Система учета научной деятельности (ASSA)

Вход

Отделение "Курчатовский геномный центр ИЦиГ СО РАН" (т.157)

Научные подразделения

Подразделения

Центр коллективного пользования протеомики и метаболомики (т.215)

Афонников Дмитрий Аркадьевич
[главный научный сотрудник]

Научные результаты

Сотрудники

Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода:

Публикации Монографии Конференции Гранты Научное руководство Патенты

Публикации

2020	Phylogeny of the Eisenia nordenskioldi complex based on mitochondrial genomes Shekhovtsov S.V., Golovanova E.V., Ershov N.I., Poluboyarova T.V., Berman D.I., Bulakhova N.A., Szederjesi T., Peltek S.E. EUR J SOIL BIOL, 2020, V. 96. P. 103137.
	Identification of Antimicrobial Peptides from Novel Lactobacillus fermentum Strain. Anna S. Pavlova, Georgii D. Ozhegov, Georgij P. Arapidi, Ivan O. Butenko, Eduard S. Fomin, Nikolai A. Alemasov, Dmitry A. Afonnikov, Dina R. Yarullina, Vadim T. Ivanov, Vadim M. Govorun, Airat R. Kayumov PROTEIN J, 2020, 39, p. 73–84
	Dissecting DISC regulation via pharmacological targeting of caspase-8/c-FLIPL heterodimer Laura K. Hillert, Nikita V. Ivanisenko, Denise Busse, Johannes Espe, Corinna König, Sergey E. Peltek, Nikolai A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik CELL DEATH DIFFER, 2020
	Kmasker plants – a tool for assessing complex sequence space in plant species Sebastian Beier, Chris Ulpinnis, Markus Schwalbe, Thomas Münch, Robert Hoffie, Iris Koeppel, Christian Hertig, Nagaveni Budhagatapalli, Stefan Hiekel, Krishna M. Pathi, Goetz Hensel, Martin Grosse, Sindy Chamas, Sophia Gerasimova, Jochen Kumlehn, Uwe Scholz, Thomas Schmutzer PLANT J, 2020, doi:10.1111/tpj.14645
	Компьютерное моделирование эволюции микробной популяции: преодоление локальных минимумов при достижении пика на ландшафте приспособленности С. А. Лашин, З. С. Мустафин, А. И. Клименко, Д. А. Афонников, Ю. Г. Матушкин Генетика, 2020, том 56, № 2, с. 234–246
	Changes in the proteomic profile of blood serum in coronary atherosclerosis Stakhneva EM, Meshcheryakova IA, Demidov EA, Starostin KV, Peltek SE, Voevoda MI, Ragino YI J MED BIOCHEM, 2020, 39(2):208-214
	A Genome-Scale Metabolic Model of 2,3-Butanediol Production by Thermophilic Bacteria Geobacillus icigianus Kulyashov M., Peltek S.E., Akberdin I.R. Microorganisms, 2020, 8(7), 1002
	Создание линии табака со сниженными антифидантными свойствами по отношению к колорадскому жуку. Костина Н.Е., Спасельникова А.В., Егорова А. А., Колосовская Е.В., Домрачев Д.В., Романова А.В., Туманян С.Р., Хамас С., Кумлен Й., Дубовский И.М., Герасимова С.В. Биология в сельском хозяйстве, 2020, Т.3(1) 2020 г
	Fold-Change-Specific Enrichment Analysis (FSEA): Quantification of Transcriptional Response Magnitude for Functional Gene Groups Wiebe D.S., Omelyanchuk N.A., Mukhin A.M., Grosse I., Lashin S.A., Zemlyanskaya E.V., Mironova V.V. Genes, 2020, 11(4): 434
	Phylogeography and genetic lineages of Aporrectodea rosea (Lumbricidae, Annelida) Shekhovtsov S.V., Derzhinsky Y.A., Poluboyarova T.V., Golovanova E.V., Peltek S.E. EUR J SOIL BIOL, 2020, V. 99, 103191
	The Phylogeny of Class B Flavoprotein Monooxygenases and the Origin of the YUCCA Protein Family Turnaev I.I., Gunbin K.V., Suslov V.V., Akberdin I.R., Kolchanov N.A., Afonnikov D.A. Plants, 2020, 9(9), 1092
	The effect of meditation on comprehension of statements about one-self and others: a pilot ERP and behavioral study Alexander Savostyanov, Sergey Tamozhnikov, Andrey Bocharov, Alexander Saprygin, Yuriy Matushkin, Sergey Lashin, Galina Kolpakova, Klimenty Sudobin, Gennady Knyazev FRONT HUM NEUROSCI, 2020, V 13, Article 437
	Анализ цветовых и текстурных характеристик зерен злаков на цифровых изображениях Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.А. Афонников Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, т. 24, № 4, с. 340-347
	Использование гиперспектральной камеры Specim IQ для анализа растений В.В. Альт, Т.А. Гурова, О.В. Елкин, Д.Н. Клименко, Л.В. Максимов, И.А. Пестунов, О.А. Дубровская, М.А. Генаев, Т.В. Эрст, К.А. Генаев, Е.Г. Комышев, В.К. Хлесткин, Д.А. Афонников Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, т. 24, № 3, с. 259-266
	A study on effects of terahertz radiation on gene networks of Escherichia coli by means of fluorescent biosensors DS SERDYUKOV,TN GORYACHKOVSKAYA,IA MESCHERYAKOVA,SV BANNIKOVA,SA KUZNETSOV,OP CHERKASOVA,VM POPIK,SE PELTEK BIOMED OPT EXPRESS, 2020, Vol. 11, No. 9 /1 5258-5273
	Conversion of hulled into naked barley by Cas endonuclease-mediated knockout of the NUD gene Sophia V. Gerasimova, Christian Hertig, Anna M. Korotkova, Ekaterina V. Kolosovskaya, Ingrid Otto, Stefan Hiekel, Alex V. Kochetov, Elena K. Khlestkina, Jochen Kumlehn BMC PLANT BIOL, 2020
	Resequencing and signatures of selection scan in two Siberian native sheep breeds point to candidate genetic variants for adaptation and economically important traits J. Sweet‐Jones, A. A. Yurchenko, A. V. Igoshin, N. S. Yudin, M. T. Swain, D. M. Larkin ANIM GENET, 2020
	Quantifying Drosophila adults with the use of a smartphone Evgenia K. Karpova, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Natalya V. Adonyeva, Dmitry A. Afonnikov, Margarita A. Eremina, Nataly E. Gruntenko Biology Open, 2020, 9: bio054452
	Распространенность языка жестов в качестве источника данных для генетической эпидемиологии наследуемых форм потери слуха. Романов Г.П., Пшенникова В.Г., Лашин С.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Сазонов Н.Н., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А., Барашков Н.А. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). 54-56
2019	Quantitative characteristics of pubescence in wheat (Triticum aestivum L.) are associated with photosynthetic parameters under conditions of normal and limited water supply Tatyana A. Pshenichnikova, Alexey V. Doroshkov, Svetlana V. Osipova, Alexey V. Permyakov, Marina D. Permyakova, Vadim M. Efimov, Dmitry A. Afonnikov PLANTA, 2019, №3, V. 243, pp. 839–847
	MIGREW: database on molecular identification of genes for resistance in wheat Fedor V. Kazantsev, Ekaterina S. Skolotneva, Vasiliy N. Kelbin, Elena A. Salina, Sergey A. Lashin BMC BIOINFORMATICS, 2019, BMC Bioinformatics 2019, 20 (Suppl 1):36
	Current achievements in modifying crop genes using CRISPR/Cas system A.M. Korotkova, S.V. Gerasimova, E.K. Khlestkina. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 2019;23(1):29-37
	Genome-wide association study and scan for signatures of selection point to candidate genes for body temperature maintenance under the cold stress in Siberian cattle populations Alexander V. Igoshin, Andrey A. Yurchenko, Nadezhda M. Belonogova, Dmitry V. Petrovsky, Ruslan B. Aitnazarov, Vladimir A. Soloshenko, Nikolay S. Yudin, Denis M. Larkin BMC GENET, 2019
	Genome‐wide association study for body weight in cattle populations from Siberia A. V. Igoshin, N. S. Yudin, N. M. Belonogova, D. M. Larkin ANIM GENET, 2019
	Системный подход к моделированию развития листостебельных грибных инфекций пшеницы Николаев С.В., Зубаирова У.С., Сколотнева Е.С., Орлова Е.А., Афонников Д.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(1):100-109
	Progress in plant genome sequencing: research directions M.K. Bragina, D.A. Afonnikov, E.A. Salina Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 2019;23(1):38-48
	New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov, Egor B. Prokhortchouk, Mariya Y. Pakharukova, Konstantin V. Gunbin, Kirill Ustyantsev, Mikhail A. Genaev, Alexander G. Blinov, Alexander Mazur, Eugenia Boulygina, Svetlana Tsygankova, Ekaterina Khrameeva, Nikolay Chekanov, Guangyi Fan, An Xiao, He Zhang, Xun Xu, Huanming Yang, Victor Solovyev, Simon Ming-Yuen Lee, Xin Liu, Dmitry A. Afonnikov, Konstantin G. Skryabin BMC GENOMICS, 2019, 20:399
	Spatial heterogeneity promotes antagonistic evolutionary scenarios in microbial community explained by ecological stratification: a simulation study Klimenko A.I., Matushkin Y.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A. ECOL MODEL, 2019, V 399, p.66-76
	Оценка количественных характеристик клубнеобразования дикого картофеля на основе анализа изображений клубней с использованием компьютерного приложения SeedСounter К.А. Иванова, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, А.А. Егорова, К.А. Колошина, Н.А. Чала, Д.А. Афонников, А.В. Кочетов, Е.В. Рогозина, С.В. Герасимова Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 2019. Онлайн.
	The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development. Doroshkov AV, Konstantinov DK, Afonnikov DA, Gunbin KV. BMC PLANT BIOL, 2019
	Germline-restricted chromosome (GRC) is widespread among songbirds Torgasheva AA, Malinovskaya LP, Zadesenets KS, Karamysheva TV, Kizilova EA, Akberdina EA, Pristyazhnyuk IE, Shnaider EP, Volodkina VA, Saifitdinova AF,Galkina SA, Larkin DM, Rubtsov NB, Borodin PM. 2019, 116: 11845-11850. P NATL ACAD SCI USA, 2019, 116: 11845-11850.
	Использование миРНК в качестве диагностических маркеров острого инфаркта миокарда и ремоделирования сердечной мышцы. Иванощук Д.Е., Розанов А.С., Орлов П.С., Михайлова С.В., Шахтшнейдер Е.В., Кручинина М.В., Воевода М.И. Атеросклероз, 2019, Том 15.- №2. – с. 68-77.
	Identification of 12 genetic loci associated with human healthspan Zenin A, Tsepilov Y, Sharapov S, Getmantsev E, Menshikov LI, Fedichev PO, Aulchenko Y Commun. biolog., 2019, 2
	Defining the genetic control of human blood plasma N-glycome using genome-wide association study Sharapov S, Tsepilov Y, Klaric L, Mangino M, Thareja G, Shadrina A, Simurina M, Dagostino C, Dmitrieva J, Vilaj M, Vuckovic F, Pavic T, Stambuk J, Trbojevic-Akmacic I, Kristic J, Simunovic J, Momcilovic A, Campbell H, Doherty M, Dunlop M, Farrington S, Pucic-Bakovic M, Gieger C, Allegri M, Louis E, Georges M, Suhre K, Spector T, Williams F, Lauc G, Aulchenko Y HUM MOL GENET, 2019
	Morphometry of the Wheat Spike by Analyzing 2D Images Mikhail A. Genaev, Evgenii G. Komyshev, Nikolai V. Smirnov, Yuliya V. Kruchinina, Nikolay P. Goncharov and Dmitry A. Afonnikov Agronomy, 2019, 0, 9, 390
	Reconstruction and Analysis of Gene Networks of Human Neurotransmitter Systems Reveal Genes with Contentious Manifestation for Anxiety, Depression, and Intellectual Disabilities Иванов Роман Артемович Замятин Владимир Клименко Александра Игоревна Матушкин Юрий Георгиевич Савостьянов Александр Николаевич Лашин Сергей Александрович Genes, 2019
	История «певчей» хромосомы Бородин, П. М. Торгашева, А. А. Малиновская, Л. П. Рубцов, Н. Б. Галкина, С. А. Ларкин, Д. М Наука из первых рук, 2019, Номер: 3 (83) Страницы: 24-43
	Phylostratigraphic Analysis Shows the Earliest Origination of the Abiotic Stress Associated Genes in A. thaliana Zakhar S. Mustafin, Vladimir I. Zamyatin, Dmitrii K. Konstantinov, Aleksej V. Doroshkov, Sergey A. Lashin, Dmitry A. Afonnikov Genes, 2019, Genes 2019, 10(12), 963
	The mTOR Signaling Pathway Activity and Vitamin D Availability Control the Expression of Most Autism Predisposition Genes Ekaterina A. Trifonova, Alexandra I. Klimenko, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov INT J MOL SCI, 2019, Int. J. Mol. Sci. 2019, 20(24), 6332;
	Metagenome-Assembled Genome Sequence of Phormidium sp. Strain SL48-SHIP, Isolated from the Microbial Mat of Salt Lake Number 48 (Novosibirsk Region, Russia) Aleksey S. Rozanov, Aleksandra A. Shipova, Alla V. Bryanskaya,Sergey E. Peltek Microbiol Resour Announc, 2019
	Metagenome-Assembled Genome of Halomonas sp. Isolate SL48-SHIP-3 from the Microbial Mat of Salt Lake Number 48 (Novosibirsk Region, Russia) Aleksandra A. Shipova, Anton V. Korzhuk, Valeria Shlyahtun, Alla V. Bryanskaya, Aleksey S. Rozanov, Sergey E. Peltek Microbiol Resour Announc, 2019
	Insight into the genetic architecture of back pain and its risk factors from a study of 509,000 individuals Maxim B. Freidin, Yakov A. Tsepilov, Melody Palmer, Lennart C. Karssen, CHARGE Musculoskeletal Working Group, Pradeep Suri, Yurii S. Aulchenko, Frances M.K. Williams PAIN, 2019
	Examining causal effects of body mass index on back pain: a Mendelian randomization study Elizaveta E. Elgaeva, Yakov Tsepilov, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Yurii Aulchenko, Pradeep Suri EUR SPINE J, 2019
	Некодирующие РНК в диагностике пневмонии Михайлова С.В., Иванощук Д.Е., Шахтшнейдер Е.В., Степанов Г.А., Розанов А.С., Пельтек С.Е., Воевода М.И Сибирский медицинский журнал, 2019, 34(4):72-82.
	Web-Based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Posttranslational Modifications of Proteins Ivanisenko VA, Ivanisenko TV, Saik OV, Demenkov PS, Afonnikov DA, Kolchanov NA. Methods in Molecular Biology, 2019, 1934:1-20
	Survival of Halophiles of Altai Lakes at Extreme Environmental Conditions: Implications for the Search for Martian Life Bryanskaya A.V., Berezhnoy A.A., Rozanov A.S., Serdyukov D.A., Malup T.K., Peltek S.E. INT J ASTROBIOL, 2019
	A novel thermophilic Aeribacillus bacteriophage AP45 isolated from the Valley of Geysers, Kamchatka: genome analysis suggests the existence of a new genus within the Siphoviridae family Morozova V., Bokovaya O., Kozlova Yu., Kurilshikov A., Babkin I., Tupikin A., Bondar A., Ryabchikova E., Bryanskaya A., Peltek S., Tikunova N. EXTREMOPHILES, 2019
	Patterns of microchromosome organization remain highly conserved throughout avian evolution. O'Connor RE, Kiazim L, Skinner B, Fonseka G, Joseph S, Jennings R, Larkin DM, Griffin DK. CHROMOSOMA, 2019, 128(1):21-29
	Evolution of gene regulation in ruminants differs between evolutionary breakpoint regions and homologous synteny blocks Farré M, Kim J, Proskuryakova AA, Zhang Y, Kulemzina AI, Li Q, Zhou Y, Xiong Y, Johnson JL, Perelman PL, Johnson WE, Warren WC, Kukekova AV, Zhang G, O'Brien SJ, Ryder OA, Graphodatsky AS, Ma J, Lewin HA, Larkin DM. GENOME RES, 2019, 29(4):576-589
	A Near Chromosome Assembly of the Dromedary Camel Genome. Ruvinskiy D, Larkin DM, Farré M. Frontiers in Genetics, 2019
	An integrated chromosome-scale genome assembly of the Masai giraffe (Giraffa camelopardalis tippelskirchi). Farré M, Li Q, Darolti I, Zhou Y, Damas J, Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Chemnick LG, Kim J, Ryder OA, Ma J, Graphodatsky AS, Zhang G, Larkin DM, Lewin HA. GigaScience, 2019
	Comparative Chromosome Mapping of Musk Ox and the X Chromosome among Some Bovidae Species Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Yudkin DV, Lemskaya NA, Okhlopkov IM, Kirillin EV, Farré M, Larkin DM, Roelke-Parker ME, O'Brien SJ, Bush M, Graphodatsky AS. Genes, 2019
	Разработка программного комплекса WebMCOT для поиска совместно встречаемых ДНК-мотивов сайтов связывания транскрипционных факторов Мухин Алексей Максимович, Левицкий Виктор Георгиевич, Лашин Сергей Александрович Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2019, Т. 17, №4. C. 74–86
	Общие признаки селекции и гены, связанные с адаптацией и акклиматизацией, в геномах российских пород крупного рогатого скота и овец Юдин Н.С., Ларкин Д.М. RUSS J GENET+, 2019, Том 55, № 8, стр. 936-943.
	High-density genotyping reveals signatures of selection related to acclimation and economically important traits in 15 local sheep breeds from Russia Yurchenko A.A., Deniskova T.E., Yudin N.S., Dotsev A.V., Khamiruev T.N., Selionova M.I., Egorov S.V., Reyer H., Wimmers K., Brem G., Zinovieva N.A., Larkin D.M. BMC GENOMICS, 2019, Vol.20(Suppl 3):294
	Происхождение, селекция и адаптация российских пород крупного рогатого скота по данным полногеномных исследований. Юдин Н.С., Ларкин Д.М. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, Том 23, № 5, стр. 559-568.

Монографии

2019	Web-Based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Posttranslational Modifications of Proteins Ivanisenko, V. A., Ivanisenko, T. V., Saik, O. V., Demenkov, P. S., Afonnikov, D. A. and Kolchanov, N. A.

Конференции

2020	Поиск и функциональный анализ генов с циркадным паттерном экспрессии у мягкой пшеницы Брагина М.К., Киселёва А.А., Салина Е.А. 5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» GPB 2020
	Разработка алгоритмов для нахождения факторов транскрипции и их сайтов связывания в аннотированных бактериальных геномах Лахова Т.Н., Ощепков Д.Ю., Мухин А.М., Лашин С.А. 12-я Международная школа молодых ученых «Системная Биология и Биоинформатика» / 12th International young scientists school «System Biology and Bioinformatics», SBB-2020
	MGSGenerator 1.5: software tool for reconstructing mathematical models of metabolic networks F.V. Kazantsev, S.A. Lashin BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Loci and genes involved in chronic musculoskeletal pain identified via analysis of genetically independent pain phenotypes Y Tsepilov, M Freidin, A Shadrina, E Elgaeva, S Sharapov, J van Zunder, L Karssen, P Suri, F Williams, Y Aulchenko BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Loci and Genes Involved in Chronic Musculoskeletal Pain Identified via Analysis of Genetically Orthogonal Pain Phenotypes Y Tsepilov, M Freidin, A Shadrina, E Elgaeva, S Sharapov, J van Zunder, L Karssen, P Suri, F Williams, Y Aulchenko European Mathematical Genetics Meeting
	Detection and investigation of genes with circadian expression pattern in common wheat Antonina Kiseleva, Maria Bragina, Elena Salina 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” (BGRS/SB-2020)
	The algorithm for finding potentially oscillating behavior in enzymatic systems Lakhova T.N., Kazantsev F.V, Matushkin Yu.G., Lashin S.A. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Multigene phylogenies for the earthworm Eisenia nordenskioldi (Lumbricidae, Annelida) Shekhovtsov S.V., Shipova A.A., Poluboyarova T.V., Peltek S.E. BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020) Symposium Systems biology and biomedicine
	Изучение генетической регуляции накопления кутику-лярного воска ячменя при помощи анализа данных RNA-seq Вихорев А., Шмаков Н., Колосовская Е., Короткова А., Герасимова С., Хлесткина Е. 12-я Международная школа молодых ученых «Системная Биология и Биоинформатика» / 12th International young scientists school «System Biology and Bioinformatics», SBB-2020
	Comparison in the proteoms of atherosclerotic plaques at different stages of development in coronary atherosclerosis Stakhneva E.M., Meshcheryakova I.A., Demidov E.A., Starostin K.V., Peltek S.E., Shramko V.S., Striukova E.V., Ragino Yu.I. 88 EAS CONGRESS
	Получение голозерных линий ячменя после направленной модификации гена Nud методом CRISPR/CAS. Короткова А.М., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. Генофонд и селекция растений
	АНАЛИЗ ПОПУЛЯЦИИ МУТАНТОВ И ПОЛУЧЕНИЕ ЛИНИЙ РАСТЕНИЙ ПОСЛЕ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ПО ГЕНУ NUD У ЯЧМЕНЯ Короткова А.М., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. ХХ-я научная конференция молодых ученых «Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и сельскохозяйственной микробиологии»
	Получение линий растений мутантов и анализ полученных популяций после геномного редактирования по гену Nud у ячменя Короткова А.М., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2020)
	WebMCOT web-service for prediction of co-occurred DNA motifs in ChIP-seq data Mukhin A. M., Levitsky V. G., Lashin S. A., Oshchepkov D. Y. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	OrthoWeb-web application for macroand microevolutionary analysis of genes Mustafin Z., Mukhin A., Afonnikov D., Matushkin Y., Lashin S BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
2019	CYP75 gene family in barley Vikhorev A.V., Gerasimova S.V., Strygina K.V., Khlestkina E.K. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019): The Eleventh International Young Scientists School
	Итоги многолетних исследований наследственной глухоты у коренного населения Сибири: от эпидемиологии до молекулярной генетики, клеточной биологии и компьютерного моделирования. Посух О.Л.,Барашков Н.А., Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Данильченко В.Ю., Маслова Е.А., Пшенникова В.Г., Романов Г.П., Соловьёв А.В., Кларов Л.А., Федорова С.А., Терютин Ф.М., Лашин С.А., Орищенко К.Е., Морозов И.В., Бондарь А.А. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	ИССЛЕДОВАНИЕ РЕГЕНЕРАЦИОННОГО ПОТЕНЦИАЛА СОРТОВ ЯЧМЕНЯ Короткова А.М., Герасимова С.В., КукоеваТ.В., ХлесткинаЕ.К. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	ALTERING PLANT DOMESTICATION TRAITS VIA SITE-DIRECTED GENOME MODIFICATION Gerasimova S.V., Ivanova K.A., Hertig C., Korotkova A.M., Hiekel S., Kolosovskaya E., Koloshina K.A., Genaev M.A., Komyshev E.G., Egorova A.A., Domrachev D.V., Rogozina E.V., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО ФЕНОТИПИРОВАНИЯ РАСТЕНИЙ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы.
	WildPetotaDB – a database for genotype and phenotype of wild tuber-bearing species of the genus Solanum L. Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В. Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference
	Identification and characterization of a barley gene controlling cuticle wax formation Gerasimova S., Kolosovskaya E., Hertig C., Hiekel S., Korotkova A., Doroshkov A., Kukoeva T., Domrachev D., Kochetov A., Kumlehn J., Khlestkina E. Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference
	Decreasing wild potato toxicity by targeted modification of glycoalkaloid metabolism genes Egorova A.A., Ivanova K.A., Domrachev D.V., Kochetov A.V., Khlestkina E.K., Gerasimova S.V. Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference 24-29 июня 2019 г., Новосибирск, Россия
	Targeted knockout of the PAIN-1 gene in Solanum tuberosum Egorova A.A., Gerasimova S.V., Schedel S., Kumlehn J., Kochetov A.V. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	Genetic differences determining inter-individual variation in protein glycosylation Аульченко Ю.С., Шарапов С.Ж. 11th ISABS and 2nd Human Glycome Meeting
	Genetic landscape of human healthspan Zenin A, Tsepilov Y, Sharapov S, Getmantsev E, Menshikov LI, Fedichev PO, Aulchenko Y 9th Moscow Conference on Computational Molecular Biology МССМВ'19
	Current achievements in study of black-spiked barley Anastasiia Yu. Glagoleva, Sergey R. Mursalimov, Natalya V. Gracheva, Nickolay A. Shmakov, Natalya M. Levanova, Andreas Börner, Dmitry A. Afonnikov, Olesya Yu. Shoeva, Elena K. Khlestkina 5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding
	Transcriptomic analysis of barley partial albinism Nickolay Shmakov, Anastasiya Glagoleva, Gennadiy Vasiliev, Dmitry Afonnikov, Elena Khlestkina 5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding
	Метод морфометрии колоса пшеницы на основе анализа изображений Комышев Е.Г., Генаев М.А., Афонников Д.А. Международный конгресс Биотехнология: состояние и перспективы развития. Науки о жизни.
	Разработка методов автоматического определения количественных характеристик, описывающих фенотипические признаки колоса пшеницы Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.А. Афонников Международная конференция «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)
	Биоинформационный анализ путей регуляции экспрессии генов предрасположенности к аутизму Клименко А.И., Трифонова Е.А., Лашин С.А., Кочетов А.В. Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
	Antagonistic evolutionary scenarios in microbial communities are played out under ecological stratification fostered by spatial gradients A.I. Klimenko, Yu.G. Matushkin, N.A. Kolchanov, S.A. Lashin The International Society for Ecological Modelling Global Conference 2019
	Методы компьютерного моделирования иерархических биологических систем Лашин С. А., Матушкин Ю. Г., Клименко А. И., Казанцев Ф. В., Лахова Т. Н., Смирнова А. А. «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)
	Реконструкция генных сетей нейротрансмиттерных систем человека Р.А. Иванов, А. И. Клименко, А. Н. Савостьянов, С.А. Лашин «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)
	Creation and analysis of an agent-based computer model of the AIDS epidemic using an algorithm for explicit calculation of the HIV replicability Smirnova A.A., Ponomarenko M.P., Lashin S.A. 11th International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics” – SBB-2019
	LARGE GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY PROVIDES INSIGHT INTO THE GENETIC ARCHITECTURE OF LOW BACK PAIN AND ITS RISK FACTORS Tsepilov Y.A., Ю.С. Аульченко 47th European Mathematical Genetics Meeting
	ИССЛЕДОВАНИЕ ТРАНСКРИПТОМА ПОЧТИ ИЗОГЕННОЙ ЛИНИИ ЯЧМЕНЯ С ЧАСТИЧНЫМ АЛЬБИНИЗМОМ Шмаков Н.А., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А., Хлёсткина Е.К. БИОТЕХНОЛОГИЯ: СОСТОЯНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ
	ИССЛЕДОВАНИЕ ЧАСТИЧНОГО АЛЬБИНИЗМА ЯЧМЕНЯ С ПОЗИЦИИ ТРАНСКРИПТОМИКИ Шмаков Н. А., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А., Хлёсткина Е.К. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)
	Novel genomic marker for the Alm locus in barley identified based on transcriptome analysis N.A. Shmakov, A.Yu. Glagoleva, G.V. Vasiliev, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina PlantGen2019
	FoldGO - новый метод анализа функционального обогащения с учетом степени изменения транскрипционной активности. Вибе Д.С., Омельянчук Н.А., Мухин А.М., Лашин С.А., Миронова В.В. 7ой съезд ВОГиС
	ANALYSIS OF BARLEY MUTANT POPULATIONS OBTAINED BY SIMULTANEOUS MUTAGENESIS AT FOUR GENOMIC LOCI Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Hertig С., Korotkova A.M., Kukoeva T.V., Hiekel S., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K. VII International Congress of Vavilov society of geneticists and breeders and associate symposiums
	Genetic control of human blood plasma N-glycome Sharapov S. Z.,Tsepilov Y.A. , Lauc G., Aulchenko Y.S. VI Съезд биохимиков России
	Genetic loci, associated with glycosylation of human total plasma proteins: a 2019 update Sodbo Zh Sharapov, Yakov A Tsepilov, Lucija Klaric, Massimo Mangino, Gaurav Thareja, Alexandra S Shadrina, Mirna Simurina, Concetta Dagostino, Julia Dmitrieva, Marija Vilaj, Frano Vuckovic, Tamara Pavic8, Jerko Stambuk, Irena Trbojevic-Akmacic, Jasminka Kristic, Jelena Simunovic, Ana Momcilovic, Harry Campbell, Margaret Doherty, Malcolm G Dunlop, Susan M Farrington, Maja Pucic-Bakovic, Christian Gieger, Massimo Allegri, Edouard Louis, Michel Georges, Karsten Suhre, Tim Spector, Frances MK Williams, Gordan Lauc, Yurii S Aulchenko 11th ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics
	ИССЛЕДОВАНИЕ ИЗМЕНЕНИЙ ПРОТЕОМА И ТРАНСКРИПТОМА ДРОЖЖЕЙ SACCHAROMYCES CEREVISIAE ПРИ ПЕРЕХОДЕ К АНАЭРОБНЫМ УСЛОВИЯМ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ Мещерякова И. А., Банникова С. В., Розанов А. С., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Демидов Е. А., Слынько Н.М., Старостин К. В., Пельтек С. Е. МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮКАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ,И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»
	ОМИКСНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ ДЛЯ ХАРАКТЕРИСТИКИ БИОРЕСУРСОВ Пельтек С.Е. , Старостин К.В., Ершов Н., Ефимов В.М., Шляхтун В.Н., Мещерякова И. А., Банникова С. В., Розанов А. С., Брянская А.В., Демидов Е.А. МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮ КАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ,И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»
	ФОРМИРОВАНИЕ И ИЗУЧЕНИЕ КОЛЛЕКЦИИ МИСКАНТУСА В ЗАПАДНОЙ СИБИРИ Бурмакина Н.В., Банникова С.В., Демидов Е.А., Мещерякова И.А., Розанов А.С., Слынько Н.М., Старостин К.В., Шеховцов С.В., Пельтек С.Е. МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮКАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ,И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»
	НЕТЕРМИЧЕСКОЕ ВОЗДЕЙСТВИЕ ТЕРАГЕРЦОВОГО ИЗЛУЧЕНИЯ НА ТЕРМОФИЛЬНЫЙ МИКРООРГАНИЗМ GEOBACILLUS ICIGIANUS Банникова С.В. , Мещерякова И.А. , Брянская А.В. , Розанов А.С. , Старостин К.В. , Попик В.М. , Пельтек С.Е. VI Съезд биофизиков России
	ВЫЯВЛЕНИЕ ПРОТЕОМНЫМИ МЕТОДАМИ ГЕНА ГЛУТАМИНСИНТЕТАЗЫ E. COLI, ЧУВСТВИТЕЛЬНОГО К ТЕРАГЕРЦОВОМУ ИЗЛУЧЕНИЮ Мещерякова И.А. , Банникова С.В. , Горячковская Т.Н. , Демидова Е.В. , Демидов Е.А. , Розанов А.С. , Попик В.М. , Пельтек С.Е. VI Съезд биофизиков России
	ИССЛЕДОВАНИЕ ВЛИЯНИЯ ТЕРАГЕРЦОВОГО ИЗЛУЧЕНИЯ НА ГЕННУЮ ЭКСПРЕССИЮ С ПОМОЩЬЮ БАКТЕРИАЛЬНЫХ ГЕНОСЕНСОРОВ Сердюков Д.С., Розанов А.С. , Мещерякова И.А. , Банникова С.В. , Горячковская Т.Н. , Ощепков Д.Ю. , Попик В.М. , Черкасова О.П. , Пельтек С.Е. VI Съезд биофизиков России
	Genome-wide tests and sequencing point to candidate gene variants for body temperature maintenance under the cold stress in Siberian cattle population A. V. Igoshin, A. A. Yurchenko, N. M. Belonogova, D. V. Petrovsky, R. B. Aitnazarov, V. A. Soloshenko, N. S. Yudin, D. M. Larkin ISAG-2019. 37th International Society for Animal Genetics Conference
	Dysregulation of postsynaptic translation in autism spectrum disorder: reconstruction of gene network associated with autism and mtor signaling. Rifonova E.A., Klimenko A.I., Saik O.V., Orlov Y.L., Lashin S.A., Ivanisenko V.A. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.

Гранты

2020

Изучение функциональной роли генов с циркадным паттерном экспрессии у мягкой пшеницы
РФФИ, номер гранта 20-316-80003 мол_эв_а

2019

Исследование происхождения и сравнительный анализ следов отбора с использованием отсеквенированных геномов турано-монгольских пород крупного рогатого скота и сибирских пород овец
Российский Научный Фонд, номер гранта 19-76-20026

Научное руководство

2020	Разработка программного комплекса для моделирования масс-спектров пептидов Епифанов Ростислав Юрьевич , 2020-06-24

Патенты

2019	Программа для оценки количественных характеристик колоса пшеницы (ОКХК) / The program for the extraction the quantitative characheristics of the wheat spike (WERecognizer) Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич Номер патента 2019666362