 |
|
|
Фишман Вениамин Семенович, к. б. н.
|
Публикации
| 2024 |
A HGF Mutation in the Familial Case of Primary Lymphedema: A Report
Galina Koksharova, Natalia Kokh, Maria Gridina, Rustam Khapaev, Vadim Nimaev, Veniamin Fishman
[INT J MOL SCI]
|
|
A germline chimeric KANK1-DMRT1 transcript derived from a complex structural variant is associated with a congenital heart defect segregating across five generations
Silvia Souza da Costa, Veniamin Fishman, Mara Pinheiro, Andre Rodrigueiro, Maria Teresa Sanseverino, Paulo Zielinsky, Claudia M. B. Carvalho, Carla Rosenberg, Ana Cristina Victorino Krepischi
[CHROMOSOME RES]
|
|
Modification of the Hi-C Technology for Molecular Genetic Analysis of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Sections of Tumor Tissues
Maria M Gridina, Yana K Stepanchuk, Miroslav A Nurridinov, Timofey A Lagunov, Nikita Yu Torgunakov, Artem A Shadsky, Anastasia I Ryabova, Nikolay V Vasiliev, Sergey V Vtorushin, Tatyana S Gerashchenko, Evgeny V Denisov, Mikhail A Travin, Maxim A Korolev, Veniamin S Fishman
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Structural variants in the Epb41l4a locus: TAD disruption and Nrep gene misregulation as hypothetical drivers of neurodevelopmental outcomes
Paul Salnikov, Alexey Korablev, Irina Serova, Polina Belokopytova, Aleksandra Yan, Yana Stepanchuk, Savelii Tikhomirov, Veniamin Fishman
[SCI REP-UK]
|
|
Towards Development of the 4C-Based Method Detecting Interactions of Plasmid DNA with Host Genome
Alexandra P Yan, Paul A Salnikov, Maria M Gridina, Polina S Belokopytova, Veniamin S Fishman
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
| 2023 |
Экспрессия генов биомолекул, ассоциированных с этиопатогенезом атеросклероза, в атеросклеротических бляшках коронарных артерий
Семаев С.Е., Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Фишман В.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Волков А.М., Рагино Ю.И.
[КОМПЛЕКСНЫЕ ПРОБЛЕМЫ СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ]
|
|
A family case of a rare autoinflammatory disease associated with mutations in the NLRP3 and TNFRSF1A genes in the practice of a rheumatologist
Kurochkina Yu.D., Korolev M.A., Letyagina E.A., Fishman V.S., Gridina M.M.,Valeeva E.S.
[Бюллетень сибирской медицины]
|
|
A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells
Anna Khabarova, Galina Koksharova, Pavel Salnikov, Polina Belokopytova, Roman Mungalov, Inna Pristyazhnuk, Artem Nurislamov, Maria Gridina, Veniamin Fishman
[CHROMOSOME RES]
|
|
Annotation of uORFs in the OMIM genes allows to reveal pathogenic variants in 5'UTRs
Alexandra Filatova, Ivan Reveguk, Maria Piatkova, Daria Bessonova, Olga Kuziakova, Victoria Demakova, Alexander Romanishin, Veniamin Fishman, Yerzhan Imanmalik, Nikolay Chekanov, Rostislav Skitchenko, Yury Barbitoff, Olga Kardymon, Mikhail Skoblov
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Cell type–specific interpretation of noncoding variants using deep learning–based methods
Maria Sindeeva, Nikolay Chekanov, Manvel Avetisian, Tatiana I Shashkova, Nikita Baranov, Elian Malkin, Alexander Lapin, Olga Kardymon, Veniamin Fishman
[GigaScience]
|
|
Expanding the list of sequence-agnostic enzymes for chromatin conformation capture assays with S1 nuclease
Gridina Maria, Popov Andrey, Shadskiy Artem, Torgunakov Nikita, Kechin Andrey, Khrapov Evgeny, Ryzhkova Oxana, Filipenko Maxim & Fishman Veniamin
[EPIGENET CHROMATIN]
|
|
Function and Evolution of the Loop Extrusion Machinery in Animals
Evelyn Kabirova, Artem Nurislamov, Artem Shadskiy, Alexander Smirnov, Andrey Popov, Pavel Salnikov, Nariman Battulin, Veniamin Fishman
[INT J MOL SCI]
|
|
Hi-C analysis of genomic contacts revealed karyotype abnormalities in chicken HD3 cell line
Maslova A, Plotnikov V, Nuriddinov M, Gridina M, Fishman V, Krasikova
[BMC GENOMICS]
|
|
Influence of human peripheral blood samples preprocessing on the quality of Hi-C libraries
M M Gridina, E Vesna, M E Minzhenkova, N V Shilova, O P Ryzhkova, L P Nazarenko, E O Belyaeva, I N Lebedev, V S Fishman
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Lampbrush chromosome studies in the post-genomic era
Alla Krasikova, Veniamin Fishman, Tatiana Kulikova
[BIOESSAYS]
|
| 2022 |
3DGenBench: a web-server to benchmark computational models for 3D Genomics
Belokopytova, Emil Viesná, Mateusz Chiliński, Yifeng Qi, Hossein Salari, Marco Di Stefano, Andrea Esposito, Mattia Conte, Andrea M. Chiariello, Vladimir B. Teif, Dariusz Plewczynski, Bin Zhang, Daniel Jost, Veniamin Fishman
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
ADAMTS1 Is Differentially Expressed in Human Lymphocytes with Various Frequencies of Endogenous γH2AX Foci and Radiation-Induced Micronuclei
S. A. Vasilyev, R. R. Savchenko, A. A. Belenko, N. A. Skryabin, A. A. Sleptsov, V. S. Fishman, A. A. Murashkina, O. V. Gribova, Z. A. Startseva, E. S. Sukhikh, A. V. Vertinskiy, L. G. Sukhikh, O. L. Serov, I. N. Lebedev
[RUSS J GENET+]
|
|
Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects
Varvara Lukyanchikova*, Miroslav Nuriddinov*, Polina Belokopytova, Alena Taskina, Jiangtao Liang, Maarten Reijnders, Livio Ruzzante, Romain Feron, Robert Waterhouse, Yang Wu, Chunhong Mao, Zhijian Tu, Igor Sharakhov, and Veniamin Fishman
* authors contributed equally
[NAT COMMUN]
|
|
Comparison and critical assessment of single-cell Hi-C protocols
M Gridina, A Taskina, T Lagunov, A Nurislamov, T Kulikova, A Krasikova, V Fishman
[Heliyon]
|
|
FastContext: A tool for identification of adapters and other sequence patterns in next generation sequencing (NGS) data
Е. Viesná, V. Fishman
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Method for the Isolation of “RNA-seq-Quality” RNA from Human Intervertebral Discs after Mortar And Pestle Homogenization
Artemii A. Ivanov, Olga N. Leonova, Daniil S. Wiebe, Alexsandr V. Krutko, Mariya M. Gridina, Veniamin S. Fishman, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov, Tatiana S. Golubeva
[Cells]
|
|
Multilevel view on chromatin architecture alterations in cancer
Maria Gridina, Veniamin Fishman
[Frontiers in Genetics]
|
|
Single-Cell DNA Methylation Analysis of Chicken Lampbrush Chromosomes
Artem Nurislamov, Timofey Lagunov, Maria Gridina, Alla Krasikova, Veniamin Fishman
[INT J MOL SCI]
|
|
The role of high-order chromatin organization in gene regulation
Veniamin Fishman, Alexey V Pindyurin
[Frontiers in Genetics]
|
|
Комплексные геномные перестройки в этиологии «хромосомного фенотипа»
М. Е. Миньженкова, Ж. Г. Маркова, Д. А. Юрченко, А. А. Тарлычева, Т. В. Маркова, Н. А. Семенова, А. Ф. Муртазина, В. В. Кадышев, М. М. Гридина, Э. . Весна, В. С. Фишман, Н. В. Шилова
[Медицинская генетика]
|
| 2021 |
Differential DNA Methylation of the IMMP2L Gene in
Families with Maternally Inherited 7q31.1 Microdeletions
is Associated with Intellectual Disability and
Developmental Delay
Vasilyev Stanislav A., Skryabin Nikolay, A. Kashevarova
Anna A., Tolmacheva Ekaterina N., Savchenko Renata R.,
Vasilyeva Oksana Yu., Lopatkina Maria E., Zarubin Alexei
A., Fishman Veniamin S., Belyaeva Elena O., Filippova
Miroslava O., Shorina Asia R., Maslennikov Arkadiy B.,
Shestovskikh Olga L., Gayner Tatyana A., Culic Vida, Vulic
Robert, Nazarenko Lyudmila P., Lebedev Igor N.
[CYTOGENET GENOME RES]
|
|
A cookbook for DNase Hi-C
Maria Gridina, Evgeniy Mozheiko, Emil Valeev, Ludmila P. Nazarenko, Maria E. Lopatkina, Zhanna G. Markova, Maria I. Yablonskaya, Viktoria Yu Voinova, Nadezhda V. Shilova, Igor N. Lebedev, Veniamin Fishman
[EPIGENET CHROMATIN]
|
|
Derivation of Ringed Seal ( Phoca hispida) Induced Multipotent Stem Cells
Violetta R Beklemisheva, Polina S Belokopytova, Veniamin S Fishman, Aleksei G Menzorov
[CELL REPROGRAM]
|
|
Erythrocytes 3D genome organization in vertebrates
Anastasia Ryzhkova, Alena Taskina, Anna Khabarova, Veniamin Fishman, Nariman Battulin
[SCI REP-UK]
|
|
Here and there: the double-side transgene localization
P A Salnikov, A A Khabarova, G S Koksharova, R V Mungalov, P S Belokopytova, I E Pristyazhnuk, A R Nurislamov, P Somatich, M M Gridina, V S Fishman
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Predicting Genome Architecture: Challenges and Solutions
P. Belokopytova, V. Fishman
[Frontiers in Genetics]
|
|
The Mutation Spectrum of Maturity Onset Diabetes
of the Young (MODY)-Associated Genes amongWestern Siberia Patients
Dinara E. Ivanoshchuk, Elena V. Shakhtshneider, Oksana D. Rymar, Alla K. Ovsyannikova, Svetlana V. Mikhailova, Veniamin S. Fishman, Emil S. Valeev, Pavel S. Orlov and Mikhail I. Voevoda
[J. Pers. Med]
|
|
Анализ дифференциальной экспрессии генов
липидного обмена в атеросклеротических бляшках
у пациентов с коронарным атеросклерозом
Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Фишман В.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И.
[Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины]
|
|
Создание библиотек баркодированных плазмид
с помощью метода клонирования по Гибсону
А.В. Смирнов, А.М. Юнусова, А.А. Муравьева, Э.C. Валеев, В.C. Фишман, Н.Р. Баттулин
[Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции]
|
| 2020 |
DNA barcoding reveals that injected transgenes are predominantly processed by homologous recombination in mouse zygote
Alexander Smirnov, Veniamin Fishman, Anastasia Yunusova, Alexey Korablev, Irina Serova, Boris V Skryabin, Timofey S Rozhdestvensky, Nariman Battulin
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Effect of the THBS1 Gene Knockout on the Radiation-Induced Cellular Response in a Model System In Vitro
R. R. Savchenko, S. A. Vasilyev, V. S. Fishman, E. S. Sukhikh, L. G. Sukhikh, A. A. Murashkin, I. N. Lebedev
[RUSS J GENET+]
|
|
Postsynthetic On-Column 2' Functionalization of RNA by Convenient Versatile Method
Olga A Krasheninina, Veniamin S Fishman, Alexander A Lomzov, Alexey V Ustinov, Alya G Venyaminova
[INT J MOL SCI]
|
|
Quantitative prediction of enhancer-promoter interactions
Polina Belokopytova, Miroslav Nuriddinov, Evgeniy Mozheiko, Daniil Fishman, Veniamin Fishman
[GENOME RES]
|
| 2019 |
3D organization of chicken genome demonstrates evolutionary conservation of topologically associated domains and highlights unique architecture of erythrocytes' chromatin.
Fishman V., Battulin N., Nuriddinov M., Maslova A., Zlotina A., Strunov A., Chervyakova D.,
Korablev A., Serov O., Krasikova A.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
C-InterSecture—a computational tool for interspecies comparison of genome architecture
Нуриддинов Мирослав Абдурахимович
Фишман Вениамин Семёнович
[BIOINFORMATICS]
|
|
Detection of Point Mutations and Chromosomal Translocations Based on Massive Parallel Sequencing of Enriched 3C Libraries
Mozheiko E.A., Fishman V.S.
[RUSS J GENET+]
|
|
Targeted genomic integration of EGFP under tubulin beta 3 class III promoter and mEos2 under tryptophan hydroxylase 2 promoter does not produce sufficient levels of reporter gene expression
Aleksei G. Menzorov
Konstantin E. Orishchenko
Veniamin S. Fishman
Anastasia A. Shevtsova
Roman V. Mungalov
Inna E. Pristyazhnyuk
Elena A. Kizilova
Natalia M. Matveeva
Natalia Alenina
Michael Bader
Nikolai B. Rubtsov
Oleg L. Serov
[J CELL BIOCHEM]
|
|
Time origin and structural analysis of the induced CRISPR/cas9 megabase-sized deletions and duplications involving the Cntn6 gene in mice.
Inna E. Pristyazhnyuk, Julia Minina, Alexey Korablev, Irina Serova, Veniamin Fishman, Maria Gridina, Timofey S. Rozhdestvensky, Leonid Gubar, Boris V. Skryabin, and Oleg L. Serov
[SCI REP-UK]
|
|
Использование тимидинкиназы для отрицательной селекции индуцированных плюрипотентных стволовых клеток
Алексей Гавриилович Мензоров, Константин
Евгеньевич Орищенко, Мария Михайловна
Гридина, Вениамин Семенович Фишман,
Олег Леонидович Серов, Анна Александровна
Кашеварова, Татьяна Владимировна
Никитина, Игорь Николаевич Лебедев
[Гены и клетки]
|
|
Происхождение и судьба масштабных хромосомных перестроек, индуцированных технологией CRISPR/Cas9 у мышей: от зигот до соматических клеток
Алексей Николаевич Кораблев, Инна Евгеньевна Пристяжнюк, Юлия Михайловна Минина, Ирина Александровна Серова, Вениамин Семенович Фишман, Мария Михайловна Гридина, Timofey Rozhdestvensky, Leonid Gubar, Boris Skryabin, Олег Леонидович Серов
[Гены и клетки]
|
|
Создание репортерного лентивирусного вектора Lego-REX1-EGFP для отбора индуцированных плюрипотентных стволовых клеток
Артем Рустамович Нурисламов, Вениамин Семенович Фишман, Алексей Гавриилович Мензоров
[Гены и клетки]
|
| 2018 |
Allele-Specific Biased Expression of the CNTN6 Gene in iPS Cell-Derived Neurons from a Patient with Intellectual Disability and 3p26.3 Microduplication Involving the CNTN6 Gene
Maria M. Gridina, Natalia M. Matveeva, Veniamin S. Fishman, Aleksei G. Menzorov, Helen A. Kizilova, Nikolay A. Beregovoy, Igor I. Kovrigin, Inna E. Pristyazhnyuk, Igor P. Oscorbin, Maxim L. Filipenko, Anna A. Kashevarova, Nikolay A. Skryabin, Tatyana V. Nikitina, Elena A. Sazhenova, Ludmila P. Nazarenko, Igor N. Lebedev, Oleg L. Serov
[MOL NEUROBIOL]
|
|
Interpreting chromosomal rearrangements in the context
of 3-dimentional genome organization: a practical guide for medical genetics
V.S. Fishman, P.A. Salnikov, N.R. Battulin
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Intragenic Microduplication of LAMA1 and a Constitutional 18p11.32 Microduplication in a Patient with Keratosis Pilaris and Intellectual Disability.
Anna A. Kashevarova, Lyudmila P. Nazarenko, Nikolay A. Skryabin, Tatyana V. Nikitina, Stanislav
A. Vasilyev, Ekaterina N. Tolmacheva, Mariya E. Lopatkina, Olga A. Salyukova, Nataliya N.
Chechetkina, Ekaterina A. Vorotelyak, Ekaterina, P. Kalabusheva, Veniamin S. Fishman, Julia
Kzhyshkowska, Claudio Graziano, Pamela Magini, Giovanni Romeo, Igor N. Lebedev
[AM J MED GENET A]
|
|
АНАЛИЗ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ЭКСПРЕССИИ МАТРИКСНЫХ МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗ
В СТАБИЛЬНОЙ И НЕСТАБИЛЬНОЙ АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШКАХ МЕТОДОМ
ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК: ПИЛОТНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Иванощук Д.Е., Рагино Ю. И.
, Шахтшнейдер Е.В., Михайлова С.В.
, Фишман В. С., Полонская Я.В.
, Каштанова Е.В., Чернявский А.М.
, Мурашов И.С., Воевода М.И.
[Российский Кардиологический Журнал]
|
| 2017 |
5’-биспиренильные зонды типа «молекулярный маяк» для детекции РНК.
Крашенинина О.А., Фишман В.С., Новопашина Д.С., Веньяминова А.Г.
[Биоорганическая химия]
|
|
Alternative dominance of the parental genomes in hybrid cells generated through the fusion of mouse embryonic stem cells with fibroblasts
Matveeva N.M., Fishman V.S., Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Pristyazhnyuk I.E., Menzorov A.G., Serov O.L.
[SCI REP-UK]
|
|
Deterministic versus stochastic model of reprogramming: new evidence from cellular barcoding technique
Anastasia M. Yunusova, Veniamin S. Fishman, Gennady V. Vasiliev, Nariman R. Battulin.
[OPEN BIOL]
|
|
Rational design and studies of excimer forming novel dual probes to target RNA
Krasheninina OA, Lomzov AA, Fishman VS, Novopashina DS, Venyaminova AG.
[Bioorganic & Medicinal Chemistry]
|
|
Нарушение экспрессии аллелей гена CNTN6 в нейронах, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток пациента с 3p26.3 микродупликацией
Гридина М.М., Матвеева Н.М., Фишман В.С., Мензоров А.Г., Кизилова Е.А., Ковригин И.И., Пристяжнюк И.Е., Никитина Т.В., Кашеварова А.А., Скрябин Н.А., Назаренко Л.П., Лебедев И.Н., Серов О.Л.
[Гены и клетки]
|
|
Установление границ хромосомных перестроек у пациентов с микроделециями и микродупликациями 3p26.3
Гридина М.М., Шнайдер Т.А., Ковригин И.И., Мензоров А.Г., Фишман В.С.
[Acta Naturae]
|
| 2016 |
Modeling of chromosomal diseases related to intellectual disability using genome editing of induced pluripotent stem cells from a patient with CNTN6 gene microdeletion
Shnayder T.A., Menzorov A.G., Matveeva N.M., Fishman V.S., Pristyazhnyuk I.E., Karamysheva T.V., Kashevarova A.A., Skryabin N.A., Sazhenova E.A., Lebedev I.N., Serov O.L.
[EUR J HUM GENET]
|
|
Практическое руководство по редактированию геномов системой CRISPR/Cas9
Мензоров А.Г., Лукьянчикова В.А., Кораблев А.Н., Серова И.А., Фишман В.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2015 |
Cell divisions are not essential for the direct conversion of fibroblasts into neuronal cells
VS Fishman, TA Shnayder, KE Orishchenko, M Bader, N Alenina and OL Serov
[CELL CYCLE]
|
|
Comparison of American mink embryonic stem and induced pluripotent stem cell transcriptomes
Aleksei G Menzorov, Natalia M Matveeva, Marios N Markakis, Venyamin S Fishman, Knud Christensen, Anna A Khabarova, Inna E Pristyazhnyuk, Elena A Kizilova, Susanna Cirera, Razvan Anistoroaei, Oleg L Serov
[BMC GENOMICS]
|
|
Comparison of the 3D organization of sperm and fibroblast genomes using the Hi-C approach
Nariman Battulin, Veniamin S Fishman, Alexander M Mazur, Mikhail Pomaznoy, Anna A Khabarova, Dmitry A Afonnikov, Egor B Prokhortchouk, Oleg L Serov
[GENOME BIOL]
|
|
Direct Conversion of Somatic Cells to Neuronal Precursors: Problems and Outlooks
I. E. Pristyazhnyuk, T. A. Shnayder, V. S. Fishman, N. M. Matveeva, and O. L. Serov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
| 2014 |
A Novel KCNJ5-insT149 Somatic Mutation Close to, but Outside, the Selectivity Filter Causes Resistant Hypertension by Loss of Selectivity for Potassium
Kuppusamy M, Caroccia B, Stindl J, Bandulik S, Lenzini L, Gioco F, Fishman V, Zanotti G, Gomez-Sanchez C, Bader M, Warth R, Rossi GP
[The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism]
|
|
Reprogramming of somatic cells: problems and solutions
6. Т.А. Schneider, V.S. Fishman, M. А. Liskovykh, S.V.Ponamartsev, О.L. Serov, А.N. Tomilin, N. Alenina
[]
|
|
Прямая конверсия соматических клеток в нейрональные предшественники: проблемы и перспективы.
И.Е. Пристяжнюк, Т.А. Шнайдер, В.С. Фишман, Н.М. Матвеева, О.Л. Серов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2013 |
INVESTIGATION OF THE SPATIAL GENOME ORGANIZATION OF MOUSE SPERM AND FIBROBLASTS BY THE Hi-C METHOD
N.R. Battulin, V.S. Fishman, A.A. Khabarova, M.Yu. Pomaznoy, T.A. Shnaider, D.A. Afonnikov, O.L. Serov
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2012 |
3С-методы в исследованиях пространственной организации генома
Н.Р. Баттулин, В.С. Фишман, Ю.Л. Орлов, А.Г. Мензоров, Д.А. Афонников, О.Л. Серов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
Монографии
| 2021 |
Практическая молекулярная генетика для начинающих: 8–9-е классы.
Аульченко Ю.С., Баттулин Н.Р., Бородин П.М., Воронина Е.Н., Карташов М.Ю., Колесникова Т.Д., Нижников А.А., Пилипенко А.С., Посух О.В., Седых С.Е., Соловьев В.И., Торгашева Н.А., Фишман В.С., Хлесткина Е.К., Цыбко А.С., Шнайдер Т.А., Юнусова А.М.
|
Конференции
| 2024 |
Differential gene expression in degenerative lumbar discs from the Russian disc degeneration study (RuDDS) biobank
Aleksandr Tiapkin, Artemii Ivanov, Olga Leonova, Aleksandr Krutko, Alexey Peleganchuk, Veniamin Fishman, Elizaveta Elgaeva, Yakov Tsepilov
[European Human Genetics Conference ESHG Hybrid Conference 2024. Berlin, Germany. 2024]
|
| 2022 |
DIFFERENTIAL EXPRESSION OF EXTRACELLULAR MATRIX-RELATED GENES IN TISSUE OF
STABLE AND UNSTABLE ATHEROSCLEROTIC PLAQUES
Elena Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya I. Ragino, Yana V.
Polonskaya, Elena V. Kashtanova, Alexandr Chernyavsky, Ivan Murashov, Mikhail Voevoda
[90th EAS Congress 2022, 20-25 мая 2022]
|
| 2020 |
Web-3DPredictor: a web interface for high-resolution prediction of genome architecture
Emil Valeev, Polina Belokopytova, Veniamin Fishman
[BGRS\SB-2020]
|
|
Analysis of rare variants in genes related to aberrations of lipid metabolism in patients with coronary atherosclerosis
Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Yana Polonskaya, Elena Kashtanova, Alexander Chernyavsky, Mikhail I. Voevoda
[88 EAS CONGRESS]
|
|
Analysis of differential expression of the cytokine/chemokine genes in tissue of stable and unstable atherosclerotic plaques
Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Yana Polonskaya, Elena Kashtanova, Alexander Chernyavsky, Ivan Murashov, Mikhail I. Voevoda
[88 EAS CONGRESS]
|
|
Analysis of rare variants in genes related to aberrations of lipid metabolism in patients with coronary atherosclerosis
Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Yana Polonskaya, Elena Kashtanova, Alexander Chernyavsky, Mikhail I. Voevoda
[88 EAS CONGRESS]
|
|
Polymorphism of the APPL1 gene in patients with carbohydrate metabolism disorders
D. Ivanoshchuk, E. Shakhtshneider, A. Ovsyannikova, S. Mikhailova, P. Orlov, O. Rymar, V. Fishman, Y. Ragino,M.I. Voevoda
[EAS Congress 2020, virtual congress]
|
|
RNA-Seq Transcriptome Analysis of Stable and Unstable Atherosclerotic Plaques
Elena V. Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Veniamin Fishman, Yuliya Ragino, Elena Kashtanova, Yana Polonskaya, Alexander Chernyavsky, Ivan Murashov, Mikhail I. Voevoda
[88 EAS CONGRESS]
|
| 2019 |
ANALYSIS OF DIFFERENTIAL EXPRESSION OF MATRIX METALLOPROTEINASES GENES IN STABLE AND UNSTABLE ATHEROSCLEROTIC PLAQUES
E. Shakhtshneider, D. Ivanoshchuk, S. Mikhailova, V. Fishman, Y. Ragino, Y. Polonskaya, E. Kashtanova, A. Chernyavsky, I. Murashov, M. Voevoda
[EAS 2019, Maastricht: 87th EAS Congress87th EAS Congress]
|
|
Predicting pathological promoter-enhancer rewiring in chromosomal rearrangements
V. Fishman, P. Belokopytova, P. Salnikov, D. Fishman
[BGRS 2018]
|
|
АНАЛИЗ КОРРЕЛЯЦИИ ДАННЫХ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК С ПРОТЕОМНЫМИ МАРКЕРАМИ В СТАБИЛЬНЫХ И НЕСТАБИЛЬНЫХ АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШКАХ КОРОНАРНЫХ АРТЕРИЙ
Шахтшнейдер Е.В., Рагино Ю.И., Иванощук Д.Е., Каштанова Е.В., Фишман В.С., Полонская Я.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И.
[I Всероссийский Конгресс «Физиология и тканевая инженерия сердца и сосудов:от клеточной биологии до протезирования»]
|
|
Идентификация мутаций в генах MYOC, WDR36, OPTN, LTBP2 и ТЕК у пациентов с врожденной глаукомой
Д.Е. Иванощук, О.В. Фенькова, С.В. Михайлова, П.С. Белокопытова, В.С.Фишман, Е.В. Шахтшнейдер, Ф.Ж. Фурсова, М.И. Воевода
[VI съезд биохимиков России и IX российский симпозиум "белки и пептиды"]
|
|
Происхождение и судьба масштабных хромосомных перестроек, индуцированных технологией CRISPR/Cas9 у мышей: от зигот до соматических клеток
Алексей Николаевич Кораблев, Инна Евгеньевна Пристяжнюк, Юлия Михайловна Минина, Ирина Александровна Серова, Вениамин Семенович Фишман, Мария Михайловна Гридина, Timofey Rozhdestvensky, Leonid Gubar, Boris Skryabin, Олег Леонидович Серов
[IV Национальный конгресс по регенеративной медицине]
|
|
Скрининг редких замен в генах, вовлеченных в дисгенез угла передней камеры глаза у пациентов с врожденной глаукомой
В.С. Фишман, Э.С. Валеев, П.С. Белокопытова, О.В. Фенькова, С.В. Михайлова, А.Ж. Фурсова, М.И. Воевода, Д.Е. Иванощук
[Научно-практическая конференция с международным участием «Генетика — фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции»]
|
|
ТАРГЕТНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНОВ LDLR, APOB, PCSK9, LDLRAP1 И КЛАСТЕРА ГЕНОВ APOA5-A4-C3-A1 У ПАЦИЕНТОВ С СЕМЕЙНОЙ ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИЕЙ
Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Фишман В.С., Белокопытова П.С., Орлов П.С., Тимощенко О.В., Воевода М.И.
[I Всероссийский конгресс с международным участием "Физиология и тканевая инженерия сердца и сосудов: от клеточной биологии до протезирования"]
|
| 2018 |
Получение мышей с хромосомными перестройками гена CNTN6 при помощи CRISPR/CAS9 технологии и их характеристика
Кораблев А.Н., Пристяжнюк И.Е., Минина Ю.М., Серова И.А., Фишман В.С., Рождественский Т.С, Губарь Л, Скрябин Б.В., Серов О.Л.
[Международный конгресс "CRISPR-2018"]
|
| 2017 |
Analysis of chicken chromatin structure using Hi-C data.
Nuriddinov M.A., Fishman V.S., Battulin N.R., Maslova A.V., Serov O.L., Krasikova A.V.
[BELYAEV CONFERENCE]
|
|
THE CHICKEN HI-C DATA REVEAL THE RELATIONS BETWEEN THE LOCAL GENOME PROPERTIES AND THE CHROMOSOME ARCHITECTURE
Nuriddinov M.A., Fishman V.S., Battulin N.R., Maslova A.V., Serov O.L., Krasikova A.V.
[II Всероссийская конференция с международным участием «Высокопроизводительное секвенирование в геномике»]
|
|
Targeted modification of topological domains in mice
Veniamin Fishman, Varvara Lukyanchikova, Oleg Serov, Nariman Battulin
[25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus]
|
|
Нарушение экспрессии аллелей гена CNTN6 в нейронах, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток пациента с 3p26.3 микродупликацией
Гридина М.М., Матвеева Н.М., Фишман В.С., Мензоров А.Г., Кизилова Е.А., Ковригин И.И., Пристяжнюк И.Е., Никитина Т.В., Кашеварова А.А., Скрябин Н.А., Назаренко Л.П., Лебедев И.Н., Серов О.Л.
[III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине]
|
|
Установление границ хромосомных перестроек у пациентов с микроделециями и микродупликациями 3p26.3
Гридина М.М., Шнайдер Т.А., Ковригин И.И., Мензоров А.Г., Фишман В.С.
[II Всероссийская конференция с международным участием «Высокопроизводительное секвенирование в геномике»]
|
| 2016 |
Conservation of spatial genome organization: from chicken erythrocytes to mouse sperm cells
Veniamin Fishman, Nariman Battulin, Antonina Maslova, Alla Krasikova, Oleg Serov
[5 Съезд Биохимиков России]
|
|
Modeling of chromosomal diseases related to intellectual disability using genome editing of induced pluripotent stem cells from a patient with CNTN6 gene microdeletion
Shnayder T.A., Menzorov A.G., Matveeva N.M., Fishman V.S., Pristyazhnyuk I.E., Karamysheva T.V., Kashevarova A.A., Skryabin N.A., Sazhenova E.A., Lebedev I.N., Serov O.L.
[European Human Genetics Conference 2016]
|
|
Susceptibility of embryonic fibroblasts to reprogramming inherited through cell division
Юнусова Анастасия Маратовна
Фишман Вениамин Семенович
Баттулин Нариман Рашитович
[Cell Technologies at The Edge: Research & Practice (CTERP)]
|
|
Symmetric reprogramming fate in somatic cell lineages
Юнусова Анастасия Маратовна
Фишман Вениамин Семенович
Баттулин Нариман Рашитович
[EMBO Workshop «Nuclear function and cell fate choice»]
|
|
THE SPATIAL MAP OF AVIAN GENOME
V. Fishman, N. Battulin, A. Maslova, O. Serov, A. Krasikova.
[10th International Multiconference: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
| 2015 |
ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ЯДЕРНОГО И МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМОВ 3С МЕТОДАМИ
Фишман В.С., Баттулин Н.Р., Миронова И.В., Помазной М.Ю., Афонников Д.А., Мазур А.М., Хабарова А.А., Прохорчук Е.Б., Серов О.Л.
[Международная конференция «Хромосома» 2015]
|
| 2014 |
Создание новой трансгенной линии мышей для изучения процессов нейрогенеза
Орищенко* К.Е., Мензоров А.Г., Баттулин Н.Р., Кизилова Е.А., Пристяжнюк И.Е., Голубица А.Н., Железова А.И., Матвеева Н.М., Фишман В.С., Шевцова А.А., Рубцов Н.Б., Серов О.Л.
[VI Съезд ВОГИС]
|
|
Создание системы ДНК-баркодированных вирусов для маркирования клеток
Юнусова Анастасия Маратовна Фишман Вениамин Семенович Баттулин Нариман Рашитович
[VI Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике на тему «ГЕНОМИКА И СИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯ»]
|
Гранты
| 2020 |
Популяционный анализ трехмерной организации промоторных районов генов человека
Фишман Вениамин Семенович (Р) Можейко Евгений Александрович
|
|
Структура, функции и эволюция мейотических хромосом птиц
Торгашева АА, Сух А, Красикова АВ, Малиновская ЛП, Пристяжнюк ИЕ, Фишман ВС, Бородин ПМ, Задесенец КС, Гридина ММ, Нуриддинов МА
|
| 2019 |
Топологически-ассоциированные домены хроматина и А/В-компартменты в геноме курицы: идентификация и визуализация с помощью технологии HiC и микроскопии сверхвысокого разрешения
Красикова Алла Валерьевна
Дедух Дмитрий Викторович
Фишман Вениамин Семенович
Баттулин Нариман Рашитович
Гридина Мария Михайловна
Куликова Татьяна Вадимовна
Маслова Антонина Владимировна
Нуриддинов Мирослав Абдурахимович
Рюмин Сергей Сергеевич
Старшова Полина Андреевна
Штомпель Анастасия Сергеевна
|
|
Разработка нового подхода к молекулярной диагностике хромосомных болезней человека на основе комбинации технологий захвата конформации хромосом и массового параллельного секвенирования
Фишман Вениамин Семенович (Р)
Баттулин Нариман Рашитович
Скрябин Николай Алексеевич
Лебедев Игорь Николаевич
Кашеварова Анна Александровна
Лопаткина Мария Евгеньевна
Назаренко Людмила Павловна
Нуриддинов Мирослав Абдурахимович
Белокопытова Полина Станиславовна
Сальников Павел Александрович
|
|
Исследование роли конденсинов в поддержании трехмерной архитектуры интерфазного ядра плюрипотентных клеток
Юнусова Анастасия Маратовна
Нуриддинов Мирослав Абдурахимович
Смирнов Александр Васильевич
Шнайдер Татьяна Александровна
Фишман Вениамин Семенович
|
| 2018 |
Разработка нового подхода к молекулярной диагностике хромосомных болезней человека на основе комбинации технологий захвата конформации хромосом и массового параллельного секвенирования,
Фишман Вениамин Семенович
Баттулин Нариман Рашитович
Скрябин Николай Алексеевич
Лебедев Игорь Николаевич
Кашеварова Анна Александровна
Лопаткина Мария Евгеньевна
Назаренко Людмила Павловна
Нуриддинов Мирослав Абдурахимович
Белокопытова Полина Станиславовна
Сальников Павел Александрович
|
|
Исследование роли пространственной организации генома в регуляции активности генов на примере локуса Pdgfra/Kit/Kdr, с использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9
Фишман Вениамин Семенович
Юнусова Анастасия Маратовна
Хабарова Анна Александровна
Кораблев Алексей Николаевич
Рыжкова Анастасия Сергеевна
Лукьянчикова Варвара Алексеевна
Смирнов Александр Васильевич
Гридина Мария Михайловна
Баттулин Нариман Рашитович
|
| 2017 |
Реконструкция хромосомной организации геномов млекопитающих и новый взгляд на хромосомную эволюцию
Ларкин Денис Михайлович
Баттулин Нариман Рашитович
Игошин Александр Владимирович
Нуриддинов Мирослав Абдурахимович
Фишман Вениамин Семенович
Юдин Николай Серафимович
Юрченко Андрей Александрович
|
|
Направленная модификация генома для исследования роли пространственной архитектуры ядра в развитии патологий
Фишман ВС, Нуриддинов МА, Сальников ПА
|
| 2014 |
Клеточные и молекулярные механизмы патогенеза хромосомных болезней
Лебедев Игорь Николаевич Мензоров Алексей Гавриилович Серов Олег Леонидович Матвеева Наталья Михайловна Фишман Вениамин Семенович
|
|
Исследование пространственной организации геномов сперматозоидов и фибробластов мыши
Фишман Вениамин Семенович, Баттулин Нариман Рашитович, Помазной Михаил Юрьевич
|
| 2013 |
Прямая конверсия фибробластов в серотонинергические нейроны
Баттулин Нариман Рашитович, Хабарова Анна Александровна,Фишман Вениамин Семенович, Шнайдер Татьяна Александровна, Юнусова Анастасия Маратовна
|
| 2012 |
Роль клеточного деления при трансдифференцировке фибробластов в нейроны
Мензоров Алексей Гавриилович, Баттулин Нариман Рашитович, Фишман Вениамин Семенович, Юнусова Анастасия Маратовна, Шнайдер Татьяна Александровна
|
|
Наследование способности к репрограммированию в клеточных делениях
Баттулин Нариман Рашитович, Фишман Вениамин Семенович, Шнайдер Татьяна Александровна, Юнусова Анастасия Маратовна
|
|
Исследование трехмерной организации генома половых и соматических клеток методом Hi-C
Баттулин Нариман Рашитович Серов Олег Леонидович Колчанов Николай Александрович Рубцов Николай Борисович Орлов Юрий Львович Афонников Дмитрий Аркадьевич Медведев Кирилл Евгеньевич Карамышева Татьяна Витальевна Юнусова Анастасия Маратовна Шнайдер Татьяна Александровна Фишман Вениамин Семенович Мензоров Алексей Гавриилович Хабарова Анна Александровна
|
Научное руководство
| 2019 |
Разработка и экспериментальная валидация модели для предсказания пространственных контактов хроматина на основе эпигенетических характеристик геномов мыши и человека
Фишман Вениамин Семенович
[Блокопытова Полина Станиславовна]
|
|
Использование системы Cre-LoxP для индукции множественных хромосомных перестроек в геноме клеток человека
[Мунгалов Роман Владимирович]
|
| 2018 |
УВЕЛИЧЕНИЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ВНЕСЕНИЯ КРУПНОМАСШТАБНЫХ ГЕНОМНЫХ ДЕЛЕЦИЙ ЗА СЧЕТ НАПРАВЛЕННОГО РЕМОДЕЛИНГА АРХИТЕКТУРЫ ХРОМАТИНА
[Сальников Павел Александрович]
|
| 2016 |
Определение пути формирования гибридных клеток мыши фибробластного фенотипа: дифференцировка или репрограммирование
Фишман ВС
[Побединцева Мария Андреевна]
|
|
ПОЛУЧЕНИЕ ЭМБРИОНАЛЬНЫХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК МЫШИ, НЕСУЩИХ ГЕН ГИБРИДНОГО БЕЛКА MEOS2-TPH2 ПОД ЭНДОГЕННЫМ ПРОМОТОРОМ ГЕНА TPH2
Фишман ВС
[Петрова Анна Игоревна]
|
Учебные курсы
| 2017 |
ГМО: технологии создания и применение
Баттулин НР, Фишман ВС, Мензоров АГ
|
| 2016 |
Главные элементы успешной научной карьеры: Организация науки в России и за рубежом
Фишман ВС
|
Диссертации
| 2015 |
Сравнение пространственной организации геномов фибробластов и сперматозоидов мыши методом Hi-C
[Кандидат]
|
|
|
