1.      Основное направление исследований

 Исследование механизмов, контролирующих устойчивость растений к стрессам. Разработка методов создания растений с заданными технологическими свойствами с помощью подходов системной биологии и генной инженерии. Изучение структурно-функциональной организации генов растений и механизмов контроля экспрессии на посттранскрипционном уровне. Разработка компьютерных методов для предсказания кодирующего потенциала генов эукариот и оптимизации экспрессии трансгенов в растениях.

 Задачи, решаемые в рамках основного направления на данном этапе:

1. Изучение молекулярных механизмов устойчивости растений к фитопатогенам (на модели трансгенных растений). Разработка способов получения растений с увеличенной устойчивостью к фитопатогенам с помощью методов генной инженерии. Объекты исследований: Nicotiana tabacum, Solanum tuberosum, Phytophthora infestans, Phytophthora parasitica, вирус табачной мозаики, вирусы картофеля А, Y, вироид картофеля.
2. Изучение молекулярных механизмов, контролирующих устойчивость растений к абиотическим стрессам на модели трансгенных растений. Разработка способов получения растений с увеличенной засухо- и холодоустойчивостью с помощью методов генной инженерии. Объекты исследований: Nicotiana tabacum, Solanum tuberosum, Zea mays.
3. Контроль экспрессии генов эукариот в условиях стресса на транскрипционном и посттранскрипционном уровнях. Разработка методов оптимизации экспрессии генетических конструкций в растениях с помощью методов биоинформатики и компьютерного анализа. Исследование полного кодирующего потенциала генов эукариот с помощью методов компьютерной геномики и протеомики.

2.      Аннотация базового бюджетного проекта подразделения

Бюджетный проект VI.53.1.3. «Генетический контроль механизмов несовместимости между растениями разных таксонов и их адаптации к неблагоприятным условиям среды» (координатор проекта: д.б.н. проф. Л. А. Першина). В рамках проекта запланировано проведение комплексных экспериментальных исследований, направленных на изучение генетического контроля механизмов несовместимости между растениями, принадлежащими разным таксонам, и генетического контроля признаков, определяющих адаптивность растений к условиям среды.

Лаборатория генной инженерии отвечает за блок 5 бюджетного проекта: «Исследование генных сетей, контролирующих адаптацию к биотическим и абиотическим стрессам на разных стадиях развития растений, с помощью методов генной инженерии и трансгенеза»

3.      Прикладные разработки.

В лаборатории разработаны способы получения сортов растений с увеличенной устойчивостью к вирусам и абиотическим стрессам (на которые получены патенты и авторские свидетельства), основанных на подходах генной инженерии. Поскольку применение ГМО в практике сельского хозяйства РФ имеет ряд существенных ограничений, использование этих методов в практике пока не проводится.

4.      Иллюстрированное описание лучших результатов, полученных подразделением за последние 5 лет. Общий объем текста на одну лабораторию (сектор) – не более 4000 знаков с пробелами, количество иллюстраций: от одной до трех – пяти рисунков с подписями. Рекомендуется, что общий объем текста с иллюстрациями должен занимать не более 5 страниц в формате Word (для текста шрифт Times New Roman, фонт № 12, через 1 интервал).

4.1. Найдено, что триплеты в составе молекулы РНК имеют различные физико-химические характеристики, что может быть связано с их функциональной активностью и с возникновением служебных кодонов в составе генетического кода на ранних этапах эволюции жизни.

Обнаружено, что одна из характеристика молекулы РНК «размер поверхности молекулы РНК, доступной для взаимодействия с другими молекулами» (Accessible Surface Area, ASA), зависит от контекста (комбинации нуклеотидов) (рис. 1). Показано, что триплет AUG характеризуется высоким значением этого параметра, что могло служить одной из причин выбора этого триплета в качестве стартового кодона трансляции на ранних этапах эволюции. Кроме этого, высоким значением ASA характеризуется стоп-кодон UGA, а также триплеты в составе сайта Шайна-Дальгарно. Выдвинута гипотеза о том, что величина ASA, отражающая реакционноспособность участка РНК, могла служить одним из факторов, повлиявших на выбор триплетов AUG и UGA в качестве служебных кодонов (работа выполнена совместно с группой Dr. S. Ahmad, National Institute of Biomedical Innovation, Osaka, Japan).

Рисунок 1. Среднее значение ASA для триплетов в составе молекул РНК (также приведено стандартное отклонение) (Singh et al., 2010).

4.2. Обнаружено, что в эукариотических мРНК могут содержаться эволюционно-консервативные альтернативные сайты инициации трансляции и такие мРНК могут дополнительно кодировать новые изоформы белка, различающиеся по размеру N-концевого домена.

Долгое время считалось, что мРНК генов эукариот содержат одну рамку считывания и один стартовый кодон трансляции и возможность кодирования нескольких белков одной мРНК не принималась во внимание. Однако, в последнее время эта ситуация пересматривается, поскольку были получены доказательства частого присутствия альтернативных стартовых кодонов. В частности, нами был проведен компьютерный анализ структурно-функциональной организации эукариотических мРНК, который показал положительную взаимосвязь между эффективностью сигнала инициации трансляции (оптимальностью или субоптимальностью нуклеотидного контекста) и присутствием эволюционно-консервативных альтернативных стартовых кодонов в начале CDS (Bazykin and Kochetov, 2011). Эти данные доказывают функциональную значимость альтернативных сайтов инициации трансляции. (эта работа выполнена совместно с группой Егора Базыкина, Институт проблем передачи информации РАН г. Москва).

Рисунок 2. В таблице показана число эволюционно-консервативных AUG кодонов, присутствующих в начале открытых рамок считывания в мРНК генов позвоночных животных, насекомых и дрожжей (со второго по пятый, десятый, двадцатый и сотый кодоны). На рисунке показана доля эволюционной консервативных альтернативных стартовых кодонов в начале открытых рамок считывания в мРНК человека (со второго по 45 кодон). Можно видеть, что субоптимальный контекст стартового кодона (YnnAUG) сопровождается значительно более высоким уровнем эволюционной консервативности нижерасположенных кодонов AUG, что подтверждает гипотезу об их функциональной значимости.

4.3. Показано, что биологическая роль гена орнитинаминотрансферазы (ОАТ) связана с поддержанием пула свободных аминокислот в норме и при стрессе (особенно в меристемах и быстрорастущих тканях стебля и корня).

ОАТ конвертирует орнитин в пирролин-5-карбоксилат, который может далее переходить в пролин или глутамат. Роль ОАТ не была понятна, так как синтез пролина из орнитина мог представлять собой один из механизмов контроля осмотического давления в клетках растений в ответ на абиотические стрессы. Анализ активности промотора гена ОАТ арабидопсиса показал, что ОАТ экспрессируется на ранних этапах развития проростка и активируется ауксином; при появлении в среде источников неорганического азота происходит индукция экспрессии ОАТ в листьях и в кончиках новообразующихся боковых корней. Это говорит об участии этого фермента в конверсии запасных форм азота (аргинина, орнитина) в глутамат (рис. 3).

Рисунок 3. Схема, демонстрирующая активность промотора гена орнитинаминотрансферазы на ранних стадиях развития проростка (А), при индукции ауксином (Б) и при добавлении в среду источников азота (В).

4.4. Показано, что экстраклеточные РНКазы растительного происхождения могут участвовать в ответе на вирусные инфекции.

Создана новая генетическая модель – линии трансгенных растений Nicotiana tabacum, характеризующиеся либо сниженным уровнем собственной экстраклеточной S-подобной РНКазы Nk1, либо увеличенным уровнем S-подобной РНКазы (ген выделен из Zinnia elegans). Обнаружено, что супрессия гена Nk1 не приводит к изменениям в морфологии и сроках развития трансгенных растений, а увеличенная продукция рибонуклеазы приводит к повышению устойчивости растений к РНК-вирусам разных групп (вирусу табачной мозаики и ожога гречихи).

Рисунок 4. На форезе приведен спектр белков с рибонуклеазной активностью в экстрактах из листьев линий трансгенных растений с супрессированной активностью S-подобной РНКазы (Nk1), нетрансгенных растений и линии с увеличенной активностью S-подобной РНКазы Zinnia elegans (ZnRNase II). Приведены фотографии растений (не зафиксировано изменение морфологических характеристик), а также данные по накоплению антигена вируса табачной мозаики на 7, 14 и 21 дни после инокуляции в контроле (SR1) и линиях растений с высоким уровнем нуклеазной активности (RNS1,5,10).

5.      Задачи, планируемые на перспективу: формулировки должны содержать как фундаментальные научные задачи, так и возможную прикладную направленность исследований в подразделении.

• Реконструкция генных сетей стрессового ответа у растений на основе данных высокопроизводительных протеомных и транскриптомных экспериментов.
• Молекулярно-биологические механизмы, контролирующие паттерны экспрессии генов высших растений (и других эукариот) в условиях стресса.
• Поиск новых регуляторных белков и пептидов, контролирующих развитие и физиологические процессы у растений и других эукариот.
• Разработка способов увеличения устойчивости растений к бактериальному раку (прикладное направление).

Бывшие сотрудники

Совместители

Публикации

2023	Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia Dmitry I. Karetnikov, Gennady V. Vasiliev, Stepan V. Toshchakov, Nikolay A. Shmakov, Mikhail A. Genaev, Mikhail A. Nesterov, Salmaz M. Ibragimova, Daniil A. Rybakov, Tatjana A. Gavrilenko, Elena A. Salina, Maxim V. Patrushev, Alex V. Kochetov and Dmitry A. Afonnikov INT J MOL SCI, 2023, v. 24, p. 5713
	Аномальная активность сигнального пути mTOR в расстройствах аутистического спектра: возможности механизмобоснованной терапии Трифонова Екатерина Александровна Котлярова Анастасия Анатольевна Кочетов Алексей Владимирович Молекулярная биология, 2023, том 57, № 2
	Abnormal mTOR Signaling Pathway Activity in Autism Spectrum Disorders: Prospects of Mechanism-Based Therapy E. A. Trifonova А. А. Kotliarova A. V. Kochetov Molecular Biology, 2023, vol. 57, no. 2
2022	Abnormal mTOR Activity in Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric and MIA-Associated Autism Spectrum Disorders Ekaterina A. Trifonova, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov INT J MOL SCI, 2022, 23, 967
	Investigation of cytotoxic and antioxidative activity of 1,2,3‑triazolyl‑modifed furocoumarins and 2,3‑dihydrofurocoumarins Artemii A. Ivanov, Egor A. Ukladov, Stepan A. Kremis, Sodbo Z. Sharapov, Sergey I. Baiborodin, Alla V. Lipeeva, Elvira E. Shults, Tatiana S. Golubeva PROTOPLASMA, 2022
	De Novo Domestication Concept for Potato Germplasm Enhancement Anastasiya A. Egorova, Nadezhda A. Chalaya, Ivan N. Fomin, Alisa I. Barchuk, Sophia V. Gerasimova Agronomy, 2022
	Variability of leaf pubescence characteristics in transgenic tobacco lines with partial proline dehydrogenase gene suppression. S.M. Ibragimova, M.A. Genaev, A.V. Kochetov, D.A. Afonnikov BIOL PLANTARUM, 2022, 66:24-28
	Фитоценотическая приуроченность Fragaria moschata Weston. (Rosaceae) в Приенисейских Саянах Батурин С.О., Степанов Н.В., Филипенко Е.А. Сибирский экологический журнал, 2022, № 3, С. 350-363.
	A protocol for recruiting and analyzing the disease-oriented Russian disc degeneration study (RuDDS) biobank for functional omics studies of lumbar disc degeneration Olga N. Leonova, Elizaveta E. Elgaeva, Tatiana S. Golubeva, Alexey V. Peleganchuk, Aleksandr V. Krutko, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov PloS One, 2022
	Stabilization of Octahedral Metal Halide Clusters by Host–Guest Complexation with γ-Cyclodextrin: Toward Nontoxic Luminescent Compounds Anton A. Ivanov, Mohamed Haouas, Darya V. Evtushok, Tatiana N. Pozmogova, Tatiana S. Golubeva, Yann Molard, Stéphane Cordier, Clément Falaise, Emmanuel Cadot, and Michael A. Shestopalov* INORG CHEM, 2022
	Molecular and Genetic Aspects of Potato Response to Late Blight Infection T. S. Golubeva, V. A. Cherenko, O. I. Sinitsyna, A. V. Kochetov RUSS J GENET+, 2022
	Anti-Inflammatory Activity of Soluble Epoxide Hydrolase Inhibitors Based on Selenoureas Bearing an Adamantane Moiety Vladimir Burmistrov, Christophe Morisseau, Denis Babkov, Tatiana Golubeva, Dmitry Pitushkin, Elena Sokolova, Vladimir Vasipov, Yaroslav Kuznetsov, Sergey Bazhenov, Uliana Novoyatlova, Nikolay Bondarev, Ilya Manukhov, Victoria Osipova, Nadezhda Berberova, Alexander Spasov, Gennady Butov, Bruce Hammock INT J MOL SCI, 2022
	Seedling Biometry of nud Knockout and win1 Knockout Barley Lines under Ionizing Radiation Antonova E.V., Shimalina N.S., Korotkova A.M., Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Khlestkina E.K. Plants, 2022, 11, no. 19: 2474
	Method for the Isolation of “RNA-seq-Quality” RNA from Human Intervertebral Discs after Mortar And Pestle Homogenization Artemii A. Ivanov, Olga N. Leonova, Daniil S. Wiebe, Alexsandr V. Krutko, Mariya M. Gridina, Veniamin S. Fishman, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov, Tatiana S. Golubeva Cells, 2022
	Reference genes for qPCR-based miRNA expression profiling in 14 human tissues Veryaskina YA, Titov SE, Zhimulev IF MED PRIN PRACT, 2022
	The profile of microRNA expression in bone marrow in non-Hodgkin’s lymphomas Veryaskina YuA, Titov SE, Kovynev IB, Pospelova TI, Zhimulev IF Diagnostics, 2022
	Selection of reference genes for quantitative analysis of microRNA expression in three different types of cancer Veryaskina YuA, Titov SE, Ivanov MK, Ruzankin PS, Tarasenko AS, Shevchenko SP, Kovynev IB, Stupak EV, Pospelova TI, Zhimulev IF PloS One, 2022
	Developmental and hormonal regulation of Arabidopsis thaliana ornithine-delta-aminotransferase A.A. Egorova, S.V. Gerasimova, A.V. Kochetov Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, Mar;26(2):153-158
2021	Recent Advances in the Development of Exogenous dsRNA for the Induction of RNA Interference in Cancer Therapy Tatiana S. Golubeva, Viktoria A. Cherenko, Konstantin E. Orishchenko MOLECULES, 2021
	ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ УСТОЙЧИВОСТИ КАРТОФЕЛЯ К ФИТОФТОРОЗУ Т. С. Фролова, В. А. Черенко, О. И. Синицына, А. В. Кочетов Vavilov journal of genetics and breeding, 2021
	A previously unknown way of heme detoxification in the digestive tract of cats Alexandr B. Duzhak, Petr S. Sherin, Vadim V. Yanshole4, Sergey L. Veber, Sergey I. Baiborodin, Olga I. Sinitsyna & Yuri P. Tsentalovich SCI REP-UK, 2021, 11:8290
	Electrosynthesis of Stable Betulin‐Derived Nitrile Oxides and their Application in Synthesis of Cytostatic Lupane‐Type Triterpenoid‐Isoxazole Conjugates Jevgeņija Lugiņina, Martin Linden, Māris Bazulis, Viktors Kumpiņš, Anatoly Mishnev, Sergey A. Popov, Tatiana S. Golubeva, Siegfried R. Waldvogel, Elvira E. Shults, Māris Turks EUR J ORG CHEM, 2021
	New model systems for RNA interference in plants to develop eco-friendly and effective antipathogenic tools A. V. Urin, T. S. Golubeva IOP Conf. Ser.: Earth Env. Sci., 2021
	Silencing of Nicotiana benthamiana phytoendesaturase using dsRNA synthesized in vivo V. A. Cherenko, E. A. Filipenko and T. S. Golubeva IOP Conf. Ser.: Earth Env. Sci., 2021
	The identification of a new gene for leaf pubescence introgressed into bread wheat from Triticum timopheevii Zhuk. and its manifestation in a different genotypic background Симонов Александр Владимирович Смирнова Ольга Григорьевна Генаев Михаил Александрович Пшеничникова Татьяна Алексеевна Plant Genetic Resources, 2021, https://www.cambridge.org/core/journals/plant-genetic-resources/article/identification-of-a-new-gene-for-leaf-pubescence-introgressed-into-bread-wheat-from-triticum-timopheevii-zhuk-and-its-manifestation-in-a-different-genotypic-background/53B7CC3DCB46945
	Do Autism Spectrum and Autoimmune Disorders Share Predisposition Gene Signature Due to mTOR Signaling Pathway Controlling Expression? Ekaterina A. Trifonova, Alexandra I. Klimenko, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov INT J MOL SCI, 2021, 22(10), 5248
	Рибосомное профилирование как инструмент исследования трансляции у растений: основные итоги, проблемы и перспективы Афонников, Д. А., Синицына, О. И., Голубева, Т. С., Шмаков, Н. А., Кочетов, А. В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, № 3, Т. 25, С. 251-259
	Using wild strawberry of the Sakha (Yakutia) Republic in breeding garden strawberry (Fragaria × ananassa Duch.) Baturin S., Belevtsova V. BIO Web of Conferences, 2021, Volume 38, № 00012
	NLR Genes Related Transcript Sets in Potato Cultivars Bearing Genetic Material of Wild Mexican Solanum Species Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Antonova O.Y., Shatskaya N.V., Glagoleva A.Y., Ibragimova S.M., Khiutti A., Afanasenko O.S., Gavrilenko T.A. Agronomy, 2021, v. 11, P. 2426
	Phytophthora infestans: An Overview of Methods and Attempts to Combat Late Blight Artemii A. Ivanov, Egor O. Ukladov, Tatiana S. Golubeva J Fungi, 2021
	Synthesis and Cytotoxicity of Sulfanyl, Sulfinyl and Sulfonyl Group Containing Ursane Conjugates with 1,3,4-Oxadiazoles and 1,2,4-Triazoles Semenova M. D., Popov S. A., Golubeva T. S., Baev D. S., Shults E. E., Turks M. ChemistrySelect, 2021
	Regions of chromosome 2A of bread wheat (Triticum aestivum L.) associated with variation in physiological and agronomical traits under contrasting water regimes Pshenichnikova T.A., Osipova S.V., Smirnova O.G., Leonova I.N., Permyakova M.D., Permyakov A.V., Rudikovskaya E.G., Konstantinov D.K., Verkhoturov, V.V., Lohwasser, U., Börner A. Plants, 2021
	Взаимосвязь между генетическим статусом локуса Vrn-1 и размерами корневой системы у мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.) Смирнова О.Г., Пшеничникова Т.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(8). C.805-811
	Preoperative typing of thyroid and parathyroid tumors with a combined molecular classifier. Titov SE, Kozorezova ES, Demenkov PS, Veryaskina YA, Kuznetsova IV, Vorobyev SL, Chernikov RA, Sleptsov IV, Timofeeva NI, Ivanov MK Cancers, 2021
	MicroRNAs in the Myelodysplastic Syndrome Y. A. Veryaskina, S. E. Titov, I. B. Kovynev, S. S. Fedorova, T. I. Pospelova, I. F. Zhimulev Acta Naturae, 2021
2020	Species of Fragaria L. (Rosaceae) genus of Central, Northern and Eastern Mongolia Baturin S., Tovuudorj N., Filipenko E., Tovuudorj R., Jigmed G. BIO Web of Conferences, 2020, Volume 24, № 00011, 7 p.
	Chromones and coumarins from Saposhnikovia divaricata (Turcz.) Schischk. Growing in Buryatia and Mongolia and their cytotoxicity B.M. Urbagarova, E.E. Shults, V.V. Taraskin, L.D. Radnaeva, T.N. Petrova, T.V. Rybalova, T.S. Frolova, A.G. Pokrovskii, Ja. Ganbaatar J ETHNOPHARMACOL, 2020
	On Functional Properties of Mg-Zn-X Biodegradable Magnesium Alloys Dmitry Merson, Alexander Brilevsky, Pavel Myagkikh, Alexandra Tarkova, Alexei Prokhorikhin, Evgeny Kretov, Tatiana Frolova, Alexei Vinogradov MATERIALS, 2020
	From specific γ‐CD / [Nb6Cl12(H2O)6]2+ recognition to biological activity tuning Pavel A. Abramov, Anton A. Ivanov, Tatiana N. Pozmogova, Anastasiya O. Solovieva, Tatiana S. Frolova, Olga I. Sinitsyna, Olga V. Lundovskaya, Alphiya R. Tsygankova, Mohamed Haouas, David Landy, Enrico Benassi, Lidiya V. Shestopalova, Clément Falaise, Emmanuel Cadot, Michael A. Shestopalov, Maxim N. Sokolov CHEM-EUR J, 2020
	0D to 3D coordination assemblies engineered on 2‐(alkylsulfanyl)azine ligands: crystal structures, dual luminescence and cytotoxic activity Maxim Rogovoy, Tatiana Frolova, Denis Samsonenko, Alexey Berezin, Irina Bagryanskaya, Nina Nedolya, Olga Tarasova, Vladimir Fedin, Alexander V. Artem'ev EurJIC, 2020
	1-Hydroxyanthraquinones Containing Aryl Substituents as Potent and Selective Anticancer Agents Nafisa S. Sirazhetdinova, Victor A. Savelyev, Tatyana S. Frolova, Dmitry S. Baev, Lyubov S. Klimenko, Ivan V. Chernikov, Olga S. Oleshko, Teresa A. Sarojan, Andrey G. Pokrovskii and Elvira E. Shults MOLECULES, 2020
	Lipophilic Metabolites from Five‐Needle Pines, Pinus armandii and Pinus kwangtungensis , Exhibiting Antibacterial Activity Alexander V. Shpatov, Tatyana S. Frolova, Sergey A. Popov, Olga I. Sinitsyna, Olga I. Salnikova, Guangyao Zheng, Linlin Yan, Nadezhda V. Sinelnikova, Lyudmila M. Pshennikova, Alexey V. Kochetov CHEM BIODIVERS, 2020
	Создание линии табака со сниженными антифидантными свойствами по отношению к колорадскому жуку. Костина Н.Е., Спасельникова А.В., Егорова А. А., Колосовская Е.В., Домрачев Д.В., Романова А.В., Туманян С.Р., Хамас С., Кумлен Й., Дубовский И.М., Герасимова С.В. Биотехнология и селекция растений, 2020, Т.3(1) 2020 г
	Влияние гонадэктомии и эстрадиола на экспрессию генов сигнального каскада инсулина у самок и самцов мышей. Яковлева Т.В., Костина Н.Е., Макарова Е.Н., Бажан Н.М. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 2020;24 (4):427-434.
	Synthesis and cytotoxicity of hybrids of 1,3,4- or 1,2,5-oxadiazoles tethered from ursane and lupane core with 1,2,3-triazole Sergey A. Popov, Marya D. Semenova, Dmitry S. Baev, Tatiana S. Frolova, Michael A. Shestopalov, Chengzhang Wang, Zhiwen Qi, Elvira E. Shults, Māris Turks STEROIDS, 2020
	Water‐soluble rhenium clusters with triazoles: the effect of chemical structure on cellular internalization and the DNA binding of the complexes Dmitry I. Konovalov, Anton A. Ivanov, Tatiana S. Frolova, Ilia V. Eltsov, Yakov M. Gayfulin, Louis Plunkett, Masoomeh Bazzar, Ali M. Adawi, Jean-Sebastien G. Bouillard, Sergey I. Baiborodin, Olga I. Sinitsyna, Natalia V. Kuratieva, Vadim V. Yanshole, Olga A. Efremova, Michael A. Shesto CHEM-EUR J, 2020, Volume26, Issue61 Pages 13904-13914
	Effect of gonadectomy and estradiol on the expres-sion of insulin signaling cascade genes in female and male mice. IakovlevaT.V., Kostina N.E., Makarova E.N., Bazhan N.M. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(4):427-434
	The miRNA Profile in Non-Hodgkin’s Lymphoma Patients with Secondary Myelodysplasia Yuliya Andreevna Veryaskina, Sergei Evgenievich Titov, Igor Borisovich Kovynev, Tatiana Ivanovna Pospelova, Igor Fyodorovich Zhimulev Cells, 2020, Cells 2020, 9(10), 2318
	ПРОФИЛИРОВАНИЕ ЭКСПРЕССИИ МИКРОРНК В КЛЕТКАХ ОСТРОГО ПРОМИЕЛОЦИТАРНОГО ЛЕЙКОЗА ПРИ РАЗЛИЧНОМ КАРИОТИПЕ Ю. А. Веряскина, С. Е. Титов, М. М. Агакишиев, А. В. Забела, В. С. Селиванов, С. П. Мелихов, И. Б. Ковынев , Т. И. Поспелова, И. Ф. Жимулёв Цитология, 2020, Цитология, 2020, T. 62, № 4, стр. 250-257
	Profiling 25 Bone Marrow microRNAs in Acute Leukemias and Secondary Nonleukemic Hematopoietic Conditions Igor B. Kovynev, Sergei E. Titov, Pavel S. Ruzankin , Mechti M. Agakishiev, Yuliya A. Veryaskina, Viktor M. Nedel’ko, Tatiana I. Pospelova, Igor F. Zhimulev Biomedicines, 2020, Biomedicines 2020, 8(12), 607
	Prognostic Markers of Myelodysplastic Syndromes Yuliya Andreevna Veryaskina, Sergei Evgenievich Titov , Igor Borisovich Kovynev, Tatiana Ivanovna Pospelova, Igor Fyodorovich Zhimulev MED LITH, 2020, Medicina 2020, 56(8), 376
	Intratumoral Heterogeneity of Expression of 16 miRNA in Luminal Cancer of the Mammary Gland Yuliya A. Veryaskina,Sergei E. Titov ,Vlada V. Kometova ,Valerii V. Rodionov ,Igor F. Zhimulev Non-Coding RNA, 2020, Non-Coding RNA 2020, 6(2), 16
	Preoperative detection of malignancy in fine-needle aspiration cytology (FNAC) smears with indeterminate cytology (Bethesda III, IV) by a combined molecular classifier Sergei Titov, Pavel S Demenkov, Sergei A Lukyanov, Sergei V Sergiyko, Gevork A Katanyan, Yulia A Veryaskina, Mikhail K Ivanov J CLIN PATHOL, 2020, J Clin Pathol 73(11): 722-727, 2020
	Recombination Events in Leishmania donovani: Mining Population Data Rogozin IB, Charyyeva A, Sidorenko IA, Babenko VN, Yurchenko V Pathogens and Disease, 2020, 9(7):572
	The relationship between root system development and vernalization under contrasting irrigation in bread wheat lines with the introgressions from a synthetic hexaploid Tatyana A. Pshenichnikova Olga G. Smirnova Alexander V. Simonov Ludmila V. Shchukina Evgeniya V. Morozova Ulrike Lohwasser Andreas Börner PLANT GROWTH REGUL, 2020
2019	Disodium salt of glycyrrhizic acid – A novel supramolecular delivery system for anthelmintic drug praziquantel Elizaveta S.Meteleva, Yulia S.Chistyachenko, Lyubov P.Suntsova, Mikhail V.Khvostov, Nikolay E.Polyakov, Olga Yu. Selyutina, Tatyana G.Tolstikova, Tatyana S.Frolova, Viatcheslav A.Mordvinov, Alexander V.Dushkin, Nikolay Z.Lyakhov J DRUG DELIV SCI TEC, 2019
	Design, Synthesis and Antibacterial Activity of Coumarin-1,2,3-triazole Hybrids Obtained from Natural Furocoumarin Peucedanin Alla V. Lipeeva, Danila O. Zakharov, Liubov G. Burova, Tatyana S. Frolova, Dmitry S. Baev, Ilia V. Shirokikh, Alexander N. Evstropov, Olga I. Sinitsyna, Tatyana G. Tolsikova, Elvira E. Shults MOLECULES, 2019
	Синтез, гиполипидемическая и противогрибковая активность сульфонатов тетрагидроберберрубина И. В. Нечепуренко, Е. Д. Широкова, М. В. Хвостов, Т. С. Фролова, О. И. Синицина, А. М. Максимов, Р. А. Бредихин, Н. И. Комарова, Д. С. Фадеев, О. А. Лузина, Т. Г. Толстикова, Н. Ф. Салахутдинов Известия АН. Серия химическая, 2019
	Synthesis, hypolipidemic and antifungal activity of tetrahydroberberrubine sulfonates I. V. Nechepurenko, E. D. Shirokova, M. V. Khvostov, T. S. Frolova, O. I. Sinitsyna, A. M. Maksimov, R. A. Bredikhin, N. I. Komarova, D. S. Fadeev, O. A. Luzina, T. G. Tolstikova, N. F. Salakhutdinov RUSS CHEM B+, 2019
	Lupane-type conjugates with aminoacids, 1,3,4- oxadiazole and 1,2,5-oxadiazole-2-oxide derivatives: synthesis, anti-inflammatory activity and in silico evaluation of target affinity Sergey A.Popov, Marya D.Semenova, Dmitry S.Baev, Irina V.Sorokina, Natalya A.Zhukova, Tatyana S.Frolova, Тatyana G.Tolstikova, Elvira E.Shults, MārisTurks STEROIDS, 2019
	Genotoxic activity of 1,2,3-triazolyl modified furocoumarins and 2,3-dihydrofurocoumarins Stepan A. Kremis , Dmitry S. Baev, Alla V. Lipeeva, Elvira E. Shults, Tatiana G. Tolstikova, Olga I. Sinitsyna, Alexey V. Kochetov, Tatiana S. Frolova J BIOCHEM MOL TOXIC, 2019
	Synthesis of cytotoxic urs-12-ene- and 28-nor-urs-12-ene- type conjugates with amino- and mercapto-1,3,4-oxadiazoles and mercapto-1,2,4-triazoles Sergey A. Popov, Marya D. Semenova, Dmitry S. Baev, Tatiana S. Frolova, Elvira E. Shults, Chengzhang Wang, Māris Turks STEROIDS, 2019
	The mTOR Signaling Pathway Activity and Vitamin D Availability Control the Expression of Most Autism Predisposition Genes Ekaterina A. Trifonova, Alexandra I. Klimenko, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov INT J MOL SCI, 2019, Int. J. Mol. Sci. 2019, 20(24), 6332;
	Исследование цитотоксического эффекта магниевых сплавов на клеточные культуры Т.С. Фролова, А.А. Бойков, А.Р. Таркова, К.Е. Орищенко, А.А. Прохорихин, Д.У. Малаев, О.И. Синицина, В.И. Байструков, Е.И. Кретов, М.В. Прямов, Д.Л. Мерсон, А.Ю. Виноградов Патология кровообращения и кардиохирургия, 2019
	Влияние гамма-излучения на уровень повреждений ДНК в клетках проростков Аllium cepa L Болсуновский А. Я., Дементьев Д. В., Фролова Т. С., Трофимова Е. А., Иняткина Е. М., Васильев С. А., Синицына О. И. Doklady Akademii Nauk, 2019, том 489, № 2, с. 199–204
	Перспективы моделирования лекарственноиндуцированных гиперкинезов на Drosophila melanogaster Н.В. Адоньева, Е.А. Трифонова, Н.Е. Грунтенко Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2019, 2019;5(1):6-12
	Регуляторные последовательности для конститутивной, тканеспецифичной и индуцированной экспрессии перенесенных генов у декоративных растений Смирнова О.Г., Шумный В.К., Кочетов А.В. Физиология растений, 2019, Т. 66, № 5, С. 323–338
	Regulatory Sequences for Constitutive, Tissue-Specific, and Induced Expression of Transgenes in Ornamental Plants Smirnova O.G., Shumny V.K., Kochetov A.V. RUSS J PLANT PHYSL+, 2019, Vol. 66, No. 5, pp. 679–693
	О роли ксеногамии в формировании жизненной стратегии Fragaria vesca L. в Западной Сибири Батурин С.О. Сибирский экологический журнал, 2019, № 1, С. 112-118.
	Анеуплоидия при скрещиваниях Fragaria × ananassa Duch. × Potentilla anserina L. Батурин С.О., Филипенко Е.А. Биотехнология и селекция растений, 2019, Т.2. - № 1. – С. 24-31.
	Экстракты базидиальных грибов порядков Agaricales, Polyporales и Hymenochaetales, обладающие противовирусной активностью. Проценко М.А., Макаревич Е.В., Ибрагимова Ж.Б., Филиппова Е.И., Костина Н.Е., Горбунова И.А., Власенко В.А. Успехи медицинской микологии, 2019, Том XX. Глава 7. Биотехнологии и лекарства.
2018	Dynamic landscape of the local translation at activated synapses. Khlebodarova T.M., Kogai V.V., Trifonova E.A., Likhoshvai V.A. MOL PSYCHIATR, 2018, V. 23(1), P. 107-114
	Preparation of curcumin self-micelle solid dispersion with enhanced bioavailability and cytotoxic activity by mechanochemistry Qihong Zhang, Nikolay E. Polyakov, Yulia S. Chistyachenko, Mikhail V. Khvostov, Tatjana S. Frolova, Tatjana G. Tolstikova, Alexandr V. Dushkin, Weike Su DRUG DELIV, 2018
	Composition of High Molecular Weight Glutenin Subunits in Common wheat varieties and promising lines L.V. Obukhova, V.K. Shymny RUSS J GENET+, 2018, 2018 V. 54. № 3. pp. 305-313
	Особенности семенного размножения сортов F1 ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) в условиях Западной Сибири Аполинарьева И.К., Батурин С.О. Сборник статей "Инновационные направления развития сибирского садоводства: наследие академиков М.А. Лисавенко, И.П. Калининой", 2018, Барнаул: Концепт, 2018. – С. 24-35.
	НОВЫЕ ИОННЫЕ КОНЪЮГАТЫ НА ОСНОВЕ a-ТОКОФЕРИЛСУКЦИНАТА КАК ПОТЕНЦИАЛЬНЫЕ ЦИТОТОКСИЧЕСКИЕ АГЕНТЫ Фролова Т. С., Шарапов С. Ж., Синицына О. И., Толстикова Т. Г., Григорьев И. А., Морозов С. В., Юшкова Ю. В. Биоорганическая химия, 2018, том 44, № 3, с. 325–332
	New Ionic Conjugates Based on α-Tocopheryl Succinate as Potential Cytotoxic Agents Frolova, T. S., Sharapov, S. Z., Sinitsyna, O. I., Tolstikova, T. G., Grigoriev, I. A., Morozov, S. V., Yushkova, Y. V. RUSS J BIOORG CHEM+, 2018, Vol. 44, No. 3, pp. 330–336
	Substrate specificity of healthy human sera IgG antibodies with peroxidase and oxydoreductase activities Tolmacheva, A.S., Ermakov, E.A., Buneva, V.N., Nevinsky G.A. R Soc Open Sci, 2018, 5(1): 171097
	Orientation-controlled, low-temperature plasma growth and applications of h-BN nanosheets Merenkov, I.S., Myshenkov, M.S., Zhukov, Y.M., Sato, Y., Frolova, T.S., Danilov, D.V., Kasatkin, I.A., Medvedev, O.S., Pushkarev, R.V., Sinitsyna, O.I., Terauchi, M., Zvereva, I.A., Kosinova, M.L., Ostrikov K. NANO RES, 2018
	Converting Hulled into Naked Barley through Targeted Knock-Out of the Nud1 Gene S. Gerasimova, C. Hertig, A. Korotkova, I. Otto, S. Hiekel, A. Kochetov, J. Kumlehn, E. Khlestkina IN VITRO CELL DEV-PL, 2018, V. 54 (Suppl 1). S101
	Регуляция биосинтеза стероидных гликоалкалоидов картофеля К.А. Иванова, С.В. Герасимова, Е.К. Хлесткина Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, Т. 22(1):25-34
	Fluorescent labeling of ursolic acid with FITC for investigation of its cytotoxic activity using confocal microscopy T.S. Frolova, A.V. Lipeeva, D.S. Baev, S.I. Baiborodin, K.E. Orishchenko, A.V. Kochetov, O.I. Sinitsyna BIOORG CHEM, 2018
	Targeted genome modification in protoplasts of a highly regenerable Siberian barley cultivar using RNA-guided Cas9 endonuclease S.V. Gerasimova, A.M. Korotkova, C. Hertig, S. Hiekel, R. Hoffie, N. Budhagatapalli, I. Otto, G. Hensel, V.K. Shumny, A.V. Kochetov, J. Kumlehn, E.K. Khlestkina Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, Т. 22, №8. С.1033-1039.
	Гены-мишени для метаболической инженерии представителей семейства Solanaceae: эволюция и структурная организация Иванова К.А., Спасельникова А.В., Шумный В.К., Герасимова С.В. Биотехнология и селекция растений, 2018, Т. 1, №1. С. 34-42.
	Генная сеть и база данных генов устойчивости пшеницы к патогенным грибам Смирнова О.Г., Шумный В.К., Кочетов А.В. Физиология растений, 2018, том 65, № 3, с. 1–15
	Gene Network and Database for Genes of Wheat’s Resistance to Pathogenic Fungi O. G. Smirnova, V. K. Shumny, A. V. Kochetov RUSS J PLANT PHYSL+, 2018, Vol. 65, No. 3, pp. 319–332
	Промоторы картофеля для экспрессии трансгенов Смирнова О.Г. Актуальные проблемы картофелеводства: фундаментальные и прикладные аспекты. Материалы всероссийской научно-практической конференции с международным участием (Россия, Томск, 10-13 апреля 2018 года)., 2018, С. 192-193
	Использование промоторов генов картофеля для регуляции экспрессии целевых генов у трансгенных растений Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля. Материалы научной конференции (Россия, Новосибирск, 1-5 августа 2018 года)., 2018, С. 29
	Морфогенетический потенциал сортов картофеля сибирской селекции в культуре in vitro. С.М. Ибрагимова , А.В. Романова, Г.Х. Мызгина, A.В. Кочетов Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, 22(3):316-320
	Ribonuclease activity as a new prospective disease resistance marker in potato E.A. Trifonova , S.M. Ibragimova, O.A. Volkova, V.K. Shumny, A.V. Kochetov Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, 22(8):987-991
2017	Start codons and mRNA translation efficiency prediction using RiboSeq-based weight matrices Kondrakhin Yu.V., Sharipov R.N., Volkova O.A. Acta Naturae, 2017, 9(1), 25
	AltORFev facilitates the prediction of alternative open reading frames in eukaryotic mRNAs Kochetov Alex V., Allmer Jens, Klimenko Alexandra I., Zuraev Bulat S., Matushkin Yury G., Lashin Sergey A. BIOINFORMATICS, 2017, 33(6):923-925
	Гены сельскохозяйственных растений, модифицированные с помощью системы CRISPR/Cas. Короткова А.М., Герасимова С.В., Шумный В.К., Хлесткина Е.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 21(2):250-258. DOI 10.18699/VJ17.244
	Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots N. A. Omelyanchuk, D. S. Wiebe, D. D. Novikova, V. G. Levitsky, N. Klimova, V. Gorelova, C. Weinholdt, G. V. Vasiliev, E. V. Zemlyanskaya, N. A. Kolchanov, A. V. Kochetov, I. Grosse, V. V. Mironova SCI REP-UK, 2017, 7: 2489
	Genome Editing System CRISPR/CAS9 and Peculiarities of Its Application in Monocots S. V. Gerasimova, E. K. Khlestkina, A. V. Kochetov, V. K. Shumny RUSS J PLANT PHYSL+, 2017, Vol. 64, No. 2, pp. 141–155.
	СИСТЕМА CRISPR/CAS9 ДЛЯ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМОВ И ОСОБЕННОСТИ ЕЕ ПРИМЕНЕНИЯ НА ОДНОДОЛЬНЫХ РАСТЕНИЯХ С. В. Герасимова, Е. К. Хлесткина, А. В. Кочетов, В. К. Шумный Физиология растений, 2017, том 64, № 2, с. 92–108
	Apoptosis as the Basic Mechanism of Cytotoxic Action of Ursolic and Pomolic Acids in Glioma Cells Frolova T.S., Lipeeva A.V., Baev D.S., Tsepilov Y. A., Sinitsyna O.I. Molecular Biology, 2017, Vol. 51, No. 5, pp. 705–711
	Апоптоз как основной механизм цитотоксического действия урсоловой и помоловой кислот в клетках глиомы Фролова Т.С., Липеева А.В., Баев Д.С., Цепилов Я.С., Синицына О.И. Molecular Biology, 2017, том 51, №5, с 61-68
	ОСОБЕННОСТИ ОКИСЛИТЕЛЬНО-ВОССТАНОВИТЕЛЬНЫХ, АМИЛАЗНОЙ И АТРАЗНОЙ АКТИВНОСТЕЙ IGG АНТИТЕЛ ИЗ КРОВИ БОЛЬНЫХ ШИЗОФРЕНИЕЙ Е. А. Ермаков, А. С. Толмачева, Л. П. Смирнова, С. А. Иванова, В. Н. Бунева, Г. А. Невинский Российский иммунологический журнал, 2017, том 11 (20), №4 с. 37-50
	Molecular Mechanisms of Autism as a Form of Synaptic Dysfunction E. A. Trifonova, T. M. Khlebodarova, N. E. Gruntenko Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, Vol. 7, No. 8, pp. 869–877
	Achievements and Prospects of Applying High-Throughput Sequencing Techniques to Potato Genetics and Breeding Bykova I.V., Shmakov N.A., Afonnikov D.A., Kochetov A.V., Khlestkina E.K. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, 2017, Vol. 7, No. 7, pp. 736–743. DOI: 10.1134/S2079059717070036
	Ribo-seq DB – a repository of selected human and mouse Ribo-seq and RNA-seq data. Sharipov R.N., Yevshin I.S., Kondrakhin Yu.V, Volkova O.A. Acta Naturae, 2017, 9(1), 27
	Assessment of translation efficiency from Ribo-seq and mRNA-seq data. Yevshin I.S., Sharipov R.N., Volkova O.A. Acta Naturae, 2017, 9(1), 28
	Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis Alex V. Kochetov, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Salmaz M. Ibragimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Tatyana A. Gavrilenko, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko BMC PLANT BIOL, 2017, BMC Plant Biology 2017, 17 (Suppl 2):251
	A Database on Genes Increasing the Resistance of Wheat and its Related Species against Pathogenic Fungi Smirnova O.G., Kochetov V.A. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, V. 7, N. 8, P. 816–821
	Создание базы данных и реконструкция генной сети ответа пшеницы на патогенную инфекцию Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Генофонд и селекция растений. Тезисы докладов III международной конференции, посвященной 130-летию Н.И. Вавилова, 2017, С. 63-64
	Механизмы устойчивости пшеницы к патогенным грибам Смирнова О.Г., Кочетов А.В БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева., 2017, С. 179
	О системах скрещивания в природных популяциях Fragaria vesca L. в Западной Сибири Батурин Сергей Олегович Материалы VI Международной научной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения профессора А.В. Положий (Томск, 24-26 октября 2017 г.), 2017, Томск, Издательский Дом ТГУ, С. 187-189.
2016	Анализ наследования запасных белков эндосперма линией сорта мягкой пшеницы Саратовская 29 от ее родительских форм. Л.В. Обухова, В.К. Шумный RUSS J GENET+, 2016, Том 52, №1, с.59-65
	2.3 THz radiation: Absence of genotoxicity/mutagenicity in Escherichia coli and Salmonella typhimurium Svetlana Sergeeva, Elisaveta Demidova, Olga Sinitsyna, Tatiana Goryachkovskaya, Alla Bryanskaya, Artem Semenov, Irina Meshcheryakova, Grigory Dianov, Vasiliy Popik, Sergey Peltek MUTAT RES-GEN TOX EN, 2016
	Наработка рекомбинантных белков в клетках растений С. В. Герасимова, О. Г. Смирнова, А. В. Кочетов, В. К. Шумный Физиология растений, 2016, том 63, № 1, с. 31–43
	Antioxidant and antitumor activity of trolox, trolox succinate, and α-tocopheryl succinate conjugates with nitroxides. Zakharova OD, Frolova TS, Yushkova YV, Chernyak EI, Pokrovsky AG, Pokrovsky MA, Morozov SV, Sinitsina OI, Grigor'ev IA, Nevinsky GA. EUR J MED CHEM, 2016, T. 122, P. 127-137. doi: 10.1016/j.ejmech.2016.05.051.
	ОЦЕНКА ГЕНОТОКСИЧНОСТИ МАЛЫХ ДОЗ ГАММА-ИЗЛУЧЕНИЯ С ПОМОЩЬЮ SOS-ХРОМОТЕСТА И ТЕСТА ЭЙМСА А. Я. Болсуновский, О. И. Синицына, Т. С. Фролова, Е. А. Васюнина, Д. В. Дементьев Doklady Akademii Nauk, 2016, том 469, № 5, с. 742–745
	Genotoxicity Assessment of Low-Level Doses of Gamma Radiation with the SOS Chromotest and the Ames Test A. Ya. Bolsunovsky, O. I. Sinitsyna, T. S. Frolova, E. A. Vasyunina, D. V. Dementyev Doklady Biochemistry and Biophysics, 2016, Vol. 469, pp. 1–4.
	Натурализация Fragaria x ananassa Duch. в Западной Сибири Батурин Сергей Олегович Сибирский экологический журнал, 2016, № 3, С. 449-458.
	Формирование генофонда для получения сортов F1 ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Аполинарьева И.К. Плодоводство и ягодоводство России, 2016, М.: 2016. Т. XXXXIV. С. 98-102.
	Генетические ресурсы селекции розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Хапова С.А. Плодоводство и ягодоводство России, 2016, М.: 2016. Т. XXXXIV. С. 102-106.
	Assessment of translational importance of mammalian mRNA sequence features based on Ribo-Seq and mRNA-Seq data Oxana A. Volkova,Yury V. Kondrakhin†, Ivan S. Yevshin, Tagir F. Valeev,Ruslan N. Sharipov Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2016, April 2016, Vol. 14, No. 02, doi: 10.1142/S0219720016410067
	Low doses of gamma-radiation induce SOS response and increase mutation frequency in Escherichia coli and Salmonella typhimurium cells Alexander Bolsunovsky, Tatiana Frolova, Dmitry Dementyev, Olga Sinitsyna ECOTOX ENVIRON SAFE, 2016, V. 134, P. 233-238
	Ингибирование мутагенной активации орто-аминоазотолуола повышает его канцерогенность для печени мышей Каледин В. И., Овчинникова Л. П., Ильницкая С. И., Морозкова Т. С., Попова Н. А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, т.20 № 5. Стр. 708-715
	Expression of extracellular ribonuclease gene increases resistance to Cucumber mosaic virus in tobacco Sugawara T., Trifonova E.A., Kochetov A.V., Kanayama Y. BMC PLANT BIOL, 2016, 16:246
	Трансгенные растения как генетические модели для изучения функций генов Кочетов А.В., Шумный В.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20. 476-481
	Индуцированная экспрессия гена рибонуклеазы III Serratia marcescens в трансгенных растениях табака Nicotiana tabacum L. cv. SR1. Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Романова А.В., Филипенко Е.А., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2016, 2016 52 1-6
	Phosphonium betaines derived from hexafluoro-1,4-naphthoquinone:Synthesis and cytotoxic and antioxidant activites. Zhivetyeva S.I.,Zakharova O.D.,Ovchinnikova L.P.,Baev D.S.,Bagryanskaya I.Yu.,Shteingarts V.D.,Tolstikova T.G.,Nevinsky G.A.,Tretyakov E.V. J FLUORINE CHEM, 2016, v 192,P. 68-77
	База данных генов, повышающих устойчивость пшеницы и родственных ей злаков к патогенным грибам Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, Т. 20. № 6. С. 904-908.
	Plant Cell Wall and Mechanisms of Resistance to Pathogens Smirnova O.G., Kochetov A.V. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, Vol. 6, No. 5, pp. 622–631
	Production of recombinant proteins in plant cells Gerasimova S.V., Smirnova O.G., Kochetov A.V., Shumny V.K. RUSS J PLANT PHYSL+, 2016, 63(1): 26-37
	The interitance of ednosperm storage proteins by the line of the Saratovcksaya 29 cultivar of common wheat from its parental forms L.V. Obukhova, V.K. Shumny RUSS J GENET+, 2016, 2016 V 52 №1 pp 49-55
	СОЗДАНИЕ ГЕНОФОНДА СТРЕССОВОУСТОЙЧИВЫХ ГИБРИДОВ ДЛЯ СЕЛЕКЦИИ КРУПНОПЛОДНОЙ ЗЕМЛЯНИКИ (FRAGARIA Х ANANASSA DUCH.) В ЗАПАДНОЙ СИБИРИ Кузьмина А.А., Батурин С.О. В книге: Генофонд и селекция растений Тезисы докладов II Международной конференции, посвященной 80-летию СИБНИИРС., 2016, 2016. С. 35.
	Reconstruction of the gene network of the wheat response to fungal pathogens Smirnova O.G., Kochetov A.V. Plant Genetics and Genomics For Food Security. Novosibirsk, Russia. Abstract Book, 2016, P. 56
	База данных генов устойчивости пшеницы к патогенным грибам Смирнова О.Г., Кочетов А.В. 50 лет ВОГиС: успехи и перспективы. Сборник тезисов Всероссийской конференции, 2016, C. 289
	Оценка трансляционной значимости характеристик нуклеотидной последовательности мРНК млекопитающих на основе данных рибосомного профилирования O.A.Волкова, Ю.В. Кондрахин, Р.Н.Шарипов Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):779-786 DOI 10.18699/VJ16.195
2015	IgG abzymes with peroxidase and oxidoreductase activities from the sera of healthy humans Tolmacheva AS, Blinova EA, Ermakov EA, Buneva VN, Vasilenko Nl, Nevinsky GA J MOL RECOGNIT, 2015, 28(9):565-80. doi: 10.1002/jmr.2474
	Генетический контроль ремонтантности в популяциях Fragaria vesca L. (Rosaceae) в Западной Сибири Батурин С.О. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, № 1. Т. 19. С. 69-73.
	Вирус-индуцируемый сайленсинг как метод изучения функций генов высших растений Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2015, 51 558-567
	Трансгенная экспрессия нативной и мутантной нуклеазы Serratia marcescens модулирует устойчивость табака Nicotiana tabacum L. к вирусу табачной мозаики Трифонова Е. А., Савельева А. В., Романова А. В., Филипенко Е. А., Сапоцкий М. В., Малиновский В. И., Кочетов А. В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2015, 51 835-840
	Роль клеточной стенки растений в защитном ответе Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, т.19, №6, c.715-723
	Оценка солеустойчивости трансгенных растений табака, несущих ген ∆1-пирролин-5-карбоксилат синтазы 1 (P5CS1) Arabidopsis thaliana. Ибрагимова С.М., Трифонова Е.А., Филипенко Е.А., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2015, т.51.№12,1368-1375
	CONJUGATES OF TROLOX AND a-TOCOPHERYL SUCCINATE WITH NITROXIDES: SYNTHESSIS, ANTIOXIDANT AND ANTITUMOR ACTIVITY TAT’YANA S. FROLOVA, OL’GA D. ZAKHAROVA, YULIYA F. POLIENKO, YULIYA V. YUSHKOVA, ELENA I.CHERNYAK, SERGEI V.MOROZOV, OL’GA I. SINITSINA, IGOR A. GRIGOR’EV & GEORGY A. NEVINSKY International Journal of Medicine and Pharmaceutical Sciences, 2015, Vol. 5, Issue 3, Jun 2015, 9-24
	Genotoxic and Mutagenic Properties of Synthetic Betulinic Acid and Betulonic Acid T. S. Frolovaa, T. P. Kukina, O. I. Sinitsyna RUSS J BIOORG CHEM+, 2015, Vol. 41, No. 4, pp. 409–413
	МУТАГЕННАЯ АКТИВНОCТЬ В ТЕCТЕ ЭЙМCА ЧЕТЫPЕX АМИНОАЗОCОЕДИНЕНИЙ C PАЗЛИЧНОЙ КАНЦЕPОГЕННОCТЬЮ ДЛЯ ПЕЧЕНИ КPЫC Т.C. Фpолова, О.И. Cиницына, В.И. Каледин BIOPHYSICS, 2015, том 60, вып. 5, c. 990–994
	Promoters of Plant Genes Responsive to Pathogen Invasion. Smirnova O.G., Kochetov A.V. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, 2015, Vol. 5, No. 3, pp. 254–261.
	ANTIOXIDANT ACTIVITY AND CYTOTOXICITY OF POLYFLUORINATED 1,4- NAPHHOQUINONES WITH ALKYLATING FUNCTIONS IN THE QUINONE MOIETY OL'GA D.ZARHAROVA,LUDMILA P.OVCHINNIKOVA,LEONID I.GORYUNOV,NADEZHDA M.TROSHKOVA,VITALIJ D.SHTENGARTS &GEORGY A.NEVINSKY International Journal of Medicine and Pharmaceutical Sciences, 2015, Vol.5,Issue 1, 11-20
	Влияние загрязнения атмосферного воздуха взвешенными веществами на сердечно-сосудистую систему. А.Ф. Колпакова, Р.Н. Шарипов, О.А. Волкова Сибирский медицинский журнал, 2015, Сибирский медицинский журнал
	Disruption of Transcriptional Coactivator Sub1 Leads to Genome-Wide Re-distribution of Clustered Mutations Induced by APOBEC in Active Yeast Gene Lada AG, Kliver SF, Dhar A, Polev DE, Masharsky AE, Rogozin IB, Pavlov YI. PLOS GENET, 2015, PLoS Genet. 2015 May 5;11(5):e1005217. doi: 10.1371/journal.pgen.1005217. eCollection 2015.
	An effective two-step synthesis, fluorescent properties, antioxidant activity and cytotoxicity evaluation of benzene-fluorinated 2,2-dimethyl-2,3-dihydro-1H-quinolin-4-ones Larisa V. Politanskaya, , Igor P. Chuikov, Evgeny V. Tretyakov, Vitalij D. Shteingarts, Ludmila P. Ovchinnikova, Olga D. Zakharova, Georgy A. Nevinsky J FLUORINE CHEM, 2015, , V. 178, October 2015, P. 142–153. http://dx.doi.org/10.1016/j.jfluchem.2015.07.006
	Influence of Antioxidant SkQ1 on Accumulation of Mitochondrial DNA Deletions in the Hippocampus of Senescence-Accelerated OXYS Rats P. S. Loshchenova, O. I. Sinitsyna, L. A. Fedoseeva, N. A. Stefanova, and N. G. Kolosova BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2015, V ol. 80, No. 5, pp. 596-603
	TOXICITY AND ANTIVIRAL ACTIVITY OF THE EXTRACTS OF SUBMERGED MYCELIUM OF NEMATOPHAGOUS DUDDINGTONIA FLAGRANS FUNGUS IN VERO CELL CULTURE. Ibragimova Z.B., Anan’ko G.G., Kostina N.E., Teplyakova T.V., Mazurkova N.A. B EXP BIOL MED+, 2015, Т. 160. № 2. С. 246-248
	EFFECTS OF LESIONS TO CAPSAICIN-SENSITIVE NERVES ON BLOOD PRESSURE IN METABOLIC SYNDROME IN RATS Spiridonov V.K., Tolochko Z.S., Kostina N.E. Neuroscience Behavioral Physiology, 2015, Т. 45. № 5. С. 550-557
	РОЛЬ КАПСАИЦИН-ЧУВСТВИТЕЛЬНЫХ НЕРВОВ В РЕГУЛЯЦИИ СОДЕРЖАНИЯ ДЕГИДРОЭПИАНДРОСТЕРОН-СУЛЬФАТА В КРОВИ КРЫС В НОРМЕ И ПРИ МЕТАБОЛИЧЕСКОМ СИНДРОМЕ Спиридонов В.К., Толочко З.С., Овсюкова М.В., Костина Н.Е., Обут Т.А. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2015, Т. 101. № 8. С. 936-948
	РАЗРАБОТКА И ВАЛИДАЦИЯ МЕТОДИК КОЛИЧЕСТВЕННОГО АНАЛИЗА ФЕНОЛЬНЫХ СОЕДИНЕНИЙ И ФЛАВОНОИДОВ В ЭКСТРАКТАХ ИЗ ВЫСШИХ ГРИБОВ. Проценко М.А., Костина Н.Е. Химия растительного сырья, 2015, № 3. С. 117-126
	Выделение в чистую культуру новых штаммов базидиомицета Daedaleopsis tricolor из природных местообитаний новосибирской области Проценко М.А., Костина Н.Е. Современная микология в России, 2015, Т. 4., С. 255-256
2014	Перспективы получения однородного семенного потомства у ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Кузьмина А.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, № 4/1. Т. 18. С. 812-817.
	Isolation of Pomolic Acid from Chamaenerion angustifolium and the Evaluation of Its Potential Genotoxicity in Bacterial Test Systems T. S. Frolovaa, O. I. Sal’nikova, T. A. Dudareva, T. P. Kukina, and O. I. Sinitsyna RUSS J BIOORG CHEM+, 2014, Vol. 40, No. 1, pp. 82–88.
	Mutagen activation and carcinogenicity of aminoazodyes of ortho-aminoazotoluene and 3'-methyl- 4-dimethylaminoazobenzene in experiments on suckling mice Kaledin V.I., Il'nitskaya S.I., Ovchinnikova L.P., Popova N.A., Bogdanova L.A., Morozkova T.S. BIOPHYSICS, 2014, volume 59, issue 3, pages 527-532
	Мутагенная активация и канцерогенность аминоазокрасителей орто-аминоазотолуола и 3'-метил - 4-диметилазобензола в опытах на подсосных мышатах В.И. Каледин, С.И.Ильницкая, Л.П.Овчинникова, Н.А.Попова, Л.А.Богданова, Т.С.Морозкова BIOPHYSICS, 2014, том.59, вып.3, стр.527-532
	СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛНЫХ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК КРЫС ЛИНИЙ WISTAR И OXYS ПИТОМНИКА ЛАБОРАТОРНЫХ ЖИВОТНЫХ ИЦИГ СО РАН Р.А. Максютов, Е.В. Гаврилова, Т.С. Непомнящих, У.Н. Роцкая, П.С. Лощенова, Н.Г. Колосова, О.И. Синицина, С.Н. Щелкунов Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, том 18, No 3, с. 437-445
	Генетический контроль строения корневой системы и её связь со скоростью развития растения у мягкой пшеницы (Triticum aestivum L). Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В., Щукина Л.В., Смирнова О.Г., Бёрнер А. Материалы VI съезда ВОГиС, Ростов-на-Дону, 15-20 июня 2014г., 2014, C. 146-147
	Промоторы генов, регулирующих ответ на патогены у растений. Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, 18. №4. 765 – 775
	Энхансеры трансляции для генной инженерии растений. Кочетов А.В., Филипенко Е.А., Смирнова О.Г., Шумный В.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, 18. №4. 610 - 617.
	Synthesis and cytotoxicity evalution of polyfluorinated 1,4- naphthoquinones containing amino acid substituents N.M.Troshkova,L.I.Gorynov,V.D.Shteingarts,O.D.Zakharova,L.P.Ovchinnirova,G.A.Nevinsky J FLUORINE CHEM, 2014
	Корреляционный анализ зависимости силы муки от запасных белков пшеницы Обухова Людмила Васильевна, Будашкина Екатерина Борисовна Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Т. 18. N. 4/1, стр. 807 - 811
	RiboSeqDB – a repository of selected human and mouse ribosome footprint and RNA-seq data Sharipov R.N., Yevshin I.S., Kondrakhin Y.V., Volkova O.A. Virtual Biology, 2014, Virtual Biology, 2, 37-46,ISSN: 2306-8140, http://virtual-biology.org/vb/article/view/18
2013	SYNTHESIS AND STUDY OF MUTAGENIC PROPERTIES OF LUPANE TRITERPENOIDS CONTAINING 1,2,3-TRIAZOLE FRAGMENTS IN THE C-30 POSITION A. N. Antimonova, N. I. Petrenko, M. M. Shakirov, T. V. Rybalova, T. S. Frolova, E. E. Shults, T. P. Kukina, O. I. Sinitsyna, and G. A. Tolstikov CHEM NAT COMPD+, 2013, Vol. 49, No. 4, September, 2013
	Hidden coding potential of eukaryotic genomes: non-AUG started ORFs Kochetov A.V., Prayaga P.D., Volkova O.A., Sankararamakrishnan R. Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2013, 31(1):103-114
	Age-dependent guanine oxidation in DNA of different brain regions of Wistar rats and prematurely aging OXYS rats Sattarova EA, Sinitsyna OI, Vasyunina EA, Duzhak AB, Kolosova NG, Zharkov DO, Nevinsky GA. BBA-GEN SUBJECTS, 2013, Jun;1830(6):3542-52
	Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Sommer B., Kormeier B., Demenkov P., Arrigo P., Hippe K., Ates O., Kochetov A.V., Ivanisenko V., Kolchanov N.A., Hofestaedt R. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, 11. 1. 1340005.
	Влияние полового созревания на экспрессию гена DD2R в жировом теле самок Drosophila Андреенкова (Лаухина) Ольга Владимировна, Филипенко Елена Анатольевна, Раушенбах Инга Юрьевна RUSS J GENET+, 2013, Т.49, № 9, С.1124-1126
	Соматические мутации в гене цитохрома b митохондриальной ДНК гиппокампа крыс линии Wistar Лощенова П.С., Рогозин И. Б., Роцкая У.Н., Малярчук Б.А., Невинский Г.А., Синицына О. И. Экологическая генетика, 2013, Том ХI, №2
	ХАРАКТЕРИСТИКА ПУРОИНДОЛИНОВ В КОНТРОЛЕ ТЕКСТУРЫ ЭНДОСПЕРМА У ЛИНИЙ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ С ЗАМЕЩЕНИЕМ ХРОМОСОМ 5Й ГОМЕОЛОГИЧЕСКОЙ ГРУППЫ Л. В. Обухова, Т. Т. Ефремова, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2013, том 49, № 3, с. 337–342
	Компьютерный анализ данных экспрессии генов в клетках мозга, полученных с помощью микрочипов и высокопроизводительного секвенирования Медведева И.В., Вишневский О.В., Сафронова Н.С., Кожевникова О.С., Генаев М.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Орлов Ю.Л. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, ТОМ 17, № 3, С.202-211
	Фенологические наблюдения в семенных потомствах ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Аполинарьева И.К., Батурин С.О., Петрук В.А. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2013, № 3. - С.59-65
	PR-белки с рибонуклеазной активностью и устойчивость растений к патогенным грибам. 175. Филипенко Е.А., Кочетов А.В., Kanayama Y., Малиновский В.И., Шумный В.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, 17. 326-334.
	Роль ауто- и гетерологичных рибонуклеаз семейства III в механизмах устойчивости к патогенам и регуляции экспрессии генов высших растений. Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, 17. 558-567.
	Аналіз запасних білків кукурудзи, трансформованої in planta з використанням обеззброєнних штамів Agrobacterium tumefaciens. Матвєєва О.Ю., Сірант Л.В., Курчій В.М., Моргун Б.В., Тищенко О.М., Кочетов О.В. Физиология растений и генетика, 2013, Т.45, № 4. –С. 358-364.
	Анализ эффективности использования двухцепочечного рнк-супрессора гена пролиндегидрогеназы для повышения уровня устойчивости подсолнечника (Helianthus annuus L.) К водному дефициту и засолению. Комисаренко А.Г., Михальская С.И., Сергеева Л.Е., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н. Известия Самарского научного центра РАН, 2013, Т. 15. № 3-5. С. 1629-1632.
	Исследование содержания свободного пролина в растениях кукурузы, трансформированных in planta с использованием LBA4404, несущего pBI2E с двухцепочечным РНК-супрессором гена пролиндегидрогеназы. Михальская С.И., Матвеева А.Ю., Сергеева Л.Е., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н. Известия Самарского научного центра РАН, 2013, Т. 15. № 3-5. С. 1662-1665.
2012	A Model of the Gene Network for Flowering Time Regulation in Winter Wheat and Barley. Smirnova O.G , Stepanenko I.L., Titov I.I. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, 2012, Vol. 2, No. 4, pp. 319–324
	Wheat Promoter Sequences for Transgene Expression. Smirnova O.G., Kochetov A.V. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, 2012, Vol. 2, No. 6, pp. 434–439.
	Mechanism of Action and Activity Regulation of COP1, a Constitutive Repressor of Photomorphogenesis. Smirnova O.G , Stepanenko I.L., Shumny V.K. RUSS J PLANT PHYSL+, 2012, 2012, Vol. 59, No. 2, pp. 155–166.
	Simple database to select promoters for plant transgenesis. Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В. TRANSGENIC RES, 2012, 21. 429-437
	Механизм действия и регуляция активности конститутивного репрессора фотоморфогенеза COP1. Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Шумный В.К. Физиология растений, 2012, том 59, № 2, с. 1–13
	Частичная супрессия гена пролиндегидрогеназы увеличивает устойчивость растений к различным видам абиотических стрессов. С.С. Ибрагимова, Я.С. Колодяжная, С.В. Герасимова, А.В. Кочетов Физиология растений, 2012, т.59, №1, 99-107
	Inducible expression of the gene of Zinnia elegans coding for extracellular ribonuclease in the SR1 Nicotiana tabacum plants Trifonova E.A., Romanova A.V., Sangaev S.S., Sapotsky M.V., Malinovsky V.I., Kochetov A.V. BIOL PLANTARUM, 2012, 56. 571-574
	Промоторы пшеницы для экспрессии трансгенов Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 16. 1. 224-231.
	Research progress on the medicinal and nutritional properties of sea buckthorn (Hippophae rhamnoides) Kanayama Y., Kato K., Stobdan T., Galitsyn G.G., Kochetov A.V., Kanahama K. J HORTIC SCI BIOTECH, 2012, 87. 203-210
	Extensive translatome remodeling during ER stress response in mammalian cells Ventoso I., Kochetov A., Montaner D., Dopazo J., Santoyo J. PloS One, 2012, 7: e35915
	Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA. ANN BOT-LONDON, 2012, 110 (2): 349-360.
	Модель генной сети регуляции времени цветения у озимой пшеницы и ячменя. Степаненко И.Л., Смирнова О.Г., Титов И.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т. 16, № 1, С. 99-108
	Развитие и прорастание семянок у ремонтантных сортов крупноплодной земляники (Fragaria × ananassa Duch.) Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Кузнецова Л.Л. Сельскохозяйственная биология, 2012, №3
	TGP – база данных промоторов для трансгенеза растений Смирнова О.Г., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Кочетов А.В. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2012, Т.7. №2. С.444-460.
	Усиление общетоксического и ослабление гепатоканцерогенного действия диэтилнитрозамина при введении его в смеси с изопропанолом Каледин В.И., Багинская Н.В., Васюнина Е.А., Ильницкая С.И., Овчинникова Л.П. Вопросы онкологии, 2012, том 56, н.5, стр.658-662
	Possible link between the synthesis of GR alpha isoforms and eIF2 alpha phosphorylation state. Kochetov AV, Merkulova TI, Merkulov VM MED HYPOTHESES, 2012, V 79. P. 709-712
	Мутагенная активация снижает канцерогенность орто-аминоазотолуола для печени мышей Овчинникова Л.П., Богданова Л.А., Каледин В.И. B EXP BIOL MED+, 2012, № 11, Т. 154, стр.623-628
	Информационная поддержка экспериментов по трансгенезу растений в базе данных трансляционных энхансеров. Смирнова О.Г., Рассказов Д.А., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т.16. №4/1. С. 766-773.
	Информационный портал "Биотехнология растений" - Интернет ресурс для поддержки экспериментов в области генной инженерии растений, генетики и селекции пшеницы. Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т.16. №4/1. С. 838-848.
	Breeding of pink-flowering ornamental strawberries in Siberia Kuznetsova L.L., Zielke R.A., Grout B.W.W., Baturin S.O. Acta Hort. (ISHS), 2012, 937. - 2012. – Р. 469-472
2011	Alternative translation start sites are conserved in eukaryotic genomes Bazykin G.A., Kochetov A.V. NUCLEIC ACIDS RES, 2011, 39. 567-577.
	Tandem termination signal in plant mRNA Kochetov A.V., Volkova O.A., Poliakov A., Dubchak I., Rogozin I.B. GENE, 2011, 481. 1-6.
	Анализ транскрипционной активности промотора гена дельта-орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana Герасимова С.В., Горелова В.В., Дорогина О.В., Жмудь Е.В., Коваль В.С., Романова А.В., Кочетов А.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2011, 47. 5. 707-710.
	Супероксидисмутазная, каталазная, пероксидазная и Н2О2-независимая оксидоредуктазная активности антител из крови здоровых крыс WISTAR. Щеглова Т.В., Толмачева А.С., Овчинникова Л.П., Синицина О.И., Василенко Н.Л., Бунева В.Н., Невинский Г.А. Российский иммунологический журнал, 2011, том 5(14), № 1, с. 11–20
	The Role of the COP1, SPA, and PIF Proteins in Plant Photomorphogenesis O. G. Smirnova, I. L. Stepanenko, V. K. Shumnyia Biology Bulletin Reviews, 2011, Vol. 1, No. 4, pp. 314–324
	Изменчивость в агамоспермном потомстве крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) по фертильности пыльцы Батурин С.О., Амброс Е.В. Научные ведомости БелГУ. Серия: Естественные науки, 2011, №9 (104), Вып. 15/1. – С. 204-209.
	Оценка цитотоксичности и антиоксидантных свойств гидрофильных производных 2,4,6,-триалкилфенолов в клетках Escherichia coli. Роцкая У.Н., Овчинникова Л.П., Васюнина Е.А., Синицина О.И., Кандалинцева Н.В., Просенко Е.А., Невинский Г.А. Биомедицинская химия, 2011, Т. 57 (3), С.326-334
	Функции дельта-аминотрансферазы у растений Герасимова С.В., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2011, т.131, № 6, 531-542
	Production of recombinan HIV-1 GAG polyprotein fused to yellow Fluorescent Protein (EYFP) in Leishmania tarentolae 156. Razumova Ju.V., Cheresiz S.V., Kochetov A.V., Beklemishev A.B. Вестник уральской медицинской академической науки, 2011, 4/1 202
	Репродуктивные особенности и перспективы использования розовоцветкового декоративного гибрида Fragaria x Potentilla (сорт Frel) в селекции крупноплодной земляники Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Т. 15, № 4, С. 800-807.
	Cytotoxicity of new polifluorinated 1,4 - naphtoquinones with diverse substituents in the quinine moiety. Olga d Zakharova,Ludmila P.Ovchinnikova,Leonid I.Goryunov,Nadezhda M.Troshkova,Vitaliiy D.Shtengarts,Georgy A.Nevinsky Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2011, 19,pp.256-260
	Интродукция розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria × ananassa Duch.) в Западной Сибири Кузнецова Л.Л., Батурин С.О. Научные ведомости БелГУ. Серия: Естественные науки, 2011, т. 104, № 9 вып. 15/2, C. 54-59
	Роль белков COP1, SPA и PIF в регуляции фотоморфогенеза растений Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2011, Т.311, 1. С.3-15
	Метаболизм сахарозы на ранних этапах онтогенеза кукурузы (Zea mays L.), трансформированной in planta обезоруженными штаммами штаммом Agrobacterium tumefaciens Тищенко Е.Н., Сакало В.Д., Матвеева А.Ю., Курчий В.М., Моргун Б.В., Кочетов А.В. Биотехнология, 2011, 4. 3. 64-73
	Активность сахаросинтетазы и инвертазы эндосперма кукурузы (Zea mays L.), инфицированной in planta обезоруженными штаммами Agrobacterium tumefaciens Матвеева А.Ю., Сакало В.Д., Курчий В.М., Моргун Б.В., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н. Вісник Українського товариства генетиків та селекціонерів, 2011, 9. 1. 55-64
2010	Особенности прорастания семянок агамоспермных потомков Fragaria x ananassa Duch. при различных способах семенной репродукции Батурин С.О., Амброс Е.В. Сельскохозяйственная биология, 2010, № 5. С. 87-91.
	Оценка всхожести семян и сортовой однородности семенного потомства ремонтантных коммерческих сортов крупноплодной земляники Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Петрук В.А. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2010, № 1. С. 40-45.
	Перспективы использования сеянцев агамоспермного происхождения в селекции крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Амброс Е.В., Батурин С.О. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2010, № 9. С.36-42.
	Роль различных метаболитов в формировании стрессоустойчивости растений Ибрагимова С.С., В.В. Горелова, А.В. Кочетов, В.К. Шумный Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2010, т.8, вып.3, с.98-103
	Роль экстраклеточных рибонуклеаз в физиологических процессах высших растений Сангаев С.С., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Левенко Б.А., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, №2, т.14, с.232-242
	Состояние и перспективы селекции розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) в Западной Сибири Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. Информационный вестник ВОГИС, 2010, № 1, Т. 14, С. 165-171.
	Cytotoxicity of new n-butylamino and sulfur-containing derivatives of polyfluorinated 1,4-naphthoquinone Olga A.Zakharova,Leonid I.Goryunov,Nadezhda M.Troshkova,Ludmila P.Ovchinnikova,Vitaliy D.Shteeingarts,Georgy A.Nevinsky EUR J MED CHEM, 2010, 45,270-274
	Трансгенные растения Nicotiana tabacum как генетическая модель для изучения роли нуклеаз в противовирусном иммунитете растений Савельева А. В., Трифонова Е. А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Т. 275. С. 309-311
	Трансформанты табака, экспрессирующие кДНК гена орнитинаминотрансферазы Medicago truncatula Герасимова С.В., Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Романова А.В., Коваль В.С., Кочетов А.В., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, 46, 7, 1000-1003
	Evaluation of Cytotoxity and Efficiency of Antioxidant Protection of Hidrophilic Derivatives of 2,4,6-Trialkylphenols in E coli Cellscherichia U.N.Rotskaya, L.P.Ovchinnikova, E.A.Vasunina, O.I.Sinitsina, N.V.Kandalintseva, E.A.Prosenko, G.A.Nevinsky. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2010, 4, 4, 377-382
	High frequency of somatic mutations in rat liver mitochondrial DNA Rotskaya U.N, Rogozin IB, Vasyunina EA, Malyarchuk BA, Nevinsky GA, Sinitsyna OI. MUTAT RES-FUND MOL M, 2010, 685(1-2):97-102
	Interrelations between the nucleotide context of human start AUG codon, N-end amino acids of the encoded protein and initiation of translation Volkova O.A. Kochetov A.V. Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2010, 27(5) 611-618
	On nucleotide solvent accessibility in RNA structure Singh H., Andrabi M., Kahali B., Ghosh T.C., Miziguchi K., Kochetov A.V., Ahmad S. GENE, 2010, 463, 41-48
	Sensibility to phytorhabdoviruses of transgenic tobacco plants Spivak N.Ya., Kochetov A.V., Lozova O.I., Levenko B.A., Yuzvenko L.V., Nikolaychuk M.V., Levchuk O.B., Didenko L.F., Trifonova E.A., Sangaev S.S. Scientific Bulletin of the Uzhgorod University (Series Biology), 2010, Vol. 27. P. 37-39
	Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R J INTEGR BIOINFORM, 2010, 7(1):148. doi: 10.2390/biecoll-jib-2010-148
	Анализ запасных белков (проламинов, пуроиндолинов и Waxy) у линий мягкой пшеницы Triticum aestivum L. x (Triticum timopheevii Zhuk. x Triticum tauschii) с комплексной устойчивостью к грибным инфекциям Обухова Л.В., Лайкова Л.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2010, №6, Т. 46, стр. 764-768
	Состояние и перспективы селекции розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria × ananassa Duch.) в Западной Сибири Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т.14., № 1
	Некоторые достижения в решении проблем семенной репродукции ремонтантных сортов крупноплодной земляники Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Кузнецова Л.Л. Материалы Международной научно-методической дистанционной конференции «Актуальные проблемы размножения ягодных культур и пути их решения», 2010
	Матроклинное наследование при скрещиваниях Fragaria x Potentilla Батурин С.О., Амброс Е.В., Кузнецова Л.Л. Фактори експериментальноiй еволюцiп органiзмiв, 2010, т8, 303-306
	Генетический контроль формирования окраски корнеплода у кормовой свеклы Мглинец А. В., Осипова З. А. Информационный вестник ВОГИС, 2010, № 4, Т. 14, С. 720-728.
	Зависимость цитотоксичности и антиокислительной активности аммониевых производных алкилфенолов от особенностей их структуры Роцкая У.Н., Овчинникова Л.П., Васюнина Е.А., Синицына О.И.,Дюбченко О.И., Кандалинцева Н.В., Просенко А.Е., Невинский Г.А. RUSS J BIOORG CHEM+, 2010, №4,36,563-569
	Инактивация гена Nk1 в растениях табака Nicotiana tabacum SR1 за счет РНК-интерференции Сангаев С.С., Трифонова Е.А., Титов С.Е., Романова А.В., Колодяжная Я.С., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В. RUSS J GENET+, 2010, Т.46. №1. С. 131-134
	Индукция регенерации in vitro при Agrobacterium-опосредованной трансформации инбредных линий подсолнечника Комисаренко А.Г., Михальская С.И., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н. Биотехнология, 2010, 3, 67 - 74
2009	Исследование запасных белков у интрогрессивных линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L. х Triticum timopheevi Zhuk.), устойчивых к листовой ржавчине Л. В. Обухова, Е. Б. Будашкина, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2009, т.45, №3, с. 313-321
	Особенности прорастания семян Fragaria vesca L. из нетипичных экотопов в Западной Сибири Батурин С.О. Сибирский экологический журнал, 2009, № 6. С.863-868.
	Поиск высокомолекулярных субъединиц глютенина Triticum timopheevi Zhuk. у линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L. x Triticum timopheevi Zhuk.) Л. В. Обухова, Е. Б. Будашкина, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2009, № 9. Т.45. С. 1292-1295
	Проявление агамоспермии при аутбридинге у Fragaria vesca L Батурин С.О. RUSS J GENET+, 2009, № 3, Т. 45, С. 369-374.
	Dark and light green tissues of tobacco leaves systemically infected with tobacco mosaic virus Burundukova O.L., Sapotsky M.V., Kochetov A.V., Trifonova E.A., Malinovsky V.I. BIOL PLANTARUM, 2009, V. 52. P. 294-300
	Трансгенные растения, толерантные к абиотическим стресса Колодяжная Я.С, Куцоконь Н.К., Левенко Б.А., Cютикова О.С., Рахметов Д.Б., Кочетов А.В. RUSS J GENET+, 2009, 43, 72-93
	PMAP: databases for analyzing proteolytic events and pathways Igarashi Y., Heureux E., Doctor K.S., Talwar P., Gramatikova S., Gramatikoff K, Zhang NUCLEIC ACIDS RES, 2009, 37 (Database issue):D611-618
	Анализ спектров соматических мутаций митохондриальной ДНК крыс линий OXYS и WISTAR Роцкая У. Н., Рогозин И. Б., Васюнина Е. А., Колосова Н.Г., Невинский Г. А., Синицына О. И. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, том 74, вып. 4, с. 532-541
	Антиокислительная активность тиофана [бис-(3-(3,5-ди-трет-бутил-гидроксифенил)пропил)сульфида] Овчинникова Л.П.,Роцкая У.Н.,Васюнина Е.А.,Синицына О.И.,Кандалинцева Н.В., Просенко А.Е.,Невинский Г.А. RUSS J BIOORG CHEM+, 2009, 35(3),417-427
	Атиокислительная активность тиофана [бис-(3-(3,5-ди-трет-бутил-4-гидроксифенил)пропил) сульфида] Овчиннникова Л.П., Роцкая У.Н., Васюнина Е.А., Синицина О.И., Кандалинцева Н.В., Просенко А.Е., Невинский Г.А. RUSS J BIOORG CHEM+, 2009, 35 (3), с. 417-423
	Иммуноглобулины класса G из крови здоровых крыс Wistar окисляют амины А.С. Толмачева, Н.Л. Василенко, Н.П. Заксас, О.И. Синицина, В.Н. Бунева, Г.А. Невинский Российский иммунологический журнал, 2009, 1, 3(12), 39-49
	Oxidoreductase activities of polyclonal IgGs from the sera of Wistar rats are better activated by combinations of different metal ions Anna S.Tolmacheva, Nataliya P. Zaksas, Valentina N. Buneva, Nataliya L. Vasilenko, Georgy A. Nevinsky J. molecular recognit, 2009, 22(1):26-37. doi: 10.1002/jmr.923.
2008	Качество зерна и муки интрогрессированных линий мягкой пшеницы с генами устойчивости к листовой ржавчине от Triticum timofeevi Л.В. Обухова Е.Б. Будашкина М.Ф. Ермакова Н.П. Калинина В.К. Шумный Сельскохозяйственная биология, 2008, №5, с. 38-42
	Молекулярные основы закона рядов гомологической изменчивости Н.И.Вавилова Рогозин И.Б., Глазко В.И., Кунин Е.В. Информационный вестник ВОГИС, 2008, т.12, N 3, 362-371
	Новые перспективные антиоксиданты на основе 2,6- диметилфенола Кемелева Е.А., Васюнина Е.А., Синицина О.И., ХомченкоА.С., Гросс М.А., Кандалинцева Н.В., Просенко А.Е., Невинский Г.А. RUSS J BIOORG CHEM+, 2008, Т. 34. С. 558-569.
	A Dual Origin of the Xist Gene from a Protein-Coding Gene and a Set of Transposable Elements E.A. Elisaphenko, N.N. Kolesnikov, A.I. Shevchenko, I.B. Rogozin, T.B. Nesterova, N. Brockdorff, S.M. Zakian PloS One, 2008, Jun 25;3(6):e2521
	Identification of murine B cell lines that undergo somatic hypermutation focused to A:T and G:C residues Bhattacharya P., Grigera F., Rogozin I.B., McCarty T., Morse H.C. III, Kenter A.L. EUR J IMMUNOL, 2008, V. 38, N 1, 227-239
	Alternative translation and hidden coding potential of eukaryotic mRNAs Kochetov A.V. BIOESSAYS, 2008, 30, 683-691
	uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs Kochetov A.V., Ahmad S., Ivanisenko V., Volkova O.A., Kolchanov N.A., Sarai A. FEBS LETT, 2008, 582. 1293-1297
	Анализ серий семян сахарной свеклы при апозиготоической репродукции Малецкий С.С., Малецкая Е.И., Юданова С.С., Колодяжная Я.С. RUSS J GENET+, 2008, том 74, вып. 4, с. 532-541
	Высокомолекулярные субъединицы глютенина у образцов пшениц - доноров иммунитета к грибным инфекциям Л.В.Обухова Информационный вестник ВОГИС, 2008, №4, т.12, с.734-738
	Высокоэффективная экспрессия В-субъединицы термолабильного энтеротоксина Escherichia coli в растениях с помощью вируса-вектора на основе генома X-вируса картофеля Равин Н.В., Куприянов В.В., Замчук Л.А., Кочетов А.В., Дорохов Ю.Л., Атабеков И.Г., Скрябин К.Г. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2008, 73, 1382-1389
	Изучение структуры популяций амаранта (Amaranthus L.) по изоферментным локусам Р. С. Юдина, С. С. Ибрагимова, Н. Б. Железнова Информационный вестник ВОГИС, 2008, № 3, Т. 12, С. 385-391
2007	Молекулярные механизмы системной устойчивости растений к вирусным инфекциям и способы повышения вирусоустойчивости путем трансгенеза Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2007, Т.127. С.13-24
	Наследование мутации ps у сахарной свеклы Мглинец А. В., Осипова З. А RUSS J GENET+, 2007, № 5, Т.V. 43, С. 647-652.
	Completion of the mapping of transcription start sites for the five-gene block subgenomic RNAs of beet yellows closterovirus and identification of putative subgenomic promoters Vitushkina M.V., Rogozin I.B., Jelkmann W., Koonin E.V., Agranovsky A.A. VIRUS RES, 2007, V. 128, N 1-2, 153-158
	Трансгенные растения табака Nicotiana tabacum SR1, экспрессирующие экстраклеточную рибонуклеазу Zinnia elegans Сангаев С.С., Трифонова Е.А., Титов С.Е., Романова А.В., Колодяжная Я.С., Комарова М.Л., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, Т. 43. 1002-1005.
	Трансформанты табака, экспрессирующие антисмысловую последовательность гена пролиндегидрогеназы, проявляют устойчивость к тяжелым металлам оследовательность гена пролиндегидрогеназы, проявляют устойчивость к тяжелым металлам Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Кочетов А.В., Трифонова Е.А., Романова А.В., Комарова М.Л., Коваль В.С., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, T.43. № 7. С. 994-998
	Эффективная экспрессия гена экстраклеточной рибонуклеазы Zinnia elegans в растениях табака Nicotiana tabacum SR1 Сангаев С.С., Трифонова Е.А., Титов С.Е., Романова А.В., Колодяжная Я.С., Комарова М.Л., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В., Шумный В. К. RUSS J GENET+, 2007, Т.43. № 7. С.1002-1005
	Evolution and diversification of lamprey antigen receptors: evidence for involvement of an AID-APOBEC family cytosine deaminase Rogozin IB, Iyer LM, Liang L, Glazko GV, Liston VG, Pavlov YI, Aravind L, Pancer Z. NAT IMMUNOL, 2007, V. 8, N 6, 647-656.
	Protection of transgenic tobacco plants expressing bovine pancreatic ribonuclease against tobacco mosaic virus Trifonova E. A., Sapotsky M.V., Komarova M. L., Scherban A.B., Shumny V.K., Polyakova A.M., Lapshina L.A., Kochetov A.V., Malinovsky V.I. PLANT CELL REP, 2007, V.26, P.1121-1126
	Наследование розовой окраски венчика у полиплоидов земляники (Fragaria L.) Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. Досягнення i проблеми генетики, селекцiп та бпотехнологiп, 2007
	AUG_hairpin: prediction of a downstream secondary structure influencing the recognition of a translation start site Kochetov A.V., Palyanov A., Titov I.I., Grigorovich D., Sarai A., Kolchanov N.A. BMC BIOINFORMATICS, 2007, 8(1):318
	Воплощение классических механизмов мутагенеза у про- и эукариот в гипермутагенезе и иммунном ответе у позвоночных Лада А.Г., Иер Л.М., Рогозин И.Б., Аравинд Л., Павлов Ю.И. RUSS J GENET+, 2007, V. 43, N 10, 1311-1327
	Индукция диплоидного партеногенеза у Fragaria vesca L Батурин С.О. Сибирский экологический журнал, 2007, № 6. С. 987-991
2006	ИЦиГ СО РАН и международные программы по генетике пшеницы Пшеничникова Т.А., Смирнова О.Г. Информационный вестник ВОГИС, 2006, №1, т. 10, 203-206
	Окисление гуанина в ДНК печени и легких преждевременно стареющих крыс OXYS Е. А. Кемелева, О.И. Синицина, K. A.Конлон, M. Берриоз, Н. Г. Колосова, Д. О. Жарков, Е. А. Васюнина, Г. А. Невинский BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2006, 71, 6, 760-767
	Оценка солеустойчивости растений табака Nicotiana tabacum, несущих антисмысловой супрессор гена пролиндегидрогеназы Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Кочетов А.В., Комарова М.Л., Романова А.В., Коваль В.С., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2006, Т.42.-№ 2.- с.278-281
	Потенциальные открытые рамки считывания в 5”-нетранслируемых районах эукариотических мРНК Волкова О. А., Кочетов А. В., Титов С. Е., Колчанов Н. А. BIOPHYSICS, 2006, 51(4), 615-21
	Статистический анализ последовательностей ДНК, содержащих сайты формирования нуклеосом Орлов Ю.Л., Левицкий В.Г., Смирнова О.Г., Подколодная О.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А BIOPHYSICS, 2006, №4, т.51, 608-614.
	Трансгенез как способ увеличения устойчивости растений к повышенным концентрациям тяжелых металлов Колодяжная Я.С., Кочетов А.В., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2006, Т. 126, № 5, С. 456–461
	Immunofluorescent detection of 8-oxoguanine DNA lesions in liver cells from aging OXYS rats, a strain prone to overproduction of free radicals Kemeleva E. A., Sinitsyna O.I., Kolosova N.G., Vasyunina E.A., Zharko D.O., Conlon K.A., Berrios M., Nevinsky G.A. MUTAT RES-FUND MOL M, 2006, No 1-2, Vol 599, pp. 88-97
	Use of Transgenic Carrot Plants Producing Human Interleukin-18 for Modulation of Mous Immune Reactions Якушенко У.В., Храпов Ю.А., Дейнеко Е.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Шумный В.К., Сенников Ы.В., Козлов В.А. In Book: New research on Biotechnology and Medicine. Eds.: Egorov A.M., Zaikov G.E. Nova Science Publishers, 2006, P.97-107
	Age-associated changes in oxidative damage and the activity of antioxidant enzymes in rats with inherited overgeneration of free radicals Sinitsyna O, Krysanova Z, Ishchenko A, Dikalova AE, Stolyarov S, Kolosova N, Vasunina E, Nevinsky G. J CELL MOL MED, 2006, No 1, Vol 10, pp. 206-215
	Roles of DNA polymerases in replication, repair, and recombination in eukaryotes Pavlov YI, Shcherbakova PV, Rogozin IB INT REV CYTOL, 2006, vol. 255, pp. 41-132
	Substrate specificity of rat sera IgG antibodies with peroxidase and oxidoreductase activities Ikhmyangan EN, Vasilenko NL, Sinitsina OI, Buneva VN, Nevinsky GA J MOL RECOGNIT, 2006, 5, 19, 432-440
	Альтернативные сайты инициации трансляции и их вклад в протеом эукариотических клеток Кочетов А.В. Molecular Biology, 2006, 40. 788-795
	Signs of positive selection of somatic mutations in human cancers detected by EST sequence analysis Babenko VN, Basu MK, Kondrashov FA, Rogozin IB, Koonin EV. BMC CANCER, 2006, 6:36
	Взаимосвязь контекстной организации сигнала инициации трансляции и аминокислотной последовательности на N-конце белков эукариот Волкова О.А., Титов С.Е., Кочетов А.В. BIOPHYSICS, 2006, 51(7)
	Генетический контроль признака "красная пигментация листа" у сахарной свеклы Мглинец А. В., Осипова З. А. Информационный вестник ВОГИС, 2006, № 3, Т.10, С. 588-593
	Генетическое изучение новой окраски у свеклы Beta vulgaris L. Мглинец А.В., Осипова З.А. RUSS J GENET+, 2006, №7. Т. 42. С. 936-938
2005	Analysis of evolution of exon-intron structure of eukaryotic genes Rogozin IB, Sverdlov AV, Babenko VN, Koonin EV BRIEF BIOINFORM, 2005, 6(2):118-134
	Conservation versus parallel gains in intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2005, 33(6):1741-1748
2004	Идентификация апомиксиса у Роа pratensis L. при помощи SDS-электрофореза запасных белков эндосперма Агафонов А.В., Сухарева Н.Б., Батурин С.О., Стружкина О.А. BIOL BULL+(RUS), 2004, № 1, 2004. С. 42-48.
	Reconstruction of ancestral protosplice sites Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2004, 4(16):1505-1508
	Preferential loss and gain of introns in 3' portions of genes suggests a reverse-transcription mechanism of intron insertion Sverdlov AV, Babenko VN, Rogozin IB, Koonin EV GENE, 2004, 338(1):85-91
	Prevalence of intron gain over intron loss in the evolution of paralogous gene families Babenko VN, Rogozin IB, Mekhedov SL, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2004, 32(12):3724-3733
2003	Evidence of splice signal migration from exon to intron during intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2003, 13(24):2170-2174
	Computational analysis of mutation spectra Rogozin IB, Babenko VN, Milanesi L, Pavlov YI BRIEF BIOINFORM, 2003, 4(3):210-227
	Application of filter technology in photomorphogenesis gene network Smirnova O.G., Stepanenko I.L. In Silico Biology, 2003, N.1-2. P. 117-125
2002	Iduction of apomixis in Fragaria x vescana Sukhareva N.B., Baturin S.O., Trajkovski K. Acta Hort. (ISHS), 2002, V. 567. P. 231-234.
2001	SDS-электрофорез белков эндосперма индивидуальных семян Poa pratensis L. (Poaceae) в эколого-генетических исследованиях Агафонов А.В., Стружкина О.А., Батурин С.О. Сибирский экологический журнал, 2001, № 6. 2001. С. 723-728.
	Сравнительно-морфологический анализ апомиктического потомства крупноплодной земляники Батурин С.О. Сельскохозяйственная биология, 2001, № 1. 2001. С. 39-43.
1999	The experimental apomixis in garden strawberry (Fragaria x ananassa Duch.) Baturin S.O., Sukhareva N.B. Apomixis newsletters, 1999, N 11. P. 15-17.
	Use of a rank correlation coefficient for comparing mutational spectra Babenko VN, Rogozin IB BIOPHYSICS, 1999, 44(4):632-638
1995	Перспективы улучшения биохимического состава плода Земляники крупноплодной при апомиксисе Батурин С.О., Сухарева Н.Б., Солоненко Л.П., Пфейфер В.И. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 1995, N 3-4. С.32-37.
	Использование апомиксиса для изучения наследования ремонтантности у Земляники крупноплодной (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Сухарева Н.Б., Малецкий С.И. Информационный вестник ВОГИС, 1995, Т. 31, N 10. С.1418-1424.
1994	Наследование пола у апомиктических сеянцев Земляники крупноплодной (Fragaria x ananassa Duch.) Малецкий С.И., Сухарева Н.Б., Батурин С.О. Информационный вестник ВОГИС, 1994, Т.30. N 2. С. 237-243.
	Усовершенствование методики приготовления постоянных цитологических препаратов Сухарева Н.Б., Батурин С.О. Ботанический журнал, 1994, Т.79, N 7. С. 131-133.

Монографии

2020	Choice of the promoter for tissue and developmental stage-specific gene expression. Smirnova O.G., Kochetov A.V.
2018	ВЕКТОРЫ И РЕПЛИКОНЫ ДЛЯ БИОИНЖЕНЕРИИ РАСТЕНИЙ: ОТ БИОПРОДУКЦИИ К ГЕНОМНОМУ РЕДАКТИРОВАНИЮ Герасимова С. В., Назаренко А. В., Кочетов А. В.
	CRISPR/CAS ДЛЯ СЕЛЕКЦИИ И ДОМЕСТИКАЦИИ РАСТЕНИЙ Хлесткина Е. К., Короткова А. М., Иванова К. А., Герасимова С. В.
2016	Векторы, репликоны и биопродукция в растениях Герасимова С.В., Назаренко А.В., Кочетов А.В.
2015	mRNA translational enhancers as a tool for plant gene engineering Kochetov A.V., Filipenko E.A., Nikulin P.S
	Promoters for transgenic horticultural plants Olga G. Smirnova, Elena N. Tishchenko, Anton А. Ermakov, Vladimir K. Shumny
2013	Degrees of Freedom. Ponomarenko M, Babenko V, Kochetov A, Kolchanov N
2010	Компьютерный генетический конструктор: математическое моделирование генетических и метаболических подсистем E. coli Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Ратушный А.В., Лашин С.А., Турнаев И.И., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Колчанов Н.А.
	Visualization and Analysis of Biological Networks combining Text Mining and Data Warehouse Approaches Björn Sommer, Evgeny S. Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian J. Janowski, Timofey V. Ivanisenko, Anatoly O. Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel S. Demenkov, Alexey V. Kochetov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov and Ralf Hofestädt
2009	Глютенины мягкой пшеницы Обухова Людмила Васильева
2008	Регуляторные последовательности ДНК: описание в базах данных. Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Степаненко И.Л., Хлебодарова Т.М., Меркулова Т.И., Меркулов В.М., Мищенко Е.Л., Ибрагимова С.С., Смирнова О.Г., Подколодный Н.Л., Ромащенко А.Г., Ощепков Д.Ю., Мигинский Д.С.
	Компьютерная транскриптомика. Трансляция. В монографии «Системная Компьютерная Биология». Под ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А. Кочетов А.В., Вишневский О.В., Волкова О.А., Владимиров Н.В., Лихошвай В.А. Матушкин Ю.Г., Григорович Д.А., Нишида Х., Сараи А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Пономаренко М.П., Титов И.И., Колчанов Н.А.
	Engineering of Broad Spectrum Resistance to Viral Infections in Transgenic Plants Trifonova E.A.
2006	STUDY OF THE INTERACTIONS BETWEEN VIRAL AND HUMAN GENOMES DURING TRANSFORMATION OF B CELLS WITH EPSTEIN-BARR VIRUS E. Ananko, D. Oshchepkov, E. Nedosekina, V. Levitsky, I. Lokhova, O. Smirnova, V. Likhoshvai, N. Kolchanov.
2004	Репродуктивная биология покрытосеменных растений. Генетический словарь Малецкий С.И., Левитес Е.В., Батурин С.О., Юданова С.С.

Конференции

2022	Увеличение размера корневой системы яровой мягкой пшеницы с использованием линии, несущей интрогрессию от Aegilops tauschii. Пшеничникова Т.А., Смирнова О.Г., Симонов А.В., Булатов И.О. 6-ая Международная конференции «Генофонд и селекция растений» (6th International Conference “Genepool and Plant Breeding”)
	Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T. 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T. 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Reconstruction and analysis of potato Solanum tuberosum pangenome of Siberian cultivars Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V., Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
	РЕКОНСТРУКЦИЯ И АНАЛИЗ ПАНГЕНОМА КАРТОФЕЛЯ SOLANUM TUBEROSUM СОРТОВ СИБИРСКОЙ СЕЛЕКЦИИ Каретников Д.И., Генаев М.А., Нестеров М.А., Ибрагимова С.М., Васильев Г.В., Тощаков С.В., Гавриленко Т.А., Афонников Д.А., Салина Е.А., Патрушев М.В., Кочетов А.В. III Международная научно-практическая конференция "Клеточная биология и биотехнология растений"
	ПОЛУЧЕНИЕ НОВЫХ ГЕНОТИПОВ КАРТОФЕЛЯ С УСТОЙЧИВОСТЬЮ К ХОЛОДОВОМУ ОСАХАРИВАНИЮ Егорова А.А., Герасимова С.В., Сабоиев И.А., Домрачев Д., Коэппель И., Хикель Ш., Хертиг К., Чамас С., Кумлен Й., Рогозина Е., Чалая Н., Салина Е.А., Кочетов А.В. XIX ВСЕРОССИЙСКАЯ МОЛОДЕЖНАЯ ШКОЛА-КОНФЕРЕНЦИЯ ПО АКТУАЛЬНЫМ ПРОБЛЕМАМ ХИМИИ И БИОЛОГИИ
	RECONSTRUCTION AND ANALYSIS OF PANGENOME OF SIBERIAN CULTIVARS OF POTATO SOLANUM TUBEROSUM Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Shmakov N.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V. III Всероссийская конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике» (HSG-2022)
2021	Influence of an introgression from Triticum timopheevii into chromosome 5A of bread wheat cultivars on diverse biological parameters under contrasting irrigation conditions. Simonov A.V., Smirnova O.G., Permyakov A.V., Permyakova M.D., Osipova S.V., Pshenichnikova T.A. The 6th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding, jointly organized with the Cereals Section of EUCARPIA
	Using wild strawberry of the Sakha (Yakutia) Republic in breeding large-fruited strawberry (Fragaria x ananassa Duch.) Baturin S., Belevtzova V. NORTHERN ASIA PLANT DIVERSITY: CURRENT TRENDS IN RESEARCH AND CONSERVATION
	Influence of an introgression from Triticum timopheevii into chromosome 5A of bread wheat cultivars Saratovskaya 29 and Diamant 2 on agronomical, physiological and biochemical parameters under contrasting irrigation conditions. Simonov A.V., Smirnova O.G., Permyakov A.V., Permyakova M.D., Osipova S.V., Pshenichnikova T.A. PLANT GENETICS, GENOMICS, BIOINFORMATICS, AND BIOTECHNOLOGY (PLANTGEN2021)
	Locus Hl, determining leaf pubescence in the genus Triticum L., as a marker of non-homoeological rearrangement 4A/5A/7B, its phenotypic expression and role in adaptation to drought. Pshenichnikova T.A., Simonov A.V., Smirnova O.G., Permyakov A.V., Permyakova M.D., Osipova S.V. PlantGen2021
	Можно ли из анализа генов предрасположенности к аутизму сделать вывод об аутоиммунной природе расстройства? Е. Трифонова, А. Клименко, З. Мустафин, Е. Иванова, С. Лашин IX Международная научно-практическая конференция "Аутизм. Вызовы и решения"
	Developing potato varieties with decreased cold-induced sweetening Egorova A., Gerasimova S., Ibragimova S., Romanova A., Saboiev I., Domrachev D., Koeppel I., Hertig C., Hiekel S., Chamas S., Kumlehn J., Rogosina E., Chalaya N., Salina E., Kochetov A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Regeneration capacity of potato cultivars prone to cold sweetening Ibragimova S., Romanova A., Saboiev I., Salina E., Kochetov A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Comparative assessment of sugar accumulation in commercial potato cultivars (Solanum tuberosum L.) for genome editing Saboiev I., Ibragimova S., Egorova A., Salina E., Kochetov A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
	Phenotypic characteristics of tobacco plants harboring mutations in nicotine biosynthesis genes from PMT and QPT gene families. Kostina N.E. Lykhina A.V., Domrachev D.V., Spaselnikova A.V., Tomilin M.A., Romanova A.V., Chamas S., Kumlehn J., Gerasimova S.V. 6th International Scientific Conference PlantGen
	Ежегодная Сибирская межрегиональная конференция «Современные подходы к организации юннатской деятельности» (г. Новосибирск) как ресурс педагога в реализации средового подхода в дополнительном образовании детей Батурин С.О., Стекленева А.И., Зубова С.В. «Научное наследие В.И. Верещагина: прошлое, настоящее, будущее»
2020	Создание генофонда скороспелых ремонтантных F1 гибридов крупноплодной земляники (Fragaria × ananassa Duch.) Батурин С.О. V Международная конференция «Генофонд и селекция растений»
	Взаимосвязь между размерами корневой системы и генетическим статусом локуса Vrn-1 у мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.) Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В., Смирнова О.Г. 5ая Международная конференции «Генофонд и селекция растений»
	Виды рода FRAGARIA L. Центральной, Северной и Восточной Монголии Батурин С.О., Товуудорж Н., Филипенко Е.А., Жигмед Г. Всероссийская конференция с участием иностранных ученых «Растительное разнообразие: состояние, тренды, концепция сохранения»
	Анализ профиля экспрессии миРНК в клетках костного мозга при лимфоидных и миелоидных опухолях. Веряскина Ю. А., Титов С. Е., Воронцова Е.В., Ковынев И.Б., Поспелова Т.И. VI ПЕТЕРБУРГСКИЙ МЕЖДУНАРОДНЫЙ ОНКОЛОГИЧЕСКИЙ ФОРУМ "БЕЛЫЕ НОЧИ 2020»
	(EP383) MICRORNA EXPRESSION PROFILING AS AN INSTRUMENT IN IDENTIFICATION OF ACUTE LEUKEMIAS. Y.A. Veryaskina, S.E. Titov, M.M. Agakishiev, A.V. Zabela, M.A. Kolesnikova, V.S. Selivanov, S.P. Melihov, P.S. Ruzankin, I.B. Kovynev, T.I. Pospelova, I.F. Zhimulev 25th Congress of the European Hematological Association — EHA (2020)
	(PB1818) MICRORNA EXPRESSION PROFILES HAVE SPECIFIC POINTS IN SUBGROUPS OF ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA Y.A. Veryaskina, S.E. Titov M.M. Agakishiev, A.V. Zabela, M.A. Kolesnikova, V.S. Selivanov, S.P. Melihov, P.S. Ruzankin, I.B. Kovynev, T.I. Pospelova, I.F. Zhimulev. 25th Congress of the European Hematological Association — EHA (2020)
	Анализ профиля экспрессии микроРНК в клетках костного мозга при лимфоидных и миелоидных опухолях Веряскина Ю.А. Золото «Белых ночей»: МикроРНК: перспективы применения в диагностике, прогнозировании и мониторинге онкологических заболеваний
	Выявление злокачественных опухолей щитовидной железы в мазках с неопределенным цитологическим заключением с помощью молекулярного классификатора. Титов СЕ, Иванов МК, Веряскина ЮА, Деменков ПС, Шевченко СП, Катанян ГА, Лукьянов СА. VI ПЕТЕРБУРГСКИЙ МЕЖДУНАРОДНЫЙ ОНКОЛОГИЧЕСКИЙ ФОРУМ "БЕЛЫЕ НОЧИ 2020»
	Эпигенетические механизмы регуляции опухолевой прогрессии при первичном и вторичном миелоидном лейкозе Веряскина Ю. А., Титов С. Е., Агакишиев М. М., Ковынев И. Б., Поспелова Т. И. V Конгресс гематологов России
	Возможности микро-РНК-профилирования в дифференциальной диагностике острых лейкозов и бластных форм миелодисплазий Ковынев И. Б., Поспелова Т. И., Веряскина Ю. А., Титов С. Е., Забела А. В., Селиванов В. С., Мелихов С. П., Воронцова Е. В., Колесникова М. А., Агакишиев М. М. V Конгресс гематологов России
	Направленный нокаут гена вакуолярной инвертазы Pain-1 в Solanum tuberosum L. Егорова А.А., Герасимова С.В., Коэппель И., Хамаз С., Хикель Ш., Хертиг К., Ибрагимова С.М., Сабоиев И.А., Нестеров М.А., Кумлен Й., Салина Е.А., Кочетов А.В. SBB-2020
	САЙЛЕНСИНГ ФИТОЕНДЕСАТУРАЗЫ N. BENTHAMIANA C ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ДЦРНК, СИНТЕЗИРОВАННОЙ IN VIVO В. А. Черенко, Е. А. Филипенко, Т. С. Фролова Современная биотехнология: актуальные вопросы, инновации и достижений
	Постинфекционные аутоиммунные осложнения (PANS/PANDAS/SC) и аутизм: коморбидные расстройства или общий патогенез? Трифонова Е.А., Клименко А.И., Лашин С.А. VIII Международная научно-практическая конференция "Аутизм. Вызовы и решения"
2019	Fine tuning of anthocyanin synthesis in barley grain by targeted mutagenesis Alexandr Vikhorev, Ksenia Strygina, Sofia Gerasimova, Elena Khlestkina 5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding (CBB 5)
	Cytotoxic activity of octahedral molybdenum clusters with cyclodextrin and their intracellular distribution Tatiana S. Frolova, Alexander Y. Alekseev, Anton A. Ivanov, Clément Falaise, Emmanuel Cadot, Michael A. Shestopalov XXVII. INTERNATIONAL CONFERENCE ON COORDINATION AND BIOINORGANIC CHEMISTRY
	ОПТИМИЗАЦИЯ МЕТОДА ДНК КОМЕТ ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ ОДНО- И ДВУНИТЕВЫХ РАЗРЫВОВ В РАСТИТЕЛЬНЫХ КЛЕТКАХ Фролова Т. С., Синицина О. И. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	Экстракты базидиальных грибов порядков AGARICALES, POLYPORALES И HYMENOCHAETALES, обладающие противовирусной активностью Проценко М.А., Макаревич Е.В., Ибрагимова Ж.Б., Филиппова Е.И., Костина Н.Е., Горбунова И.А., Власенко В.А. Научно-практическая конференция по медицинской микологии
	Создание и оценка гибридного материала для селекции нейтральнодневной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) в Западной Сибири. Батурин Сергей Олегович, Кузьмина Арина Ариановна Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference
	РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО ФЕНОТИПИРОВАНИЯ РАСТЕНИЙ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы.
	WildPetotaDB – a database for genotype and phenotype of wild tuber-bearing species of the genus Solanum L. Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В. Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference
	Биоинформационный анализ путей регуляции экспрессии генов предрасположенности к аутизму Клименко А.И., Трифонова Е.А., Лашин С.А., Кочетов А.В. Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
	The genetic analysis of root size in bread wheat under contrasting water regimes Pshenichnikova T., Simonov A., Morozova E., Shchukina L., O. Smirnova, Börner A. The 5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding
	Dysregulation of postsynaptic translation in autism spectrum disorder: reconstruction of gene network associated with autism and mtor signaling. Rifonova E.A., Klimenko A.I., Saik O.V., Orlov Y.L., Lashin S.A., Ivanisenko V.A. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
2018	НОКАУТ КЛЮЧЕВЫХ ГЕНОВ БИОСИНТЕЗА НИКОТИНА N. TABACUM МЕТОДОМ РНК-НАПРАВЛЕННОГО МУТАГЕНЕЗА Спасельникова А.В., Егорова А.А., Домрачев Д.В., Кочетов А.В., Герасимова С.В. XVIII научная конференция молодых ученых "Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии"
	Выбор целевых сайтов и направляющих РНК для нокаута генов Nud и Vrs1 ячменя при помощи РНК-направленной эндонуклеазы Герасимова С.В., Хертиг К., Короткова А.М., Хикель С., Кумлен Й., Кочетов А.В., Хлесткина Е.К. Генофонд и селекция растений
	Genetic mechanisms of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in Solanum phureja A.A. Egorova, N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya, K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology” – BGRS\SB-2018
	ФЕНОТИПИЧЕСКИЙ И ГЕНОТИПИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ СИБИРСКИХ ЯРОВЫХ СОРТОВ ЯЧМЕНЯ С РАЗЛИЧНЫМ РЕГЕНЕРАЦИОННЫМ ПОТЕНЦИАЛОМ Короткова А.М., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. Генофонд и селекция растений
	Altering Barley Agronomic Traits via Targeted Mutagenesis Sophia V. Gerasimova, A.M. Korotkova, C. Hertig, I. Otto, S. Hiekel, J.Kumlehn, A.V. Kochetov, E.K. Khlestkina. BGRS-2018
	Reconstruction of Gene Networks Associated with Autism and Related to mTOR Signaling Pathway using ANDSystem O.V. Saik, E.A. Trifonova, T.M. Khlebodarova, V.A. Ivanisenko BGRS\SB-2018
	THE GAME GENES AS A TARGET FOR DE NOVO DOMESTICATION OF WILD POTATO GERASIMOVA S.V., IVANOVA K.A., KHLESTKINA E.K. 10-ая ШКОЛА МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ «Системная биология и Биоинформатика», SBB-2018
	МИКРОСАТЕЛЛИТНЫЙ АНАЛИЗ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ ЕГОРОВА А.А., ИВАНОВА К.А., КОЛОШИНА К.А., ГЕРАСИМОВА С.В. БИОТЕХНОЛОГИЯ В РАСТЕНИЕВОДСТВЕ, ЖИВОТНОВОДСТВЕ И ВЕТЕРИНАРИИ
	РАЗРАБОТКА МЕТОДИК ФЕНОТИПИРОВАНИЯ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ КОЛОШИНА К.А., ИВАНОВА К.А., КОМЫШЕВ Е.Г., ГЕНАЕВ М.А., КОЧЕТОВ А.В., ГЕРАСИМОВА С.В. "ДЕНЬ ПОЛЯ" В РАМКАХ КПНИ ФАНО РОССИИ "РАЗВИТИЕ СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВА КАРТОФЕЛЯ" И НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ И ПРИКЛАДНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ В СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВЕ КАРТОФЕЛЯ"
	Применение системы редактирования генома Cas9/gRNA для доместикации картофеля de novo К.А. Иванова, С.В. Герасимова, А.А. Егорова, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.В. Домрачев, К.А. Колошина, А.В. Кочетов, Е.К. Хлесткина Crispr-2018
	Промоторы картофеля для экспрессии трансгенов Смирнова О.Г. Актуальные проблемы картофелеводства: фундаментальные и прикладные аспекты
	Использование промоторов генов картофеля для регуляции экспрессии целевых генов у трансгенных растений Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля
	Genetic control of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in potato plants Solanum phureja A.A.Egorova, N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya, K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov "PLANT FUNCTIONING UNDER ENVIRONMENTAL STRESS" SEPTEMBER 12 - 15, 2018, CRACOW, POLAND.
	Изучение роли экстраклеточных рибонуклеаз в фитопатогенезе у растений на примере трансгенных растений картофеля, несущих ген экстраклеточной рибонуклеазы цинии ZRNase. С.М. Ибрагимова, Е.А. Трифонова, Е.А. Филипенко, А.В. Кочетов Механизмы устойчивости растений и микроорганизмов к неблагоприятным условиям среды.
	Перспективы использования сортов картофеля сибирской селекции в генно-инженерных работах. С. М. Ибрагимова, А.В.Романова, Г.Х. Мызгина, А.В. Кочетов КПНИ ФАНО Росси, научная конференция «Развитие селекции и семеноводства картофеля» и научной конференции «Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля»
	НОКАУТ КЛЮЧЕВЫХ ГЕНОВ БИОСИНТЕЗА НИКОТИНА N. TABACUM МЕТОДОМ РНК-НАПРАВЛЕННОГО МУТАГЕНЕЗА Спасельникова А.В., Егорова А.А., Кочетов А.В., Герасимова С.В. IV международная конференция «Генофонд и селекция растений» (4-6 апреля 2018 г., Новосибирск, россия ISBN 978-5-91291-034-0
2017	О системах скрещивания в природных популяциях Fragaria vesca L. в Западной Сибири Батурин С.О. VI Международная научная конференция "Проблемы изучения растительного покрова Сибири", посвященная 100-летию со дня рождения профессора А.В. Положий
	Расстройства аутистического спектра как проявление нарушений функций синапсов. Трифонова Е.А., Хлебодарова Т.М., Когай В.В., Лихошвай В.А. Всероссийская научно-практическая конференции с международным участием "Современные проблемы клинической психологии и психологии личности"
	Сложная динамика локальной трансляции в синапсе: математическая модель Е.А. Трифонова, Т.М. Хлебодарова, В.В. Когай, В.А. Лихошвай Международная конференция, посвященная столетию со дня рождения академика АН СССР Д.К.Беляева «Беляевские чтения»
	SCREENING OF THE RUSSIAN SPRING BARLEY COLLECTION TO SELECT TARGET CULTIVARS AND TARGET GENES FOR FURTHER CRISPR/CAS9-EDITING A.M. Korotkova, S.V. Gerasimova, T.V. Kukoeva, E.K. Khlestkina Systems Biology and Bioinformatics THE NINTH INTERNATIONAL YOUNG SCIENTISTS SCHOOL SBB-2017
	Screening the collection of Russian soft wheats to develop novel technology of their conversion to hard-grained cultivars . Fomin1 I., Morozova E., Korotkova A., Khlestkina E. The 9th International Young Scientists School "Systems Biology and Bioinformatics", SBB-2017
	CROP GENES MODIFIED USING CRISPR/CAS9 SYSTEM: SYSTEMATIC ANALYSIS OF PUBLISHED REPORTS Korotkova A.M., Gerasimova S.V., Shumny V.K., Khlestkina E.K. the 4th International conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)
	Динамические нарушения системы локального биосинтеза белка в синапсе при расстройствах аутистического спектра Трифонова Е.А. V Международная научно-практическая конференция "Аутизм. Вызовы и решения"
	СКРИНИНГ КОЛЛЕКЦИИ ЯРОВОГО ЯЧМЕНЯ НА СПОСОБНОСТЬ К КАЛЛУСООБРАЗОВАНИЮ, РЕГЕНЕРАЦИИ, ТРАНСФОРМАЦИИ И РАЗРАБОТКА ДИАГНОСТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ДЛЯ ГЕНОВ NUD И VRS1 Короткова А.М., Герасимова С.В., Кукоева T.В., Хлесткина E.K. Генофонд и селекция растений, 3-я Международная конференция, посвященная 130-летию Н.И. Вавилова
	Genome editing in Siberian barley. Gerasimova S.V., Korotkova A.M., Khlestkina E.K. the 4th International conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)
	ПОСТАНОВКА МЕТОДА ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ДЛЯ СИБИРСКИХ СОРТОВ ЯРОВОГО ЯЧМЕНЯ С.В. Герасимова, А.М. Короткова, Е.К. Хлесткина БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	Анализ транскрипционной регуляции промотора гена орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana A.A. Егорова, В.В. Горелова, С.В. Герасимова БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	ТРАНСГЕННЫЕ РАСТЕНИЯ КАРТОФЕЛЯ, НЕСУЩИЕ ГЕН ЭКСТРАКЛЕТОЧНОЙ РИБОНУКЛЕАЗЫ ЦИНИИ (ZRNaseII), КАК МОДЕЛЬ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОНТРОЛЯ УСТОЙЧИВОСТИ К ФИТОПАТОГЕНАМ С.М. Ибрагимова, Е.А. Трифонова, Е.А. Филипенко, А.В. Кочетов «Беляевские чтения»: Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева.
	Создание базы данных и реконструкция генной сети ответа пшеницы на патогенную инфекцию Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Генофонд и селекция растений, 3-я Международная конференция, посвященная 130-летию Н.И. Вавилова
	Механизмы устойчивости пшеницы к патогенным грибам Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Беляевские чтения: Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева (7-10 августа 2017 г., Новосибирск, Россия)
	ЗНАЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ КОЛЛЕКЦИЙ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ЗАДАЧ ПРЯМОЙ И ОБРАТНОЙ ГЕНЕТИКИ РАСТЕНИЙ Хлесткина Е.К.*, Афонников Д.А., Бернер А., Быкова И.В., Васильев Г.В., Герасимова С.В., Глаголева А.Ю., Гордеева Е.И., Григорьев Ю.Н., Короткова А.М., Пшеничникова Т.А., Стрыгина К.В., Шацкая Н.В., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Юдина Р.С. III МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ГЕНОФОНД И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ», ПОСВЯЩЕННАЯ 130-ЛЕТИЮ Н.И. ВАВИЛОВА (28.03. – 30.03.2017)
	Assessment of translation efficiency from ribosome profiling and mRNA-seq data. Yevshin I.S., Sharipov R.N., Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow
	Prediction of start codons and mRNA translation efficiency using RiboSeq-based weight matrices. Kondrakhin Yu.V., Sharipov R.N., Volkova O.A. Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow
	Сравнительный анализ особенностей организации нуклеотидных последовательностей mRNA и длинных некодирующих lncRNA Волкова О.А., Кондрахин Ю.В., Шарипов Р.Н. XVI Российская конференция «Распределенные информационно - вычислительные ресурсы. Наука - цифровой экономике»
	Ribo-seq DB – a repository of selected human and mouse Ribo-seq and RNA-seq data. Sharipov R.N., Yevshin I.S., Kondrakhin Volkova O.A II Всероссийской конференции с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике"
	Assessment of translation efficiency from Ribo-seq and mRNA-seq data. Yevshin I.S., Sharipov R.N., Volkova O.A. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике"
	Ribo-seq DB – a repository of selected human and mouse Ribo-seq and RNA-seq data. Sharipov R.N., Yevshin I.S., Kondrakhin Volkova O.A II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике"
	CRISPR/Cas FOR PLANT DOMESTICATION AND BREEDING KHLESTKINA E.K., KOROTKOVA A.M., GERASIMOVA S.V., IVANOVA K.A., KOCHETOV A.V., SHUMNY V.K. Международная конференция, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева.
	ГЕНЫ SP И SGT ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ КАК МИШЕНИ ДЛЯ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ С ЦЕЛЬЮ ДОМЕСТИКАЦИИ DE NOVO Иванова К.А., Герасимова С.В., Кочетов А.В., Рогозина Е.В., Киру С.Д., Хлесткина Е.К. IV ВАВИЛОВСКАЯ МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ИДЕИ Н. И. ВАВИЛОВА В СОВРЕМЕННОМ МИРЕ"
2016	Roles of pathogenesis related-10 proteins in biotic and abiotic stresses in comparison with heterologous ribonucleases Trifonova E.A. BGRS/SB’16, Novosibirsk 2 nd IC&G SB RAS – Tohoku University Open Joint Seminar on Education and Research in High-Tech for Plant Production
	Молекулярные механизмы аутизма как одного из видов нарушений развития и функций синапсов Трифонова Е.А. IV Международная научно-практическая конференция "Аутизм. Вызовы и решения"
	Создание генофонда стрессовоустойчивых гибридов для селекции крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) в Западной Сибири Кузьмина А.А., Батурин С.О. II Международная конференция Генофонд и селекция растений, посвящённая 80-ти летию СибНИИРС
	Создание генофонда стрессовоустойчивых гибридов для селекции крупноплодной земляники (Fragaria х ananassa Duch.) в Западной Сибири. Кузьмина А.А., Батурин С.О. II Международная конференция «Генофонд и селекция растений», посвященная 80-летию СибНИИРС
	Identification and tagging of allelic variants of the Nud gene in the siberin barley collection Korotkova A., Kukoeva T., Gerasimova S., Khlestkina E. The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)
	Виды рода Fragaria L. Западной и Восточной Сибири Батурин Сергей Олегович Флора и растительность Сибири и Дальнего Востока: Чтения памяти Л.М. Черепнина и материалы шестой Всероссийской конференции с международным участием, посвященные 110-лению со дня рождения Л.М. Черепнина и 80-летию Гербария им. Л.М. Черепнина (KRAS)
	Оценка эффективности трансляции на основании данных рибосомного профилирования и mRNA-seq ИС Евшин, ОА Волкова,ФА Колпаков NGS в медицинской генетике
	ASSESSMENT OF TRANSLATION EFFICENCY FROM RIBOSOME PROFILING AND MRNA-SEQ DATA I.S. Yevshin, R.N. Sharipov, O.A. Volkova The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. BGRS2016 Novosibirsk, Russia
	ASSESSMENT OF TRANSLATIONAL IMPORTANCE OF MAMMALIAN MRNA SEQUENCE FEATURES BASED ON RIBO- AND MRNA-SEQ DATA Yu.V. Kondrakhin, R.N. Sharipov, O.A. Volkova The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. BGRS 2016 Novosibirsk, Russia
	Knockout of Nud and Vrs genes in barley using CRISPR/Cas system Gerasimova S.V., Kochetov A.V., Khlestkina E.K. The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)
	The plant δOAT gene is active in proliferating tissues Egorova A.A., Kochetov A.V., Gerasimova S.V. The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)
	База данных генов устойчивости пшеницы к патогенным грибам Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Всероссийская конференция с международным участием «50 лет ВОГиС: успехи и перспективы»
	Reconstruction of the gene network of the wheat response to fungal pathogens Smirnova O.G., Kochetov A.V. The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)
2015	RNA-binding and/or RNA hydrolytic activities in the resistance of higher plants to phytopathogens Trifonova E.A. Tohoku University-Russian Academy Joint Seminar on Education and Research in High-Tech for Plant Production
	Перспективы селекции розовоцветковой ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Хапова С.А. Всероссийская научно-практическая конференции «Фундаментальные и прикладные аспекты развития актуальных направлений генетики, биотехнологии и вирусологии садовых растений»
	Формирование генофонда для получения сортов F1 ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Аполинарьева И.К. Всероссийская научно-практическая конференция "Фундаментальные и прикладные аспекты развития актуальных направлений в генетике, биотехнологии и вирусологии садовых растений"
	Plant promoters for specific transgene expression in tomato Smirnova O.G., Kochetov A.V. The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology” PlantGen 2015
	ИСПОЛЬЗОВАНИЕ КОМПЬЮТЕРНОЙ ТЕХНОЛОГИИ GeneNet ДЛЯ РЕКОНСТРУКЦИИ ФРАГМЕНТОВ ГИБРИДНОЙ ГЕННОЙ СЕТИ СИМБИОТИЧЕСКОЙ АЗОТФИКСАЦИИ Ибрагимова С.М., Степаненко И.Л. Фундаментальные и прикладные проблемы современной экспериментальной биологии растений
	Estimation of translational importance of mammalian mRNA nucleotide sequence characteristics based on ribosomal profiling data O.A. Volkova, Y.V. Kondrakhin, R.N. Sharipov Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15)
2014	The mRNA features important for translation initiation revealing using ribosome profiling data Gluschenko O., Sharipov R. N., Kondrakhin Yu.V., Volkova O.A. The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. BGRS\SB-2014
	Получение качественного посевного материала семянок сортов ремонтантной крупноплодной земляники Аполинарьева И.К., Батурин С.О., Петрук В.А., Боровикова Т.В. XVII Международная научно-практическая конференция "Аграрная наука - сельскохозяйственному производству Сибири, Монголии, Казахстана и Болгарии"
	KINET 1.0 - a new web database on kinetics data and parameters for E.coli metabolic pathways Ermak T.V., Akberdin I.R., Timonov V.S., Mischenko E.L., Oshchepkova E.A., Perfilyeva O.A., Smirnova O.G., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A. 9th BGRS\SB-2014
	Несоответствие между канцерогенной и мутагенной активностью орто-аминоазотолуола и 3 - метил -4-диметиламиноазобензола в опытах на подсосных мышатах. Попова Н.А ,ОвчинниковаЛ.П.,Каледин В.И. VI Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров и ассоциированные генетические симпозиумы
	Генетический контроль строения корневой системы и её связь со скоростью развития растения у мягкой пшеницы (Triticum aestivum L). Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В., Щукина Л.В., Смирнова О.Г., Бёрнер А. VI Съезд ВОГИС
2013	Antineoplastic properties of pomolic acid isolated from Chamaenerion angustifolium T. Frolova, O. Sinitsyna, T. Kukina The 38th FEBS Congress “Mechanisms in Biology” July 6-11, 2013 in St. Petersburg.
	Computer analysis of transcription factor binding sites in genome scale based on ChIP-seq data Yuriy L. Orlov, Vladimir A. Ivanisenko, Alexey V. Kochetov, Nikolay A. Kolchanov German-Russian Forum Biotechnology, Rostock 2013
	SOMATIC POINT MUTATIONS IN THE PROTEIN-CODING REGION OF MITOCHONDRIAL DNA OBTAINED FROM HIPPOCAMPUS OF WISTAR RATS Лощенова Полина Сергеевна, Рогозин Игорь Борисович, Малярчук Борис Аркадьевич, Синицына Ольга Ивановна Нестабильность генома, Эволюция и Заболевания человека
	ВОЗРАСТНАЯ ДИНАМИКА ЧАСТОТЫ СОМАТИЧЕСКИХ ТОЧКОВЫХ МУТАЦИЙ В БЕЛОК-КОДИРУЮЩЕМ РАЙОНЕ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК ГИППОКАМПА КРЫС ЛИНИИ WISTAR. Лощенова П. С., Синицына О. И. VI ВСЕРОССИЙСКИЙ С МЕЖДУНАРОДНЫМ УЧАСТИЕМ КОНГРЕСС МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ-БИОЛОГОВ «СИМБИОЗ – РОССИЯ 2013»
	Сегрегация признака «окраска венчика» в инбредных потомствах розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. Фактори експериментальноï еволюцiï органiзмiв
	Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней Arabidopsis thaliana L. Миронова В.В., Кузнецова Л.С., Филипенко Е.А., Климова Н.В., Васильев Г.В., Кочетов А.В. International Conference ” High-Throughput Sequencing in Genomics”
	Использование информационного ресурса TGP для создания генетических конструкций с чувствительными к солевому стрессу промоторами Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Конференция ВОГиС «Проблемы генетики и селекции»
	Новый подход к оценке исходного материала для получения высокопродуктивных форм растений. Вайшля О.Б., Смирнова О.Г. Конференция ВОГиС «Проблемы генетики и селекции»
	База данных БВИР-интернет ресурс для поддержки и планирования экспериментов по трансгенезу растений. Ибрагимова С.М., Смирнова О.Г., Рассказов Д. А., Кочетов А.В. Инновационные направления современной физиологии растений
	Генно-инженерный подход к решению проблемы устойчивости растений к абиотическому стрессу. Ибрагимова С.М., Кочетов А.В. X Международная конференция «Биология клеток растений in vitro и биотехнология»
2012	Построение и анализ математической модели mTOR сигнального пути Акбердин И.Р., Трифонова Е.А., Гайнова И.А., Макашева В.А., Шорина А.Р., Лихошвай В.А. Четвертая международная конференция «Математическая биология и биоинформатика»
	THE MODEL FOR AUXIN REGULATED AtPIN1 EXPRESSION IN THE ROOT APICAL MERISTEM А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, С.С. Сангаев, Н.А. Омельянчук, А.В. Кочетов, В.В. Миронова The 2nd International Conference "Plant Genetics, Genomics and Biotechnology"
	Dynamical and structural analysis of an apoptosis network in hepatitis C. Stepanenko I.L., Smirnova O.G. Eghth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \Systems Biology (BGRS'2012)
	A central regulatory circuit of arabidopsis circadian clock gene network Smirnova O.G., Stepanenko I.L. Eghth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \Systems Biology (BGRS'2012)
	Исследование регуляторных районов PIN1 гена Arabidopsis thaliana L. (Study of PIN1 regulatory regions in Arabidopsis thaliana L. А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, И.В. Миронова, С.С. Сангаев, А.В. Кочетов, В.В. Миронова II (X) Международная Ботаническая Конференция молодых ученых в Санкт-Петербурге, 11-16 ноября 2012 года
	«Наследование ремонтантности в сибирских популяциях Fragaria vesca L.» Батурин С.О. "Досягнення i проблеми генетики, селекцiï та бïотехнологiï", ІХ з’їзді Українське товариства генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова
	Эпигенетический контроль типа пола у Fragaria x ananassa Duch. Батурин С.О. IV Международная школа для молодых ученых «Эмбриология, генетика и биотехнология"
	Особенности интродукции и перспективы использования розовоцветковой земляники (Fragaria × ananassa Duch.) в Западной Сибири Батурин С.О. Интродукция, сохранение и сипользование биологического разнообразия мировой флоры, Материалы Международной конференции, посвященной 80-летию ЦБС НАН Беларуси
	Быстрый поиск промоторов растений для трансгенеза Смирнова О.Г., Кочетов А.В. IV Всероссийский симпозиум "ТРАНСГЕННЫЕ РАСТЕНИЯ: технология создания, биологические свойства, применение, биобезопасность"
	Трансгенные растения табака с модифицированным паттерном экспрессии генов метаболизма пролина как модель для изучения роли пролина в устойчивости растений к стрессу. Ибрагимова С.С., Кочетов А.В. IV Всероссийский симпозиум «Трансгенные растения: технологии создания, биологические свойства, применение, биобезопасность»
	РОЛЬ РНК-СВЯЗЫВАЮЩЕЙ И ГИДРОЛИТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЕЙ В УСТОЙЧИВОСТИ РАСТЕНИЙ К ФИТОПАТОГЕНАМ Трифонова Е.А., Романова А.В., Филипенко Е.А., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В. Научное наследие Н.И. Вавилова и современность
	THE ROLE OF EXTRACELLULAR NUCLEASES AND RNA-BINDING ACTIVITY IN THE RESISTANCE OF HIGHER PLANTS TO PHYTOPATHOGENS E.A. Trifonova, A.V. Savelyeva, A.V. Romanova, E.A. Filipenko, M.V. Sapotsky, V.I. Malinovsky, A.V. Kochetov 2nd International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”
	Использование гипергеометрической модели распределения вероятностей при анализе наследования окраски венчика у Fragaria x ananassa Duch. Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. 5-ая международная научно-практическая конференция «АГРОИНФО-2012»
2011	ОТНОСИТЕЛЬНОЕ КОЛИЧЕСТВО МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК И МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДЕЛЕЦИИ В ГИППОКАМПЕ КРЫС ЛИНИЙ OXYS И WISTAR В ПРОЦЕССЕ СТАРЕНИЯ Лощенова Полина Сергеевна Роцкая Ульяна Николаевна Синицына Ольга Ивановна VIII Международная конференция "Молекулярная генетика соматических клеток"
	ВИТАМИН Е И SKQ ПРЕДОТВРАЩАЮТ НАКОПЛЕНИЕ ДЕЛЕТИРОВАННОЙ мтДНК В ГИППОКАМПЕ КРЫС ПРИ ПРЕЖДЕВРЕМЕННОМ СТАРЕНИИ Лощенова Полина Сергеевна Роцкая Ульяна Николаевна Синицына Ольга Ивановна Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика, г. Новосибирск, 14-17 ноября 2011 г.
	A plausible mechanism for the root apical meristem patterning. V.V. Mironova, E.S. Novoselova, S.S. Sangaev, F.V. Kazantsev, N.A. Omelyanchuk, V.A. Likhoshvai 7th International Conference on Structure and Function of Roots
	Computer simulation confirmed auxin dose-dependent control of root vascular cells specification E.S. Novoselova, V.V. Mironova, S.S. Sangaev, F.V. Kazantsev, N.A. Omelyanchuk, V.A. Likhoshvai 7th International Symposium on Structure and Function of Roots
	Computational genomics: looking for new knowledge in old data Kochetov A.V. German/Russian Workshop on Integrative Biological Pathway Analysis and Simulation
	Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Hofestädt R., Sommer B., Tiys E.S., Kormeier B., Hippe K., Janowski S.J., Ivanisenko T.V., Bragin F.O., Arrigo P., Demenkov P.S., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A. International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 11)
	The mRNA characteristics potentially involved in recognition of non-AUG start codons in yeast mRNAs. Volkova O.A., Kochetov A.V. International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 11)
	Супрессия активности гена пролиндегидрогеназы повышает неспецифическую устойчивость растений к абиотическим стрессам. Колодяжная Я.С., Коваль В.С., Романова А.В., Титов С.Е., Кочетов А.К 2-й Всероссийский симпозиум "Физиология трансгенного растения и проблемы биобезопасности", Москва.
	The mRNA characteristics potentially involved in recognition of non-AUG start codons in yeast mRNAs Volkova O. A., Kochetov A. V. Moscow Conference on Computational Molecular Biology
	ВИТАМИН Е И SKQ ПРЕДОТВРАЩАЮТ НАКОПЛЕНИЕ ДЕЛЕТИРОВАННОЙ МТДНК В ГИППОКАМПЕ КРЫС ПРИ ПРЕЖДЕВРЕМЕННОМ СТАРЕНИИ Лощенова П. С., Роцкая У. Н., Синицына О. И. Международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: Геномика, Протеомика, Биоинформатика»
	ОТНОСИТЕЛЬНОЕ КОЛИЧЕСТВО МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК И МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДЕЛЕЦИИ В ГИППОКАМПЕ КРЫС ЛИНИЙ OXYS И WISTAR В ПРОЦЕССЕ СТАРЕНИЯ Лощенова П. С., Роцкая У. Н., Синицина О. И. VIII Международная конференция «Молекулярная генетика соматических клеток»
	A gene regulatory network model for vernalization and seasonal flowering response in winter wheat. Stepanenko I.L., Smirnova O.G., Titov I.I International Conference Wheat Resources and Genomics (WGRG 2011)
	Wheat promoter sequences for transgene expression. Смирнова О.Г., Кочетов А.В. The International Conference Wheat Genetic Resources and Genomics (WGRG 2011)
	Сегрегация по половому статусу цветков в ряду семенных поколений Fragaria x ananassa Duch. при эпигенетическом контроле Батурин С.О. Фактори експериментальноï еволюцiï органiзмiв
	VISUALIZATION AND ANALYSIS OF A CARDIO VASCULAR DISEASE-RELATED BIOLOGICAL NETWORK COMBINING TEXT MINING AND DATA WAREHOUSE APPROACHES Ralf Hofestädt, Björn Sommer, Evgeny Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian Janowski, Timofey Ivanisenko, Anatoly Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel Demenkov, Alexey Kochetov, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov Moscow Conference on Computational Molecular Biology 2011
	Прорастание семянок у ремонтантных сортов крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) в зависимости от способа их выделения Апполинарьева И.К., Петрук В.А., Батурин С.О. Методы и технические средства исследований физических процессов в сельском хозяйстве
	2011 Biochemical Marker-assisted Development of New Common Wheat Line with HMW-glutenin Genes from Triticum timopheevii Zhuk Proceedings of the 15th International EWAC Conference, 7-11 November 2011. Novi Sad, Serbia.www.ewac.eu European Cereals Co-operative Newsletter. 2012. pp.163-168. Обухова Людмила Васильевна, Будашкина Екатерина Борисовна, Шумный Владимир Константинович European Cereals Genetics Co-operative Newsletter 2012. Proceedings of the 15th International EWAC Conference 7-11 November 2011, Novi Sad, Serbia
2010	Трансгенные растения Nicotiana tabacum как генетическая модель для изучения роли нуклеаз в противовирусном иммунитете растений Савельева А. В., Трифонова Е. А. 1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии", Томск, 6-9 октября 2010
	Computational genomics: searching for new proteome components Kochetov A.V. Joint Indo-Russian Workshop "Predictive Biology using Systems and Integrative analysis and Methods", November 15-19, 2010, p 8-9, Chandigarh, India
	The physiological role of deltaOAT gene in plant development and stress response Gerasimova S.V., Gorelova V.V., Romanova A.V., Koval V.S., Kochetov A.V. Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk
	The role of dsRNA binding and hydrolytic activities in the virus-resistance of higher plants Trifonova E.A., Saveleva A.V., Romanova A.V., Sangaev S.S., Kochetov A.V. Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk
	Проявление автосегрегации в агамоспермном потомстве Fragaria vesca L. (Rosaceae) Батурин С.О. Всероссийская научная конференция "Апомиксис и репродуктивная биология", посвященной 100-летию со дня рождения С.С. Хохлова. Материалы. Изд-во Саратовского университета, Саратов.
	Всхожесть семян в зависимости от сроков плодоношения ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Аполинарьева И.К., Батурин С.О. Первая Всероссийская молодёжная научная конференция, посвященная 125-летию биологических исследований в Томском государственном университете
	Дозовый эффект гена при наследовании розовой окраски венчика у потомков межродовых гибридов Fragaria x ananassa Duch. × Comarum palustre L. Кузнецова Л.Л., Батурин С.О. Перспективы развития и проблемы современной ботаники / Материалы II (IV) Всероссийской молодежной научно-практической конференции. Новосибирск: Изд-во СО РАН.
	Role of N-end amino acids in translation of human proteins Volkova O.A., Kochetov A.V. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
	Metabolic engineering of plants for stress resistance. Ibragimova S.S., Kochetov A.V. Int.Conf. Plants Genetics, Genomics, and Biotechnology
	ТРАНСГЕНЕЗ КАК СПОСОБ ПОВЫШЕНИЯ СТРЕССОУСТОЙЧИВОСТИ У РАСТЕНИЙ Ибрагимова С. С., Романова А. В., Сангаев С. С., Кирсанова С. Н. , Кочетов А. В. Растение и стресс (Plants under Enviromental Stress)
	Red and far-red light signal transduction in plant phothomorphogenesis. Смирнова О.Г. The 7th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
	A database of plant promoters for transgenesis. Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В. International Conference Plant Genetics, Genomics and Biotechnology
	Матроклинное наследование при скрещиваниях Fragaria x Potentilla Батурин С.О., Амброс Е.В., Кузнецова Л.Л. Фактори експериментальноï еволюцiï органiзмiв
	Генотипическая изменчивость по качеству пыльцы в агамоспермном потомстве Fragaria x ananassa Duch. Амброс Е.В., Батурин С.О. Биология развития: морфогенез репродуктивных структур и роль соматических, стволовых клеток в онтогенезе и эволюции
	Breeding pink-flowering everbearing strawberry adapted to the variable conditions of West Siberia Kuznetsova L.L., S.O. Baturin S.O. Plant Genetics, Genomics and Biotechnology
	Некоторые достижения в решении проблем семенной репродукции ремонтантных сортов крупноплодной земляники Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Кузнецова Л.Л. Актуальные проблемы размножения садовых культур и пути их решения
2009	Определение токсичности и генотоксичности образцов донных отложений и растений,содержащих америций -241,в экосистеме реки Енисей. Овчинникова Л.П.,Васюнина Е.А.,Роцкая У.Н.,Невинский Г.А. VСъезд ВОГиС
	Предпосылки и перспективы создания базы данных семенной репродукции ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Петрук В.А. 4-ая международная научно-практическая конференция "АГРОИНФО-2009": Информационные технологии, системы и приборы в АПК. 14-15 октября 2009г. г.Новосибирск - п.Краснообск
	О ремонтантности в сибирских популяциях Fragaria vesca L. (Rosaceae.) Батурин С.О. 8-ая Международная научно-практическая конференция "Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии". 19-22 октября 2009г. Барнаул
	Interrelation between the translation initiation signal and the N-end of encoded protein in human mRNAs Volkova O.A., Kochetov A.V. Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow
	Эпигенетический контроль типа пола цветков у Fragaria x ananassa Duch. Батурин С.О. V Miжнародноi науковоi конфекренцii "Фактори експериментальноi еволюцii органiзмiв", Украiна, Автономна республика Крим, Алушта, 22-28 вересня 2009 року
	Изучение роли экстраклеточных нуклеаз и дц-РНК-связывающей активности в устойчивости растений к фитопатогенным вирусам на модели трансгенных растений Трифонова Е.А., Романова А.В., Сангаев С.С., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В. VII Международная школа-конференция "Молекулярная генетика соматических клеток", 22-25 октября 2009, Звенигород (Москва)
	Трансгенные растения рапса и редьки масличной с повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам Сютикова О.С., Любинская А.В., Левенко Б.А., Рахметов Д.Б., Кочетов А.В. Мат. 5 Межд. Конгр. "Биотехнология:состояние и перспективы развития"
	Исследование запасных белков интрогрессивных линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L. x T. timopheevii Zhuk) Л. В. Обухова, Е. Б. Будашкина, В. К. Шумный Съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со Дня рождения Ч. Дарвина 21 — 28 июня 2009 г. - Москва
	Анализ соматических мутационных спектров в митохондриальной ДНК крыс линии Wistar РоцкаяУ.Н., Рогозин И.Б., Васюнина Е.А., Колосова Н.Г., Невинский Г.А XII Всероссийская молодёжная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии,
	Уровени 8оксогуанина и 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы (OGGI) в нервных клетках крыс OXYS и Wistar. Саттарова Е.А., Синицина О.И., Жарков Д.О., Невинский Г.А. Научная конференция «Медицинская геномика и протеомика»
	TGP (Transgene Promoters): a database of biotechnologically important plant gene promoters. Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В. The 5th German-Russian Forum Biotechnology
2008	Nanobiotechnology and its application to biomedicine: text-mining knowledge extraction and integration Ivavisenko V.A. Demenkov P.S., Yarkova E.E., Ivavisenko N.V., Ivavisenko T.V. Sournina N.Yu., Podkolodny N.L., Khlebodarova T.M., Ibragimova S.S., Smirnova O.G. 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28
	Нередукция гамет у Fragaria vesca L. в природе и опыте Батурин С.О. IV Международная научная конференция "Факторы экспериментальной эволюции организмов". Алушта. 22-26 сентября
	Genetically modified tobacco plants of with the decreased activity proline dehydrogenase gene are characterised by the elevated resistance to abiotic stresses Kolodyazhnaya Ya., Levenko B.A., Kochetov A.V. IX International conference "Plant cell biology in vitro и biotechnology", Zvenigorid, Russia, 8-12 September
	ANDCell: a tool for automated knowledge extraction from PubMed and reconstruction of association networks Ivanisenko V.A., Yarkova E.E., Demenkov P.S., Kochetov A.V. Proceedings of the 5th International Symposium on Integrative Bioinformatics. P 327, 20-22 August 2008, Germany
	Genetically modified tobacco and potato plants with elevated proline level are characterized by resistance to salt stress Kolodyazhnaya Ya Progress and problems of genetics, selection and biotechnology. Alushta, Ukraine, 2008, September 22-26
	Генетически модифицированные растения картофеля (Solanum tuberosum L.), характеризующиеся повышенной устойчивостью к засолению Кирсанова С.Н., Колодяжная Я.С., Кочетов А.В. Нанотехнологии в сельском хозяйстве. РГАУ-МСХА, Москва, 9-11 декабря 2008
	Генетически модифицированные растения табака с пониженной активностью пролиндегидрогеназы характеризуются повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам Колодяжная Я.С., Левенко Б.А., Кочетов А.В. Тез. IX Междун. конференции "Биология клеток растений in vitro и биотехнология", Звенигород
	Получение и анализ трансгенных растений, несущих ген пирролин-5-карбоксилатсинтeтазы Medicago truncatula Сютикова О.С., Рахметов Д.Б., Кочетов А.В., Левенко Б.А. Тез. IX Междун. конференции "Биология клеток растений in vitro и биотехнология", Звенигород
	Fine structure of mammalian translation initiation signal Volkova O.A., Kochetov A.V. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
	Analysis os somatic spectra in mitochondrial DNA of OXYS and WISTAR rats Rotskaya U.N., Rogozin I.B., Vasyunina E.A., Kolosova N.G., Nevinsky G.A., Sinitsyna O.I. Russian-Europian Workshop DNA Repair and Epigenetic Regulation of Genome Stability
2007	Супрессия активности гена пролиндегидрогеназы повышает неспецифическую устойчивость растений к абиотическим стрессам Колодяжная Я.С., Коваль В.С., Романова А.В., Титов С.Е., Кочетов А.К. 2-й Всероссийский симпозиум "Физиология трансгенного растения и проблемы биобезопасности" (Москва 22-25 октября 2007 г.)
	Signals influencing general translational efficiency of eukaryotic mRNAs Ivanisenko VA, Mischenko EL, Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Titov I.I., Kolchanov N.A., Sarai A. 3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007". July 27-31, 2007, Moscow, Russia
	Генетически модифицированные растения табака (Nicotiana tabacum L.), характеризующиеся повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам Колодяжная Я.С. Титов С.Е VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова, Алушта, Украина, 24-28 сентября
	Наследование розовой окраски венчика у полиплоидов земляники (Fragaria L.) Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова, Алушта, Украина, 24-28 сентября
	Трансгенные растения табака, экспрессирующие гены экстраклеточных рибонуклеаз, как модель для изучения молекулярных механизмов неспецифической устойчивости растений к падля изучения молекулярных механизмов неспецифической устойчивости растений к патогенам Трифонова Е.А., Сапоцкий М.В., Романова А.В., Сангаев С.С., Малиновский В.И., Кочетов А.В Всероссийская научная конференция "Устойчивость растений к неблагоприятным факторам внешней среды". Иркутск
	Повышенная устойчивость трансгенных растений табака, экспрессирующих ген панкреатической рибонуклеазы быка, к вирусу табачной мозаики Трифонова Е.А., Сапоцкий М.В., Комарова М.Л., Кочетов А.В., Малиновский В.И. Материалы Международной конференции "Современная физиология растений: от молекул до экосистем" Сыктывкар
	Взаимосвязь контекстной организации сигнала инициации трансляции и аминокислотной последовательности на N-конце белков ряда эукариот Волкова О.А., Кочетов А.В. Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск
	Глютенины гексаплоидной пшеницы Л.В.Обухова Международная научная конференция "Развитие научного наследия Н.И.Вавилова на современном этапе", 19 декабря 2007 года, Новосибирск
	Перспективы получения ГМ растений картофеля, несущих антисмысловой супрессор гена пролиндегидрогеназы и обладающих повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Кочетов А.В Международная научно-практическая конференция "Картофелеводство XXI века: проблемы и решения", 10-12 июля, Минск
	Эпигенетический контроль типа пола цветков в роде Fragaria Батурин С.О. Х генетико-селекционная школа: "Реализация идей Н.И. Вавилова на современном этапе развития генетики,селекции и семеноводства сельскохозяйственных культур". Новосибирск, 2007.
	Трансгенные растения табака, экспрессирующие гены экстраклеточных рибонуклеаз, как модель для изучения молекулярных механизмов неспецифической устойчивости растений к патогенам. Трифонова Е.А., Сапоцкий М.В., Романова А.В., Сангаев С.С., Малиновский В.И., Кочетов А.В Всероссийская конференция «Устойчивость растений к неблагоприятным факторам внешней среды», Иркутск.
	Contextual organization of 3’-end context of translation start site in eukaryotic mRNAs Volkova O.A., Kochetov A.V. Moscow Conference on Computational Molecular Biology
	Новые перспективные антиоксиданты на основе 2,6- диметилфенола. Кемелева Е.А., Васюнина Е.А., Синицына О.И., Хомченко А.С., Гросс М.А., Кандалинцева Н.В., ПросенкоА.Е., Невинский Г.А. 3-Международная конференция "Фундаментальные науки - медицине"
	Cоматический мутагенез в митохондриальной ДНК крыс линий OXYS и Wistar. Роцкая У.Н., Рогозин И.Б., Васюнина Е.А., Колосова Н.Г., Синицына О.И. Конференция, посвященная 100-летию со дня рождения М.Е.Лобашева «Системный контроль генетических и цитогенетических процессов»
	Prolamin analysis of common wheat introgression lines with leaf rust resistance from Triticum timopheevii L.V. Obukhova, E.B. Budashkina Proceedings of14th Internation EWAC Conference, Newsletter 2008
	Cоматический мутагенез в митохондриальной ДНК крыс линий OXYS и Wistar Роцкая У.Н., Рогозин И.Б., Васюнина Е.А., Колосова Н.Г., Синицина О.И. Конференция, посвященная 100-летию со дня рождения М.Е.Лобашева «Системный контроль генетических и цитогенетических процессов»
	Новые перспективные антиоксиданты на основе 2,6- диметилфенола. Кемелева (Саттарова) Е.А., Васюнина Е.А., Синицина О.И., Хомченко А.С., Гросс М.А., Кандалинцева Н.В., ПросенкоА.Е., Невинский Г.А. 3-Международная конференция "Фундаментальные науки - медицине"
2006	Distant education and collaborative projects: the Network www-site Kochetov A.V. 4th Meeting of German/Russian Virtual Network of Bioinformatics. Bielefeld, Germany, October 9-10
	The contribution of alternative translation start sites to human protein diversity Kochetov A.V., Sarai A., Kolchanov N.A. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
	The role of alternative translation start sites in generation of eukaryotic protein diversity Kochetov A.V. 8th International Engelhardt Conference on Mollecular Biology "RNA-protein interactions", Moscow, August 19-24
	Alternative coding potential of mammalian mRNAs Kochetov A.V. Conf. on Translational Control and Non-coding RNA. Nove Hrad, Czech Rep., Nov. 8-12
	Анализ спектров соматических мутаций митохондриальной дНК крыс линий OXIS и WISTAR Роцкая У.Н., Рогозин И.Б., Васюнина Е.А., Колосова Н.Г., Синицына О.И. Всероссийская конференция "Структура и экспрессия митохондриального генома растений" 3-7 сентября 2006 года. г. Иркутск. Сибирский институт физиологии и биохимии растений
	Amino acid preferences at the N-terminal part of eukaryotic proteins correlating with a specific contextual organization of translation initiation signal. Proc. 5th Intern. Volkova O.A., Kochetov A.V. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
	Interrelationship between N-terminal region of eukaryotic proteins and specific contextual organization of translation start site Volkova O.A., Kochetov A.V. Translational Control and Non-Coding RNA Meeting
	BiotechPro: a database for microbiologically synthesized products of biotechnological value. Ibragimova S.S., Smirnova O.G., Grigorovich D.A., Khlebodarova T.M. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
	In silico cell II. Information sources for modeling Escherichia coli metabolic pathways. Khlebodarova T.M., Ananko E.A., Nedosekina (Oschepkova) E.A. Podkolodnaya O.A., Poplavsky A.S., Smirnova O.G., Ibragimova S.M., Mishenko E.L., Stepanenko I.L., Ignatieva E.V., Proskura A.L., Nishio Imaizumi, Usuda Matsui, Podkolodny N.L. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
	DNA damage and repair in OXYS rats with free radical overgeneration. E. Kemeleva, O. Sinitsyna, A. Ishchenko, D. Zharkov, G. Nevinsky International Free Radical Summer School
	Окислительный стресс и соматический мутагенез у крыс линий OXYS и Wistar. Синицына О.И., РоцкаяУ.Н., Кемелева Е.А., Васюнина Е.А., Колосова Н.Г., Невинский Г.А. Международная конференция «Физико-химическая биология»
	Regulation of the pentose phosphate pathway in Escherichia coli: gene network construction and mathematical modeling. Ratushny A.V., Smirnova O.G., Usuda Y., Matsui K. The 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)
	Gene network reconstruction and mathematical modeling of salvage pathways: regulation of adenine phosphoribosyltransferase activity by structurally similar substrates. Smirnova O.G., Ratushny A.V. The 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)
	TGP (Transgene Promoters): a database of biotechnologically important plant gene promoters. Smirnova O.G., Ibragimova S.S., Grigorovich D.A., Kochetоv A.V. The 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)
	Regulation of pyruvate biosynthesis in Escherichia coli: gene network reconstruction and mathematical modeling of enzymatic reactions of the pathway. Turnaev I., Smirnova O.G. The 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)
	Компьютерные подходы к исследованию влияния полиморфизмов на экспрессию генов и функцию белков. Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Кочетов А.В., Игнатьева Е.В., Пономаренко М.П., Орлова Г.В., Меркулова Т.И., Ощепков Д.Ю., Аман Е.Э., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Деменков П.С., Пинтус С.С., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Турнаев И.И., Апасьева Н.В., Губина М.А., Ромащенко А.Г. International conference “Basic Science for Biotechnology and Medicine” September 3-7, 2006, Novosibirsk. Russia.
	Mathematical modeling of serine and glycine biosynthesis regulation in Echerichia coli. Turnaev I., Ibragimova S.S., Usuda, Y., Matsui K. The 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)
	Биотопический фактор в поддержании гетерогенности популяции лесной земляники (Fragaria vesca L.) Батурин С.О. Фактори експериментальноï еволюцiï органiзмiв
	Окислительный стресс и соматический мутагенез у крыс линий OXIS и WISTAR Синицына О.И., Роцкая У.Н., Кемелева Е.А.(Саттарова), Васюнина Е.А., Колосова Н.Г, Невинский Г.А. Физико-химическая биология

Гранты

2022	Разработка комплексного подхода для защиты картофеля Solanum tuberosum от фитофтороза препаратами на основе дцРНК Российский научный фонд, номер гранта 22-76-00037
	Генетический контроль дегенерации поясничных межпозвонковых дисков Российский Научный Фонд, Администрация Новосибирской области, номер гранта 22-15-20037
	Сайленсинг генов-элиситинов INF1 и INF4 Phytophthora infestans, опосредованный синтезированной in vivo экзогенной дцРНК Совет по грантам Президента Российской Федерации, номер гранта МК-4311.2022.5
2020	Создание новых доноров для селекции картофеля методом редактирования геномов РФФИ, номер гранта 20-016-00217
	Создание новых доноров для селекции картофеля методом редактирования геномов РФФИ, номер гранта 20-016-00217 А
2019	Роль генетических и эпигенетических механизмов в формировании вторичной миелодисплазии при злокачественных неходжкинских лимфомах, осложненных анемическим синдромом РФФИ, номер гранта 19-34-60024
	Использование методов РНК-интерференции и препаратов на основе двуцепочечной РНК для борьбы с фитопатогенами Российский научный фонд, номер гранта 19-74-00067
2018	Фенотипрование и генетический анализ размеров корневой системы у мягкой пшеницы в условиях контрастного водного режима РФФИ, номер гранта 19-416-540001 р_а
	Новый подход к созданию безопасных растительных систем экспрессии чужеродных белков: снижение природной токсичности табака методом геномного редактирования РФФИ, номер гранта 18-416-543004 р_мол_а
	Разработка платформы для доместикации картофеля de novo РФФИ, номер гранта 18-316-00068 мол_а
2017	Комплексный план научных исследований «Развитие селекции и семеноводства картофеля» Номер гранта 0321-2017-0062
2016	Поиск целевых генов и оптимизация подходов по модификации геномов для получения новых форм злаков с заранее заданными свойствами РНФ, номер гранта 16-14-00086
2014	Идентификация и маркирование новых генов устойчивости к листовой ржавчине пшеницы Министерство образования и науки РФ (соглашение № 14.604.21.0107 от 07.08.2014)., номер гранта Уникальный идентификатор RFMEFI60414X0107
	Построение модели и предсказание эффективности трансляции мРНК млекопитающих по ее первичной последовательности на основе данных по рибосомному профилированию. РФФИ, номер гранта 14-04-01284
2012	Междисциплинарный интеграционный проект СО РАН «Молекулярные механизмы функционирования защитно-репарационных систем человека; разработка дифференциальных комплексных методов диагностики и терапии заболеваний с аутоиммунными, онкологическими патологиями и заболеваниями пожилого возраста» Президиум СО РАН, номер гранта 59
	Междисциплинарный интеграционный проект СО РАН "Магнитные эффекты в биологически значимых системах" СО РАН, номер гранта 71
	Гибриды с цитоплазматической мужской стерильностью как исходный материал для селекции сахарной свеклы (Beta vulgaris L.) РФФИ и БРФФИ, номер гранта 12-04-90000-Бел_а
	Окислительный стресс и мутагенез митохондриальной ДНК соматических клеток при преждевременном старении и патологиях Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 12-04-01495
2011	Экспериментально-теоретическое изучение молекулярно-генетических механизмов распределения ауксина в корне растений РФФИ, номер гранта 11-04-01254а
2010	Молекулярные механизмы стресс-специфического контроля экспрессии генов животных Министерство образования и науки Российской Федерации, номер гранта 02.740.11. 0705
	Исследование роли экстраклеточных рибонуклеаз в механизме вирусоустойчивости растений РФФИ, номер гранта 10-04-90411
	Агамоспермия - новый подход к созданию исходного материала для селекции сахарной свеклы (Beta vulgaris L.) РФФИ, номер гранта 10-04-00697
2009	Разработка программно-информационного комплекса для исследования механизмов регуляции экспрессии генов эукариот Министерство образования и науки, номер гранта П-721
	Молекулярные механизмы функционирования защитно-репарационных систем человека; разработка дифференциальных комплексных методов диагностики и терапии заболеваний с аутоиммунными, онкологическими патологиями и заболеваниями пожилого возраста. Президиум СО РАН, номер гранта Интеграционный междисциплинарный грант СО РАН № 98:
2008	Окислительный стресс и соматический мутагенез при преждевременном старении Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 08-04-01027-а
2007	Анализ механизмов транспорта иммуноактивных медиаторов через кишечный эпителий на модели трансгенных растений моркови с генами интерлейкинов 10 и 18 человека для пероральной доставки иммунорегуляторных препаратов Федеральное Агенство по науке и инновациям, номер гранта 02.512.11.2109
2006	Хромосомная и генетическая инженерия как метод изучения генома и экспрессии генов у растений Грант Президента РФ для поддержки ведущих научных школ, номер гранта НШ-528-2006.4
	Изучение особенностей модификации генома у трансгенных растений и разработка оптимальной системы экспрессии целевых генов РАН, номер гранта Программа РАн "Биоразнообразие и динамика генофондов" Направление - "Фундаментальные проблемы трансгенеза растений и животных"
	РОЛЬ МИКРООРГАНИЗМОВ В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ И БИОИНЖЕНЕРНЫЕ ПРИЛОЖЕНИЯ Президиум СО РАН, номер гранта 24
	Молекулярные механизмы функционирования защитно-репарационных систем человека; разработка дифференциальных комплексов диагностики и терапии заболеваний с аутоиммунными, онкологическими патологиями и заболеваниями пожилого возраста. Президиум СО РАН, номер гранта Интеграционный междисциплинарный проект СО РАН №6
2005	Создание трансгенных растений-биопродуцентов белков медицинского назначения с иммуномодулирующим действием Федеральное агенство по науке и инновациям, номер гранта 02.435.11.3013
	"Development of edible vaccines using transgenic plants" Международный научно-технический центр, номер гранта №1276
	Молекулярно-генетический анализ трансгенных растений: изучение районов интеграции Т-ДНК инсерций в ядерный геном РФФИ, номер гранта 05-04-48925
	Окислительный стресс как физико-химическая основа соматического мутагенеза и преждевременного старения Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 05-04-48779-а
2004	Эпигенетическое наследование репродуктивных признаков у растений РФФИ, номер гранта РФФИ № 04-04-48176-а

Научное руководство

2023	Сравнительный анализ молекулярной и генетической архитектуры болезни Альцгеймера и расстройств аутистического спектра: связь с сигнальным путем mTOR Пащенко Анна Андреевна 2023-02-06
2022	Сайленсинг генов inf1 и inf4 Phytophthora infestans (Mont.) de Bary, опосредованный синтезированной in vivo экзогенной дцРНК Иванов Артемий Александрович 2022-07-28
	Оценка комбинационной способности родительских форм по признаку нейтральнодневности для селекции гибридов F1 крупноплодной земляники Урманчина Софья Геннадьевна 35.03.04 Агрономия, профиль - Селекция и генетика сельскохозяйственных культур, 2022-06-21
2021	Выделение источников скороспелости в направленных скрещиваниях нейтральнодневной крупноплодной земляники (Fragaria × ananassa Duch.) Курочкина Валерия Александровна Селекция и генетика сельскохозяйственных культур, 2021-06-28
	Разработка подхода для синтеза dsRNA в бактериях E. coli Черенко Виктория Александровна 06.04.05 Биология (магистр), 2021-06-11
	Новые модельные системы для РНК-интерференции у растений на примере Arabidopsis thaliana Урин Авель Витальевич Биология (06.03.01) бакалавриат, 2021-06-07
2020	Генетический анализ родительских форм ремонтантной крупноплодной земляники по гену розовой окраски венчика при линейной селекции (Fragaria × ananassa Duch.) Ананьина Алина Олеговна Селекция и генетика сельскохозяйственных культур, 2020-06-26
2019	Выявление доноров раннего срока вступления в плодоношение для селекции F1 ремонтантных гибридов крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch) Курочкина Валерия Александровна Селекция и генетика сельскохозяйственных культур, 2019-06-25
	Анализ молекулярных процессов, происходящих в корнях картофеля Solanum phureja при заражении золотистой картофельной нематодой Globodera rostochiensis Егорова Анастасия Александровна Биология, 2019-06-16
	Гены метаболизма алкалоидов табака как мишени для геномного редактирования Спасельникова Алиса Валерьевна Биология, 2019-06-16
	Получение трансгенных растений Nicotiana tabacum, стабильно экспрессирующих ген белка оболочки бактериофага MS2 Байрамова Дарья Олеговна Биология, 2019-06-14
	Нокаут генов семейства РМТ в растениях Nicotiana tabacum Томилин Матвей Алексеевич Биология, 2019-06-14
	Анализ генотипа и фенотипа линий ячменя, мутантных по генам транскрипционных факторов типа AP2/ERF Колосовская Екатерина Вадимовна Биология, 2019-06-14
2018	Оценка исходного материала ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria х ananassa Duch.) для использования в селекции F1 ремонтантных гибридов с семенным способом репродукции Лапина Маргарита Сергеевна Селекция и генетика сельскохозяйственных культур, 2018-06-26
	Изучение цитотоксических свойств С-2 и С-3-1,2,3-триазолил модифицированных фурокумаринов Кремис Степан Анатольевич 31.05.01 Лечебное дело, 2018-06-06
2017	Исследование участия гена орнитинаминотрансферазы в ростовых процессах растений Егорова Анастасия Александровна Биология, 2017-06-04
2016	Усовершенствование приемов семенного воспроизводства ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) в условиях лесостепи Западной Сибири Аполинарьева Ирина Константиновна Селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений, 2016-12-01
2014	Изучение потомства F1 от межвидового скрещивания F. vesca × F. orientalis (сорт Покровская) Щевровская Ксения Дмитриевна Селекция и генетика с.-х. культур, 2014-06-05
2013	Генетическая изменчивость по окраске венчика в агамоспермном потомстве крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Старусева Елена Николаевна 2013-06-19
	Наследование розовой окраски венчика при инбридинге розовоцветковой крупноплодной земляники Fragaria х ananassa Duch. Воропаева Валентина Александровна 2013-06-12
2012	Сегрегация цветков по половому статусу в ряду семенных поколений Fragaria x ananassa Duch. при эпигенетическом контроле Токоякова Валерия Юрьевна "Селекция и генетика с-х культур", 2012-06-14
	Наследование признака "розовая окраска венчика" у крупноплодной земляники Fragaria x ananassa Dich. Кузнецова Любовь Леонидовна 03.02.07 - "генетика", 2012-04-11
	Трансляционно-значимые характеристики 5’-нетранслируемых районов мРНК эукариотических генов Волкова Оксана Анатольевна Генетика, 2012-03-06
	Исследование роли гена орнитинаминотрансферазы в развитии и стрессоустойчивости растений Герасимова Софья Викторовна Генетика - 03.00.15, 2012-02-14
	Формообразование у Fragaria x ananassa Duch. при нередуцированном партеногенезе Амброс Елена Валерьевна 03.02.01 - "ботаника", 2012-01-17
2011	Наследование розовой окраски венчика в инбредных потомствах розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Воропаева Валентина Александровна "селекция и генетика сельскохозяйственных культур", 2011-06-02
2010	Изучение роли экстраклеточных рибонуклеаз на модели трансгенных растений табака (Nicotiana tabacum L.) Сангаев Содном Сергеевич Генетика, 2010-09-30
	ПОЛУЧЕНИЕ ТРАНСГЕННЫХ РАСТЕНИЙ ТАБАКА, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ХИМЕРНЫЙ ГЕН НУКЛЕАЗЫ SERRATIA MARCESCENS Савельева Анна Валентиновна Генетика, 2010-06-01
	Использование раздельнополости в селекции ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Змызгова Марина Андреевна "селекция и генетика сельскохозяйственных культур", 2010-05-24
	Наследование розовой окраски венчика в скрещиваниях Fragaria x ananassa с розовоцветковыми гибридами (Fragaria x Potentilla) Никитина Евгения Викторовна "селекция и генетика сельскохозяйственных культур", 2010-05-24
2009	ВОЗРАСТНАЯ ДИНАМИКА МАРКЕРОВ ОКИСЛИТЕЛЬНОГО СТРЕССА У КРЫС ЛИНИЙ WISTAR И OXYS Саттарова Евгения Александровна Биохимия, 2009-11-13
	Получение гибридов ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) с улучшенным вкусом плодов Биткина Вероника Андреевна "селекция и генетика сельскохозяйственных культур", 2009-06-01

Учебные курсы

2018	Генетика развития растений с основами физиологии Герасимова С.В. НГУ, кафедра цитологии и генетики, семестров: 1
2013	Мутагенез и репарация НГУ, кафедра молекулярной биологии, 5 курс, семестров: 1
2011	практикум по генной инженерии НГУ, кафедра цитологии и генетики, семестров: 1
2010	Мутагенез и репарация НГУ, ФЕН, Кафедра молекулярной биологии, семестров: 1
2009	Мутагенез и репарация НГУ, ФЕН, Кафедра молекулярной биологии, семестров: 1
2008	Молекулярные механизмы репарации ДНК НГУ, ФЕН, Кафедра молекулярной биологии, семестров: 1
2007	Молекулярные механизмы репарации ДНК НГУ, ФЕН, Кафедра молекулярной биологии, семестров: 1
2006	Молекулярные механизмы репарации ДНК НГУ, ФЕН, Кафедра молекулярной биологии, семестров: 1

Патенты

2021	База данных генотипа и фенотипа диких видов картофеля (WildPetotaDB) / A database of the genotype and phenotype of wild potato species (WildPetotaDB) Комышев Е.Г., Колошина К.А., Фомин И.В., Колосовская Е.В., Генаев М.А., Эрст Т.В., Егорова А.А., Чалая Н.А., Рогозина Е.В., Герасимова С.В. Номер патента 2021620100
2019	(17S-)-N-бензил-5-((3-бета-ацетокси-28-нор-урс-12-ен)-17-ил)-1,3,4-оксадиазол-2-амин, обладающий селективной цитотоксичностью в отношении клеток рака молочной железы MCF-7 Попов Сергей Александрович, Семенова Мария Дмитриевна, Шульц Эльвира Эдуардовна, Фролова Татьяна Сергеевна
2016	Гены устойчивости к грибным патогенам (ГУГП)/ Pathogenesis-Related Genes (PRG) Смирнова О.Г., Кочетов А.В., Рассказов Д.А. Номер патента № 2016620429
2012	База данных "Внешние информационные ресурсы" (ВИР)/ DATABASE "External Information Resources" (EIR) Ибрагимова Салмаз Номер патента №2012620703
	База данных «Трансляционные сигналы» (ТРАНСИГ)/ Database «TRANslational SIGnals» (TRANSIG) Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Номер патента 2012620739
2010	Рекомбинантная плазмида, обеспечивающая экспрессию гена экстраклеточной рибонуклеазы Zinnia elegans ZRNaseII в трансгенных растениях (варианты), и способ получения вирусоустойчивых форм растений. Трифонова Е.А., Сангаев С.С., Романова А.В., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В., Шумный В.К. Номер патента 2393226
	Рекомбинантная плазмида, обеспечивающая экспрессию гена экстраклеточной рибонуклеазы Zinnia elegans в трансгенных растениях (варианты), и способ получения вирусоустойчивых форм растений 145. Трифонова Е.А., Сангаев С.С., Романова А.В., Кочетов А.В., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Шумный В.К. Номер патента 2393226
2008	Способ получения трансгенных растений табака с повышенным содержанием пролина. Титов С.Е., Герасимова С.В., Кочетов А.В., Колодяжная Я.С., Комарова М.Л., Романова А.В., Шумный В.К. Номер патента 2324737
2007	Способ получения трансгенных растений, устойчивых к вирусной инфекции Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Комарова М.Л., Шумный В.К., Малиновский В.И., Сапоцкий М.В. Номер патента 2300567
	База данных: Биотехнологически значимые продукты (BiotechPro) Ибрагимова С.М., Смирнова О.Г., Григорович Д.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А. Номер патента №2007620105
	База данных: Трансген-Промотор (TGProm) Смирнова О.Г., Ибрагимова С.М., Кочетов А.В., Григорович Д.А., Колчанов Н.А. Номер патента № 2007620101
2006	База данных: Регуляторные районы генов прокариот (ProkaTEX) Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Поплавский А.С., Наумочкин А.Н., Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А. Номер патента №2006620257
	База кинетических данных (KiNET) Недосекина Е.А., Хлебодарова Т.М., Поплавский А.С., Смирнова О.Г., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А. Номер патента №2006620209
	База данных: Районы позиционирования нуклеосом (NPRD). Левицкий В.Г., Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Фурман Д.П., Катохин А.В., Смирнова О.Г., Хлебодарова Т.М. Номер патента №2006620074