Хабарова Анна Александровна, к. б. н. Подразделение: 033. Сек. геномных механизмов онтогенеза Заведующий: 240. Лаб.генетики нейродегенератив.заболеваний Совместительство: 216. Лаб.стабильности генома. Должность: старший научный сотрудник Комната: 1110 Email: khabarova@bionet.nsc.ru Рабочий: +7 (383) 363-49-63*1110

Публикации

2024	Design of iPSC-based cell model to study the functions of the UBE2A gene Alexandra Bogomazova, Alisa V Fedorenko, Ekaterina A Khomyakova, Anastasia V Surdina, Elizaveta K Sekretova, Tatiana V Limanskaya, Lilia D Belikova, Egor A Volovikov, Maria M Gridina, Anna A Khabarova, Anna A Kashevarova, Dmitry A Fedotov, Elena A Zerkalenkova, Maria A Lagarkova, Igor N Lebedev [Гены и клетки]
	TAD border deletion at the Kit locus causes tissue-specific ectopic activation of a neighboring gene. Kabirova E, Ryzhkova A, Lukyanchikova V, Khabarova A, Korablev A, Shnaider T, Nuriddinov M, Belokopytova P, Smirnov A, Khotskin NV, Kontsevaya G, Serova I, Battulin N. [NAT COMMUN]
2023	A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells Anna Khabarova, Galina Koksharova, Pavel Salnikov, Polina Belokopytova, Roman Mungalov, Inna Pristyazhnuk, Artem Nurislamov, Maria Gridina, Veniamin Fishman [CHROMOSOME RES]
	Ultrastructural Abnormalities in Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Neural Stem Cells and Neurons of Two Cohen Syndrome Patients Shnaider TA, Khabarova AA, Morozova KN, Yunusova AM, Yakovleva SA, Chvileva AS, Wolf ER, Kiseleva EV, Grigor’eva EV, Voinova VY, Lagarkova MA, Pomerantseva EA, Musatova EV, Smirnov AV, Smirnova AV, Stoklitskaya DS, Arefieva TI, Larina DA, Nikitina TV, Pristyazhnyuk IE [Cells]
	Изучение синдрома Коэна на основе пациент-специфичных ИПСК с мутацией в гене СОН1. Т.А. Шнайдер, К.Н. Морозова, А.А. Хабарова, С. Чечеткина, A. Чвилева, A. Юнусова, Е. Вольф, Е.В. Киселева, И.Е. Пристяжнюк. [Гены и клетки]
2022	Generation of two iPSC lines from healthy donor with a heterozygous mutation in the VPS13B gene S.A.Chechetkina, A.A.Khabarova, A.S.Chvileva, O.M.Kurchenko, A.V.Smirnov, A.M.Yunusova, I.N.Kotov, E.V.Musatova, E.A.Pomerantseva, E.A.Volovikov, M.A.Lagarkova, T.A.Shnaider, I.E.Pristyazhnyuk [STEM CELL RES]
	The human EF1a promoter does not provide expression of the transgene in mice Nariman Battulin, Alexey Korablev, Anastasia Ryzhkova, Alexander Smirnov, Evelyn Kabirova, Anna Khabarova, Timofey Lagunov, Irina Serova, Oleg Serov [TRANSGENIC RES]
	НAR: ИСТОРИЯ, ФУНКЦИИ, РОЛЬ В ЭВОЛЮЦИИ И ПАТОГЕНЕЗЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ ЧЕЛОВЕКА А. С. Рыжкова, А. А. Хабарова, А. С. Чвилёва, Т. А. Шнайдер [Цитология]
2021	Complex biology of constitutional ring chromosomes structure and (in)stability revealed by somatic cell reprogramming T V Nikitina, A A Kashevarova, M M Gridina, M E Lopatkina, A A Khabarova, Yu S Yakovleva, A G Menzorov, Yu A Minina, I E Pristyazhnyuk, S A Vasilyev, D A Fedotov, O L Serov, I N Lebedev [SCI REP-UK]
	Erythrocytes 3D genome organization in vertebrates Anastasia Ryzhkova, Alena Taskina, Anna Khabarova, Veniamin Fishman, Nariman Battulin [SCI REP-UK]
	Here and there: the double-side transgene localization P A Salnikov, A A Khabarova, G S Koksharova, R V Mungalov, P S Belokopytova, I E Pristyazhnuk, A R Nurislamov, P Somatich, M M Gridina, V S Fishman [Vavilov journal of genetics and breeding]
2020	Generation of iPSC line ICGi024-A from human skin fibroblasts of a patient with ring chromosome 18 AA Khabarova, IE Pristyazhnyuk, PA Orlova, TV Nikitina, AA Kashevarova, ME Lopatkina, EO Belyaeva, NN Sukhanova, LP Nazarenko, IN Lebedev, OL Serov [STEM CELL RES]
2019	Generation of four iPSC lines from two siblings with a microdeletion at the CNTN6 gene and intellectual disability T.A.Shnaider,I.E.Pristyazhnyuk, A.G.Menzorov, N.M.Matveeva, A.AKhabarova, N.A.Skryabin, A.A.Kashevarova, M.E.Lopatkina, L.P.Nazarenko, I.N.Lebedev, O.L.Serov [STEM CELL RES]
	Induced pluripotent stem cell line, ICAGi001-A, derived from human skin fibroblasts of a patient with 2p25.3 deletion and 2p25.3-p23.3 inverted duplication KhabarovaA.A, Pristyazhnyuk I.E., NikitinaT.V., GaynerT.A., TorkhovaN.B., SkryabinN.A., KashevarovaA.A., BabushkinaN.P., MarkovaZh.G., MinzhenkovaM.E., NazarenkoL.P., ShilovaN.V., ShorinaA.R., LebedevI.N., SerovO.L. [STEM CELL RES]
	ДифференциальнАя стабильность кольцевых хромосом в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках Татьяна Владимировна Никитина, Анна Александровна Кашеварова, Алексей Гавриилович Мензоров, Станислав Анатольевич Васильев, Мария Михайловна Гридина, Анна Александровна Хабарова, Юлия Сергеевна Яковлева, Мария Евгеньевна Лопаткина, Марина Алексеевна Распопова, Дмитрий Александрович Дериглазов, Олег Леонидович Серов, Игорь Николаевич Лебедев [Гены и клетки]
	Реорганизация хроматина в процессе эритроидной дифференцировки А. А. Хабарова, А. С. Рыжкова, Н. Р. Баттулин [Vavilov journal of genetics and breeding]
2018	Generation of two iPSC lines (IMGTi001-A and IMGTi001-B) from human skin fibroblasts with ring chromosome 22 Nikitina TV, Menzorov AG, Kashevarova AA, Gridina MM, Khabarova AA, Yakovleva YS, Lopatkina ME, Kizilova EA, Vasilyev SA, Serov OL, Lebedev IN. [STEM CELL RES]
	Induced pluripotent stem cell line, IMGTi003-A, derived from skin fibroblasts of an intellectually disabled patient with ring chromosome 13 Nikitina T.V., Menzorov A.G., Kashevarova A.A., Gridina M.M., Khabarova A.A., Yakovleva Yu.S., Lopatkina M.E., Pristyazhnyuk I.E., Vasilyev S.A., Serov O.L., Lebedev I.N. [STEM CELL RES]
2016	Erratum to: comparison of the three-dimensional organization of sperm and fibroblast genomes using the Hi-C approach Nariman Battulin, Veniamin S Fishman, Alexander M Mazur, Mikhail Pomaznoy, Anna A Khabarova, Dmitry A Afonnikov, Egor B Prokhortchouk, Oleg L Serov [GENOME BIOL]
2015	Comparison of American mink embryonic stem and induced pluripotent stem cell transcriptomes Aleksei G Menzorov, Natalia M Matveeva, Marios N Markakis, Venyamin S Fishman, Knud Christensen, Anna A Khabarova, Inna E Pristyazhnyuk, Elena A Kizilova, Susanna Cirera, Razvan Anistoroaei, Oleg L Serov [BMC GENOMICS]
	Comparison of the 3D organization of sperm and fibroblast genomes using the Hi-C approach Nariman Battulin, Veniamin S Fishman, Alexander M Mazur, Mikhail Pomaznoy, Anna A Khabarova, Dmitry A Afonnikov, Egor B Prokhortchouk, Oleg L Serov [GENOME BIOL]
2013	INVESTIGATION OF THE SPATIAL GENOME ORGANIZATION OF MOUSE SPERM AND FIBROBLASTS BY THE Hi-C METHOD N.R. Battulin, V.S. Fishman, A.A. Khabarova, M.Yu. Pomaznoy, T.A. Shnaider, D.A. Afonnikov, O.L. Serov [Vavilov journal of genetics and breeding]
2012	Reprogramming somatic cells by fusion with embryonic stem cells does not cause silencing of the Dlk1-Dio3 region in mice. Battulin NR, Khabarova AA, Boyarskikh UA, Menzorov AG, Filipenko ML, Serov OL [World Journal of Stem Cells]
2011	Reprogramming mediated by cell fusion technology Serov OL, Matveeva NM, Khabarova AA [INT REV CEL MOL BIO]
2010	Dominance of parental genomes in embryonic stem cell/fibroblast hybrid cells depends on the ploidy of the somatic partner Kruglova A.A., Matveeva N.M., Gridina M.M., Battulin N.R., Karpov A., Kiseleva E.V., Morozova K.N., Serov O.L. [CELL TISSUE RES]
2008	Embryonic stem cell/fibroblast hybrid cells with near-tetraploid karyotype provide high yield of chimeras. Kruglova AA, Kizilova EA, Zhelezova AI, Gridina MM, Golubitsa AN, Serov OL [CELL TISSUE RES]
2005	Видимая и «скрытая» сегрегация родительских хромосом в эмбриональных стволовых гибридных клетках Пристяжнюк И.Е., Темирова С.А., Мензоров А.Г., Круглова А.А., Матвеева Н.М., Серов О.Л. [RUSS J DEV BIOL+]

Конференции

2024	Cohesin degradation effect on mechanical properties of human colon tumor cells Kabirova E., Yunusova A., Khabarova A., Battulin N. [BGRS/SB-2024: 14th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
	Tissue-specific effect of the TADs border disruption on the Kdr gene expression E.Kabirova, A.Ryzhkova, V.Lukyanchikova, A.Khabarova, N.Battulin [Cold Spring Harbor Asia «Chromatin, Epigenetics & Transcription»]
2023	Complex of disturbances in the intracellular organization of neurons differentiated from fibroblasts of patients with Cohen's syndrome Морозова К.Н. Шнайдер Т.А., Хабарова А.А., Чечеткина С., Чвилева A., Юнусова A., Вольф Е., Киселева Е.В., Пристяжнюк И.Е. [Chromosome-2023]
	АРХИТЕКТУРНЫЕ БЕЛКИ ХРОМАТИНА КОГЕЗИН И КОНДЕНСИНЫ УЧАСТВУЮТ В ПОДДЕРЖАНИИ СТАБИЛЬНОСТИ ГЕНОМА Баттулин Н., Смирнов А., Юнусова А., Хабарова А., Рыжкова А., Кабирова Э. [INTERNATIONAL CONFERENCE CHROMOSOME 2023]
	Взаимосвязь регуляции генов с 3D архитектурой генома на модели локуса Kit/Kdr мыши Кабирова Э.М., Рыжкова А.С., Лукьянчикова В.А., Хабарова А.А., Баттулин Н.Р. [INTERNATIONAL CONFERENCE CHROMOSOME 2023]
	Изучение синдрома Коэна на основе пациент-специфичных иПСК с мутацией в гене СОН1 Т.А. Шнайдер, К.Н. Морозова, А.А. Хабарова, С. Чечеткина, A. Чвилева, A. Юнусова, Е. Вольф, Е.В. Киселева, И.Е. Пристяжнюк. [Международный конгресс CRISPR-2023]
2022	3D organization of the genome tissue-specifically regulates activity of the development genes Pdgfra, Kit, Kdr in mouse Kabirova E., Lukyanchikova V., Ryzhkova A., Khabarova A., Battulin N. [ISCOMS 2022 "29th International Student Congress Of (bio)Medical Sciences"]
	Influence of TADs boundary disruption on 3D genome organisation and genes expression at the mouse Pdgfra/Kit/Kdr locus Kabirova E., Lukyanchikova V., Ryzhkova A., Khabarova A., Battulin N. [BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
	Pluripotent stem cell lines from two patients with COH1 gene mutations as the valuable in vitro model of Cohen syndrome. Shnaider T., Khabarova A., Morozova K., Kiseleva E., Vladimirova E., Chechetkina S., Chvileva A., Smirnova A., Larina D., Pristyazhnyuk I. [Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference]
	Электронно-микроскопический анализ фибробластов пациента с синдромом Коэна. Морозова К.Н. Пристяжнюк И.Е., Хабарова А.А., Шнайдер. Т.А.1, Киселева Е.В. [XXIX Российская конференция по электронной микроскопии.]
2018	Динамика нестабильности кольцевых хромосом при репрограммировании соматических клеток Никитина Т.В., Васильев С.А., Распопова М.А., Мензоров А.Г., Кашеварова А.А., Хабарова А.А., Гридина М.М., Яковлева Ю.С., Лебедев И.Н. [Международная конференция Хромосома 2018]
2015	ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ЯДЕРНОГО И МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМОВ 3С МЕТОДАМИ Фишман В.С., Баттулин Н.Р., Миронова И.В., Помазной М.Ю., Афонников Д.А., Мазур А.М., Хабарова А.А., Прохорчук Е.Б., Серов О.Л. [Международная конференция «Хромосома» 2015]
2014	Конструирование первичных (эмбриональных) химер с окологексаплоидными гибридными клетками мыши Голубица А.Н., Железова А.И., Хабарова А.А., Кизилова* Е.А. [VI Съезд ВОГИС]
	Получение и характеристика индуцированных плюрипотентных стволовых клеток американской норки Мензоров А.Г., Матвеева Н.М., Хабарова А.А., Кизилова Е.А., Пристяжнюк И.Е., Голубица А.Н., Железова А.И., Серов О.Л. [VI Съезд ВОГИС]
2011	Исследование импринтинга локуса Dlk1-Dio3 при репрограммировании в гибридных клетках Н.Р. Баттулин, А.А. Хабарова, А.Г. Мензоров, О.Л. Серов [Биология стволовых клеток: фундаментальные аспекты]
2009	Alternative expression of parental genomes in embryonic stem cell-fibroblast cell hybrids is determined by ploidy of somatic partner Kruglova A.A., Matveeva N.M., Gridina M.M., Battulin N.R.,Kiseleva E.V, Morozova K.N., and Serov O.L [BITS’s 2nd Annual Congress of Regenerative Medicine & Stem Cell at CMBF-2009, Dalian, China]
	Ранние стадии перепрограммирования фибробластов в гетеро- и синкарионах и при индукции в них плюрипотентности с помощью трансфекции векторами экспрессирующими Oct4/Sox2 и Nanog/Lin30 Серов ОЛ, Круглова АА, Матвеева НМ, Гридина ММ, Кизилова ЕА, Баттулин НР [Всероссийский симпозиум по биологии клетки в культуре "Культивируемые клетки как основа клеточных технологий", 12-14 октября, Санкт-Петербург]
	Сходство ранних стадий перепрограммирования фибробластов после их слияния с эмбриональными стволовыми клетками и при индукции в них плюрипотентности путем транзиторной трансфекции векторами экспрессирующими OCT4/SOX2 Круглова АА, Матвеева НМ, Кизилова ЕА, Гридина ММ, Баттулин НР, Пристяжнюк ИЕ, Серов ОЛ [5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.]
2007	Phenotype of hybrid cells generated by fusion of embryonic stem cells with tetraploid fibroblasts Kruglova A., Gridina M., Menzorov A., Matveeva N., Serov O. [IV International meetings Stem Cells Network North Rhine-Westfalia]
2005	Характеристика ядерного и митохондриального геномов во внутри- и межвидовых эмбриональных стволовых гибридных клетках мыши Мензоров А.Г., Круглова А.А., Темирова С.А., Серов О.Л. [VI международная конференция по молекулярной генетике соматических клеток]
2004	Сегрегация хромосом и митохондрий в межвидовых эмбриональных гибридных клетках мыши Мензоров А.Г., Круглова А.А., Матвеева Н.М., Серов О.Л. [3-й съезд ВОГиС]
2003	Использование микросателлитов для идентификации родительских хромосом в эмбриональных гибридных клетках Мензоров А.Г., Круглова А.А., Шилов А.Г., Матвеева Н.М. [Вторая интеграционная междисциплинарная конференция молодых ученых СО РАН и высшей школы]

Гранты

2019	Изучение механизмов нарушения нейрогенеза вызванных мутациями в гене CNTN6 на модели трехмерных церебральных органоидов Юнусова Анастасия Маратовна Шнайдер Татьяна Александровна Гладких Ольга Леонидовна Хабарова Анна Александровна Пристяжнюк Инна Евгеньевна (Р) Белокопытова Полина Станиславовна Гридина Мария Михайловна
	Изучение механизмов нарушения нейрогенеза вызванных мутациями в гене CNTN6 на модели трехмерных церебральных органоидов. Гридина Мария Михайловна Белокопытова Полина Станиславовна Хабарова Анна Александровна Гладких Ольга Леонидовна Шнайдер Татьяна Александровна Юнусова Анастасия Маратовна Пристяжнюк Инна Евгеньевна (Р)
	Разработка нового подхода к молекулярной диагностике хромосомных болезней человека на основе комбинации технологий захвата конформации хромосом и массового параллельного секвенирования Фишман Вениамин Семенович (Р) Баттулин Нариман Рашитович Скрябин Николай Алексеевич Лебедев Игорь Николаевич Кашеварова Анна Александровна Лопаткина Мария Евгеньевна Назаренко Людмила Павловна Нуриддинов Мирослав Абдурахимович Белокопытова Полина Станиславовна Сальников Павел Александрович
2018	Исследование роли пространственной организации генома в регуляции активности генов на примере локуса Pdgfra/Kit/Kdr, с использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9 Фишман Вениамин Семенович Юнусова Анастасия Маратовна Хабарова Анна Александровна Кораблев Алексей Николаевич Рыжкова Анастасия Сергеевна Лукьянчикова Варвара Алексеевна Смирнов Александр Васильевич Гридина Мария Михайловна Баттулин Нариман Рашитович
	Исследование реорганизации 3D архитектуры генома в процессе терминальной дифференцировки эритробластов мыши Лукьянчикова Варвара Алексеевна Рыжкова Анастасия Сергеевна Хабарова Анна Александровна Баттулин Нариман Рашитович Фишман Вениамин Семенович (Р)
2016	Нормализация кариотипа индуцированных плюрипотентных стволовых клеток как основы хромосомной терапии болезней человека Хабарова Анна Александровна Гридина Мария Михайловна Орищенко Константин Евгеньевич Мензоров Алексей Гавриилович Кашеварова Анна Александровна Никитина Татьяна Владимировна
2013	Прямая конверсия фибробластов в серотонинергические нейроны Баттулин Нариман Рашитович, Хабарова Анна Александровна,Фишман Вениамин Семенович, Шнайдер Татьяна Александровна, Юнусова Анастасия Маратовна
2012	Исследование трехмерной организации генома половых и соматических клеток методом Hi-C Баттулин Нариман Рашитович Серов Олег Леонидович Колчанов Николай Александрович Рубцов Николай Борисович Орлов Юрий Львович Афонников Дмитрий Аркадьевич Медведев Кирилл Евгеньевич Карамышева Татьяна Витальевна Юнусова Анастасия Маратовна Шнайдер Татьяна Александровна Фишман Вениамин Семенович Мензоров Алексей Гавриилович Хабарова Анна Александровна
2010	Ранние стадии перепрограммирования родительских геномов в гибридных клетках, получаемых слиянием эмбриональных стволовых и соматических клеток разной плоидности. Гридина М.М. Карпов А. В. Хабарова А.А. Нещадим Д.В. Пристяжнюк И.Е. Мензоров А.Г.

Научное руководство

2021	ИНДУКЦИЯ ХРОМОСОМНЫХ ПЕРЕСТРОЕК В КЛЕТКАХ ЛИНИИ HAP1 С ПОМОЩЬЮ СИСТЕМЫ CRE/LOXP ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ИХ ВЛИЯНИЯ НА ФУНКЦИОНИРОВАНИЕ ГЕНОМА [Кокшарова Галина Сергеевна]
2010	ХАРАКТЕРИСТИКИ РАННИХ СТАДИЙ ОБРАЗОВАНИЯ КЛЕТОЧНЫХ ГИБРИДОВ ОТ СЛИЯНИЯ ТЕТРАПЛОИДНЫХ ЭМБРИОНАЛЬНЫХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК И ДИПЛОИДНЫХ ФИБРОБЛАСТОВ МЫШИ [Нещадим Дмитрий Владимирович]

Диссертации

2009	ПРОЯВЛЕНИЕ РОДИТЕЛЬСКИХ ГЕНОМОВ В ГИБРИДНЫХ КЛЕТКАХ, ПОЛУЧЕННЫХ СЛИЯНИЕМ ДИПЛОИДНЫХ ЭМБРИОНАЛЬНЫХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК С ДИ- И ТЕТРАПЛОИДНЫМИ ФИБРОБЛАСТАМИ [Специалист]