 |
|
|
Генаев Михаил Александрович, к. б. н.
|
Персональная информацияДата рождения
14.04.1986
Образование
НГУ ФИТ – 2008
Публикации
| 2024 |
Evaluation of the Spike Diversity of Seven Hexaploid Wheat Species and an Artificial Amphidiploid Using a Quadrangle Model Obtained from 2D Images.
Komyshev E.G., Genaev M.A., Kruchinina Yu.V., Koval V.S., Goncharov N.P. and Afonnikov D.A.
[Plants]
|
|
Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks.
Artemenko N.V., Genaev M.A., Epifanov R.UI., Komyshev E.G., Kruchinina Y.V., Koval V.S., Goncharov N.P. and Afonnikov D.A.
[Frontiers in Plant Science]
|
|
Конвейер обработки гиперспектральных изображений на примере исследования зерен ячменя, содержащих меланин.
Бусов И.Д., Генаев М.А., Комышев Е.Г., Коваль В.С., Зыкова Т.E., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Новый ген опушения листа Hl1th, интрогрессированный в мягкую пшеницу от Thinopyrum ponticum, и его фенотипическое проявление при гомеологичных хромосомных замещениях
Симонов А.В., Гордеева Е.И., Генаев М.А., Ли Вэньцзянь, Булатов И.О., Пшеничникова Т.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2023 |
Determination of the melanin and anthocyanin content in barley grains by digital image analysis using machine learning methods
E.G. Komyshev, M.A. Genaev, I.D. Busov, M.V. Kozhekin, N.V. Artemenko, A.Y. Glagoleva, V.S. Koval, D.A. Afonnikov
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato
Cultivars Grown in Russia
Dmitry I. Karetnikov, Gennady V. Vasiliev, Stepan V. Toshchakov, Nikolay A. Shmakov, Mikhail A. Genaev, Mikhail A. Nesterov, Salmaz M. Ibragimova, Daniil A. Rybakov,
Tatjana A. Gavrilenko, Elena A. Salina, Maxim V. Patrushev, Alex V. Kochetov and Dmitry A. Afonnikov
[INT J MOL SCI]
|
|
WAX INDUCER 1 Regulates β-Diketone Biosynthesis by Mediating Expression of the Cer-cqu Gene Cluster in Barley
Gerasimova, S.V.; Kolosovskaya, E.V.; Vikhorev, A.V.; Korotkova, A.M.; Hertig, C.W.; Genaev, M.A.; Domrachev, D.V.; Morozov, S.V.; Chernyak, E.I.; Shmakov, N.A.; Vasiliev, G.V.; Kochetov, A.V.; Kumlehn, J.; Khlestkina, E.K.
[INT J MOL SCI]
|
| 2022 |
Wheat yield estimation based on analysis of UAV
images at low altitude
Mikhail Kozhekin, Mikhail Genaev, Vasily Koval, Andrey Slobodchikov, Dmitry Afonnikov
[BIO Web of Conferences]
|
|
Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using
Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network
Mikhail A. Genaev, Evgenii G. Komyshev, Olga D. Shishkina, Natalya V. Adonyeva, Evgenia K. Karpova, Nataly E. Gruntenko, Lyudmila P. Zakharenko, Vasily S. Koval and Dmitry A. Afonnikov
[Mathematics]
|
|
QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color
Characteristics Estimated by Digital Image Processing
Mian Abdur Rehman Arif, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Vasily S. Koval, Nikolay
A. Shmakov, Andreas Börner and Dmitry A. Afonnikov
[Plants]
|
|
Relationship between the characteristics of bread wheat grains, storage time and germination
Dmitry A. Afonnikov. Evgenii G. Komyshev, Vadim M. Efimov, Mikhail A. Genaev, Vasily S. Koval, Peter U. Gierke and Andreas Börner
[Plants]
|
|
Variability of leaf pubescence characteristics in transgenic tobacco lines with partial proline dehydrogenase gene suppression.
S.M. Ibragimova, M.A. Genaev, A.V. Kochetov, D.A. Afonnikov
[BIOL PLANTARUM]
|
| 2021 |
Automatic morphology phenotyping of tetra- and hexaploid wheat spike using computer vision methods
A.Yu. Pronozin, A.A. Paulish, E.A. Zavarzin, A.Yu. Prikhodko, N.M. Prokhoshin, Yu.V. Kruchinina,
N.P. Goncharov, E.G. Komyshev, M.A. Genaev
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Image-Based Wheat Fungi Diseases Identification by Deep Learning
Genaev M .A., Skolotneva E.S., Gultyaeva E.I., Orlova E.A., Bechtold N.P., Afonnikov D.A.
[Plants]
|
|
The identification of a new gene for leaf pubescence introgressed into bread wheat from Triticum timopheevii Zhuk. and its manifestation in a different genotypic background
Симонов Александр Владимирович
Смирнова Ольга Григорьевна
Генаев Михаил Александрович
Пшеничникова Татьяна Алексеевна
[Plant Genetic Resources]
|
|
Автоматическое фенотипирование морфологии колоса
тетра- и гексаплоидных видов пшеницы методами компьютерного зрения
А.Ю. Пронозин, А.А. Паулиш, Е.А. Заварзин, А.Ю. Приходько, Н.М. Прохошин, Ю.В. Кручинина,
Н.П. Гончаров, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2020 |
Технология структурирования и обработки транскриптомных данных на основе гибридного использования RDBMS и NoSQL подходов
Мухин А.М., Генаев М.А., Рассказов Д.А., Лашин С.А., Афонников Д.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Quantifying Drosophila adults with the use of a smartphone
Evgenia K. Karpova, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Natalya V. Adonyeva, Dmitry A. Afonnikov, Margarita A. Eremina, Nataly E. Gruntenko
[Biology Open]
|
|
Анализ цветовых и текстурных характеристик зерен злаков на цифровых изображениях
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Использование гиперспектральной камеры Specim IQ
для анализа растений
В.В. Альт, Т.А. Гурова, О.В. Елкин, Д.Н. Клименко, Л.В. Максимов, И.А. Пестунов, О.А. Дубровская,
М.А. Генаев, Т.В. Эрст, К.А. Генаев, Е.Г. Комышев, В.К. Хлесткин, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2019 |
Morphometry of the Wheat Spike by Analyzing 2D Images
Mikhail A. Genaev, Evgenii G. Komyshev, Nikolai V. Smirnov, Yuliya V. Kruchinina,
Nikolay P. Goncharov and Dmitry A. Afonnikov
[Agronomy]
|
|
New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes
Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov, Egor B. Prokhortchouk, Mariya Y. Pakharukova, Konstantin V. Gunbin, Kirill Ustyantsev, Mikhail A. Genaev, Alexander G. Blinov, Alexander Mazur, Eugenia Boulygina, Svetlana Tsygankova, Ekaterina Khrameeva, Nikolay Chekanov, Guangyi Fan, An Xiao, He Zhang, Xun Xu, Huanming Yang, Victor Solovyev, Simon Ming-Yuen Lee, Xin Liu, Dmitry A. Afonnikov, Konstantin G. Skryabin
[BMC GENOMICS]
|
|
Оценка количественных характеристик клубнеобразования
дикого картофеля на основе анализа изображений клубней
с использованием компьютерного приложения SeedСounter
К.А. Иванова, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, А.А. Егорова, К.А. Колошина, Н.А. Чала,
Д.А. Афонников, А.В. Кочетов, Е.В. Рогозина, С.В. Герасимова
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2018 |
Novel read density distribution score shows possible aligner artefacts, when mapping a single chromosome
Fedor M. Naumenko, Irina I. Abnizova, Nathan Beka, Mikhail A. Genaev, Yuriy L. Orlov
[BMC GENOMICS]
|
|
SpikeDroidDB – информационная система
для аннотации морфометрических характеристик
колоса пшеницы
М.А. Генаев, Е.Г. Комышев, Фу Хао, В.С. Коваль, Н.П. Гончаров, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Информационная Система По Биоресурсным Коллекциям Институтов ФАНО России
Лашин С.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Казанцев Ф.В., Комышев Е.Г., Ощепкова Е.А., Петров А.В., Рассказов Д.А., Смирнова А.А., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
Evaluation of the SeedCounter, a Mobile Application for Grain Phenotyping
Komyshev E., Genaev M., Afonnikov D.
[Frontiers in Plant Science]
|
| 2016 |
Methods of high-throughput plant phenotyping for large-scale breeding and genetic experiments
D. A. Afonnikov, M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. G. Komyshev, T. A. Pshenichnikova
[RUSS J GENET+]
|
|
Протокол анализа количественных характеристик опушения листа картофеля
А.В. Дорошков, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2015 |
Computer high-throughput approaches to wheat phenotyping: application to leaf pubescence analysis
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A. Simonov A.V.
[The 3rd Intern. Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”, Abstract book]
|
| 2013 |
BioUniWA – СИСТЕМА ГЕНЕРАЦИИ WEB-СЕРВИСОВ И КОНВЕЙЕРОВ ДЛЯ УНИФИЦИРОВАННОГО ДОСТУПА К РЕСУРСАМ В ОБЛАСТИ БИОИНФОРМАТИКИ
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
The antioxidant enzymes activity in leaves of inter-varietal substituion lines of wheat (Triticum aestivum L.) with different tolerance to soil water deficit
S.V. Osipova, A.V. Permyakov, M.D. Permyakova, M.A. Genaev, A. Börner
[Acta Physiologia Plantarum]
|
|
Компьютерный анализ данных экспрессии генов в клетках мозга, полученных с помощью микрочипов и высокопроизводительного секвенирования
Медведева И.В., Вишневский О.В., Сафронова Н.С., Кожевникова О.С., Генаев М.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Орлов Ю.Л.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2012 |
BioInfoWF – система автоматической генерации веб-интерфейсов и веб-сервисов для биоинформационных исследований
М.А. Генаев, Е.Г. Комышев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes (SAMEM): Analysis of molecular evolution modes at deep inner branches of the phylogenetic tree
Gunbin KV, Suslov VV, Genaev MA, Afonnikov DA.
[In Silico Biology]
|
|
Computer approaches to wheat high-throughput phenotyping
Afonnikov D., Genaev M., Doroshkov A., Denisyuk V., Morozova E., Simonov A., Pshenichnikova T.
[Journal of Stress Physiology & Biochemistry]
|
|
Extraction of quantitative characteristics describing wheat leaf pubescence with a novel image processing technique
Mikhail A. Genaev, Alexey V. Doroshkov, Tatyana A. Pshenichnikova, Nikolay A. Kolchanov, Dmitry A. Afonnikov
[PLANTA]
|
|
RatDNA: база данных микрочиповых исследований на крысах для генов, ассоциированных с заболеваниями старения
О.С. Кожевникова, М.К. Мартыщенко, М.А. Генаев, Е.E. Корболина, Н.А. Муралева, Н.Г. Колосова, Ю.Л. Орлов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
WheatPGE: A system for analysis of relationships among the phenotype, genotype, and environment in wheat
M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. V. Morozova, T. A. Pshenichnikova and D. A. Afonnikov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Информационная поддержка селекционно-генетического эксперимента у пшеницы в системе WheatPGE
Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Морозова Е.В., Симонов А.В., Афонников Д.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Информационный портал "Биотехнология растений" - Интернет ресурс для поддержки экспериментов в области генной инженерии растений, генетики и селекции пшеницы.
Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2011 |
КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА WheatPGE ДЛЯ АНАЛИЗА ВЗАИМОСВЯЗИ ФЕНОТИП-ГЕНОТИП-ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА У ПШЕНИЦЫ
М.А. Генаев, A.В. Дорошков, Е.В. Морозова, Т.А. Пшеничникова, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков: анализ эволюции циклинов B
Гунбин К.В., Генаев М.А., Турнаев И.И., Афонников Д.А.
[Вестник ТГУ]
|
| 2010 |
A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits
Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Moscow University Biological Sciences Bulletin]
|
|
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков
Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А.
[Труды ТГУ. Серия: Биологическая]
|
|
Компьютерная система филогенетического анализа генных сетей: изучение эволюции генной сети клеточного цикла животных
Тимонов В.С., Турнаев И.И., Генаев М.А., Гунбин К.В.
[Труды ТГУ. Серия: Биологическая]
|
Монографии
| 2014 |
Wheat leaf pubescence analysis: methods of computer phenomics
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A.
|
| 2012 |
Разработка методов, алгоритмов и программ параллельного моделирования в биоинформатике
Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, К.В. Гунбин, М.А. Генаев, Ю.Л. Орлов, Е.В. Игнатьева, О.В. Вишневский, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, Н.А. Колчанов
|
| 2010 |
BioinfoWF – веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики
Генаев М.А., Гунбин К.В., Афонников Д.А.
|
Конференции
| 2024 |
Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia
Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A.
[The 14th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2024)]
|
|
Исследование вариаций и структуры генома сортов картофеля Solanum tuberosum, выращиваемых в России
Д.И. Каретников, Г.В. Васильев, С.В. Тощаков, Н.А. Шмаков, М.А. Генаев, М.А. Нестеров, С.М. Ибрагимова, Д.А. Рыбаков, Т.А. Гавриленко, Е.А. Салина, М.В. Патрушев, А.В. Кочетов, Д.А. Афонников
[INTERNATIONAL CONGRESS “VIII Congress of the Vavilov Society of Geneticists and Breeders, Dedicated to the 300th Anniversary of Russian Science and Higher Education”]
|
| 2023 |
Analysis of the genome structure and its variations in potato cultivars grown in Russia
Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A.
[7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)]
|
| 2022 |
Computer annotation of plant protein sequences
based on sequence similarity and orthology
Malyugin E., Mustafin Z., Pronozin A., Genaev M., Afonnikov D.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022)]
|
|
Large scale analysis of the crop transcriptomic data:
analysis of out of the reference transcripts
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Shmakov N.A., Mustafin Z.S., Mukhin A.M., Lashin S.A.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022)]
|
|
RECONSTRUCTION AND ANALYSIS OF PANGENOME OF SIBERIAN CULTIVARS OF POTATO SOLANUM TUBEROSUM
Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Shmakov N.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V.
[III Всероссийская конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике» (HSG-2022)]
|
|
Reconstruction and analysis of potato Solanum tuberosum pangenome of Siberian cultivars
Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V., Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference]
|
|
РЕКОНСТРУКЦИЯ И АНАЛИЗ ПАНГЕНОМА КАРТОФЕЛЯ SOLANUM TUBEROSUM СОРТОВ СИБИРСКОЙ СЕЛЕКЦИИ
Каретников Д.И., Генаев М.А., Нестеров М.А., Ибрагимова С.М., Васильев Г.В., Тощаков С.В., Гавриленко Т.А., Афонников Д.А., Салина Е.А., Патрушев М.В., Кочетов А.В.
[III Международная научно-практическая конференция "Клеточная биология и биотехнология растений"]
|
| 2020 |
Using fast homology search tools for protein sequence functional annotation: a comparison
Pronozin A., Genaev M., Afonnikov D.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Использование программ быстрого поиска гомологии для функциональной аннотации белков
Pronozin A., Genaev M., Afonnikov D.
[«Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2020» (АПВПМ-2020)]
|
|
Исследование эффекта гормезиса при регулярном тепловом
стрессировании у двух видов Drosophila с использованием
нового автоматического метода изучения плодовитости
Е. К. Карпова*, Е. Г. Комышев, М. А. Генаев, Н. В. Адоньева,
М. А. Еремина, Н. Е. Грунтенко
[МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ДРОЗОФИЛА В ГЕНЕТИКЕ И МЕДИЦИНЕ"]
|
| 2019 |
ОПУШЕНИЕ ЛИСТА ПШЕНИЦЫ: ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОЕ
ФЕНОТИПИРОВАНИЕ, ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОНТРОЛЬ И
ФИЗИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ
Афонников Д.А, Дорошков А.В., Генаев М.А., Симонов А.В., Осипова С.В.,Пермяков А.В., Пермякова М.Д., Ефимов В.М., Пшеничникова Т.А.
[«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮ КАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ, И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»]
|
|
ALTERING PLANT DOMESTICATION TRAITS VIA SITE-DIRECTED GENOME MODIFICATION
Gerasimova S.V., Ivanova K.A., Hertig C., Korotkova A.M., Hiekel S., Kolosovskaya E., Koloshina K.A., Genaev M.A., Komyshev E.G., Egorova A.A., Domrachev D.V., Rogozina E.V., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.]
|
|
WildPetotaDB – a database for genotype and phenotype of wild tuber-bearing species of the genus Solanum L.
Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В.
[Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
|
|
Метод морфометрии колоса пшеницы на основе анализа изображений
Комышев Е.Г., Генаев М.А., Афонников Д.А.
[Международный конгресс Биотехнология: состояние и перспективы развития. Науки о жизни.]
|
|
РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО
ФЕНОТИПИРОВАНИЯ РАСТЕНИЙ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ
Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы.]
|
|
Разработка методов автоматического определения количественных характеристик, описывающих
фенотипические признаки колоса пшеницы
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Международная конференция «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)]
|
| 2018 |
Hippocampal differentially expressed genes between tame and
aggressive foxes are included in pathways associated with stress,
behavior and adult neurogenesis
Гербек Ю.Э., Генаев М.А., Васильев Г.В., Гулевич Р.Г., Шихевич С.Г., Шепелева Д.В., Афонников Д.А., Трут Л.Н.
[The 11th International Multiconference BGRS\SB-2018]
|
|
Применение системы редактирования
генома Cas9/gRNA для доместикации
картофеля de novo
К.А. Иванова, С.В. Герасимова, А.А. Егорова,
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.В. Домрачев,
К.А. Колошина, А.В. Кочетов, Е.К. Хлесткина
[Crispr-2018]
|
|
РАЗРАБОТКА МЕТОДИК ФЕНОТИПИРОВАНИЯ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ
КОЛОШИНА К.А., ИВАНОВА К.А., КОМЫШЕВ Е.Г., ГЕНАЕВ М.А., КОЧЕТОВ А.В., ГЕРАСИМОВА С.В.
["ДЕНЬ ПОЛЯ" В РАМКАХ КПНИ ФАНО РОССИИ "РАЗВИТИЕ СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВА КАРТОФЕЛЯ" И НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ И ПРИКЛАДНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ В СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВЕ КАРТОФЕЛЯ"]
|
| 2017 |
Expression of genes related with stress and behavioral regulation in dorsal hippocampus of the experimentally domesticated foxes.
Herbeck Y, Genaev M, Vasiliev G, Gulevich R, Shikhevich S, Shepeleva D, Afonnikov D, Trut L.
[BNA international Festival of Neuroscience 2017]
|
|
MOBILE APPLICATION FOR HIGH THROUGHPUT GRAIN PHENOTYPING
M. A. Genaev, E. G. Komyshev, D. A. Afonnikov
[4th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)]
|
|
The Genome of Opisthorchis felineus
N. Ershov, M. Pomaznoy, D. Afonnikov, K. Gunbin, M. Genaev, K. Ustiantsev, M. Pakharukova, E. Prokhortchouk, A. Mazur, N. Chekanov, K. Skryabin, N. Kolchanov, et al., V. Mordvinov
[Asian Neglected Tropical Disease Conference 2017 (NTDASIA2017)]
|
|
Экспрессия генов, связанных с поведением, стрессом и фотопериодизмом, в дорзальном гиппокампе доместицируемых лисиц.
Гербек Ю.Э., Генаев М.А., Васильев Г.В., Гулевич Р.Г., Шихевич С.Г., Шепелева Д.В., Афонников Д.А., Трут Л.Н.
[Международная конференция "Беляевские чтения".]
|
| 2016 |
SEEDCOUNTER APPLICATION AND WHEAT EAR RECOGNIZING ALGORITHM FOR HIGH THROUGHPUT WHEAT PHENOTYPING
E. G. Komyshev, M. A. Genaev, D. A. Afonnikov
[Международный научный симпозиум «Генетика и геномика растений для продовольственной безопасности»]
|
|
SyGraph – web system for visualization of synteny alignments and comparison of assembly contigs
M. A. Genaev, D. A. Afonnikov
[BGRS-2006]
|
|
Wheatdb2: plant trait database and information system based on Crop Ontology terms
E.G. Komyshev, M.A. Genaev, A.V. Akushkina, D.A. Afonnikov
[10th anniversary International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology»]
|
|
Компьютерное фенотипирование растений для селекционно-генетических экспериментов
Генаев М.А.
[международной научно-практической конференции РАЗВИТИЕ НОВЫХ ТЕХНОЛОГИЙ СЕЛЕКЦИИ И СОЗДАНИЕ ОТЕЧЕСТВЕННОГО КОНКУРЕНТОСПОСОБНОГО СЕМЕННОГО ФОНДА КАРТОФЕЛЯ]
|
| 2015 |
CONSERVATIVE FULCRUM FOR EVOLUTION PROGRESS
K.V. Gunbin, V.V. Suslov, M.A. Genaev, E.G. Komyshev
[IV МЕЖДУНАРОДНАЯ Конференция, посвященная Н.В.Тимофееву-Ресовскому “Современные проблемы генетики, радиобиологии, радиоэкологии и эволюции]
|
|
SeedCounter – mobile application for grain phenotyping
Комышев Е.Г., Генаев М.А, Афонников Д.А.
[Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk]
|
| 2014 |
Генетическое разнообразие опушения листа мягкой пшеницы: описание методом высокопроизводительного фенотипирования
Дорошков А.В., Генаев М.А., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[VI Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров и ассоциированные генетические симпозиумы]
|
| 2013 |
Generation of web services – the unification of access to bioinformatics resources
Комышев Евгений Геннадьевич
[Пятая международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика» - 5th International Young Scientists School «Systems Biology and Bioinformatics», SBB’2013]
|
|
Компьютерная технология фенотипирования пшеницы.
Афонников Д.А., Дорошков А.В., Генаев М.А., Пшеничникова Т.А., Тарасова И.А., Морозова Е.В. , Симонов А.В.
[Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 19-22 марта 2013]
|
|
Разработка системы создания web-сервисов и конвейеров для унифицированного доступа к ресурсам в области биоинформатики
Комышев Евгений Геннадьевич
[мнск 2013 г. новосибирск]
|
| 2012 |
BioinfoWF -- WEB SERVICES AND WEB INTERFACES GENERATOR FOR BIOINFORMATICS ANALYSIS
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Гунбин Константин Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
[Школа молодых ученых "Биоинформатика и системная биология"]
|
|
Computer approaches ti wheat high-throughput phenotyping
Afonnikov D., Genaev M., Doroshkov A., Denisyuk V., Morozova E., Simonov A., Pshenichnikova T.
[The 2nd International Conference "Plant Genetics Genomics and Biotechnology"]
|
|
PEFF DB: the web-available database of Protein Evolutional and Functional Features
K.V. Gunbin, M.A. Genaev, D.A. Afonnikov
[III Moscow Conference «Molecular Phylogenetics» (MolPhy-3)]
|
|
РЕАЛИЗАЦИЯ ПОДСИСТЕМЫ ГЕНЕРАЦИИ WEB-СЕРВИСОВ ДЛЯ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫХ МОДУЛЕЙ СИСТЕМЫ BioInfoWF
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович
[мнск 2012 г. новосибирск]
|
| 2011 |
Analysis of leaf hairiness morphology wheat: computational approaches using image processing technique.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova, D.A. Afonnikov.
[The International Conference “Wheat Genetics Resources and Genomics”.]
|
|
BioinfoWF — workflow management system for bioinformatics analysis.
Genaev M.A., Afonnikov D.A., Gunbin K.V.
[Третья школа молодых ученых «Биоинформатика и системная биология»]
|
|
Hight througput phenotyping approach to analysis of the leaf hairiness in wheat.
D.A. Afonnikov, A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova.
[The International Conference “Wheat Genetics Resources and Genomics”.]
|
| 2010 |
Analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L. using the high throughput phenotyping approach.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A. Pshenichnikova, D.A. Afonnikov
[The International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”]
|
|
BioinfoWF - веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики
Генаев М.А., Гунбин К.В., Афонников Д.А.
[Электронные библиотеки: перспективные методы и технологии, электронные коллекции. RCDL’2010]
|
|
BioinfoWF – веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики
Genaev M.A.
[The Young Scientists School "Bioinformatics and system biology"]
|
|
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes of protein families: relation of molecular evolution with the phenotypical features of organisms
Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[14-th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles]
|
|
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes of protein-coding genes: relation of molecular evolution with the phenotypical features of organisms
Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Genaev M.A., Kolchanov N.A.
[2nd Moscow International Сonference "Molecular phylogenetics" (MolPhy-2)]
|
|
Method and Software Tools for Gene Networks Evolution Research
Timonov V.S., Gunbin K.V., Turnaev I.I., Genaev M.A., Kolchanov N.A.
[14-th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles]
|
|
Using a computer-base image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Trticum aestivum L.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova, D.A. Afonnikov.
[The 7th International Conference on Bioinformatics of Genome regulation and Structure.]
|
|
WheatDB - база данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск]
|
|
WheatPGE - компьютерная система анализа взаимосвязи признаков фенотипа генотипа и окружающей среды у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[Электронные библиотеки:перспективные методы и технологии, электронные коллекции. XII Всероссийская научная конференция RCDL'2010. Казань]
|
|
WheatPGE : a system for analysis of phenotypic, genotypic and environmental relationships in wheat
Genaev M.A.
[XVI Biotechnology Summer School, Gdansk, Poland, 11 - 17 July 2010]
|
|
WheatPGE — система анализа взаимосвязей фенотип-генотип-окружающая среда у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[Молодежный научный форум "ЛОМОНОСОВ - 2010" г. Москва]
|
|
Анализ морфологии опушения листа у пшеницы: компьютерный подход с использованием анализа изображений
Афонников Д.А. Дорошков А.В., Генаев М.А.
[Российско-Французского семинар "Геномика, биоинформатика и моделирование в науках о жизни", 18-21 июня 2010]
|
|
Визуализация схем скрещивания пшеницы в рамках разработки системы WheatDB
Генев М.А. Дорошков А.В.
[XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.]
|
|
Исследование опушения листа пшеницы Triticum aestivum L. с помошью высокоэффективных методов фенотипирования
Дорoшков А.В., Генаев М.А., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.]
|
|
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков
Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А.
[1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии"]
|
|
Методы компьютерного анализа в исследовании опушения листа пшеницы TRITICUM AESTIVUM L.
Дорошков А.В., Генаев М.А., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск]
|
| 2008 |
Создание графовой базы данных и реализация основных типов запросов к ней
Генаев М.А.
[XLVI Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-46) г.Новосибирск 26 – 30 апреля 2008 г.]
|
| 2007 |
Визуализатор вырожденных олигонуклеотидных мотивов
Генаев М.А.
[XLV международная научная студенческая конференция: Студент и научно-технический прогресс, Новосибирск 10-12 апреля 2007г.]
|
Гранты
| 2016 |
Разработка компьютерных методов высокопроизводительного фенотипирования злаков на основе анализа изображений и их интеграция с информационной системой поддержки селекционно-генетических исследований
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович
|
|
Вариабельность VRN1 генов и эволюция признака яровость-озимость у тетраплоидных пшениц и эгилопсов
Вавилова Валерия Юрьевна, Генаев Михаил Александрович, Конопацкая Ирина Дмитриевна, Трапезникова Мария Сергеевна
|
| 2013 |
Разработка программного комплекса для анализа влияния SNP на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний
Колчанов Николай Александрович, Подколодный Николай Леонтьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Брызгалов Леонид Олегович, Рассказов Дмитрий Александрович, Васькин Юрий Юрьевич, Данилова Юлия
|
| 2012 |
Междисциплинарный интеграционный проект «Математические модели, числен-ные методы и параллельные алго-ритмы для решения больших задач СО РАН и их реализация на мно-гопроцессорных СуперЭВМ»
Подколодный Николай Леонтьевич Колчанов Николай Александрович Фомин Эдуард Станиславович Алемасов Николай Александрович Казанцев Федор Владимирович Афонников Дмитрий Аркадьевич Гунбин Константин Владимирович Генаев Михаил Александрович Вишневский Олег Владимирович
|
|
Междисциплинарный интеграционный проект «Методы параллельной обработки данных и моделирование на распределенных вычислительных системах»
Подколодный Николай Леонтьевич, Колчанов Николай Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Генаев Михаил Александрович, Гунбин Константин Владимирович, Казанцев Федор Владимирович, Рассказов Дмитрий Александрович
|
| 2011 |
Проектирование и разработка RESTful-веб-сервисов для создания распределенной инфраструктуры, ориентированной на решения задач реконструкции и анализа генных сетей
Н.А. Колчанов, Н.Л. Подколодный, В.С. Тимонов, И.Р. Акбердин, Е.А. Ананько, М.А. Генаев, Е.В. Игнатьева, Ф.В. Казанцев, Н.Н. Подколодная, О.А. Подколодная, Д.А. Рассказов, А.В. Семенычев
|
| 2009 |
Структура и свойства молекулярных органических кристаллов в условиях высоких давлений и низких температур
Колчанов Николай Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Гунбин Константин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович, Суслов Валентин Владимирович, Медведев Кирилл Евгеньевич, Генаев Михаил Александрович
|
Научное руководство
| 2022 |
СИСТЕМА КОМПЬЮТЕРНОГО ЗРЕНИЯ ДЛЯ ОЦЕНКИ
КОЛИЧЕСТВЕННЫХ ХАРАКТЕРИСТИК ПОСЕВОВ ПШЕНИЦЫ
[Кожекин Михаил Викторович]
|
|
Оценка эффектов стимуляции аутофагии и стресса ЭПР на структурный гомеостаз клеток меланомы кожи мыши на основе анализа микроизображений методами компьютерного зрения
Таскаева Юлия Сергеевна, Генаев Михаил Александрович
[Гогаева Изабелла Сергеевна]
|
| 2021 |
Система компьютерного зрения для извлечения количественных характеристик проростков пшеницы
[Бусов Игорь Дмитриевич]
|
| 2018 |
Веб-приложение для программы подсчёта трихом у пшеницы
[Алина Можина]
|
|
Метод оценки цвета зерна по фотографии
Михаил Генаев, Дмитрий Афонников
[Смирнов Николай]
|
| 2012 |
Подсистема генерации web-сервисов для вычислительных модулей системы BioInfoWF
[Комышев Евгений Геннадьевич]
|
|
Программное средство для определения скелета растрового изображения с применением волнового алгоритма.
[Русакова Наталья]
|
| 2010 |
Создание системы визуализации статистических данных для фенотипических признаков растений
[Радошкевич Даниил Александрович]
|
|
Создание системы статистической обработки данных для анализа фенотипических признаков растений
[Котов Иван Анатольевич]
|
Учебные курсы
| 2018 |
Компьютерная транскриптомика
Землянская Елена Васильевна, Генаев Михаил Александрович
|
Патенты
| 2022 |
Пpoгpaммa для оценки количественных характеристик посевов пшеницы (OKXПП) / Software tool for estimating quantitative characteristics of wheat crops (WheatDetectionSystem)»
Кожекин М.В., Афонников Д. А., Генаев М. А., Коваль В.С.
|
| 2021 |
База данных генотипа и фенотипа диких видов картофеля (WildPetotaDB) / A database of the genotype and phenotype of wild potato species (WildPetotaDB)
Комышев Е.Г., Колошина К.А., Фомин И.В., Колосовская Е.В., Генаев М.А., Эрст Т.В., Егорова А.А., Чалая Н.А., Рогозина Е.В., Герасимова С.В.
|
| 2019 |
Программа для оценки количественных характеристик колоса пшеницы (ОКХК) / The program for the extraction the quantitative characheristics of the wheat spike (WERecognizer)
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
|
| 2017 |
Программа поиска вариабельности генов VRN1 у пшениц и эгилопсов (ВРН1-Вит-ЮИ) / Program for search VRN1 genes variability in wheat species and aegilops (VRN1-Wheat-UI)
Вавилова В. Ю., Генаев М.А., Конопацкая И. Д., Гончаров Н. П.
|
|
База данных вариабельности генов VRN1 у пшениц и эгилопсов (ВРН1-Wheat-ДБ) / Database VRN1 genes variability in wheat and aegilops species (VRN1-Wheat-DB)
Вавилова В. Ю., Генаев М.А., Конопацкая И. Д., Гончаров Н. П.
|
|
Система учета заданий по секвенированию ДНК (СЦ-ИЦиГ) / Accounting System for DNA sequencing tasks (SС-ICG)
Генаев Михаил Александрович, Комышев Евгений Геннадьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич
|
| 2016 |
Система визуализации синтенных блоков и сравнения геномных сборок (СиГраф)
Генаев М.А., Афонников Д.А.
|
|
Мобильное и настольное приложение для массового фенотипирования зерен пшеницы (СиидКаунтер)/Mobile and desktop application for mass phenotyping seeds of wheat (SeedCounter)
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
|
| 2014 |
Программа для автоматической оценки эффективности элонгации трансляции генов различных организмов (EloE) / Software tool for automatical estimation of genes elongation translation efficiency in various organisms (EloE)
В. С. Соколов, Б. С. Зураев, М. А. Генаев
|
| 2013 |
Система автоматической генерации веб-интерфейсов для конвейеров и вычислительных модулей для поддержки исследований в области биоинформатики (BioInfoWF)
Генаев Михаил Александрович, Гунбин Константин Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
|
|
Система генерации веб-сервисов и конвейеров для унифицированного доступа к ресурсам в области биоинформатики (BioUniWA)
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
|
| 2012 |
База данных генов крысы, ассоциированных с заболеваниями старения для исследований на микрочипах (РатДНК ДБ)/ Database of rat genes associated with senescence deceases for microarray research (RatDNA DB)
Орлов Юрий Львович, Мартыщенко Мария Кирилловна, Генаев Михаил Александрович, Кожевникова Оюна Суранзановна
|
|
База данных эволюционных и функциональных характеристик белков (ПЕФФ ДБ)/ Database of Protein Evolutional and Functional Features (PEFF DB)
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Генаев М.А.
|
|
Программа автоматического определения количественных характеристик опушения листа (ОЛДетект2) / Software tool for automatically determination of the quantitative characteristics of leaf hairiness in plants (LHDetect2)
Генаев Михаил Александрович, Дорошков Алексей Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Пшеничникова Татьяна Алексеевна
|
| 2010 |
База данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы (ВитПГЕ).
Генаев М.А., Дорошков А.В., Афонников Д.А.
|
| 2007 |
База данных: Транскрипционный Фактор-Ген Млекопитающих взаимодействия (ТФГМВ)/ Transcription Factor- Mammalian Gene Interactions (TFMGI)
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Игнатьева Е.В., Генаев М.А.
|
Диссертации
| 2013 |
РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ АВТОМАТИЧЕСКОГО ОПРЕДЕЛЕНИЯ КОЛИЧЕСТВЕННЫХ ХАРАКТЕРИСТИК ОПУШЕНИЯ ЛИСТА
[Кандидат]
|
|
|
