 |
 |
|
Система учета научной деятельности (ASSA) |
|
|
|
 |
|
 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Сектор геномных механизмов онтогенеза (т.33)Отдел молекулярных механизмов онтогенеза (т.15)
Научные результаты Сотрудники Гладких Ольга Леонидовна [старший лаборант] Гридина Мария Михайловна [старший научный сотрудник] Пристяжнюк Инна Евгеньевна [научный сотрудник] Шнайдер Татьяна Александровна [младший научный сотрудник] Бывшие сотрудникиГригорьева Татьяна НиколаевнаМунгалов Роман Владимирович Сайфулина Алевтина Леонидовна Хабарова Анна Александровна Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода: 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 Публикации Монографии Конференции Гранты Научное руководство Учебные курсы
|
| 2024 | ЦИТОТОКСИЧЕСКОЕ ДЕЙСТВИЕ ОНКОЛИТИЧЕСКОГО ВИРУСА VV-GMCSF-LACTВ ОТНОШЕНИИ 3D-КУЛЬТУР КЛЕТОК ГЛИОБЛАСТОМЫ ЧЕЛОВЕКА U-87 MG Дымова М.А., Шнайдер Т.А., Чечеткина С.А., Петров Г.О., Малышева Д.О., Дроков Д.В., Агеенко А.Б., Васильева Н.С., Рихтер В.А., Кулигина Е.В. Acta Biomedica Scientifica, 2024, Vol. 8, N 6
|
| A germline chimeric KANK1-DMRT1 transcript derived from a complex structural variant is associated with a congenital heart defect segregating across five generations Silvia Souza da Costa, Veniamin Fishman, Mara Pinheiro, Andre Rodrigueiro, Maria Teresa Sanseverino, Paulo Zielinsky, Claudia M. B. Carvalho, Carla Rosenberg, Ana Cristina Victorino Krepischi CHROMOSOME RES, 2024, Mar 19;32(2):6
|
|
| Structural variants in the Epb41l4a locus: TAD disruption and Nrep gene misregulation as hypothetical drivers of neurodevelopmental outcomes Paul Salnikov, Alexey Korablev, Irina Serova, Polina Belokopytova, Aleksandra Yan, Yana Stepanchuk, Savelii Tikhomirov, Veniamin Fishman SCI REP-UK, 2024, Article number: 5288
|
|
| Towards Development of the 4C-Based Method Detecting Interactions of Plasmid DNA with Host Genome Alexandra P Yan, Paul A Salnikov, Maria M Gridina, Polina S Belokopytova, Veniamin S Fishman BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2024
|
|
| Modification of the Hi-C Technology for Molecular Genetic Analysis of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Sections of Tumor Tissues Maria M Gridina, Yana K Stepanchuk, Miroslav A Nurridinov, Timofey A Lagunov, Nikita Yu Torgunakov, Artem A Shadsky, Anastasia I Ryabova, Nikolay V Vasiliev, Sergey V Vtorushin, Tatyana S Gerashchenko, Evgeny V Denisov, Mikhail A Travin, Maxim A Korolev, Veniamin S Fishman BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2024
|
|
| A HGF Mutation in the Familial Case of Primary Lymphedema: A Report Galina Koksharova, Natalia Kokh, Maria Gridina, Rustam Khapaev, Vadim Nimaev, Veniamin Fishman INT J MOL SCI, 2024
|
|
| (+)-fenchol and (−)-isopinocampheol derivatives targeting the entry process of filoviruses Anastasiya S. Sokolova , Dmitriy S. Baev , Ekaterina D. Mordvinova , Olga I. Yarovaya , Natalia V. Volkova , Dmitriy N. Shcherbakov , Alina A. Okhina , Artem D. Rogachev , Tatiana A. Shnaider , Anastasiya S. Chvileva , Tatiana V. Nikitina , Tatyana G. Tolstikova , Nariman F. Salakhutdinov EUR J MED CHEM, 2024
|
|
| TAD border deletion at the Kit locus causes tissue-specific ectopic activation of a neighboring gene. Kabirova E, Ryzhkova A, Lukyanchikova V, Khabarova A, Korablev A, Shnaider T, Nuriddinov M, Belokopytova P, Smirnov A, Khotskin NV, Kontsevaya G, Serova I, Battulin N. NAT COMMUN, 2024
|
|
| Assessing cell lines with inducible depletion of cohesin and condensins components through analysis of metaphase chromosome morphology A. M. Yunusova, A. V. Smirnov, I. E. Pristyazhnuk, T. A. Shnaider, E. K. Maltseva, S. D. Afonnikova, O. A. Gusev, N. R. Battulin Vavilov journal of genetics and breeding, 2024
|
|
| Design of iPSC-based cell model to study the functions of the UBE2A gene Alexandra Bogomazova, Alisa V Fedorenko, Ekaterina A Khomyakova, Anastasia V Surdina, Elizaveta K Sekretova, Tatiana V Limanskaya, Lilia D Belikova, Egor A Volovikov, Maria M Gridina, Anna A Khabarova, Anna A Kashevarova, Dmitry A Fedotov, Elena A Zerkalenkova, Maria A Lagarkova, Igor N Lebedev Гены и клетки, 2024
|
|
| 2023 | Экспрессия генов биомолекул, ассоциированных с этиопатогенезом атеросклероза, в атеросклеротических бляшках коронарных артерий Семаев С.Е., Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Фишман В.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Волков А.М., Рагино Ю.И. КОМПЛЕКСНЫЕ ПРОБЛЕМЫ СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, 2023, 12(4S):65-79
|
| A family case of a rare autoinflammatory disease associated with mutations in the NLRP3 and TNFRSF1A genes in the practice of a rheumatologist Kurochkina Yu.D., Korolev M.A., Letyagina E.A., Fishman V.S., Gridina M.M.,Valeeva E.S. Бюллетень сибирской медицины, 2023, 22(2):170–175
|
|
| Annotation of uORFs in the OMIM genes allows to reveal pathogenic variants in 5'UTRs Alexandra Filatova, Ivan Reveguk, Maria Piatkova, Daria Bessonova, Olga Kuziakova, Victoria Demakova, Alexander Romanishin, Veniamin Fishman, Yerzhan Imanmalik, Nikolay Chekanov, Rostislav Skitchenko, Yury Barbitoff, Olga Kardymon, Mikhail Skoblov NUCLEIC ACIDS RES, 2023, gkac1247
|
|
| Hi-C analysis of genomic contacts revealed karyotype abnormalities in chicken HD3 cell line Maslova A, Plotnikov V, Nuriddinov M, Gridina M, Fishman V, Krasikova BMC GENOMICS, 2023
|
|
| Cell type–specific interpretation of noncoding variants using deep learning–based methods Maria Sindeeva, Nikolay Chekanov, Manvel Avetisian, Tatiana I Shashkova, Nikita Baranov, Elian Malkin, Alexander Lapin, Olga Kardymon, Veniamin Fishman GigaScience, 2023
|
|
| Lampbrush chromosome studies in the post-genomic era Alla Krasikova, Veniamin Fishman, Tatiana Kulikova BIOESSAYS, 2023
|
|
| Influence of human peripheral blood samples preprocessing on the quality of Hi-C libraries M M Gridina, E Vesna, M E Minzhenkova, N V Shilova, O P Ryzhkova, L P Nazarenko, E O Belyaeva, I N Lebedev, V S Fishman Vavilov journal of genetics and breeding, 2023
|
|
| Function and Evolution of the Loop Extrusion Machinery in Animals Evelyn Kabirova, Artem Nurislamov, Artem Shadskiy, Alexander Smirnov, Andrey Popov, Pavel Salnikov, Nariman Battulin, Veniamin Fishman INT J MOL SCI, 2023
|
|
| A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells Anna Khabarova, Galina Koksharova, Pavel Salnikov, Polina Belokopytova, Roman Mungalov, Inna Pristyazhnuk, Artem Nurislamov, Maria Gridina, Veniamin Fishman CHROMOSOME RES, 2023
|
|
| Ultrastructural Abnormalities in Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Neural Stem Cells and Neurons of Two Cohen Syndrome Patients Shnaider TA, Khabarova AA, Morozova KN, Yunusova AM, Yakovleva SA, Chvileva AS, Wolf ER, Kiseleva EV, Grigor’eva EV, Voinova VY, Lagarkova MA, Pomerantseva EA, Musatova EV, Smirnov AV, Smirnova AV, Stoklitskaya DS, Arefieva TI, Larina DA, Nikitina TV, Pristyazhnyuk IE Cells, 2023
|
|
| Изучение синдрома Коэна на основе пациент-специфичных ИПСК с мутацией в гене СОН1. Т.А. Шнайдер, К.Н. Морозова, А.А. Хабарова, С. Чечеткина, A. Чвилева, A. Юнусова, Е. Вольф, Е.В. Киселева, И.Е. Пристяжнюк. Гены и клетки, 2023, 2023. Том XVIII, Приложение, с. 49-50.
|
|
| Design, synthesis and antiviral evaluation of novel conjugatesof the 1,7,7‐trimethylbicyclo[2.2.1]heptane scaffold andsaturated N‐heterocycles via 1,2,3‐triazole linker Anastasiya S. Sokolova, Olga I. Yarovaya, Oleg I. Artyushin, Elena V. Sharova, Dmitriy S. Baev, Ekaterina D. Mordvinova, Dmitriy N. Shcherbakov, Tatiana A. Shnaider, Tatiana V. Nikitina, Iana L. Esaulkova, Polina A. Ilyina, Vladimir V. Zarubaev, Valery K. Brel, Tatyana G. Tolstikova, Nariman F. Salakhutdinov ARCH PHARM, 2023
|
|
| Expanding the list of sequence-agnostic enzymes for chromatin conformation capture assays with S1 nuclease Gridina Maria, Popov Andrey, Shadskiy Artem, Torgunakov Nikita, Kechin Andrey, Khrapov Evgeny, Ryzhkova Oxana, Filipenko Maxim & Fishman Veniamin EPIGENET CHROMATIN, 2023, 16: 48
|
|
| Generation of Induced Pluripotent Stem Cell Line iTAF15Xsk4 from Fibroblasts of a Patient with Microdeletion at Xq24 I. E. Pristyazhnyuk, N. I. Meshcheryakov, b, T. V. Nikitina, A. A. Kashevarova, D. A. Fedotov, E. N. Tolmacheva, L. I. Minaycheva, L. P. Nazarenko, I. N. Lebedev, and A. G. Menzorov RUSS J DEV BIOL+, 2023, Vol. 54, No. 6, pp. 358–364
|
|
| 2022 | Generation of two iPSC lines from healthy donor with a heterozygous mutation in the VPS13B gene S.A.Chechetkina, A.A.Khabarova, A.S.Chvileva, O.M.Kurchenko, A.V.Smirnov, A.M.Yunusova, I.N.Kotov, E.V.Musatova, E.A.Pomerantseva, E.A.Volovikov, M.A.Lagarkova, T.A.Shnaider, I.E.Pristyazhnyuk STEM CELL RES, 2022
|
| Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects Varvara Lukyanchikova*, Miroslav Nuriddinov*, Polina Belokopytova, Alena Taskina, Jiangtao Liang, Maarten Reijnders, Livio Ruzzante, Romain Feron, Robert Waterhouse, Yang Wu, Chunhong Mao, Zhijian Tu, Igor Sharakhov, and Veniamin Fishman * authors contributed equally NAT COMMUN, 2022
|
|
| 3DGenBench: a web-server to benchmark computational models for 3D Genomics Belokopytova, Emil Viesná, Mateusz Chiliński, Yifeng Qi, Hossein Salari, Marco Di Stefano, Andrea Esposito, Mattia Conte, Andrea M. Chiariello, Vladimir B. Teif, Dariusz Plewczynski, Bin Zhang, Daniel Jost, Veniamin Fishman NUCLEIC ACIDS RES, 2022
|
|
| Establishment of the Primary Avian Gonadal Somatic Cell Lines for Cytogenetic Studies. Animals 2022, . https://doi.org/ Pristyazhnyuk, I.E. Malinovskaya, L.P. Borodin, P.M. Animals, 2022, v. 22, p. 1724
|
|
| Germline-Restricted Chromosomes and Autosomal Variants Revealed by Pachytene Karyotyping of 17 Avian Species Malinovskaya L.P. Slobodchikova A.Y. Grishko E.O. Pristyazhnyuk I.E. Torgasheva A.A. Borodin P.M. CYTOGENET GENOME RES, 2022
|
|
| The human EF1a promoter does not provide expression of the transgene in mice Nariman Battulin, Alexey Korablev, Anastasia Ryzhkova, Alexander Smirnov, Evelyn Kabirova, Anna Khabarova, Timofey Lagunov, Irina Serova, Oleg Serov TRANSGENIC RES, 2022
|
|
| Method for the Isolation of “RNA-seq-Quality” RNA from Human Intervertebral Discs after Mortar And Pestle Homogenization Artemii A. Ivanov, Olga N. Leonova, Daniil S. Wiebe, Alexsandr V. Krutko, Mariya M. Gridina, Veniamin S. Fishman, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov, Tatiana S. Golubeva Cells, 2022
|
|
| HARs: History, Functions, and Role in the Evolution and Pathogenesis of Human Diseases A. S. Ryzhkova, A. A. Khabarova, A. S. Chvileva, T. A. Shnaider Cell and Tissue Biology, 2022
|
|
| FastContext: A tool for identification of adapters and other sequence patterns in next generation sequencing (NGS) data Е. Viesná, V. Fishman Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, 26(8):806-809
|
|
| The role of high-order chromatin organization in gene regulation Veniamin Fishman, Alexey V Pindyurin Frontiers in Genetics, 2022
|
|
| Single-Cell DNA Methylation Analysis of Chicken Lampbrush Chromosomes Artem Nurislamov, Timofey Lagunov, Maria Gridina, Alla Krasikova, Veniamin Fishman INT J MOL SCI, 2022, 23(20):12601
|
|
| Comparison and critical assessment of single-cell Hi-C protocols M Gridina, A Taskina, T Lagunov, A Nurislamov, T Kulikova, A Krasikova, V Fishman Heliyon, 2022, 8(10):e11023
|
|
| Комплексные геномные перестройки в этиологии «хромосомного фенотипа» М. Е. Миньженкова, Ж. Г. Маркова, Д. А. Юрченко, А. А. Тарлычева, Т. В. Маркова, Н. А. Семенова, А. Ф. Муртазина, В. В. Кадышев, М. М. Гридина, Э. . Весна, В. С. Фишман, Н. В. Шилова Медицинская генетика, 2022, 21(11):44-47
|
|
| Multilevel view on chromatin architecture alterations in cancer Maria Gridina, Veniamin Fishman Frontiers in Genetics, 2022
|
|
| ADAMTS1 Is Differentially Expressed in Human Lymphocytes with Various Frequencies of Endogenous γH2AX Foci and Radiation-Induced Micronuclei S. A. Vasilyev, R. R. Savchenko, A. A. Belenko, N. A. Skryabin, A. A. Sleptsov, V. S. Fishman, A. A. Murashkina, O. V. Gribova, Z. A. Startseva, E. S. Sukhikh, A. V. Vertinskiy, L. G. Sukhikh, O. L. Serov, I. N. Lebedev RUSS J GENET+, 2022
|
|
| Generation of iPS cell line (ICGi040-A) from skin fibroblasts of a patient with ring small supernumerary marker chromosome 4 M.M.Gridina, A.R.Nurislamov, J.M.Minina, M.E.Lopatkina, G.V.Drozdov, S.A.Vasilyev, L.I.Minaycheva, E.O.Belyaeva, T.V.Nikitina, A.A.Kashevarova, I.N.Lebedev, T.V.Karamysheva, N.B.Rubtsov, O.L.Serov STEM CELL RES, 2022, 61, 102740
|
|
| 2021 | Differential DNA Methylation of the IMMP2L Gene in
Families with Maternally Inherited 7q31.1 Microdeletions
is Associated with Intellectual Disability and
Developmental Delay Vasilyev Stanislav A., Skryabin Nikolay, A. Kashevarova Anna A., Tolmacheva Ekaterina N., Savchenko Renata R., Vasilyeva Oksana Yu., Lopatkina Maria E., Zarubin Alexei A., Fishman Veniamin S., Belyaeva Elena O., Filippova Miroslava O., Shorina Asia R., Maslennikov Arkadiy B., Shestovskikh Olga L., Gayner Tatyana A., Culic Vida, Vulic Robert, Nazarenko Lyudmila P., Lebedev Igor N. CYTOGENET GENOME RES, 2021
|
| The Mutation Spectrum of Maturity Onset Diabetes
of the Young (MODY)-Associated Genes amongWestern Siberia Patients Dinara E. Ivanoshchuk, Elena V. Shakhtshneider, Oksana D. Rymar, Alla K. Ovsyannikova, Svetlana V. Mikhailova, Veniamin S. Fishman, Emil S. Valeev, Pavel S. Orlov and Mikhail I. Voevoda J. Pers. Med, 2021, 11, 57-71
|
|
| Predicting Genome Architecture: Challenges and Solutions P. Belokopytova, V. Fishman Frontiers in Genetics, 2021, 11:617202
|
|
| Complex biology of constitutional ring chromosomes structure and (in)stability revealed by somatic cell reprogramming T V Nikitina, A A Kashevarova, M M Gridina, M E Lopatkina, A A Khabarova, Yu S Yakovleva, A G Menzorov, Yu A Minina, I E Pristyazhnyuk, S A Vasilyev, D A Fedotov, O L Serov, I N Lebedev SCI REP-UK, 2021, 11(1):4325
|
|
| A cookbook for DNase Hi-C Maria Gridina, Evgeniy Mozheiko, Emil Valeev, Ludmila P. Nazarenko, Maria E. Lopatkina, Zhanna G. Markova, Maria I. Yablonskaya, Viktoria Yu Voinova, Nadezhda V. Shilova, Igor N. Lebedev, Veniamin Fishman EPIGENET CHROMATIN, 2021, No. 14, Article number: 15
|
|
| Erythrocytes 3D genome organization in vertebrates Anastasia Ryzhkova, Alena Taskina, Anna Khabarova, Veniamin Fishman, Nariman Battulin SCI REP-UK, 2021
|
|
| Анализ полиморфизма гена f5 у мужчин с коронарным атеросклерозом с использованием метода полноэкзомного секвенирования Е. В. Стрюкова, Е. В. Шахтшнейдер, Д. Е. Иванощук, Ю. И. Рагино, Я. В. Полонская, И. С. Мурашов, А. М. Волков, А. В. Кургузов, А. М. Чернявский, Э. С. Валеев, В. Н. Максимов, Е. В. Каштанова Атеросклероз, 2021, 17(1):29-37
|
|
| Создание библиотек баркодированных плазмид
с помощью метода клонирования по Гибсону А.В. Смирнов, А.М. Юнусова, А.А. Муравьева, Э.C. Валеев, В.C. Фишман, Н.Р. Баттулин Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2021
|
|
| Evaluation of the OsTIR1 and AtAFB2 AID Systems for Genome Architectural Protein Degradation in Mammalian Cells Anastasia Yunusova*, Alexander Smirnov, Tatiana Shnaider, Varvara Lukyanchikova, Svetlana Afonnikova and Nariman Battulin* Front Mol Biosci, 2021, Front. Mol. Biosci. 2021. 8:757394
|
|
| Analysis of Rare Variants in Genes Related to Lipid Metabolism in Patients with Familial Hypercholesterolemia in Western Siberia (Russia) Elena Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Olga Timoshchenko, Pavel Orlov, Sergey Semaev, Emil Valeev, Andrew Goonko, Nataliya Ladygina and Mikhail Voevoda J. Pers. Med, 2021, 11, 1232-1245
|
|
| Высокопроизводительные молекулярно-генетические технологии для поиска новых этиопатогенетических факторов развития атеросклероза Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Валеев Э.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И. Атеросклероз, 2021, 17(3):83-84
|
|
| Here and there: the double-side transgene localization P A Salnikov, A A Khabarova, G S Koksharova, R V Mungalov, P S Belokopytova, I E Pristyazhnuk, A R Nurislamov, P Somatich, M M Gridina, V S Fishman Vavilov journal of genetics and breeding, 2021
|
|
| Анализ дифференциальной экспрессии генов
липидного обмена в атеросклеротических бляшках
у пациентов с коронарным атеросклерозом Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Фишман В.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И. Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины, 2021, 36(4):156–163
|
|
| CLARITY and Light-Sheet microscopy sample preparation
in application to human cerebral organoids T.A. Shnaider, I.E. Pristyazhnyuk Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(8):889-895
|
|
| Derivation of Ringed Seal ( Phoca hispida) Induced Multipotent Stem Cells Violetta R Beklemisheva, Polina S Belokopytova, Veniamin S Fishman, Aleksei G Menzorov CELL REPROGRAM, 2021, 23(6):326-335
|
|
| A hypomorphic mutation in the mouse csn1s1 gene generated by CRISPR/Cas9 pronuclear microinjection A V Smirnov, T А Shnaider, A N Korablev, A M Yunusova, I A Serova, N R Battulin Vavilov journal of genetics and breeding, 2021
|
|
| Derivation of iPS cell line (ICGi032-A) from a patient affected with fragile X syndrome. Gridina MM, Shitik EM, Lemskaya NA, Minina JM, Grishchenko IV, Dolskiy AA, Shorina AR, Maksimova YV, Yudkin DV. STEM CELL RES, 2021, 29, 57, 102615
|
|
| 2020 | Quantitative prediction of enhancer-promoter interactions Polina Belokopytova, Miroslav Nuriddinov, Evgeniy Mozheiko, Daniil Fishman, Veniamin Fishman GENOME RES, 2020, 30(1):72-84
|
| DNA barcoding reveals that injected transgenes are predominantly processed by homologous recombination in mouse zygote Alexander Smirnov, Veniamin Fishman, Anastasia Yunusova, Alexey Korablev, Irina Serova, Boris V Skryabin, Timofey S Rozhdestvensky, Nariman Battulin NUCLEIC ACIDS RES, 2020, Volume 48, Issue 2, 24 January 2020, Pages 719–735
|
|
| Effect of the THBS1 Gene Knockout on the Radiation-Induced Cellular Response in a Model System In Vitro R. R. Savchenko, S. A. Vasilyev, V. S. Fishman, E. S. Sukhikh, L. G. Sukhikh, A. A. Murashkin, I. N. Lebedev RUSS J GENET+, 2020, Vol. 56, No. 5, pp. 618–626
|
|
| Postsynthetic On-Column 2' Functionalization of RNA by Convenient Versatile Method Olga A Krasheninina, Veniamin S Fishman, Alexander A Lomzov, Alexey V Ustinov, Alya G Venyaminova INT J MOL SCI, 2020
|
|
| Establishment of an induced pluripotent stem cell line (ICGi025-A) from fibroblasts of a patient with 46,XY,r(8)/45,XY,–8 mosaicism M.M.Gridina, T.V.Nikitina, P.A.Orlova, J.M.Minina, A.A.Kashevarova, Yu.S.Yakovleva, M.E.Lopatkina, S.A.Vasilyev, D.A.Fedotov, L.I.Mikhailik, L.P.Nazarenko, I.N.Lebedev, O.L.Serov STEM CELL RES, 2020, V. 49. December 2020, 102024
|
|
| Establishment of an induced pluripotent stem cell line (ICGi026-A) from peripheral blood mononuclear cells of a patient with fragile X syndrome M M Gridina, P A Orlova, J M Minina, E M Shitik, N A Lemskaya, I V Grishchenko, A A Dolskiy, A R Shorina, Y V Maksimova, D V Yudkin, O L Serov STEM CELL RES, 2020, Dec;49:102070
|
|
| Generation of iPSC line ICGi024-A from human skin fibroblasts of a patient with ring chromosome 18 AA Khabarova, IE Pristyazhnyuk, PA Orlova, TV Nikitina, AA Kashevarova, ME Lopatkina, EO Belyaeva, NN Sukhanova, LP Nazarenko, IN Lebedev, OL Serov STEM CELL RES, 2020
|
|
| 2019 | Induced pluripotent stem cell line, ICAGi001-A, derived from human skin fibroblasts of a patient with 2p25.3 deletion and 2p25.3-p23.3 inverted duplication KhabarovaA.A, Pristyazhnyuk I.E., NikitinaT.V., GaynerT.A., TorkhovaN.B., SkryabinN.A., KashevarovaA.A., BabushkinaN.P., MarkovaZh.G., MinzhenkovaM.E., NazarenkoL.P., ShilovaN.V., ShorinaA.R., LebedevI.N., SerovO.L. STEM CELL RES, 2019, V.34, 101377
|
| 3D organization of chicken genome demonstrates evolutionary conservation of topologically associated domains and highlights unique architecture of erythrocytes' chromatin. Fishman V., Battulin N., Nuriddinov M., Maslova A., Zlotina A., Strunov A., Chervyakova D., Korablev A., Serov O., Krasikova A. NUCLEIC ACIDS RES, 2019
|
|
| Способы повышения эффективности knock-in в геном плюрипотентных клеток человека при помощи системы CRISPR/Cas9 М.М. Гридина Vavilov journal of genetics and breeding, 2019
|
|
| Реорганизация хроматина в процессе эритроидной дифференцировки А. А. Хабарова, А. С. Рыжкова, Н. Р. Баттулин Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, Т.23 , № 1 (2019)
|
|
| Targeted genomic integration of EGFP under tubulin beta 3 class III promoter and mEos2 under tryptophan hydroxylase 2 promoter does not produce sufficient levels of reporter gene expression Aleksei G. Menzorov Konstantin E. Orishchenko Veniamin S. Fishman Anastasia A. Shevtsova Roman V. Mungalov Inna E. Pristyazhnyuk Elena A. Kizilova Natalia M. Matveeva Natalia Alenina Michael Bader Nikolai B. Rubtsov Oleg L. Serov J CELL BIOCHEM, 2019, 120(10):17208-17218
|
|
| Germline-restricted chromosome (GRC) is widespread among songbirds Torgasheva AA, Malinovskaya LP, Zadesenets KS, Karamysheva TV, Kizilova EA, Akberdina EA, Pristyazhnyuk IE, Shnaider EP, Volodkina VA, Saifitdinova AF,Galkina SA, Larkin DM, Rubtsov NB, Borodin PM. 2019, 116: 11845-11850. P NATL ACAD SCI USA, 2019, 116: 11845-11850.
|
|
| Generation of four iPSC lines from two siblings with a microdeletion at the CNTN6 gene and intellectual disability T.A.Shnaider,I.E.Pristyazhnyuk, A.G.Menzorov, N.M.Matveeva, A.AKhabarova, N.A.Skryabin, A.A.Kashevarova, M.E.Lopatkina, L.P.Nazarenko, I.N.Lebedev, O.L.Serov STEM CELL RES, 2019
|
|
| Time origin and structural analysis of the induced CRISPR/cas9 megabase-sized deletions and duplications involving the Cntn6 gene in mice. Inna E. Pristyazhnyuk, Julia Minina, Alexey Korablev, Irina Serova, Veniamin Fishman, Maria Gridina, Timofey S. Rozhdestvensky, Leonid Gubar, Boris V. Skryabin, and Oleg L. Serov SCI REP-UK, 2019, 9: 14161
|
|
| Использование тимидинкиназы для отрицательной селекции индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Алексей Гавриилович Мензоров, Константин Евгеньевич Орищенко, Мария Михайловна Гридина, Вениамин Семенович Фишман, Олег Леонидович Серов, Анна Александровна Кашеварова, Татьяна Владимировна Никитина, Игорь Николаевич Лебедев Гены и клетки, 2019, Том XIV, Приложение, 2019, С. 150-151
|
|
| ДифференциальнАя стабильность кольцевых хромосом в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках Татьяна Владимировна Никитина, Анна Александровна Кашеварова, Алексей Гавриилович Мензоров, Станислав Анатольевич Васильев, Мария Михайловна Гридина, Анна Александровна Хабарова, Юлия Сергеевна Яковлева, Мария Евгеньевна Лопаткина, Марина Алексеевна Распопова, Дмитрий Александрович Дериглазов, Олег Леонидович Серов, Игорь Николаевич Лебедев Гены и клетки, 2019, Том XIV, Приложение, 2019, С. 166-167
|
|
| Создание репортерного лентивирусного вектора Lego-REX1-EGFP для отбора индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Артем Рустамович Нурисламов, Вениамин Семенович Фишман, Алексей Гавриилович Мензоров Гены и клетки, 2019, Том XIV, Приложение, 2019, С. 170-171
|
|
| C-InterSecture—a computational tool for interspecies comparison of genome architecture Нуриддинов Мирослав Абдурахимович Фишман Вениамин Семёнович BIOINFORMATICS, 2019, Volume 35, Issue 23, 1 December 2019, Pages 4912–4921,
|
|
| Происхождение и судьба масштабных хромосомных перестроек, индуцированных технологией CRISPR/Cas9 у мышей: от зигот до соматических клеток Алексей Николаевич Кораблев, Инна Евгеньевна Пристяжнюк, Юлия Михайловна Минина, Ирина Александровна Серова, Вениамин Семенович Фишман, Мария Михайловна Гридина, Timofey Rozhdestvensky, Leonid Gubar, Boris Skryabin, Олег Леонидович Серов Гены и клетки, 2019
|
|
| Detection of Point Mutations and Chromosomal Translocations Based on Massive Parallel Sequencing of Enriched 3C Libraries Mozheiko E.A., Fishman V.S. RUSS J GENET+, 2019
|
|
| 2018 | Ring chromosomes: from formation to clinical potential Pristyazhnyuk I.E., Menzorov A.G. PROTOPLASMA, 2018, 255(2); 439-449 doi: 10.1007/s00709-017-1165-1
|
| Allele-Specific Biased Expression of the CNTN6 Gene in iPS Cell-Derived Neurons from a Patient with Intellectual Disability and 3p26.3 Microduplication Involving the CNTN6 Gene Maria M. Gridina, Natalia M. Matveeva, Veniamin S. Fishman, Aleksei G. Menzorov, Helen A. Kizilova, Nikolay A. Beregovoy, Igor I. Kovrigin, Inna E. Pristyazhnyuk, Igor P. Oscorbin, Maxim L. Filipenko, Anna A. Kashevarova, Nikolay A. Skryabin, Tatyana V. Nikitina, Elena A. Sazhenova, Ludmila P. Nazarenko, Igor N. Lebedev, Oleg L. Serov MOL NEUROBIOL, 2018, 55:6533-6546
|
|
| Generation of two iPSC lines (IMGTi001-A and IMGTi001-B) from human skin fibroblasts with ring chromosome 22 Nikitina TV, Menzorov AG, Kashevarova AA, Gridina MM, Khabarova AA, Yakovleva YS, Lopatkina ME, Kizilova EA, Vasilyev SA, Serov OL, Lebedev IN. STEM CELL RES, 2018, 31, 244–248
|
|
| АНАЛИЗ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ЭКСПРЕССИИ МАТРИКСНЫХ МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗ
В СТАБИЛЬНОЙ И НЕСТАБИЛЬНОЙ АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШКАХ МЕТОДОМ
ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК: ПИЛОТНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ Иванощук Д.Е., Рагино Ю. И. , Шахтшнейдер Е.В., Михайлова С.В. , Фишман В. С., Полонская Я.В. , Каштанова Е.В., Чернявский А.М. , Мурашов И.С., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2018, №8, С.52-58
|
|
| Induced pluripotent stem cell line, IMGTi003-A, derived from skin fibroblasts of an intellectually disabled patient with ring chromosome 13 Nikitina T.V., Menzorov A.G., Kashevarova A.A., Gridina M.M., Khabarova A.A., Yakovleva Yu.S., Lopatkina M.E., Pristyazhnyuk I.E., Vasilyev S.A., Serov O.L., Lebedev I.N. STEM CELL RES, 2018, 33:260–264
|
|
| Intragenic Microduplication of LAMA1 and a Constitutional 18p11.32 Microduplication in a Patient with Keratosis Pilaris and Intellectual Disability. Anna A. Kashevarova, Lyudmila P. Nazarenko, Nikolay A. Skryabin, Tatyana V. Nikitina, Stanislav A. Vasilyev, Ekaterina N. Tolmacheva, Mariya E. Lopatkina, Olga A. Salyukova, Nataliya N. Chechetkina, Ekaterina A. Vorotelyak, Ekaterina, P. Kalabusheva, Veniamin S. Fishman, Julia Kzhyshkowska, Claudio Graziano, Pamela Magini, Giovanni Romeo, Igor N. Lebedev AM J MED GENET A, 2018
|
|
| Interpreting chromosomal rearrangements in the context
of 3-dimentional genome organization: a practical guide for medical genetics V.S. Fishman, P.A. Salnikov, N.R. Battulin BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2018
|
|
| Церебральные органоиды – перспективная модель в клеточных технологиях Т. А. Шнайдер Vavilov journal of genetics and breeding, 2018
|
|
| 2017 | 5’-биспиренильные зонды типа «молекулярный маяк» для детекции РНК. Крашенинина О.А., Фишман В.С., Новопашина Д.С., Веньяминова А.Г. Биоорганическая химия, 2017, №3, Том 43
|
| Rational design and studies of excimer forming novel dual probes to target RNA Krasheninina OA, Lomzov AA, Fishman VS, Novopashina DS, Venyaminova AG. Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2017, Apr 1;25(7):2244-2250
|
|
| Deterministic versus stochastic model of reprogramming: new evidence from cellular barcoding technique Anastasia M. Yunusova, Veniamin S. Fishman, Gennady V. Vasiliev, Nariman R. Battulin. OPEN BIOL, 2017, 7 (4)
|
|
| Спонтанная хромосомная нестабильность в клетках с кольцевой хромосомой как основа хромосомной терапии Кашеварова А.А., Беляева Е.О., Никонов А.М., Плотникова О.В., Гергерт И.Г., Никитина Т.В., Скрябин Н.А., Мензоров А.Г., Гридина М.М., Васильев С.А., Лопаткина М.Е., Савченко Р.Р., Чурилова А.В., Толмачева Е.Н., Серов О.Л., Назаренко Л.П., Лебедев И.Н. Медицинская генетика, 2017, 12:18-26
|
|
| Получение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток американской норки: протокол Пристяжнюк Инна Евгеньевна, Мензоров Алексей Гаврилович Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 2017;21(6):701-709 DOI 10.18699/VJ17.288
|
|
| Изучение инактивации Х-хромосом в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках американской норки Пристяжнюк И.Е., Мензоров А.Г. Цитология, 2017, 2017;59(11):783
|
|
| Получение ИПСК с кольцевыми хромосомами и анализ их стабильности в соматических и плюрипотентных клетках Никитина Т.В., Васильев С.А., Мензоров А.Г., Кашеварова А.А., Чурилова А.В., Гридина М.М., Беляева Е.О., Лебедев И.Н. Гены и клетки, 2017, 2017;12(3):177
|
|
| Нарушение экспрессии аллелей гена CNTN6 в нейронах, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток пациента с 3p26.3 микродупликацией Гридина М.М., Матвеева Н.М., Фишман В.С., Мензоров А.Г., Кизилова Е.А., Ковригин И.И., Пристяжнюк И.Е., Никитина Т.В., Кашеварова А.А., Скрябин Н.А., Назаренко Л.П., Лебедев И.Н., Серов О.Л. Гены и клетки, 2017, 12(3):76-77
|
|
| Установление границ хромосомных перестроек у пациентов с микроделециями и микродупликациями 3p26.3 Гридина М.М., Шнайдер Т.А., Ковригин И.И., Мензоров А.Г., Фишман В.С. Acta Naturae, 2017, 9(1):84
|
|
| Identical phenotypes of inherited reciprocal chromosomal microdeletions and microduplications are explained by similar expression levels of genes affected by CNVs Lebedev I.N., Gridina M.M., Menzorov A.G., Matveeva N.M., Pristyazhnyuk I.E., Shnaider T.A., Nazarenko L.P., Skryabin N.A., Nikitina T.V., Sazhenova E.A., Kashevarova A.A., Serov O.L. Mol Cytogen, 2017, 10(Suppl 1):1.P15
|
|
| 2016 | Erratum to: comparison of the three-dimensional organization of sperm and fibroblast genomes using the Hi-C approach Nariman Battulin, Veniamin S Fishman, Alexander M Mazur, Mikhail Pomaznoy, Anna A Khabarova, Dmitry A Afonnikov, Egor B Prokhortchouk, Oleg L Serov GENOME BIOL, 2016
|
| 2010 | Dominance of parental genomes in embryonic stem cell/fibroblast hybrid cells depends on the ploidy of the somatic partner Kruglova A.A., Matveeva N.M., Gridina M.M., Battulin N.R., Karpov A., Kiseleva E.V., Morozova K.N., Serov O.L. CELL TISSUE RES, 2010, V. 340, 437-450.
|
| 2005 | Видимая и «скрытая» сегрегация родительских хромосом в эмбриональных стволовых гибридных клетках Пристяжнюк И.Е., Темирова С.А., Мензоров А.Г., Круглова А.А., Матвеева Н.М., Серов О.Л. RUSS J DEV BIOL+, 2005, Онтогенез. 2005. Т. 36(2):151-8.
|
Монографии
| 2021 | Практическая молекулярная генетика для начинающих: 8–9-е классы. Аульченко Ю.С., Баттулин Н.Р., Бородин П.М., Воронина Е.Н., Карташов М.Ю., Колесникова Т.Д., Нижников А.А., Пилипенко А.С., Посух О.В., Седых С.Е., Соловьев В.И., Торгашева Н.А., Фишман В.С., Хлесткина Е.К., Цыбко А.С., Шнайдер Т.А., Юнусова А.М.
|
Конференции
| 2024 | ИСПОЛЬЗОВАНИЕ СИСТЕМЫ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА CRISPR/CAS9 ДЛЯ СОЗДАНИЯ ЛИНИЙ ЭС КЛЕТОК МЫШИ С ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ ЗАМЕНОЙ КОМПЛЕКСА КОГЕЗИНА НА КОМПЛЕКС КОНДЕНСИНА II В ИНТЕРФАЗЕ А.М. Юнусова, Т.А. Шнайдер, А.В. Смирнов, Н.Р. Баттулин. Congress CRISPR-2023
|
| Tissue-specific effect of the TADs border disruption on the Kdr gene expression E.Kabirova, A.Ryzhkova, V.Lukyanchikova, A.Khabarova, N.Battulin Cold Spring Harbor Asia «Chromatin, Epigenetics & Transcription»
|
|
| Differential gene expression in degenerative lumbar discs from the Russian disc degeneration study (RuDDS) biobank Aleksandr Tiapkin, Artemii Ivanov, Olga Leonova, Aleksandr Krutko, Alexey Peleganchuk, Veniamin Fishman, Elizaveta Elgaeva, Yakov Tsepilov European Human Genetics Conference ESHG Hybrid Conference 2024. Berlin, Germany. 2024
|
|
| Cohesin degradation effect on mechanical properties of human colon tumor cells Kabirova E., Yunusova A., Khabarova A., Battulin N. BGRS/SB-2024: 14th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
|
|
| 2023 | Изучение синдрома Коэна на основе пациент-специфичных иПСК с мутацией в гене СОН1 Т.А. Шнайдер, К.Н. Морозова, А.А. Хабарова, С. Чечеткина, A. Чвилева, A. Юнусова, Е. Вольф, Е.В. Киселева, И.Е. Пристяжнюк. Международный конгресс CRISPR-2023
|
| Complex of disturbances in the intracellular organization of neurons differentiated from fibroblasts of patients with Cohen's syndrome Морозова К.Н. Шнайдер Т.А., Хабарова А.А., Чечеткина С., Чвилева A., Юнусова A., Вольф Е., Киселева Е.В., Пристяжнюк И.Е. Chromosome-2023
|
|
| Исследование роли комплексов конденсинов в поддержании пространственной структуры генома эмбриональных стволовых клеток мыши А.М. Юнусова, Т.А. Шнайдер, М.А. Нуриддинов, Н.Р. Баттулин. еждународная конференция по структуре и организации хромосом и геномов «Хромосома 2023»
|
|
| Взаимосвязь регуляции генов с 3D архитектурой генома на модели локуса Kit/Kdr мыши Кабирова Э.М., Рыжкова А.С., Лукьянчикова В.А., Хабарова А.А., Баттулин Н.Р. INTERNATIONAL CONFERENCE CHROMOSOME 2023
|
|
| АРХИТЕКТУРНЫЕ БЕЛКИ ХРОМАТИНА КОГЕЗИН И КОНДЕНСИНЫ УЧАСТВУЮТ В ПОДДЕРЖАНИИ СТАБИЛЬНОСТИ ГЕНОМА Баттулин Н., Смирнов А., Юнусова А., Хабарова А., Рыжкова А., Кабирова Э. INTERNATIONAL CONFERENCE CHROMOSOME 2023
|
|
| 2022 | Получение ИПСК из фибробластов пациентки с микроделецией Xq24 А.Г. Мензоров, И.Е. Пристяжнюк Н.И. Мещеряков, Т.В. Никитина, Е.Н. Толмачева, Л.И. Минайчева, Л.П. Назаренко, И.Н. Лебедев V Национальный конгресс по регенеративной медицине
|
| Электронно-микроскопический анализ фибробластов пациента с синдромом Коэна. Морозова К.Н. Пристяжнюк И.Е., Хабарова А.А., Шнайдер. Т.А.1, Киселева Е.В. XXIX Российская конференция по электронной микроскопии.
|
|
| Pluripotent stem cell lines from two patients with COH1 gene mutations as the valuable in vitro model of Cohen syndrome. Shnaider T., Khabarova A., Morozova K., Kiseleva E., Vladimirova E., Chechetkina S., Chvileva A., Smirnova A., Larina D., Pristyazhnyuk I. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
|
|
| DIFFERENTIAL EXPRESSION OF EXTRACELLULAR MATRIX-RELATED GENES IN TISSUE OF
STABLE AND UNSTABLE ATHEROSCLEROTIC PLAQUES Elena Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya I. Ragino, Yana V. Polonskaya, Elena V. Kashtanova, Alexandr Chernyavsky, Ivan Murashov, Mikhail Voevoda 90th EAS Congress 2022, 20-25 мая 2022
|
|
| Influence of TADs boundary disruption on 3D genome
organisation and genes expression at the mouse
Pdgfra/Kit/Kdr locus Kabirova E., Lukyanchikova V., Ryzhkova A., Khabarova A., Battulin N. BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
|
|
| 3D organization of the genome tissue-specifically regulates activity of the development genes Pdgfra, Kit, Kdr in mouse Kabirova E., Lukyanchikova V., Ryzhkova A., Khabarova A., Battulin N. ISCOMS 2022 "29th International Student Congress Of (bio)Medical Sciences"
|
|
| 2021 | Analysis of the variants of the F5 gene in men with coronary atherosclerosis Striukova E.V., Shakhtshneider E., Ivanoshchuk D., Ragino Y.I., Polonskaya Y.V., Murashov I.S., Volkov A.M., A.V.Kurguzov, Chernyavsky A., Valeev E., Maksimov V.N., Kashtanova E.V. 89 EAS Congress 2021
|
| 2020 | Web-3DPredictor: a web interface for high-resolution prediction of genome architecture Emil Valeev, Polina Belokopytova, Veniamin Fishman BGRS\SB-2020
|
| RNA-Seq Transcriptome Analysis of Stable and Unstable Atherosclerotic Plaques Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Elena Kashtanova, Yana Polonskaya, Alexander Chernyavsky, Ivan Murashov, Mikhail I. Voevoda 88 EAS CONGRESS
|
|
| Analysis of differential expression of the cytokine/chemokine genes in tissue of stable and unstable atherosclerotic plaques Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Yana Polonskaya, Elena Kashtanova, Alexander Chernyavsky, Ivan Murashov, Mikhail I. Voevoda 88 EAS CONGRESS
|
|
| Analysis of rare variants in genes related to aberrations of lipid metabolism in patients with coronary atherosclerosis Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Yana Polonskaya, Elena Kashtanova, Alexander Chernyavsky, Mikhail I. Voevoda 88 EAS CONGRESS
|
|
| Analysis of rare variants in genes related to aberrations of lipid metabolism in patients with coronary atherosclerosis Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Yana Polonskaya, Elena Kashtanova, Alexander Chernyavsky, Mikhail I. Voevoda 88 EAS CONGRESS
|
|
| Новый вариант делеции в гене GCK у пациента с диабетом MODY типа 2 Иванощук Д.Е., Овсянникова А.К., Валеев Э.С., Михайлова С.В., Рымар О.Д., Шахтшнейдер Е.В. Фундаментальные исследования в эндокринологии: современная стратегия развития и технологии персонализированной медицины
|
|
| Polymorphism of the APPL1 gene in patients with carbohydrate metabolism disorders D. Ivanoshchuk, E. Shakhtshneider, A. Ovsyannikova, S. Mikhailova, P. Orlov, O. Rymar, V. Fishman, Y. Ragino,M.I. Voevoda EAS Congress 2020, virtual congress
|
|
| X-chromosome Inactivation in American Mink iPSC Pristyazhnyuk I., Menzorov A. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020) The Twelfth International Multiconference
|
|
| Rescue of the karyotype with ring chromosome 8 in human induced pluripotent stem cells T. V. Nikitina, M. M. Gridina, Y. M. Minina, A. A. Kashevarova, Y. S. Yakovleva, D. A. Fedotov, M. E. Lopatkina, S. A. Vasilyev, O. L. Serov, I. N. Lebedev 53rd Conference of the European-Society-of-Human-Genetics (ESHG) - Virtual Conference
|
|
| 2019 | Изучение роли гена CNTN6 в ранних этапах нейрогенеза человека на модели церебральных органоидов” Татьяна Александровна Шнайдер Олег Леонидович Серов IV Национальный конгресс по регенеративной медицине
|
| Predicting pathological promoter-enhancer rewiring in chromosomal rearrangements V. Fishman, P. Belokopytova, P. Salnikov, D. Fishman BGRS 2018
|
|
| Скрининг редких замен в генах, вовлеченных в дисгенез угла передней камеры глаза у пациентов с врожденной глаукомой В.С. Фишман, Э.С. Валеев, П.С. Белокопытова, О.В. Фенькова, С.В. Михайлова, А.Ж. Фурсова, М.И. Воевода, Д.Е. Иванощук Научно-практическая конференция с международным участием «Генетика — фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции»
|
|
| Идентификация мутаций в генах MYOC, WDR36, OPTN, LTBP2 и ТЕК у пациентов с врожденной глаукомой Д.Е. Иванощук, О.В. Фенькова, С.В. Михайлова, П.С. Белокопытова, В.С.Фишман, Е.В. Шахтшнейдер, Ф.Ж. Фурсова, М.И. Воевода VI съезд биохимиков России и IX российский симпозиум "белки и пептиды"
|
|
| Происхождение и судьба масштабных хромосомных перестроек, индуцированных технологией CRISPR/Cas9 у мышей: от зигот до соматических клеток Алексей Николаевич Кораблев, Инна Евгеньевна Пристяжнюк, Юлия Михайловна Минина, Ирина Александровна Серова, Вениамин Семенович Фишман, Мария Михайловна Гридина, Timofey Rozhdestvensky, Leonid Gubar, Boris Skryabin, Олег Леонидович Серов IV Национальный конгресс по регенеративной медицине
|
|
| АНАЛИЗ КОРРЕЛЯЦИИ ДАННЫХ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК С ПРОТЕОМНЫМИ МАРКЕРАМИ В СТАБИЛЬНЫХ И НЕСТАБИЛЬНЫХ АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШКАХ КОРОНАРНЫХ АРТЕРИЙ Шахтшнейдер Е.В., Рагино Ю.И., Иванощук Д.Е., Каштанова Е.В., Фишман В.С., Полонская Я.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И. I Всероссийский Конгресс «Физиология и тканевая инженерия сердца и сосудов:от клеточной биологии до протезирования»
|
|
| ТАРГЕТНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНОВ LDLR, APOB, PCSK9, LDLRAP1 И КЛАСТЕРА ГЕНОВ APOA5-A4-C3-A1 У ПАЦИЕНТОВ С СЕМЕЙНОЙ ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИЕЙ Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Фишман В.С., Белокопытова П.С., Орлов П.С., Тимощенко О.В., Воевода М.И. I Всероссийский конгресс с международным участием "Физиология и тканевая инженерия сердца и сосудов: от клеточной биологии до протезирования"
|
|
| ANALYSIS OF DIFFERENTIAL EXPRESSION OF MATRIX METALLOPROTEINASES GENES IN STABLE AND UNSTABLE ATHEROSCLEROTIC PLAQUES E. Shakhtshneider, D. Ivanoshchuk, S. Mikhailova, V. Fishman, Y. Ragino, Y. Polonskaya, E. Kashtanova, A. Chernyavsky, I. Murashov, M. Voevoda EAS 2019, Maastricht: 87th EAS Congress87th EAS Congress
|
|
| 2018 | Динамика нестабильности кольцевых хромосом при репрограммировании соматических клеток Никитина Т.В., Васильев С.А., Распопова М.А., Мензоров А.Г., Кашеварова А.А., Хабарова А.А., Гридина М.М., Яковлева Ю.С., Лебедев И.Н. Международная конференция Хромосома 2018
|
| Анализ экспрессии гена CNTN6 в нейронах, полученных из ИПСК пациентов с 3p26.3 микродупликацией и микроделецией и задержкой умственного развития. М.М. Гридина, Н.М. Матвеева, А.Г. Мензоров, Т.А. Шнайдер, Л.П. Назаренко, И.Н. Лебедев, О.Л. Серов. V Международная конференция ПОСТГЕНОМ’2018 «В поисках моделей персонализированной медицины»
|
|
| Получение мышей с хромосомными перестройками гена CNTN6 при помощи CRISPR/CAS9 технологии и их характеристика Кораблев А.Н., Пристяжнюк И.Е., Минина Ю.М., Серова И.А., Фишман В.С., Рождественский Т.С, Губарь Л, Скрябин Б.В., Серов О.Л. Международный конгресс "CRISPR-2018"
|
|
| 2017 | Targeted modification of topological domains in mice Veniamin Fishman, Varvara Lukyanchikova, Oleg Serov, Nariman Battulin 25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus
|
| Analysis of chicken chromatin structure using Hi-C data. Nuriddinov M.A., Fishman V.S., Battulin N.R., Maslova A.V., Serov O.L., Krasikova A.V. BELYAEV CONFERENCE
|
|
| THE CHICKEN HI-C DATA REVEAL THE RELATIONS BETWEEN THE LOCAL GENOME PROPERTIES AND THE CHROMOSOME ARCHITECTURE Nuriddinov M.A., Fishman V.S., Battulin N.R., Maslova A.V., Serov O.L., Krasikova A.V. II Всероссийская конференция с международным участием «Высокопроизводительное секвенирование в геномике»
|
|
| Получение химерных мышей путем инъекции эмбриональных стволовых клеток в бластоцисту на базе Центра генетических ресурсов лабораторных животных ИЦиГ СО РАН Концевая Г.В., Феофанова Н.А., Мензоров А.Г., Пристяжнюк И.Е., Смирнов А.В., Баттулин Н.Р., Герлинская Л.А. 6-ая научно-практическая конференция Rus-LASA
|
|
| Нарушение экспрессии аллелей гена CNTN6 в нейронах, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток пациента с 3p26.3 микродупликацией Гридина М.М., Матвеева Н.М., Фишман В.С., Мензоров А.Г., Кизилова Е.А., Ковригин И.И., Пристяжнюк И.Е., Никитина Т.В., Кашеварова А.А., Скрябин Н.А., Назаренко Л.П., Лебедев И.Н., Серов О.Л. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
|
|
| Изучение инактивации Х-хромосом в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках американской норки Пристяжнюк И.Е., Мензоров А.Г. Конференция с международным участием «Клеточная биология: проблемы и перспективы»
|
|
| Получение ИПСК с кольцевыми хромосомами и анализ их стабильности в соматических и плюрипотентных клетках Никитина Т.В., Васильев С.А., Мензоров А.Г., Кашеварова А.А., Чурилова А.В., Гридина М.М., Беляева Е.О., Лебедев И.Н. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
|
|
| Identical phenotypes of inherited reciprocal chromosomal microdeletions and microduplications are explained by similar expression levels of genes affected by CNVs Lebedev IN, Gridina MM, Menzorov AG, Matveeva NM, Pristyazhnyuk IE, Shnaider TA, Nazarenko LP, Skryabin NA, Nikitina IV, Sazhenova EA,Kashevarova AQA, Serov OL Meeting abstracts from the 11th European Cytogenetics Conference
|
|
| Установление границ хромосомных перестроек у пациентов с микроделециями и микродупликациями 3p26.3 Гридина М.М., Шнайдер Т.А., Ковригин И.И., Мензоров А.Г., Фишман В.С. II Всероссийская конференция с международным участием «Высокопроизводительное секвенирование в геномике»
|
|
| 2005 | Характеристика ядерного и митохондриального геномов во внутри- и межвидовых эмбриональных стволовых гибридных клетках мыши Мензоров А.Г., Круглова А.А., Темирова С.А., Серов О.Л. VI международная конференция по молекулярной генетике соматических клеток
|
| 2004 | Сегрегация хромосом и митохондрий в межвидовых эмбриональных гибридных клетках мыши Мензоров А.Г., Круглова А.А., Матвеева Н.М., Серов О.Л. 3-й съезд ВОГиС
|
| 2003 | Использование микросателлитов для идентификации родительских хромосом в эмбриональных гибридных клетках Мензоров А.Г., Круглова А.А., Шилов А.Г., Матвеева Н.М. Вторая интеграционная междисциплинарная конференция молодых ученых СО РАН и высшей школы
|
Гранты
| 2024 | Развитие коллекции культур клеток позвоночных в качестве базового депозитария российской коллекции типовых культур (RTCC) для обеспечения национальной технологической независимости и биобезопасности Министерство образования и науки Российской Федерации, номер гранта 075-15-2021-1063/10 от 27.04.2024
|
| 2023 | Исследование роли HAR, локализованных в гене CNTN6, в ранних этапах нейрогенеза человека на модели 3D церебральных органоидов РНФ, номер гранта 24–24-00447
|
| 2021 | Развитие коллекции культур клеток позвоночных в качестве базового депозитария российской коллекции типовых культур (RTCC) для обеспечения национальной технологической независимости и биобезопасности Министерство науки и высшего образования РФ, номер гранта 075-15-2021-1063
|
| 2020 | Популяционный анализ трехмерной организации промоторных районов генов человека РФФИ, номер гранта 20-34-90110
|
| Структура, функции и эволюция мейотических хромосом птиц РНФ, номер гранта 20-64-46021
|
|
| Оценка уровня трисомии хромосомы 6 и механизмы ее возникновения в соматических клетках мышей-носителей масштабных делеций, дупликаций и инверсий, полученных с помощью технологии CRISPR/Cas9 РФФИ, номер гранта 20-04-00463 А
|
|
| 2019 | Изучение механизмов нарушения нейрогенеза вызванных мутациями в гене CNTN6 на модели трехмерных церебральных органоидов РФФИ, номер гранта 19-29-04067 мк
|
| Изучение механизмов нарушения нейрогенеза вызванных мутациями в гене CNTN6 на модели трехмерных церебральных органоидов. РФФИ, номер гранта 19-29-04067 мк
|
|
| Топологически-ассоциированные домены хроматина и А/В-компартменты в геноме курицы: идентификация и визуализация с помощью технологии HiC и микроскопии сверхвысокого разрешения РНФ, номер гранта 19-74-20075
|
|
| Разработка нового подхода к молекулярной диагностике хромосомных болезней человека на основе комбинации технологий захвата конформации хромосом и массового параллельного секвенирования РФФИ, номер гранта 18-29-13021 мк
|
|
| Исследование роли конденсинов в поддержании трехмерной архитектуры интерфазного ядра плюрипотентных клеток РФФИ, номер гранта 19-04-00840
|
|
| 2018 | Разработка нового подхода к молекулярной диагностике хромосомных болезней человека на основе комбинации технологий захвата конформации хромосом и массового параллельного секвенирования, РФФИ, номер гранта №18-29-13021
|
| Исследование роли пространственной организации генома в регуляции активности генов на примере локуса Pdgfra/Kit/Kdr, с использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9 РФФИ, номер гранта 18-29-07022 мк
|
|
| Исследование реорганизации 3D архитектуры генома в процессе терминальной дифференцировки эритробластов мыши РФФИ, номер гранта 18-04-00668 А
|
|
| 2017 | Реконструкция хромосомной организации геномов млекопитающих и новый взгляд на хромосомную эволюцию Российский Фонд Фундаментальных Исследований, номер гранта 17-00-00147
|
| Направленная модификация генома для исследования роли пространственной архитектуры ядра в развитии патологий РНФ, номер гранта 17-74- 10143
|
|
| 2012 | Роль клеточного деления при трансдифференцировке фибробластов в нейроны РФФИ, номер гранта 12-04-31345
|
| Наследование способности к репрограммированию в клеточных делениях РФФИ, номер гранта 12-04-31490
|
|
| Исследование трехмерной организации генома половых и соматических клеток методом Hi-C ФЦП Кадры, номер гранта №2012-1.2.1-12-000-1013-014
|
Научное руководство
| 2024 | Создание и характеристика клеточной линии на основе Phoenix для функционального анализа вариантов в гене VPS13B, ассоциированных с синдромом Коэна Вольф Екатерина Романовна 2024-06-13
|
| 2022 | Получение и характеристика линий индуцированных плюрипотентных стволовых клеток из фибробластов кожи пациента с компаунд-гетерозиготной мутацией в гене COH1 (синдромом Коэна) Владимирова Елена Владимировна Генетика, 2022-06-06
|
| 2021 | ИНДУКЦИЯ ХРОМОСОМНЫХ ПЕРЕСТРОЕК В КЛЕТКАХ ЛИНИИ HAP1 С ПОМОЩЬЮ СИСТЕМЫ CRE/LOXP ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ИХ ВЛИЯНИЯ НА ФУНКЦИОНИРОВАНИЕ ГЕНОМА Кокшарова Галина Сергеевна 2021-05-31
|
| 2019 | Разработка и экспериментальная валидация модели для предсказания пространственных контактов хроматина на основе эпигенетических характеристик геномов мыши и человека Блокопытова Полина Станиславовна Биология, 2019-06-15
|
| Использование системы Cre-LoxP для индукции множественных хромосомных перестроек в геноме клеток человека Мунгалов Роман Владимирович 2019-06-08
|
|
| 2018 | УВЕЛИЧЕНИЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ВНЕСЕНИЯ КРУПНОМАСШТАБНЫХ ГЕНОМНЫХ ДЕЛЕЦИЙ ЗА СЧЕТ НАПРАВЛЕННОГО РЕМОДЕЛИНГА АРХИТЕКТУРЫ ХРОМАТИНА Сальников Павел Александрович 2018-06-08
|
Учебные курсы
| 2017 | ГМО: технологии создания и применение Баттулин НР, Фишман ВС, Мензоров АГ НГУ, ФЕН, семестров: 1
|
|
© 2010-2024 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены. | |