![]() |
![]() |
![]() |
Система учета научной деятельности (ASSA) |
![]() ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() |
Лаборатория молекулярных механизмов патологических процессов (т.05)Отделение генетики животных и человека
Научные результаты Сотрудники О Подразделении 1. Основное направление фундаментальных и фундаментально-ориентированных исследований
2. Задачи, решаемые в настоящее время в рамках базового бюджетного проекта VI.60.1.1. (молекулярные механизмы патологических процессов: роль описторхид в канцерогенезе), № гос. регистрации 01201280335. Руководитель д.б.н. Мордвинов В.А.
3. Прикладные разработки Рекомбинантная плазмидная днк pmaltev-legumain, кодирующая полипептид, обладающий антигенными свойствами белка легумаин Opisthorchis felineus, и штамм E.coli bl 21(de3)plyss-pmaltev-legumain - продуцент рекомбинантного полипептида, обладающего антигенными свойствами белка легумаин Opisthorchis felineus.
4. Иллюстрированное описание лучших результатов, полученных подразделением за последние 5 лет Для реконструкции митогеномов, выявления и описания генетического разнообразия описторхид был применен ПЦР-анализ с помощью разработанных наборов праймеров. Последовательности полностью просеквенированных митогеномов зарегистрированы в GenBank с номерами NC_011127 для O.felineus (Зап. Сибирь, НСО) и NC_012147 для C. sinensis (Хабаровский край). С помощью метода глубокого пиросеквенирования по технологии «454 Life Science» идентифицировано 45 однонуклеотидных полиморфизмов в митохондриальном геноме O.felineus из популяции на севере Новосибирской области (Рис.1). Рисунок 1. Однонуклеотидные полиморфизмы, обнаруженные в митогеноме O. felineus
Для реконструкции филогеографии вида O.felineus было изучено генетическое разнообразие по маркерам ITS1, cox1 и cox3 в популяциях из Западной и Восточной Сибири, Казахстана, Европейской Территории России. Характер распределения незначительной генетической гетерогенности между образцами не позволяет предположить наличие подвидов или какой-либо значимой внутривидовой структурированности на обширной территории ареала вида (Рис. 2). На основе анализа такого распределения выдвинуто предположение о недавнем взрывообразном распространении паразита. Рисунок 2. Медианные сети гаплотипов по маркерам ITS1, cox1 и cox3, построенные для трех условных метапопуляций O.felineus.
В целях более глубокого исследования генома и транскриптома O. felineus была проанализирована библиотека кДНК этого гельминта. Проведено концевое секвенирование для 2560 клонов (генерация ESTs) (номера в GenBank JK624271–JK626790, JK006511–JK006547 и JK649790–JK649792). Проведена функциональная аннотация в терминах Gene Onthology (GO) выведенных аминокислотных последовательностей для 283 контигов, сформированных из EST (Рис. 3). Рисунок 3. Распределение терминов классификации пептидов, выведенных из ESTs по терминам GO (А - молекулярная функция, Б - биологический процесс, В - клеточные компоненты).
С целью выявления механизмов формирования лекарственной устойчивости у паразитов семейства Opisthorchiidae была определена специфичность ферментативной активности CYP450 - представителя 1 фазы биотрансформации ксенобиотиков паразита O. felineus. Исследования функциональной активности in vivo и in situ показали, что CYP может участвовать в метаболизме экзогенных соединений, в частности субстратов, характерных для CYP2E1 (хлорзоксазон) и CYP2B (пентоксирезоруфин). Активность CYP почти полностью ингибировалась кетоконазолом (Рис. 4), известным ингибитором микросомальных цитохромов, что свидетельствует о консервативном строении фермента. Получены предварительные данные по спектру метаболитов антипаразитарных препаратов (альбендазола) методом высокоэффективной хроматографии при инкубации O. felineus ex vivo, что в дальнейшем позволит выявить ключевые этапы биотрансформации препаратов внутри O. felineus. Рисунок 4. Исследование in situ функциональной активности CYP. В рамках выполнения проекта опробованы различные экспериментальные модели описторхидозов, в частности описторхоза, вызванного O. felineus, с использованием лабораторных животных (хомячки вида Mesocricetus auratus, лабораторные мыши линии Severe Combined Immunodeficiency (SCID)).
По результатам гистологического анализа печени показано, что у хомячков вида M. auratus, зараженных O. felineus в дозе 50 метацеркарий, начиная с 5 недели заражения появляются воспалительные изменения печени и утолщение стенок желчных протоков за счет перидуктального фиброза, с 10 недели заражения появляются полипозные разрастания эпителия, которые полностью или частично обтурируют просвет желчных протоков (Рис. 5). В группе животных, подвергшихся сочетанному воздействию диметилнитрозамина и O. felineus, индуцируется формирование злокачественных опухолей желчевыводящих путей. Рисунок 5. Полипы в просвете желчного протока. Окраска г – э. Ув. 100. OF - группа животных, зараженных O. felineus; ДМН + OF - группа животных с сочетанным воздействием диметилнитрозамина и O. felineus.
5. Задачи, планируемые на перспективу
Августинович Дамира Фуатовна [ведущий научный сотрудник] Бикеев Наиль Рафикович [лаборант] Голубева Надежда Михайловна [старший лаборант] Губанова Наталья Владимировна [научный сотрудник] Запарина Оксана [научный сотрудник] Киселева Евгения Валерьевна [лаборант] Ковнер Анна Владимировна [научный сотрудник] Красовская Галина Михайловна [старший лаборант] Львова Мария Николаевна [научный сотрудник] Медведева Екатерина Вячеславовна [инженер] Минькова Галина Александровна [инженер] Пономарев Дмитрий Владимирович [младший научный сотрудник] Пономарёв Денис Васильевич [младший научный сотрудник] Романюкова Вероника Сергеевна [лаборант] Сивков Антон Юрьевич [ведущий инженер] Фукс Элина Станиславовна [лаборант] Шилов Александр Геннадьевич [ведущий инженер] Бывшие сотрудникиАнтонов Виктор ВасильевичБагинская Нина Владиславовна Брусенцова Ирина Витальевна Вавилин Валентин Андреевич Вишнивецкая Галина Борисовна Захарова Нина Семеновна Кашина Елена Валентиновна Кизименко Алена Валерьевна Ковалева Евгения Руслановна Лантух Владимир Анатольевич Малых Ирина Михайловна Маренина Мария Константиновна Мордвинов Вячеслав Алексеевич Нигматуллина Александра Рауфовна Овчинников Владимир Юрьевич Пеньковская Юлия Анатольевна Первунин Даниил Игоревич Помазной Михаил Юрьевич Пономарева Евгения Павловна Савина Екатерина Сергеевна Таможников Сергей Сергеевич Татьков Сергей Иванович Тумашев Ростислав Андреевич Шаманина Марина Юрьевна СовместителиКапущак Ярослав Кириллович [старший лаборант]Локтев Валерий Борисович [ведущий научный сотрудник] Сербина Елена Анатольевна [инженер] Скорицкая Ольга Генриховна [старший лаборант] Цыганов Михаил [инженер] Щелкунов Сергей Николаевич [ведущий научный сотрудник] Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода: 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 Публикации
|
2011 | Human induced pluripotent stem cells derived from fetal neural stem cells successfully undergo directed differentiation into cartilage Medvedev S.P., Grigor’eva E.V., Shevchenko A.I., Malakhova A.A., Dementyeva E.V., Shilov A.A., Pokushalov E.A., Zaidman A.M., Aleksandrova M.A., Plotnikov E.Yu., Sukhikh G.T., Zakian S.M. STEM CELLS DEV, 2011, V. 20. № 6. P. 1099-1112. ![]() |
2010 | Исследование транскрипционно активных генов печеночного сосальщика Opisthorchis felineus Помазной М.Ю., Татьков С.И. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Т. 275. С. 387-390. ![]() |
Нестабильность хромосомного состава культивируемых in vitro плюрипотентных клеток мыши Минина Ю. М., Жданова Н. С, Шилов А. Г., Толкунова Е. Н., Лисковых М. А., Томилин А. Н. Cell and Tissue Biology, 2010, 5, 52, 420-425 ![]() |
|
Обнаружение в Новосибирской области среди штаммов M. tuberculosis генотипов, ассоциированных с множественной лекарственной устойчивостью Сивков А.Ю., Татьков С.И., Мордвинов В.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Т. 275. С. 399-401. ![]() |
|
Получение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток из фибробластов кожи плода человека Медведев С.П., Малахова А.А., Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Дементьева Е.В., Соболев И.А., Лебедев И.Н., Шилов А.Г., Жимулев И.Ф., Закиян С.М. Acta Naturae, 2010, № 2(5), Т. 2, С. 108-110 ![]() |
|
Сравнительный анализ кариотипов Opisthorchis felineus из Западной Сибири Поляков А.В., Катохин А.В., Бочарова Т.А., Романов К.В., Львова М.Н., Бонина О.М., Юрлова Н.И., Мордвинов В.А. Cибирский экологический журнал, 2010, Т. 1. С. 3-6. ![]() |
|
Effect of double-stranded DNA on maturation of dendritic cells in vitro Alyamkina EA, Leplina OY, Sakhno LV, Chernykh ER, Ostanin AA, Efremov YR, Shilov AG, Proskurina AS, Orishchenko KE, Dolgova EV, Rogachev VA, Nikolin VP, Popova NA, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA CELL IMMUNOL, 2010, 266: 46-51 ![]() |
|
2009 | Promoters of the Genes Encoding the Transcription Factors Regulating the Cytokine Gene Expression in Macrophages Contain Putative Binding Sites for Aryl Hydrocarbon Receptor D. P. Furman, E.A. Oshchepkova, D.Yu. Oshchepkov, M.Yu. Shamanina, V.A. Mordvinov COMPUT BIOL CHEM, 2009, V. 33. №6. P. 465-468. ![]() |
Выявление новых DRE в регуляторной области генов человека, кодирующих компоненты цитозольного комплекса арил-гидрокарбонового рецептора Д.Ю. Ощепков, Д.П. Фурман, Е.А. Ощепкова, А.В. Катохин, М.Ю. Шаманина, В.А. Мордвинов Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т.13. № 1. С. 46-52. ![]() |
|
2008 | Оценка генетических отличий Opisthorchis felineus от Opisthorchis viverrini и Clonorchis sinensis по ITS2- и CO1-последовательностям Катохин А.В., Шеховцов С.В., Konkow S., Юрлова Н.И., Сербина Е.А., Водяницкая С.Н., Федоров К.П., Локтев В.Б., Муратов И.В., Ohyama F., Махнева Т.В., Пельтек С.Е., Мордвинов В.А. Doklady Akademii Nauk, 2008, Т. 421. № 4. С.549-552 ![]() |
Regulatory region of human genes encoding macrophageal transcription factors possess multiple potential dioxin response elements Oshchepkova EA, Furman DP Oshchepkov DY, Katokhin AV, Shamanina MY, Mordvinov VA, Tsyrlov IB Organohalogen Compounds, 2008, V. 70. P. 001467-001470. ![]() |
|
Анализ структуры инсулин-зависимых регуляторных контуров зрелых адипоцитов Кузнецова Т.Н., Е.В. Игнатьева, В.А. Мордвинов, А.В. Катохин, М.Ю. Шаманина, Д.Ю. Ощепков, Н.А. Колчанов Успехи физиологических наук, 2008, Т. 39. №1. С. 3-22. ![]() |
|
Ген SuUR - уникальный инструмент для изучения структуры и организации хромосом и генома дрозофилы Жимулёв И.Ф., Беляева Е.С., Андреенкова Н.Г., Андреева Е.Н., Белякин С.Н., Болдырева Л.В., Брусенцова И. В., Волкова Е.И., Демаков С.А., Демакова О.В., Заруцкая Е.А., Зыков И. А., Кокоза Е.Б., Колесникова Т.Д., Комор У.А., Коряков Д.Е., Макунин И.В., Пинд Информационный вестник ВОГИС, 2008, Т.12, N 1/2, c. 127-149 ![]() |
|
2007 | Метод полимеразной цепной реакции с детекцией в реальном времени и возможности его применения в клинической практике Шаманина М.Ю., Вавилин В.А., Мордвинов В.А., Катохин А.В., Кузнецова Т.Н., Ляхович В.В. Вестник РАМН, 2007, 2007. № 7. С. 37–46. ![]() |
Detection of new potentially active DRE sites in regulatory region of human genes encoding components of Ah receptor cytosolic complex Nedosekina EA, Oshchepkov DY, Katokhin AV, Kuznetsova TN, Shamanina MY, Mordvinov VA, Tsyrlov I Organohalogen Compounds, 2007, V. 69. P. 1889-1892. ![]() |
|
2006 | The Drosophila dosage compensation complex binds to polytene chromosomes independently of developmental changes in transcription Irina V Kotlikova, Olga V Demakova, Valery F Semeshin, Victor V Shloma, Lidiya V Boldyreva, Mitzi I Kuroda, and Igor F Zhimulev GENETICS, 2006, 172(2): 963-974 ![]() |
Генные сети липидного метаболизма Колчанов Н.А., Воевода М.И., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Игнатьева Е.В. Бюллетень СО РАМН, 2006, N2 (120), стр. 29-42. ![]() |




![]() |
© 2010-2025 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены. | ![]() |