Особенности формирования молекулярно-генетических механизмов метаболических нарушений и наследственных заболеваний у жителей Северной Азии и разработка новых подходов к их коррекции
Основной целью исследования является изучение особенностей формирования молекулярно-генетических механизмов метаболических нарушений и некоторых редких заболеваний у жителей Северной Азии в исторической перспективе и разработка новых подходов к коррекции их нарушений. Для достижения цели предполагается решения ряда взаимосвязанных задач, таких как выявление процессов формирование генетического состава (т.е. особенностей структуры генофонда) населения в период его существования в регионе (по филогенетически информативным локусам), исследование механизмов адаптации населения к условиям региона на молекулярно-генетическом уровне (эволюция адаптативно значимых локусов генома), молекулярно-генетические механизмы приспособления населения региона к меняющимся социально-экономическим и культурным составляющим развития сообществ человека в регионе.
В плане изучения молекулярно-генетических основ глухоты в популяциях Сибири будет проведен сопоставительный анализ спектра и частоты встречаемости мутаций гена GJB2 (Сх26) в полиэтничном населении Сибири и выявление факторов, определяющих закономерности их распространенности. Генетический анализ случаев наследуемой врожденной глухоты неясной этиологии и поиск новых локусов (генов), ассоциированных с потерей слуха, с привлечением современных методов полногеномного анализа. Полученные данные внесут вклад в понимание молекулярно-генетических механизмов наследуемых форм глухоты, закономерностей их распространенности в популяциях Сибири и будут актуальны для разработки оптимальной методологии молекулярной диагностики данной патологии.
С целью поиска новых подходов к коррекции метаболических нарушений предполагается воздействовать одновременно на экспрессию нескольких белков, участвующих в конкретном метаболическом пути (синтез холестерина) и изучить возможности нового подхода. Задача не имеет аналогов, так как структуры олигонуклеотидных производных должны допускать возможность одновременного воздействия. Преимуществом предлагаемого подхода, что и делает его актуальным, являются то, что олигонуклеотидные производные, в отличие от низкомолекулярных препаратов, преимущественно накапливаются в почках и печени и минуют систему цитохрома Р450.
3. Прикладные разработки
Разработка новых медицинских технологий в области геномной медицины.
4. Иллюстрированное описание лучших результатов, полученных подразделением за последние 5 лет
Впервые в России проведена проверка ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП), идентифицированных в недавних зарубежных полногеномных исследованиях, на пригодность в качестве маркеров риска развития инфаркта миокарда. Воспроизведены результаты полногеномных исследований по ассоциациям ОНП rs619203, rs499818, rs1333049 и rs10757278 с инфарктом миокарда и факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний для популяции русских г. Новосибирска. Для ОНП rs28711149, rs1376251, rs2549513, rs4804611, rs17465637 такие ассоциации не обнаружены.
Оценено генетическое разнообразие гена HFE в популяциях России и показана его информативность в качестве биомаркера для реконструкции картины формирования структуры современных популяций в северной части Евразии. Из палеогенетических исследований следует, что население Горного Алтая в период позднего неолита и начала I тыс. до н. э. было представлено, главным образом, носителями западноевразийских гаплотипов мтДНК, в основном гаплогруппы Н с гетерогенным составом ее вариантов. Проникновение в регион мигрантов с восточноевразийскими гаплотипами мтДНК началось в I тыс. до н. э. и коррелировало с распространением кочевого животноводства. Показано отсутствие в Барабинской лесостепи в период энеолита (IV тыс. до н. э.) и до конца II тыс. до н. э. носителей гаплогруппы Н мтДНК, распространенной среди современного населения региона. Их появление зафиксировано в начале I тыс. до н. э. Контекстным анализом структуры ДНК в местах локализации полиморфизмов IVS2(+4)t/c, IVS4(-44)t/c, IVS5(-47)a/g гена HFE определена их потенциальная функциональная значимость на разных этапах формирования сплайсосомы в ходе процессинга пре-мРНК.
Изучено распространение 23-х ОНП в генах семейства 2′-5′-олиго-аденилатсинтетаз (OAS1, OAS2, OAS3 и OASL) у жителей г. Новосибирска, перенесших клещевой энцефалит, и в популяционном контроле. Обнаружена ассоциация 5 ОНП генов OAS2 и OAS3 с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита.
Показано наличие достоверных различий частот аллелей и генотипов по замене G на A в позиции 15 от начала первого интрона гена TNFalpha у здоровых коров черно-пестрой породы и инфицированных вирусом лейкоза по данным серологической диагностики. Оказалось, что частоты генотипов и аллелей этого маркера существенно различаются в выборках животных, инфицированных вирусом или находящихся на различных стадиях заболевания лейкозом.
Совместно с ФГБУ «НИИ терапии» СО РАМН сформирован крупнейший в России популяционный банк генетических материалов жителей нашей страны на базе международного эпидемиологического проекта HAPIEE, создающий основу для широкомасштабных молекулярно-генетических исследований. Ведётся наблюдение с помощью регистров инсульта, инфаркта миокарда, общей смертности за судьбой лиц прошедших через скрининг. Формируются коллекции образцов ДНК ряда фенотипов (наследственные нарушения ритма, гипертрофическая кардиомиопатия, внезапная сердечная смерть, врождённые пороки сердца и др.) Постоянно ведётся работа по пополнению банка ДНК коренных народностей Западной и Восточной Сибири, Дальнего Востока, Центральной Азии.
Впервые в России проведена проверка ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП), идентифицированных в недавних зарубежных полногеномных исследованиях, на пригодность в качестве маркеров риска развития сахарного диабета 2-го типа и артериальной гипертензии. Для сахарного диабета второго типа обнаружены ассоциации ОНП rs7903146 в гене TF7L2 и rs10811661 в гене CDKN2A/B, не выявлены ассоциации для ОНП rs9939609 в гене FTO и rs2237892 в гене KCNQ1.
Подтверждена ассоциация rs699 и rs5068 с артериальной гипертензией у мужчин. rs2681492 ассоциирован с систолическим и пульсовым АД и частотой сердечных сокращений. Носители разных генотипов rs4343 значимо отличаются по среднему уровню индекса атерогенности, индекса массы тела и отношению талия/бёдра.
Выполнена проверка ассоциации 28 ОНП с внезапной сердечной смертью (ВСС). В общей группе с ВСС ассоциированы rs10757278 (рис. 1), rs1333049. У мужчин до 50 лет ассоциирован с ВСС rs3010396 гена CASQ2 и ID полиморфизм гена ADRA2B (рис. 2). У мужчин ассоциирован с ВСС rs2228314 гена SREBF2 (рис. 3). У женщин старше 50 лет - rs499818. У мужчин старше 50 лет ассоциирован с ВСС rs187238 гена IL18, rs3864180 гена GPC5, rs1010 гена VAMP8. Из 28 исследованных генетических маркёров ассоциация с внезапной сердечной смертью подтверждена для 12. Генетические маркёры ВСС, найденные в зарубежных ассоциативных исследованиях необходимо проверять на российской популяции.
Изучен спектр мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в европеоидной популяции России у лиц с гиперхолестеринемией. Выявлены 7 ранее неизвестных мутаций в экзонах 9 и 12. Найдено 12 ранее описанных для других популяций мира мутаций в экзонах 2, 5, 6, 8, 9, и 11. Только одна из этих мутаций ранее была описана в России в клинической выборке пациентов с семейной гиперхолестеринемией. Показано, что в России спектр мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в популяционной выборке пациентов с гиперхолестеринемией значительно отличается от спектра мутаций пациентов с семейной гиперхолестеринемией (клинические выборки).
Впервые показана ассоциация полиморфизма гена холодового рецептора TRPM8 с рядом заболеваний человека и их факторами риска. Впервые продемонстрирована его ассоциация с показателями, характеризующими термочувствительность.
Рисунок 1
Рисунок 2
Рисунок 3
Совместно с сотрудниками Института археологии и этнографии СО РАН (координатор программ – академик В.И. Молодин) сформированы репрезентативные коллекции палеоантропологических образцов от представителей древнего населения Сибири различной этнокультурной и хронологической принадлежности – с эпохи неолита (VI–V тыс. до н. э.) до позднего средневековья (XVI–XVII в. н. э.). Проведено исследование разнообразия линий митохондриальной ДНК (мтДНК) в генофондах населения лесостепной полосы Западной Сибири (Барабинская лесостепь и прилегающие территории) эпохи неолита и различных периодов эпохи бронзы (VI – начало I тыс. до н. э.) (рис.). Высокая репрезентативность изученного материала (~ 200 образцов мтДНК) позволила реконструировать динамику состава генофонда мтДНК населения региона на протяжении пяти тысячелетий. Определены компоненты генофонда, свойственные наиболее ранним группам населения и маркирующие генетическую преемственность разновременных групп (варианты гаплогрупп А, С, Z, U5a). Реконструирована последовательность появления в генофонде новых для региона гаплогрупп мтДНК (гаплогруппы T, H). Комплексный междисциплинарный характер исследований (тесная интеграция палеогенетических, археологических и антропологических исследований) позволил связать изменения состава генофонда мтДНК исследованных групп с предполагаемыми демографическими и этнокультурными процессами, протекавшими в Западной Сибири в обозначенный период. Установлено, что в периоды неолита и ранней бронзы (VI–III тыс. до н. э.) доминировала преемственность в структуре генофонда мтДНК между разновременными этнокультурными группами. Значительные изменения состава линий мтДНК в генофондах произошли в результате крупных миграционных потоков в регион в периоды развитой (II тыс. до н. э.) и финальной бронзы (начало I тыс. до н. э.). Таким образом, впервые методами палеогенетики на репрезентативном материале реконструированы генетические аспекты формирования древнего населения обширного региона (западносибирской лесостепи) на протяжении длительного периода времени (около пяти тысячелетий).
5. Задачи, планируемые на перспективу
Расшифровка структуры генетической предрасположенности к заболеваниям человека на основе полногеномномного анализа.
Разработка персонифицированных подходов к профилактике и лечению заболеваний человека на основе геномной информации.
Этноспецифический и палеогенетический полногеномный анализ геномов древнего и современного населения Евразии.
Совершенствование подходов к селекции сельскохозяйственных животных на основе геномной информации.
Diagnosis of Familial Hypercholesterolemia in Children and Young Adults Olga Timoshchenko, Dinara Ivanoshchuk, Sergey Semaev, Pavel Orlov, Valentina Zorina, Elena Shakhtshneider INT J MOL SCI, 2024, 25(1), 314
Brain-Region-Specific Genes Form the Major Pathways Featuring Their Basic Functional Role: Their Implication in Animal Chronic Stress Model. Babenko V., Redina O., Smagin D., Kovalenko I., Galyamina A., Kudryavtseva N. INT J MOL SCI, 2024, 25(5):2882
Ассоциация вариантов генов АРОЕ, СЕТР и хромосомного региона 9Р21.3 с ишемической болезнью сердца, инфарктом миокарда и острой сердечной недостаточностью Семаев С.Е., Щербакова Л.В., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Малютина С.К., Гафаров В.В., Воевода М.И., Рагино Ю.И., Шахтшнейдер Е.В. Атеросклероз, 2024, 20(2):121-135
GCK-MODY у молодых мужчин: значение поведенческих и кардиометаболических факторов риска в развитии осложнений Рымар О.Д., Галенок Р.Б., Иванощук Д.Е., Долинская Ю.А., Дудина М.В., Каширина А.П., Овсянникова А.К., Мельникова П.М., Смолеусова В.Г., Шахтшнейдер Е.В. Доктор.Ру., 2024, Том 23, № 4, стр. 60-66
Сравнение наборов для измерения концентрации ДНК
методом флюоресценции на нижней границе
диапазона измерений П.С. Орлов, О.П. Хрипко, Т.C. Кокорина, М.И. Воевода Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, N3 ТОМ 10 страницы 42-46
Rare Variants Of Obesity-Associated Genes In Young Adults With Abdominal Obesity Bairqdar A., Shakhtshneider E., Ivanoshchuk D., Mikhailova S., Kashtanova E., Shramko V., Polonskaya Ya.V., Ragino Y.I. J. Pers. Med, 2023, 13(10), 1500
Searching for new genes associated with the familial hypercholesterolemia phenotype using whole-genome sequencing and machine learning D.E. Ivanoshchuk, A.B. Kolker, O.V. Timoshchenko, S.E. Semaev, E.V. Shakhtshneider Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, Том 27/ Номер 5. Страницы 522-529
Prevalence of Common Alleles of Some Stress Resilience Genes among Adolescents Born in Different Periods Relative to the Socioeconomic Crisis of the 1990s in Russia Mikhailova, S.V.; Ivanoshchuk, D.E.; Yushkevich, E.A.; Bairqdar, A.; Anisimenko, M.S.; Shcherbakova, L.V.; Denisova, D.V.; Orlov, P.S. CURR ISSUES MOL BIOL, 2023, 2023, 45(1), 51-65
СИГНАЛЫ НАПРАВЛЕННОГО ОТБОРА В ПОПУЛЯЦИЯХ КОРЕННОГО НАСЕЛЕНИЯ СИБИРИ Колесников Н.А., Харьков В.Н., Зарубин А.А., Воевода М.И., Губина М.А., Штыгашева О.В., Максимова Н.Р., Сухомясова А.Л., Степанов В.А. Генетика, 2023, 2022. Т. 58. № 4. С. 473-477.
Leukocyte telomere length and mitochondrial DNA copy number association with colorectal cancer risk in an ageing population Malyutina S.K., Maximov V.N., Chervova O., Orlov P., Voloshin V., Ryabikov A.N., Voevoda M.I,, Nikitenko T.M. Global Translational Medicine, 2023, 2(1):184
The Mutation Spectrum of Rare Variants in the Gene of Adenosine Triphosphate (ATP)-Binding Cassette Subfamily C Member 8 in Patients with a MODY Phenotype in Western Siberia Dinara Ivanoshchuk, Elena Shakhtshneider, Svetlana Mikhailova, Alla Ovsyannikova, Oksana Rymar, Emil Valeeva, Pavel Orlov, Mikhail Voevoda J. Pers. Med, 2023, 13(2), 172
Effects of Positive Fighting Experience and Its Subsequent Deprivation on the Expression Profile of Mouse Hippocampal Genes Associated with Neurogenesis Redina O.E., Babenko V.N., Smagin D.A., Kovalenko I.L., Galyamina A.G., Efimov V.M., Kudryavtseva N.N. INT J MOL SCI, 2023, Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 3040
Functionally Significant Variants in Genes Associated with
Abdominal Obesity: A Review Bairqdar A., Ivanoshchuk D., Shakhtshneider E. J. Pers. Med, 2023, 13, 460
Elucidation of the Landscape of Alternatively Spliced Genes and Features in the Dorsal Striatum of Aggressive/Aggression-Deprived Mice in the Model of Chronic Social Conflicts. Babenko, V. Redina, O. Smagin, D. Kovalenko, I. Galyamina, A. Kudryavtseva, N. Genes, 2023, 14:599
Анализ ассоциации вариантов генов аполипопротеинов APOA2, APOA5 и APOH с гиперлипидемией С. В. Михайлова, Д. Е. Иванощук, Н. С. Широкова, П. С. Орлов, А. Бейркдар, Е. В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2023, Том 19, № 1 (2023), С. 6-18
Insight into the Natural History of Pathogenic Variant c.919-2A>G in the SLC26A4 Gene Involved in Hearing Loss: The Evidence for Its Common Origin in Southern Siberia (Russia) Danilchenko V. Y., Zytsar M. V., Maslova E. A., Orishchenko K.E, Posukh O.L. Genes, 2023, 14, 928.
RESULTS OF TARGETED SEQUENCING OF PRL, PRLR, AND PRLHR GENES IN YOUNG WOMEN WITH NONNEOPLASTIC HYPERPROLACTINEMIA SHAKHTSHNEIDER E.V., IVANOSHCHUK D.E., VOEVODA S.M., RYMAR O.D. Cell and Tissue Biology, 2023
Association of Common Variants of APOE, CETP, and the 9p21.3 Chromosomal Region with the Risk of Myocardial Infarction: A Prospective Study Sergey Semaev, Elena Shakhtshneider, Liliya Shcherbakova, Pavel Orlov, Dinara Ivanoshchuk, Sophia Malyutina, Valery Gafarov, Mikhail Voevoda, Yuliya Ragino INT J MOL SCI, 2023, 24(13)
Анализ полиморфизма генов рецепторов врожденного иммунитета у пациентов с коронарным атеросклерозом и в популяционной выборке г. Новосибирска. Михайлова С.В., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Латынцева Л.Д., Каштанова Е.В., Полон-
ская Я.В., Рагино Ю.И., Шахтшнейдер Е.В. Siberian scientific medical journal, 2023, 2023;43(4):97–109
АССОЦИАЦИЯ НАРУШЕНИЯ СНА С РАЗЛИЧНЫМИ ПОЛИМОРФНЫМИ ВАРИАНТАМИ ГЕНА 5-HTTLPR SNP RS25531 A>G У ЛИЦ 25-44 ЛЕТ ГАФАРОВ В.В, ГРОМОВА Е.А., ГАГУЛИН И.В., ПАНОВ Д.О., МАКСИМОВ В.Н., ГУБИНА М.А., ГАФАРОВА А.В. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика, 2023, Том: 15Номер: 1 Год: 2023 Страницы: 43-49
Проблемы изучения направленного естественного отбора у человека С.В. Михайлова Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(6):684-693
Functional Consequences of Pathogenic Variants of the GJB2 Gene (Cx26) Localized in Different Cx26 Domains Olga L. Posukh, Ekaterina A. Maslova, Valeriia Yu. Danilchenko, Marina V. Zytsar, Konstantin E. Orishchenko Biomolecules, 2023, 13(10):1521
The GJB2 (Cx26) Gene Variants in Patients with Hearing Impairment in the Baikal Lake Region (Russia). Pshennikova VG, Teryutin FM, Cherdonova AM, Borisova TV, Solovyev AV, Romanov GP, Morozov IV, Bondar AA, Posukh OL, Fedorova SA, Barashkov NA. Genes, 2023, 14(5):1001
Problems with studying directional natural selection in humans S.V. Mikhailova Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(6):684-693.
Assessment of the Genetic Characteristics of a Generation Born during a Long-Term Socioeconomic Crisis Svetlana V. Mikhailova; Dinara E. Ivanoshchuk; Pavel S. Orlov; Ahmad Bairqdar; Maksim S. Anisimenko; Diana V. Denisova Genes, 2023, Volume 14, Issue 11, 2064
The Relationship between All-Cause Natural Mortality and Copy Number of Mitochondrial DNA in a 15-Year Follow-Up Study Malyutina S.K., Maximov V.N., Chervova O., Orlov P., Ivanova A.A., Mazdorova E.V., Ryabikov A.N., Simonova G.I., Voevoda M.I. INT J MOL SCI, 2023, 24(13): 10469
Serum matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) as a biomarker in paediatric and adult tick-borne encephalitis patients Fortova A., Hönig V., Salat J., Palus M., Pychova M., Krbkova L., Barkhash A. V., Kriha M. F., Chrdle A., Lipoldova M., Ruzek D. VIRUS RES, 2023, Vol. 324, p.199020
Genetic polymorphisms in innate immunity genes influence predisposition to tick‑borne encephalitis Fortova A., Barkhash A. V., Pychova M., Krbkova L., Palus M., Salat J., Ruzek D. J NEUROVIROL, 2023, Vol. 29, pp. 699-705
The leukocyte telomere length, mtDNA copy number and acute coronary syndrome in a 15-year follow-up Maximov V.N., Orlov P., Gurazeva A., Shabanova E., Gafarov V.V., Chervova O., Malyutina S.K. ATHEROSCLEROSIS, 2023, 379(Suppl 1): s44
2022
Анализ ассоциации распространенного варианта rs13107325
гена транспортера двухвалентных катионов SLC39A8 с показателями липидного обмена подростков г. Новосибирска С.В. Михайлова, Д.Е. Иванощук, П.С. Орлов, Д.В. Денисова, Е.В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2022, . Т. 18, No 4. С. 354-361
Генетическая предрасположенность человека и лабораторных животных к различным инфекциям, передающимся иксодовыми клещами Бархаш А.В. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2022, Т.40, №2, с.3-13
Dorsal Striatum Transcriptome Profile Profound Shift in Repeated Aggression Mouse Model Converged to Networks of 12 Transcription Factors after Fighting Deprivation Vladimir Babenko, Olga Redina, Dmitry Smagin, Irina Kovalenko, Anna Galyamina, Roman Babenko, Natalia Kudryavtseva Genes, 2022
Agent‐Based Modeling of Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A) Prevalence with Regard to Intensity of Selection Pressure in Isolated Human Population Georgii P. Romanov , Anna A. Smirnova , Vladimir I. Zamyatin, Aleksey M. Mukhin, Fedor V. Kazantsev,
Vera G. Pshennikova, Fedor M. Teryutin, Aisen V. Solovyev, Sardana A. Fedorova, Olga L. Posukh,
Sergey A. Lashin and Nikolay A. Barashkov Biology, 2022, Biology 2022, 11, 257. https://doi.org/10.3390/biology11020257
ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК И ШЕСТИ ГЕНОВ
ЯДЕРНОГО ГЕНОМА В ПОПУЛЯЦИИ АМУРСКИХ ЭВЕНКОВ М. А. Губина, В. Н. Бабенко, В. А. Бацевич, Н. А. Лейбова, А. П. Забияко Генетика, 2022, том 58, № 1, с. 52–67
LPS Administration Impacts Glial Immune Programs by Alternative Splicing Vladimir N. Babenko
Galina T. Shishkina
Dmitriy A. Lanshakov
Ekaterina V. Sukhareva
Nikolay N. Dygalo Biomolecules, 2022, Spec Edition Biomolecules and Biomarkers in Head and Neck Medicine
Молекулярно-генетическая диагностика гетерозиготной формы семейной гиперхолестеринемии в молодом возрасте: клинический случай О.В. Тимощенко, Д.Е. Иванощук, С.Е. Семаев,
Л.Д. Латынцева, Е.В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2022, Т. 18, №1, с. 76-80
Associations of APOE Gene Variants rs429358 and rs7412 with Parameters of the Blood Lipid Profile and the Risk of Myocardial Infarction and Death in a White Population of Western Siberia Semaev S.E., Shakhtshneider E.V., Shcherbakova L.V., Ivanoshchuk D.E., Orlov P.S., Malyutina S.K., Gafarov V.V., Ragino Yu.I., Voevoda M.I. CURR ISSUES MOL BIOL, 2022, 44(4), 1713-1724
Результаты таргетного секвенирования генов PRL, PRLR, PRLHR у молодых женщин с гиперпролактинемией неопухолевого генеза Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Воевода С.М., Рымар О.Д. Siberian scientific medical journal, 2022, № 4
Selection of Diagnostically Significant Regions of the SLC26A4 Gene Involved in Hearing Loss Danilchenko V.Y.; Zytsar M.V.; Maslova E.A.; Posukh O.L. INT J MOL SCI, 2022, 23(21):13453
Дисфункция генов, ассоциируемых с канцерогенезом и апоптозом, развивающаяся в гипоталамусе самцов мышей под влиянием хронического социального стресса Галямина А.Г., Смагин Д.А., Коваленко И.Л., Редина О.Е., Бабенко В.Н., Кудрявцева Н.Н. Биохимия, 2022, т.87, №9, с. 1318-1333
The Dysfunction of Carcinogenesis- and Apoptosis-Associated Genes that Develops in the Hypothalamus
under Chronic Social Defeat Stress in Male Mice Anna G. Galyamina, Dmitry A. Smagin, Irina L. Kovalenko,
Olga E. Redina, Vladimir N. Babenko, and Natalia N. Kudryavtseva Biochemistry (Moscow). Suppl B., 2022, Vol. 87, No. 9, pp. 1050-1064
Анализ ассоциаций артериальной гипертензии с 16 генетическими маркерами, отобранными по данным полногеномных исследований Маздорова Е.В., Максимов В.Н., Орлов П.С., Шахматов С.Г., Рябиков А.Н., Воевода М.И., Малютина С.К. Артериальная гипертензия, 2022, 28(1): С.46-57
Результаты секвенирования нового поколения у мужчин с пограничным удлинением интервала QT (пилотное исследование) Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Нестерец А.М., Кузнецов А.А., Иванова А.А., Малютина С.К., Денисова Д.В., Стрюкова Е.В., Максимов В.Н., Максимова С.В. КОМПЛЕКСНЫЕ ПРОБЛЕМЫ СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, 2022, 11(2): 98-106
Ассоциация относительной длины теломер лейкоцитов и количества копий мтДНК с острым коронарным синдромом при 15-летнем наблюдении Максимов В.Н., Орлов П.С., Гуражева А.А., Мельникова Е.С., Гафаров В.В., Чернова О.А., Воевода М.И., Малютина С.К. Успехи геронтологии, 2022, 35(3): 351-360
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ ИНТЕРЛЕЙКИНОВ
IL-17A G197A И IL-17F A7488G У БОЛЬНЫХ РАКОМ ЖЕЛУДКА
В ЗАПАДНО-СИБИРСКОМ РЕГИОНЕ М. А. Губина, И. Г. Соловьева, В. Н. Бабенко, А. В. Соколов, Е. Ю. Губина Генетика, 2022, ГЕНЕТИКА, 2022, том 58, № 7, с. 808–814
Анализ частоты встречаемости гаплотипов гена
дофамин-ß-гидроксилазы у зависимых от синтетических наркотиков Губина М.А., Соловьева И.Г., Бабенко В.Н., Патрикеева О.Н., Губина А.Ю., Щеглова Л.Л. Наркология, 2022, Наркология 2022. Том 21. Номер 8 с. 20-29
The Dysfunction of Carcinogenesis- and Apoptosis-Associated Genes that Develops in the Hypothalamus under Chronic Social Defeat Stress in Male Mice A.G. Galyamina, D.A. Smagin, I.L. Kovalenko, O.E. Redina, V.N. Babenko, N.N. Kudryavtseva BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2022, Vol. 87, No. 9, pp. 1318-1333
The association between genetic markers from GWAS and essential hypertension in a case-control study (Siberian population) E.V. Mazdorova, A. Ryabikov, V.N. Maksomov, P.S.Orlov, S.Malyutina ATHEROSCLEROSIS, 2022, Vol.355, P177, August 2022
The Genetic Predisposition of Human and Laboratory Animals to Different Infections Transmitted by Ixodid Ticks Barkhash A.V. MOL GENET MICROBIOL+, 2022, Vol. 37, No. 2, pp. 55–64.
Внезапная сердечная смерть у молодых мужчин: результаты экзомного секвенирования. Иванова А.А., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Родина И.А., Хамович О.В., Малютина С.К., Новоселов В.П., Максимов В.Н. Атеросклероз, 2022, 18(4): 317-337
2021
Autophagy genes expression profiling in secondary glioblastoma cells transcriptome Gubanova N., Bragin A., Vasiliev G., Babenko V., Ponomarenko M., Orlov Y. Cell Death Discovery, 2021, 7 (SUPPL 1), pp.5-5
Different Rates of the SLC26A4-Related Hearing Loss in Two Indigenous Peoples of Southern Siberia (Russia) Valeriia Yu. Danilchenko, Marina V. Zytsar, Ekaterina A. Maslova, Marita S. Bady-Khoo, Nikolay A. Barashkov, Igor V. Morozov, Alexander A. Bondar, Olga L. Posukh Diagnostics, 2021, 11(12), 2378
Fitness Analysis and Transcriptome Profiling Following Repeated Mild Heat Stress of Varying Frequency in Drosophila melanogaster Females Gruntenko NE, Karpova EK, Babenko VN, Vasiliev GV, Andreenkova OV, Bobrovskikh MA, Menshanov PN, Babenko RO, Rauschenbach IY. Biology, 2021, 10(12):1323
Functional Evaluation of a Rare Variant c.516G>C (p.Trp172Cys) in the GJB2 (Connexin 26) Gene Associated with Nonsyndromic Hearing Loss. Maslova E.A., Orishchenko K.E., Posukh O.L. Biomolecules, 2021, 11(1), 61
Биопсихосоциальные предпосылки развития наркотической зависимости в подростковом возрасте. Соловьева И.Г., Патрикеева О.Н., Губина М.А., Рецер Р.А., Ларин А.В., Карпенко Д.А., Cундуева Д.Е . Казанский педагогический журнал, 2021, 2020; (1): 249-254.
The Mutation Spectrum of Maturity Onset Diabetes
of the Young (MODY)-Associated Genes amongWestern Siberia Patients Dinara E. Ivanoshchuk, Elena V. Shakhtshneider, Oksana D. Rymar, Alla K. Ovsyannikova, Svetlana V. Mikhailova, Veniamin S. Fishman, Emil S. Valeev, Pavel S. Orlov and Mikhail I. Voevoda J. Pers. Med, 2021, 11, 57-71
Анализ полиморфизма гена f5 у мужчин с коронарным атеросклерозом с использованием метода полноэкзомного секвенирования Е. В. Стрюкова, Е. В. Шахтшнейдер, Д. Е. Иванощук, Ю. И. Рагино, Я. В. Полонская, И. С. Мурашов, А. М. Волков, А. В. Кургузов, А. М. Чернявский, Э. С. Валеев, В. Н. Максимов, Е. В. Каштанова Атеросклероз, 2021, 17(1):29-37
Polymorphism of genes associated with infectious lung diseases in Northern Asian populations and in patients
with community-acquired pneumonia S.V. Mikhailova , L.V. Shcherbakova, N.I. Logvinenko, I.I. Logvinenko, M.I. Voevoda Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(3):301-309
Autosomal recessive cataract (CTRCT18) in the Yakut population isolate of Eastern Siberia: a novel founder variant in the FYCO1 gene. Barashkov NA, Konovalov FA, Borisova TV, Teryutin FM, Solovyev AV, Pshennikova VG, Sapojnikova NV, Vychuzhina LS, Romanov GP, Gotovtsev NN, Morozov IV, Bondar AA, Platonov FA, Burtseva TE, Khusnutdinova EK, Posukh OL, Fedorova SA. EUR J HUM GENET, 2021, 29(6):965-976.
Genetic etiology of hearing loss in Russia Posukh OL HUM GENET, 2021
АССОЦИАЦИЯ МЕЖДУ ЭВОЛЮЦИОННОЙ КОНСЕРВАТИВНОСТЬЮ
ДЛИННЫХ НЕКОДИРУЮЩИХ РНК И ПРИСУТСТВИЕМ
CPG-ОСТРОВОВ Сидоренко ИА, Рогозин ИБ, Бабенко ВН Успехи современной биологии, 2021, том 141, No 2, с. 107–117
Innate-Immunity Genes in Obesity S.V. Mikhailova, D.E. Ivanoshchuk J. Pers. Med, 2021, 11(11):1201. https://doi.org/10.3390/jpm11111201
Reduced expression of Slc genes in the VTA and NAcc of male mice with positive fighting experience Smagin D.A., Babenko V.N., Redina O.E., Kovalenko I.L., Galyamina A.G., Kudryavtseva N.N. Genes, 2021, 12(7):1099
Correlation of expression changes between genes controlling 5-HT synthesis and genes Crh and Trh in the midbrain raphe nuclei of chronically aggressive and defeated male mice. Redina, O., Babenko, V., Smagin, D., Kovalenko, I., Galyamina, A., Kudryavtseva N. Genes, 2021, 12(11)
Analysis of Rare Variants in Genes Related to Lipid Metabolism in Patients with Familial Hypercholesterolemia in Western Siberia (Russia) Elena Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Olga Timoshchenko, Pavel Orlov, Sergey Semaev, Emil Valeev, Andrew Goonko, Nataliya Ladygina and Mikhail Voevoda J. Pers. Med, 2021, 11, 1232-1245
НЕКОТОРЫЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ ТЯЖЕСТИ ТЕЧЕНИЯ ИНФАРКТА МИОКАРДА Орлов П.С., Ложкина Н.Г., Максимов В.Н., Малютина С.К., Гафаров В.В., Воевода М.И. Атеросклероз, 2021, Т. 17. № 2. С. 5-11.
A common founder effect of the splice site variant c.‑23+1G>A in GJB2 gene causing autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) in Eurasia Solovyev AV, Kushniarevich A, Bliznetz E, Bady-Khoo M, Lalayants MR, Markova TG, Minárik G, Kádasi L, Metspalu E, Pshennikova VG, Teryutin FM, Khusnutdinova EK, Poliakov A, Мetspalu M, Posukh OL, Barashkov NA, Fedorova SA. HUM GENET, 2021
Особенности геномного распределения регионов высокой гомозиготности у
коренного населения Северной Евразии на индивидуальном и популяционном
уровне на основе анализа SNP высокой плотности Н. А. Колесников, В. Н. Харьков, А.А. Зарубин, М.О. Раджабов, М.И.
Воевода, М.А. Губина, Э.К. Хуснутдинова, С.С. Литвинов, Н. В. Екомасова,
О. В. Штыгашева, Н. Р. Максимова, А. Л. Сухомясова, . А. Степанов. Генетика, 2021, Т57, N11, c.1261-1275
Вариант G319S гена HNF1A при семейной форме сахарного диабета. Д.Е. Иванощук, С.В. Михайлова, А.К. Овсянникова, Е.В. Шахтшнейдер, И.В. Друк, О.Д. Рымар, М.И. Воевода. Терапия, 2021, 2021; 9: 148–154.
Identifying the involvement of pro-inflammatory signal in hippocampal gene expression changes after experimental ischemia: transcriptome-wide analysis Shishkina GT, Gulyaeva NV, Lanshakov DA, Kalinina TS, Onufriev MV, Moiseeva YV, Sukhareva EV, Babenko VN, Dygalo NN. Biomedicines, 2021, Volume 9, Issue 12, 1840
Высокопроизводительные молекулярно-генетические технологии для поиска новых этиопатогенетических факторов развития атеросклероза Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Валеев Э.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И. Атеросклероз, 2021, 17(3):83-84
Течение GCK-MODY диабета у лиц старше 18 лет: данные проспективного наблюдения Овсянникова А.К., Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Воевода М.И., Рымар О.Д. Сахарный диабет, 2021, 24(2):133-140.
Анализ дифференциальной экспрессии генов
липидного обмена в атеросклеротических бляшках
у пациентов с коронарным атеросклерозом Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Фишман В.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И. Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины, 2021, 36(4):156–163
Варианты генов HNF4A и HNF1A у пациентов с дисрегуляцией метаболизма глюкозы и дислипидемией. Иванощук Д.Е., Овсянникова А.К., Михайлова С.В., Шахтшнейдер Е.В., Валеев Э.С., Рымар О.Д., Орлов П.С., Воевода М.И. Атеросклероз, 2021, №4, 11-19
Новый этап палеогенетического исследования носителей одиновской культуры (Барабинская лесостепь): первые результаты Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пристяжнюк М.С., Пилипенко И.В., Нестерова М.С., Поздняков Д.В., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2021, Т. XXVII. - С. 690-695.
2020
A rare splice site mutation in the gene encoding
glucokinase/hexokinase 4 in a patient
with MODY type 2 D.E. Ivanoshchuk, E.V. Shakhtshneider, A.K. Ovsyannikova, S.V. Mikhailova, O.D. Rymar, V.I. Oblaukhova, A.A. Yurchenko, M.I. Voevoda Vavilov journal of genetics and breeding, 2020
Burial ground of the Afanasievo culture Bertek-33 on the Ukok plateau (Altai Mountains): results of a paleogenetic study. Pilipenko A.S., Trapezov R.O., Cherdantsev S.V., Pilipenko I.V., Zhuravlev A.A., Pristyazhnyuk M.S., Molodin V.I. Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2020, Принята в печать
Полиморфизм гена APOA5 у пациентов с первичной гиперлипидемией С.В. Михайлова, Д.Е. Иванощук, Н.С. Широкова, Е.В. Шахтшнейдер КОМПЛЕКСНЫЕ ПРОБЛЕМЫ СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, 2020, Том 9, № 2, C. 38-44
Молекулярно-генетический анализ гена CYP1B1 при первичной врожденной глаукоме: клинический случай ИВАНОЩУК Д. Е., ФЕНЬКОВА О. Г., ШАХТШНЕЙДЕР Е. В., МИХАЙЛОВА С. В., ФУРСОВА А. Ж., ВОЕВОДА М. И. Сибирское медицинское обозрение, 2020, №2, С.87-91
High rates of three common GJB2 mutations c.516G>C, c.-23+1G>A, c.235delC in deaf patients from Southern Siberia are due to the founder effect. Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Y., Maslova E.A., Barashkov N.A., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L. Genes, 2020, 11, 833-850.
The Phylogeny of Class B Flavoprotein Monooxygenases and the Origin of the YUCCA Protein Family Turnaev I.I., Gunbin K.V., Suslov V.V., Akberdin I.R., Kolchanov N.A., Afonnikov D.A. Plants, 2020, 9(9), 1092
Analysis of APPL1 Gene Polymorphisms in Patients with a Phenotype of Maturity Onset Diabetes of the Young Dinara E. Ivanoshchuk,Elena V. Shakhtshneider,Oksana D. Rymar,Alla K. Ovsyannikova,Svetlana V. Mikhailova,Pavel S. Orlov,Yuliya I. Ragino andMikhail I. Voevoda J. Pers. Med, 2020, 2020, 10(3), 100
Gene Expression Changes in the Ventral Tegmental
Area of Male Mice with Alternative Social Behavior
Experience in Chronic Agonistic Interactions Olga Redina, Vladimir Babenko, Dmitry Smagin, Irina Kovalenko, Anna Galyamina, Vadim Efimov and Natalia Kudryavtseva INT J MOL SCI, 2020, 21: 6599; Q1
ГЕНЫ АПОЛИПРОТЕИНОВ APOA5 И APOH КАК РЕГУЛЯТОРЫ МЕТАБОЛИЗМА ЛИПОПРОТЕИНОВ Н.С. Широкова, С.В. Михайлова, Д.Е. Иванощук, Е.В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2020, №3 С. 53-60
Анализ мутационного спектра гена SLC26A4 и его вклада в этиологию наследуемой потери слуха у коренного населения Южной Сибири. Данильченко В.Ю., Зыцарь М.В., Маслова Е.А., Бады-Хоо М.С., Морозов И.В., Бондарь А.А., Посух О.Л. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). С.43-45
Изучение функциональной значимости варианта с.516G>C (p.Trp172Cys) гена GJB2, ассоциированного с потерей слуха у коренного населения Южной Сибири Маслова Е.А., Зыцарь М.В., Данильченко В.Ю., Орищенко К.Е., Посух О.Л. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). С.51-53
Распространенность языка жестов в качестве источника данных для генетической эпидемиологии наследуемых форм потери слуха. Романов Г.П., Пшенникова В.Г., Лашин С.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Сазонов Н.Н., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А., Барашков Н.А. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). 54-56
Copy Number of the Mitochondrial DNA of Leucocytes as an Aging Marker and Risk Factors for the Development of Age-Related Diseases in Humans Maximov V., Malyutina S.K., Orlov P., Ivanoschuk D., Mikhailova S.V., ShapkinaM.Y., Hubacek J., Holmes M.,Bobak M., Voevoda M. Adv. Gerontol, 2020, 10(1): 1-8
A new approach to estimating the prevalence of hereditary hearing loss: an analysis of the distribution of sign language users based on census data in Russia. Romanov G.P., Pshennikova V.G., Lashin S.A., Solovyev A.V., Teryutin F.M., Cherdonova A.M., Borisova T.V., Sazonov N.N., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A., Barashkov N.A. PloS One, 2020, 15(11):e0242219
Dopamine response gene pathways in dorsal striatum MSNs from a gene expression viewpoint: cAMP‑mediated gene networks Babenko V.N., Galyamina A.G., Rogozin I.B., Smagin D. A., Kudryavtseva N.N. BMC NEUROSCI, 2020
Differentially Expressed Genes of the Slc6a Family as Markers of Altered Brain Neurotransmitter System Function in Pathological States in Mice Babenko V. N., Smagin D. A., Kovalenko I. L., Galyamina A. G., Kudryavtseva N. N. Neuroscience Behavioral Physiology, 2020, 50(2): 199-209
Screening of West Siberian patients with primary сongenital glaucoma for CYP1B1 gene mutations D.E. Ivanoshchuk, S.V. Mikhailova, O.G. Fenkova, E.V. Shakhtshneider, A.Z. Fursova, I.Y. Bychkov, M.I. Voevoda Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(8):861-867
Сравнительный анализ молекулярно- генетических, когнитивных и аффективных характеристик у лиц, употребляющих разные виды синтетических наркотиков. Наркология 2020 Том 19 №9. с.52 Соловьева И.Г., Патрикеева О.Н., Губина М.А., Рецер Р.А., Ларин А.В., Кормилина О.М. Наркология, 2020, Том 19 №9. с.52-60
Первые результаты секвенирования панели генов при внезапной сердечной смерти молодых мужчин Максимов В.Н., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Иванова А.А., Малютина С.К., Максимова С.В., Родина И.А., Хамович О.В., Новосёлов В.П. Медицинская генетика, 2020, Т. 19. № 5 (214). С. 36-38
Секвенирование нового поколения при внезапной сердечной смерти (пилотное исследование) Максимов В.Н., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Иванова А.А., Малютина С.К., Максимова С.В., Родина И.А., Хамович О.В., Новосёлов В.П., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2020, Т. 25, №. 10, С. 24-30
Погребальный памятник афанасьевской культуры Бертек-33 на плато Укок (Горный Алтай): результаты палеогенетического исследования Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Журавлев А.А., Пристяжнюк М.С., Молодин В.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2020, Т. 48, № 4
Генетический состав домашних животных, как маркер миграций человека Пилипенко А.С., Пилипенко И.В., Черданцев С.В., Трапезов Р.О. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2020, Т.XXVI, С. 571-578
Recombination Events in Leishmania donovani: Mining Population Data Rogozin IB, Charyyeva A, Sidorenko IA, Babenko VN, Yurchenko V Pathogens and Disease, 2020, 9(7):572
Ethnicity-specific distribution of TRPM8 gene variants in Eurasian populations: signs of selection T.A. Potapova, A.G. Romashchenko, N.S. Yudin, M.I. Voevoda Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(3):292-298
Analyzing a putative enhancer of optic disc morphology Babenko V
Babenko O
Orlov Yu BMC GENET, 2020, 21:1; SI; Q3
2019
Дифференциально экспрессирующиеся гены семейства Slc6a как маркеры измененной функции нейромедиаторных систем мозга при патологических состояниях у мышей В. Н. Бабенко, Д. А. Смагин, И. Л. Коваленко,
А. Г. Галямина, Н. Н. Кудрявцева Журнал высшей нервной деятельности, 2019, том 69, № 1, с. 98–112
FTO haplotyping underlines high obesity risk for European populations Babenko VN, Babenko RO, Gamieldien G, Markel AL BMC MED GENOMICS, 2019, BMC Genetics 2019
Связь полиморфизма генов ABCB9 и COL22A1 с предрасположенностью человека к тяжелым формам клещевого энцефалита Бархаш А.В., Юрченко А.А., Юдин Н.С., Козлова И.В., Борищук И.А., Смольникова М.В., Зайцева О.И., Позднякова Л.Л., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. RUSS J GENET+, 2019, Т.55, №3, С. 337-347.
Новый генетический маркер предрасположенности человека к тяжелым формам клещевого энцефалита Бархаш А.В., Козлова И.В., Позднякова Л.Л.,
Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Molecular Biology, 2019, Т.53, №3, С. 388-392
New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov, Egor B. Prokhortchouk, Mariya Y. Pakharukova, Konstantin V. Gunbin, Kirill Ustyantsev, Mikhail A. Genaev, Alexander G. Blinov, Alexander Mazur, Eugenia Boulygina, Svetlana Tsygankova, Ekaterina Khrameeva, Nikolay Chekanov, Guangyi Fan, An Xiao, He Zhang, Xun Xu, Huanming Yang, Victor Solovyev, Simon Ming-Yuen Lee, Xin Liu, Dmitry A. Afonnikov, Konstantin G. Skryabin BMC GENOMICS, 2019, 20:399
The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development. Doroshkov AV, Konstantinov DK, Afonnikov DA, Gunbin KV. BMC PLANT BIOL, 2019
mtProtEvol: the resource presenting molecular evolution analysis of proteins involved in the function of Vertebrate mitochondria. Kuzminkova AA, Sokol AD, Ushakova KE, Popadin KY, Gunbin KV. BMC EVOL BIOL, 2019
ImtRDB: a database and software for mitochondrial imperfect interspersed repeats annotation Shamanskiy VN, Timonina VN, Popadin KY, Gunbin KV. BMC GENOMICS, 2019
Unique mutational spectrum of the GJB2 gene and its pathogenic contribution to deafness in Tuvinians (Southern Siberia, Russia): a high prevalence of rare variant c.516G>C (p.Trp172Cys). Posukh O.L., Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Bondar A.A., Morozov I.V., Maximov V.N., Voevoda M.I. Genes, 2019, Jun 5;10(6). pii: E429
A rare case of Waardenburg syndrome with unilateral hearing loss caused by nonsense variant c.772C>T (p.Arg259*) in the MITF gene in Yakut patient from the Eastern Siberia (Sakha Republic, Russia). Barashkov NA, Romanov GP, Borisova UP, Solovyev AV, Pshennikova VG, Teryutin FM, Bondar AA, Morozov IV, Khusnutdinova EK, Posukh OL, Burtseva TE, Odland JØ, Fedorova SA. INT J CIRCUMPOL HEAL, 2019, 78(1):1630219.
Comparison of prediction in silico tools on missense variants in GJB2, GJB6 and GJB3 genes associated with autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) Pshennikova V.G., Barashkov N.A., Romanov G.P., Teryutin F.M., Solov’ev A.V., Gotovtsev N.N., Nikanorova A.A., Nakhodkin S.S., Sazonov N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. The Scientific World Journal, 2019, Mar 20;2019:5198931
Analysis of Polymorphism rs1333049 (Located at 9P21.3) in the White Population of Western Siberia and Associations with Clinical and Biochemical Markers Elena Shakhtshneider, Pavel Orlov, Sergey Semaev, Dinara Ivanoshchuk,Sofia Malyutina, Valery Gafarov, Yuliya Ragino and Mikhail Voevoda Biomolecules, 2019, 9, 290
Использование миРНК в качестве диагностических маркеров острого инфаркта миокарда и ремоделирования сердечной мышцы. Иванощук Д.Е., Розанов А.С., Орлов П.С., Михайлова С.В., Шахтшнейдер Е.В., Кручинина М.В., Воевода М.И. Атеросклероз, 2019, Том 15.- №2. – с. 68-77.
Searching for Signatures of Cold Climate Adaptation in TRPM8 Gene in Populations of East Asian Ancestry Alexander V. Igoshin, Konstantin V. Gunbin, Nikolay S. Yudin, Mikhail I. Voevoda Frontiers in Genetics, 2019
Новые аспекты использования белковых тканеспецифичных маркеров в оценке степени тяжести внебольничных пневмоний. Воевода М.И., Рагино Ю.И., Николаев К.Ю., Харламова О.С., Стахнева Е.М., Каштанова Е.В., Полонская Я.В., Иванощук Д.Е., Кручинина М.В., Кручинин В.Н. Siberian scientific medical journal, 2019, 2019; 39 (4): 93–98.
Association of RS708272 (CETP Gene Variant) with Lipid Profile Parameters and the Risk of Myocardial Infarction in the White Population of Western Siberia Sergey Semaev, Elena Shakhtshneider, Pavel Orlov, Dinara Ivanoshchuk, Sophia Malyutina, Valery Gafarov, Yuliya Ragino and Mikhail Voevoda Biomolecules, 2019, Biomolecules 2019, 9(11), 739
Genes Potentially Associated with Familial Hypercholesterolemia Mikhailova S., Ivanoshchuk D., Timoshchenko O. and Shakhtshneider E. Biomolecules, 2019, 9(12), 807;
Новая нонсенс-мутация с.1121G>A (p.Trp374*) гена CLIC5 – основная причина ювенильной аутосомно-рецессивной формы глухоты (DFNB103), очаги накопления которой обнаружены в арктических районах Якутии. Пшенникова В.Г., Романов Г.П., Николаева Т.М., Терютин Ф.М., Борисова Т.В., Комарьков И.Ф., Антонец А.В., Соловьев А.В., Кларов Л.А., Бондарь А.А., Морозов И.В., Посух О.Л., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А., Барашков Н.А. Медицинская генетика, 2019, 18(10): 36-48
Volatile Evolution of Long Non-Coding RNA Repertoire in Retinal Pigment Epithelium: Insights from Comparison of Bovine and Human RNA Expression Profiles. Postnikova OA, Rogozin IB, Samuel W, Nudelman G, Babenko VN, Poliakov E, Redmond TM Genes, 2019, 10(3). pii: E205
Nucleotide Weight Matrices Reveal Ubiquitous Mutational Footprints of AID/APOBEC Deaminases in Human Cancer Genomes. Rogozin IB, Roche-Lima A, Lada AG, Belinky F, Sidorenko IA, Glazko GV, Babenko VN, Cooper DN, Pavlov YI CANCER-AM CANCER SOC, 2019, 11(2). pii: E211
Evolution of Exons and the Exon–Intron Structure of Long
Intergenic Noncoding RNA Genes in Placental Mammals Sidorenko IA, Rogozin IB, Babenko VN Biology Bulletin Reviews, 2019, Vol. 9, No. 6, pp. 491–502
ЭВОЛЮЦИЯ ЭКЗОНОВ И ЭКЗОН-ИНТРОННОЙ СТРУКТУРЫ ГЕНОВ ДЛИННЫХ МЕЖГЕННЫХ НЕКОДИРУЮЩИХ РНК У ПЛАЦЕНТАРНЫХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ Сидоренко ИА, Рогозин ИБ, Бабенко ВН Успехи современной биологии, 2019, том 139, № 3, с. 221–234
Aberrant Expression of Collagen Gene Family in the Brain Regions of Male Mice with Behavioral Psychopathologies Induced by Chronic Agonistic Interactions Smagin DA, Galyamina AG, Kovalenko IL, Babenko VN, Kudryavtseva NN Biomed Res Int, 2019, 2019:7276389
Число копий митохондриальной ДНК лейкоцитов как маркёр старения и риска развития возраст-зависимых заболеваний у человека Максимов В.Н., Малютина С.К., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Михайлова C.В., Шапкина М.Ю., Hubacek J., Holmes M., Bobak М., Воевода М.И. Успехи геронтологии, 2019, 32(3):422-430
Сравнительный анализ количества копий митохондриальной ДНК в ткани миокарда при внезапной сердечной и несердечной смерти Максимов В.Н., Гуражева А.А., Орлов П.С., Малютина С.К., Иванова А.А., Максимова С.В., Родина И.А., Хамович О.В., Новоселов В.П. Атеросклероз, 2019, 15(3):36-41
Изменения липидного обмена мыши при одновременном воздействии антисмысловыми олигонуклеотидными производными к мРНК генов апоВ, PCSK9 и апоCIII С.И. Ошевский, Ю.И. Рагино, Е.В. Каштанова, Я.В. Полонская, Е.М. Стахнева, В.П. Николин, Н.А. Попова, Н.А. Колчанов, М.И. Воевода Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(8):1020-1025
Клинико-патологические характеристики наркозависимости и полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы у потребителей синтетических наркотиков Соловьева И.Г., Губина М.А., Патрикеева О.Н., Кунгурцева О.Н., Кормилина О.М., Рецер Р.А. Наркология, 2019, 2019.N 01. стр. 18-24
Ассоциация длины теломер лейкоцитов и уровня специфических антител после вакцинации против клещевого энцефалита Юдин Н.С., Белявская В.А., Максимов В.Н., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, Том 23, № 8, стр. 1026-1031.
ПИЛОТНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ TRPA1 И TRPV1 С ИНФАРКТОМ МИОКАРДА Орлов П.С., Максимов В.Н., Михайлова С.В., Иванощук Д.Е., Малютина С.К., Воевода М.И. Атеросклероз, 2019, Т. 15. № 3. С. 50-55.
2018
CpG islands’ clustering uncovers early development genes in the human genome Babenko V.N. , Bogomolov A.G., Babenko R.O., Galieva E.R., Orlov Y.L. COMPUT SCI INF SYST, 2018, V 15 N2
Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak Archaeological and Anthropological Sciences, 2018, Vol. 10, Issue 7, P. 1557-1570.
Haplotype analysis of Apoe SNPs in ADNI dataset. Babenko VN, Afonnikov DA, Ignatieva EV, Klimov AV, Gusev FE, Rogaev EI BMC NEUROSCI, 2018, 19(Suppl 1):16
Single nucleotide polymorphism rs1800872 in the promoter region of the IL10 gene is associated with predisposition to chronic hepatitis C in Russian population Barkhash A.V., Kochneva G.V., Chub E.V., Romaschenko A.G. MICROBES INFECT, 2018, Vol. 20, No. 3. P. 212-216.
A case of maturity-onset diabetes of the young in a family with a novel HNF1Agene mutation in five generations Ovsyannikova A., Rymar O., Ivanoshchuk D., Mikhailova S., Shakhtshneider E., Orlov P, Malakhina E., Voevoda M. A Diabetes Therapy, 2018
Polymorphism of the GLIS3 gene in a Caucasian population and among individuals with carbohydrate metabolism disorders in Russia E. V. Shakhtshneider, S. V. Mikhailova, D. E. Ivanoshchuk, P. S. Orlov, A. K. Ovsyannikova, O. D. Rymar, Yu. I. Ragino, M. I. Voevoda BMC Research Notes, 2018, BMC Research Notes 2018 11:211
Генетическая предрасположенность человека к заболеваниям, вызываемым вирусами семейства Flaviviridae Юдин Н.С., Бархаш А.В., Максимов В.Н., Игнатьева Е.В., Ромащенко А.Г. Molecular Biology, 2018, Т.52, №2. С. 190-209.
A matrix metalloproteinase 9 (MMP9) gene single nucleotide polymorphism is associated with predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced severe central nervous system disease Barkhash A.V., Yurchenko A.A., Yudin N.S., Ignatieva E.V., Kozlova I.V., Borishchuk I.A., Pozdnyakova L.L., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. TICKS TICK-BORNE DIS, 2018, Vol. 9, No. 4. P. 763-767
Дифференциально экспрессирующиеся гены нейромедиаторных систем в дорсальном стриатуме самцов мышей с двигательными нарушениями Смагин Д.А., Галямина А.Г., Коваленко И.Л., Бабенко В.Н., Тамкович Н.В., Борисов С.А., Толстикова Т.Г., Кудрявцева Н.Н. Журнал высшей нервной деятельности, 2018, т.68, №2, с. 227-249
A novel pathogenic variant c.975G>A (p.Trp325*) in the POU3F4 gene in Yakut family (Eastern Siberia, Russia) with the X-linked deafness-2 (DFNX2). Barashkov N.A., Klarov L.A., Teryutin F.M., Solovyev A.V., Pshennikova V.G., Konnikova E.E., Romanov G.P., Tobokhov A.V., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Tomsky M.I., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. INT J PEDIATR OTORHI, 2018, 104: 94–97.
Updated carrier rates for c.35delG (GJB2) associated with hearing loss in Russia and common c.35delG haplotypes in Siberia. Zytsar M.V., Barashkov N.A., Bady-Khoo M.S., Shubina-Olejnik O.A., Danilenko N.G., Bondar A.A., Morozov I.V., Solovyev A.V., Danilchenko V.Yu., Maximov V.N., Posukh O.L. BMC MED GENET, 2018, Aug 7;19(1):138
АНАЛИЗ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ЭКСПРЕССИИ МАТРИКСНЫХ МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗ
В СТАБИЛЬНОЙ И НЕСТАБИЛЬНОЙ АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШКАХ МЕТОДОМ
ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК: ПИЛОТНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ Иванощук Д.Е., Рагино Ю. И.
, Шахтшнейдер Е.В., Михайлова С.В.
, Фишман В. С., Полонская Я.В.
, Каштанова Е.В., Чернявский А.М.
, Мурашов И.С., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2018, №8, С.52-58
Сytoscape – плагин для построения структурных моделей биологических сетей в виде случайных графов Подколодный Н.Л., Гаврилов Д.А., Твердохлеб Н.Н., Подколодная О.А. Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, номер 3, том 16, стр. 37-50.
Genes reveal traces of common recent demographic history for most of the Uralic-speaking populations Kristiina Tambets, Bayazit Yunusbayev, Georgi Hudjashov, Anne-Mai Ilumäe, Siiri Rootsi, Terhi Honkola, Outi Vesakoski, Quentin Atkinson, Pontus Skoglund, Alena Kushniarevich, Sergey Litvinov, Maere Reidla, Ene Metspalu, Lehti Saag, Timo Rantanen, Monika Karmin, Jüri Parik, Sergey I. Zhadanov, Marina Gubina, Larisa D. Damba, Marina Bermisheva, Tuuli Reisberg, Khadizhat Dibirova, Irina Evseeva, Mari Nelis, Janis Klovins, Andres Metspalu, Tõnu Esko, Oleg Balanovsky, Elena Balanovska, Elza K. Khusnutdinova, Ludmila P. Osipova, Mikhail Voevoda, Richard Villems, Toomas Kivisild, Mait Metspalu GENOME BIOL, 2018, (2018) 19:139
Компьютерный анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq С. С. Ковалев, Е. Ю. Леберфарб, Н. В. Губанова, А. О. Брагин, А. Г. Галиева,А. В. Цуканов, В. Н. Бабенко, Ю. Л. Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, Том 16, № 3, С.22-36
Компьютерная база данных для анализа дифференциально экспрессирующихся генов, связанных с агрессивным поведением, на моделях лабораторных животных Анатолий Олегович Брагин, Кирилл Александрович Табанюхов, Ирина Витальевна Чадаева, Антон Витальевич Цуканов, Роман Олегович Бабенко, Ирина Вадимовна Медведева, Антон Геннадьевич Богомолов, Владимир Николаевич Бабенко, Юрий Львович Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, 2018. - Том 16, Выпуск № 3. - С. 7-21. - DOI 10.25205/1818-7900-2018-16-3-7-21. - ISSN 1818-7900
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ ТЕРМОРЕЦЕПТОРОВ TRPV1 И TRPA1 ЧЕЛОВЕКА В ПОПУЛЯЦИЯХ АЛТАЕ-САЯНСКОГО РЕГИОНА И ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА М. А. Губина, П. С. Орлов, В. Н. БабенкоА. П. Забияко, Д. Е. Иванощук, М. И. Воевода Генетика, 2018, том 54, № 2, с. 243–252
ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК В ПОПУЛЯЦИИ СИБИРСКИХ ТАТАР БАРАБИНСКОЙ ЛЕСОСТЕПИ М. А. Губина, В. Н. Бабенко, М. И. Воевода Генетика, 2018, том 54, № 6, с. 694–709
ГЕНЕТИКО-ДЕМОГРАФИЧЕСКИЕ ПАРАМЕТРЫ НАСЕЛЕНИЯ г. НОВОСИБИРСКА О. Л. Курбатова, И. Г. Удина, А. С. Грачева, Е. Ю. Победоносцева, М. А. Губина, М. И. Воевода Генетика, 2018, том 54, ПРИЛОЖЕНИЕ, с. S74–S84
Maternal genetic features of the Iron Age Tagar population from Southern Siberia (1st millennium BC) Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Stepan V. Cherdantsev, Vladimir N. Babenko, Marina S. Nesterova, Dmitri V. Pozdnyakov, Vyacheslav I. Molodin, Natalia V. Polosmak PloS One, 2018, 13(9): e0204062
Leukocyte telomere length and risk of coronary heart disease and stroke mortality: prospective evidence from a Russian cohort Stefler D., Malyutina S.K., Maximov V.N., Orlov P.S., Ivanoschuk D., Nikitin Yu.P., Gafarov V.V., Ryabikov A.N., Voevoda M.I., Bobak M., Holmes M.V. SCI REP-UK, 2018, 8(1):16627
Проверка ассоциации новых полиморфизмов с внезапной сердечной смертью у мужчин Максимов В. Н., Иванова А. А., Орлов П. С., Иванощук Д. Е., Малютина С. К., Новосёлов В. П., Воевода М. И. Российский Кардиологический Журнал, 2018, (10):70-75
Исследование ассоциаций полиморфизмов генов KCNN2 и NOS1AP с внезапной сердечной смертью Орлов П. С., Иванощук Д. Е., Иванова А. А., Малютина С. К., Новоселов В. П., Воевода М. И., Максимов В. Н. Российский Кардиологический Журнал, 2018, (10):59-63.
Ассоциации артериального давления и артериальной гипертензии с генетическими маркерами, отобранными по данным полногеномных исследований Малютина С.К., Максимов В.Н., Орлов П.С., Маздорова Е.В., Рябиков А.Н., Никитин Ю.П., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2018, 23(10):8-13
Количество копий митохондриальной ДНК лейкоцитов как маркёр старения и риска развития возраст-зависимых заболеваний у человека Максимов В.Н., Малютина С.К., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Михайлова C.В., Шапкина М.Ю., Hubacek J., Holmes M., Bobak М., Воевода М.И. Успехи геронтологии, 2018
The association between progression of carotid atherosclerosis and telomere length: serial measurements in follow-up in ageing cohort Ryabikov A.N., Malyutina S.K., Maximov V.N., Holmes M., Palekhina Yu.Yu., Ryabikov M.N., Orlov P.S., Ivanoschuk D., Munz I.V., Voevoda M.I., Bobak M. EUR HEART J, 2018
Altered Slc25 family gene expression as markers of mitochondrial dysfunction in brain regions under experimental mixed anxiety/depression-like disorder. Babenko VN, Smagin DA, Galyamina AG, Kovalenko IL, Kudryavtseva NN BMC NEUROSCI, 2018, 2018
Abnormal social behaviors and dysfunction of autism-related genes associated with daily agonistic interactions in mice Kudryavtseva N.N., Kovalenko I.L., Smagin D.A., Galyamina A.G., Babenko V.N. ELSEVIER/ San Diego: Academic Press, 2018, Chapter 14, ISBN: 9780128041161
Neurogenomics of repeated aggression and autistic spectrum disorders: New direction in the experimental study of social behavior. Kudryavtseva N.N., Kovalenko I.L., Smagin D.A., Galyamina A.G., Babenko V.N. The Bulletin of the International Society for Research on Aggression, 2018, 2018, Vol 41, No 2, p. 23-24.
Выявление и анализ динамических паттернов суточной экспрессии генов млекопитающих О.А. Подколодная, Н.Н. Твердохлеб, Н.Л. Подколодный Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, 8,22,1055-1062
Maturity-onset diabetes of the young due to HNF1B mutation: a case report Klimontov V.V., Bulumbaeva D.M., Koroleva E.A., Ovsyannikova A.K., Rymar O.D., Ivanoshchuk D.E., Shakhtshneider E.V. // Systems Biology and Biomedicine (SBioMed-2018) : Symposium (21–22 Aug. 2018, Novosibirsk, Russia); Abstracts, 2018, Novosibirsk: ICG SB RAS, 2018. – P. 64.
Purifying and positive selection in the evolution of stop codons. Belinky F, Babenko VN, Rogozin IB, Koonin EV SCI REP-UK, 2018, 8(1):9260
Characteristics of MODY-GCK Diabetes in Children and Adolescents in Siberia Ovsyannikova A.K., Rymar O.D., Shakhtshneider E.V., Ivanoshchuk D.E. HORM RES PAEDIAT, 2018, Volume: 90 Pages: 261
Clinical Case of MODY-GCK Diabetes: Heterogeneity of Course Among Relatives from One Family Ovsyannikova A.K., Rymar O.D., Shakhtshneider E.V., Ivanoshchuk D.E., Voevoda M.I. HORM RES PAEDIAT, 2018, Т. 90. № S1. С. 262.
2017
Between Lake Baikal and the Baltic Sea: genomic history of the gateway to Europe. Triska P, Chekanov N, Stepanov V, Khusnutdinova EK, Kumar GPA, Akhmetova V, Babalyan K, Boulygina E, Kharkov V, Gubina M, Khidiyatova I, Khitrinskaya I, Khrameeva EE, Khusainova R, Konovalova N, Litvinov S, Marusin A, Mazur AM, Puzyrev V, Ivanoshchuk D, Spiridonova M, Teslyuk A, Tsygankova S, Triska M, Trofimova N, Vajda E, Balanovsky O, Baranova A, Skryabin K, Tatarinova TV, Prokhortchouk E. BMC GENET, 2017, 18(Suppl 1)
Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки, по данным полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е.В., Спицина А.М., Богомолов А.Г., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Программные системы: теория и приложения, 2017, 8:1(32), 219–242
Genomic landscape of CpG rich elements in human genome Babenko V.N., Chadaeva I.V., Orlov Y.L. BMC EVOL BIOL, 2017, 2017; Vol 17(Suppl 1):19 DOI: 10.1186/s12862-016-0864-0
Opinions of hearing parents about the causes of hearing impairment of their children with biallelic GJB2 mutations. Solovyev A.V., Dzhemileva L.U., Posukh O.L., Barashkov N.A., Bady-Khoo M.S., Lobov S.L., Popova N.Yu., Romanov G.P., Sazonov N.N., Bondar A.A., Morozov I.V., Tomsky M.I., Fedorova S.A., Khusnutdinova E.K. J Community Genet, 2017, 8(3): 167-171
Analysis of GJB6 (Сx30) and GJB3 (Сx31) genes in deaf patients with monoallelic mutations in GJB2 (Сx26) gene in the Sakha Republic (Yakutia). Pshennikova V.G., Barashkov N.A., Solovyev A.V., Romanov G.P., Diakonov E.E., Sazonov N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Tomsky M.I., Fedorova S.A. RUSS J GENET+, 2017, V.53, 6: 688–697.
Molecular mechanisms of the interaction between the processes of the cell response to mechanical stress and neuronal apoptosis in primary open-angle glaucoma O. V. Saik, N. A. Konovalova, P. S. Demenkov, N. V. Ivanisenko, T. V. Ivanisenko, D. E. Ivanoshchuk, O. S. Konovalova, O. A. Podkolodnaya, I. N. Lavrik, N. A. Kolchanov, V. A. Ivanisenko Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, ISSN 2079-0597, 2017, Vol. 7, No. 5, pp. 558–564
Анализ информативности компьютерных in silico предсказательных программ при оценке клинической значимости миссенс-замен гена GJB2 (Сx26). Пшенникова В.Г., Барашков Н.А., Соловьев А.В., Романов Г.П., Терютин Ф.М., Посух О.Л., Сазонов Н.Н., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Томский М.И., Федорова С.А. Якутский медицинский журнал, 2017, №3, С.40-46.
Альтернативный сплайсинг в отделах головного мозга селектированных по агрессивности крыс В. Н. Бабенко, А. О. Брагин, И. В. Чадаева, А. Л. Маркель, Ю. Л. Орлов Molecular Biology, 2017, 2017 г., том 51, № 5, с. 870-880
RNA-Seq Mouse Brain Regions Expression Data Analysis: Focus on ApoE Functional Network. BAbenko VN, Smagin DA, Kudryavtseva NN J INTEGR BIOINFORM, 2017, Sep 13;14(3). pii: /j/jib.2017.14.issue-3/jib-2017-0024/jib-2017-0024
Дифференциальная экспрессия и альтернативный сплайсинг в культурах клеток глиом по данным RNA-seq Губанова Н.В., Брагин А.О., Бабенко В.Н., Гайтан А.С., Кривошапкин А.Л., Орлов Ю.Л. Acta Naturae, 2017, Том 9(1). С.19
Reconstruction of SNP haplotypes with mutation c.-23+1G>A in human gene GJB2 (Chromosome 13) in some populations of Eurasia. Solovyev A.V., Barashkov N.A., Bady-Khoo M.S., Zytsar M.V., Posukh O.L., Romanov G.P., Rafailov A.M., Sazonov N.N., Alexeev A.N., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. RUSS J GENET+, 2017, V.53, 8, pp. 936–941.
Анализ циркадного ритма биологических процессов в печени и почках мыши Подколодный Н.Л. Твердохлеб Н.Н. Подколодная О.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, Т. 21, N 8, с. 903-910
2016
Impact of socio-demographic structure of the deaf people communities in prevalence of hereditary hearing loss. Posukh O.L., Bady-Khoo M.S., Zytsar M.V., Mikhalskaia V.Yu., Lashin S.A., Barashkov N.A., Romanov G.P. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, Vol. 6, No. 8, pp. 854–863
Association of IL28B and IL10 gene polymorphism with predisposition to tick-borne encephalitis in a Russian population Barkhash A.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. TICKS TICK-BORNE DIS, 2016, Vol. 7, No. 5. P. 808-812
Полиморфизм генов CD209 и TLR3 в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. RUSS J GENET+, 2016, Т.52, №6, С. 697-704.
Полиморфизм генов c-fms, ITGB3, CCR2 и DBH в популяциях староверов Тюмени и русских Новосибирска Губина М.А., Бабенко В.Н., Иванощук Д.Е., Шуряева А.К., Латыева О.О., Соловьева И.Г., Пономарева М.Н., Коновалова Н.А., Максимов В.Н., Воевода М.И. Molecular Biology, 2016, 2016 год, №2, том 50, с.246-254
Whole Exome Sequencing Reveals Homozygous Mutations in RAI1, OTOF, and SLC26A4 Genes Associated with Nonsyndromic Hearing Loss in Altaian Families (South Siberia) Сhurbanov AY, Karafet TM, Morozov IV, Mikhalskaia VY, Zytsar MV, Bondar AA, Posukh OL. PloS One, 2016, 2016 Apr 15;11(4):e0153841. doi: 10.1371/journal.pone.0153841. eCollection 2016
Spectrum and Frequency of the GJB2 Gene Pathogenic Variants in a Large Cohort of Patients with Hearing Impairment Living in a Subarctic Region of Russia (the Sakha Republic) Barashkov NA, Pshennikova VG, Posukh OL, Teryutin FM, Solovyev AV, Klarov LA, Romanov GP, Gotovtsev NN, Kozhevnikov AA, Kirillina EV, Sidorova OG, Vasilyevа LM, Fedotova EE, Morozov IV, Bondar AA, Solovyevа NA, Kononova SK, Rafailov AM, Sazonov NN, Alekseev AN, Tomsky MI, Dzhemileva LU, Khusnutdinova EK, Fedorova SA PloS One, 2016, 2016 May 25;11(5):e0156300. doi: 10.1371/journal.pone.0156300
[Gene Polymorphism of the c-fms, ITGB3,CCR2, and DBH genes in the populations of old believers of the Tyumen oblast and Russian residents of Novosibirsk]. Gubina MA, Babenko VN, Ivanoshchuk DE, Shuryaeva AK, Latieva OO, Solov'eva IG, Ponomareva MN, Konovalova NA, Maksimov VN, Voevoda MI. Molecular Biology, 2016, 50(2):246-254
The Dynamics of the Composition of mtDNA Haplotypes of the Ancient Population of the Altai Mountains from the Early Bronze Age (3rd Millennium BC) to the Iron Age (2nd-1st Centuries BC) Gubina MA, Kulikov IV, Babenko VN, Chikisheva TA, Romaschenko AG, Voevoda MI, Molodin VI. GENETICA, 2016, 52(1):106-119
ДИНАМИКА СОСТАВА ГАПЛОТИПОВ мтДНК ДРЕВНЕГО НАСЕЛЕНИЯ ГОРНОГО АЛТАЯ ОТ ЭПОХИ РАННЕЙ БРОНЗЫ (III тыс. до н. э.) ДО ЖЕЛЕЗНОГО ВЕКА (II–I вв. до н. э.) Губина МА Куликов ИВ, Бабенко ВН, Чикишева ТА, Ромащенко АГ Воевода МИ, Молодин ВИ Генетика, 2016, 52(1):106-119
Haplotype analysis of the HFE gene among populations of Northern Eurasia, in patients with metabolic disorders or stomach cancer, and in long-lived people Mikhailova SV, Babenko VN, Ivanoshchuk DE, Gubina MA, Maksimov VN, Solovjova IG, Voevoda MI. BMC GENET, 2016, 17(1):83. doi: 10.1186/s12863-016-0396-z.
Candidate SNP markers of chronopathologies are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters Petr Ponomarenko, Dmitry Rasskazov, Valentin Suslov, Ekaterina Sharypova, Ludmila Savinkova, Olga Podkolodnaya, Nikolay Podkolodny, Natalya Tverdokhleb, Irina Chadaeva, Mikhail Ponomarenko, Nikolay Kolchanov Biomed Res Int, 2016, vol. 2016, Article ID 8642703. doi:10.1155/2016/8642703
The Simons Genome Diversity Project: 300 genomes from 142 diverse populations. Mallick S., Li H., Lipson M., Mathieson I., Gymrek M. Racimo F., Zhao M., Chennagiri N., Nordenfelt S., Tandon A., Skoglund P., Lazaridis I., Sankararaman S., Fu Q., Rohland N., Renaud G., Erlich Y., Willems T., Gallo C., Spence J.P., Song Y.S., Poletti G., Balloux F., van Driem G., de Knijff P., Romero I.G., Jha A.R., Behar D.M., Bravi C.M., Capelli C., Hervig T., Moreno-Estrada A., Posukh O.L., Balanovska E., Balanovsky O., Karachanak-Yankova S., Sahakyan H., Toncheva D., Yepiskoposyan L., Tyler-Smith C., Xue Y., Abdullah M.S., Ruiz-Linares A., Beall C.M., Di Rienzo A., Jeong C., Starikovskaya E.B., Metspalu E., Parik J., Villems R., Henn B.M., Hodoglugil U., Mahley R., Sajantila A., Stamatoyannopoulos G., Wee J.T., Khusainova R., Khusnutdinova E., Litvinov S., Ayodo G., Comas D., Hammer M.F., Kivisild T., Klitz W., Winkler C.A., Labuda D., Bamshad M., Jorde L.B., Tishkoff S.A., Watkins W.S., Metspalu M., Dryomov S., Sukernik R., Singh L., Thangaraj K., Pääbo S., Kelso J., Patterson N., Reich D. NATURE, 2016, 2016 Sep 21;538(7624):201-206. doi: 10.1038/nature18964
Biomedical and candidate SNP markers of chronopathologies can significantly change the affinity of the ТАТА-binding protein to the promoters of human genes. Rasskazov DA, Podkolodnyy NL, Podkolodnaya OA, Tverdokhleb NN, Suslov VV, Savinkova LK, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, 7, 6, 738-748
Effects of SNPs in the positioning regions of RNA polymerase II on the TBP/promoter affinity in genes of the human circadian clock. Podkolodnaya OA, Rasskazov DA, Podkolodnyy NL, Podkolodnaya NN, Suslov VV, Savinkova LK, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, 7, 6, 759-770
Genomic analyses inform on migration events during the peopling of Eurasia Pagani L, Lawson DJ, Jagoda E, Mörseburg A, Eriksson A, Mitt M, Clemente F, Hudjashov G, DeGiorgio M, Saag L, Wall JD, Cardona A, Mägi R, Sayres MA, Kaewert S, Inchley C, Scheib CL, Järve M, Karmin M, Jacobs GS, Antao T, Iliescu FM, Kushniarevich A, Ayub Q, Tyler-Smith C, Xue Y, Yunusbayev B, Tambets K, Mallick CB, Saag L, Pocheshkhova E, Andriadze G, Muller C, Westaway MC, Lambert DM, Zoraqi G, Turdikulova S, Dalimova D, Sabitov Z, Sultana GN, Lachance J, Tishkoff S, Momynaliev K, Isakova J, Damba LD, Gubina M, Nymadawa P, Evseeva I, Atramentova L, Utevska O, Ricaut FX, Brucato N, Sudoyo H, Letellier T, Cox MP, Barashkov NA, Škaro V, Mulahasanovic L, Primorac D, Sahakyan H, Mormina M, Eichstaedt CA, Lichman DV, Abdullah S, Chaubey G, Wee JT, Mihailov E, Karunas A, Litvinov S, Khusainova R, Ekomasova N, Akhmetova V, Khidiyatova I, Marjanović D, Yepiskoposyan L, Behar DM, Balanovska E, Metspalu A, Derenko M, Malyarchuk B, Voevoda M, Fedorova SA, Osipova LP, Lahr MM, Gerbault P, Leavesley M, Migliano AB, Petraglia M, Balanovsky O, Khusnutdinova EK, Metspalu E, Thomas MG, Manica A, Nielsen R, Villems R, Willerslev E, Kivisild T, Metspalu M NATURE, 2016, 2016 Sep 21;538(7624):238-242. [Epub ahead of print]
Новая транзиция c.1621C>T (p.Gln541*) гена FYCO1 – основная причина аутосомно-рецессивной формы катаракты (CTRCT18) в Якутии: результаты полноэкзомного секвенирования. Барашков Н.А., Коновалов Ф.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Пшенникова В.Г., Сапожникова Н.В., Вытюжина Л.С., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А. Медицинская генетика, 2016, Т.15. №10. С. 25-33.
Математическая модель циркадного осциллятора млекопитающих: взаимодействие с системой NAD+/SIRT1 и возрастные изменения экспрессии генов циркадного осциллятора Подколодный Н.Л., Твердохлеб Н.Н., Подколодная О.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(6):848-856
Analysis of differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals Babenko V.N., Bragin A.O., Spitsina A.M., Chadaeva I.V., Galieva E.R., Orlova G.V., Medvedeva I.V., Orlov Y.L. J INTEGR BIOINFORM, 2016, 13(4):292. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-292
Эволюция CpG-островов путем тандемных дупликаций Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л., Исакова Ж.И., Антонов Д.А., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016; 20(6):746-755 DOI 10.18699/VJ16.191
Полиморфизм регуляторной области гена LCT в некоторых тюркоязычных популяциях Алтае-Саянского региона. И.В. Пилипенко, М.С. Пристяжнюк, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода, А.С. Пилипенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):887-893
Молекулярная генетика MODY. М. И. Воевода, А. А. Иванова, Е. В. Шахтшнейдер, А. К. Овсянникова, С. В. Михайлова, К. С. Астракова, С. М. Воевода, О. Д. Рымар TERAPEVT ARKH, 2016
2015
MtDNA Haplogroup A10 Lineages in Bronze Age Samples Suggest That Ancient Autochthonous Human Groups Contributed to the Specificity of the Indigenous West Siberian Population Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vyacheslav I. Molodin, Aida G. Romaschenko PloS One, 2015
Influence of Polymorphisms -824 A/G Gene of Tumor Necrosis Factor Alpha on the Basic Economic Useful Traits of Cattle Kochnev N.N., Krytsyna T.I., Smirnova A.M., Yudin N.S. biotech asia, 2015, V. 12, No. 1, P. 243-248.
Effect of flanking sequences on the accuracy of the recognition of transcription factor binding sites. Khlebodarova T. M., Oshchepkov D. Yu., Levitsky V. G., Podkolodnaya O. A., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Stepanenko I. L., Kolchanov N. A. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, Vol. 5, No. 4, p. 322–329
Применение репродуктивных технологий для повышения эффективности геномной селекции молочного крупного рогатого скота Юдин Н.С., Лукьянов К.И., Воевода, Колчанов Н.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, Том 19, № 3, стр. 77-85.
ИССЛЕДОВАНИЕ АССОЦИАЦИЙ НОВЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ САХАРНОГО ДИАБЕТА 2 ТИПА НА ЗАПАДНО-СИБИРСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ ЕВРОПЕОИДОВ Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Михайлова С.В., Максимов В.Н., Воевода М.И. Siberian scientific medical journal, 2015, Т. 35. № 2. С. 74-79.
ПРОВЕРКА 8 ОНП НА ПРИГОДНОСТЬ В КАЧЕСТВЕ МАРКЕРОВ РИСКА РАЗВИТИЯ ИНФАРКТА МИОКАРДА У ЖИТЕЛЕЙ НОВОСИБИРСКА Орлов П.С., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Атеросклероз, 2015
Association Analysis of Genetic Variants with Type Diabetes in a Mongolian Population in China. Bai H, Liu H, Suyalatu S, Guo X, Chu S, Chen Y, Lan T, Borjigin B, Orlov YL, Posukh OL, Yang X, Guilan G, Osipova LP, Wu Q, Narisu N. Journal of Diabetes Research, 2015, 2015: 613236. doi: 10.1155/2015/613236. Epub 2015 Jul 28.
Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans. Raghavan M, Steinrücken M, Harris K, Schiffels S, Rasmussen S, DeGiorgio M, Albrechtsen A, Valdiosera C, Ávila-Arcos MC, Malaspinas AS, Eriksson A, Moltke I, Metspalu M, Homburger JR, Wall J, Cornejo OE, Moreno-Mayar JV, Korneliussen TS, Pierre T, Rasmussen M, Campos PF, Damgaard Pde B, Allentoft ME, Lindo J, Metspalu E, Rodríguez-Varela R, Mansilla J, Henrickson C, Seguin-Orlando A, Malmström H, Stafford T Jr, Shringarpure SS, Moreno-Estrada A, Karmin M, Tambets K, Bergström A, Xue Y, Warmuth V, Friend AD, Singarayer J, Valdes P, Balloux F, Leboreiro I, Vera JL, Rangel-Villalobos H, Pettener D, Luiselli D, Davis LG, Heyer E, Zollikofer CP, Ponce de León MS, Smith CI, Grimes V, Pike KA, Deal M, Fuller BT, Arriaza B, Standen V, Luz MF, Ricaut F, Guidon N, Osipova L, Voevoda MI, Posukh OL, Balanovsky O, Lavryashina M, Bogunov Y, Khusnutdinova E, Gubina M, Balanovska E, Fedorova S, Litvinov S, Malyarchuk B, Derenko M, Mosher MJ, Archer D, Cybulski J, Petzelt B, Mitchell J, Worl R, Norman PJ, Parham P, Kemp BM, Kivisild T, Tyler-Smith C, Sandhu MS, Crawford M, Villems R, Smith DG, Waters MR, Goebel T, Johnson JR, Malhi RS, Jakobsson M, Meltzer DJ, Manica A, Durbin R, Bustamante CD, Song YS, Nielsen R, Willerslev E. SCIENCE, 2015, 349(6250):aab3884. doi: 10.1126/science.aab3884. Epub 2015 Jul 21.
Global diversity, population stratification, and selection of human copy-number variation. Sudmant PH, Mallick S, Nelson BJ, Hormozdiari F, Krumm N, Huddleston J, Coe BP, Baker C, Nordenfelt S, Bamshad M, Jorde LB, Posukh OL, Sahakyan H, Watkins WS, Yepiskoposyan L, Abdullah MS, Bravi CM, Capelli C, Hervig T, Wee JT, Tyler-Smith C, van Driem G, Romero IG, Jha AR, Karachanak-Yankova S, Toncheva D, Comas D, Henn B, Kivisild T, Ruiz-Linares A, Sajantila A, Metspalu E, Parik J, Villems R, Starikovskaya EB, Ayodo G, Beall CM, Di Rienzo A, Hammer M, Khusainova R, Khusnutdinova E, Klitz W, Winkler C, Labuda D, Metspalu M, Tishkoff SA, Dryomov S, Sukernik R, Patterson N, Reich D, Eichler EE. SCIENCE, 2015, 349(6253):aab3761. doi: 10.1126/science.aab3761. Epub 2015 Aug 6.
Полиморфизм гена TRPM8 в кыргызской популяции:возможная связь с высокогорной адаптацией. Бабенко ВН., Исакова ЖТ., Талайбекова ЭТ., Асамбаева ДА., Кобзев ВФ., Потапова ТА., Воевода МИ., Алдашев АА. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 19(5), 630-637
117 Analysis of SNP containing sites in human genome using text complexity estimates Nataly S. Safronova, Vladimir N. Babenko, Yuriy L. Orlov Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2015, 33:sup1, 73-74, DOI:10.1080/07391102.2015.1032750
19 Implication of transposons distribution on chromatin state and genome architecture in human Vladimir N. Babenko, Vladimir F. Matvienko, Nataly S. Safronova Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2015, sup1, 10-11, DOI: 10.1080/07391102.2015.1032559
The Mammalian Circadian Clock: Gene Regulatory Network and Computer Analysis O.A. Podkolodnaya, N.N. Podkolodnaya, N.L. Podkolodnyy Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, Vol. 5, No. 4, pp. 354–362
Association of Dopamine Receptor D4 (DRD4) Gene Polymorphism with Cardiovascular Disease Risk Factors N. S. Yudin, T. M. Mishakova, E. V. Ignatieva, V. N. Maksimov, V. V. Gafarov, S. K. Malyutina, and M. I. Voevoda Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, Vol. 5, No. 6, pp. 650–655. doi: 10.1134/S2079059715060192
АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА ADRA2B С ФАКТОРАМИ РИСКА СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ В ПОПУЛЯЦИИ КОРЕННЫХ ЖИТЕЛЕЙ ГОРНОЙ ШОРИИ Мулерова Т.А., Янкин А.Ю., Рубцова Е.В., Кузьмина А.А., Орлов П.С., Татарникова Н.П., Максимов В.Н., Воевода М.И., Огарков М.Ю. Бюллетень сибирской медицины, 2015, Т. 14. № 2. С. 29-34.
Оценка роли однонуклеотидного полиморфизма в гене лимфотоксина бета при доместикации свиньи на основе биоинформационного и экспериментального подходов Р.Б. Айтназаров, Е.В. Игнатьева, Н.Э. Базарова, В.Г.Левицкий, С.П. Князев, Я. Гон, Н.С. Юдин Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, Т.19, №6 Стр.699-706
Биомедицинские и кандидатные SNP-маркеры для хронопатологий могут достоверно изменять сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека. Рассказов Д.А., Подколодный Н.Л., Подколодная О.А., Подколодная Н.Н., Суслов В.В., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 6, 19, 691-698
Влияние однонуклеотидных полиморфных замен в районах позиционирования РНК-полимеразы II на сродство к ним TBP в генах циркадных часов человека Подколодная О.А., Рассказов Д.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Суслов В.В., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 6, 19, 682-690
Проверка ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов генов KIF6, PALLD, SNX19, MYH15, VAMP8 генетического рискометра ишемической болезни сердца с внезапной сердечной смертью Максимов В.Н., Иванова А.А., Орлов П.С., Савченко С.В., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2015, Том 10, № 126, стр. 12-18.
The extent of linkage disequilibrium in the ancient Ukrainian grey cattle breed Boussaha M., Letaief R., Yudin N., Voevoda M., Rocha D. Global Journal of Animal Breeding and Genetics, 2015, Vol. 3, No. 4, P. 159-163
Мировые тенденции в селекции молочного скота Лукьянов К.И., Солошенко В.А., Клименок И.И., Юдин Н.С. Генетика и разведение животных, 2015, № 3, стр. 63-69.
Transient receptor potential melastatin 8 gene polymorphism is associated with cold-induced airway hyperresponsiveness in bronchial asthma. Naumov DE, Perelman JM, Kolosov VP, Potapova TA, Maksimov VN, Zhou X RESPIROLOGY, 2015, 20(8):1192-7
Одновременное воздействие несколькими антисмысловыми олигонуклеотидными производными, его эффективность на примере липидного обмена мыши Ошевский С.И., Рагино Ю.И., Каштанова Е.В., Полонская Я.В., Стахнёва Е.М., Николин В.П., Попова Н.А., Кораблев А.Н.. Колчанов Н.А., Воевода М.И. Атеросклероз, 2015, 3 (том 11), с. 72-78
ОЦЕНКА ЗНАЧИМОСТИ ЛИПИДНОГО МАРКЕРА ЛИПОПРОТЕИН (А) В ДИАГНОСТИКЕ БОЛЬНЫХ ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНИ СЕРДЦА Маздорова Е.В., Николаев К.Ю., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Максимов В.Н., Рагино Ю.И., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2015, 2015. Т. 55. № 8. С. 49.
Оценка значимости липидного маркера липопротеина (а) в диагностике больных ишемической болезнью сердца Маздорова Е.В., Николаев К.Ю., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Максимов В.Н., Рагино Ю.И., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2015, Т. 55, № 8: 49.
Проверка 8 ОНП на пригодность в качестве маркеров риска развития инфаркта миокарда у жителей Новосибирска П.С. Орлов, В.Н. Максимов, В.В. Гафаров, С.К. Малютина, А.Г. Ромащенко, М.И. Воевода. Атеросклероз, 2015, №1 (11): 14-19.
Sleep disorders and the TNF-α/G-308A polymorphism in program WHO MONICA MOPSY V. Gafarov, M. Voevoda, E. Gromova, I. Gagulin, A. Gafarova, V. Maximov, N. Judin, T. Mishakova Somnologie, 2015, Suppl 1: 13.
The spread of porcine endogenous retroviruses among different populations of wild boar and domestic pig. Knyazev S., Yudin N., Aitnazarov R., Nikitin S., Ermolaev V. Suiform Soundings, 2015, V. 13, No. 2, P. 33-36.
Регуляторная геномика – экспериментально-компьютерные подходы Е. В. Игнатьева, О. А. Подколодная, Ю. Л. Орлов, Г. В. Васильев, Н. А. Колчанов RUSS J GENET+, 2015, Т. 51, № 4, с. 409–429 (Vol. 51, No. 4, pp. 334–352)
Полиморфизм -824 А/G гена фактора некроза опухоли альфа и показатели воспроизводства коров Крыцына Т.И., Кочнев Н.Н., Айтназаров Р.Б., Юдин Н.С., Печурин С.Н. Достижения науки и техники АПК, 2015, Том 29, № 1, стр. 39-41.
Молекулярно-генетические маркеры экономически важных признаков у молочного скота Юдин Н.С., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2015, Том 51, № 5, стр. 600-612.
2014
Анализ ассоциаций однонуклеотидных полиморфизмов гена холодового рецептора TRPM8 с липидными показателями плазмы крови и антропометрическими параметрами у русских. Потапова Т.А, Бабенко В.Н, Кобзев В.Ф, Ромащенко А.Г, Максимов В.Н, Воевода М.И. B EXP BIOL MED+, 2014, т.157. №6. стр.728-733
Реакция респираторной системы на локальное охлаждение у людей с однонуклеотидным полиморфизмом rs11562975 гена термочувствительного ионного канала TRPM8 Козырева Т.В., Ткаченко Е.Я., Потапова Т.А., Воевода М.И Физиология человека, 2014, т.40, №2, с.94-98
The roles of the monomer length and nucleotide context of plant tandem repeats in nucleosome positioning Levitsky VG, Babenko VN, Vershinin AV Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2014, 32(1):115-126.
Анализ анкетирования родителей детей-инвалидов по слуху в Якутии, Туве и Башкортостане: мнение слышащих родителей о причинах потери слуха у ребенка с последующим сравнением с результатами ДНК-тестирования гена GJB2 (Сх26). Барашков Н.А., Джемилева Л.У., Посух О.Л., Соловьев А.В., Бады-Хоо М.С., Пшенникова В.Г., Терютин Ф.М., Лобов С.Л., Неустроева А.Б., Куртанов Х.А., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Рафаилов А.М., Соловьева Н.А., Кононова С.К., Алексеев А.Н., Федорова С.А., Хуснутдинова Э.К. Медицинская генетика, 2014, Т.13. №1. С.8-16.
Изучение наследственных форм тугоухости / глухоты в Республике Тыва. Cообщение I. Эпидемиология нарушений слуха в Республике Тыва. Бады-Хоо М.С., Посух О.Л., Зоркольцева И.В., Скиданова О.В., Барашков Н.А., Омзар О.С., Монгуш Р.Ш., Бамба О.М., Тукар В.М., Зыцарь М.В., Михальская В.Ю. Медицинская генетика, 2014, Т.13. №1. С.17-26.
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ЦИРКАДНЫХ ЧАСОВ И МЕТАБОЛИЗМА ЭНЕРГЕТИЧЕСКИХ СУБСТРАТОВ МЛЕКОПИТАЮЩИХ Подколодная Ольга Александровна RUSS J GENET+, 2014, № 2, том 50, № 2, с. 125–137
Association between polymorphisms in OAS2 and CD209 genes and predisposition to chronic hepatitis C in Russian population Barkhash A.V., Kochneva G.V., Chub E.V., Mikhailova S.V., Romaschenko A.G. MICROBES INFECT, 2014, Vol. 16, No. 5, P. 445-449.
Genetic basis of olfactory cognition: extremely high level of DNA sequence polymorphism in promoter regions of the human olfactory receptor genes revealed using the 1000 Genomes Project dataset Ignatieva E.V., Levitsky V.G., Yudin N.S., Moshkin M.P., Kolchanov N.A. Front Psychol, 2014, published: 24 March 2014 doi: 10.3389/fpsyg.2014.00247
Анализ аутосомных микросателлитных ДНК-локусов в геноме кыргызов. Исакова ЖТ, Бабенко ВН, Асамбаева ДА, Талайбекова ЭТ, Алдашев АА Доклады нациаональной академии наук Кыргызской Распублики, 2014, 2914, N1, с. 64-68
Насыщенность генома свиньи эндогенными ретровирусами: влияние наследственности и среды. Айтназаров Р.Б., Никитин С.В., Князев С.П., Юдин Н.С. Инновации и продовольственная безопасность, 2014, № 2, стр.41-49.
Влияние полиморфизма гена ассоциированного с пролиферацией ядерного элемента PANE1 на репродуктивные показатели у свиней. Юдин Н.С., Айтназаров Р.Б., Князев С.П., Бекенев В.А., Подоба Ю.В., Бердибаева А.В., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 2, стр. 258-262.
Однонуклеотидный полиморфизм в популяции крупного рогатого скота красной степной породы. Люханов M.П., Koроткевич O.С., Себежкo O.И., Юдин Н.С. Современные проблемы науки и образования, 2014, № 1, стр. 326.
Age-related hearing impairment (ARHI) associated with GJB2 single mutation IVS1+1G>A in the Yakut population isolate in Eastern Siberia. Barashkov N.A., Teryutin F.M., Pshennikova V.G., Solovyev A.V., Klarov L.A., Solovyeva N.A., Kozhevnikov A.A., Vasilyeva L.M., Fedotova E.E., Pak M.V., Lekhanova S.N., Zakharova E.V., Savvinova K.E., Gotovtsev N.N., Rafailov A.M., Luginov N.V., Alexeev A.N., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. PloS One, 2014
Идентификация полноразмерных геномов эндогенных ретровирусов у сибирских мини-свиней. Айтназаров Р.Б., Юдин Н.С., Никитин С.В., Ермолаев В.И., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 2, стр. 294-297.
Отбор по поведению и состояние систем макроглобулинов и липопротеинов у американской норки (Neovison vison). Ермолаев В.И., Савина М.А., Юдин Н.С., Айтназаров Р.Б., Никитин С.В., Трапезова Л.И., Трапезов О.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 2, стр. 235-239.
Genetic Organization of Interphase Chromosome Bands and Interbands in Drosophila melanogaster. Zhimulev IF, Zykova TY, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Babenko VN, Demakov SA, Belyaeva ES. PloS One, 2014, 9(7):e101631. doi: 10.1371/journal.pone.0101631
Extremely high carrier frequency of the GJB2 splice site IVS1+1G>A mutation in Eastern Siberia is comparable to the carrier frequency of the sickle cell anemia in Africa. Barashkov N.A., Solovyev A.V., Teryutin, F.M. Pshennikova V.G., Klarov L. A., Romanov G. P., Nakhodkin S.S., Savvinova K.E., Gotovtsev N.N., Solovyeva N.A., Kozhevnikov A.A., Vasilyeva L.M., Fedotova E.E., Pak M.V., Lekhanova S.N., Zakharova E.V., Rafailov A.M., Luginov N.V., Alexeev A.N., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. J Genet Genome Res, 2014, 1:1
Создание панели ДНК пород крупного рогатого скота России для геномных исследований. Юдин Н.С., Васильева Л.А., Белявская В.А., Айтназаров Р.Б., Смирнов П.Н., Хитон М., Легрейд У., Орлова Г.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 3, стр. 202-207
Полиморфизм гена MYOC у пациентов Западной Сибири с первичной открытоугольной глаукомой Иванощук Д.Е., Бычков И.Ю., Михайлова С.В., Коновалова Н.А., Еремина А.В., Пономарева М.Н., Коновалова О.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Бюллетень СО РАМН, 2014, №3, том 34, с. 24-29
Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Iosif Lazaridis, Nick Patterson, Alissa Mittnik, Gabriel Renaud, Swapan Mallick, Karola Kirsanow, Peter H. Sudmant, Joshua G. Schraiber, Sergi Castellano, Mark Lipson, Bonnie Berger, Christos Economou, Ruth Bollongino, Qiaomei Fu, Kirsten I. Bos, Susanne Nordenfelt, Heng Li, Cesare de Filippo, Kay Prüfer, Susanna Sawyer, Cosimo Posth, Wolfgang Haak, Fredrik Hallgren, Elin Fornander, Nadin Rohland, Dominique Delsate, Michael Francken, Jean-Michel Guinet, Joachim Wahl, George Ayodo, Hamza A. Babiker, Graciela Bailliet, Elena Balanovska, Oleg Balanovsky, Ramiro Barrantes, Gabriel Bedoya, Haim Ben-Ami, Judit Bene, Fouad Berrada, Claudio M. Bravi, Francesca Brisighelli, George B. J. Busby, Francesco Cali, Mikhail Churnosov, David E. C. Cole, Daniel Corach, Larissa Damba, George van Driem, Stanislav Dryomov, Jean-Michel Dugoujon, Sardana A. Fedorova, Irene Gallego Romero, Marina Gubina, Michael Hammer, Brenna M. Henn, Tor Hervig, Ugur Hodoglugil, Aashish R. Jha, Sena Karachanak-Yankova, Rita Khusainova, Elza Khusnutdinova, Rick Kittles, Toomas Kivisild, William Klitz, Vaidutis Kučinskas, Alena Kushniarevich, Leila Laredj, Sergey Litvinov, Theologos Loukidis, Robert W. Mahley, Béla Melegh, Ene Metspalu, Julio Molina, Joanna Mountain, Klemetti Näkkäläjärvi, Desislava Nesheva, Thomas Nyambo, Ludmila Osipova, Jüri Parik, Fedor Platonov, Olga Posukh, Valentino Romano, Francisco Rothhammer, Igor Rudan, Ruslan Ruizbakiev, Hovhannes Sahakyan, Antti Sajantila, Antonio Salas, Elena B. Starikovskaya, Ayele Tarekegn, Draga Toncheva, Shahlo Turdikulova, Ingrida Uktveryte, Olga Utevska, René Vasquez, Mercedes Villena, Mikhail Voevoda, Cheryl A. Winkler, Levon Yepiskoposyan, Pierre Zalloua, Tatijana Zemunik, Alan Cooper, Cristian Capelli, Mark G. Thomas, Andres Ruiz-Linares, Sarah A. Tishkoff, Lalji Singh, Kumarasamy Thangaraj, Richard Villems, David Comas, Rem Sukernik, Mait Metspalu, Matthias Meyer, Evan E. Eichler, Joachim Burger, Montgomery Slatkin, Svante Pääbo, Janet Kelso, David Reich, Johannes Krause. NATURE, 2014, 2014 Sep 18;513(7518):409-13. doi: 10.1038/nature13673.
Влияние фланкирующих последовательностей на точность распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов. Хлебодарова Т.М., Ощепков Д.Ю., Левицкий В.Г., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Колчанов Н. А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, т.18, № 4/2, с.876-886.
ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК У СТАРОВЕРОВ СИБИРИ М. А. Губина, В. Н. Бабенко, Л. Д. Дамба, М. Н. Пономарева, Н. А. Коновалова, М. И. Воевода RUSS J GENET+, 2014, том 50, № 6, с. 729–744
Изучение наследственных форм тугоухости / глухоты в Республике Тыва. Cообщение II. Оценка спектра мутаций гена GJB2 (Cx26) и их вклада в этиологию потери слуха. Бады-Хоо М.С., Бондарь А.А., Морозов И.В., Зыцарь М.В., Михальская В.Ю., Скиданова О.В., Барашков Н.А., Монгуш Р.Ш., Омзар О.С., Тукар В.М., Посух О.Л. Медицинская генетика, 2014, №11. С.ХХ
Влияние полиморфизма -824A/G гена фактора некроза опухоли на молочную продуктивность коров красной степной породы. Кочнев Н.Н., Крыцына Т.И., Айтназаров Р.Б., Гончаренко Г.М., Юдин Н.С. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2014, № 4, стр. 68-73.
Ассоциация полиморфизма -824A/G гена фактора некроза опухоли альфа с показателями роста телят красной степной породы. Крыцына Т.И., Кочнев Н.Н., Голубева Е.Б., Айтназаров Р.Б., Гончаренко Г.М., Юдин Н.С. Вестник НГАУ, 2014, № 3, стр. 71-75.
ПОЛНОГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ ПУЛИРОВАННЫХ ВЫБОРОК ДНК КОГОРТ ЧЕЛОВЕКА В.Н. Бабенко, В.Н. Максимов, Е.В. Кулакова, Н.С. Сафронова, М.И. Воевода, Е.И. Рогаев Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Т. 18. N. 4/2, с. 847-855
Ассоциация полиморфизмов TRPM8 с липидами крови и антропометрическими показателями в русской популяции. Potapova TA, Babenko VN, Kobzev VF, Romashchenko AG, Maksimov VN, Voevoda MI. B EXP BIOL MED+, 2014, 157, № 6, 757-761.
ЦИРКАДНЫЕ ЧАСЫ МЛЕКОПИТАЮЩИХ: ГЕННАЯ СЕТЬ И КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ Подколодная О.А., Подколодная Н.Н., Подколодный Н.Л. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Т. 18. N. 4/2. стр. 928-938
Ассоциация полиморфизма гена DRD4 с некоторыми факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний Юдин Н.С., Мишакова Т.М., Игнатьева Е.В., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Малютина С.К., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, №4/3, стр. 1237-1245.
2013
Эффект суппрессии P-элементов с маркерным геном mini-white в межгенных районах DROSOPHILA MELANOGASTER Бабенко В.Н., Матвиенко В. ф. Цитология, 2013, том55, N3, 181-184
Association of single nucleotide polymorphism rs3775291 in the coding region of the TLR3 gene with predisposition to tick-borne encephalitis in a Russian population Barkhash A.V., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. ANTIVIR RES, 2013, Vol. 99, Issue 2, P. 136-138
Гаплотипическое разнообразие мтДНК и У-хромосомы в популяциях Алтай- Саянского района Губина МА, Дамба ЛВ, Бабенко ВН, Ромащенко АГ, Воевода МИ RUSS J GENET+, 2013, 49(3):329-343
Эпидемиология нарушений слуха и результаты первого этапа молекулярно-генетических исследований наследуемых форм нейросенсорной тугоухости/глухоты в Республике Тыва М.С. Бады-Хоо, О.В. Скиданова, О.С. Омзар, Р.Ш. Монгуш, Н.А. Барашков, О.М. Бамба, В.М. Тукар, Е.В. Дувак, О.Л. Посух Здоровье и благополучие в Туве, 2013, №2(6) (май 2013), С.26-35
CCR5, CCR2, apoe, p53, ITGB3 and HFE gene polymorphism in Western Siberia long-livers Ivanoshchuk DE, Mikhaĭlova SV, Kulikov IV, Maksimov VN, Voevoda MI, Romashchenko AG. Adv. Gerontol, 2013, vol.3 № 2, pp.89-92
Adult Opisthorchis felineus major protein fractions deduced from transcripts: Comparison with liver flukes Opisthorchis viverrini and Clonorchis sinensis. Pomaznoy M., Tatkov S., Katokhin A., Afonnikov D., Babenko V., Furman D., Brusentsov I., Belavin P., Najakshin A., Guselnikov S., Vasiliev G., Sivkov A., Prokhortchouk E., Skryabin K., Mordvinov V. EXP PARASITOL, 2013, 135, 297-306. doi:10.1016/j.exppara.2013.07.011
Генетические предикторы инфаркта миокарда у лиц молодого возраста Шестерня П.А., Никулина С.Ю., Шульман В.А., Мартынова Е.А., Демкина А.И., Орлов П.С., Максимов В.Н., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2013, №7 стр.4-8
Ассоциация генетических маркёров со сниженной сократительной функцией сердца у больных с острым коронарным синдромом Ложкина Н.Г., Максимов В.Н., Куликов И.В., Орлов П.С., Куимов А.Д., Воевода М.И. Медицина и образование в Сибири, 2013
Генетические маркёры тяжести поражения коронарных сосудов у больных с острым коронарным синдромом Куликов И.В., Ложкина Н.Г., Максимов В.Н., Орлов П.С., Куимов А.Д., Воевода М.И. Бюллетень СО РАМН, 2013, Т. 33 № 4, С. 65-70.
ПРОФЕССИОНАЛЬНАЯ ХРОНИЧЕСКАЯ ОБСТРУКТИВНАЯ БОЛЕЗНЬ ЛЕГКИХ С ПОЗИЦИЙ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ Шпагина Л.А., Воевода М.И., Котова О.С., Максимов В.Н., Орлов П.С., Шпагин И.С., Герасименко О.Н., Бобров С.В. Бюллетень физиологии и патологии дыхания, 2013, 2013. № 49. С. 8-15.
Пролактин как эндогенный фактор ремиелинизации. Предтеченская Е. В., Попова Н. А., Ходаков А. А., Ромащенко А. А. Практическая медицина, 2013, №1-1 (68)С.44-47
Study of swine alpha-macroglobulin gene-family polymorphism in the context of some problems of animal breeding Yermolaev V.I., Savina M.A., Knyazev S.P., Yudin N.S., Aitnazarov R.B., Bekenev V.A., Deeva V.S., Nikitin S. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2013, Vol. 3, No. 3, p. 225-232
ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК В ПОПУЛЯЦИЯХ КОРЕННЫХ ЖИТЕЛЕЙ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА М. А. Губина, Л. А. Гырголькау, В. Н. Бабенко, Л. Д. Дамба, В. Н. Максимов, М. И. Воевода RUSS J GENET+, 2013, ГЕНЕТИКА, 2013, том 49, № 7, с. 862–876
Association of polymorphism harbored by tumor necrosis factor alpha gene and sex of calf with lactation performance in cattle Yudin N.S., Aitnazarov R.B., Voevoda M.I., Gerlinskaya L.A., Moshkin M.P. ASIAN AUSTRAL J ANIM, 2013, Vol. 26, No. 10, P. 1379-1387
Генетические маркеры личностной тревожности как один из факторов риска развития сердечно-сосудистых заболеваний (программа ВОЗ «MONICA», подпрограмма «MONICA-психосоциальная») Гафаров В.В., Воевода М.И., Громова Е.А., Максимов В.Н., Гагулин И.В., Юдин Н.С., Гафарова А.В., Мишакова Т.М. TERAPEVT ARKH, 2013, № 4, стр. 38-47.
Риск сердечно-сосудистых заболеваний, психосоциальные факторы и их биологические детерминанты (программа ВОЗ “MONICA-психосоциальная») Гафаров В.В., Воевода М.И., Громова Е.А., Максимов В.Н., Гафарова А.В., Гагулин И.В., Юдин Н.С., Мишакова Т.М. Мир науки, культуры, образования, 2013, № 1. С. 252-255.
Экстремально высокая частота гетерозиготных носителей аутосомно-рецессивной глухоты 1А типа в Восточной Сибири сопоставима с частотой гетерозиготного носительства серповидно-клеточной анемии в Африке. Барашков Н.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Соловьева Н.А., Пшенникова В.Г., Кларов Л.А., Сидорова О.Г., Григорьева Л.В., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Саввинова К.Е., Находкин С.С., Кожевников А.А., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Пак М.В., Леханова С.Н., Кононова С.К., Рафаилов А.М., Алексеев А.Н., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А. Якутский медицинский журнал, 2013, №4 (44). С.27-30
Генные сети Н.А. Колчанов, Е.В. Игнатьева, О.А. Подколодная, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Т.17, N4/2, 833-849
Effect of genotype structure for 5 MYOC gene SNPs on its frequency in patients with adult-onset Primary Open Angle Glaucoma (POAG) Ivanoshchuk, DE (Ivanoshchuk, D. E.); Konovalova, NA (Konovalova, N. A.); Konovalova, OS (Konovalova, O. S.); Voevoda, MI (Voevoda, M.I.); Romashchenko, AG (Romashchenko, A. G.) FEBS J, 2013, Volume: 280 Special Issue: SI Pages: 432-432 Supplement: 1 Published: JUL 2013
2012
ПРЕДИКТОРНАЯ РОЛЬ ПОЛИМОРФИЗМОВ ХРОМОСОМЫ 9Sр21.3 И ИХ ВЗАИМОСВЯЗЬ С ОТЯГОЩЕННОЙ НАСЛЕДСТВЕННОСТЬЮ В РАЗВИТИИ ИНФАРКТА МИОКАРДА Шестерня Л.А., Шульман В.А., Никулина С.Ю., Мартынова Е.А., Демкина А.И., Орлов П.С., Максимов В.Н.,Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2012, №6(68) ст.14-18
Routes of nanoparticle uptake into mammalian organisms, their biocompatibility and cellular effect O. A. Podkolodnaya, E. V. Ignatieva, N. L. Podkolodnyy, N. A. Kolchanov Biology Bulletin Reviews, 2012, Volume 2, Issue 4, pp 279–289
Single nucleotide polymorphism in the promoter region of the CD209 gene is associated with human predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Brinton M.A., Voevoda M.I. ANTIVIR RES, 2012, Vol. 93, No. 1. P. 64-68.
Detection of mitochondrial DNA from domestic cattle in European bison (Bison bonasus) from the Altai Republic in Russia Yudin N.S., Kulikov I.V., Gunbin K.V., Aitnazarov R.B., Kushnir A.V., Sipko T.P., Moshkin M.P. ANIM GENET, 2012, Vol. 43, No. 3, P. 362.
Drosophila melanogaster Genome: Correlation of Chromatin State with Splicing and Transcription Regulation Babenko VN, Matvienko VF, Zykov IA Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, Vol. 2, No. 1, pp. 85–96;
Пути поступления наночастиц в организм млекопитающих, их биосовместимость и клеточные эффекты. Подколодная О. А., Игнатьева Е. В. , Подколодный Н. Л. , Колчанов Н. А. . Успехи современной биологии, 2012, Т. 132, № 1, с. 3–15
Патогенетическое значение полиморфизма генов дофаминергической системы, ассоциированных с формированием нарушения сна, в открытой популяции среди мужчин 25—64 лет мегаполиса Западной Сибири Гафаров В.В., Воевода М.И., Громова Е.А., Максимов В.Н., Гафарова А.В., Гагулин И.В., Юдин Н.С., Мишакова Т.М. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2012, № 2 (71), С. 12-18.
SPF-виварий: научно-технологический комплекс для исследований в области нанобиобезопасности Пельтек С.Е., Мошкин М.П., Герлинская Л.А., Горячковская Т.Н., Банникова С.В., Подколодная О.А, Попик В.М., Колчанов Н.А. Нанотехнологии Экология Производство, 2012, №2 (15) март 2012 http://www.nanoprom.net/journal/archive/15.html\
Проверка взаимосвязи между девятью однонуклеотидными полиморфизмами и инфарктом миокарда на сибирской популяции Максимов В. Н.,Куликов И.В., Орлов П.С., Гафаров В.В. Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Вестник РАМН, 2012, №5 страницы с 24-29
A single nucleotide polymorphism in the promoter region of the mink tumor necrosis factor-alpha gene. Yudin N.S., Aitnazarov R.B., Kulikov I.V., Ignatieva E.V., Trapezov O.V. Scientifur, 2012, Vol. 36, No. 3/4, P. 300-304.
Finding biomarkers in non-model species: literature mining of transcription factors involved in bovine embryo development. Turenne N, Tiys E, Ivanisenko V, Yudin N, Ignatieva E, Valour D, Degrelle S, Hue I BioData Mining, 2012, Aug 29;5(1):12
Ассоциация полиморфизма генов дофаминергической системы (DRD4, DAT) с жизненным истощением в открытой популяции среди мужчин 25–64 лет (Новосибирск). Эпидемиологическое исследование по программе ВОЗ «MONICA-psychosocial» Гафаров В.В., Воевода М.И., Громова Е.А., Максимов В.Н., Гафарова А.В., Гагулин И.В., Юдин Н.С., Мишакова Т.М. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика, 2012, № 1, 2012 С. 57-63.
Ассоциация VNTR-полиморфизма генов дофаминергической системы с враждебностью среди мужчин 25–64 лет в открытой популяции мегаполиса Западной Сибири (Новосибирск) Гафаров В.В., Громова Е.А., Максимов В.Н., Юдин Н.С., Мишакова Т.М., Гагулин И.В., Воевода М.И. Медицинская генетика, 2012, Том 11, № 8 (122), 2012. С. 37-42.
Nucleosome Organization in Plant DNA Satellite Sequences Babenko VN, Kutashev KO, Matvienko VF Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, Vol. 2, No. 6, pp. 501–507; http://www.springerlink.com/openurl.asp?genre=article&id=doi:10.1134/S2079059712060020
Полиморфизм генов CCR5, CCR2, apoE, р53, ITGB3 и HFE у долгожителей Западной Сибири Д.Е. Иванощук, С.В. Михайлова, И.В.Куликов, В.Н. Максимов, М.И. Воевода,А.Г. Ромащенко Успехи геронтологии, 2012, № 3, С.394-397
Информационная поддержка исследования механизмов регуляции транскрипции: онтологический подход Подколодный Николай Леонтьевич Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 4/1, т. 16, С. 742-755
Распределенная система RESTful-web-сервисов для реконструкции и анализа генных сетей Подколодный Николай Леонтьевич Семенычев Александр Владимирович Рассказов Дмитрий Александрович Боровский Виктор Геннадьевич Ананько Елена Анатольевна Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Наталья Николаевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 4/1, Т.16, 791-798
Клинико-функциональные и молекулярно-генетические особенности хронической обструктивной болезни легких в условиях высокого профессионального риска. Шпагина Л.А., Воевода М.И., Бобров С.В., Максимов В.Н., Орлов П.С., Шпагин И.С., Герасименко О.Н Пульмонология, 2012, №4 стр. 10-14
НУКЛЕОСОМНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ В САТЕЛЛИТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ ДНК РАСТЕНИЙ В.Н. Бабенко К.О. Куташев В.Ф. Матвиенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 2012, 16(1), 271-278
Генофонд мтДНК населения восточного варианта пахомовской культуры Молодин В.И., Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2012, № 4 (52). С. 62-69.
2011
Полиморфизм гена HFE у населения Северной Азии Михайлова С.В., Ромащенко А.Г., Бабенко В.Н., Губина М.А., Соболева Д.Е., Кобзев В.Ф., Воевода М.И Вестник РАМН, 2011
АССОЦИАТИВНЫЙ АНАЛИЗ НЕКОТОРЫХ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФНЫХ МАРКЕРОВ САХАРНОГО ДИАБЕТА ВТОРОГО ТИПА С ИНФАРКТОМ МИОКАРДА Павел Сергеевич ОРЛОВ, Игорь Вячеславович КУЛИКОВ,Сергей Николаевич УСТИНОВ, Валерий Васильевич ГАФАРОВ,Софья Константиновна МАЛЮТИНА, Аида Герасимовна РОМАЩЕНКО, Михаил Иванович ВОЕВОДА, Владимир Николаевич МАКСИМОВ Бюллетень СО РАМН, 2011, том 31 №5 с19-24
Полиморфизм второго интрона гена SDF1 у галловейской, герефордской и черно-пестрой пород крупного рогатого скота Юдин Н.С., Нефедова М.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2011, Том 47, № 2, стр. 279-283
Ассоциация полиморфизма гена холодового рецептора TRPM8 с липидными показателями крови и антропометрическими параметрами у шорцев Потапова Т.А., Юдин Н.С., Пилипенко И.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Шахтшнейдер Е.В., Огарков М.Ю., Воевода М.И. B EXP BIOL MED+, 2011, №2, стр. 186-190
Protein composition of interband regions in polytene and cell line chromosomes of Drosophila melanogaster. Demakov SA, Vatolina TY, Babenko VN, Semeshin VF, Belyaeva ES, Zhimulev IF. BMC GENOMICS, 2011, 12(1):566
Identical Functional Organization of Nonpolytene and Polytene Chromosomes in Drosophila melanogaster. Vatolina TY, Boldyreva LV, Demakova OV, Demakov SA, Kokoza EB, Semeshin VF, Babenko VN, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF. PloS One, 2011, 6(10):e25960
Linkage and association analyses of glaucoma related traits in a large pedigree from a Dutch genetically isolated population Axenovich T, Zorkoltseva I, Belonogova N, van Koolwijk L, Borodin P, Kirichenko A, Babenko V, Ramdas W, Amin N, Despriet D, Vingerling J, Lemij H, Oostra BA, Klaver C, Aulchenko Y, van Duijn C. J MED GENET, 2011, 48(12):802-9
A method for generating selective DNA probes for the analysis of C-negative regions in human chromosomes. Morozkin ES, Loseva EM, Karamysheva TV, Babenko VN, Laktionov PP, Vlassov VV, Rubtsov NB. CYTOGENET GENOME RES, 2011, 135(1):1-11
Identification and molecular genetic characterization of the polytene chromosome interbands in Drosophila melanogaster Vatolina TIu, Demakov SA, Semeshin VF, Makunin IV, Babenko VN, Beliaeva ES, Zhimulev IF. RUSS J GENET+, 2011, 47(5):597-609
Геном Drosophila melanogaster: cвязь состояния хроматина с регуляцией сплайсинга и транскрипции Бабенко ВН, Матвиенко ВФ, Зыков ИА Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, т.13 N. 3 579-591
Связь однонуклеотидного полиморфизма rs11562975 гена термочувствительного ионного канала TRPM8 с чувствительностью к холоду и ментолу Козырева Т.В.,Ткаченко Е.Я., Потапова Т.А., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Физиология человека, 2011, №2, Т.37, С.71-76
Роль транскрипционного фактора Sp4 и коннексина-40 в генезе суправентрикулярных аритмий Воевода М.И., Казаринова Ю.Л., Максимов В.Н., Куликов И.В., Малютина С.К., Никулина С.Ю., Ромащенко А.Г., Исаченко О.О., Чернова А.А., Шульман В.А. Вестник аритмологии, 2011, № 63, С. 32-35.
CCL5/RANTES gene polymorphisms in Slavonic patients with myocardial infarction Tereshchenko IP, Petrkova J, Voevoda MI, Taborsky M, Navratilova Z, Romaschenko AG, Maksimov VN, Mrazek F, Petrek M. MEDIAT INFLAMM, 2011, р. 1-6.
Митохондриальная ДНК женщины из пещеры Каминная (Горный Алтай) эпохи позднего неолита Пилипенко А.С., Молодин В.И., Ромащенко А.Г. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Том 15, № 4, стр. 633-643
Полиморфизм гена дофамин-β гидроксилазы, параметры вегетативной регуляции и клинико патологические характеристики злокачественного процесса у больных раком желудка Соловьева И.Г., Губина М.А., Ромащенко А.Г., Черенкова М.М.,Понебратец О.Ю., Широков Р.В., Абрамова Т.Я., Сидоров С.В.,Чердынцева Н.В., Козлов В.А. Сибирский онкологический журнал, 2011, №5.-с.46-51.
2010
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, 275:337-339
Компьютерная система филогенетического анализа генных сетей: изучение эволюции генной сети клеточного цикла животных Тимонов В.С., Турнаев И.И., Генаев М.А., Гунбин К.В. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Т. 275, 412–414.
Ландшафт альтернативного сплайсинга в геноме Drosophila melanogaster Бабенко В.Н., Айтназаров Р.Б., Гончаров Ф.В., Жимулев И.Ф. RUSS J GENET+, 2010, № 9,т. 46, с. 1168-1170
A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2010, 4, 65, 143-145
Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека, связанный с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита, в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Molecular Biology, 2010, Т.44, №6. С. 985-993.
Триолигонуклеотидные реагенты: адресованная модификация РНК. Ошевский С. И. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2010, №1, V430, pp53-56
Does drive toward canonic exonic splicing sites exist in mammals Babenko V, Ward W, Ruvinsky A J MOL EVOL, 2010, 70(4):387-394
Gene density profile reveals the marking of late replicated domains in the Drosophila melanogaster genome Belyakin SN, Babenko VN, Maksimov DA, Shloma VV, Kvon EZ, Belyaeva ES, Zhimulev IF. CHROMOSOME RES, 2010, 119(6):589-600
Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
Paucity and preferential suppression of transgenes in late replication domains of the D. melanogaster genome Babenko V.N., Makunin I.V., Brusentsova I.V., Belyaeva E.S., Maksimov D.A., Belyakin S.N., Maroy P., Vasil’eva L.A., Zhimulev I.F. BMC GENOMICS, 2010, V. 11. P. 318-332
Адаптация к бездне Афонников Д.А., Гунбин В.К., Суслов В.В. Химия и жизнь, 2010, №3, 38-41
The ethnospecific distribution of the HFE haplotypes for IVS2(+4)t/c, IVS(-44)t/c, and IVS5(-47)g/a in populations of Russia and possible effects of these single-nucleotide polymorphisms in splicing Mikhailova S.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romashchenko A.G. GENET TEST, 2010, V. 14, N. 4, P. 461–469
Variability in the 2'-5'-oligoadenylate synthetase gene cluster is associated with human predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced disease Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Myasnikova N.G., Pilipenko P.I., Romaschenko A.G., Voevoda M.I., Brinton M.A. J INFECT DIS, 2010, Vol. 202, No. 12, P. 1813-1818
Анализ вырожденных олигонуклеотидных мотивов в промоторах генов миРНК, экспрессирующихся в различных тканях млекопитающих О.В.Вишневский, К.В.Гунбин, А.В.Бочарников, Е.В.Березиков Вестник МГУ, 2010, No. 4, pp. 73–75
Анализ полиморфизма генов матриксных металлопротеиназ 2 и 9 у пациентов с ишемической болезнью сердца. Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачёва О.М., Максимов В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. TERAPEVT ARKH, 2010, 2010, № 1, С. 31-34.
Анализ полиморфизма трех позиций промоторного региона гена TNF-a у пациентов с ишемической болезнью сердца, нестабильной стенокардией и инфарктом миокарда Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачева О.М., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2010, Т. 50, № 2, стр. 9-14
Молекулярно-генетические аспекты психонейроиммунных взаимоотношений у здоровых европеоидов Соловьева И. Г., Губина М. А., Стенина А. С., Абрамова Т. Я., Соболева Д. Е., Кожевников В. С., Ромащенко А. Г., Короленко Ц. П., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, 2 (53). - С. 10-13
Психоэмоциональные особенности и полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы 444G/A у больных раком желудка Соловьева И. Г., Короленко Ц. П., Губина М. А., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, 2 (53). - С. 78-80.
Роль полиморфизма С(-260)-Т гена CD14 в течении и исходе нозокомиальной пневмонии Байгозина Е.А., Совалкин В.И., Куликов И.В., Потапова Т.А., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Пульмонология, 2009, № 5, стр.65-67
Характеристика молекулярно-генетической организации интеркалярного гетерохроматина в районе 10А-В D. melanogaster Бабенко ВН, Похолкова ГС, Кокоза ЕВ, Андреенкова НС, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, 424:27-30
Эволюция ключевых белков клеточного цикла коррелирует с увеличением сложности эукариотических организмов Турнаев И.И., Гунбин К.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 2, 426, 265-269
Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA BMC GENOMICS, 2009, V. 1, 10, 639
Молекулярно-генетические аспекты психонейроиммунных взаимоотношений у здоровых европеоидов Соловьева И. Г., Губина М. А., Стенина А. С., Абрамова Т. Я., Соболева Д. Е., Кожевников В. С., Ромащенко А. Г., Короленко Ц. П., Абрамов В. В Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, №2 (53), с 10-13
Полиморфизм гена аполипопротеина Е в популяции коренных жителей Горной Шории и его ассоциация с параметрами углеводного обмена Шахтшнейдер Е.В., Воевода М.И., Огарков М.Ю., Барбараш О.Л., Поликутина О.М., Казачек Я.В., Баум В.А., Юдин Н.С., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Атеросклероз, 2009, Том 5, №1, стр. 28-32
Психоэмоциональные особенности и полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы 444G/A у больных раком желудка Соловьева И. Г., Короленко Ц. П., Губина М. А., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, - 2 (53). - С. 78-80
The macrophage migration inhibitory factor (MIF) gene polymorphism in Czech and Russian patients with myocardial infarction Tereshchenko IP, Petrkova J, Mrazek F, Lukl J, Maksimov VN, Romaschenko AG, Voevoda MI, Petrek M. CLIN CHIM ACTA, 2009, V. 402, No. 1-2, P.199-202
Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 4, 425, 546-548
Изучение генетико-антропологического состава населения древних историко-культурных общностей Алтая Чикишева Т.А., Поздняков Д.В., Губина М.А., Куликов И.В. Вестник РГНФ, 2009, 3(56) с.46-57.
Мутации в гене филаггрина у больных с вульгарным ихтиозом в популяции Новосибирска Максимов В.Н., Куликов И.В., Семаев С.Е., Максимова Ю.В., Аллахвердян А.А., Простякова Е.М., Батина О.В., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Бюллетень сибирской медицины, 2008, № 1, стр. 173-176
Особенности захоронения младенцев в жилищах городища Чича-1 в Баабинской лесостепи по данным анализа структуры ДНК Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2008, № 2, Т. 34, С. 57-67
АССОЦИАТИВНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ P53 И C-FMS С РАЗВИТИЕМ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ У РУССКИХ ЖЕНЩИН И.В. Пилипенко, О.В. Горчакова, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода,Н.Н. Бабышкина, Н.В. Чугунова, А.В. Дорошенко, А.Г. Ромащенко Сибирский онкологический журнал, 2008
Genetic variation in the enigmatic Altaian Kazakhs of South-Central Russia: Insights into Turkic population history Gokcumen O, Dulik MC, Pai AA, Zhadanov SI, Rubinstein S, Osipova LP, Andreenkov OV, Tabikhanova LE, Gubina MA, Labuda D, Schurr TG AM J PHYS ANTHROPOL, 2008, 136(3), P. 278-293
Russian Old Believers: genetic consequences of their persecution and exile, as shown by mitochondrial DNA evidence Rubinstein S, Dulik MC, Gokcumen O, Zhadanov S, Osipova L, Cocca M, Mehta N, Gubina M, Posukh O, Schurr TG HUM BIOL, 2008, Jun;80(3):203-37
TG Russian Old Believers: genetic consequences of their persecution and exile, as shown by mitochondrial DNA evidence Rubinstein S, Dulik MC, Gokcumen O, Zhadanov S, Osipova L, Cocca M, Mehta N, Gubina M, Posukh O, Schurr TG HUM BIOL, 2008, Jun;80(3):203-37
TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko INTELL DATA ANAL, 2008, No. 5, Vol. 12, P. 443-461
2007
Консервативность ДНК 3’-нетранслируемой области гена GRO1 северного оленя Юдин Н.С., Потапова Т.А., Кобзев В.Ф., Южаков А.А., Кушнир А.В. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2007, № 9, стр. 93-97
Палеогенетическое исследование древнего населения Горного Алтая Чикишева Т.А., Губина М.А., Куликов И.В., Карафет Т.М., ВоеводаМ.И., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2007, N4 (32) c 130-142
A counter clockwise northern route of the Y-chromosome haplogroup N from Southeast Asia towards Europe Siiri Rootsi, Lev A. Zhivotovsky, Marian Baldovic, Manfred Kayser, Ildus A. Kutuev, Rita Khusainova, Marina A. Bermisheva, Marina Gubina, Sardana A. Fedorova, Anne-Mai Ilum, Elza K. Khusnutdinova, Mikhail I. Voevoda, Ludmila P. EUR J HUM GENET, 2007, Feb;15(2):204-11
Long-term trends in evolution of indels in protein sequences Wolf Y, Madej T, Babenko V, Shoemaker B, Panchenko AR. BMC EVOL BIOL, 2007, 7,19
Model of the reception of hedgehog morphogen concentration gradient: comparison with an extended range of experimental data Gunbin K.V., Omelyanchuk L.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, 2b, 5, 491-507
Accumulation of slightly deleterious mutations in mitochondrial protein-coding genes of large versus small mammals Popadin K., Polishchuk L.V., Mamirova L., Knorre D., Gunbin K. P NATL ACAD SCI USA, 2007, 33, 104, 13390-13395
The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A. In Silico Biology, 2007, 3, 7, 333-354
Vasa-related genes and their expression in stem cells of colonial parasitic rhizocephalan barnacle Polyascus polygenea (Arthropoda: Crustacea: Cirripedia: Rhizocephala) Shukalyuk A.I., Golovnina K.A., Baiborodin S.I., Gunbin K.V., Blinov A.G., Isaeva V.V. CELL BIOL INT, 2007, 31(2):97-108
The location of the gene regions under selective pressures: PLATO algorithm parallelization Vyatkin Yu. V., Gunbin K.V., Snytnikov A.V., Afonnikov D.A. Lect Notes Comput Sci, 2007, V. 4671, P. 184-187.
Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 2, 11, 373-400
Ассоциация аллелей гена IL10(G-1087A) с уровнем пролактина и инсулина в периферической крови у здоровых европеоидов Соловьева И.Г., Смольникова М.В., Губина М.А., Дортман В.В., Кожевников В.С., Меняева Е.В., Коненков В.И., Абрамов В.В. Омский научный вестник, 2007, №3 (61), приложение 2.
Beringian standstill and spread of Native American founders Tamm E., Kivisild T., Reidla M., Metspalu M., Smith D.G., Mulligan C.J., Bravi C.M., Rickards O., Martinez-Labarga C., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A., Golubenko M.V., Stepanov V.A., Gubina M.A., Zhadanov S.I., Osipova L.P., Damba L., Voevoda M.I., Dipi PloS One, 2007, 2(9):e829
Делеция 2282del4 в гене филаггрина в популяции жителей Новосибирска и у больных вульгарным ихтиозом Максимов В.Н., Куликов И.В., Семаев С.Е., Максимова Ю.В., Простякова Е.М., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Медицинская генетика, 2007, № 8, С. 21-23
2006
Полиморфизм гена аполипопротеина Е, желчно-каменная болезнь и панкреатит Григорьева И.Н., Никитенко Т.М., Романова Т.И., Осипенко М.Ф., Егошина М.А., Сединина Е.В., Венжина Ю.Ю., Шахтшнейдер Е.В., Куликов И.В., Максимов В.Н., Усов С.А., Мироненко Т.В., Данильчева Т.В., Иванова М.В., Потапова Т.А., Ромащенко А.Г. Малютина С. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 4, С. 80-88.
Численное исследование модели рецепции градиента концентрации морфогена Hedgehog В.В.Когай, К.В.Гунбин, Л.В.Омельянчук, С.И. Фадеев, Н.А.Колчанов Сибирский журнал индустриальной математики, 2006, 3(27), IX, 66-79
Этногенетические особенности подверженности атеросклерозу в этнических группах Сибири (на примере гена аполипопротеина Е) Воевода М.И., Степанов В.А., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 2, С. 63-72.
Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck GENOMICS, 2006, V. 88, № 6, P. 752-761.
Палеогенетические исследования носителей Пазырыкской культуры IV-II вв до н.э. Куликов И.В., Нефёдова М.В., Губина М.А., Шульгина Е.О., Дамба Л.Д., Молодин В.И., Чикишева Т.А., Воевода М.И. 1, Ромащенко А.Г. Всероссийский археологический съезд "Современные проблемы Археологии России, 2006, 264-266
The phylogeography of mtDNA variation in Altaian Kazakh populations Gokсumen O, Osipova LP, Zhadanov SI, Andreenkov O, Tabikhanova L, Gubina M, Schurr TG AM J PHYS ANTHROPOL, 2006, Suppl. 42:93
Signs of positive selection of somatic mutations in human cancers detected by EST sequence analysis Babenko VN, Basu MK, Kondrashov FA, Rogozin IB, Koonin EV. BMC CANCER, 2006, 6:36
Гаплотипический анализ гена HFE в популяции русских и среди пациентов с мультифакториальными заболеваниями Михайлова СВ, Онопченко О.В., Суханов А.В., Максимов В.Н., Гаскина Т.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т. 10, №3, С. 504-513.
Долгожительство – модель изучения процесса старения. Шабалин А.В., Воевода М.И., Черных Н.И., Пентегова В.А., Рагино Ю.И., Иванова М.В., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Шахтшнейдер Е.В. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 4, С. 11-21
Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О, Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т.10, №3. С.565-571
2005
Полиморфизм гена HFE у больных хроническим гепатитом С Кулагина Е.А., Михайлова С.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И., Курилович С.А. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии, 2005, №4, С.29-34
Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2005, Т.9, N2, май 2005, 232-261
Analysis of evolution of exon-intron structure of eukaryotic genes Rogozin IB, Sverdlov AV, Babenko VN, Koonin EV BRIEF BIOINFORM, 2005, 6(2):118-134
Conservation versus parallel gains in intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2005, 33(6):1741-1748
2004
Моделирование биологической эволюции: регуляторные генетические системы и кодирование сложности биологической организации Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин К.В. Информационный вестник ВОГИС, 2004, № 29. С.: 86-99.
Генетические механизмы кодирования биологической сложности Суслов В.В., Гунбин К.В., Колчанов Н.А. Экологическая генетика, 2004, Т. II. № 1. С. 13-26.
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть I. Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А. Сибирский экологический журнал, 2004, 11(5):599-610
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть II. Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А. Сибирский экологический журнал, 2004, 11(5):611-621
Reconstruction of ancestral protosplice sites Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2004, 4(16):1505-1508
Preferential loss and gain of introns in 3' portions of genes suggests a reverse-transcription mechanism of intron insertion Sverdlov AV, Babenko VN, Rogozin IB, Koonin EV GENE, 2004, 338(1):85-91
Prevalence of intron gain over intron loss in the evolution of paralogous gene families Babenko VN, Rogozin IB, Mekhedov SL, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2004, 32(12):3724-3733
Comparative analysis of complete genomes reveals gene loss, acquisition and acceleration of evolutionary rates in Metazoa, suggests a prevalence of evolution via gene acquisition and indicates that the evolutionary rates in animals tend to be conserved. Babenko VN, Krylov DM NUCLEIC ACIDS RES, 2004, 32(17):5029-5035
2003
Полиморфизм гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом, в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Хаснулин В.И., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2003, Т.39 № 7C. 988-995
Evidence of splice signal migration from exon to intron during intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2003, 13(24):2170-2174
Computational analysis of mutation spectra Rogozin IB, Babenko VN, Milanesi L, Pavlov YI BRIEF BIOINFORM, 2003, 4(3):210-227
2002
Transcription Regulatory Regions Database (TRRD): its status in 2002 Kolchanov NA, Ignatieva EV, Ananko EA, Podkolodnaya OA, Stepanenko IL, Merkulova TI, Pozdnyakov MA, Podkolodny NL, Naumochkin AN, Romashchenko AG NUCLEIC ACIDS RES, 2002, Jan 1;30(1):312-317
2001
Распространение аллелей C282Y, H63D и S65C гена HFE и предрасположенности к нарушениям метаболизма железа в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Хаснулин, Воевода М.И Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии, 2001, Т.XI, №4, С.13-17
The contribution of exon-skipping events on chromosome 22 to protein coding diversity. Hide WA, Babenko VN, van Heusden PA, Seoighe C, Kelso JF GENOME RES, 2001, 1(11):1848-1853
2000
Хронические диффузные заболевания печени с синдромом перегрузки железом Кулагина Е.А., Михайлова С.В. Бюллетень СО РАМН, 2000, №2 (96), С. 74-77
1999
GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, 5, 44, 837-841
Recognition of NFATp/AP-1 composite elements within genes induced upon the activation of immune cells. Kel A, Kel-Margoulis O, Babenko V, Wingender E. J MOL BIOL, 1999, 288(3):353-376
Investigating extended regulatory regions of genomic DNA sequences Babenko VN, Kosarev PS, Vishnevsky OV, Levitsky VG, Basin VV, Frolov AS BIOINFORMATICS, 1999, 15(7-8):644-653
Use of a rank correlation coefficient for comparing mutational spectra Babenko VN, Rogozin IB BIOPHYSICS, 1999, 44(4):632-638
1998
Eukaryotic mRNAs encoding abundant and scarce proteins are statistically dissimilar in many structural features. Kochetov AV, Ischenko IV, Vorobiev DG, Kel AE, Babenko VN, Kisselev LL, Kolchanov NA. FEBS LETT, 1998, 440(3):351-355
A genetic algorithm for designing gene family-specific oligonucleotide sets used for hybridization: the G protein-coupled receptor protein superfamily Kel A, Ptitsyn A, Babenko V, Meier-Ewert S, Lehrach H. BIOINFORMATICS, 1998, 4(3):259-270
GeneExpress: a computer system for description, analysis, and recognition of regulatory sequences in eukaryotic genome. N.A. Kolchanov, M.P. Ponomarenko, A.E. Kel, A.S. Frolov, F.A. Kolpakov, T.N. Goryachkovsky, O.V. Kel, E.A. Ananko, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, V.N. Babenko, I.L. Stepanenko, A.G. Romashchenko, T.I. Merkulova, D.G. Vorobiev, S.V. Lavryushev, A.V. Kochetov, G.B. Kolesov, V.V. Solovyev, L. Milanesi, N.L. Podkolodny, E. Wingender, T. Heinemeyer Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol, 1998, 6, 95-104
Распределение транскриптов Bsp-повторов Canidae в почке песца: структурное сходство Bsp-повторов с SINEs Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Ромащенко А.Г., Беляева Т.А., Мелиди Н.Н., Лавриненко В.А., Гувакова Т.В., Иванова Л.Н. Доклады АН СССР, 1995, Т.343,№2, С.160-164
Identification of cDNA sequences by specific oligonucleotide sets. Computer tool and application. Kolchanov NA, Vishnevsky OV, Kel AE, Shindyalov IN Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol, 1995, 3:206-214
1991
Comparison of asymptotic tests of the Hardy-Weinberg distribution. Ginzburg E.Kh, Axenovich TI, Babenko VN ANN HUM GENET, 1991, 55(Pt 4):329-338.
Монографии
2022
Genetic Testing for Rare Diseases. Глава: Different Rates of the SLC26A4-Related Hearing Loss in Two Indigenous Peoples of Southern Siberia (Russia) Danilchenko V.Y.; Zytsar M.V.; Maslova E.A.; Bady-Khoo M.S.; Barashkov N.A.; Morozov I.V.; Bondar A.A.; Posukh O.L.
2020
Методические рекомендации по диагностике и ведению пациентов с диабетом MODY М.И. Воевода, О.Д. Рымар, Е.В. Шахтшнейдер, А.К. Овсянникова, Д.Е. Иванощук, Е.С. Малахина, О.В. Сазонова
2019
MODY: молекулярно-генетические детерминанты и персонализированный подход к ведению пациентов с моногенными формами сахарного диабета М.И. Воевода, Е.В. Шахтшнейдер, А.К. Овсянникова, О.Д. Рымар, Д.Е. Иванощук, С.В. Михайлова, П.С. Орлов, А.А. Иванова
2018
Abnormal social behaviors and dysfunction of autism-related genes associated with daily agonistic interactions in mice. Kudryavtseva N.N., Kovalenko I.L., Smagin D.A., Galyamina A.G., Babenko V.N.
2017
Degrees of Freedom Ponomarenko M., Babenko V., Kochetov A., Kolchanov N.
Анализ экспрессии генов и расположения сайтов связывания транскрипционных факторов в геноме по данным высокопроизводительного секвенирования / Монография. отв. ред. Ю.Л. Орлов; - Н. Изд-во «Академиздат», 2016, 136 с. Ю.Л. Орлов, В.Н. Бабенко, А.Г. Богомолов, Э.Р. Галиева, И.В. Чадаева
Дифференциально экспрессирующиеся гены в мозге мышей линии С57BL/6J, ассоциируемые с агонистическими взаимодействиями: Базы данных. Коллективная монография Кудрявцева Наталия Николаевна Смагин Дмитрий Александрович Коваленко Ирина Леонидовна Галямина Анна Георгиевна Бабенко Владимир Николаевич
2015
Генетическая история народов Якутии и наследственно обусловленные болезни. Глава 3. Аутосомно-рецессивная глухота А1 типа в Якутии: молекулярно-генетические причины. Барашков Н.А., Джемилева Л.У., Посух О.Л., Терютин Ф.М., Соловьев А.В., Пшенникова В.Г., Кларов Л.А., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Кононова С.К., Федотова Э.Е., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А.
2014
Электрофизиология в рисунках и схемах. Учебно-методическое пособие. Новосиб. гос. ун-т. - Новосибирск : РИЦ НГУ, 2014. - 95 с. Юдин Н.С., Бабина А.В.
Электрофизиология в рисунках и схемах Н.С. Юдин, А.В. Бабина
Физиология сенсорных систем А.В. Бабина, Н.С. Юдин
2013
Degrees of Freedom. Ponomarenko M, Babenko V, Kochetov A, Kolchanov N
Мультидисциплинарные исследования населения Барабинской лесостепи V - I тыс. до н.э.: археологический, палеогенетический и антропологический аспекты Молодин В.И., Пилипенко А.С., Чикишева Т.А., Ромащенко А.Г., Журавлев А.А., Поздняков Д.В., Трапезов Р.О.
2012
Human migrations in the southern region of the West Siberian Plain during the Bronze Age: Archaeological, palaeogenetic and anthropological data Molodin V.I., Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Zhuravlev A.A., Trapezov R.O., Chikisheva T.A., Pozdnyakov D.V.
Анализ эволюции в семействах белоккодирующих генов у архей рода Pyrococcus при адаптации к высоким давлениям океанических глубин Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А.
BioinfoWF – веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики Генаев М.А., Гунбин К.В., Афонников Д.А.
Молекулярная эволюция циклинов: зависимость между изменением белков и ростом сложности эукариот Гунбин К.В., Турнаев И.И., Афонников Д.А.
Роль микроорганизмов в функционировании живых систем: фундаментальные проблемы и биоинженерные приложения И. С. Андреева, А. В. Брянская, С. М. Жмодик, В. А. Лихошвай, Б. Б. Намсараев, Д. Ю. Рогозин, О. П. Таран, С. Е. Ткачев, Е. А. Ананько, K. Aсано, Д. А. Афонников, Т. Г. Банзаракцаева, Д. Д. Бархутова, Ж. Батаа, В. В. Бахвалова, С. И. Беликов, В. М. Белолипецкий, П. В. Белолипецкий, Т. К. Белянин, А. А. Богуш, Е. В. Болдырева, Е. Н. Болдарева, A. В. Брушков, Л. И. Бурцева, С. П. Бурюхаев, В. В. Власов, С. Н. Генова, Н. А. Гольцова, В. М. Горленко, К. В. Гунбин, Э. В. Данилова, А. Г. Дегерменджи, М. А. Дымова, Е. К. Емельянова, В. И. Жираковский, А. В. Задорожный, С. С. Ибрагимова, Л. И. Иванов, Г. В. Калмыкова, Т. П. Камынина, А. В. Качко, И. В. Козлова, Л. П. Козырева, Ю. П. Колмогоров, Н. А. Колчанов, В. Н. Компаниченко, Е. В. Лаврентьева, Е. В. Лазарева, С. А. Лашин, С. Г. Ливанов, Н. Н. Ливанова, Ю. Г. Матушкин, И. B. Морозов, О. В. Морозова, З. Б. Намсараев, С. Ф. Орешкова, Д. Ю. Ощепков, В. В. Панов, В. Н. Пармон, С. Е. Пельтек, Н. И. Печуркина, О. А. Подколодная, В. А. Пономарчук, И. Г. Прокопкин, В. Г. Пугачев, Н. М. Пуховская, Л. И. Пучкова, В. А. Рар, А. В. Ратушный, В. Е. Репин, А. С. Розанов, Е. И. Рябчикова, Ю. В. Сабитова, И. В. Саранина, Д. В. Семенова, В. А. Симонов, О. Г. Смирнова, К. Н. Сорокина, Т. Ю. Степанова, О. В. Стронин, В. В. Суслов, M. Taнака, О. С. Таранов, Н. В. Тикунова, И. И. Турнаев, Т. Торок, О. Д. Тотменина, М. Ю. Трусова, M. Утсуми, М. Л. Филипенко, Н. В. Фоменко, M. Фукуда, М. А. Хаснатинов, Т. М. Хлебодарова, Д. Д. Цыренова
2009
Особенности структуры генофонда митохондриальной ДНК населения городища Чича-1 Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И.
Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. Под ред. А.Б. Масленникова. Вып. 12 Воевода М.И., Максимов В.Н., Малютина С.К., Гафаров В.В., Шишкин С.В., Ромащенко А.Г., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Кузнецова Т.Н., Кобзев В.Ф., Юдин Н.С.
Морфогенез животных: реконструкция в базах данных и моделирование Гунбин К.В., Омельянчук Л.В., Ананько Е.А., Когай В.В., Фадеев С.И., Колчанов Н.А.
Исследование эволюции генов Hh-каскада сигналов Гунбин К.В., Колчанов Н.А.
Процессы морфогенеза и подходы к их моделированию Николаев С.В., Гунбин К.В., Омельянчук Н.А., Суслов В.В., Омельянчук Л.В., Колчанов Н.А.
Понятие о генных сетях. База данных GeneNet. Ананько Е.А., Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
Проблемы биологической и культурной адаптации человеческих популяций. Археология. Адаптационные стратегии древнего населения Северной Евразии: сырье и приемы обработки Алкин С.В., Чикишева Т.А., Губина М.А., Куликов И.В.
Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий Чикишева Т.А., Губина М.А.
2007
The Hedgehog Signaling Cascade System: Evolution and Functional Dynamics Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Omelyanchuk L.V., Kolchanov N.A.
Программа фундаментальных исследований президиума РАН Воевода М.И А.Г. Ромащенко, М.А. Губина, А.В. Бархаш, Е.В. Шахшнейдер, В.Н. Максимов, И.В. Куликов, Т.А. Потапова, И.В. Мягкова, Н.С. Юдин
2006
Dollo parsimony and the reconstruction of genome evolution Igor B. Rogozin · Yuri I. Wolf · Vladimir N. Babenko · Eugene V. Koonin
Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. Под ред. А.Б. Масленникова. Вып. 9 Воевода М.И., Юдин Н.С., Васильев Г.В., Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Бархаш А.В., Ромащенко А.Г.
TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS DATABASE (TRRD): A SOURCE OF EXPERIMENTALLY CONFIRMED DATA ON TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS OF EUKARYOTIC GENES N. Kolchanov, E. Ignatieva, O. Podkolodnaya, E. Ananko, I. Stepanenko, T. Merkulova, T. Khlebodarova, V. Merkulov, N. Podkolodny, D. Grigorovich, A. Poplavsky, A. Romashchenko
Конференции
2024
Моделирование in vitro функциональных эффектов вариантов гена GJB2 (коннексин 26), ассоциированных с потерей слуха Маслова Е.А., Орищенко К.Е., Посух О.Л. VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы
Linkage of alternatively spliced exons proliferates in neuronal genes Boltunov TA, Babenko VN BGRS-2024
Striatum Transcriptome Profile Shift in Repeated Aggression Mouse Model quickly recovered to normal except for 12 circadian clock genes after Fighting Deprivation Vladimir Babenko, Olga Redina, Dmitry Smagin, Irina Kovalenko, Anna Galyamina, Roman Babenko , Natalia Kudryavtseva BGRS-2024
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ГЕНОТИПА И ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ ПРИ ФОРМИРОВАНИИ ФЕНОТИПА ДИСЛИПИДЕМИИ У ПОДРОСТКОВ МИХАЙЛОВА С.В., ОРЛОВ П.С., ИВАНОЩУК Д.Е., ШАХТШНЕЙДЕР Е.В., ДЕНИСОВА Д.В. Десятая Всероссийская научно-практическая конференция, посвященная 300-летию Российской академии наук и 100-летию со дня рождения академика РАМН Казначеева Влаиля ПетровичаФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ АСПЕКТЫ КОМПЕНСАТОРНО-ПРИСПОСОБИТЕЛЬНЫХ ПРОЦЕССОВ
Роль эффекта основателя в распространенности патогенных вариантов
c. 919‑2A > G, c. 2027T > A и c. 1545T > G гена SLC26A4, ассоциированных
с потерей слуха, в Республике Тыва (Южная Сибирь) В. Ю. Данильченко, М. В. Зыцарь, О. Л. Посух МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС «VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы»
Сплайсинговые варианты в этиологии моногенных заболеваний: варианты в гене SLC26A4, ассоциированные с потерей слуха В. Ю. Данильченко, Е. А. Панина, М. В. Зыцарь, Е. А. Маслова, К. Е. Орищенко, О. Л. Посух XI международная конференция молодых ученых: биоинформатиков, биотехнологов, биофизиков, вирусологов, молекулярных биологов и специалистов фундаментальной медицины. OPENBIO
2023
The leukocyte telomere length, mtDNA copy
number and acute coronary syndrome in a 15-year follow-up Maximov V.N., Orlov P., Gurazeva A., Shabanova E., Gafarov V.V., Chervova O., Malyutina S.K. 91st EAS Congress
2022
Impaired trafficking and reduced hemichannels permeability are the main consequences of a rare variant c.516G>C (p.Trp172Cys) in GJB2 gene associated with hearing loss Ekaterina Maslova, Konstantin Orishchenko, Olga Posukh ISCOMS - The International Student Congress Of (bio)Medical Sciences
Preliminary bioinformatic analysis to optimize the testing
of the SLC26A4 pathogenic variants involved in hearing loss Danilchenko V.Yu., Zytsar M.V., Maslova E.A., Posukh O.L. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/ Systems Biology The 13th International Multiconference
Specific allelic diversity of the SLC26A4 gene associated
with hearing loss in the indigenous peoples of Southern Siberia (Russia) Danilchenko V.Yu., Zytsar M.V., Maslova E.A., Posukh O.L. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/ Systems Biology The 13th International Multiconference
The association between genetic markers from GWAS and essential hypertension in a case-control study (Siberian population) E.V. Mazdorova, V.N. Maksimov, P.S. Orlov, A.N. Ryabikov, S.K. Malyutina. 90th EAS Congress 2022,
Анализ спектра вариантов в генах липидного обмена у пациентов с коронарным атеросклерозом методом полноэкзомного секвенирования Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Валеев Э.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И. Российский национальный конгресс кардиологов Кардиология 2022: новая стратегия в новой реальности – открытость, единство, суверенитет
Идентификация генетических детерминант у пациентов с семейной гиперхолестеринемией с использованием высокотехнологичного секвенирования Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е. XXXI Всероссийская кардиологическая конференция «Традиции и инновации в кардиологии»
DIFFERENTIAL EXPRESSION OF EXTRACELLULAR MATRIX-RELATED GENES IN TISSUE OF
STABLE AND UNSTABLE ATHEROSCLEROTIC PLAQUES Elena Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya I. Ragino, Yana V.
Polonskaya, Elena V. Kashtanova, Alexandr Chernyavsky, Ivan Murashov, Mikhail Voevoda 90th EAS Congress 2022, 20-25 мая 2022
DIAGNOSTIC THE FAMILIAL HYPERCHOLESTEROLEMIA IN WEST SIBERIA USING TARGETED HIGH THROUGHPUT SEQUENCING Elena Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Sergey Semaev, Olga Timoshchenko, Mikhail Voevoda 90th EAS Congress 2022, 20-25 мая 2022
Высокопроизводительное секвенирование генов адипокинов в популяции западной Сибири А. Бейркдар, Е. В. Шахтшнейдер, Д. Е. Иванощук, Ю. И. Рагино Фундаментальные исследования в эндокринологии: современная стратегия развития и технологии персонализированной медицины
2021
Изучение функциональной значимости варианта с.516G>C (p.Trp172Cys) гена GJB2, ассоциированного с потерей слуха у коренного населения Южной Сибири Маслова Е.А., Зыцарь М.В., Данильченко В.Ю., Орищенко К.Е., Посух О.Л. IX Съезд Российского общества медицинских генетиков
Overall proteome variability manifested by alternative splicing in the dorsal striatum samples of mouse chronic social conflict model VLADIMIR BABENKO, DMITRY SMAGIN, IRINA KOVALENKO, ANNA GALYAMINA, NATALIA KUDRYAVTSEVA Belgrade Bioinformatics Conference
cAMP mediated genes profiles underscore drastic reduction of dopamine intake along with opioids in the dorsal striatum of fighting deprived aggressive mice Vladimir Babenko*, Dmitry Smagin, Irina Kovalenko, Anna Galyamina, and Natalia Kudryavtseva Belgrade Bioinformatics Conference
Altered splicing profile of Ptbp1 drives global splicing tune-up upon neuroinflammation response in rat model VLADIMIR BABENKO, GALINA SHISHKINA, DMITRI LANSHAKOV, TATIANA KALININA, ELENA SUKHAREVA
AND NIKOLAY DYGALO Belgrade Bioinformatics Conference
Assessing proteome diversity raised by alternative splicing in Brain RNA-Seq data Babenko V, Babenko R Moscow Conference for Computational Molecular Biology (MCCMB'2021)
Population specific enhancer affecting optic disc development timespan underlies Glaucoma predisposition. Бабенко Владимир Николаевич
Бабенко Роман Олегович Moscow Conference for Computational Molecular Biology (MCCMB'2021)
Analysis of the variants of the F5 gene in men with coronary atherosclerosis Striukova E.V., Shakhtshneider E., Ivanoshchuk D., Ragino Y.I., Polonskaya Y.V., Murashov I.S., Volkov A.M., A.V.Kurguzov, Chernyavsky A., Valeev E., Maksimov V.N., Kashtanova E.V. 89 EAS Congress 2021
Analysis of variants in the KLOTHO gene in patients with coronary atherosclerosis Shakhtshneider E., Semaev S., Timoshchenko O., Ivanoshchuk D., Stakhneva E.M., Nikitin Y., Ragino Y.I. 89 EAS Congress 2021
Genetic analysis in Russian patients with Familial Hypercholesterolemia Shakhtshneider E.V., Ivanoshchuk D.Е., Timoshchenko O., Orlov P.S. 89 EAS Congress 2021
2020
Mutational spectrum of the SLC26A4 gene and its contribution to the etiology of hearing loss in the indigenous peoples of Southern Siberia (Russia). Danilchenko V.Y., Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Maslova E.A., Bondar A.A., Morozov I.V., Barashkov N.A., Posukh O.L. The European Human Genetics Virtual Conference ESHG 2020.2 - Live in Your Living Room
Genetic Polymorphism Associated with Infectious Pulmonary Diseases in Siberian Populations and Among Patients with Community Acquired Pneumonia Mikhailova SV, Shcherbakova LV, Logvinenko NI, Logvinenko II, Voevoda MI BGRS Symposium “Systems biology and biomedicine” (SbioMed-2020)
Monoamine signaling gene networks unraveled in mouse social stress mode Babenko VN
Kudryavtseva NN BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, Symposium “Cognitive Science and Genomics” (CSGB- 2020)
Transcriptional profiling of ventral tegmental area of male mice with alternative patterns of social behaviors. Olga Redina, Vladimir Babenko, Vadim Efimov, Dmitry Smagin, Irina Kovalenko, Anna Galyamina, Natalia Kudryavtseva. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
lncRNAs – their potential in regulation of hypertensionand behavior of ISIAH rats. Ivan Sidorenko, Vladimir Babenko, Arcady Markel, Olga Redina. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
RNA-Seq Transcriptome Analysis of Stable and Unstable Atherosclerotic Plaques Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Elena Kashtanova, Yana Polonskaya, Alexander Chernyavsky, Ivan Murashov, Mikhail I. Voevoda 88 EAS CONGRESS
Analysis of differential expression of the cytokine/chemokine genes in tissue of stable and unstable atherosclerotic plaques Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Yana Polonskaya, Elena Kashtanova, Alexander Chernyavsky, Ivan Murashov, Mikhail I. Voevoda 88 EAS CONGRESS
Analysis of rare variants in genes related to aberrations of lipid metabolism in patients with coronary atherosclerosis Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Yana Polonskaya, Elena Kashtanova, Alexander Chernyavsky, Mikhail I. Voevoda 88 EAS CONGRESS
Analysis of rare variants in genes related to aberrations of lipid metabolism in patients with coronary atherosclerosis Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Yana Polonskaya, Elena Kashtanova, Alexander Chernyavsky, Mikhail I. Voevoda 88 EAS CONGRESS
A novel variant c.516G>C (p.W172C) in the GJB2 gene is the main cause for recessive hearing loss in indigenous peoples of Southern Siberia (Russia). Ekaterina Maslova, Valeria Danilchenko, Marina Zytsar, Konstantin Orischenko, Olga Posukh. ISCOMS – the International Student Congress Of (bio)Medical Sciences.
Новый вариант делеции в гене GCK у пациента с диабетом MODY типа 2 Иванощук Д.Е., Овсянникова А.К., Валеев Э.С., Михайлова С.В., Рымар О.Д., Шахтшнейдер Е.В. Фундаментальные исследования в эндокринологии: современная стратегия развития и технологии персонализированной медицины
Monoamine signaling gene networks unraveled in mouse
social stress model Babenko V.N., Kudryavtseva N.N. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, Symposium “Cognitive Science and Genomics” (CSGB- 2020)
Complex assessment of pathogenicity of novel variant c.516G>C (p.Trp172Cys) in the GJB2 gene associated with hearing loss in indigenous peoples of Southern Siberia (Russia). E. A. Maslova, V. Y. Danilchenko, M. V. Zytsar, K. E. Orishchenko, O. L. Posukh The European Human Genetics Virtual Conference ESHG 2020.2 - Live in Your Living Room
Generation of the panel of transgenic human cell lines with stable expression of mutant variants of the GJB2 gene associated with hearing loss for comparative in vitro studies. Ekaterina Alexandrovna Maslova, Marina Vyacheslavovna Zytsar, Valeriia Yuryevna Danilchenko, Konstantin Evgenyevich Orishchenko, Olga Leonidovna Posukh The 12th International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology»
Редкий вариант G319S гена HNF1A при семейной форме сахарного диабета с ранним началом Иванощук Д.Е., Друк И.В., Овсянникова А.К., Баранова А.А., Михайлова С.В., Рымар О.Д., Шахтшнейдер Е.В. Фундаментальные исследования в эндокринологии: современная стратегия развития и технологии персонализированной медицины
Полиморфизм генов SOX2, SOX3, HESX1 и OTX2, вовлеченных в формирование гипоталамо-гипофизарной оси Иванощук Д.Е. Фундаментальные исследования в энгдокринологии: современная стратегия развития и технологии персонализированной медицины
Polymorphism of the APPL1 gene in patients with carbohydrate metabolism disorders D. Ivanoshchuk, E. Shakhtshneider, A. Ovsyannikova, S. Mikhailova, P. Orlov, O. Rymar, V. Fishman, Y. Ragino,M.I. Voevoda EAS Congress 2020, virtual congress
METHYLATION AND EXPRESSION PROFILES IN
APOE VICINITY POINT TO SPECIFIC NEIGHBORING INTERACTION OF APOE AND TOMM40
GENES: IMPLICATION FOR THE ALZHEIMER DISEASE. Babenko V., Babenko R.,Rogaev E. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, Symposium “Cognitive Science and Genomics” (CSGB- 2020)
Mutational spectrum of the SLC26A4 gene and its contribution to the etiology of hearing loss in the indigenous peoples of Southern Siberia (Russia) Valeriia Yuryevna Danilchenko, Marina Vyacheslavovna Zytsar, Marita Sergeevna Bady-Khoo, Ekaterina Alexandrovna Maslova, Olga Leonidovna Posukh The 12th International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology»
СПЕКТР ВАРИАНТОВ В ГЕНАХ PRL, PRLR, PRLHRУ ПАЦИЕНТОВ С ГИПЕРПРОЛАКТИНЕМИЕЙ Воевода С.М., Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рымар О.Д. Фундаментальные исследования в эндокринологии: современная стратегия развития и технологии персонализированной медицины (BRE2020)
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ HNF1A, HNF4A, HNF1BУ ПАЦИЕНТОВ С ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИЕЙ Гридчин А.М., Иванощук Д.Е., Тимощенко О.В., Шахтшнейдер Е.В Фундаментальные исследования в эндокринологии: современная стратегия развития и технологии персонализированной медицины (BRE2020)
38ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНА CEL У ПАЦИЕНТОВ С ФЕНОТИПОМ MATURITY ONSET DIABETES OF THE YOUNG Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Овсянникова А.К., Рымар О.Д., Воевода М.И. Фундаментальные исследования в эндокринологии: современная стратегия развития и технологии персонализированной медицины (BRE2020)
Полиморфизм гена CEL у пациентов с
гипергликемией и дислипидемией Орлов Павел Сергеевич Фундаментальные исследования в эндокринологии: современная стратегия развития и технологии персонализированной медицины (BRE2020)
2019
Итоги многолетних исследований наследственной глухоты у коренного населения Сибири: от эпидемиологии до молекулярной генетики, клеточной биологии и компьютерного моделирования. Посух О.Л.,Барашков Н.А., Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Данильченко В.Ю., Маслова Е.А., Пшенникова В.Г., Романов Г.П., Соловьёв А.В., Кларов Л.А., Федорова С.А., Терютин Ф.М., Лашин С.А., Орищенко К.Е., Морозов И.В., Бондарь А.А. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Анализ информативности in silico предсказательных программ при оценке клинической значимости миссенс-вариантов генов коннексинов GJB2 (Сx26), GJB6 (Сx30) и GJB3 (Сx31). Пшенникова В.Г., Барашков Н.А., Романов Г.П., Соловьев А.В., Готовцев Н.Н., Никанорова А.А., Терютин Ф.М., Находкин С.С., Сазонов Н.Н., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Брачная структура, репродуктивные параметры и мутации гена GJB2 (Сх26) у глухих людей в Якутии. Романов Г.П., Барашков Н.А., Терютин Ф.М., Лашин С.А., Соловьев А.В., Пшенникова В.Г., Бондарь А.А., Морозов И.В., Сазонов Н.Н., Томский М.И., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Селективное преимущество гетерозиготных носителей мутации с.-23+1G>A гена GJB2 у коренных жителей Восточной Сибири. Соловьев А.В., Барашков Н.А., Терютин Ф.М., Саввинова К.Е., Пшенникова В.Г., Готовцев Н.Н., Романов Г.П., Рафаилов А.М., Томский М.И., Сазонов Н.Н., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Существенный вклад мутаций гена SLC26A4 в этиологию наследуемой потери слуха у коренного населения Республики Тыва. Данильченко В.Ю., Зыцарь М.В., Маслова Е.А., Бады-Хоо М.С., Морозов И.В., Бондарь А.А., Посух О.Л. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Распространённость мутации c.35delG (ген GJB2), ассоциированной с потерей слуха, у населения России и реконструкция предковых гаплотипов, включающих c.35delG, в регионах Сибири. Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Данильченко В.Ю., Бондарь А.А., Морозов И.В., Барашков Н.А., Соловьёв А.В., Максимов В.Н., Посух О.Л. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Комплексная оценка патогенетической значимости нового варианта с.516G>C гена GJB2, ассоциированного с потерей слуха у коренного населения Южной Сибири. Маслова Е.А., Бады-Хоо М.С., Зыцарь М.В., Орищенко К.Е., Посух О.Л. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Аутосомно-рецессивная катаракта (CTRCT18) в Якутии: результаты полноэкзомного секвенирования и реконструкция гаплотипа-основателя с мутацией c.1621C>T (p.Gln541) гена FYCO1. Барашков Н.А., Коновалов Ф.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Пшенникова В.Г., Сапожникова Н.В.,Вычюжина Л.С., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Бурцева Т.Е., Платонов Ф.А.,Томский М.И., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А. Аутосомно-рецессивная катаракта (CTRCT18) в Якутии: результаты полноэкзомного секвенирования и реконструкция гаплотипа-основателя с мутацией c.1621C>T (p.Gln541) гена FYCO1. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию
Mitochondrial mutational spectrum as an universal marker of cellular longevity K. Popadin, A. Mikhaylova, A. Mikhaylova, K. Ushakova, E. Tretyakov, A. Iurchenko, M. Zazhytska, D. Knorre, Z. Fleischmann, S. Annis, M. Franco, K. Wasko, W. Kunz, I. Mazunin, S. Nikolaev, A. Reymond, K. Khrapko, K.
Gunbin SMBE 2019
Mitochondrial mutational spectrum in vertebrates is shaped by generation time A. G. Mikhaylova, A. A. Mikhaylova, K. Ushakova, E. Tretyakov, K. Popadin, K. Gunbin, I. Mazunin, D. Knorre,
S. Nikolaev, A. Yurchenko, K. Khrapko, A. Reymond SMBE 2019
Seeking for mtDNA structural determinants of organisms longevity V. Shamanskiy, V. Timonina, P. Konstantin, K. Gunbin SMBE 2019
Tandem repeats are selfish elements which mark the level of hidden recombination in animal mitochondrial genomes A. A. Mikhailova, K. Ushakova, A. G. Milhaylova, V. Lobanova, P. Kravchenko, I. Mazunin, D. Knorre, A. Reymond, K. Gunbin, K. Popadin SMBE 2019
Seeking for mtDNA structural determinants of organisms longevity Valeria N. Timonina , Viktor N. Shamanskiy , Konstantin Yu. Popadin , Konstantin V. Gunbin MCCMB 2019
Mistranslation optimization of mitochondrial genes drives mammalians longevity. A hypothesis. Kristina E. Ushakova , Anastasia D. Sokol , Konstantin Yu. Popadin , Konstantin V. Gunbin MCCMB 2019
Tandem repeats are selfish elements which mark the level of hidden recombination in animal mitochondrial genomes Alina A. Mikhailova , Kristina Ushakova , Alina G. Mikhaylova , Valeria Lobanova , Ilya Mazunin , Pavel Kravchenko , Dmitry Knorre , Alexandre Reymond , Konstantin Gunbin , Konstantin Popadin MCCMB 2019
Mitochondrial mutational spectrum in vertebrates is shaped by temperature and generation time Alina Mikhaylova , Alina Mikhaylova , Kristina Ushakova , Evgeniy Tretyakov , Konstantin Popadin , Alexander Reymond , Konstantin Gunbin , Dmitrii Knorre , Ilya Mazunin , Konstantin Khrapko , Sergey Nikolaev MCCMB 2019
A genetic handicap approach: how to estimate the genome-wide burden of slightly-deleterious variants in a model population Viktor Shamanskiy , Anastasia Sokol , Valeria Timonina , Konstantin Gunbin , Konstantin Popadin MCCMB 2019
Heat shock proteins buffer environmental and genetic perturbations: from short-term to long-term effects Anastasia Sokol , Valeria Timonina , Ilya Mazunin , Konstantin Gunbin , Dmitry Knorre , Konstantin Popadin MCCMB 2019
Host genetic control of tick-borne encephalitis virus infection – current progress and future prospects Barkhash A., Voevoda M., Romaschenko A. 13th International Symposium on Ticks and Tick-borne Diseases
Генетическая предрасположенность человека к клещевому энцефалиту: вклад интерферон-индуцируемых генов IFIT1 и IFIT2 Бархаш А.В., Козлова И.В., Котова И.В., Савинова Ю.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. VI Всероссийская междисциплинарная научно-практическая конференция с международным участием «Социально значимые и особо опасные инфекционные заболевания»
Скрининг редких замен в генах, вовлеченных в дисгенез угла передней камеры глаза у пациентов с врожденной глаукомой В.С. Фишман, Э.С. Валеев, П.С. Белокопытова, О.В. Фенькова, С.В. Михайлова, А.Ж. Фурсова, М.И. Воевода, Д.Е. Иванощук Научно-практическая конференция с международным участием «Генетика — фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции»
Идентификация мутаций в генах MYOC, WDR36, OPTN, LTBP2 и ТЕК у пациентов с врожденной глаукомой Д.Е. Иванощук, О.В. Фенькова, С.В. Михайлова, П.С. Белокопытова, В.С.Фишман, Е.В. Шахтшнейдер, Ф.Ж. Фурсова, М.И. Воевода VI съезд биохимиков России и IX российский симпозиум "белки и пептиды"
Клинико-патопсихологические аспекты наркозависимости от синтетических каннабиноидов и синтетических катинонов: роль полиморфизма генов дофамин-β-гидроксилазы (DBH) и транспортера дофамина (DAT) Патрикеева О.Н., Соловьева И.Г., Губина М.А., Кунгурцева О.Н., Рецер Р.А., Ларин А.В., Гиркин С.В. Материалы Международного конгресса, «Современные технологии в диагностике и терапии психических и неврологических расстройств»
Databases and computer resources on plant miRNA to study its role in abiotic stress response Orlov Y.L., Babenko V.N., Dergilev A.V., Galieva A.G.,
Dobrovolskaya O.B., Chen M. 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)
ПОЛИМОРФИЗМ RS1333049 (9P21.3) В ЕВРОПЕОИДНОЙ ПОПУЛЯЦИИ ЗАПАДНОЙ СИБИРИ И ЕГО АССОЦИАЦИЯ С КЛИНИЧЕСКИМИ И БИОХИМИЧЕСКИМИ МАРКЕРАМИ С.Е. Семаев, Е.В. Шахтшнейдер, П.С. Орлов, С.К. Малютина, Д.Е. Иванощук,В.В. Гафаров, Ю.И. Рагино, М.И. Воевода VIII Съезд кардиологов Сибирского федерального округа «От первичной профилактики до высоких технологий в кардиологии»
АНАЛИЗ КОРРЕЛЯЦИИ ДАННЫХ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК С ПРОТЕОМНЫМИ МАРКЕРАМИ В СТАБИЛЬНЫХ И НЕСТАБИЛЬНЫХ АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШКАХ КОРОНАРНЫХ АРТЕРИЙ Шахтшнейдер Е.В., Рагино Ю.И., Иванощук Д.Е., Каштанова Е.В., Фишман В.С., Полонская Я.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И. I Всероссийский Конгресс «Физиология и тканевая инженерия сердца и сосудов:от клеточной биологии до протезирования»
ТАРГЕТНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНОВ LDLR, APOB, PCSK9, LDLRAP1 И КЛАСТЕРА ГЕНОВ APOA5-A4-C3-A1 У ПАЦИЕНТОВ С СЕМЕЙНОЙ ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИЕЙ Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Фишман В.С., Белокопытова П.С., Орлов П.С., Тимощенко О.В., Воевода М.И. I Всероссийский конгресс с международным участием "Физиология и тканевая инженерия сердца и сосудов: от клеточной биологии до протезирования"
Таргетное секвенирование известных и новых генов у пациентов с семейной гиперхолестеринемией Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е. , Орлов П.С. , Семаев С.Е., Тимощенко О.В.,
Воевода М.И. Российский национальный конгресс кардиологов 2019 (с международным участием)
АНАЛИЗ АССОЦИАЦИИ RS1333049 ХРОМОСОМНОГО РЕГИОНА 9P21.3 С ФАКТОРАМИ РИСКА СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ Шахтшнейдер Е.В., Орлов П.С., Семаев С.Е., Иванощук Д.Е., Малютина С.К., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Воевода М.И. Российский национальный конгресс кардиологов 2019 (с международным участием)
АНАЛИЗ ДАННЫХ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШЕК КОРОНАРНЫХ АРТЕРИЙ Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Каштанова Е.В., Рагино Ю.И., Полонская Я.В., Чернявский А.М., Воевода М.И. Российский национальный конгресс кардиологов 2019 (с международным участием)
Medium spiny neurons genes pathways form for distinct clasters in stress affected murine model Babenko V.N., Kudryavtseva N.N. Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB)
Анализ ассоциации rs1333049 хромосомного региона 9p21.3 с факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний. Шахтшнейдер Е.В., Орлов П.С., Семаев С.Е., Иванощук Д.Е., Малютина С.К., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Воевода М.И. Российский национальный конгресс кардиологов 2019
ANALYSIS OF THE LDLR, APOB, PCSK9 AND LDLRAP1 GENES VARIABILITY IN PATIENTS WITH FAMILIAL HYPERCHOLESTEROLEMIA IN WEST SIBERIA USING TARGETED HIGH THROUGHPUT RESEQUENCING E. Shakhtshneider, D. Ivanoshchuk, P. Orlov, O. Timoshchenko, M.Voevoda EAS 2019, Maastricht: 87th EAS Congress87th EAS Congress
HYPERLIPIDEMIA IN PATIENTS WITH MODY2 AND MODY3 IN RUSSIA E. Shakhtshneider, D. Ivanoshchuk, A. Ovsyannikova, S. Mikhailova, O. Rymar, Y. Ragino, M. Voevoda EAS 2019, Maastricht: 87th EAS Congress87th EAS Congress
ANALYSIS OF DIFFERENTIAL EXPRESSION OF MATRIX METALLOPROTEINASES GENES IN STABLE AND UNSTABLE ATHEROSCLEROTIC PLAQUES E. Shakhtshneider, D. Ivanoshchuk, S. Mikhailova, V. Fishman, Y. Ragino, Y. Polonskaya, E. Kashtanova, A. Chernyavsky, I. Murashov, M. Voevoda EAS 2019, Maastricht: 87th EAS Congress87th EAS Congress
Анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq Ковалев С.С., Леберфарб Е.Ю., Орлова Н.Г., Брагин А.О., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. VI Съезд биофизиков России
Разработка компьютерной базы данных альтернативного сплайсинга в глиомах Орлов Ю.Л., Ковалев С.С., Бабенко В.Н., Леберфарб Е.Ю. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
2018
Allelic diversity of the GJB2 gene in deaf patients and ethnically matched controls from Turkic-speaking populations of South Siberia. Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Maslova E.A., Danilchenko V.Y., Barashkov N.A., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L. The European Human Genetics Conference in conjunction with the European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics.
Insight into genetic and social aspects of modern communities of deaf people in Siberia for forecasting the prevalence of hereditary deafness. Posukh O.L., Bady-Khoo M.S., Romanov G.P., Barashkov N.A., Smirnova A.A., Zytsar M.V., Maslova E.A., Danilchenko V.Y., Posukh O.V., Lashin S.A. The European Human Genetics Conference in conjunction with the European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics.
Opinions of young hearing people living in the Sakha Republic (Russia) about potential risk of the birth of deaf child. Cherdonova A.M., Solovyev A.V., Pshennikova V.G., Barashkov N.A., Romanov G.P., Nikanorova A.A., Kononova S.K., Posukh O.L., Fedorova S.A., Teryutin F.M. The European Human Genetics Conference in conjunction with the European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics.
Progressive post-lingual sensorineural hearing loss with unknown etiology in subarctic part of Russia (Sakha Republic). Barashkov N.A., Romanov G.P., Teryutin F.M., Pshennikova V.G., Solovyev A.V., Gotovtsev N.N., Nikanorova A.A., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. The European Human Genetics Conference in conjunction with the European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics.
Informative parameters of in silico predictive programs in assessing clinical significance of missense variants of the GJB2 (Cx26) gene. Pshennikova V.G., Barashkov N.A., Romanov G.P., Teryutin F.M., Solovyev A.V., Gotovtsev N.N., Nikanorova A.A., Sazonov N.N., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. The European Human Genetics Conference in conjunction with the European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics.
Novel pathogenic variant in the POU3F4 gene associated with the X-linked deafness-2 (DFNX2) in Yakut family (Eastern Siberia, Russia). Barashkov N.A., Klarov L.A., Solovyev A.V., Konnikova E.E., Romanov G.P., Tobokhov A.V., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. 17th International Congress on Circumpolar Health
Allelic diversity of the GJB2 gene in deaf patients and ethnically matched populations from South Siberia. Zytsar M., Bady-Khoo M., Maslova E., Danilchenko V., Barashkov N., Morozov I., Bondar A., Posukh O. 11th International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology», Symposium Biodiversity: genomics and evolution (BioGenEvo-2018).
Agent-based modelling of genetic deafness propagation under various sociodemographic conditions. Lashin S.A., Matushkin Yu.G., Smirnova A.A., Romanov G.P., Posukh O.L. 11th International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology», The 3rd International Symposium Mathematical Modeling and High-Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology (MM-HPC-BBB-2018
Founder effect in prevalence of hereditary hearing loss in indigenous Siberian populations. Danilchenko V., Zytsar M., Posukh O. The Tenth International Young Scientists School Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2018).
Gene networks of human hearing impairments: reconstruction and analysis. Zamyatin V.I., Mustafin Z.S., Ignatieva E.V., Matushkin Yu.G., Posukh O.L., Lashin S.A. The Tenth International Young Scientists School Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2018).
Haplotype Analysis of the HFE Gene Among Patients with Different Forms of Tick-borne Encephalitis S. Mikhailova, A. Barkhash , I. Kozlova, I. Borischuk, N.Yudin, O. Zaitseva , L. Pozdnyakova, M. Voevoda BGRS 2018 (BioGenEvo-2018)
Brain regions transriptome analysis in mouse chronic stress model Babenko VN, Babenko RO, Kudryavtseva NN Belgrade Bioinformatics Conference
Transposable Elements mediated CTCF binding sites: their nuclear compartments localization in human genome Babenko VN, Babenko RO Chromosome 2018
Analysis of alternative splicing by RNA-seq
data Babenko VN BGRS\SB-2018. The 11th International Conference. Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
Analysis of alternative splicing by RNA-seq
data Babenko VN BGRS\SB-2018. The 11th International Conference. Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
АНАЛИЗ ТРАНСКРИПТОМНОГО ПРОФИЛЯ СТАБИЛЬНЫХ И НЕСТАБИЛЬНЫХ АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШЕК Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Полонская Я.В., Чернявский А.М., Воевода М.И. Российский национальный конгресс кардиологов
Computer analysis of alternative splicing events by RNA-seq data in brain cells V.N. Babenko, N.V. Gubanova, A.V. Tsukanov, S.S. Kovalev, A.O. Bragin,G.V. Vasiliev, Yu.L. Orlov Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
Ассоциация генетических маркеров с риском отдаленного неблагоприятного прогноза сердечно-сосудистых заболеваний Шахтшнейдер Е.В., Орлов П.С., Щербакова Л.В., Иванощук Д.Е., Малютина С.К., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Воевода М.И. Российский национальный конгресс кардиологов 2018 (с международным участием) "Новые технологии - в практику здравоохранения"
PPP1r1b gene and others in the dorsal striatum of mice with movement disturbances Smagin D.A., Galyamina A.G., Kovalenko I.L., Kudryavtseva N.N., Babenko V.N 31 ECNP Congress
Search for human genes predetermining predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis using whole-exome sequencing Barkhash A., Yurchenko A., Yudin N., Kozlova I., Borishchuk I., Smolnikova M., Zaitseva O., Pozdnyakova L., Voevoda M., Romaschenko A. EMBO Symposium “Innate Immunity in Host-Pathogen Interactions”
Поиск генов предрасположенности человека к тяжелым формам клещевого энцефалита с помощью полноэкзомного секвенирования. Бархаш А.В., Юрченко А.А.,Юдин Н.С., Козлова И.В., Борищук И.А.,Смольникова М.В., Зайцева О.И., Позднякова Л.Л., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Научная конференция грантодержателей РНФ "Современные тенденции в химии, биологии, медицине "От молекулы к лекарству"
Roles of non-coding RNAs in stress response in plants Chen M., Wang J., Dobrovolskaya O.B., Babenko V.N., Orlov Y.L., Liu Y., Samarina L.S. Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
The overlapped motifs co-occurrence in ChIP-seq data. V.G. Levitsky,D.Y. Oshchepkov, E.V. Zemlyanskaya, V.V. Mironova, E.V. Ignatieva,O.A. Podkolodnaya, T.I. Merkulova The 11th International Conference “On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB'2018)
2017
ALTERNATIVE SPLICING, ISOFORMS AND ROLE OF GRIN1 GENE EXPRESSION IN BEHAVIOR OF RATS SELECTED BY AGGRESSIVE BEHAVIOR Babenko V.N., Bragin A.O., Chadaeva I.V. БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
Анализ ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов rs1048661, rs2165241, rs3825942 гена LOXL1 с различными типами глаукомы у пациентов Западной Сибири Д.Е. Иванощук, Е.О. Датских, С.В. Михайлова, А.Ж. Фурсова, Н.А. Коновалова, И.Ю. Бычков, О.С. Коновалова, М.И. Воевода, А.Г. Ромащенко БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
Founder effect in prevalence of hereditary deafness caused by mutations in gene GJB2 (13q11-q12) among Siberian populations: common ancestral haplotypes for major GJB2 mutations and estimation of their age M.V. Zytsar, M.S. Bady-Khoo, N.A. Barashkov, V.Yu. Danilchenko, O.L. Posukh The 9th International Young Scientists School "Systems Biology and Bioinformatics", SBB-2017
Эффект основателя в распространенности наследственной глухоты, обусловленной мутациями гена GJB2, в популяциях Cибири М.В. Зыцарь, М.С. Бады-Хоо, В.Ю. Данильченко, А.А. Бондарь, И.В. Морозов, Н.А. Барашков, О.Л. Посух. Беляевские чтения: Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
Identification of human genes predetermining susceptibility/resistance to tick-borne encephalitis virus Barkhash A., Yurchenko A., Yudin N., Kozlova I., Borishchuk I., Pozdnyakova L., Voevoda M., Romaschenko A. International Symposium on Tick-Borne Pathogens and Disease (ITPD 2017)
Частоты гаплотипов гена HFE среди пациентов с разными формами клещевого энцефалита. Михайлова С.В., Бархаш А.В., Козлова И.В., Борищук И.А., Воевода М.И. БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
Updated carrier rates for deafness-inducing mutation c.35delG (GJB2) in Russia and common haplotypes associated with c.35delG in Siberia. Posukh O.L., Zytsar M.V., Barashkov N.A., Shubina-Olejnik O.A., Danilenko N.G., Danilchenko V.Yu., Solovyev A.V., Morozov I.V., Bondar A.A. The 67th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics (ASHG)
Abnormality of social behavior and dysfunction of autism related gene expression developing under chronic social defeat stress in male mice Kudryavtseva N.N., Kovalenko I.L., Smagin D.A., Galyamina A.G., Babenko V.N. 30th Congress of European College of Neuropsychopharmacology
Доказательства эффекта основателя по мутации сайта сплайсинга c.-23+1G>A гена GJB2 в некоторых популяциях Евразии по данным полногеномного анализа Соловьев А.В., Барашков Н.А., Бады-Хоо М.С., Посух О.Л., Зыцарь М.В., Романов Г.П., Сазонов Н.Н., Алексеев А.Н., Джемилева Л.У., Метспалу Э., Метспалу М., Виллемс Р., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А. II Всероссийская конференция с международным участием «Высокопроизводительное секвенирование в геномике»
Waardenburg syndrome in the Sakha Republic (Eastern Siberia, Russia): mutation analysis of genes PAX3, MITF, SOX10 and SNAI2. Barashkov N.A., Borisova U.P., Romanov G.P., Solovyev A.V., Pshennikova V.G., Teryitin F.M., Bondar A.A., Morozov I.V., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. European Human Genetics Conference 2017, Copenhagen, Denmark, May 27-30.
Первичная наследственная лимфедема, предварительные результаты семейного анализа Латыева О.О. Губина М.А. Шевченко А.В. Нимаев В.В. VI съезд лимфологов России 15-16 ноября 2017
Анализ альтернативного сплайсинга в глиомах с помощью секвенирования транскриптом Брагин А.О., Губанова Н.В., Ковалев С.С., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Вторая Международная научно-практическая конференция «NGS в медицинской генетике 2017»
Поиск вариантов генов, детерминирующих предрасположенность человека к тяжелым формам клещевого энцефалита Бархаш А.В., Юрченко А.А., Юдин Н.С., Игнатьева Е.В., Козлова И.В., Борищук И.А., Позднякова Л.Л., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Российская научная конференция, посвященная 80-летию открытия вируса клещевого энцефалита "Клещевой энцефалит и другие переносимые клещами инфекции"
РАЗНООБРАЗИЕ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК ОВЕЦ ИЗ АРХЕОЛОГИЧЕСКИХ ПАМЯТНИКОВ ЮГА ЗАПАДНОЙ СИБИРИ ЭПОХИ БРОНЗЫ - РАННЕГО ЖЕЛЕЗНОГО ВЕКА ПИЛИПЕНКО А.С., ПИЛИПЕНКО И.В., ПАПИН Д.В., ЧЕРДАНЦЕВ С.В., МОЛОДИН В.И., ТРАПЕЗОВ Р.О., НЕСТЕРОВА М.С. V (XXI) ВСЕРОССИЙСКИЙ АРХЕОЛОГИЧЕСКИЙ СЪЕЗД Барнаул, 02-07 октября 2017 г.
2016
Differential alternative splicing in brain tissues of rats selected by aggressive behavior Babenko V.N., Bragin A.O., Chadaeva I.V., Orlov Y.L. BGRS 2016
Human genetic predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced disease: possible involvement of polymorphism in chemokine and interleukin genes Barkhash A.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. International Scientific Conference “Viruses 2016 - At the Forefront of Virus-Host Interactions”
Clustering of CpG rich elements in gene dense region Babenko V. N., Chadaeva I., Orlov Y. L. Belgrade Bioinformatics Conference
Computer Analysis of RNA-seq Data of Laboratory Rats with Aggressive Behavior Anatoly O. Bragin*, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel SocBin Bioinformatics 2016
RNA-SEQ DATA ANALYSIS OF RATS WITH AGGRESSIVE BEHAVIOR IN THREE BRAIN AREAS A.O. Bragin, A.L. Markel, V.N. Babenko, I.V. Chadaeva, E.S. Tiys, Y.L. Orlov BGRS-2016
Possible role of human interleukin and chemokine genes in the control of tick-borne encephalitis virus infection Barkhash A., Babenko V, Romaschenko A. EMBO Symposium “Innate Immunity in Host-Pathogen Interactions”
Gene ontology analysis and network reconstruction for genes related to aging diseases and behavior I.V. Chadaeva, O.V. Saik, V.N. Babenko BGRS 2016
Анализ гаплотипов хромосом с мажорными мутациями (p.W172C, IVS1+1G>A, c.235delC) гена GJB2 у коренного населения Южной Сибири (тувинцы и алтайцы). Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Михальская В.Ю., Бондарь А.А., Морозов И.В., Барашков Н.А., Посух О.Л. 20-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «БИОЛОГИЯ-НАУКА XXI ВЕКА»
Вклад мутаций генов OTOF, RAI1 и SLC26A4 в этиологию наследственной потери слуха на Алтае и в Туве. Михальская В.Ю., Бады-Хоо М.С., Зыцарь М.В., Бондарь А.А., Морозов И.В., Посух О.Л. 20-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «БИОЛОГИЯ-НАУКА XXI ВЕКА»
Whole exome sequencing of the Yakut family from Eastern Siberia with congenital autosomal-recessive cataract: the novel nonsense mutation in the FYCO1 gene. Barashkov N.A., Konovalov F.A., Teryutin F.M., Solovyev A.V., Pshennikova V.G., Romanov G.P., Gotovtsev N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Alexeev A.N., Tomsky M.I., Posukh O.L., Fedorova S.A. European Human Genetics Conference/European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics. Barcelona, Spain, May 21-24, 2016.
Genome-wide reconstruction of the common ancestral haplotype with splice site mutation c.-23+1G>A (GJB2) in some Siberian and Caucasian populations. Solovyev A.V., Barashkov N.A., Posukh O.L., Bady-Khoo M.S., Teryutin F.M., Pshennikova V.G., Romanov G.P., Gotovtsev N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Rafailov A.M., Sazonov N.N., Alexeev A.N., Dzhemileva L.U., Metspalu E., Khusnutdinova E.K., Metspalu M., Villems R., Fedorova S.A. European Human Genetics Conference/European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics. Barcelona, Spain, May 21-24, 2016.
Genetic fitness of deaf people in the Sakha Republic (Eastern Siberia, Russia). Romanov G.P., Barashkov N.A., Teryutin F.M., Klarov L.A., Pshennikova V.G., Nikolaeva L.A., Garyukhina O.N., Skryabina E.D., Solovyev A.V., Gotovtsev N.N., Sazonov N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Alekseev A.N., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. European Human Genetics Conference/European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics. Barcelona, Spain, May 21-24, 2016.
Founder effect in Siberian indigenous populations through the prism of hereditary deafness. Posukh O.L., Bady-Khoo M.S., Zytsar M.V., Mikhalskaia V.Y., Barashkov N.A., Morozov I.V., Bondar A.A. The International Symposium Systems Biology and Biomedicine (SBioMed-2016) / 10th anniversary International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \Systems Biology» BGRS\SB-2016.
A software system for simulating social and genetic aspects of deafness in human populations. Dyachenko I.S., Posukh O.L., Bady-Khoo M.S., Zytsar M.V, Mikhalskaia V.Yu., Romanov G.P., Barashkov N.A., Matushkin Yu.G., Lashin S.A. 10th anniversary International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \Systems Biology» BGRS\SB-2016.
Genetic fitness of deaf people in the Sakha Republic. Romanov G.P., Barashkov N.A., Teryutin F.M., Klarov L.A., Solovyev A.V., Gotovtsev N.N., Pshennikova V.G., Sazonov N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. The International Symposium Systems Biology and Biomedicine (SBioMed-2016) / 10th anniversary International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \Systems Biology» BGRS\SB-2016.
POLYMORPHISM OF LOXL1 GENE IN WEST SIBERIA PATIENTS WITh OPEN ANGLE GLAUCOMA AND PSEUDOEXFOLIATION GLAUCOMA. D.E. Ivanoshchuk, E.O. Datskih, N.A. Konovalova, I.Y. Bychkov, A.Z. Fursova, O.S. Konovalova, S.V. Mikhailova , M.N. Ponomareva, M.I. Voevoda, A.G. Romaschenko BGRS-2016
Analysis of Differential Gene Expression by RNA-seq Data in Brain Areas of Laboratory Animals Yuriy Orlov, Anastasia Spitsina,Irin a Medvedeva,Anatoly Bragin, Vladimir Babenko Integrated Bioinformatics symposium
Альтернативный сплайсинг и дифференциальная экспрессия генов в тканях головного мозга крыс, селектированных по агрессивности Бабенко В.Н., Брагин А.О., Чадаева И.В., Орлов Ю.Л. III Международной научной конференции «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы»
Marital status, marriage patterns and fertility of deaf people in the Tyva Republic (South Siberia, Russia). Posukh O.L., Bady-Khoo M.S., Mikhalskaia V.Yu., Zytsar M.V., Barashkov N.A., Romanov G.P., Lashin S.A. the 66th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics (October 18–22, 2016, Vancouver, Canada)
Analysis of Differential Gene expression by RNA-Seq data in Brain regions of Lab Animals Бабенко ВН, Орлов ЮЛ, Брагин АО, Кудрявцева НН Intergrative Bioinformatics
2015
Chemokine (CCL2, CXCL10) and Interleukin (IL28B, IL10) Gene Variability and Human Predisposition to Tick-Borne Encephalitis Barkhash A.V., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. 28th International Conference on Antiviral Research
Tale of the transposons on chromatin landscape Babenko V. N., Matvienko V. F. Moscow Conference on Computational Molecular Biology, 2015 Moscow
Структурные маркеры генов APOB, LDLR, PCSK9 в развитии атеросклероза Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Макаренкова К.В., Астракова К.С., Рагино Ю.И., Воевода М.И. Российский национальный конгресс кардиологов
Screening for LDLR gene mutations responsible for hypocholesterolemia in Russian population E. Shakhtshneider · D. Ivanoshchuk · I. Pilipenko · Y. Nikitin · S. Malyutina · M. Voevoda 83nd EAS Congress 2015 Glasgow, London
CTCF binding sites and gene expression analysis in genome scale by sequencing data Kulakova E.V., Spitsina A.M., Safronova N.S., Svichkarev A.V., Dergilev A.I., Ponomarenko M.P., Babenko V.N., Hong P., Li G., Orlov Y.L. 7th International Young Scientists School “Systems biology and bioinformatics” SBB-2015
Integrative analysis of antisense transcripts in plants Orlov Y.L., Dobrovolskaya O., Babenko V.N., Safronova N.S., Chen M. The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology” PlantGen 2015
Analysis of gene location relative to chromosome loops and topological chromosome domains by ChIA-PET and Hi-C Orlov Y.L., Kulakova E.V., Spitsina A.M., Svichkarev A.V., Babenko V.N., Li G. 3D Genome Workshop
Statistical analysis of chromosome contacts by ChIA-PET and Hi-C technologies Orlov Y.L., Kulakova E., Spitsina A., Babenko V. Future of Biomedicine 2015 Conference
Computer Tools for Gene Expression Data Processing and Correlation Analysis Babenko V.N., Orlov Y. L., Spitsyina A. M. Podkolodnaya N. Computational systems biology and bioinformatics (CSBio 2015)
Анализ геномного контекста мутации с.35delG гена GJB2 у белорусских пациентов с потерей слуха в сравнении с пациентами из Сибири. Шубина-Олейник О.А. , Синявская М.Г., Зыцарь М.В. , Меркулова Е.П., Посух О.Л., Барашков Н.А., Михальская В.Ю., Даниленко Н.Г. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Реконструкция предкового гаплотипа с мутацией сайта сплайсинга c.-23+1G>A гена GJB2 в некоторых популяциях Евразии. Соловьев А.В., Барашков Н.А., Терютин Ф.М., Бады-Хоо М.С., Пшенникова В.Г., Кларов Л.А., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Кожевников А.А., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Морозов И.В., Бондарь А.А., Соловьева Н.А., Рафаилов А.М., Сазонов Н.Н., Алексеев А.Н., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Частота ассортативных браков среди глухих и слабослышащих людей в Якутии. Романов Г.П., Барашков Н.А., Терютин Ф.М., Кларов Л.А., Николаева Л.А., Гарюхина О.Н., Скрябина Е.Д., Соловьев А.В., Готовцев Н.Н., Пшенникова В.Г., Рафаилов А.М., Сазонов Н.Н., Морозов И.В., Бондарь А.А., Алексеев А.Н., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Реконструкция гаплотипов хромосом с мажорными мутациями (p.W172C, IVS1+1G>A, c.235delC) гена GJB2 у коренного населения южной Сибири (тувинцы и алтайцы) Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Михальская В.Ю., Бондарь А.А., Морозов И.В., Барашков Н.А., Посух О.Л. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков.
Экзомное секвенирование для молекулярной диагностики наследственной потери слуха. Посух О.Л. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Новая нонсенс-мутация p.W325X (c.977G>A) гена POU3F4 в якутской семье с синдромом Gusher (DFNX2). Барашков Н.А., Кларов Л.А., Терютин Ф.М., Соловьев А.В., Пшенникова В.Г., Николаева К.Ю., Конникова Э.Э., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Саввинова К.Е., Кожевников А.А., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Пак М.В., Леханова С.Н., Саввина Н.В., Лугинов Н.В., Морозов И.В., Бондарь А.А., Соловьева Н.А., Рафаилов А.М., Сазонов Н.Н., Алексеев А.Н., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Вклад мутаций генов OTOF, RAI1 и SLC26A4 в этиологию наследственной потери слуха на Алтае и в Туве. Михальская В.Ю., Бады-Хоо М.С., Зыцарь М.В., Бондарь А.А., Морозов И.В., Посух О.Л. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Анализ спектра и частоты GJB2-мутаций у пациентов с врожденными нарушениями слуха в Республике Саха (Якутия). Пшенникова В.Г., Барашков Н.А., Терютин Ф.М., Соловьев А.В., Кларов Л.А., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Саввинова К.Е., Кожевников А.А., Сидорова О.Г., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Морозов И.В., Бондарь А.А., Соловьева Н.А., Кононова С.К., Рафаилов А.М., Сазонов Н.Н., Алексеев А.Н., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Гетерозиготное носительство мутации сайта сплайсинга IVS1+1G>A гена GJB2 (СХ26) – фактор риска возрастных изменений слуха (пресбиакузис) в популяции якутов. Терютин Ф.М., Барашков Н.А., Кунельская Н.Л., Пшенникова В.Г., Соловьев А.В., Кларов Л.А., Кожевников А.А., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Пак М.В., Леханова С.Н., Морозов И.В., Бондарь А.А., Соловьева Н.А., Рафаилов А.М., Алексеев А.Н., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Анализ спектра и частоты мутаций в гене USH2A у пациентов с cиндромом Ушера из Республики Башкортостан. Кузнецов Д.Ю., Джемилева Л.У., Лобов С.Л., Барашков Н.А., Посух О.Л., Хидиятова И.М., Хуснутдинова Э.К. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
Сравнительный анализ вклада мутаций гена GJB2 (Сх26) в возникновение нейросенсорной тугоухости у жителей ряда регионов Сибири и Беларуси. Посух О.Л., Даниленко Н.Г., Барашков Н.А., Бады-Хоо М.С., Шубина-Олейник О.А., Зыцарь М.В., Михальская В.Ю., Меркулова Е.П., Левая-Смоляк А.М., Синявская М.Г. II-ая Международная научная конференция «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы» (к 50-летию ГНУ «Институт генетики и цитологии НАН Беларуси»)
Связь полиморфизма генов интерлейкинов и хемокинов с предрасположенностью человека к заболеваниям, вызываемым флавивирусами: клещевому энцефалиту и хроническому гепатиту C Бархаш А.В., Кочнева Г.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Конференция, посвященная 60-летнему юбилею основания Института полиомиелита и вирусных энцефалитов имени М.П. Чумакова
Gene Expression Analysis in Brain Areas of Laboratory Rats with Aggressive Behavior by RNA-seq Data Anatoly O. Bragin, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel CSBio’2015
Opinions of hearing parents about the causes of hearing loss in their deaf children compared with GJB2 (Cx26) genetic testing results in Russia. Nikolay A. Barashkov, Lilya U. Dzhemileva, Olga L. Posukh, Aisen V. Solovev, Marita S. Bady-Khoo, Vera G. Pshennikova, Fedor M. Teryutin, Semeon L. Lobov, Aiza B. Neustroeva, Khariton A. Kurtanov, Leonid A. Klarov, Lena M. Vasilyeva, Elvira E. Fedotova, Adyum M. Rafailov, Natalya A. Solovyeva, Sardana K. Kononova, Anatoliy N. Alekseev, Sardana A. Fedorova, Elza K. Khusnutdinova. Human Genome Meeting 2015
Association of novel mutation p.W325X (c.977G>A) in the POU3F4 gene with perilymphatic Gusher-deafness syndrome (DFNX2) in Yakut family (Eastern Siberia). PS02.49. N.A. Barashkov, L.A. Klarov, F.M. Teryutin, A.V. Solovyev, V.G. Pshennikova, K.Y. Nikolaeva, E.E. Konnikova, G.P. Romanov, N.N. Gotovtsev, K.E. Savvinova, M.V. Pak, S.N. Lekhanova, N.V. Savvina, N.V. Luginov, I.V. Morozov, A.A. Bondar, N.A. Solovyeva, A.M. Rafailov, N.N. Sazonov, A.N. Alexeev, O. L. Posukh, L.U. Dzhemileva, E.K. Khusnutdinova, S.A. Fedorova. The European Human Genetics Conference June 6-9, 2015, Glasgow, Scotland, United Kingdom
Reconstruction of the ancestral haplotype with c.-23+1G>A splice site mutation of the GJB2 gene in certain populations of Eurasia. PS18.11. A.V. Solovyev, N.A. Barashkov, F.M. Teryutin, M.S. Bady-Khoo, V.G. Pshennikova, L.A. Klarov, G.P. Romanov, N.N. Gotovtsev, A.A. Kozhevnikov, L.M. Vasilyeva, E.E. Fedotova, I.V. Morozov, A.A. Bondar, N.N. Solovyeva, A.M. Rafailov, N.N. Sazonov, A.N. Alexeev, L.U. Dzhemileva, E.K. Khusnutdinova, O.L. Posukh, S.A. Fedorova. The European Human Genetics Conference June 6-9, 2015, Glasgow, Scotland, United Kingdom
Assortative mating rate among deaf people in Yakutia (Eastern Siberia). PS20.17. G.P. Romanov, N.A. Barashkov, F.M. Teryutin, L.A. Klarov, L.A. Nikolaeva, O.N. Garyukhina, E.D. Skryabina, A.V. Solovyev, N.N. Gotovtsev, V.G. Pshennikova, N.N. Sazonov, I.V. Morozov, A.A. Bondar, A.N. Alekseev, L.U. Dzhemileva, E.K. Khusnutdinova, O.L. Posukh, S.A. Fedorova. The European Human Genetics Conference June 6-9, 2015, Glasgow, Scotland, United Kingdom
Different GJB2 gene contribution to deafness in ethnically matched patients from two regions of South Siberia. J18.19. O.L. Posukh, M.S. Bady-Khoo, N.A. Barashkov, A.A. Bondar, V.Y. Mikhalskaya, I.V. Morozov, V.N. Tadinova, M.V. Zytsar. The European Human Genetics Conference June 6-9, 2015, Glasgow, Scotland, United Kingdom
The contribution of GJB2 gene mutations in hearing loss in Eastern Siberia (the Sakha Republic) is the highest among all studied regions of Asia. V.G. Pshennikova, N.A. Barashkov, F.M. Teryutin, A.V. Solovyev, L.A. Klarov, G.P.Romanov, N.N. Gotovtsev, K.E. Savvinova, A.A. Kozhevnikov, O.G. Sidorova, L.M. Vasilyevа, E.E. Fedotova, I.V. Morozov, A.A. Bondar, N.A. Solovyovа, S.K. Kononova, A.M. Rafailov, N.N. Sazonov, A.N. Alekseev, O.L. Posukh, L.U. Dzhemileva, E.K. Khusnutdinova, S.A. Fedorova. The European Human Genetics Conference June 6-9, 2015, Glasgow, Scotland, United Kingdom
Вариабельность генов липидного обмена у пациентов с семейной гиперхолестеринемией Воевода М.И., Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Макаренкова К.В., Рагино Ю.И. VI съезд кардиологов Сибирского Федерального округа «Трансляционная кардиология – путь к прогрессу»
Длина теломер как маркёр старения и фактор риска развития заболеваний в Сибири Максимов В.Н., Малютина С.К., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Воропаева Е.Н., Бобак М., Воевода М.И. XII Тихоокеанский медицинский конгресс с международным участием
Поиск генетических маркеров артериальной гипертензии в сибирской популяции Максимов В.Н., Орлов П.С., Малютина С.К., Маздорова Е.В., Никитин Ю.П., Воевода М.И. XII Тихоокеанский медицинский конгресс с международным участием
Связь полиморфизма генов интерлейкинов и хемокинов с предрасположенностью человека к клещевому энцефалиту Бархаш А.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. VII Ежегодный Всероссийский Конгресс по инфекционным болезням с международным участием
2014
Age related hearing impairment (ARHI) associated with GJB2 single mutation IVS1+1G>A in the Yakut population isolate from Eastern Siberia. Barashkov N.A., Teryutin F.M., Pshennikova V.G., Solovyev A.V., Klarov L.A., Solovyeva N.A., Kozhevnikov A.A., Vasilyeva L.M., Fedotova E.E., Pak M.V., Lekhanova S.N., Zakharova E.V., Gotovtsev N.N., Savvinova K.E., Rafailov A.M., Luginov N.V., Alexeev A.N., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. American Society of Human Genetics 64th Annual Meeting
Поиск генов предрасположенности человека к заболеваниям, вызываемым флавивирусами: клещевому энцефалиту и хроническому гепатиту C Бархаш А.В., Кочнева Г.В., Чуб Е.В., Михайлова С.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. VI Ежегодный Всероссийский Конгресс по инфекционным болезням
Применение геномной селекции в молочном животноводстве: успехи и проблемы Юдин Н.С. VI съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
Association of the dopamine receptor D4 (DRD4) gene polymorphism with cardiovascular disease risk factors N.S. Yudin, T.M. Mishakova, V.N. Maksimov, V.V. Gafarov, S.K. Malyutina, M.I. Voevoda International Symposium “Human Genetics” ISHG-2014
The case of Michel aplasia in Russian family with congenital sensorineural deafness: results of temporal bone CT-images analysis. Klarov L.A., Barashkov N.A., Teryutin F.M., Klarova L.A., Solovyev A.V., Pshennikova V.G., Romanov G.P., Solovyeva N.A., Fedotova E.E., Luginov N.V., Savvinova K.E., Gotovtsev N.N., Rafailov A.M., Alexeev A.N., Dzhemileva L.U., Posukh O.L., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. The European Human Genetics Conference
Opinions of hearing parents about the causes of hearing loss in their deaf children compared with GJB2 (cx26) genetic testing results in three national Republics of Russia. Barashkov N.A., Dzhemileva L.U., Posukh O.L., A.V. Solovyev, Bady-Khoo M.S., Pshennikova V.G., Teryutin F.M., Lobov S.L., Neustroeva A.B., Kurtanov Kh.A., Vasilyeva L.M., Fedotova E.E., Rafailov A.M., Solovyeva N.A., Kononova S.K., Alekseev A.N., Fedorova S.A., Khusnutdinova E.K. The European Human Genetics Conference
Extreme carrier frequency of the splice site IVS1+1G>A mutation in GJB2 gene in the Eastern Siberia is comparable to carrier frequency of the sickle cell anemia in Africa. Solovyev A.V., Barashkov N.A., Teryutin F.M., Solovyeva N.A., Pshennikova V.G., Sidorova O.G., Grigoryeva L.V., Romanov G.P., Gotovtsev N.N., Savvinova K.E., Nakhodkin S.S., Pak M.V., Lekhanova S.N., Kononova S.K., Rafailov A.M., Alexeev A.N., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. The European Human Genetics Conference
Prevalence of mutation с.11864G>A (p.Trp3955X) in the USH2A gene in patients with Usher syndrome from Volga-Ural Region of Russia. Dzhemileva L.U., Lobov S.L., Kuznetzov D.U., Valiev R.R., Mukminov A.S., Ahmetova V.L., Khusainova R.I., Carunas A.S., Khidiyatova I.M., Barashkov N.A., Fedorova S.A., Posukh O.L., Khusnutdinova E.K. The European Human Genetics Conference
Whole exome sequencing in Altaian families (the Altai Republic, Southern Siberia) with congenital hearing loss. Posukh O., Сhurbanov A., Karafet T., Bondar A., Morozov I., Mikhalskaya V., Zytsar M. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014/International Symposium “Human Genetics”
Наследственная глухота в регионах Сибири: Республики Алтай и Тыва. Посух О.Л., Бады-Хоо М.С., Бондарь А.А., Морозов И.В., Барашков Н.А., Зыцарь М.В., Михальская В.Ю. VI съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
Анализ частоты гетерозиготного носительства и оценка«возраста» мутации IVS1+1G>A гена GJB2, приводящей к аутосомно-рецессивной глухоте 1А типа в популяции якутов. Барашков Н.А., Соловьев А.В., Пшенникова В.Г., Терютин Ф.М., Романов Г.П., Кларов Л.А., Саввинова К.Е., Готовцев Н.Н., Рафаилов А.М., Соловьева Н.А., Алексеев А.Н., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А. VI съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
"Генетические аспекты формирования первичной открытоугольной глаукомы" Воевода М.И., Иванощук Д.Е., Бычков И.Ю., Михайлова С.В., Коновалова Н.А., Еремина А.В., Пономарева М.Н., Коновалова О.С., Ромащенко А.Г. Всероссийская научно-практическая конференция с интернет-трансляцией "Фундаментальные исследования в офтальмологии"
Молекулярно-генетические основы наследственной несиндромальной сенсоневральной тугоухости в Волго-Уральском регионе. Джемилева Л.У., Лобов С.Л., Кузнецов Д.Ю., Мукминов А.С., Валеев Р.Р., Хидиятова И.М., Барашков Н.А., Посух О.Л., Хуснутдинова Э.К. Молекулярно-генетические основы наследственной несиндромальной сенсоневральной тугоухости в Волго-Уральском регионе. VIII Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Молекулярная диагностика -2014», Москва, 2014.
Мутация с.11864G>A (p.Trp3955X) в гене ушерина (USH2A) - основная молекулярно-генетическая причина синдрома Ушера у пациентов из Республики Башкортостан. Джемилева Л.У., Лобов С.Л., Кузнецов Д.Ю., Мукминов А.С., Журавский С.Г., Маркова Т.Г., Барашков Н.А., Посух О.Л., Хидиятова И.М.,Хуснутдинова Э.К. Молекулярно-генетические основы наследственной несиндромальной сенсоневральной тугоухости в Волго-Уральском регионе. VIII Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Молекулярная диагностика -2014», Москва, 2014.
Разработка алгоритма молекулярно-генетической диагностики аутосомно-рецессивной глухоты 1а типа в Республике Саха (Якутия). Пшенникова В.Г., Барашков Н.А., Терютин Ф.М., Соловьев А.В., Соловьева Н.А., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Кларов Л.А., Романов Г.П., Сидорова О.Г., Кожевников А.А., Кононова С.К., Рафаилов А.М., Сазонов Н.Н., Алексеев А.Н., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А. VIII Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Молекулярная диагностика -2014», Москва, 2014.
The Сompilation of Human Gene Networks Controlling Feeding Behavior and Thermoregulation E.V. Ignatieva, O.V.Saik, O.A. Podkolodnaya, N.N. Podkolodnaya, P.S. Demenkov, E.S. Tiys, E.A. Oshchepkova, E.A. Ananko, N.V. Ivanisenko, O.V. Popik, N.L. Podkolodny, V.A. Ivanisenko, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov, E.I. Rogaev The first international scientific conference "Science of the Future"
Single nucleotide polymorphism in dairy cattle populations of West Siberia Korotkevich O.S., Lyukhanov M.P., Petukhov V.L., Yudin N.S., Sebezhko O.S., Konovalova T.V., Kamaldinov E.V. 10th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP) Aug 17, 2014 – Aug 22, 2014 Vancouver, British Columbia, Canada
IL28B and IL10 gene variability and human predisposition to chronic hepatitis C and tick-borne encephalitis, caused by related viruses Barkhash A.V., Kochneva G.V., Chub E.V., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. The 2014 Innate Immunity Summit
Генетическая предрасположенность к заболеваниям, вызываемым флавивирусами Бархаш А.В., Кочнева Г.В., Чуб Е.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. VI Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и системная биология»
TRANSPOSONS VS GENES: SURVIVAL STRATEGIES Matvienko V.F. Babenko V.N. BGRS\SB-2014
THE MAMMALIAN CIRCADIAN CLOCK: COMPUTER ANALYSIS OF GENE NETWORK Подколодная О.А., Подколодная Н.Н., Подколодный Н.Л. The 9th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB’14)
2013
Наследственная глухота в Республике Тыва Посух О.Л., Бады-Хоо М.С., Бондарь А.А., Морозов И.В., Барашков Н.А., Зоркольцева И.В., Зыцарь М.В., Михальская В.Ю. Научная конференция «Фундаментальные науки – медицине», посвященная 10-летию Медицинского факультета НГУ
Метаболический синдром в подростковой популяции Сибири (2003-2009 гг.) Завьялова Л.Г., Денисова Д.В., Рагино Ю.И., Иванова М.В., Максимов В.Н., Орлов П.С. Российский национальный Конгресс кардиологов «Кардиология: от науки к практике»
Whole-exome sequencing in Altaian families with autosomal recessive nonsyndromic hearing loss (the Republic of Altai, Southern Siberia) Churbanov A.Y., Posukh O.L., Karafet T.M. The European Human Genetics Conference
Heterozygous mutation IVS1+1G>A (GJB2 gene) is associated with age-related hearing impairment (ARHI) in the Yakut population isolate (Eastern Siberia). Barashkov N.A., Teryutin F.M., Pshennikova V.G., Soloviev A.V., Klarov L.A., Kozjevnikov A.A., Vasilieva L.M., Fedotova E.E., Pak M.V., Lekhanova S.N., Solovieva N.A., Rafailov A.M., Alexeev A.N., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Fedorova S.A., Khusnutdinova E.K. The European Human Genetics Conference
Genetic epidemiology of hearing loss in the Republic of Tuva (Southern Siberia). Posukh O.L., Bady-Khoo M.S., Posukh O.V., Morozov I.V., Barashkov N.A., Skidanova O.V. The European Human Genetics Conference
Carrier frequency of SLC26A5 (Prestin) gene mutation c.-53-2A>G among 16 ethnic populations of Eurasia. Dzhemileva L.U., Barashkov N.A., Posukh O.L., Khusainova R.I., Akhmetova V.L., Khidiyatova I.M., Lobov S.L., Kuznetsov D.U., Valiev R.R., Fedorova S.A., Khusnutdinova E.K. The European Human Genetics Conference
Effect of Genotype Structure for 5 MYOC Gene SNPs on Its Frequency in Patients with Adult-Onset Primary Open Angle Glaucoma (POAG) Dinara E. Ivanoshchuk, Natalya A. Konovalova, Olga S. Konovalova , Mikhail I. Voevoda, Aida G. Romashchenko Federation of European Biochemical Societies CONGRESS 2013 “Mechanisms in Biology”
Possible involvement of polymorphisms in OAS2, OAS3, and CD209 genes, associated with severe forms of tick-borne encephalitis, in predisposition to hepatitis C in Russian population Barkhash A., Kochneva G., Chub E., Mikhailova S., Romaschenko A. 15th International Congress of Immunology
Генетическая предрасположенность человека к клещевому энцефалиту Бархаш А.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Научно-практическая конференция «Диагностика и профилактика инфекционных болезней»
Поиск генов предрасположенности человека к клещевому энцефалиту Бархаш А.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Российская научная конференция с международным участием «Актуальные проблемы клещевого энцефалита»
Поиск генов, ассоциированных с возникновением первичной открытоугольной глаукомы Динара Евгеньевна Иванощук, Н.А. Коновалова, И.Ю. Бычков, О.С. Коновалова, А.В. Еремина, М.И. Воевода, А.Г. Ромащенко Актуальные вопросы в современной офтальмологии
Оценка значимости липопротеина (а) в диагностике атеросклероза у мужчин города новосибрск Маздорова Е.В., Николаев К.Ю., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Иванощук Д.Е.,Орлов П.С., Максимов В.Н.,Воевода М.И. V съезд кардиологов Сибирского федерального округа"Сибирская наука-российской практике"
Анализ эндогенных ретровирусов у миниатюрных свиней. Юдин Н.С., Айтназаров Р.Б., Базарова Н.Э., Никитин С.В., Воевода М.И. Фундаментальные науки- медицине
Мутагены – как фактор угрозы биологическому разнообразию и генетическим ресурсам животных Быковченко Ю.Г., Бердибаева А.Б., Юдин Н.С. Современные проблемы геохимической экологии и сохранения биоразнообразия
2012
Ассоциативный анализ ряда генетических маркеров с артериальной гипертензией Максимов В.Н., Воевода М.И., Никитин Ю.П., Малютина С.К., Орлов П.С. VIII Всероссийский конгресс "Артериальная гипертония: от А.Л. Мясникова до наших дней"
Exploring the Association of Essential Hypertension and Blood Pressure with Several SNPs in Siberian Population: Interim Findings Malyutina S., Maximov V., Orlov P., Ryabikov A., Voevoda M., Nikitin Y. ESH 2012
Distributed RESTFUL-WEB-services for the recognition and analysis of gene networks. Podkolodnyy N.L., Semenychev A.V., Borovsky V.G., Rasskazov D.A., Ananko E.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya N.N. Podkolodnaya O.A. The Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS'2012)
Analysis of SNP distribution and inter-SNP distance in the human genome E.V. Ignatieva, V.G. Levitsky, N.S. Yudin The Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS/SB'12)
Analysis of the GJB2 coding region in Tuvinian deaf patients (the Tuva Republic, Southern Siberia). European Conference of Human Genetics. M.S. Bady-Khoo, N.A. Barashkov, I.V. Morozov, E.V. Duvak, O.L. Posukh. European Conference of Human Genetics
Computational evaluation of impact of amino acid substitution p.W172C on structure and function of gap-junction protein connexin 26 and its association with hearing impairment. S.S. Pintus, M.S. Bady-Khoo, O.L. Posukh. The 8th International Conference on the Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2012).
A single nucleotide polymorphism in the promoter region of the mink tumor necrosis factor-alpha gene. Yudin N.S., Aitnazarov R.B., Kulikov I.V., Ignatieva E.V., Trapezov O.V. X International Scientific Congress in Fur Animal Production.
TLR3 gene polymorphism is associated with predisposition to tick-borne encephalitis in Russian population Barkhash A.V., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. 2nd Antivirals Congress
Распределенная система RESTful-web-сервисов для реконструкции и анализа генных сетей Подколодный Н.Л., Семенычев А.В., Рассказов Д.А., Деменков П.С., Боровский В.Г., Подколодная Н.Н., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А. XIV Российская конференция с международным участием "Распределенные информационные и вычислительные ресурсы" (DICR-2012)
Гены-кандидаты сердечно-сосудистых заболеваний и внезапная сердечная смерть. Максимов В.Н., Куликов И.В., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Иванова А.А., Савченко С.В., Воевода М.И VIII Международная научно-практическая конференция «Внезапная смерть: от оценки риска к профилактике»
Ассоциация полиморфизма гена TLR3 с предрасположенностью к клещевому энцефалиту Бархаш А.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. V Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «Непостоянство генома»
Генетические аспекты глаукомы Иванощук .Д.Е. Человек и лекарство. Урал-2012
2011
Изучение молекулярно-генетического контроля наследуемых форм нейросенсорной тугоухости/глухоты и анализ их распространенности в популяциях Сибири: 1-ый этап исследований в Республике Тыва. Бады-Хоо М.С., Дувак Е.В., Омзар О.С., Скиданова О.В., Посух О.Л. II-ая Всероссийская конференция по редким заболеваниям и редко применяемым медицинским технологиям «Дорога жизни» с международным участием. 21-22 апреля, 2011, Санкт-Петербург.
Результаты 1-ого этапа исследований наследуемых форм нейросенсорной тугоухости/глухоты и анализ их распространенности в Республике Тыва. Бады-Хоо М.С., Дувак Е.В., Омзар О.С., Скиданова О.В., Посух О.Л. III-я Международная научно-практическая конференция «Биоразнообразие и сохранение и генофонда флоры, фауны и народонаселения Центрально-Азиатского региона». Кызыл, 28 сентября–2 октября 2011г.
Миграция андроновского населения в Западную Сибирь: археологический, антропологический и палеогенетический аспекты Молодин В. И., Чикишева Т.А., Поздняков Д.В. Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Труды III (XIX) Всероссийского археологического съезда. 2011, Т. I. С. 249-250.
Single nucleotide polymorphism rs2287886 in the promoter region of the CD209 gene is associated with human predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis Barkhash A., Perelygin A., Babenko V., Brinton M., Voevoda M. 3rd EMBO Conference on Host Genetic Control of Infectious Diseases
Nucleosome organization in plant satellites Babenko VN, Matvienko VF, Vershinin AS, Levitsky AG Wheat Genetic Resources and Genomics
Nucleosome phasing grid in plant satellites Бабенко ВН Современные методы математики, инофрматики и биоинформатики, посвященная 100-лектию со дня рождения члена - корреспондента АН СССР Алексея Андреевича Ляпунова
Исследование регуляции сплайсинга в нервных тканях Бабенко ВН, Матвиенко ВФ Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика
Краниологические особенности и характер изменения состава гаплотипов мтДНК у древнего населения Горного Алтая Губина М.А., Воевода М.И., Ромащенко А.Г., Куликов И.В., Чикишева Т.А., Молодин В.И. III Всероссийский археологический съезд.
К вопросу о связях населения территории современного Казахстана и Барабинской лесостепи в эпоху бронзы (по материалам археологии, антропологии и палеогенетики) Молодин В.И., Пилипенко А.С., Чикишева Т.А., Журавлев А.А., Поздняков Д.В., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Маргулановские чтения
Применение методов палеогенетики для этногенетических реконструкций Пилипенко А.С., Молодин В.И., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика»
SNP polymorphism of cold and mentol receptor 1 (CMR1, TRPM8) in native and caucasian populations of North Asia Voevoda M., Potapova T., Babenko V., Pilipenko I., Yudin N., Kulikov I., Romaschenko A. Human Genome Meeting
Frequency of cystic fibrosis δf508 mutation in adult and elderly caucasian population of North Asia and its association with common chronic diseases Voevoda M.I., Gurina I.V., Logvinenko N.I., Kulikov I.V., Malyutina S.K., Romaschenko A.G., Maksimov V.N. HUGO
Association of macrophage colony-stimulating factor receptor polymorphism with stroke in Caucasian population of Siberia Voevoda M., Maksimov V., Shishkin S., Schakhtschneider E., Romaschenko A. 79th Congress of the European Atherosclerosis Society
Персонализированная геномная медицина и современные информационные технологии Воевода М.И., Максимов В.Н., Ромащенко А.Г., Орлова Г.В., Колчанов Н.А. Санкт-Петербурского научного форума «Наука и общество. Физиология и медицина XXI века»
Генетические аспекты реакций человека на неблагоприятные эколого-производственные факторы Воевода М.И., Куликов И.В., Юдин Н.С., Максимов В.Н., Ромащенко А.Г., Потапова Т.А., Толкачёва О.М. Всероссийская научно-практическая конференция «Инновационные технологии в медицине труда»
Полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы 444 G/A: параметры иммунной системы и клинические характеристики рака желудка// «Иммунопатогенез и иммунотерапия основных заболеваний человека: от эксперимента к клинике Соловьева И.Г., Губина М.А., Ромащенко А.Г., Черенкова М.М.,Широков Р.В., Стенина А.С., Кожевников В.С., Абрамова Т.Я., Козлов В.А. Материалы 8-й отчетной конференции НИИ КИ СО РАМН
Популяционные и социальные аспекты наследственной глухоты в некоторых популяциях Сибири. Посух О.Л., Бады-Хоо М.С., Барашков Н.А., Джемилева Л.У. Международная конференция «Проблемы популяционной и общей генетики», посвященной памятной дате - 75-летию академика Ю.П. Алтухова.
2010
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А. 1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии"
Молекулярная эволюция циклинов: зависимость между изменением белков и ростом сложности эукариот Гунбин К.В., Турнаев И.И., Афонников Д.А. 1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии"
2'-5'-oligoadenylate synthetase genes polymorphism, associated with predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis, in human North Eurasian populations Barkhash A.V., Babenko V.N., Kobzev V.F., Romaschenko A.G., Voevoda M.I. 10th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases (MEEGID X)
Analysis of the degenerate motifs in promoters of miRNA genes, expressed in different tissues of mammalians Vishnevsky O.V., Gunbin K.V., Bocharnikov A.V., Berezikov E.V. 14-th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes of protein families: relation of molecular evolution with the phenotypical features of organisms Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. 14-th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles
Method and Software Tools for Gene Networks Evolution Research Timonov V.S., Gunbin K.V., Turnaev I.I., Genaev M.A., Kolchanov N.A. 14-th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes of protein-coding genes: relation of molecular evolution with the phenotypical features of organisms Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Genaev M.A., Kolchanov N.A. 2nd Moscow International Сonference "Molecular phylogenetics" (MolPhy-2)
Analysis of the conservative motifs in promoters of miRNA genes, expressed in different tissues of mammalians O.V.Vishnevsky, K.V. Gunbin, A.V.Bocharnikov, E.V. Berezikov Evolutionary Biology Concepts, Molecular and Morphological Evolution
Изучение генетической предрасположенности человека к вирусу клещевого энцефалита Бархаш А.В. II Национальная конференция с международным участием "Нейроинфекции. Современные аспекты клещевых инфекций".
Migrations in the south of West Siberian plain during the Bronze Age (IV-II millenium BC): archaeological, paleogenetic and anthropological data Molodin V.I., Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Jhuravlev A.A., Trapezov R.O., Chikisheva T.A., Pozdnyakov D.V. International conference "Migrations in Prehistory and Early History. Stable Isotopes and population genetics – New Answers to Old Questions?", Berlin, Germany, March 24-26
Prokaryotic adaptation to different environmental conditions at the genomic level: Molecular evolution analysis Dmitry A. Afonnikov, Konstantin V. Gunbin, Kirill E. Medvedev Joint Indo-Russian Workshop "Predictive Biology using Systems and Integrative analysis and Methods"
Analysis of the degenerate motifs in 5’- regulatory regions of brain-specific miRNA genes of primates Vishnevsky O.V., Gunbin K.V., Bocharnikov A.V., Berezikov E.V. Molecular Phylogenetics: Contributions to the 2nd Moscow International Conference "Molecular Phylogenetics" (Moskow, Russia, May 18-21, 2010)
Полиморфизмы, ассоциациированные с инфарктом миокарда в полногеномных исследованиях. Проверка на сибирской популяции Воевода М.И., Максимов В.Н., Куликов И.В., Орлов П.С., Гафаров В.В., Малютина С.К., Ромащенко А.Г. VI Съезд Российского общества медицинских генетиков, Ростов-на-Дону, 14-18 мая 2010 г.
Анализ вырожденных олигонуклеотидных мотивов в промоторах генов миРНК, экспрессирующихся в различных тканях млекопитающих О.В.Вишневский, К.В.Гунбин, А.В.Бочарников, А.В.Романенко. Научная конференция-совещание "Вычисления с использованием графических процессоров в биологии и биоинформатике" 24-25 мая 2010 г., Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова.
Молекулярная эволюция циклинов животных и грибов: зависимость между изменением белков и ростом сложности организмов Турнаев И.И., Гунбин К.В., Суслов В.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А. Первая международная научно-практическая конференция. Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине
Исследование эволюции циклинов: зависимость между эволюционным изменением циклинов и увеличением сложности эукариот Турнаев И.И., Гунбин К.В., Афонников Д.А. Проблемы экологии. Чтения памяти профессора М.М. Кожова.
Изучение в российской популяции ассоциации инфаркта миокарда с ОНП, связанными с этим заболеванием по результатам полногеномных исследований Воевода М.И., Максимов В.Н., Куликов И.В., Орлов П.С., Малютина С.К., Гафаров В.В., Ромащенко А.Г. Сборник тезисов международного конгресса "Кардиология на перекрёстке наук" Тюмень
The relation between biological complexity of eukaryotes and evolutionary changes of Notch cascade protein features Gunbin K.V. Bukharina T.A. Седьмая Международная Конференция по Биоинформатике Регуляции и Структуры Генома (BGRS'2010)
Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. IV Международная Школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биология клетки».
Polymorphism in the 2-5-oligoadenylate synthetase gene cluster is associated with human resistance/susceptibility to tick-borne encephalitis virus induced disease Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Myasnikova N.G., Pilipenko P.I., Romaschenko A.G., Voevoda M.I., Brinton M.A. Ninth International Symposium on Positive-Strand RNA Viruses
BioinfoWF - веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики Генаев М.А., Гунбин К.В., Афонников Д.А. Электронные библиотеки: перспективные методы и технологии, электронные коллекции. RCDL’2010
Molecular evolution of the Wolbachia wRi, wMel and wPip genomes Gunbin K.V., Ilinsky Yu.Yu., Afonnikov D.A. Проблемы экологии. Чтения памяти профессора М.М. Кожова. Тезисы докладов Международной научной конференции и Международной школы для молодых ученых (Иркутск, 20-25 сентября 2010 г.) – Иркутск: Изд-во Иркутского государственного университета. 2010. С. 242.
Molecular evolution of the Wolbachia wRi, wMel and wPip genomes Gunbin K.V., Ilinsky Yu.Yu., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Crimean Meeting: Third International Conference, Dedicated N.V. Timofeeff-Ressovsky “Modern Problems of Genetics, Radiobiology, Radioecology and Evolution”; Third Readings after V.I. Korogodin and V.A. Shevchenko; NATO Advanced Research Workshop “Radiobio
2009
Адаптивная эволюция археобактерий рода Pyrococcus: приспособления к обитанию в условиях высоких давлений на уровне генов и белков Гунбин К.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина
Поиск генов-кандидатов молекулярно-генетических взаимодействий Drosophila melanogaster – Wolbachia Илинский Ю.Ю., Гунбин К.В. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина
Этноспецифическое распределение гаплотипов по полиморфизмам IVS2 (+4) t/c, IVS4 (-47) t/c, and IVS5 (-44) a/g гена HFE в популяциях России и возможная роль этих полиморфизмов в сплайсинге Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф. , Воевода М.И., Ромащенко А.Г. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
Gene density in the late replicated domains of Drosophila Belyakin S. N., Babenko V.N., Maximov D.A., Shloma V.V., Kvon E.Z., Belyaeva E.S., Zhimulev I.F. Chromoosoma 2009, Novosibirsk
Alnterniative landscape of D. melanogaster Бабенко В.Н. Chromoosoma 2009, Novosibirsk
The effects of allelic variation of bovine cytokine genes on susceptibility to infectious diseases Yudin N.S., Vasil'eva L.A., Kobzev V.F., Kuznetsova T.N., Nefedova M.V., Kulikov I.V., Maksimov V.N., Naykova T.M., Potapova T.A., Barkhash A.V., Tumanov Yu.V., Smirnov P.N., Laegreid W.W., Romashchenko A.G., Voevoda M.I. German-Russian Forum Biotechnology GRFB'09
Detection of genes that underwent positive selection in deep-sea archaea of Pyrococcus genus K.V. Gunbin, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov International Autumn School for Young Scientists on Computational Systems Biology and Bioinformatics
Investigating Branch point consensus of human Babenko V. N. Goncharov F.P. Romaschenko AG, Zhimulev IF MCCMB 2009, Moscow
Glaucoma and myopia whole genome association study Vladimir Babenko, Marina Gubina, Igor Kulikov, Ruslan Aitnazarov Of the international Moskow conference on computational molecular biology
Detection of genes that underwent positive selection in deep-sea archaebacteria of Pyrococcus genus K.V. Gunbin, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov 4th Moscow Conference on Computational Molecular Biology
Полиморфизмы генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз человека и их связь с тяжелыми формами клещевого энцефалита Бархаш А.В., Перелыгин А.А., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Мясникова Н.Г., Морозова О.В., Бринтон М.А., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. V Международная научная конференция "Факторы экспериментальной эволюции организмов"
Распространение гена ксилозоизомеразы в пространстве видов бактерий Розанов А.С., Гунбин К.В., Пельтек С.Е. XII Всероссийская молодежная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии. МЭС ТИБОХ, Владивосток 7-14 сентября 2009г.
Связь полиморфизма генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз с течением клещевого энцефалита Бархаш А.В., Мясникова Н.Г., Пилипенко П.И., Ромащенко А.Г., Никитин Ю.П., Воевода М.И. Межрегиональная научно-практическая конференция "Современные молекулярно-биологические и генетические технологии в медицинской практике"
Взаимодействие симбиотической системы Drosophila melanogaster – Wolbachia: генетика и эволюция Илинский Ю.Ю., Гунбин К.В., Захаров И.К. Чарлз Дарвин и современная биология
Горячие точки молекулярно-генетических взаимодействий Drosophila – Wolbachia Гунбин К.В., Илинский Ю.Ю. Эволюционная и популяционная экология - назад в будущее
Связь полиморфизмов генов 2’-5’-олигоаденилатсинтетаз человека с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Перелыгин А.А., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Мясникова Н.Г., Морозова О.В., Бринтон М.А., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
ИЗУЧЕНИЕ СВЯЗИ ПОЛИМОРФИЗМА L33P ГЕНА ТРОМБОЦИТАРНОГО ГЛИКОПРОТЕИНА ITGB3 С СОСУДИСТОЙ ПАТОЛОГИЕЙ ЗРИТЕЛЬНОГО НЕРВА Д.Е.Соболева, М.Н. Пономарева, М.А.Губина, В.Н. Максимов, Н.А. Коновалова, А.Г. Ромащенко V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
Glaukoma and myopia genome association study V.Babenko M. Gubina I. Kulikov R. Aitnasarov Of the international Moskow conference on computational molecular biology
Полиморфизм генов предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Малютина С.К., Гафаров В.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Юдин Н.С., Воевода М.И. V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров
Гены предрасположенности к ИБС в популяции Сибири Толкачёва О.М., Максимов В.Н., Куликов И.В., Завьялова Л.Г., Денисова Д.В., Васильев Г.В., Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Вопросы патогенеза типовых патологических процессов
Гены предрасположенности к ИБС в популяции Сибири Максимов В.Н., Толкачёва О.М., Куликов И.В., Завьялова Л.Г., Денисова Д.В., Васильев Г.В., Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Всероссийская научно-практическая конференция «Перспективы кардиологии России в XXI веке»
Ассоциация однонуклеотидных полиморфных маркеров генов TLR2 и TLR6 с генерализованным пародонтитом. Потапова Т.А., Горбунова И.Л., Вишнякова Н.А., Ромащенко А.Г. V съезд ВОГиС
2008
A stady of the association of E 148E and IVS5 (+219) C/T polymorphisms in the dopamine-B-hydroxylase (DBH) gene and open angle glaucoma Soboleva D.E., Gubina M.A., Kulikov I.V., Konovalova O.S., Romaschenko A.G. 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28
Intron landscape of human genome Maximov DA, Babenko VN 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28
Molecular evolution of the key regulatory genes in the eukaryotic cell cycle gene network Turnaev I.I., Gunbin K.V., Kolchanov N.A. 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008
Polymorphism of lipoprotein lipase gene in West Siberia Caucasian population and its association with plasma lipid levels Voevoda M.I., Shakhtshneider E.V., Kulikov I.V., Maksimov V.N., Romashchenko A.G., Nikitin Yu.P. 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28
The molecular evolution of the pyrococcus genomes: a computer-assisted study K.V. Gunbin, P.B. Baryshev, D.A. Afonnikov 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008
The parallelization of the plato algorithm for analysis of the anomalously evolving gene regions Vyatkin Yu.V., Gunbin K.V., Snytnikov A.V., Afonnikov D.A. 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008
Оценка потенциальной функциональной значимости полиморфизмов IVS2 (+4) t/c, IVS4 (-47) t/c, and IVS5 (-44) a/g гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом человека Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Максимов В.Н., Воевода М.И., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. II-ая Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика" г. Пущино Московской области 7-13 сентября 2008 г.
Палеогенетические исследования древнего наеления Горного Алтая М.А. Губина, Т.А. Чикишева, И.В. Куликов, М.И. Воевода, А.Г. Ромащенко Всероссийский археологический съезд. Суздаль
Составление многомерных генетических карт территории Сибири А.М. Мазур, В.А. Степанов, М.А. Губина, Н.Н. Чеканов, Е. Булыгина, Е.Б. Прохорчук Международный форум по нанотехнологиям, 3-5 декабря 2008 Москва
Изучение полиморфизмов гена MYOC в популяции русских России для ранней диагностики открытоугольной глаукомы Соболева Д.Е., Губина М.А., Коновалова О.С., Коновалова Н.А., Куликов И.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Научно-практическая конференция Глаукома:реальность и перспективы под редакцией С.Э. Аветисова. Москва
Анализ полиморфизма матриксной металлопротеиназы 9 у пациентов с атеросклерозом и инфарктом миокарда Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачёва О.М., Максимов В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Российская конференция "Профилактика сердечно-сосудистых заболеваний", 25-26 марта 2008 г., Новосибирск
Полиморфизм генов кандидатов у лиц с хронической сердечной недостаточностью Ирхина И.С., Гончарова М.В., Максимов В.Н., Куликов И.В., Аллахвердян А.А., Казаринова Ю.Л., Ромащенко А.Г., Малютина С.К., Воевода М.И., Шабалин А.В. Российская конференция "Профилактика сердечно-сосудистых заболеваний", 25-26 марта 2008 г., Новосибирск
Полиморфизм генов предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям в популяционном и проспективном исследовании Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Малютина С.К., Гафаров В.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Юдин Н.С., Воевода М.И. Российская конференция "Профилактика сердечно-сосудистых заболеваний", 25-26 марта 2008 г., Новосибирск
Полиморфизм гена дофамин-Полиморфизм гена дофамин B гидроксилазы и психонейроиммунологические параметры у здоровых европеоидов ;-гидроксилазы и психонейроиммунологические параметры у здоровых европеоидов Соловьева И.Г., Губина М.A., Стенина А.С., Соболева Д.Е., Лещинская В.В., Ромащенко А.Г., Абрамов В.В. Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии: тезисы докладов Второй Всероссийской конференции с международным участием/под ред. В.Я. Семке, Т.П. Ветлугиной. – Томск: Изд-во "Иван Федоров",
Формирование этнокультурных сообществ в западносибирской лесостепи на основе данных палеогенетики (первые результаты) А.С. Пилипенко, А.Г. Ромащенко, В.И. Молодин, А.А. Журавлев, А.Е. Гришин, Д.В. Поздняков, И.В. Куликов, Т.А. Чикишева, В.Ф. Кобзев Труды II (XVIII) Всероссийского археологического съезда в Суздале. Т. III, 2008, Москва, Институт археологии РАН
Изучение полиморфизма гена MYOC в популяции русских России для ранней диагностики открытоугольной глаукомы Соболева (Иванощук) Д.Е., Губина М.А., Коновалова О.С., Коновалова Н,А., Куликов И.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Глаукома: реальность и перспективы
Полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы и психонейроиммунологические параметры у здоровых европеоидов Соловьева И.Г., Губина М.В., Стенина А.С., Соболева(Иванощук) Д.Е., Лещинская В.В., Ромащенко А.Г., Абрамов В.В Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии
Изучение полиморфизма V64I гена CCR2 у больных с сосудистой патологией зрительного нерва Пономарева М.Н., Соболева Д.Е., Губина М.А., Куликов И.В., Ромащенко А.Г Актуальные вопросы офтальмологии
A study of the association of E148E and IVS (+219) C/T polymorphosms in the Dopamine-b-hydroxylase gene and open angle glaucoma D.E.Soboleva, M.A.Gubina, I.V. Kulikov, N.A.Konovalova, O.S.Konovalova, A.G.Romaschenko The six international conference on bioinformatics of genome regulation and structure
2007
The Hedgehog Signaling Cascade System: Evolution and Functional Dynamics Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Omelyanchuk L.V., Kolchanov N.A. 3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007"
Molecular genetic systems of development: dynamics of functioning and molecular evolution Kolchanov N.A., Suslov V.V., Gunbin K.V. Computational phylogenetics and molecular evolution "CPMS' 2007"
Gene networks and evolution of regulatory genetic system Kolchanov N.A., Suslov V.V., Gunbin K.V. Current Evolutionary Thinking in Biology, Medicine and Sociology. International Conference Dedicated to 90 Anniversary of Prof. Dmitry K. Belyaev
Adaptive evolution of genetic systems Kolchanov N.A., Suslov V.V., Gunbin K.V. II International Conference "Biosphere Origin and Evolution"
Изучение влияния однонуклеотидного полиморфизма G215C гена р53 на формирование предрасположенности к развитию рака молочной железы у русских женщин Пилипенко И.В., Голубева Д.В., Кобзев В.Ф., Чердынцева Н.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова, Алушта, Украина, 24-28 сентября
Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О., Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова
Изучение генетической предрасположенности человека к вирусу клещевого энцефалита Бархаш А.В., Перелыгин А.А., Пилипенко П.И., Морозова О.В., Бринтон М.А., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Всероссийская научная конференция "Современные научные и прикладные аспекты клещевого энцефалита" (к 70-летию открытия вируса клещевого энцефалита)
Численное исследование модели рецепции градиента концентрации морфогена Hedgehog Фадеев С.И., Когай В.В., Гунбин К.В. Математика в современном мире. Российская конференция посвященная 50-летию Института Математики им. С.Л. Соболева СО РАН.
Пол-зависимое распределение аллелей del425 и 3’UTR гена c-fms у пожилых больных нейрооптикопатией на фоне дисциркуляторной энцефалопатии Пономарева М.Н., Коновалова Н.А., Соболева Д.Е., Губина М.А., Ромащенко А.Г., Кляшев С.А. XV научно-практическая конференция офтальмологов
Характеристика генофондов по полиморфизмам генов предрасположенности и врожденной резистентности к инфекционным заболеваниям: изучение ассоциации молекулярно-генетических маркеров с экономически важными количественными признаками у крупного рогатого скота и свиней. Юдин Н.С., Васильева Л.А., Потапова Т.А., Бархаш А.В., Айтназаров Р.Б., Ермолаев В.И., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Биоразнообразие и динамика генофондов
Характеристика генофондов по полиморфизмам генов предрасположенности и врожденной резистентности к инфекционным заболеваниям: характеристика особенностей генофонда населения Северной Азии по полиморфизму генов предрасположенности к распространенным заболеваниям и адаптации к факторам внешней среды и основных тенденций его эволюции. Воевода М.И., Ромащенко А.Г., Губина М.А., Бархаш А.В., Шахтшнейдер Е.В.. Максимов В.Н., Куликов И.В., Потапова Т.А., Мягкова И.В., Юдин Н.С. Биоразнообразие и динамика генофондов.
Эволюция атеросклероза в этнических группах Северной Азии Воевода М.И., Романова А.Н., Янченко О.В., Рагино Ю.И., Максимов В.Н., Шахтшнейдер Е.В., Потапова Т.А., Ромащенко А.Г. Межрегиональная научно-практическая конференция"Молекулярно-клеточные аспекты патологии" человека на Севере.
2006
High-throughput maldi-tof analysis of genomic seguence polymorphisms. Large-scale genetic study in Novosibirsk region Generozov E.V., Pogoda T.V., Marsheva O.V., Voevoda M.I., Maksimov V.N., Malytina S.K., Kulikov I.V. Shakhtshneider E.V., Romaschenko A.G. 3 rd International Conference "Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnologies for Medicine", Novosibirsk
Genetic resistance to Flaviviruses Perelygin A.A., Barkhash A.V., Brinza D., Romaschenko A.G., Voevoda M.I., Brinton M.A. 3rd International conference "Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnologies for Medicine"
A model for sensing the morphogen Hedgehog concentration gradient Gunbin К.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Omelyanchuk L.V. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)
Aromorphoses and adaptive molecular evolution: morphogens and signaling cascade genes Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)
Variability in the 2'-5'-oligoadenylate synthetase (OAS) gene cluster is associated with severity of tick-borne encephalitis virus-induced disease in Russian patients Barkhash A., Perelygin A., Brinza D., Pilipenko P., Bogdanova Yu., Romaschenko A., Voevoda M., Brinton M. Ninth Southeastern Regional Virology Conference
Ethnic peculiarities of human pathology in Siberia. Genetic background of predisposition to common diseases Voevoda M.I., Romashchenko A.G.,Maksimov V.N., Shakhtshneider E.V., Yudin N.S., Barkhash A.V., Kobzev V.F., Kulikov I.V., Mishakova T.M., Naykova T.M., Myagkova I.V., Potapova T.A., Nikitin Yu.P 13th International Congress on Circumpolar health
The phylogeography of mtDNA variation in Altaian Kazakh populations Gokсumen O, Osipova LP, Zhadanov SI, Andreenkov O, Tabikhanova L, Gubina M, Schurr TG The American Association of Physical Anthropologists Meeting
Палеогенетические исследования останков носителей Пазырыкской культуры IV-II вв до н.э. Куликов И.В., Нефедова М.В., Шульгина Е.О., Губина М.А., Пилипенко А.С., Дамба Л.Д., Кобзев В.Ф., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Всероссийский археологический съезд "Современные проблемы Археологии России", 23 – 28 октября 2006 г, Новосибирск
Выявление генов предрасположенности к распространенным сердечно-сосудистым заболеваниям: принципы, достижения и перспективы Воевода М.И., Юдин Н.С., Васильев Г.В., Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Бархаш А.В., Ромащенко А.Г. Международная конференция "Фундаментальные науки – биотехнологии и медицине"
Изучение генетической предрасположенности человека к вирусу клещевого энцефалита Бархаш А.В. II Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биотехнология»
Молекулярно-генетические основы предрасположенности человека к клещевому энцефалиту Бархаш А.В. Перспективы использования молекулярно-генетических исследований в практическом здравоохранении
Археология, антропология и палеогенетика Троицкого могильника (культура мохэ): первые результаты комплексного анализа С.В. Алкин, Т.А.Чикишева, М.А. Губина, И.В. Куликов Проблемы биологической и культурной адаптации человеческих популяций, научная конференция Октябрь 2007, Санкт-Петербург, Музей антропологии и этнографии РАН (Кунсткамера)
Особенности гаплотипического разнообразия мтДНК в некоторых популяциях Сибири, Дальнего Востока и Средней Азии Губина М.А., Дамба Л.Д., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Вилемс Р., Воевода М.И. Современные проблемы археологии России, Новосибирск, 23-28 октября
Особенности гаплотипического разнообразия мтДНК представителей Кротовской культуры Барабы Пилипенко А.С., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Гришин А.Е., Поздняков Д.В., Молодин В.И. Современные проблемы археологии России, Новосибирск, Ин-т археологии и этнографии СО РАН
Association study of SNP of the TNF-alpha gene with bovine leukosis and evaluation of its functional significance Yudin N.S., Vasil’eva L.A., Kobzev V.F., Kuznetsova T.N., Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)
TRRD: a database on experimentally identified transcription regulatory regions and transcription factor binding sites. Kolchanov N.A., Podkolodnaya O.A., Ananko E.A., Ignatieva E.V., Stepanenko I.L., Khlebodarova T.M., Merkulov V.M., Merkulova T.I., Podkolodny N.L., Romashchenko A.G. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
A database designed for the polymorphisms of the human CCR2 gene. Apasyeva N.V., Yudin N.S., Ignatieva E.V., Voevoda M.I., Romashenko A.G. fifth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure
Apolipoprotein polymorphism in native population of mountain in Shoriya (West Siberia) and its association with plasma lipid levels Shakhchneider E.V., Barbarash O.L., Ogarkov M.Y., Kulikov I.V., Baum V.A., Ustinov S.N., Yudin N.S., Kobzev V.F., Romashenko A.G., Voevoda M.I. XIV International Symposium on Atherosclerosis
Компьютерные подходы к исследованию влияния полиморфизмов на экспрессию генов и функцию белков. Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Кочетов А.В., Игнатьева Е.В., Пономаренко М.П., Орлова Г.В., Меркулова Т.И., Ощепков Д.Ю., Аман Е.Э., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Деменков П.С., Пинтус С.С., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Турнаев И.И., Апасьева Н.В., Губина М.А., Ромащенко А.Г. International conference “Basic Science for Biotechnology and Medicine” September 3-7, 2006, Novosibirsk. Russia.
Bioinformatics and mechanisms of molecular pathology N.A. Kolchanov, V. Ivanisenko, M. Ponomarenko, E. Aman, E. Ignatieva, T. Kuznetsova, V. Mordvinov, P. Demenkov, A. Ratushny, V.Likhoshvai, E. Ananko, N. Podkolodny, N. Podkolodnaya, A.. Romaschenko Геномика, протеомика, биоинформатика и нанотехнологии для медицины – GPMB-2006 Новосибирск, июль 2006
Изучение полиморфизма гена c-FMS (по DEL425) в популяциях коренных народов Западной Сибири Сенькова Н.А., Осипова Л.П., Ромащенко А.Г. Биологические эффекты малых доз ионизирующей радиации и радиоактивное загрязнение среды: тезисы докладов Международной конференции (Сыктывкар, Республика Коми, Россия, 28 февраля – 3 марта 2006 г.)
Изучение полиморфизмов DEL425 3'UTR(TC--CA) гена C-FMS в популяциях коренных народов Западной Сибири Сенькова Н.А., Осипова Л.П., Ромащенко А.Г. 13 Международный конгресс по приполярной медицине (Новосибирск, 12-16 июня 2006 г.)
2001
Reconstructing ORFs for the EST and mRNA Assemblies in the AllGenes Gene Index Project Vladimir Babenko, Brian Brunk, Jonathan Crabtree, Li Li, Christian Stoeckert The third Georgia Tech - Emory International Conference on Bioinformatics
2000
Alu subfamilies in the expressed sequences Babenko VN, Hide W Genome Sequencing and Biology
Гранты
2022
Персонализированный подход для прогнозирования
семейной гиперхолестеринемии на основе машинного
обучения и секвенирования нового поколения РНФ, номер гранта 22-25-00743
2021
Оценка генетической динамики городской популяции в период социально-экономического кризиса РНФ, номер гранта № 22-28-00866
2020
Поиск новых этиопатогенетических факторов развития ИБС в молодом возрасте с помощью высокопроизводительных молекулярно-генетических и биохимических технологий следующего поколения и разработка персонализированного подхода к ранней диагностике и профилактике заболевания грант Президента Российской Федерации для государственной поддержки ведущих научных школ Российской Федерации, номер гранта НШ-2595-2020.7
2019
Генетическая предрасположенность человека и модельных животных к различным клещевым инфекциям Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 19-115-50232-"Экспансия"
Исследованиеюю Номер гранта РНФ 19-15-00026
Генетическая вариабельность у пациентов с семейной гиперхолестеринемией РФФИ, номер гранта 19-015-00458
Поиск новых генетических факторов, связанных с предрасположенностью человека к заболеваниям, вызываемым флавивирусами Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 19-015-00124-а
Влияние частых стрессов на репродуктивную функцию насекомых: молекулярно-генетические механизмы РФФИ, номер гранта 19-04-00458-а
2017
Изучение разнообразия генетического
контроля наследуемой потери слуха у
коренного населения Сибири и создание
специфичной панели генов для
персонифицированного ДНК-тестирования РФФИ, номер гранта 17-29-06016-офи_м
2016
Реконструкция некоторых фенотипических черт представителей древнего населения Западной Сибири методами палеогенетики РФФИ, номер гранта 16-06-00495 А
Экзомный анализ предрасположенности человека к тяжелым формам клещевого энцефалита Российский научный фонд, номер гранта 16-15-00127
Популяционная структура и следы адаптации к холодному климату в геномах российских пород крупного рогатого скота и овец Российский научный фонд
2015
Влияние генов семейства фактора некроза опухолей на компромисс между иммунитетом и хозяйственно-важными признаками при доместикации животных РФФИ, номер гранта 13-04-00968
Грант "Академическая мобильность" в рамках третьего этапа открытого благотворительного конкурса Фонда Михаила Прохорова на участие в Международной научной конференции “Viruses 2016 - At the Forefront of Virus-Host Interactions”(Basel, Switzerland) Благотворительный фонд культурных инициатив (Фонд Михаила Прохорова), номер гранта АМ – 166 / 15
Гранты выдающимся ученым за рубежом Правительство Российской Федерации, номер гранта 14.B25.31.0033
Mongolian population РФФИ, номер гранта 15-54-53091 ГФЕН_а
Компьютерное исследование геномов эукариот Бюжет, номер гранта ИЦиГ СО РАН VI.61.1.
Анализ генетических полиморфизмов адаптации к окружающей среде и диабета II типа у монгольских бурят РФФИ, номер гранта 15-54-53091 ГФЕН_а
Оценка потенциальной роли социально-демографической структуры сообществ глухих людей в распространенности наследуемых форм потери слуха в регионах Сибири РФФИ, номер гранта 15-04-04860_а
2014
Экспериментальные генетические модели агрессивного и толерантного поведения: исследование молекулярно-генетических механизмов с использованием технологий секвенирования следующего поколения (RNA-Seq) РНФ, номер гранта РНФ № 14-14-00269
Грант "Академическая мобильность" в рамках второго этапа открытого благотворительного конкурса Фонда Михаила Прохорова на участие в The 2014 Innate Immunity Summit (London, Great Britain). Благотворительный фонд культурных инициатив (Фонд Михаила Прохорова), номер гранта АМ –83/14
Поиск общих генетических факторов, связанных с предрасположенностью человека к заболеваниям, вызываемым различными флавивирусами Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 14-04-00641-a
Сравнительный анализ вклада мутаций гена GJB2 в возникновение нейросенсорной тугоухости у жителей Беларуси и ряда регионов Сибири (Россия). РФФИ, номер гранта Бел_а 14-04-90010
Южная Сибирь или Меланезия родина Денисовского человека РФФИ, номер гранта 14-06-0018
2013
Грант "Академическая мобильность" в рамках второго этапа открытого благотворительного конкурса Фонда Михаила Прохорова на участие в 15th International Congress of Immunology (Milan, Italy) Благотворительный фонд культурных инициатив (Фонд Михаила Прохорова), номер гранта АМ – 142/13
Изучение молекулярных механизмов наследственной глухоты и распространенности в популяциях Сибири (2013). СО РАН
Комплексное изучение наследуемых форм потери слуха в популяциях Сибири Программа фундаментальных исследований Президиума РАН "Фундаментальные науки – медицине", номер гранта ФНМ-30
2012
Формирование банка ДНК пород крупного рогатого скота Западной Сибири для молекулярно-генетического анализа их генофонда Президиум СО РАН, номер гранта 3
Научный проект "Изучение возможной связи полиморфизма генов TLR3 и CCR5 с предрасположенностью к клещевому энцефалиту в популяции русских" для представления на научном мероприятии "2nd Antivirals Congress" Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 12-04-09575-моб_з
Генофонд митохондриальной ДНК средневекового населения юга Западной Сибири (тюркское и монгольское время, вторая половина I - первая половина II тысячелетия н.э.) РФФИ, номер гранта РФФИ 12-04-31818
Прогностическая ценность новых генетических маркеров для выявления предрасположенности к развитию сахарного диабета второго типа у жителей города Новосибирска. Мэрия города Новосибирск
Изучение молекулярных механизмов наследственной глухоты и распространенности в популяциях Сибири. СО РАН
Междисциплинарный интеграционный проект СО РАН № 32 "Этногенез населения юга Западной Сибири в эпоху голоцена (по данным археологии, антропологии и палеогенетики)", 2012-2014 гг. СО РАН, номер гранта № 32
2011
Участие в 3rd EMBO Conference on Host Genetic Control of Infectious Diseases Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 11-04-09652-моб_з
Разработка алгоритмов и программных систем для решения задач анализа последовательностей, возникающих в теоретической и прикладной геномике Министерство образования и науки РФ, номер гранта 07.514.11.4003
Изучение молекулярных механизмов наследственной глухоты и распространенности в популяциях Сибири (2011). СО РАН
Изучение молекулярно-генетического контроля наследуемых форм нейросенсорной тугоухости/глухоты и анализ их распространенности в популяциях Сибири РФФИ, номер гранта 11-04-01221а
Изучение связи полиморфизма генов неспецифического иммунного ответа с предрасположенностью человека к заболеваниям, вызываемым флавивирусами Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 11-04-01206а
Реконструкция процессов антропогенеза: анализ митохондриальных геномов представителей древнего и современного населения Сибири РФФИ, номер гранта 11-06-12006
2010
Участие в 10th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 10-04-09807-моб_з
Общие закономерности и региональные тенденции антропогенетических и историко-культурных процессов Южных районов Сибири в эпоху неолита РГНФ, номер гранта 10-01-00322а.
Элементы социальной структуры пазырыкского общества и их проявления в особенностях погребальной обрядности (по данным археологии, антропологии, палеогенетики и дендрохронологии) РГНФ, номер гранта 10-01-00193а
2009
Участие в V Международной научной конференции "Факторы экспериментальной эволюции организмов" Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 09-04-09455-моб_з
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов Президиум РАН, номер гранта 23.29
ПОСТГЕНОМНАЯ БИОИНФОРМАТИКА: КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ Президиум СО РАН, номер гранта 119
Компьютерное исследование молекулярной эволюции генов и молекулярно-генетических систем многоклеточных животных РФФИ, номер гранта 09-04-01641
Структура и свойства молекулярных органических кристаллов в условиях высоких давлений и низких температур СО РАН (интеграционный проект), номер гранта 109
Интеграционный проект СО РАН № 115 "Антропогенетические, экологические и социально-культурные составляющие этногенеза древнего населения Западной Сибири (V-I тыс. до н.э.) Сибирское Отделение Российской Академии Наук, номер гранта 115
Этногенез и этническая история в эпоху развитой бронзы на юге Западносибирской равнины (по данным археологии, палеогенетики, антропологии) РФФИ, номер гранта 09-06-00357-а
2007
Участие в VIII Съезде Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 07-04-08467-з
Разработка новой стратегии антисенс подхода "Бинарный олигонуклеотидный реагент, генерирующий антибиотик" РФФИ, номер гранта 07-03-00950
2006
Оценка риска отдаленных последствий воздействия на население опасных факторов ядерных и химических технологий Международный научно-технический центр, номер гранта 2311
РОЛЬ МИКРООРГАНИЗМОВ В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ И БИОИНЖЕНЕРНЫЕ ПРИЛОЖЕНИЯ Президиум СО РАН, номер гранта 24
Применение высоких давлений к исследованию молекулярных кристаллов СО РАН (интеграционный проект), номер гранта 49
Научное руководство
2024
Поиск сцепленных экзонов в выборках RNA-Seq гиппокампа крысы и анализ информационной сложности их ансамблей Болтунов Тимофей Антонович 03.01.09 – математическая биология, биоинформатика, 2024-06-21
2023
Анатомия пяти отделов мозга по анализу экспрессии генов Файрушина Карина Биология (06.03.01) бакалавриат, 2023-06-20
Применение вычислительных технологий RNA-Seq в биологии Емелин Антон Викторович 03.01.09 – математическая биология, биоинформатика, 2023-06-19
Оценка частот распространенных полиморфных вариантов генов TLR1, TLR2, OAS1 у пациентов, перенесших COVID-19 Кучирка Лада Ивановна 2023-06-06
2022
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ПОПУЛЯЦИОННЫХ ВЫБОРОК ПОДРОСТКОВ Г. НОВОСИБИРСКА, РОЖДЁННЫХ В РАЗНЫЕ ПЕРИОДЫ КОНЦА 20-ГО И НАЧАЛА 21-ГО ВЕКА Юшкевич Евгений Александрович Направление подготовки: 06.04.01 Биология, 2022-06-09
2021
Анализ ассоциации вариантов генов липидного обмена APOA2, APOA5, APOH с первичной гиперлипидемией Широкова Нина Сергеевна лечебное дело, 2021-06-09
2020
АЛЛЕЛЬНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ГЕНА GJB2 У НАСЕЛЕНИЯ РЯДА РЕГИОНОВ СИБИРИ Зыцарь Марина Вячеславовна 03.02.07 – генетика, 2020-10-14
Сравнительный функциональный анализ в системе in vitro мутантных вариантов гена GJB2, ассоциированных с потерей слуха Маслова Екатерина Александровна 2020-06-19
Изучение адаптации к полярному климату на генетическом уровне Губина Екатерина Юрьевна 2020-01-23
ИССЛЕДОВАНИЕ ГЕНА ДОФАМИНОВОГО РЕЦЕПТОРА D4 У ПОДРОСТКОВ Сафин Артур Радикович 2020-01-23
Изучение семейного анамнеза, отягощенного сахарным диабетом Исакова Виолетта Максимовна 2020-01-23
2019
Изучение экзон-интронной структуры генов некодирующих РНК Сидоренко Иван Алексеевич Биоинформатика, 2019-04-15
2018
Оценка функциональной значимости вариантов последовательности гена GJB2, ассоциированных с потерей слуха у коренного населения Сибири. Маслова Екатерина Александровна академический бакалавриат 06.03.01 - биология, 2018-06-02
2016
Разработка пакета визуализации структурных характеристик генетического текста Спицина Анастасия Михайловна 2016-06-15
ИССЛЕДОВАНИЕ ГЕНА FLT4 В СЕМЬЯХ БОЛЬНЫХ ПЕРВИЧНОЙ ЛИМФЕДЕМОЙ Латыева Олеся Олеговна Генетика, 2016-06-01
Полиморфизм митохондриальной ДНК в популяции cибирских татар Барабинской лесостепи Шуряева Анна Константиновна Генетика, 2016-06-01
ИЗУЧЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНЫХ МЕХАНИЗМОВ И РАСПРОСТРАНЕННОСТИ НАСЛЕДСТВЕННОЙ ГЛУХОТЫ В РЕСПУБЛИКЕ ТЫВА Бады-Хоо Марита Сергеевна 03.02.07 - генетика, 2016-04-20
2015
Реконструкция гаплотипов хромосом с мажорными мутациями гена GJB2 у тувинцев и алтайцев с потерей слуха Зыцарь Марина Вячеславовна биолог (цитология и генетика), 2015-06-05
Вклад мутаций генов OTOF, RAI1 и SLC26A4 в этиологию наследственной потери слуха в популяциях Сибири (Алтай и Тува) Михальская Валерия Юрьевна биолог (цитология и генетика), 2015-06-05
Анализ ассоциации некоторых полиморфных вариантов генов TNFalpha и TNFR1 с молочной продуктивностью крупного рогатого скота Печурин Сергей Николаевич 2015-06-04
Молекулярно-генетический анализ эндогенных ретровирусов у миниатюрных свиней Кирильчук Рената Сергеевна 2015-06-04
2014
Молекулярно-генетический анализ экспрессии эндогенных ретровирусов у минисвиней Базарова Наталья Эдуардовна Частная зоотехния, технология производства продуктов животноводства, 2014-06-30
2009
Реконструкция и компьютерный анализ генной сети внутриклеточного ответа на гипоксию. Мешков Иван Олегович Генетика, 2009-06-01
2000
Функциональная роль Bsp-повторов: подбор условий обогащения транскриптов Bsp-повторов из почки песца Бензо Елена Сергеевна цитолог и генетик, 2000-06-08
Приглашенный курс лекций "Введение в биоинформатику" Курс прочитан в региональном институте непрерывного образования Пермского госуниверситета (РИНО ПГУ). Объем курса - 22 академических часа. Имеется приглашение для чтения лекций блока «Биоинформатика» объемом 22 часа на курсах повышения квалификации профессорско-преподавательского состава Пермского госуниверситета на срок с 29 октября по 2 ноября 2007г (от 16.10.2007 № 180-3/7415). Имеется благодарность за чтение лекций от Пермского госуниверситета (от 17.12.2007 № 80-3/9185)., семестров: 1
2004
Генные сети НГУ, ФЕН, КИБ, семестров: 1
Патенты
2023
Программа построения решающих правил для прогнозирования семейной гиперхолестеринемии на основе машинного обучения и секвенирования нового поколения (ПСГХС) Колкер А.Б., Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Тимощенко О.В., Рагино Ю.И. Номер патента 2023660511
2022
"База данных ансамбля деревьев для прогнозирования семейной гиперхолестеринемии на основе машинного обучения и секвенирования нового поколения» (АДПСГ) Колкер А.Б., Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Тимощенко О.В., Рагино Ю.И. Номер патента №2022623708
2020
Экзомы пациентов с коронарным атеросклерозом (ЭКА) Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Каштанова Е.В., Полонская Я.В., Рагино Ю.И. Номер патента №2020622711
"Экзомы пациентов с моногенными формами сахарного диабета (ЭМСД)" Шахтшнейдер Елена Владимировна, Иванощук Динара Евгеньевна, Овсянникова Алла Константиновна, Рымар Оксана Дмитриевна, Орлов Павел Сергеевич, Втюрин Константин Александрович, Воевода Михаил Иванович Номер патента № 2020620959
База данных полиморфизмов генов дофамин-β-гидроксилазы, транспортера дофамина, Дфаминового рецептора D4 пациентов ГБУЗ НСО "Новосибирский областной клинический наркологический диспансер" с зависимостью от синтетических наркотиков Соловьева И.Г., Губина М.А., Патрикеева О.Н., Рецер Р.А., Ларин А.В. Номер патента 2019621605
База данных «Дифференциальный альтернативный сплайсинг генов человека при вторичной глиобластоме (ДАСГГ)» / «Differential Alternative Splicing of Human Genes in secondary Glioblastome (DASGG)» Брагин А.О., Губанова Н.В., Бабенко В.Н., Богомолов А.Г., Цуканов А.В., Леберфарб Е.Ю., Орлов Ю.Л. Номер патента Свидетельство о госрегистрации № 2018621416
Дифференциальный альтернативный сплайсинг генов крыс, селектированных по агрессивному поведению (ГК-АСАП) Брагин АО, Чадаева ИВ, Бабенко ВН, Богомолов АГ, Кожемякина РВ, Маркель АЛ, Орлов ЮЛ Номер патента 2018620934
База данных «Дифференциальный альтернативный сплайсинг генов крыс, селектированных по агрессивному поведению (ГК-АСАП)» / «Differential alternative splicing of rat genes selected for aggressive behavior (RG-ASAB)» Брагин А.О., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Богомолов А.Г., Кожемякина Р.В., Маркель А.Л., Орлов Ю.Л Номер патента 2018621208
2013
Полиморфизмы генов циркадных часов (ПМ ГЦЧ)/ Рolymorphisms of circadian clock genes (PM CCG) Подколодная О.А., Подколодный Н.Л. Номер патента 20133621533
2012
Интегрированная база данных молекулярно-генетических систем (МГСБаза)/Integrated molecular genetic systems database (MGSBase) Подколодный Н.Л., Семенычев А.В., Рассказов Д.А., Деменков П.С., Подколодная Н.Н., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А. Номер патента 2012620886
2010
СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К ИШЕМИЧЕСКОЙ НЕЙРООПТИКОПАТИИ Пономарева М.Н., Коновалова Н.А., Скляр Л.В., Руднева Л.Ф., Ромащенко А.Г., Губина М.А., Соболева Д.Е., Колчанов Н.А. Номер патента №2405455
2000
Способ диагностики предрасположенности к гемохроматозу Ромащенко А.Г., Михайлова С.В., Воевода М.И., Кобзев В.Ф. Номер патента 2144566