 |
|
|
Комышев Евгений Геннадьевич, к. б. н.
|
Публикации
| 2024 |
Identification of novel loci precisely modulating pre-harvest sprouting resistance and red color components of the seed coat in T. aestivum L.
Afonnikova S.D., Kiseleva A.A., Fedyaeva A.V., Komyshev E.G., Koval V.S., Afonnikov D.A., Salina E.A.
[Plants]
|
|
Evaluation of the Spike Diversity of Seven Hexaploid Wheat Species and an Artificial Amphidiploid Using a Quadrangle Model Obtained from 2D Images.
Komyshev E.G., Genaev M.A., Kruchinina Yu.V., Koval V.S., Goncharov N.P. and Afonnikov D.A.
[Plants]
|
|
Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks.
Artemenko N.V., Genaev M.A., Epifanov R.UI., Komyshev E.G., Kruchinina Y.V., Koval V.S., Goncharov N.P. and Afonnikov D.A.
[Frontiers in Plant Science]
|
|
Конвейер обработки гиперспектральных изображений на примере исследования зерен ячменя, содержащих меланин.
Бусов И.Д., Генаев М.А., Комышев Е.Г., Коваль В.С., Зыкова Т.E., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2023 |
Determination of the melanin and anthocyanin content in barley grains by digital image analysis using machine learning methods
E.G. Komyshev, M.A. Genaev, I.D. Busov, M.V. Kozhekin, N.V. Artemenko, A.Y. Glagoleva, V.S. Koval, D.A. Afonnikov
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Характеристика синтетической линии пшеницы –
потенциального источника хозяйственно ценных признаков
И.Г. Адонина, М.В. Зорина, С.П. Мехдиева, И.Н. Леонова, Е.Г. Комышев, Е.М. Тимонова, Е.А. Салина
[Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции]
|
| 2022 |
Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using
Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network
Mikhail A. Genaev, Evgenii G. Komyshev, Olga D. Shishkina, Natalya V. Adonyeva, Evgenia K. Karpova, Nataly E. Gruntenko, Lyudmila P. Zakharenko, Vasily S. Koval and Dmitry A. Afonnikov
[Mathematics]
|
|
QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color
Characteristics Estimated by Digital Image Processing
Mian Abdur Rehman Arif, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Vasily S. Koval, Nikolay
A. Shmakov, Andreas Börner and Dmitry A. Afonnikov
[Plants]
|
|
Relationship between the characteristics of bread wheat grains, storage time and germination
Dmitry A. Afonnikov. Evgenii G. Komyshev, Vadim M. Efimov, Mikhail A. Genaev, Vasily S. Koval, Peter U. Gierke and Andreas Börner
[Plants]
|
| 2021 |
Automatic morphology phenotyping of tetra- and hexaploid wheat spike using computer vision methods
A.Yu. Pronozin, A.A. Paulish, E.A. Zavarzin, A.Yu. Prikhodko, N.M. Prokhoshin, Yu.V. Kruchinina,
N.P. Goncharov, E.G. Komyshev, M.A. Genaev
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Автоматическое фенотипирование морфологии колоса
тетра- и гексаплоидных видов пшеницы методами компьютерного зрения
А.Ю. Пронозин, А.А. Паулиш, Е.А. Заварзин, А.Ю. Приходько, Н.М. Прохошин, Ю.В. Кручинина,
Н.П. Гончаров, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2020 |
First person – Evgeniya Karpova and Evgenii Komyshev
Evgeniya Karpova, Evgenii Komyshev
[Biology Open]
|
|
Quantifying Drosophila adults with the use of a smartphone
Evgenia K. Karpova, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Natalya V. Adonyeva, Dmitry A. Afonnikov, Margarita A. Eremina, Nataly E. Gruntenko
[Biology Open]
|
|
Анализ цветовых и текстурных характеристик зерен злаков на цифровых изображениях
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Использование гиперспектральной камеры Specim IQ
для анализа растений
В.В. Альт, Т.А. Гурова, О.В. Елкин, Д.Н. Клименко, Л.В. Максимов, И.А. Пестунов, О.А. Дубровская,
М.А. Генаев, Т.В. Эрст, К.А. Генаев, Е.Г. Комышев, В.К. Хлесткин, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2019 |
Morphometry of the Wheat Spike by Analyzing 2D Images
Mikhail A. Genaev, Evgenii G. Komyshev, Nikolai V. Smirnov, Yuliya V. Kruchinina,
Nikolay P. Goncharov and Dmitry A. Afonnikov
[Agronomy]
|
|
Оценка количественных характеристик клубнеобразования
дикого картофеля на основе анализа изображений клубней
с использованием компьютерного приложения SeedСounter
К.А. Иванова, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, А.А. Егорова, К.А. Колошина, Н.А. Чала,
Д.А. Афонников, А.В. Кочетов, Е.В. Рогозина, С.В. Герасимова
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2018 |
SpikeDroidDB – информационная система
для аннотации морфометрических характеристик
колоса пшеницы
М.А. Генаев, Е.Г. Комышев, Фу Хао, В.С. Коваль, Н.П. Гончаров, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Информационная Система По Биоресурсным Коллекциям Институтов ФАНО России
Лашин С.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Казанцев Ф.В., Комышев Е.Г., Ощепкова Е.А., Петров А.В., Рассказов Д.А., Смирнова А.А., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
Evaluation of the SeedCounter, a Mobile Application for Grain Phenotyping
Komyshev E., Genaev M., Afonnikov D.
[Frontiers in Plant Science]
|
| 2016 |
Methods of high-throughput plant phenotyping for large-scale breeding and genetic experiments
D. A. Afonnikov, M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. G. Komyshev, T. A. Pshenichnikova
[RUSS J GENET+]
|
| 2015 |
Computer high-throughput approaches to wheat phenotyping: application to leaf pubescence analysis
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A. Simonov A.V.
[The 3rd Intern. Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”, Abstract book]
|
| 2013 |
BioUniWA – СИСТЕМА ГЕНЕРАЦИИ WEB-СЕРВИСОВ И КОНВЕЙЕРОВ ДЛЯ УНИФИЦИРОВАННОГО ДОСТУПА К РЕСУРСАМ В ОБЛАСТИ БИОИНФОРМАТИКИ
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2012 |
BioInfoWF – система автоматической генерации веб-интерфейсов и веб-сервисов для биоинформационных исследований
М.А. Генаев, Е.Г. Комышев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
Монографии
| 2014 |
Wheat leaf pubescence analysis: methods of computer phenomics
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A.
|
Конференции
| 2024 |
Genome-wide association study reveals novel loci modulating pre-harvest sprouting and grain color in red-grained winter wheat T. aestivum L.
Afonnikova S., Kiseleva A., Fedyaeva A., Komyshev E., Koval V., Afonnikov D., Salina E.
[The 14th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2024)]
|
|
Поиск локусов и генов-кандидатов, ассоциированных с окраской и предуборочным прорастанием зерна у краснозерной озимой мягкой пшеницы
Афонникова С.Д., Киселёва А.А., Федяева А.В., Комышев Е.Г., Афонников Д.А., Салина Е.А.
[7-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» (GPB 2024)]
|
| 2023 |
Synthetic amphiploids - a potential source of common wheat genetic diversity in economically valuable traits
Adonina I. G., Zorina M.V., Mehdiyeva S.P., Leonova I.N., Komyshev E.G., Timonova E.M., Salina E.A.
[The 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2023)]
|
| 2020 |
Исследование эффекта гормезиса при регулярном тепловом
стрессировании у двух видов Drosophila с использованием
нового автоматического метода изучения плодовитости
Е. К. Карпова*, Е. Г. Комышев, М. А. Генаев, Н. В. Адоньева,
М. А. Еремина, Н. Е. Грунтенко
[МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ДРОЗОФИЛА В ГЕНЕТИКЕ И МЕДИЦИНЕ"]
|
| 2019 |
ALTERING PLANT DOMESTICATION TRAITS VIA SITE-DIRECTED GENOME MODIFICATION
Gerasimova S.V., Ivanova K.A., Hertig C., Korotkova A.M., Hiekel S., Kolosovskaya E., Koloshina K.A., Genaev M.A., Komyshev E.G., Egorova A.A., Domrachev D.V., Rogozina E.V., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.]
|
|
WildPetotaDB – a database for genotype and phenotype of wild tuber-bearing species of the genus Solanum L.
Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В.
[Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
|
|
Метод морфометрии колоса пшеницы на основе анализа изображений
Комышев Е.Г., Генаев М.А., Афонников Д.А.
[Международный конгресс Биотехнология: состояние и перспективы развития. Науки о жизни.]
|
|
РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО
ФЕНОТИПИРОВАНИЯ РАСТЕНИЙ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ
Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы.]
|
|
Разработка методов автоматического определения количественных характеристик, описывающих
фенотипические признаки колоса пшеницы
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Международная конференция «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)]
|
| 2018 |
Применение системы редактирования
генома Cas9/gRNA для доместикации
картофеля de novo
К.А. Иванова, С.В. Герасимова, А.А. Егорова,
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.В. Домрачев,
К.А. Колошина, А.В. Кочетов, Е.К. Хлесткина
[Crispr-2018]
|
|
РАЗРАБОТКА МЕТОДИК ФЕНОТИПИРОВАНИЯ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ
КОЛОШИНА К.А., ИВАНОВА К.А., КОМЫШЕВ Е.Г., ГЕНАЕВ М.А., КОЧЕТОВ А.В., ГЕРАСИМОВА С.В.
["ДЕНЬ ПОЛЯ" В РАМКАХ КПНИ ФАНО РОССИИ "РАЗВИТИЕ СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВА КАРТОФЕЛЯ" И НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ И ПРИКЛАДНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ В СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВЕ КАРТОФЕЛЯ"]
|
| 2017 |
MOBILE APPLICATION FOR HIGH THROUGHPUT GRAIN PHENOTYPING
M. A. Genaev, E. G. Komyshev, D. A. Afonnikov
[4th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)]
|
| 2016 |
SEEDCOUNTER APPLICATION AND WHEAT EAR RECOGNIZING ALGORITHM FOR HIGH THROUGHPUT WHEAT PHENOTYPING
E. G. Komyshev, M. A. Genaev, D. A. Afonnikov
[Международный научный симпозиум «Генетика и геномика растений для продовольственной безопасности»]
|
|
Wheatdb2: plant trait database and information system based on Crop Ontology terms
E.G. Komyshev, M.A. Genaev, A.V. Akushkina, D.A. Afonnikov
[10th anniversary International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology»]
|
| 2015 |
SeedCounter – mobile application for grain phenotyping
Комышев Е.Г., Генаев М.А, Афонников Д.А.
[Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk]
|
| 2013 |
Generation of web services – the unification of access to bioinformatics resources
Комышев Евгений Геннадьевич
[Пятая международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика» - 5th International Young Scientists School «Systems Biology and Bioinformatics», SBB’2013]
|
|
Разработка системы создания web-сервисов и конвейеров для унифицированного доступа к ресурсам в области биоинформатики
Комышев Евгений Геннадьевич
[мнск 2013 г. новосибирск]
|
| 2012 |
BioinfoWF -- WEB SERVICES AND WEB INTERFACES GENERATOR FOR BIOINFORMATICS ANALYSIS
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Гунбин Константин Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
[Школа молодых ученых "Биоинформатика и системная биология"]
|
|
РЕАЛИЗАЦИЯ ПОДСИСТЕМЫ ГЕНЕРАЦИИ WEB-СЕРВИСОВ ДЛЯ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫХ МОДУЛЕЙ СИСТЕМЫ BioInfoWF
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович
[мнск 2012 г. новосибирск]
|
Гранты
| 2016 |
Разработка компьютерных методов высокопроизводительного фенотипирования злаков на основе анализа изображений и их интеграция с информационной системой поддержки селекционно-генетических исследований
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович
|
Патенты
| 2021 |
База данных генотипа и фенотипа диких видов картофеля (WildPetotaDB) / A database of the genotype and phenotype of wild potato species (WildPetotaDB)
Комышев Е.Г., Колошина К.А., Фомин И.В., Колосовская Е.В., Генаев М.А., Эрст Т.В., Егорова А.А., Чалая Н.А., Рогозина Е.В., Герасимова С.В.
|
| 2019 |
Программа для оценки количественных характеристик колоса пшеницы (ОКХК) / The program for the extraction the quantitative characheristics of the wheat spike (WERecognizer)
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
|
| 2017 |
Система учета заданий по секвенированию ДНК (СЦ-ИЦиГ) / Accounting System for DNA sequencing tasks (SС-ICG)
Генаев Михаил Александрович, Комышев Евгений Геннадьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич
|
| 2016 |
Мобильное и настольное приложение для массового фенотипирования зерен пшеницы (СиидКаунтер)/Mobile and desktop application for mass phenotyping seeds of wheat (SeedCounter)
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
|
| 2013 |
Система генерации веб-сервисов и конвейеров для унифицированного доступа к ресурсам в области биоинформатики (BioUniWA)
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
|
|
|
