, Nikita V. Ivanisenko, Alexandr D. Gavrilenko, Timofey V. Ivanisenko, Anna V. Adamovskaya, Polina M. Revva, Nikolay A. Kolchanov, Inna N. Lavrik and Vladimir A. Ivanisenko J INTEGR BIOINFORM, 2023
	Реконструкция и анализ регуляторной генной сети функционирования клеточной стенки листьев Arabidopsis thaliana L. при ответе на водный дефицит A.R. Volyanskaya, E.A. Antropova, U.S. Zubairova, P.S. Demenkov, A.S. Venzel, Y.L. Orlov, A.A. Makarova, T.V. Ivanisenko, T.A. Gorshkova, A.R. Aglyamova, N.A. Kolchanov, M. Chen, V.A. Ivanisenko Vavilov journal of genetics and breeding, 2023
	Serotonin Receptors as a Potential Target in the Treatment of Alzheimer’s Disease Dmitrii V. Eremin, Elena M. Kondaurova, Aleksander Ya. Rodnyy, Camilla A. Molobekova , Dmitrii A. Kudlay and Vladimir S. Naumenko BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2023, Vol. 88, Nos. 12-13, pp. 2023-2042
	КОРРЕЛЯЦИОННЫЕ СВЯЗИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА МАРКЕРА РАКА ЛЁГКИХ Eno2 И ГЕНОВ КАНЦЕРОГЕНЕЗА И АПОПТОЗА В ГИПОТАЛАМУСЕ МЫШЕЙ С ДЕПРЕССИВНОПОДОБНЫМ ПОВЕДЕНИЕМ Галямина А.Г., Коваленко И.Л., СмагинД.А., Кудрявцева Н.Н. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2023, Том 176, № 11 С.632-637
	Cytological Analysis of Crossover Frequency and Distribution in Male Meiosis of Cardueline Finches (Fringillidae, Aves). Grishko, E. Malinovskaya, L. Slobodchikova, A. Kotelnikov, A. Torgasheva, A. Borodin, P. Animals, 2023, 13, 3624.
	Получение линий индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi022-A-3, ICGi022-A-4 и ICGi022-A-5 с внесенной в ген MYBPC3 с помощью системы CRISPR/Cas9 мутацией p.Asn515del Павлова С.В., Шаяхметова Л.Ш., Проняева К.А., Шульгина А.Е., Закиян С.М., Дементьева Е.В. RUSS J DEV BIOL+, 2023, Т. 54, № 1, С. 105–113
	Effect of Expression of the NDB2 Heterologous Gene of Arabidopsis thaliana on Growth and Respiratory Activity of Nicotiana tabacum N. E. Korotaeva, A. M. Shigarova, A. I. Katyshev, I. V. Fedoseeva, A. V. Fedyaeva, D. V. Sauchyn, A. M. Shyshlova-Sokolovskaya, O. Yu. Urbanovich, G. B. Borovskii RUSS J PLANT PHYSL+, 2023, Т. 70. – №. 5. – С. 93.
	Длительное воздействие короткого светового дня и ингибитора триптофангидроксилазы на поведение и серотониновую систему мозга Danio rerio И.Е.Сорокин, В.С.Евсюкова, А.Б.Арефьева, В.В.Сачкова, П.А.Куликов, А.В.Куликов Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2023, Т. 175 (6), с. 778-785
2022	Noncoding rare variants in PANX3 are associated with chronic back pain Nadezhda M Belonogova, Anatoly V Kirichenko, Maxim B Freidin, Frances M K Williams, Pradeep Suri, Yurii S Aulchenko, Tatiana I Axenovich, Yakov A Tsepilov PAIN, 2022, DOI: 10.1097/j.pain.0000000000002781
	Dissection of Structural Reorganization of Wheat 5B Сhromosome Associated With Interspecies Кecombination Suppression Elena Salina, Alexander Muterko, Antonina Kiseleva, Zhiyong Liu, Abraham Korol Frontiers in Plant Science, 2022, Volume 13, Article 884632
	Detecting major introgressions in wheat and their putative origins using coverage analysis Jens Keilwagen, Heike Lehnert, Thomas Berner, Ekaterina Badaeva, Axel Himmelbach, Andreas Börner, Benjamin Kilian SCI REP-UK, 2022, volume 12, Article number: 1908
	Metabolomic Analysis Reveals That the Moor Frog Rana arvalis Uses Both Glucose and Glycerol as Cryoprotectants Sergei V. Shekhovtsov, Nina A. Bulakhova, Yuri P. Tsentalovich, Ekaterina A. Zelentsova, Ekaterina N. Meshcheryakova, Tatiana V. Poluboyarova, Daniil I. Berman Animals, 2022, 12(10), 1286
	De novo assembly and analysis of the transcriptome of the Siberian wood frog Rana amurensis D.N. Smirnov, S.V. Shekhovtsov, A.A. Shipova, G.R. Gazizova, E.I. Shagimardanova, N.A. Bulakhova, E.N. Meshcheryakova, T.V. Poluboyarova, E.E. Khrameeva, S.E. Peltek, D.I. Berman Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, Т. 26. – №. 1. – С. 109.
	Estimating range disjunction time of the Palaearctic Admirals (Limenitis L.) with COI and histone H1 genes Solovyev V.I., Dubatolov V.V., Vavilova V.Y., Kosterin O.E. ORG DIVERS EVOL, 2022
	Effects of the Cc2d1a/Freud-1 Knockdown in the Hippocampus of BTBR Mice on the Autistic-Like Behavior, Expression of Serotonin 5-HT1A and D2 Dopamine Receptors, and CREB and NF-κB Intracellular Signaling Irina I. Belokopytova, Elena M. Kondaurova, Elizabeth A. Kulikova, Tatiana V. Ilchibaeva, Vladimir S. Naumenko, and Nina K. Popova1 BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2022, Vol. 87, No. 10, pp. 1206-1218 © Pleiades Publishing, Ltd., 2022.
	Дисфункция генов, ассоциируемых с канцерогенезом и апоптозом, развивающаяся в гипоталамусе самцов мышей под влиянием хронического социального стресса Галямина А.Г., Смагин Д.А., Коваленко И.Л., Редина О.Е., Бабенко В.Н., Кудрявцева Н.Н. Биохимия, 2022, т.87, №9, с. 1318-1333
	The Dysfunction of Carcinogenesis- and Apoptosis-Associated Genes that Develops in the Hypothalamus under Chronic Social Defeat Stress in Male Mice Anna G. Galyamina, Dmitry A. Smagin, Irina L. Kovalenko, Olga E. Redina, Vladimir N. Babenko, and Natalia N. Kudryavtseva Biochemistry (Moscow). Suppl B., 2022, Vol. 87, No. 9, pp. 1050-1064
	Mlig-SKP1 gene is required for spermatogenesis in the flatworm Macrostomum lignano Biryukov M., Dmitrieva A., Vavilova V., Ustyantsev K., Bazarova E., Sukhikh I., Berezikov E., Blinov A. INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 15110
	Single-Cell DNA Methylation Analysis of Chicken Lampbrush Chromosomes Artem Nurislamov, Timofey Lagunov, Maria Gridina, Alla Krasikova, Veniamin Fishman INT J MOL SCI, 2022, 23(20):12601
	Generation of iPS cell line (ICGi040-A) from skin fibroblasts of a patient with ring small supernumerary marker chromosome 4 M.M.Gridina, A.R.Nurislamov, J.M.Minina, M.E.Lopatkina, G.V.Drozdov, S.A.Vasilyev, L.I.Minaycheva, E.O.Belyaeva, T.V.Nikitina, A.A.Kashevarova, I.N.Lebedev, T.V.Karamysheva, N.B.Rubtsov, O.L.Serov STEM CELL RES, 2022, 61, 102740
	Митохондрии и гибель клеток суспензионной культуры Saccharum officinarum L. при отрицательной температуре Любушкина И. В., Степанов А. В., Федяева А. В., Федосеева И. В., Побежимова Т. П., Грабельных О. И. Физиология растений, 2022
2021	Allelic Variation Analysis at the Vernalization Response and Photoperiod Genes in Russian Wheat Varieties Identified Two Novel Alleles of Vrn-B3 Berezhnaya A., Kiseleva A., Leonova I., Salina E. Biomolecules, 2021, 11(12), 1897; https://doi.org/10.3390/biom11121897, IF=4.879, Q2
	Features of transcriptional dynamics of the duplicated Vernalization-B1 gene in wheat (Triticum spp.) Muterko A., Salina E. Plant Breeding, 2021, 140(6), 1023–1031
	Targeting the B1 Gene and Analysis of Its Polymorphism Associated with Awned/Awnless Trait in Russian Germplasm Collections of Common Wheat Shcherban A.B., Kuvaeva D.D., Mitrofanova O.P., Khverenets S.E., Pryanishnikov A.I., Salina, E.A. Plants, 2021, 10(11), 2285
	Introducing Beneficial Alleles from Plant Genetic Resources into the Wheat Germplasm Sharma S., Schulthess A.W., Bassi F.M., Badaeva E.D., Neumann K., Graner A., Özkan H., Werner P., Knüpffer H., Kilian B. Biology, 2021, 10(10), 982. https://doi.org/10.3390/biology10100982
	Разработка панели маркеров для генотипирования отечественных сортов сои по генам, контролирующим срок вегетации и реакцию на фотопериод Перфильев Р.Н., Щербань А.Б., Салина Е.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(7):761-769
	Biochemical response to freezing in the Siberian salamander Salamandrella keyserlingii Shekhovtsov S.V., Bulakhova, N.A., Tsentalovich Y.P., Zelentsova E.A., Meshcheryakova E.N., Poluboyarova T.V., Berman, D.I. Biology, 2021, V. 10. I. 11. no. 1172.
	Повышенные температуры вызывают образование АФК и нарушения дыхания в клетках суспензионной культуры Saccharum officinarum Любушкина, И. В., Федяева, А. В., Степанов, А. В., Грабельных, О. И. Журнал Сибирского федерального университета. Биология, 2021
	Характеристика суспензионных культур клеток Arabidopsis thaliana (L.) Heynh с изменённой экспрессией гена альтернативной оксидазы митохондрий АOX1a и анализ их морозоустойчивости А. В. Степанов, С. А. Кашин, Н. С. Забанова, О. А. Федотова, А. В. Федяева, И. В. Любушкина,Т. П. Побежимова, О. И. Грабельных Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология», 2021
	АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ В КЛЕТКАХ СУСПЕНЗИОННОЙ КУЛЬТУРЫ ARABIDOPSIS THALIANA С ПОНИЖЕННОЙ ЭКСПРЕССИЕЙ ГЕНА NDB2 Fedoseeva I., Katyshev A., Fedyaeva A., Stepanov A., Borovskii G. Sib J Life Sci Agric, 2021
2018	Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak Archaeological and Anthropological Sciences, 2018, Vol. 10, Issue 7, P. 1557-1570.
2017	Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016	Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56 (II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия) А.С. Пилипенко, В.И. Молодин, Р.О. Трапезов, С.В. Черданцев, А.А. Журавлев Археология, этнография и антропология Евразии, 2016, Том 44, № 4, С. 141-149
2011	Protein Structure Discovery: пакет программ для решения задач компьютерной протеомики Иванисенко В. А., Деменков П. С., Иванисенко Т. В., Колчанов Н. А. Биоорганическая химия, 2011, 2011, Т. 37, № 1, С. 22–35
	Application of the ANDCell Computer System to Reconstruction and Analysis of Associative Networks Describing Potential Relationships between Myopia and Glaucoma O. A. Podkolodnaya, E. E. Yarkova, P. S. Demenkov, O. S. Konovalova, V. A. Ivanisenko, and N. A. Kolchanov Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, 2011, Vol. 1, No. 1, pp. 21–28.
	Извлечение знаний из текстов научных публикаций и создание баз знаний в области нанобиотехнологии В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов Российские нанотехнологии, 2011, 2011 . Т. 6 № 7- 8, с. 14-21.
	PROMEDIA – база данных химических соединений, потенциальных биомаркеров заболеваний, имеющих значение для неинвазивной диагностики Сайк О.В., Мошкин М.П., Балдин М.Н., Грузнов В.М., Козлов В.А., Самороков С.Н., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2011, №2, Т.6, С.250-263
	Предсказание аллергенности белков с использованием информации о конформационных пептидах А.О. Брагин, П.С. Деменков, В.А. Иванисенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, 2011. Т. 15. № 3. С. 462-468.
	Protein Structure Discovery: software package to perform computational proteomics tasks Ivanisenko VA, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Kolchanov NA RUSS J BIOORG CHEM+, 2011, Jan-Feb;37(1):22-35.
2010	Использование компьютерной системы ANDCell для реконструкции и анализа ассоциативных сетей потенциальных механизмов взаимосвязи миопии и глаукомы О.А.Подколодная, Е.Э. Яркова, П.С.Деменков, О.С.Коновалова,. В.А.Иванисенко, Н.А.Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14, № 1. — С. 106–115.
	Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R J INTEGR BIOINFORM, 2010, 7(1):148. doi: 10.2390/biecoll-jib-2010-148
	Веб-ориентированная система построения и исполнения комплексных запросов к реляционным источникам биологической информации на основе семантической формализации структуры данных Коротков Р.О., Деменков П.С., Иванисенко В.А. Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2010, Т. 8. № 3. С. 13-22.
	База данных химических соединений, имеющих потенциальное значение для неинвазивной диагностики заболеваний Сайк О.В., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Мошкин М.П., Иванисенко В.А. В мире научных открытий, 2010, №4 (10), Часть 14. С. 102-103
2009	Анализ распределения аденозин-фосфат связывающих сайтов белков на экзонной структуре гена Медведева И. В., Деменков П. С., Иванисенко В. А. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Том 13, №1, стр. 122-127
2008	Associative Network Discovery (AND) компьютерная система для автоматической реконструкции сетей ассоциативных знаний о молекулярно-генетических взаимодействиях П.С. Деменков, Е.Э. Аман, В.А. Иванисенко Вычислительные технологии, 2008, 2, 13, 15-19
2006	Prediction of the Changes in Thermodynamic Stability of Proteins Caused by Single Amino Acid Substitutions Demenkov P.S., Aman E.E., Ivanisenko V.A. BIOPHYSICS, 2006, т. 51, выпуск N7
2004	Обнаружение эмпирической аксиоматической теории в условиях шумов. Деменков П.С. Вычислительные системы, 2004
	Inheritance and chromosomal location of the genes for long glume phenotype found in Portuguese landraces of hexaploid wheat, ‘Arrancada’ Watanabe N., Goncharoiv N.P., Bannikova S.V. Journal of Genetics and Breeding, 2004, Vol. 58. P.273-278.

Accounting System of Scientific Activity (ASSA)

Laboratories Russian Science Foundation

Departments

Former employees

Plurals