Biocontrol Potential of the New Codling Moth Granulovirus (CpGV) Strains Aleksandra A. Tsygichko, Anzhela M. Asaturova, Tatiana N. Lakhova, Alexandra I. Klimenko, Sergey A. Lashin and Gennady V. Vasiliev Microorganisms, 2024
AtSNP_TATAdb: Candidate molecular markers of plant advantages related to single nucleotide polymorphisms within proximal promoters of Arabidopsis thaliana L. Bogomolov A, Zolotareva K, Filonov S, Chadaeva I, Rasskazov D, Sharypova E, Podkolodnyy N, Ponomarenko P, Savinkova L, Tverdokhleb N, Khandaev B, Kondratyuk E, Podkolodnaya O, Zemlyanskaya E, Kolchanov NA, Ponomarenko M. INT J MOL SCI, 2024, 1, 25, 607
Ассоциации CAG-полиморфизма гена андрогенового рецептора с уровнем стероидных гормонов и антропометрическими показателями у мужчин: роль этнического фактора. Осадчук Л.В., Васильев Г.В., Осадчук А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, 28 (1):80-89.
Associations between CAG repeat polymorphism in the androgen receptor gene with sex steroid levels and anthropometrics among men: a role of ethnic factor. Osadchuk L.V., Vasiliev G.V., Osadchuk A.V. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, 28 (1):80-89.
A Principal Components Analysis and Functional Annotation of Differentially Expressed Genes in Brain Regions of Gray Rats Selected for Tame or Aggressive Behavior Irina Chadaeva, Rimma Kozhemyakina, Svetlana Shikhevich, Anton Bogomolov, Ekaterina Kondratyuk, Dmitry Oshchepkov, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel INT J MOL SCI, 2024, 25(9): 4613
Effects of different types of induced neonatal inflammation on development and behavior of C57BL/6 and BTBR mice Yuliya A. Ryabushkina, Kseniya A. Ayriyants, Anna A. Sapronova, Anastasia S. Mutovina, Maria M. Kolesnikova, Eva V. Mezhlumyan, Natalya P. Bondar*, Vasiliy V. Reshetnikov* PHYSIOL BEHAV, 2024, Volume 280, 1 June 2024, 114550
Enrichment of Grain Anthocyanin Content through Marker-Assisted Breeding for Ant1, Ant2 or HvMyc2 Genes in Barley (Hordeum vulgare L.) Kukoeva T.V., Molobekova C.A., Totsky I.V., Vasiliev G.V., Pronozin A.Y., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K., Shoeva O.Y. Agronomy, 2024, 14(6), 1231
Enhancement of the Antitumor and Antimetastatic Effect of Topotecan and Normalization of Blood Counts in Mice with Lewis Carcinoma by Tdp1 Inhibitors-New Usnic Acid Derivatives. Kornienko TE, Chepanova AA, Zakharenko AL, Filimonov AS, Luzina OA, Dyrkheeva NS, Nikolin VP, Popova NA, Salakhutdinov NF, Lavrik OI. INT J MOL SCI, 2024, 2024 Jan 19;25(2):1210.
The Search for and Functional Analysis of Genetic Variants in microRNA-Binding Sites using Massively Parallel Reporter Assay E Yu Rykova, N I Ershov, A O Degtyareva, L O Bryzgalov, E L Lushnikova B EXP BIOL MED+, 2024, 176(5):595-598
Biodistribution of rna vaccines and of their products: Evidence from human and animal studies I Pateev, K Seregina, R Ivanov, V Reshetnikov Biomedicines, 2024
Untranslated Region Sequences and the Efficacy of mRNA Vaccines against Tuberculosis Vasiliy Reshetnikov, Ilya Terenin, Galina Shepelkova, Vladimir Yeremeev, Semyon Kolmykov, Maxim Nagornykh, Elena Kolosova, Tatiana Sokolova, Olga Zaborova, Ivan Kukushkin, Alisa Kazakova, Dmitry Kunyk, Anna Kirshina, Olga Vasileva, Kristina Seregina, Ildus Pateev, Fedor Kolpakov, Roman Ivanov INT J MOL SCI, 2024
Assembly and Genome Annotation of Different Strains of Apple Fruit Moth Virus (Cydia pomonella granulovirus) Tatiana N. Lakhova, Aleksandra A. Tsygichko, Alexandra I. Klimenko, Vladimir Y. Ismailov, Gennady V. Vasiliev, Anzhela M. Asaturova, Sergey A. Lashin INT J MOL SCI, 2024
Новая-старая эпигенетическая парадигма канцерогенеза. Попова Н.А., Николин В.П., Меркулова Т.И. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, 2024;10(2):99-104
Митохондриальный геном Eisenia altaica (Lumbricidae, Annelida) П.А. Леонов, Г.В. Юрлова, Т.В. Полубоярова, Г.В. Васильев, А.А. Шипова, Е.В. Голованова, С.В. Шеховцов, К.С. Зубко Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, 2024 год, Том 10, №2, С. 93-98
New Cydia pomonella granulovirus strain with high entomopathogenic activity Aleksandra A. Tsygichko, Anzhela M. Asaturova, Gennady V. Vasiliev, Alexandra I. Klimenko, Sergey A. Lashin, Tatiana N. Lakhova Microbiol Resour Announc, 2024
Механизмы адаптации гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковой системы у самцов мышей под влиянием хронического стресса социальных поражений А.А. Сапронова, Ю.А. Рябушкина, П.Э. Кисаретова, Н. П. Бондарь Журнал высшей нервной деятельности, 2024, 74(2): 197-209
TauL1, TauL2 and TauL3 gene-pools of Aegilops tauschii essentially differ in their genetic expression patterns Alexander Ju. Dudnikov, Gennady V. Vasiliev, Ming Hao, Deng-Cai Liu, Fan Xing, Mehdi Mansouri, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov Botanica Serbica, 2024, 48 (2): 239–246
The Transcriptomic Response of Cells of the Thermophilic Bacterium Geobacillus icigianus to Terahertz Irradiation Sergey Peltek, Svetlana Bannikova,Tamara M. Khlebodarova, Yulia Uvarova, Aleksey M. Mukhin, Gennady Vasiliev, Mikhail Scheglov, Aleksandra Shipova, Asya Vasilieva, Dmitry Oshchepkov, Alla Bryanskaya, Vasily Popik INT J MOL SCI, 2024
Mechanisms of Adaptation of the Hypothalamic-Pituitary-Adrenal Axis in Male Mice in Chronic Social Defeat Stress A. A. Sapronova, Yu.A. Ryabushkina, P. E. Kisaretova, N. P. Bondar Neuroscience Behavioral Physiology, 2024
2023
Population Structure and Genetic Diversity of the 175 Soybean Breeding Lines and Varieties Cultivated in West Siberia and Other Regions of Russia Nadezhda A. Potapova, Alexander S. Zlobin, Roman N. Perfil’ev, Gennady V. Vasiliev, Elena A. Salina, Yakov A. Tsepilov Plants, 2023, 12(19), 3490, https://doi.org/10.3390/plants12193490
A New Cypovirus-1 Strain as a Promising Agent for Lepidopteran Pest Control Martemyanov V.V., Akhanaev Y.B., Belousova I.A., Pavlusin S.V., Yakimova M.E., Kharlamova D.D., Ageev A.A., Golovina A.N., Astapenko S.A., Kolosov A.V., Ananko G.G., Taranov O.S., Shvalov A.N., Bodnev S.A., Ershov N.I., Grushevaya I.V., Timofeyev M.A., Tokarev Y.S. Microbiology spectrum, 2023, 11(3):e0385522
Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato
Cultivars Grown in Russia Dmitry I. Karetnikov, Gennady V. Vasiliev, Stepan V. Toshchakov, Nikolay A. Shmakov, Mikhail A. Genaev, Mikhail A. Nesterov, Salmaz M. Ibragimova, Daniil A. Rybakov,
Tatjana A. Gavrilenko, Elena A. Salina, Maxim V. Patrushev, Alex V. Kochetov and Dmitry A. Afonnikov INT J MOL SCI, 2023, v. 24, p. 5713
The Expression of miRNAs Involved in Long-Term Memory Formation in the CNS of the Mollusk Helix lucorum Gennady V. Vasiliev, Vladimir Y. Ovchinnikov, Pavel D. Lisachev, Natalia P. Bondar, and Larisa N. Grinkevich INT J MOL SCI, 2023, 24(1):301
The complex role of transcription factor GAGA in germline death during Drosophila spermatogenesis: transcriptomic and bioinformatic analyses Fedorova S, Dorogova NV, Karagodin DA, Oshchepkov DY, Brusentsov II, Klimova NV, Baricheva EM. PeerJ, 2023, PeerJ. 2023 Jan 9;11:e14063
A comparison of stress reactivity between BTBR and C57BL/6J mice:
an impact of early‑life stress Kseniya A. Ayriyants
Yulia A. Ryabushkina
Anna A. Sapronova
Anna V. Ivanchikhina
Maria M. Kolesnikova
Natalya P. Bondar
Vasiliy V. Reshetnikov EXP BRAIN RES, 2023, Volume 241, pages 687–698
Molecular Abnormalities in BTBR Mice and Their Relevance to Schizophrenia and Autism Spectrum Disorders: An Overview of Transcriptomic and Proteomic Studies Polina Kisaretova, Anton Tsybko,Natalia P Bondar, Vasiliy V Reshetnikov Biomedicines, 2023, 11(2), 289
New insights into plastid and mitochondria evolution in wild peas (Pisum L.) Shatskaya N.V., Bogdanova V.S., Kosterin O.E., Vasiliev G.V. Diversity, 2023, vol. 14, 256
Comparing the biological properties of double-stranded DNA extracted from human and porcine placenta and salmon sperm Proskurina A, Nikolin V, Popova N, Varaksin N, Ryabicheva T, Ershova E, Kostyuk S, Leplina O, Ostanin A, Chernykh E, Bogachev S Rep Biochem Mol Biol, 2023, 11(4): 577-589
Differentially expressed genes and molecular susceptibility to human age-related diseases Shikhevich S, Chadaeva I, Khandaev B, Kozhemyakina R, Zolotareva K, Kazachek A, Oshchepkov D, Bogomolov A, Klimova NV, Ivanisenko VA, Demenkov P, Mustafin Z, Markel A, Savinkova L, Kolchanov NA, Kozlov V, Ponomarenko M INT J MOL SCI, 2023, 4, 24, 3996
On the Role of TATA Boxes and TATA-Binding Protein in Arabidopsis thaliana L. K. Savinkova, E. B. Sharypova and N. A. Kolchanov Plants, 2023, Plants 2023, vol.12 (5), 1000;
Three Cycles of Continuous Propagation of a Severe PSTVd
Strain NicTr-3 in Solanum lycopersicum cv. Rutgers Resulted in Its Attenuation and Very Mild Disease Symptoms in Potato Alex V. Kochetov, Nikolay Shmakov, Dmitry A. Afonnikov, Gennady V. Vasiliev, Natalja V. Shatskaya, Anastasiya A. Egorova, Nina V. Mironenko, Nina M. Lashina, Alexander V. Khiutti and Olga S. Afanasenko Agronomy, 2023, v. 13, №3, P. 684
Candidate SNP markers significantly altering the affinity of TATA-binding protein for the promoters of human hub genes for atherogenesis, atherosclerosis and atheroprotection. Bogomolov A, Filonov S, Chadaeva I, Rasskazov D, Khandaev B, Zolotareva K, Kazachek A, Oshchepkov D, Ivanisenko VA, Demenkov P, Podkolodnyy N, Kondratyuk E, Ponomarenko P, Podkolodnaya O, Mustafin Z, Savinkova L, Kolchanov N, Tverdokhleb N, Ponomarenko M. INT J MOL SCI, 2023, 10, 24, 9010
Impact of Double-Stranded RNA Internalization on Hematopoietic Progenitors and Krebs-2 Cells and Mechanism Ritter GS, Proskurina AS, Meschaninova MI, Potter EA, Petrova DD, Ruzanova VS, Dolgova EV, Kirikovich SS, Levites EV, Efremov YR, Nikolin VP, Popova NA, Venyaminova AG, Taranov OS, Ostanin AA, Chernykh ER, Kolchanov NA, Bogachev SS. INT J MOL SCI, 2023, 24(5):4858 - 4881
Cases of paternal inheritance and recombination of mitochondrial DNA in peas (Pisum L.) Bulgakova (Bogdanova) V.S., Shatskaya N.V., Kosterin O.E., Vasiliev G.V. EUPHYTICA, 2023, Vol. 219, article 74
Роль внеклеточных нуклеиновых кислот в процессах регенерации. В.П. Николин, Н.А. Попова Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2023, 2023;9(2):100-105.
Длительный опыт агрессии изменяет экспрессию генов в гипоталамусе самцов мышей двух линий А. А. Сапронова, П. Э. Кисаретова, Р. Салман, Н. П. Бондарь Нейрохимия, 2023, том 40, № 3, с. 234–244
Repeated Experience of Aggression Changes in Gene Expression in the Hypothalamus in Male Mice of Two Strains A. A. Sapronova, P. E. Kisaretova, R. Salman, and N. P. Bondar NEUROCHEM J+, 2023, Vol. 17, No. 3, pp. 359–368.
База знаний RatDEGdb по дифференциально экспрессирующимся генам крысы как модельного объекта биомедицинских исследований Чадаева И.В., Филонов С.В., Золотарева К.А., Хандаев Б.М., Ершов Н.И., Подколодный Н.Л., Кожемякина Р.В., Рассказов Д.А., Богомолов А.Г., Кондратюк Е.Ю., Климова Н.В., Шихевич С.Г., Рязанова М.А., Федосеева Л.А., Редина О.Е., Кожевникова О.С., Стефанова Н.А., Колосова Н.Г., Маркель А.Л., Пономаренко М.П., Ощепков Д.Ю. Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(7):794-806.
Однонуклеотидные замены в геноме человека, влияющие на связывание факторов транскрипции, и их роль в развитии патологий Е. В. Антонцева, А. О. Дегтярева, Е. Е. Корболина, И. С. Дамаров, Т. И. Меркулова Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, Том 27, № 6, с.662-675
Human-genome single nucleotide polymorphisms affecting transcription factor binding and their role in pathogenesis E.V. Antontseva , A.O. Degtyareva, E.E. Korbolina, I.S. Damarov, T.I. Merkulova Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, V.27, № 6, 662-675
Unraveling the unusual subgenomic organization in the neopolyploid free-living flatworm Macrostomum lignano Zadesenets KS, Ershov NI, Bondar NP, Rubtsov NB MOL BIOL EVOL, 2023, 40(12):1-14
Th17 Cells, Glucocorticoid Resistance, and Depression Khantakova JN, Mutovina A, Ayriyants KA, Bondar NP. Cells, 2023, Cells. 2023; 12(23):2749
Drosophila melanogaster Transcriptome Response to Different Wolbachia Strains Gruntenko, N.E.; Deryuzhenko, M.A.; Andreenkova, O.V.; Shishkina, O.D.; Bobrovskikh, M.A.; Shatskaya, N.V.; Vasiliev, G.V. INT J MOL SCI, 2023, 24, 17411
Genomic and Transcriptomic Research in the Discovery and Application of Colorectal Cancer Circulating Markers Anastasia A Ponomaryova, Elena Yu Rykova, Anastasia I Solovyova, Anna S Tarasova, Dmitry N Kostromitsky, Alexey Yu Dobrodeev, Sergey A Afanasiev, Nadezhda V Cherdyntseva INT J MOL SCI, 2023, 24(15):12407
Effects of combinations of untranslated-region sequences on translation of mRNA Anna Kirshina, Olga Vasileva, Dmitry Kunyk, Kristina Seregina, Albert Muslimov, Roman Ivanov, Vasiliy Reshetnikov Biomolecules, 2023
Naphthyl-Substituted Indole and Pyrrole Carboxylic Acids as Effective Antibiotic Potentiators—Inhibitors of Bacterial Cystathionine γ-Lyase Andrey S Kuzovlev, Mikhail D Zybalov, Andrey V Golovin, Maxim A Gureev, Mariia A Kasatkina, Mikhail V Biryukov, Albina R Belik, Sergey A Silonov, Maxim A Yunin, Nailya A Zigangirova, Vasiliy V Reshetnikov, Yulia E Isakova, Yuri B Porozov, Roman A Ivanov INT J MOL SCI, 2023
The dual role of the innate immune system in the effectiveness of mRNA therapeutics Albert Muslimov, Valeriy Tereshchenko, Daniil Shevyrev, Anna Rogova, Kirill Lepik, Vasiliy Reshetnikov, Roman Ivanov INT J MOL SCI, 2023
Immunogenicity of full-length and multi-epitope mRNA vaccines for M. Tuberculosis as demonstrated by the intensity of T-cell response: a comparative study in mice Vasileva OO, Tereschenko VP, Krapivin BN, Muslimov AR, Kukushkin IS, Pateev II, Rybtsov SA, Ivanov RA, Reshetnikov VV Bulletin of RSMU, 2023
Impact of untranslated mRNA sequences on immunogenicity of mRNA vaccines against M. tuberculosis in mice Shepelkova GS, Reshetnikov VV, Avdienko VG, Sheverev DV, Yeremeev VV, Ivanov RA Bulletin of RSMU, 2023
RatDEGdb: a knowledge base of differentially expressed genes in the rat as a model object in biomedical research Chadaeva I.V., Filonov S.V., Zolotareva K.A., Khandaev B.M., Ershov N.I., Podkolodnyy N.L., Kozhemyakina R.V., Rasskazov D.A., Bogomolov A.G., Kondratyuk E.Yu., Klimova N.V., Shikhevich S.G., Ryazanova M.A., Fedoseeva L.A., Redina О.Е., Kozhevnikova O.S., Stefanova N.A., Kolosova N.G., Markel A.L., Ponomarenko M.P., Oshchepkov D.Yu. Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(7):794-806
2022
SNPs in 3'UTR miRNA Target Sequences Associated with Individual Drug Susceptibility Elena Rykova, Nikita Ershov, Igor Damarov, Tatiana Merkulova INT J MOL SCI, 2022, 23(22):13725
Optogenetic approaches in biotechnology and biomaterials Vasily V. Reshetnikov, Sviatlana V. Smolskaya, Sofia G. Feoktistova, Vladislav V. Verkhusha TRENDS BIOTECHNOL, 2022, 2022
The functional insight into the genetics of cardiovascular disease: results from the post-GWAS study L.O. Bryzgalov, E.E. Korbolina, I.S. Damarov, T.I. Merkulova Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, 2022;26(1):65-73
Stress reactivity, susceptibility to hypertension, and differential expression of genes in hypertensive compared to normotensive patients Oshchepkov D, Chadaeva I, Kozhemyakina R, Zolotareva K, Khandaev B, Sharypova E, Ponomarenko P, Bogomolov A, Klimova NV, Shikhevich S, Redina O, Kolosova NG, Nazarenko M, Kolchanov NA, Markel A, Ponomarenko M. INT J MOL SCI, 2022, 5, 23, Article number 2835
Биоинформатический поиск соответствия дифференциально экспрессируемых генов домашних и диких животных с ортологичными генами, изменяющими репродуктивный потенциал человека. Пономаренко М.П., Чадаева И.В., Пономаренко П.М., Богомолов А.Г., Ощепков Д.Ю., Шарыпова Е.Б., Суслов В.В., Осадчук А.В., Осадчук Л.В., Матушкин Ю.Г. Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, 1, 26, 96-108
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ ИЗУЧЕНИЕ
ПРОТИВООПУХОЛЕВОЙ АКТИВНОСТИ ПРЕПАРАТА
"ПЕФАГТАЛ", АДРЕСОВАННОГО К αvβ3-ИНТЕГРИНАМ Н.А.Попова, В.П.Николин, В.И.Каледин, И.А.Серова, Е.А.Матюнина, М.А.Бакарев, Е.Л.Лушникова, А.Н.Вологодский Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2022, Том 173, № 1, стр. 122-127
An experimental study of the effects of SNPs in the TATA boxes of the GRIN1, ASCL3 and NOS1 genes on interactions with the TATA-binding protein. Sharypova E.B., Drachkova I.A., Chadaeva I.V., Ponomarenko M.P., Savinkova L.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, 3, 26, 227-233
Features of activity of the phenylpropanoid biosynthesis pathway in melanin-accumulating barley grains Anastasiia Y. Glagoleva, Alexander V. Vikhorev, Nikolay A. Shmakov, Sergey V. Morozov, Elena I. Chernyak, Gennady V. Vasiliev, Natalia V. Shatskaya, Elena K. Khlestkina, Olesya Y. Shoeva Frontiers in Plant Science, 2022
Plant_SNP_TATA_Z-tester: a Web service that unequivocally estimates the impact of proximal promoter mutations on plant gene expression Rasskazov D, Chadaeva I, Sharypova E, Zolotareva K, Khandaev B, Ponomarenko P, Podkolodnyy N, Tverdokhleb N, Vishnevsky O, Bogomolov A, Podkolodnaya O, Savinkova L, Zemlyanskaya E, Golubyatnikov V, Kolchanov N, Ponomarenko M. INT J MOL SCI, 2022, V. 23. N. 15. Article number 8684.
Androgen receptor gene CAG repeat length varies and affects semen quality in an ethnic-specific fashion in young men from Russia Osadchuk L., Vasiliev G., Kleshchev M., Osadchuk A. INT J MOL SCI, 2022, Vol. 23. 10594.
Identification of Hypothalamic Long Noncoding RNAs Associated with Hypertension and the Behavior/Neurological Phenotype of Hypertensive ISIAH Rats Fedoseeva L.A.; Ershov N.I.; Sidorenko I.A.; Markel A.L.; Redina O.E. Genes, 2022, 13, 1598
Биологические эффекты экзогенной РНК В.П. Николин, Н.А. Попова Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2022, 8(2):206-213
Transcription Factors as Important Regulators of Changes in Behavior through Domestication of Gray Rats: Quantitative Data from RNA Sequencing Oshchepkov, D., Chadaeva I., Kozhemyakina R., Shikhevich S., Sharypova E., Savinkova L., Klimova N.V., Tsukanov A., Levitsky V.G., Markel A.L. INT J MOL SCI, 2022, Int. J. Mol. Sci. 2022, 23(20), 12269
Behavioral effects and inflammatory markers in the brain and periphery after repeated social defeat stress burdened by Opisthorchis felineus infection in mice. Avgustinovich DF, Tenditnik MV, Bondar NP, Marenina MK, Zhanaeva SYa, Lvova MN, Katokhin AV,
Pavlov KS, Evseenko VI, Tolstikova TG. PHYSIOL BEHAV, 2022, 252: article 113846
Changes in the number and morphology of blood cells in mice pretreated with RNA preparations and exposed to 8 Gy of gamma radiation Dubatolova TD, Ritter GS, Proskurina AS, Kisaretova PE, Nikolin VP, Popova NA, Ruzanova VS, Taranov OS, Kolchanov NA, Bogachev SS International Journal of Radiation Research, 2022, 20(2): 361-368
Delayed effects of neonatal immune activation on brain neurochemistry and hypothalamic-pituitary-adrenal axis functioning Julia N Khantakova, Natalia P Bondar, Anna A Sapronova, Vasiliy V Reshetnikov EUR J NEUROSCI, 2022, V. 56, Issue 10, Pages 5931-5951
Transcriptome Alterations Caused by Social Defeat Stress of Various Durations in Mice and Its Relevance to Depression and Posttraumatic Stress Disorder in Humans: A Meta-Analysis. Vasiliy V. Reshetnikov, Polina E. Kisaretova, Natalia P. Bondar INT J MOL SCI, 2022, 23(22):13792
Cas-Based Systems for RNA Editing in Gene Therapy of Monogenic Diseases: In Vitro and in Vivo Application and Translational Potential Reshetnikov Vasiliy V., Chirinskaite Angelina V., Sopova Julia V., Ivanov Roman A.,Leonova Elena I. Front. Cell Dev. Biol., 2022, 2022
Easy and Effective Method for Extracting and Purifying Wolbachia Genomic DNA Andreenkova O.V., Shishkina O.D., Klimenko A.I., Korenskaia A.E., Bobrovskikh M.A., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E. INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 15315
New Wolbachia pipientis Genotype Increasing Heat Stress Resistance of Drosophila melanogaster Host Is Characterized by a Large Chromosomal Inversion Korenskaia A.E., Shishkina O.D., Klimenko A.I., Andreenkova O.V., Bobrovskikh M.A., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E. INT J MOL SCI, 2022, 23(24), 16212
Unique Features of the Immune Response in BTBR Mice Мутовина Анастасия Сергеевна, Айриянц Ксения Аркадьевна, Межлумян Ева Викторовна, Рябушкина Юлия Андреевна, Литвинова Екатерина Анатольевна, Бондарь Наталья Петровна, Хантакова Юлия Николаевна, Решетников Василий Владимирович INT J MOL SCI, 2022
Once induced, it lasts for a long time: the structural and molecular signatures associated with depressive-like behavior after neonatal immune activation Julia N. Khantakova, Natalia P. Bondar, Elena V. Antontseva, and Vasiliy V. Reshetnikov FRONT CELL NEUROSCI, 2022, Front. Cell. Neurosci., 22 December 2022 Sec. Cellular Neuropathology
Translational potential of base-editing tools for gene therapy of monogenic diseases Vasiliy V. Reshetnikov
Angelina V. Chirinskaite
Julia V. Sopova
Roman A. Ivanov
Elena I. Leonova Front Bioengineer Biotechnol, 2022
CRISPR/Cas-edited pigs for personalized medicine: more than preclinical test-system Elena I. Leonova, Vasily V. Reshetnikov, Julia V. Sopova Res Result Pharmacol, 2022
Влияние различных доз мРНК-ЛНЧ-вакцин на нейровоспаление у BALB/c мышей А. С. Киршина,
А. А. Казакова,
Е. С. Колосова,
Е. А. Имашева,
О. О. Васильева,
О. В. Заборова,
И. М. Теренин,
А. Р. Муслимов,
В. В. Решетников Вестник РГМУ, 2022
Промоторы генов, кодирующих β-амилазу, альбумин и глобулин пищевых растений в сравнении с непищевыми, характеризуются более низкой аффинностью к ТАТА-связывающему белку: in silico анализ. Вишневский О.В., Чадаева И.В., Шарыпова Е.Б., Хандаев Б.М., Золотарева К.А., Казачек А.В., Пономаренко П.М., Подколодный Н.Л., Рассказов Д.А., Богомолов А.Г., Подколодная О.А., Савинкова Л.К., Землянская Е.В., Пономаренко М.П. Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, 8, 26, 798-805
2021
Autophagy genes expression profiling in secondary glioblastoma cells transcriptome Gubanova N., Bragin A., Vasiliev G., Babenko V., Ponomarenko M., Orlov Y. Cell Death Discovery, 2021, 7 (SUPPL 1), pp.5-5
Fitness Analysis and Transcriptome Profiling Following Repeated Mild Heat Stress of Varying Frequency in Drosophila melanogaster Females Gruntenko NE, Karpova EK, Babenko VN, Vasiliev GV, Andreenkova OV, Bobrovskikh MA, Menshanov PN, Babenko RO, Rauschenbach IY. Biology, 2021, 10(12):1323
Social defeat stress in adult mice causes alterations in gene expression, alternative splicing, and the epigenetic landscape of H3K4me3 in the prefrontal cortex: An impact of early-life stress V.V.Reshetnikov
P.E.Kisaretova
N.I.Ershov
T.I.Merkulova
N.P.Bondar PROG NEURO-PSYCHOPH, 2021, Volume 106, 2 March 2021, 110068
Особенности социального поведения мышей после длительного действия психоэмоционального и инфекционного факторов Августинович ДФ, Бондарь НП Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2021, 107 (1):28-42
The pathogenic potential of the combined action of chronic Opisthorchis felineus infection and repeated social defeat stress in C57BL/6 mice. Damira Avgustinovich, Anna Kovner, Elena Kashina, Natalia Shatskaya, Galina Vishnivetskaya, Natalia Bondar, Maria Lvova INT J PARASITOL, 2021, 51:353-363
Hypothalamic Norepinephrine Concentration and Heart Mass in Hypertensive ISIAH Rats Are Associated with a Genetic Locus on Chromosome 18 Olga E. Redina; Svetlana E. Smolenskaya; Yulia K. Polityko; Nikita I. Ershov; Michael A. Gilinsky; Arcady L. Markel J. Pers. Med, 2021, J. Pers. Med. 2021, 11(2), 67;
Differential expression of 10 genes in the hypothalamus
of two generations of rats selected for a reaction to humans Климова Н.В., Чадаева И.В., Шихевич С.Г., Кожемякина Р.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021
A bioinformatics model of human diseases on the basis of differentially expressed genes (of domestic versus wild animals) that are orthologs of human genes associated with reproductive-potential changes. Vasiliev G, Chadaeva I, Rasskazov D, Ponomarenko P, Sharypova E, Drachkova I, Bogomolov A, Savinkova L, Ponomarenko M, Kolchanov N, Osadchuk A, Oshchepkov D, Osadchuk L. INT J MOL SCI, 2021, 5, 22, 2346
Метод поиска структурной гетерогенности сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием альтернативных de novo моделей на примере FOXA2 А.В. Цуканов , В.Г. Левицкий, Т.И. Меркулова Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(1):7-17.
Discordant evolution of organellar genomes in peas (Pisum L.) Bogdanova V.S., Shatskaya N.V., Mglinets a.v., Kosterin O.E., Vasiliev G.V. MOL PHYLOGENET EVOL, 2021, Vol. 160, 107136
Секвенирование вироидов. Шацкая Н.В. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2021, 2021 • 7 • 1 • 17-22
Regulatory SNPs: Altered Transcription Factor Binding Sites Implicated in Complex Traits and Diseases. Degtyareva, A.O.;
Antontseva, E.V.; Merkulova, T.I. INT J MOL SCI, 2021, 22, 6454.
Disruptive selection of human immunostimulatory and immunosuppressive genes both provokes and prevents rheumatoid arthritis, respectively, as a self-domestication syndrome. Klimova N.V., Oshchepkova E., Chadaeva I., Sharypova E., Ponomarenko P., Drachkova I., Rasskazov D., Oshchepkov D., Ponomarenko M., Savinkova L., Kolchanov N.A., Kozlov V.A. Frontiers in Genetics, 2021, V. 12. Article number 610774.
Whole-exome sequencing analysis of human semen quality in Russian multiethnic population Kolmykov S., Vasiliev G., Osadchuk L., Kleshchev M., Osadchuk A. Frontiers in Genetics, 2021, 12:662846.
The Role of Stress-Induced Changes of Homer1 Expression in Stress Susceptibility Reshetnikov V.V., Bondar N.P. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2021, 86, pages 613–626
Роль изменений экспрессии Homer1 в чувствительности к стрессу В.В. Решетников, Н.П. Бондарь Биохимия, 2021, том 86, вып. 6, с. 755–770
Sex-specific behavioral and structural alterations caused by early-life stress in C57BL/6 and BTBR mice Vasiliy V.Reshetnikov, Kseniya A.Ayriyants,Yulia A.Ryabushkina, Nikita G.Sozonov, Natalya P.Bondar BEHAV BRAIN RES, 2021, Volume 414, 24 September 2021, 113489
Domestication explains two-thirds of differential-gene-expression variance between domestic and wild animals; the remaining one-third reflects intraspecific and interspecific variation Chadaeva I, Ponomarenko P, Kozhemyakina R, Suslov V, Bogomolov A, Klimova N, Shikhevich S, Savinkova L, Oshchepkov D, Kolchanov N, Markel A, Ponomarenko M. Animals, 2021, V. 11. N. 9. Article number 2667.
Вироид веретеновидности клубней картофеля Кочетов, А. В., Пронозин, А. Ю., Шацкая, Н. В., Афонников, Д. А., Афанасенко, О. С. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, № 3, Т. 25, С. 269-275
Ремоделирование хроматина в олигодендрогенезе Е.В. Антонцева, Н.П. Бондарь Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(5):573-579
Features of the Social Behavior of Mice after Prolonged Exposure to Psychoemotional and Infective Factors. Avgustinovich DF, Bondar NP. Neuroscience Behavioral Physiology, 2021, 51(7):960-968
E. coli aggregation and impaired cell division after terahertz irradiation. 1. Peltek S, Meshcheryakova I, Kiseleva E, Oshchepkov D, Rozanov A, Serdyukov D, Demidov E, Vasiliev G, Vinokurov N, Bryanskaya A, Bannikova S, Popik V, Goryachkovskaya T. SCI REP-UK, 2021, Oct 14;11(1):20464.
Recent Trends in Cancer Genomics and Bioinformatics Tools Development Anastasia A. Anashkina, Elena Y. Leberfarb, Yuriy L. Orlov INT J MOL SCI, 2021, 2021, 22(22), 12146
Microorganisms of two thermal pools on Kunashir Island, Russia Rozanov A.S., Korzhuk A.V., Shekhovtsov S.V., Vasiliev G.V., Peltek S.E. Biology, 2021, V. 10. I. 9 P. 924.
NLR Genes Related Transcript Sets in Potato Cultivars Bearing Genetic Material of Wild Mexican Solanum Species Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Antonova O.Y., Shatskaya N.V., Glagoleva A.Y., Ibragimova S.M., Khiutti A., Afanasenko O.S., Gavrilenko T.A. Agronomy, 2021, v. 11, P. 2426
Experimental comparison of the in vivo efficacy of two novel anticancer therapies Ruzanova VS, Proskurina AS, Ritter GS, Efremov YR, Nikolin VP, Popova NA, Naprimerov VA, Dolgova EV, Potter EA, Kirikovich SS, Levites EV, Mustafin ZS, Lashin SA, Burakova EA, Stetsenko DA, Ostanin AA, Chernykh ER, Bogachev SS ANTICANCER RES, 2021, V. 41. N 7. P. 3371-3387
High-resolution MRI data of the brain of C57BL/6J and BTBR mice in three anatomical views Yulia A.Ryabushkina,Oleg B.Shevelev,Polina E.Kisaretova, Nikita G.Sozonov, Kseniya A.Ayriyants, Natalya P.Bondar, Vasiliy V.Reshetnikov Data in Brief, 2021, Volume 39, December 2021, 107619
A Panel of rSNPs Demonstrating Allelic Asymmetry in Both ChIP-seq and RNA-seq Data and the Search for Their Phenotypic Outcomes through Analysis of DEGs Elena E Korbolina, Leonid O Bryzgalov, Diana Z Ustrokhanova, Sergey N Postovalov, Dmitry V Poverin, Igor S Damarov, Tatiana I Merkulova INT J MOL SCI, 2021, 22(14), :7240
Metagenomics data of microbial communities in bacterial mats and bottom sediments in water bodies within the Kurai Mercury Province (Gorny Altai, Russia). Rozanov A. S., Myagkaya I. N., Korzhuk A. V., Ershov N. I., Kirichenko I. S., Gustaytis M. A., Saryg-ool B.Y., Malov V.I., Shipova A.A., Lazareva E.V. & Peltek, S. E. Data in Brief, 2021
Metagenomics data of microbial communities of natural organic matter from the dispersion train of sulfide tailings. Korzhuk A. V., Myagkaya I. N., Rozanov A. S., Ershov N. I., Saryg-Ool B. O. Y., Malov V. I., Shipova A.A., Lazareva E.V. & Peltek, S. E. Data in Brief, 2021
Folate-Equipped Cationic Liposomes Deliver Anti-MDR1-siRNA to the Tumor and Increase the Efficiency of Chemotherapy Daniil V Gladkikh, Aleksandra V Sen Kova, Ivan V Chernikov, Tatyana O Kabilova, Nelly A Popova, Valery P Nikolin, Elena V Shmendel, Mikhail A Maslov, Valentin V Vlassov, Marina A Zenkova, Elena L Chernolovskaya Pharmaceutic, 2021, 13(8):1252-1272.
The influence of an enamine usnic acid derivative (a tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitor) on the therapeutic effect of topotecan against transplanted tumors in vivo Nikolin VP, Popova NA, Kaledin VI, Luzina OA, Zakharenko AL, Salakhutdinov NF, Lavrik OI. CLIN EXP METASTAS, 2021, 38(5):431-440.
Противоопухолевая активность комбинации Топотекана и ингибитора Тирозил-ДНК-Фосфодиэстеразы 1 на модели мышиной асцитной карциноме Кребс-2. Диркеева НС, Захаренко АЛ, Новоселова ЕС, Чепанова АА, Попова НА, Николин ВП, Лузина ОА, Салакхутдинов НФ, Рябчикова ЕИ, Лаврик ОИ. Молекулярная биология, 2021, 55(2):312-317.
2020
Stress early in life leads to cognitive impairments, reduced numbers of CA3 neurons and altered maternal behavior in adult female mice Reshetnikov V.V., Kovner A.V., Lepeshko A.A., Pavlov K.S., Grinkevich L.N., Bondar N.P. GENES BRAIN BEHAV, 2020, Volume 19, Issue 3
Impact of mothers' experience and early‐life stress on aggression and cognition in adult male mice Vasiliy V. Reshetnikov, Yulia A. Ryabushkina,Natalia P. Bondar DEV PSYCHOBIOL, 2020, Volume 62, Issue 1, Pages 36-49
Phylogeny of the Eisenia nordenskioldi complex based on mitochondrial genomes Shekhovtsov S.V., Golovanova E.V., Ershov N.I., Poluboyarova T.V., Berman D.I., Bulakhova N.A., Szederjesi T., Peltek S.E. EUR J SOIL BIOL, 2020, V. 96. P. 103137.
Potential regulatory SNPs in the ATXN7L3B and KRT15 genes are associated with gender-specific colorectal cancer risk Elena Yu Leberfarb, Arina O Degtyareva, Ilya I Brusentsov, Vladimir N Maximov, Mikhail I Voevoda, Alexander I Autenshlus, Dmitriy V Morozov, Andrey V Sokolov, Tatiana I Merkulova PERS MED, 2020, Jan;17(1):43-54
Генетический полиморфизм экспериментально воспроизводимых форм артериальной гипертонии Редина О.Е., Девяткин В.А., Ершов Н.И., Маркель А.Л. Генетика, 2020, Т. 56. – № 2. – С. 211-224.
Genetic polymorphism of experimentally produced forms of arterial hypertension O. E. Redina, V. A. Devyatkin, N. I. Ershov, A. L. Markel RUSS J GENET+, 2020, Vol. 56, No. 2, pp. 213–225.
Полиморфизм rs2072580 T>A в перекрывающихся промоторных областях генов SART3 и ISCU, связанный с риском развития рака молочной железы А.О.Дегтярева, Е.Ю.Леберфарб, Е.Г.Ефимова, И.И.Брусенцов, А.В.Усова, Е.Л.Лушникова, Т.И.Меркулова Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2020, Т.169, № 1, с.88-91
Candidate SNP markers of atherogenesis significantly shifting the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters show stabilizing natural selection as a sum of neutral drift accelerating atherogenesis and directional natural selection slowing it. Ponomarenko M, Rasskazov D, Chadaeva I, Sharypova E, Drachkova I, Oshchepkov D, Ponomarenko P, Savinkova L, Oshchepkova E, Nazarenko M, Kolchanov N. INT J MOL SCI, 2020, 3, 21, 1045
Maternal Separation Early in Life Alters the Expression of Genes Npas4 and Nr1d1 in Adult Female Mice: Correlation with Social Behavior Yuliya A. Ryabushkina, Vasiliy V. Reshetnikov, Natalya P. Bondar BEHAV NEUROL, 2020, Volume 2020, Article ID 7830469, 9 pages
The Effects of Chronic Stress on Brain Myelination in Humans and in Various Rodent Models Elena Antontseva, Natalia Bondar, Vasiliy Reshetnikov, Tatiana Merkulova NEUROSCIENCE, 2020, Volume 441, 10 August 2020, Pages 226-238
Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in ChIP-seq data Victor Levitsky, Dmitry Oshchepkov, Elena Zemlyanskaya, Tatyana Merkulova INT J MOL SCI, 2020, 21, 6023
Влияние культивирования эмбрионов на онтогенез потомства у млекопитающих Раннева СВ, Брусенцев ЕЮ, Игонина ТН, Рагаева ДС, Рожкова ИН, Ершов НИ, Левинсон АЛ, Амстиславский СЯ Онтогенез, 2020, Т. 51. № 6. C. 417–439.
Data of correlation analysis between the density of H3K4me3 in promoters of genes and gene expression: data from RNA-seq and ChIP-seq analyses of the murine prefrontal cortex V.V.Reshetnikov, P.E.Kisaretova, N.I.Ershov, T.I.Merkulova, N.P.Bondar Data in Brief, 2020, Volume 33, December 2020, Pages 106365
Characterization of biological peculiarities of the radioprotective activity of double-stranded RNA isolated from Saccharomyces сerevisiae Ritter GS, Nikolin VP, Popova NA, Proskurina AS, Kisaretova PE, Taranov OS, Dubatolova TD, Dolgova EV, Potter EA, Kirikovich SS, Efremov YR, Bayborodin SI, Romanenko MV, Meschaninova MI, Venyaminova AG, Kolchanov NA, Shurdov MA, Bogachev SS. INT J RADIAT BIOL, 2020, V. 96, N 9, P. 1173-1191.
Disruptive natural selection by male reproductive potential prevents underexpression of protein-coding genes on the human Y chromosome as a self-domestication syndrome. Ponomarenko M., Kleshchev M., Ponomarenko P., Chadaeva I., Sharypova E., Rasskazov D., Kolmykov S., Drachkova I., Vasiliev G., Gutorova N., Ignatieva E., Savinkova L., Bogomolov A., Osadchuk L., Osadchuk A., Oshchepkov D. BMC GENET, 2020, V. 21, Suppl. 1. P. 89
Unannotated single nucleotide polymorphisms in the TATA box of erythropoiesis genes show in vitro positive involvements in cognitive and mental disorders. Ponomarenko M., Sharypova E., Drachkova I., Chadaeva I., Arkova O., Podkolodnaya O., Ponomarenko P., Kolchanov N., Savinkova L. BMC MED GENET, 2020, V. 21, Suppl. 1. P. 165.
Repeated and single maternal separation specifically alter microglial morphology in the prefrontal cortex and neurogenesis in the hippocampus of 15-day-old male mice Reshetnikov Vasiliy; Ryabushkina Yulia; Kovner Anna; Lepeshko Arina; Bondar Natalia NEUROREPORT, 2020, December 16, 2020 - Volume 31 - Issue 18 - p 1256-1264
The first mitochondrial genome of the relic Acanthobdella peledina (Annelida, Acanthobdellida) Alexander Bolbat, Gennady Vasiliev and Irina Kaygorodova MITOCHONDR DNA, 2020, VOL. 5, NO. 3, 3300–3301
Species Delimitation of the Eisenia nordenskioldi Complex (Oligochaeta, Lumbricidae) Using Transcriptomic Data Sergei V. Shekhovtsov, Aleksandra A. Shipova, Tatiana V. Poluboyarova, Gennady V. Vasiliev, Elena V. Golovanova, Anna P. Geraskina, Nina A. Bulakhova, Tímea Szederjesi, Sergei E. Peltek Frontiers in Genetics, 2020, V. 11, 1508
Genes associated with cognitive performance in the Morris water maze: an RNA-seq study Vasiliy V. Reshetnikov, Polina E. Kisaretova, Nikita I. Ershov, Anastasia S. Shulyupova, Dmitry Yu. Oshchepkov, Natalia V. Klimova, Anna V. Ivanchihina, Tatiana I. Merkulova, Natalia P. Bondar SCI REP-UK, 2020, Sci Rep 10, 22078 (2020)
The mechanism of potato resistance to
Globodera rostochiensis: comparison of root
transcriptomes of resistant and susceptible
Solanum phureja genotypes Alex V. Kochetov, Anastasiya A. Egorova, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina,
Sophia V. Gerasimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov,
Olga Y. Antonova, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko and Tatjana A. Gavrilenko BMC PLANT BIOL, 2020, 20(Suppl 1):350
Genomics and proteomics of the liver fluke Opisthorchis felineus Mordvinov V.A., Ershov N.I., Zaparina O.G., Pakharukova M.Y. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020
Апробация различных вариантов RNA-seq для идентификации аутронов генов у плоского червя Opisthorchis felineus Н.И. Ершов, Д.Е. Маслов, Н.П. Бондарь Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 2020;24(8):897-904
Creation of an online platform for identification of microorganisms: peak picking or full-spectrum analysis Starostin K.V., Demidov E.A., Ershov N.I., Bryanskaya A.V., Efimov V.M., Shlyakhtun V.N., Peltek S.E. Frontiers in Microbiology, 2020
rs2072580T>A Polymorphism in the Overlapping Promoter Regions of the SART3 and ISCU Genes Associated with the Risk of Breast Cancer Degtyareva AO, Leberfarb EY, Efimova EG, Brusentsov II, Usova AV, Lushnikova EL, Merkulova TI B EXP BIOL MED+, 2020
Методы in vitro, используемые для изучения ДНК-белковых взаимодействий. Л.К. Савинкова, Е.Б. Шарыпова, Н.А. Колчанов Успехи современной биологии, 2020, № 6, том 140, стр. 540-554
On the Relationship between Regulatory and Exomic DNA Markers Postovalov Sergey, Berikov Vladimir, Bryzgalov Leonid, Korbolina Elena IEEE Xplore digital library, 2020
Accessing the impact of functional variants on human phenotypes by transcriptome analysis in individuals carrying different rSNP alleles Korbolina Elena, Bryzgalov Leonid, Postovalov Sergey, Nedelko Victor, Berikov Vladimir, Merkulova Tatiana IEEE Xplore digital library, 2020
2019
Rat prefrontal cortex transcriptome: effects of aging and sporadic Alzheimer’s disease-like pathology Stefanova N.A., Ershov N.I., Maksimova K.Yi., Muraleva N.A., Tyumentsev M.A., Kolosova N.A. J Gerontol A Biol Sci Med Sci, 2019, 74(1):33-43
Immunopathology of Mixed Anxiety/Depression Disorders: An Experimental Approach to Studies of Immunodeficiency States (review) N.N. Kudryavtseva, A.V. Shurlygina, A.G. Galyamina,
D.A. Smagin, I.L. Kovalenko, N.A. Popova, V.P. Nikolin, S.I. Ilnitskaya, E.V. Melnikova, and V.A. Trufakin Neuroscience Behavioral Physiology, 2019, Vol. 49, No. 3, March, 2019
New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov, Egor B. Prokhortchouk, Mariya Y. Pakharukova, Konstantin V. Gunbin, Kirill Ustyantsev, Mikhail A. Genaev, Alexander G. Blinov, Alexander Mazur, Eugenia Boulygina, Svetlana Tsygankova, Ekaterina Khrameeva, Nikolay Chekanov, Guangyi Fan, An Xiao, He Zhang, Xun Xu, Huanming Yang, Victor Solovyev, Simon Ming-Yuen Lee, Xin Liu, Dmitry A. Afonnikov, Konstantin G. Skryabin BMC GENOMICS, 2019, 20:399
Natural selection equally supports the human tendencies in subordination and domination: a genome-wide study with in silico confirmation and in vivo validation in mice. Chadaeva I., Ponomarenko P., Rasskazov D., Sharypova E., Kashina E., Kleshchev M., Ponomarenko M., Naumenko V., Savinkova L., Kolchanov N., Osadchuk L., Osadchuk A. Frontiers in Genetics, 2019, 2, 10, Article 73
Влияние неонатального введения дексаметазона на когнитивные способности взрослых самцов мышей и экспрессию генов в гипоталамусе Н.П. Бондарь, В.В. Решетников, К.В. Бурдеева, Т.И. Меркулова Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(4):456-464
Кандидатные SNP-маркеры атеросклероза, которые способны достоверно изменять сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека Пономаренко М.П., Рассказов Д.А., Чадаева И.В., Шарыпова Е.Б., Драчкова И.А., Пономаренко П.М., Ощепкова Е.А., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Генетика, 2019, 9, 55, 1083-1098
The differences in brain stem transcriptional profiling in hypertensive ISIAH and normotensive WAG rats Fedoseeva L.A., Klimov L.O., Ershov N.I., Efimov V.M., Markel A.L., Orlov Y.L., & Redina O.E. BMC GENOMICS, 2019, 20(3), 297.
A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive
analysis of motifs co-occurrence with MCOT package Levitsky V., Zemlyanskaya E., Oshchepkov D., Podkolodnaya O., Ignatieva E.,
Grosse I., Mironova V., Merkulova T. NUCLEIC ACIDS RES, 2019, 47(21):e139
Suppression of Alzheimer’s Disease-Like Pathology
Progression by Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1: A
Transcriptome Profiling Study Stefanova NA, Ershov NI, Kolosova NG. OXID MED CELL LONGEV, 2019, 2019 Jul 15;2019:3984906
Transcriptomic analysis confirms differences among nuclear genomes of cryptic earthworm lineages living in sympatry Shekhovtsov S.V., Ershov N.I., Vasiliev G.N., Peltek S.E. BMC EVOL BIOL, 2019, V. 19(S1). P. 50.
A rat model of human behavior provides evidence of natural selection against underexpression of aggressiveness-related genes in humans. Oshchepkov D., Ponomarenko M., Klimova N., Chadaeva I., Bragin A., Sharypova E., Shikhevich S., Kozhemyakina R. Frontiers in Genetics, 2019, V. 10. Article № 1267
Diversity of mariner-like elements in Orthoptera K. Ustyantsev, M. Biryukov, I. Sukhikh, N.V. Shatskaya, V. Fet, A. Blinov, I. Konopatskaia Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(8):1059-1066
The plastid and mitochondrial genomes of Vavilovia formosa (Stev.) Fed. and the phylogeny of related legume genera Shatskaya N.V., Bogdanova V.S., Kosterin O.E., Vasiliev G.V., Kimeklis A.K., Andronov E.E., Provorov E.A. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, Vol. 23. No. 8. P. 972-980
Транскриптомное секвенирование в культурах клеток глиом и анализ данных экспрессии генов Ю.Л.Орлов, С.С.Ковалев, Ю.П.Белоусова, Н.Г.Орлова, Е.Ю.Леберфарб Гены и клетки, 2019, Vol.XIV, №3, р.111
Кандидатные SNP-маркеры ревматоидного полиартрита, которые могут достоверно изменять сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека Чадаева И.В., Рассказов Д.А., Шарыпова Е.Б., Драчкова И.А., Ощепкова Е.А., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А., Козлов В.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 8, 23, 1047-1058
Изменения липидного обмена мыши при одновременном воздействии антисмысловыми олигонуклеотидными производными к мРНК генов апоВ, PCSK9 и апоCIII С.И. Ошевский, Ю.И. Рагино, Е.В. Каштанова, Я.В. Полонская, Е.М. Стахнева, В.П. Николин, Н.А. Попова, Н.А. Колчанов, М.И. Воевода Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(8):1020-1025
Antimetastatic Activity of Combined Topotecan
and Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase-1 Inhibitor
on Modeled Lewis Lung Carcinoma E. V. Koldysheva, A. P. Men’shchikova, E. L. Lushnikova, N. A. Popova, V. I. Kaledin, V. P. Nikolin, A. L. Zakharenko, O. A. Luzina, N. F. Salakhutdinov, and O. I. Lavrik Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2019, Vol. 166, No. 5, March, 2019 ONCOLOGY
Оценка эффективности эрадикации стволовых инициирующих раковых клеток на примере линии клеток глиобластомы человека U87 Долгова Е.В., Поттер Е.А., Проскурина А.С., Николин В.П., Попова Н.А., Романенко М.В., Нетесов С.В., Таранов О.С., Ефремов Я.Р., Завьялов Е.Л., Останин А.А., Черных Е.Р., Богачев С.С. Вопросы онкологии, 2019, Т 65. № 6. С. 904-919.
Компьютерные методы для анализа технологий секвенирования в анализе хромосомных контактов в клетке Орлов Ю.Л., Ковалев С.С., Дергилев А.И., Бабенко Р.О., Галиева Э.Р., Леберфарб Е.Ю. Гены и клетки, 2019, Том XIV №4-1, 2019. C. 171.
2018
Molecular adaptations to social defeat stress and induced depression in mice Natalya Bondar, Leonid Bryzgalov, Nikita Ershov, Fedor Gusev, Vasiliy Reshetnikov, Damira Avgustinovich, Mikhail Tenditnik, Evgeny Rogaev, Tatiana Merkulova MOL NEUROBIOL, 2018, 55(4):3394-3407
Effects of early-life stress on social and anxiety-like behaviors in adult mice: sex-specific effects Bondar N., Lepeshko A., Reshetnikov V. BEHAV NEUROL, 2018, Volume 2018 (2018), 13 pages
Candidate SNP markers of reproductive potential are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters Chadaeva IV, Ponomarenko PM, Rasskazov DA, Sharypova EB, Kashina EV, Zhechev DA, Drachkova IA, Arkova AV, Savinkova LK, Ponomarenko MP, Kolchanov NA, Osadchuk LV, Osadchuk AV. BMC GENOMICS, 2018, Suppl 3, 19, article 0
Consequences of early life stress on genomic landscape of H3K4me3 in prefrontal cortex of adult mice Nikita I. Ershov, Natalya P. Bondar, Arina A. Lepeshko, Vasiliy V. Reshetnikov, Julia A. Ryabushkina, Tatiana I. Merkulova BMC GENOMICS, 2018, 19(Suppl 3):93
Novel functional variants at the GWAS-implicated loci might confer risk to major depressive disorder, bipolar affective disorder and schizophrenia. Bryzgalov L.O., Korbolina E.E., Brusentsov I.I., Leberfarb E.Y., Bondar N.P., Merkulova T.I. BMC NEUROSCI, 2018, Apr 19;19(Suppl 1):22
Novel Approach to Functional SNPs Discovery from Genome-Wide Data Reveals Promising Variants for Colon Cancer Risk Elena E. Korbolina, Ilja I. Brusentsov, Leonid O. Bryzgalov, Elena Yu. Leberfarb, Arina O. Degtyareva and Tatyana I. Merkulova HUM MUTAT, 2018, Jun;39(6):851-859
Нормализация углеводно-жирового обмена клофибратом ассоциирована с отсутствием его промотирующего действия на гепатоканцерогенез у мышей. Н.В.Багинская, С.И. Ильницкая Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2018, т.104, №2, стр. 164-173
The impact of early-life stress on the expression of HPA-associated genes in the adult murine brain V.V. Reshetnikov, A.A. Studenikina, J.A. Ryabushkina, T.I. Merkulova, N.P. Bondar BEHAVIOUR, 2018, Volume 155, Issue 2-3, pages 181 – 203
Экспериментальное изучение влияния редких полиморфизмов ТАТА-боксов промоторов генов HBB, HBD и F9 человека на кинетику взаимодействия с ТАТА-связывающим белком Шарыпова Е.Б., Драчкова И.А., Кашина Е.В., Рассказов Д.А., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А., Савинкова Л.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, 1, 22, 145-152
Исследование экспрессии генов рецептора глюкокортикоидов и микроРНК в гиппокампе и концентрации кортизола в крови у лисиц, селекционируемых по реакции на человека
(Hippocampal glucocorticoid receptor and microRNA gene expression and serum cortisol concentration in foxes selected for behavior toward humans) В.Ю. Овчинников, Е.В. Антонов, Г.В. Васильев, С.Г. Шихевич, Д.В. Шепелева, Ю.Э. Гербек Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, том 22
The long-term effects of early postnatal stress on cognitive abilities and expression of genes of the glutamatergic system in mice V. V. Reshetnikov, A. A. Lepeshko, Yu. A. Ryabushkina, A. A. Studenikina, T. I. Merkulova, N. P. Bondar NEUROCHEM J+, 2018, 12(2): 142-151
Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на когнитивные способности и экспрессию генов глутаматергической системы у мышей В В Решетников, А А Лепешко, Ю А Рябушкина, А А Студеникина, Т И Меркулова, Н П Бондарь Нейрохимия, 2018, 35(2): 140-150
Cryptic divergences in the genus Pisum L. (peas), as revealed by phylogenetic analysis of plastid genomes Bogdanova V.S., Mglinets A.V., Shatskaya N.V., Kosterin O.E., Solovyev V.I., Vasiliev G.V. MOL PHYLOGENET EVOL, 2018, Vol. 129. P. 280-290
Анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным транскриптомного секвенирования. Ковалев С.С., Губанова Н.В., Леберфарб Е.Ю., Брагин А.О., Орлов Ю.Л. Гены и клетки, 2018, Приложение, No 1, стр.71-72
Компьютерный анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq С. С. Ковалев, Е. Ю. Леберфарб, Н. В. Губанова, А. О. Брагин, А. Г. Галиева,А. В. Цуканов, В. Н. Бабенко, Ю. Л. Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, Том 16, № 3, С.22-36
Novel tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors enhance the therapeutic impact of topoteсan on in vivo tumor models Zakharenko AL, Luzina OA, Sokolov DN, Kaledin VI, Nikolin VP, Popova NA, Patel J, Zakharova OD, Chepanova AA, Zafar A, Reynisson J, Leung E, Leung IKH, Volcho KP, Salakhutdinov NF, Lavrik OI EUR J MED CHEM, 2018, 1;161:581-593
Comparative Study of Toxicity of Alkoxyamines In Vitro and In Vivo Popova NA, Sysoeva GM, Nikolin VP, Kaledin VI, Tretyakov EV, Edeleva MV, Balakhnin SM, Lushnikova EL, Audran G, Mark S B EXP BIOL MED+, 2018, 165(1):176
Antimetastatic Effect of Liposomal Recombinant Lactaptin Kaledin VI, Koval OA, Kuligina EV, Lushnikova EL, Nikolin VP, Popova NA, Pyshnaya IA, Richter VA B EXP BIOL MED+, 2018, 164(6):762-765
Индукция апоптоза как условие радикализации химиотерапии опухолей. В.И. Каледин, В.П. Николин, Н.А. Попова Письма в Вавиловский журнал, 2018, 2018. http://pismavavilov.ru/download/reviews/appx1.pdf
Оценка эффективности эрадикации стволовых инициирующих раковых клеток на примере первичных культур глиобластомы человека Долгова Е.В., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Тыринова Т.В., Николин В.П., Попова Н.А., Таранов О.С., Ефремов Я.Р., Орищенко К.Е., Завьялов Е.Л., Мишинов С.В., Ступак В.В., Останин А.А., Черных Е.Р., Богачев С.С. Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, Т. 19. – №. 6. – С. 1-11
Efficacy of a new cancer treatment strategy based on eradication of tumor-initiating stem cells in a mouse model of Krebs-2 solid adenocarcinoma Potter ЕА, Proskurina AS, Ritter GS, Dolgova ЕV, Nikolin VP, Popova NA, Taranov OS, Efremov YR, Bayborodin SI, Ostanin АА, Chernykh ЕR, Kolchanov NA, Bogachev SS ONCOTARGET, 2018, 9(47): 28486-28499
Regulatory SNPs and their widespread effects
on the transcriptome Merkulov VM, Leberfarb EY, Merkulova TI. J BIOSCIENCES, 2018, Dec;43(5):1069-1075.
Оценка эффективности эрадикации стволовых инициирующих раковых клеток на примере асцитной формы гепатокарциномы мыши Г-29 Поттер Е.А., Риттер Г.С., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Кисаретова П.Э., Ефремов Я.Р., Николин В.П., Попова Н.А., Таранов О.С., Останин А.А., Черных Е.Р., Сидоров С.В., Колчанов Н.А., Богачев С.С. Вопросы онкологии, 2018, Т. 64. № 6. С. 818-829.
2017
Comparison of tolerance to sunlight between spatially distant and genetically different strains of Lymantria dispar nucleopolyhedrovirus Akhanaev Y.B., Belousova I.A., Ershov N.I., Nakai M., Martemyanov V.V., Glupov V.V. PloS One, 2017, 12(12):e0189992. doi: 10.1371/journal.pone.0189992
Antibodies to H1 histone from the sera of HIV-infected patients recognize and catalyze site-specific degradation of this histone Svetlana V. Baranova, Pavel S. Dmitrienok, Nikita V. Ivanisenko, Valentina N. Buneva, Georgy A. Nevinsky J MOL RECOGNIT, 2017
Механизмы формирования глюкокортикоидной резистентности в структурах головного мозга при стресс-индуцированных психопатологиях. В.М. Меркулов, Т.И. Меркулова, Н.П. Бондарь Биохимия, 2017, том 82, вып. 3, с. 494 – 510
Antibodies to H2a and H2b histones from the sera of HIV-infected patients catalyze site-specific degradation of these histones Baranova S. V., Dmitrenok P. S., Ivanisenko N. V., Buneva V. N., Nevinsky G. A. MOL BIOSYST, 2017
Efficient inhibition of influenza A viral replication in cells by deoxyribozymes delivered by nanocomposites Marina Repkova, Asya Levina, Boris Chelobanov, Zinfer Ismagilov ,Natalia Shatskaya , Sergei Baiborodin , Ekaterina Filippova , Natalia Mazurkova , Valentina Zarytova , INT J ANTIMICROB AG, 2017, 703-708 pp
SNP_TATA_Comparator: genomewide landmarks for preventive personalized medicine. Ponomarenko M, Rasskazov D, Chadaeva I, Sharypova E, Ponomarenko P, Arkova O, Kashina E, Ivanisenko N, Zhechev D, Savinkova L, Kolchanov N. Front Biosci (Schol Ed), 2017, 2, 9, 276-306
Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots N. A. Omelyanchuk, D. S. Wiebe, D. D. Novikova, V. G. Levitsky, N. Klimova, V. Gorelova, C. Weinholdt, G. V. Vasiliev, E. V. Zemlyanskaya, N. A. Kolchanov, A. V. Kochetov, I. Grosse, V. V. Mironova SCI REP-UK, 2017, 7: 2489
Whole-genome sequencing of eukaryotes: from sequencing of DNA fragments to a genome assembly. Zadesenets KS, Ershov NI, Rubtsov NB RUSS J GENET+, 2017, vol. 53, No.6, pp 631–639
Candidate SNP markers of familial and sporadic Alzheimer's diseases are predicted by a significant change in the affinity of TATA-Binding protein for human gene promoters. Ponomarenko P, Chadaeva I, Rasskazov DA, Sharypova E, Kashina EV, Drachkova I, Zhechev D, Ponomarenko MP, Savinkova LK, Kolchanov N Frontiers in Aging Neuroscience, 2017, 9, 231, doi: 10.3389/fnagi.2017.00231
ABC transporters in the liver fluke Opisthorchis felineus. Mordvinov VA, Ershov NI, Pirozhkova DS, Pakharukov YV, Pakharukova MY. MOL BIOCHEM PARASIT, 2017, 2017 Jul 17. 216:60–68 doi: 10.1016/j.molbiopara.2017.07.001.
Candidate SNP markers of social dominance, which may affect the affinity of the TATA-binding protein for human gene promoters. Chadaeva IV, Rasskazov DA, Sharypova EB, Savinkova LK, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, 5, 7, 523-537. doi: 10.1134/S2079059717050045
Растворимая эпоксидгидролаза (sEH) как потенциальная мишень для лекарственной терапии артериальной гипертензии О. Е. Редина, Т. О. Абрамова, Л. О. Климов, М. А. Рязанова, Л. А. Федосеева, С. Э. Смоленская, Н. И. Ершов, А. Д. Дубинина, А. Л. Маркель RUSS J GENET+, 2017, том 53 № 9 с. 1025–1034
Molecular mechanisms of the interaction between the processes of the cell response to mechanical stress and neuronal apoptosis in primary open-angle glaucoma O. V. Saik, N. A. Konovalova, P. S. Demenkov, N. V. Ivanisenko, T. V. Ivanisenko, D. E. Ivanoshchuk, O. S. Konovalova, O. A. Podkolodnaya, I. N. Lavrik, N. A. Kolchanov, V. A. Ivanisenko Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, ISSN 2079-0597, 2017, Vol. 7, No. 5, pp. 558–564
Gene expression profiling of tumor-initiating stem cells from mouse Krebs-2 carcinoma using a novel marker of poorly differentiated cells Potter EA, Dolgova EV, Proskurina AS, Efremov YR, Minkevich AM, Rozanov AS, Peltek SE, Nikolin VP, Popova NA, Seledtsov IA, Molodtsov VV, Zavyalov EL, Taranov OS, Baiborodin SI, Ostanin AA, Chernykh ER, Kolchanov NA, Bogachev SS ONCOTARGET, 2017, V. 8, N 6, P. 9425-9441
Regression model for predicting pathogenic properties of SOD1 mutants based on the analysis of conformational stability and conservation of hydrogen bonds. Alemasov N. A., Ivanisenko N. V., Ivanisenko V. A. J MOL GRAPH MODEL, 2017
Soluble epoxide hydrolase (sEH) as a potential target for arterial hypertension therapy O. E. Redina, T. O. Abramova, L. O. Klimov, M. A. Ryazanova, L. A. Fedoseeva, S. E. Smolenskaya, N. I. Ershov, A. D. Dubinina, and A. L. Markel RUSS J GENET+, 2017, Vol. 53, No. 9, pp. 972–981
Однонуклеотидные полиморфизмы, специфичные для гипертензивных крыс линии НИСАГ Н. И. Ершов, А. Л. Маркель, О. Е. Редина Биохимия, 2017, Т.82(2): 344-356
Экспериментальное исследование препарата дрожжевой РНК как возможного радиопротектора при радиотерапии злокачественных опухолей Николин В.П., Богачев С.С., Попова Н.А., Торнуев Ю.В., Виноградова Е.В. B EXP BIOL MED+, 2017, Т.163, № 5.– С. 596 – 599.
Сравнительное исследование токсичности алкоксиаминов in vitro и in vivo Н.А.Попова, Г.М. Сысоева, В.П. Николин, В.И. Каледин, Е.В. Третьяков, М.В. Еделева, С.М. Балахнин, Е.Л. Лушникова, G.Audran, С.Марк B EXP BIOL MED+, 2017, Т. 164, № 7. С. 61-65
Высокая противометастатическая активность липосомальной формы платина после лиофильного высушивания и хранения В.И. Каледин, В.П. Николин, Н.А. Попова, М.Г. Клинникова, Л.А. Богданова, Т.С. Морозкова B EXP BIOL MED+, 2017, Т. 163, № 3. С. 331-334
Deterministic versus stochastic model of reprogramming: new evidence from cellular barcoding technique Anastasia M. Yunusova, Veniamin S. Fishman, Gennady V. Vasiliev, Nariman R. Battulin. OPEN BIOL, 2017, 7 (4)
Иммунопатология смешанного тревожно/депрессивного расстройства: Экспериментальный подход к коррекции иммунодефицитных состояний. Журн. высш. нервн Кудрявцева Н.Н., Шурлыгина А.В., Галямина А.Г., Смагин Д. А., Коваленко И.Л., Попова Н.А., Николин В.П., Ильницкая С.И., Мельникова Е.В., Труфакин В.А. Журнал высшей нервной деятельности, 2017, Т.67 №6, 671-692
Circulating DNA in rheumatoid arthritis: pathological changes and association with clinically used serological markers. Rykova E, Sizikov A, Roggenbuck D, Antonenko O, Bryzgalov L, Morozkin E, Skvortsova K, Vlassov V, Laktionov P, Kozlov V. ARTHRITIS RES THER, 2017, 2;19(1):85. doi: 10.1186/s13075-017-1295-z.
Статистические оценки ошибок коротких прочтений ДНК при высокопроизводительном секвенировании Васильев Г.В., Орлова Н.Г., Абнизова И.И., те Боекхорст Р., Орлов Ю.Л. Acta Naturae, 2017, Том 9(1). С. 21.
Chromosome Evolution in the Free-Living Flatworms: First Evidence of Intrachromosomal Rearrangements in Karyotype Evolution of Macrostomum lignano (Platyhelminthes, Macrostomida) Zadesenets K.S., Ershov N.I., Berezikov E., Rubtsov N.B. Genes, 2017, 8: 298
Influence of magnetic field on enzymatic ONOO– production Dranova T., Petrovskii D., Ershov N., Slepneva I., Stass D JPCS, 2017, №886(2017) 012004
Mechanisms of brain glucocorticoid resistance in stress-induced psychopathologies Merkulov V.M., Merkulova T.I., Bondar N.P. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2017, 82(3): 351-365.
Experimental opisthorchiasis: Study of blood cell composition, hematopoiesis, and startle reflex in laboratory animals D. F. Avgustinovich a, *, I. A. Orlovskaya b , L. B. Toporkova b , G. B. Vishnivetskaya a , A. V. Katokhin a , M. N. Lvova a , E. V. Kashina a , N. P. Bondar a , N. A. Feofanova a, b , and V. A. Mordvinov a, c Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, 7(1):82-92 · January 2017
Metabolic pathways and genes identified by RNA-seq analysis of barley near-isogenic lines differing by allelic state of the Black lemma and pericarp (Blp) gene Anastasiya Y. Glagoleva, Nikolay A. Shmakov, Olesya Y. Shoeva, Gennady V. Vasiliev, Natalia V. Shatskaya, Andreas Börner, Dmitry A. Afonnikov, Elena K. Khlestkina BMC PLANT BIOL, 2017, 17(Suppl 1):182, DOI 10.1186/s12870-017-1124-1
RNAseq-BASED DECIFERING OF MOLECULAR MECHANISMS UNDERLYING TRAIT FORMATION: NON-ALTERNATIVE WAY IN CASE OF IMPEDED METABOLITE IDENTIFICATION Glagoleva A.Y., Shmakov N.A., Shoeva O. Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Börner A., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K. Acta Naturae, 2017, Спецвыпуск №1 2017 том 9
Integrated mathematical models for describing complex biological processes. Mishchenko E. L., Petrovskaya O. V., Mishchenko A. M., Petrovskiy E. D., Ivanisenko N. V., Ivanisenko V. A. BIOPHYSICS, 2017, 62(5), 778-795
Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis Alex V. Kochetov, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Salmaz M. Ibragimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Tatyana A. Gavrilenko, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko BMC PLANT BIOL, 2017, BMC Plant Biology 2017, 17 (Suppl 2):251
Expression Dynamics of the REL, RELA, and IRF1 Transcription Factors in U937 Macrophages after Dioxin Exposure E. V. Kashina, D. Yu. Oshchepkov, E. V. Antontseva, M. Yu. Shamanina, D. P.Furman, V. A. Mordvinov Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, Vol. 7, No. 5, pp. 580-584
2016
Identification of microsatellite loci based on BAC sequencing data and their physical mapping into the soft wheat 5B chromosome Nesterov M.A., Afonnikov D.A., Sergeeva E.M., Miroshnichenko L.A., Bragina M.K., Bragin A.O., Vasiliev G.V., Salina E.A. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, Vol. 6, No. 8, pp. 825–837. DOI: 10.1134/S2079059716070078
Whole transcriptome profiling of adult and infective stages of the trematode Opisthorchis felineus Pomaznoy MY, Logacheva MD, Young ND, Penin AA, Ershov NI, Katokhin AV, Mordvinov VA. PARASITOL INT, 2016, S1383-5769(15)00145-2
Гипотетические SNP-маркеры, значимо изменяющие оценки сродства ТАТА-связывающего белка к промоторам онкогенов VEGFA, ERBB2, IGF1R, FLT1, KDR и MET – мишеней для химиотерапии. Турнаев И.И., Рассказов Д.А., Аркова О.В., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2016, 1, 50, 161-173
THE INFLUENCE OF NITROXYL RADICAL 4- ТRIPHENYLPHOSPHONIOACETAMIDO-2,2,6,6-TETRAMETHYLPIPERIDINE-1- OXYL (TPPA-TEMPO) ON GENERAL TOXICITY AND THERAPEUTIC EFFICIENCY OF CYCLOPHOSPHAMIDE ON TRANSPLANTABLE MOUSE LYMPHOSARCOMA LS IN VITRO AND IN VIVO NELLY A. POPOVA1, VASILY I. KALEDIN2, VALERY P. NIKOLIN3, GALINA M. SYSOEVA4, EKATERINA I. YUZHIK5, ELENA L. LUSHNIKOVA6, LEV M. NEPOMNYASHCHIKH7, IGOR A. KIRILYUK8 & IGOR A. GRIGOR’EV9 International Journal of Medicine and Pharmaceutical Sciences, 2016
Genome-wide transcriptome analysis of hypothalamus in rats with inherited stress-induced arterial hypertension Leonid O. Klimov, Nikita I. Ershov, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel and Olga E. Redina BMC GENET, 2016, 201617(Suppl 1):13
Comparative transcriptional profiling of renal cortex in rats with inherited stress-induced arterial hypertension and normotensive Wistar Albino Glaxo rats Larisa A. Fedoseeva, Marina A. Ryazanova, Nikita I. Ershov, Arcady L. Markel, Olga E. Redina BMC GENET, 2016, 17(Suppl 1):12.
A strategy to eradicate well-developed Krebs-2 ascites in mice Ekaterina A. Potter, Evgenia V. Dolgova, Anastasia S. Proskurina, Alexandra M. Minkevich, Yaroslav R. Efremov, Oleg S. Taranov, Vladimir V. Omigov, Valeriy P. Nikolin, Nelly A. Popova, Sergey I. Bayborodin, Alexander A. Ostanin, Elena R. Chernykh, Nikolay A. Kolchanov, Mikhail A. Shurdov, Sergey S. Bogachev ONCOTARGET, 2016, 2016 Mar 8; 7(10):11580-94. doi: 10.18632/oncotarget.7311.
Терапевтические эффекты воздействия циклофосфана, препаратов двуцепочечной ДНК и их сочетания на раковые клетки асцита Кребс-2 и различные формы трансплантатов Е.А. Поттер, Е.В. Долгова, А.М. Минкевич, Я.Р. Ефремов, О.С. Таранов, В.В. Омигов, В.П. Николин, Н.А. Попова, А.С. Проскурина, Е.И. Верещагин, А.В. Козел, В.А. Рогачев, Д.Б. Петров, А.А. Останин, Е.Р. Черных, Н.А. Колчанов, С.С. Богачев Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(1):96-107 DOI 10.18699/VJ15.116
Характеристика режимов терапевтического воздействия циклофосфана и препаратов двуцепочечной ДНК на опухоль Кребс-2, растущую в асцитной форме, приводящих к эрадикации первичного асцита Е.А. Поттер, Е.В. Долгова, А.М. Минкевич, В.П. Николин, Н.А. Попова, Я.Р. Ефремов, С.И. Байбородин, В.А. Рогачев, А.С. Проскурина, А.В. Козел, О.С. Таранов, В.В. Омигов, Е.И. Верещагин, Д.Б. Петров, А.А. Останин, Е.Р. Черных, Н.А. Колчанов, С.С. Богачев Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(1):108-124 DOI 10.18699/VJ15.117
Candidate SNP markers of gender-biased autoimmune complications of monogenic diseases are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters Mikhail Ponomarenko, Olga Arkova, Dmitry Rasskazov, Petr Ponomarenko, Ludmila Savinkova, Nikolay Kolchanov Frontiers in Immunology, 2016, V. 7. P. 130
Induction of tyrosine aminotransferase in mice is inhibited by the activated metabolites of ortho-aminoazotoluene V.I. Kaledin, S.I. Ilnitskaya, N.A.Popova, O.A.Koval, I.A.Pyshnaya, L.F.Gulyaeva Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, 6 (1) P.91-98
Экспериментальный описторхоз: исследование состава форменных элементов крови, гемопоэза и стартл-рефлекса у лабораторных животных Д.Ф. Августинович, И.А. Орловская, Л.Б. Топоркова, Г.Б. Вишнивецкая, А.В. Катохин, М.Н. Львова, Е.В. Кашина, Н.П. Бондарь, Н.А. Феофанова, В.А. Мордвинов Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016. 20 (2):155-164
Hidden Heterogeneity of Transcription Factor Binding Sites: A Case Study of SF-1 V.G. Levitsky, D.Yu. Oshchepkov, N.V. Klimova, E.V Ignatieva, G.V. Vasiliev, V.M. Merkulov, T.I. Merkulova COMPUT BIOL CHEM, 2016, V. 64, P. 19-32
Неодинаковая эффективность липосомальных форм гидро-фильного и гидрофобного противоопухолевых препаратов в отношении со-лидных трансплантатов опухоли мышей и ее метастазов в печени Попова Н.А., Каледин В.И., Николин В.П., Богданова Л.А., Морозкова Т.С., Торнуев Ю.В. // Бюл. экс-пер. биол. – B EXP BIOL MED+, 2016, Т. 161, № 6. – С.770 – 774.
Properties of internalization factors contributing to the uptake of extracellular DNA into tumor-initiating stem cells of mouse Krebs-2 cell line Evgeniya V. Dolgova, Ekaterina A. Potter, Anastasiya S. Proskurina, Alexandra M. Minkevich, Elena R. Chernych, Alexandr A. Ostanin, Yaroslav R. Efremov, Sergey I. Bayborodin, Valeriy P. Nikolin, Nelly A. Popova, Nikolay A. Kolchanov, Sergey S. Bogachev STEM CELL RES THER, 2016, 7(1):76. DOI 10.1186/s13287-016-0338-8
Non-adherent spheres with multiple myeloma surface markers contain cells that contribute to the sphere formation and are capable of internalizing extracellular double-stranded DNA Dolgova EV, Shevela EY, Tyrinova TV, Minkevich AM, Proskurina AS, Potter EA, Orishchenko KE, Zavjalov EL, Bayborodin SI, Nikolin VP, Popova NA, Pronkina NV, Ostanin AA, Chernykh ER, Bogachev SS CL LYMPH MYELOM LEUK, 2016, pii: S2152-2650(16)30134-3. doi: 10.1016/j.clml.2016.06.014. [Epub ahead of print]
Candidate SNP markers of chronopathologies are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters Petr Ponomarenko, Dmitry Rasskazov, Valentin Suslov, Ekaterina Sharypova, Ludmila Savinkova, Olga Podkolodnaya, Nikolay Podkolodny, Natalya Tverdokhleb, Irina Chadaeva, Mikhail Ponomarenko, Nikolay Kolchanov Biomed Res Int, 2016, vol. 2016, Article ID 8642703. doi:10.1155/2016/8642703
Five-year disease-free survival among stage II-IV breast cancer patients receiving FAC and AC chemotherapy in phase II clinical trials of Panagen Proskurina AS, Gvozdeva TS, Potter EA, Dolgova EV, Orishchenko KE, Nikolin VP, Popova NA, Sidorov SV, Chernykh ER, Ostanin AA, Leplina OY, Dvornichenko VV, Ponomarenko DM, Soldatova GS, Varaksin NA, Ryabicheva TG, Uchakin PN, Rogachev VA, Shurdov MA, Bogachev SS. BMC CANCER, 2016, 16:651. doi: 10.1186/s12885-016-2711-5
Correlation of susceptibility to ortho-aminoazotoluene-induced hepatocarcinogenesis with Car and Ahr signaling pathway activation in mice N.V. Baginskaya Elena V Kashina M. Yu. Shamanina S. I. Ilnitskaya V. I. Kaledin V. A. Mordvinov Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, 6(4):463-468 · June 2016
Стимуляция метаболизма диэтилнитрозамина снижает его общетоксическое и гепатоканцерогенное действие Ильницкая С.И., Каледин В.И., Богданова Л.А., Морозкова Т.С., Капустина В.И., Перепечаева М.Л., Гришанова А.Ю. B EXP BIOL MED+, 2016, Т.162, №7, стр. 113 - 116
Иммуномодулирующее влияние ингибиторов индоламин‑2,3-диоксигеназы (идо) на опухолевый рост Попова Н. А., Николин В. П., Каледин В. И., Лушникова Е. Л. Российский иммунологический журнал, 2016, Том 10 (19), Номер 2 (1), Июнь 2016. Стр. 481
Phenological asynchrony between host plant and gypsy moth reduces insect gut microbiota and susceptibility to Bacillus thuringiensis Vyacheslav V. Martemyanov, Irina A. Belousova, Sergey V. Pavlushin, Ivan M. Dubovskiy, Nikita I. Ershov, Tatyana Y. Alikina, Marsel R. Kabilov, Victor V. Glupov Ecology and Evolution, 2016, DOI: 10.1002/ece3.2460, 2016; 1–13
Biomedical and candidate SNP markers of chronopathologies can significantly change the affinity of the ТАТА-binding protein to the promoters of human genes. Rasskazov DA, Podkolodnyy NL, Podkolodnaya OA, Tverdokhleb NN, Suslov VV, Savinkova LK, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, 7, 6, 738-748
Effects of SNPs in the positioning regions of RNA polymerase II on the TBP/promoter affinity in genes of the human circadian clock. Podkolodnaya OA, Rasskazov DA, Podkolodnyy NL, Podkolodnaya NN, Suslov VV, Savinkova LK, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, 7, 6, 759-770
Prediction and verification of the influence of the rs367781716 SNP on the interaction of the ТАТА-binding protein with the promoter of the human АВСА9 gene Arkova OV, Drachkova IA, Arshinova TV, Rasskazov DA, Suslov VV, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP, Kolchanov NA, Savinkova LK Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, 7, 6, 785-791
Genes of susceptibility to early neurodegenerative changes in the rat retina and brain: Analysis by means of congenic strains Korbolina E.E., Zhdankina A.А., Fursova A.Zh., Kozhevnikova O.S., Kolosova N.G. BMC GENET, 2016, 17 Suppl 3: S5. DOI: 10.1186/s12863-016-0461-7.
Ингибирование мутагенной активации орто-аминоазотолуола повышает его канцерогенность для печени мышей Каледин В. И., Овчинникова Л. П., Ильницкая С. И., Морозкова Т. С., Попова Н. А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, т.20 № 5. Стр. 708-715
Режим однократной инъекции препарата двуцепочечной ДНК после каждой инъекции циклофосфана, приводящий к эрадикации первичного асцита Кребс-2. Поттер Е.А., Долгова Е.В., Минкевич А.М., Николин В.П., Попова Н.А., Ефремов Я.Р., Байбородин С.И., Рогачев В.А., Проскурина А.С., Таранов О.С., Верещагин Е.И., Останин А.А., Черных Е.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016. Т. 20. № 5. С. 716-722. DOI 10.18699/VJ16.161
Разработка регламента терапевтического режима, основанного на синергичном действии циклофосфана и препаратов двуцепочечной ДНК, приводящего к полному вылечиванию экпериментальных животных от асцитной формы опухоли мыши Кребс-2 Поттер Е.А., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Ефремов Я.Р., Таранов О.С., Николин В.П., Попова Н.А., Дубатолова Т.Д., Петрова Д.Д., Верещагин Е.И., Минкевич А.М., Андрушкевич О.М., Байбородин С.И., Рогачев В.А., Останин А.А., Черных Е.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, Т. 20. № 5. С. 723-735. DOI 10.18699/VJ16.162
COMPARATIVE TRANSCRIPTIONAL PROFILING OF HYPOTHALAMUS IN ISIAH RATS WITH INHERITED STRESS-INDUCED ARTERIAL HYPERTENSION AND NORMOTENSIVE WISTAR ALBINO GLAXO RATS Klimov Leonid, Ershov Nikita, Efimov Vadim, Markel Arkady, Redina Olga J HYPERTENS, 2016, September 2016 - Volume 34 - Issue - p e284
THE GENE-EXPRESSION PROFILE OF RENAL CORTEX IN RATS WITH INHERITED STRESS-INDUCED ARTERIAL HYPERTENSION (ISIAH) Ryazanova Marina; Fedoseeva Larisa; Ershov Nikita; Markel Arcady; Redina Olga J HYPERTENS, 2016, September 2016 - Volume 34 - Issue - p e287
Brain-derived neurotrophic factor and early-life stress: Multifaceted interplay Bondar N.P., Merkulova T.I. J BIOSCIENCES, 2016, J Biosci (2016) 41: 751.
Identification of nuclear genes controlling chlorophyll synthesis in barley by RNA-seq Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Doroshkov A.V., Gordeeva E.I., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K. BMC PLANT BIOL, 2016, 16 (Suppl 3):245. DOI 10.1186/s12870-016-0926-x
Динамика экспрессии транскрипционных факторов REL, RELA и IRF1 в макрофагоподобной линии U937 после воздействия диоксина. Кашина Е.В., Ощепков Д.Ю., Антонцева Е.В., Шаманина М.Ю., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(6):894-898
The gene-expression profile of renal medulla in ISIAH rats with inherited stress-induced arterial hypertension Marina A. Ryazanova, Larisa A. Fedoseeva, Nikita I. Ershov, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel and Olga E. Redina BMC GENET, 2016, 17(Suppl 3):151
Glucocorticoid receptor: Translocation from the cytoplasm to the nuclei; chromatin and intranuclear chaperone cycles Merkulov V.M., Klimova N.V., Merkulova T.I. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, V. 6. Issue 3. P. 297-306.
The ultradian rhythm of the glucocorticoid secretion and the time course of target gene regulation Merkulov V.M., Klimova N.V., Merkulova T.I. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, V. 6. Issue 3. P. 288-296.
Candidate SNP markers of aggressiveness-related complications and comorbidities of genetic diseases are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters. Chadaeva I.V., Ponomarenko M.P., Rasskazov D.A., Sharypova E.B., Kashina E.V. Matveeva M.Yu., Arshinova T.V., Ponomarenko P.M., Arkova O.V., Bondar N.P. Savinkova L.K., Kolchanov N.A. BMC GENOMICS, 2016, Suppl. 14, 17, 995
Regulatory single nucleotide polymorphisms (rSNPs) at the promoters 1A and 1B of the human APC gene Marina Yu Matveeva, Elena V. Kashina, Vasily V. Reshetnikov, Leonid O. Bryzgalov, Elena V. Antontseva, Natalia P. Bondar and Tatiana I. Merkulova BMC GENET, 2016, 17(Suppl 3):460
Анализ геномного распределения сайтов связывания транскрипционных факторов GAGA и CNC в развитии Drosophila melanogaster Брусенцов И.И., Карагодин Д.А., Баричева Э.М., Меркулова Т.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(6):762-769
Выявление новых регуляторных SNP-маркеров, ассоциированных с предрасположенностью к развитию колоректального рака Леберфарб Е.Ю., Брызгалов Л.О., Брусенцов И.И., Меркулова Т.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(6)
Molecular determinants of the adrenal gland functioning related to stress-sensitive hypertension in ISIAH rats Larisa A. Fedoseeva, Leonid O. Klimov, Nikita I. Ershov, Yury V. Alexandrovich, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel, Olga E. Redina BMC GENOMICS, 2016, 2016, 17(Suppl 14):989
The reasons of Trithorax-like expression disturbance in Trl 3609 allele of Drosophila melanogaster Karagodin D. A., Battulina N. V., Merkulova T. I., Baricheva E. M. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2016, Vol. 471, № 1, P. 443-446
Stimulation of diethylnitrosamine metabolism reduces its general toxic and hepatocarcinogenic effects Il'nitskaya S.I., Kaledin V.I., Bogdanova L.A., Morozkova t.S., Kapustina V.I., Perepechaeva M.L., Grishanova A.Y. B EXP BIOL MED+, 2016, volume 162, issue 1, 98-101
Кандидатные SNP-маркеры социального доминирования, способные влиять на сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека. Чадаева И.В., Рассказов Д.А., Шарыпова Е.Б., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 6, 20, 787-796
Структурное моделирование мод связывания НАД+ с ПАРП-1 Иванисенко Н.В., Жечев Д.А., Иванисенко В.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016
A real-time study of the interaction of TBP with a TATA box-containing duplex identical to an ancestral or minor allele of human gene LEP or TPI. Arkova O., Kuznetsov N., Fedorova O., Savinkova L. Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2016, v.35, # 14, P. 3070-3081
Antitumor and Antimetastatic Effect of Small Immunostimulatory RNA against B16 Melanoma in Mice Kabilova TO, Sen'kova AV, Nikolin VP, Popova NA, Zenkova MA, Vlassov VV, Chernolovskaya EL PloS One, 2016, 11(3):e0150751
Полиморфизм регуляторной области гена LCT в некоторых тюркоязычных популяциях Алтае-Саянского региона. И.В. Пилипенко, М.С. Пристяжнюк, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода, А.С. Пилипенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):887-893
2015
SiO2 nanoparticles as platform for delivery of 3'-triazole analogues of AZT-triphosphate into cells Vasilyeva, S.V., Levina, A.S., Li-Zhulanov, N.S., Shatskaya, N.V., Baiborodin, S.I., Repkova, M.N., Zarytova, V.F., Mazurkova, N.A., Silnikov, V.N. Bioorganic and Medicinal Chemistry, 2015, January 13, 2015 DOI: 10.1016/j.bmc.2015.02.063
Индукцию тирозинаминотрансферазы у мышей ингибируют активированные метаболиты орто-аминоазотолуола В.И. Каледин, С.И.Ильницкая, Н.А.Попова, О.А.Коваль, И.А.Пышная, Л.Ф.Гуляева Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, т.19, №1, стр.136-143
Механизм влияния полиморфизмов кор-промоторов генов пищевого поведения человека на взаимодействие с ТАТА-связывающим белком Аркова Ольга Владимировна Пономаренко Михаил Павлович Аршинова Татьяна Валентиновна Савинкова Людмила Кузьминична Медицинская генетика, 2015
Combination of cyclophosphamide and double-stranded DNA demonstrates synergistic toxicity against established xenografts Alyamkina EA, Nikolin VP, Popova NA, Minkevich AM, Kozel AV, Dolgova EV, Efremov YR, Bayborodin SI, Andrushkevich OM, Taranov OS, Omigov VV, Rogachev VA, Proskurina AS, Vereschagin EI, Kiseleva EV, Zhukova MV, Ostanin AA, Chernykh ER, Bogachev SS, Shurdov MA. CANCER CELL INT, 2015, 15: 32
Изменения транскриптома префронтальной коры мозга при развитии признаков болезни Альцгеймера у крыс OXYS. Стефанова Н.А., Корболина Е.Е., Ершов Н.И., Рогаев Е.И., Колосова Н.Г. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 19(4):74-82
Корреляция чувствительности к гепатоканцерогенезу, индуцированному введением орто-аминоазотолуола, со степенью активации сигнальных путей Ahr и Car у мышей. Багинская Н.В., Кашина Е.В., Шаманина М.Ю., Ильницкая С.И., Каледин В.И., Мордвинов В.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, т.19, №4, стр.77-82
How to use SNP_TATA_Comparator to find a significant change in gene expression caused by the regulatory SNP of this gene’s promoter via a change in affinity of the TATA-binding protein for this promoter Mikhail Ponomarenko, Dmitry Rasskazov, Olga Arkova, Petr Ponomarenko, Valentin Suslov, Ludmila Savinkova, Nikolay Kolchanov Biomed Res Int, 2015, Volume 2015, Article ID 359835
Identification of functional networks associated with cell death in the retina of OXYS rats during the development of retinopathy Telegina DV, Korbolina EE, Ershov NI, Kolosova NG, Kozhevnikova OS. CELL CYCLE, 2015, Vol.14 Issue 14 (22) P.3544 - 56 doi: 10.1080/15384101.2015.1080399.
Рецептор глюкокортикоидов: переход из цитоплазмы в клеточное ядро, хроматиновый и внутриядерный шапероновый циклы В.М. Меркулов, Н.В. Климова, Т.И. Меркулова Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, Т. 19, № 3, С. 255-263
Внутрисуточный ритм секреции глюкокортикоидов и динамика генного ответа В.М. Меркулов, Н.В. Климова, Т.И. Меркулова Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, Т. 19, № 2, С. 214-221
Полиморфизм гена TRPM8 в кыргызской популяции:возможная связь с высокогорной адаптацией. Бабенко ВН., Исакова ЖТ., Талайбекова ЭТ., Асамбаева ДА., Кобзев ВФ., Потапова ТА., Воевода МИ., Алдашев АА. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 19(5), 630-637
Идентификация микросателлитных локусов по данным секвенирования ВАС-клонов и их физическое картирование на хромосому 5B мягкой пшеницы. М.А. Нестеров, Д.А. Афонников, Е.М. Сергеева, Л.А. Мирошниченко, М.К. Брагина, А.О. Брагин, Г.В. Васильев, Е.А. Салина. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 19(6):707-714 DOI 10.18699/VJ15.086
The decreased expression of genes controlling the vascular tone in the kidneys of ISIAH rats with stress-induced arterial hypertension O. E. Redina, L. O. Klimov, N. I. Ershov, T. O. Abramova, L. N. Ivanova, and A. L. Markel. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, Vol. 5, No. 4, pp. 340–347
Identification of microRNA genes in three opisthorchiids Ovchinnikov VY, Afonnikov DA, Vasiliev GV, Kashina EV, Sripa B, Mordvinov VA, Katokhin AV. PLOS NEGLECT TROP D, 2015, 9(4):e0003680
ПРОГНОЗ И ВЕРИФИКАЦИЯ ВЛИЯНИЯ SNP rs367781716 НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ТАТА-СВЯЗЫВАЮЩЕГО БЕЛКА С ПРОМОТОРОМ ГЕНА АВСА9 ЧЕЛОВЕКА Аркова ОВ., Драчкова ИА., Аршинова ТВ., Рассказов ДА., Суслов ВВ., Пономаренко ПМ., Пономаренко МП., Колчанов НА., Савинква ЛК. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, т.19, № 6, с.
Obesity-related known and candidate SNP markers can significantly change affinity of TATA-binding protein for human gene promoters Arkova OV, Ponomarenko MP, Rasskazov DA, Drachkova IA, Arshinova TV, Ponomarenko PM, Savinkova LK, Kolchanov NA BMC GENOMICS, 2015, Suppl.13. V. 16. S5.
МУТАГЕННАЯ АКТИВНОCТЬ В ТЕCТЕ ЭЙМCА ЧЕТЫPЕX АМИНОАЗОCОЕДИНЕНИЙ C PАЗЛИЧНОЙ КАНЦЕPОГЕННОCТЬЮ ДЛЯ ПЕЧЕНИ КPЫC Т.C. Фpолова, О.И. Cиницына, В.И. Каледин BIOPHYSICS, 2015, том 60, вып. 5, c. 990–994
ВЛИЯНИЕ ИЗМЕНЕНИЯ АКТИВНОCТИ ЦИТОXPОМА P450 2E1 В ПЕЧЕНИ НА ТОКCИЧЕCКИЕ CВОЙCТВА И КАНЦЕPОГЕННОCТЬ ДИЭТИЛНИТPОЗАМИНА У МЫШЕЙ В.И. Каледин, C.И. Ильницкая, Е.А. Ваcюнина, Н.А. Попова, Л.А. Богданова, М.Л. Пеpепечаева, А.Ю. Гpишанова BIOPHYSICS, 2015, том 60, вып. 6, c. 1166–1173
Влияние паклитаксела на противоопухолевое действие циклофосфана на модели двух перевиваемых опухолей мышей Каледин В.И., Николин В.П., Попова Н.А., Пышная И.А., Богданова Л.А., Морозкова Т.С. B EXP BIOL MED+, 2015, Т. 159, с. 93 - 95
Половые различия чувствительности к пульмоноканцерогенному действию уретана у мышей меняются на противоположные после неонатальной андрогенизации Морозкова Т.С., Каледин В.И. B EXP BIOL MED+, 2015, Т. 159, С.761-764
Изучение потенциально регуляторных SNPs в промоторных районах гена АРС человека Матвеева М.Ю., Кашина Е.В., Брызгалов Л.О., Антонцева Е.В., Бондарь Н.П., Решетников В.В., Меркулова Т.И. Медицинская генетика, 2015, Том №14. №3, c.41
Выявление и функциональный анализ регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстого кишечника Леберфарб Е.Ю., Брызгалов Л.О., Брусенцов И.И., Дегтярева А.О., Меркулова Т.И. Медицинская генетика, 2015, Том 14, №3
Altered Hippocampal Neurogenesis and Amygdalar Neuronal Activity in Adult Mice with Repeated Experience of Aggression Dmitry A. Smagin, June-Hee Park, Tatyana V. Michurina, Natalia Peunova, Zachary Glass, Kasim Sayed, Natalya P. Bondar, Irina N. Kovalenko, Natalia N. Kudryavtseva and Grigori Enikolopov Frontiers in Neuroscience, 2015, volume 9, article 443, doi: 10.3389/fnins.2015.00443
Regulatory single nucleotide polymorphisms at the beginning of intron 2 of the human KRAS gene Elena V Antontseva, Marina Yu Matveeva , Natalia P Bondar, Elena V Kashina, Elena Yu Leberfarb, Leonid O Bryzgalov, Polina A Gervas, Anastasia A Ponomareva, Nadezhda V Cherdyntseva, Yury L Orlov, Tatiana I Merkulova J BIOSCIENCES, 2015, Dec;40(5):873-83
Эпигенетические «зонды» для мониторинга рака легкого: профиль метилирования элементов LINE-1 в циркулирующей ДНК крови А. А. Пономарева, Е. Ю. Рыкова, Н. В. Чердынцева, А. А. Бондарь, А. Ю. Добродеев, А. А. Завьялов, С. А. Тузиков, Л. О. Брызгалов, Т. И. Меркулова, В. В. Власов, П. П. Лактионов Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, Том 19, №1
Биомедицинские и кандидатные SNP-маркеры для хронопатологий могут достоверно изменять сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека. Рассказов Д.А., Подколодный Н.Л., Подколодная О.А., Подколодная Н.Н., Суслов В.В., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 6, 19, 691-698
Влияние однонуклеотидных полиморфных замен в районах позиционирования РНК-полимеразы II на сродство к ним TBP в генах циркадных часов человека Подколодная О.А., Рассказов Д.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Суслов В.В., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 6, 19, 682-690
De Novo Assembly of the Pea (Pisum sativum L.) Nodule Transcriptome Vladimir A. Zhukov, Alexander I. Zhernakov, Olga A. Kulaeva, Nikita I. Ershov, Alexey Y. Borisov, and Igor A. Tikhonovich International Journal of Genomics, 2015, Volume 2015 (2015), Article ID 695947, 11 pages, http://dx.doi.org/10.1155/2015/695947
Dioxin-mediated regulation of expression IL-12 family cytokines in human macrophages as a factor of tumor promotion by TCDD E. Kashina, D. Oshchepkov, A. Shilov, E. Antontseva, D. Furman, V. Mordvinov European Journal of Cancer Supplements, 2015, Volume 13, Issue 1, November 2015, Pages 23
Effect of hepatic P450 2e1 activity modulation on the toxicity and carcinogenicity of diethylnitrosamine in mice Kaledin V.I., Ilnitskaya S.I., Vasyunina E.A., Popova N.A., Bogdanova L.A., Perepechaeva M.L., Grishanova A.Y. BIOPHYSICS, 2015, volume 60, issue 6, pages 1166-1173
Одновременное воздействие несколькими антисмысловыми олигонуклеотидными производными, его эффективность на примере липидного обмена мыши Ошевский С.И., Рагино Ю.И., Каштанова Е.В., Полонская Я.В., Стахнёва Е.М., Николин В.П., Попова Н.А., Кораблев А.Н.. Колчанов Н.А., Воевода М.И. Атеросклероз, 2015, 3 (том 11), с. 72-78
Amyloid accumulation is a late event in sporadic Alzheimer's disease-like pathology in nontransgenic rats. Stefanova NA, Muraleva NA, Korbolina EE, Kiseleva E, Maksimova KY, Kolosova NG. ONCOTARGET, 2015, Jan 30;6(3):1396-413
Регуляторная геномика – экспериментально-компьютерные подходы Е. В. Игнатьева, О. А. Подколодная, Ю. Л. Орлов, Г. В. Васильев, Н. А. Колчанов RUSS J GENET+, 2015, Т. 51, № 4, с. 409–429 (Vol. 51, No. 4, pp. 334–352)
Nuclear-cytoplasmic conflict in pea (Pisum sativum L.) is associated with nuclear and plastidic candidate genes encoding Acetyl-CoA carboxylase subunits Bogdanova V.S., Zaytseva O.O., Mglinets A.V., Shatskaya N.V., Kosterin O.E., Vasiliev G.V. PloS One, 2015, 10(3): e0119835.
Results of multicenter double-blind placebocontrolled phase II clinical trial of Panagen preparation to evaluate its leukostimulatory activity and formation of the adaptive immune response in patients with stage II-IV breast cancer Anastasia S Proskurina, Tatiana S Gvozdeva, Ekaterina A Alyamkina, Evgenia V Dolgova, Konstantin E Orishchenko, Valeriy P Nikolin, Nelly A Popova, Sergey V Sidorov, Elena R Chernykh, Alexandr A Ostanin, Olga Y Leplina, Victoria V Dvornichenko, Dmitriy M Ponomarenko, Galina S Soldatova, Nikolay A Varaksin, Tatiana G Ryabicheva, Stanislav N Zagrebelniy, Vladimir A Rogachev, Sergey S Bogachev and Mikhail A Shurdov BMC CANCER, 2015, 15:122 DOI 10.1186/s12885-015-1142-z
2014
Regulatory transcription factors can control the process of transcription at the stage of pre-mRNA elongation Merkulov V.M., Merkulova T.I. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2014, V. 4. Issue 6, P. 549-555.
Immunotherapy of hepatocellular carcinoma with small double-stranded RNA Kabilova T.O., Kovtonyuk L.V., Zonov I.V., Ryabchikova E.I., Popova N.A., Nikolin V.P.,Kaledin V.I., Zenkova M.A., Vlassov V.V., Chernolovskaya E.L. BMC CANCER, 2014, Vol. 14, P. 338-349
Program complex SNP-MED for analysis of single-nucleotide polymorphism (SNP) effects on the function of genes associated with socially significant diseases N. L. Podkolodnyy, D. A. Afonnikov, Yu. Yu. Vaskin, L.O. Bryzgalov, V. A. Ivanisenko, P. S. Demenkov, M.P. Ponomarenko, D.A. Rasskazov, K. V. Gunbin, I. V. Protsyuk, I.Yu. Shutov, P.N. Leontyev, M.Yu. Fursov, N.P. Bondar, E.V. Antontseva, T.I. Merkulova, and N.A. Kolchanov Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2014, Vol. 4, No. 3, pp. 159–167.
Mutagen activation and carcinogenicity of aminoazodyes of ortho-aminoazotoluene and 3'-methyl- 4-dimethylaminoazobenzene in experiments on suckling mice Kaledin V.I., Il'nitskaya S.I., Ovchinnikova L.P., Popova N.A., Bogdanova L.A., Morozkova T.S. BIOPHYSICS, 2014, volume 59, issue 3, pages 527-532
Application of experimentally verified transcription factor binding sites models for computational analysis of ChIP-Seq data Victor G Levitsky, Ivan V Kulakovskiy, Nikita I Ershov, Dmitry Yu Oschepkov, Vsevolod J Makeev, T C Hodgman, Tatyana I Merkulova BMC GENOMICS, 2014, 15:80
Senescence-accelerated OXYS rats: A model of age-related cognitive decline with relevance to abnormalities in Alzheimer disease Stefanova NA, Kozhevnikova OS, Vitovtov AO, Maksimova KY, Logvinov SV, Rudnitskaya EA, Korbolina EE, Muraleva NA, Kolosova NG. CELL CYCLE, 2014, 2014 Feb 17;13(6)
Подавление сульфоконьюгации снижает защитное действие орто-аминоазотолуола на гепатоканцерогенез, индуцированный у мышей диэтилнитрозамином В.И.Каледин, С.И.Ильницкая, Н.А.Попова, Л.А.Богданова B EXP BIOL MED+, 2014, том 157, №3, стр. № 348-351
Effects of Antagonists of Mu and Kappa Opioid Receptors on Aggressivity in Male Mice with Repeated Experience of Aggression Bondar N.P. Neuroscience Behavioral Physiology, 2014, March 2014, Volume 44, Issue 3, pp 331-338
Мутагенная активация и канцерогенность аминоазокрасителей орто-аминоазотолуола и 3'-метил - 4-диметилазобензола в опытах на подсосных мышатах В.И. Каледин, С.И.Ильницкая, Л.П.Овчинникова, Н.А.Попова, Л.А.Богданова, Т.С.Морозкова BIOPHYSICS, 2014, том.59, вып.3, стр.527-532
The mechanism by which TATA-box polymorphisms associated with human hereditary diseases influence interactions with the TATA-binding protein. Drachkova I.A., Savinkova L.K., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Peltek S.E., Kolchanov N.A. HUM MUTAT, 2014, 5, 35, 601-608
Identification of thyroid hormone receptor homologs in the fluke Opisthorchis felineus (Platyhelminthes). Pakharukova MY, Ershov NI, Vorontsova EV, Shilov AG, Merkulova TI, Mordvinov VA. MOL BIOCHEM PARASIT, 2014, 194, 64–68
Senescence - Accelerated OXYS Rats: A Genetic Model of Premature Aging and Age - Related Diseases N. G. Kolosova, N. A. Stefanova, E. E. Korbolina,
A. Zh. Fursova, and O. S. Kozhevnikova Adv. Gerontol, 2014, Vol. 4, No. 4, pp. 294–298.
Ингибирующее влияние орто-аминоазотолуола на гепатоканцерогенное действие диэтилнитрозамина у подсосных мышей, феномен и возможный механизм. Каледин В.И., Ильницкая С.И., Попова Н.А., Багинская Н.В., Богданова Л.А., Перепечаева М.Л., Гришанова А.Ю. BIOPHYSICS, 2014, том. 59, вып. 4, стр. 776-784
Position of an Active Thiosulfonate Group in New Phenolic Antioxidants is Critical for ARE-Mediated Induction of GSTP1 and NQO1 V.A. Vavilin, A.B. Shintyapina, O.G. Safronova, E.V. Antontseva, V.A. Mordvinov, M.V. Nikishina, N.V. Kandalintseva, A.E. Prosenko, V.V. Lyakhovich JPSR, 2014, 6(4), 178-183
Suppression of sulfoconjugation reduces the protective effect of ortho-aminoazotoluene on hepatocarcinogenesis induced by diethylnitrosamin in mice V.I.Kaledin, S.I. Il'nitskaya, N.A.Popova, L.A.Bogdanova B EXP BIOL MED+, 2014, Vol.157, No.3, P.368-370
Identification of cancer stem cells and a strategy for their elimination Dolgova EV, Alyamkina EA, Efremov YR, Nikolin VP, Popova NA, Tyrinova TV, Kozel AV, Minkevich AM, Andrushkevich OM, Zavyalov EL, Romaschenko AV, Bayborodin SI, Taranov OS, Omigov VV, Shevela EY, Stupak VV, Mishinov SV, Rogachev VA, Proskurina AS, Mayorov VI, Shurdov MA, Ostanin AA, Chernykh ER, Bogachev SS. CANCER BIOL THER, 2014, 15(10): 1378-1394
Геномика Васильев Геннадий Владимирович Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Т.18. №1. С.158-165.
ДИНАМИКА ЭКСПРЕССИИ ЦИТОКИНА IL-12 В МАКРОФАГАХ ЧЕЛОВЕКА ПОСЛЕ ИХ ОБРАБОТКИ ДИОКСИНОМ Д.Ю. Ощепков, Е.В. Кашина, Е.В. Антонцева, Е.А. Ощепкова, В.А. Мордвинов, Д.П. Фурман Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 2, 354-362
Двойственное влияние ингибиторов индол-2,3-диоксигеназы на терапевтическое действие циклофосфана и циклоплатама в отношении асцитной опу-холи Эрлиха у мышей Богданова Л. А., Морозкова Т. С., Амитина С. А., Мажукин Д. Г., Николин В. П., Попова Н. А., Каледин В. И. B EXP BIOL MED+, 2014, Т. 157. № 4. С. 507-510
Dual effects of indoleamine 2,3-dioxygenase inhibitors on the therapeutic effects of cyclophosphamide and cycloplatam on ehrlich ascites tumor in mice. Bogdanova LA1, Morozkova TS, Amitina SA, Mazhukin DG, Nikolin VP, Popova NA, Kaledin VI. B EXP BIOL MED+, 2014, 157(4):506-9
Analysis of the Placental Tissue Transcriptome of Normal and Preeclampsia Complicated Pregnancies E. A. Trifonova, T. V. Gabidulina, N. I. Ershov, V. N. Serebrova, A. Yu. Vorozhishcheva, V. A. Stepanov Acta Naturae, 2014, 6(2): 71–83
Real-Time Interaction between ТВР and the TATA Box of the Human Triosephosphate Isomerase Gene Promoter in the Norm and Pathology Arkova OV, Kuznetsov NA, Fedorova OS, Kolchanov NA, Savinkova LK Acta Naturae, 2014, v.6(2), 36-40
Сниженный уровень экспрессии генов, контролирующих тонус сосудов в почках крыс НИСАГ со стресс-зависимой артериальной гипертензией. О.Е. Редина, Л.О. Климов, Н.И. Ершов, Т.О. Абрамова, Л.Н. Иванова, А.Л. Маркель. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Т. 18. N. 4/2, C. 910-919.
Dynamics of IL12 Cytokine Expression in Human Macrophages after Dioxin Exposure D. Y. Oshchepkov, E. V. Kashina, E. V. Antontseva, E. A. Oshchepkova, V. A. Mordvinov, and D. P. Furman Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2014, Vol. 4, No. 6, pp. 568–574
ChIP-seq данные и их анализ Орлов Ю.Л., Васильев Г.В., Кулакова Е.В., Колчанов Н.А. Молекулярная и прикладная генетика, 2014, Молекулярная и прикладная генетика. Сб. науч. тр. Институт генетики и цитологии НАН Беларуси. Т. 18. С.84 -97.
rSNP_Guide-based evaluation of SNPs in promoters of the human APC and MLH1 genes associated with colon cancer D. A. Rasskazov, E. V. Antontseva, L. O. Bryzgalov, M. Yu. Matveeva, E. V. Kashina, P. M. Ponomarenko, G. V. Orlova, M. P. Ponomarenko, D. A. Afonnikov, T. I. Merkulova Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2014, July 2014, Volume 4, Issue 4, pp 245-253
2013
Проагрессивный эффект диазепама на самцов мышей с повторным опытом агрессии Григорьева А.Е., Смагин Д.А., Бондарь Н.П., Галямина А.Г., Кудрявцева Н.Н Журнал высшей нервной деятельности, 2013, 64(4): 486-494
Регуляторные коды транскрипции геномов эукариот Т. И. Меркулова, Е. А. Ананько, Е. В. Игнатьева, Н. А. Колчанов RUSS J GENET+, 2013, том 49, № 1, с. 37–54
An experimental verification of the predicted effects of promoter TATA-box polymorphisms associated with human diseases on interactions between the TATA-boxes and TATA-binding protein. Savinkova L.K., Drachkova I.A., Arshinova T.V., Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A. PloS One, 2013, 2, 8, e54626
Effect of human double-stranded DNA preparation on the production of cytokines by dendritic cells and peripheral blood cells from relatively healthy donors Orishchenko KE, Ryzhikova SL, Druzhinina YG, Ryabicheva TG, Varaksin NA, Alyamkina EA, Dolgova EV, Rogachev VA, Proskurina AS, Nikolin VP, Popova NA, Strunov AA, Kiseleva EV, Leplina OY, Ostanin AA, Chernykh ER, Sidorov SV, Mayorov VI, Bogachev SS, Shurdov MA. Cancer Therapy, 2013, V. 8, p. 191-205
Rat retinal transcriptome: Effects of aging and AMD-like retinopathy. Kozhevnikova OS, Korbolina EE, Ershov NI, Kolosova NG CELL CYCLE, 2013, May 6;12(11). Pages 1745 - 1761
Иммуномодулирующее влияние этилпирувата на несингенную перевиваемую опухоль мышей Л.А. Богданова, Т.С. Морозкова, В.И. Каледин, В.П. Николин, Н.А. Попова B EXP BIOL MED+, 2013, т.155, № 6, стр. 750-752
Ligand-Directed Acid-Sensitive Amidophosphate 5-Trifluoromethyl-2 '-Deoxyuridine Conjugate as a Potential Theranostic Agent Godovikova, TS ; Lisitskiy, VA ; Antonova, NM ; Popova, TV ; Zakharova, OD; Chubarov, AS ; Koptyug, IV ; Sagdeev, RZ ; Kaptein, R ; Akulov, AE ; Kaledin, VI ; Nikolin, VP ; Baiborodin, SI ; Koroleva, LS ; Silnikov, VN BIOCONJUGATE CHEM, 2013, Volume: 24 Issue: 5 Pages: 780-795 DOI: 10.1021/bc3006072 Published: MAY 2013
Характеристика изменения количества умеренных повторов в геноме клеток костного мозга экспериментальных мышей на фоне инъекции циклофосфана и экзогенной ДНК человека Долгова Е.В., Прокопенко А.В., Николин В.П., Попова Н.А., Проскурина А.С., Орищенко К.Е., Алямкина Е.А., Ефремов Я.Р., Черных Е.Р., Останин А.А., Богачев С.С., Гвоздева Т.С., Малкова Е.М., Таранов О.С., Рогачев В.А., Панов А.В., Загребельный С.Н., Шурдов М.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Т. 17, № 2, стр. 246-264
Adult Opisthorchis felineus major protein fractions deduced from transcripts: Comparison with liver flukes Opisthorchis viverrini and Clonorchis sinensis. Pomaznoy M., Tatkov S., Katokhin A., Afonnikov D., Babenko V., Furman D., Brusentsov I., Belavin P., Najakshin A., Guselnikov S., Vasiliev G., Sivkov A., Prokhortchouk E., Skryabin K., Mordvinov V. EXP PARASITOL, 2013, 135, 297-306. doi:10.1016/j.exppara.2013.07.011
Защитное действие темпола при облысении, вызываемом циклофосфамидом у мышей. ПОПОВА Н.А., НИКОЛИН В.П., КАЛЕДИН В.И., КИРИЛЮК И.А., ГРИГОРЬЕВ И.А. Сибирский онкологический журнал, 2013, 2013. № 4 С. 57-59
Reduction of serotonergic gene expression in the raphe nuclei of the midbrain under positive fighting experience in male mice D. Smagin, U. Boyarskikh, N. Bondar, M. Filipenko, N. Kudryavtseva Advances in Bioscience and Biotechnology, 2013, Vol.4 No.10B, October 2013
Проагрессивный эффект диазепама на самцов мышей с повторным опытом агрессии Григорьева А.Е., Смагин Д.А., Бондарь Н.П., Галямина А.Г., Кудрявцева Н.Н. Журнал высшей нервной деятельности, 2013, 63(4): 486-494
Downregulation of Serotonergic Gene Expression in the Raphe Nuclei of the Midbrain Under Chronic Social Defeat Stress in Male Mice Boyarskikh U.A., Bondar N.P., Filipenko M.L., Kudryavtseva N.N. MOL NEUROBIOL, 2013, 48(1): 13-21
Delivery and processing of exogenous double-stranded DNA in mouse CD34 + hematopoietic progenitor cells and their cell cycle changes upon combined treatment with cyclophosphamide and double-stranded DNA Dolgova EV, Efremov YR, Orishchenko KE, Andrushkevich OM, Alyamkina EA, Proskurina AS, Bayborodin SI, Nikolin VP, Popova NA, Chernykh ER, Ostanin AA, Taranov OS, Omigov VV, Minkevich AM, Rogachev VA, Bogachev SS, Shurdov MA. GENE, 2013, V. 528, N 2, p. 74-83
Detection of Regulatory SNPs in Human Genome Using ChIP-seq ENCODE Data Leonid O. Bryzgalov, Elena V. Antontseva, Marina Yu. Matveeva, Alexander G. Shilov, Elena V. Kashina, Viatcheslav A. Mordvinov, Tatyana I. Merkulova PloS One, 2013, Volume 8, Issue 10, e78833
Potentialities of aberrantly methylated circulating DNA for diagnostics and post-treatment follow-up of lung cancer patients. Ponomaryova AA, Rykova EY, Cherdyntseva NV, Skvortsova TE, Dobrodeev AY, Zav'yalov AA, Bryzgalov LO, Tuzikov SA, Vlassov VV, Laktionov PP. LUNG CANCER, 2013, 2013 Sep;81(3):397-403. doi: 10.1016/j.lungcan.2013.05.016. Epub 2013 Jun 24.
From binding motifs in ChIP-Seq data to improved models of transcription factor binding sites. Kulakovskiy I, Levitsky V, Oshchepkov D, Bryzgalov L, Vorontsov I, Makeev V. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, 2013 Feb;11(1):1340004. doi: 10.1142/S0219720013400040. Epub 2013 Jan 16.
Влияние диазепама на смешанное тревожно-депрессивное расстройство у самцов мышей А.Г. Галямина, Д.А. Смагин, И.Л. Коваленко, Н.П. Бондарь, Н.Н. Кудрявцева Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2013, 99(11): 1240-1249
Стабильная липосомальная лекарственная форма комплексных соединений платины для воздействия на метастазы опухолей в печени. Попова Н.А., Каледин В.И., Николин В.П., Морозкова Т.С. 2013 г. Высокие технологии, фундаментальные и при-кладные исследования в физиологии и медицине» СПб, Издательство политехнического университета, 2013, С.165-168.
Dioxin-mediated regulation of genes involved in cytokines production by macrophages. E.V.Kashina, D.Y. Oshchepkov, E.V.Antontseva, E.A. Oshchepkova, M.Y. Shamanina, D.P. Furman and V.A. Mordvinov. FEBS J, 2013, 280 (Suppl. 1) p. 459–460
Immunomodulating effect of ethyl piruvate on nonsyngenic transplanted tumor in mice L.A.Bogdanova, T.S.Morozkova, V.I.Kaledin, V.P.Nikolin, N.A. Popova B EXP BIOL MED+, 2013, V. 155, N 6, P. 785-788
Программный комплекс SNP-MED для анализа влияния однонуклеотидных полиморфизмов на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, Ю.Ю. Васькин, Л.О. Брызгалов, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, М.П. Пономаренко, Д.А. Рассказов, К.В. Гунбин, И.В. Процук, И.Ю. Шутов, П.Н. Леонтьев, М.Ю. Фурсов, Н.П. Бондарь, Е.В. Антонцева, Т.И. Меркулова, Н.А. Колчанов. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, том 17, №4/1, с.577-588
Характеристика лейкостимулирующего и противоракового действия препарата «Панаген» на основе фрагментированной двуцепочечной ДНК человека в эксперименте и при клиническом применении. I. Лейкостимулирующее и противораковое действие препарата в экспериментальных условиях. Проскурина А.С., Алямкина Е.А., Долгова Е.В., Николин В.П., Попова Н.А., Гвоздева Т.С., Орищенко К.Е., Сидоров С.В., Черных Е.Р., Останин А.А., Леплина О.Ю., Дворниченко В.В., Пономаренко Д.М., Солдатова Г.С., Вараксин Н.А., Рябичева Т.Г., Загребельный С.Н., Рогачев В.А., Богачев С.С., Шурдов М.А. Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2013, Том 11, выпуск 4, стр. 67-82
Характеристика лейкостимулирующего и противоракового действия препарата «Панаген» на основе фрагментированной двуцепочечной ДНК человека в эксперименте и при клиническом применении. II. Лейкостимулирующее и противораковое действие препарата при клиническом применении. Гвоздева Т.С., Проскурина А.С., Орищенко К.Е., Сидоров С.В., Черных Е.Р., Останин А.А., Леплина О.Ю., Дворниченко В.В., Пономаренко Д.М., Солдатова Г.С., Вараксин Н.А., Рябичева Т.Г., Загребельный С.Н., Николин В.П., Попова Н.А., Рогачев В.А., Алямкина Е.А., Долгова Е.В., Богачев С.С., Шурдов М.А. Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2013, Том 11, выпуск 4, стр. 83-90
ОЦЕНКА ПО ТЕХНОЛОГИИ rSNP_Guide SNPs ПРОМОТОРОВ ГЕНОВ АРС И МLH1 ЧЕЛОВЕКА, СВЯЗАННЫХ С РАКОМ ТОЛСТОГО КИШЕЧНИКА Д.А. Рассказов, Е.В. Антонцева, Л.О. Брызгалов,М.Ю. Матвеева, Е.В. Кашина, П.М. Пономаренко, Г.В. Орлова, М.П. Пономаренко, Д.А. Афонников, Т.И. Меркулова Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Том 17, No 4/1, 589-598
Pathological changes in mice treated with cyclophosphamide and exogenous DNA Dolgova EV, Nikolin VP, Popova NA, Proskurina AS, Orishchenko KE, Alyamkina EA, Efremov YR, Baiborodin SI, Chernykh ER, Ostanin AA, Bogachev SS, Gvozdeva TS, Malkova EM, Taranov OS, Rogachev VA, Panov AS, Zagrebelnyi SN, Shurdov MA. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2013, V.3, N 4, p. 291-304
2012
Glucocorticoid receptor isoforms generated by alternative splicing and alternative translation initiation Merkulov V.M., Merkulova T.I. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, V. 2, Issue 3, P. 205-213.
Expression of Ext1, Ext2, and heparanase genes in brain of senescence-accelerated OXYS rats in early ontogenesis and during development of neurodegenerative changes. Shevelev OB, Rykova VI, Fedoseeva LA, Leberfarb EY, Dymshits GM, Kolosova NG BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2012, 77(1):56-61.
Cytochrome P450 in fluke Opisthorchis felineus: Identification and characterization. Pakharukova MY, Ershov NI, Vorontsova EV, Katokhin AV, Merkulova TI, Mordvinov VA MOL BIOCHEM PARASIT, 2012, V. 181. No. 2. P. 190–194
Метаболит циклофосфамида, запускающий апоптоз в клетках лимфосаркомы мыши RLS, является субстратом для Р-гликопротеина. Патутина О., Миронова Н., Логашенко Е., Попова Н., Николин В., Васильев Г., Каледин В., Зенкова М., Власов В. B EXP BIOL MED+, 2012, т. 152.№ 9. С. 318-322
Quantitative trait loci on chromosome 1 for cataract and AMD-like retinopathy in senescence-accelerated OXYS rats Elena E. Korbolina, Ouyna S. Kozhevnikova, Nataliya A. Stefanova, and Natalia G. Kolosova AGING-US, 2012, Aging (Albany NY). 2012 Jan 31. Vol.4 No.1 P.49-59
"Delayed death" phenomenon: A synergistic action of cyclophosphamide and exogenous DNA Dolgova EV, Proskurina AS, Nikolin VP, Popova NA, Alyamkina EA, Orishchenko KE, Rogachev VA, Efremov YR, Dubatolova TD, Prokopenko AV, Chernykh ER, Ostanin AA, Taranov OS, Omigov VV, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA GENE, 2012, V. 495, p. 134-145
Экспрессия Ext1, Ext2 и гепараназы в мозге преждевременно стареющих крыс OXYS в период раннего онтогенеза и развития нейродегенеративных изменений. Шевелев О.Б., Рыкова В.И., Федосеева Л.А., Леберфарб Е.Ю., Дымшиц Г.М., Колосова Н.Г. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2012, том 77, вып. 1, с. 71 – 78.
Short double-stranded RNA with immunostimulatory activity: sequence dependence. Kabilova TO, Meschaninova MI, Venyaminova AG, Nikolin VP, Zenkova MA, Vlassov VV, Chernolovskaya EL. NUCLEIC ACID THER, 2012, 22(3):196-204.
Effects of human exogenous DNA on production of perforin-containing CD8+ cytotoxic lymphocytes in laboratory setting and clinical practice. Alyamkina EA, Leplina OY, Ostanin AA, Chernykh ER, Nikolin VP, Popova NA, Proskurina AS, Gvozdeva TS, Dolgova EV, Orishchenko KE, Rogachev VA, Sidorov SV, Varaksin NA, Ryabicheva TG, Bogachev SS, Shurdov MA. CELL IMMUNOL, 2012, V. 276, P. 59-66
Продигиозин Serratia marcescens подавляет in vitro развитие чувствительного и устойчивого к хлорохину штаммов малярийного паразита грызунов Plasmodium berghei А.Б.Дужак, З.И.Панфилова, Т.Г.Панкова, Т.М.Игонина, О.Д.Захарова, Е.А.Васюнина биофармацевтический журнал, 2012, Т.4, №2, С.7-13
Интернализация экзогенной ДНК во внутренние компартменты клеток костного мозга мышей Долгова Е.В., Николин В.П., Попова Н.А., Проскурина А.С., Орищенко К.Е., Алямкина Е.А., Ефремов Я.Р., Черных Е.Р., Останин А.А., Малкова Е.М., Таранов О.С., Рогачев В.А., Сидоров С.В., Богачев С.С., Шурдов М.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т. 16, №2, стр. 397-414
RatDNA: база данных микрочиповых исследований на крысах для генов, ассоциированных с заболеваниями старения О.С. Кожевникова, М.К. Мартыщенко, М.А. Генаев, Е.E. Корболина, Н.А. Муралева, Н.Г. Колосова, Ю.Л. Орлов Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Том 16, № 4/1, С. 756-765
Search for regulatory SNPs associated with colon cancer in the APC and MLH1 genes E. V. Antontseva, L. O. Bryzgalov, M. Yu. Matveeva, E. V. Kashina, N. V. Cherdyntseva and T. I. Merkulova Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, V. 2, No. 3. P. 222-228.
Влияние антагонистов мю-и каппа-опиоидных рецепторов на агрессивность самцов мышей с повторным опытом агрессии Бондарь Н.П. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2012, Т.98 №6 с. 681-692
ИЗУЧЕНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ТАТА-СВЯЗЫВАЮЩЕГО БЕЛКА ЧЕЛОВЕКА С ТАТА-ЭЛЕМЕНТОМ ПРОМОТОРА ГЕНА NOS2A С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДА ПОВЕРХНОСТНОГО ПЛАЗМОННОГО РЕЗОНАНСА Драчкова И.А., Шеховцов С.В., Пельтек С.Е., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Аршинова Т.В., Меркулова Т.И., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, т. 16, № 2, с. 391-396
Влияние психоэмоционального состояния на метастазирование карциномы легких льюисаc Амикишиева А.В., Ильницкая С.И., Николин В.П., Попова Н.А., Каледин В.И. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2012, 98(3):417-23.
Unbiased approach to profile the variety of small non-coding RNA of human blood plasma with massively parallel sequencing technology. Semenov DV, Baryakin DN, Brenner EV, Kurilshikov AM, Vasiliev GV, Bryzgalov LA(LO), Chikova ED, Filippova JA, Kuligina EV, Richter VA. Expert Opin Biol Ther., 2012, Suppl 1:S43-51
Triterpenoid saponins from the roots of Acanthophyllum gypsophiloides Regel. Khatuntseva EA, Men'shov VM, Shashkov AS, Tsvetkov YE, Stepanenko RN, Vlasenko RY, Shults EE, Tolstikov GA, Tolstikova TG, Baev DS, Kaledin VA, Popova NA, Nikolin VP, Laktionov PP, Cherepanova AV, Kulakovskaya TV, Kulakovskaya EV, Nifantiev NE. BEILSTEIN J ORG CHEM, 2012, 8:763-75.
Influence of femtosecond laser radiation on cells of the transplantable tumour Krebs-2 Yu P Meshalkin, ab N A Popova, bc V P Nikolin, c V I Kaledin, c A V Kirpichnikov, a E V Pestryakov QUANTUM ELECTRON+, 2012, Volume 42 Number 6 Pages 505–508
Изучение взаимодействия TBP человека с ТАТА-элементом промотора гена NOS2A с использованием метода поверхностного плазмонного резонанса И.А. Драчкова, C.В. Шеховцов, С.Е. Пельтек, П.М. Пономаренко, Т.В. Аршинова, М.П. Пономаренко, Т.И. Меркулова, Л.К. Савинкова, Н.А. Колчанов Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 2, 16, 391-396
Nanocomposites consisting of titanium dioxide nanoparticles and oligonucleotides. Levina A, Ismagilov Z, Repkova M, Shatskaya N, Shikina N, Tusikov F, Zarytova V. J NANOSCI NANOTECHNO, 2012, Mar;12(3):1812-20.
Усиление общетоксического и ослабление гепатоканцерогенного действия диэтилнитрозамина при введении его в смеси с изопропанолом Каледин В.И., Багинская Н.В., Васюнина Е.А., Ильницкая С.И., Овчинникова Л.П. Вопросы онкологии, 2012, том 56, н.5, стр.658-662
Accelerated rejection of the second transplants of immunogenic tumor in mice under inhibition of indoleamine 2,3-dioxygenase activity by ethyl pyruvate E.D. Vasilyeva, V. Kaledin, V.P. Nicolin, N.A. Popova*, I.A. Kirilyuk, I.A. Grigor’ev Experimental oncology, 2012, 34,№ 1. 286–288, 2012
Possible link between the synthesis of GR alpha isoforms and eIF2 alpha phosphorylation state. Kochetov AV, Merkulova TI, Merkulov VM MED HYPOTHESES, 2012, V 79. P. 709-712
Влияние 2,3,7,8-тетрахлордибензо-пара-диоксина на регуляцию экспрессии IL12A, IL12B и IL4 генов человека, экспрессирующихся в макрофаге. Кашина Е.В., Ощепков Д.Ю., Антонцева Е.В., Ощепкова Е.А., Фурман Д.П., Мордвинов В.А Медицинский академический журнал, 2012, Приложение 2012. С. 380-382.
Influence of atovastatin and carboxymethylated glucan on the serum lipoprotein profile and MMP activity of mice with lipemia induced by poloxamer 407 Korolenko TA, Tuzikov FV, Cherkanova MS, Johnston TP, Tuzikova NA, Loginova VM, Filjushina EE, Kaledin VI CAN J PHYSIOL PHARM, 2012, 90(2):141-53
Internalization of exogenous DNA into internal compartments of murine bone marrow cells Dolgova EV, Nikolin VP, Popova NA, Proskurina AS, Orishenko KE, Alyamkina EA, Efremov YR, Chernykh ER, Ostanin AA, Malkova EM, Taranov OS, Rogachev VA, Sidorov SV, Bogachev SS, Shurdov MA Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, V. 2, N 6, P. 440-452
Мутагенная активация снижает канцерогенность орто-аминоазотолуола для печени мышей Овчинникова Л.П., Богданова Л.А., Каледин В.И. B EXP BIOL MED+, 2012, № 11, Т. 154, стр.623-628
2011
Analysis and recognition of the GAGA transcription factor binding sites in Drosophila genes Omelina E.S., Baricheva E.M., Oshchepkov D.Yu., Merkulova T.I. COMPUT BIOL CHEM, 2011, V. 35, № 6, P. 363-370
Разработка методов распознования сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA, их экспериментальная верификация и использование для анализа данных массовой иммунопреципитации хроматина Левицкий В. Г., Ощепков Д. Ю., Ершов Н. И., Брызгалов Л. О., Антонцева Е. В., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А. Doklady Akademii Nauk, 2011, Т. 436, № 3, - С.417-421.
Analysis of Data on Large Scale Chromatin Immunoprecipitation by Recognition of Transcription Factor Binding Sites VG Levitskii, GV Vasil’ev, DYu Oshchepkov, NI Ershov, and TI Merkulova Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, V. 1, N. 3, P. 173–182
Изменение сродства ТАТА-связывающего белка к олигонуклеотидам, соответствующим ТАТА-боксам промоторов генов человека, несущим полиморфизмы, ассоциированные с наследственными заболеваниями Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, № 3, т. 15, стр. 439-447
In vitro examining the existing prognoses how TBP binds to TATA with SNP associated with human diseases Drachkova I.A., Ponomarenko P.M., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Suslov V.V., Savinkova L.K., Kolchanov N.A. Health, 2011, 3, 9, 577-583
Полиморфизм гена HFE у населения Северной Азии Михайлова С.В., Ромащенко А.Г., Бабенко В.Н., Губина М.А., Соболева Д.Е., Кобзев В.Ф., Воевода М.И Вестник РАМН, 2011
Ortho-aminoazotoluene activates mouse constitutive androstane receptor (mCAR) and increases expression of mCAR target genes. Smetanina MA, Pakharukova MY, Kurinna SM, Dong B, Hernandez JP, Moore DD, Merkulova TI. TOXICOL APPL PHARM, 2011, V. 255(1):P. 76-85.
Азосоединения ОАТ и 3'МеДАБ одинаково вызывают опухоли печени у мышей линии GR, но по-разному влияют на активность транскрипционных факторов FoxA Пахарукова М.Ю., Сметанина М.А., Ильницкая С.И., Каледин В.И., Меркулова Т.И. B EXP BIOL MED+, 2011, Том 152, № 7. С. 109-112.
Effect of vasopressin V1 receptor antagonist, SSR149415, on anxiety-like behavior and Lewis lung carcinoma metastasis in mice. Amikishieva A. V. Ilnitskaya S.I., Nikolin V. P.,Popova N. A. Experimental oncology, 2011, V.33.№ 3. P. 1-4
Полиморфизм второго интрона гена SDF1 у галловейской, герефордской и черно-пестрой пород крупного рогатого скота Юдин Н.С., Нефедова М.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2011, Том 47, № 2, стр. 279-283
Ассоциация полиморфизма гена холодового рецептора TRPM8 с липидными показателями крови и антропометрическими параметрами у шорцев Потапова Т.А., Юдин Н.С., Пилипенко И.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Шахтшнейдер Е.В., Огарков М.Ю., Воевода М.И. B EXP BIOL MED+, 2011, №2, стр. 186-190
All signs of the metabolic syndrome in hypertensive ISIAH rats are associated with increased activity of the transcription factors PPAR, LXR, PXR, and CAR in the liver. Е. N. Pivovarova, М. I. Dushkin, M. L. Perepechaeva, V .F. Коbzev, V. А. Тrufakin, А. L. Маrkel BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2011, v.5, N1, P. 29-36. DOI 10.1134/S1990750811010082
OAT and 3’MeDAB Azo Compounds Similarly Cause Liver Tumors in GR Mice, but Differently Modify Activities of FoxA Transcription Factors M. Yu. Pakharukova, M. A. Smetanina, S. I. Ilnitskaya, V. I. Kaledin, and T. I. Merkulova B EXP BIOL MED+, 2011, Vol. 152, No. 1, November, 2011 ONCOLOGY, PP. 101-104. (DOI) 10.1007/s10517-011-1465-y
Торможение метаболизма стимулирует, а активация метаболизма ингибирует канцерогенное действие орто-аминоазотолуола на печень мышей В.И.Каледин, С.И.Ильницкая Вопросы онкологии, 2011, том 57, №2,стр.216-220
Effect of vasopressin V1B receptor antagonist, SSR149415, on anxiety-like behavior and Lewis lung carcinoma metastasis in mice A.V.Amikishieva, S.I. Ilnitskaya, V.P.Nikolin, N.A,Popova Experimental oncology, 2011, V.33, №3, P.126-129
Inhibition of metastasis development by daily administration of ultralow doses of RNase A and DNase I O.Patutina , N. Mironova , E.Ryabchikova , N. Popova , V.Nikolin , V. Kaledin , V.Vlassov , M.Zenkova BIOCHIMIE, 2011, v 93, P. 689-696
Поиск регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстой кишки, в генах АРС и МLH1. Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Матвеева М.Ю., Кашина Е.В., Чердынцева Н.В., Меркулова Т.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, том 15, №4, с.644-652
Характеристика временных параметров проявления эффекта токсического действия инъекций экзогенной ДНК на фоне предобработки цитостатиком циклофосфаном Долгова Е.В., Проскурина А.С., Николин В.П., Попова Н.А., Алямкина Е.А., Орищенко К.Е., Шилов А.Г., Ефремов Я.Р., Черных Е.Р., Останин А.А., Богачев С.С., Прокопенко А.В., Малкова Е.М., Таранов О.С., Гвоздева Т.С., Рогачев В.А., Загребельный С.Н., Шурдов М.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Т. 15, № 4, С. 674-689
Все признаки метаболического синдрома у гипертензивной линии крыс НИСАГ ассоциируются с повышенной активностью факторов транскрипции PPAR, LXR, PXR и CAR в печени Пивоварова Е.Н., Душкин М.И., Перепечаева М.Л., Кобзев В.Ф., Труфакин В.А., Маркель А.Л. Биомедицинская химия, 2011, №4, Т.57, С.435-445
2010
Нитроксильный антиоксидант ТРРФ-ТЕМПО повышает эффективность противоопухолевой терапии на модели перевиваемой лимфосаркомы мышей Кирилюк И.А.,Каледин В. И., Попова Н. А., Николин В. П.,Васильева Е. Д., Григорьев И. А., Лушникова Е. Л. , Непомнящих Л. М. B EXP BIOL MED+, 2010, № 7. С. 85-89
Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека, связанный с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита, в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Molecular Biology, 2010, Т.44, №6. С. 985-993.
Полиморфизмы ТАТА-боксов генов хозяйственно важных и лабораторных животных и растений, ассоциированные с их селекционно-ценными признаками Суслов В.В., Пономаренко П.М, Пономаренко М.П, Драчкова И.А., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. RUSS J GENET+, 2010, 4, 46, 448-457
Распространение свиных эндогенных ретровирусов у разных форм Sus scrofa L. 1758 (Suidae, Mammalia) Айтназаров Р.Б., Никитин С.В., Князев С.П., Кобзев В.Ф., Бекенев В.А., Деева В.С., Гончаренко Г.М., Юдин Н.С., Ермолаев В.И. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2010, №9, стр. 49-54.
Редкое сочетание двух новых однонуклеотидных полиморфизмов в интроне 16 гена рецептора рианодина RYR1 у свиней кемеровской породы Юдин Н.С., Князев С.П., Айтназаров Р.Б., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Игнатьева Е.В., Никитин С.В., Ермолаев В.И. Информационный вестник ВОГИС, 2010, №1, Т.14, С. 116-121
Точное уравнение равновесия для четырех шагов связывания ТВР с ТАТА-боксом для предсказания фенотипической экспрессии при мутациях Пономаренко П.М., Суслов В.В.,Савинкова Л.К., Пономаренко М.П.,Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2010, 3, 55, 400-414
Экспериментальная проверка функциональной активности потенциальных DRE-сайтов, обнаруженных в промоторах IRF1, REL и IL12A генов человека Е.В. Кашина, Е.В. Антонцева, М.Ю. Шаманина, Е.А. Ощепкова, Д.Ю. Ощепков, А.В. Катохин, А.Ю. Гришанова, Д.П. Фурман, В.А. Мордвинов Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Том 275. С. 353-356.
Экспрессия ядерных рецепторов PPAR, LXR и RXR в печени и показатели липидного и углеводного обмена в крови у чувствительных и резистентных к гепатоканцерогенезу линий мышей Е.Н. Пивоварова, Н.В. Багинская, М.Л. Перепечаева, С.И. Ильницкая, М И. Душкин Биомедицинская химия, 2010, N4, T.56, С. 480-489
Differentiation of wild boar and domestic pig population based on the frequency of chromosomes carring endogenous retroviruses Nikitin S.V., Yudin N.S., Knyazev S.P., Aitnazarov R.B., Bekenev V.A., Deeva V.S., Goncharenko G.M., Kobzev V.F., Savina M.A., Ermolaev V.I. Natural Science, 2010, V.2, N.6, 527-534.
Effect of double-stranded DNA on maturation of dendritic cells in vitro Alyamkina EA, Leplina OY, Sakhno LV, Chernykh ER, Ostanin AA, Efremov YR, Shilov AG, Proskurina AS, Orishchenko KE, Dolgova EV, Rogachev VA, Nikolin VP, Popova NA, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA CELL IMMUNOL, 2010, 266: 46-51
Exogenous allogenic fragmented double-stranded DNA is internalized into human dendritic cells and enhances their allostimulatory activity Alyamkina EA, Dolgova EV, Likhacheva AS, Rogachev VA, Sebeleva TE, Nikolin VP, Popova NA, Kiseleva EV, Orishchenko KE, Sakhno LV, Gel'fgat EL, Ostanin AA, Chernykh ER, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA CELL IMMUNOL, 2010, 262: 120-126
Inhibition of metastasis development by daily administration of ultralow doses of RNase A and DNase I Olga Patutina, PhD; Nadezda Mironova, PhD; Elena Ryabchikova, PhD Prof; Nelly Popova, PhD; Valery Nikolin, PhD MD; Vasily Kaledin, PhD; Valentin Vlassov, Academician; Marina Zenkova, BIOCHIMIE, 2010, Elsevier Editorial System(tm) for Biochimie Manuscript Draft Manuscript Number:: BIOCHI-D-10-00444R1
Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
A strategy of tumor treatment in mice with doxorubicin-cyclophosphamide combination based on dendritic cell activation by human double-stranded DNA preparation Alyamkina EA, Nikolin VP, Popova NA, Dolgova EV, Proskurina AS, Orishchenko KE, Efremov YR, Chernykh ER, Ostanin AA, Sidorov SV, Ponomarenko DM, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA Genetic Vaccines and Therapy, 2010, 8(1): 7
Генная сеть активации макрофага: участие ксенобиотков в регуляции экспрессии генов цитокинов. Ощепкова Е.А., Ощепков Д.Ю., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Цитокины и воспаление, 2010, Т.9, №3, с.49.
SNPs in the HIV-1 and HIV-2 TATA Box and the AIDS pandemic Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Savinkova L.K., Ponomarenko P.M., Efimov V.M., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2010, 3, 8, 607-625.
Liver expression of the nuclear hormone receptors PPAR, LXR, and RXR and blood parameters of lipid and carbohydrate metabolism in strains of mice susceptible and resistant to hepatocarcinogenesis E. N. Pivovarova, N. V. Baginskaya, M. L. Perepechaeva, S. I. Ilnitskaya and M. I. Dushkin BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2010, Volume 4, Number 2, 198-204, DOI: 10.1134/S1990750810020113
The increased CAR-dependent metabolism of thyroid hormones in mice with high cancer susceptibility M. Pakharukova, M. Smetanina, V. Kaledin, T. Obut, T. Merkulova. LIFE SCI, 2010, V. 87, p. 439-444
The siRNA targeted to mdr1b and mdr1a mRNAs in vivo sensitizes murine lymphosarcoma to chemotherapy O.Patutina, N. Mironova, N. Popova, V Kaledin, V Nikolin, V Vlassov and M Zenkova BMC CANCER, 2010, V 10.article number 204. May 2010
Активация конститутивного рецептора андростанов и повышение экспрессии его генов – мишеней в печени мышей под действием ортоаминоазотолуола Сметанина М.А., Пахарукова М.Ю., Меркулова ТИ. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14, №2, С. 320-330
Tumor growth inhibition by combined action of shock waves and cytostatics I.V. Mastikhin, V.S. Teslenko, V.P. Nikolin, N.G. Kolosova, V.N. Gorchakov Book: New Trends in Shock Wave Applications to Medicine and Biotechnology, 2010, Research Singpost 37/661 (2), Fort P.O. Trivandrum-695 023 Kerala, India pp. 151-164. Edit.: Achim M. Loske
Differentiation of Wild and Domestic Swine Populations Estimated by the Frequency of Chromosomes Carrying Endogenous Retroviruses. Nikitin S. V., Yudin N. S., Aitnazarov R. B., Bekenev V. A., Deeva V. S., Goncharenko G. M., Kobzev V. F., Savina M. A., Ermolaev V. I., Knyazev S. P.. Natural Science, 2010, N6. V. 2. P. 527-534.
Анализ результатов эксперимента по массовой иммунопреципитации хроматина с помощью методов распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов Левицкий В.Г., Васильев Г.В., Ощепков Д.Ю., Ершов Н.И., Меркулова Т.И. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14, № 4, С. 685–697
Влияние гепатоканцеpогенноcти эcтpагола на глюкокоpтикоидную индукцию печень-cпецифичныx феpментов и активноcть фактоpов тpанcкpипции Foxа и HNF4 в печени мышей и кpыc В.И. Каледин, М.Ю. Пахарукова, Е.Н. Пивоварова, К.Ю. Кропачев, Н.В. Багинская, Е.Д. Васильева, С.И. Ильницкая, Е.В. Никитенко, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова BIOPHYSICS, 2010, том 55, вып.2, c.326–335
Влияние полиморфизмов ТАТА-бокса промотора гена бета-глобина человека, ассоциированный с бета-талассемией, на взаимодействие ТАТА-связывающего белка Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А., Савинкова Л.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, т.14, с. 698-705
Tumoricidal Activity of RNase A and DNase I. Patutina OA, Mironova NL, Ryabchikova EI, Popova NA, Nikolin VP, Kaledin VI, Vlassov VV, Zenkova MA. Acta Naturae, 2010, 2(1):88-94.
Комплексная оценка генетического полиморфизма хромосомных и внехромосомных маркеров патогенности Salmonella Enterica при помощи пульс-электрофореза Е.В.Дударева, А.В.Тронева, Ю.Г.Юшков, М.Л.Филиппенко, В.А.Афонюшкин, С.В.Леонов, В.Ю.Коптев, В.Т.Вольф, О.В.Аркова, Ю.Н.Козлова Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2010, №1(205)
Ингибирующее влияние о-аминоазотолуола на гепатоканцерогенное действие диэтилнитрозамина при совместном применении у мышей Каледин В.И. , Ильницкая С.И., Багинская Н.В. Вопросы онкологии, 2010, Т.56.- №2.- С.196 – 200
Ингибитор активности индоламин-2,3-диоксигеназы 1-метилD-триптофан может стимулировать рост иммуногенных опухолей Васильева Е. Д., Николин В. П., Попова Н. А., Лушникова Е. Л., В. И. Каледин B EXP BIOL MED+, 2010, № 5.С. 559-561
2009
Лейкостимулирующее действие фрагментов экзогенной ДНК, защищенных протамином, при вызванной циклофосфаном миелосупрессии мышей Е.В. Долгова, В.А. Рогачев, В.П. Николин, Н.А. Попова, А.С. Лихачева, Е.А. Алямкина, Т.Е. Себелева, Е.Р. Черных, Е.Л. Гельфгат, С.С. Богачев, М.А. Шурдов Вопросы онкологии, 2009, № 6, Т. 55, стр. 761-764
Combined therapy with Cyclophosphamide and DNA preparation inhibits the tomor growth in mice Alyamkina EA, Dolgova EV, Likhacheva AS, Rogachev VA, Sebeleva TE, Nikolin VP, Popova NA, Orishchenko KE, Strunkin DN, Chernykh ER, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA. Genetic Vaccines and Therapy, 2009, V. 7, N 1
Полиморфизмы ТАТА-боксов промоторов генов человека и ассоциированные с ними наследственные патологии Cавинкова Л.К., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Колчанов Н.А. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, 2, 74, 149-163
Предсказание влияния полиморфных замен нуклеотидов в ТАТА-боксах промоторов генов человека на сродство к ним ТАТА-связывающего белка Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К.,Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2009, 3, 43, 512-520
Correlation between hepatocarcinogenic effect of estragole and its influence on glucocorticoid induction of liver-specific enzymes and activities of FOXA and HNF4 transcription factors in mouse and rat liver Kaledin V I; Pakharukova M Yu; Pivovarova E N; Kropachev K Yu; Baginskaya N V; Vasilieva E D; Ilnitskaya S I; Nikitenko E V; Kobzev V F; Merkulova T I BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, Volume 74, Number 4, 377-384, DOI: 10.1134/S000629790904004X
Соответствие между гепатоканцерогенным действием эстрагола и его влиянием на глюкокортикоидную индукцию печень-специфичных ферментов и активность факторов транскрипции FoxА и HNF4 в печени мышей и крыс В.И. Каледин, М.Ю. Пахарукова, Е.Н. Пивоварова, К.Ю. Кропачев, Н.В. Багинская, Е.Д. Васильева, С.И. Ильницкая, Е.В. Никитенко, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, том 74, стр. 466-475
Induction of fatty liver by fasting in mouse strains to metabolic syndrome development Baginskaya N.V., Perepechaeva M.L.,Ilnitskaya S.I.,Pivovarova E.N., Kaledin V.I Medical J., 2009, V.3(4).- P.599-600
Limiting effect of diazepam on Lewis lung carcinoma metastasis in anxious male mice Kaledin V.I.,Ilnitskaya S.I.,Nikolin V.P.,Popova N.A.,Smagin D.A., Kudryavtseva N.N Experimental oncology, 2009, V31.№1.P .62-64
Orto-aminoazotoluen induces the expression of the p53 gene in inbred strains of mice susceptible and resistant to hepatocarcinogenesis Timofeeva OA, Eremeev AV, Goloshchapov AN, Ilnitskaya SI, Merculova TI, Kaledin VI, Setkov NA. Doklady Biological Sciences, 2009, Т.429.- №2.-С.579-82.
Полиморфизм гена аполипопротеина Е в популяции коренных жителей Горной Шории и его ассоциация с параметрами углеводного обмена Шахтшнейдер Е.В., Воевода М.И., Огарков М.Ю., Барбараш О.Л., Поликутина О.М., Казачек Я.В., Баум В.А., Юдин Н.С., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Атеросклероз, 2009, Том 5, №1, стр. 28-32
Induction of fatty liver by fasting in mouse strains disposed to metabolic syndrome development Baginskaya N.V., Perepechaeva M.L., Ilnitskaya C.I., Pivovarova E.N., Kaledin V.I. Clinical and Experimental Medical Journal, 2009, v3(4): 599-600 2009
Specifically activated dendritic cells--cell-based vaccine against lymphosarcoma exhibiting multiple drug resistance phenotype Mironova NL, Panzinskyi EE, Popova NA, Nikolin VP, Zenkova MA, Vlasov VV Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, Sep-Oct;428:252-6.
Structural Variants of Glucocorticoid Receptor Binding Sites and Different Versions of Positive Glucocorticoid Responsive Elements: Analysis of GR-TRRD Database Merkulov V.M., Merkulova T.I. J STEROID BIOCHEM, 2009, v.115. p.1-8
Tempol reduces the therapeutic effect of cyclophosphamide on an experimental tumor model Kaledin V I.,. Popova N.A, Nikolin V.P., Vasilieva E.D., Kirilyuk I.A., Grigor’ev I.A. FREE RADICAL RES, 2009, V.43.№ 7. P 685-690
Влияние этанола на процессы метастазирования аденокарциномы Льюис у самцов мышей с разным эмоциональным состоянием Ильницкая С.И., Николин В.П., Попова Н.А., Августинович Д.Ф., Каледин В.И., Кудрявцева Н.Н. , 2009, Т.95.- №1.- С.74-78
Выявление новых сайтов транскрипционных факторов SREBP в промоторных районах генов позвоночных на основе комбинации биоинформационного и экспериментального подходов Е.В. Игнатьева, Т.И. Меркулова, Д.Ю. Ощепков, Н.В. Климова, Г.В. Васильев, И.И. Турнаев, В.Ф. Кобзев, Н.А. Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2009, №1, Т.13, С.37-45
Гепатокарцинома -29, метастазирующая перевиваемая опухоль, вызывающая кахексию. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины В. И. Каледин, Н. А. Жукова, В. П. Николин, Н. А. Попова, М. Д. Беляев, Н. В. Багинская, Е. А. Литвинова, Т. Г. Толстикова, Е. Л. Лушникова, Д. Е. Семенов B EXP BIOL MED+, 2009, № 12. С.664-669
Действие экзогенной ДНК, ассоциированной с протамином, на рост экспериментальных опухолей мыши Е.А. Алямкина, А.С. Лихачева, В.П. Николин, Н.А. Попова, Е.В. Долгова, В.А. Рогачев, Т.Е. Себелева, Д.Н. Стрункин, С.С. Богачев, М.А. Шурдов Вопросы онкологии, 2009, № 6, Т. 55, стр. 765-768
Дифференциация популяций диких и домашних свиней по частоте хромосом, содержащих эндогенные ретровирусы Юдин Н.С., Айтназаров Р.Б., Князев С.П., Бекенёв В.А., Деева В.С., Гончаренко Г.М., Кобзев В.Ф., Савина М.А., Ермолаев В.И., Никитин С.В. Информационный вестник ВОГИС, 2009, т.13, № 4, с.741-750
Изменения транскриптома печени крысы под действием гепатоканцерогенного для этих животных 3МЕДАБ и неканцерогенного ОАТ Н.И. Ершов, В.Г. Левицкий, Д.Ю. Ощепков, О.В. Вишневский, Л.О. Брызгалов, Е.В. Антонцева, Т.И. Меркулова. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13, № 4, С. 703–722
Ингибирующее влияние тироксина на поздние стадии гепатоканцерогенеза, индуцированные у 14-дневных мышей диэтилнитрозамином В.И.Каледин, Ильницкая С.И., Багинская Н.В., Сенькова А.В. , 2009, т.95, №9, стр. 993-996
Интибирующее влияние тироксина на поздние стадии гепатоканцерогенеза, индуцированного у 14-дневных мышей диэтилнитрозамином Каледин В. И., Ильницкая С. И., Багинская, Сенькова А. В. , 2009, Т. 95, № 9. С. 993-997
2008
Особенности захоронения младенцев в жилищах городища Чича-1 в Баабинской лесостепи по данным анализа структуры ДНК Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2008, № 2, Т. 34, С. 57-67
Полиморфизм гена холодового рецептора TRPM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока Потапова Т.А., Юдин Н.С., Бабенко В.Н., Пилипенко И.В., В.Ф. Кобзев И.В., Гырголькау Л.А., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2008, №4, Том 12, С. 749-754
Популяционное исследование спектра мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в российской популяции Воевода М.И., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Максимов В.Н., Пилипенко И.В., Терещенко И.П., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Никитин Ю.П. RUSS J GENET+, 2008, Т. 44, №10, стр. 1374-1378
Пошаговая модель связывания ТВР/ТАТА бокс позволяет предсказать наследственные заболевания человека по точечным полиморфизмам Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2008, 6, 419, 828-832
Редокс-модификация и фосфорилирование регулируют активность митохондриального белкового комплекса, специфично связывающегося с промотором гена сох1 кукурузы Тарасенко В.И., Кобзев В.Ф., Константинов Ю.М. Molecular Biology, 2008, Т. 42, № 1, стр. 181-183
Сравнительная характеристика ядерной и митохондриальной ДНК-топоизомеразы I кукурузы Тарасенко В.И., Катышев А.И., Кобзев В.Ф., Константинов Ю.М. Molecular Biology, 2008, Т. 42, № 1, стр. 88-95
Увеличенное взаимодействие белка ядерных экстрактов перевиваемых опухолей печени и легких мышей с ТАТА-содержащим олигонуклеотидом Лысова М.В., Аршинова Т.В., Драчкова И.А., Кобзев В.Ф., Каледин В.И., Савинкова Л.К. B EXP BIOL MED+, 2008, Т. 145, № 1, стр.100-102
Участие экзогенной ДНК в молекулярных процессах, протекающих в соматической клетке Лихачева А.С., Рогачев В.А., Николин В.П., Попова Н.А., Шилов А.Г., Себелева Т.Е., Стрункин Д.Н., Черных Е.Р., Гельфгат Е.Л., Богачев С.С., Шурдов М.А. Информационный вестник ВОГИС, 2008, № 3, Т.12, стр. 426-473
Цианамид увеличивает противоопухолевое действие циклофосфамида сильнее, чем общетоксическое В.И. Каледин, В.П. Николин, Н.А.Попова Doklady Akademii Nauk, 2008, Т.420.№ 4. С. 568-570
АССОЦИАТИВНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ P53 И C-FMS С РАЗВИТИЕМ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ У РУССКИХ ЖЕНЩИН И.В. Пилипенко, О.В. Горчакова, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода,Н.Н. Бабышкина, Н.В. Чугунова, А.В. Дорошенко, А.Г. Ромащенко Сибирский онкологический журнал, 2008
Effects of o-aminoazotoluene on liver regeneration and p53 activation in mice susceptible and resistant to hepatocarcinogenesis Timofeeva O.A, Eremeev A.V., Goloshchapov A., Kalashnikova E., Ilnitskaya S.I., Setkov N.A., Kobzev V., Buzard G.S., Filipenko M.L., Kaledin V.I., Merculova T.I. TOXICOLOGY, 2008, №254, P.91-96
Expression of MAP/ERK kinase cascade corresponds to the ability to develop food aversion in terrestrial snail at different stages of ontogenesis Grinkevich LN, Lisachev PD, Kharchenko OA, Vasil'ev GV BRAIN RES, 2008, V.1187 p.12-9.
Genetic algorithm and optimized weight matrix application for peroxisome proliferator response elements recognition: Prerequisites of accuracy growth for wide genome research Victor G. Levitsky, Elena V. Ignatieva, Eugenia Aman, Tatyana I. Merkulova, Nikolay A. Kolchanov, T. Charles Hodgman INTELL DATA ANAL, 2008, 12(5): 513-526
Нарушение функционирования соматических клеток в яйцевых камерах Drosophila melanogaster у мутантов по гену trithorax-like Огиенко А.А., Лаухина О.В., Васильев Г.В., Баричева Э.М. Информационный вестник ВОГИС, 2008, т.12, с. 399-405
TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko INTELL DATA ANAL, 2008, No. 5, Vol. 12, P. 443-461
High-affinity cation binding to organic cation transporter 1 induces movement of helix 11 and blocks transport after mutations in a modeled interaction domain between two helices. Gorbunov D, Gorboulev V, Shatskaya N, Mueller T, Bamberg E, Friedrich T, Koepsell H. MOL PHARMACOL, 2008, Jan;73(1):50-61
Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов FOXA, связанных с регуляцией пролиферации Брызгалов Л.О., Ершов Н.И., Ощепков Д.Ю., Каледин В.И., Меркулова Т.И. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2008, Вып. 1, Том 73: 70-75
Изучение возможности реверсии устойчивости к хлорохину верапамилом у Plasmodium berghei - возбудителя малярии грызунов Панкова ТГ., Игонина ТМ., Майер ТВ., Рабинович СА., Максакоская ЕВ., Морозов ЕН Медицинская паразитология и паразитарные болезни, 2008, №4, 19-22
2007
Исследование связывания ядерных белков штаммов P.berghei, различающихся по чувствительности к хлорохину, с олигонуклеотидами, соответствующими регуляторным элементам гена множественной лекарственной устойчивости Панкова Т.Г., Т.М. Игонина, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова. Биомедицинская химия, 2007, т. 53. 547-556
Исследование связывания ядерных белков штаммов Plasmodium bergei, различающихся по чувствительности к хлорохину, с олигонуклеотидами, соотвествующими регуляторным элементам гена множественной лекарственной устойчивости Панкова Т.Г., Т.М. Игонина, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова. Биомедицинская химия, 2007, т.53, с.399-405
Консервативность ДНК 3’-нетранслируемой области гена GRO1 северного оленя Юдин Н.С., Потапова Т.А., Кобзев В.Ф., Южаков А.А., Кушнир А.В. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2007, № 9, стр. 93-97
Метилирование CpG-динуклеотидов в районе промотора гена белка S100b у мышей линии BALB/cLac Малуп Т.К., Кобзев В.Ф., Жданова Л.Г., Слободянюк С.Я., Свиридов С.М. Doklady Akademii Nauk, 2007, т. 412, № 1, с.115-117
Combined experimental and computational approaches to study the regulatory elements in eukaryotic genes Kolchanov NA, Merkulova TI, Ignatieva EV, Ananko EA, Oshchepkov DY, Levitsky VG, Vasiliev GV, Klimova NV, Merkulov VM, Hodgman TC BRIEF BIOINFORM, 2007, 8(4), 266-274
Промотирующее влияние ортоаминоазотолуола на гепатоканцерогенез сопровождается усилением воспалительных и пролиферативных процессов в ткани печени и снижением концентрации свободного тироксина в крови Багинская Н.В., Ильницкая С.И., Никитенко Е.В., Каледин В.И. B EXP BIOL MED+, 2007, Т.144, №12, С.672-675
Cравнительная характеристика ядерной и митохондриальной ДНК-топоизомеразы I кукурузы Тарасенко В.И., Катышев А.И., Кобзев В.Ф., Константинов Ю.М Molecular Biology, 2007, т. 41, № 6. с. 365-370
Транскрипционные факторы FOXA определяют амплитуду глюкокортикоидной индукции тирозинаминотрансферазы у мышей Брызгалов Л.О., Ершов Н.И., Ильницкая С.И. B EXP BIOL MED+, 2007, № 11, Том 144: 565-567
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах Меркулова Т. И., Ощепков Д. Ю., Игнатьева Е. В., Ананько Е.В., Левицкий В.Г., Васильев Г. В., Климова Н. В., Меркулов В.М., Колчанов Н.А. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2007, 11, 72, 1459-1467
Effective transcription factor binding site prediction using a combination of optimization, a genetic algorithm and discriminant analysis to capture distant interactions Levitsky V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Turnaev I.I., Merkulova T.I., Kolchanov N.A., Hodgman T.C. BMC BIOINFORMATICS, 2007, Vol. 8:481. PMID: 18093302
Exogenous DNA can be captured by stem cells and be involved in their rescue from death after lethal-dose γ-radiation Likhacheva AS, Nikolin VP, Popova NA, Rogachev VA, Prokhorovich MA, Sebeleva TE, Bogachev SS, Shurdov MA. Gene Therapy and Molеcular Biology, 2007, 11: 305-314
Integration of human DNA fragments into the cell genome of certain tissues from adult mice treated with cytostatic cycloposphamide in combination whit human DNA Likhacheva AS, Nikolin VP, Popova NA, Dubatolova TD, Strunkin DN, Rogachev VA, Sebeleva TE, Erofeev IS, Bogachev SS, Yakubov LA, Shurdov MA Gene Therapy and Molеcular Biology, 2007, 11: 185-202
Effects of administration of sodium glutamate during the neonatal period on behavior and blood corticosterone levels in male mice Kuznetsova E.G., Amstislavskaya T.G., Bulygina V.V., Il'nitskaya S.I., Tibeikina M.A., Skrinskaya Y.A. Neuroscience Behavioral Physiology, 2007, V.37; P. 827-833.
Поиск новых сайтов связывания транскрипционного фактора SF1 методом SITECON: экспериментальная проверка и анализ регуляторных районов генов-ортологов. Игнатьева Е. В., Климова Н. В., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А. Doklady Akademii Nauk, 2007, 415(1):120-124
Recognition of interferon-inducible sites, promoters, and enhancers Ananko E.A., Kondrakhin Y.V., Merkulova T.I., Kolchanov N.A BMC BIOINFORMATICS, 2007, v.8 p.56
Search for new binding sites for the transcription factor SF-1 by the SITECON method: experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes Ignat'eva EV, Klimova NV, Oshchepkov DY, Vasil'ev GV, Merkulova TI, Kolchanov NA. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2007, V.415, c.165-169
Роль SNPs гена K-ras мыши в механизме формирования предрасположенности к пульмоноканцерогенезу Антонцева Е.В., Скорытченко Я.Д., Каледин В.И., Меркулова Т.И. Cell and Tissue Biology, 2007, т.49, №9, с. 713
Early-life hypoxia in the development of behavioral dysfunctions in accelerated-senescence OXYS rats and its correction with antioxidants Korbolina E.E., Agafonova I.G., Sergeeva S.V., Trofimova N.A., Mishenko N.P., Kolosova N.G. Adv. Gerontol, 2007, Vol. 20. N 3. P. 46-48.
The influence of psychoemotional status on metastasis of Lewis lung carcinoma and Hepatocarcinoma – 29 in mice of C57BL/6 and CBA strains Kudryavtseva N. N., Tenditnik M. V., Nikolin V. P., Popova N. A., Kaledin V. I. Experimental oncology, 2007, V 29.N 1. P. 35-38
Активация конститутивного рецептора андростанов (CAR) под действием гепатоканцерогенных аминоазокрасителей в печени мышей и крыс М.Ю. Пахарукова*, М.А. Сметанина, В.И. Каледин, В.Ф. Кобзев, И.В. Романова, Т.И. Меркулова. B EXP BIOL MED+, 2007, №9, 144, 313-316
Активация конститутивного рецептора андростанов под действием гепатоканцерогенных аминоазокрасителей в печени мышей и крыс М.Ю.Пахарукова, М.А.Сметанина, В.И.Каледин, В.Ф.Кобзев, И.В.Романова, Т.И.Меркулова B EXP BIOL MED+, 2007, т. 144, № 9, с.313-316
Влияние возраста и пола на гепатотоксическое и гипотермическое действие эстрагола у мышей Каледин В.И., Васильева Е.Д., Ильницкая С.И., Морозкова Т.И., Амстиславская Т.Г. , 2007, №8, Т.93, C.844-851
Bioinformatical and experimental approaches to investigation of transcription factor binding sites in vertebrate gene Merkulova T. I., Oshchepkov D. Yu., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Levitsky V. G., Vasiliev G. V., Klimova N. V. , Merkulov V. M., Kolchanov N. A. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2007, 72 (11):1187-1193
Изучение влияния нитрозоэтил мочевины на глюкокортикоидную индукцию тирозинаминотрансферазы и ДНК-связывающую активность некоторых факторов транскрипции в печени мышей Пивоварова Е. Н., Ильницкая С. И., Кобзев В.Ф., Меркулова Т. И., Каледин В. И. Бюллетень СО РАМН, 2007, №1 (123), - С.88-91
2006
Исследование связывания ядерных белков штаммов Plasmodium berghei с различной чувствительностью к хлорохину с олигонкуклеотидами, моделирующими регуляторные участки гена множественной лекарственной устойчивости Панкова Т.Г., Т.М. Игонина, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова. B EXP BIOL MED+, 2006, №6, с. 283-286.
Место связывания глюкокортикоидного рецептора на ДНК и структурные варианты глюкокортикоидных регуляторных элементов: данные, собранные в базе GR ¬ TRRD Меркулов В.М. Меркулова Т.И. Экологическая генетика, 2006, Т. IV , вып. 4. С. 20-31
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах Климова Н.В., Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2006, т.40, стр. 512-523.
Development of behavioural dysfunctions in accelerated-senescence OXYS rats is associated with early postnatal alterations in brain phosphate metabolism Sergeeva S.V., Bagryanskaya E.G., Korbolina E.E., Kolosova N.G. EXP GERONTOL, 2006, 41(2):141-50.
Enhancing effect of new biological response modifier sulfoethyl(1-3)-beta-D-glucan 0n antitumor activity of cyclophosphamide in the treatment of experimental murine leukoses Khalikova T.A., Korolenko T.A., Zhanaeva S.Y., Kaledin V.I., Kogan G. Experimental oncology, 2006, N 4, V. 28, P.47-52.
Potential binding sites for SF-1: Recognition by the SiteGA method, experimental verification, and search for new target genes Klimova NV, Levitsky VG, Ignatieva EV, Vasiliev GV, Kobzev VF, Busygina TV, Merkulova TI, Kolchanov NA Molecular Biology, 2006, V.40, № 3. P.1-12.
SNP в начале интрона 2 гена K-ras мыши, ассоциированные сразвитием рака легких, влияют на связывание с факторами транскрипции Е.В. Горшкова, В.И. Каледин, В.Ф. Кобзев, Т.И. Меркулова B EXP BIOL MED+, 2006, № 6, Т. 141, С.681-684.
An effect of the microsporidian Vairimorpha ephestiae (Microsporidia: Burenellidae) on activity and spectrum of nonspecific esterases in different tissues of the greater wax moth galleria mellonella (Lepidoptera: Pyralidae) larvae Vorontsova Ia.L., Ershov N.I., Glupov V.V. Паразитология, 2006, 40(1): 74-84
Animal model of drug-resistant tumor progression N. Mironova, O.Shklyaeva. E. Andreeva, N.Popova, V. Kaledin, V. Nikolin, V. Vlasov, M.Zenkova ANN NY ACAD SCI, 2006, N 1091, pp. 490-500
Ассоциации эндогенных ретровирусов разных типов с генетическими маркерами в популяциях домашних и диких свиней Айтназаров Р.Б., Ермолаев В.И., Никитин С.В., Савина М.А., Кобзев В.Ф., Князев С.П., Гончаренко Г.М., Бекенёв В.А., Юдин Н.С. Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук, 2006, № 4. C. 39–43.
Влияние бетулоновой кислоты и ее амидных производных на рост и диссиминирование опухолевых трансплантатов у мышей И.В. Сорокина, Н.А. Жукова, Т.Г. Толстикова, С.В. Позднякова, О.Р. Грек, Н.А. Попова, В.А. Каледин, В.П. Николин. B EXP BIOL MED+, 2006, т.142, № 1,С. 29-31
Влияние неонатального введения глутамата натрия и диэтилнитрозоамина на поведение и уровень кортикостерона в крови самцов мышей. Кузнецова Е.Г., Амстиславская Т., Булыгина В.В.,Ильницкая С.И., Тибейкина М.А.,Скринская Ю.А. , 2006, Т.92.- №6.- Стр.751 – 760.
Влияние психоэмоционального состояния на рост и метастазирование опухоли Льюис у мышей Каледин В. И., Тендитник М. В., Николин В. П. , Попова Н. А., Кудрявцева Н.Н. Doklady Akademii Nauk, 2006, Т.406. N 2.С. 272-274
Влияние экзогенной ДНК на восстановление лейкопоэза и противоопухолевый эффект циклофосфана Николин В.П., Попова Н.А., Себелева Т.Е., Стрункин Д.Н., Рогачев В.А., Семенов Д.В., Богачев С.С., Якубов Л.А., Шурдов М.А. Вопросы онкологии, 2006, т.52, №3, стр. 336-340
Влияние экзогенной ДНК на рост экспериментальных опухолей Николин В.П., Попова Н.А., Себелева Т.Е., Стрункин Д.Н., Рогачев В.А., Семенов Д.В., Богачев С.С., Якубов Л.А., Шурдов М.А. Вопросы онкологии, 2006, т. 52., N 1, стр. 66-69
Изучение влияния антиоксиданта тиофана на канцерогенное действие 3,4-бензпирена при пероральном введении у мышей В. И. Каледин, В.Г. Некрасов, А.М. Гончар, В.И. Ермолаев, А. Е. Просенко. Сибирский экологический журнал, 2006, Т 5. С. 649-654
Изучение влияния бетулоновой кислоты и ее амидных производных на рост и метастазирование перевиваемых опухолей у мышей. Вопр. Биологической, медицинской и фармацевтической химии Сорокина И.В., Жукова Н.А., Толстикова Т.Г., Позднякова С.И., Грек О.Р., Попова Н.А., Андреева Е.М., Каледин В.И., Николин В.П. Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии, 2006, Т.142.-№ 1. С. 29-31
Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О, Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т.10, №3. С.565-571
Изучение эффективности моно- и полихимиотерапии на модели перевиваемой мышиной лимфосаркомы, нечувствительной к индукции апоптоза Каледин В. И., Попова Н. А., Андреева Е.М. Вопросы онкологии, 2006, Т.. 52. № 1. С. 70-73
2005
Cаийты связывания транскрипционного фактора SF1 в промоторных районах генов, кодирующих ферменты стероидогенеза 3бетаГСДI и Р450с17 мыши Бусыгина Т.В., Васильев Г.В., Климова Н.В., Игнатьева Е.В., Осадчук А.В. Биохимия, 2005, № 10, Т. 70, C. 1397-1402
Binding Sites for Transcription Factor SF-1 in Promoter Regions of Genes Encoding Mouse Steroidogenesis Enzymes 3βHSDI and P450c17 T.V. Busygina, G.V. Vasiliev, N.V. Klimova, E.V. Ignatieva, A.V. Osadchuk BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2005, №10, V. 70, P. 1152–1156
Codon 12 region of mouse K-ras gene is the site for in vitro binding of transcription factors GATA-6 and NF-Y Gorshkova (Antontseva) EV, Kaledin VI, Kobzev VF, Merkulova TI. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2005, 2005 Oct;70(10):1180-4
Mining genome variation to associate genetic disease with mutation alterations and ortho/paralogous polimorphysms in transcription factor binding site. Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Merkulova T.M., Vasiliev G.V., and Ponomarenko M.P. INT J ARTIF INTELL T, 2005, 4, 14, 599-620
Subtype-specific affinity for corticosterone of rat organic cation transporters rOCT1 and rOCT2 depends on three amino acids within the substrate binding region. Gorboulev V, Shatskaya N, Volk C, Koepsell H. MOL PHARMACOL, 2005, May;67(5):1612-9
Amino acids critical for substrate affinity of rat organic cation transporter 1 line the substrate binding region in a model derived from the tertiary structure of lactose permease. Popp C, Gorboulev V, Müller TD, Gorbunov D, Shatskaya N, Koepsell H. MOL PHARMACOL, 2005, May;67(5):1600-11
2003
Predisposition to alcoholism, tryptophan oxygenase activity, and structure of intron 6 in the corresponding gene of C57BL/6J, CC57BR/Mv, and BALB/cJ mice Kaledin V.I., Klimova N.V., Vasil'ev G.V.Ivanova E.A., Vasil'eva E.D., Il'nitskaya S.I. B EXP BIOL MED+, 2003, №4, V.136, P. 385-387
Изучение предрасположенности к алкоголизму, активности триптофаноксигеназы и структуры интрона 6 соответствующего гена у мышей линий C57BL/6J, CC57BR/Mv и BALB/cJ Каледин В.И., Климова Н.В., Васильев Г.В., Иванова Е.А., Васильева Е.Д., Ильницкая С.И. B EXP BIOL MED+, 2003, №10, Т. 136, С. 435-437
Полиморфизм гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом, в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Хаснулин В.И., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2003, Т.39 № 7C. 988-995
rSNP_Guide, a database system for analysis of transcription factor binding to DNA with variations: application to genome annotation. Ponomarenko J.V., Merkulova T.I., Orlova G.V., Fokin O.N., Gorshkova (Antontseva) E.V., Frolov A.S., Valuev V.P., Ponomarenko M.P. NUCLEIC ACIDS RES, 2003, 1, 31, 118-121
Влияние фенобарбитала на противоопухолевый эффект циклофосфана в зависимости от типа вызываемой им гибели опухолевых клеток. Каледин В.И., Николин В.П., Баймак Т.Ю., Галямова М.Р., Попова Н.А., Андреева Е.М. B EXP BIOL MED+, 2003, Т. 135, № 3
2002
Pulmonary carcinogenesis susceptibility-associated single-nucleotide polymorphisms in K-ras intron 2 affect the binding of factor Gata-6 but not gene expression Timofeeva, O.A., Gorshkova (Antontseva), E.V., Levashova, Z.B., Kobzev, V.F., Filipenko, M.L., Kaledin, V.I., Merkulova, T.I. Molecular Biology, 2002, 36(5), pp. 659-664
Mining DNA sequences to predict sites which mutations cause genetic diseases. Ponomarenko J.V., Merkulova T.I., Orlova G.V., Fokin O.N., Gorshkova (Antontseva) E.V., Ponomarenko M.P. Knowl-Based Syst. J., 2002, 4, 15, 225-233
rSNP_Guide: an integrated database-tools system for studying SNPs and site-directed mutations in transcription factor binding sites Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Merkulova T.I., Gorshkova (Antontseva) E.V., Fokin O.N., Vasiliev G.V., Frolov A.S., Ponomarenko M.P. HUM MUTAT, 2002, 4, 20, 239-248
Transcription Regulatory Regions Database (TRRD): its status in 2002 Kolchanov NA, Ignatieva EV, Ananko EA, Podkolodnaya OA, Stepanenko IL, Merkulova TI, Pozdnyakov MA, Podkolodny NL, Naumochkin AN, Romashchenko AG NUCLEIC ACIDS RES, 2002, Jan 1;30(1):312-317
Identification of genetic variations of the human organic cation transporter hOCT1 and their functional consequences. Kerb R, Brinkmann U, Chatskaia N, Gorbunov D, Gorboulev V, Mornhinweg E, Keil A, Eichelbaum M, Koepsell H. PHARMACOGENETICS, 2002, Nov;12(8):591-5.
Апоптоз-индуцирующая и противоопухолевая эффективность циклофосфана, платина и адриамицина при их раздельном применении и в комбинации у мышей с лимфосаркомой LS. Николин В.П., Каледин В.И., Баймак Т.Ю., Галямова М.Р., Попова Н.А., Войцицкий В.Е. Вопросы онкологии, 2002, Т. 48, №2
Высокая апоптогенная и противоопухолевая активность продуктов биологической, но не химической активации циклофосфана. Каледин В.И., Николин В.П., Галямова М.Р., Васильева Е.Д., Баймак Т.Ю., Попова Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2002, Т. 386, №5
Apoptosis-mediated regression of transplantable LS limfosarcoma in CBA mice treated with ASVP (adriamicin, cyclophosphamid, vincristin, prednisolon) or cyclophosphamid alone. Kaledin V.I., Nicolin V.P., Timofeeva O.A., Filipenko M.L., Baymak T.Yu., Galyamjva M.R., Popova N.A. Experimental oncology, 2002, Vol. 24
2001
rSNP_Guide, a database system for analysis of transcription factor binding to target sequences: application to SNPs and site-directed mutations Ponomarenko JV, Merkulova TI, Vasiliev GV, Levashova ZB, Orlova GV, Lavryushev SV, Fokin ON, Ponomarenko MP, Frolov AS, Sarai A. NUCLEIC ACIDS RES, 2001, 1, 29, 312-316.
Распространение аллелей C282Y, H63D и S65C гена HFE и предрасположенности к нарушениям метаболизма железа в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Хаснулин, Воевода М.И Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии, 2001, Т.XI, №4, С.13-17
2000
Точковые мутации в районе 663-666 п.н. интрона 6 гена триптофаноксигеназы, связанные с рядом психических расстройств, разрушают сайт связывания фактора транскрипции YY1. Васильев Г.В., Меркулов В.М., Кобзев В.Ф., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Подколодная О.А., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2000, 2, 34, 214-222
Циклофосфан-индуцированный апоптоз клеток мышиной лимфосаркомы в условиях in vivo. Каледин В.И., Николие В.П., Агеева Т.А., Попова Н.А., Баймак Т.Ю. Вопросы онкологии, 2000, Т. 46, №5
1999
GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, 5, 44, 837-841
Point mutations within 663-666 bp of intron 6 of the human TDO2 gene, associated with a number of psychiatric disorders, damage the YY-1 transcription factor binding site. Vasiliev G.V., Merkulov V.M., Kobzev V.F., Merkulova T.I., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A. FEBS LETT, 1999, 1/2, 462, 85-88
Identification of sequence-dependent features correlating to activity of DNA sites interacting with proteins Ponomarenko M.P., Ponomarenko J.V., Frolov A.S., Podkolodny N.L., Savinkova L.K., Kolchanov N.A., Overton G.C. BIOINFORMATICS, 1999, 7/8, 15, 687-703
Reduction of serotonergic gene expression in the midbrain raphe nuclei under positive fighting experience. Smagin D.A., Boyarskikh U.A., Bondar N.P., Filipenko M.L., Kudryavtseva N.N.
2018
Initiation Factors Ponomarenko M., Savinkova L., Ponomarenko P., Kolchanov N.
2017
Hogness Box Ponomarenko M., Mironova V., Gunbin K., Ponomarenko P., Suslov V., Savinkova L.
2013
Hogness Box. Ponomarenko M, Mironova V, Gunbin K, Savinkova L
Initiation Factors. Ponomarenko M, Savinkova L, Kolchanov N
2011
Dioxin responsive elements in the promoter regions of the genes encoding macrophageal transcription factors and cytokines: prediction and experimental verification E.V. Kashina, D.Yu. Oshchepkov, E.V. Antontseva, E.A. Oshchepkova, M.Yu. Shamanina, V.A. Mordvinov, D.P. Furman
2009
Особенности структуры генофонда митохондриальной ДНК населения городища Чича-1 Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И.
Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. Под ред. А.Б. Масленникова. Вып. 12 Воевода М.И., Максимов В.Н., Малютина С.К., Гафаров В.В., Шишкин С.В., Ромащенко А.Г., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Кузнецова Т.Н., Кобзев В.Ф., Юдин Н.С.
2006
Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. Под ред. А.Б. Масленникова. Вып. 9 Воевода М.И., Юдин Н.С., Васильев Г.В., Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Бархаш А.В., Ромащенко А.Г.
TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS DATABASE (TRRD): A SOURCE OF EXPERIMENTALLY CONFIRMED DATA ON TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS OF EUKARYOTIC GENES N. Kolchanov, E. Ignatieva, O. Podkolodnaya, E. Ananko, I. Stepanenko, T. Merkulova, T. Khlebodarova, V. Merkulov, N. Podkolodny, D. Grigorovich, A. Poplavsky, A. Romashchenko
In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (Eds. N.Kolchanov and R. Hofestaedt) Springer Science+Business Media. Inc. Levitsky V., Ignatieva E., Vasiliev G., Klimova N., Busygina T., Merkulova T., Kolchanov N.
Конференции
2024
Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A. The 14th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2024)
Genome analysis of novel strains of Cydia
pomonella granulovirus from Russia Lakhova T., Klimenko A., Tsygichko A., Ismailov V., Vasiliev G., Asaturova A., Lashin S. 14th International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology
Исследование вариаций и структуры генома сортов картофеля Solanum tuberosum, выращиваемых в России Д.И. Каретников, Г.В. Васильев, С.В. Тощаков, Н.А. Шмаков, М.А. Генаев, М.А. Нестеров, С.М. Ибрагимова, Д.А. Рыбаков, Т.А. Гавриленко, Е.А. Салина, М.В. Патрушев, А.В. Кочетов, Д.А. Афонников INTERNATIONAL CONGRESS “VIII Congress of the Vavilov Society of Geneticists and Breeders, Dedicated to the 300th Anniversary of Russian Science and Higher Education”
Проблемы хромосомного и геномного анализа немодельных организмов с нестандартной организацией кариотипа и генома Задесенец К.С., Ершов Н.И., Рубцов Н.Б. ХIX Всероссийский симпозиум «Структура и функции клеточного ядра»
Необычные варианты геномной и кариотипической эволюции у эукариот Задесенец К.С., Ершов Н.И., Рубцов Н.Б. VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы
Онтологический подход к анализу дифференциальной экспрессии генов на основе больших транскриптомных данных Ощепков Д.Ю., Чадаева И.В. , Кожемякина Р.В., Золотарева К., Хандаев Б., Шарыпова Е.Б., Пономаренко П.М., Богомолов А.Г., Климова Н.В., Шихевич С.Г., Редина О.Е., Колосова Н.Г., Назаренко М., Колчанов Н.А., Маркель А.Л., Пономаренко М.П. Международный Конгресс «VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы»
Влияние эндосимбиотической бактерии Wolbachia на дифференциальную
экспрессию генов, метаболизм и поведение Drosophila melanogaster Н. Е. Грунтенко, М. А. Дерюженко, О. В. Андреенкова, О. Д. Шишкина, Е. К. Карпова, Е. В. Бурдина,
М.А. Бобровских, Л. П. Захаренко, Г. В. Васильев, Н. В. Шацкая VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы
NEONATAL INFLAMMATION DOES NOT LEAD TO DELAYED EFFECTS ON GLUTAMATE SYSTEM AND BRAIN NEUROPLASTICITY: CHARACTERISTICS OF MICE WITH AUTISM-LIKE PHENOTYPE EV Mezhlumyan, KA Ayriyants, AS Mutovina, MM Kolesnikova, NP Bondar International Conference NEUROSCIENCE WEEK 2024
INDUCTION OF INFLAMMATION IN EARLY POSTNATAL PERIOD: EFFECT ON ACTIVATION OF ASTROCYTES AND MICROGLIA IN BTBR MALES MM Kolesnikova, KA Ayriyants, AS Mutovina, EV Mezhlumyan, NP Bondar International Conference NEUROSCIENCE WEEK 2024 2024, Yerevan State Medical University, Armenia
MOUSE REPEATED AGGRESSION PARADIGM: DEPRIVATION FROM FIGHTING RESULTS IN HEIGHTENED ANXIETY AND AGGRESSION IN MALE CD1 MICE A.S. Mutovina, К.А. Ayriyants, A.А. Sapronova, P.E. Kisaretova, N.P. Bondar 30th International "Stress and Behavior" Neuroscience and Biopsychiatry Conference
Этнозависимый характер полно-экзомных ассоциаций с параметрами мужской фертильности А.В. Осадчук, С.К. Колмыков, Г.В. Васильев, М.А. Клещев, Л.В. Осадчук XXXIV Ежегодная международная конференция РАРЧ «Репродуктивные технологии сегодня и завтра»
Анализ адаптационно‑значимого для хозяина штамма wMelPlus эндосимбиотической бактерии Wolbachia и его влияния на транскриптом Drosophila melanogaster О. Д. Шишкина, М. А. Дерюженко, О. В. Андреенкова, М. А. Бобровских, Н. В. Шацкая, Г. В. Васильев, А. И. Клименко, А. Е. Коренская, Н. Е. Грунтенко VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы
2023
Влияние различных воспалительных агентов на клетки крови и уровень экспрессии провоспалительных генов в отделах головного мозга и селезенке самцов мышей линий BTBR T+Itpr3tf/J и C57BL/6 Мутовина А.С., Айриянц К.А., Межлумян Е.В., Решетников В.В., Бондарь Н.П. 76-я Всероссийская с международным участием школа-конференция молодых ученых Биосистемы: организация, поведение, управление
The impact of terahertz radiation on stress response systems of prokaryotes Peltek S., Bannikova S., Mesheryakova I., Bryanskaya A., Oshchepkov D., Vasiliev G., Vasilievа A., Uvarova Y., Kiseleva E., Popik V., Khlebodarova T.M., Goryachkovskaya T THE 5-TH INTERNATIONAL CONFERENCE “TERAHERTZ AND MICROWAVE RADIATION: GENERATION, DETECTION AND APPLICATIONS” (TERA-2023)
Analysis of the genome structure and its variations in potato cultivars grown in Russia Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
Хронический социальный стресс изменяет чувствительность к дексаметазону генов-мишеней глюкокортикоидного рецептора П.Э. Кисаретова, А.С. Шулюпова, Н.П. Бондарь IV International Conference “Volga Neuroscience Meeting 2023″
Хронический стресс изменяет чувствительность к глюкокортикоидам: вовлечение генов синтеза кортикостерона и ферментов энергетического метаболизма Кисаретова.П.Э, Найданова М.А., Салман Р., Бондарь Н.П. XX Всероссийская молодёжная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии
Ассоциации CAG-полиморфизма гена андрогенового рецептора с параметрами сперматогенеза и уровнем стероидных гормонов у российских мужчин. Осадчук Л.В., Васильев Г.В., Клещев М.А., Осадчук А.В. XXXIII Ежегодная международная конференция РАРЧ «Репродуктивные технологии сегодня и завтра»
Поиск ассоциаций генов fam71f1, ppp1r15a, tex11 с параметрами сперматогенеза в урбанизированных популяциях: роль этнического фактора. Осадчук А.В., Васильев Г.В., Иванов М.К., Клещев М.А., Осадчук Л.В. XXXIII Ежегодная международная конференция РАРЧ «Репродуктивные технологии сегодня и завтра»
Евразийский тренд фенотипической и генетической изменчивости мужского репродуктивного потенциала в популяциях Российской Федерации и Республики Беларусь Осадчук А.В., Васильев Г.В., Колмыков С.К., Иванов М.К., Прасолова М.А., Клещев М.А., Осадчук Л.В. XXIV съезд физиологического общества им. И.П. Павлова
Влияние хронического социального стресса на чувствительность экспрессии генов ГГНС к введению дексаметазона у мышей C57BL/6 Салман Р., Найданова М., Рябушкина Ю., Кисаретова П., Бондарь Н. XXIV съезд физиологического общества им. И.П. Павлова
МикроРНК в механизмах пластичности ЦНС Гринкевич Л.Н., Васильев Г.В., Лисачев П.Д., Бондарь Н.П. XXIV съезд физиологического общества им. И.П. Павлова
Зачем мухам вольбахии, или Особенности влияния бактерии на метаболизм, дифференциальную экспрессию генов и образ жизни хозяина Грунтенко Н.Е., Андреенкова О.В., Шишкина О.Д., Шацкая Н.В., Дерюженко М.А., Карпова Е.К., М.А. Бобровских М.А., Захаренко Л.П., Адоньева Н.В. Всероссийская конференция с международным участием «Дрозофила 2023»
Анализ штамма Wolbachia wMelPlus, повышающего
стрессоустойчивость Drosophila melanogaster Шишкина О.Д., Андреенкова О.В., Шацкая Н.В., Клименко А.И., Коренская А.Е., Грунтенко Н.Е. Всероссийская конференция с международным участием «Дрозофила 2023»
Кариотип и геном Macrostomum lignano: необычный результат кариотипической и геномной эволюции после полногеномной дупликации Задесенец К.С.,Ершов Н.И.,Бондарь Н.П.,Рубцов Н.Б. INTERNATIONAL CONFERENCE CHROMOSOME 2023
2022
Genome-Wide detection of human regulatory SNPs based
on analysis of ChIP-seq and RNA-seq complex data Damarov I., Merkulova T., Bryzgalov L., Ustrokhanova D. 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” – BGRS/SB-2022
Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T. 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T. 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Domestication explains 2/3 of differential gene expression variance between domestic and wild animals; the remaining 1/3 reflects intraspecific and interspecific variation Irina Chadaeva, Petr Ponomarenko, Rimma Kozhemyakina, Valentin Suslov, Anton Bogomolov, Natalya Klimova, Svetlana Shikhevich, Ludmila Savinkova, Dmitry Oshchepkov, Nikolay A. Kolchanov, Arcady Markel, Mikhail Ponomarenko Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
Reconstruction and analysis of potato Solanum tuberosum pangenome of Siberian cultivars Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V., Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
Формирование глюкокортикоидной резистентности в отделах головного мозга при хроническом социальном стрессе у мышей: молекулярные механизмы Н.П. Бондарь, А.С. Шулюпова, Н.И. Ершов, П.Э. Кисаретова, Н.Г. Созонов, А.А. Сапронова III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов/VII Съезд физиологов СНГ
Влияние введения бактериального и вирусного миметиков на развитие, социальное и индивидуальное поведение мышей линии BTBR Айриянц К.А., Межлумян Е.В., Мутовина А.С., Колесникова М.М., Рябушкина Ю.А., Сапронова А.А., Решетников В.В. XIX Всероссийская молодёжная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии
Meta-analysis of prefrontal cortex RNA-seq data after social defeat stress of varying duration Ksenia Ayriyants, Natalia Bondar, Vasiliy Reshetnikov, Polina Kisaretova 13th FENS Forum of Neuroscience 2022
H3K4me3 epigenetic signatures in social defeat stress of varying duration Polina Kisaretova, Vasiliy Reshetnikov, Nikita Ershov, Natalia Zhukova, Natalia Bondar 13th FENS Forum of Neuroscience 2022
Изменения транскриптома префронтальной коры и дорсальных ядер шва у мышей с опытом хронического стресса социальных поражений: эффект дексаметазона Кисаретова П.Э., Шулюпова А.С., Сапронова А.А., Бондарь Н.П. VIII Молодёжная Школа-Конференция по молекулярной биологии и генетическим технологиям Института цитологии РАН
Meta-analysis of transcriptomic changes in prefrontal cortex
after chronic social defeat stress Kisaretova P., Reshetnikov V., Bondar N. The Thirteenth International Multiconference: BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY(BGRS/SB-2022)
Влияние опыта раннего постнатального стресса на стресс-реактивность мышей линии BTBR Айриянц К.А., Сапронова А.М., Иванчихина А.А., Бондарь Н.П., Решетников В.В. VIII Молодёжная Школа-Конференция по молекулярной биологии и генетическим технологиям Института цитологии РАН
Influence of administration of pro-inflammatory agents on development, individual and social behavior of BTBR mice Ayriyants K., Reshetnikov V., Bondar N., Mutovina A., Kolesnikova M., Muzhlyumyan E., Kisaretova P. 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Этнический тренд генетической изменчивости мужской фертильности в популяциях Российской Федерации и Республики Беларусь. Осадчук А.В., Васильев Г.В., Колмыков С.К., Иванов М.К., Прасолова М.А., Клещев М.А., Осадчук Л.В. XXXII ежегодная международная конференция РАРЧ «Репродуктивные технологии сегодня и завтра».
Different immune challenges alter hypothalamic microglia and astrocytes activity in the adult BTBR and C57Bl/6 mice Mutovina A., Ayriyants K., Ryabushkina Y., Reshetnikov V., Khantakova J.N., Bondar N.P. 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Влияние острого введения LPS и Poly I:C на экспрессию провоспалительных генов в мозге самцов мышей линии BTBR и C57Bl/6 А.С. Мутовина, К.А. Айриянц, Е.В. Межлумян, М.М. Колесникова, А.А. Сапронова, Ю.Н. Хантакова, Ю.А. Рябушкина, В.В. Решетников XIX Всероссийская молодёжная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии
Влияние различных воспалительных агентов на клетки крови и активность клеток мозга у взрослых мышей линии BTBR и C57BL/6 А.С. Мутовина, К.А. Айриянц, В.В. Решетников, Ю.А. Рябушкина, Ю.Н. Хантакова, Н.П. Бондарь VIII Молодёжная Школа-Конференция по молекулярной биологии и генетическим технологиям Института цитологии РАН
Влияние индукции раннего постнатального воспаления на показатели крови самцов мышей линий С57Bl/6 и BTBR Е.В. Межлумян, К.А. Айриянц, А.С. Мутовина, М.М. Колесникова, Ю.А. Рябушкина, А.А. Сапронова, Ю.Н. Хантакова, В.В. Решетников XIX Всероссийская молодёжная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии
РЕКОНСТРУКЦИЯ И АНАЛИЗ ПАНГЕНОМА КАРТОФЕЛЯ SOLANUM TUBEROSUM СОРТОВ СИБИРСКОЙ СЕЛЕКЦИИ Каретников Д.И., Генаев М.А., Нестеров М.А., Ибрагимова С.М., Васильев Г.В., Тощаков С.В., Гавриленко Т.А., Афонников Д.А., Салина Е.А., Патрушев М.В., Кочетов А.В. III Международная научно-практическая конференция "Клеточная биология и биотехнология растений"
RECONSTRUCTION AND ANALYSIS OF PANGENOME OF SIBERIAN CULTIVARS OF POTATO SOLANUM TUBEROSUM Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Shmakov N.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V. III Всероссийская конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике» (HSG-2022)
Genome assembly of a new Wolbachia pipientis strain:
a promising source for studying Drosophila melanogaster
endosymbiosis Klimenko A.I., Korenskaia A.E., Shishkina O.D., Andreenkova O.V., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E. BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ ГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ ШТАММОВ WOLBACHIA PIPIENTIS, РАЗЛИЧАЮЩИХСЯ ПО ВЛИЯНИЮ НА СТРЕССОУСТОЙЧИВОСТЬ DROSOPHILA MELANOGASTER Шишкина О.Д., Андреенкова О.В., Клименко А.И., Коренская А.Е., Васильев Г.В., Шацкая Н.В., Грунтенко Н.Е. HSG-2022: III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике"
Functional study of rs2072580 (SART3 and ISCU genes) associated with breast cancer Дегтярева А.О., Антонцева Е.В., Меркулова Т.И. BGRS-2022
Functional study of rs590352 (ATXN7L3B) associated with colorectal cancer Антонцева Е.В., Дегтярева А.О., Алиев Т.И., Меркулова Т.И. BGRS-2022
Этнические различия длины CAG-повторов в гене андрогенового рецептора и уровня тестостерона у молодых мужчин Сибирского региона России. Онопченко М.А., Васильев Г.В., Осадчук А.В., Осадчук Л.В. I Международный Конгресс «Новейшие и достижения в области медицины, здравоохранения и здоровьесберегающих технологий.
Полноэкзомный анализ сперматогенеза в преселектированной выборке из
российских мультиэтнических популяций Осадчук А.В., Колмыков С.К., Васильев Г.В., Клещев М.А., Осадчук Л.В. NGS в медицинской генетике. Пятая международная научно-практическая конференция.
Функциональный анализ однонуклеотидных замен rs2072580 и rs590352,
связанных с предрасположенностью к развитию онкологических заболеваний Дегтярева А.О., Леберфарб Е.Ю., Брусенцов И.И., Антонцева Е.В., Меркулова Т.И. NGS в медицинской генетике. Пятая международная научно-практическая конференция.
Полиморфизм CAG повторов гена андрогенового рецептора у российских мужчин: роль этнической принадлежности и связь с нарушениями сперматогенеза Осадчук Л.В., Васильев Г.В., Клещев М.А., Осадчук А.В. 20-й конгресс по андрологии Профессиональной ассоциации андрологов России
Экспансия AZF микроделеций Y-хромосомы и их ассоциации с ослабленным сперматогенезом в российских и белорусских урбанизированных популяциях. 4. Осадчук А.В., Васильев Г.В., Иванов М.К., Прасолова М.А., Кульчитский В.А., Линник А.И., Шантанова Л.Н., Троев И.П., Типисова Е.В., Клещев М.А., Осадчук Л.В. 20-й конгресс по андрологии Профессиональной ассоциации андрологов России.
ROLE OF THE ALLELIC POLYMORPHISM OF THE BRAIN NEUROTRANSMITTERS SYSTEMS IN A FORMATION OF PERSONALITY FEATURES OF SOCIAL BEHAVIOR IN PEOPLE, LIVING IN DIFFERENT REGIONS OF SIBERIA AND MONGOLIA Савостьянов Александр Николаевич
Лашин Сергей Александрович
Клименко Александра Игоревна
Таможников Сергей Сергеевич
Милахина Наталья Сергеевна
Бочаров Андрей В.
Ефимов Вадим Михайлович
Матушкин Юрий Георгиевич
Васильев Геннадий Владимирович
Иванов Роман Артемович
Князев Геннадий Георгиевич XVII INTERNATIONAL INTERDISCIPLINARY CONGRESS NEUROSCIENCE FOR MEDICINE AND PSYCHOLOGY
2020
Genome and karyotype evolution after whole genome duplication in free-living flatworms of the genus Macrostomum. Zadesenets K., Ershov N., Oshchepkov D., Berezikov E., Schaerer L., Rubtsov N.B. BGRS/SB-2020. July 6-10, 2020 Novosibirsk
Altered expression of genes Npas4 and Nr1d1 in adult female mice with history of early-life stress Yuliya Ryabushkina Vasiliy Reshetnikov Natalya Bondar BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, Symposium “Cognitive Science and Genomics” (CSGB- 2020)
The impact of early-life stress on the expression of genes associated with the formation of the myelin sheath of neurons in the prefrontal cortex of 15-day-old male mice Anastasia S. Shulyupova, Arina A. Smelova, Vasiliy V. Reshetnikov, Natalya P. Bondar BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, Symposium “Cognitive Science and Genomics” (CSGB- 2020)
Dynamic regulation of murine cortical transcriptome by early-life stress: Impairment of myelination and cognitive functions N.P. Bondar, A.S. Shulyupova, P.E. Kisaretova, N.I. Ershov,
E.V. Antontseva, T.I. Merkulova BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, Symposium “Cognitive Science and Genomics” (CSGB- 2020)
Whole-exome sequencing association studies on impaired spermatogenesis in different ethnic groups in Russia. Kolmykov S.K. Vasiliev G.V. Ponomarenko M.P. Kleshev M.A. Osadchuk A.V. Osadchuk L.V. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/ Systems Biology The 12th International Multiconference
Analysis of short- and long-range interactions within potential binding sites notably extends the fraction of verified peaks in ChIP-seq data Цуканов Антон Витальевич, Левицкий Виктор Георгиевич, Меркулова Татьяна Ивановна BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology“
Accessing the impact of functional variants on human phenotypes by transcriptome analysis in individuals carrying different rSNP alleles Корболина Е.Е., Брызгалов Л.О., Постовалов С.Н., Неделько В.М., Бериков В.Б., Меркулова Т.И. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology»
Постовалов С.Н., Бериков В.Б., Брызгалов Л.О., Корболина Е.Е., устный доклад «On the Relationship between Regulatory and Exomic DNA Markers». Постовалов С.Н., Бериков В.Б., Брызгалов Л.О., Корболина Е.Е. 2020 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT)
МИКРОБНЫЕ СООБЩЕСТВА ПРИРОДНОГО ОРГАНИЧЕСКОГО ВЕЩЕСТВА ИЗ ПОТОКА РАССЕЯНИЯ ВЫСОКОСУЛЬФИДНОГО ХВОСТОХРАНИЛИЩА А.С. Розанов, И.Н. Мягкая, Н.И. Ершов, Б.Ю. Сарыг-оол, М.А. Густайтис, А.А. Шипова, В.С. Ушаков, Е.В. Лазарева, С.Е. Пельтек VII МЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «БИОТЕХНОЛОГИЯ: НАУКА И ПРАКТИКА»
Functional study of potential regulatory SNPs (rs590352, rs11542583, rs3829202, rs78317230, rs2072580, rs4796672) Arina Degtyareva, Elena Leberfarb, Ilya Brusentsov, Tatiana Kuzina, Tatiana Merkulova 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020
2019
ПРОГНОЗЫ И ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ IN VITRO ВЛИЯНИЯ НЕАННОТИРОВАННЫХ SNPs ПРОМОТОРОВ ЭРИТРОИДНЫХ ГЕНОВ НА АФФИННОСТЬ ТВР/ТАТА И КОГНИТИВНЫЕ НАРУШЕНИЯ Е.Б.Шарыпова, И.А. Драчкова, И.В.Чадаева, М.П.Пономаренко, Л.К.Савинкова VIII Научно-практическая конференция с международным участием "Генетика - фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции"
Early-life stress increases susceptibility to social defeat stress in adults and causes long-lasting transcriptional and epigenetic alterations: Evidence from RNA-seq and H3K4me3-based chromatin immunoprecipitation with sequencing Vasiliy Reshetnikov, Nikita Ershov, Polina Kisaretova,
Natalia Bondar 10th IBRO World Congress of Neuroscience (IBRO 2019)
Study of the leaf rust resistance gene Lr52 by targeted sequencing Bragina M.K., Afonnikov D.A., Vasiliev G.V., Salina E.A. 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)
Phylogenetic analysis of high-throughput sequencing data
for a non-transcribed spacer 5S rDNA of Triticum aestivum relatives Nesterov M.A., Sergeeva E.M., Vasiliev G.V., Salina E.A. 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)
ПОЛИМОРФИЗМ rs590352 (C>G) ГЕНА ATXN7L3B И РИСК РАЗВИТИЯ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА Дегтярева А.О., Леберфарб Е.Ю., Брызгалов Л.О., Брусенцов И.И., Воевода М. И., Аутеншлюс А. И., Максимов В. Н., Морозов Д. В., Соколов А.В., Меркулова Т.И. ВОГИС
Эволюция генома макростомид: полногеномная дупликация, дестабилизация и последующая редиплоидизация генома Задесенец К.С., Ершов Н.И., Рубцов Н.Б. VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС).
Genome reorganization after whole genome duplication in evolution of free-living flatworms of the genus Macrostomum Zadesenets K., Ershov N., Jetybayev I., Berezikov E., Schaerer L., Rubtsov N. International Conference on Polyploidy
Сочетанное действие социального стресса и описторхоза вызывает патологи поведения у мышей Августинович ДФ, Вишнивецкая ГБ, Бондарь НП XV международный междисциплинарный конгресс «НЕЙРОНАУКА ДЛЯ МЕДИЦИНЫ И ПСИХОЛОГИИ»
Изменение экспрессии генов в мозге мышей под влиянием социального стресса и описторхоза Шацкая НВ, Кашина ЕВ, Августинович ДФ. XV международный междисциплинарный конгресс «НЕЙРОНАУКА ДЛЯ МЕДИЦИНЫ И ПСИХОЛОГИИ»
The comprehensive analysis of motifs co-occurrence in ChIP-seq data with MCOT package Левицкий Виктор Георгиевич
Ощепков Дмитрий Юрьевич
Землянская Елена Васильевна
Миронова Виктория Владимировна
Меркулова Татьяна Ивановна VII International Congress of Vavilov society of geneticists and breeders and associate symposiums
The comprehensive analysis of motifs co-occurrence in ChIP-seq data with MCOT package Левицкий Виктор Георгиевич
Миронова Виктория Владимировна
Землянская Елена Васильевна
Ощепков Дмитрий Юрьевич
Меркулова Татьяна Ивановна 9-ая Московская конференция по вычислительной молекулярной биологии МССМВ'19
Stress early in life alters the murine cortical transcriptome in age-dependent manner N.P. Bondar, N.I. Ershov, A.S. Shulyupova, P.E. Kisaretova, V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, T.I. Merkulova 48th Meeting of the European Brain and Behaviour Society
Новый маркерный признак низкодифференцированных клеток эукариот и области его применения в биологии и медицине Богачев С.С., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Долгова Е.В., Риттер Г.С., Андрушкевич О.М., Ефремов Я.Р., Байбородин С.И., Николин В.П., Попова Н.А., Леплина О.Ю., Останин А.А., Черных Е.Р., Мишинов С.В., Ступак В.В., Таранов О.С., Сидоров С.В., Колчанов Н.А. Международный конгресс «VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы»
Препарат двуцепочечной РНК из дрожжей Saccharomyces сerevisiae как новое радиопротекторное средство Риттер Г.С., Николин В.П., Попова Н.А., Кисаретова П.Э., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Кирикович С.С., Байбородин С.И., Таранов О.С., Ефремов Я.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С. Международный конгресс «VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы»
Morris water maze performance correlates with gene expression in the
hippocampus: A transcriptome analysis Кисаретова Полина Эдуардовна, Шулюпова Анастасия Сергеевна, Иванчихина Анна Михайловна, Климова Наталья Викторовна, Ершов Никита Игоревич, Решетников Василий Владимирович, Меркулова Татьяна Ивановна, Бондарь Наталья Петровна The 10th IBRO World Congress of Neuroscience
Различия в проявлении пространственной памяти у мышей: роль экспрессии генов в гиппокампе Кисаретова Полина Эдуардовна, Шулюпова Анастасия Сергеевна, Иванчихина Анна Михайловна, Климова Наталья Викторовна, Ершов Никита Игоревич, Решетников Василий Владимирович, Меркулова Татьяна Ивановна, Бондарь Наталья Петровна XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития»
Early life stress leads to enhanced susceptibility to social stress in adult male C57BL/6 mice Кисаретова Полина Эдуардовна, Решетников Василий Владимирович, Ершов Никита Игоревич, Бондарь Наталья Петровна 11th International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics” – SBB-2019
Transcriptomic analysis of barley partial albinism Nickolay Shmakov, Anastasiya Glagoleva, Gennadiy Vasiliev, Dmitry Afonnikov, Elena Khlestkina 5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding
ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ В ОТДЕЛАХ ГОЛОВНОГО МОЗГА У КРЫС, СЕЛЕКЦИОНИРОВАННЫХ НА РУЧНОЕ И АГРЕССИВНОЕ ПОВЕДЕНИЕ Чадаева И.В., Климова Н.В., Шихевич С.А., Кожемякина Р.В. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Функциональная аннотация регуляторных полиморфизмов, связанных с развитием онкологических заболеваний. Леберфарб Е.Ю., Дегтярева А.О., Брусенцов И.И., Ефимова Е.Г., Меркулова Т.И. VI Съезд биофизиков России
Novel genomic marker for the Alm locus in barley identified based on transcriptome analysis N.A. Shmakov, A.Yu. Glagoleva, G.V. Vasiliev, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina PlantGen2019
ИССЛЕДОВАНИЕ ИЗМЕНЕНИЙ ПРОТЕОМА И ТРАНСКРИПТОМА ДРОЖЖЕЙ SACCHAROMYCES CEREVISIAE ПРИ ПЕРЕХОДЕ К АНАЭРОБНЫМ УСЛОВИЯМ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ Мещерякова И. А., Банникова С. В., Розанов А. С., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Демидов Е. А., Слынько Н.М., Старостин К. В., Пельтек С. Е. МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮКАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ,И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»
ОМИКСНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ ДЛЯ ХАРАКТЕРИСТИКИ БИОРЕСУРСОВ Пельтек С.Е. , Старостин К.В., Ершов Н., Ефимов В.М., Шляхтун В.Н., Мещерякова И. А., Банникова С. В., Розанов А. С., Брянская А.В., Демидов Е.А. МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮ КАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ,И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»
Анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq Ковалев С.С., Леберфарб Е.Ю., Орлова Н.Г., Брагин А.О., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. VI Съезд биофизиков России
Исследование молекулярных основ глиобластомы с помощью электронных ресурсов и баз данных Ковалев С.С., Белоусова Ю.П., Галиева Е.Р., Леберфарб Е.Ю., Орлов Ю.Л. Международная научно-практическая конференция «Биоразнообразие и сохранение генофонда флоры, фауны и народонаселения центрально-азиатского региона» 11-15 сентября 2019. г.Кызыл.
Database on alternative gene splicing in glioma cell cultures Kovalev S.S., Gubanova N.V., Lieberfarb E.Y., Galieva A.G., Orlov Y.L. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019) The Eleventh International Young Scientists School.
Разработка компьютерной базы данных альтернативного сплайсинга в глиомах Орлов Ю.Л., Ковалев С.С., Бабенко В.Н., Леберфарб Е.Ю. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
2018
Патогенный потенциал двух воздействий на хозяина – инфицирования трематодой Opisthorchis felineus (Rivolta, 1884) и социального стресса Августинович Д.Ф., Ковнер А.В., Вишнивецкая Г.Б., Кашина Е.В., Шацкая Н.В., Бондарь Н.П., Львова М.Н. VIСъезд Паразитологического общества "Современная паразитология - основные тренды и вызовы"
Hippocampal differentially expressed genes between tame and
aggressive foxes are included in pathways associated with stress,
behavior and adult neurogenesis Гербек Ю.Э., Генаев М.А., Васильев Г.В., Гулевич Р.Г., Шихевич С.Г., Шепелева Д.В., Афонников Д.А., Трут Л.Н. The 11th International Multiconference BGRS\SB-2018
Gene Expression Related to Aggressive Behavior on Rat Model Чадаева И.В., Климова Н.В., Брагин А.О., Кожемякина Р.В., Шихевич С.Г., Орлов Ю.Л. BGRS 2018
Влияние раннего постнатального стресса на транскриптом гиппокампа головного мозга 15-дневных мышей Лепешко А. А., Рябушкина Ю. А., Решетников В. В., Бондарь Н. П. Зимняя молодежная школа ПИЯФ по биофизике и молекулярной биологии
Влияние изменения режима аэрации на транскриптом и протеом S.cerevisiae А.С. Розанов, И.А. Мещерякова, С.В. Банникова, Д.Ю. Ощепков, Г.В. Васильев, С.Е. Пельтек Астана Биотех 2018
Genetic mechanisms of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in Solanum phureja A.A. Egorova,
N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya,
K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology” – BGRS\SB-2018
Whole genome duplication in genome evolution of the free-living flatworm Macrostomum lignano (Platyhelmnithes, Turbellaria) Zadesenets K., Ershov N., Schärer L., Berezikov E., Rubtsov N.B. XIV ISFB
WGD in genome evolution of the free-living flatworm Macrostomum lignano Zadesenets K.S., Ershov N.I., Schärer L., Berezikov E., Rubtsov N.B. 22th International Chromosome Conference
Investigating genetic control of pigmentation in mutant barley lines with RNA-seq. BGRS, 2018 N.Shmakov, A.Glagoleva, A.Doroshkov, G.Vasiliev, N.Shatskaya, D.Afonnikov, E.Khlestkina BGRS\SB-2018 The 11th International Conference Systems Biology and Biomedicine, SBioMed-2018 Symposium
Длительное отделение от матерей в ранний период жизни приводит к когнитивным и поведенческим нарушениям у взрослых самок мышей: ключевая роль гиппокампа Решетников В.В., Ковнер А.В., Рябушкина Ю.А., Лепешко А.А., Бондарь Н.П. ГИППОКАМП И ПАМЯТЬ: НОРМА И ПАТОЛОГИЯ
Особенности изменений транскриптома гиппокампа головного мозга 15-ти дневных мышей, подвергавшихся раннему постнатальному стрессу Лепешко А.А., Рябушкина Ю.A., Решетников В.В., Бондарь Н.П. ГИППОКАМП И ПАМЯТЬ: НОРМА И ПАТОЛОГИЯ
Previous mother’s experience and early life stress: impact on aggression and cognition in adult mice V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, N.P. Bondar The 11th International Conference BGRS\SB-2018
Impact of early life stress on susceptibility
to chronic social stress in adult mice A. Lepeshko, V. Reshetnikov, N. Bondar The 11th International Conference BGRS\SB-2018
Consequences of early life stress in mice: transcriptional and epigenetic hallmarks in frontal cortex and hippocampus N.P. Bondar, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, T.I. Merkulova The 11th International Conference BGRS\SB-2018. Simposium Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB-2018
The long-term consequences of early-life dexamethasone treatment on the cognitive ability of male mice and gene expression in the hippocampus U.I. Batluk, K.V. Burdeeva, A.O. Degtyareva, O.M. Dolganova, N.I. Ershov, T.I. Merkulova, N.P. Bondar The 11th International Conference BGRS\SB-2018. Simposium Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB-2018
Inferring phylogeny among cryptic lineages of Eisenia nordenskioldi nordenskioldi (Lumbricidae) based on transcriptomic data Shekhovtsov S.V., Ershov N.I., Vasiliev G.N., Peltek S.E. Biodiversity: Genomics and Evolution (BioGenEvo-2018)
Identification of genes, associated with black pigmentation of seeds in cereals, based on transcriptomic analysis. A.Yu. Glagoleva, N.A. Shmakov, O.Yu. Shoeva, G.V. Vasiliev, N.V. Shatskaya, A. Börner, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina The Tenth International Young Scientists School (SBB-2018)
Dynamics of S. cerevisiae proteomic and transcriptomic response to changes in aeration conditions A. Rozanov, I. Meshcheryakova, S. Bannikova, D. Oshchepkov, G. Vasiliev, S. Peltek 11th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology” — BGRS\SB-2018
The comparison of brain stem transcriptomes in rats from hypertensive ISIAH and normotensive WAG strains L.A.Fedoseeva, L.O.Klimov, N.I.Ershov, V.M.Efimov, A.L.Markel, Y.L.Orlov, O.E.Redina Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
Computer analysis of alternative splicing events by RNA-seq data in brain cells V.N. Babenko, N.V. Gubanova, A.V. Tsukanov, S.S. Kovalev, A.O. Bragin,G.V. Vasiliev, Yu.L. Orlov Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
Влияние стресса матери на проявление последствий раннего постнатального стресса у взрослых самцов мышей Батлук У.И., Решетников В.В, Рябушкина Ю.А.,
Бондарь Н.П. Фундаментальные аспекты компенсаторно-приспособительных процессов
Отставленные эффекты неонатального введения дексаметазона: нурушение когнитивных способностей взрослых самцов мышей и изменение экспрессии генов в гиппокампе У. И. Батлук, К. В. Бурдеева, А.С. Шулюпова, Н.П. Бондарь V МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОТЕХНОЛОГОВ, МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ И ВИРУСОЛОГОВ OpenBio-2018
Detoxification system of the food-borne parasite Opisthorchis felineus, Rivolta 1884: functional and bioinformatic studies Maria Y. Pakharukova, Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov 14th International Congress of Parasitology (ICOPA)
Comparative transcriptomics of Opisthorchiidae liver flukes Maria Y. Pakharukova, Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov 14th International Congress of Parasitology (ICOPA)
Поиск молекулярных терапевтических мишеней среди белков системы биотрансформации ксенобиотиков у описторхид Пахарукова М.Ю., Ершов Н.И., А.В. Ковнер, В.А. Мордвинов СОВРЕМЕННАЯ ПАРАЗИТОЛОГИЯ — ОСНОВНЫЕ ТРЕНДЫ И ВЫЗОВЫ. Материалы VI Съезда Паразитологического общества: Международная конференция:
Opisthorchiidae triad: comparative genomics of the carcinogenic liver flukes using a draft genome of Opisthorchis felineus Viatcheslav A. Mordvinov, Nikita I. Ershov, Mariya Y. Pakharukova, Dmitry A. Afonnikov 14th International Congress of Parasitology (ICOPA)
Геном печеночного сосальщика Opisthorchis felineus (Rivolta, 1884) и сравнительная геномика описторхид Мордвинов В.А., Пахарукова М.Ю., Ершов Н.И. СОВРЕМЕННАЯ ПАРАЗИТОЛОГИЯ — ОСНОВНЫЕ ТРЕНДЫ И ВЫЗОВЫ. Материалы VI Съезда Паразитологического общества: Международная конференция:
Comparative transcriptomics of Opisthorchiidae liver flukes: identification of potential therapeutic targets in detoxification system Maria Y. Pakharukova, Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov 28th Annual Meeting of the German Society for Parasitology
Новый подход к поиску радиопротекторов Риттер Г.С., Николин В.П., Попова Н.А., Кисаретова П.Э., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Кирикович С.С., Байбородин С.И., Таранов О.С., Ефремов Я.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С. V МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОТЕХНОЛОГОВ, МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ И ВИРУСОЛОГОВ OpenBio-2018
Изучение радиопротекторного действия двуцепочечной РНК, выделенной из дрожжей Saccharomyces cerevisiae Риттер Г.С., Николин В.П., Попова Н.А., Кисаретова П.Э., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Кирикович С.С., Байбородин С.И., Таранов О.С., Ефремов Я.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С. Четвертый междисциплинарный научный форум с международным участием «Новые материалы и перспективные технологии»
An integrative framework for effective identification of functional disease-associated variants in genome-wide studies E. Korbolina, L. Bryzgalov, A. Degtyareva, M. Verstunina, T. Merkulova Systems Biology and Biomedicine (SBioMed-2018): Symposium (21-22 Aug. 2018, Novosibirsk, Russia)
New regulatory SNP associated with colorectal cancer E. Leberfarb,
A. Degtyareva, V. Maximov, M. Voevoda, A. Autenshlus, D. Morozov,
A. Sokolov, D. Veselova, S. Bannikova, E. Demidov, L. Bryzgalov, T. Merkulova 11-я Международная мультиконференция по биоинфорBioinformatics of Genome Regulation and Structure Systems Biology — BGRSSB-2018
Transcriptional and epigenetic consequences of early life stress on murine frontal cortex N.P. Bondar, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, A.S. Shulyupova, T.I. Merkulova Latest Advances in Development & Function of Neuronal Circuits, Cold Spring Harbor Asia conference
The overlapped motifs co-occurrence in ChIP-seq data. V.G. Levitsky,D.Y. Oshchepkov, E.V. Zemlyanskaya, V.V. Mironova, E.V. Ignatieva,O.A. Podkolodnaya, T.I. Merkulova The 11th International Conference “On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB'2018)
Genetic control of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in potato plants Solanum phureja A.A.Egorova, N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya, K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov "PLANT FUNCTIONING UNDER ENVIRONMENTAL STRESS" SEPTEMBER 12 - 15, 2018, CRACOW, POLAND.
2017
GENE EXPRESSION ANALYSIS OF EGR1, GRIA2, MAPK1, BY qPCR IN BRAIN AREAS OF RATS SELECTED BY AGGRESSIVE BEHAVIOR Chadaeva I.V., Klimova N.V., Markel A.L., Vasiliev G.V. БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
Компьютерное моделирование низкомолекулярных ингибиторов эффекторного домена смерти белка FADD Иванисенко Н.В. Международный конгресс Биотехнология: состояние и перспективы развития
Изучение эволюции генома свободноживущего плоского червя Macrostomum lignano (Platyhelminthes, Turbellaria) с помощью высокопроизводительного секвенирования микродиссекционных ДНК-библиотек Задесенец КС, Березиков Е, Ершов НИ, Тупикин АЕ, Кабилов МР, Рубцов НБ. Высокопроизводительное секвенирование в геномике
КАНДИДАТНЫЕ SNP-МАРКЕРЫ ТАТА БОКСОВ ПРОМОТОРОВ ГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА ДЛЯ РЕПРОДУКТИВНОГО ПОТЕНЦИАЛА М. Пономаренко, И. Чадаева, Д. Рассказов, Е. Шарыпова, И. Драчкова, Е. Кашина, Л.К. Савинкова, П. Пономаренко, Л.В. Осадчук, А.В. Осадчук БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
Long-lasting consequences of early life stress in mice: changes in gene expression and H3K4me3 profile. Bondar N.P. , Reshetnikov V.V., Studenikina A.A., Ryabushkina Yu.A., Lepeshko A.A., Ershov N.I., Merkulova T.I. 2017 Annual Meeting, Genes, Brain and Behavior
Early life stress promotes the changes in whole-genome distribution of H3K4me3 in prefrontal cortex of adult mice. Bondar N.P., Ershov N.I., Lepeshko A.A., Reshetnikov V.V., Ryabushkina Yu.A., Merkulova T.I. БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
The impact of early life stress on distribution of H3K4Me3 histone modification in murine prefrontal cortex: the role in gene expression. V.V. Reshetnikov, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, Yu.A. Ryabushkina, A.A. Studenikina, N.P. Bondar, T.I. Merkulova 24th Multidisciplinary international neuroscience and biological psychiatry "stress and behavior" conference
Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на экспрессию генов глюкокортикоидной и глутаматной систем в головном мозге мышей В.В. Решетников, А.А. Студеникина, Ю.А. Рябушкина, Т.И. Меркулова, Н.П. Бондарь БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
Генетический контроль уровня норадреналина в гипоталамусе крыс НИСАГ и сцепленных с ним признаков О.Е. Редина, С.Э. Смоленская, Н.И. Ершов, М.А. Гилинский, Е.В. Антонов, А.Л. Маркель Международная конференция «Беляевские чтения», посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
NOVEL APPROACH TO FUNCTIONAL SNPs DISCOVERY FROM GENOME-WIDE DATA REVEALS PROMISING VARIANTS FOR COLON CANCER RISK E.E. Korbolina I.I. Brusentsov L.O. Bryzgalov E.Yu. Leberfarb A.O. Degtyareva T.I. Merkulova BELYAEV CONFERENCE
Чувствительность к гепатоканцерогенезу у мышей ассоциирована с экспрессией мРНК ядерных рецепторов Car, PPARs и их генов-мишеней Н.В. Багинская, Е.В. Кашина, М.Ю. Шаманина, С.И. Ильницкая, В.А.Мордвинов БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
ЗНАЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ КОЛЛЕКЦИЙ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ЗАДАЧ ПРЯМОЙ И ОБРАТНОЙ ГЕНЕТИКИ РАСТЕНИЙ Хлесткина Е.К.*, Афонников Д.А., Бернер А., Быкова И.В., Васильев Г.В., Герасимова С.В., Глаголева А.Ю., Гордеева Е.И., Григорьев Ю.Н., Короткова А.М., Пшеничникова Т.А., Стрыгина К.В., Шацкая Н.В., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Юдина Р.С. III МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ГЕНОФОНД И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ», ПОСВЯЩЕННАЯ 130-ЛЕТИЮ Н.И. ВАВИЛОВА (28.03. – 30.03.2017)
GENETICS AND OMICS APPROACHES TO BETTER UNDERSTANDING REGULATION OF METABOLI C PATHWAYS UNDERLYING PIGMENTATION IN WHEAT AND BARLEY O.Y. Shoeva, E.I. Gordeeva, N.A. Shmakov, K.V. Strygina, A.Y. Glagoleva, T.V. Kukoeva , N.V. Shatskaya , G.V. Vasiljev , A. Börner, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina* 4-ая международная научная конференция "Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений" (PlantGen2017)
The hidden tetraploidy in the M. lignano genome Zadesenets KS, Ershov NI, Schaerer L, Berezikov E, Rubtsov NB 11th Macrostomum Meeting
IDENTIFICATION OF GENES CONTROLLING BLACK PIGMENTATION IN CEREALS Glagoleva A.Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N. V., Shmakov N.A., Afonnikov D.A., Shoeva O. Y., Börner A., Khlestkina E.K. 4th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)
RNAseq-BASED DECIFERING OF MOLECULAR MECHANISMS UNDERLYING TRAIT FORMATION: NON-ALTERNATIVE WAY IN CASE OF IMPEDED METABOLITE IDENTIFICATION Glagoleva A.Y., Shmakov N.A., Shoeva O. Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Börner A., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике" (HSG-2017)
ИДЕНТИФИКАЦИЯ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ЧЕРНОЙ ОКРАСКОЙ КОЛОСА У ЗЛАКОВ, НА ОСНОВЕ ТРАНСКРИПТОМНОГО АНАЛИЗА Глаголева А.Ю., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Васильев Г.В., Шацкая Н.В., Бернер А., Афонников Д.А., Хлесткина Е.К. IV Вавиловская международная конференция «Идеи Н. И. Вавилова в современном мире»
КОМБИНАТОРНАЯ ТЕРАПИЯ ОПИСТОРХОЗА: ЭФФЕКТЫ ВОЗДЕЙСТВИЯ НА МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МИШЕНИ IN VITRO Пахарукова М.Ю., Ершов Н.И., Трипати Т., Мордвинов В.А. МЕЖДУНАРОДНОЙ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ «МОЛЕКУЛЫ И СИСТЕМЫ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ И АДРЕСНОЙ ТЕРАПИИ»
The Genome of Opisthorchis felineus N. Ershov, M. Pomaznoy, D. Afonnikov, K. Gunbin, M. Genaev, K. Ustiantsev, M. Pakharukova, E. Prokhortchouk, A. Mazur, N. Chekanov, K. Skryabin, N. Kolchanov, et al., V. Mordvinov Asian Neglected Tropical Disease Conference 2017 (NTDASIA2017)
Comparative transcriptomics of Opisthorchiidae liver flukes Ershov NI, Pakharukova MY, Afonnikov DA, Kovner A, Mordvinov VA Swiss TPH Winter Symposium 2017 Helminth Infection – from Transmission to Control, TOPIC WORKING GROUP MEETING
Экспрессия генов, связанных с поведением, стрессом и фотопериодизмом, в дорзальном гиппокампе доместицируемых лисиц. Гербек Ю.Э., Генаев М.А., Васильев Г.В., Гулевич Р.Г., Шихевич С.Г., Шепелева Д.В., Афонников Д.А., Трут Л.Н. Международная конференция "Беляевские чтения".
Expression of genes related with stress and behavioral regulation in dorsal hippocampus of the experimentally domesticated foxes. Herbeck Y, Genaev M, Vasiliev G, Gulevich R, Shikhevich S, Shepeleva D, Afonnikov D, Trut L. BNA international Festival of Neuroscience 2017
Компьютерные оценки ошибок коротких прочтений ДНК при высокопроизводительном секвенировании Васильев Г.В., Абнизова И.И., те Боекхорст Р., Галиева Э.Р., Орлов Ю.Л. Вторая Международная научно-практическая конференция «NGS в медицинской генетике 2017».
The expression of GRIA1, CACNA2D3, POMC and MAPK1 genes and their role in aggressive behavior in rats Mazurina E.P., Tabanyuhov K.A., Chadaeva I.V., Kozhemyakina R.V., Klimova N.V., Orlov Y.L. Systems Biology and Bioinformatics: the Ninth International Young Scientists School SBB-2017
2016
Использование NGS методов выявления функционально активных районов генома для поиска полиморфизмов, определяющих развитие патологий, на примере колоректального рака Е.Ю. Леберфарб, Л.О. Брызгалов, И.И.Брусенцов, Ю.Л. Орлов, Т.И. Меркулова NGS в медицинской генетике
Мишень-направленная доставка терапевтических нуклеиновых кислот для направленного воздействия на экспрессию генов, ответственных за пролиферацию и лекарственную устойчивость опухолевых клеток М.А. Маслов1, О.В. Марков2, Т.О. Кабилова2, Е.В. Шмендель1, П.А. Пучков1, Д.В. Гладких2, И.В. Черников2, А.В. Филатов2, Н.Л. Миронова2, О.А. Патутина2, Н.Г. Морозова1, В.И. Каледин3, А.Н. Кораблев3, В.П. Николин3, А.А. Ходаков3, Н.А. Попова3, Е.Л. Черноловская2, М.А. Зенкова2 К о м п л е к с н ы е м е ж д и с ц и п л и н а р н ы е ф у н- дам е н т а л ь н ы е и с с л е д о в а н и я (комфи) в области молекулярной и клеточной организации биологических структур и процессов».
РАЗРАБОТКА СТРАТЕГИИ ЭЛИМИНАЦИИ АСЦИТА НА МОДЕЛИ ОПУХОЛИ МЫШИ КРЕБС-2 Поттер Е.А., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Николин В.П., Попова Н.А., Ефремов Я.Р., Таранов О.С., Богачев С.С. XIII ВСЕРОССИЙСКАЯ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ С МЕЖДУНАРОДНЫМ УЧАСТИЕМ «ОТЕЧЕСТВЕННЫЕ ПРОТИВООПУХОЛЕВЫЕ ПРЕПАРАТЫ» памяти А.Ю. Барышникова
РЕЗУЛЬТАТЫ II ФАЗЫ КЛИНИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ ПРЕПАРАТА «ПАНАГЕН» И ДАННЫЕ ПО 5-ЛЕТНЕЙ БЕЗРЕЦИДИВНОЙ ВЫЖИВАЕМОСТИ ПАЦИЕНТОВ, УЧАСТВОВАВШИХ В ИССЛЕДОВАНИИ С.С. Богачев, А.С. Проскурина, Т.С. Гвоздева, Е.А. Поттер, Е.В. Долгова, К.Е. Орищенко, В.П. Николин, Н.А. Попова, Е.Р. Черных, А.А. Останин, О.Ю. Леплина, Н.А. Вараксин, Т.Г. Рябичева, В.В. Дворниченко, Д.М. Пономаренко, С.В. Сидоров. XIII ВСЕРОССИЙСКАЯ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ С МЕЖДУНАРОДНЫМ УЧАСТИЕМ «ОТЕЧЕСТВЕННЫЕ ПРОТИВООПУХОЛЕВЫЕ ПРЕПАРАТЫ» памяти А.Ю. Барышникова
Влияние SNP rs201381696 ТАТА бокса гена LEP человека на экспрессию репортерного гена LUC Шарыпова ЕБ, Кашина ЕВ, Аркова ОВ, Бондарь НП, Аршинова ТВ, Пономаренко ПМ, Пономаренко МП, Савинкова ЛК BGRS 2016
Связь метаболических изменений, вызванных клофибратом и авандией, с уровнем индуцированного гепатоканцерогенеза у разных линий мышей. Ильницкая С.И Каледин В.И. Форум «Биомедицина-2016»
Development of Microsatellite Markers According to BAC Sequencing Data and Their Physical Mapping to the Bread Wheat 5B Chromosome M.A. Nesterov, D.A. Afonnikov, E.M. Sergeeva, L.A. Miroshnichenko, M.K. Bragina, A.O. Bragin, G.V. Vasiliev, E.A. Salina The Tenth International Conference on the Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2016)
Иммуномодулирующее влияние ингибиторов индоламин‑2,3-диоксигеназы (идо) на опухолевый рост. Попова Н. А., Николин В. П., Каледин В. И., Лушникова Е. Л. Первый Калининградский научный иммунологический форум
Immunostimulating RNA: antitumor and antimetastatic effects. Kabilova T. O. , Sen’kova A. V. , Nikolin V. P. , Popova N. A. , Vlassov V. V. , Zenkova M. A. , Chernolovskaya E. L.. Международная конференция "Химическая биология" посвященная 90-летию академика Д. Г. Кнорре .
Genetic and molecular mechanisms crucial for hypertension development in the ISIAH rats. O.E. Redina, L.O. Klimov, M.A. Ryazanova, L.A. Fedoseeva, T.O. Abramova, Yu.V. Alexandrovich, S.E. Smolenskaya, Ye.V. Antonov, N.I. Ershov, V.M. Efimov, A.L. Markel. Десятая Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology), BGRS\SB-2016.
Candidate SNP markers of aggressiveness-related complications and comorbidities of hereditary diseases predicted by a significant alteration in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters M.P. Ponomarenko, D.A. Rasskazov, E.B. Sharypova, I.V. Chadaeva, P.M. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov BGRS\SB-2016: the International Satellite Symposium “Systems Biology and Biomedicine, SBioMed-2016"
Mutations spectra of major oncogenes in patients with multiple primary neoplasia Vasiliev GV, Savkova AV, Gerasimov AV BGRS\SB-2016
The opposing effects of short- and long-term social stress on prefrontal cortex transcriptome N.P. Bondar, L.O. Bryzgalov, N.E. Ershov, F.E. Gusev, V.V. Reshetnikov, D.F. Avgustinovich, M.V. Tenditnik, E.I. Rogaev, T.I. Merkulova BGRS\SB-2016, Symposium «Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics” (CSGB- 2016)
Regulatory single nucleotide polymorphisms (rSNPS) at the promoters 1A and 1B of the human APC gene M.Y. Matveeva, E.V. Kashina, V.V. Reshetnikov, L.O. Bryzgalov, E.V. Antontseva, N. P. Bondar, T. I. Merkulova, BGRS\SB-2016: the International Satellite Symposium “Systems Biology and Biomedicine, SBioMed-2016"
The gene-expression profile of renal cortex in rats with inherited stress-induced arterial hypertension (ISIAH). Marina A. Ryazanova, Larisa A. Fedoseeva, Nikita I. Ershov, Arcady L Markel, Olga E. Redina. Hypertension Seoul 2016
Comparative transcriptional profiling of hypothalamus in ISIAH rats with inherited stress-induced arterial hypertension and normotensive Wistar Albino Glaxo rats Leonid Klimov, Nikita Ershov, Vadim Efimov, Arcady Markel, Olga Redina Hypertension Seoul 2016
Влияние раннего постнатального стресса на профиль распределения метки активного хроматина H3K4me3 Решетников В.В.,Лепешко А.А., Ершов Н.И., Студеникина А.А., Бондарь Н.П. VII Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биология живых существ»
CHANGES IN THE BRAIN TRANSCRIPTOME OF OXYS RATS AS THE SIGNS OF ALZHEIMER’S DISEASE DEVELOP AND EFFECTS OF SKQ1 N.A. Stefanova, N.I. Ershov, N.A. Muraleva, N.G. Kolosova BGRS-2016 and Structure\ Systems Biology — BGRS\SB-2016 Symposium Systems Biology and Biomedicine (SBioMed-2016)
Two congenic strains prove effects on cataract and retinopathy but not on brain neurodegeneration in senescence-accelerated OXYS rats E.E. Korbolina A.O. Vitovtov N.G. Kolosova The 10th International Conference on the Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology
DEVELOPMENT OF CATARACT AS THE BASIC SELECTION TRAIT IN THE ONTOGENY OF SENESCENCE-ACCELERATED OXYS RATS Yu.V. Rumyantseva A.Z. Fursova E.E. Korbolina N.G. Kolosova The 10th International Conference on the Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology
2015
Ассоциированные с ожирением потенциальные SNP-маркеры rs200487063, rs34104384, и rs201381696 изменяют сродство ТАТА-связывающего белка к промотору гена LEP человека Аркова О.В., Рассказов Д.А., Драчкова И.А., Пономаренко П.М., Аршинова Т.В., Пономаренко М.П., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2015 (AMCA 2015)
Antitumor and antimetastatic effect of short immunostimulating dsRNA. M.A. Zenkova, T.O. Kabilova, V.P. Nikolin, N.A. Popova, V.V. Vlassov, E.L. Chernolovskaya. 11-th Annual meeting of the oligonucleotide therapeutics Society (OTS), Leiden, the Netherlands
Мишень-направленная доставка терапевтических нуклеиновых кислот для направленного воздействия на экспрессию генов, ответственных за пролиферацию и лекарственную устойчивость опухолевых клеток М.А. Маслов, О.В. Марков, Т.О. Кабилова, Е.В. Шмендель, П.А. Пучков, Д.В. Гладких, И.В. Черников, А.В. Филатов, Н.Л. Миронова, О.А. Патутина, Н.Г. Морозова, В.И. Каледин, А.Н. Кораблев, В.П. Николин, А.А. Ходаков, Н.А. Попова, Е.Л. Черноловская, М.А. Зенкова 12-13 октября 2015 года Конференция «К о м п л е к с н ы е м е ж д и с ц и п л и н а р н ы е ф у н- дам е н т а л ь н ы е и с с л е д о в а н и я (комфи) в области молекулярной и клеточной организации биологических структур и процессов». Москва, Институт биоорганической химии и
Механизм влияния полиморфизмов кор-промоторов генов пищевого поведения человека на взаимодействие с ТАТА-связывающим белком Аркова Ольга Владимировна, Пономаренко Михаил Павлович, Аршинова Татьяна Валентиновна, Савинкова Людмила Кузьминична 7 съезд Российского общества медицинских генетиков
Изучение потенциально регуляторных SNPs в промоторных районах гена АРС человека Матвеева М.Ю., Кашина Е.В., Брызгалов Л.О., Антонцева Е.В., Бондарь Н.П., Решетников В.В., Меркулова Т.И. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Выявление и функциональный анализ регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстого кишечника Леберфарб Е.Ю., Брызгалов Л.О., Брусенцов И.И., Дегтярева А.О., Меркулова Т.И. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Identification of functional networks associated with cell death in the retina of OXYS rats during the development of retinopathy D.V.Telegina, E.E. Korbolina, N.I. Ershov, O.S. Kozhevnikova The 7th International Young Scientists School "Systems Biology and bioinformatics" SBB-15
SYNTENY AND PHYSICAL MAP OF THE SHORT ARM OF CHROMOSOME 5B OF COMMON WHEAT Salina E.A., Sergeeva E.M., Nesterov M.A., Kiseleva A.A., Timonova E.M., Vasiliev G.V., Frenkel Z., Korol A., Safar J., Dolezel J., International Wheat Genomic Sequencing Consortium The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”
DEVELOPMENT AND PHYSICAL MAPPING OF SSR MARKERS ON CHROMOSOME 5BS OF THE HEXAPLOID WHEAT (Triticum aestivum L.) Nesterov M.A., Sergeeva E.M., Miroshnichenko L.A., Koltunova M., Vasiliev G.V., Salina E.A. The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”
Molecular adaptation to social defeat stress: effects on prefrontal cortex transcriptome. N.P. Bondar, L.O. Bryzgalov, D.F. Avgustinovich, M.V. Tenditnik, E.I. Rogaev, T.I. Merkulova. 17th Annual Genes, Brain & Behaviour Meeting
Prophylaxis of carcinogenesis by noncarcinogenic compounds competing with carcinogens for cellular targets Kaledin V.I. XV world cancer congress conference
Канцерогенез: новая - старая - парадигма Каледин В.И. IV международная мультидисциплинарная конференция "Актуальные проблемы науки XXI века
Adult and infective stages of the trematode Opisthorchis felineus: different hosts – different transcriptomes. Михаил Помазной, Мария Логачева, Нил Янг, Алексей Пенин, Никита Ершов, Алексей Катохин, Вячеслав Мордвинов Infectious Disease Genomics
2014
Идентификация микроРНК генов плоских червей семейства Opisthorchiidae В.Ю. Овчинников, Д.А. Афонников, Г.В. Васильев, Е.В. Кашина, B. Sripa, В.А. Мордвинов, А.В. Катохин Международная конференция молодых ученых биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов
Annotations in silico of 388 SNPs of the core-promoters of 68 human feeding behavior genes in terms of their potential associations with nervous disorders Ponomarenko M.P., Arkova O.V., Saik O.V., Arshinova T.V., Ponomarenko P.M., Rasskazov D.A., Genaev M.A., Komyshev E.G., Savinkova L.K., Kolchanov N.A. BGRS\SB-2014
Auxin-responsive transcriptome of Arabidopsis thaliana roots Миронова Виктория Владимировна Новикова Дарья Дмитриевна Омельянчук Надежда Анатольевна Васильев Геннадий Владимирович Климова Наталья Викторовна BGRS-2014
EXPERIMENTALLY VERIFIED TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITES MODELS APPLIED FOR COMPUTATIONAL ANALYSIS OF CHIP-SEQ DATA. D.Y. Oshchepkov, V.G. Levitsky, I.V. Kulakovskiy, N.I. Ershov, V.J. Makeev, T.I. Merkulova. BGRS\SB-2014
DIOXIN-MEDIATED REGULATION OF GENES INVOLVED IN CYTOKINES PRODUCTION BY MACROPHAGES E.V. Kashina, D.Y. Oshchepkov, E.A. Oshchepkova, A.G. Shilov, E.V. Antontseva, D.P. Furman, V.A. Mordvinov BGRS\SB-2014
ХАРАКТЕРИСТИКА РЕЖИМОВ СИНЕРГИЧНОГО ДЕЙСТВИЯ ЦИКЛОФОСФАНА И ДВУЦЕПОЧЕЧНОЙ ДНК, ЭРАДИЦИРУЮЩИХ ПЕРВИЧНЫЙ АСЦИТ КРЕБС-2 Алямкина Е.А., Долгова Е.В., Минкевич А.М., Николин В.П., Попова Н.А., Ефремов Я.Р., Байбородин С.И., Проскурина А.С., Таранов О.С., Омигов В.В., Шурдов М.А., Останин А.А., Черных Е.Р., Богачев С.С. Новейшие методы клеточных технологий в медицине
ФЕНОМЕН «ОТСРОЧЕННОЙ СМЕРТИ»: ХАРАКТЕРИСТИКА СИНЕРГИЧНОГО ТОКСИЧЕСКОГО ДЕЙСТВИЯ ЦИКЛОФОСФАНА И ЭКЗОГЕННОЙ ДНК Долгова Е.В., Проскурина А.С., Николин В.П., Попова Н.А., Алямкина Е.А., Ефремов Я.Р., Таранов О.С., Омигов В.В., Загребельный С.Н., Шурдов М.А., Останин А.А., Черных Е.Р., Богачев С.С. Новейшие методы клеточных технологий в медицине
СИНЕРГИЧНЫЙ ТОКСИЧЕСКИЙ ЭФФЕКТ ЦИКЛОФОСФАНА И ПРЕПАРАТА ДВУЦЕПОЧЕЧНОЙ ДНК НА РАЗВИТЫЙ ОПУХОЛЕВЫЙ ТРАНСПЛАНТАТ Минкевич А.М., Алямкина Е.А., Николин В.П.2, Попова Н.А., Козел А.В., Долгова Е.В., Ефремов Я.Р., Байбородин С.И., Андрушкевич О.М., Таранов О.С., Омигов В.В., Рогачев В.А., Проскурина А.С., Шурдов М.А., Останин А.А., Черных Е.Р., Богачев С.С. Новейшие методы клеточных технологий в медицине
MOLECULAR MECHANISMS OF METABOLISM, EXCRETION AND DRUG TOLERANCE IN HUMAN LIVER FLUKE OPISTHORCHIS FELINEUS Maria Y. Pakharukova1*, Nikita I. Ershov1, Darya S. Pirozhkova1, Valentin A. Vavilin2, Kira S. Zadesenets1, Tatiana G. Duzhak3, Viatcheslav A. Mordvinov1 International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology
Estimation of impact of alpha-crystallin’s alterations on the development of AMD-like retinopathy in OXYS rats N. Muraleva, O. Kozhevnikova, E. Korbolina, A. Fursova, and N. Kolosova BGRS/BS:ISHG-2014
The use of 3D-chromatin structure data to predict novel genes associated with the development of depression. N.P. Bondar*, L.O. Bryzgalov, N.I. Ershov, M.Yu. Matveeva Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014/International Symposium “Human Genetics”
Annotations in silico of 388 SNPs of the core-promoters of 68 human feeding behavior genes Ponomarenko M., Arkova O., Saik O., Drachkova I., Arshinova T., Ponomarenko P., Rasskazov D., Genaev M., Komyshev E.G, Savinkova L., Kolchanov N.A. BGRS\SB-2014
The structural organization and evolution of 5S rDNA of wheat 5BS chromosome by data of partial sequencing Sergeeva E.M., Koltunova M.K., Afonnikov D.A., Vasiliev G.V., Salina E.A. The 9th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014
Крысы OXYS – генетическая модель преждевременного старения и связанных с ним заболеваний Н.Г. Колосова, Н.А. Стефанова, Е.Е. Корболина, А.Ж. Фурсова, О.С. Кожевникова Всероссийская конференция с международным участием «Фундаментальные проблемы геронтологии и гериатрии»
2013
Computational and experimental analysis of miRNA genes of Opisthorchiidae family liver flukes Овчинников Владимир Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Васильев Геннадий Владимирович, Катохин Алексей Вадимович, Кашина Елена Валентиновна, Мордвинов Вячеслав Алексеевич MCCMB-2013 (Московская конференция по компьютерной молекулярной биологии)
Computational and experimental analysis of miRNA genes of Opisthorchiidae family liver flukes Овчинников Владимир Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Васильев Геннадий Владимирович, Катохин Алексей Вадимович, Кашина Елена Валентиновна, Мордвинов Вячеслав Алексеевич International Conference ” High-Throughput Sequencing in Genomics”
Comparative analysis of rat retinal transcriptome using RNA-Seq: effects of aging and AMD-like retinopathy O. S. Kozhevnikova, E. E. Korbolina, N. I. Ershov, N. G. Kolosova FEBS Congress
Оценка функциональности районов генома с различными эпигенетическими маркерами на основе их обогащения SNPs, ассоциированными с различными фенотипическими проявлениями. Брызгалов Л.О., Антонцева Е.В., Бондарь Н.П., Матвеева М.Ю., Меркулова Т.И. High-throughput Sequencing in Genomics
Функциональная интерпретация SNPs в гене APC человека Н.П. Бондарь, Е.В. Антонцева, Л.О. Брызгалов, М.Ю. Матвеева, Е.В. Кашина, Т.И. Меркулова Фундаментальные науки – медицине
Эпигенетические маркеры в циркулирующих ДНК крови в диагностике и мониторинге рака легкого Пономарева А.А., Рыкова Е.Ю., Чердынцева Н.В., Скворцова Т.Э., Брызгалов Л.О., Добродеев А.Ю., Завьялов А.А., Тузиков С.А., Власов В.В., Лактионов П.П. Фундаментальные науки – медицине
Molecular and cellular implications of repeated aggression: Effect of fighting deprivation. Kudryavtseva N.N., Smagin D.A., Boyarskikh U.A., Bondar N.P., Filipenko M.L., Enikolopov G.N. 45th European Brain and Behaviour Society Meeting
. Стабильная липосомальная лекарственная форма комплексных соединений платины для воздействия на метастазы опухолей в печени Попова Н.А., Каледин В.И., Николин В.П., Морозкова Т.С. Пятая международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине»
Исследование биохимических характеристик углеводно-жирового обмена у линий мышей контрастных по чувствительности к спонтанному гепатоканцерогенезу Багинская Н.В., Ильницкая С.И., Каледин В.И. 22 Съезд Физиологического общества имени И.П.Павлова
Genetic differences in nuclear receptors Car and AhR activation and expression in different mouse strains after o-aminoazotoluene application Baginskaya N.V., Kashina E.V., Shamanina M.Y., Ilnitskaya S.I., Mordvinov V.A. FEBS Congress
ВЛИЯНИЕ ПРОТИВОДИАБЕТИЧЕСКОГО ПРЕПАРАТА РОЗИГЛИТАЗОНА НА ПОКАЗАТЕЛИ ОБМЕНА ВЕЩЕСТВ И ЭКСПРЕССИЮ ЯДЕРНЫХ РЕЦЕПТОРОВ У МЫШЕЙ ПРИ ВВЕДЕНИИ ГЕПАТОКАНЦЕРОГЕНА ОАТ. Багинская Н.В., Кашина Е.В., Шаманина М.Ю., Ильницкая С.И., Мордвинов В.А. Биологически активные вещества и материалы: фундаментальные и прикладные вопросы получения и применения.
Xenobiotic-metabolizing system phase 1 in Opisthorchis felineus (Trematoda, Platyhelminthes). Pakharukova M., Ershov N., Vavilin V., Zadesenets K., Duzhak T., Merkulova T., Mordvinov V. The 38th FEBS Congress “Mechanisms in Biology”
Research of the mechanisms of praziquantel action on fluke Opisthorchis felineus (Trematoda, Platyhelminthes). Pakharukova M., Ershov N., Shilov A., Katokhin A., Mordvinov V. The 38th FEBS Congress “Mechanisms in Biology”
Dioxin-mediated regulation of genes involved in cytokines production by macrophages. Kashina E.V., Oshchepkov D.Y., Antontseva E.V., Oshchepkova E.A., Shamanina M.Y., Furman D.P., Mordvinov V.A. The 38th FEBS Congress “Mechanisms in Biology”
Xenobiotic-metabolizing system in flukes with focus on phase 1 in Opisthorchis felineus. Pakharukova M, Ershov N, Vavilin V, Zadesenets K, Duzhak T, Merkulova T, Mordvinov V. WAAVP 2013: 24TH INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE WORLD ASSOCIATION FOR THE ADVANCEMENT OF VETERINARY PARASITOLOGY
Общие представления о системе метаболизма ксенобиотиков у трематод: характеристика фазы I, II, III биотрансформации O. felineus. Пахарукова М.Ю., Ершов Н.И., Задесенец К.С., Дужак Т.Г., Вавилин В.А., Мордвинов В.А. V Всероссийский Съезд (05ВСПО) Паразитологического общества РАН
Выявление патофизиологических механизмов преэклампсии методом полногеномного анализа экспрессии Трифонова Е.А., Ершов Н.И., Ворожищева А.Ю., Степанов В.А. High-throughput Sequencing in Genomics
Короткие некодирующие РНК плазмы крови человека Барякин Д.Н., Семенов Д.В., Бреннер Е.В., Курильщиков А.М., Козлов В.В., Наров Ю.Э., Васильев Г.В., Чикова Е.Д., Филиппова Ю.А., Брызгалов Л.О., Кулигина Е.В., Рихтер В.А. High-throughput Sequencing in Genomics
Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней Arabidopsis thaliana L. Миронова В.В., Кузнецова Л.С., Филипенко Е.А., Климова Н.В., Васильев Г.В., Кочетов А.В. International Conference ” High-Throughput Sequencing in Genomics”
2012
WHOLE GENOME ANALYSIS OF THE DEVELOPMENT GENES REGULATED BY TRANSCRIPTION FACTORS IN MICE AND D. RERIO USING THE CHIP-SEQ TECHNOLOGY Orlov Yu., Ershov N., Vinata S., Kondrikhin I., Matavan I., Afonnikov D., Kolchanov N. III международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» (Postgenome-2012).
Экспериментальная проверка функциональной активности потенциальных DRE - сайтов, обнаруженных в промоторах IL12A, IL12B и IL4 генов человека. Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Лопатникова Ю.А., Ощепкова Е.А., Ощепков Д.Ю., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика
ДНК-микрочип для исследования механизмов развития у крыс OXYS ретинопатии, аналогичной возрастной макулярной дегенерации у людей Кожевникова О.С., Корболина Е.Е., Орлов Ю.Л., Стефанова Н.А., Муралева Н.А., Швалов А.А., Колосова Н.Г. Фундаментальные науки – медицине
Organization of xenobiotic-metabolizing system phase 1 in Opisthorchis felineus (Trematoda, Platyhelminthes) Мaria Y. Pakharukova, Nikita I. Ershov, Valentin А. Vavilin, Kira Zadesenets, Alexei V. Katokhin, Tatiana I. Merkulova, Viatcheslav A. Mordvinov 12th International Symposium on Flatworm Biology
Organization of xenobiotic-metabolizing system phase 1 in Opisthorchis felineus (Trematoda, Platyhelminthes). Maria Y. Pakharukova, Nikita I. Ershov, Valentin A. Vavilin, Alexei V. Katokhin, Tatiana G. Duzhak, Tatiana I. Merkulova, Viatcheslav A. Mordvinov The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology
Mutations in K-Ras and EGFR genes and the search for SNPs, associated with their occurrence E.V. Antontseva, L.O. Bryzgalov, M.Yu. Matveeva, A.A. Ponomaryova, A.A. Ivanova, Е.Y. Rykova, N.V. Cherdyntseva, T.I. Merkulova Postgenomic Technologies for Biomedicine (PTB-2012)
A new approach to identify the rSNPs in the human genome based on ChIP-seq data. Bryzgalov L.O., Antontseva E.V., Matveeva M.Y., Kashina E.V., Shilov A.G., Bondar N.P., Merkulova T.I. the 8th International Conference on the Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2012)
Влияние хронического введения антидепрессанта кломипрамина и анксиолитика диазепама на различные звенья иммунитета у тревожно-депрессивных мышей В.А. Труфакин, А.В. Шурлыгина, Е.В. Мельникова, М.В. Тендитник, Н.Г. Пантелеева,Д.А. Смагин, Н.П. Бондарь, Н.Н. Кудрявцева VII Сибирский съезд физиологов
Взаимосвязь тревожности и депрессии в развитии тревожно-депрессивного расстройства у мышей: эффекты диазепама А.Г. Галямина, Д.А. Смагин, А.Е Григорьева, И.Л. Коваленко, Н.П. Бондарь, Н.Н. Кудрявцева VII Сибирский съезд физиологов
Повторный опыт агрессии, тревожность и эффекты диазепама у самцов мышей А.Е. Григорьева, Д.А. Смагин, А.Г. Галямина, Н.П. Бондарь, Н.Н. Кудрявцева VII Сибирский съезд физиологов
Characterization of OXYS rats, the model for age-related macular degeneration O. Kozhevnikova, E. Korbolina, A. Zhdankina, A. Markovets, A. Fursova, N. Kolosova The XXth Biennial Meeting of the International Society for Eye Research (ISER)
Experimental examining of prognoses in silico TBP binding to TATA box with SNP associated with human diseases Drachkova I.A., Ponomarenko P.M., Savinkova L.K., Ponomarenko M.P., Arshinova T.V., Kolchanov N.A. The eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology
In silico verification of TFBS in ChIP-Seq data V.G. Levitsky, D.Y. Oshchepkov, G.V. Vasiliev, N.I. Ershov, T.I. Merkulova, Kulakovskiy I.V., Makeev V.J. The eighth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure \ System biology (BGRS\SB'2012)
Соматические мутациий в генах K-ras и EGFR и поиск SNP ассоциированных с их возникновением Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Матвеева М.Ю., Пономарёва A.A., Иванова А.А., Рыкова Е.Ю., Чердынцева Н.В., Меркулова Т.И. Фундаментальные науки- медицине
Анализ функциональной значимости фрагментов генома, перепредставленных в составе апоптотической ДНК. Л.О. Брызгалов, Е.М. Лосева, Е.С. Морозкин, А.М. Курильщиков, И.В. Морозов, Е.В. Антонцева, Е.Ю. Рыкова, П.П. Лактионов, Т.И. Меркулова Фундаментальные науки – медицине
Выявление регуляторных SNP в геноме человека с использованием данных ChIP-seq проекта ENCODE Т.И. Меркулова, Е.В. Антонцева, Л.О. Брызгалов, М.Ю. Матвеева, Н.П. Бондарь, Е.В. Кашина, А.Г. Шилов. Фундаментальные науки – медицине
In silico verification of TFBS in ChIP-Seq data. V.G. Levitsky, D.Y. Oshchepkov, G.V. Vasiliev, N.I. Ershov, T.I. Merkulova, Kulakovskiy, Makeev V.J. SysPatho workshop «Systems biology and medicine»
Dioxin in regulation of genes involved in cytokinine synthesis by macrophages: a possible pathway underlying dioxin immunotoxicity and cancer. D.Y. Oshchepkov, E.A. Oshchepkova, E.V. Kashina, E.V. Antontseva, D.P. Furman, V.A. Mordvinov. SysPatho workshop «Systems biology and medicine»
Eliciting the role of dioxin in regulation of the genes involved in cytokines synthesis by macrophages. D.Y. Oshchepkov, E.V. Kashina, E.A. Oshchepkova, E.V. Antontseva, M.Yu. Shamanina, D.P. Furman, V.A. Mordvinov. The eighth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology,
Use of phage display for tumor-targeting chemotherapy development ”.25–27 апреля 35. M.B. Dyukalova, N.A. Popova, V.I. Kaledin, V.P. Nikolin, A.A. Ilyichev xі конференции молодых онкологов украины с участием международных специалистов “современные проблемы экспериментальной и клинической онкологии
Вазопрессинергическая и тиреодная системы : новый взгляд на взаимодействие. Амикишиева А.В., Ильницкая С.И., Николин В.П., Лавриненко В.А., Каледин В.И. V11 Сибирский съезд физиологов. Материалы съезда с международным участием.
Подавление нитроксильным радикалом ТРРА-ТЕМПО роста перевиваемой опухоли и им-мунного ответа на нее у мышей Попова Н.А., Сысоева Г.М., Николин В.П., Каледин В.И., Кирилюк И.А., Григорьев И.А. третья международная научно-практическая конференция«высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине
Выявление роли ксенобиотиков в регуляции генов, вовлеченных в синтез цитокинов макрофагами. Ощепков Д.Ю., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. III международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» (Postgenome-2012).
Expressed Sequence Tag Analysis of Adult Opisthorchis felineus M. Yu. Pomaznoy, S. I. Tat’kov, D. A. Afonnikov, D. P. Furman, P. A. Belavin, A. M. Nayakshin, S. V. Gusel’nikov, G. V. Vasil’ev, A. Yu. Sivkov, A. V. Katokhin, and V. A. Mordvinov BREW 2012: Bioinformatics Research and Education Workshop
ВЛИЯНИЕ 2,3,7,8-ТЕТРАХЛОРДИБЕНЗО-ПАРА-ДИОКСИНА НА РЕГУЛЯЦИЮ ЭКСПРЕССИИ IL12A, IL12B И IL4 ГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХСЯ В МАКРОФАГЕ Кашина Е.В., Ощепков Д.Ю., Антонцева Е.В., Ощепкова Е.А., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Проблемы биомедицинской науки третьего тысячелетия 2-я Всероссийская научная конференция молодых ученых.
Развитие ретинопатии и активация метаболического пути болезни Альцгеймера в сетчатке крыс OXYS Кожевникова О.С., Корболина Е.Е., Муралева Н.А., Орлов Ю.Л., Стефанова Н.А., Колосова Н.Г. III международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» (Postgenome-2012). 2012, г.Казань
RNA-SEQ ANALYSIS OF OXYS RATS RETINA AT DIFFERENT STAGES OF AMD-LIKE RETINOPATHY Korbolina E.E., Kojevnikova O.S., Kolosova N.G. III международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» (Postgenome-2012). 2012, г.Казань 2012
2011
Влияние активации конститутивного рецептора андростана на чувствительность к химическому гепатоканцерогенезу и показатели обмена веществ у самцов и самок мышей линии C57Bl/6J. Н.В. Багинская, С.И. Ильницкая, В.И. Каледин 3 съезд физиологов СНГ
Влияние полиморфизмов ТАТА-боксов, ассоциированных с наследственными заболеваниями человека, на взаимодействие с hТВР Драчкова И.А.. Савинкова Л.К., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А. II-nd International conference Physico-Chemical Biology dedicated to the 85th anniversary of academician Dmitri G. Knorre.
Анализ данных массовой иммунопреципитации хроматина с помощью экспериментально верифицированных методов распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA Ощепков Д. Ю., Левицкий В. Г. , Кулаковский И. В., Ершов Н. И., Васильев Г.В., Меркулова Т. И. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика»
ЦИТОХРОМ P450 У ПАРАЗИТИЧЕСКИХ ПЛОСКИХ ЧЕРВЕЙ НА ПРИМЕРЕ ВОЗБУДИТЕЛЯ ОПИСТОРХОЗА OPISTHORCHIS FELINEUS М.Ю. Пахарукова, Н.И. Ершов, В.А. Вавилин, Е.В. Воронцова, А.В. Катохин, Т.И. Меркулова, В.А. Мордвинов II международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»
Идентификация ортологов рецептора тиреоидного гормона у плоских червей Opisthorchis felineus. Воронцова Е.В., Пахарукова М.Ю., Ершов Н.И., Катохин А.В., Меркулова Т.И., Мордвинов В.А. II международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»
Мутации в генах K-ras и ERRF у больных немелкоклеточным раком легких в Западно-Сибирском регионе России. Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Матвеева М.Ю., Пономарёва А.А., Иванова А.А., Рыкова Е.Ю., Чердынцева Н.В., Меркулова Т.И.. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»
Выявление регуляторных SNP, ассоциированных с различными заболеваниями, с использованием данных ChIP-seq. Меркулова Т.И., Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Пономаренко М.П., Савинкова Л.К., Васильев Г.В., Драчкова И.А., Матвеева М.Ю., Колчанов Н.А. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»
Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов SF-1 и SREBP в геномах позвоночных с помощью нового подхода, сочетающего экспериментальные и биоинформатические методы Климова Н.В., Левицкий В.Г., Ощепков Д.Ю., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Меркулова Т.И. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика и биоинформатика»
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияние мутаций на молекулярно-генетические системы организмов Пономаренко М.П., Игнатьева Е.В., Левицкий В.Г., Савинкова Л.К., Захаренко Л.П., Пинтус С.С., Суслов В.В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А. Программа фундаментальных исследований Президиума РАН. № 11. “Биологическое разнообразие”. Подпрограмма “Генофонды и генетическое разнообразие”. Сборник материалов. – Москва: ИОГен. 2011. С. 100-104.
PROFILE OF THE CIRCULATING RNA IN APPARENTLY HEALTHY INDIVIDUALS OBTAINED WITH MASSIVE PARALLEL SEQUENCING OF TOTAL PLASMA RNA ON SOLID PLATFORM D.V. Semenov, D.A. Baryakin, E.V. Brenner, A.M. Kuril’shikov, G.V. Vasiliev, L.A. Bryzgalov, E.D. Chikova, J.A. Fillipova, E.V. Kuligina, V.A. Richter CIRCULATING NUCLEIC ACIDS IN PLASMA AND SERUM
2010
Экспериментальная проверка функциональной активности потенциальных DRE-сайтов, обнаруженных в промоторах IRF1, REL и IL12A генов человека Е.В. Кашина, Е.В. Антонцева, М.Ю. Шаманина, Е.А. Ощепкова, Д.Ю. Ощепков, А.В. Катохин, А.Ю. Гришанова, Д.П. Фурман, В.А. Мордвинов 1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии", Томск, 6-9 октября 2010
2'-5'-oligoadenylate synthetase genes polymorphism, associated with predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis, in human North Eurasian populations Barkhash A.V., Babenko V.N., Kobzev V.F., Romaschenko A.G., Voevoda M.I. 10th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases (MEEGID X)
Investigation of UV Laser Radiation Effect on KREBS 2 Cells Viability Maslov N.A., Rojin I.A., Popova N.A., Nikolin V.P., Kaledin V.I., Amstislavskaya T.G. 15th INTERNATIONAL CONFERENCE ON THE METHODS OF AEROPHYSICAL RESEARCH, Novosibirsk
The siRNA targeted to mdr1b in vivo restores the sensitivity of murine lymphosarcoma to chemotherapy. 3rd Special Meeting on ABC Protein Patutina O.A., Mironova N.L., Popova. N.A., Kaledin V.I., Nikolin V.P., Vlasov V.V., Zenkova M.A. 3rd Special Meeting on ABC Protein. ATB-Binding Cassete (ABC) Protein: From Multidrag Resostance to Genetic Diseases. Insbruck, Austria
Investigation of Opisthorchosis felineus transcription profile by direct sequencing cDNA library’s clones S.I. Tatkov, I. I. Brusentsov, M.Yu. Pomaznoy, O.V. Nosareva, A.M. Nayakshin, S. V. Guselnikov, E. V. Brenner, G. V. Vasiliev, A.V. Katokhin, V. A. Mordvinov 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
prognosis and verification of the TATA SNP effects V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, I.A. Drachkova, N.A. Kolchanov Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010
SNPs in the hiv-1 TATA box and the aids pandemic V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010
Генная сеть активации макрофага: участие ксенобиотков в регуляции экспрессии генов цитокинов Ощепкова Е.А., Ощепков Д.Ю., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Всероссийская научная конференция "Молекулярно-генетические основы функционирования цитокиновой сети в норме и при патологии", 15-17 сентября 2010г.
Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине Попова Н.А., Маслов Н.А., Рожин И.А, Николин В.П., Каледин В.И., Амстиславская Т.Г. Международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине" 23-26 ноября, 2010, г. Санкт-Петербург
ТАТА-боксы вносят вклад в норму реакции Суслов В.В., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Драчкова И.А. Международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине" 23-26 ноября, 2010, г. Санкт-Петербург
Экспериментально-компьютерное исследование генов, вовлекаемых в реакцию макрофага на диоксин Ощепков Д.Ю., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине" 23-26 ноября, 2010, г. Санкт-Петербург
Поиск потенциальных мишеней для диагностики паразита Opisthorchis felineus Помазной М. Ю., Татьков С. И., Брусенцов И. И., Сивков А.Ю., Наякшин А.М., Гусельников С.В., Бреннер Е.В., Васильев Г.В., Катохин А.В., Мордвинов В.А. Молекулярная диагностика 22-25 ноября 2010, Москва
SNP ТАТА-бокса ВИЧ-1 и пандемия СПИД Суслов В.В., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Ефимов В.М., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Проблемы экологии. Чтения памяти проф. М.М.Кожова. Иркутск, 2010
An experimental and computation approach to search for the transcription factor GAGA binding sites Omelina E.S., Oshchepkov D.Yu., Baricheva E.M., Merkulova T.I. BGRS-2010
SNPs IN THE HIV-1 TATA BOX AND THE AIDS PANDEMIC V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov (6) IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky Crimean meeting."Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution".
«Прогноз и экспериментальная проверка изменения сродства ТВР к ТАТА-боксам промотров генов человека, содержащим полиморфизмы». – Драчкова ИА., Пономаренко РМ., Пономаренко МП., Аршинова ТВ., Савинкова ЛК., Колчанов НА. «Первые Международные Беккеровские чтения» (27-29 мая 2010)
Experimental verification of the prognosis human TBP/TATA affinity change as a result of polymorphisms associated with hereditary pathologies I.A. Drachkova., P.M. Ponomarenko., T.V. Arshinova., M.P. Ponomarenko., L.K. Savinkova., N.A. Kolchanov. BGRS
Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. IV Международная Школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биология клетки».
Promoters of the genes encoding the macrophage transcription factors contain binding sites for aryl hydrocarbon receptor. Oshchepkova E.A., Oshchepkov D.Y., Kashina E.V., Antontseva E.V., Shamanina M.Y., Mordvinov V.A., Furman D.P. Seventh international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology
Detection of dioxin responsive elements in the promoter regions of the genes encoding macrophage cytokines. Oshchepkova E.A., Oshchepkov D.Y., Kashina E.V., Antontseva E.V., Furman D.P., Mordvinov V.A. Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure and Systems Biology (BGRS_SB’10),Новосибирск, Россия, 20-27 июня
Detection of dioxin responsive elements in the promoter regions of the macrophage transcription factors and cytokines genes. Oshchepkova E.A., Oshchepkov D.Y., Kashina E.V., Antontseva E.V., Shamanina M.Y., Mordvinov V.A., Furman D.P. “From Functional Genomics to Systems Biology”,
Компьютерно-экспериментальное изучение сайтов связывания транскрипционных факторов. Ощепков Д.Ю., Климова Н.В., Антонцева Е.В., Левицкий В.Г., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Пономаренко М.П., Драчкова И.А., Савинкова Л.К., Фурман Д.П., Мордвинов В.А., Меркулова Т.И. I международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»
Экспериментально-компьютерное исследование генов, вовлекаемых в реакцию макрофага на диоксин. Ощепков Д.Ю., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Международная научно-практическая конференция «Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине»
Testing of functional activity of putative dioxin responsive elements in promoter regions of genes, encoding macrophageal transcription factors and cytokines Kashina E.V., Antontseva E.V., Katokhin A.V., Oshchepkova E.A., Oshchepkov D.Y., Shamanina M.Y., Grishanova A.Y., Furman D.P, Mordvinov V.A. The seventh international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology
Investigation of sex difference in susceptibility to hepatocarcinogenesis in mice N.V.Baginskaya, S.I.Ilnitskaya, V.I.Kaledin 7 International Conference on Bioinformatics of Genom Regulation and Structure/Systems Biology
Механизмы развития признаков преждевременного старения у крыс OXYS: анализ транскрипционного профиля и QTL Кожевникова О.С., Корболина Е.Е., Цепилов Я.А., Колосова Н.Г. Генетика продолжительности жизни и старения
Analysis of the degenerate motifs in regions of FoxA-binding sites. Вишневский Олег Владимирович Меркулова Татьяна Ивановна Ананько Анатолий Григорьевич Лаврентьев Михаил Михайлович Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
2009
Оценка влияния миграционных процессов на генофонд мтДНК населения Западной Сибири 4-1 тыс. до н.э. Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Журавлев А.А., Куликов И.В., Кобзев В.Ф. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
Этноспецифическое распределение гаплотипов по полиморфизмам IVS2 (+4) t/c, IVS4 (-47) t/c, and IVS5 (-44) a/g гена HFE в популяциях России и возможная роль этих полиморфизмов в сплайсинге Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф. , Воевода М.И., Ромащенко А.Г. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
The effects of allelic variation of bovine cytokine genes on susceptibility to infectious diseases Yudin N.S., Vasil'eva L.A., Kobzev V.F., Kuznetsova T.N., Nefedova M.V., Kulikov I.V., Maksimov V.N., Naykova T.M., Potapova T.A., Barkhash A.V., Tumanov Yu.V., Smirnov P.N., Laegreid W.W., Romashchenko A.G., Voevoda M.I. German-Russian Forum Biotechnology GRFB'09
Полиморфизмы генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз человека и их связь с тяжелыми формами клещевого энцефалита Бархаш А.В., Перелыгин А.А., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Мясникова Н.Г., Морозова О.В., Бринтон М.А., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. V Международная научная конференция "Факторы экспериментальной эволюции организмов"
Связь полиморфизмов генов 2’-5’-олигоаденилатсинтетаз человека с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Перелыгин А.А., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Мясникова Н.Г., Морозова О.В., Бринтон М.А., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
Revealing of potential FoxA target genes, involved in proliferation control. N. Ershov, T. Merkulova, L. Bryzgalov, M. Pakharukova, D. Oschepkov and V. Kaledin. 34th FEBS Congress.
Induction of fatty liver by fasting in mouse strain disposed to metabolic syndrome development Baginskaya N.V., Ilnitskaya C.I., Perepechaeva M.L., Pivovarova E.N., Kaledin V.I. 1st Congress of Fatty Liver and Metabolic Syndrome: From Basic Science to Clinical Praxis
Полиморфизм генов предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Малютина С.К., Гафаров В.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Юдин Н.С., Воевода М.И. V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
Гены предрасположенности к ИБС в популяции Сибири Толкачёва О.М., Максимов В.Н., Куликов И.В., Завьялова Л.Г., Денисова Д.В., Васильев Г.В., Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Вопросы патогенеза типовых патологических процессов
Гены предрасположенности к ИБС в популяции Сибири Максимов В.Н., Толкачёва О.М., Куликов И.В., Завьялова Л.Г., Денисова Д.В., Васильев Г.В., Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Всероссийская научно-практическая конференция «Перспективы кардиологии России в XXI веке»
Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов FOXA, связанных с контролем пролиферации Меркулова Т.И., Брызгалов Л.О., Ершов Н.И., Ощепков Д.Ю., Пахарукова М.Ю., Кропачев К.Ю., Пивоварова Е.Н., Каледин В.И. V съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров.
Противораковый эффект экзогенной ДНК Е.А. Алямкина, Е.В. Долгова, В.П. Николин, Н.А. Попова, Е.Р. Черных, Л.В. Сахно, Е.Л. Гельфгат Съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина и V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
Феномен присутствия экзогенной ДНК при репарации межцепочечных сшивок Е.В. Долгова, Е.А. Алямкина, А.С. Лихачева, В.П. Николин, Н.А. Попова Съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина и V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
Роль экзогенной ДНК в репарационных процессах при повреждениях, индуцированных кросслинкирующими цитостатиками и гамма-радиацией А.С. Лихачева, Е.В. Долгова, В.П. Николин, Н.А. Попова, В.А. Рогачев, С.С. Богачев Съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина и V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
Поиск генов-кандидатов преждевременного старения крыс OXYS Ойдопова О. С., Полыгалова Н. Е., Корболина Е. Е., Колосова Н. Г. Материалы Пятого съезда Вавиловского общества генетиков и селекционеров
2008
the precise equilibrium equation of TBP/TATA-binding predicts human familial diseases upon mutations Ponomarenko P.M., Savinkova L.K., Drachkova I.A., Lysova M.V., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A. 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28
Обращение фенотипа множественной лекарственной устойчивости опухоли с помощью siРНК, адресованной к мРНК генов mdr1a и mdr1b, у мышей Шкляева О.А.Миронова Н.Л., , Попова Н. А., Николин В. П., Каледин В. И., Власов В. В., Зенкова М. А. IV съезд Российского Общества биохимиков и молекулярных биологов, 10-15 мая, Новосибирск, 2008
Molecular mechanisms undrelying species-, strain- and sex-related differences in sensitivity to estragol and ethylnitrosourea carcinogens treatment Pivovarova E.N., Ilnitskaya S.I., Kaledin V.I. The Russian Conference with International participation on Molecular Oncology ( сборник материалов ).- Novosibirsk
The influence of activation of peroxisome proliferator-activated receptors on liver tumour development and blood biochemistry in mouse strains are different on induced hepatocarcinogenesis sensitivity Baginskaya N.V., Ilnitskaya S.I., Kaledin V.I. The Russian Conference with International participation on Molecular Oncology ( сборник материалов ).- Novosibirsk
Транскрипционные факторы FOXA как потенциальные опухолевые супрессоры в печени Т.И. Меркулова, Л.О. Брызгалов, Н.И. Ершов, Д.Ю. Ощепков, М.Ю. Пахарукова, К.Ю. Кропачев, В.И. Каледин Всероссийская конференция "Молекулярная онкология", г. Новосибирск
Участие экзогенной ДНК в молекулярных процессах, протекающих в соматической клетке С.С. Богачев, А.С. Лихачева, В.А. Рогачев, В.П. Николин, Н.А. Попова, Т.Е. Себелева, Е.Р. Черных, Е.Л. Гельфгат, М.А. Шурдов Научная конференция с международным участием "Дни иммунологии в Сибири-2008"
Полиморфизм генов предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям в популяционном и проспективном исследовании Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Малютина С.К., Гафаров В.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Юдин Н.С., Воевода М.И. Российская конференция "Профилактика сердечно-сосудистых заболеваний", 25-26 марта 2008 г., Новосибирск
Ассоциативный анализ полиморфизмов генов TP53 и C-FMS с развитием рака молочной железы у русских женщин И.В. Пилипенко Сборник материалов III региональной конференции молодых ученых им. академика РАМН Н.В. Васильева. 29 апреля 2008 г., Томск
Формирование этнокультурных сообществ в западносибирской лесостепи на основе данных палеогенетики (первые результаты) А.С. Пилипенко, А.Г. Ромащенко, В.И. Молодин, А.А. Журавлев, А.Е. Гришин, Д.В. Поздняков, И.В. Куликов, Т.А. Чикишева, В.Ф. Кобзев Труды II (XVIII) Всероссийского археологического съезда в Суздале. Т. III, 2008, Москва, Институт археологии РАН
Транскрипционные факторы FOXA как потенциальные опухолевые супрессоры в печени Т.И. Меркулова, Л.О. Брызгалов, Н.И. Ершов, Д.Ю. Ощепков, М.Ю. Пахарукова, К.Ю. Кропачев, В.И. Каледин. Всероссийская конференция с международным участием "Молекулярная онкология"
SITECON: a quality tool for prediction of new potential SREBP binding sites. experimental verification and analysis of regulatory regions of vertebrate genes. D.Y. Oshchepkov, E.V. Ignatieva, G.V.Vasiliev, N.V. Klimova, T.I. Merkulova Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
Исследование молекулярных механизмов, обеспечивающих видовую специфичность в действии гепатоканцерогенных соединений у экспериментальных животных М.Ю. Пахарукова, М.А. Сметанина, В.И. Каледин, Т.И. Меркулова. всероссийской конференции с международным участием «Молекулярная онкология»
The influence of activation of peroxysome proliferator-activated receptors on liver tumors development and blood biochemistry in mouse strains are different on induced hepatocarcinogenesis sensitivity2 Baginskaya N.V., Ilnitskaya C.I., Kaledin V.I. Всероссийская конференция с международным участием «Молекулярная онкология» “Molecular oncology”
Expression of liver nuclear hormone receptors PPAR-α and PPAR–γ, LХR and RХR and blood corticosterone and insulin level in sensitivity to chemical hepatocarcinogenesis mouse strain DD and in resistant mouse strain СС57BR Dushkin M.I., Baginskay N.V.,Perepechaeva M.L., Safronova O.G. Pivovarova E.N., Kaledin V.I. Всероссийская конференция с международным участием «Молекулярная онкология» “Molecular oncology”
Ассоциация сниженного уровня глюкокортикоидов и экспрессии ядерных гормональных рецепторов с чувствительностью к химическому гепатоканцерогенезу у мышей линии DD Душкин М.И., Багинская Н.В, Ефремов Я.Р., Пивоварова Е.Н., Каледин В.И. Международный междисциплинарный симпозиум <От Экспериментальной Биологии к Превентивной и Интегративной Медицине>
Поиск генетических детерминант ответственных за проявление комплекса признаков преждевременного старения крыс линии OXYS Ойдопова О.С., Полыгалова Н.Е., Корболина Е.Е., Колосова Н.Г. Генетика продолжительности жизни и старения
Изучение молекулярных основ половых, линейных и видовых различий в действии канцерогенов нитрозоэтилмочевины и эстрагола. Пивоварова Е. Н., Ильницкая С. И., Каледин В. И. «Молекулярная онкология», Всероссийская конференция с международным участием.
Поиск генов-кандидатов преждевременного старения крыс OXYS Ойдопова О.С., Полыгалова Н.Е., Корболина Е.Е., Колосова Н.Г. IV съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов
2007
Similarity of mitochondrial DNA patterns in ancient and modern indigenous West Siberian populations Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Kulikov I.V., Kobzev V.F., Grishin A.E., Pozdnyakov D.V., Molodin V.I. II International Conference "Biosphere Origin and Evolution" October 28 - November 2, 2007, Loutraki, Greece
Effect of psychoemotional and immune state on growth and metastasis of Lewis lung carcinoma in mice. Inter-national symposium "Interaction of the nervous Popova N.A., Avgustinovich D.E., Nikolin V.P., Kaledin V. I., Ilnitskaya s.I., Kudryavtseva N.N. International symposium "Interaction of the nervous and immune system in health and disease" Saint-Petersburg. Russia
Изучение влияния однонуклеотидного полиморфизма G215C гена р53 на формирование предрасположенности к развитию рака молочной железы у русских женщин Пилипенко И.В., Голубева Д.В., Кобзев В.Ф., Чердынцева Н.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова, Алушта, Украина, 24-28 сентября
Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О., Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова
Изучение Молекулярных механизмов опухолесупрессорного действия транскрипционных факторов HNF3 Ершов Н.И. XLV международная научная студенческая конференция: Студент и научно-технический прогресс, Новосибирск 10-12 апреля 2007г.
Психогенный иммунодефицит Попова Н.А., Каледин В. И., Николин В.П.Кудрявцева Н.Н Съезд профессиональных иммунологов. Анталия. Турция
Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов FOXA, вовлеченных в механизм их опухолесупрессорного действия Л.О. Брызгалов, Н.И. Ершов, Д.Ю. Ощепков, В.И. Каледин, Т.И. Меркулова Тезисы II съезда общества клеточной биологии совместно с юбилейной конференцией, посвященной 50-летию Института цитологии РАН. С.-Петербург, 16–19 октября 2007
Возможное участие вазопрессина в регуляции роста и метастазирования опухолей Каледин В.И., Попова Н.А., Николин В.П., Кудрявцева Н.Н. ХХ съезд физиологического общества им ИП Павлова, 4-8 июня, Москва
ПОВЫШЕННАЯ ДНК-СВЯЗЫВАЮЩАЯ АКТИВНОСТЬ TATA-СВЯЗЫВАЮЩЕГО БЕЛКА В ЭКСТРАКТАХ ЯДЕР ПЕРЕВИВАЕМЫХ ОПУХОЛЕЙ ПЕЧЕНИ И ЛЕГКОГО МЫШЕЙ Лысова М.В., Аршинова Т.В., Драчкова И.А., Каледин В.И., Савинкова Л.К. II Cъезд Общества клеточной биологии совместно с Юбилейной конференцией, посвященной 50-летию Института цитологии РАН. Санкт-Петербург, 16 - 19 октября 2007
Изучение роли ядерных рецепторов и Ah-рецептора в механизме действия гепатоканцерогенных азокрасителей. М.Ю. Пахарукова, М.А. Сметанина, В.И. Каледин, И.В. Романова, Т.И. Меркулова Международная конференция общества клеточной биологии
Роль SNPs гена K-ras мыши в механизме формирования предрасположенности к пульмоноканцерогенезу Антонцева Е.В., Скорытченко Я.Д., Каледин В.И., Меркулова Т.И. II съезд Общества клеточной биологии и юбилейная конференция, посвященная 50-летию Института цитологии РАН»
Характеристика генофондов по полиморфизмам генов предрасположенности и врожденной резистентности к инфекционным заболеваниям: изучение ассоциации молекулярно-генетических маркеров с экономически важными количественными признаками у крупного рогатого скота и свиней. Юдин Н.С., Васильева Л.А., Потапова Т.А., Бархаш А.В., Айтназаров Р.Б., Ермолаев В.И., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Биоразнообразие и динамика генофондов
2006
Experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Klimova N.V., Vasiliev G.V., Merkulova T.I. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
SITECON: a quality tool for prediction of transcription factor binding sites now handles those for SF-1. experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Klimova N.V., Vasiliev G.V., Merkulova T.I. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
Ethnic peculiarities of human pathology in Siberia. Genetic background of predisposition to common diseases Voevoda M.I., Romashchenko A.G.,Maksimov V.N., Shakhtshneider E.V., Yudin N.S., Barkhash A.V., Kobzev V.F., Kulikov I.V., Mishakova T.M., Naykova T.M., Myagkova I.V., Potapova T.A., Nikitin Yu.P 13th International Congress on Circumpolar health
Палеогенетические исследования останков носителей Пазырыкской культуры IV-II вв до н.э. Куликов И.В., Нефедова М.В., Шульгина Е.О., Губина М.А., Пилипенко А.С., Дамба Л.Д., Кобзев В.Ф., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Всероссийский археологический съезд "Современные проблемы Археологии России", 23 – 28 октября 2006 г, Новосибирск
Выявление генов предрасположенности к распространенным сердечно-сосудистым заболеваниям: принципы, достижения и перспективы Воевода М.И., Юдин Н.С., Васильев Г.В., Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Бархаш А.В., Ромащенко А.Г. Международная конференция "Фундаментальные науки – биотехнологии и медицине"
Единичные нуклеотидные замены в интроне 2 гена K-ras мыши, сопряженные с развитием рака легких, влияют на связывание факторов транскрипции. Горшкова (Антонцева) Е.В., Меркулова Т.И., Каледин В.И. Международняа конференция "Физико-химическая биология" 30 июля- 3 августа 2006
Особенности гаплотипического разнообразия мтДНК в некоторых популяциях Сибири, Дальнего Востока и Средней Азии Губина М.А., Дамба Л.Д., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Вилемс Р., Воевода М.И. Современные проблемы археологии России, Новосибирск, 23-28 октября
Особенности гаплотипического разнообразия мтДНК представителей Кротовской культуры Барабы Пилипенко А.С., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Гришин А.Е., Поздняков Д.В., Молодин В.И. Современные проблемы археологии России, Новосибирск, Ин-т археологии и этнографии СО РАН
Влияние психоэмоционального состояния на рост и метастазирование карциномы Льюис у мышей Попова Н.А., Николин В.П., Тендитник М.В., Кудрявцева Н.Н., Каледин В.И. Четвертая российская конференция "Нейроиммунопатология". Научно-практический журнал "Патогенез"
Взаимодействие белков транскрипционного комплекса РНК-полимеразы II с олигорибонуклеотидами Драчкова И.А., Репкова М.Н., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Савинкова Л.К. Международная конференция "Физико-химическая биология", посвященная 80-летию со дня рождения академика Д.Г. Кнорре. Новосибирск, июль 2006
SITECON: a quality tool for prediction of transcription factor binding sites now handles those for SF-1. Experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes. Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Klimova N.V., Vasiliev G.V., Merkulova T.I. Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)
Association study of SNP of the TNF-alpha gene with bovine leukosis and evaluation of its functional significance Yudin N.S., Vasil’eva L.A., Kobzev V.F., Kuznetsova T.N., Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)
TRRD: a database on experimentally identified transcription regulatory regions and transcription factor binding sites. Kolchanov N.A., Podkolodnaya O.A., Ananko E.A., Ignatieva E.V., Stepanenko I.L., Khlebodarova T.M., Merkulov V.M., Merkulova T.I., Podkolodny N.L., Romashchenko A.G. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
Prediction of interferon-inducible genes in human genome Ananko E.A., Kondrakhin Yu.V., Merkulova T.I. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
Methods for recognition of interferon-inducible sites, promoters, and enhancers. Kondrakhin Yu.V., Ananko E.A., Merkulova T.I. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
The SITEGA and PWM methods application for transcription factor binding sites recognition in EPD promoters Levitsky V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Merkulova T.I 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
Functional interpretation of pulmonary carcinogenesis susceptibility-associated SNP in K-Ras intron 2. Gorshkova E.V. (Antontseva E.V), Merkulova T.I., Kaledin V.I. 3rd International conference “Genomics, proteomics, bioinformatics and nanotechnologies for medicine”
Apolipoprotein polymorphism in native population of mountain in Shoriya (West Siberia) and its association with plasma lipid levels Shakhchneider E.V., Barbarash O.L., Ogarkov M.Y., Kulikov I.V., Baum V.A., Ustinov S.N., Yudin N.S., Kobzev V.F., Romashenko A.G., Voevoda M.I. XIV International Symposium on Atherosclerosis
Поиск генетических локусов, ответственных за проявление комплекса признаков преждевременного старения крыс линии OXYS. Полыгалова Н.Е., Корболина Е.Е., Колосова Н.Г., Редина О.Е. Материалы международной конференции "Генетика в России и мире", посвященной 40-летию Института общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН. Москва, 28 июня-2 июля 2006, с. 158.
Компьютерные подходы к исследованию влияния полиморфизмов на экспрессию генов и функцию белков. Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Кочетов А.В., Игнатьева Е.В., Пономаренко М.П., Орлова Г.В., Меркулова Т.И., Ощепков Д.Ю., Аман Е.Э., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Деменков П.С., Пинтус С.С., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Турнаев И.И., Апасьева Н.В., Губина М.А., Ромащенко А.Г. International conference “Basic Science for Biotechnology and Medicine” September 3-7, 2006, Novosibirsk. Russia.
2004
Влияние эстрагола на глюкокортикоидную индукцию тирозинаминотрансферазы и триптофаноксигеназы в печени мышей и крыс Пахарукова М.Ю., Пивоварова Е.Н., Ильницкая С.И., Васильева Е.Д., Каледин В.И. VIII Молодежная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии
2003
Повышение апоптоз-индуцирующего действия химиотерапии посредством природных биогенных регуляторов. Баймак Т.Ю. Вторая интеграционная междисциплинарная конференция молодых ученых СО РАН и высшей школы
2001
Аплптоз-индуцирующая и противоопухолевая активность циклофосфана, платина и адриамицина при их раздельном применении и в комбинации у мышей с лимфосаркомой LS. Баймак Т.Ю., Галямова М.Р., Николин В.П., Каледин В.И., Попова Н.А., Войцицкий В.Е. XVIII съезд физиологического общества имени И.В. Павлова
Гранты
2023
Широкомасштабный поиск SNPs, способных оказывать влияние на процесс РНК-интерференции, на основе анализа аллель-ассиметричных событий в данных RNA-seq РНФ, номер гранта 22-25-00255
2022
Популяционное исследование мужского
репродуктивного потенциала: оценка возможностей
полно-экзомного секвенирования и идентификация
новых генов, ассоциированных с ослабленным
сперматогенезом РНФ, номер гранта 19-15-00075-П
2021
Формирование глюкокортикоидной резистентности в дорзальных ядрах шва среднего мозга при хроническом социальном стрессе и ее коррекция с помощью антидепрессантов РНФ, номер гранта 21-15-00142
Исследование возможного механизма регуляции
стрессоустойчивости насекомых внутриклеточным
симбионтом на модели Wolbachia pipientis - Drosophila
melanogaster РНФ, номер гранта 21-14-00090
Генетический потенциал сортов мягкой пшеницы и культурной сои и его использование в селекции на адаптивность и высокое содержание белка Российский научный фонд, номер гранта 21-76-30003
2020
Роль вспомогательных репродуктивных технологий в развитии расстройств аутистического спектра у потомков РФФИ, номер гранта 20-015-00162 А
2019
Поддержка и развитие центра коллективного пользования научным оборудованием Центр генетических ресурсов лабораторных животных путем инструментального развития исследований для обеспечения реализации приоритетов научно-технологического развития Минобрнауки России, номер гранта 05.621.21.0023
Выяснение эпигенетических механизмов отсроченного влияния раннего постнатального стресса на формирование когнитивных расстройств у взрослых особей (продление) РНФ, номер гранта 16-15-10131
Популяционное исследование мужского репродуктивного потенциала: оценка возможностей полно-экзомного секвенирования и идентификация новых генов, ассоциированных с ослабленным сперматогенезом РНФ, номер гранта 19-15-00075
Влияние частых стрессов на репродуктивную функцию насекомых: молекулярно-генетические механизмы РФФИ, номер гранта 19-04-00458-а
2018
Мета-анализ полногеномных данных на основе выявления и аннотации различных структурно-функциональных типов сайтов связывания транскрипционных факторов в составе композиционных элементов РФФИ, номер гранта 18-29-13040 мк
Полногеномный поиск регуляторных SNPs, связанных с развитием онкологических заболеваний, на основании комплексного анализа аллель-специфических событий в экспериментальных данных ChIP-seq и RNA-seq РФФИ, номер гранта 18-29-09041 мк
Взаимодействие сигнальных путей ауксина и этилена у
растений: от генов-мишеней к новым биологическим функциям РФФИ, номер гранта 18-44-540039
Влияние стресса в ранний период жизни на формирование чувствительности к хроническому социальному стрессу во взрослом возрасте у мышей РФФИ, номер гранта 18-34-00603
2017
Хозяин-зависимый потенциал трематоды O. felineus РФФИ, номер гранта РФФИ 17-04-00790
Расширение генетического разнообразия генофонда картофеля по технологическим свойствам и переработке крахмала в Новосибирской области РФФИ, НСО, номер гранта 17-44-540510
Картирование и изучение структурно-функциональной организации генных локусов дикорастущей пшеницы Triticum dicoccoides (продление). Российский научный фонд, номер гранта 14-14-00161-П
Оценочная функция ранжирования результатов молекулярного докинга и ее применение для дизайна ингибиторов дигидродипиколинат синтазы (DapA) из Mycobacterium tuberculosis и супероксиддисмутазы (SOD1), ассоциированной с боковым амиотрофическим склерозом человека РФФИ, номер гранта 17-54-49004
2016
Выяснение эпигенетических механизмов отсроченного влияния раннего постнатального стресса на формирование когнитивных расстройств у взрослых особей РНФ, номер гранта 16-15-10131
Комплексный анализ экспрессии генов в мозге ручных лисиц: исследование на уникальной селекционной модели доместикации РНФ, номер гранта 16-14-10216
Популяционная структура и следы адаптации к холодному климату в геномах российских пород крупного рогатого скота и овец Российский научный фонд
Функциональное исследование систем метаболизма и транспорта ксенобиотиков трематоды Opisthorchis felineus РФФИ, номер гранта 16-04-00356
2015
Функциональные свойства ферментов системы эксцизионной репарации оснований ДНК, содержащих природные и искусственные мутации РФФИ, номер гранта 16-04-00037 А
Выявление и функциональный анализ регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстого кишечника с использованием доступных данных ChIP-seq, ChIA-PET и RNA-seq РФФИ, номер гранта 15-04-05780 А
Выявление молекулярно-генетических предпосылок развития ранних нейродегенеративных изменений в мозге и сетчатке РФФИ, номер гранта 15-04-06066 А
Молекулярные механизмы гибели клеток в сетчатке при старении и развитии ретинопатии РФФИ, номер гранта 15-04-02195 А
2014
Поиск функционально значимых полиморфизмов ТАТА-боксов промоторов генов человека и их комплексное экспериментальное изучение РФФИ, номер гранта 14-04-00485а
Разработка регламента детекции и маркирования новых генов комплексной устойчивости к грибным патогенам пшеницы на основе геномного секвенирования. Министерство образования и науки Российской Федерации, номер гранта 14.604.21.0106
Экспериментальные генетические модели агрессивного и толерантного поведения: исследование молекулярно-генетических механизмов с использованием технологий секвенирования следующего поколения (RNA-Seq) РНФ, номер гранта РНФ № 14-14-00269
Генетика гипертензивных состояний: исследование и анализ транскриптома почки, надпочечника и отделов мозга у крыс линии НИСАГ со стресс-чувствительной артериальной гипертонией, поиск новых молекулярных мишеней для терапии и профилактики РНФ, номер гранта 14-15-00118
Изучение влияния хронического социального стресса на пространственную организацию транскрипционно-активного хроматина методом ChIA-PET РФФИ, номер гранта 14-04-01707
Поиск функционально значимых полиморфизмов ТАТА-боксов промоторов генов человека и их комплексное экспериментальное изучение РФФИ, номер гранта 14-04-00485
2013
Изучение биораспределения, фармакодинамики и фармакокинетики терапевтиических нуклеиновых кислот в составе модульных систем для мишень-направленной доствки в организме здоровых лабораторных животных и животных-опухоленосителей РФФИ, номер гранта РФФИ № 13-04-40182-Н _____
Разработка программного комплекса для анализа влияния SNP на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний Минобрнауки, номер гранта ФЦП, ГК 07.514.13.0094
Реконструкция молекулярно-генетического аппарата секреторного комплекса возбудителя описторхоза Opisthorchis felineus (Trematoda, Platyhelminthes) РФФИ, номер гранта 13-04-00662 А
Компьютерно-экспериментальное исследование по идентификации генов и функционированию экскреторно-секреторного комплекса паразитов Opisthorchiidae РФФИ, номер гранта № 1304-00662a
Роль ауксина и этилена в регуляции активности генов в корне проростка Arabidopsis thaliana L.: полногеномный подход РФФИ, номер гранта 12-04-33112-мол-а-вед
Анализ данных полногеномных исследований с целью выявления новых генов, участвующих в механизмах развития депрессивных состояний РФФИ, номер гранта № 13-04-01077
Полногеномный поиск SNPs, способствующих возникновению активирующих мутаций, для формирования новой группы маркёров предрасположенности к канцерогенезу Президиум РАН, номер гранта 23
2012
Химически модифицированные малые интерферирующие РНК для преодоления множественной лекарственной устойчивости опухолей СО РАН, номер гранта 85
Изучение безопасности и совместимости тканей с поверхностью имплантатов, обработанных электронно-ионно-плазменными технологиями СО РАН, номер гранта 10
Поиск и создание новых гепатопротекторных препаратов на основе природных тритерпеноидов для коррекции токсического и лекарственного поражения печени СО РАН, номер гранта 41
Характеристика влияния двухцепочечной фрагментированной ДНК на продукцию цитокинов иммунокомпетентными клетками человека и поиск молекулярных путей этого воздействия РФФИ, номер гранта 12-04-00954-а
2011
Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований по тематике технологической платформы "Медицина будущего" в области поиска молекулярных мишеней онкологических заболеваний с помощью биоинформационных и постгеномных технологий Министерство образования и науки РФ, номер гранта 16.512.11.2274
Изучение связи полиморфизма генов неспецифического иммунного ответа с предрасположенностью человека к заболеваниям, вызываемым флавивирусами Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 11-04-01206а
Экспериментально-компьютерное исследование механизмов метаболизма ксенобиотиков у печеночных сосальщиков семейства Opisthorchiidae Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 11-04-01333a
Реконструкция процессов антропогенеза: анализ митохондриальных геномов представителей древнего и современного населения Сибири РФФИ, номер гранта 11-06-12006
Роль ядерных рецепторов в механизмах чувствительности и резистентности к гепатоканцерогенезу РФФИ, номер гранта РФФИ №11-04-00545-а
Раннее выявление мутаций в генах EGFR и K-Ras для диагностики и развития персонализированных методов лечения немелкоклеточного рака легких Президиум РАН, номер гранта 23
2010
Экспериментально-теоретическое исследование связанных с различными заболеваниями полиморфизмов ТАТА-боксов и их ближайшего окружения в промоторах генов человека РФФИ, номер гранта 10-04-00462-а
Молекулярные механизмы стресс-специфического контроля экспрессии генов животных Министерство образования и науки Российской Федерации, номер гранта 02.740.11. 0705
Лазерная диагностика канцерогенеза с использованием измерения преломления и флуоресцентной спектроскопии СО РАН, номер гранта 148
2009
Федеральная целевая программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы. Научно-исследовательские работы по теме: «Исследование влияния экзогенной двуцепочечной ДНК человека на активацию и формирование противоракового адаптивного иммунитета и разработка принципиально новых подходов в использовании препарата нового поколения Панаген» Номер гранта Гос.контракт №02.740.11.0091
Разработка методов лазерного нагрева металлических наночастиц в биологических тканях для термического разрушения патологических клеток Номер гранта № 9
.Развитие исследований в области медицинской химии и фармакологии как научной основы разработки отечественных лекарственных препаратов Номер гранта № 93
Поиск и создание новых препаратов для противоопухолевой терапии на основе модифицированных природных соединений Номер гранта № 104
Иммуномодуляторы на основе древних палеобактерий позднего неогена и геномодифицированных дендритных клеток Номер гранта № 15
Определение противоопухолевого потенциала интерферирующих РНК пролонгированного действия in vivo Номер гранта № 41
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов Президиум РАН, номер гранта 23.29
ПОСТГЕНОМНАЯ БИОИНФОРМАТИКА: КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ Президиум СО РАН, номер гранта 119
Изучение конкурентных взаимоотношений транскрипционных факторов семейства Fox в регуляции экспресии генов печени и их роли в гепатоканцерогенезе РФФИ, номер гранта 09-04-00562-а
2008
Поиск генов, контролирующих реакцию организма при эмоциональном стрессе, и изучение их экспрессии на модели крыс НИСАГ с наследуемой индуцируемой стрессом артериальной гипертензией РФФИ, номер гранта 08-04-01048
2007
Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов HNF3, обеспечивающих реализацию опухолесупрессорного действия этих белков в печени Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 07-04-00441а
Интегральные механизмы участия ядерных гормональных рецепторов в гепатоканцерогенезе РФФИ, номер гранта 07-04-00864-a
2006
Оценка риска отдаленных последствий воздействия на население опасных факторов ядерных и химических технологий Международный научно-технический центр, номер гранта 2311
Изучение регуляции экспрессии гена Trithorax-like и его роли в онтогенезе D. melanogaster РФФИ, номер гранта 06-04-49000
Интегральные механизмы регуляции липидного обмена и воспалительного ответа в макрофагах: роль ядерных гормональных рецепторов РФФИ, номер гранта 06-04-48273
Изучение антионкогенных свойств факторов транскрипции HNF3 в печени мышей и крыс и выяснение механизмов, обеспечивающих снижение активности этих факторов под действием гепатоканцерогенных соединений Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 06-04-48575a
2005
Исследование редокс-зависимых механизмов преждевременного старения крыс OXYS РФФИ, номер гранта 05-04-48483-а
Изучение генетической детерминации уровня артериального давления в покое и в условиях эмоционального стресса на модели крыс НИСАГ с наследуемой индуцируемой стрессом артериальной гипертензией РФФИ, номер гранта 05-04-48567
2004
Изучение механизма возникновения сайт-направленных мутаций в протоонкогенах семейства ras РФФИ, номер гранта 04-04-48136
Научное руководство
2021
Влияние ассоциированных с наследственными заболеваниями однонуклеотидных замен в ТАТА-боксах на взаимодействие с ТАТА-связывающим белком Драчкова Ирина Альбертовна Молекулярная биология, 2021-06-25
Влияние хронического социального стресса на статус метилирования ДНК в промоторах генов, регулируемых глюкокортикоидами Созонов Никита Геннадьевич Генетика, 2021-06-01
Влияние раннего постнатального стресса
на выраженность расстройств аутистического спектра на модели BTBR мышей Иванчихина Анна Витальевна лечебное дело, 2021-06-01
2020
Влияние раннего постнатального стресса на транскриптом префронтальной коры
головного мозга взрослых самцов мышей линии C57Bl/6 Кисаретова Полина Эдуардовна 2020-06-22
Функциональная аннотация потенциально регуляторных полиморфизмов rs590352 в гене ATXN7L3B и rs11542583 в гене COG8 человека Кузина Татьяна Станиславовна Генетика, 2020-06-17
ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ АННОТАЦИЯ rs 11542583 АССОЦИИРОВАННАЯ С ОНКОЛОГИЧЕСКИМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ Зверева Елена Олеговна 30.05.01 – Медицинская биохимия, 2020-06-17
Выявление регуляторных SNPs в геноме человека на основании анализа экспериментальных данных ChIP-seq и RNA-seq Дамаров Игорь Сергеевич 2020-06-09
2019
Влияние раннего постнатального стресса на экспрессию генов, связанных с формированием миелиновой оболочки нейронов, в префронтальной коре 15-дневных самцов мышей Шулюпова Анастасия Сергеевна 30.05.01 – Медицинская биохимия, 2019-10-05
Участие генов циркадного ритма в формировании чувствительности к социальному стрессу Пастухова Мария Андреевна 06.04.01 Биология, 2019-10-05
Структурные и функциональные изменения в гиппокампе у самок мышей, подверженных раннему постнатальному стрессу Рябушкина Юлия Андреевна 06.04.01 Биология, 2019-10-05
Изучение связи регуляторных полиморфизмов с раком молочной железы на выборке больных западно-сибирского региона Ефимова Е.Г. 30.05.01 – Медицинская биохимия, 2019-06-13
Функциональная аннотация полиморфизмов rs590352 и rs4796672 потенциально связанных с канцерогенезом Романенко Павел Николаевич 30.05.01 – Медицинская биохимия, 2019-06-13
2018
РОЛЬ RS2072580 В МЕХАНИЗМАХ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К РАЗВИТИЮ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА Веселова Дарья Алексеевна медицинская биохимия, 2018-06-18
Отсроченные эффекты введения дексаметазона в раннем возрасте на экспрессию генов в гипоталамусе и гиппокампе у самцов мышей Бурдеева Ксения Владимировна 30.05.01 – Медицинская биохимия, 2018-06-14
Изучение связи потенциально регуляторных полиморфизмов с колоректальным раком с использованием выборки больных западно-сибирского региона Верстунина Марина Андреевна медицинская биохимия, 2018-06-14
Влияние раннего постнатального стресса на транскриптом гиппокампа и префронтальной коры головного мозга 15-ти дневных мышей Лепешко Арина Александровна 06.04.01 Биология, 2018-06-07
Отдаленные последствия введения дексаметазона в раннем онтогенезе на когнитивные способности самцов мышей и экспрессию генов в гиппокампе Батлук Ульяна Ивановна 06.03.01 Биология, 2018-06-05
Полногеномный анализ триметилирования гистона Н3 в префронтальной коре головного мозга мышей в норме и при хроническом социальном стрессе Ещенко Наталья Вячеславовна 06.03.01 Биология, 2018-06-05
Дифференциальная экспрессия и альтернативный сплайсинг в культурах клеток глиом по данным RNA-Seq Ковалев Сергей Сергеевич 30.05.01 – Медицинская биохимия, 2018-06-01
Изучение потенциально функционально значимых полиморфизмов ТАТА-боксов промоторов генов липидного метаболизма человека» Аркова Ольга Владимировна Генетика, 2018-02-14
2017
Изменение экспрессии генов сигнального пути глюкокортикоидного рецептора на модели раннего постнатального стресса у мышей Студеникина Анастасия Александровна 2017-06-14
Выявление новых регуляторных полиморфизмов, ассоциированных с предрасположенностью к развитию колоректального рака Дегтярева Арина Олеговна 03.00.04 - биохимия, 2017-06-14
Функциональный анализ полиморфизмов в генах, связанных с развитием онкологический заболеваний Голованова Альбина Владимировна Биохимия, 2017-06-14
Эффекты введения дексаметазона в раннем возрасте на паттерн метилирования ДНК в гиппокампе мышей Садчиков Артем александрович медицинская биофизика, 2017-06-14
Влияние раннего постнатального стресса на экспрессию генов фронтальной коры головного мозга взрослых мышей Рябушкина Юлия Андреевна 06.03.01 Биология, 2017-06-02
Компьютерно-экспериментальное изучение влияния SNPs кор-промоторов генов ожирения на взаимодействие с ТАТА-связывающим белком человека Полякова Алена Александровна 2017-05-28
2016
Особенности профиля триметилирования гистона H3 (H3K4me3) в префронтальной коре мозга взрослых мышей, подвергавшихся стрессу в ранний постнатальный период Лепешко Арина Александровна 2016-06-06
2015
Оценка регуляторного потенциала однонуклеотидных замен, расположенных в районе промотора 1В гена аденоматозного полипоза человека Решетников Василий Владимирович 2015-06-06
2012
Анализ взаимодействия ТАТА-связывающего белка с ТАТА-боксами, полиморфные варианты которых ассоциированы с сердечно-сосудистыми заболеваниями человека Аркова Ольга Владимировна Генетика, 2012-05-06
2011
Ранние изменения транскриптома печени крысы под действием гепатоканцерогенных аминоазосоединений Ершов Никита Игоревич Генетика, 2011-04-06
Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов SF-1 и SREBP на днк с помощью экспериментально-компьютерного подхода Климова Наталья Викторовна 03.02.07 - генетика, 2011-02-16
2010
Выявление связанных с регуляцией пролиферации генов-мишеней транскрипционных факторов FoxA в геноме мыши Брызгалов Леонид Олегович Генетика, 2010-09-30
Компьютерный анализ коротких молекулярных сигналов регуляции экспрессии генов человека Пономаренко Пётр Михайлович , 2010-06-10
2008
Выяснение роли ТФ HNF3 и ядерных рецепторов в механизме видовой специфичности действия гепатоканцерогенных аминоазокрасителей Пахарукова Мария Юрьевна Генетика, 2008-10-19
Компьютерный анализ коротких молекулярных сигналов регуляции экспрессии генов человека Пономаренко Пётр Михайлович , 2008-06-18
Изучение роли мононуклеотидных замен в гене K-ras мыши в механизме формирования предрасположенности к развитию рака легких Венгерова Яна Дмитриевна Генетика, 2008-06-02
2006
Функциональная интерпретация единичных нуклеотидных замен в интроне 2 гена K-Ras мыши, связанных с развитием рака легких Антонцева Елена Вячеславовна Генетика, 2006-11-29
2004
Потенциальные регуляторные SNP в интроне 6 гена триптофаноксигеназы Васильев Геннадий Владимирович Генетика, 2004-03-24
2002
Влияние химических гепатоканцерогенов на активность транскрипционных факторов HNF3: связь с антиглюкокортикоидныи и опухолеиндуцирующим дйствием этих соединений Кропачев Константин Юрьевич Генетика, 2002-11-27
1998
Роль мембранных сигнальных систем в пролиферативном действии эстрадиола, эстрадиол-модифицированных и немодифицированных олигодезоксинуклеотидов Левашова Зоя Борисовна Генетика, 1998-04-22
1994
«Идентификация сайтов связывания рецептора глюкокортикоидов; их структура и функция» Плисов Сергей Юльевич Генетика, 1994-01-17
Учебные курсы
2018
Физиология 21 века Медведев С. П., Мечетина Л. В.,Батурина Г. С.,Ланшаков Д. А., Бондарь Н. П., Гербек Ю. Э. Новосибирский Государственный Университет,
кафедра физиологии, семестров: 1
2012
Новая иммунология. Мультимедийный курс Попова Н. А. Кафедра цитологии и генетики НГУ, для студентов 3 и 4 курса ФЕН и Медфака НГУ, семестров: 1
Патенты
2023
«База данных дифференциально экспрессирующихся генов крыс как модельных объектов заболеваний человека (RatDEGdb) /A database of differentially expressed genes in rats as model objects for human diseases (RatDEGdb)» Чадаева И.В., Ершов Н.И., Подколодный Н.Л., Кожемякина Р.В., Рассказов Д.А., Богомолов А.Г., Кондратюк Е.Ю., Шихевич С.Г., Рязанова М.А., Федосеева Л.А., Редина О.Е., Кожевникова О.С., Стефанова Н.А., Колосова Н.Г., Маркель А.Л., Пономаренко М.П., Ощепков Д.Ю. Номер патента 2023623888
2019
Способ защиты животных от высокодозового ионизирующего излучения Богачев С.С., Долгова Е.В., Поттер Е.А., Проскурина А.С., Риттер Г.С., Николин В.П., Попова Н.А., Ефремов Я.Р., Кисаретова П.Э., Таранов О.С., Кирикович С.С., Левитес Е.В., Дубатолова Т.Д. Номер патента 2701155
2018
Способ лечения онкологических заболеваний Богачев С.С., Проскурина А.С., Долгова Е.В., Поттер Е.А., Николин В.П., Попова Н.А., Ефремов Я.Р., Байбородин С.И., Таранов О.С., Останин А.А., Черных Е.Р. Номер патента 2675233
База данных «Дифференциальный альтернативный сплайсинг генов человека при вторичной глиобластоме (ДАСГГ)» / «Differential Alternative Splicing of Human Genes in secondary Glioblastome (DASGG)» Брагин А.О., Губанова Н.В., Бабенко В.Н., Богомолов А.Г., Цуканов А.В., Леберфарб Е.Ю., Орлов Ю.Л. Номер патента Свидетельство о госрегистрации № 2018621416
Способ лечения онкологических заболеваний Шурдов Михаил Аркадьевич, Богачев Сергей Станиславович, Алямкина Екатерина Анатольевна, Долгова Евгения Владимировна,
Черных Елена Рэмовна,
Леплина Ольга Юрьевна,
Останин Александр Анатольевич,
Рогачев Владимир Алексеевич,
Гвоздева Татьяна Сергеевна,
Прокопенко Анастасия Вадимовна,
Загребельный Станислав Николаевич,
Ефремов Ярослав Рейнгольдович,
Вараксин Николай Анатольевич,
Рябичева Татьяна Геннадьевна,
Пономаренко Дмитрий Михайлович,
Дворниченко Виктория Владимировна,
Сидоров Сергей Васильевич,
Проскурина Анастасия Сергеевна,
Николин Валерий Петрович,
Попова Нелли Александровна,
Орищенко Константин Евгеньевич Номер патента 2490028
Способ лечения онкологических заболеваний Алямкина Екатерина Анатольевна, Долгова Евгения Владимировна, Проскурина Анастасия Сергеевна, Николин Валерий Петрович,
Попова Нелли Александровна,
Орищенко Константин Евгеньевич,
Загребельный Станислав Николаевич,
Богачев Сергей Станиславович,
Шурдов Михаил Аркадьевич,
Ефремов Ярослав Рейнгольдович,
Черных Елена Рэмовна,
Останин Александр Анатольевич,
Пономаренко Дмитрий Михайлович,
Дворниченко Виктория Владимировна,
Сидоров Сергей Васильевич Номер патента 2489169
Средство для коррекции цитостатической полихимиотерапии с противовоспалительной активностью Сорокина И.В., Толстикова Т. Г., Жукова Н. А., Баев Д.С., Толстиков Г.А., Антимонова А.Н.,Петренко Н.И., Шульц Э.Э. Николин В.П., Попова Н.А. Номер патента 2425680
2010
Способ получения стимулированных дендритных клеток для индукции иммунного ответа против туберкулеза человека Алямкина Е.А., Долгова Е.В., Лихачева А.С., Рогачев В.А., Себелева Т.Е., Николин В.П., Попова Н.А., Сахно Л.В., Гельфгат Е.Л., Останин А.А., Черных Е.Р., Загребельный С.Н., Богачев С.С., Шурдов М.А. Номер патента 2401664
Способ лечения онкологических заболеваний. М.А. Шурдов, С.С. Богачев. Рогачев, В.П. Николин, Н.А. Попова, А.С. Лихачева, Т.Е. Себелева, Стрункин Г. М., , А.Г. Шилов, Черных, Е.Л.
Гельфгат Е. Л. Алямкина Е. А., Долгова Е. В. Номер патента PCT/RU 2008/000680