 |
|
|
Иванисенко Никита Владимирович, к. б. н.
В данный момент не является сотрудником института
|
Публикации
| 2024 |
Modulation of extrinsic apoptotic pathway by intracellular glycosylation
Kamil Seyrek, Nikita V. Ivanisenko, Corinna König, Inna N. Lavrik
[TRENDS CELL BIOL]
|
| 2023 |
PROSTATA: a framework for protein stability assessment
using transformers
Dmitriy Umerenkov, Fedor Nikolaev, Tatiana I. Shashkova, Pavel V. Strashnov, Maria Sindeeva, Andrey Shevtsov, Nikita V. Ivanisenko, Olga L. Kardymon
[BIOINFORMATICS]
|
|
Prioritization of potential pharmacological targets for thedevelopment of anti-hepatocarcinoma drugs modulating the extrinsic apoptosis pathway: the reconstruction andanalysis of associative gene networks help.
Demenkov P.S., Antropova E.A., Adamovskaya A.V., Mishchenko E.L., Khlebodarova T.M., Ivanisenko T.V., Ivanisenko N.V., Venzel A.S., Lavrik I.N., Ivanisenko V.A.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Reconstruction of the regulatory hypermethylation network controlling hepatocellular carcinoma development during hepatitis C viral infection
Evgeniya A. Antropova, Tamara M. Khlebodarova, Pavel S. Demenkov, Anastasiia R.
Volianskaia, Artur S. Venzel, Nikita V. Ivanisenko, Alexandr D. Gavrilenko, Timofey V.
Ivanisenko, Anna V. Adamovskaya, Polina M. Revva, Nikolay A. Kolchanov, Inna N. Lavrik
and Vladimir A. Ivanisenko
[J INTEGR BIOINFORM]
|
|
Приоритизация потенциальных фармакологических мишеней для создания лекарств против гепатокарциномы, модулирующих внешний путь апоптоза, на основе реконструкции и анализа ассоциативных генных сетей
П. С. Деменков, Е. А. Антропова, А. В. Адамовская, Е. Л. Мищенко, Т. М. Хлебодарова, Т. В. Иванисенко, Н. В. Иванисенко, А. С. Вензель, И. Н. Лаврик, В. А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2022 |
Computer analysis of regulation of hepatocarcinoma marker genes hypermethylated by HCV proteins.
Antropova E.A., Khlebodarova T.M., Demenkov P.S., Venzel A.S., Ivanisenko N.V., Gavrilenko A.D., Ivanisenko T.V., Adamovskaya A.V., Revva P.M., Lavrik I.N., Ivanisenko V.A.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Computer analysis of the relation between hydrogen bond stability in SOD1 mutants and the survival time of amyotrophic lateral sclerosis patients
Alemasov, N. A., Timofeev, V. S., Ivanisenko, N. V., Kolchanov, N. A., & Ivanisenko, V. A.
[J MOL GRAPH MODEL]
|
|
Development of Small Molecules Targeting Procaspase-8 at the DISC
J. Espe, N. V. Ivanisenko, L. K. Hillert-Richter, V. A. Ivanisenko, I. N. Lavrik
[Cell and Tissue Biology]
|
|
Impact of human CD95 mutations on cell death and autoimmunity: a model.
Seyrek K., Ivanisenko N. V., Wohlfromm F., Espe J., Lavrik I. N.
[TRENDS IMMUNOL]
|
|
Regulation of extrinsic apoptotic signaling by c-FLIP: towards targeting cancer networks
Nikita V. Ivanisenko, Kamil Seyrek, Laura K. Hillert Richter, Corinna König, Johannes Espe, Kakoli Bose, Inna N. Lavrik
[Trends in Cancer]
|
|
Компьютерный анализ особенностей регуляции гиперметилированных маркерных генов гепатокарциномы вирусными белками гепатита С.
Антропова Е.А., Хлебодарова Т.М., Деменков П.С., Вензель А.С., Иванисенко Н.В., Гавриленко А.Д., Иванисенко Т.В., Адамовская А.В., Ревва П.М., Лаврик И.Н., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2021 |
Correlation of Metabolic Profiles of Plasma and Cerebrospinal Fluid of High-Grade Glioma Patients
A. D. Rogachev, N. A. Alemasov, V. A. Ivanisenko, N. V. Ivanisenko, E. V. Gaisler, O. S. Oleshko, S. V.
Cheresiz, S. V. Mishinov, V. V. Stupak, A. G. Pokrovsky
[Metabolites]
|
| 2020 |
ANDDigest: a new web-based module of ANDSystem for the search of knowledge in the scientific literature
Timofey V. Ivanisenko, Olga V. Saik, Pavel S. Demenkov, Nikita V. Ivanisenko, Alexander N. Savostianov, Vladimir A. Ivanisenko
[BMC BIOINFORMATICS]
|
|
Controlling Cell Death through Post-translational Modifications of DED Proteins
Kamil Seyrek, Nikita V. Ivanisenko, Max Richter, Laura K. Hillert, Corinna König, Inna N. Lavrik
[TRENDS CELL BIOL]
|
|
Design, Synthesis and Molecular Modeling Study of Conjugates of ADP and Morpholino Nucleosides as A Novel Class of Inhibitors of PARP-1, PARP-2 and PARP-3
Yuliya V. Sherstyuk, Nikita V. Ivanisenko, Alexandra L. Zakharenko, Maria V. Sukhanova,
Roman Y. Peshkov, Ilia V. Eltsov , Mikhail M. Kutuzov, Tatiana A. Kurgina,
Ekaterina A. Belousova, Vladimir A. Ivanisenko, Olga I. Lavrik, Vladimir N. Silnikov and
Tatyana V. Abramova
[INT J MOL SCI]
|
|
Dissecting DISC regulation via pharmacological targeting of caspase-8/c-FLIPL heterodimer
Laura K. Hillert, Nikita V. Ivanisenko, Denise Busse, Johannes Espe, Corinna König, Sergey E. Peltek, Nikolai A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik
[CELL DEATH DIFFER]
|
|
Learning the changes of barnase mutants thermostability from structural fluctuations obtained using anisotropic network modeling
Nikolay A.Alemasov, Nikita V. Ivanisenko, Vladimir A.Ivanisenko
[J MOL GRAPH MODEL]
|
|
Mathematical Modeling Reveals the Importance of the DED Filament Composition in the Effects of Small Molecules Targeting Caspase-8/c-FLIPL Heterodimer
N. V. Ivanisenko, I. N. Lavrik
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Pharmacological targeting of c-FLIPL and Bcl-2 family members promotes apoptosis in CD95L-resistant cells.
Corinna König, Laura K. Hillert-Richter, Nikita V. Ivanisenko, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik
[SCI REP-UK]
|
|
The role of death domain proteins in host response upon SARS-CoV-2 infection: modulation of programmed cell death and translational applications
Nikita V. Ivanisenko, Kamil Seyrek, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik
[Cell Death Discovery]
|
| 2019 |
DNase and RNase activities of fresh cow milk lactoferrin
Svetlana E. Soboleva, Olga D. Zakharova, Sergey E. Sedykh, Nikita V. Ivanisenko, Valentina N. Buneva, Georgy A. Nevinsky
[J MOL RECOGNIT]
|
|
Delineating the role of c-FLIP/NEMO interaction in the CD95 network via rational design of molecular probes
Nikita V. Ivanisenko, Jörn H. Buchbinder, Johannes Espe, Max Richter, Miriam Bollmann, Laura K. Hillert, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik
[BMC GENOMICS]
|
|
ESEEM Reveals Bound Substrate Histidine in the ABC Transporter HisQMP2
Nikolay Isaev, Johanna Heuveling, Nikita Ivanisenko, Erwin Schneider, Heinz‑Jürgen Steinhof
[APPL MAGN RESON]
|
|
Improved regression model to predict an impact of SOD1 mutations on ALS patients survival time based on analysis of hydrogen bond stability
Nikolay A.Alemasov, Nikita V. Ivanisenko, Bhupesh Taneja, Vibha Taneja, Srinivasan Ramachandran, Vladimir A. Ivanisenko
[J MOL GRAPH MODEL]
|
|
Long and short isoforms of c-FLIP act as control checkpoints of DED filament assembly.
Hillert LK, Ivanisenko NV, Espe J, König C, Ivanisenko VA, Kähne T, Lavrik IN
[ONCOGENE]
|
|
Mechanisms of Procaspase-8 Activation in the Extrinsic Programmed Cell Death Pathway
Ivanisenko N.V., Lavrik I.N.
[Molecular Biology]
|
|
Organization and evolution of the chalcone synthase gene family in bread wheat and relative species
Anastasia Y. Glagoleva, Nikita V. Ivanisenko, Elena K. Khlestkina
[BMC GENET]
|
| 2018 |
Antibodies against H3 and H4 histones from the sera of HIV‐infected patients catalyze site‐specific degradation of these histones. Journal of Molecular Recognition.
Baranova S. V., Dmitrenok P. S., Zubkova A. D., Ivanisenko N. V., Odintsova E. S., Buneva V. N., Nevinsky G. A.
[J MOL RECOGNIT]
|
|
How human serum albumin recognizes DNA and RNA.
Alinovskaya L. I., Sedykh S. E., Ivanisenko N. V., Soboleva S. E., Nevinsky G. A.
[BIOL CHEM]
|
|
Molecular mechanisms underlying the impact of mutations in SOD1 on its conformational properties associated with amyotrophic lateral sclerosis as revealed with molecular modelling
Nikolay A. Alemasov, Nikita V. Ivanisenko, Srinivasan Ramachandran, Vladimir A. Ivanisenko
[BMC STRUCT BIOL]
|
|
Компьютерное предсказание патогенных свойств мутантов белка SOD1, ассоциированных с боковым амиотрофическим склерозом
Алемасов Н.А., Иваниесенко Н.В., Иванисенко В.А.
[Международный журнал гуманитарных и естественных наук]
|
| 2017 |
Antibodies to H1 histone from the sera of HIV-infected patients recognize and catalyze site-specific degradation of this histone
Svetlana V. Baranova, Pavel S. Dmitrienok, Nikita V. Ivanisenko, Valentina N. Buneva, Georgy A. Nevinsky
[J MOL RECOGNIT]
|
|
Antibodies to H2a and H2b histones from the sera of HIV-infected patients catalyze site-specific degradation of these histones
Baranova S. V., Dmitrenok P. S., Ivanisenko N. V., Buneva V. N., Nevinsky G. A.
[MOL BIOSYST]
|
|
Integrated mathematical models for describing complex biological processes.
Mishchenko E. L., Petrovskaya O. V., Mishchenko A. M., Petrovskiy E. D., Ivanisenko N. V., Ivanisenko V. A.
[BIOPHYSICS]
|
|
Molecular mechanisms of the interaction between the processes of the cell response to mechanical stress and neuronal apoptosis in primary open-angle glaucoma
O. V. Saik, N. A. Konovalova, P. S. Demenkov, N. V. Ivanisenko, T. V. Ivanisenko, D. E. Ivanoshchuk, O. S. Konovalova, O. A. Podkolodnaya, I. N. Lavrik, N. A. Kolchanov, V. A. Ivanisenko
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Regression model for predicting pathogenic properties of SOD1 mutants based on the analysis of conformational stability and conservation of hydrogen bonds.
Alemasov N. A., Ivanisenko N. V., Ivanisenko V. A.
[J MOL GRAPH MODEL]
|
|
SNP_TATA_Comparator: genomewide landmarks for preventive personalized medicine.
Ponomarenko M, Rasskazov D, Chadaeva I, Sharypova E, Ponomarenko P, Arkova O, Kashina E, Ivanisenko N, Zhechev D, Savinkova L, Kolchanov N.
[Front Biosci (Schol Ed)]
|
| 2016 |
Dynamic properties of SOD1 mutants can predict survival time of patients carrying familial amyotrophic lateral sclerosis
Nikolay A. Alemasova, Nikita V. Ivanisenko, Sergey P. Medvedev, Suren M. Zakian, Nikolay A. Kolchanov & Vladimir A. Ivanisenko
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
Molecular associations of Primary Open-Angle Glaucoma with potential comorbid diseases (POAG-associome)
Olga V Saik, Natalia A Konovalova, Pavel S Demenkov, Timofey V Ivanisenko, Evgeny D Petrovskiy, Nikita V Ivanisenko, Dinara E Ivanoshchuk, Maria N Ponomareva, Olga S Konovalova, Inna N. Lavrik, Nikolay A Kolchanov, Vladimir A Ivanisenko
[Biotecnología Aplicada]
|
|
Дизайн и проверка действия малых химических соединений, направленных на ингибирование белка FADD
Н.В. Иванисенко, Л. Хиллерт, В.А. Иванисенко, И.Н. Лаврик
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Компьютерное моделирование пространственных структур пептидов из MUC1, способных ингибировать апоптоз
Н.В. Иванисенко, И.Н. Лаврик, В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Молекулярно-генетические механизмы взаимодействия процессов ответа клетки на механический стресс и нейронального апоптоза при первичной открытоугольной глаукоме
Сайк О.В., Коновалова Н.А., Деменков П.С., Иванисенко Н.В., Иванисенко Т.В., Иванощук Д.Е., Пономарева М.Н., Коновалова О.С., Подколодная О.А., Лаврик И.Н., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Молекулярно-генетические механизмы регуляции процессов апоптоза белками вируса гепатита С.
Сайк О. В., Деменков П. С., Иванисенко Н. В., Иванисенко Т. В., Лаврик И. Н., Иванисенко В. А.
[Проблемы современной науки и образования]
|
|
Структурное моделирование мод связывания НАД+ с ПАРП-1
Иванисенко Н.В., Жечев Д.А., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2015 |
ANDSystem: an Associative Network Discovery System for automated literature mining in the field of biology
Vladimir A Ivanisenko, Olga V Saik, Nikita V Ivanisenko, Evgeny S Tiys, Timofey V Ivanisenko, Pavel S Demenkov and Nikolay A Kolchanov
[BMC SYST BIOL]
|
|
Structural and dynamic properties of mutant SOD1 proteins associated with amyotrophic lateral sclerosis
Alemasov, N. A., Ivanisenko, N. V., Ivanisenko, V. A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Systemic lupus erythematosus: molecular cloning and analysis of recombinant monoclonal kappa light chain NGTA2-Me-pro-ChTr possessing two different activities—trypsin-like and metalloprotease
Timofeeva A. M., Ivanisenko N. V., Buneva V. N., Nevinsky G. A.
[INT IMMUNOL]
|
| 2014 |
A New Stochastic Model for Subgenomic Hepatitis C Virus Replication Considers Drug Resistant Mutants
Nikita V. Ivanisenko, Elena L. Mishchenko, Ilya R. Akberdin, Pavel S. Demenkov, Vitaly A. Likhoshvai, Konstantin N. Kozlov, Dmitry I. Todorov, Vitaly V. Gursky, Maria G. Samsonova, Alexander M. Samsonov, Diana Clausznitzer, Lars Kaderali, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko
[PloS One]
|
|
Exploring Interaction of TNF and Orthopoxviral CrmB Protein by Surface Plasmon Resonance and Free Energy Calculation.
Ivanisenko NV, Tregubchak TV, Saik OV, Ivanisenko VA, Shchelkunov SN
[PROTEIN PEPTIDE LETT]
|
|
Моделирование механизмов регуляции поддержания плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток: кинетический и стохастический подходы
Акбердин И.Р.,, Иванисенко Н.В., Казанцев Ф.В., Ощепкова Е.А., Омельянчук Н.А., Матушкин Ю.Г., Афонников Д.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Предсказание генов маркеров агрессивности глиомы низкой степени злокачественности по экспрессионным данным TCGA
Иванисенко Н.В., Губанова Н.В., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Структурные и динамические особенности мутантов белка SOD1, ассоциированных с боковым амиотрофическим склерозом
Алемасов Н.А., Иванисенко Н.В., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2013 |
Computational screening for new inhibitors of M. tuberculosis mycolyltransferases antigen 85 group of proteins as potential drug targets.
Gahoi S, Mandal RS, Ivanisenko N, Shrivastava P, Jain S, Singh AK, Raghunandanan MV, Kanchan S, Taneja B, Mandal C, Ivanisenko VA, Kumar A, Kumar R, Open Source Drug Discovery Consortium, Ramachandran S
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
Enhanced Differential Evolution Entirely Parallel Method for Biomedical Applications
Konstantin Kozlov, Nikita Ivanisenko, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov, Maria Samsonova, Alexander M. Samsonov
[Lect Notes Comput Sci]
|
|
Molecular Motion in Frozen Phospholipid Bilayers in the Presence of Sucrose and Sorbitol Studied by the Spin-Echo EPR of Spin Labels
NV Ivanisenko, SA Dzuba
[APPL MAGN RESON]
|
|
PЕПЛИКАЦИЯ CУБГЕНОМНОГО PЕПЛИКОНА ВИPУCА ГЕПАТИТА C В ПPИCУТCТВИИ ИНГИБИТОPОВ NS3-ПPОТЕАЗЫ: CТОXАCТИЧЕCКАЯ МОДЕЛЬ
Н.В. Иваниcенко, Е.Л. Мищенко, И.P. Акбеpдин, П.C. Деменков, В.А. Лиxошвай, К.Н. Козлов, Д.И. Тодоpов, М.Г. Cамcонова, А.М. Cамcонов, Н.А. Колчанов, В.А. Иваниcенко
[МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОФИЗИКА]
|
|
The substitutions G245C and G245D in the Zn(2+)-binding pocket of the p53 protein result in differences of conformational flexibility of the DNA-binding domain.
Pintus SS, Ivanisenko NV, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Ramachandran S, Kolchanov NA, Ivanisenko VA.
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
Молекулярные механизмы взаимодействия белков CrmB вируса оспы коров и вируса натуральной оспы с фактором некроза опухолей человека
Иванисенко Н.В., Трегубчак Т.В., Сайк О.В., Иванисенко В.А., Щелкунов С.Н., Колчанов Н.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
| 2012 |
Low-Temperature Dynamical and Structural Properties of Saturated and Monounsaturated Phospholipid Bilayers Revealed by Raman and Spin-Label EPR Spectroscopy.
N. V. Surovtsev , N. V. Ivanisenko, K. Yu. Kirillov, S. A. Dzuba
[J PHYS CHEM B]
|
|
ПОДАВЛЕНИЕ РЕПЛИКАЦИИ СУБГЕНОМНОГО РНК РЕПЛИКОНА ВИРУСА ГЕПАТИТА С ИНГИБИТОРОМ NS3 ПРОТЕАЗЫ SCH 503034 В HUH-7 КЛЕТКАХ: СТОХАСТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ
Е.Л. Мищенко, Н.В. Иванисенко, И.Р. Акбердин, П.С. Деменков, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
Монографии
| 2016 |
Создание малых химических соединений, направленно действующих на внешний путь апоптоза с помощью компьютерного моделирования и экспериментальных подходов.
И.Н. Лаврик, Л. Хиллерт, Н.В. Иванисенко, О.В. Попик, О.В. Сайк, Т.В. Иванисенко, П.С. Деменков, Е.Д. Петровский, В.А. Иванисенко
|
| 2015 |
Молекулярное моделирование и создание малых химических соединений, направленных на регуляцию программируемой клеточной гибели, индуцируемой через клеточные рецепторы / отв. ред. И.Н. Лаврик, В.А. Иванисенко
ИН Лаврик, Л Хиллерт, С Питкевич, НВ Иванисенко, ОВ Попик, ТВ Иванисенко, ПС Деменков, ЕД Петровский, ВА Иванисенко
|
| 2010 |
German/Russian Network of Computational Systems Biology. R. Hofestadt and N. Kolchanov (Eds).
E.L. Mishchenko, N.V. Ivanisenko, A.M.Mishchenko, V.A.Likhoshvai, V.A. Ivanisenko, R. Hofestadt, N.A. Kolchanov
|
| 2008 |
Распознавание функциональных сайтов в пространственных структурах белков
Иванисенко В.А., Деменков П.С., Фомин Э.С., Крестьянова М.А., Ощурков И.С., Иванисенко Т.В., Иванисенко Н.В., Пинтус С.С., Яркова Е.Э., Степаненко И.Л., Сурнина Н.Ю., Гончаров С.С., Колчанов Н.А.
|
Конференции
| 2020 |
Functional annotation of the transcription factors from Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20ZR.
Kolmykov S.K., Kulyashov M., Ivanisenko N.V., Evshin I.S., Khlebodarova T.M., Akberdin I.R.
[12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” (BGRS/SB-2020)]
|
|
Integration of transcriptomics data into a genome-scale metabolic model of the methanotrophic bacterium Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20ZR.
Kolmykov S.K., Kulyashov M., Ivanisenko N.V., Evshin I.S., Khlebodarova T.M., Akberdin I.R.
[12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” (BGRS/SB-2020)]
|
|
Learning the changes of barnase mutants thermostability from
structural fluctuations obtained using anisotropic network
modeling
Nikolay Alemasov, Nikita Ivanisenko, Vladimir Ivanisenko
[Twelfth International Multiconference BGRS/SB-2020]
|
| 2018 |
Rational design of molecular probes targeting caspase-8/c-FLIPL heterodimer in the Death-Inducing Signaling Complex
Иванисенко Никита Владимирович
[26th Conference of the European Cell Death Organization]
|
| 2017 |
Компьютерное моделирование низкомолекулярных ингибиторов эффекторного домена смерти белка FADD
Иванисенко Н.В.
[Международный конгресс Биотехнология: состояние и перспективы развития]
|
| 2016 |
ANDSystem: система автоматического извлечения знаний и интеграции омиксных данных.
В.А. Иванисенко, О.В. Сайк, Н.В. Иванисенко, Т.В. Иванисенко, П.С. Деменков, Н.А. Колчанов
[V СЪЕЗД ФИЗИОЛОГОВ СНГ и V СЪЕЗД БИОХИМИКОВ РОССИИ]
|
|
Approach to predicting the solubility/insolubility of E. coli proteins based on their primary structure using sequence normalization and machine learning techniques
N.A. Alemasov, N.V. Ivanisenko, K.S. Antonets, A.A. Nizhnikov, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2016]
|
|
Novel approach for computational design of small molecule inhibitors of protein/protein interactions in CD95/FAS pathway
Nikita Ivanisenko, A.S. Ishchenko, I.N. Lavrik, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2016]
|
| 2015 |
Молекулярно-динамическая модель для оценки влияния мутаций в белке на фенотипические признаки организма
Алемасов Н.А., Иваниесенко Н.В., Иванисенко В.А.
[Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2015 (AMCA 2015)]
|
|
MOLECULAR SIMULATION OF INHIBITION OF TUMOR NECROSIS FACTOR BY TNF-BINDING ORTOPOXVIRAL PROTEINS CRMB
Иванисенко Н.В.
[Белки и пептиды 2015]
|
|
Использование пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток для моделирования синдрома удлиненного интервала QT
Дементьева Е.В., Григорьева Е.В., Вялкова А.В., Медведев С.П., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Байрамова С.А., Иванисенко Н.В., Иванисенко В.А., Покушалов Е.А., Караськов А.М., Закиян С.М.
[VI Всероссийский съезд аритмологов]
|
|
Структурные и динамические особенности мутантов белка SOD1, ассоциированных с боковым амиотрофическим склерозом
Алемасов Н.А., Иванисенко Н.В., Иванисенко В.А.
[Белки и пептиды 2015]
|
| 2014 |
The modeling of regulatory mechanisms for mESC self-renewal: kinetic and stochastic approaches
Akberdin I.R., Ivanisenko N.V., Oschepkova E.A., Omelyanchuk N.A., Matushkin Yu.G., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине]
|
|
Application of human induced pluripotent stem cells for modelling long QT syndrome
Dementyeva E.V., Grigor’eva E.V., Vyalkova A.V., Medvedev S.P., Shevchenko A.I., Elisaphenko E.A., Bairamova S.A., Pokushalov E.A., Ivanisenko N.V., Ivanisenko V.A., Karaskov A.M., Sukhikh G.T., Zakian S.M.
[IV Международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»]
|
|
HCV replication modeling: drug resistance phenomenon
Иванисенко Никита Владимирович, Мищенко Елена Леонидовна, Иванисенко Владимир Александрович
[International Symposium on Integrative Bioinformatics 2013]
|
|
MOLECULAR MECHANISMS OF INTERACTION OF ORTHOPOXVIRAL CrmB PROTEINS WITH TUMOR NECROSIS FACTOR
Nikita Ivanisenko, Tatiana Tregubchak, Olga Saik, Sergey Shchelkunov, Vladimir Ivanisenko
[20th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships - EuroQSAR-2014]
|
|
Mathematical model for subgenomic Hepatitis C Virus replication: impact of drug resistance emergence on long-term kinetics of NS3 protease inhibitors action
Ivanisenko N., Mishchenko E., Akberdin I., Demenkov P., Kozlov K., Todorov D., Gursky V.V., Samsonova M.G., Samsonov A.M., Clausznitzer D., Kaderali L., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[9th BGRS\SB-2014]
|
|
Regulatory mechanisms for mESC self-renewal: kinetic and stochastic modeling
Akberdin I.R., Ivanisenko N.V., Oshchepkova E.A., Omelyanchuk N.A., Matushkin Yu.G., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[9th BGRS\SB-2014]
|
|
Structural and dynamical properties of SOD1 protein mutants related to familial amyotrophic lateral sclerosis
Nikolay Alemasov, Nikita Ivanisenko, Vladimir Ivanisenko
[IB-PAS 2014]
|
|
The Сompilation of Human Gene Networks Controlling Feeding Behavior and Thermoregulation
E.V. Ignatieva, O.V.Saik, O.A. Podkolodnaya, N.N. Podkolodnaya, P.S. Demenkov, E.S. Tiys, E.A. Oshchepkova, E.A. Ananko, N.V. Ivanisenko, O.V. Popik, N.L. Podkolodny, V.A. Ivanisenko, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov, E.I. Rogaev
[The first international scientific conference "Science of the Future"]
|
|
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ БЕЛКОВ CRMB ВИРУСА ОСПЫ КОРОВ И ВИРУСА НАТУРАЛЬНОЙ ОСПЫ С ФАКТОРОМ НЕКРОЗА ОПУХОЛЕЙ ЧЕЛОВЕКА
Иванисенко Никита Владимирович, Трегубчак Т.В., Сайк О.В., Щелкунов С.Н., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[XXI Российский национальный конгресс "Человек и Лекарство"]
|
|
Моделирование сердечно-сосудистых заболеваний с использованием индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека
Дементьева Е.В., Григорьева Е.В., Вялкова А.В., Медведев С.П., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Байрамова С.А., Покушалов Е.А., Иванисенко Н.В., Иванисенко В.А., Караськов А.М., Сухих Г.Т., Закиян С.М.
[Первый всероссийский симпозиум «Новейшие методы клеточных технологий в медицине»]
|
| 2012 |
A stochastic model for suppression of subgenomic hepatitis C virus replication in Huh-7 cells.
N.V. Ivanisenko, E.L. Mishchenko, I.R. Akberdin, P.S. Demenkov, V.A. Likhoshvai, M.G. Samsonova, D. Clausznitzer, L. Kaderali, N.A. Kolchanov and V.A. Ivanisenko
[Международный симпозиум "Syspatho-Системная биология и медицина"]
|
|
SUPPRESSION OF SUBGENOMIC HCV RNA BY NS3 PROTEASE ANTIVIRALS IN CELLS: A BASIC STOCHASTIC MATHEMATICAL MODEL
Ivanisenko N.V., Mishchenko E.L., Akberdin I.R., Demenkov P.S., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
| 2011 |
A mathematical model for the suppression of subgenomic Hepatitis C virus replication in Huh-7 cells in the presence of the NS3 protease inhibitors
Мищенко Е., Иванисенко Н., Акбердин И., Лихошвай В., Козлов К., Гурский В., Самсонова М., Колчанов Н., Иванисенко В.
[International Conference on Systems Biology (ICSB 2011), Хайдельберг, Германия, 28 августа-1 сентября]
|
|
Математическая модель подавления репликации субгеномного репликона вируса гепатита С в клетке с ингибитором NS3 протеазы SCH503034
Мищенко Е., Иванисенко Н., Акбердин И., Лихошвай В., Козлов К., Гурский В., Самсонова М., Колчанов Н., Иванисенко В.
[Санкт-Петербургский научный форум “Наука и общество. Физиология и медицина 21 века. VI Петербургская встреча лауреатов нобелевской премии”, Санкт-Петербург, Россия, 19-23 сентября]
|
| 2010 |
ITMSys: An interactive web-based text-mining system for automated analysis of the full-text articles
Ivanisenko T.V., Demenkov P.S., Ivanisenko N.V., Ivanisenko V.A.
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
Гранты
| 2021 |
Изучение межклеточной миграции ядер в мейозе высших растений:
трехмерный ультраструктурный анализ, иммуноокрашивание целых органов и
визуализация в живых клетках
Мурсалимов Сергей Рамильевич, Сидорчук Юрий Владимирович, Иванисенко Никита Владимирович, Пермякова Наталья Владиславовна, Щелокова Анастасия Спартаковна, Хозеева Софья Александровна
|
| 2019 |
Влияние мутаций на макроскопические свойства белков: теоретическое исследование механизмов с помощью методов молекулярного моделирования
Алемасов Николай Александрович, Иванисенко Никита Владимирович
|
| 2017 |
Оценочная функция ранжирования результатов молекулярного докинга и ее применение для дизайна ингибиторов дигидродипиколинат синтазы (DapA) из Mycobacterium tuberculosis и супероксиддисмутазы (SOD1), ассоциированной с боковым амиотрофическим склерозом человека
Сайк Ольга Владимировна Иванисенко Тимофей Владимирович Афонников Дмитрий Аркадьевич Иванисенко Никита Владимирович Иванисенко Владимир Александрович (Р) Алемасов Николай Александрович
|
| 2016 |
Дуплицированные гены в аллополиплоидном геноме пшеницы - вклад в формирование тканеспецифичных регуляторных механизмов
Глаголева Анастасия Юрьевна, Гордеева Елена Ивановна, Иванисенко Никита Владимирович, Короткова Анна Михайловна, Кукоева Татьяна Владимировна, Стрыгина Ксения Владимировна, Хлесткина Елена Константиновна, Шмаков Николай Александрович
|
| 2012 |
Изучение механизмов функционирования репликона вируса гепатита C в клетке хозяина методами системной биологии
Самсонова Мария Георгиевна, Тодоров Дмитрий Игоревич, Березин Сергей Васильевич, Гурский Виталий Валериевич, Мясникова Екатерина Марковна, Суркова Светлана Юрьевна, Козлов Константин Николаевич, Акбердин Илья Ринатович, Брагин Анатолий Олегович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович, Иванисенко Н.В., Иванисенко Тимофей Владимирович, Медведева Ирина Вадимовна, Мищенко Елена Леонидовна, Сайк Ольга Владимировна, Тийс Евгений Сергеевич
|
| 2010 |
EU-FP7 Research Project SysPatho
Акбердин И.Р., Мищенко Е.Л., Иванисенко Н.В., Деменков П.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А., Колчанова Н.А.
|
|
Разработка алгоритмов для биоинформационного анализа комплексных метаболических и молекулярно-генетических сетей
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Иванисенко Н.В., Медведева И.В., Тийс Е.С., Брагин А.О., Игнатьева Е.В., Ананько Е.В., Мищенко Е.Л., Сайл О.В.
|
Патенты
| 2021 |
Программа для парного структурного выравнивания третичных структур белков (ТСБ) / Program for pairwise structure alignment of tertiary structures of proteins by secondary structure elements and atomic coordinates (TSP)
Иванисенко Владимир Александрович, Иванисенко Тимофей Владимирович, Иванисенко Никита Владимирович
|
| 2020 |
Программа предсказания аминокислотных замен, модулирующих активность и стабильность, в белках семейства протеиназ К (ПАКЗАС/PAASAS)
Иванисенко Н.В., Алемасов Н.А., Иванисенко В.А.
|
|
|
