1.     Основное направление фундаментальных и фундаментально-ориентированных исследований 

1. Изучение молекулярно-генетических механизмов формирования заболеваний человека и животных
2. Изучение эволюции генофонда человека и животных в Северной Азии
3. Изучение молекулярно-генетических механизмов адаптации человека и животных к неблагоприятным условиям среды
4. Разработка новых подходов к лечению заболеваний человека

2.     Задачи, решаемые в настоящее время в рамках базового бюджетного проекта

Проект: VI.58.1.1. Руководитель: чл.-корр. РАМН М.И. Воевода.

Особенности формирования молекулярно-генетических механизмов метаболических нарушений и наследственных заболеваний у жителей Северной Азии и разработка новых подходов к их коррекции

Основной целью исследования является изучение особенностей формирования молекулярно-генетических механизмов метаболических нарушений и некоторых редких заболеваний у жителей Северной Азии в исторической перспективе и разработка новых подходов к коррекции их нарушений. Для достижения цели предполагается решения ряда взаимосвязанных задач, таких как выявление процессов формирование генетического состава (т.е. особенностей структуры генофонда) населения в период его существования в регионе (по филогенетически информативным локусам), исследование механизмов адаптации населения к условиям региона на молекулярно-генетическом уровне (эволюция адаптативно значимых локусов генома), молекулярно-генетические механизмы приспособления населения региона к меняющимся социально-экономическим и культурным составляющим развития сообществ человека в регионе.

В плане изучения молекулярно-генетических основ глухоты в популяциях Сибири будет проведен сопоставительный анализ спектра и частоты встречаемости мутаций гена GJB2 (Сх26) в полиэтничном населении Сибири и выявление факторов, определяющих закономерности их распространенности. Генетический анализ случаев наследуемой врожденной глухоты неясной этиологии и поиск новых локусов (генов), ассоциированных с потерей слуха, с привлечением современных методов полногеномного анализа. Полученные данные внесут вклад в понимание молекулярно-генетических механизмов наследуемых форм глухоты, закономерностей их распространенности в популяциях Сибири и будут актуальны для разработки оптимальной методологии молекулярной диагностики данной патологии.

С целью поиска новых подходов к коррекции метаболических нарушений предполагается воздействовать одновременно на экспрессию нескольких белков, участвующих в конкретном метаболическом пути (синтез холестерина) и изучить возможности нового подхода. Задача не имеет аналогов, так как структуры олигонуклеотидных производных должны допускать возможность одновременного воздействия. Преимуществом предлагаемого подхода, что и делает его актуальным, являются то, что олигонуклеотидные производные, в отличие от низкомолекулярных препаратов, преимущественно накапливаются в почках и печени и минуют систему цитохрома Р450. 

3.     Прикладные разработки

Разработка новых медицинских технологий в области геномной медицины.

4.     Иллюстрированное описание лучших результатов, полученных подразделением за последние 5 лет

Впервые в России проведена проверка ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП), идентифицированных в недавних зарубежных полногеномных исследованиях, на пригодность в качестве маркеров риска развития инфаркта миокарда. Воспроизведены результаты полногеномных исследований по ассоциациям ОНП rs619203, rs499818, rs1333049 и rs10757278 с инфарктом миокарда и факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний для популяции русских г. Новосибирска. Для ОНП rs28711149, rs1376251, rs2549513, rs4804611, rs17465637 такие ассоциации не обнаружены.

Оценено генетическое разнообразие гена HFE в популяциях России и показана его информативность в качестве биомаркера для реконструкции картины формирования структуры современных популяций в северной части Евразии. Из палеогенетических исследований следует, что население Горного Алтая в период позднего неолита и начала I тыс. до н. э. было представлено, главным образом, носителями западноевразийских гаплотипов мтДНК, в основном гаплогруппы Н с гетерогенным составом ее вариантов. Проникновение в регион мигрантов с восточноевразийскими гаплотипами мтДНК началось в I тыс. до н. э. и коррелировало с распространением кочевого животноводства. Показано отсутствие в Барабинской лесостепи в период энеолита (IV тыс. до н. э.) и до конца II тыс. до н. э. носителей гаплогруппы Н мтДНК, распространенной среди современного населения региона. Их появление зафиксировано в начале I тыс. до н. э. Контекстным анализом структуры ДНК в местах локализации полиморфизмов IVS2(+4)t/c, IVS4(-44)t/c, IVS5(-47)a/g гена HFE определена их потенциальная функциональная значимость на разных этапах формирования сплайсосомы в ходе процессинга пре-мРНК.

Изучено распространение 23-х ОНП в генах семейства 2′-5′-олиго-аденилатсинтетаз (OAS1, OAS2, OAS3 и OASL) у жителей г. Новосибирска, перенесших клещевой энцефалит, и в популяционном контроле. Обнаружена ассоциация 5 ОНП генов OAS2 и OAS3 с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита.

Показано наличие достоверных различий частот аллелей и генотипов по замене G на A в позиции 15 от начала первого интрона гена TNFalpha у здоровых коров черно-пестрой породы и инфицированных вирусом лейкоза по данным серологической диагностики. Оказалось, что частоты генотипов и аллелей этого маркера существенно различаются в выборках животных, инфицированных вирусом или находящихся на различных стадиях заболевания лейкозом.

Совместно с ФГБУ «НИИ терапии» СО РАМН сформирован крупнейший в России популяционный банк генетических материалов жителей нашей страны на базе международного эпидемиологического проекта HAPIEE, создающий основу для широкомасштабных молекулярно-генетических исследований. Ведётся наблюдение с помощью регистров инсульта, инфаркта миокарда, общей смертности за судьбой лиц прошедших через скрининг. Формируются коллекции образцов ДНК ряда фенотипов (наследственные нарушения ритма, гипертрофическая кардиомиопатия, внезапная сердечная смерть, врождённые пороки сердца и др.) Постоянно ведётся работа по пополнению банка ДНК коренных народностей Западной и Восточной Сибири, Дальнего Востока, Центральной Азии.

Впервые в России проведена проверка ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП), идентифицированных в недавних зарубежных полногеномных исследованиях, на пригодность в качестве маркеров риска развития сахарного диабета 2-го типа и артериальной гипертензии. Для сахарного диабета второго типа обнаружены ассоциации ОНП rs7903146 в гене TF7L2 и rs10811661 в гене CDKN2A/B, не выявлены ассоциации для ОНП rs9939609 в гене FTO и rs2237892 в гене KCNQ1.

Подтверждена ассоциация rs699 и rs5068 с артериальной гипертензией у мужчин. rs2681492 ассоциирован с систолическим и пульсовым АД и частотой сердечных сокращений. Носители разных генотипов rs4343 значимо отличаются по среднему уровню индекса атерогенности, индекса массы тела и отношению талия/бёдра.

Выполнена проверка ассоциации 28 ОНП с внезапной сердечной смертью (ВСС). В общей группе с ВСС ассоциированы rs10757278 (рис. 1), rs1333049. У мужчин до 50 лет ассоциирован с ВСС rs3010396 гена CASQ2 и ID полиморфизм гена ADRA2B (рис. 2). У мужчин ассоциирован с ВСС rs2228314 гена SREBF2 (рис. 3). У женщин старше 50 лет - rs499818. У мужчин старше 50 лет ассоциирован с ВСС rs187238 гена IL18, rs3864180 гена GPC5, rs1010 гена VAMP8. Из 28 исследованных генетических маркёров ассоциация с внезапной сердечной смертью подтверждена для 12. Генетические маркёры ВСС, найденные в зарубежных ассоциативных исследованиях необходимо проверять на российской популяции.

Изучен спектр мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в европеоидной популяции России у лиц с гиперхолестеринемией. Выявлены 7 ранее неизвестных мутаций в экзонах 9 и 12. Найдено 12 ранее описанных для других популяций мира мутаций в экзонах 2, 5, 6, 8, 9, и 11. Только одна из этих мутаций ранее была описана в России в клинической выборке пациентов с семейной гиперхолестеринемией. Показано, что в России спектр мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в популяционной выборке пациентов с гиперхолестеринемией значительно отличается от спектра мутаций пациентов с семейной гиперхолестеринемией (клинические выборки).

 Впервые показана ассоциация полиморфизма гена холодового рецептора TRPM8 с рядом заболеваний человека и их факторами риска. Впервые продемонстрирована его ассоциация с показателями, характеризующими термочувствительность. 

Рисунок 1

Рисунок 2

Рисунок 3

Совместно с сотрудниками Института археологии и этнографии СО РАН (координатор программ – академик В.И. Молодин) сформированы репрезентативные коллекции палеоантропологических образцов от представителей древнего населения Сибири различной этнокультурной и хронологической принадлежности – с эпохи неолита (VI–V тыс. до н. э.) до позднего средневековья (XVI–XVII в. н. э.). Проведено исследование разнообразия линий митохондриальной ДНК (мтДНК) в генофондах населения лесостепной полосы Западной Сибири (Барабинская лесостепь и прилегающие территории) эпохи неолита и различных периодов эпохи бронзы (VI – начало I тыс. до н. э.) (рис.). Высокая репрезентативность изученного материала (~ 200 образцов мтДНК) позволила реконструировать динамику состава генофонда мтДНК населения региона на протяжении пяти тысячелетий. Определены компоненты генофонда, свойственные наиболее ранним группам населения и маркирующие генетическую преемственность разновременных групп (варианты гаплогрупп А, С, Z, U5a). Реконструирована последовательность появления в генофонде новых для региона гаплогрупп мтДНК (гаплогруппы T, H). Комплексный междисциплинарный характер исследований (тесная интеграция палеогенетических, археологических и антропологических исследований) позволил связать изменения состава генофонда мтДНК исследованных групп с предполагаемыми демографическими и этнокультурными процессами, протекавшими в Западной Сибири в обозначенный период. Установлено, что в периоды неолита и ранней бронзы (VI–III тыс. до н. э.) доминировала преемственность в структуре генофонда мтДНК между разновременными этнокультурными группами. Значительные изменения состава линий мтДНК в генофондах произошли в результате крупных миграционных потоков в регион в периоды развитой (II тыс. до н. э.) и финальной бронзы (начало I тыс. до н. э.). Таким образом, впервые методами палеогенетики на репрезентативном материале реконструированы генетические аспекты формирования древнего населения обширного региона (западносибирской лесостепи) на протяжении длительного периода времени (около пяти тысячелетий).

5.     Задачи, планируемые на перспективу

1. Расшифровка структуры генетической предрасположенности к заболеваниям человека на основе полногеномномного анализа.
2. Разработка персонифицированных подходов к профилактике и лечению заболеваний человека на основе геномной информации.
3. Этноспецифический и палеогенетический полногеномный анализ геномов древнего и современного населения Евразии.
4. Совершенствование подходов к селекции сельскохозяйственных животных на основе геномной информации.

Бывшие сотрудники

Совместители

Публикации

2011	Полиморфизм гена дофамин-β гидроксилазы, параметры вегетативной регуляции и клинико патологические характеристики злокачественного процесса у больных раком желудка Соловьева И.Г., Губина М.А., Ромащенко А.Г., Черенкова М.М.,Понебратец О.Ю., Широков Р.В., Абрамова Т.Я., Сидоров С.В.,Чердынцева Н.В., Козлов В.А. Сибирский онкологический журнал, 2011, №5.-с.46-51.
2010	Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, 275:337-339
	Компьютерная система филогенетического анализа генных сетей: изучение эволюции генной сети клеточного цикла животных Тимонов В.С., Турнаев И.И., Генаев М.А., Гунбин К.В. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Т. 275, 412–414.
	Ландшафт альтернативного сплайсинга в геноме Drosophila melanogaster Бабенко В.Н., Айтназаров Р.Б., Гончаров Ф.В., Жимулев И.Ф. RUSS J GENET+, 2010, № 9,т. 46, с. 1168-1170
	A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2010, 4, 65, 143-145
	Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека, связанный с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита, в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Molecular Biology, 2010, Т.44, №6. С. 985-993.
	Триолигонуклеотидные реагенты: адресованная модификация РНК. Ошевский С. И. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2010, №1, V430, pp53-56
	Does drive toward canonic exonic splicing sites exist in mammals Babenko V, Ward W, Ruvinsky A J MOL EVOL, 2010, 70(4):387-394
	Gene density profile reveals the marking of late replicated domains in the Drosophila melanogaster genome Belyakin SN, Babenko VN, Maksimov DA, Shloma VV, Kvon EZ, Belyaeva ES, Zhimulev IF. CHROMOSOME RES, 2010, 119(6):589-600
	Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
	Paucity and preferential suppression of transgenes in late replication domains of the D. melanogaster genome Babenko V.N., Makunin I.V., Brusentsova I.V., Belyaeva E.S., Maksimov D.A., Belyakin S.N., Maroy P., Vasil’eva L.A., Zhimulev I.F. BMC GENOMICS, 2010, V. 11. P. 318-332
	The ethnospecific distribution of the HFE haplotypes for IVS2(+4)t/c, IVS(-44)t/c, and IVS5(-47)g/a in populations of Russia and possible effects of these single-nucleotide polymorphisms in splicing Mikhailova S.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romashchenko A.G. GENET TEST, 2010, V. 14, N. 4, P. 461–469
	Variability in the 2'-5'-oligoadenylate synthetase gene cluster is associated with human predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced disease Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Myasnikova N.G., Pilipenko P.I., Romaschenko A.G., Voevoda M.I., Brinton M.A. J INFECT DIS, 2010, Vol. 202, No. 12, P. 1813-1818
	Анализ вырожденных олигонуклеотидных мотивов в промоторах генов миРНК, экспрессирующихся в различных тканях млекопитающих О.В.Вишневский, К.В.Гунбин, А.В.Бочарников, Е.В.Березиков Вестник МГУ, 2010, No. 4, pp. 73–75
	Анализ полиморфизма трех позиций промоторного региона гена TNF-a у пациентов с ишемической болезнью сердца, нестабильной стенокардией и инфарктом миокарда Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачева О.М., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2010, Т. 50, № 2, стр. 9-14
	Интеркалярный хроматин в геноме Drosophila Жимулев ИФ, Беляева ЕС, Андреева ИС, Андреенкова АВ, Бабенко ВН, Белякин СН, Болдырева ЛС, Брусенцова ИС, Демаков СН, Зыков ИА, Кокоза ЕП, Колесникова ТН, Максимов ДН, Макунин ИВ, Пиндюрин АВ, Семешин ВФ, Хорошко ВА RUSS J GENET+, 2010, 46(10):1405-1408
2009	Молекулярно-генетические аспекты психонейроиммунных взаимоотношений у здоровых европеоидов Соловьева И. Г., Губина М. А., Стенина А. С., Абрамова Т. Я., Соболева Д. Е., Кожевников В. С., Ромащенко А. Г., Короленко Ц. П., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, 2 (53). - С. 10-13
	Психоэмоциональные особенности и полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы 444G/A у больных раком желудка Соловьева И. Г., Короленко Ц. П., Губина М. А., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, 2 (53). - С. 78-80.
	Роль полиморфизма С(-260)-Т гена CD14 в течении и исходе нозокомиальной пневмонии Байгозина Е.А., Совалкин В.И., Куликов И.В., Потапова Т.А., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Пульмонология, 2009, № 5, стр.65-67
	Характеристика молекулярно-генетической организации интеркалярного гетерохроматина в районе 10А-В D. melanogaster Бабенко ВН, Похолкова ГС, Кокоза ЕВ, Андреенкова НС, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, 424:27-30
	Эволюция ключевых белков клеточного цикла коррелирует с увеличением сложности эукариотических организмов Турнаев И.И., Гунбин К.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 2, 426, 265-269
	Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA BMC GENOMICS, 2009, V. 1, 10, 639
	The macrophage migration inhibitory factor (MIF) gene polymorphism in Czech and Russian patients with myocardial infarction Tereshchenko IP, Petrkova J, Mrazek F, Lukl J, Maksimov VN, Romaschenko AG, Voevoda MI, Petrek M. CLIN CHIM ACTA, 2009, V. 402, No. 1-2, P.199-202
	Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 4, 425, 546-548
	Внезапная сердечная смерть и полиморфизм генов-кандидатов сердечно-сосудистых заболеваний Воевода М.И., Куликов И.В., Максимов В.Н., Малютина С.К., Шахтшнейдер Е.В., Кулишова Л.М., Новоселов В.П., Ромащенко А.Г. KARDIOLOGIYA, 2009, № 4, С. 52-57
	Генетика фибрилляции предсердий Никулина С.Ю., Шульман В.А., Кузнецова О.О., Аксютина Н.В., Чернова А.А., Максимов В.Н., Куликов И.В., Устинов С.Н., Казаринова Ю.Л., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2009, № 3, стр. 43-48
	Изучение генетико-антропологического состава населения древних историко-культурных общностей Алтая Чикишева Т.А., Поздняков Д.В., Губина М.А., Куликов И.В. Вестник РГНФ, 2009, 3(56) с.46-57.
2008	Молекулярно-генетические системы развития: динамика функционирования и молекулярная эволюция Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2008, 2, 73, 270 – 282
	Мутации в гене филаггрина у больных с вульгарным ихтиозом в популяции Новосибирска Максимов В.Н., Куликов И.В., Семаев С.Е., Максимова Ю.В., Аллахвердян А.А., Простякова Е.М., Батина О.В., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Бюллетень сибирской медицины, 2008, № 1, стр. 173-176
	Особенности захоронения младенцев в жилищах городища Чича-1 в Баабинской лесостепи по данным анализа структуры ДНК Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2008, № 2, Т. 34, С. 57-67
	Оценка потенциальной функциональной значимости полиморфизмов IVS2(+4) t/c, IVS4(-44) t/c и IVS5(-47) a/g гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом человека Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Максимов В.Н., Воевода М.И., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2008, Т. 3, № 2, стр. 60-68
	Полиморфизм гена холодового рецептора TRPM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока Потапова Т.А., Юдин Н.С., Бабенко В.Н., Пилипенко И.В., В.Ф. Кобзев И.В., Гырголькау Л.А., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2008, №4, Том 12, С. 749-754
	Полиморфизм холодового рецептора TPRM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока Потапова ТА, Юдин НС, Бабенко ВН, Пилипенко ИВ, Кобзев ВФ, Гырголькау ЛА, Воевода МИ Информационный вестник ВОГИС, 2008, 4, 749-754
	Популяционное исследование спектра мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в российской популяции Воевода М.И., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Максимов В.Н., Пилипенко И.В., Терещенко И.П., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Никитин Ю.П. RUSS J GENET+, 2008, Т. 44, №10, стр. 1374-1378
	Фибрилляция предсердий: генеалогия и генетика Никулина С.Ю., Шульман В.А., Кузнецова О.О., Аксютина Н.В., Чернова А.А., Максимов В.Н., Куликов И.В., Устинов С.Н., Казаринова Ю.Л., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Сибирское медицинское обозрение, 2008, № 4(52), стр. 4-10
	Genetic variation in the enigmatic Altaian Kazakhs of South-Central Russia: Insights into Turkic population history Gokcumen O, Dulik MC, Pai AA, Zhadanov SI, Rubinstein S, Osipova LP, Andreenkov OV, Tabikhanova LE, Gubina MA, Labuda D, Schurr TG AM J PHYS ANTHROPOL, 2008, 136(3), P. 278-293
	Russian Old Believers: genetic consequences of their persecution and exile, as shown by mitochondrial DNA evidence Rubinstein S, Dulik MC, Gokcumen O, Zhadanov S, Osipova L, Cocca M, Mehta N, Gubina M, Posukh O, Schurr TG HUM BIOL, 2008, Jun;80(3):203-37
	TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko INTELL DATA ANAL, 2008, No. 5, Vol. 12, P. 443-461
2007	Консервативность ДНК 3’-нетранслируемой области гена GRO1 северного оленя Юдин Н.С., Потапова Т.А., Кобзев В.Ф., Южаков А.А., Кушнир А.В. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2007, № 9, стр. 93-97
	Палеогенетическое исследование древнего населения Горного Алтая Чикишева Т.А., Губина М.А., Куликов И.В., Карафет Т.М., ВоеводаМ.И., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2007, N4 (32) c 130-142
	A counter clockwise northern route of the Y-chromosome haplogroup N from Southeast Asia towards Europe Siiri Rootsi, Lev A. Zhivotovsky, Marian Baldovic, Manfred Kayser, Ildus A. Kutuev, Rita Khusainova, Marina A. Bermisheva, Marina Gubina, Sardana A. Fedorova, Anne-Mai Ilum, Elza K. Khusnutdinova, Mikhail I. Voevoda, Ludmila P. EUR J HUM GENET, 2007, Feb;15(2):204-11
	Long-term trends in evolution of indels in protein sequences Wolf Y, Madej T, Babenko V, Shoemaker B, Panchenko AR. BMC EVOL BIOL, 2007, 7,19
	Model of the reception of hedgehog morphogen concentration gradient: comparison with an extended range of experimental data Gunbin K.V., Omelyanchuk L.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, 2b, 5, 491-507
	Accumulation of slightly deleterious mutations in mitochondrial protein-coding genes of large versus small mammals Popadin K., Polishchuk L.V., Mamirova L., Knorre D., Gunbin K. P NATL ACAD SCI USA, 2007, 33, 104, 13390-13395
	The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A. In Silico Biology, 2007, 3, 7, 333-354
	Vasa-related genes and their expression in stem cells of colonial parasitic rhizocephalan barnacle Polyascus polygenea (Arthropoda: Crustacea: Cirripedia: Rhizocephala) Shukalyuk A.I., Golovnina K.A., Baiborodin S.I., Gunbin K.V., Blinov A.G., Isaeva V.V. CELL BIOL INT, 2007, 31(2):97-108
	Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 2, 11, 373-400
	Ассоциация аллелей гена IL10(G-1087A) с уровнем пролактина и инсулина в периферической крови у здоровых европеоидов Соловьева И.Г., Смольникова М.В., Губина М.А., Дортман В.В., Кожевников В.С., Меняева Е.В., Коненков В.И., Абрамов В.В. Омский научный вестник, 2007, №3 (61), приложение 2.
	Beringian standstill and spread of Native American founders Tamm E., Kivisild T., Reidla M., Metspalu M., Smith D.G., Mulligan C.J., Bravi C.M., Rickards O., Martinez-Labarga C., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A., Golubenko M.V., Stepanov V.A., Gubina M.A., Zhadanov S.I., Osipova L.P., Damba L., Voevoda M.I., Dipi PloS One, 2007, 2(9):e829
	Делеция 2282del4 в гене филаггрина в популяции жителей Новосибирска и у больных вульгарным ихтиозом Максимов В.Н., Куликов И.В., Семаев С.Е., Максимова Ю.В., Простякова Е.М., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Медицинская генетика, 2007, № 8, С. 21-23
2006	Полиморфизм гена аполипопротеина Е, желчно-каменная болезнь и панкреатит Григорьева И.Н., Никитенко Т.М., Романова Т.И., Осипенко М.Ф., Егошина М.А., Сединина Е.В., Венжина Ю.Ю., Шахтшнейдер Е.В., Куликов И.В., Максимов В.Н., Усов С.А., Мироненко Т.В., Данильчева Т.В., Иванова М.В., Потапова Т.А., Ромащенко А.Г. Малютина С. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 4, С. 80-88.
	Численное исследование модели рецепции градиента концентрации морфогена Hedgehog В.В.Когай, К.В.Гунбин, Л.В.Омельянчук, С.И. Фадеев, Н.А.Колчанов Сибирский журнал индустриальной математики, 2006, 3(27), IX, 66-79
	Этногенетические особенности подверженности атеросклерозу в этнических группах Сибири (на примере гена аполипопротеина Е) Воевода М.И., Степанов В.А., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 2, С. 63-72.
	Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck GENOMICS, 2006, V. 88, № 6, P. 752-761.
	Гаплотипический анализ гена HFE в популяции русских и среди пациентов с мультифакториальными заболеваниями Михайлова СВ, Онопченко О.В., Суханов А.В., Максимов В.Н., Гаскина Т.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т. 10, №3, С. 504-513.
	Долгожительство – модель изучения процесса старения. Шабалин А.В., Воевода М.И., Черных Н.И., Пентегова В.А., Рагино Ю.И., Иванова М.В., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Шахтшнейдер Е.В. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 4, С. 11-21
	Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О, Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т.10, №3. С.565-571

Конференции

2010	Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А. 1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии"
	Молекулярная эволюция циклинов: зависимость между изменением белков и ростом сложности эукариот Гунбин К.В., Турнаев И.И., Афонников Д.А. 1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии"
	2'-5'-oligoadenylate synthetase genes polymorphism, associated with predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis, in human North Eurasian populations Barkhash A.V., Babenko V.N., Kobzev V.F., Romaschenko A.G., Voevoda M.I. 10th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases (MEEGID X)