 |
 |
|
Система учета научной деятельности (ASSA) |
|
|
|
 |
|
 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Лаборатория регуляции экспрессии генов (т.61)Отдел молекулярной генетикиПодразделенияСектор геномных исследований (т.30)Сектор молекулярно-генетических механизмов белок-нуклеиновых взаимодействий (т.38)
Научные результаты Сотрудники О Подразделении 1. Основное направление исследований Исследование регуляторных районов генов и потенциально регуляторных SNPs; их выявление в масштабе генома. Изучение механизмов канцерогенеза: поиск регуляторных SNPs, связанных с развитием рака легких и толстого кишечника, выяснение роли тканеспецифичных транскрипционных факторов в механизмах гепатоканцерогенеза, изучение новых противоопухолевых препаратов. Выяснение молекулярных механизмов развития депрессии. Задачи, решаемые в рамках основного направления на данном этапе:
2. Аннотация базового бюджетного проекта подразделения Бюджетный проект VI.58.1.2. «Молекулярно-генетические основы транскрипционной регуляции» (координатор проекта: д.б.н. проф. Т.И. Меркулова). В рамках проекта запланировано проведение комплексных экспериментально-теоретических исследований, направленных на изучение регуляторного кода ДНК эукариот и выяснение механизмов определяющих характер транскриптома эукариотической клетки. Лаборатория регуляции экспрессии генов отвечает за блок 3 бюджетного проекта: «Поиск и функциональный анализ потенциально регуляторных SNPs в геноме человека»
4. Иллюстрированное описание лучших результатов, полученных подразделением за последние 5 лет Получены принципиально важные результаты, указывающие на ключевую роль специфичного для печени транскрипционного фактора и известного ксеносенсора CAR (конститутивный рецептор андростанов) в механизмах химически индуцированного гепатоканцерогенеза. На модели инбредных мышей, чувствительных (C3H) и устойчивых (C57BL и CC57BR) к действию фенобарбитала как промотора опухолей печени, показана определяющая роль CAR в механизме действия этого соединения. Установлено, что только в печени мышей С3Н фенобарбитал активирует СAR (рис.1А,Б) и усиливает экспрессию его генов–мишеней: Sult2a1- основного фермента катаболизма тиреоидных гормонов (рис.1В), и Mdm2 - важного регулятора пролиферации и апоптоза (рис.1Г). Таким образом, CAR-опосредованная стимуляция гепатоканцерогенеза фенобарбиталом может осуществляться за счет одновременного подавления опухолесупрессорной функции тиреодных гормонов и индукции генов, непосредственно контролирующих пролиферацию и апоптоз [Life Sci., 2010].
Рисунок 1. Фенобарбитал (ФБ) увеличивает ДНК-связывающую активность CAR и уровень мРНК Sult2A1 и mdm2 в печени мышей С3Н, но не CC57BR и C57BL. А) Типичный радиоавтограф изменения ДНК-связывающей активности CAR. Б) Результаты количественной обработки радиоавтографов. За единицу принята активность CAR в печени животных, не получавших ФБ. В скобках – количество экспериментов. В), Г). Данные RT-QPCR по уровню экспрессии генов Sult2A1(В) и mdm2(Г) представлены в относительных единицах от уровня экспрессии Gapdh. Достоверные отличия от животных, не получавших ФБ * – Р<0,05; ** – Р<0,01; *** – Р<0,005. С использованием мышей, нокаутных по СAR, показано, что гепатоканцерогенные аминоазокрасители ОАТ и 3’-МеДАБ является лигандами этого белка, повышающими его активность, что приводит к усилению экспрессии генов-мишеней СAR,. Среди генов-мишеней выявлен известный протоонкоген c-Myc, активация которого усиливает пролиферацию и приводит к злокачественному перерождению клеток. Показано, что пролиферация клеток печени под действием гепатоканцерогена ОАТ действительно хронически повышена у контрольных животных и не изменена у CAR- дефицитных мышей [Toxicology and Applied Pharmacology, 2012].
Разработан новый подход к предсказанию регуляторных районов в геноме человека и выявлению потенциально регуляторных SNPs (rSNPs), основанный на использовании данных международного проекта ENCODE по распределению мест связывания факторов транскрипции, полученных в результате ChIP-seq анализа. Подход базируется на предположении о том, что обогащение района генома участками связывания факторов транскрипции (пики ChIP-seq) указывает на его регуляторную функцию, и соответственно SNPs, попадающие в этот район, являются потенциально регуляторными (Рис.2А).
Анализ баз данных SNPs, связанных с фенотипическими проявлениям, показал, что такие выборки существенно обогащены предсказанными нами rSNPs по сравнению с массивами случайно отобранных SNPs (Рис. 2Б). 40 SNPs, попавших в район перекрывания по крайней мере семи пиков ChIP-seq, были экспериментально протестированы методом задержки в геле с использованием экстрактов ядер 4-х клеточных линий человека (HepG2, HeLaS3, HCT-116, and K562). Для 29 SNPs было показано радикальное изменение в картине связывания ядерных белков хотя бы одной клеточной линии (примеры на рис. 3В), еще для 6 SNPs найдены менее выраженные изменения. Вместе взятые эти данные свидетельствуют об эффективности предложенного нами подхода [PLOS ONE, 2013].
Впервые осуществлена реалистичная оценка возможностей и ограничений компьютерных методов, применяемых для интерпретации данных по полногеномному распределению сайтов связывания транскрипционных факторов (ChIP-Seq). Использованы построенные нами методы распознавания FoxA, основанные на двух наиболее часто используемых принципах: обнаружении нуклеотидных мотивов в последовательностях de novo (mono- и diChipmunk) и обучении по выборке известных сайтов связывания (PWM и SiteGA). Для выбора корректных порогов для всех четырех методов распознавания результаты работы каждого из них были экспериментально верифицированы с помощью метода EMSA (Рис 3 А). Пример эксперимента по верификации показан на Рис.3 Б. Затем методы были применены для распознавания сайтов связывания FoxA2 в пиках ChIP-Seq двух независимых экспериментов. В результате впервые удалось надежно определить точную локализацию и число сайтов связывания FoxA в пиках ChIP-Seq. Наборы FoxA2 сайтов, выявленных разными методами, существенно отличаются, что подтверждает развиваемую нами концепцию структурной гетерегенности сайтов связывания транскрипционного фактора [J Steroid Biochem Mol Biol, 2009]. Одновременное использование методов, относящихся к разным классам (например, SiteGA и DiChipmunk) позволяет идентифицировать существенно больше сайтов связывания FoxA2 и соответственно ChIP-seq пиков, содержащих эти сайты (Рис 3 В). [BMC Genomics, 2014]
Рисунок 3. А. Примеры подбора порогов для различных методов распознавания. Вертикальная прерывистая линия соответствует порогу метода, выше которого экспериментально подтверждаются все предсказанные сайты Б. Конкуренция олигонуклеотидов в EMSA за рекомбинантный белок GST-FoxA2. Проба - радиоактивно меченый олигонуклеотид TTR с известным сайтом связывания FoxA2. В качестве конкурента к пробам добавлялся возрастающий избыток исследуемых немеченых олигонуклеотидов. Полоса, соответствующая ДНК-белковому комплексу, отмечена стрелкой. В. Зависимость числа пиков ChIP-seq, содержащих хотя бы один предсказанный сайт, от высоты пика.
5. Задачи, планируемые на перспективу
Антонцева Елена Вячеславовна [научный сотрудник] Васильев Геннадий Владимирович [ведущий научный сотрудник] Дегтярева Арина Олеговна [младший научный сотрудник] Ершов Никита Игоревич [старший научный сотрудник] Злобина Раиса Андреевна [ведущий инженер] Корболина Елена Евгеньевна [научный сотрудник] Меркулов Василий Михайлович [ведущий инженер] Похламкова Полина Дмитриевна [лаборант] Рыкова Елена Юрьевна [ведущий научный сотрудник] Савинкова Людмила Кузьминична [ведущий научный сотрудник] Сапронова Анна Андреевна [младший научный сотрудник] Тарнецкая Наталья Николаевна [инженер] Тыртышная Арина Антоновна [лаборант] Шацкая Наталья Владиславовна [научный сотрудник] Юрикова Ольга Николаевна [лаборант] Бывшие сотрудникиАмстиславский Вячеслав СергеевичАркова Лидия Александровна Аршинова Татьяна Валентиновна Балышев Александр Игоревич Богданова Людмила Александровна Болбат Александр Васильевич Быстрова Татьяна Николаевна Васильев Геннадий Владимирович Васильева Евдокия Душеевна Драчкова Ирина Альбертовна Жечев Дмитрий Александрович Зиганшина Елена Викторовна Иванов Игорь Диадорович Игонина Тамара Михайловна Ильницкая Светлана Ивановна Каледин Василий Иванович Климова Наталья Викторовна Кобзев Виктор Федорович Леберфарб Елена Юрьевна Лысова Марина Владимировна Николин Валерий Петрович Панкова Тамара Григорьевна Печуркина Наталья Ивановна Троицкий Александр Васильевич Чекурова Любовь Васильевна СовместителиБрызгалов Леонид Олегович [научный сотрудник]Дамаров Игорь Сергеевич [младший научный сотрудник] Кондратюк Екатерина Юрьевна [ведущий инженер] Попова Нэлли Александровна [научный консультант] Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода: 99 00 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 Публикации Монографии Конференции Гранты Научное руководство Патенты
|
| 2012 | Cytochrome P450 in fluke Opisthorchis felineus: Identification and characterization. Pakharukova MY, Ershov NI, Vorontsova EV, Katokhin AV, Merkulova TI, Mordvinov VA MOL BIOCHEM PARASIT, 2012, V. 181. No. 2. P. 190–194
|
| Quantitative trait loci on chromosome 1 for cataract and AMD-like retinopathy in senescence-accelerated OXYS rats Elena E. Korbolina, Ouyna S. Kozhevnikova, Nataliya A. Stefanova, and Natalia G. Kolosova AGING-US, 2012, Aging (Albany NY). 2012 Jan 31. Vol.4 No.1 P.49-59
|
|
| 2011 | Analysis and recognition of the GAGA transcription factor binding sites in Drosophila genes Omelina E.S., Baricheva E.M., Oshchepkov D.Yu., Merkulova T.I. COMPUT BIOL CHEM, 2011, V. 35, № 6, P. 363-370
|
| Разработка методов распознования сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA, их экспериментальная верификация и использование для анализа данных массовой иммунопреципитации хроматина Левицкий В. Г., Ощепков Д. Ю., Ершов Н. И., Брызгалов Л. О., Антонцева Е. В., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А. Doklady Akademii Nauk, 2011, Т. 436, № 3, - С.417-421.
|
|
| Analysis of Data on Large Scale Chromatin Immunoprecipitation by Recognition of Transcription Factor Binding Sites VG Levitskii, GV Vasil’ev, DYu Oshchepkov, NI Ershov, and TI Merkulova Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, V. 1, N. 3, P. 173–182
|
|
| Изменение сродства ТАТА-связывающего белка к олигонуклеотидам, соответствующим ТАТА-боксам промоторов генов человека, несущим полиморфизмы, ассоциированные с наследственными заболеваниями Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, № 3, т. 15, стр. 439-447
|
|
| In vitro examining the existing prognoses how TBP binds to TATA with SNP associated with human diseases Drachkova I.A., Ponomarenko P.M., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Suslov V.V., Savinkova L.K., Kolchanov N.A. Health, 2011, 3, 9, 577-583
|
|
| Полиморфизм гена HFE у населения Северной Азии Михайлова С.В., Ромащенко А.Г., Бабенко В.Н., Губина М.А., Соболева Д.Е., Кобзев В.Ф., Воевода М.И Вестник РАМН, 2011
|
|
| Brain proteoglycans in postnatal development and during behavior decline in senescence-accelerated OXYS rats Rykova V.I., Leberfarb E.Yu., Stefanova N.A., Shevelev O.V., Dymshits G.M., Kolosova N.G. Успехи геронтологии, 2011, 2011, т.24, №2,с.234-243
|
|
| Ortho-aminoazotoluene activates mouse constitutive androstane receptor (mCAR) and increases expression of mCAR target genes. Smetanina MA, Pakharukova MY, Kurinna SM, Dong B, Hernandez JP, Moore DD, Merkulova TI. TOXICOL APPL PHARM, 2011, V. 255(1):P. 76-85.
|
|
| Азосоединения ОАТ и 3'МеДАБ одинаково вызывают опухоли печени у мышей линии GR, но по-разному влияют на активность транскрипционных факторов FoxA Пахарукова М.Ю., Сметанина М.А., Ильницкая С.И., Каледин В.И., Меркулова Т.И. B EXP BIOL MED+, 2011, Том 152, № 7. С. 109-112.
|
|
| Effect of vasopressin V1 receptor antagonist, SSR149415, on anxiety-like behavior and Lewis lung carcinoma metastasis in mice. Amikishieva A. V. Ilnitskaya S.I., Nikolin V. P.,Popova N. A. Experimental oncology, 2011, V.33.№ 3. P. 1-4
|
|
| Полиморфизм второго интрона гена SDF1 у галловейской, герефордской и черно-пестрой пород крупного рогатого скота Юдин Н.С., Нефедова М.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2011, Том 47, № 2, стр. 279-283
|
|
| Ассоциация полиморфизма гена холодового рецептора TRPM8 с липидными показателями крови и антропометрическими параметрами у шорцев Потапова Т.А., Юдин Н.С., Пилипенко И.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Шахтшнейдер Е.В., Огарков М.Ю., Воевода М.И. B EXP BIOL MED+, 2011, №2, стр. 186-190
|
|
| 2010 | Нитроксильный антиоксидант ТРРФ-ТЕМПО повышает эффективность противоопухолевой терапии на модели перевиваемой лимфосаркомы мышей Кирилюк И.А.,Каледин В. И., Попова Н. А., Николин В. П.,Васильева Е. Д., Григорьев И. А., Лушникова Е. Л. , Непомнящих Л. М. B EXP BIOL MED+, 2010, № 7. С. 85-89
|
| Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека, связанный с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита, в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Molecular Biology, 2010, Т.44, №6. С. 985-993.
|
|
| Полиморфизмы ТАТА-боксов генов хозяйственно важных и лабораторных животных и растений, ассоциированные с их селекционно-ценными признаками Суслов В.В., Пономаренко П.М, Пономаренко М.П, Драчкова И.А., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. RUSS J GENET+, 2010, 4, 46, 448-457
|
|
| Распространение свиных эндогенных ретровирусов у разных форм Sus scrofa L. 1758 (Suidae, Mammalia) Айтназаров Р.Б., Никитин С.В., Князев С.П., Кобзев В.Ф., Бекенев В.А., Деева В.С., Гончаренко Г.М., Юдин Н.С., Ермолаев В.И. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2010, №9, стр. 49-54.
|
|
| Редкое сочетание двух новых однонуклеотидных полиморфизмов в интроне 16 гена рецептора рианодина RYR1 у свиней кемеровской породы Юдин Н.С., Князев С.П., Айтназаров Р.Б., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Игнатьева Е.В., Никитин С.В., Ермолаев В.И. Информационный вестник ВОГИС, 2010, №1, Т.14, С. 116-121
|
|
| Точное уравнение равновесия для четырех шагов связывания ТВР с ТАТА-боксом для предсказания фенотипической экспрессии при мутациях Пономаренко П.М., Суслов В.В.,Савинкова Л.К., Пономаренко М.П.,Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2010, 3, 55, 400-414
|
|
| Экспериментальная проверка функциональной активности потенциальных DRE-сайтов, обнаруженных в промоторах IRF1, REL и IL12A генов человека Е.В. Кашина, Е.В. Антонцева, М.Ю. Шаманина, Е.А. Ощепкова, Д.Ю. Ощепков, А.В. Катохин, А.Ю. Гришанова, Д.П. Фурман, В.А. Мордвинов Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Том 275. С. 353-356.
|
|
| Экспрессия ядерных рецепторов PPAR, LXR и RXR в печени и показатели липидного и углеводного обмена в крови у чувствительных и резистентных к гепатоканцерогенезу линий мышей Е.Н. Пивоварова, Н.В. Багинская, М.Л. Перепечаева, С.И. Ильницкая, М И. Душкин Биомедицинская химия, 2010, N4, T.56, С. 480-489
|
|
| Differentiation of wild boar and domestic pig population based on the frequency of chromosomes carring endogenous retroviruses Nikitin S.V., Yudin N.S., Knyazev S.P., Aitnazarov R.B., Bekenev V.A., Deeva V.S., Goncharenko G.M., Kobzev V.F., Savina M.A., Ermolaev V.I. Natural Science, 2010, V.2, N.6, 527-534.
|
|
| Effect of double-stranded DNA on maturation of dendritic cells in vitro Alyamkina EA, Leplina OY, Sakhno LV, Chernykh ER, Ostanin AA, Efremov YR, Shilov AG, Proskurina AS, Orishchenko KE, Dolgova EV, Rogachev VA, Nikolin VP, Popova NA, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA CELL IMMUNOL, 2010, 266: 46-51
|
|
| Exogenous allogenic fragmented double-stranded DNA is internalized into human dendritic cells and enhances their allostimulatory activity Alyamkina EA, Dolgova EV, Likhacheva AS, Rogachev VA, Sebeleva TE, Nikolin VP, Popova NA, Kiseleva EV, Orishchenko KE, Sakhno LV, Gel'fgat EL, Ostanin AA, Chernykh ER, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA CELL IMMUNOL, 2010, 262: 120-126
|
|
| Inhibition of metastasis development by daily administration of ultralow doses of RNase A and DNase I Olga Patutina, PhD; Nadezda Mironova, PhD; Elena Ryabchikova, PhD Prof; Nelly Popova, PhD; Valery Nikolin, PhD MD; Vasily Kaledin, PhD; Valentin Vlassov, Academician; Marina Zenkova, BIOCHIMIE, 2010, Elsevier Editorial System(tm) for Biochimie Manuscript Draft Manuscript Number:: BIOCHI-D-10-00444R1
|
|
| Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
|
|
| A strategy of tumor treatment in mice with doxorubicin-cyclophosphamide combination based on dendritic cell activation by human double-stranded DNA preparation Alyamkina EA, Nikolin VP, Popova NA, Dolgova EV, Proskurina AS, Orishchenko KE, Efremov YR, Chernykh ER, Ostanin AA, Sidorov SV, Ponomarenko DM, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA Genetic Vaccines and Therapy, 2010, 8(1): 7
|
|
| Генная сеть активации макрофага: участие ксенобиотков в регуляции экспрессии генов цитокинов. Ощепкова Е.А., Ощепков Д.Ю., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Цитокины и воспаление, 2010, Т.9, №3, с.49.
|
|
| SNPs in the HIV-1 and HIV-2 TATA Box and the AIDS pandemic Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Savinkova L.K., Ponomarenko P.M., Efimov V.M., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2010, 3, 8, 607-625.
|
|
| Liver expression of the nuclear hormone receptors PPAR, LXR, and RXR and blood parameters of lipid and carbohydrate metabolism in strains of mice susceptible and resistant to hepatocarcinogenesis E. N. Pivovarova, N. V. Baginskaya, M. L. Perepechaeva, S. I. Ilnitskaya and M. I. Dushkin BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2010, Volume 4, Number 2, 198-204, DOI: 10.1134/S1990750810020113
|
|
| The increased CAR-dependent metabolism of thyroid hormones in mice with high cancer susceptibility M. Pakharukova, M. Smetanina, V. Kaledin, T. Obut, T. Merkulova. LIFE SCI, 2010, V. 87, p. 439-444
|
|
| The siRNA targeted to mdr1b and mdr1a mRNAs in vivo sensitizes murine lymphosarcoma to chemotherapy O.Patutina, N. Mironova, N. Popova, V Kaledin, V Nikolin, V Vlassov and M Zenkova BMC CANCER, 2010, V 10.article number 204. May 2010
|
|
| Активация конститутивного рецептора андростанов и повышение экспрессии его генов – мишеней в печени мышей под действием ортоаминоазотолуола Сметанина М.А., Пахарукова М.Ю., Меркулова ТИ. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14, №2, С. 320-330
|
|
| Анализ результатов эксперимента по массовой иммунопреципитации хроматина с помощью методов распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов Левицкий В.Г., Васильев Г.В., Ощепков Д.Ю., Ершов Н.И., Меркулова Т.И. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14, № 4, С. 685–697
|
|
| Влияние гепатоканцеpогенноcти эcтpагола на глюкокоpтикоидную индукцию печень-cпецифичныx феpментов и активноcть фактоpов тpанcкpипции Foxа и HNF4 в печени мышей и кpыc В.И. Каледин, М.Ю. Пахарукова, Е.Н. Пивоварова, К.Ю. Кропачев, Н.В. Багинская, Е.Д. Васильева, С.И. Ильницкая, Е.В. Никитенко, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова BIOPHYSICS, 2010, том 55, вып.2, c.326–335
|
|
| Влияние полиморфизмов ТАТА-бокса промотора гена бета-глобина человека, ассоциированный с бета-талассемией, на взаимодействие ТАТА-связывающего белка Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А., Савинкова Л.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, т.14, с. 698-705
|
|
| Ингибирующее влияние о-аминоазотолуола на гепатоканцерогенное действие диэтилнитрозамина при совместном применении у мышей Каледин В.И. , Ильницкая С.И., Багинская Н.В. Вопросы онкологии, 2010, Т.56.- №2.- С.196 – 200
|
|
| Ингибитор активности индоламин-2,3-диоксигеназы 1-метилD-триптофан может стимулировать рост иммуногенных опухолей Васильева Е. Д., Николин В. П., Попова Н. А., Лушникова Е. Л., В. И. Каледин B EXP BIOL MED+, 2010, № 5.С. 559-561
|
|
| 2009 | Лейкостимулирующее действие фрагментов экзогенной ДНК, защищенных протамином, при вызванной циклофосфаном миелосупрессии мышей Е.В. Долгова, В.А. Рогачев, В.П. Николин, Н.А. Попова, А.С. Лихачева, Е.А. Алямкина, Т.Е. Себелева, Е.Р. Черных, Е.Л. Гельфгат, С.С. Богачев, М.А. Шурдов Вопросы онкологии, 2009, № 6, Т. 55, стр. 761-764
|
| Ортоаминоазотолуол подавляет пролиферацию гепатоцитов у инбредных линий мышей, подверженных гепатоканцерогенезу Еремеев А.В., Тимофеева О.А., Голощапов А.В., Ильницкая С.И., Меркулова Т.И. Каледин В.И., Сетков Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, Т.428.- №4.-С.560 – 566
|
|
| Combined therapy with Cyclophosphamide and DNA preparation inhibits the tomor growth in mice Alyamkina EA, Dolgova EV, Likhacheva AS, Rogachev VA, Sebeleva TE, Nikolin VP, Popova NA, Orishchenko KE, Strunkin DN, Chernykh ER, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA. Genetic Vaccines and Therapy, 2009, V. 7, N 1
|
|
| Полиморфизмы ТАТА-боксов промоторов генов человека и ассоциированные с ними наследственные патологии Cавинкова Л.К., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Колчанов Н.А. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, 2, 74, 149-163
|
|
| Предсказание влияния полиморфных замен нуклеотидов в ТАТА-боксах промоторов генов человека на сродство к ним ТАТА-связывающего белка Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К.,Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2009, 3, 43, 512-520
|
|
| Correlation between hepatocarcinogenic effect of estragole and its influence on glucocorticoid induction of liver-specific enzymes and activities of FOXA and HNF4 transcription factors in mouse and rat liver Kaledin V I; Pakharukova M Yu; Pivovarova E N; Kropachev K Yu; Baginskaya N V; Vasilieva E D; Ilnitskaya S I; Nikitenko E V; Kobzev V F; Merkulova T I BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, Volume 74, Number 4, 377-384, DOI: 10.1134/S000629790904004X
|
|
| Соответствие между гепатоканцерогенным действием эстрагола и его влиянием на глюкокортикоидную индукцию печень-специфичных ферментов и активность факторов транскрипции FoxА и HNF4 в печени мышей и крыс В.И. Каледин, М.Ю. Пахарукова, Е.Н. Пивоварова, К.Ю. Кропачев, Н.В. Багинская, Е.Д. Васильева, С.И. Ильницкая, Е.В. Никитенко, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, том 74, стр. 466-475
|
|
| Induction of fatty liver by fasting in mouse strains to metabolic syndrome development Baginskaya N.V., Perepechaeva M.L.,Ilnitskaya S.I.,Pivovarova E.N., Kaledin V.I Medical J., 2009, V.3(4).- P.599-600
|
|
| Limiting effect of diazepam on Lewis lung carcinoma metastasis in anxious male mice Kaledin V.I.,Ilnitskaya S.I.,Nikolin V.P.,Popova N.A.,Smagin D.A., Kudryavtseva N.N Experimental oncology, 2009, V31.№1.P .62-64
|
|
| Orto-aminoazotoluen induces the expression of the p53 gene in inbred strains of mice susceptible and resistant to hepatocarcinogenesis Timofeeva OA, Eremeev AV, Goloshchapov AN, Ilnitskaya SI, Merculova TI, Kaledin VI, Setkov NA. Doklady Biological Sciences, 2009, Т.429.- №2.-С.579-82.
|
|
| Полиморфизм гена аполипопротеина Е в популяции коренных жителей Горной Шории и его ассоциация с параметрами углеводного обмена Шахтшнейдер Е.В., Воевода М.И., Огарков М.Ю., Барбараш О.Л., Поликутина О.М., Казачек Я.В., Баум В.А., Юдин Н.С., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Атеросклероз, 2009, Том 5, №1, стр. 28-32
|
|
| Induction of fatty liver by fasting in mouse strains disposed to metabolic syndrome development Baginskaya N.V., Perepechaeva M.L., Ilnitskaya C.I., Pivovarova E.N., Kaledin V.I. Clinical and Experimental Medical Journal, 2009, v3(4): 599-600 2009
|
|
| Specifically activated dendritic cells--cell-based vaccine against lymphosarcoma exhibiting multiple drug resistance phenotype Mironova NL, Panzinskyi EE, Popova NA, Nikolin VP, Zenkova MA, Vlasov VV Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, Sep-Oct;428:252-6.
|
|
| Structural Variants of Glucocorticoid Receptor Binding Sites and Different Versions of Positive Glucocorticoid Responsive Elements: Analysis of GR-TRRD Database Merkulov V.M., Merkulova T.I. J STEROID BIOCHEM, 2009, v.115. p.1-8
|
|
| Tempol reduces the therapeutic effect of cyclophosphamide on an experimental tumor model Kaledin V I.,. Popova N.A, Nikolin V.P., Vasilieva E.D., Kirilyuk I.A., Grigor’ev I.A. FREE RADICAL RES, 2009, V.43.№ 7. P 685-690
|
|
| Влияние этанола на процессы метастазирования аденокарциномы Льюис у самцов мышей с разным эмоциональным состоянием Ильницкая С.И., Николин В.П., Попова Н.А., Августинович Д.Ф., Каледин В.И., Кудрявцева Н.Н. , 2009, Т.95.- №1.- С.74-78
|
|
| Выявление новых сайтов транскрипционных факторов SREBP в промоторных районах генов позвоночных на основе комбинации биоинформационного и экспериментального подходов Е.В. Игнатьева, Т.И. Меркулова, Д.Ю. Ощепков, Н.В. Климова, Г.В. Васильев, И.И. Турнаев, В.Ф. Кобзев, Н.А. Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2009, №1, Т.13, С.37-45
|
|
| Гепатокарцинома -29, метастазирующая перевиваемая опухоль, вызывающая кахексию. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины В. И. Каледин, Н. А. Жукова, В. П. Николин, Н. А. Попова, М. Д. Беляев, Н. В. Багинская, Е. А. Литвинова, Т. Г. Толстикова, Е. Л. Лушникова, Д. Е. Семенов B EXP BIOL MED+, 2009, № 12. С.664-669
|
|
| Действие экзогенной ДНК, ассоциированной с протамином, на рост экспериментальных опухолей мыши Е.А. Алямкина, А.С. Лихачева, В.П. Николин, Н.А. Попова, Е.В. Долгова, В.А. Рогачев, Т.Е. Себелева, Д.Н. Стрункин, С.С. Богачев, М.А. Шурдов Вопросы онкологии, 2009, № 6, Т. 55, стр. 765-768
|
|
| Дифференциация популяций диких и домашних свиней по частоте хромосом, содержащих эндогенные ретровирусы Юдин Н.С., Айтназаров Р.Б., Князев С.П., Бекенёв В.А., Деева В.С., Гончаренко Г.М., Кобзев В.Ф., Савина М.А., Ермолаев В.И., Никитин С.В. Информационный вестник ВОГИС, 2009, т.13, № 4, с.741-750
|
|
| Изменения транскриптома печени крысы под действием гепатоканцерогенного для этих животных 3МЕДАБ и неканцерогенного ОАТ Н.И. Ершов, В.Г. Левицкий, Д.Ю. Ощепков, О.В. Вишневский, Л.О. Брызгалов, Е.В. Антонцева, Т.И. Меркулова. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13, № 4, С. 703–722
|
|
| Ингибирующее влияние тироксина на поздние стадии гепатоканцерогенеза, индуцированные у 14-дневных мышей диэтилнитрозамином В.И.Каледин, Ильницкая С.И., Багинская Н.В., Сенькова А.В. , 2009, т.95, №9, стр. 993-996
|
|
| Интибирующее влияние тироксина на поздние стадии гепатоканцерогенеза, индуцированного у 14-дневных мышей диэтилнитрозамином Каледин В. И., Ильницкая С. И., Багинская, Сенькова А. В. , 2009, Т. 95, № 9. С. 993-997
|
|
| 2008 | Особенности захоронения младенцев в жилищах городища Чича-1 в Баабинской лесостепи по данным анализа структуры ДНК Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2008, № 2, Т. 34, С. 57-67
|
| Оценка потенциальной функциональной значимости полиморфизмов IVS2(+4) t/c, IVS4(-44) t/c и IVS5(-47) a/g гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом человека Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Максимов В.Н., Воевода М.И., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2008, Т. 3, № 2, стр. 60-68
|
|
| Оценка частоты хромосом, содержащих свиные эндогенные ретровирусы, в популяциях домашней свиньи и дикого кабана Никитин С.В., Юдин Н.С., Князев С.П., Айтназаров Р.Б., Кобзев В.Ф., Бекенёв В.А., Савина М.А., Ермолаев В.И. RUSS J GENET+, 2008, № 6. T.44. С. 789-797.
|
|
| Полиморфизм гена холодового рецептора TRPM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока Потапова Т.А., Юдин Н.С., Бабенко В.Н., Пилипенко И.В., В.Ф. Кобзев И.В., Гырголькау Л.А., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2008, №4, Том 12, С. 749-754
|
|
| Популяционное исследование спектра мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в российской популяции Воевода М.И., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Максимов В.Н., Пилипенко И.В., Терещенко И.П., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Никитин Ю.П. RUSS J GENET+, 2008, Т. 44, №10, стр. 1374-1378
|
|
| Пошаговая модель связывания ТВР/ТАТА бокс позволяет предсказать наследственные заболевания человека по точечным полиморфизмам Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2008, 6, 419, 828-832
|
|
| Редокс-модификация и фосфорилирование регулируют активность митохондриального белкового комплекса, специфично связывающегося с промотором гена сох1 кукурузы Тарасенко В.И., Кобзев В.Ф., Константинов Ю.М. Molecular Biology, 2008, Т. 42, № 1, стр. 181-183
|
|
| Сравнительная характеристика ядерной и митохондриальной ДНК-топоизомеразы I кукурузы Тарасенко В.И., Катышев А.И., Кобзев В.Ф., Константинов Ю.М. Molecular Biology, 2008, Т. 42, № 1, стр. 88-95
|
|
| Увеличенное взаимодействие белка ядерных экстрактов перевиваемых опухолей печени и легких мышей с ТАТА-содержащим олигонуклеотидом Лысова М.В., Аршинова Т.В., Драчкова И.А., Кобзев В.Ф., Каледин В.И., Савинкова Л.К. B EXP BIOL MED+, 2008, Т. 145, № 1, стр.100-102
|
|
| Участие экзогенной ДНК в молекулярных процессах, протекающих в соматической клетке Лихачева А.С., Рогачев В.А., Николин В.П., Попова Н.А., Шилов А.Г., Себелева Т.Е., Стрункин Д.Н., Черных Е.Р., Гельфгат Е.Л., Богачев С.С., Шурдов М.А. Информационный вестник ВОГИС, 2008, № 3, Т.12, стр. 426-473
|
|
| Цианамид увеличивает противоопухолевое действие циклофосфамида сильнее, чем общетоксическое В.И. Каледин, В.П. Николин, Н.А.Попова Doklady Akademii Nauk, 2008, Т.420.№ 4. С. 568-570
|
|
| Effects of o-aminoazotoluene on liver regeneration and p53 activation in mice susceptible and resistant to hepatocarcinogenesis Timofeeva O.A, Eremeev A.V., Goloshchapov A., Kalashnikova E., Ilnitskaya S.I., Setkov N.A., Kobzev V., Buzard G.S., Filipenko M.L., Kaledin V.I., Merculova T.I. TOXICOLOGY, 2008, №254, P.91-96
|
|
| Expression of MAP/ERK kinase cascade corresponds to the ability to develop food aversion in terrestrial snail at different stages of ontogenesis Grinkevich LN, Lisachev PD, Kharchenko OA, Vasil'ev GV BRAIN RES, 2008, V.1187 p.12-9.
|
|
| Genetic algorithm and optimized weight matrix application for peroxisome proliferator response elements recognition: Prerequisites of accuracy growth for wide genome research Victor G. Levitsky, Elena V. Ignatieva, Eugenia Aman, Tatyana I. Merkulova, Nikolay A. Kolchanov, T. Charles Hodgman INTELL DATA ANAL, 2008, 12(5): 513-526
|
|
| Поиск генетических детерминант преждевременного старения крыс OXYS Ойдопова О.С., Полыгалова Н.Е., Корболина Е.Е., Колосова Н.Г. Успехи геронтологии, 2008, Т. 21. № 3. С. 499–500.
|
|
| Нарушение функционирования соматических клеток в яйцевых камерах Drosophila melanogaster у мутантов по гену trithorax-like Огиенко А.А., Лаухина О.В., Васильев Г.В., Баричева Э.М. Информационный вестник ВОГИС, 2008, т.12, с. 399-405
|
|
| TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko INTELL DATA ANAL, 2008, No. 5, Vol. 12, P. 443-461
|
|
| Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов FOXA, связанных с регуляцией пролиферации Брызгалов Л.О., Ершов Н.И., Ощепков Д.Ю., Каледин В.И., Меркулова Т.И. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2008, Вып. 1, Том 73: 70-75
|
|
| Изменения состава протеогликанов мозга крыс с возрастом Леберфарб Е.Ю., Рыкова В.И., Колосова Н.Г., Дымшиц Г.М. B EXP BIOL MED+, 2008, №12,т.146, с.691-693.
|
|
| Изучение возможности реверсии устойчивости к хлорохину верапамилом у Plasmodium berghei - возбудителя малярии грызунов Панкова ТГ., Игонина ТМ., Майер ТВ., Рабинович СА., Максакоская ЕВ., Морозов ЕН Медицинская паразитология и паразитарные болезни, 2008, №4, 19-22
|
|
| 2007 | Исследование связывания ядерных белков штаммов P.berghei, различающихся по чувствительности к хлорохину, с олигонуклеотидами, соответствующими регуляторным элементам гена множественной лекарственной устойчивости Панкова Т.Г., Т.М. Игонина, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова. Биомедицинская химия, 2007, т. 53. 547-556
|
| Исследование связывания ядерных белков штаммов Plasmodium bergei, различающихся по чувствительности к хлорохину, с олигонуклеотидами, соотвествующими регуляторным элементам гена множественной лекарственной устойчивости Панкова Т.Г., Т.М. Игонина, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова. Биомедицинская химия, 2007, т.53, с.399-405
|
|
| Консервативность ДНК 3’-нетранслируемой области гена GRO1 северного оленя Юдин Н.С., Потапова Т.А., Кобзев В.Ф., Южаков А.А., Кушнир А.В. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2007, № 9, стр. 93-97
|
|
| Метилирование CpG-динуклеотидов в районе промотора гена белка S100b у мышей линии BALB/cLac Малуп Т.К., Кобзев В.Ф., Жданова Л.Г., Слободянюк С.Я., Свиридов С.М. Doklady Akademii Nauk, 2007, т. 412, № 1, с.115-117
|
|
| Combined experimental and computational approaches to study the regulatory elements in eukaryotic genes Kolchanov NA, Merkulova TI, Ignatieva EV, Ananko EA, Oshchepkov DY, Levitsky VG, Vasiliev GV, Klimova NV, Merkulov VM, Hodgman TC BRIEF BIOINFORM, 2007, 8(4), 266-274
|
|
| Промотирующее влияние ортоаминоазотолуола на гепатоканцерогенез сопровождается усилением воспалительных и пролиферативных процессов в ткани печени и снижением концентрации свободного тироксина в крови Багинская Н.В., Ильницкая С.И., Никитенко Е.В., Каледин В.И. B EXP BIOL MED+, 2007, Т.144, №12, С.672-675
|
|
| Cравнительная характеристика ядерной и митохондриальной ДНК-топоизомеразы I кукурузы Тарасенко В.И., Катышев А.И., Кобзев В.Ф., Константинов Ю.М Molecular Biology, 2007, т. 41, № 6. с. 365-370
|
|
| Транскрипционные факторы FOXA определяют амплитуду глюкокортикоидной индукции тирозинаминотрансферазы у мышей Брызгалов Л.О., Ершов Н.И., Ильницкая С.И. B EXP BIOL MED+, 2007, № 11, Том 144: 565-567
|
|
| Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах Меркулова Т. И., Ощепков Д. Ю., Игнатьева Е. В., Ананько Е.В., Левицкий В.Г., Васильев Г. В., Климова Н. В., Меркулов В.М., Колчанов Н.А. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2007, 11, 72, 1459-1467
|
|
| Effective transcription factor binding site prediction using a combination of optimization, a genetic algorithm and discriminant analysis to capture distant interactions Levitsky V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Turnaev I.I., Merkulova T.I., Kolchanov N.A., Hodgman T.C. BMC BIOINFORMATICS, 2007, Vol. 8:481. PMID: 18093302
|
|
| Exogenous DNA can be captured by stem cells and be involved in their rescue from death after lethal-dose γ-radiation Likhacheva AS, Nikolin VP, Popova NA, Rogachev VA, Prokhorovich MA, Sebeleva TE, Bogachev SS, Shurdov MA. Gene Therapy and Molеcular Biology, 2007, 11: 305-314
|
|
| Integration of human DNA fragments into the cell genome of certain tissues from adult mice treated with cytostatic cycloposphamide in combination whit human DNA Likhacheva AS, Nikolin VP, Popova NA, Dubatolova TD, Strunkin DN, Rogachev VA, Sebeleva TE, Erofeev IS, Bogachev SS, Yakubov LA, Shurdov MA Gene Therapy and Molеcular Biology, 2007, 11: 185-202
|
|
| Effects of administration of sodium glutamate during the neonatal period on behavior and blood corticosterone levels in male mice Kuznetsova E.G., Amstislavskaya T.G., Bulygina V.V., Il'nitskaya S.I., Tibeikina M.A., Skrinskaya Y.A. Neuroscience Behavioral Physiology, 2007, V.37; P. 827-833.
|
|
| Поиск новых сайтов связывания транскрипционного фактора SF1 методом SITECON: экспериментальная проверка и анализ регуляторных районов генов-ортологов. Игнатьева Е. В., Климова Н. В., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А. Doklady Akademii Nauk, 2007, 415(1):120-124
|
|
| Recognition of interferon-inducible sites, promoters, and enhancers Ananko E.A., Kondrakhin Y.V., Merkulova T.I., Kolchanov N.A BMC BIOINFORMATICS, 2007, v.8 p.56
|
|
| Search for new binding sites for the transcription factor SF-1 by the SITECON method: experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes Ignat'eva EV, Klimova NV, Oshchepkov DY, Vasil'ev GV, Merkulova TI, Kolchanov NA. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2007, V.415, c.165-169
|
|
| Роль SNPs гена K-ras мыши в механизме формирования предрасположенности к пульмоноканцерогенезу Антонцева Е.В., Скорытченко Я.Д., Каледин В.И., Меркулова Т.И. Cell and Tissue Biology, 2007, т.49, №9, с. 713
|
|
| The influence of psychoemotional status on metastasis of Lewis lung carcinoma and Hepatocarcinoma – 29 in mice of C57BL/6 and CBA strains Kudryavtseva N. N., Tenditnik M. V., Nikolin V. P., Popova N. A., Kaledin V. I. Experimental oncology, 2007, V 29.N 1. P. 35-38
|
|
| Активация конститутивного рецептора андростанов (CAR) под действием гепатоканцерогенных аминоазокрасителей в печени мышей и крыс М.Ю. Пахарукова*, М.А. Сметанина, В.И. Каледин, В.Ф. Кобзев, И.В. Романова, Т.И. Меркулова. B EXP BIOL MED+, 2007, №9, 144, 313-316
|
|
| Активация конститутивного рецептора андростанов под действием гепатоканцерогенных аминоазокрасителей в печени мышей и крыс М.Ю.Пахарукова, М.А.Сметанина, В.И.Каледин, В.Ф.Кобзев, И.В.Романова, Т.И.Меркулова B EXP BIOL MED+, 2007, т. 144, № 9, с.313-316
|
|
| Взаимодействие рекомбинантного ТАТА-связывающего белка с ТАТА-боксами промоторов генов млекопитающих Савинкова Л.К., Драчкова И.А., Пономаренко М.П., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Колчанов Н.А. Экологическая генетика, 2007, Т.V, №2, 44-49
|
|
| Влияние возраста и пола на гепатотоксическое и гипотермическое действие эстрагола у мышей Каледин В.И., Васильева Е.Д., Ильницкая С.И., Морозкова Т.И., Амстиславская Т.Г. , 2007, №8, Т.93, C.844-851
|
|
| Bioinformatical and experimental approaches to investigation of transcription factor binding sites in vertebrate gene Merkulova T. I., Oshchepkov D. Yu., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Levitsky V. G., Vasiliev G. V., Klimova N. V. , Merkulov V. M., Kolchanov N. A. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2007, 72 (11):1187-1193
|
|
| Изучение влияния нитрозоэтил мочевины на глюкокортикоидную индукцию тирозинаминотрансферазы и ДНК-связывающую активность некоторых факторов транскрипции в печени мышей Пивоварова Е. Н., Ильницкая С. И., Кобзев В.Ф., Меркулова Т. И., Каледин В. И. Бюллетень СО РАМН, 2007, №1 (123), - С.88-91
|
|
| 2006 | Исследование связывания ядерных белков штаммов Plasmodium berghei с различной чувствительностью к хлорохину с олигонкуклеотидами, моделирующими регуляторные участки гена множественной лекарственной устойчивости Панкова Т.Г., Т.М. Игонина, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова. B EXP BIOL MED+, 2006, №6, с. 283-286.
|
| Место связывания глюкокортикоидного рецептора на ДНК и структурные варианты глюкокортикоидных регуляторных элементов: данные, собранные в базе GR ¬ TRRD Меркулов В.М. Меркулова Т.И. Экологическая генетика, 2006, Т. IV , вып. 4. С. 20-31
|
|
| Метод SiteGA для распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А., Ходжман Т.С. BIOPHYSICS, 2006, т.51, стр. 633-639
|
|
| Потенциальные сайты связывания фактора транскрипции SF-1: выявление методом SiteGA, экспериментальная проверка и поиск новых генов-мишеней Н.В.Климова, В.Г.Левицкий, Е.В.Игнатьева, Г.В.Васильев, В.Ф.Кобзев, Т.В.Бусыгина, Т.И.Меркулова, Н.А.Колчанов Molecular Biology, 2006, Т.40, №3, стр.512-523
|
|
| Различия в связывании ядерных белков из отличающи хся по устойчивости к хлорохину штаммов P.berghei с олигонуклеотидами, соответствующими регуляторным элементам mdr1 гена Панкова Т.Г., Игонина Т.М., Кобзев В.Ф., Меркулова Т.И. B EXP BIOL MED+, 2006, т.141, N 3, с.283-286.
|
|
| Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов с помощью метода SiteGA Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В.,Ананько Е.А.,Меркулова Т.И., Колчанов Н.А.,Ходжман Ч. BIOPHYSICS, 2006, 4, 51, 633-639
|
|
| Характеристика транскриптов генов Mn- и Cu/Zn-содержащих супероксиддисмутаз Larix gmelinii Катышев А.И., Константинов Ю.М., Кобзев В.Ф. Molecular Biology, 2006, т.40, N 2, с.372-374
|
|
| Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах Климова Н.В., Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2006, т.40, стр. 512-523.
|
|
| Development of behavioural dysfunctions in accelerated-senescence OXYS rats is associated with early postnatal alterations in brain phosphate metabolism Sergeeva S.V., Bagryanskaya E.G., Korbolina E.E., Kolosova N.G. EXP GERONTOL, 2006, 41(2):141-50.
|
|
| Enhancing effect of new biological response modifier sulfoethyl(1-3)-beta-D-glucan 0n antitumor activity of cyclophosphamide in the treatment of experimental murine leukoses Khalikova T.A., Korolenko T.A., Zhanaeva S.Y., Kaledin V.I., Kogan G. Experimental oncology, 2006, N 4, V. 28, P.47-52.
|
|
| Potential binding sites for SF-1: Recognition by the SiteGA method, experimental verification, and search for new target genes Klimova NV, Levitsky VG, Ignatieva EV, Vasiliev GV, Kobzev VF, Busygina TV, Merkulova TI, Kolchanov NA Molecular Biology, 2006, V.40, № 3. P.1-12.
|
|
| SNP в начале интрона 2 гена K-ras мыши, ассоциированные сразвитием рака легких, влияют на связывание с факторами транскрипции Е.В. Горшкова, В.И. Каледин, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова B EXP BIOL MED+, 2006, № 6, Т. 141, С.681-684.
|
|
| An effect of the microsporidian Vairimorpha ephestiae (Microsporidia: Burenellidae) on activity and spectrum of nonspecific esterases in different tissues of the greater wax moth galleria mellonella (Lepidoptera: Pyralidae) larvae Vorontsova Ia.L., Ershov N.I., Glupov V.V. Паразитология, 2006, 40(1): 74-84
|
|
| Animal model of drug-resistant tumor progression N. Mironova, O.Shklyaeva. E. Andreeva, N.Popova, V. Kaledin, V. Nikolin, V. Vlasov, M.Zenkova ANN NY ACAD SCI, 2006, N 1091, pp. 490-500
|
|
| Ассоциации эндогенных ретровирусов разных типов с генетическими маркерами в популяциях домашних и диких свиней Айтназаров Р.Б., Ермолаев В.И., Никитин С.В., Савина М.А., Кобзев В.Ф., Князев С.П., Гончаренко Г.М., Бекенёв В.А., Юдин Н.С. Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук, 2006, № 4. C. 39–43.
|
|
| Влияние бетулоновой кислоты и ее амидных производных на рост и диссиминирование опухолевых трансплантатов у мышей И.В. Сорокина, Н.А. Жукова, Т.Г. Толстикова, С.В. Позднякова, О.Р. Грек, Н.А. Попова, В.А. Каледин, В.П. Николин. B EXP BIOL MED+, 2006, т.142, № 1,С. 29-31
|
|
| Влияние неонатального введения глутамата натрия и диэтилнитрозоамина на поведение и уровень кортикостерона в крови самцов мышей. Кузнецова Е.Г., Амстиславская Т., Булыгина В.В.,Ильницкая С.И., Тибейкина М.А.,Скринская Ю.А. , 2006, Т.92.- №6.- Стр.751 – 760.
|
|
| Влияние психоэмоционального состояния на рост и метастазирование опухоли Льюис у мышей Каледин В. И., Тендитник М. В., Николин В. П. , Попова Н. А., Кудрявцева Н.Н. Doklady Akademii Nauk, 2006, Т.406. N 2.С. 272-274
|
|
| Влияние экзогенной ДНК на восстановление лейкопоэза и противоопухолевый эффект циклофосфана Николин В.П., Попова Н.А., Себелева Т.Е., Стрункин Д.Н., Рогачев В.А., Семенов Д.В., Богачев С.С., Якубов Л.А., Шурдов М.А. Вопросы онкологии, 2006, т.52, №3, стр. 336-340
|
|
| Влияние экзогенной ДНК на рост экспериментальных опухолей Николин В.П., Попова Н.А., Себелева Т.Е., Стрункин Д.Н., Рогачев В.А., Семенов Д.В., Богачев С.С., Якубов Л.А., Шурдов М.А. Вопросы онкологии, 2006, т. 52., N 1, стр. 66-69
|
|
| Изучение влияния антиоксиданта тиофана на канцерогенное действие 3,4-бензпирена при пероральном введении у мышей В. И. Каледин, В.Г. Некрасов, А.М. Гончар, В.И. Ермолаев, А. Е. Просенко. Сибирский экологический журнал, 2006, Т 5. С. 649-654
|
|
| Изучение влияния бетулоновой кислоты и ее амидных производных на рост и метастазирование перевиваемых опухолей у мышей. Вопр. Биологической, медицинской и фармацевтической химии Сорокина И.В., Жукова Н.А., Толстикова Т.Г., Позднякова С.И., Грек О.Р., Попова Н.А., Андреева Е.М., Каледин В.И., Николин В.П. Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии, 2006, Т.142.-№ 1. С. 29-31
|
|
| Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О, Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т.10, №3. С.565-571
|
|
| Изучение эффективности моно- и полихимиотерапии на модели перевиваемой мышиной лимфосаркомы, нечувствительной к индукции апоптоза Каледин В. И., Попова Н. А., Андреева Е.М. Вопросы онкологии, 2006, Т.. 52. № 1. С. 70-73
|
|
| 2005 | Mining genome variation to associate genetic disease with mutation alterations and ortho/paralogous polimorphysms in transcription factor binding site. Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Merkulova T.M., Vasiliev G.V., and Ponomarenko M.P. INT J ARTIF INTELL T, 2005, 4, 14, 599-620
|
| 2003 | Полиморфизм гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом, в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Хаснулин В.И., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2003, Т.39 № 7C. 988-995
|
| rSNP_Guide, a database system for analysis of transcription factor binding to DNA with variations: application to genome annotation. Ponomarenko J.V., Merkulova T.I., Orlova G.V., Fokin O.N., Gorshkova (Antontseva) E.V., Frolov A.S., Valuev V.P., Ponomarenko M.P. NUCLEIC ACIDS RES, 2003, 1, 31, 118-121
|
|
| 2002 | Mining DNA sequences to predict sites which mutations cause genetic diseases. Ponomarenko J.V., Merkulova T.I., Orlova G.V., Fokin O.N., Gorshkova (Antontseva) E.V., Ponomarenko M.P. Knowl-Based Syst. J., 2002, 4, 15, 225-233
|
| 2001 | rSNP_Guide, a database system for analysis of transcription factor binding to target sequences: application to SNPs and site-directed mutations Ponomarenko JV, Merkulova TI, Vasiliev GV, Levashova ZB, Orlova GV, Lavryushev SV, Fokin ON, Ponomarenko MP, Frolov AS, Sarai A. NUCLEIC ACIDS RES, 2001, 1, 29, 312-316.
|
| Распространение аллелей C282Y, H63D и S65C гена HFE и предрасположенности к нарушениям метаболизма железа в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Хаснулин, Воевода М.И Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии, 2001, Т.XI, №4, С.13-17
|
|
| 2000 | Точковые мутации в районе 663-666 п.н. интрона 6 гена триптофаноксигеназы, связанные с рядом психических расстройств, разрушают сайт связывания фактора транскрипции YY1. Васильев Г.В., Меркулов В.М., Кобзев В.Ф., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Подколодная О.А., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2000, 2, 34, 214-222
|
| 1999 | GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, 5, 44, 837-841
|
| Point mutations within 663-666 bp of intron 6 of the human TDO2 gene, associated with a number of psychiatric disorders, damage the YY-1 transcription factor binding site. Vasiliev G.V., Merkulov V.M., Kobzev V.F., Merkulova T.I., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A. FEBS LETT, 1999, 1/2, 462, 85-88
|
|
| Identification of sequence-dependent features correlating to activity of DNA sites interacting with proteins Ponomarenko M.P., Ponomarenko J.V., Frolov A.S., Podkolodny N.L., Savinkova L.K., Kolchanov N.A., Overton G.C. BIOINFORMATICS, 1999, 7/8, 15, 687-703
|
|
| Integrated databases and computer systems for studying eukaryotic gene expression. Kolchanov N.A., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Ananko E.A., Kolpakov F.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Goryachkovskaya T.N., Stepanenko I.L., Merkulova T.I., Babenko V.N., Ponomarenko J.V., Kochetov A.V., Podkolodny N.L., Vorobyev D.G., Lavrushev S.V., Grigorovich D.A., Kondrakhin Yu.V., Milanesi L., Wingender E., Solovyev V.V., Overton G.C. BIOINFORMATICS, 1999, 7/8, 15, 669-686
|
Монографии
| 2011 | Dioxin responsive elements in the promoter regions of the genes encoding macrophageal transcription factors and cytokines: prediction and experimental verification E.V. Kashina, D.Yu. Oshchepkov, E.V. Antontseva, E.A. Oshchepkova, M.Yu. Shamanina, V.A. Mordvinov, D.P. Furman
|
| 2008 | Регуляторные последовательности ДНК: описание в базах данных. Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Степаненко И.Л., Хлебодарова Т.М., Меркулова Т.И., Меркулов В.М., Мищенко Е.Л., Ибрагимова С.С., Смирнова О.Г., Подколодный Н.Л., Ромащенко А.Г., Ощепков Д.Ю., Мигинский Д.С.
|
| Регуляторные последовательности ДНК: исследование компьютерными методами. Ощепков Д.Ю., Бугреев Д.В., Невинский Г.А., Колчанов Н.А., Игнатьева Е.В., Климова Н.В., Васильев Г.В., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Воробьев Ю.Н., Емельянов Д.Ю., Левицкий В.Г., Ананько Е.А., Вишневский О.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В.
|
|
| Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. Под ред. А.Б. Масленникова. Вып. 12 Воевода М.И., Максимов В.Н., Малютина С.К., Гафаров В.В., Шишкин С.В., Ромащенко А.Г., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Кузнецова Т.Н., Кобзев В.Ф., Юдин Н.С.
|
|
| 2006 | Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. Под ред. А.Б. Масленникова. Вып. 9 Воевода М.И., Юдин Н.С., Васильев Г.В., Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Бархаш А.В., Ромащенко А.Г.
|
| TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS DATABASE (TRRD): A SOURCE OF EXPERIMENTALLY CONFIRMED DATA ON TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS OF EUKARYOTIC GENES N. Kolchanov, E. Ignatieva, O. Podkolodnaya, E. Ananko, I. Stepanenko, T. Merkulova, T. Khlebodarova, V. Merkulov, N. Podkolodny, D. Grigorovich, A. Poplavsky, A. Romashchenko
|
Конференции
| 2012 | Взаимосвязь тревожности и депрессии в развитии тревожно-депрессивного расстройства у мышей: эффекты диазепама А.Г. Галямина, Д.А. Смагин, А.Е Григорьева, И.Л. Коваленко, Н.П. Бондарь, Н.Н. Кудрявцева VII Сибирский съезд физиологов
|
| Выявление роли ксенобиотиков в регуляции генов, вовлеченных в синтез цитокинов макрофагами. Ощепков Д.Ю., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. III международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» (Postgenome-2012).
|
|
| 2011 | Влияние активации конститутивного рецептора андростана на чувствительность к химическому гепатоканцерогенезу и показатели обмена веществ у самцов и самок мышей линии C57Bl/6J. Н.В. Багинская, С.И. Ильницкая, В.И. Каледин 3 съезд физиологов СНГ
|
| Влияние полиморфизмов ТАТА-боксов, ассоциированных с наследственными заболеваниями человека, на взаимодействие с hТВР Драчкова И.А.. Савинкова Л.К., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А. II-nd International conference Physico-Chemical Biology dedicated to the 85th anniversary of academician Dmitri G. Knorre.
|
|
| Анализ данных массовой иммунопреципитации хроматина с помощью экспериментально верифицированных методов распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA Ощепков Д. Ю., Левицкий В. Г. , Кулаковский И. В., Ершов Н. И., Васильев Г.В., Меркулова Т. И. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика»
|
|
| ЦИТОХРОМ P450 У ПАРАЗИТИЧЕСКИХ ПЛОСКИХ ЧЕРВЕЙ НА ПРИМЕРЕ ВОЗБУДИТЕЛЯ ОПИСТОРХОЗА OPISTHORCHIS FELINEUS М.Ю. Пахарукова, Н.И. Ершов, В.А. Вавилин, Е.В. Воронцова, А.В. Катохин, Т.И. Меркулова, В.А. Мордвинов II международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»
|
|
| Идентификация ортологов рецептора тиреоидного гормона у плоских червей Opisthorchis felineus. Воронцова Е.В., Пахарукова М.Ю., Ершов Н.И., Катохин А.В., Меркулова Т.И., Мордвинов В.А. II международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»
|
|
| Мутации в генах K-ras и ERRF у больных немелкоклеточным раком легких в Западно-Сибирском регионе России. Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Матвеева М.Ю., Пономарёва А.А., Иванова А.А., Рыкова Е.Ю., Чердынцева Н.В., Меркулова Т.И.. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»
|
|
| Выявление регуляторных SNP, ассоциированных с различными заболеваниями, с использованием данных ChIP-seq. Меркулова Т.И., Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Пономаренко М.П., Савинкова Л.К., Васильев Г.В., Драчкова И.А., Матвеева М.Ю., Колчанов Н.А. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»
|
|
| 2010 | Экспериментальная проверка функциональной активности потенциальных DRE-сайтов, обнаруженных в промоторах IRF1, REL и IL12A генов человека Е.В. Кашина, Е.В. Антонцева, М.Ю. Шаманина, Е.А. Ощепкова, Д.Ю. Ощепков, А.В. Катохин, А.Ю. Гришанова, Д.П. Фурман, В.А. Мордвинов 1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии", Томск, 6-9 октября 2010
|
| 2'-5'-oligoadenylate synthetase genes polymorphism, associated with predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis, in human North Eurasian populations Barkhash A.V., Babenko V.N., Kobzev V.F., Romaschenko A.G., Voevoda M.I. 10th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases (MEEGID X)
|
|
| Investigation of UV Laser Radiation Effect on KREBS 2 Cells Viability Maslov N.A., Rojin I.A., Popova N.A., Nikolin V.P., Kaledin V.I., Amstislavskaya T.G. 15th INTERNATIONAL CONFERENCE ON THE METHODS OF AEROPHYSICAL RESEARCH, Novosibirsk
|
|
| The siRNA targeted to mdr1b in vivo restores the sensitivity of murine lymphosarcoma to chemotherapy. 3rd Special Meeting on ABC Protein Patutina O.A., Mironova N.L., Popova. N.A., Kaledin V.I., Nikolin V.P., Vlasov V.V., Zenkova M.A. 3rd Special Meeting on ABC Protein. ATB-Binding Cassete (ABC) Protein: From Multidrag Resostance to Genetic Diseases. Insbruck, Austria
|
|
| Investigation of Opisthorchosis felineus transcription profile by direct sequencing cDNA library’s clones S.I. Tatkov, I. I. Brusentsov, M.Yu. Pomaznoy, O.V. Nosareva, A.M. Nayakshin, S. V. Guselnikov, E. V. Brenner, G. V. Vasiliev, A.V. Katokhin, V. A. Mordvinov 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
|
|
| prognosis and verification of the TATA SNP effects V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, I.A. Drachkova, N.A. Kolchanov Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010
|
|
| SNPs in the hiv-1 TATA box and the aids pandemic V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010
|
|
| Генная сеть активации макрофага: участие ксенобиотков в регуляции экспрессии генов цитокинов Ощепкова Е.А., Ощепков Д.Ю., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Всероссийская научная конференция "Молекулярно-генетические основы функционирования цитокиновой сети в норме и при патологии", 15-17 сентября 2010г.
|
|
| Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине Попова Н.А., Маслов Н.А., Рожин И.А, Николин В.П., Каледин В.И., Амстиславская Т.Г. Международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине" 23-26 ноября, 2010, г. Санкт-Петербург
|
|
| ТАТА-боксы вносят вклад в норму реакции Суслов В.В., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Драчкова И.А. Международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине" 23-26 ноября, 2010, г. Санкт-Петербург
|
|
| Экспериментально-компьютерное исследование генов, вовлекаемых в реакцию макрофага на диоксин Ощепков Д.Ю., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине" 23-26 ноября, 2010, г. Санкт-Петербург
|
|
| Поиск потенциальных мишеней для диагностики паразита Opisthorchis felineus Помазной М. Ю., Татьков С. И., Брусенцов И. И., Сивков А.Ю., Наякшин А.М., Гусельников С.В., Бреннер Е.В., Васильев Г.В., Катохин А.В., Мордвинов В.А. Молекулярная диагностика 22-25 ноября 2010, Москва
|
|
| SNP ТАТА-бокса ВИЧ-1 и пандемия СПИД Суслов В.В., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Ефимов В.М., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Проблемы экологии. Чтения памяти проф. М.М.Кожова. Иркутск, 2010
|
|
| An experimental and computation approach to search for the transcription factor GAGA binding sites Omelina E.S., Oshchepkov D.Yu., Baricheva E.M., Merkulova T.I. BGRS-2010
|
|
| SNPs IN THE HIV-1 TATA BOX AND THE AIDS PANDEMIC V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov (6) IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky Crimean meeting."Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution".
|
|
| «Прогноз и экспериментальная проверка изменения сродства ТВР к ТАТА-боксам промотров генов человека, содержащим полиморфизмы». – Драчкова ИА., Пономаренко РМ., Пономаренко МП., Аршинова ТВ., Савинкова ЛК., Колчанов НА. «Первые Международные Беккеровские чтения» (27-29 мая 2010)
|
|
| Experimental verification of the prognosis human TBP/TATA affinity change as a result of polymorphisms associated with hereditary pathologies I.A. Drachkova., P.M. Ponomarenko., T.V. Arshinova., M.P. Ponomarenko., L.K. Savinkova., N.A. Kolchanov. BGRS
|
|
| Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. IV Международная Школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биология клетки».
|
|
| Promoters of the genes encoding the macrophage transcription factors contain binding sites for aryl hydrocarbon receptor. Oshchepkova E.A., Oshchepkov D.Y., Kashina E.V., Antontseva E.V., Shamanina M.Y., Mordvinov V.A., Furman D.P. Seventh international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology
|
|
| Detection of dioxin responsive elements in the promoter regions of the genes encoding macrophage cytokines. Oshchepkova E.A., Oshchepkov D.Y., Kashina E.V., Antontseva E.V., Furman D.P., Mordvinov V.A. Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure and Systems Biology (BGRS_SB’10),Новосибирск, Россия, 20-27 июня
|
|
| Detection of dioxin responsive elements in the promoter regions of the macrophage transcription factors and cytokines genes. Oshchepkova E.A., Oshchepkov D.Y., Kashina E.V., Antontseva E.V., Shamanina M.Y., Mordvinov V.A., Furman D.P. “From Functional Genomics to Systems Biology”,
|
|
| Компьютерно-экспериментальное изучение сайтов связывания транскрипционных факторов. Ощепков Д.Ю., Климова Н.В., Антонцева Е.В., Левицкий В.Г., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Пономаренко М.П., Драчкова И.А., Савинкова Л.К., Фурман Д.П., Мордвинов В.А., Меркулова Т.И. I международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»
|
|
| Экспериментально-компьютерное исследование генов, вовлекаемых в реакцию макрофага на диоксин. Ощепков Д.Ю., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Международная научно-практическая конференция «Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине»
|
|
| Testing of functional activity of putative dioxin responsive elements in promoter regions of genes, encoding macrophageal transcription factors and cytokines Kashina E.V., Antontseva E.V., Katokhin A.V., Oshchepkova E.A., Oshchepkov D.Y., Shamanina M.Y., Grishanova A.Y., Furman D.P, Mordvinov V.A. The seventh international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology
|
|
| Investigation of sex difference in susceptibility to hepatocarcinogenesis in mice N.V.Baginskaya, S.I.Ilnitskaya, V.I.Kaledin 7 International Conference on Bioinformatics of Genom Regulation and Structure/Systems Biology
|
|
| 2009 | Оценка влияния миграционных процессов на генофонд мтДНК населения Западной Сибири 4-1 тыс. до н.э. Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Журавлев А.А., Куликов И.В., Кобзев В.Ф. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
|
| Этноспецифическое распределение гаплотипов по полиморфизмам IVS2 (+4) t/c, IVS4 (-47) t/c, and IVS5 (-44) a/g гена HFE в популяциях России и возможная роль этих полиморфизмов в сплайсинге Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф. , Воевода М.И., Ромащенко А.Г. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
|
|
| The effects of allelic variation of bovine cytokine genes on susceptibility to infectious diseases Yudin N.S., Vasil'eva L.A., Kobzev V.F., Kuznetsova T.N., Nefedova M.V., Kulikov I.V., Maksimov V.N., Naykova T.M., Potapova T.A., Barkhash A.V., Tumanov Yu.V., Smirnov P.N., Laegreid W.W., Romashchenko A.G., Voevoda M.I. German-Russian Forum Biotechnology GRFB'09
|
|
| Полиморфизмы генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз человека и их связь с тяжелыми формами клещевого энцефалита Бархаш А.В., Перелыгин А.А., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Мясникова Н.Г., Морозова О.В., Бринтон М.А., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. V Международная научная конференция "Факторы экспериментальной эволюции организмов"
|
|
| Связь полиморфизмов генов 2’-5’-олигоаденилатсинтетаз человека с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Перелыгин А.А., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Мясникова Н.Г., Морозова О.В., Бринтон М.А., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
|
|
| Структурно-функциональные изменения протеогликанов мозга крыс в онтогенезе. Леберфарб Е.Ю., Рыкова В.И., Дымшиц Г.М., Колосова Н.Г. Пятый международный междисциплинарный конгресс «Нейронаука для медицины и психологии» Судак, Крым
|
|
| Структурно-функциональные особенности протеогликанов мозга преждевременно стареющих крыс линии OXYS Леберфарб Е.Ю., Рыкова В.И., Колосова Н.Г., Дымшиц Г.М. V съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, Москва, 21-28 июня 2009г.
|
|
| Revealing of potential FoxA target genes, involved in proliferation control. N. Ershov, T. Merkulova, L. Bryzgalov, M. Pakharukova, D. Oschepkov and V. Kaledin. 34th FEBS Congress.
|
|
| Induction of fatty liver by fasting in mouse strain disposed to metabolic syndrome development Baginskaya N.V., Ilnitskaya C.I., Perepechaeva M.L., Pivovarova E.N., Kaledin V.I. 1st Congress of Fatty Liver and Metabolic Syndrome: From Basic Science to Clinical Praxis
|
|
| Полиморфизм генов предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Малютина С.К., Гафаров В.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Юдин Н.С., Воевода М.И. V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
|
|
| Гены предрасположенности к ИБС в популяции Сибири Толкачёва О.М., Максимов В.Н., Куликов И.В., Завьялова Л.Г., Денисова Д.В., Васильев Г.В., Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Вопросы патогенеза типовых патологических процессов
|
|
| Гены предрасположенности к ИБС в популяции Сибири Максимов В.Н., Толкачёва О.М., Куликов И.В., Завьялова Л.Г., Денисова Д.В., Васильев Г.В., Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Всероссийская научно-практическая конференция «Перспективы кардиологии России в XXI веке»
|
|
| 2008 | the precise equilibrium equation of TBP/TATA-binding predicts human familial diseases upon mutations Ponomarenko P.M., Savinkova L.K., Drachkova I.A., Lysova M.V., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A. 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28
|
| Обращение фенотипа множественной лекарственной устойчивости опухоли с помощью siРНК, адресованной к мРНК генов mdr1a и mdr1b, у мышей Шкляева О.А.Миронова Н.Л., , Попова Н. А., Николин В. П., Каледин В. И., Власов В. В., Зенкова М. А. IV съезд Российского Общества биохимиков и молекулярных биологов, 10-15 мая, Новосибирск, 2008
|
|
| Molecular mechanisms undrelying species-, strain- and sex-related differences in sensitivity to estragol and ethylnitrosourea carcinogens treatment Pivovarova E.N., Ilnitskaya S.I., Kaledin V.I. The Russian Conference with International participation on Molecular Oncology ( сборник материалов ).- Novosibirsk
|
|
| The influence of activation of peroxisome proliferator-activated receptors on liver tumour development and blood biochemistry in mouse strains are different on induced hepatocarcinogenesis sensitivity Baginskaya N.V., Ilnitskaya S.I., Kaledin V.I. The Russian Conference with International participation on Molecular Oncology ( сборник материалов ).- Novosibirsk
|
|
| Транскрипционные факторы FOXA как потенциальные опухолевые супрессоры в печени Т.И. Меркулова, Л.О. Брызгалов, Н.И. Ершов, Д.Ю. Ощепков, М.Ю. Пахарукова, К.Ю. Кропачев, В.И. Каледин Всероссийская конференция "Молекулярная онкология", г. Новосибирск
|
|
| Субфракционный профиль частиц липопротеинов низкой плотности и спектр мутаций гена LDLR при гиперхолистеринэмии Шахтшнейдер Е.В., Куликов И.В., Рагино Ю.И., Полонская Я.В., Пилипенко И.В., Терещенко И.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Никитин Ю.П., Воевода М.И. Кардиоваскулярная терапия и профилактика, 2008, 7(6), Приложение 1
|
|
| Участие экзогенной ДНК в молекулярных процессах, протекающих в соматической клетке С.С. Богачев, А.С. Лихачева, В.А. Рогачев, В.П. Николин, Н.А. Попова, Т.Е. Себелева, Е.Р. Черных, Е.Л. Гельфгат, М.А. Шурдов Научная конференция с международным участием "Дни иммунологии в Сибири-2008"
|
|
| Полиморфизм генов предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям в популяционном и проспективном исследовании Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Малютина С.К., Гафаров В.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Юдин Н.С., Воевода М.И. Российская конференция "Профилактика сердечно-сосудистых заболеваний", 25-26 марта 2008 г., Новосибирск
|
|
| Ассоциативный анализ полиморфизмов генов TP53 и C-FMS с развитием рака молочной железы у русских женщин И.В. Пилипенко Сборник материалов III региональной конференции молодых ученых им. академика РАМН Н.В. Васильева. 29 апреля 2008 г., Томск
|
|
| Формирование этнокультурных сообществ в западносибирской лесостепи на основе данных палеогенетики (первые результаты) А.С. Пилипенко, А.Г. Ромащенко, В.И. Молодин, А.А. Журавлев, А.Е. Гришин, Д.В. Поздняков, И.В. Куликов, Т.А. Чикишева, В.Ф. Кобзев Труды II (XVIII) Всероссийского археологического съезда в Суздале. Т. III, 2008, Москва, Институт археологии РАН
|
|
| Протеогликаны мозга крыс Wistar и преждевременно стареющих крыс Oxys разного возраста. Рыкова В.И., Леберфарб Е.Ю., Колосова Н.Г., Дымшиц Г.М. IV съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов
|
|
| Сравнение протеогликанов мозга крыс Wistar и преждевременно стареющих крыс Oxys разного возраста Леберфарб Е.Ю., Рыкова В.И., Колосова Н.Г., Дымшиц Г.М. IX международный конгресс молодых ученых и специалистов «Науки о человеке», Томск
|
|
| Транскрипционные факторы FOXA как потенциальные опухолевые супрессоры в печени Т.И. Меркулова, Л.О. Брызгалов, Н.И. Ершов, Д.Ю. Ощепков, М.Ю. Пахарукова, К.Ю. Кропачев, В.И. Каледин. Всероссийская конференция с международным участием "Молекулярная онкология"
|
|
| SITECON: a quality tool for prediction of new potential SREBP binding sites. experimental verification and analysis of regulatory regions of vertebrate genes. D.Y. Oshchepkov, E.V. Ignatieva, G.V.Vasiliev, N.V. Klimova, T.I. Merkulova Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
|
|
| Исследование молекулярных механизмов, обеспечивающих видовую специфичность в действии гепатоканцерогенных соединений у экспериментальных животных М.Ю. Пахарукова, М.А. Сметанина, В.И. Каледин, Т.И. Меркулова. всероссийской конференции с международным участием «Молекулярная онкология»
|
|
| The influence of activation of peroxysome proliferator-activated receptors on liver tumors development and blood biochemistry in mouse strains are different on induced hepatocarcinogenesis sensitivity2 Baginskaya N.V., Ilnitskaya C.I., Kaledin V.I. Всероссийская конференция с международным участием «Молекулярная онкология» “Molecular oncology”
|
|
| Expression of liver nuclear hormone receptors PPAR-α and PPAR–γ, LХR and RХR and blood corticosterone and insulin level in sensitivity to chemical hepatocarcinogenesis mouse strain DD and in resistant mouse strain СС57BR Dushkin M.I., Baginskay N.V.,Perepechaeva M.L., Safronova O.G. Pivovarova E.N., Kaledin V.I. Всероссийская конференция с международным участием «Молекулярная онкология» “Molecular oncology”
|
|
| Ассоциация сниженного уровня глюкокортикоидов и экспрессии ядерных гормональных рецепторов с чувствительностью к химическому гепатоканцерогенезу у мышей линии DD Душкин М.И., Багинская Н.В, Ефремов Я.Р., Пивоварова Е.Н., Каледин В.И. Международный междисциплинарный симпозиум <От Экспериментальной Биологии к Превентивной и Интегративной Медицине>
|
|
| 2007 | Similarity of mitochondrial DNA patterns in ancient and modern indigenous West Siberian populations Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Kulikov I.V., Kobzev V.F., Grishin A.E., Pozdnyakov D.V., Molodin V.I. II International Conference "Biosphere Origin and Evolution" October 28 - November 2, 2007, Loutraki, Greece
|
| Effect of psychoemotional and immune state on growth and metastasis of Lewis lung carcinoma in mice. Inter-national symposium "Interaction of the nervous Popova N.A., Avgustinovich D.E., Nikolin V.P., Kaledin V. I., Ilnitskaya s.I., Kudryavtseva N.N. International symposium "Interaction of the nervous and immune system in health and disease" Saint-Petersburg. Russia
|
|
| Изучение влияния однонуклеотидного полиморфизма G215C гена р53 на формирование предрасположенности к развитию рака молочной железы у русских женщин Пилипенко И.В., Голубева Д.В., Кобзев В.Ф., Чердынцева Н.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова, Алушта, Украина, 24-28 сентября
|
|
| Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О., Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова
|
|
| Изучение Молекулярных механизмов опухолесупрессорного действия транскрипционных факторов HNF3 Ершов Н.И. XLV международная научная студенческая конференция: Студент и научно-технический прогресс, Новосибирск 10-12 апреля 2007г.
|
|
| Психогенный иммунодефицит Попова Н.А., Каледин В. И., Николин В.П.Кудрявцева Н.Н Съезд профессиональных иммунологов. Анталия. Турция
|
|
| Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов FOXA, вовлеченных в механизм их опухолесупрессорного действия Л.О. Брызгалов, Н.И. Ершов, Д.Ю. Ощепков, В.И. Каледин, Т.И. Меркулова Тезисы II съезда общества клеточной биологии совместно с юбилейной конференцией, посвященной 50-летию Института цитологии РАН. С.-Петербург, 16–19 октября 2007
|
|
| Возможное участие вазопрессина в регуляции роста и метастазирования опухолей Каледин В.И., Попова Н.А., Николин В.П., Кудрявцева Н.Н. ХХ съезд физиологического общества им ИП Павлова, 4-8 июня, Москва
|
|
| ПОВЫШЕННАЯ ДНК-СВЯЗЫВАЮЩАЯ АКТИВНОСТЬ TATA-СВЯЗЫВАЮЩЕГО БЕЛКА В ЭКСТРАКТАХ ЯДЕР ПЕРЕВИВАЕМЫХ ОПУХОЛЕЙ ПЕЧЕНИ И ЛЕГКОГО МЫШЕЙ Лысова М.В., Аршинова Т.В., Драчкова И.А., Каледин В.И., Савинкова Л.К. II Cъезд Общества клеточной биологии совместно с Юбилейной конференцией, посвященной 50-летию Института цитологии РАН. Санкт-Петербург, 16 - 19 октября 2007
|
|
| Изучение роли ядерных рецепторов и Ah-рецептора в механизме действия гепатоканцерогенных азокрасителей. М.Ю. Пахарукова, М.А. Сметанина, В.И. Каледин, И.В. Романова, Т.И. Меркулова Международная конференция общества клеточной биологии
|
|
| Роль SNPs гена K-ras мыши в механизме формирования предрасположенности к пульмоноканцерогенезу Антонцева Е.В., Скорытченко Я.Д., Каледин В.И., Меркулова Т.И. II съезд Общества клеточной биологии и юбилейная конференция, посвященная 50-летию Института цитологии РАН»
|
|
| Характеристика генофондов по полиморфизмам генов предрасположенности и врожденной резистентности к инфекционным заболеваниям: изучение ассоциации молекулярно-генетических маркеров с экономически важными количественными признаками у крупного рогатого скота и свиней. Юдин Н.С., Васильева Л.А., Потапова Т.А., Бархаш А.В., Айтназаров Р.Б., Ермолаев В.И., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Биоразнообразие и динамика генофондов
|
|
| 2006 | Experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Klimova N.V., Vasiliev G.V., Merkulova T.I. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
|
| SITECON: a quality tool for prediction of transcription factor binding sites now handles those for SF-1. experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Klimova N.V., Vasiliev G.V., Merkulova T.I. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
|
|
| Ethnic peculiarities of human pathology in Siberia. Genetic background of predisposition to common diseases Voevoda M.I., Romashchenko A.G.,Maksimov V.N., Shakhtshneider E.V., Yudin N.S., Barkhash A.V., Kobzev V.F., Kulikov I.V., Mishakova T.M., Naykova T.M., Myagkova I.V., Potapova T.A., Nikitin Yu.P 13th International Congress on Circumpolar health
|
|
| Палеогенетические исследования останков носителей Пазырыкской культуры IV-II вв до н.э. Куликов И.В., Нефедова М.В., Шульгина Е.О., Губина М.А., Пилипенко А.С., Дамба Л.Д., Кобзев В.Ф., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Всероссийский археологический съезд "Современные проблемы Археологии России", 23 – 28 октября 2006 г, Новосибирск
|
|
| Выявление генов предрасположенности к распространенным сердечно-сосудистым заболеваниям: принципы, достижения и перспективы Воевода М.И., Юдин Н.С., Васильев Г.В., Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Бархаш А.В., Ромащенко А.Г. Международная конференция "Фундаментальные науки – биотехнологии и медицине"
|
|
| Единичные нуклеотидные замены в интроне 2 гена K-ras мыши, сопряженные с развитием рака легких, влияют на связывание факторов транскрипции. Горшкова (Антонцева) Е.В., Меркулова Т.И., Каледин В.И. Международняа конференция "Физико-химическая биология" 30 июля- 3 августа 2006
|
|
| Особенности гаплотипического разнообразия мтДНК в некоторых популяциях Сибири, Дальнего Востока и Средней Азии Губина М.А., Дамба Л.Д., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Вилемс Р., Воевода М.И. Современные проблемы археологии России, Новосибирск, 23-28 октября
|
|
| Особенности гаплотипического разнообразия мтДНК представителей Кротовской культуры Барабы Пилипенко А.С., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Гришин А.Е., Поздняков Д.В., Молодин В.И. Современные проблемы археологии России, Новосибирск, Ин-т археологии и этнографии СО РАН
|
|
| Влияние психоэмоционального состояния на рост и метастазирование карциномы Льюис у мышей Попова Н.А., Николин В.П., Тендитник М.В., Кудрявцева Н.Н., Каледин В.И. Четвертая российская конференция "Нейроиммунопатология". Научно-практический журнал "Патогенез"
|
|
| Взаимодействие белков транскрипционного комплекса РНК-полимеразы II с олигорибонуклеотидами Драчкова И.А., Репкова М.Н., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Савинкова Л.К. Международная конференция "Физико-химическая биология", посвященная 80-летию со дня рождения академика Д.Г. Кнорре. Новосибирск, июль 2006
|
|
| SITECON: a quality tool for prediction of transcription factor binding sites now handles those for SF-1. Experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes. Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Klimova N.V., Vasiliev G.V., Merkulova T.I. Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)
|
|
| Association study of SNP of the TNF-alpha gene with bovine leukosis and evaluation of its functional significance Yudin N.S., Vasil’eva L.A., Kobzev V.F., Kuznetsova T.N., Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)
|
|
| TRRD: a database on experimentally identified transcription regulatory regions and transcription factor binding sites. Kolchanov N.A., Podkolodnaya O.A., Ananko E.A., Ignatieva E.V., Stepanenko I.L., Khlebodarova T.M., Merkulov V.M., Merkulova T.I., Podkolodny N.L., Romashchenko A.G. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
|
|
| Prediction of interferon-inducible genes in human genome Ananko E.A., Kondrakhin Yu.V., Merkulova T.I. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
|
|
| Methods for recognition of interferon-inducible sites, promoters, and enhancers. Kondrakhin Yu.V., Ananko E.A., Merkulova T.I. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
|
|
| The SITEGA and PWM methods application for transcription factor binding sites recognition in EPD promoters Levitsky V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Merkulova T.I 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
|
|
| Functional interpretation of pulmonary carcinogenesis susceptibility-associated SNP in K-Ras intron 2. Gorshkova E.V. (Antontseva E.V), Merkulova T.I., Kaledin V.I. 3rd International conference “Genomics, proteomics, bioinformatics and nanotechnologies for medicine”
|
|
| Apolipoprotein polymorphism in native population of mountain in Shoriya (West Siberia) and its association with plasma lipid levels Shakhchneider E.V., Barbarash O.L., Ogarkov M.Y., Kulikov I.V., Baum V.A., Ustinov S.N., Yudin N.S., Kobzev V.F., Romashenko A.G., Voevoda M.I. XIV International Symposium on Atherosclerosis
|
Гранты
| 2013 | Разработка программного комплекса для анализа влияния SNP на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний Минобрнауки, номер гранта ФЦП, ГК 07.514.13.0094
|
| 2011 | Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований по тематике технологической платформы "Медицина будущего" в области поиска молекулярных мишеней онкологических заболеваний с помощью биоинформационных и постгеномных технологий Министерство образования и науки РФ, номер гранта 16.512.11.2274
|
| Изучение связи полиморфизма генов неспецифического иммунного ответа с предрасположенностью человека к заболеваниям, вызываемым флавивирусами Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 11-04-01206а
|
|
| Экспериментально-компьютерное исследование механизмов метаболизма ксенобиотиков у печеночных сосальщиков семейства Opisthorchiidae Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 11-04-01333a
|
|
| Реконструкция процессов антропогенеза: анализ митохондриальных геномов представителей древнего и современного населения Сибири РФФИ, номер гранта 11-06-12006
|
|
| Роль ядерных рецепторов в механизмах чувствительности и резистентности к гепатоканцерогенезу РФФИ, номер гранта РФФИ №11-04-00545-а
|
|
| Раннее выявление мутаций в генах EGFR и K-Ras для диагностики и развития персонализированных методов лечения немелкоклеточного рака легких Президиум РАН, номер гранта 23
|
|
| 2010 | Молекулярные механизмы стресс-специфического контроля экспрессии генов животных Министерство образования и науки Российской Федерации, номер гранта 02.740.11. 0705
|
| Лазерная диагностика канцерогенеза с использованием измерения преломления и флуоресцентной спектроскопии СО РАН, номер гранта 148
|
|
| 2009 | Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов Президиум РАН, номер гранта 23.29
|
| ПОСТГЕНОМНАЯ БИОИНФОРМАТИКА: КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ Президиум СО РАН, номер гранта 119
|
|
| Изучение конкурентных взаимоотношений транскрипционных факторов семейства Fox в регуляции экспресии генов печени и их роли в гепатоканцерогенезе РФФИ, номер гранта 09-04-00562-а
|
|
| 2007 | Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов HNF3, обеспечивающих реализацию опухолесупрессорного действия этих белков в печени Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 07-04-00441а
|
| 2006 | Изучение антионкогенных свойств факторов транскрипции HNF3 в печени мышей и крыс и выяснение механизмов, обеспечивающих снижение активности этих факторов под действием гепатоканцерогенных соединений Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 06-04-48575a
|
Научное руководство
| 2011 | Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов SF-1 и SREBP на днк с помощью экспериментально-компьютерного подхода Климова Наталья Викторовна , 2011-02-16
|
| 2010 | Компьютерный анализ коротких молекулярных сигналов регуляции экспрессии генов человека Пономаренко Пётр Михайлович , 2010-06-10
|
| 2008 | Компьютерный анализ коротких молекулярных сигналов регуляции экспрессии генов человека Пономаренко Пётр Михайлович , 2008-06-18
|
| Изучение роли мононуклеотидных замен в гене K-ras мыши в механизме формирования предрасположенности к развитию рака легких Венгерова Яна Дмитриевна , 2008-06-02
|
Патенты
| 2007 | Способ получения фосфотиоатных аналогов олигодезоксирибонуклеотидов. Кобзев В.Ф. Номер патента 2292349
|
| Способ получения 5’-аминоалкилфосфат олигодезоксирибонуклеотидов. Кобзев В.Ф. Номер патента 2292350
|
|
| 2000 | Способ диагностики предрасположенности к гемохроматозу Ромащенко А.Г., Михайлова С.В., Воевода М.И., Кобзев В.Ф. Номер патента 2144566
|
|
© 2010-2026 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены. | |