Система учета научной деятельности (ASSA)

Вход

Отделение "Курчатовский геномный центр ИЦиГ СО РАН"(т.157)

Научные подразделения

Салина Елена Артемовна
[главный научный сотрудник]

Научные результаты

Сотрудники

Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода:

Публикации Монографии Конференции Гранты Научное руководство Учебные курсы Патенты

Публикации

2023	Identification of genetic loci for early maturity in spring bread wheat using the association analysis and gene dissection Antonina A. Kiseleva, Irina N. Leonova, Elena V. Ageeva, Ivan E. Likhenko, Elena A. Salina PeerJ, 2023, 11:e16109 DOI 10.7717/peerj.16109
	Population Structure and Genetic Diversity of the 175 Soybean Breeding Lines and Varieties Cultivated in West Siberia and Other Regions of Russia Nadezhda A. Potapova, Alexander S. Zlobin, Roman N. Perfil’ev, Gennady V. Vasiliev, Elena A. Salina, Yakov A. Tsepilov Plants, 2023, 12(19), 3490, https://doi.org/10.3390/plants12193490
	Характеристика синтетической линии пшеницы – потенциального источника хозяйственно ценных признаков И.Г. Адонина, М.В. Зорина, С.П. Мехдиева, И.Н. Леонова, Е.Г. Комышев, Е.М. Тимонова, Е.А. Салина Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2023, Т.9,№3,С.117-125
	Novel Genetic Loci from Triticum timopheevii Associated with Gluten Content Revealed by GWAS in Wheat Breeding Lines Irina N. Leonova, Antonina A. Kiseleva, Alina A. Berezhnaya, Olga A. Orlovskaya, Elena A. Salina INT J MOL SCI, 2023, 24, 13304 https:// doi.org/10.3390/ijms241713304 (registering DOI)
	Multivariate Genome-Wide Association Study of Concentrations of Seven Elements in Seeds Reveals Four New Loci in Russian Wheat Lines Nadezhda A. Potapova, Anna N. Timoshchuk, Evgeny S. Tiys, Natalia A. Vinichenko, Irina N. Leonova, Elena A. Salina, Yakov A. Tsepilov Plants, 2023, 12, 3019 https:// doi.org/10.3390/plants12173019 Received: 25 July 2023 Revised: 11 August 2023 Accepted: 19 August 2023 Published: 22 August 2023
	Impact of Allelic Variation in Maturity Genes E1–E4 on Soybean Adaptation to Central and West Siberian Regions of Russia Perfil’ev R., Shcherban A., Potapov D., Maksimenko K., Kiryukhin S., Gurinovich S., Panarina V., Polyudina R., Salina E. Agriculture, 2023, vol. 13, no. 6: article 1251, https://doi.org/10.3390/agriculture13061251, IF=3.408, Received: 16 May 2023, Revised: 11 June 2023, Accepted: 13 June 2023, Published: 15 June 2023
	Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia Dmitry I. Karetnikov, Gennady V. Vasiliev, Stepan V. Toshchakov, Nikolay A. Shmakov, Mikhail A. Genaev, Mikhail A. Nesterov, Salmaz M. Ibragimova, Daniil A. Rybakov, Tatjana A. Gavrilenko, Elena A. Salina, Maxim V. Patrushev, Alex V. Kochetov and Dmitry A. Afonnikov INT J MOL SCI, 2023, v. 24, p. 5713
	SSR variability of stem rust pathogen on spring bread wheat in Russia Skolotneva E.S., Kosman E., Kelbin V.N., Morozova E.V., Laprina Yu.V., Baranova O.A., Kolomiets T.M., Kiseleva M.I., Sergeeva E.M., Salina E.A. PLANT DIS, 2023, https://doi.org/10.1094/PDIS-10-22-2373-RE PMID: 36265157, Vol. 107, No. 2: 493-499 February 2023
	Heterologous Expression of Extracellular Proteinase pAsPs of Aspergillus pseudotamarii in Komagataella phaffii. Zadorozhny AV, Voskoboev ME, Bochkov DV, Rozanov AS, Shedko ED, Mescheryakova IA, Blinov AG, Korzhuk AV, Shlyakhtun VN, Bogacheva NV, Antonov EV, Bannikova SV, Goryachkovskaya TN, Peltek SE INT J MOL SCI, 2023, International Journal of Molecular Sciences. 2022; 23(23):15035.
	Клонирование и экспрессия гена маннаназы Thermothielavioides terrestris в Komagataella phaffii Задорожный А.В., Павлова Е.Ю., Ушаков В.С., Богачева Н.В., Шляхтун В.Н., Розанов А.С., Воскобоев M.E., Коржук А.В., Новикова Д.С., Банникова С.В., Мещерякова И.А., Васильева А.Р., Брянская А.В., Бочков Д.В., Шипова А.А., Горячковская Т.Н., Пельтек С.Е. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2023, 2022 Т. 8, № 4. С. 344–351
	Differentially expressed genes and molecular susceptibility to human age-related diseases Shikhevich S, Chadaeva I, Khandaev B, Kozhemyakina R, Zolotareva K, Kazachek A, Oshchepkov D, Bogomolov A, Klimova NV, Ivanisenko VA, Demenkov P, Mustafin Z, Markel A, Savinkova L, Kolchanov NA, Kozlov V, Ponomarenko M INT J MOL SCI, 2023, 4, 24, 3996
	ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА ПРОРАСТАНИЕ ЗЕРНА НА КОРНЮ У МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ (TRITICUM AESTIVUM L.), И МЕТОДЫ ИХ ОЦЕНКИ А.В. Федяева, Е.А. Салина, В.К. Шумный Генетика, 2023, T. 59, № 1, стр. 5-17, DOI: 10.31857/S0016675823010058
	Молекулярные маркеры адаптации к холодному климату у крупного рогатого скота Н.С. Юдин, А.В. Игошин, Д.М. Ларкин Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2023
	The mitochondrial genome of Dendrobaena tellermanica Perel, 1966 (Annelida: Lumbricidae) and its phylogenetic position Shekhovtsov S. V., Vasiliev G. V., Latif R., Poluboyarova T. V., Peltek S. E., Rapoport I. B. Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(2):146-152
	MORPHOLOGICAL AND GENETIC ANALYSIS OF DENDRODRILUS RUBIDUS (BIMASTOS RUBIDUS)(OLIGOCHAETA, LUMBRICIDAE) IN RUSSIA AND BELARUS Ermolov S. A., Shekhovtsov S. V., Geraskina A. P., Derzhinsky E. A., Kotsur V. M., Poluboyarova T. V., Peltek S. E. Rus J Ecosystem Ecol, 2023, 8(1), 15-27
	Candidate SNP markers significantly altering the affinity of TATA-binding protein for the promoters of human hub genes for atherogenesis, atherosclerosis and atheroprotection. Bogomolov A, Filonov S, Chadaeva I, Rasskazov D, Khandaev B, Zolotareva K, Kazachek A, Oshchepkov D, Ivanisenko VA, Demenkov P, Podkolodnyy N, Kondratyuk E, Ponomarenko P, Podkolodnaya O, Mustafin Z, Savinkova L, Kolchanov N, Tverdokhleb N, Ponomarenko M. INT J MOL SCI, 2023, 10, 24, 9010
	Первичная и вторичная микро-РНК модуляция внешнего пути апоптоза при гепатоцеллюлярной карциноме Хлебодарова Т.М., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Антропова Е.А., Лаврик И.Н., Иванисенко В.А. Молекулярная биология, 2023, 57(2):166–177
	ICAnnoLncRNA: A Snakemake Pipeline for a Long Non-Coding-RNA Search and Annotation in Transcriptomic Sequences Пронозин Артем Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич Genes, 2023, 14(7), 1331
	A Multibreed Genome-Wide Association Study for Cattle Leukocyte Telomere Length Alexander V. Igoshin, Nikolay S. Yudin, Grigorii A. Romashov, Denis M. Larkin Genes, 2023
	База знаний RatDEGdb по дифференциально экспрессирующимся генам крысы как модельного объекта биомедицинских исследований Чадаева И.В., Филонов С.В., Золотарева К.А., Хандаев Б.М., Ершов Н.И., Подколодный Н.Л., Кожемякина Р.В., Рассказов Д.А., Богомолов А.Г., Кондратюк Е.Ю., Климова Н.В., Шихевич С.Г., Рязанова М.А., Федосеева Л.А., Редина О.Е., Кожевникова О.С., Стефанова Н.А., Колосова Н.Г., Маркель А.Л., Пономаренко М.П., Ощепков Д.Ю. Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(7):794-806.
	Молекулярно-генетические пути регуляции вирусом гепатита С экспрессии клеточных факторов PREB и PLA2G4C, играющих важную роль для репликации вируса Е.Л. Мищенко, А.А. Макарова, Е.А. Антропова, А.С. Вензель, Т.В. Иванисенко, П.С. Деменков, В.А. Иванисенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(7):776-783
	Создание скороспелых линий сои (GLYCINE MAX (L.) MERR.) в условиях Западной Сибири Потапов Д.А. Перфильев Р.Н. Максименко К.В. Щербань А.Б. Полюдина Р.И. Салина Е.А. Агронаука, 2023
	Accurate noise-robust classification of Bacillus species from MALDI-TOF MS spectra using a denoising autoencoder Yulia E. Uvarova, Pavel S. Demenkov, Irina N. Kuzmicheva, Artur S. Venzel, Elena L. Mischenko, Timofey V. Ivanisenko, Vadim M. Efimov, Svetlana V. Bannikova, Asya R. Vasilieva, Vladimir A. Ivanisenko and Sergey E. Peltek J INTEGR BIOINFORM, 2023
	Reconstruction of the regulatory hypermethylation network controlling hepatocellular carcinoma development during hepatitis C viral infection Evgeniya A. Antropova, Tamara M. Khlebodarova, Pavel S. Demenkov, Anastasiia R. Volianskaia, Artur S. Venzel, Nikita V. Ivanisenko, Alexandr D. Gavrilenko, Timofey V. Ivanisenko, Anna V. Adamovskaya, Polina M. Revva, Nikolay A. Kolchanov, Inna N. Lavrik and Vladimir A. Ivanisenko J INTEGR BIOINFORM, 2023
2022	Metagenomic insights into the uncultured diversity and metabolism of the microbial communities in hypersaline lake Bryanskaya A.V., Shipova A.A., Rozanov A.S., Volkova O.A., Lazareva E.V., Uvarova Y.E., Goryachkovskaya T.N., Peltek S.E. Biology, 2022, 11(4):605.
	Bioinformatic Assessment of Factors Affecting the Correlation between Protein Abundance and Elongation Efficiency in Prokaryotes Aleksandra E. Korenskaia, Yury G. Matushkin, Sergey A. Lashin, Alexandra I. Klimenko INT J MOL SCI, 2022, Т. 23. № 19. С. 11996.
	Causal effects of psychosocial factors on chronic back pain: a bidirectional Mendelian randomisation study Frances M K Williams, Elizaveta E Elgaeva, Maxim B Freidin, Olga O Zaytseva, Yurii S Aulchenko, Yakov A Tsepilov, Pradeep Suri EUR SPINE J, 2022, 2022 Jul;31(7):1906-1915
	Dissection of Structural Reorganization of Wheat 5B Сhromosome Associated With Interspecies Кecombination Suppression Elena Salina, Alexander Muterko, Antonina Kiseleva, Zhiyong Liu, Abraham Korol Frontiers in Plant Science, 2022, Volume 13, Article 884632
	Functional characterization of genes with daily expression patterns in common wheat Antonina A. Kiseleva, Mariya K. Bragina, Aleksandr F. Muterko, Elena A. Salina PLANT MOL BIOL, 2022, 109, 135–146
	Identification of QTLs for Grain Protein Content in Russian Spring Wheat Varieties Leonova I.N., Kiseleva A.A., Berezhnaya A.A., Stasyuk A.I., Likhenko I.E., Salina, E.A. Plants, 2022, 11(3), 437
	Computer analysis of the relation between hydrogen bond stability in SOD1 mutants and the survival time of amyotrophic lateral sclerosis patients Alemasov, N. A., Timofeev, V. S., Ivanisenko, N. V., Kolchanov, N. A., & Ivanisenko, V. A. J MOL GRAPH MODEL, 2022
	Diversity of stem rust resistance in modern Siberian bread wheat (Triticum aestivum) germplasm Vasiliy N. Kelbin, Ekaterina S. Skolotneva, Vladimir P. Shamanin, Elena A. Salina Plant Breeding, 2022, Volume141, Issue2 Pages 194-203 First published: 20 January 2022
	Relationship between the characteristics of bread wheat grains, storage time and germination Dmitry A. Afonnikov. Evgenii G. Komyshev, Vadim M. Efimov, Mikhail A. Genaev, Vasily S. Koval, Peter U. Gierke and Andreas Börner Plants, 2022, v. 11, p. 35
	Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network Mikhail A. Genaev, Evgenii G. Komyshev, Olga D. Shishkina, Natalya V. Adonyeva, Evgenia K. Karpova, Nataly E. Gruntenko, Lyudmila P. Zakharenko, Vasily S. Koval and Dmitry A. Afonnikov Mathematics, 2022, v. 10, p. 295
	Клонирование и экспрессия гена целлюлазы Penicillium sp. “occitanis” в K. phaffii T07, выделение и анализ свойств. Розанов А.С., Воскобоев М., Богачева Н.В., Коржук А.В., Шляхтун В.Н., Мещерякова И.А., Романцев В.А., Бочков Д.В., Задорожный А., Пельтек С.Е. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2022
	Variability of leaf pubescence characteristics in transgenic tobacco lines with partial proline dehydrogenase gene suppression. S.M. Ibragimova, M.A. Genaev, A.V. Kochetov, D.A. Afonnikov BIOL PLANTARUM, 2022, 66:24-28
	Изучение влияния чужеродных транслокаций на показатели андрогенеза in vitro у линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.) Тимонова Е.М., Адонина И.Г., Салина Е.А. Тр. по прикл. ботанике, генетике и селекции, 2022, 183(1):127-134
	Сравнительный анализ частот ДНК-полиморфизмов, ассоциированных с заболеваниями и хозяйственно важными признаками, в геномах российских и зарубежных пород крупного рогатого скота А.В. Игошин, Г.А. Ромашов, Е.Н. Черняева, Н.П. Елаткин, Н.C. Юдин, Д.M. Ларкин Vavilov journal of genetics and breeding, 2022
	Resequencing the Yaroslavl cattle genomes reveals signatures of selection and a rare haplotype on BTA28 likely to be related to breed phenotypes Ruvinskiy D.E., Igoshin A.V., Yurchenko A.A., Ilina A.V., Larkin D.M. ANIM GENET, 2022
	Метаболизм крахмала у картофеля Solanum tuberosum L. Сергеева Е.М., Ларичев К.Т., Салина Е.А., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, Том 26, № 3: 250-263
	QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color Characteristics Estimated by Digital Image Processing Mian Abdur Rehman Arif, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Vasily S. Koval, Nikolay A. Shmakov, Andreas Börner and Dmitry A. Afonnikov Plants, 2022, v. 11, article 2105.
	CRISPR/Cas9-induced modification of a conservative promoter region of VRN-A1 alters the heading time of hexaploid bread wheat Dmitry Miroshnichenko, Vadim Timerbaev, Anna Klementyeva, Alexander Pushin, Tatiana Sidorova, Dmitry Litvinov, Lubov Nazarova, Olga Shulga, Mikhail Divashuk, Gennady I. Karlov, Elena Salina, Sergey Dolgov Frontiers in Plant Science, 2022, Sec. Plant Biotechnology Received:19 Sep 2022; Accepted: 04 Nov 2022. ISSN 1664-462X
	Plasma metabolomics and gene regulatory networks analysis reveal the role of nonstructural SARS-CoV-2 viral proteins in metabolic dysregulation in COVID-19 patients V. A. Ivanisenko, E. V. Gaisler, N. V. Basov, A. D. Rogachev, S. V. Cheresiz, T. V. Ivanisenko, P. S. Demenkov, E. L. Mishchenko, O. P. Khripko, Yu. I. Khripko, S. M. Voevoda, T. N. Karpenko, A. J. Velichko, M. I. Voevoda, N. A. Kolchanov, A. G. Pokrovsky SCI REP-UK, 2022, 12, 19977
	The New Version of the ANDDigest Tool with Improved AI-Based Short Names Recognition Timofey V. Ivanisenko, Pavel S. Demenkov, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 14934
	Easy and Effective Method for Extracting and Purifying Wolbachia Genomic DNA Andreenkova O.V., Shishkina O.D., Klimenko A.I., Korenskaia A.E., Bobrovskikh M.A., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E. INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 15315
	New Wolbachia pipientis Genotype Increasing Heat Stress Resistance of Drosophila melanogaster Host Is Characterized by a Large Chromosomal Inversion Korenskaia A.E., Shishkina O.D., Klimenko A.I., Andreenkova O.V., Bobrovskikh M.A., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E. INT J MOL SCI, 2022, 23(24), 16212
	РАЗРАБОТКА И ВНЕДРЕНИЕ КОМПЛЕКСА СЕЛЕКЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ТЕХНОЛОГИЙ И СОЗДАНИЕ НА ИХ ОСНОВЕ СОРТОВ ЗЕРНОВЫХ КУЛЬТУР, АДАПТИРОВАННЫХ К РАЗЛИЧНЫМ ЭКОЛОГИЧЕСКИМ ЗОНАМ Салина Елена Артемовна, Леонова Ирина Николаевна, Щербань Андрей Борисович, Шоева Олеся Юрьевна, Лихенко Иван Евгеньевич, Советов Владимир Викторович, Лихенко Надежда Николаевна, Орлова Елена Арнольдовна, Григорьев Юрий Николаевич Наука и Технологии Сибири, 2022, № 4 (7): 96-98 ISSN: 2782-4969
	Specific features of the proteomic response of thermophilic bacterium Geobacillus icigianus to terahertz irradiation. Bannikova S.V., Khlebodarova T.M., Vasilieva A., Meshcheryakova I.A., Bryanskaya A.V., Shedko E., Popik V.M., Goryachkovskaya T.N., Peltek S.E. INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 15216
	Компьютерный анализ особенностей регуляции гиперметилированных маркерных генов гепатокарциномы вирусными белками гепатита С. Антропова Е.А., Хлебодарова Т.М., Деменков П.С., Вензель А.С., Иванисенко Н.В., Гавриленко А.Д., Иванисенко Т.В., Адамовская А.В., Ревва П.М., Лаврик И.Н., Иванисенко В.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, 26(8):733-742
	Computer analysis of regulation of hepatocarcinoma marker genes hypermethylated by HCV proteins. Antropova E.A., Khlebodarova T.M., Demenkov P.S., Venzel A.S., Ivanisenko N.V., Gavrilenko A.D., Ivanisenko T.V., Adamovskaya A.V., Revva P.M., Lavrik I.N., Ivanisenko V.A. Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, 26(8):733-742
	Heterologous Expression of Xylanase xAor from Aspergillus oryzae in Komagataella phaffii T07 Zadorozhny A.V., Ushakov V.S., Rozanov A.S., Bogacheva N.V., Shlyakhtun V.N., Voskoboev M.E., Korzhuk A.V., Romanchev V.A., Bannikova S.V., Mescheryakova I.A., Antonov E.V., Vasilieva A.R., Pavlova E.I., Chesnokov D.O., Shedko E.D., Bryanskaya A.V., Bochkov D.V., Goryachkovskaya T.N., Peltek S.E. INT J MOL SCI, 2022, 23 (15) P. 8741
2021	Identification of tissue-specific and common methylation quantitative trait loci in healthy individuals using MAGAR Scherer M, Gasparoni G, Rahmouni S, Shashkova T, Arnoux M, Louis E, Nostaeva A, Avalos D, Dermitzakis ET, Aulchenko YS, Lengauer T, Lyons PA, Georges M, Walter J EPIGENET CHROMATIN, 2021, 14(1):44
	Genome-wide association studies of low back pain and lumbar spinal disorders using electronic health record data identify a locus associated with lumbar spinal stenosis Suri P, Stanaway IB, Zhang Y, Freidin MB, Tsepilov YA, Carrell DS, Williams FMK, Aulchenko YS, Hakonarson H, Namjou B, Crosslin DR, Jarvik GP, Lee MT PAIN, 2021, 162(8):2263-2272
	Multivariate genome-wide analysis of immunoglobulin G N-glycosylation identifies new loci pleiotropic with immune function. Shadrina AS, Zlobin AS, Zaytseva OO, Klarić L, Sharapov SZ, D Pakhomov E, Perola M, Esko T, Hayward C, Wilson JF, Lauc G, Aulchenko YS, Tsepilov YA HUM MOL GENET, 2021, 30(13):1259-1270
	Nontrivial Replication of Loci Detected by Multi-Trait Methods. Ning Z, Tsepilov YA, Sharapov SZ, Wang Z, Grishenko AK, Feng X, Shirali M, Joshi PK, Wilson JF, Pawitan Y, Haley CS, Aulchenko YS, Shen X Frontiers in Genetics, 2021, 12:627989
	Fluorescent bacterial biosensor E. coli/pTdcR-TurboYFP sensitive to terahertz radiation DANIL S. SERDYUKOV, TATIANA N. GORYACHKOVSKAYA, IRINA A. MESCHERYAKOVA, SERGEI A. KUZNETSOV, VASILIY M. POPIK, SERGEY E. PELTEK BIOMED OPT EXPRESS, 2021
	PheLiGe: an interactive database of billions of human genotype-phenotype associations Shashkova TI, Pakhomov ED, Gorev DD, Karssen LC, Joshi PK, Aulchenko YS NUCLEIC ACIDS RES, 2021, 49(D1):D1347-D1350
	Essential Oils from Different Parts of the Sea Buckthorn Hippophae rhamnoides L. Nikolay M. Slynko, Leonid V. Kuibida, Ludmila E. Tatarova, George U. Galitsyn, Tatiana N. Goryachkovskaya, Sergey E. Peltek Advances in Bioscience and Biotechnology, 2021, 2019, 10, 233-243
	Пангеномы сельскохозяйственных растений Пронозин А.Ю., Брагина М.К., Салина Е.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 2021;25(1):57-63
	Correlation of Metabolic Profiles of Plasma and Cerebrospinal Fluid of High-Grade Glioma Patients A. D. Rogachev, N. A. Alemasov, V. A. Ivanisenko, N. V. Ivanisenko, E. V. Gaisler, O. S. Oleshko, S. V. Cheresiz, S. V. Mishinov, V. V. Stupak, A. G. Pokrovsky Metabolites, 2021
	Фенотипическая изменчивость селекционных линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.) по элементам структуры урожая в экологических условиях Западной Сибири и Татарстана Стасюк А.И., Леонова И.Н., Пономарева М.Л., Василова Н.З., Шаманин В.П., Салина Е.А. Сельскохозяйственная биология, 2021, т. 56, №1, с. 78-91
	The Web Platform for Storing Biotechnologically Significant Properties of Bacterial Strains Aleksey M. Mukhin, Fedor V. Kazantsev, Alexandra I. Klimenko, Tatiana N. Lakhova, Pavel S. Demenkov, Sergey A. Lashin Lect Notes Comput Sci, 2021
	Whole-Genome Resequencing Points to Candidate DNA Loci Affecting Body Temperature under Cold Stress in Siberian Cattle Populations Alexander Igoshin, Nikolay Yudin, Ruslan Aitnazarov, Andrey A. Yurchenko, Denis M. Larkin Life, 2021
	Рибосомное профилирование как инструмент исследования трансляции у растений: основные итоги, проблемы и перспективы Афонников, Д. А., Синицына, О. И., Голубева, Т. С., Шмаков, Н. А., Кочетов, А. В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, № 3, Т. 25, С. 251-259
	Вироид веретеновидности клубней картофеля Кочетов, А. В., Пронозин, А. Ю., Шацкая, Н. В., Афонников, Д. А., Афанасенко, О. С. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, № 3, Т. 25, С. 269-275
	Определение количественного содержания хлорофиллов в листьях по спектрам отражения алгоритмом случайного леса. Урбанович Е.А., Афонников Д.А., Николаев С.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, № 1, Т. 25, С. 64-70
	Image-Based Wheat Fungi Diseases Identification by Deep Learning Genaev M .A., Skolotneva E.S., Gultyaeva E.I., Orlova E.A., Bechtold N.P., Afonnikov D.A. Plants, 2021, V. 10, P. 1500
	Сравнение белкового состава атеросклеротических бляшек коронарных артерий на разных стадиях развития Стахнёва Е.М., Мещерякова И.А., Демидов Е.А., Старостин К.В., Садовский Е.В., Пельтек С.Е, Чернявский А.М., Волков А.М., Кургузов А.В., Мурашов И.С., Рагино Ю.И. Молекулярная медицина, 2021, 19(5):58-64
	Prioritization of biological processes based on the reconstruction and analysis of associative gene networks describing the response of plants to adverse environmental factors P.S. Demenkov, Е.А. Oshchepkova, T.V. Ivanisenko, V.A. Ivanisenko Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 2021 Sep; 25(5): 580–592.
	E. coli aggregation and impaired cell division after terahertz irradiation. 1. Peltek S, Meshcheryakova I, Kiseleva E, Oshchepkov D, Rozanov A, Serdyukov D, Demidov E, Vasiliev G, Vinokurov N, Bryanskaya A, Bannikova S, Popik V, Goryachkovskaya T. SCI REP-UK, 2021, Oct 14;11(1):20464.
	Продукция субтилизиновых протеаз в бактериях и дрожжах Розанов А.С., Шеховцов С.В., Богачева Н.В., Першина Е.Г., Ряполова А.В.,Бытяк Д.С., Пельтек С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(6):647-651
	Biochemical response to freezing in the Siberian salamander Salamandrella keyserlingii Shekhovtsov S.V., Bulakhova, N.A., Tsentalovich Y.P., Zelentsova E.A., Meshcheryakova E.N., Poluboyarova T.V., Berman, D.I. Biology, 2021, V. 10. I. 11. no. 1172.
	Morphological differences between genetic lineages of the peregrine earthworm Aporrectodea caliginosa (Savigny, 1826) Shekhovtsov S.V., Ermolov S.A., Poluboyarova T.V., Kim-Kashmenskaya M.N., Derzhinsky Ye. A., Peltek S.E. ACTA ZOOL ACAD SCI H, 2021, V. 67. № 3. P. 235–246.
	Microorganisms of two thermal pools on Kunashir Island, Russia Rozanov A.S., Korzhuk A.V., Shekhovtsov S.V., Vasiliev G.V., Peltek S.E. Biology, 2021, V. 10. I. 9 P. 924.
	NLR Genes Related Transcript Sets in Potato Cultivars Bearing Genetic Material of Wild Mexican Solanum Species Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Antonova O.Y., Shatskaya N.V., Glagoleva A.Y., Ibragimova S.M., Khiutti A., Afanasenko O.S., Gavrilenko T.A. Agronomy, 2021, v. 11, P. 2426
	Copy number variants in genomes of local sheep breeds from Russia A.V. Igoshin, T.E. Deniskova, A.A. Yurchenko, N.S. Yudin, A.V. Dotsev, M.I. Selionova, N.A. Zinovieva, D.M. Larkin ANIM GENET, 2021
	The gene Sr38 for bread wheat breeding in Western Siberia Skolotneva E.S., Kelbin V.N., Shamanin V.P., Boyko N.I., Aparina V.A., Salina E.A. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, Volume: 25 Issue: 7 Pages: 740-745
	Genome-wide association study identifies RNF123 locus as associated with chronic widespread musculoskeletal pain. Rahman MS, Winsvold BS, Chavez Chavez SO, Børte S, Tsepilov YA, Sharapov SZ; HUNT All-In Pain, Aulchenko YS, Hagen K, Fors EA, Hveem K, Zwart JA, van Meurs JB, Freidin MB, Williams FM. ANN RHEUM DIS, 2021, 80(9):1227-1235
	Quantitative Genetics of Human Protein N-Glycosylation Krištić J, Sharapov SZ, Aulchenko YS ADV EXP MED BIOL, 2021, 1325:151-171
	PHENOTYPIC VARIABILITY OF COMMON WHEAT (Triticum aestivum L.) BREEDING LINES ON YIELD COMPONENTS UNDER ENVIRONMENTAL CONDITIONS OF WESTERN SIBERIA AND TATARSTAN A.I. Stasyuk, I.N. Leonova, M.L. Ponomareva, N.Z. Vasilova, V.P. Shamanin, E.A. Salina Сельскохозяйственная биология, 2021, V. 56, Iss. 1, pp. 78-91
	Associations Between Genetically Predicted Plasma N-Glycans and Prostate Cancer Risk: Analysis of Over 140,000 European Descendants Duo Liu, Jingjing Zhu, Tianying Zhao, Sodbo Sharapov, Evgeny Tiys, Lang Wu Pharmgenomics Pers Med, 2021
	Metagenomics data of microbial communities in bacterial mats and bottom sediments in water bodies within the Kurai Mercury Province (Gorny Altai, Russia). Rozanov A. S., Myagkaya I. N., Korzhuk A. V., Ershov N. I., Kirichenko I. S., Gustaytis M. A., Saryg-ool B.Y., Malov V.I., Shipova A.A., Lazareva E.V. & Peltek, S. E. Data in Brief, 2021
	Metagenomics data of microbial communities of natural organic matter from the dispersion train of sulfide tailings. Korzhuk A. V., Myagkaya I. N., Rozanov A. S., Ershov N. I., Saryg-Ool B. O. Y., Malov V. I., Shipova A.A., Lazareva E.V. & Peltek, S. E. Data in Brief, 2021
	Структурно-морфологические признаки участия микроорганизмов в формировании богатых Nb–REE-руд томторского месторождения (Россия) Добрецов Н.Л., Жмодик С.М., Лазарева Е.В., Брянская А.В., Пономарчук В.А., Сарыг-оол Б.Ю., Кириченко И.С., Толстов А.В., Карманов Н.С. Doklady Akademii Nauk, 2021
	Mechanosensitive molecular interactions in atherogenic regions of the arteries: development of atherosclerosis. Mishchenko EL, Mishchenko AM, Ivanisenko VA Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, Sep;25(5):552-561
	Получение рекомбинантного штамма Komagataella phaffi – продуцента протеиназы К из Tritirachium album А. Б. Беклемишев, М. Б. Пыхтина, Я. М. Куликов, Т. Н. Горячковская, Д. В. Бочков, С. В. Сергеева, А. Р. Васильева, В. П. Романов, Д. С. Новикова, С. Е. Пельтек Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, Том 25, № 8 (2021)
2020	Технология структурирования и обработки транскриптомных данных на основе гибридного использования RDBMS и NoSQL подходов Мухин А.М., Генаев М.А., Рассказов Д.А., Лашин С.А., Афонников Д.А. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2020, Т. 15. No 2. С. 455–470
	Genome-wide association study of leaf rust resistance in Russian spring wheat varieties Irina N. Leonova, Ekaterina S. Skolotneva, Elena A. Salina BMC PLANT BIOL, 2020, 2020, 20(Suppl 1):135 https://doi.org/10.1186/s12870-020-02333-3
	Effects of Rht17 in combination with Vrn-B1 and Ppd-D1 alleles on agronomic traits in wheat in black earth and non-black earth regions Pavel Yu. Kroupin, Gennady I. Karlov, Ludmila A. Bespalova, Elena A. Salina, Anastasiya G. Chernook, Nobuyoshi Watanabe, Mikhail S. Bazhenov, Vladimir V. Panchenko, Lubov A. Nazarova, Victor Ya. Kovtunenko, Mikhail G. Divashuk BMC PLANT BIOL, 2020, 2020, 20(Suppl 1):304 https://doi.org/10.1186/s12870-020-02514-0
	Sex- and age-specific genetic analysis of chronic back pain Freidin M.B., Tsepilov Y.A., Stanaway I.B., Meng W., Hayward C., Smith B.H., Khoury S., Parisien M., Bortsov A., Diatchenko L., Borte S., Winsvold BS, Brumpton BM, Zwart JA, Aulchenko Y.S., Suri P., Williams F.M.K., HUNT All-In Pain PAIN, 2020
	Phylogeny of the Eisenia nordenskioldi complex based on mitochondrial genomes Shekhovtsov S.V., Golovanova E.V., Ershov N.I., Poluboyarova T.V., Berman D.I., Bulakhova N.A., Szederjesi T., Peltek S.E. EUR J SOIL BIOL, 2020, V. 96. P. 103137.
	Design, Synthesis and Molecular Modeling Study of Conjugates of ADP and Morpholino Nucleosides as A Novel Class of Inhibitors of PARP-1, PARP-2 and PARP-3 Yuliya V. Sherstyuk, Nikita V. Ivanisenko, Alexandra L. Zakharenko, Maria V. Sukhanova, Roman Y. Peshkov, Ilia V. Eltsov , Mikhail M. Kutuzov, Tatiana A. Kurgina, Ekaterina A. Belousova, Vladimir A. Ivanisenko, Olga I. Lavrik, Vladimir N. Silnikov and Tatyana V. Abramova INT J MOL SCI, 2020
	Identification of Antimicrobial Peptides from Novel Lactobacillus fermentum Strain. Anna S. Pavlova, Georgii D. Ozhegov, Georgij P. Arapidi, Ivan O. Butenko, Eduard S. Fomin, Nikolai A. Alemasov, Dmitry A. Afonnikov, Dina R. Yarullina, Vadim T. Ivanov, Vadim M. Govorun, Airat R. Kayumov PROTEIN J, 2020, 39, p. 73–84
	Dissecting DISC regulation via pharmacological targeting of caspase-8/c-FLIPL heterodimer Laura K. Hillert, Nikita V. Ivanisenko, Denise Busse, Johannes Espe, Corinna König, Sergey E. Peltek, Nikolai A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik CELL DEATH DIFFER, 2020
	Kmasker plants – a tool for assessing complex sequence space in plant species Sebastian Beier, Chris Ulpinnis, Markus Schwalbe, Thomas Münch, Robert Hoffie, Iris Koeppel, Christian Hertig, Nagaveni Budhagatapalli, Stefan Hiekel, Krishna M. Pathi, Goetz Hensel, Martin Grosse, Sindy Chamas, Sophia Gerasimova, Jochen Kumlehn, Uwe Scholz, Thomas Schmutzer PLANT J, 2020, doi:10.1111/tpj.14645
	Changes in the proteomic profile of blood serum in coronary atherosclerosis Stakhneva EM, Meshcheryakova IA, Demidov EA, Starostin KV, Peltek SE, Voevoda MI, Ragino YI J MED BIOCHEM, 2020, 39(2):208-214
	Learning the changes of barnase mutants thermostability from structural fluctuations obtained using anisotropic network modeling Nikolay A.Alemasov, Nikita V. Ivanisenko, Vladimir A.Ivanisenko J MOL GRAPH MODEL, 2020, Volume 97, June 2020, 107572
	Dissection of novel candidate genes for grain texture in Russian wheat varieties Kiseleva A.A., Leonova I.N., Pshenichnikova T.A., Salina E.A. PLANT MOL BIOL, 2020
	Стеблевая ржавчина в Западной Сибири – расовый состав и эффективные гены устойчивости В.П. Шаманин, И.В. Потоцкая, С.С. Шепелев, В.Е. Пожерукова, Е.А. Салина, Е.С. Сколотнева, Д. Ходсон, М. Хоумвёллер, М. Патпур, А.И. Моргунов Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(2):131-138
	Создание линии табака со сниженными антифидантными свойствами по отношению к колорадскому жуку. Костина Н.Е., Спасельникова А.В., Егорова А. А., Колосовская Е.В., Домрачев Д.В., Романова А.В., Туманян С.Р., Хамас С., Кумлен Й., Дубовский И.М., Герасимова С.В. Биотехнология и селекция растений, 2020, Т.3(1) 2020 г
	Phylogeography and genetic lineages of Aporrectodea rosea (Lumbricidae, Annelida) Shekhovtsov S.V., Derzhinsky Y.A., Poluboyarova T.V., Golovanova E.V., Peltek S.E. EUR J SOIL BIOL, 2020, V. 99, 103191
	Detection of Genomic Regions Associated with Resistance to Stem Rust in Russian Spring Wheat Varieties and Breeding Germplasm. Irina N. Leonova, Ekaterina S. Skolotneva, Elena A. Orlova, Olga A. Orlovskaya, Elena A. Salina INT J MOL SCI, 2020, 2020, 21, 4706
	The effect of meditation on comprehension of statements about one-self and others: a pilot ERP and behavioral study Alexander Savostyanov, Sergey Tamozhnikov, Andrey Bocharov, Alexander Saprygin, Yuriy Matushkin, Sergey Lashin, Galina Kolpakova, Klimenty Sudobin, Gennady Knyazev FRONT HUM NEUROSCI, 2020, V 13, Article 437
	Metabolic response of the Siberian wood frog Rana amurensis to extreme hypoxia Shekhovtsov S.V., Bulakhova N.A., Tsentalovich Yu.P., Zelentsova E.A., Yanshole L.V., Meshcheryakova E.N., Berman D.I. SCI REP-UK, 2020, V. 10. no.14604.
	Анализ цветовых и текстурных характеристик зерен злаков на цифровых изображениях Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.А. Афонников Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, т. 24, № 4, с. 340-347
	Использование гиперспектральной камеры Specim IQ для анализа растений В.В. Альт, Т.А. Гурова, О.В. Елкин, Д.Н. Клименко, Л.В. Максимов, И.А. Пестунов, О.А. Дубровская, М.А. Генаев, Т.В. Эрст, К.А. Генаев, Е.Г. Комышев, В.К. Хлесткин, Д.А. Афонников Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, т. 24, № 3, с. 259-266
	Drought stress tolerance and photosynthetic activity of alloplasmic lines T. dicoccum x T. aestivum. Terletskaya N., Shcherban A., Nesterov M., Perfil’ev R., Salina E., Altayeva N., Blavachinskaya I. INT J MOL SCI, 2020, 21 (9), 3356
	ANDDigest: a new web-based module of ANDSystem for the search of knowledge in the scientific literature Timofey V. Ivanisenko, Olga V. Saik, Pavel S. Demenkov, Nikita V. Ivanisenko, Alexander N. Savostianov, Vladimir A. Ivanisenko BMC BIOINFORMATICS, 2020, 21, 228 (2020)
	A study on effects of terahertz radiation on gene networks of Escherichia coli by means of fluorescent biosensors DS SERDYUKOV,TN GORYACHKOVSKAYA,IA MESCHERYAKOVA,SV BANNIKOVA,SA KUZNETSOV,OP CHERKASOVA,VM POPIK,SE PELTEK BIOMED OPT EXPRESS, 2020, Vol. 11, No. 9 /1 5258-5273
	The role of death domain proteins in host response upon SARS-CoV-2 infection: modulation of programmed cell death and translational applications Nikita V. Ivanisenko, Kamil Seyrek, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik Cell Death Discovery, 2020
	Conversion of hulled into naked barley by Cas endonuclease-mediated knockout of the NUD gene Sophia V. Gerasimova, Christian Hertig, Anna M. Korotkova, Ekaterina V. Kolosovskaya, Ingrid Otto, Stefan Hiekel, Alex V. Kochetov, Elena K. Khlestkina, Jochen Kumlehn BMC PLANT BIOL, 2020
	Resequencing and signatures of selection scan in two Siberian native sheep breeds point to candidate genetic variants for adaptation and economically important traits J. Sweet‐Jones, A. A. Yurchenko, A. V. Igoshin, N. S. Yudin, M. T. Swain, D. M. Larkin ANIM GENET, 2020
	Quantifying Drosophila adults with the use of a smartphone Evgenia K. Karpova, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Natalya V. Adonyeva, Dmitry A. Afonnikov, Margarita A. Eremina, Nataly E. Gruntenko Biology Open, 2020, 9: bio054452
	Распространенность языка жестов в качестве источника данных для генетической эпидемиологии наследуемых форм потери слуха. Романов Г.П., Пшенникова В.Г., Лашин С.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Сазонов Н.Н., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А., Барашков Н.А. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). 54-56
	Young «oil site» of the Uzon Caldera as a habitat for unique microbial life Sergey E. Peltek, Alla V. Bryanskaya, Yuliya E. Uvarova, Aleksey S. Rozanov, Timofey V. Ivanisenko, Vladimir A. Ivanisenko, Elena V. Lazareva, Olga V. Saik, Vadim M. Efimov, Sergey M. Zhmodik, Oxana P. Taran, Nikolay M. Slynko, Sergey V. Shekhovtsov, Valentin N. Parmon, Nikolay L. Dobretsov, Nikolay A. Kolchanov BMC MICROBIOL, 2020, 20, 349
	A new approach to estimating the prevalence of hereditary hearing loss: an analysis of the distribution of sign language users based on census data in Russia. Romanov G.P., Pshennikova V.G., Lashin S.A., Solovyev A.V., Teryutin F.M., Cherdonova A.M., Borisova T.V., Sazonov N.N., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A., Barashkov N.A. PloS One, 2020, 15(11):e0242219
	Pharmacological targeting of c-FLIPL and Bcl-2 family members promotes apoptosis in CD95L-resistant cells. Corinna König, Laura K. Hillert-Richter, Nikita V. Ivanisenko, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik SCI REP-UK, 2020
	Species Delimitation of the Eisenia nordenskioldi Complex (Oligochaeta, Lumbricidae) Using Transcriptomic Data Sergei V. Shekhovtsov, Aleksandra A. Shipova, Tatiana V. Poluboyarova, Gennady V. Vasiliev, Elena V. Golovanova, Anna P. Geraskina, Nina A. Bulakhova, Tímea Szederjesi, Sergei E. Peltek Frontiers in Genetics, 2020, V. 11, 1508
	Морфотипы и генетическая изменчивость Dendrobaena schmidti (Lumbricidae, Annelida) С. В. Шеховцов, И. Б. Рапопорт, Т. В. Полубоярова, А. П. Гераськина, Е. В. Голованова, С. Е. Пельтек Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, Т. 24. №. 1. С. 48-54.
	Генетическая и размерная изменчивость Octolasion tyrtaeum (Lumbricidae, Annelida) С.В. Шеховцов, С.А. Ермолов, Е.А. Держинский, Т.В. Полубоярова, М.С. Ларичева, С.Е. Пельтек Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2020, Т. 6. №. 1. С. 5-9.
	Потенциал использования молекулярных маркеров в селекции сои Виниченко Н.А., Салина Е.А., Кочетов А.В. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2020, 6(3):107-125 DOI 10.18699/Letters2020-6-15
	Replication of 15 loci involved in human plasma protein N-glycosylation in 4,802 samples from four cohorts Sharapov SZ, Shadrina AS, Tsepilov YA, Elgaeva EE, Tiys ES, Feoktistova SG, Zaytseva OO, Vuckovic F, Cuadrat R, Jäger S, Wittenbecher C, Karssen LC, Timofeeva M, Tillin T, Trbojević-Akmačić I, Štambuk T, Rudman N, Krištić J, Šimunović J, Momčilović A, Vilaj M, Jurić J, Slana A, Gudelj I, Klarić T, Puljak L, Skelin A, Kadić AJ, Van Zundert J, Chaturvedi N, Campbell H, Dunlop M, Farrington SM, Doherty M, Dagostino C, Gieger C, Allegri M, Williams F, Schulze MB, Lauc G, Aulchenko YS. GLYCOBIOLOGY, 2020, cwaa053
	Analysis of genetically independent phenotypes identifies shared genetic factors associated with chronic musculoskeletal pain conditions Tsepilov Y. A., Freidin M. B., Shadrina A. S., Sharapov S. Z., Elgaeva E. E., van Zundert J., Karssen L. С., Suri P., Williams F. M. K., Aulchenko Y. S. Commun. biolog., 2020, 3, Article number: 329
	The GWAS-MAP platform for aggregation of results of genome-wide association studies and the GWAS-MAP\|homo database of 70 billion genetic associations of human traits Shashkova T.I., Gorev D.D., Pakhomov E.D., Shadrina A.S., Sharapov S.Z., Tsepilov Y.A., Karssen L.C., Aulchenko Y.S. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(8):876-884
	КОМПЛЕКСНЫЙ МЕТОД ТАКСОНОМИЧЕСКОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ МИКРООРГАНИЗМОВ УВАРОВА Ю.Е., БРЯНСКАЯ А.В., РОЗАНОВ А.С., ШЛЯХТУН В.Н., ДЕМИДОВ Е.А., СТАРОСТИН К.В., ГОРЯЧКОВСКАЯ Т.Н., ШЕХОВЦОВ С.В., СЛЫНЬКО Н.М., ПЕЛЬТЕК С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, Том: 24 Номер: 4 Год: 2020 Страницы: 376-382
	Prioritization of causal genes for coronary artery disease based on cumulative evidence from experimental and in silico studies Shadrina A. S., Shashkova T. I., Torgasheva A. A., Sharapov S. Z., Klarić L., Pakhomov E. D., Alexeev D. G., Wilson J. F., Tsepilov Y. A., Joshi P. K., Aulchenko Y. S. SCI REP-UK, 2020, 10, Article number: 10486
	The mechanism of potato resistance to Globodera rostochiensis: comparison of root transcriptomes of resistant and susceptible Solanum phureja genotypes Alex V. Kochetov, Anastasiya A. Egorova, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko and Tatjana A. Gavrilenko BMC PLANT BIOL, 2020, 20(Suppl 1):350
	Creation of an online platform for identification of microorganisms: peak picking or full-spectrum analysis Starostin K.V., Demidov E.A., Ershov N.I., Bryanskaya A.V., Efimov V.M., Shlyakhtun V.N., Peltek S.E. Frontiers in Microbiology, 2020
	Metagenomics dataset used to characterize microbiome in water and sediments of the lake Solenoe (Novosibirsk region, Russia) Alla V Bryanskaya, Aleksandra A Shipova, Alexei S Rozanov, Oxana A Volkova, Elena V Lazareva, Yulia E Uvarova, Tatyana N Goryachkovskaya, Sergey E Peltek Data in Brief, 2020
	Construction of a biosensor sensitive to terahertz radiation based on the glutamine synthetase gene promoter Irina Meshcheryakova, Tatyana Goryachkovskaya, Svetlana Bannikova, Alexey Rozanov, Elizaveta Demidova, Dmitry Oshchepkov, Evgeniy Demidov, Alla Bryanskaya, Nikolay Vinokurov, Vasiliy Popik, Sergey Peltek AIP CONFERENCE PROCEEDINGS, 2020
	Metagenomic data on prokaryotic diversity of Kunashir island geothermal spring Alexei S Rozanov, Anton V Korzhuk, Valeria N Shlyakhtun, Aleksandra A Shipova, Sergey E Peltek Data in Brief, 2020
	Survival of halophiles of Altai lakes under extreme environmental conditions: implications for the search for Martian life Alla V Bryanskaya, Alexey A Berezhnoy, Alexey S Rozanov, Danil S Serdyukov, Tatyana K Malup, Sergey E Peltek INT J ASTROBIOL, 2020
	Diversity and occurrence of methylotrophic yeasts used in genetic engineering Rozanov, A.S., Pershina, E.G., Bogacheva, N.V., Shlyakhtun, V., Sychev, A.A., Peltek, S.E. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, Volume 24, Issue 2, 2020, Pages 149-157
	Возможности и перспективы формирования генетической защиты мягкой пшеницы от стеблевой ржавчины в Западной Сибири Кельбин В. Н., Сколотнева Е. С., Салина Е. А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, №8, Том 24, 821-828
	The story of the lost twins: decoding the genetic identities of the Kumhar and Kurcha populations from the Indian subcontinent. Das R, Ivanisenko VA, Anashkina AA, Upadhyai P. BMC GENET, 2020, Oct 22;21(Suppl 1):117
	Drought stress tolerance and photosynthetic activity of alloplasmic lines T. dicoccum x T. aestivum. Terletskaya N., Shcherban A., Nesterov M., Perfil’ev R., Salina E., Altayeva N., Blavachinskaya I. INT J MOL SCI, 2020
2019	A new version of the ANDSystem tool for automatic extraction of knowledge from scientific publications with expanded functionality for reconstruction of associative gene networks by considering tissue-specific gene expression Vladimir A. Ivanisenko, Pavel S. Demenkov, Timofey V. Ivanisenko, Elena L. Mishchenko, Olga V. Saik BMC BIOINFORMATICS, 2019, BMC Bioinformatics (2019) 20(Suppl 1): 34
	MIGREW: database on molecular identification of genes for resistance in wheat Fedor V. Kazantsev, Ekaterina S. Skolotneva, Vasiliy N. Kelbin, Elena A. Salina, Sergey A. Lashin BMC BIOINFORMATICS, 2019, BMC Bioinformatics 2019, 20 (Suppl 1):36
	Current achievements in modifying crop genes using CRISPR/Cas system A.M. Korotkova, S.V. Gerasimova, E.K. Khlestkina. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 2019;23(1):29-37
	Prioritization of genes involved in endothelial cell apoptosis by their implication in lymphedema using an analysis of associative gene networks with ANDSystem Olga V. Saik, Vadim V. Nimaev, Dilovarkhuja B. Usmonov, Pavel S. Demenkov, Timofey V. Ivanisenko, Inna N. Lavrik, Vladimir A. Ivanisenko BMC MED GENOMICS, 2019, BMC Medical Genomics//2019;12(Suppl 2);47:117-140
	Genome‐wide association study for body weight in cattle populations from Siberia A. V. Igoshin, N. S. Yudin, N. M. Belonogova, D. M. Larkin ANIM GENET, 2019
	Системный подход к моделированию развития листостебельных грибных инфекций пшеницы Николаев С.В., Зубаирова У.С., Сколотнева Е.С., Орлова Е.А., Афонников Д.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(1):100-109
	Delineating the role of c-FLIP/NEMO interaction in the CD95 network via rational design of molecular probes Nikita V. Ivanisenko, Jörn H. Buchbinder, Johannes Espe, Max Richter, Miriam Bollmann, Laura K. Hillert, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik BMC GENOMICS, 2019
	Progress in plant genome sequencing: research directions M.K. Bragina, D.A. Afonnikov, E.A. Salina Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 2019;23(1):38-48
	New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov, Egor B. Prokhortchouk, Mariya Y. Pakharukova, Konstantin V. Gunbin, Kirill Ustyantsev, Mikhail A. Genaev, Alexander G. Blinov, Alexander Mazur, Eugenia Boulygina, Svetlana Tsygankova, Ekaterina Khrameeva, Nikolay Chekanov, Guangyi Fan, An Xiao, He Zhang, Xun Xu, Huanming Yang, Victor Solovyev, Simon Ming-Yuen Lee, Xin Liu, Dmitry A. Afonnikov, Konstantin G. Skryabin BMC GENOMICS, 2019, 20:399
	Spatial heterogeneity promotes antagonistic evolutionary scenarios in microbial community explained by ecological stratification: a simulation study Klimenko A.I., Matushkin Y.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A. ECOL MODEL, 2019, V 399, p.66-76
	Оценка количественных характеристик клубнеобразования дикого картофеля на основе анализа изображений клубней с использованием компьютерного приложения SeedСounter К.А. Иванова, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, А.А. Егорова, К.А. Колошина, Н.А. Чала, Д.А. Афонников, А.В. Кочетов, Е.В. Рогозина, С.В. Герасимова Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 2019. Онлайн.
	The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development. Doroshkov AV, Konstantinov DK, Afonnikov DA, Gunbin KV. BMC PLANT BIOL, 2019
	Germline-restricted chromosome (GRC) is widespread among songbirds Torgasheva AA, Malinovskaya LP, Zadesenets KS, Karamysheva TV, Kizilova EA, Akberdina EA, Pristyazhnyuk IE, Shnaider EP, Volodkina VA, Saifitdinova AF,Galkina SA, Larkin DM, Rubtsov NB, Borodin PM. 2019, 116: 11845-11850. P NATL ACAD SCI USA, 2019, 116: 11845-11850.
	Приоритизация генов картофеля, вовлеченных в формирование селекционно-значимых признаков, с использованием базы знаний SOLANUM TUBEROSUM. Деменков П.С., Сайк О.В., Иванисенко Т.В., Колчанов Н.А., Кочетов А.В., Иванисенко В.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(3):312-319
	Identification of 12 genetic loci associated with human healthspan Zenin A, Tsepilov Y, Sharapov S, Getmantsev E, Menshikov LI, Fedichev PO, Aulchenko Y Commun. biolog., 2019, 2
	Defining the genetic control of human blood plasma N-glycome using genome-wide association study Sharapov S, Tsepilov Y, Klaric L, Mangino M, Thareja G, Shadrina A, Simurina M, Dagostino C, Dmitrieva J, Vilaj M, Vuckovic F, Pavic T, Stambuk J, Trbojevic-Akmacic I, Kristic J, Simunovic J, Momcilovic A, Campbell H, Doherty M, Dunlop M, Farrington S, Pucic-Bakovic M, Gieger C, Allegri M, Louis E, Georges M, Suhre K, Spector T, Williams F, Lauc G, Aulchenko Y HUM MOL GENET, 2019
	Resistance mechanisms involved in complex immunity of wheat against rust diseases E.S. Skolotneva , E.A. Salina Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 2019, 23 (5): 542 -550
	Reconstruction and Analysis of Gene Networks of Human Neurotransmitter Systems Reveal Genes with Contentious Manifestation for Anxiety, Depression, and Intellectual Disabilities Иванов Роман Артемович Замятин Владимир Клименко Александра Игоревна Матушкин Юрий Георгиевич Савостьянов Александр Николаевич Лашин Сергей Александрович Genes, 2019
	История «певчей» хромосомы Бородин, П. М. Торгашева, А. А. Малиновская, Л. П. Рубцов, Н. Б. Галкина, С. А. Ларкин, Д. М Наука из первых рук, 2019, Номер: 3 (83) Страницы: 24-43
	Long and short isoforms of c-FLIP act as control checkpoints of DED filament assembly. Hillert LK, Ivanisenko NV, Espe J, König C, Ivanisenko VA, Kähne T, Lavrik IN ONCOGENE, 2019
	Phylostratigraphic Analysis Shows the Earliest Origination of the Abiotic Stress Associated Genes in A. thaliana Zakhar S. Mustafin, Vladimir I. Zamyatin, Dmitrii K. Konstantinov, Aleksej V. Doroshkov, Sergey A. Lashin, Dmitry A. Afonnikov Genes, 2019, Genes 2019, 10(12), 963
	The mTOR Signaling Pathway Activity and Vitamin D Availability Control the Expression of Most Autism Predisposition Genes Ekaterina A. Trifonova, Alexandra I. Klimenko, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov INT J MOL SCI, 2019, Int. J. Mol. Sci. 2019, 20(24), 6332;
	Metagenome-Assembled Genome Sequence of Phormidium sp. Strain SL48-SHIP, Isolated from the Microbial Mat of Salt Lake Number 48 (Novosibirsk Region, Russia) Aleksey S. Rozanov, Aleksandra A. Shipova, Alla V. Bryanskaya,Sergey E. Peltek Microbiol Resour Announc, 2019
	Metagenome-Assembled Genome of Halomonas sp. Isolate SL48-SHIP-3 from the Microbial Mat of Salt Lake Number 48 (Novosibirsk Region, Russia) Aleksandra A. Shipova, Anton V. Korzhuk, Valeria Shlyahtun, Alla V. Bryanskaya, Aleksey S. Rozanov, Sergey E. Peltek Microbiol Resour Announc, 2019
	Insight into the genetic architecture of back pain and its risk factors from a study of 509,000 individuals Maxim B. Freidin, Yakov A. Tsepilov, Melody Palmer, Lennart C. Karssen, CHARGE Musculoskeletal Working Group, Pradeep Suri, Yurii S. Aulchenko, Frances M.K. Williams PAIN, 2019
	Examining causal effects of body mass index on back pain: a Mendelian randomization study Elizaveta E. Elgaeva, Yakov Tsepilov, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Yurii Aulchenko, Pradeep Suri EUR SPINE J, 2019
	The development and study of common wheat introgression lines derived from the synthetic form RS7 Davoyan R.O., Bebyakina I.V., Davoyan E.R., Mikov D.S., Zubanova Y.S., Boldakov D.M., Badaeva E.D., Adonina I.G., Salina E.A., Zinchenko A.N. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(7): 827-835
	Некодирующие РНК в диагностике пневмонии Михайлова С.В., Иванощук Д.Е., Шахтшнейдер Е.В., Степанов Г.А., Розанов А.С., Пельтек С.Е., Воевода М.И Сибирский медицинский журнал, 2019, 34(4):72-82.
	Comorbidity of asthma and hypertension may be mediated by shared genetic dysregulation and drug side effects. Zolotareva O, Saik OV, Königs C, Bragina EY, Goncharova IA, Freidin MB, Dosenko VE, Ivanisenko VA, Hofestädt R. SCI REP-UK, 2019, Nov 8;9(1):16302
	The molecular mechanisms driving physiological changes after long duration space flights revealed by quantitative analysis of human blood proteins. Kashirina DN, Percy AJ, Pastushkova LK, Borchers CH, Kireev KS, Ivanisenko VA, Kononikhin AS, Nikolaev EN, Larina IM. BMC MED GENOMICS, 2019, Mar 13;12(Suppl 2):45
	Survival of Halophiles of Altai Lakes at Extreme Environmental Conditions: Implications for the Search for Martian Life Bryanskaya A.V., Berezhnoy A.A., Rozanov A.S., Serdyukov D.A., Malup T.K., Peltek S.E. INT J ASTROBIOL, 2019
	A novel thermophilic Aeribacillus bacteriophage AP45 isolated from the Valley of Geysers, Kamchatka: genome analysis suggests the existence of a new genus within the Siphoviridae family Morozova V., Bokovaya O., Kozlova Yu., Kurilshikov A., Babkin I., Tupikin A., Bondar A., Ryabchikova E., Bryanskaya A., Peltek S., Tikunova N. EXTREMOPHILES, 2019
	Evaluation of cardiovascular system state by urine proteome after manned space flight L Kh Pastushkova, DN Kashirina, AG Brzhozovskiy, AS Kononikhin, ES Tiys, VA Ivanisenko, MI Koloteva, EN Nikolaev, IM Larina ACTA ASTRONAUT, 2019, Том 160, стр. 594-600
	Patterns of microchromosome organization remain highly conserved throughout avian evolution. O'Connor RE, Kiazim L, Skinner B, Fonseka G, Joseph S, Jennings R, Larkin DM, Griffin DK. CHROMOSOMA, 2019, 128(1):21-29
	Evolution of gene regulation in ruminants differs between evolutionary breakpoint regions and homologous synteny blocks Farré M, Kim J, Proskuryakova AA, Zhang Y, Kulemzina AI, Li Q, Zhou Y, Xiong Y, Johnson JL, Perelman PL, Johnson WE, Warren WC, Kukekova AV, Zhang G, O'Brien SJ, Ryder OA, Graphodatsky AS, Ma J, Lewin HA, Larkin DM. GENOME RES, 2019, 29(4):576-589
	A Near Chromosome Assembly of the Dromedary Camel Genome. Ruvinskiy D, Larkin DM, Farré M. Frontiers in Genetics, 2019
	An integrated chromosome-scale genome assembly of the Masai giraffe (Giraffa camelopardalis tippelskirchi). Farré M, Li Q, Darolti I, Zhou Y, Damas J, Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Chemnick LG, Kim J, Ryder OA, Ma J, Graphodatsky AS, Zhang G, Larkin DM, Lewin HA. GigaScience, 2019
	Comparative Chromosome Mapping of Musk Ox and the X Chromosome among Some Bovidae Species Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Yudkin DV, Lemskaya NA, Okhlopkov IM, Kirillin EV, Farré M, Larkin DM, Roelke-Parker ME, O'Brien SJ, Bush M, Graphodatsky AS. Genes, 2019
	Разработка программного комплекса WebMCOT для поиска совместно встречаемых ДНК-мотивов сайтов связывания транскрипционных факторов Мухин Алексей Максимович, Левицкий Виктор Георгиевич, Лашин Сергей Александрович Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2019, Т. 17, №4. C. 74–86
	Общие признаки селекции и гены, связанные с адаптацией и акклиматизацией, в геномах российских пород крупного рогатого скота и овец Юдин Н.С., Ларкин Д.М. RUSS J GENET+, 2019, Том 55, № 8, стр. 936-943.
	High-density genotyping reveals signatures of selection related to acclimation and economically important traits in 15 local sheep breeds from Russia Yurchenko A.A., Deniskova T.E., Yudin N.S., Dotsev A.V., Khamiruev T.N., Selionova M.I., Egorov S.V., Reyer H., Wimmers K., Brem G., Zinovieva N.A., Larkin D.M. BMC GENOMICS, 2019, Vol.20(Suppl 3):294
	Происхождение, селекция и адаптация российских пород крупного рогатого скота по данным полногеномных исследований. Юдин Н.С., Ларкин Д.М. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, Том 23, № 5, стр. 559-568.
2012	Высокопроизводительное моделирование эволюции прокариотических сообществ с использованием программного комплекса "гаплоидный эволюционный конструктор" Мустафин З.С., Матушкин Ю.Г., Лашин С.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, т.16, №4/1, с. 825-829.
	The approaches to the analysis of organization of 5BS chromosome of Triticum aestivum L. // Proc. of Proc. of The 2-nd International Conference «Plant, genetics, genomics and biotechnology». July–August 2012. Irkutsk. Russia. P.61. Sergeeva E.M., L.L. Bildanova, D.A. Afonnikov, M.K. Koltunova, E.M. Timonova, E.A. Salina GENETICS, 2012, P.61.
2010	Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, 275:337-339
	Новая форма Мискантуса Китайского (Веерника Китайского miscanthus sinensis anders.) как перспективный источник целлюлозосодержащего сырья Шумный, С.Г. Вепрев, Н.Н. Нечипоренко, Т.Н. Горячковская, Н.М. Слынько, Н.А. Колчанов, С.Е. Пельтек Информационный вестник ВОГИС, 2010, том 14, №1, стр. 122-126
	A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2010, 4, 65, 143-145
	Поиск возобновляемых источников целлюлозы для многоцелевого использования Шумный В.К., Н.А. Колчанов, Г.В. Сакович, В.Н. Пармон, С.Г. Вепрев, Н.Н. Нечипоренко, Т.Н. Горячковская, А.В. Брянская, В.В. Будаева, А.В. Железнов, Н.Б. Железнова, В.Н. Золотухин, Р.Ю. Митрофанов, А.С. Розанов, К.Н. Сорокина, Н.М. Слынько, В.А. Яковлев, Информационный вестник ВОГИС, 2010, № 3. Т. 14. С. 569-578
	Экспрессия генов раннего развития у полевки Microtus rossiaemeridionalis Сорокин М.А., Медведев С.П., Шевченко А.И., Слынько Н.М., Закиян С.М. RUSS J GENET+, 2010, Т. 46. № 2. С. 282-286.
	A new form of Miscanthus (Chinese silver grass, Miscanthus sinensis - Andersson) as a promising source of cellulosic biomass Vladimir K. Shumny, Sergey G.Veprev, Nikolay N. Nechiporenko, Tatiana N. Goryachkovskaya, Nikolay M. Slynko, Nikolay A. Kolchanov, Sergey E. Peltek. Advances in Bioscience and Biotechnology, 2010, Vol.1 No.3, PP.167-170
	Адаптация к бездне Афонников Д.А., Гунбин В.К., Суслов В.В. Химия и жизнь, 2010, №3, 38-41
	Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R J INTEGR BIOINFORM, 2010, 7(1):148. doi: 10.2390/biecoll-jib-2010-148
2009	Применение компьютерного анализа микроизображений листа для оценки характеристик опушения листа пшеницы Triticum Aestivum L Дорошков А.В., Арсенина С.И., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А. Информационный вестник ВОГИС, 2009, №13, Том1, с 218-226
	Isolation and sequence analysis of the wheat B genome subtelomeric DNA Salina E.A., Sergeeva E.M., Adonina I.G., Shcherban A.B., Afonnikov D.A., Belcram H., Huneau C., Chalhoub B. BMC GENOMICS, 2009, 10, 414
	Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA BMC GENOMICS, 2009, V. 1, 10, 639
	Species-specific induction of CYP2B by 2,4,6-tryphenyldioxane-1,3 (TPD) Pustylnyak V., Pivovarova E., Slynko N., Gulyaeva L., Lyakhovich V. LIFE SCI, 2009, 85(23-26):815-821 doi:10.1016/j.lfs.2009.10.015
	Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 4, 425, 546-548
	Анализ коррелированных замен в гомологичных белках семейства Fpg/Nei Коптелов С.С., Афонников Д.А., Жарков Д.О. Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2009, Т.7, Вып.1, С. 3-7
2008	Транскрипционный фактор YY1 участвует в активации транскрипции гена рибосомного белка L11 человека Воронина Е.Н., Колокольцева Т.Д., Слынько Н.М., Нечаева Е.А., Филипенко М.Л. Molecular Biology, 2008, т.42, № 1, с.110-116.
	Web-based computational tools for the prediction and analysis of post-translational modifications of proteins. Ivanisenko V.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Methods in Molecular Biology, 2008, V. 446, P. 363-384.
2007	Comparative study of CYP2B induction in the liver of rat and mice by different compounds. Pustylnyak V.O., Lebedev A.N., Gulyaeva L.F., Lyakhovich V.V., Slynko N.M.. LIFE SCI, 2007, v.80, pp 324-329
	The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A. In Silico Biology, 2007, 3, 7, 333-354
	The location of the gene regions under selective pressures: PLATO algorithm parallelization Vyatkin Yu. V., Gunbin K.V., Snytnikov A.V., Afonnikov D.A. Lect Notes Comput Sci, 2007, V. 4671, P. 184-187.
2006	Создание пшенично-ржаных замещенных линий с идентификацией хромосомного состава кариотипов методами C-бэндинга, GISH и SSR-маркеров Силкова О.Г., Добровольская О.Б., Дубовец Н.И., Адонина И.Г., Кравцова Л.А., Родер М.С., Салина Е.А., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2006, №46, т.42, с. 793-802
	Phylogenetic reconstruction of Aegilops section Sitopsis and the evolution of tandem repeats in the diploids and derived wheat polyploids Salina E.A., Lim Y.K., Badaeva E.D., Shcherban A.B., Adonina I.G., Amosova A.V., Samatadze T.E., Vatolina T.Yu., Zoshchuk S.A., Leitch A. R. GENOME, 2006, 49: 1023-1035
	Prediction of Contact Numbers of Amino Acid Residues Using a Neural Network Regression Algorithm D. A. Afonnikov, A. V. Morozov, N. A. Kolchanov BIOPHYSICS, 2006, 7,51,
	Wheat genome structure: translocations during the course of polyploidization Salina E.A., Leonova I.N., Efremova T.T., Roder M.S. Functional and Integrative Genomics, 2006, V (1), P. 71-80
2005	Актуальные проблемы компьютерной протеомики Иванисенко В.А., Афонников Д.А., Николаев С.В., Пинтус С.С., Крестьянова М.А., Пальянов А.Ю, Титов И.И. Информационный вестник ВОГИС, 2005, т.9, с.162-178
2004	Inheritance and chromosomal location of the genes for long glume phenotype found in Portuguese landraces of hexaploid wheat, ‘Arrancada’ Watanabe N., Goncharoiv N.P., Bannikova S.V. Journal of Genetics and Breeding, 2004, Vol. 58. P.273-278.
	Интегрированная компьютерная система по регуляции экспрессии генов эукариот. Н. А. Колчанов, О. А Подколодная, Е. А. Ананько, Д. А. Афонников, О. В. Вишневский, Д. В. Воробьев, Е. В. Игнатьева, В. Г. Левицкий, В. А. Лихошвай, Н.А.Омельянчук, Н.Л. Подколодный, А. В. Ратушный Molecular Biology, 2004, Молекулярная биология 2004, т.38, №1, с.69-81.
	Бильданова Л.Л., Бадаева Е.Д., Салина Е.А., Першина Л.А. (2004) Молекулярно-генетический анализ и С-окрашивание хромосом аллоплазматических линий мягкой пшеницы, полученных н основе беккроссных потомков ячменно пшеничных гибридов Hordeum vulgare L. (2n=14) x Triticum aestivum L. (2n=42) и различающихся по проявлению фертильности Генетика 40(12):1668-77. Бильданова Л.Л., Бадаева Е.Д., Салина Е.А., Першина Л.А. RUSS J GENET+, 2004, 40(12):1668-77
2003	Бильданова Л.Л., Салина Е.А., Першина Л.А. (2003) Изучение особенностей рекомбинации ядерного генома у беккроссных потомков ячменно-пшеничных гибридов Hordeum vulgare L. (2n=14) x Triticum aestivum L. (2n=42) с использованием SSR-анализа. Генетика 39(3): 1673-1679 Бильданова Л.Л., Салина Е.А., Першина Л.А. RUSS J GENET+, 2003, 39(3): 1673-1679
2002	ASPD (Artificially Selected Proteins/Peptides Database): a database of proteins and peptides evolved in vitro. Valuev V.P., Afonnikov D.A., Ponomarenko M.P., Milanesi L., Kolchanov N.A. NUCLEIC ACIDS RES, 2002, 1, 30, 200-202
	Бильданова Л.Л., Салина Е.А., Першина Л.А. (2002) Изучение беккроссных потомков ячменно-пшеничных гибридов с использованием методов RAPD и RAMPO. Генетика 38(3): 332-339. Бильданова Л.Л., Салина Е.А., Першина Л.А. RUSS J GENET+, 2002, 38(3): 332-339
2001	Detection of conserved physico-chemical characteristics of proteins by analyzing clusters of positions with coadaptive substitutions D.A. Afonnikov , D. Yu. Oshchepkov, and N.A. Kolchanov BIOINFORMATICS, 2001, V.17(11):1-12.
	Bildanova L.L., Troubacheeva N.V., Salina E.A., Pershina L.A. (2001) Molecular changes in the genome of backcrossed progenies of barley-wheat hybrids. EWAC Newsl. N 11: 92-94. Bildanova L.L., Troubacheeva N.V., Salina E.A., Pershina L.A. EWAC Newsletter, 2001, N 11: 92-94.
1997	Выявление коррелирующих позиций ДНК-связывающего района транскрипционных факторов семейств CREB и AP-1 Афонников Д.А., Кондрахин Ю.В., Титов И.И. Molecular Biology, 1997, Т. 31, №4, С. 741-748
1990	Vershinin A., Salina E.A., Solovyov V., Timopheeva (Bildanova) L. 1990. Genomic organization, evolution and structural peculiarities of highly repetitive DNA of Hordeum vulgare. Genome. V.33. P.441-449. Vershinin A., Salina E.A., Solovyov V., Timopheeva L. GENOME, 1990, V.33. P.441-449.

Монографии

2021	Практическая молекулярная генетика для начинающих: 8–9-е классы. Аульченко Ю.С., Баттулин Н.Р., Бородин П.М., Воронина Е.Н., Карташов М.Ю., Колесникова Т.Д., Нижников А.А., Пилипенко А.С., Посух О.В., Седых С.Е., Соловьев В.И., Торгашева Н.А., Фишман В.С., Хлесткина Е.К., Цыбко А.С., Шнайдер Т.А., Юнусова А.М.
2020	Изоляция протопластов Solanum tuberosum и Solanum verrucosum и их PEG‑опосредованная трансформация, Егорова А. А., Иванова К. А., Герасимова С. В.
2019	Web-Based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Posttranslational Modifications of Proteins Ivanisenko, V. A., Ivanisenko, T. V., Saik, O. V., Demenkov, P. S., Afonnikov, D. A. and Kolchanov, N. A.
2010	Анализ эволюции в семействах белоккодирующих генов у архей рода Pyrococcus при адаптации к высоким давлениям океанических глубин Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А.
	BioinfoWF – веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики Генаев М.А., Гунбин К.В., Афонников Д.А.
	Молекулярная эволюция циклинов: зависимость между изменением белков и ростом сложности эукариот Гунбин К.В., Турнаев И.И., Афонников Д.А.
	Роль микроорганизмов в функционировании живых систем: фундаментальные проблемы и биоинженерные приложения И. С. Андреева, А. В. Брянская, С. М. Жмодик, В. А. Лихошвай, Б. Б. Намсараев, Д. Ю. Рогозин, О. П. Таран, С. Е. Ткачев, Е. А. Ананько, K. Aсано, Д. А. Афонников, Т. Г. Банзаракцаева, Д. Д. Бархутова, Ж. Батаа, В. В. Бахвалова, С. И. Беликов, В. М. Белолипецкий, П. В. Белолипецкий, Т. К. Белянин, А. А. Богуш, Е. В. Болдырева, Е. Н. Болдарева, A. В. Брушков, Л. И. Бурцева, С. П. Бурюхаев, В. В. Власов, С. Н. Генова, Н. А. Гольцова, В. М. Горленко, К. В. Гунбин, Э. В. Данилова, А. Г. Дегерменджи, М. А. Дымова, Е. К. Емельянова, В. И. Жираковский, А. В. Задорожный, С. С. Ибрагимова, Л. И. Иванов, Г. В. Калмыкова, Т. П. Камынина, А. В. Качко, И. В. Козлова, Л. П. Козырева, Ю. П. Колмогоров, Н. А. Колчанов, В. Н. Компаниченко, Е. В. Лаврентьева, Е. В. Лазарева, С. А. Лашин, С. Г. Ливанов, Н. Н. Ливанова, Ю. Г. Матушкин, И. B. Морозов, О. В. Морозова, З. Б. Намсараев, С. Ф. Орешкова, Д. Ю. Ощепков, В. В. Панов, В. Н. Пармон, С. Е. Пельтек, Н. И. Печуркина, О. А. Подколодная, В. А. Пономарчук, И. Г. Прокопкин, В. Г. Пугачев, Н. М. Пуховская, Л. И. Пучкова, В. А. Рар, А. В. Ратушный, В. Е. Репин, А. С. Розанов, Е. И. Рябчикова, Ю. В. Сабитова, И. В. Саранина, Д. В. Семенова, В. А. Симонов, О. Г. Смирнова, К. Н. Сорокина, Т. Ю. Степанова, О. В. Стронин, В. В. Суслов, M. Taнака, О. С. Таранов, Н. В. Тикунова, И. И. Турнаев, Т. Торок, О. Д. Тотменина, М. Ю. Трусова, M. Утсуми, М. Л. Филипенко, Н. В. Фоменко, M. Фукуда, М. А. Хаснатинов, Т. М. Хлебодарова, Д. Д. Цыренова
	Visualization and Analysis of Biological Networks combining Text Mining and Data Warehouse Approaches Björn Sommer, Evgeny S. Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian J. Janowski, Timofey V. Ivanisenko, Anatoly O. Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel S. Demenkov, Alexey V. Kochetov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov and Ralf Hofestädt
2009	The importance of transpositions and recombination to genome instability according hobo-element distribution pattern in completely sequence genome of Drosophila melanogaster Zakharenko L. P., Perepelkina M. P., Afonnikov D. A.
2008	Анализ режима адаптивной эволюции в белках вируса гепатита С. В Системная компьютерная биология, под ред. Колчанова Н.А., Гончарова С.С., Лихошвая, В.А., Иванисенко В.А., Новисибирск, 2008, Изд-во СО РАН, с. 602-610. Варламова Е.С., Афонников Д.А., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
	Классификация локального пространственного окружения аминокислотных остатков по физико-химическим свойствам. В Системная компьютерная биология, под ред. Колчанова Н.А., Гончарова С.С., Лихошвая, В.А., Иванисенко В.А., Новисибирск, 2008, Изд-во СО РАН, с. 281-289. Афонников Д.А., Колчанов Н.А.
	Компьютерный анализ структурно-функциональных характеристик протеасомной деградации белков. Системная компьютерная биология, под ред. Колчанова Н.А., Гончарова С.С., Лихошвая, В.А., Иванисенко В.А., Новисибирск, 2008, Изд-во СО РАН, с. 296-301. Барышев П.С., Афонников Д.А.
	Координированные замены аминокислот в белках. Системная компьютерная биология, под ред. Колчанова Н.А., Гончарова С.С., Лихошвая, В.А., Иванисенко В.А., Новисибирск, 2008, Изд-во СО РАН, с. 591-602. Афонников Д.А.
2007	The Hedgehog Signaling Cascade System: Evolution and Functional Dynamics Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Omelyanchuk L.V., Kolchanov N.A.
2006	Prediction of contact numbers of amino acid residues using a neural network model. In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (Eds. N.Kolchanov and R. Hofestaedt) Springer Science+Business Media, Inc. 2006, pp. 297-304. Afonnikov D.A.

Конференции

2023	ВЛИЯНИЕ РЕГУЛЯТОРНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ В ПРОМОТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНОВ PPD-1 НА ВРЕМЯ КОЛОШЕНИЯ РАСТЕНИЙ T. AESTIVUM, ПОЛУЧЕННЫХ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ Киселёва А.А., Тимонова Е. М., Бережная А.А., Салина Е.А. X Съезд Общества физиологов растений России (ОФР) «Биология растений в эпоху глобальных изменений климата»
	ГЕНОМНОЕ РЕДАКТИРОВАНИЕ РАСТЕНИЙ КАК ИНСТРУМЕНТ НОВОЙ ЗЕЛЁНОЙ РЕВОЛЮЦИИ А.А. Киселёва, Е.А. Салина Международный конгресс "CRISPR-2023"
	Интрогрессивная гибридизация мягкой пшеницы Адонина И.Г., Тимонова Е.М., Салина Е.А. INTERNATIONAL CONFERENCE CHROMOSOME 2023
	Synthetic amphiploids - a potential source of common wheat genetic diversity in economically valuable traits Adonina I. G., Zorina M.V., Mehdiyeva S.P., Leonova I.N., Komyshev E.G., Timonova E.M., Salina E.A. The 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2023)
	The use of a genome substituted form of Avrodes to expand the genetic diversity of common wheat Davoyan R.O., Bebykina I.V., Davoyan E.R., Zubanova Y.S., Boldakov D.M., Zinchenco A.N., Salina E.A., Badaeva E.D., Adonina I.G. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Common wheat introgression lines with genetic material of the tribe Triticeae as a source of diversity for quality traits Leonova I.N., Kiseleva A.A., Berezhnaya A.A., Potapova N.A., Tsepilov Ya.A., Vinichenko N.A., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Allopolyploidization as a driving force of chromosome reorganization of Triticum species Salina E.A. The 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2023)
	The impact of terahertz radiation on stress response systems of prokaryotes Peltek S., Bannikova S., Mesheryakova I., Bryanskaya A., Oshchepkov D., Vasiliev G., Vasilievа A., Uvarova Y., Kiseleva E., Popik V., Khlebodarova T.M., Goryachkovskaya T THE 5-TH INTERNATIONAL CONFERENCE “TERAHERTZ AND MICROWAVE RADIATION: GENERATION, DETECTION AND APPLICATIONS” (TERA-2023)
	The ICAnnoLncRNA pipeline for a Long-Non-coding-RNA identification and Annotation in Transcriptomic Data Пронозин Артем Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Study of grain shape, color and pre-harvest sprouting in population of winter bread wheat cultivated in Russia Afonnikova S.D., Kiseleva A.A., Fedyaeva A.V., Afonnikov D.A., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	QTL analysis for heading time and grain-filling period in Triticum aestivum L. Berezhnaya A.A., Kiseleva A.A., Stasyuk A.I., Leonova I.N., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	The study and modification of wheat heading and maturity genes using genome approaches including CRISPR/Cas9 gene editing technology Kiseleva A.A., Timonova E.M., Berezhnaya A.A., Stasyuk A.I., Kolozhvari A.E., Nesterov M.A., Kelbin V.N., Leonova I.N., Kochetov A.V., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	The study of the influence of various factors on the germination index in the collection of soft winter wheat (Triticum aestivum L.) Fedyaeva A.V., Afonnikova S.D., Afonnikov D.A., Deeva V.N., Pryanishnikov A.I., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Analysis of the genome structure and its variations in potato cultivars grown in Russia Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	MASRUSplants: an online database of DNA markers associated with rust resistance genes of wheat Kelbin V.N., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	The first appearance of a virulence to the wheat gene Sr24 among stem rust samples from Kemerovo Laprina Yu.V., Skolotneva E.S., Kelbin V.N., Boyko N.I., Salina E.A., Shcherban A.B. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Developing plasmid vectors with cultivar specific U6 promoter to enhance CRISPR/Cas9 genome editing efficiency in potato (Solanum tuberosum) Larichev K.T., Sergeeva E.M., Karetnikov D.I., Afonnikov D.A., Salina E.A., Kochetov A.V. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Influence of allelic variability of photoperiod genes on soybean maturity time in central Russia and West Siberian Pervf`lev R.N., Shcherban A.B., Potapov D.A., Maksimenko K.V., Kiryukhin S.V., Gurinovich S.O, Panarina V.I., Polyudina R.I., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Structural analysis of genes affecting the tuber starch content and properties in Russian potato varieties Sergeeva E.M., Karetnikov D.I., Afonnikov D.A., Larichev K.T., Salina E.A., Kochetov A.V. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Effects of alleles of Ppd-D1 and Vrn-B3 genes on heading time and yield-related traits in spring common wheat Stasyuk A.I., Kiseleva A.A., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Efficient CRISPR/Cas9-based genomic editing technique for Nud gene mutagenesis in commercial barley cultivar mediated by particle bombardment Timonova E.M., Kiseleva A.A., Nesterov M.A., Sergeeva E.M., Filipenko E.A., Adonina I.G., Kochetov A.V., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
	Modification of agricultural traits in cultivated varieties of barley and wheat Timonova E.M., Kiseleva A.A., Berezhnaya A.A., Nesterov M.A., Adonina I.G., Kochetov A.V., Salina E.A. 3rd International Conference “Genetically modified organism. The Нistory, Achievements, Social and Environmental Risks”
	СОЗДАНИЕ ПЛАЗМИДНОГО ВЕКТОРА С СОРТОСПЕЦИФИЧНЫМИ ПРОМОТОРАМИ U6 ДЛЯ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ РОССИЙСКИХ СОРТОВ КАРТОФЕЛЯ (SOLANUM TUBEROSUM) Ларичев К.Т., Сергеева Е.М., Каретников Д.И., Афонников Д.А., Салина Е.А., Кочетов А.В. Международный конгресс "CRISPR-2023"
	НАПРАВЛЕНИЯ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ТЕХНОЛОГИЙ В СЕЛЕКЦИИ РАСТЕНИЙ: ОПЫТ КГЦ ИЦИГ СО РАН Салина Е.А., Кочетов А.В. Международный форум природоподобных технологий. Курчатовский геномный форум 2023
	ОТ АНАЛИЗА СТРУКТУРЫ ГЕНОВ К ПОЛУЧЕНИЮ ЛИНИЙ КАРТОФЕЛЯ SOLANUM TUBEROSUM С ИЗМЕНЕННЫМИ СВОЙСТВАМИ КРАХМАЛА Сергеева Е.М., Ларичев К.Т., Каретников Д.И., Афонников Д.А., Салина Е.А., Кочетов А.В. Международный форум природоподобных технологий. Курчатовский геномный форум 2023
2022	Картирование локусов, связанных с продолжительностью межфазных периодов мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.) Бережная А.А., Киселёва А.А., Стасюк А.И., Салина Е.А. 6-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений»
	Влияние аллельного разнообразия генов, контролирующих фотопериод, на сроки созревания сои Перфильев Р.Н., Щербань А.Б., Потапов Д.А., Максименко К.В., Кирюхин С.В., Гуринович С.О., Панарина В.И., Полюдина Р.И., Салина Е.А. 6-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений»
	Оценка полиморфизма коллекции озимой пшеницы по устойчивости к прорастанию зерна на корню Федяева А.В., Салина Е.А. 6-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений»
	Поиск дифференциально экспрессирующихся генов в мутантах по гену nud ячменя Короткова А.М., Скрипилева А.И., Вихорев А.В., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Хлесткина Е.К. Генофонд и селекция растений, 6-я Международная конференция посвященная 135-летию Н. И. Вавилова
	SSR генотипирование коллекции монопустульных изолятов Puccinia graminis f. sp. tritici Сколотнева Е.С., Кельбин В.Н., Лаприна Ю.В., Салина Е.А. 6-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений»
	ВКЛАД ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО ГЕНОТИПИРОВАНИЯ В СЕЛЕКЦИЮ РАСТЕНИЙ Салина Е.А. 6-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений»
	ПОИСК ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНО ЭКСПРЕССИРУЮЩИХСЯ ГЕНОВ В МУТАНТАХ ПО ГЕНУ NUD ЯЧМЕНЯ Короткова Анна Михайловна, Скрипилева Анастасия Ивановна, Вихорев Александр Викторович, Колосовская Екатерина Вадимовна, Герасимова Софья Викторовна, Хлесткина Елена Константиновна. ГЕНОМИКА И СОВРЕМЕННЫЕ БИОТЕХНОЛОГИИ В РАЗМНОЖЕНИИ, СЕЛЕКЦИИ И СОХРАНЕНИИ РАСТЕНИЙ (GenBio2022)
	Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T. 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T. 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Differential gene expression analysis in barley Nud gene mutants Korotkova A.M., Skripileva A.I., Vihorev A.V., Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Khlestkina E.K. 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” – BGRS/SB-2022
	Impact of terahertz irradiation on the antimicrobial resistance of Escherichia coli JM 103 Shedko E., Uvarova Y., Bannikova S., Goryachkovskaya T., Popik V., Bryanskaya A., Peltek S. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022)
	Высокопроизводительное генотипирование коллекции зерновых и зернобобовых культур Салина Е.А. Первый научный форум «Генетические ресурсы РОССИИ»
	QTLs associated with the duration of the developmental phases in wheat Berezhnaya A., Kiseleva A., Salina E. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
	Whole genome sequencing and development of KASP markers for genotyping the West Siberian wheat stem rust population Kelbin V.N., Muterko A.F., Skolotneva E.S., Sergeeva E.M., Salina E.A. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
	Dissection of candidate genes for grain texture in common wheat Kiseleva A.A., Leonova I.N., Salina E.A. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
	Development of CRISPR/Cas9-based genome editing constructs for Nevsky and Udacha potato cultivars Larichev K., Sergeeva E., Karetnikov D., Salina E., Kochetov A. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
	Natural variation of E1-E4, E9, GmFT5a genes in 180 soybean accessions adapted to Novosibirsk regions Perfl`ev R., Shcherban A., Potapov D., Maksimenko K., Polyudina R., Salina E. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
	The divergence of wheat 5B chromosomes during evolution and its impact on recombination suppression Salina E., Muterko A., Kiseleva A., Korol A. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
	Reconstruction and analysis of potato Solanum tuberosum pangenome of Siberian cultivars Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V., Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
	On organizing a software platform for seeking biotechnologically important features in bacteria Lashin S., Demenkov P., Ivanisenko V., Kazantsev F., Mukhin A., Kolchanov N BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Finding the ways for potential increasing of L-valine biosynthesis yield in C. glutamicum with mathematical modeling Kazantsev F., Klimenko A., Kropochev A., Trofimova M., Lashin S BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Computer annotation of plant protein sequences based on sequence similarity and orthology Malyugin E., Mustafin Z., Pronozin A., Genaev M., Afonnikov D. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022)
	Large scale analysis of the crop transcriptomic data: analysis of out of the reference transcripts Afonnikov D.A., Genaev M.A., Shmakov N.A., Mustafin Z.S., Mukhin A.M., Lashin S.A. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022)
	Математическое моделирование метаболизма L-валина бактерии C. glutamicum Трофимова Мария Федоровна МНСК-2022
	A comprehensive study of genetic mechanisms of common wheat heading and maturity times Antonina Kiseleva, Alina Berezhnaya, Anatoliy Stasyuk, Ekaterina Timonova, Anastasiya Kolozhvari, Irina Leonova, Alexey Kochetov, Elena Salina 2nd International Wheat Congress
	Genome-wide association mapping of genomic regions associated with agronomic important traits in Russian spring bread wheat varieties Irina N. Leonova, Antonina A. Kiseleva, Alina A. Berezhnaya, Ekaterina S. Skolotneva, Elena A. Orlova, Anatoly I. Stasyuk, Ivan E. Likhenko, Elena A Salina 2nd International Wheat Congress
	РЕКОНСТРУКЦИЯ И АНАЛИЗ ПАНГЕНОМА КАРТОФЕЛЯ SOLANUM TUBEROSUM СОРТОВ СИБИРСКОЙ СЕЛЕКЦИИ Каретников Д.И., Генаев М.А., Нестеров М.А., Ибрагимова С.М., Васильев Г.В., Тощаков С.В., Гавриленко Т.А., Афонников Д.А., Салина Е.А., Патрушев М.В., Кочетов А.В. III Международная научно-практическая конференция "Клеточная биология и биотехнология растений"
	ПОЛУЧЕНИЕ НОВЫХ ГЕНОТИПОВ КАРТОФЕЛЯ С УСТОЙЧИВОСТЬЮ К ХОЛОДОВОМУ ОСАХАРИВАНИЮ Егорова А.А., Герасимова С.В., Сабоиев И.А., Домрачев Д., Коэппель И., Хикель Ш., Хертиг К., Чамас С., Кумлен Й., Рогозина Е., Чалая Н., Салина Е.А., Кочетов А.В. XIX ВСЕРОССИЙСКАЯ МОЛОДЕЖНАЯ ШКОЛА-КОНФЕРЕНЦИЯ ПО АКТУАЛЬНЫМ ПРОБЛЕМАМ ХИМИИ И БИОЛОГИИ
	RECONSTRUCTION AND ANALYSIS OF PANGENOME OF SIBERIAN CULTIVARS OF POTATO SOLANUM TUBEROSUM Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Shmakov N.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V. III Всероссийская конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике» (HSG-2022)
	Полногеномный анализ ассоциаций для изучения содержания белка в зерне мягкой пшеницы А.А. Киселёва, А.А. Бережная, И.Н. Леонова, Е.А. Салина Всероссийская научно-практическая конференция «Генетические ресурсы растений для генетических технологий: к 100-летию Пушкинских лабораторий ВИР»
	ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МЕХАНИЗМОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В ФОРМИРОВАНИИ ПРОДОЛЖИТЕЛЬНОСТИ МЕЖФАЗНЫХ ПЕРИОДОВ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ А. А. Киселёва, А. А. Бережная, А. И. Стасюк, Е. М. Тимонова, А. Э. Коложвари, И. Н. Леонова, Е. А. Салина V Вавиловская международная конференция
	The impact of terahertz radiation on living systems. Peltek S., Bannikova S., Khlebodarova T., Shedko E., Meshcheryakova I., Bryanskaya A., Oshchepkov D., Vasiliev G., Vasilieva A., Uvarova Y., Kiseleva E., Popik V., Goryachkovskaya T. 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	The influence of environmental and genetic factors on the portability of polygenic risk score models across diverse ancestry groups NOSTAEVA A., KUZNETSOV I., ZHAIVORON A., AULCHENKO Y., KARSSEN L. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
	Integration of transcriptomic, genomic, and proteomic data in order to assess the impact of translation efficiency features on protein abundance for various prokaryotes Korenskaia A.E., Matushkin Yu.G., Lashin S.A., Klimenko A.I. BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Bioinformatic assessment of factors affecting the correlation between protein abundance and elongation efficiency in prokaryotes Korenskaia A.E., Matushkin Yu.G., Lashin S.A., Klimenko A.I. BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Genome assembly of a new Wolbachia pipientis strain: a promising source for studying Drosophila melanogaster endosymbiosis Klimenko A.I., Korenskaia A.E., Shishkina O.D., Andreenkova O.V., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E. BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	СРАВНИТЕЛЬНЫЙ ГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ ШТАММОВ WOLBACHIA PIPIENTIS, РАЗЛИЧАЮЩИХСЯ ПО ВЛИЯНИЮ НА СТРЕССОУСТОЙЧИВОСТЬ DROSOPHILA MELANOGASTER Шишкина О.Д., Андреенкова О.В., Клименко А.И., Коренская А.Е., Васильев Г.В., Шацкая Н.В., Грунтенко Н.Е. HSG-2022: III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике"
	Анализ сельскохозяйственных сортов ячменя методом GBS Пронозин Артем Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Салина Елена Артемовна GeneBio-2022
	Investigation of promising biotechnological strains from the FRC ICG SB RAS collection using omix technologies and bioin-formatics methods Uvarova Y., Bryanskaya A., Shipova, A., Vasilievа А., Goryachkovskaya T., Shedko E., Peltek S. BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2022) Novosibirsk, 04–08 июля 2022 года
	On the search for markers formed in the processes of microbiological metabolism of industrial waste on the example of lignin and oil sludge by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) A.R. Vasileva, Y.E. Uvarova, N.M. Slynko, T.N. Goryachkovskaya, A.V. Bryanskaya, I.A. Meshcheryakova, E.V. Antonov, L.E. Tatarova, I.N. Lytkin, A.A. Shipova, S.E. Peltek BGRS-2022
	Industrial enzymes production based on genetically engineered microorganisms strains of super-producers Peltek S., Zadorozhny A., Rozanov A., Bogacheva N., Shlyakhtun V., Voskoboev M., Blinov A., Sukhih I., Chesnokov D., Pavlova E., Goryachkovskaya T., Bochkov D., Korzhuk A., Ushakov V., Bannikova S., Meshcheryakova I., Antonov E., Vasilieva A., Shedko E., Shipova A., Uvarova Y. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022)
	IMPUTATION-BASED WHOLE-GENOME ANALYSIS IDENTIFIES CANDIDATE VARIANTS AFFECTING BODY TEMPERATURE UNDER THE COLD STRESS IN SIBERIAN CATTLE Igoshin A.V., Yudin N.S., Larkin D.M. BGRS/SB-2022
2021	Выявление генетических локусов, ассоциированных со временем созревания мягкой пшеницы БережнаяA.А., Киселёва А.A., Салина Е.А. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2021) : The 13th International Young Scientists School; Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology (PlantGen School 2021) : Young Scientists School (October 4–9, 2021, Novosibirsk, Russia)
	Quantitative genetics of human protein N-glycosylation Yurii Aulchenko 10th Moscow Conference on Computational Molecular Biology МССМВ21
	Insights into the genetic components of chronic back pain Elizaveta E. Elgaeva, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Pradeep Suri, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov 10th Moscow Conference on Computational Molecular Biology МССМВ21
	Shared heredity: a method to model genetic basis of correlated traits Gulnara R. Svishcheva, Evgeny S. Tiys, Sofia G. Feoktistova, Elizaveta E. Elgaeva, Sodbo Z. Sharapov, Yakov A. Tsepilov MCCMB 2021
	Pan-transcriptomic analysis of Solanum tuberosum NLR genes regulating resistance to Phytophthora infestans Shmakov N.A., Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Vasiliev G.V. PlantGen2021
	A feedback loop enrchment analysis in gene network of bronchial asthma and pulmonary tuberculosis interaction Evgeny S. Tiys, Pavel S. Demenkov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ ОДНОВРЕМЕННО С ОЖИРЕНИЕМ И ЛИМФЕДЕМОЙ, С ПОМОЩЬЮ СИСТЕМЫ ANDSYSTEM Сайк О.В., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Нимаев В.В. Международная научно-практическая конференция «Лимфология: от фундаментальных исследований к медицинским технологиям»
	Targeted knockout of the NUD gene in Siberian barley Korotkova A.M., Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Hertig C., Otto I., Kumlehn J., Khlestkina E.K. PlantGen2021
	Advanced panel of molecular markers identifying of stem rust resistance genes Sr2, Sr15, Sr21, Sr22, Sr23, Sr24, Sr25, Sr26, Sr31, Sr35, Sr36, Sr38, Sr39, Sr45, Sr57, Lr6Ai#2 in Siberian wheat cultivars Kelbin V.N., Skolotneva E.S., Shamanin V.P., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	The studying genetic regulation of the vaviloid type of spike branching in hybrid lines of hexaploid wheat Adonina I.G., Zorina M.V., Shcherban A.B., Mehdiyeva S.P., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Identification and characterization of two novel VRN-B3 alleles in Russian common wheat Berezhnaya A.A., Kiseleva A.A., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Study of the relationship between the conductive system of the internodes in spring bread wheat with lodging resistance and yield traits Ageeva E.V., Leonova I.N., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Using synthetic forms of RS5 and RS7 to expand the genetic diversity of common wheat for disease resistance Davoyan R.O., Bebykina I.V., Davoyan E.R., Zubanova Y.S., Zinchenco A.N., Badaeva E.D., Salina E.A., Adonina I.G. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Developing potato varieties with decreased cold-induced sweetening Egorova A., Gerasimova S., Ibragimova S., Romanova A., Saboiev I., Domrachev D., Koeppel I., Hertig C., Hiekel S., Chamas S., Kumlehn J., Rogosina E., Chalaya N., Salina E., Kochetov A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Regeneration capacity of potato cultivars prone to cold sweetening Ibragimova S., Romanova A., Saboiev I., Salina E., Kochetov A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Functional characterization of genes with circadian expression patterns in common wheat Kiseleva A.A., Bragina M.K., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	An integrated approach to study genetics of Triticum aestivum vegetation period Kiseleva А.А., Stasyuk A.I., Bragina M.K., Berezhnaya A.A., Kolozhvari A.E., Leonova I.N., Kochetov A.V., Salina E.А. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	The study of the wheat Ppd-D1 regulatory region using Cas9 RNA-directed nuclease system Kolozhvari A.E., Kiseleva А.А., Salina E.А. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Genetic loci for grain protein and gluten content in Russian spring wheat varieties Leonova I.N., Kiseleva A.A., Stasyuk A.I., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	CRISPR/Cas9 – mediated genome editing of bread wheat to modulate heading time Miroshnichenko D., Timerbaev V., Klementyeva A., Salina E., Dolgov S. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Development of a marker panel for genotyping of soybean cultivars by genes controlling the flowering time and response to the photoperiod Perfil’ev R.N., Shcherban A.B., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Comparative assessment of sugar accumulation in commercial potato cultivars (Solanum tuberosum L.) for genome editing Saboiev I., Ibragimova S., Egorova A., Salina E., Kochetov A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	The selection of efficient sgRNAs for CRISPR-Cas9 genome editing of potato (Solanum tuberosum L.) aimed to obtain the cultivars with low-amylose starch properties Sergeeva E.M., Larichev K.T., Bragina M.K., Salina E.A., Kochetov A.V. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Structural analysis of the candidate gene that controls awn length in common wheat Triticum aestivum L. Shcherban A.B., Kuvaeva D.D., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	The influence of alien translocations on in vitro androgenesis in lines of spring common wheat Timonova E.M., Adonina I.G., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	The studying of hybrid line with spherical grains and reduced height obtained by crossing triticale and synthetic hexaploid wheat Zorina M.V., Adonina I.G., Mehdiyeva S.P., Salina E.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Whole-genome resequencing points to candidate variants and genes for body temperature maintenance under the cold stress in Siberian cattle populations A.V. Igoshin, N.S. Yudin, R.B. Aitnazarov, A.A. Yurchenko, D.M. Larkin ISAG-2021. 38th International Society for Animal Genetics Conference
	Actin, tropomyosin and peroxiredoxin-2 in atherosclerotic plaques at different stages of development in coronary atherosclerosis Stakhneva EM, Meshcheryakova IA, Demidov EA, Starostin KV, Peltek SE, Polonskaya YV, Kashtanova EV, Shramko VS, Ragino YI. 89 EAS Congress 2021
	Разработка маркеров к генам биосинтеза крахмала картофеля Solanum tuberosum L. Сергеева Е.М., Щербань А.Б., Куваева Д.Д., Афонников Д.А., Салина Е.А., Кочетов А.В. V Всероссийская конференция «Фундаментальная гликобиология»
	Transcriptome analysis of Nud transgene mutant barley Korotkova A.M., Kolosovskaya E.V. , Gerasimova S.V. , Khlestkina E.K. SBB-2021 The 13th International Young Scientists School Systems Biology and Bioinformatics
	Genomics for crop breeding: past and future Salina Е.А. The 2nd International Scientific and Practical Conference "Genomics and modern biotechnologies in plant propagation, breeding and preservation" (GenBio2021)
	Метод общей адаптации выявления функциональных нуклеотидных замен в породах крупного рогатого скота для использования в геномной селекции и редактировании Ларкин Д.М., Рувинский Д.Е., Игошин А.В., Ромашов Г.А., Юдин Н.С. 3-я Международная научно-практическая конференция «Молекулярно-генетические технологии анализа экспрессии генов продуктивности и устойчивости к заболеваниям животных»
	Филотранскриптомный анализ генных сетей сахарного диабета 2 типа МАРТЮШЕВА Т.А., МУСТАФИН З.С., КЛИМОНТОВ В.В., ЛАШИН С.А. САХАРНЫЙ ДИАБЕТ-2021: ОТ МОНИТОРИНГА К УПРАВЛЕНИЮ
	Omingenic model of control of N-glycosylation of immunoglobulin G Arina Nostaeva, Sodbo Sharapov, Gordan Lauc, Michel Georges, Yury Aulchenko European Conference of Human Genetics
	Omingenic model through a lens of genetics of protein N-glycosylation Aulchenko Yurii, Kuznetsov Ivan, Nostaeva Arina, Lauc Gordan, Georges Michel Biology of Genomes
	Analysis of the genetic components behind the chronic back pain Elizaveta E. Elgaeva, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Pradeep Suri, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov ASHG Virtual Meeting 2021
	Meta-analysis of genome-wide association studies for N-glycosylation in 10,000 individuals. Sodbo Sharapov, Yakov Tsepilov, Elizaveta Elgaeva, Evgeny Tiys, Arina Nostaeva, Frano Vuckovic, Irena Trbojević-Akmačić, Michel Georges, Karsten Suhre, Nishi Chaturvedi, Harry Campbell, Malcolm Dunlop, Frances Williams, Matthias B. Schulze, Tim Spector, Gordan Lauc, Yurii S. Aulchenko. European Human Genetics Conference 2021 (ESHG 2021)
	Mapping genes involved in control of N-glycosylation of blood glycoproteins through a large genome-wide association study. Sharapov S., Tsepilov Y., Elgaeva E., Tiys E., Nostaeva A., Vuckovic F., Trbojević-Akmačič I., Georges M., Suhre K., Chaturvedi N., Campbell H., Dunlop M., Williams F., Schulze M., Spector T., Lauc G., Aulchenko Y. МССМВ'21. 10th Moscow Conference on Computational Molecular Biology
	Identification and structural features analysis of long noncoding RNAs Пронозин Артем Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology.
	Identification and structural analysis of long noncoding RNAs Пронозин Артем Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB)
	Prediction, classification and annotation of long noncoding RNAs Пронозин Артем Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич 6th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding (CBB6)
	Identification and classification of long noncoding RNAs Пронозин Артем Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич Марчуковские научные чтения – 2021.
	Микробные сообщества в веществе из потока рассеяния Урского хвостохранилища (Кемеровская область, п. Урск) Розанов А.С., Мягкая И.Н., Коржук А.В., Изотова А.А., Тощаков С.В., Лазарева Е.В., Пельтек С.Е. Международная научная конференция, посвящённая 150-летию Севастопольской биологической станции — Института биологии южных морей имени А. О. Ковалевского и 45-летию НИС «Профессор Водяницкий», "Изучение водных и наземных экосистем: история и современность"
	Изучение микробных сообществ соленых озер новосибирской области: от кое к mag Брянская А.В., Уварова Ю.Е., Шипова А.А., Розанов А.С., Старостин К.В., Горячковская Т.Н., Таран О.П., Лазарева Е.В., Пельтек С.Е. Разнообразие почв и биоты Северной и Центральной Азии. Материалы IV Всероссийской конференции с международным участием, посвященной году науки и технологий в Российской Федерации и 40-летию Института общей и экспериментальной биологии СО РАН.
2020	Использование расширенной панели молекулярных маркеров на гены устойчивости (Sr21, Sr23, Sr35, Sr36, Sr38) к стеблевой ржавчине на сортах мягкой и твердой пшеницы Кельбин В.Н., Сколотнева Е.С., Морозова Е.В., Салина Е.А. 5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» GPB 2020
	Структурно-функциональные особенности новых аллелей гена цветения мягкой пшеницы VRN-B3 Бережная А.А., Киселева А.А., Салина Е.А. 5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» GPB 2020
	Поиск и функциональный анализ генов с циркадным паттерном экспрессии у мягкой пшеницы Брагина М.К., Киселёва А.А., Салина Е.А. 5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» GPB 2020
	Новые гены-кандидаты, определяющие текстуру зерна у российских сортов мягкой пшеницы Киселева А.А., Леонова И.Н., Пшеничникова Т.А., Салина Е.А. 5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» GPB 2020
	Наследование генов-маркеров к митохондриальной ДНК у аллоплазматических линий T. dicoccum x T. aestivum Перфильев Р.Н., Щербань А.Б., Салина Е.А. 5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» GPB 2020
	Отбор с помощью молекулярных маркеров линий яровой мягкой пшеницы с ранним сроком колошения Стасюк А.И., Киселева А.А., Салина Е.А. 5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» GPB 2020
	Кариотипические особенности гибридных форм гексаплоидной пшеницы с вавилоидным типом ветвления колоса Адонина И.Г., Прокопьева М.В., Мехдиева С.П., Салина Е.А. 5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» GPB 2020
	Разработка алгоритмов для нахождения факторов транскрипции и их сайтов связывания в аннотированных бактериальных геномах Лахова Т.Н., Ощепков Д.Ю., Мухин А.М., Лашин С.А. 12-я Международная школа молодых ученых «Системная Биология и Биоинформатика» / 12th International young scientists school «System Biology and Bioinformatics», SBB-2020
	MGSGenerator 1.5: software tool for reconstructing mathematical models of metabolic networks F.V. Kazantsev, S.A. Lashin BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Loci and genes involved in chronic musculoskeletal pain identified via analysis of genetically independent pain phenotypes Y Tsepilov, M Freidin, A Shadrina, E Elgaeva, S Sharapov, J van Zunder, L Karssen, P Suri, F Williams, Y Aulchenko BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Novel loci associated with plasma immunoglobulin G N-glycosylation identified by a multivariate analysis Alexandra S. Shadrina, Alexander S. Zlobin, Olga O. Zaytseva, Gordan Lauc, Lucija Klaric, Sodbo Z. Sharapov, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Loci and Genes Involved in Chronic Musculoskeletal Pain Identified via Analysis of Genetically Orthogonal Pain Phenotypes Y Tsepilov, M Freidin, A Shadrina, E Elgaeva, S Sharapov, J van Zunder, L Karssen, P Suri, F Williams, Y Aulchenko European Mathematical Genetics Meeting
	QTL analysis complemented by the transcriptome sequencing to identify candidate genes associated with wheat heading time Antonina A. Kiseleva, Alexandr F. Muterko, Elena A. Salina 8th Plant Genomics and Gene Editing Congress: Europe
	Detection and investigation of genes with circadian expression pattern in common wheat Antonina Kiseleva, Maria Bragina, Elena Salina 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” (BGRS/SB-2020)
	The algorithm for finding potentially oscillating behavior in enzymatic systems Lakhova T.N., Kazantsev F.V, Matushkin Yu.G., Lashin S.A. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Multigene phylogenies for the earthworm Eisenia nordenskioldi (Lumbricidae, Annelida) Shekhovtsov S.V., Shipova A.A., Poluboyarova T.V., Peltek S.E. BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020) Symposium Systems biology and biomedicine
	Изучение генетической регуляции накопления кутику-лярного воска ячменя при помощи анализа данных RNA-seq Вихорев А., Шмаков Н., Колосовская Е., Короткова А., Герасимова С., Хлесткина Е. 12-я Международная школа молодых ученых «Системная Биология и Биоинформатика» / 12th International young scientists school «System Biology and Bioinformatics», SBB-2020
	Comparison in the proteoms of atherosclerotic plaques at different stages of development in coronary atherosclerosis Stakhneva E.M., Meshcheryakova I.A., Demidov E.A., Starostin K.V., Peltek S.E., Shramko V.S., Striukova E.V., Ragino Yu.I. 88 EAS CONGRESS
	Эпидемиология стеблевой ржавчины в Западной Сибири: применение SSR маркеров Кельбин Василий Николаевич, Салина Елена Артемовна XXVII Международной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов»
	The prospects for the study of the avirulence genes characteristic for the West Siberian population of wheat stem rust Puccinia graminis f. sp. tritici Vasiliy Kelbin, Ekaterina Sergeeva, Ekaterina Skolotneva, Elena Salina 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” (BGRS/SB-2020)
	Получение голозерных линий ячменя после направленной модификации гена Nud методом CRISPR/CAS. Короткова А.М., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. Генофонд и селекция растений
	АНАЛИЗ ПОПУЛЯЦИИ МУТАНТОВ И ПОЛУЧЕНИЕ ЛИНИЙ РАСТЕНИЙ ПОСЛЕ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ПО ГЕНУ NUD У ЯЧМЕНЯ Короткова А.М., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. ХХ-я научная конференция молодых ученых «Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и сельскохозяйственной микробиологии»
	ANDDIGEST: A TEXT-MINING BASED COMPUTER SYSTEM FOR GENERATING DIGESTS IN THE FIELD OF BIOLOGY IVANISENKO TIMOFEY, DEMENKOV PAVEL, IVANISENKO VLADIMIR, KOLCHANOV NIKOLAY BGRS/SB-2020. THE 12TH INTERNATIONAL MULTICONFERENCE
	Получение линий растений мутантов и анализ полученных популяций после геномного редактирования по гену Nud у ячменя Короткова А.М., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2020)
	Learning the changes of barnase mutants thermostability from structural fluctuations obtained using anisotropic network modeling Nikolay Alemasov, Nikita Ivanisenko, Vladimir Ivanisenko Twelfth International Multiconference BGRS/SB-2020
	Interpretation of the features of a linear regression model for predicting the survival time of the amyotrophic lateral sclerosis patients with mutated SOD1 Nikolay Alemasov, Alexandr Shcherbakov, Vladimir Timofeev, Vladimir Ivanisenko Twelfth International Multiconference BGRS/SB-2020
	WebMCOT web-service for prediction of co-occurred DNA motifs in ChIP-seq data Mukhin A. M., Levitsky V. G., Lashin S. A., Oshchepkov D. Y. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	OrthoWeb-web application for macroand microevolutionary analysis of genes Mustafin Z., Mukhin A., Afonnikov D., Matushkin Y., Lashin S BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	МИКРОБНЫЕ СООБЩЕСТВА ПРИРОДНОГО ОРНАНИЧЕСКОГО ВЕЩЕСТВА ИЗ ПОТОКА РАССЕЯНИЯ ВЫСКОКСУЛЬФИДНОГО ХВОСТОХРАНИЛИЩА А.С. Розанов, И.Н. Мягкая, Н.И. Ершов, Б.Ю. Сарыг-оол, М.А. Густайтис, А.А. Шипова, В.С. Ушаков, Е.В. Лазарева, С.Е. Пельтек VII МЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «БИОТЕХНОЛОГИЯ: НАУКА И ПРАКТИКА»
	Development and analysis of AIDS epidemic agent-based computer model applying an algorithm for explicit calculation of HIV replicability Anna Smirnova, Mikhail Ponomarenko, Sergey Lashin BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	MGSGenerator 1.5: инструментарий для реконструкции математических моделей метаболических сетей Казанцев Ф.В., Лашин С.А SBB-2020
	Изучение основных параметров устойчивости яровой пшеницы к мучнистой росе Н.П. Бехтольд, Е.А. Орлова, Т.А. Пшеничникова, Д.А. Афонников, У.С. Зубаирова Генофонд и селекция растений: доклады и сообщения V Международной конференции «Генофонд и селекция растений»
	Molecular genetic analysis of alloplasmic recombinant lines (Triticum dicoccum) – Triticum aestivum Shcherban A.B., Perfil'ev R.N., Salina E.A. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020)
	Features of the organization of bread wheat 5BS chromosome region carrying the leaf rust resistance gene Lr52 Брагина Мария Константиновна Афонников Дмитрий Аркадьевич Салина Елена Артемовна 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” (BGRS/SB-2020)
	ИССЛЕДОВАНИЕ ВЛИЯНИЯ ТЕРАГЕРЦОВОГО ИЗЛУЧЕНИЯ НА ЖИВЫЕ СИСТЕМЫ С ПОМОЩЬЮ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫХ E. COLI БИОСЕНСОРОВ Сердюков Д.С., Мещерякова И.А., Горячковская Т.Н., Попик В.М., Пельтек С.Е. VII Троицкая конференция с международным участием «Медицинская физика» (ТКМФ-7)
	Melatonin as a key regulator in molecular-genetic network of glucose variability related to circadian rhythm Cайк О., Деменков П., Иванисенко В., Климонтов В. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”,Symposium “Systems biology and biomedicine” (SbioMed-2020)
	Using fast homology search tools for protein sequence functional annotation: a comparison Pronozin A., Genaev M., Afonnikov D. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Использование программ быстрого поиска гомологии для функциональной аннотации белков Pronozin A., Genaev M., Afonnikov D. «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2020» (АПВПМ-2020)
	A new method for combining of genetically correlated traits by maximizing of their shared heritability Svishcheva G, Tiys E, Feoktisova S, Elgaeva E, Sharapov S, Tsepilov Y 48th European Mathematical Genetics Meeting (EMGM)
	Results of genome-wide association study of plasma proteome N-glycosylation in 10,000 samples Sodbo Sharapov, Yurii Aulchenko, Tim Spector, Sofya Feoktistova, Yakov A. Tsepilov, Elizaveta E. Elgaeva, Lucija Klaric, Eugene Tiys, Frano Vuckovic, Harry Campbell, Karsten Suhre, Matthias Schulze, Malcolm Dunlop, Frances Williams, Gordan Lauc BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Targeted mutagenesis of the HvMyc2 and HvAnt2 genes in Hordeum vulgare L. Anastasiya Egorova, Ksenia Strygina, Olesya Shoeva, Christian Hertig, Iris Koeppel, Stefan Hiekel, Alexander Vikhorev, Sophia Gerasimova, Jochen Kumlehn, Elena Khlestkina BGRS-2020
	Направленный нокаут гена вакуолярной инвертазы Pain-1 в Solanum tuberosum L. Егорова А.А., Герасимова С.В., Коэппель И., Хамаз С., Хикель Ш., Хертиг К., Ибрагимова С.М., Сабоиев И.А., Нестеров М.А., Кумлен Й., Салина Е.А., Кочетов А.В. SBB-2020
	Identification of an AP2/ERF Transcription Factor Controlling the Synthesis of Barley Epicuticular Wax Ekaterina Kolosovskaya, Sophia Gerasimova, Anna Korotkova, Christian Hertig, Sergey Morozov, Elena Chernyak, Dmitriy Domrachev, Vikhorev Alexander, Nikolay Shmakov, Alexey Kochetov, Jochen Kumlehn, Elena Khlestkina 12-ая Международная мультиконференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии / Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology, BGRS/SB-2020
	Идентификация регуляторного гена, контролирующего синтез кутикулярного воска ячменя Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Короткова А.М., Хертиг К., Морозов С.В., Черняк Е.И., Домрачев Д.В., Кочетов А.В., Кумлен Й., Хлесткина Е.К. 12-я Международная школа молодых ученых «Системная Биология и Биоинформатика» / 12th International young scientists school «System Biology and Bioinformatics», SBB-2020
	Изучение особенностей культивирования и регенерации iv vitro диких видов картофеля Колошина К.А., Иванова К.А., Герасимова С.В. Генофонд и селекция растений
	Quantitative genetics and computational functional genomics as tools to study biology Aulchenko Y.S. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Motility and fitness of microorganisms in dynamic aquatic ecosystems: a simulation study Клименко А.И., Матушкин Ю.Г., Лашин С.А. 12 международная мультиконференция BGRS/SB-2020
	Predicting elongation efficiency of gene translation for annotation of bacterial genomes: a case study for biosynthetic gene clusters of nonribosomal peptides Клименко А.И., Матушкин Ю.Г., Афонников Д.А. 12 международная мультиконференция BGRS/SB-2020
	EXTRACTION OF SPECTRAL SERIES OF IONS FROM MASS SPECTRA OF PEPTIDES BY METHODS OF INTEGRAL TRANSFORMS AND MACHINE LEARNING Fomin E., Alemasov N., Afonnikov D. BGRS-2020
	The genomes and mechanisms of adaptation to the cold climates in Russian native cattle breeds Buggiotti L., Yurchenko A., Yudin N., Larkin D. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020)
	Resequencing genomes of the Russian native Baikal and Tuva sheep breeds Sweet-Jones J., Yudin N., Larkin D. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020)
	Gene network of type 2 diabetes: reconstruction of analysis Zamyatin V., Mustafin Z., Matushkin Y., Afonnikov D., Klimontov V., Lashin S. BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020). The Twelfth International Multiconference Abstracts. 2020.
	Engineering and characterization of a recombinant human interferon alpha-2b fused with apolipoprotein A-I possessing prolonged action Maria Pykhtina *, Vladimir Romanov, Anastasiya Kotlyarova, Evgeniy Demidov, Svetlana Bannikova, Sergey Peltek, Anatoly Beklemishev 6th International Electronic Conference on Medicinal Chemistry
	Construction of a biosensor sensitive to terahertz radiation based on the glutamine synthetase gene promoter Irina Meshcheryakova, Tatyana Goryachkovskaya, Svetlana Bannikova, Alexey Rozanov, Elizaveta Demidova, Dmitry Oshchepkov, Evgeniy Demidov, Alla Bryanskaya, Nikolay Vinokurov, Vasiliy Popik, and Sergey Peltek Synchrotron and Free electron laser Radiation: generation and application (SFR-2020)
	Выявление ключевых участников молекулярно-генетических сетей, ассоциированных с лимфедемой, с помощью биоинформатических методов Сайк О.В., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Нимаев В.В. 7-й съезд лимфологов России и 8-я международная научно-практическая конференция по клинической лимфологии "ЛИМФА-2020"
	Компьютерная реконструкция экологической структуры сообщества кишечной микробиоты на основе высокопроизводительного секвенирования Кропочев А.И., Клименко А.И., Лашин С.А. 12 межд. конф. BGRS/SB-2020
	Разработка метода компьютерной реконструкции экологической структуры сообществ кишечной микробиоты на основе данных высокопроизводительного секвенирования Кропочев А. И Международная научная студенческая конференция МНСК 2020
2019	CYP75 gene family in barley Vikhorev A.V., Gerasimova S.V., Strygina K.V., Khlestkina E.K. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019): The Eleventh International Young Scientists School
	Итоги многолетних исследований наследственной глухоты у коренного населения Сибири: от эпидемиологии до молекулярной генетики, клеточной биологии и компьютерного моделирования. Посух О.Л.,Барашков Н.А., Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Данильченко В.Ю., Маслова Е.А., Пшенникова В.Г., Романов Г.П., Соловьёв А.В., Кларов Л.А., Федорова С.А., Терютин Ф.М., Лашин С.А., Орищенко К.Е., Морозов И.В., Бондарь А.А. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	ИССЛЕДОВАНИЕ РЕГЕНЕРАЦИОННОГО ПОТЕНЦИАЛА СОРТОВ ЯЧМЕНЯ Короткова А.М., Герасимова С.В., КукоеваТ.В., ХлесткинаЕ.К. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	ALTERING PLANT DOMESTICATION TRAITS VIA SITE-DIRECTED GENOME MODIFICATION Gerasimova S.V., Ivanova K.A., Hertig C., Korotkova A.M., Hiekel S., Kolosovskaya E., Koloshina K.A., Genaev M.A., Komyshev E.G., Egorova A.A., Domrachev D.V., Rogozina E.V., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО ФЕНОТИПИРОВАНИЯ РАСТЕНИЙ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы.
	WildPetotaDB – a database for genotype and phenotype of wild tuber-bearing species of the genus Solanum L. Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В. Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference
	Identification and characterization of a barley gene controlling cuticle wax formation Gerasimova S., Kolosovskaya E., Hertig C., Hiekel S., Korotkova A., Doroshkov A., Kukoeva T., Domrachev D., Kochetov A., Kumlehn J., Khlestkina E. Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference
	Decreasing wild potato toxicity by targeted modification of glycoalkaloid metabolism genes Egorova A.A., Ivanova K.A., Domrachev D.V., Kochetov A.V., Khlestkina E.K., Gerasimova S.V. Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference 24-29 июня 2019 г., Новосибирск, Россия
	Targeted knockout of the PAIN-1 gene in Solanum tuberosum Egorova A.A., Gerasimova S.V., Schedel S., Kumlehn J., Kochetov A.V. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	Genetic differences determining inter-individual variation in protein glycosylation Аульченко Ю.С., Шарапов С.Ж. 11th ISABS and 2nd Human Glycome Meeting
	Genetic landscape of human healthspan Zenin A, Tsepilov Y, Sharapov S, Getmantsev E, Menshikov LI, Fedichev PO, Aulchenko Y 9th Moscow Conference on Computational Molecular Biology МССМВ'19
	СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНОМА ПШЕНИЦЫ - НОВЫЕ ВОЗМОЖНОСТИ ДЛЯ СЕЛЕКЦИИ Салина Е.А. VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	СОЗДАНИЕ И ИСПОЛЬЗОВАНИЕ СИНТЕТИЧЕСКИХ ФОРМ ДЛЯ РАСШИРЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ НА ОСНОВЕ ГЕНОФОНДА ДИКИХ СОРОДИЧЕЙ Давоян Р.О., Бебякина И.В., Давоян Э.Р., Миков Д.С., Зубанова Ю.С., Болдаков Д.М., Зинченко А.С., Бадаева Е.К., Салина Е.А. VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНА СКВАЛЕН- СИНТАЗЫ У РАЗЛИЧНЫХ ВИДОВ АМАРАНТА Щербань А.Б., Стасюк А.И., Салина Е.А. VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	ОЦЕНКА ВЛИЯНИЯ ТРАНЛОКАЦИЙ ОТ AEGILOPS SPELTOIDES TAUSCH НА ЗИМОСТОЙКОСТЬ И УСТОЙЧИВОСТЬ К ЛИСТОВОЙ РЖАВЧИНЕ У ОЗИМОЙ ПШЕНИЦЫ Стасюк А.И., Леонова И.Н., Салина Е.А. VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	РОЛЬ БАРБАРИСА В ФОРМИРОВАНИИ ПОПУЛЯЦИИ ВОЗБУДИТЕЛЯ СТЕБЛЕВОЙ РЖАВЧИНЫ В НОВОСИБИРСКОЙ ОБЛАСТИ Сколотнева Екатерина Сергеевна, Кельбин Василий Николаевич, Сергеева Екатерина Михайловна, Салина Елена Артемовна IV Всероссийский съезд по защите растений с международным участием «Фитосанитарные технологии в обеспечении независимости и конкурентоспособности АПК России»
	Stem rust infection in Novosibirsk region: life cycle and origin Kelbin V.N., Skolotneva E.S., Vidich S., Salina E.A. 18th Congress of European Mycologists
	Current achievements in study of black-spiked barley Anastasiia Yu. Glagoleva, Sergey R. Mursalimov, Natalya V. Gracheva, Nickolay A. Shmakov, Natalya M. Levanova, Andreas Börner, Dmitry A. Afonnikov, Olesya Yu. Shoeva, Elena K. Khlestkina 5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding
	Transcriptomic analysis of barley partial albinism Nickolay Shmakov, Anastasiya Glagoleva, Gennadiy Vasiliev, Dmitry Afonnikov, Elena Khlestkina 5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding
	Метод морфометрии колоса пшеницы на основе анализа изображений Комышев Е.Г., Генаев М.А., Афонников Д.А. Международный конгресс Биотехнология: состояние и перспективы развития. Науки о жизни.
	Разработка методов автоматического определения количественных характеристик, описывающих фенотипические признаки колоса пшеницы Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.А. Афонников Международная конференция «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)
	Биоинформационный анализ путей регуляции экспрессии генов предрасположенности к аутизму Клименко А.И., Трифонова Е.А., Лашин С.А., Кочетов А.В. Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
	Antagonistic evolutionary scenarios in microbial communities are played out under ecological stratification fostered by spatial gradients A.I. Klimenko, Yu.G. Matushkin, N.A. Kolchanov, S.A. Lashin The International Society for Ecological Modelling Global Conference 2019
	Методы компьютерного моделирования иерархических биологических систем Лашин С. А., Матушкин Ю. Г., Клименко А. И., Казанцев Ф. В., Лахова Т. Н., Смирнова А. А. «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)
	Реконструкция генных сетей нейротрансмиттерных систем человека Р.А. Иванов, А. И. Клименко, А. Н. Савостьянов, С.А. Лашин «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)
	Creation and analysis of an agent-based computer model of the AIDS epidemic using an algorithm for explicit calculation of the HIV replicability Smirnova A.A., Ponomarenko M.P., Lashin S.A. 11th International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics” – SBB-2019
	LARGE GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY PROVIDES INSIGHT INTO THE GENETIC ARCHITECTURE OF LOW BACK PAIN AND ITS RISK FACTORS Tsepilov Y.A., Ю.С. Аульченко 47th European Mathematical Genetics Meeting
	ИССЛЕДОВАНИЕ ТРАНСКРИПТОМА ПОЧТИ ИЗОГЕННОЙ ЛИНИИ ЯЧМЕНЯ С ЧАСТИЧНЫМ АЛЬБИНИЗМОМ Шмаков Н.А., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А., Хлёсткина Е.К. БИОТЕХНОЛОГИЯ: СОСТОЯНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ
	ИССЛЕДОВАНИЕ ЧАСТИЧНОГО АЛЬБИНИЗМА ЯЧМЕНЯ С ПОЗИЦИИ ТРАНСКРИПТОМИКИ Шмаков Н. А., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А., Хлёсткина Е.К. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)
	Novel genomic marker for the Alm locus in barley identified based on transcriptome analysis N.A. Shmakov, A.Yu. Glagoleva, G.V. Vasiliev, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina PlantGen2019
	FoldGO - новый метод анализа функционального обогащения с учетом степени изменения транскрипционной активности. Вибе Д.С., Омельянчук Н.А., Мухин А.М., Лашин С.А., Миронова В.В. 7ой съезд ВОГиС
	RECONSTRUCTION OF ASSOCIATIVE GENE NETWORKS BASED ON AUTOMATIC EXTRACTION OF KNOWLEDGE FROM SCIENTIFIC PUBLICATIONS, PATENTS AND DATABASES USING INTELLIGENCE METHODS VA Ivanisenko, ES Tiys, TV Ivanisenko, PS Demenkov VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	РЕКОНСТРУКЦИЯ И АНАЛИЗ ГЕННОЙ СЕТИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ БОЛЕЗНИ АЛЬЦГЕЙМЕРА И ВИРУСНЫХ ПРОЦЕССОВ: ПОИСК НОВЫХ ГЕНОВ, ВОВЛЕЧЁННЫХ В МЕХАНИЗМ ЗАБОЛЕВАНИЯ Тийс Е.С., Иванисенко В.А. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	ANALYSIS OF BARLEY MUTANT POPULATIONS OBTAINED BY SIMULTANEOUS MUTAGENESIS AT FOUR GENOMIC LOCI Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Hertig С., Korotkova A.M., Kukoeva T.V., Hiekel S., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K. VII International Congress of Vavilov society of geneticists and breeders and associate symposiums
	Genetic control of human blood plasma N-glycome Sharapov S. Z.,Tsepilov Y.A. , Lauc G., Aulchenko Y.S. VI Съезд биохимиков России
	Genetic loci, associated with glycosylation of human total plasma proteins: a 2019 update Sodbo Zh Sharapov, Yakov A Tsepilov, Lucija Klaric, Massimo Mangino, Gaurav Thareja, Alexandra S Shadrina, Mirna Simurina, Concetta Dagostino, Julia Dmitrieva, Marija Vilaj, Frano Vuckovic, Tamara Pavic8, Jerko Stambuk, Irena Trbojevic-Akmacic, Jasminka Kristic, Jelena Simunovic, Ana Momcilovic, Harry Campbell, Margaret Doherty, Malcolm G Dunlop, Susan M Farrington, Maja Pucic-Bakovic, Christian Gieger, Massimo Allegri, Edouard Louis, Michel Georges, Karsten Suhre, Tim Spector, Frances MK Williams, Gordan Lauc, Yurii S Aulchenko 11th ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics
	ИССЛЕДОВАНИЕ ИЗМЕНЕНИЙ ПРОТЕОМА И ТРАНСКРИПТОМА ДРОЖЖЕЙ SACCHAROMYCES CEREVISIAE ПРИ ПЕРЕХОДЕ К АНАЭРОБНЫМ УСЛОВИЯМ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ Мещерякова И. А., Банникова С. В., Розанов А. С., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Демидов Е. А., Слынько Н.М., Старостин К. В., Пельтек С. Е. МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮКАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ,И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»
	ОМИКСНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ ДЛЯ ХАРАКТЕРИСТИКИ БИОРЕСУРСОВ Пельтек С.Е. , Старостин К.В., Ершов Н., Ефимов В.М., Шляхтун В.Н., Мещерякова И. А., Банникова С. В., Розанов А. С., Брянская А.В., Демидов Е.А. МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮ КАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ,И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»
	ФОРМИРОВАНИЕ И ИЗУЧЕНИЕ КОЛЛЕКЦИИ МИСКАНТУСА В ЗАПАДНОЙ СИБИРИ Бурмакина Н.В., Банникова С.В., Демидов Е.А., Мещерякова И.А., Розанов А.С., Слынько Н.М., Старостин К.В., Шеховцов С.В., Пельтек С.Е. МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮКАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ,И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»
	НЕТЕРМИЧЕСКОЕ ВОЗДЕЙСТВИЕ ТЕРАГЕРЦОВОГО ИЗЛУЧЕНИЯ НА ТЕРМОФИЛЬНЫЙ МИКРООРГАНИЗМ GEOBACILLUS ICIGIANUS Банникова С.В. , Мещерякова И.А. , Брянская А.В. , Розанов А.С. , Старостин К.В. , Попик В.М. , Пельтек С.Е. VI Съезд биофизиков России
	ВЫЯВЛЕНИЕ ПРОТЕОМНЫМИ МЕТОДАМИ ГЕНА ГЛУТАМИНСИНТЕТАЗЫ E. COLI, ЧУВСТВИТЕЛЬНОГО К ТЕРАГЕРЦОВОМУ ИЗЛУЧЕНИЮ Мещерякова И.А. , Банникова С.В. , Горячковская Т.Н. , Демидова Е.В. , Демидов Е.А. , Розанов А.С. , Попик В.М. , Пельтек С.Е. VI Съезд биофизиков России
	ИССЛЕДОВАНИЕ ВЛИЯНИЯ ТЕРАГЕРЦОВОГО ИЗЛУЧЕНИЯ НА ГЕННУЮ ЭКСПРЕССИЮ С ПОМОЩЬЮ БАКТЕРИАЛЬНЫХ ГЕНОСЕНСОРОВ Сердюков Д.С., Розанов А.С. , Мещерякова И.А. , Банникова С.В. , Горячковская Т.Н. , Ощепков Д.Ю. , Попик В.М. , Черкасова О.П. , Пельтек С.Е. VI Съезд биофизиков России
	Genome-wide tests and sequencing point to candidate gene variants for body temperature maintenance under the cold stress in Siberian cattle population A. V. Igoshin, A. A. Yurchenko, N. M. Belonogova, D. V. Petrovsky, R. B. Aitnazarov, V. A. Soloshenko, N. S. Yudin, D. M. Larkin ISAG-2019. 37th International Society for Animal Genetics Conference
	Dysregulation of postsynaptic translation in autism spectrum disorder: reconstruction of gene network associated with autism and mtor signaling. Rifonova E.A., Klimenko A.I., Saik O.V., Orlov Y.L., Lashin S.A., Ivanisenko V.A. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	ВЫРАЩИВАНИЕ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ В КЛИМАТИЧЕСКИХ УСЛОВИЯХ СИБИРСКОГО РЕГИОНА Колошина К.А., Иванова К.А., Герасимова С.В. МЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «РАЗВИТИЕ СЕЛЬСКОГО ХОЗЯЙСТВА НА ОСНОВЕ СОВРЕМЕННЫХ НАУЧНЫХ ДОСТИЖЕНИЙ И ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНЫХ ЦИФРОВЫХ ТЕХНОЛОГИЙ «СИБИРЬ – АГРОБИОТЕХНОЛОГИИ» («САБИТ-2019»), ПОСВЯЩЕННАЯ 50-ЛЕТИЮ СО ДНЯ СОЗДАНИЯ СО ВАСХНИЛ (СО РО
	KNOCKOUT OF NICOTINE BIOSYNTHESIS GENES IN NICOTIANA TABACUM USING RNA-GUIDED CAS ENDONUCLEASE Spaselnikova A.V., Egorova A.A., Tomilin M.A., Schedel S., Kumlehn J., Kochetov A.V., Gerasimova S.V. Международный конгресс "VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПБГУ, и ассоциированные симпозиумы"
	Эволюционный анализ генных сетей абиотического стресса растений Лашин С.А., Мустафин З.С., Замятин В.И., Константинов Д.К., Дорошков А.В., Афонников Д.А. VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	Gene networks of type 2 diabetes and Alzheimer’s disease. Reconstruction and analysis Zamyatin V., Mustafin Z.S., Matushkin Yu.G., Klimontov V.V., Lashin S.A. The 11th international young scientists school “Systems biology and bioinformatics”
	Компьютерная реконструкция экологической структуры синтетического микробного сообщества, моделирующего ядро микробиоты кишечника человека Кропочев А.И., Клименко А.И., Лашин С.А. 11 международная школа молодых ученых SBB-2019
2013	Разработка высокопроизводительных методов моделирования эволюции бактериальных сообществ в программе "Гаплоидный Эволюционный Конструктор" Мустафин З.С., Лашин С.А. Международная научная студенческая конференция «Студент и научно-технический прогресс»
	Анализ ISBP маркеров пшеницы, полученных на основе пиросеквенирования короткого плеча 5В хромосомы Triticum aestivum L. Л.Л. Бильданова, М.К. Колтунова, Е.М. Тимонова, Д.А. Афонников, Е.А. Салина Конференция ВОГиС "Проблемы генетики и селекции"
	Comparative analysis of the long and short arms of bread wheat 5B chromosome by data of low coverage 454-sequencing Sergeeva E., Afonnikov D., Koltunova M., Gusev V., Miroshnichenko L., Poncet C., Sourdille P., Feuillet C., Salina E. The 12th International Wheat Genome Symposium
	The stages of physical mapping of Triticum aestivum cv. Chinese spring chromosome 5B Sergeeva E.M., Timonova E.M., Bildanova L.L., Koltunova M.K., Nesterov M.A., Magni F., Dolezel J., Faris J., Sourdille P., Feuillet C., Salina E.A. International Wheat Genome Sequencings Consortium (IWGSC) Workshop
2012	Haploid evolutionary constructor: parallelization and high performance simulations of prokariotic communities evolution Мустафин З.С., Лашин С. А. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB 2012)
	Haploid evolutionary constructor: parallelization and high performance simulations of prokariotic communities evolution Мустафин З.С., Лашин С.А. Systems Bioligy & Bioinformatics (SBB 2012)
	Разработка высокопроизводительных методов моделирования эволюции бактериальных сообществ в программе "Гаплоидный Эволюционный Конструктор" Мустафин З.С., Лашин С.А. XIII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям
	Towards an analysis of the structure of the short arm of 5B chromosome of the bread wheat Triticum aestivum L. Е.M. Sergeeva, D.A. Afonnikov, L.L. Bildanova, M.K. Koltunova, E.M. Timonova, E.A. Salina The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology
	The approaches to the analysis of organization of 5BS chromosome of Triticum aestivum L. Sergeeva E.M., L.L. Bildanova, D.A. Afonnikov, M.K. Koltunova, E.M. Timonova, E.A. Salina. The 2-nd International Conference «Plant, genetics, genomics and biotechnology»
2011	VISUALIZATION AND ANALYSIS OF A CARDIO VASCULAR DISEASE-RELATED BIOLOGICAL NETWORK COMBINING TEXT MINING AND DATA WAREHOUSE APPROACHES Ralf Hofestädt, Björn Sommer, Evgeny Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian Janowski, Timofey Ivanisenko, Anatoly Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel Demenkov, Alexey Kochetov, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov Moscow Conference on Computational Molecular Biology 2011
	Автоматическая реконструкция ассоциативных генных сетей на примере анализа протеома мочи Тийс Е.С., Деменков П.С., Доброхотов И.В., Валеева О.А., Пастушкова Л.Х., Николаев Е.Н., Ларина И.М., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А. Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика, г. Новосибирск, 14-17 ноября 2011 г.
2010	Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А. 1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии"
	Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes of protein families: relation of molecular evolution with the phenotypical features of organisms Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. 14-th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles
	Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes of protein-coding genes: relation of molecular evolution with the phenotypical features of organisms Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Genaev M.A., Kolchanov N.A. 2nd Moscow International Сonference "Molecular phylogenetics" (MolPhy-2)
	WheatDB - база данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А. VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск
	Методы компьютерного анализа в исследовании опушения листа пшеницы TRITICUM AESTIVUM L. Дорошков А.В., Генаев М.А., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А. VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск
	Исследование опушения листа пшеницы Triticum aestivum L. с помошью высокоэффективных методов фенотипирования Дорoшков А.В., Генаев М.А., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А. XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.
	WheatPGE — система анализа взаимосвязей фенотип-генотип-окружающая среда у пшеницы Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А. Молодежный научный форум "ЛОМОНОСОВ - 2010" г. Москва
	Изучение влияния повышенных давлений на структуру белков NIP7 глубоководных и мелководных архей методами молекулярной динамики К.Е. Медведев, Д.А. Афонников Первая конференция посвященная 125-летию биологических исследований в ТГУ
	Молекулярная эволюция циклинов животных и грибов: зависимость между изменением белков и ростом сложности организмов Турнаев И.И., Гунбин К.В., Суслов В.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А. Первая международная научно-практическая конференция. Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине
	Анализ морфологии опушения листа у пшеницы: компьютерный подход с использованием анализа изображений Афонников Д.А. Дорошков А.В., Генаев М.А. Российско-Французского семинар "Геномика, биоинформатика и моделирование в науках о жизни", 18-21 июня 2010
	WheatPGE - компьютерная система анализа взаимосвязи признаков фенотипа генотипа и окружающей среды у пшеницы Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А. Электронные библиотеки:перспективные методы и технологии, электронные коллекции. XII Всероссийская научная конференция RCDL'2010. Казань
	A computer analysis of functional relationships between genes associated with multifactorial diseases: pre-eclampsia as an example E. Tiys, P. Demenkov, E. Vashukova, A. Glotov, V. Ivanisenko 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
	Analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L. using the high throughput phenotyping approach. A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A. Pshenichnikova, D.A. Afonnikov The International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”
	Using a computer-base image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Trticum aestivum L. A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova, D.A. Afonnikov. The 7th International Conference on Bioinformatics of Genome regulation and Structure.
	Анализ структур белков архей-пьезофилов под влиянием высокого давления с помощью компьютерных методов. Труды Томского государственного университета, сер. Биологическая, т. 275. Материалы 1й Всероссийской молодежной научной конференции «Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии», посвященной 125-летию биологических исследований в ТГУ. С. 378-380. Медведев К.Е., Афонников Д.А. 1я Всероссийская молодежная научная конференция «Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии», посвященная 125-летию биологических исследований в ТГУ
	BioinfoWF - веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики Генаев М.А., Гунбин К.В., Афонников Д.А. Электронные библиотеки: перспективные методы и технологии, электронные коллекции. RCDL’2010
	Molecular evolution of the Wolbachia wRi, wMel and wPip genomes Gunbin K.V., Ilinsky Yu.Yu., Afonnikov D.A. Проблемы экологии. Чтения памяти профессора М.М. Кожова. Тезисы докладов Международной научной конференции и Международной школы для молодых ученых (Иркутск, 20-25 сентября 2010 г.) – Иркутск: Изд-во Иркутского государственного университета. 2010. С. 242.
	Molecular evolution of the Wolbachia wRi, wMel and wPip genomes Gunbin K.V., Ilinsky Yu.Yu., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Crimean Meeting: Third International Conference, Dedicated N.V. Timofeeff-Ressovsky “Modern Problems of Genetics, Radiobiology, Radioecology and Evolution”; Third Readings after V.I. Korogodin and V.A. Shevchenko; NATO Advanced Research Workshop “Radiobio
	Minor changes in 2,4,6-triphenyldioxane-1,3 inducer structure cause changes in car mediated CYP2B induction V. Pustylnyak, A. Yarushkin, E. Kachaylo, N.Slynko, L. Gulyaeva 9th International ISSX Meeting
2009	Using the computer-based image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L. Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А. 1st Workshop on plant molecular biotechnology - XV Biotechnology summer school. 5-12 july, Gdansk, Poland
	Адаптивная эволюция археобактерий рода Pyrococcus: приспособления к обитанию в условиях высоких давлений на уровне генов и белков Гунбин К.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина
	Detection of genes that underwent positive selection in deep-sea archaea of Pyrococcus genus K.V. Gunbin, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov International Autumn School for Young Scientists on Computational Systems Biology and Bioinformatics
	Detection of genes that underwent positive selection in deep-sea archaebacteria of Pyrococcus genus K.V. Gunbin, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov 4th Moscow Conference on Computational Molecular Biology
	Компьютерный анализ распределения структурных аналогов активных сайтов в пространственных структурах ферментов Тийс Е. Новосибирск, апрель 2009 г.: Тез. докл. Материалы XLVII международной научной студенческой конференции "Студент и научно-технический прогресс": Биология.
	The importance of transpositions and recombination to genome instability according hobo-element distribution pattern in completely sequenced genome of Drosophila melanogaster Zakharenko L.P., Perepelkina M.P., Afonnikov D.A. In: Evolutionary Biology: Concept, Modeling, and Application. / Ed.: P. Pontarotti. – Springer-Verlag Berlin Heidelberg. 2009. P. 127-138.
	Structure-activity study of CYP2B induction in rat liver L. Gulyaeva, V. Pustylnyak, A. Yarushkin, N.Slynko 16th North American ISSX Regional Meeting
2008	The molecular evolution of the pyrococcus genomes: a computer-assisted study K.V. Gunbin, P.B. Baryshev, D.A. Afonnikov 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008
	The parallelization of the plato algorithm for analysis of the anomalously evolving gene regions Vyatkin Yu.V., Gunbin K.V., Snytnikov A.V., Afonnikov D.A. 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008
	Центр компетенции СО РАН - Intel Цели, задачи и некоторые результаты Глинский Б.М., Кучин Н.В., Самофалов В.В., Бакулина А.Ю., Афонников Д.А., Чеверда В.А. Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ'2008): Труды международной научной конференции (Санкт-Петербург, 28 января – 1 февраля 2008 г.). – Челябинск: Изд. ЮУрГУ, 2008
	Development of the computer approach for defining leaf hairiness in wheat based on its microscope image processing. D.A. Afonnikov, S.I. Arsenina, A.V. Doroshkov, T.A.Pshenichnikova. The Russian-French Conference “Problems and Prospects in Plant Biotechnology”.
	Analysis of the evolutionary specificities of the yfiA and yhbh E.Coli genes and their regulatory regions. Baryshev P.S., Oshchepkov D.Y., Khlebodarova T.M., Afonnikov D.A. Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
	Компьютерный анализ распределения структурных аналогов активных сайтов в пространственных структурах ферментов Тийс Е.С. XLVI международная научная студенческая конференция «Студент и научно-технический прогресс»: Биология
	Distribution of active site structural analogs in enzyme 3D-structures: computer analysis E.S.Teeys, V.A. Ivanisenko Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
2007	CMDB: a Database for Coordinated Mutations Yu. Vyatkin, D. Afonnikov Moscow Conference for Computational Molecular Biology (MCCMB'2007)
	Analysis of the positive selection in the Hh-signaling pathway genes Afonnikov D.A., Gunbin K.V. The 2nd Asian Bioinformatics Research and Education Network (ABREN) Virtual Training Workshop on Bioinformatics,June 20, 2007
	Структурные аналоги функциональных центров белков в пространственных структурах ферментов Тийс Е.С. XLV международная научная студенческая конференция «Студент и научно- технический прогресс»: Биология.
	CMDB: a database for coordinated mutations. Proc. Of the 3rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow, Jul 27-31, 2007, pp 316-318. Vyatkin Yu.V., Afonnikov D.A. 3rd Moscow conference on computational molecular biology, MCCMB'07
2006	Prediction of the contact numbers of the amino acid residues in proteins Афонников Д.А., Морозов 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
	Nondestructive Transfer of Complex Molecular Systems of Various Origin Into Aerosol Phase by Means of Submillimeter Irradiation of Free Electron Laser (FEL) of the Siberian Center for Photochemical Research A.S. Kozlov, A.K. Petrov, S.B. Malyshkin, M. B. Taraban, V. M. Popik,M.A. Scheglov, T.N. Goriachkovskaya, S.E. Peltek Joint 31st International conference on infrared and millimeter waves and 14th International conference on terahertz electronics: IRMMW – THz 2006, Sept. 18-22, 2006, Shanghai, China
	System computer biology in Institute of Cytology of SB RAS Yu. Matushkin, E. Ananko, D. Afonnikov, V. Golomolzin, V. Ivanisenko, E. Ignat’eva, A. Katokhin, V.Likhoshvai, D. Miginskii, N. Omelyanchuk, S. Peltek, T. Khlebodarova, N. Kolchanov Saint-Petersburg International Workshop on NanoBiotechnologies
	Nano/microfluid bio-analytical systems Pel'tek S.E., Pindyurin V.F., Popik V.M., Scheglov M.A., Goldenberg B.G., Eliseev V.S., Petrova E.V., Tikunova N.V., Rubtsov N.B., Goraychkovskaya T.N., Khlebodarova T.M., Govorun V.M., Kulipanov G.N., Kolchanov N.A. The XVI Intern. Synchrotron Radiation Conference (SR-2006), July 10-14, 2006, BINP, Novosibirsk, Russia
	Nondestructive transfer of complex molecular systems of various origin into aerosol phase by means of submillimeter irradiation of free electron laser (FEL) of Siberian center for photochemical research Petrov A.K., Kozlov A.S., Taraban M.B., Goriachkovskaya T.N., Malyshkin S.B., Popik V.M., Peltek S.E. XVI International synchrotron radiation conference: SR-2006, July 10-14, 2006, Novosibirsk
	Нано/микрофлюидные биоаналитические системы С.Е.Пельтек, Т.Н.Горячковская Н.В.Тикунова, Н.Б.Рубцов, Т.М.Хлебодарова, Н.А.Колчанов В.Ф.Пиндюрин, В.М.Попик, М.А.Щеглов, Б.Г.Гольденберг, В.С.Елисеев, Е.В.Петрова, Г.Н.Кулипанов, В.М.Говорун XVI международная конференция по использованию синхротронного излучения "СИ-2006" (Новосибирск)
	Особенности проявления гетероплазмии митохондриальной ДНК у беккросных потомков ячменно-пшеничных гибридов H. marinum subsp. gussoneanum (=H. geniculatum All.) (2n=28) T. aestivum L. (2n=42) Трубачеева Н.В., Салина Е.А., Першина Л.А. Всероссийская научная конференция "Структура и экспрессия митохондриального генома растений", Иркутск, 3-7 сентября 2006 г.
	Эволюция пшеницы: геномные перестройки в процессе образования полиплоидов Салина Е.А. IV Международная конференция "Проблема вида и видообразования" 25-28 сентября, Томск
	The use of microsatellite markers for comparative mapping of homologous in wheat Khlestkina E.K., Pshenichnikova N.A., Roder M.S., Salina E.A., Arbuzova V.S., Borner A. The 2d Intern. Tandem Rep. Conf. Workshop on the Bioinformatics, Genomics and Functionality of Microsatellites and VNTRs.
	Identification and structure-functional analysis of the specificity determining residues of the alpha subunits of the proteosomal complex. Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, Novosibirsk, Russia, 2006, v.1, p. 235-239. Baryshev P.B., Afonnikov D.A., Nikolaev S.V. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
	CONNP: the prediction of the contact numbers of the amino acid residues in proteins using neural network regression. Bioinformatics of genome regulation and structure. Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, Novosibirsk, Russia, 2006, v.1, p. 219-222. Afonnikov D.A., Morozov A.V. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
	Microsatellite loci across wheat genomes with a common origin E.A.Salina, I.N.Leonova, M.S.Roder The 2nd Intern.Tandem Rep.Cons.Workshop on the Bioinformatics and Functionality of Microsatellites
	Структурная организация субтеломерных районов хромосом Triticum aestivum по результатам анализа BAC-клонов Сергеева Е.М., Щербань А.Б., Адонина И.Г., Салина Е.А. Материалы Международной Конференции «Генетика в России и мире», посвященной 40-летию Института общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН
	Изменения организации генов 45S рРНК у искусственных аллополиплоидов Triticum-Aegilops Щербань А.Б., Бадаева Е.Д., Амосова А.В., Сергеева Е.М., Салина Е.А. Материалы Международной Конференции «Генетика в России и мире», посвященной 40-летию Института общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН

Гранты

2022	Генетический контроль дегенерации поясничных межпозвонковых дисков Российский Научный Фонд, Администрация Новосибирской области, номер гранта 22-15-20037
2021	Генетический потенциал сортов мягкой пшеницы и культурной сои и его использование в селекции на адаптивность и высокое содержание белка Российский научный фонд, номер гранта 21-76-30003
2020	Создание новых доноров для селекции картофеля методом редактирования геномов РФФИ, номер гранта 20-016-00217 А
	Изучение функциональной роли генов с циркадным паттерном экспрессии у мягкой пшеницы РФФИ, номер гранта 20-316-80003 мол_эв_а
2019	Гены - регуляторы гликозилирования белков человека Российский научный фонд, номер гранта 19-15-00115
	Исследование происхождения и сравнительный анализ следов отбора с использованием отсеквенированных геномов турано-монгольских пород крупного рогатого скота и сибирских пород овец Российский Научный Фонд, номер гранта 19-76-20026
2014	Идентификация генетических факторов, определяющих хозяйственно важные признаки у линий мягкой пшеницы (T. aestivum L.) с интрогрессией генетического материала тетраплоидных видов рода Triticum РФФИ, номер гранта 14-04-90000
	Особенности структурной организации и эволюции генов 5S рРНК генома В аллополиплоидной пшеницы Triticum aestivum L. РФФИ, номер гранта 14-04-32365
2013	Геном злаков: изучение организации и вклада отдельных участков хромосом и генных локусов в проявление признаков и формообразование. Правительство Российской Федерации, номер гранта VI.53.1.5
2012	Изучение структурной организации хромосомы 5В мягкой пшеницы с использованием современных технологий по картированию и секвенированию аллополиплоидных геномов Министерство образования и науки Российской Федерации, номер гранта МК-2573.2012.4
2011	Разработка алгоритмов и программных систем для решения задач анализа последовательностей, возникающих в теоретической и прикладной геномике Министерство образования и науки РФ, номер гранта 07.514.11.4003
2010	Участие в двустороннем Индо-Российском семинаре "Предсказательная биология с использованием системного и интегрированного анализа и методов" РФФИ, номер гранта 10-04-92803
	Разработка алгоритмов для биоинформационного анализа комплексных метаболических и молекулярно-генетических сетей Министерство образования и науки, номер гранта 14.740.11.0001
2009	Разработка Веб-ориентированной экспертной системы, предназначенной для распознавания взаимосвязанных белков, выявленных с применением постгеномных методов Федеральное агенство по науке и инновациям, номер гранта 02.514.11.4123
	ПОСТГЕНОМНАЯ БИОИНФОРМАТИКА: КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ Президиум СО РАН, номер гранта 119
	Компьютерное исследование молекулярной эволюции генов и молекулярно-генетических систем многоклеточных животных РФФИ, номер гранта 09-04-01641
	Структура и свойства молекулярных органических кристаллов в условиях высоких давлений и низких температур СО РАН (интеграционный проект), номер гранта 109
2007	Разработка универсальных геносенсоров для детекции общей токсичности, мутагенности и техногенных стрессов ФАНИ, номер гранта №02.512.11.2165
	Конструирование геносенсоров и оценка их чувствительности к токсическим воздействиям НГУ, номер гранта № 75/2007
	Участие в международной конференции Aaronsohn-ITMI РФФИ, номер гранта 07-04-0858
2006	Хромосомная и генетическая инженерия как метод изучения генома и экспрессии генов у растений Грант Президента РФ для поддержки ведущих научных школ, номер гранта НШ-528-2006.4
	РОЛЬ МИКРООРГАНИЗМОВ В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ И БИОИНЖЕНЕРНЫЕ ПРИЛОЖЕНИЯ Президиум СО РАН, номер гранта 24
	Применение высоких давлений к исследованию молекулярных кристаллов СО РАН (интеграционный проект), номер гранта 49
2005	Молекулярно-генетическое картирование генома пшеницы: построение насыщенных хромосомных карт и локализация локусов, контролирующих морфологические и количественные признаки РФФИ, номер гранта 05-04-48735-а
	Теоретическое исследование особенностей эволюции белков, обусловленных координированными заменами аминокислотных остатков РФФИ, номер гранта 05-04-49141
	Компьютерный анализ структурной организации и эволюции функциональных сайтов глобулярных белков РФФИ, номер гранта 05-04-49283
1999	Экспериментальное и теоретическое исследование пространственной структуры и процесса ренатурации белковых молекул РФФИ, номер гранта 99-04-49879

Научное руководство

2022	Оценка потенциала перепрофилирования лекарственных средств для лечения хронической боли в спине при помощи Менделевской Рандомизации Верзун Дмитрий Андреевич 2022-06-08
	"Реализация алгоритма клампинга однонуклеотидных полиморфизмов с учётом неравновесия по сцеплению на платформе GWAS-MAP" Трушин Александр Алексеевич 2022-06-06
2021	Разработка on-line системы хранения и анализа результатов полногеномных исследований ассоциаций Горев Денис Дмитриевич 05.13.01 — Системный анализ, управление и обработка информации (информационные и технические системы), 2021-12-30
	Разработка методов автоматического определения количественных характеристик, описывающих фенотипические признаки колоса пшеницы Комышев Евгений Геннадьевич 03.01.09 – математическая биология, биоинформатика, 2021-06-23
	Молекулярная эволюция белков, содержащих домен фосфолипазы А2, у плоских червей Бочарникова Мария Евгеньевна 06.03.01 Биология, 2021-06-08
	Разработка компьютерного метода классификации днРНК A. thaliana L. Москаленко Николай Олегович 06.03.01 Биология, 2021-06-08
	Эволюция генов рецепторов LysM Вавиловии прекрасной (Vavilovia formosa) Каретников Дмитрий Игоревич 06.03.01 Биология, 2021-06-08
	Экспрессия гонов Escherichia Coli в ответ на негероическое воздействие терагерцового излучении Сердюков Данил Сергеевич Молекулярная биология, 2021-02-23
2020	Платформа для комплексного анализа результатов полногеномных исследований ассоциаций Шашкова Татьяна Игоревна 03.01.09 – математическая биология, биоинформатика, 2020-12-24
	Интегрированная информационно-компьютерная платформа для исследования молекулярно-генетических систем Казанцев Федор Владимирович 2020-10-14
	Разработка программного комплекса для моделирования масс-спектров пептидов Епифанов Ростислав Юрьевич 09.04.01 - Информатика и вычислительная техника, 2020-06-24
2010	Анализ структур белков в условиях повышенных давлений при помощи компьютерных методов Медведев Кирилл Евгеньевич Генетика, 2010-06-01
2009	Предсказание контактов аминокислотных остатков в структурах белков с использованием алгоритма нейронной сети Корнилова Екатерина Владимировна Дискретная математика и математическая кибернетика, 2009-06-04
2008	Разработка системы определения опушенности листа пшеницы на основе анализа его изображения Арсенина Светлана Игоревна 2008-06-14
2006	Выявление и структурно-функциональный анализ аминокислотных остатков α субъединиц протеасомы, специфических для положения субъединиц в протеосомальном комплексе Барышев Павел Борисович Генетика, 2006-06-05
2005	Молекулярно-генетический анализ аллоплазматических рекомбинантных линий (H. vulgare)- T. aestivum с разным проявлением фертильности Бильданова Лариса Леонидовна 2005-10-19
	Компьютерный анализ молекулярной эволюции белков: исследование адаптивного режима эволюции белков вируса гепатита С человека. Варламова Елена Сергеевна Генетика, 2005-06-02
2004	Сравнение эволюционных расстояний семейств бактреиальных белков Савенкова Ульяна Викторовна Генетика, 2004-06-03
2003	Характеристика пшенично-ржаных замещенных линий с использованием микросателлитных маркеров и изучение влияния отдельных хромосом ржи на показатели андрогенеза in vitro Добровольская Оксана Борисовна 03.02.07 - генетика, 2003-12-10
2002	Использование RAPD-, STS-подходов для молекулярного картирования и маркирования генов мягкой пшеницы T. aestivum L. Хлёсткина Елена Константиновна 2002-04-24
2000	Микро- и макросателлиты генома мягкой пшеницы и ее сородичей Песцова Елена Геннадьевна 2000-11-29

Учебные курсы

2021	Introduction to quantitative genetics Moscow Institute of Physics and Technology, School of Medical and Biological Physics, Department of Bioinformatics and Systems Biology/Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет), Центр образовательных программ физтех-школы биологической и медицинской физики, семестров: 1
	Молекулярная генетика развития растений Курчатовский Геномный Центр, семестров: 1
2020	Models and methods of human quantitative genetics Аульченко Ю.С., Шарапов С.Ж., Ностаева А.В. Moscow Institute of Physics and Technology, School of Medical and Biological Physics, Department of Bioinformatics and Systems Biology; and Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences, семестров: 1
2011	Введение в биоинформатику, лекции НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, лекции. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
	Введение в биоинформатику, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
2010	Введение в биоинформатику, лекции НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, лекции. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
	Введение в биоинформатику, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
	Высокопроизводительные вычисления в биоинформатике Центр технологий HP в НГУ, семестров: 1
2009	Введение в биоинформатику, лекции НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, лекции. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
	Введение в биоинформатику, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
	Высокопроизводительные вычисления в биоинформатике Центр технологий HP в НГУ, семестров: 1
2008	Введение в биоинформатику, лекции НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, лекции. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
	Введение в биоинформатику, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
2007	Структурная компьютерная биология, лекции. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
	Введение в биоинформатику, лекции НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Введение в биоинформатику, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
2006	Структурная компьютерная биология, лекции. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
	Введение в биоинформатику, лекции НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Введение в биоинформатику, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра генетики, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
2005	Структурная компьютерная биология, лекции. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1
	Структурная компьютерная биология, семинары. НГУ, Факультет естественных наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1

Патенты

2023	Программа для предсказания взаимодействий между вершинами ассоциативной сети (ЭНДИнтерПредикт) / A program for predicting interactions between vertices of an associative network (ANDInterPredict) Иванисенко Тимофей Владимирович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович Номер патента 2023680578
	Программа для генерации обучающих выборок, предназначенных для глубокого машинного обучения графовых нейронных сетей (ЭНДТрэйнингСет) / A program for generating training sets for deep machine learning of graph neural networks (ANDTrainingSet) Иванисенко Тимофей Владимирович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович Номер патента 2023680472
	Программа для обучения графовой нейронной сети предсказанию ассоциативных связей между вершинами графа (ЭНДИнтерКоммон) / A program for deep machine learning of a graph neural network to predict associative interactions between vertices of a graph (ANDInterCommon) Иванисенко Тимофей Владимирович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович Номер патента 2023681228
	«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию магния (КСЦМг) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by magnesium content (СBVMg)» Злобин А.С., Потапова Н.А., Цепилов Я.А., Виниченко Н.А., Леонова И.Н., Салина Е.А. Номер патента 2023622542
	«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию марганца (КСЦМн) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by manganese content (СBVMn)» Злобин А.С., Потапова Н.А., Цепилов Я.А., Виниченко Н.А., Леонова И.Н., Салина Е.А. Номер патента 2023622543
	«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию цинка (КСЦЦ) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by zinc content (СBVZn)» Злобин А.С., Потапова Н.А., Цепилов Я.А., Виниченко Н.А., Леонова И.Н., Салина Е.А. Номер патента 2023622544
	Программа для анализа длинных некодирующих РНК (АднРНК) / Program for the long non-coding RNA analysis (AlncRNA) Пронозин Артем Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич Номер патента 2023665246
	Программа для обработки данных, полученных генотипированием путем секвенирования (ГПС-ОД) / The program for genotyping-by-sequencing data processing (GBS-DP) Пронозин Артем Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Салина Елена Артемовна Номер патента 2023665263
	«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию меди (КСЦМ) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by cuprum content (СBVCu)» Злобин А.С., Потапова Н.А., Цепилов Я.А., Виниченко Н.А., Леонова И.Н., Салина Е.А. Номер патента 2023622284
	«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию калия (КСЦК) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by potassium content (СBVK)» Злобин А.С., Потапова Н.А., Цепилов Я.А., Виниченко Н.А., Леонова И.Н., Салина Е.А. Номер патента 2023622285
	«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию железа (КСЦЖ) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by ferrum content (СBVFe)». Злобин А.С., Потапова Н.А., Цепилов Я.А., Виниченко Н.А., Леонова И.Н., Салина Е.А. Номер патента 2023622283
	«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию кальция (КСЦКа) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by calcium content (СBVCa)» Злобин А.С., Потапова Н.А., Цепилов Я.А., Виниченко Н.А., Леонова И.Н., Салина Е.А. Номер патента 2023621647
	Штамм бактерий bacillus licheniformis 47018, обладающий способностью продуцировать термостабильную альфа-амилазу. Брянская А.В., Горячковская Т.Н., Уварова Ю.Е., Бочков Д.В., Шипова А.А., Банникова С.В., Пельтек С.Е. Номер патента Патент на изобретение 2788850 C1
2022	Компьютерная программа генерации обучающих выборок для машинного обучения моделей классификации имён биологических объектов в неструктурированных текстах (ЭНДГен) / Computer program of the generating of learning sets for the training of models aimed on the classification of names of biological objects in unstructured texts (ANDGen) Иванисенко Тимофей Владимирович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович Номер патента 2022668790
	Программа для обучения моделей классификации имён биологических объектов в размеченных текстах, на основе контекста (ЭНДТрэин) / A program for training of classification models for the classification of names of biological entities in the pre-mapped texts, on the basis of their context (ANDTrain) Иванисенко Тимофей Владимирович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович Номер патента 2022667646
	Программа оценки точности разметки коротких имён биологических объектов в неструктурированных текстах на английском языке (ЭНДПред) / The program for assessing the accuracy of mapped short names of biological objects in the unstructured english texts (ANDPred) Иванисенко Тимофей Владимирович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович Номер патента 2022668741
	Пpoгpaммa для оценки количественных характеристик посевов пшеницы (OKXПП) / Software tool for estimating quantitative characteristics of wheat crops (WheatDetectionSystem)» Кожекин М.В., Афонников Д. А., Генаев М. А., Коваль В.С. Номер патента 2022668470
	Способ отбора константных безостых форм мягкой пшеницы Щербань Андрей Борисович, Куваева Диана Дмитриевна, Стасюк Анатолий Иванович, Салина Елена Артемовна Номер патента 2768393
2021	Молекула РНК-проводника для геномного редактирования протомоторной области гена VRN-а1 однодольных зерновых с применением системы CRISPR/CAS9 Тимербаев Вадим Рафаилович, Мирошниченко Дмитрий Николаевич, Клементьева Анна Александровна, Шульга Ольга Альбертовна, Салина Елена Артемовна, Долгов Сергей Владимирович Номер патента 2762831
	СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-(+)-ВИННОЙ КИСЛОТЫ Розанов А.С., Пельтек С.Е., Коржук А.В., Старостин К.В., Шляхтун В. Номер патента RU2756179C1
	Программа для расчета значений совстречаемости пар биологических объектов из онтологии ЭНДСистем в текстах рефератов научных публикаций (ЭНДМатч) / Program for pairwise scoring of co-occurrences between biological objects from the ontology of ANDSystem in the unstructured texts of abstracts of scientific publications (ANDMatch) Иванисенко Владимир Александрович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Тимофей Владимирович Номер патента 2021664006
	Программа для парного структурного выравнивания третичных структур белков (ТСБ) / Program for pairwise structure alignment of tertiary structures of proteins by secondary structure elements and atomic coordinates (TSP) Иванисенко Владимир Александрович, Иванисенко Тимофей Владимирович, Иванисенко Никита Владимирович Номер патента 2021663894
	Биотехнологически значимые штаммы бактерий (МикроБиотех) / Biotechnologically significant strains of bacteria (MicroBiotech) Мухин А.М., Лахова Т.Н., Клименко А.И., Казанцев Ф.В., Деменков П.С., Лашин С.А. Номер патента 2021621155
	База данных генетических ассоциаций признаков овец (ГАПО) Аульченко Ю.С., Шашкова Т.И., Цепилов Я.А., Кириченко А.В., Злобин А.С. Номер патента 2021620564
	Штамм бактерий Bacillus megaterium 83_ICG, обладающий способностью продуцировать пробиотические и антимикробные вещества класса органических кислот Брянская Алла Викторовна (RU) Уварова Юлия Евгеньевна (RU) Шляхтун Валерия Николаевна (RU) Слынько Николай Мефодьевич (RU) Татарова Людмила Евгеньевна (RU) Шипова Александра Андреевна (RU) Горячковская Татьяна Николаевна (RU) Пельтек Сергей Евгеньевич (RU) Номер патента 2557086
	База данных генотипа и фенотипа диких видов картофеля (WildPetotaDB) / A database of the genotype and phenotype of wild potato species (WildPetotaDB) Комышев Е.Г., Колошина К.А., Фомин И.В., Колосовская Е.В., Генаев М.А., Эрст Т.В., Егорова А.А., Чалая Н.А., Рогозина Е.В., Герасимова С.В. Номер патента 2021620100
2020	База данных дайджестов научных публикаций в области биологии (ЭНДДайджестДБ) / Database of digests of scientific literature in the field of biology (ANDDigestDB) Иванисенко Тимофей Владимирович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович Номер патента 2020621827
	Программный комплекс для управления веб ресурсом автоматической генерации дайджестов научных публикаций в области биологии (ЭНДДайджест) / Software package for the management of the web-based portal for the automated generation of digests of scientific publications in the field of biology (ANDDigest) Иванисенко ТВ, Деменков ПС, Иванисенко ВА Номер патента 2020660515
	Программа предсказания аминокислотных замен, модулирующих активность и стабильность, в белках семейства протеиназ К (ПАКЗАС/PAASAS) Иванисенко Н.В., Алемасов Н.А., Иванисенко В.А. Номер патента 2020617253
	Способ отбора растений яровой мягкой пшеницы с укороченным сроком колошения Салина Елена Артемовна, Стасюк Анатолий Иванович, Киселёва Антонина Андреевна Номер патента 2710729
2019	Программа для оценки количественных характеристик колоса пшеницы (ОКХК) / The program for the extraction the quantitative characheristics of the wheat spike (WERecognizer) Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич Номер патента 2019666362
2010	База данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы (ВитПГЕ). Генаев М.А., Дорошков А.В., Афонников Д.А. Номер патента 2010620602
1987	1-бром-3-(2,4-дихлор-нафтокси) пропан, обладающий синергетическиой активностьюк инсектицидам - неопинамину и мекарбенилу Слынько Н.М., Леонова И.Н., Салганик Р.И., Неделькина С.В., Перегуда Т.А., Агашкова Т.М. Номер патента 1338328

Система учета научной деятельности (ASSA)

Отделение "Курчатовский геномный центр ИЦиГ СО РАН"(т.157)

Бывшие сотрудники

Совместители

Публикации

Монографии

Конференции

Гранты

Научное руководство

Учебные курсы

Патенты