Влияние стеариновой кислоты на эффективность криоконсервации эмбрионов домашней кошки (Felis silvestris catus) Брусенцев Е.Ю., Окотруб С.В., Лебедева Д.А., Окотруб К.А., Рахманова Т.А., Амстиславский С.Я. Известия РАН. Серия биологическая, 2024, № 1, с. 76–89.
Effects of stearic acid on the embryo cryopreservation in the mouse Igonina TN, Rakhmanova TA, Omelchenko AN, Okotrub KA, Brusentsev EYu, Rozhkova IN, Amstislavsky SYa CRYOLETTERS, 2024, V. 45. № 1. P. 28-35.
Program freezing of diapausing embryos in the mouse Amstislavsky S.Ya., Okotrub S.V., Rozhkova I.N., Rakhmanova T.A., Igonina T.N., Brusentsev E.Yu., Kozeneva V.S., Lebedeva D.A., Omelchenko A.N., Okotrub K.A. THERIOGENOLOGY, 2024, 217, 1–10.
Effect of cryopreservation on Odc1 and RhoA genes expression in diapausing mouse blastocysts Amstislavsky S., Brusentsev E., Lebedeva D., Rozhkova I., Rakhmanova T., Okotrub S., Kozeneva V., Igonina T., Babochkina T. REPROD DOMEST ANIM, 2024, V. 59. e14576.
Experimental approaches to controlled diapause in mammals Brusentsev E.Yu., Rakhmanova T.A., Rozhkova I.N., Okotrub S.V., Kozeneva V.S., Amstislavsky S.Ya. RUSS J ECOL+, 2024, Vol. 55, No. 4, pp. 308–318.
Probing metabolism in mouse embryos using Raman spectroscopy and deuterium tags A.N. Omelchenko, K.A. Okotrub, T.N. Igonina, T.A. Rakhmanova, S.V. Okotrub, I.N. Rozhkova, V.S. Kozeneva, S.Ya. Amstislavsky, N.V. Surovtsev SPECTROCHIM ACTA A, 2024
Catching the Big Fish in Big Data: A Meta-Analysis of Zebrafish Kidney scRNA-Seq Datasets Highlights Conserved Molecular Profiles of Macrophages and Neutrophils in Vertebrates Aleksandr V Bobrovskikh, Ulyana S Zubairova, Ludmila G Naumenko, Alexey V Doroshkov Biology, 2024, 13(10):773
Genotype imputation in human genomic studies Berdnikova AA, Zorkoltseva IV, Tsepilov YA, Elgaeva EE Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, 28(6):628-639
2023
Эффекты вспомогательных репродуктивных технологий на социальное поведение мышей линии BTBR – модели расстройств аутистического спектра Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Брусенцев Е.Ю., Игонина Т.Н., Рахманова Т.А., Лебедева Д.А., Яцук Т.А., Козенева В.С., Напримеров В.А., Амстиславский С.Я. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2023, Т. 109. № 3. С. 315–333.
Effects of forskolin on cryopreservation and embryo development in the domestic cat Rakhmanova TA, Mokrousova VI, Okotrub SV, Kizilova EA, Brusentsev EYu, Amstislavsky SYa THERIOGENOLOGY, 2023, V. 210, P. 192–198.
Multi-Trait Exome-Wide Association Study of Back Pain-Related Phenotypes Zorkoltseva IV
Elgaeva EE
Belonogova NM
Kirichenko AV
Svishcheva GR
Freidin MB
Williams FMK
Suri P
Tsepilov YA
Axenovich TI Genes, 2023, 14(10):1962
Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei Aleksandr V. Bobrovskikh, Ulyana S. Zubairova, Alexey V. Doroshkov Biology, 2023, 12(12),1516
Профиль экспрессии генов, связанных с регуляцией стресса, поведения и нейрогенеза, вдоль дорзовентральной оси в гиппокампе у взрослых ручных и агрессивных лисиц Ю. В. Александрович, Е. В. Антонов, С. Г. Шихевич, А. В. Харламова, Л. В. Мейстер, Ю. В. Маковка, Д. В. Шепелева, Р. Г. Гулевич, Ю. Э. Гербек Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, т.27, № 6, 651-661
Реконструкция и анализ регуляторной генной сети функционирования клеточной стенки листьев Arabidopsis thaliana L. при ответе на водный дефицит A.R. Volyanskaya, E.A. Antropova, U.S. Zubairova, P.S. Demenkov, A.S. Venzel, Y.L. Orlov, A.A. Makarova,
T.V. Ivanisenko, T.A. Gorshkova, A.R. Aglyamova, N.A. Kolchanov, M. Chen, V.A. Ivanisenko Vavilov journal of genetics and breeding, 2023
Repurposing Antihypertensive and Statin Medications for Spinal Pain: A Mendelian Randomization Study Suri P, Elgaeva EE, Williams FMK, Freidin MB, Verzun DA, Tsepilov YA SPINE, 2023
Development and Replication of a Genome-Wide Polygenic Risk Score for Chronic Back Pain Tsepilov YA, Elgaeva EE, Nostaeva AV, Compte R, Kuznetsov I, Karssen LC, Freidin MB, Suri P, Williams FMK, Aulchenko YS J. Pers. Med, 2023
Bidirectional Mendelian Randomization Study of Personality Traits Reveals a Positive Feedback Loop Between Neuroticism and Back Pain Elgaeva EE, Williams FMK, Zaytseva OO, Freidin MB, Aulchenko YS, Suri P, Tsepilov YA J PAIN, 2023
Evidence of causal effects of blood pressure on back pain and back pain on type II diabetes provided by a bidirectional Mendelian randomization study Suri P, Elgaeva EE, Williams FMK, Freidin MB, Zaytseva OO, Aulchenko YS, Tsepilov YA SPINE J, 2023
Изменения уровня мРНК генов Tph1, Tph2, активности триптофангидроксилазы и метаболизма серотонина в мозге мышей через 5 суток после введения липополисахарида Д. В. Щербаков, А. Б. Арефьева, П. Д. Комлева, А. Е. Изъюров, Н. В. Хоцкин , Д. В. Базовкина, А. В. Куликов Молекулярная биология, 2023, T. 57. № 2, стр. 299-306
2022
Transcriptomic Data Meta-Analysis Sheds Light on High Light Response in Arabidopsis thaliana L. Бобровских Александр Владимирович
Зубаирова Ульяна Станиславовна
Бондарь Евгения Ивановна
Лавреха Виктория Вадимовна
Дорошков Алексей Владимирович INT J MOL SCI, 2022, 23(8), 4455
Changes in Glial Support of the Hippocampus during the Development of an Alzheimer’s Disease-Like Pathology and Their Correction by Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1 Ekaterina A. Rudnitskaya, Alena O. Burnyasheva, Tatiana A. Kozlova, Daniil A. Peunov , Nataliya G. Kolosova, Natalia A. Stefanova. INT J MOL SCI, 2022, 23, 1134.
Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus Ulyana S. Zubairova, Aleksandra Yu. Kravtsova, Alexander V. Romashchenko, Anastasiia A. Pushkareva, Alexey V. Doroshkov Plants, 2022, https://www.mdpi.com/2223-7747/11/12/1533/htm
A protocol for recruiting and analyzing the disease-oriented Russian disc degeneration study (RuDDS) biobank for functional omics studies of lumbar disc degeneration Olga N. Leonova, Elizaveta E. Elgaeva, Tatiana S. Golubeva, Alexey V. Peleganchuk, Aleksandr V. Krutko, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov PloS One, 2022
Mlig-SKP1 gene is required for spermatogenesis in the flatworm Macrostomum lignano Biryukov M., Dmitrieva A., Vavilova V., Ustyantsev K., Bazarova E., Sukhikh I., Berezikov E., Blinov A. INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 15110
Исследование миграционных процессов в Евразии методами палеогенетики Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В. Археология, этнография и антропология Евразии, 2022, Т. 50. - № 2. - С. 140-149
Планиграфические особенности распределения вариантов митохондриальной ДНК в комплексах андроновского времени могильника Тартас-1 (предварительные результаты) Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пристяжнюк М.С., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Кобелева Л.С., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Археология, этнография и антропология Евразии, 2022, Т. 50. № 4. С. 137-144
Разнообразие вариантов митохондриальной ДНК у носителей окуневской культуры из могильника Сыда V (Минусинская котловина) Пилипенко И.В., Пристяжнюк М.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Вестник НГУ. Серия: История, филология, 2022, Т. 21. - № 7. - С. 53-71
Разнообразие вариантов мтДНК и Y-хромосомы в генофонде носителей староалейской культуры (могильник Фирсово-XIV) Черданцев С.В., Трапезов Р.О., Томилин М.А., Пилипенко И.В., Папин Д.В., Федорук А.С., Тур С.С., Пилипенко А.С. Теория и практика археологических исследований, 2022, Т. 34 - № 1. - С. 125-145
Первые результаты палеогенетического исследования носителей андроновской (федоровской) культуры из могильников Чекановский лог-2, 10 Трапезов Р.О., Пилипенко А.С., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пилипенко И.В., Журавлев А.А., Пристяжнюк М.С., Демин М.А., Савко И.А., Папин Д.В. Народы и религии Евразии, 2022, Т. 27. - С. 690-695
Mendelian randomization analysis of plasma levels of CD209 and MICB proteins and the risk of varicose veins of lower extremities Alexandra S Shadrina, Elizaveta E Elgaeva, Ian B Stanaway, Gail P Jarvik, Bahram Namjou, Wei-Qi Wei, Joe Glessner, Hakon Hakonarson, Pradeep Suri, Yakov A Tsepilov PloS One, 2022
Расширение ареала вьюна Никольского Misgurnus nikolskyi (Cobitidae) на юге Западной Сибири Интересова ЕА, Романов ВИ, Давлетшина ГИ, Федорова ВС, Трифонов ВА Российский Журнал Биологических Инвазий, 2022, 15(2): 38-42
The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with fluorescence in situ localization of major repetitive DNAs Romanenko SA, Prokopov DY, Proskuryakova AA, Davletshina GI, Tupikin AE, Kasai F, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA INT J MOL SCI, 2022, 23(21): 13063
Identification of Iguania ancestral syntenic blocks and putative sex chromosomes in the veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Chamaeleonidae, Iguania) Tishakova KV, Prokopov DY, Davletshina GI, Rumyantsev AV, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Giovannotti M, Lisachov AP, Trifonov VA INT J MOL SCI, 2022, 23(24): 15838
New data on small lampreys of the genus Lethenteron (Petromyzontidae) of the Tom river, a typical habitat of the Siberian brook lamprey Lethenteron kessleri Interesova EA, Babkina IB, Romanov VI, Pozdnyak IV, Davletshina GI, Trifonov VA Journal of Ichthyology, 2022, 62(7): 1230-1236
2021
Amplified Fragments of an Autosome-Borne Gene Constitute a Significant Component of the W Sex Chromosome of Eremias velox (Reptilia, Lacertidae). Lisachov Artem
Andreyushkova Daria
Davletshina Guzel
Prokopov Dmitry
Romanenko Svetlana
Galkina Svetlana
Saifitdinova Alsu
Simonov Evgeniy
Borodin Pavel
Trifonov Vladimir Genes, 2021, 12(5), 779
Comparative transcriptome profiling of a resistant vs susceptible bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivar in response to water deficit and cold stress Dmitrii K. Konstantinov, Ulyana S. Zubairova, Anton A. Ermakov, Alexey V. Doroshkov PeerJ, 2021, PeerJ 9:e11428
Regulatory SNPs: Altered Transcription Factor Binding Sites Implicated in Complex Traits and Diseases. Degtyareva, A.O.;
Antontseva, E.V.; Merkulova, T.I. INT J MOL SCI, 2021, 22, 6454.
A computational model of the cereal leaves hydraulics S V Nikolaev, U S Zubairova JPCS, 2021, 2099 (2021) 012039
DARTS: An Algorithm for
Domain-Associated Retrotransposon Search in Genome Assemblies Mikhail Biryukov, Kirill Ustyantsev Genes, 2021
Эксперимент по доместикации лисиц и эволюция собак с позиции современных молекулярно-генетических и археологических данных Трут Л.Н., Харламова А.В., Пилипенко А.С., Гербек Ю.Э. Генетика, 2021, Т. 57. – №. 7. – С. 767-785
Генетический состав носителей тагарской культуры: современное состояние и перспективы исследований Черданцев С.В., Трапезов Р.О., Пристяжнюк М.С., Томилин М.А., Журавлев А.А., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2021, Т. XXVII. - С. 723-729
Новый этап палеогенетического исследования носителей одиновской культуры (Барабинская лесостепь): первые результаты Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пристяжнюк М.С., Пилипенко И.В., Нестерова М.С., Поздняков Д.В., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2021, Т. XXVII. - С. 690-695.
2020
Candidate genes for age at menarche are associated with endometriosis Irina Ponomarenko, Evgeny Reshetnikov, Alexey Polonikov, Irina Verzilina, Inna Sorokina, Elizaveta E Elgaeva, Yakov A Tsepilov, Anna Yermachenko, Volodymyr Dvornyk, Mikhail Churnosov REPROD BIOMED ONLINE, 2020
Полиморфизм rs2072580 T>A в перекрывающихся промоторных областях генов SART3 и ISCU, связанный с риском развития рака молочной железы А.О.Дегтярева, Е.Ю.Леберфарб, Е.Г.Ефимова, И.И.Брусенцов, А.В.Усова, Е.Л.Лушникова, Т.И.Меркулова Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2020, Т.169, № 1, с.88-91
Classification of LTR retrotransposons in the flatworm Macrostomum lignano M. Biryukov, E. Berezikov, K. Ustyantsev Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2020, 6(2), 54-59
ОСОБЕННОСТИ ГЕНОФОНДА
ТУВИНСКОГО ЭТНОСА НА ОСНОВЕ
ИЗУЧЕНИЯ АНТИГЕНОВ ГРУПП КРОВИ
В СРАВНИТЕЛЬНОМ АСПЕКТЕ Л.Э. Табиханова, Л.П. Осипова, С.С.Ковалёв, У.Н. Кавай-оол, А.Н. Сарыглар, Т.В. Чуркина, М.Р. Хантемирова Якутский медицинский журнал, 2020, №2, с.84-87
FEATURES OF THE GENE POOL
OF THE TUVINIAN ETHNOS BASED
ON THE STUDY OF BLOOD GROUP ANTIGENS IN COMPARATIVE PERSPECTIVE L.E. Tabikhanova, L.P. Osipova, S.S. Kovalev, U.N. Kavai-ool,
A.N. Sariglar, T.V. Churkina, M.R. Khantemirova Якутский медицинский журнал, 2020, №2, с.84-87
Green revolution ‘stumbles’ in a dry environment: Dwarf wheat with Rht genes fails to produce higher grain yield than taller plants under drought S. Jatayev, I. Sukhikh, V. Vavilova, S. E. Smolenskaya, N. P. Goncharov, A. Kurishbayev, L. Zotova, A. Absattarova, D. Serikbay, Y.‐G. Hu, N. Borisjuk, N. K. Gupta, B. Jacobs, S. de Groot, F. Koekemoer, B. Alharthi, K. Lethola, D. T. Cu, C. Schramm, P. Anderson, C. L. D. Jenkins, K. L. Soole, Y. Shavrukov, P. Langridge PLANT CELL ENVIRON, 2020, Vol. 43. P. 2355–2364.
Replication of 15 loci involved in human plasma protein N-glycosylation in 4,802 samples from four cohorts Sharapov SZ, Shadrina AS, Tsepilov YA, Elgaeva EE, Tiys ES, Feoktistova SG, Zaytseva OO, Vuckovic F, Cuadrat R, Jäger S, Wittenbecher C, Karssen LC, Timofeeva M, Tillin T, Trbojević-Akmačić I, Štambuk T, Rudman N, Krištić J, Šimunović J, Momčilović A, Vilaj M, Jurić J, Slana A, Gudelj I, Klarić T, Puljak L, Skelin A, Kadić AJ, Van Zundert J, Chaturvedi N, Campbell H, Dunlop M, Farrington SM, Doherty M, Dagostino C, Gieger C, Allegri M, Williams F, Schulze MB, Lauc G, Aulchenko YS. GLYCOBIOLOGY, 2020, cwaa053
Analysis of genetically independent phenotypes identifies shared genetic factors associated with chronic musculoskeletal pain conditions Tsepilov Y. A., Freidin M. B., Shadrina A. S., Sharapov S. Z., Elgaeva E. E., van Zundert J., Karssen L. С., Suri P., Williams F. M. K., Aulchenko Y. S. Commun. biolog., 2020, 3, Article number: 329
Два мужских погребения из кургана саргатской культуры: биоархеологический и палеогенетический обзор Шарапова С.В., Пилипенко А.С., Ражев Д.И., Трапезов Р.О., Черданцев С. В. Stratum plus, 2020, №3, стр. 353-378
Two Male Burials from the Sargat Culture Kurgan: Bio-archaeological and Paleogenetic Review Sharapova S.V., Pilipenko A.S., Razhev D.I., Trapezov R.O., Cherdantsev S.V. Stratum plus, 2020, № 3, Pp. 353-378
Исследование генетического состава носителей староалейской культуры: постановка проблемы и первые результаты анализа вариабельности мтДНК Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Тур С.С., Федорук А.С., Фролов Я.В., Папин Д.В. Теория и практика археологических исследований, 2020, Т. 32, С. 111-134
Погребальный памятник афанасьевской культуры Бертек-33 на плато Укок (Горный Алтай): результаты палеогенетического исследования Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Журавлев А.А., Пристяжнюк М.С., Молодин В.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2020, Т. 48, № 4
К вопросу о генетическом составе сарматского населения Нижнего Поволжья (данные палеогенетики) Пилипенко А. С., Черданцев С. В., Трапезов Р. О., Томилин М. А., Балабанова М. А., Пристяжнюк М. С., Журавлев А. А. Вестник ВГУ. Серия 4., 2020, Т. 25, № 4, С. 17–50
Генетический состав домашних животных, как маркер миграций человека Пилипенко А.С., Пилипенко И.В., Черданцев С.В., Трапезов Р.О. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2020, Т.XXVI, С. 571-578
Новые данные о генетическом составе андроновского населения юга Сибири (Верхнее Приобье и Кулунда) Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Папин Д.В., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2020, Т.XXVI, С. 671-677
Антиоксиданты разного механизма действия снижают неоплазию эпителия желчных протоков при экспериментальном описторхозе Запарина О.Г., Ковнер А.В. Гены и клетки, 2020
Genomics and proteomics of the liver fluke Opisthorchis felineus Mordvinov V.A., Ershov N.I., Zaparina O.G., Pakharukova M.Y. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020
Нейрогенез в зрелом головном мозге: изменения при старении и развитии болезни Альцгеймера Бурняшева А.О., Стефанова Н.А., Рудницкая Е.А. Успехи геронтологии, 2020
Внеклеточные везикулы возбудителя описторхоза трематоды Opisthorchis felineus увеличивают скорость миграции и пролиферации холангиоцитов человека H69 Д.В. Пономарев, Е.С. Савина, О.Г. Запарина Гены и клетки, 2020
rs2072580T>A Polymorphism in the Overlapping Promoter Regions of the SART3 and ISCU Genes Associated with the Risk of Breast Cancer Degtyareva AO, Leberfarb EY, Efimova EG, Brusentsov II, Usova AV, Lushnikova EL, Merkulova TI B EXP BIOL MED+, 2020
2019
The role of long non-coding RNAs in the pathogenesis of hereditary diseases. Sparber P., Filatova A., Khantemirova M., Skoblov M. BMC MED GENOMICS, 2019
Unique mutational spectrum of the GJB2 gene and its pathogenic contribution to deafness in Tuvinians (Southern Siberia, Russia): a high prevalence of rare variant c.516G>C (p.Trp172Cys). Posukh O.L., Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Bondar A.A., Morozov I.V., Maximov V.N., Voevoda M.I. Genes, 2019, Jun 5;10(6). pii: E429
The Evaluation of Genetic Relationships within Acridid Grasshoppers (Orthoptera, Caelifera, Acrididae) on the Subfamily Level Using Molecular Markers Sukhikh I., Ustyantsev K., Bugrov A., Sergeev M., Fet V., Blinov A. FOLIA BIOL-KRAKOW, 2019, 67(3):119-126
Diversity of mariner-like elements in Orthoptera K. Ustyantsev, M. Biryukov, I. Sukhikh, N.V. Shatskaya, V. Fet, A. Blinov, I. Konopatskaia Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(8):1059-1066
Examining causal effects of body mass index on back pain: a Mendelian randomization study Elizaveta E. Elgaeva, Yakov Tsepilov, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Yurii Aulchenko, Pradeep Suri EUR SPINE J, 2019
2018
An Unusual Burial of a Xiongnu-Sarmatian Era Warrior in the Western Siberian Forest-Steppe: Results of a Paleogenetic Analysis Pilipenko A.S., Cherdantsev S.V., Trapezov R.O., Pozdnyakov D.V., Chikisheva T.A., Molodin V.I. Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2018, Vol. 46, N. 4, P. 123-131.
Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak Archaeological and Anthropological Sciences, 2018, Vol. 10, Issue 7, P. 1557-1570.
Maternal genetic features of the Iron Age Tagar population from Southern Siberia (1st millennium BC) Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Stepan V. Cherdantsev, Vladimir N. Babenko, Marina S. Nesterova, Dmitri V. Pozdnyakov, Vyacheslav I. Molodin, Natalia V. Polosmak PloS One, 2018, 13(9): e0204062
2017
Ancestry and demography and descendants of Iron Age nomads of the Eurasian Steppe Martina Unterländer, Friso Palstra, Iosif Lazaridis, Aleksandr Pilipenko, Zuzana Hofmanová, Melanie Groß, Christian Sell, Jens Blöcher, Karola Kirsanow, Nadin Rohland, Benjamin Rieger, Elke Kaiser, Wolfram Schier, Dimitri Pozdniakov, Aleksandr Khokhlov, Myriam Georges, Sandra Wilde, Adam Powell, Evelyne Heyer, Mathias Currat, David Reich, Zainolla Samashev, Hermann Parzinger, Vyacheslav I. Molodin, and Joachim Burger NAT COMMUN, 2017
Палеогенетическое исследование родства погребенных из курганов саргатской культуры в Барабинской лесостепи (Западная Сибирь) А.С. Пилипенко, С.В. Черданцев, Р.О. Трапезов, В.И. Молодин, Л.С. Кобелева, Д.В. Поздняков, Н.В. Полосьмак Археология, этнография и антропология Евразии, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016
Stress and hypertensive disease: adrenals as a link. Experimental study on hypertensive ISIAH rat strain Yegor V. Antonov, Yuriy V. Alexandrovich, Olga E. Redina, Michael A. Gilinsky & Arcady L. Markel Clinical and Experimental Hypertension, 2016, Volume 38, Issue 5, 415-423
Molecular determinants of the adrenal gland functioning related to stress-sensitive hypertension in ISIAH rats Larisa A. Fedoseeva, Leonid O. Klimov, Nikita I. Ershov, Yury V. Alexandrovich, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel, Olga E. Redina BMC GENOMICS, 2016, 2016, 17(Suppl 14):989
Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56 (II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия) А.С. Пилипенко, В.И. Молодин, Р.О. Трапезов, С.В. Черданцев, А.А. Журавлев Археология, этнография и антропология Евразии, 2016, Том 44, № 4, С. 141-149
Полиморфизм регуляторной области гена LCT в некоторых тюркоязычных популяциях Алтае-Саянского региона. И.В. Пилипенко, М.С. Пристяжнюк, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода, А.С. Пилипенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):887-893
2015
MtDNA Haplogroup A10 Lineages in Bronze Age Samples Suggest That Ancient Autochthonous Human Groups Contributed to the Specificity of the Indigenous West Siberian Population Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vyacheslav I. Molodin, Aida G. Romaschenko PloS One, 2015
Mitochondrial DNA diversity in the gene pool of the Neolithic and Early Bronze Age Cisbaikalian human population R. O. Trapezov, A. S. Pilipenko, V. I. Molodin Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, January 2015, Volume 5, Issue 1, pp 26-32
Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребения 1 кургана 1 могильника Ак-Алаха-3 А.С. Пилипенко, Р.О. Трапезов, Н.В. Полосьмак Археология, этнография и антропология Евразии, 2015, Том 43 № 2, стр. 138-145
Палеогенетическое исследование носителей пазырыкской культуры из могильника Ак-Алаха-1 (Горный Алтай) Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Полосьмак Н.В. Археология, этнография и антропология Евразии, 2015, Том 43, № 4, стр. 144 - 150
Применение сопряжённых уравнений для исследования чувствительности в модели симпластного роста клеток линейного листа А.В. Пененко, У.С. Зубаирова, С.В. Николаев Труды Международной конференции АКТУАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНОЙ И ПРИКЛАДНОЙ МАТЕМАТИКИ – 2015 посвященной 90-летию со дня рождения академика Г. И. Марчука, 2015, С.562-572
A computational model of the effect of symplastic growth on cell mechanics in a linear leaf blade Zubairova U., Golushko S., Penenko A., Nikolaev S. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2015, Vol. 13, No. 1 1540005
2014
Разнообразие линий митохондриальной ДНК в генофонде населения Прибайкалья эпохи неолита и ранней бронзы Трапезов Р.О., Пилипенко А.С., Молодин В.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, 2014 год, том 18, №3, стр. 469-477
2013
Разнообразие микроорганизмов в образцах из археологических комплексов пазырыкской культуры (IV-III вв. до н.э.) Северо-Западной Монголии Ханаева Т.А., Суслова М.Ю., Земская Т.И., Молодин В.И., Пилипенко А.С., Парцингер Г. МИКРОБИОЛОГИЯ, 2013
Modeling of plant embryo morphodynamics at early developmental stages S. V. Nikolaev, N. A. Kolchanov, S. K. Golushko, J. -C. Palauqui, A. Urban, E. V. Amelina, A. V. Yurchenko, K. S. Golushko, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, A. Trubuil Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2013, May 2013, Volume 3, Issue 3, pp 176-183
Модель регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега Arabidopsis thaliana С. В. Николаев, У. С. Зубаирова, А. В. Пененко, Э. Д. Мелснесс (E. D. Mjolsness), Б. Е. Шапиро (B. E. Shapiro), Н. А. Колчанов Doklady Akademii Nauk, 2013, том 452, № 3, с. 336–338
Model of Structuring the Stem Cell Niche in Shoot Apical Meristem of Arabidopsis thaliana S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, E. D. Mjolsness, B. E. Shapiro, and Academician N. A. Kolchanov Doklady Biological Sciences, 2013, Vol. 452, pp. 316–319
Модели регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега У.С. Зубаирова, С.В. Николаев Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, том 17, № 4/1, с. 738-747
2012
Моделирование роста и развития растительных тканей в формализме L-систем Зубаирова У.С., Пененко А.В., Николаев С.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, том 16, №4/1, С. 816-824
Моделирование морфодинамики на ранних стадиях эмбриогенеза растения Николаев С.В., Колчанов Н.А., Голушко С.К., Палаки Ж.-К., Урбан О., Амелина Е.В., Юрченко А.В., Голушко К.С., Зубаирова У.С., Пененко А.В., Трубюй А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, том 16, №4/1, С. 805-815
Генофонд мтДНК населения восточного варианта пахомовской культуры Молодин В.И., Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2012, № 4 (52). С. 62-69.
Древняя ДНК заговорила Пилипенко А.С. Наука из первых рук, 2012, № 1. С. 38-39.
2011
ASSOCIATION OF COLD RECEPTOR TRPM8 GENE POLYMORPHISM WITH BLOOD LIPID INDICES AND ANTHROPOMETRIC PARAMETERS IN SHORIANS POTAPOVA T.A., YUDIN N.S., PILIPENKO I.V., KOBSEV V.F., ROMASHCHENKO A.G., SHAKHTSHNEIDER E.V., OGARKOV M.Y., VOEVODA M.I B EXP BIOL MED+, 2011, Т. 151, № 2, Р. 223-226
Paleogenetic analysis in archeological studies Pilipenko A.S., Molodin V.I. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, Volume 1, Number 1, 51-72
Митохондриальная ДНК женщины из пещеры Каминная (Горный Алтай) эпохи позднего неолита Пилипенко А.С., Молодин В.И., Ромащенко А.Г. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Том 15, № 4, стр. 633-643
A Study of a One-Dimensional Model of Regulation of the Renewing Zone Size in a Biological Tissue Accounting for Cell Division S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, S. I. Fadeev, E. Mjolsness, N. A. Kolchanov Journal of Applied and Industrial Mathematics, 2011, Vol. 5, No. 4, pp. 1–14.
2010
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учётом деления клеток Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И., Мйолснесс Э., Колчанов Н.А. Сибирский журнал индустриальной математики, 2010, том 13, № 4 (44) С. 70-82
Палеогенетический анализ в археологических исследованиях Пилипенко А.С., Молодин В.И. Информационный вестник ВОГИС, 2010, T. 14. № 2. С. 280-311.
Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
Древняя ДНК и стабильные изотопы – новые ответы на старые вопросы Молодин В.И., Пилипенко А.С. Наука из первых рук, 2010, № 2. С. 72-81.
2009
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ ИЛ-18 И ИЛ-1β У БОЛЬНЫХ РАКОМ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ СИЛКОВ А.Н., ГОРЕВА Е.П., ЖОВМЕР А.С., КИРЕЕВ Ф.Д., МАКСИМОВ В.Н., ПИЛИПЕНКО И.В., МАЛИНОВСКАЯ Е.А., БАБЫШКИНА Н.Н., ЛИТВЯКОВ Н.В., СЕННИКОВ С.В., КОЗЛОВ В.А. Российский иммунологический журнал, 2009
2008
Особенности захоронения младенцев в жилищах городища Чича-1 в Баабинской лесостепи по данным анализа структуры ДНК Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2008, № 2, Т. 34, С. 57-67
Полиморфизм гена холодового рецептора TRPM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока Потапова Т.А., Юдин Н.С., Бабенко В.Н., Пилипенко И.В., В.Ф. Кобзев И.В., Гырголькау Л.А., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2008, №4, Том 12, С. 749-754
Спектр мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в российской популяции М.И. Воевода, И.В. Куликов, Е.В. Шахтшнейдер, В.Н. Максимов, И.В. Пилипенко, И.П. Терещенко, В.Ф. Кобзев, А.Г. Ромащенко, Ю.П. Никитин RUSS J GENET+, 2008, №10, том 44, с. 1374-1378
Взаимосвязь полиморфных вариантов гена-онкосупрессора р53 и хемокинового рецептора CCR5 с риском возникновения рака молочной железы у женщин репродуктивного периода и менопаузы. Е.С. Григорьева, Н.Н. Бабышкина, Е.А. Малиновская, Н.В. Чугунова, М.В. Завьялова, И.В. Пилипенко Сибирский онкологический журнал, 2008
АССОЦИАТИВНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ P53 И C-FMS С РАЗВИТИЕМ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ У РУССКИХ ЖЕНЩИН И.В. Пилипенко, О.В. Горчакова, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода,Н.Н. Бабышкина, Н.В. Чугунова, А.В. Дорошенко, А.Г. Ромащенко Сибирский онкологический журнал, 2008
СУБФРАКЦИОННЫЙ ПРОФИЛЬ ЧАСТИЦ ЛИПОПРОТЕИНОВ НИЗКОЙ ПЛОТНОСТИ И СПЕКТР МУТАЦИЙ ГЕНА LDLR ПРИ ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИИ ШАХТШНЕЙДЕР Е.В., КУЛИКОВ И.В., РАГИНО Ю.И., ПОЛОНСКАЯ Я.В., ПИЛИПЕНКО И.В., ТЕРЕЩЕНКО И.П., КОБЗЕВ В.Ф., РОМАЩЕНКО А.Г., НИКИТИН Ю.П., ВОЕВОДА М.И. Кардиоваскулярная терапия и профилактика, 2008, Т. 7, N 6 S1, P. 411-412
2007
ИССЛЕДОВАНИЕ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ IL-18 И IL-1β У БОЛЬНЫХ РАКОМ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ЖОВМЕР А.С., СИЛКОВ А.Н., ПИСКУНОВ А.А., МАКСИМОВ В.Н., ПИЛИПЕНКО И.В., МАЛИНОВСКАЯ Е.А., СЛОНИМСКАЯ Е.М., ЧЕРДЫНЦЕВ Н.В., СЕННИКОВ С.В., КОЗЛОВ В.А. Омский научный вестник, 2007
Мультидисциплинарные исследования населения Барабинской лесостепи V - I тыс. до н.э.: археологический, палеогенетический и антропологический аспекты Молодин В.И., Пилипенко А.С., Чикишева Т.А., Ромащенко А.Г., Журавлев А.А., Поздняков Д.В., Трапезов Р.О.
2012
Human migrations in the southern region of the West Siberian Plain during the Bronze Age: Archaeological, palaeogenetic and anthropological data Molodin V.I., Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Zhuravlev A.A., Trapezov R.O., Chikisheva T.A., Pozdnyakov D.V.
К этногенезу культур эпохи бронзы на юге Западной Сибири Молодин В.И., Чикишева Т.А., Пилипенко А.С.
2009
Особенности структуры генофонда митохондриальной ДНК населения городища Чича-1 Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И.
2008
Глава 6. Компьютерная биология развития. Раздел 6.3. Морфогенез растений: реконструкция в базах данных и моделирование. Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Подколодный Н.А., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Пененко А.В., Лавреха В.В., Зубаирова У.С., Колчанов Н.А.
Конференции
2024
The influence of lumbar intervertebral disc degeneration on low back pain is modified by genetic propensity
to pain Suri P, Kazemi-Naeni M, Freidin MB, Tsepilov YA, Elgaeva EE, Granville-Smith I, Compte R, Williams FMK The International Society for the Study of the Lumbar Spine Annual meeting
Differential gene expression in degenerative lumbar discs from the Russian disc degeneration study (RuDDS) biobank Aleksandr Tiapkin, Artemii Ivanov, Olga Leonova, Aleksandr Krutko, Alexey Peleganchuk, Veniamin Fishman, Elizaveta Elgaeva, Yakov Tsepilov European Human Genetics Conference ESHG Hybrid Conference 2024. Berlin, Germany. 2024
New genes for back pain-related phenotypes identified by multi-trait gene-based association analysis Nadezhda M. Belonogova, Elizaveta E. Elgaeva, Irina V. Zorkoltseva, Anatoliy V. Kirichenko,
Gulnara R. Svishcheva, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Pradeep Suri, Tatiana
I. Axenovich, and Yakov A. Tsepilov European Human Genetics Conference ESHG Hybrid Conference 2024. Berlin, Germany. 2024
Evolution of embryonic diapause in mammals and applying reproductive technologies to diapausing embryos Amstislavsky S., Rakhmanova T., Rozhkova I., Kozeneva V., Okotrub S., Lebedeva D., Igonina T., Babochkina T., Omelchenko A., Okotrub K., Brusentsev E. BGRS/SB-2024
Эффекты репродуктивных технологий на поведение и развитие мозга у мышей линии B6.Cg-Tg, моделирующих болезнь Паркинсона Рожкова И., Козенева В., Брусенцев Е., Рахманова Т., Шавшаева Н., Афанасова С., Лебедева Д., Окотруб С., Игонина Т., Амстиславский С. BGRS/SB-2024
Efficiency of a new multi-trait approach applied
to back pain-related phenotypes Belonogova N.M., Elgaeva E.E., Zorkoltseva I.V., Kirichenko A.V.,Svishcheva G.R., Freidin M.B., Williams F.M.K., Suri P., Axenovich T.I.,Tsepilov Y.A. BGRS/SB-2024
Repurposing antihypertensive and statin medications for spinal pain: a Mendelian randomization study Suri P, Elgaeva EE, Williams FMK, Freidin MB, Aulchenko YS, Tsepilov YA 18th International Forum for Back and Neck Pain Research in Primary Care
Bidirectional Mendelian randomization analysis of back pain and 22 associated factors Elgaeva EE, Williams FMK, Zaytseva OO, Freidin MB, Aulchenko YS, Tsepilov YA, Suri P European Human Genetics Conference, Hybrid Conference
Exome sequencing association analysis replicated the role of rare variants of SLC13A1 in back pain Zorkoltseva IV, Elgaeva EE, Kirichenko AV, Belonogova NM, Svishcheva GR, Tsepilov YA, Axenovich TI European Human Genetics Conference, Hybrid Conference
2022
Early dysfunction of glial cells as a possible premise of Alzheimer’s disease. Rudnitskaya E.A., Kozlova T.A., Burnyasheva A.O., Stefanova N.A., Kolosova N.G. Конференция Российского нейрохимического общества RUSNEUROCHEM.
Дисбаланс глутаматергической и ГАМКергической систем при развитии признаков болезни Альцгеймера у крыс OXYS. Бурняшева А.О., Рудницкая Е.А., Телегина Д.В. IX международная конференция молодых ученых биотехнологов, биофизиков, молекулярных биологов и вирусологов OpenBio-2022.
Alterations of glutamatergic/GABAergic systems during healthy aging and Alzheimer’s disease-like pathology in rats. Burnyasheva A.O., Rudnitskaya E.A., Telegina D.V. BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Changes in glutamatergic and GABAergic systems during development of Alzheimer’s disease-like pathology in OXYS rats. Burnyasheva A.O., Rudnitskaya E.A., Telegina D.V. Конференция Российского нейрохимического общества RUSNEUROCHEM.
Association between polygenic risk scores for plasma protein N-glycosylation traits and 276 ICD-10 diseases ZAYTSEVA O.O., NOSTAEVA A.V., SHARAPOV S.ZH., ELGAEVA E.E., LAUC G., AULCHENKO Y.S., TSEPILOV Y.A. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
Bidirectional Mendelian randomization study reveals causal effects of psychosocial factors on chronic back pain and vice versa ELGAEVA E., WILLIAMS F., FREIDIN M., ZAYTSEVA O., AULCHENKO Y., TSEPILOV Y., SURI P. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
Genetic components of chronic back pain may underpin distinct subtypes of the disease Elgaeva E, Freidin M, Williams F, Suri P, Aulchenko YS, Tsepilov Y European Society of Human Genetics Conference ESHG 2022
Composition of sex chromosomes of veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Iguania, Squamata) reveals new insights into sex chromosome evolution of iguanian lizards Tishakova K, Prokopov D, Davletshina G, O’Brien P, Ferguson-Smith M, Giovannotti M, Trifonov V The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology"
The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with in situ localization of major tandemly arranged repetitive DNAs Romanenko SA, Proskuryakova AA, Prokopov DYu, Davletshina GI, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology"
Секвенирование полных митохондриальных геномов белуг из археологических раскопок Поволжья Давлетшина ГИ, Молодцова АС, Воробьева НВ, Аськеев ИВ, Аськеев ОВ, Аськеев АО, Шаймуратова ДН, Трифонов ВА III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике"
ИДЕНТИФИКАЦИЯ ПРЕДКОВЫХ СИНТЕННЫХ БЛОКОВ И ПОЛОВЫХ ХРОМОСОМ У ЙЕМЕНСКОГО ХАМЕЛЕОНА (CHAMAELEO CALYPTRATUS, IGUANIA, REPTILIA) Тишакова К.В., Прокопов Д.Ю., Давлетшина Г. И., Трифонов В.А. III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике"
Functional study of rs2072580 (SART3 and ISCU genes) associated with breast cancer Дегтярева А.О., Антонцева Е.В., Меркулова Т.И. BGRS-2022
Functional study of rs590352 (ATXN7L3B) associated with colorectal cancer Антонцева Е.В., Дегтярева А.О., Алиев Т.И., Меркулова Т.И. BGRS-2022
2021
«Foodborne trematode Opisthorchis felineus infection: mechanistic insights into biliary neoplasia formation» Пахарукова М.Ю, Запарина О., Багинская Н.В., Мордвинов В.А. 13th European Multicolloquium of Parasitology (EMOP2021)
«Comparative analysis of host and parasite microbial communities in experimental models of three liver fluke infections» Пахарукова М.Ю, Запарина О., Лишай Е.А., Мордвинов В.А. 13th European Multicolloquium of Parasitology (EMOP2021)
Diversity and evolution of structural variants of tat ltr-retrotransposons in green plants. M. Biryukov., K. Ustyantsev EMBO Workshop The Mobile Genome: Genetic and Physiological Impacts of Transposable Elements
Insights into the genetic components of chronic back pain Elizaveta E. Elgaeva, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Pradeep Suri, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov 10th Moscow Conference on Computational Molecular Biology МССМВ21
Shared heredity: a method to model genetic basis of correlated traits Gulnara R. Svishcheva, Evgeny S. Tiys, Sofia G. Feoktistova, Elizaveta E. Elgaeva, Sodbo Z. Sharapov, Yakov A. Tsepilov MCCMB 2021
Mitochondrial antioxidant SkQ1 (Co Q10 derived) prevents the development of bile duct neoplasia in experimental opisthorchiasis Oxana G. Zaparina
Anna V. Kovner
Viatcheslav A. Mordvinov
Maria Y. Pakharukova 29th Annual Meeting of the German Society for Parasitology 2021, March, Bonn, Germany
Аnalysis of host and parasite microbial communities in experimental models of three liver fluke infections Maria Pakharukova, Oxana Zaparina, Viatcheslav A. Mordvinov 29th Annual Meeting of the German Society for Parasitology
Функциональный анализ однонуклеотидных замен rs2072580 и rs590352,
связанных с предрасположенностью к развитию онкологических заболеваний Дегтярева А.О., Леберфарб Е.Ю., Брусенцов И.И., Антонцева Е.В., Меркулова Т.И. NGS в медицинской генетике. Пятая международная научно-практическая конференция.
Altered postnatal development as premise of neurodegeneration and Alzheimer’s disease: experimental study Ekaterina Rudnitskaya, Tatiana Kozlova, Alena Burnyasheva, Natalia Stefanova, Nataliya Kolosova 3rd International Conference on Neurovascular and Neurodegenerative Disorders
Задержка созревания мозга в раннем онтогенезе как возможная предпосылка развития болезни Альцгеймера Рудницкая Е.А., Козлова Т.А., Бурняшева А.О., Стефанова Н.А., Пеунов Д.А. , Колосова Н.Г. XVIII Всероссийская молодежная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии
Identification of genes involved in the process of stem cell differentiation into muscle cells in the free-living flatworm Macrostomum lignano M.Yu. Biryukov, A.M. Dmitrieva, E.L. Bazarova, K.V. Ustyantsev, E.V. Berezikov. OpenBio2021
Evaluation of causal relationships between varicose veins of lower extremities and knee osteoarthritis using large - scale genetic data Alexandra S. Shadrina, Elizaveta E. Elgaeva, Maxim B. Freidin, Yakov A. Tsepilov European Human Genetics Virtual Conference 2021
Analysis of the genetic components behind the chronic back pain Elizaveta E. Elgaeva, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Pradeep Suri, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov ASHG Virtual Meeting 2021
Meta-analysis of genome-wide association studies for N-glycosylation in 10,000 individuals. Sodbo Sharapov, Yakov Tsepilov, Elizaveta Elgaeva, Evgeny Tiys, Arina Nostaeva, Frano Vuckovic, Irena Trbojević-Akmačić, Michel Georges, Karsten Suhre, Nishi Chaturvedi, Harry Campbell, Malcolm Dunlop, Frances Williams, Matthias B. Schulze, Tim Spector, Gordan Lauc, Yurii S. Aulchenko. European Human Genetics Conference 2021 (ESHG 2021)
Mapping genes involved in control of N-glycosylation of blood glycoproteins through a large genome-wide association study. Sharapov S., Tsepilov Y., Elgaeva E., Tiys E., Nostaeva A., Vuckovic F., Trbojević-Akmačič I., Georges M., Suhre K., Chaturvedi N., Campbell H., Dunlop M., Williams F., Schulze M., Spector T., Lauc G., Aulchenko Y. МССМВ'21. 10th Moscow Conference on Computational Molecular Biology
2020
Антиоксиданты разного механизма действия снижают неоплазию эпителия желчных протоков при экспериментальном описторхозе Запарина О.Г., Ковнер А.В. VII МОЛОДЁЖНАЯ ШКОЛА-КОНФЕРЕНЦИЯ по молекулярной и клеточной биологии
Application of ITS1 and ITS2 for population genetic studies of sturgeons (Acipenseridae) Davletshina G., Kliver S., Prokopov D., Interesova E., Trifonov V. BGRS-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Loci and genes involved in chronic musculoskeletal pain identified via analysis of genetically independent pain phenotypes Y Tsepilov, M Freidin, A Shadrina, E Elgaeva, S Sharapov, J van Zunder, L Karssen, P Suri, F Williams, Y Aulchenko BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Association between total plasma N-glycan levels and chronic back pain: a prospective study Elizaveta E. Elgaeva, Yakov A. Tsepilov, Irena Trbojevic Akmacic, Andrea Skelin, Concetta Dagostino, Massimo Allegri, Jan Van Zundert, Dragan Primorac, Gordan Lauc, Frances M. K. Williams, Maxim B. Freidin BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Loci and Genes Involved in Chronic Musculoskeletal Pain Identified via Analysis of Genetically Orthogonal Pain Phenotypes Y Tsepilov, M Freidin, A Shadrina, E Elgaeva, S Sharapov, J van Zunder, L Karssen, P Suri, F Williams, Y Aulchenko European Mathematical Genetics Meeting
LTR retrotransposons in green plants show multiple examples of convergent evolution Biryukov M., Ustyantsev K. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2020)
Delay of early postnatal development as a risk factor
for accelerated aging and Alzheimer’s disease Rudnitskaya E.A., Kozlova T.A., Burnyasheva A.O., Stefanova N.A., Kolosova N.G. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Spatial learning as activator of hippocampal neurogenesis during
aging and development of Alzheimer's disease-like pathology Burnyasheva A.O., Kozlova T.A., Rudnitskaya E.A., Stefanova N.A. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Changes in Expression of Genes Associated with Neurogenesis during Development
of Alzheimer’s Disease Signs in OXYS Rats Burnyasheva A.O., Rudnitskaya E.A., Stefanova N.A., Kolosova N.G SBB-2020
A study of genes controlling carcinogenesis in a regenerative model flatworm Macrostomum lignano Ustyantsev K., Vavilova V., Biryukov M., Berezikov E. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology“
MLIG-SKP1 IS REQUIRED FOR CORRECT SPERM DEVELOPMENT IN THE REGENERATIVE FREE-LIVING FLATWORM MACROSTOMUM LIGNANO V. Vavilova, E. Bazarova, M. Biryukov, K. Ustyantsev, E. Berezikov OpenBIO2020
DEVELOPING AN EXPERIMENTAL PLATFORM TO STUDY
MECHANISMS OF STEM CELL DIFFERENTIATION USING
A MODEL REGENERATIVE FLATWORM MACROSTOMUM LIGNANO K. V. Ustyantsev, V. Yu. Vavilova, M. Yu. Biryukov,
F. Reinoite, J. Wudarski, S. Mouton, E. V. Berezikov OpenBIO2020
A new method for combining of genetically correlated traits by maximizing of their shared heritability Svishcheva G, Tiys E, Feoktisova S, Elgaeva E,
Sharapov S, Tsepilov Y 48th European Mathematical Genetics Meeting (EMGM)
Results of genome-wide association study of plasma proteome
N-glycosylation in 10,000 samples Sodbo Sharapov, Yurii Aulchenko, Tim Spector, Sofya Feoktistova, Yakov A. Tsepilov, Elizaveta E. Elgaeva, Lucija Klaric, Eugene Tiys, Frano Vuckovic, Harry Campbell, Karsten Suhre, Matthias Schulze, Malcolm Dunlop, Frances Williams, Gordan Lauc BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
Functional study of potential regulatory SNPs (rs590352, rs11542583, rs3829202, rs78317230, rs2072580, rs4796672) Arina Degtyareva, Elena Leberfarb, Ilya Brusentsov, Tatiana Kuzina, Tatiana Merkulova 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020
Diversity and evolution of Tat LTR retrotransposon structures in non-flowering plants Mikhail Biryukov, Kirill Ustyantsev Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020)
Accumulation of oxidative hepatobiliary lesions during experimental opisthorchiasis Zaparina O.G., Kovner A.V., Pakharukova M.Y., Mordvinov V.A. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/ System Biology (BGRS/SB-2020)
OPISTHORCHIS FELINEUS EXTRACELLULAR VESICLES INCREASE CELL PROLIFERATION AND MIGRATION RATES OF HUMAN H69 CHOLANGIOCYTES PONOMAREV D.V., ZAPARINA O., PAKHARUKOVA M.Y., MORDVINOV V.A. BGRS/SB-2020. THE 12TH INTERNATIONAL MULTICONFERENCE
Внеклеточные везикулы возбудителя
описторхоза трематоды Opisthorchis
felineus увеличивают скорость
миграции и пролиферации
холангиоцитов человека H69 Д.В. Пономарев, Е.С. Савина, О.Г. Запарина VII МОЛОДЁЖНАЯ ШКОЛА-КОНФЕРЕНЦИЯ по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН
2019
ПОЛИМОРФИЗМ rs590352 (C>G) ГЕНА ATXN7L3B И РИСК РАЗВИТИЯ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА Дегтярева А.О., Леберфарб Е.Ю., Брызгалов Л.О., Брусенцов И.И., Воевода М. И., Аутеншлюс А. И., Максимов В. Н., Морозов Д. В., Соколов А.В., Меркулова Т.И. ВОГИС
Итоги многолетних исследований наследственной глухоты у коренного населения Сибири: от эпидемиологии до молекулярной генетики, клеточной биологии и компьютерного моделирования. Посух О.Л.,Барашков Н.А., Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Данильченко В.Ю., Маслова Е.А., Пшенникова В.Г., Романов Г.П., Соловьёв А.В., Кларов Л.А., Федорова С.А., Терютин Ф.М., Лашин С.А., Орищенко К.Е., Морозов И.В., Бондарь А.А. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Существенный вклад мутаций гена SLC26A4 в этиологию наследуемой потери слуха у коренного населения Республики Тыва. Данильченко В.Ю., Зыцарь М.В., Маслова Е.А., Бады-Хоо М.С., Морозов И.В., Бондарь А.А., Посух О.Л. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Распространённость мутации c.35delG (ген GJB2), ассоциированной с потерей слуха, у населения России и реконструкция предковых гаплотипов, включающих c.35delG, в регионах Сибири. Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Данильченко В.Ю., Бондарь А.А., Морозов И.В., Барашков Н.А., Соловьёв А.В., Максимов В.Н., Посух О.Л. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Experimental model of Opisthorchis felineus liver fluke infection: mechanistic insights into biliary neoplasia formation Maria Pakharukova, Oxana Zaparina, Nina V. Baginskaya, Viatcheslav A. Mordvinov the Asian Neglected Tropical Disease Conference - NTDASIA2019
Функциональная аннотация регуляторных полиморфизмов, связанных с развитием онкологических заболеваний. Леберфарб Е.Ю., Дегтярева А.О., Брусенцов И.И., Ефимова Е.Г., Меркулова Т.И. VI Съезд биофизиков России
Окислительные повреждения в печени при экспериментальном описторхозе накапливаются в зависимости от времени течения инфекции Запарина О.Г., Ковнер А.В., Мордвинов В.А., Пахарукова М.Ю. Паразитологические исследования в Сибири и на Дальнем Востоке
Accumulation of oxidative damage markers due to opistorchiasis in an experimental model Zaparina O.G. Международная научная конференция студентов и молодых ученых «Farabi alemi»
Genome-wide association study of genetic principal components of four chronic musculoskeletal human pain types Yakov A. Tsepilov, Maxim B. Freidin, Sodbo Zh. Sharapov, Aleksandra S. Shadrina, Elizaveta E. Elgaeva, Melody Palmer, Lennart C. Karssen, Pradeep Suri, Frances M. K. Williams 9th Moscow Conference on Computational Molecular Biology МССМВ'19 2019, Москва
Исследование главных генетических компонент четырех хронических скелетно-мышечных болей человека Е. Е. Елгаева Международная научная студенческая конференция (МНСК-2019)
Исследование мультифакторных заболеваний на примере предрасположенности к алкоголизму: молекулярная генетика и биофизика Осипова Л.П., Хантемирова М.Р., Галиева Э.Р., Личман Д.В., Бабенко Р.О., Ковалев С.С., Табиханова Л.Э., Орлов Ю.Л. VI Съезд биофизиков России
Цифровая медицина как современное направление фундаментальных онкологических исследований в России Ковалев С.С., Белоусова Ю.П., Хантемирова М.Р., Орлов Ю.Л. IV Межрегиональный фестиваль «Молодой профессионал Сибири» 17-18 сентября. 2019. г.Кызыл.
Вычислительные методы для транскриптомного профилирования и анализа данных высокопроизводительного секвенирования Ковалев С.С., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Белоусова Ю.П., Хантемирова М.Р., Орлов Ю.Л. Национальный Суперкомпьютерный Форум (НСКФ-2019), г. Переславль-Залесский, ИПС имени А.К. Айламазяна РАН, 26 – 29 ноября 2019 г.
Molecular phylogeny of the Pamphagidae family (Orthoptera, Caelifera) Vavilova V., Sukhikh I., Blinov A, Bugrov A. 13th International Congress of Orthopterology
Pollen parent transfer mitochondria to offspring M Biryukov, AG Blinov, VA Sokolov Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology (PlantGen2019)
Establishing the molecular phylogeny of Acrididae grasshoppers (Orthoptera, Caelifera) Sukhikh I., Ustyantsev K., Bugrov A., Sergeev M., Vavilova V., Blinov A 13th International Congress of Orthopterology
Revision of phylogenic relationships between several Acrididae subfamilies Sukhikh I., Ustyantsev K., Bugrov A., Sergeev M., Vavilova V., Blinov A. Systems Biology and Bioinformatics, The Eleventh International young Scientists School (SBB-2019)
2018
Early and late transcriptional responses to the low concentration of salicylic acid
in Arabidopsis thaliana L. root E. Elgaeva, E. Zemlyanskaya, D. Novikova, V. Mironova Systems Biology And Bioinformatics (SBB-2018) | The Tenth International Young Scientists School
Ранний и поздний транскрипционный ответ на низкие концентрации салициловой кислоты в корне Arabidopsis thaliana L. Е. Е. Елгаева Международная научная студенческая конференция
2016
Genetic and molecular mechanisms crucial for hypertension development in the ISIAH rats. O.E. Redina, L.O. Klimov, M.A. Ryazanova, L.A. Fedoseeva, T.O. Abramova, Yu.V. Alexandrovich, S.E. Smolenskaya, Ye.V. Antonov, N.I. Ershov, V.M. Efimov, A.L. Markel. Десятая Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology), BGRS\SB-2016.
Виталитетная структура популяций растений в лесных фитоценозах Елгаева Е. Е. Международная научная студенческая конференция
2015
How symplastic mode of growth effects on cell mechanics in unidirectional growing plant tissue Zubairova U.S., Golushko S.K., Penenko A.V., Nikolaev S.V The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”
Исследование чувствительности и параметрическая идентификация модели симпластного роста линейного листа Пененко А.В., Зубаирова У.С., Николаев С.В. Седьмая международная молодежная научная школа-конференция «Теория и численные методы решения обратных и некорректных задач», посвященная 90-летию со дня рождения академика Гурия Ивановича Марчука
2012
Реконструкция процессов антропогенеза: анализ геномов представителей древнего и современного населения Сибири Колчанов Н.А., Мордвинов В.А., Афонников Д.А., Гунбин К.В., Пилипенко А.С., Молодин В.И., Деревянко А.П. Мега-структура евразийского мира: основные этапы сложения
Микробиота древних захоронений Алтая Андреева И.С., Пилипенко А.С., Пучкова Л. И., Емельянова Е.К., Молодин В.И. Всероссийская научная конференция «Сибирь в исторической перспективе и проблемы сохранения народов и культур»
Activation of CLV3 gene expression in model of the stem cell niche structure regulation in the shoot apical meristem Zubairova U.S., Nikolaev S.V. The eighth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure \ System biology (BGRS\SB'2012)
2011
Компьютерный анализ дифференциально экспрессирующихся генов у крыс гипертензивной линии НИСАГ. Александрович Ю.В., Орлов А.В., Пыльник Т.О., Смоленская С.Э., Редина О.Е. , Орлов Ю.Л. , Маркель А.Л. II Международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика», Новосибирск, 2011
The Cell Growth and Division Can Destroy Stem Cell Niche in a Reaction-Diffusion Model Ulyana Zubairova European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2011)
Миграция андроновского населения в Западную Сибирь: археологический, антропологический и палеогенетический аспекты Молодин В. И., Чикишева Т.А., Поздняков Д.В. Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Труды III (XIX) Всероссийского археологического съезда. 2011, Т. I. С. 249-250.
Исследование генофонда мтДНК населения Барабинской лесостепи эпохи неолита и раннего металла (VI – IV тысячелетие до н.э.) Трапезов Ростислав Олегович XVIII Международная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов»
К вопросу о связях населения территории современного Казахстана и Барабинской лесостепи в эпоху бронзы (по материалам археологии, антропологии и палеогенетики) Молодин В.И., Пилипенко А.С., Чикишева Т.А., Журавлев А.А., Поздняков Д.В., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Маргулановские чтения
Применение методов палеогенетики для этногенетических реконструкций Пилипенко А.С., Молодин В.И., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика»
SNP polymorphism of cold and mentol receptor 1 (CMR1, TRPM8) in native and caucasian populations of North Asia Voevoda M., Potapova T., Babenko V., Pilipenko I., Yudin N., Kulikov I., Romaschenko A. Human Genome Meeting
МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ОБРАЗЦОВ, ВЗЯТЫХ ПРИ РАСКОПКАХ МЕРЗЛОТНЫХ КУРГАНОВ ПАЗЫРЫКСКОЙ КУЛЬТУРЫ ОЛОН-КУРИН-ГОЛ. Андреева И.С., Пилипенко А.С., Пучкова Л. И., Емельянова Е.К., Саранина И.В., Репин В. Е., Молодин В.И. «Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний»
2010
A Model of Shoot Apocal Meristem Compartmentalization Based on CLV/WUS Interplay Nikolaev SV, Zubairova US, Mjolsness ED, Shapiro BE, Smal PA, Kolchanov NA 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
The cell growth and division can destroy stem cell niche in a reaction-diffusion model S. Nikolaev, U. Zubairova, S. Fadeev, E. Mjolsness, N. Kolchanov 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
Модель типа реакция-диффузия механизма регуляции пространственной структуры апикальной меристемы побега Николаев С. В. , Зубаирова У.С., Мьолснесс Э., Смаль П.А., Шапиро Б., Колчанов Н.А. III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино
Нестабильность структуры клеточного ансамбля в модифицированной модели трехцветного флага в результате роста и деления клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мьолснесс Э., Колчанов Н.А. III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино
Migrations in the south of West Siberian plain during the Bronze Age (IV-II millenium BC): archaeological, paleogenetic and anthropological data Molodin V.I., Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Jhuravlev A.A., Trapezov R.O., Chikisheva T.A., Pozdnyakov D.V. International conference "Migrations in Prehistory and Early History. Stable Isotopes and population genetics – New Answers to Old Questions?", Berlin, Germany, March 24-26
A reaction-diffusion model of shoot apical meristem compartmentalization based on CLV/WUS interplay Nikolaev S.V., Zubairova U.S., Mjolsness E., Smal P.A., Shapiro B., Kolchanov N.A. Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia
Modified French Flag model: instability of the structure under cell growth and division Zubairova U.S., Nikolaev S.V., Fadeev S.I., Mjolsness E., Kolchanov N.A. Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia
Палеогенетическое исследование населения усть-тартасской культуры Барабы эпохи энеолита (конец V – начало IV тысячелетия до н.э.) Трапезов Р.О., Пилипенко А.С. XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.
Возмущения за счет деления клеток в пространственно‐распределенной модели регуляции структуры ниши стволовых клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мелснесс Э., Колчанов Н.А. Международная конференция "Стохастические модели в биологии и предельные алгебры", 2—7 августа 2010 Омск Россия
Миграция носителей андроновской культуры в лесостепную зону Западной Сибири по данным анализа мтДНК (вторая половина II тысячелетия до н.э.) Журавлев А.А., Пилипенко А.С., Трапезов Р.О. Международный молодежный научный форум "ЛОМОНОСОВ-2010". Секция "Биология", Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, апрель
Моделирование динамических систем с динамической структурой на примере камбиальных клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В. Сборник трудов VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых учёных "Молодёжь и современные информационные технологии", 3-5 марта 2010 года
2009
Оценка влияния миграционных процессов на генофонд мтДНК населения Западной Сибири 4-1 тыс. до н.э. Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Журавлев А.А., Куликов И.В., Кобзев В.Ф. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
Особенности структуры генофонда мтДНК населения позднекротовской культуры Барабы (вторая половина 2 тыс. до н.э.) Журавлев А.А., Пилипенко А.С. XLVII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-47) г.Новосибирск, 11 – 15 апреля 2009 г.
Археология и палеогенетика. Некоторый опыт и перспективы мультидисциплинарных исследований Молодин В.И., Ромащенко А.Г., Пилипенко А.С. Всероссийская (с международным участием) конференция "Роль естественно-научных методов в археологических исследованиях", Барнаул, 23-27 августа
Эндонуклеазы рестрикции, выделенные из психрофильных и термофильных микроорганизмов экстремальных зон Пучкова Л.И., Андреева И.С., Емельянова Е.К., Морозова О.В., Саранина И.В., Пилипенко А.С., Молодин В.И., Репин В.Е. Всероссийская конференция "Биоразнообразие: результаты и перспективы исследований"
2008
Психрофильный штамм асinetobacter SP. ОК-103P – продуцент эндонуклеазы рестрикции, узнающей нуклеотидную последовательность 5’- GGATCC-3’ АНДРЕЕВА И.С., ПУЧКОВА Л. И., ПЕЧУРКИНА Н. И., ПИЛИПЕНКО А.С., РЕПИН В.Е., МОЛОДИН В.И. 5-й съезд Общества биотехнологов России имени Ю.А. Овчинникова состоится 2–4 декабря 2008, г. Москва
Процессы формирования населения лесостепной полосы Западной Сибири эпохи бронзы по данным полиморфизма мтДНК Пилипенко А.С. Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике "Геномика и эволюция". 1-5 декабря 2008, г. Звенигород.
Ассоциативный анализ полиморфизмов генов TP53 и C-FMS с развитием рака молочной железы у русских женщин И.В. Пилипенко Сборник материалов III региональной конференции молодых ученых им. академика РАМН Н.В. Васильева. 29 апреля 2008 г., Томск
Формирование этнокультурных сообществ в западносибирской лесостепи на основе данных палеогенетики (первые результаты) А.С. Пилипенко, А.Г. Ромащенко, В.И. Молодин, А.А. Журавлев, А.Е. Гришин, Д.В. Поздняков, И.В. Куликов, Т.А. Чикишева, В.Ф. Кобзев Труды II (XVIII) Всероссийского археологического съезда в Суздале. Т. III, 2008, Москва, Институт археологии РАН
2007
Similarity of mitochondrial DNA patterns in ancient and modern indigenous West Siberian populations Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Kulikov I.V., Kobzev V.F., Grishin A.E., Pozdnyakov D.V., Molodin V.I. II International Conference "Biosphere Origin and Evolution" October 28 - November 2, 2007, Loutraki, Greece
Применение формализма dL-систем для изучения модели регуляции размеров возобновительной зоны в растущей ткани Зубаирова У.С., Николаев С.В. VIII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, Новосибирск, 27-29 ноября 2007
Изучение влияния однонуклеотидного полиморфизма G215C гена р53 на формирование предрасположенности к развитию рака молочной железы у русских женщин Пилипенко И.В., Голубева Д.В., Кобзев В.Ф., Чердынцева Н.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова, Алушта, Украина, 24-28 сентября
2006
Анализ возможной связи полиморфизмов G215C и IVS 3 (ins) гена р53 с развитием рака легкого у человека Мягкова И.В. (Пилипенко И.В.), Голубева Д.В., Морозова О.А., Кобзев В.Ф., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. 10-я Пущинская школа-конференция молодых ученых, Россия, Пущино (Московская область)
Этнические особенности патологии человека в Сибири. Генетические основы предрасположенности к распространенным заболеваниям М.И. Воевода, А.Г. Ромащенко, В.Н. Максимов, Е.В. Шахтшнейдер, Н.С. Юдин, А.В. Бархаш, В.Ф. Кобзев, И.В. Куликов, С.В. Михайлова, Т.М. Мишакова, Т.В. Найкова, И.В. Мягкова (Пилипенко И.В.), Т.А. Потапова, Ю.П. Никитин 13-го Международный конгресс по приполярной медицине. 12-16 июня 2006 г., г. Новосибирск
Анализ гаплотипического разнообразия митохондриальной ДНК представителей кротовской культуры (середина II тысячелетия до н.э.) из могильников Барабинской лесостепи Пилипенко А.С. XLIV Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс"
Палеогенетические исследования останков носителей Пазырыкской культуры IV-II вв до н.э. Куликов И.В., Нефедова М.В., Шульгина Е.О., Губина М.А., Пилипенко А.С., Дамба Л.Д., Кобзев В.Ф., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Всероссийский археологический съезд "Современные проблемы Археологии России", 23 – 28 октября 2006 г, Новосибирск
Выявление генетических маркеров предрасположенности к распространенным онкологическим заболеваниям Пилипенко И.В. Научно-практическая конференция "Перспективы использования молекулярно-генетических исследований в практическом здравоохранении". 25 мая 2006 г., г. Новосибирск
Особенности гаплотипического разнообразия мтДНК представителей Кротовской культуры Барабы Пилипенко А.С., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Гришин А.Е., Поздняков Д.В., Молодин В.И. Современные проблемы археологии России, Новосибирск, Ин-т археологии и этнографии СО РАН
Гранты
2023
Широкомасштабный поиск SNPs, способных оказывать влияние на процесс РНК-интерференции, на основе анализа аллель-ассиметричных событий в данных RNA-seq РНФ, номер гранта 22-25-00255
Разработка статистических методов оценки наследуемости, объясняемой редкими генетическими вариантами, и использование этих методов для анализа социально-значимых патологий Российский Научный Фонд, номер гранта 23-25-00209
2022
Экзосомы описторхид: состав, биологическая активность, структура и свойства РНФ, номер гранта 22-24-20010
Генетический контроль дегенерации поясничных межпозвонковых дисков Российский Научный Фонд, Администрация Новосибирской области, номер гранта 22-15-20037
2021
Анализ вклада нарушений глютаматэргической и ГАМКэргической систем в развитие ранних нейродегенеративных изменений в мозге и сетчатке крыс OXYS РНФ, номер гранта 21-75-00029
Комплексное исследование динамики маркеров почечной и сердечной недостаточности при экспериментальном описторхозе Российский фонд фундаметальных исследований, номер гранта 20-415-543016
Выявление ростовых факторов и иммуномодуляторов трематод, способствующих ранозаживлению у млекопитающих РФФИ, номер гранта 20-44-540011
2020
Происхождение и эволюция структурных вариантов Тat LTR-ретротранспозонов зелёных растений РФФИ, номер гранта РФФИ 20-34-90114 Аспиранты
Разработка теоретических и прикладных основ использования больших данных для картирования генов РФФИ, номер гранта 20-04-00464 А
Разработка теоретических и прикладных основ использования больших данных для картирования генов РФФИ, номер гранта 20-04-00464 А
Сходство и различия трех видов эпидемиологически
значимых трематод семейства Opisthorchiidae (Opisthorchis felineus, O. viverrini, Clonorchis sinensis): поиск механизмов патогенности РФФИ, номер гранта 20-04- 00370А
2019
Эксперимент по доместикации лисиц и эволюция собак: взгляд с позиций современных молекулярно-генетических и археологических данных РФФИ, номер гранта 19-14-50414
Поддержка и развитие центра коллективного пользования научным оборудованием Центр генетических ресурсов лабораторных животных путем инструментального развития исследований для обеспечения реализации приоритетов научно-технологического развития Минобрнауки России, номер гранта 05.621.21.0023
Изучение генетической программы формирования репродуктивной системы плоских червей с помощью транспозонного мутагенеза РНФ, номер гранта 19-74-00029
Комплексный подход к анализу генетической архитектуры дорсалгии РФФИ
2016
Реконструкция некоторых фенотипических черт представителей древнего населения Западной Сибири методами палеогенетики РФФИ, номер гранта 16-06-00495 А
2013
Экспрессия генов, принимающих участие в регуляции водно-солевого гомеостаза и артериального давления у гипертензивных крыс НИСАГ. РФФИ, номер гранта 13-04-01492-А
2012
Генофонд митохондриальной ДНК средневекового населения юга Западной Сибири (тюркское и монгольское время, вторая половина I - первая половина II тысячелетия н.э.) РФФИ, номер гранта РФФИ 12-04-31818
Междисциплинарный интеграционный проект СО РАН № 32 "Этногенез населения юга Западной Сибири в эпоху голоцена (по данным археологии, антропологии и палеогенетики)", 2012-2014 гг. СО РАН, номер гранта № 32
2011
Компьютерный анализ и моделирование процессов развития апикальной меристемы побега РФФИ, номер гранта 11-04-01748
Участие в 8-й европейской конференции по математической и теоретической биологии (ECMTB 2011) РФФИ, номер гранта 11-04-09431-моб_з
Формирование билатеральной симметрии в зародышах двудольных растений РФФИ, номер гранта 11-04-91397-НИСИ_а
Реконструкция процессов антропогенеза: анализ митохондриальных геномов представителей древнего и современного населения Сибири РФФИ, номер гранта 11-06-12006
2010
Волосы из древних погребений, как объект междисциплинарного исследования (изучение останков носителей культуры хунну) РФФИ, номер гранта 10-06-00406-а
Элементы социальной структуры пазырыкского общества и их проявления в особенностях погребальной обрядности (по данным археологии, антропологии, палеогенетики и дендрохронологии) РГНФ, номер гранта 10-01-00193а
2009
Интеграционный проект СО РАН № 115 "Антропогенетические, экологические и социально-культурные составляющие этногенеза древнего населения Западной Сибири (V-I тыс. до н.э.) Сибирское Отделение Российской Академии Наук, номер гранта 115
Этногенез и этническая история в эпоху развитой бронзы на юге Западносибирской равнины (по данным археологии, палеогенетики, антропологии) РФФИ, номер гранта 09-06-00357-а
2008
Компьютерное моделирование и анализ механизма гомеостаза структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме Arabidopsis thaliana РФФИ, номер гранта 08-04-01214-а
Молекулярно-генетические механизмы комплексных поведенческих, морфологических и физиологических признаков: экспериментальное исследование на селекционных моделях животных. Программа Президиума РАН
Научное руководство
2025
Оценка потерянной наследуемости хронической боли в спине, объясняемой редкими вариантами Бердникова Анна Александровна 01.04.02 Прикладная математика и информатика, 2025-06-30
2023
Разработка метода оценки неаддитивной наследуемости признаков на основе анализа суммарных статистик полногеномных анализов ассоциаций Пак Баяр 02.04.01 Математика и компьютерные науки, 2023-06-19
Поиск оптимальной референсной панели для импутации данных генотипирования выборки россиян Бердникова Анна Александровна 2023-06-09
2022
Оценка потенциала перепрофилирования лекарственных средств для лечения хронической боли в спине при помощи Менделевской Рандомизации Верзун Дмитрий Андреевич 2022-06-08
Реализация алгоритма клампинга однонуклеотидных полиморфизмов с учётом неравновесия по сцеплению на платформе GWAS-MAP Трушин Александр Алексеевич 2022-06-06
2011
Особенности структуры генофонда митохондриальной ДНК населения позднекротовской культуры Барабы (вторая половина II тыс. до н.э.) Журавлев Антон Александрович генетика и цитология, 2011-11-29
2010
Палеогенетическое исследование представителей усть-тартасской культуры Барабы эпохи энеолита (конец V - начало IV тыс. до н.э.) Трапезов Ростислав Олегович генетика и цитология, 2010-05-29
Учебные курсы
2024
Биометрия Новосибирский государственный университет, семестров: 1
Теория селекции Новосибирский государственный университет, семестров: 1
2023
Биометрия НГУ, кафедра цитологии и генетики, бакалавры 3 курс, весенний семестр, семестров: 1
2022
Биометрия Цепилов Я.А., Елгаева Е.Е., Шарапов С.Ж. НГУ, кафедра цитологии и генетики, бакалавры 3 курс, весенний семестр, семестров: 1
Количественная генетика Сириус, курс для магистрантов, семестров: 1
2021
Компьютерная статистическая геномика Мульти-школа Молодых Ученых, объединяющая 13-ую Школу «Системная биология и Биоинформатика» SBB-2021 («Systems biology and Bioinformatics») и Школу молодых ученых «Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений» PlantGen School 2021 («Plant genetics, genomics, bioinformatics and biotechnology»), семестров: 1
2017
Эволюция жизни на Земле Гражданкин Д.В., Пилипенко А.С., Шеховцов С.В. НГУ, ФЕН, кафедра генетики, семестров: 1
2015
Генетика Хлесткина Е.К., Кочетов А.В., Баттулин Н.Р., Пилипенко А.С., Шеховцов С.В. для аспирантов 2-го курса Научно-образоватлеьного отдела ИЦиГ СО РАН, семестров: 2