 |
|
|
Суслов Валентин Владимирович
|
Публикации
| 2022 |
Биоинформатический поиск соответствия дифференциально экспрессируемых генов домашних и диких животных с ортологичными генами, изменяющими репродуктивный потенциал человека.
Пономаренко М.П., Чадаева И.В., Пономаренко П.М., Богомолов А.Г., Ощепков Д.Ю., Шарыпова Е.Б., Суслов В.В., Осадчук А.В., Осадчук Л.В., Матушкин Ю.Г.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2021 |
Domestication explains two-thirds of differential-gene-expression variance between domestic and wild animals; the remaining one-third reflects intraspecific and interspecific variation
Chadaeva I, Ponomarenko P, Kozhemyakina R, Suslov V, Bogomolov A, Klimova N, Shikhevich S, Savinkova L, Oshchepkov D, Kolchanov N, Markel A, Ponomarenko M.
[Animals]
|
| 2020 |
The Phylogeny of Class B Flavoprotein Monooxygenases and the Origin of the YUCCA Protein Family
Turnaev I.I., Gunbin K.V., Suslov V.V., Akberdin I.R., Kolchanov N.A., Afonnikov D.A.
[Plants]
|
| 2018 |
Evolution of Brain Active Gene Promoters in Human Lineage Towards the Increased Plasticity of Gene Regulation.
Gunbin KV, Ponomarenko MP, Suslov VV, Gusev F, Fedonin GG, Rogaev EI.
[MOL NEUROBIOL]
|
| 2016 |
Biomedical and candidate SNP markers of chronopathologies can significantly change the affinity of the ТАТА-binding protein to the promoters of human genes.
Rasskazov DA, Podkolodnyy NL, Podkolodnaya OA, Tverdokhleb NN, Suslov VV, Savinkova LK, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Candidate SNP markers of chronopathologies are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters
Petr Ponomarenko, Dmitry Rasskazov, Valentin Suslov, Ekaterina Sharypova, Ludmila Savinkova, Olga Podkolodnaya, Nikolay Podkolodny, Natalya Tverdokhleb, Irina Chadaeva, Mikhail Ponomarenko, Nikolay Kolchanov
[Biomed Res Int]
|
|
Effects of SNPs in the positioning regions of RNA polymerase II on the TBP/promoter affinity in genes of the human circadian clock.
Podkolodnaya OA, Rasskazov DA, Podkolodnyy NL, Podkolodnaya NN, Suslov VV, Savinkova LK, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Prediction and verification of the influence of the rs367781716 SNP on the interaction of the ТАТА-binding protein with the promoter of the human АВСА9 gene
Arkova OV, Drachkova IA, Arshinova TV, Rasskazov DA, Suslov VV, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP, Kolchanov NA, Savinkova LK
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
| 2015 |
How to use SNP_TATA_Comparator to find a significant change in gene expression caused by the regulatory SNP of this gene’s promoter via a change in affinity of the TATA-binding protein for this promoter
Mikhail Ponomarenko, Dmitry Rasskazov, Olga Arkova, Petr Ponomarenko, Valentin Suslov, Ludmila Savinkova, Nikolay Kolchanov
[Biomed Res Int]
|
|
Identification of the relationship between the variability of the expression of signaling pathway genes in the human brain and the affinity of TATA-binding protein to their promoters.
Ponomarenko MP, Suslov VV, Gunbin KV, Ponomarenko PM, Vishnevsky OV, Kolchanov NA.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
The number of homologs of some enzymes involved in tryptophan biosynthesis is correlated to the proportion of proteins associated with transcription in plants
Turnaev I.I., Akberdin I. R., Suslov V.V., Afonnikov D.A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Биомедицинские и кандидатные SNP-маркеры для хронопатологий могут достоверно изменять сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека.
Рассказов Д.А., Подколодный Н.Л., Подколодная О.А., Подколодная Н.Н., Суслов В.В., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Влияние однонуклеотидных полиморфных замен в районах позиционирования РНК-полимеразы II на сродство к ним TBP в генах циркадных часов человека
Подколодная О.А., Рассказов Д.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Суслов В.В., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
ПРОГНОЗ И ВЕРИФИКАЦИЯ ВЛИЯНИЯ SNP rs367781716 НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ТАТА-СВЯЗЫВАЮЩЕГО БЕЛКА С ПРОМОТОРОМ ГЕНА АВСА9 ЧЕЛОВЕКА
Аркова ОВ., Драчкова ИА., Аршинова ТВ., Рассказов ДА., Суслов ВВ., Пономаренко ПМ., Пономаренко МП., Колчанов НА., Савинква ЛК.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2014 |
Выявление связи вариабельности экспрессии генов путей передачи сигналов в мозге человека со сродством ТАТА-связывающего белка к промоторам этих генов
М.П. Пономаренко, В.В. Суслов, К.В. Гунбин, П.М. Пономаренко, О.В. Вишневский, Н.А. Колчанов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Число гомологов некоторых ферментов биосинтеза триптофана у растений коррелирует с долей белков, ассоциированных с транскрипцией
Турнаев И.И., Акбердин И.Р., Суслов В.В., Афонников Д.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2013 |
Abundances of microRNAs in human cells can be estimated as a function of the abundances of YRHB and RHHK tetranucleotides in these microRNAs as an ill-posed inverse problem solution
Ponomarenko MP, Suslov VV, Ponomarenko PM, Gunbin KV, Stepanenko IL, Vishnevsky OL, Kolchanov NA
[Frontiers in Genetics]
|
|
Genome Features and GC Content in Prokaryotic Genomes in Connection with Environmental Evolution
Suslov V.V., Afonnikov D.A., Podkolodny N.L., Orlov Yu.L.
[PALEONTOL J+(RUS)]
|
|
Par force evolution as a mechanism for rapid adaptation
V. V. Suslov
[Paleontology Journal (Mosk).]
|
|
Phylogenetic Analysis of Housekeeping Archaeal Proteins and Early Stages of Archaea Evolution
K. V. Gunbin, V. V. Suslov, D. A. Afonnikov
[PALEONTOL J+(RUS)]
|
|
Межмолекулярные взаимодействия в функциональных системах нейрона.
Проскура А.Л., Малахин И.А., Турнаев И.И., Суслов В.В., Запара Т.А., Ратушняк А.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2012 |
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes (SAMEM): Analysis of molecular evolution modes at deep inner branches of the phylogenetic tree
Gunbin KV, Suslov VV, Genaev MA, Afonnikov DA.
[In Silico Biology]
|
|
Computer modeling of genome complexity variation trends in prokaryotic communities under varying habitat conditions
Lashin S.A., Matushkin Yu.G., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
[ECOL MODEL]
|
|
Теории биологической эволюции с позиций современного развития системной биологии
С. А. Лашин, В. В. Суслов, Ю. Г. Матушкин
[RUSS J GENET+]
|
| 2011 |
Evolutionary Trends in the Prokaryotic Community and Prokaryotic Community–Phage Systems
S. A. Lashin, Yu. G. Matushkin, V. V. Suslov, N. A. Kolchanov
[RUSS J GENET+]
|
|
In vitro examining the existing prognoses how TBP binds to TATA with SNP associated with human diseases
Drachkova I.A., Ponomarenko P.M., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Suslov V.V., Savinkova L.K., Kolchanov N.A.
[Health]
|
|
Molecular evolution of cyclin proteins in animals and fungi.
Gunbin K.V., Suslov V.V., Turnaev I.I., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[BMC EVOL BIOL]
|
|
Парадоксы "Проблем происхождения жизни"
Колчанов Н.А., Суслов В.В.
[Наука в России]
|
|
Подход и программные средства для описания макро- и микродинамики экосистем
Тимонов В.С., Суслов В.В., Брянская А.В., Ефимов В.М., Колчанов Н.А.
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
|
|
Эволюционные тренды в системах “прокариотическое сообщество” и “прокариотическое сообщество–фаг”
Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
[RUSS J GENET+]
|
| 2010 |
Comparative Modeling Of Coevolution In Communities Of Unicellular Organisms: Adaptability And Biodiversity
Lashin S.A., Suslov V.V., Matushkin Y.G.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Possibility spaces and evolution
Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A.
[PALEONTOL J+(RUS)]
|
|
SNPs in the HIV-1 and HIV-2 TATA Box and the AIDS pandemic
Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Savinkova L.K., Ponomarenko P.M., Efimov V.M., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Адаптация к бездне
Афонников Д.А., Гунбин В.К., Суслов В.В.
[Химия и жизнь]
|
|
Полиморфизмы ТАТА-боксов генов хозяйственно важных и лабораторных животных и растений, ассоциированные с их селекционно-ценными признаками
Суслов В.В., Пономаренко П.М, Пономаренко М.П, Драчкова И.А., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К., Колчанов Н.А.
[RUSS J GENET+]
|
|
Точное уравнение равновесия для четырех шагов связывания ТВР с ТАТА-боксом для предсказания фенотипической экспрессии при мутациях
Пономаренко П.М., Суслов В.В.,Савинкова Л.К., Пономаренко М.П.,Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
| 2009 |
Дарвиновская эволюция и регуляторные генетические системы
В.В. Cуслов, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Моделирование эволюции трофически замкнутых сообществ с компенсаторным и некомпенсаторным метаболизмом
Лашин C.А., Суслов В.В., Матушкин Ю.Г.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Предисловие: 200 лет со дня рождения Чарлза Дарвина
Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К., Суслов В.В.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2008 |
Approaches to the Computer Reconstruction of the Biological Networks
Miginsky D.S., Suslov V.V., Timonov V.S., Rasskazov D.A., Sournina N.Yu., Podkolodny N.L.
[INTELL DATA ANAL]
|
|
Genetic Systems of Development: Functional Dynamics and Molecular Evolution
Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Международная конференция “Происхождение и эволюция биосферы” (BOE’2007)
Суслов В.В., Снытников В.Н.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2007 |
Simulation of coevolution in community by using the "Evolutionary Constructor" program. In Silico Biology (Special Issue: 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS 2006))
Lashin S.A., Suslov V.V., Kolchanov N.A., Matushkin Yu.G
[In Silico Biology]
|
|
Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция
Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Сетевое описание биосистем: проблемы и подходы
Колчанов Н.А., Мигинский Д.С., Подколодный Н.Л., Рассказов Д.А., Суслов В.В., Тимонов В.С., Сергеев М.Г.
[Вычислительные технологии]
|
| 2006 |
On the Early Stages of the Evolution of the Geosphere and Biosphere
Dobretsov N.L., Kolchanov N.A., Suslov V.V.
[PALEONTOL J+(RUS)]
|
| 2005 |
Интеграция генных сетей, контролирующих физиологические функции организма
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Суслов В.В., Хлебодарова Т.М., Проскура А.Л., Воронич Е.С., Дубовенко Е.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2004 |
Генетические механизмы кодирования биологической сложности
Суслов В.В., Гунбин К.В., Колчанов Н.А.
[Экологическая генетика]
|
|
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть I.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А.
[Сибирский экологический журнал]
|
|
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть II.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А.
[Сибирский экологический журнал]
|
|
Моделирование биологической эволюции: регуляторные генетические системы и кодирование сложности биологической организации
Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин К.В.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
Монографии
| 2017 |
Cladogenesis
Ponomarenko M., Gunbin K., Doroshkov A., Suslov V., Kolchanov N.
|
|
Hogness Box
Ponomarenko M., Mironova V., Gunbin K., Ponomarenko P., Suslov V., Savinkova L.
|
| 2014 |
Evolution, Biodiversity and Ecology in Microbial Communities: Mathematical Modeling and Simulation with the “Haploid Evolutionary Constructor” Software Tool
Lashin S.A., Matushkin Yu.G., Klimenko A.I., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
|
| 2012 |
Том IV. Глава 6. Компьютерная эволюционная биология. 6.3.2.3. Безмасштабные сети и их эволюция.
Титов И.И., Гунбин К.В., Суслов В.В.
|
| 2011 |
Компьютерный анализ эволюции генных сетей морфогенеза
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Суслов В.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
|
|
Моделирование коэволюции одноклеточных гаплоидных организмов с помощью программного комплекса «Эволюционный конструктор»
Лашин С.А., Суслов В.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
|
| 2010 |
Роль микроорганизмов в функционировании живых систем: фундаментальные проблемы и биоинженерные приложения
И. С. Андреева, А. В. Брянская, С. М. Жмодик, В. А. Лихошвай, Б. Б. Намсараев, Д. Ю. Рогозин, О. П. Таран, С. Е. Ткачев, Е. А. Ананько, K. Aсано, Д. А. Афонников, Т. Г. Банзаракцаева, Д. Д. Бархутова, Ж. Батаа, В. В. Бахвалова, С. И. Беликов, В. М. Белолипецкий, П. В. Белолипецкий, Т. К. Белянин, А. А. Богуш, Е. В. Болдырева, Е. Н. Болдарева, A. В. Брушков, Л. И. Бурцева, С. П. Бурюхаев, В. В. Власов, С. Н. Генова, Н. А. Гольцова, В. М. Горленко, К. В. Гунбин, Э. В. Данилова, А. Г. Дегерменджи, М. А. Дымова, Е. К. Емельянова, В. И. Жираковский, А. В. Задорожный, С. С. Ибрагимова, Л. И. Иванов, Г. В. Калмыкова, Т. П. Камынина, А. В. Качко, И. В. Козлова, Л. П. Козырева, Ю. П. Колмогоров, Н. А. Колчанов, В. Н. Компаниченко, Е. В. Лаврентьева, Е. В. Лазарева, С. А. Лашин, С. Г. Ливанов, Н. Н. Ливанова, Ю. Г. Матушкин, И. B. Морозов, О. В. Морозова, З. Б. Намсараев, С. Ф. Орешкова, Д. Ю. Ощепков, В. В. Панов, В. Н. Пармон, С. Е. Пельтек, Н. И. Печуркина, О. А. Подколодная, В. А. Пономарчук, И. Г. Прокопкин, В. Г. Пугачев, Н. М. Пуховская, Л. И. Пучкова, В. А. Рар, А. В. Ратушный, В. Е. Репин, А. С. Розанов, Е. И. Рябчикова, Ю. В. Сабитова, И. В. Саранина, Д. В. Семенова, В. А. Симонов, О. Г. Смирнова, К. Н. Сорокина, Т. Ю. Степанова, О. В. Стронин, В. В. Суслов, M. Taнака, О. С. Таранов, Н. В. Тикунова, И. И. Турнаев, Т. Торок, О. Д. Тотменина, М. Ю. Трусова, M. Утсуми, М. Л. Филипенко, Н. В. Фоменко, M. Фукуда, М. А. Хаснатинов, Т. М. Хлебодарова, Д. Д. Цыренова
|
| 2008 |
Анализ режима адаптивной эволюции в белках вируса гепатита С. В Системная компьютерная биология, под ред. Колчанова Н.А., Гончарова С.С., Лихошвая, В.А., Иванисенко В.А., Новисибирск, 2008, Изд-во СО РАН, с. 602-610.
Варламова Е.С., Афонников Д.А., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
|
|
Моделирование эволюции сообществ: программа “Эволюционный конструктор” // В монографии: Системная компьютерная биология. Ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А.
Лашин С.А., Суслов В.В., Лихошвай В.А., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
|
|
Понятие о генных сетях. База данных GeneNet.
Ананько Е.А., Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
|
|
Процессы морфогенеза и подходы к их моделированию
Николаев С.В., Гунбин К.В., Омельянчук Н.А., Суслов В.В., Омельянчук Л.В., Колчанов Н.А.
|
Конференции
| 2022 |
Domestication explains 2/3 of differential gene expression variance between domestic and wild animals; the remaining 1/3 reflects intraspecific and interspecific variation
Irina Chadaeva, Petr Ponomarenko, Rimma Kozhemyakina, Valentin Suslov, Anton Bogomolov, Natalya Klimova, Svetlana Shikhevich, Ludmila Savinkova, Dmitry Oshchepkov, Nikolay A. Kolchanov, Arcady Markel, Mikhail Ponomarenko
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference]
|
| 2019 |
ЗАКОН ИЛИ ПРАВИЛА ГОМОЛОГИЧЕСКИХ РЯДОВ? I. ТЕОРИИ ЭВОЛЮЦИИ И ЗАКОН ВАВИЛОВА
Суслов В.В., Пономаренко М.П., Рассказов Д.А.
[Экология и эволюция: новые горизонты, посвященный 100-летию С.С. Шварца]
|
|
ЗАКОН ИЛИ ПРАВИЛА ГОМОЛОГИЧЕСКИХ РЯДОВ? II. РЯДЫ КОПА И ВАВИЛОВА
Суслов В.В., Пономаренко М.П., Рассказов Д.А.
[Экология и эволюция: новые горизонты, посвященная 100-летию академика С.С. Шварца]
|
|
ЗАКОН ИЛИ ПРАВИЛА ГОМОЛОГИЧЕСКИХ РЯДОВ? III. АДАПТАЦИЯ И САМОАДАПТАЦИЯ
Брагин А.О., Суслов В.В., Орлов Ю.Л.
[Экология и эволюция: новые горизонты, посвященная 100-летию академика С.С. Шварца]
|
|
ЗАКОН ИЛИ ПРАВИЛА ГОМОЛОГИЧЕСКИХ РЯДОВ? IV. УРБАНИЗАЦИЯ И ДОМЕСТИКАЦИЯ
Брагин А.О., Суслов В.В., Орлов Ю.Л.
[Экология и эволюция: новые горизонты, посвященная 100-летию академика С.С. Шварца]
|
|
Урбанизация и доместикация
Брагин А.О., Чадаева И.В., Суслов В.В., Орлов Ю.Л.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.]
|
| 2018 |
Analysis of genome size, CG content and characteristics of microorganisms’environment habitats
V.V. Suslov, A.V. Tsukanov, Y.L. Orlov
[BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE\SYSTEMS BIOLOGY (BGRS\SB-2018)]
|
|
Bacterial Species Concept and Rampant Recombination of Wolbachia Genomes
Yury Ilinsky, Yuri Vyatkin, Roman Bykov, Mary Yudina, Valentin Suslov
[Chromosome 2018 : International Conference.]
|
|
Discordant evolution of YUCCA family proteins demonstrated along sequence.
I. Turnaev, K. Gunbin, V. Suslov, D. Afonnikov
[11-ая Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии — BGRS\SB-2018]
|
|
Homologous series and parallel evolution problem
V. Suslov, M. Ponomarenko, D. Rasskazov
[BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE\SYSTEMS BIOLOGY (BGRS\SB-2018)]
|
|
Ontology of homologous series
V. Suslov
[BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE\SYSTEMS BIOLOGY (BGRS\SB-2018)]
|
| 2017 |
Evolution of brain active gene promoters in human lineage towards the increased plasticity of gene regulation
K.V.Gunbin, M.P. Ponomarenko, V.V. Suslov, F.Gusev, G.G. Fedonin, E.I. Rogaev
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology' 2017 (MCCMB'2017)]
|
|
ГОМОЛОГИЧЕСКИЕ РЯДЫ И ПРОБЛЕМА АДАПТАЦИИ
Суслов В.В., Пономаренко М.П., Рассказов Д.А.
[3-я международная конференция «Современные проблемы биологической эволюции», посвященная 130-летию со дня рождения Н.И. Вавилова и 110-летию со дня основания Государственного Дарвиновского музея]
|
|
Норма реакции в эволюции человека и антропоидов:
сравнительно-геномный анализ проксимальных
промоторов
Гунбин К.В., Пономаренко М.П., Суслов В.В.
[3-я международная конференция «Современные проблемы биологической эволюции», посвященная 130-летию со дня рождения Н.И. Вавилова и 110-летию со дня основания Государственного Дарвиновского музея]
|
|
Рекомбинация эндосимбиотической бактерии Wolbachia и концепция вида у прокариот
Илинский Ю.Ю., Суслов В.В., Быков Р.А., Юдина М.А., Юрлова Г.В.
[3-я международная конференция «Современные проблемы биологической эволюции», посвященная 130-летию со дня рождения Н.И. Вавилова и 110-летию со дня основания Государственного Дарвиновского музея]
|
|
Эндосимбионт Wolbachia в популяциях насекомых: горизонтальный перенос и рекомбинация штаммов
Илинский Ю.Ю., Юдина М.А., Быков Р.А., Суслов В.В.
[Международная научная конференция «Генетика популяций: прогресс и перспективы», посвящённая 80-летию со дня рождения академика Ю. П. Алтухова и 45-летию лаборатории популяционной генетики ИОГен РАН]
|
| 2016 |
ADAPTATION AND BIOLOGICAL TIME
V.V. Suslov
[BGRS\SB-2016]
|
|
MOLECULAR EVOLUTION OF YUCCA PROTEIN FAMILY
I.I. Turnaev, V.V. Suslov, K.V. Gunbin, D.A. Afonnikov
[BGRS\SB-2016]
|
|
TATA-BOX AND GENE EXPRESSION NORM OF REACTION
V.V. Suslov, M.P. Ponomarenko, D.A. Rasskazov
[BGRS\SB-2016]
|
|
TATA-Box AND BRAIN GENES NORM OF REACTION
Ponomarenko M.P., Suslov V.V., Gunbin K.V., Ponomarenko P.M., Vishnevsky O.V.
[CSGB-2016]
|
|
VAVILOV’S HOMOLOGOUS SERIES AS EVOLUTIONARY FORCE
V.V. Suslov, M.P. Ponomarenko, D.A. Rasskazov
[BGRS\SB-2016]
|
|
Компьютерные оценки связи состава генома прокариот и среды обитания
Суслов В.В., Чадаева И.В., Орлов Ю.Л.
[II Всероссийская конференция по астробиологии ЖИЗНЬ ВО ВСЕЛЕННОЙ: ФИЗИЧЕСКИЕ, ХИМИЧЕСКИЕ И БИОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ Пущино]
|
|
Смысл организма – систематичность экспансии
Суслов В.В.
[II Всероссийская конференция по астробиологии ЖИЗНЬ ВО ВСЕЛЕННОЙ: ФИЗИЧЕСКИЕ, ХИМИЧЕСКИЕ И БИОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ Пущино]
|
|
Целеполагание и эволюция организмов
Суслов В.В.
[XVIII ВСЕРОССИЙСКАЯ НАУЧНО-ТЕХНИЧЕСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «НЕЙРОИНФОРМАТИКА-2016»]
|
| 2015 |
CONSERVATIVE FULCRUM FOR EVOLUTION PROGRESS
K.V. Gunbin, V.V. Suslov, M.A. Genaev, E.G. Komyshev
[IV МЕЖДУНАРОДНАЯ Конференция, посвященная Н.В.Тимофееву-Ресовскому “Современные проблемы генетики, радиобиологии, радиоэкологии и эволюции]
|
|
Rare amino acid changes fixation drives divergence in Metazoa evolution
Konstantin Gunbin, Valentin Suslov, Yuri Orlov
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15)]
|
|
Stress as a theory of life
Suslov V.V.
[“The Origin of Life”. Höör, Sweden, 8- 10 May 2015]
|
|
TATA-BOX AS GENOME WIDE VARIABILITY VARIATOR
M.P. Ponomarenko, V.V. Suslov, K.V. Gunbin, P.M. Ponomarenko, O.V. Vishnevsky, N.A. Kolchanov
[IV международная Конференция, посвященная Н.В.Тимофееву-Ресовскому “Современные проблемы генетики, радиобиологии, радиоэкологии и эволюции”]
|
|
To small populations: access granted yet denied?
Suslov V.V.
[IV международная Конференция, посвященная Н.В.Тимофееву-Ресовскому “Современные проблемы генетики, радиобиологии, радиоэкологии и эволюции”]
|
|
МАЛЫЕ ПОПУЛЯЦИИ, ОБРАЗОВАНИЕ И ЦЕЛОСТНОСТЬ ВИДА
Суслов В.В.
[Структура вида у млекопитающих]
|
| 2014 |
Сложность геномов и эволюция прокариот
Н.С. Сафронова, Ю.Л. Орлов, В.В. Суслов
[Развитие жизни в процессе абиотических изменений на Земле]
|
|
BALDWIN EFFECT AS EVOLUTION SILENCER
Suslov V.V.
[BGRS-2014]
|
|
EVOLUTION OF MODERN HUMAN AND RECOMBINATION OF MEMES
Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Gunbin K.V.
[BGRS-2014]
|
|
FORWARD-TIME SIMULATION OF EVOLUTIONARY PROCESSES IN ANCIENT POPULATIONS USING THE DIPLOID EVOLUTIONARY CONSTRUCTOR
Lashin S.A., Suslov V.V., Gunbin K.V.
[BGRS-2014]
|
|
INDIRECT SELECTION AS INVASION SILENCER
Suslov V.V.
[BGRS-2014]
|
|
INVASION, ADAPTATION AND EVOLUTION: HOW TO RECONCILE
Suslov V.V.
[BGRS-2014]
|
|
INVASION, ADAPTATION AND EVOLUTION: WHEN ALL OUT OF SYNC
Suslov V.V.
[BGRS-2014]
|
|
ONTOLOGY OF PREVENTIVE ADAPTATIONS
Suslov V.V.
[BGRS-2014]
|
|
THE GENOMIC TEXT CHARACTERISTICS AND GC CONTENT ARE RELATED TO THE BACTERIAL GENOME EVOLUTION
Suslov V.V., Safronova N.S., Orlov Y.L., Afonnikov D.A.
[BGRS-2014]
|
|
АРОМОРФОЗ И НЕСПЕЦИФИЧЕСКАЯ АДАПТИВНОСТЬ
В.В. Суслов
[VI СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ (ВОГиС)]
|
|
Оптимизация стресса и ароморфная эволюция IV: целеполагание в поведении и эволюции
Суслов В.В.
[XXVIII Любищевские чтения]
|
|
Оптимизация стресса и ароморфная эволюция V: красота и стресс: возможный подход к дарвиновскому объяснению эпифеномена красоты
Суслов В.В.
[XXVIII Любищевские чтения]
|
|
Основное противоречие адаптации и пути его разрешения
В.В. Суслов
[Развитие жизни в процессе абиотических изменений на Земле 2014, п. Листвянка (Иркутская область)]
|
|
Проблемы эволюции путем горизонтального переноса генов
Клименко А.И., Лашин С.А., Суслов В.В.
[Развитие жизни в процессе абиотических изменений на Земле]
|
|
ЦЕЛЕПОЛАГАНИЕ В ПОВЕДЕНИИ И ЭВОЛЮЦИИ
СУСЛОВ В.В.
[Нейроинформатика – 2014]
|
| 2013 |
Human brain origin and the evolution of ТАТА-boxes of protein-coding genes expressed in brain.
K.V. Gunbin, M.P. Ponomarenko, V.V. Suslov, D.A. Afonnikov
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'13)]
|
| 2012 |
IS INADAPTATION A FAILURE ALWAYS?
Suslov V.V.
[АДАПТАЦИОННЫЕ СТРАТЕГИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ]
|
|
Oligonucleotide frequencies and CG-content of bacterial genomes are related to the environment evolution
Safronova N.S., Suslov V.V., Afonnikov D.A., Podkolodnyy N.L., Mitra C.K., Orlov Y.L.
[BGRS’2012]
|
|
Osborn Law of adaptive radiation as a background of aromorphoses
Suslov V.V.
[BGRS’2012]
|
|
PAR FORCE EVOLUTION AS A MECHANISM OF RAPID ADAPTATION
Suslov V.V.
[АДАПТАЦИОННЫЕ СТРАТЕГИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ]
|
|
Stress and homeomorphy of adaptation mechanisms.
Suslov V.V.
[BGRS’2012]
|
|
THE PRINCIPLE OF ADVANCED EVOLUTION OF SERVICE INFRASTRUCTURE
Suslov V.V.
[АДАПТАЦИОННЫЕ СТРАТЕГИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ]
|
|
Tender for a ecological niche as condition of the aro(allo)morphoses
Suslov V.V.
[BGRS’2012]
|
|
The enigmatic nature of the relation between TBP/TATA-affinity and the reaction norm of gene expression
P.M. Ponomarenko, V.V. Suslov, O.V. Vishnevsky, K.V. Gunbin, M.P. Ponomarenko
[III Moscow Conference «Molecular Phylogenetics» (MolPhy-3)]
|
|
НЕСПЕЦИФИЧЕСКАЯ АДАПТИВНОСТЬ И ВОЗНИКНОВЕНИЕ ЖИЗНИ
Суслов В.В.
[1-ая Всероссийская научная школа-конференция по Астробиологии «Астробиология: от происхождения жизни на Земле к жизни во Вселенной» Памяти Давида Гиличинского.]
|
| 2011 |
COMPUTER ESTIMATION OF GENOME COMPLEXITY AND MINIMAL GENOME SIZE
Орлов Юрий Львович, Суслов Валентин Владимирович
[III international conference Biosphere origin and evolution]
|
|
Computer tool for modeling the eukaryotes origin and evolution of early eukaryotic ecosystems
Lashin S.A., Suslov V.V., Matushkin Yu.G.
[III International Conference “Biosphere origin and evolution”]
|
|
Could chronic stress induced by polycyclic aromatic hydrocarbons have implications for hominid evolution?
Oshchepkov D.Y., Suslov V.V.
[Proceedings of III International Conference Biosphere Origin and Evolution]
|
|
Deep inside into Vertebrates and Invertebrates macroevolution: the molecular evolution modes of strict orthologous protein sequences.
Gunbin KV, Suslov VV, Afonnikov DA.
[15th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles.]
|
|
Evolutionary trends of genome amplification and reduction
Matushkin Yu.G., Lashin S.A., Suslov V.V.
[III international conference Biosphere origin and evolution]
|
|
Gene networks and the evolution of biological systems.
Kolchanov N.A., Afonnikov D.A., Gunbin K.V., Suslov V.V.
[III International Conference “Biosphere origin and evolution”]
|
|
Modeling of phage infection in prokaryotic communities by Evolutionary Constructor program
Lashin S.A., Suslov V.V., Matushkin Yu.G.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology 2011]
|
|
Why we need new evidences for deep Archaea evolution: the lesson from study of horizontal transfer highways.
Gunbin K., Suslov V., Afonnikov D.
[III International Conference “Biosphere origin and evolution”]
|
|
Анализ механизмов адаптации протеома архей к высоким давлениям.
Афонников Д.А., Гунбин К.В., Медведев К.Е., Суслов В.В.
[II международная научно практическая конференция Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика]
|
|
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияние мутаций на молекулярно-генетические системы организмов
Пономаренко М.П., Игнатьева Е.В., Левицкий В.Г., Савинкова Л.К., Захаренко Л.П., Пинтус С.С., Суслов В.В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
[Программа фундаментальных исследований Президиума РАН. № 11. “Биологическое разнообразие”. Подпрограмма “Генофонды и генетическое разнообразие”. Сборник материалов. – Москва: ИОГен. 2011. С. 100-104.]
|
|
Визуальное моделирование экологических систем: программная система E.N.O.T.
А.В. Семенычев, В. В. Суслов, В.С. Тимонов.
[Третья школа молодых ученых “Биоинформатика и системная биология”]
|
|
Генетическая основа макроэволюционных преобразований – исследование режимов молекулярной эволюции ортологичных белков позвоночных и беспозвоночных.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Афонников Д.А.
[II международная научно практическая конференция Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика]
|
|
Генетическая основа макроэволюционных преобразований: исследование режимов молекулярной эволюции ортологичных белков позвоночных и беспозвоночных.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Афонников Д.А.
[Международная конференция “Современные проблемы математики, информатики и биоинформатики”, посвященная 100-летию со дня рождения члена-корреспондента АН СССР Алексея Андреевича Ляпунова]
|
|
Компьютерный анализ эволюции генных сетей морфогенеза.
Колчанов Н.А., Гунбин К.В., Суслов В.В., Афонников Д.А.
[Морфогенез в индивидуальном и историческом развитии]
|
|
МЕТОДЫ и СРЕДСТВА ВИЗУАЛЬНОЙ РЕКОНСТРУКЦИИ И АНАЛИЗА СЕТЕВЫХ МОДЕЛЕЙ ЭКОЛОГИЧЕСКИХ СИСТЕМ.
В.С. Тимонов, А.В. Семенычев, В.В. Суслов, Н.А. Колчанов.
[IV Международная конференция "Актуальные проблемы биологии, нанотехнологий и медицины"]
|
|
Моделирование коэволюции одноклеточных организмов в трофических кольцах с взаимным ингибированием
Матушкин Ю.Г., Лашин С.А., Суслов В.В.
[VI Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития»]
|
|
Подарок Прометея: мог ли хронический стресс продуктами горения ускорить эволюцию гоминид
Ощепков Д.Ю., Суслов В.В.
[Современные проблемы эволюции. XXV Чтения памяти А.А. Любищева.]
|
|
Программные средства для многоуровневого моделирования эволюции про- и эукариот
Лашин С.А., Суслов В.В., Матушкин Ю.Г.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика»]
|
| 2010 |
Evolution of trophically linked populations of unicellular organisms; translation efficiency in unicellular organisms
Yu.G.Matushkun, S.A. Lashin, V.V. Suslov, V.A.Likhoshvai, V.G.Levitsky
[Joint Indo-Russian Workshop "Predictive Biology using Systems and Integrative analysis and Methods", November 15-19, 2010, p 8-9, Chandigarh, India]
|
|
Gene loss and acquiring in evolution of prokaryotic communities – modeling with Evolutionary Constructor program
Lashin S.A., Suslov V.V., Matushkin Yu.G.
[Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure and Systems Biology (BGRS_SB’10),Новосибирск, Россия, 20-27 июня]
|
|
SNP ТАТА-бокса ВИЧ-1 и пандемия СПИД
Суслов В.В., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Ефимов В.М., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А.
[Проблемы экологии. Чтения памяти проф. М.М.Кожова. Иркутск, 2010]
|
|
SNPs IN THE HIV-1 TATA BOX AND THE AIDS PANDEMIC
V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov (6)
[IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky Crimean meeting."Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution".]
|
|
SNPs in the hiv-1 TATA box and the aids pandemic
V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov
[Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010]
|
|
Stress and pseudoinheritance of acquired characters
Suslov V.V., Kolchanov N.A.
[Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010]
|
|
prognosis and verification of the TATA SNP effects
V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, I.A. Drachkova, N.A. Kolchanov
[Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010]
|
|
Гомеоморфия механизмов адаптации
Суслов В.В.
[Международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине" 23-26 ноября, 2010, г. Санкт-Петербург]
|
|
Компьютерное моделирование эволюции прокариотических сообществ
Lashin S.A., Suslov V.V., Matushkin Yu. G.
[Российско-Французского семинар "Геномика, биоинформатика и моделирование в науках о жизни", 18-21 июня 2010]
|
|
Компьютерное моделирование эволюции сообществ одноклеточных гаплоидных организмов
Матушкин Ю. Г., Лашин С.А., Суслов В.В.
[Математическая биология и биоинформатика: III Международная конференция , г. Пущино]
|
|
Между устойчивостью и адаптируемостью: моделирование коэволюции в сообществах с помощью программы "Эволюционный Конструктор"
Лашин С.А., Суслов В.В., Матушкин Ю.Г.
[Проблемы экологии. Чтения памяти профессора М.М. Кожова. 20-25 сентября 2010. Иркутск]
|
|
Между устойчивостью и адаптируемостью: моделирование коэволюции в сообществах с помощью программы "Эволюционный конструктор"
Лашин С.А., Суслов В.В., Матушкин Ю.Г.
[Проблемы экологии. Чтения памяти профессора М.М. Кожова. 20-25 сентября 2010. Иркутск]
|
|
Молекулярная эволюция циклинов животных и грибов: зависимость между изменением белков и ростом сложности организмов
Турнаев И.И., Гунбин К.В., Суслов В.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А.
[Первая международная научно-практическая конференция. Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине]
|
|
Подход и программные средства для описания макро- и микродинамики экосистем
Тимонов В.С., Суслов В.В., Брянская А.В., Ефимов В.М., Колчанов Н.А.
[XIII Российская конференция с участием иностранных ученых "Распределенные информационные и вычислительные ресурсы"(DICR'2010). Новосибирск, ИВТ СО РАН, 30 ноября - 4 декабря 2010 г. № гос. регистрации 0321100051]
|
|
ТАТА-боксы вносят вклад в норму реакции
Суслов В.В., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Драчкова И.А.
[Международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине" 23-26 ноября, 2010, г. Санкт-Петербург]
|
| 2009 |
Evolability and biodiversity - modeling of coevolution in communities using Evolutionary Constructor programm
С.А.Лашин, В.В.Суслов, Ю.Г. Матушкин
[International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 09)]
|
|
Моделирование эволюционно-популяционных процессов с помощью "Эволюционного конструктора"
Ю.Г. Матушкин, С.А. Лашин, В.В. Суслов, Н.А.Колчанов
[5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.]
|
| 2007 |
Adaptive evolution of genetic systems
Kolchanov N.A., Suslov V.V., Gunbin K.V.
[II International Conference "Biosphere Origin and Evolution"]
|
|
Gene networks and evolution of regulatory genetic system
Kolchanov N.A., Suslov V.V., Gunbin K.V.
[Current Evolutionary Thinking in Biology, Medicine and Sociology. International Conference Dedicated to 90 Anniversary of Prof. Dmitry K. Belyaev]
|
|
Molecular genetic systems of development: dynamics of functioning and molecular evolution
Kolchanov N.A., Suslov V.V., Gunbin K.V.
[Computational phylogenetics and molecular evolution "CPMS' 2007"]
|
| 2006 |
Architecture of software toolkit for storing and operating with biosystems models
Miginsky D.S., Suslov V.V., Rasskazov D.A., Podkolodny N.L., Kolchanov N.A
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
Aromorphoses and adaptive molecular evolution: morphogens and signaling cascade genes
Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)]
|
Гранты
| 2019 |
ПРИЧИНЫ МАССОВЫХ ВЫМИРАНИЙ В ИСТОРИИ ЖИЗНИ: ФАКТЫ И ГИПОТЕЗЫ
Хлебодарова Т.М. Суслов В.В.
|
| 2012 |
Междисциплинарный интеграционный проект "Исследование закономерностей и тенденций развития самоорганизующихся систем на примере веб-пространства и биологических сообществ"
Подколодный Николай Леонтьевич, Колчанов Николай Александрович, Деменков Павел Сергеевич, Рассказов Дмитрий Александрович, Подколодная Наталья Николаевна, Иванисенко Владимир Александрович, Титов Игорь Иванович, Лашин Сергей Александрович, Суслов Валентин Владимирович
|
| 2011 |
Изучение адаптации протеомов микроорганизмов к повышенным давлениям внешней среды методами биоинформатики
Афонников Дмитрий Аркадьевич, Гунбин Константин Владимирович, Медведев Кирилл Евгеньевич, Пинтус Сергей Сергеевич, Старостина Полина Александровна, Суслов Валентин Владимирович
|
| 2009 |
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов
Акбердин Илья Ринатович, Гунбин Константин Владимирович, Захаренко Л.П., Иванисенко Владимир Александрович, Игнатьева Елена Васильевна, Казанцев Федор Владимирович, Левицкий Виктор Георгиевич, Лихошвай Виталий Александрович, Омельянчук Надежда Анатольевна, Ощепков Дмитрий Юрьевич, Пинтус Сергей Сергеевич, Пономаренко Михаил Павлович, Пономаренко Петр Михайлович, Ри Максим Тексенович, Савинкова Людмила Кузминична, Суслов Валентин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович, Хлебодарова Тамара Михайловна
|
|
Компьютерное исследование молекулярной эволюции генов и молекулярно-генетических систем многоклеточных животных
Гунбин Константин Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Бухарина Татьяна Анатольевна, Вяткин Юрий Викторович, Суслов Валентин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович
|
|
Структура и свойства молекулярных органических кристаллов в условиях высоких давлений и низких температур
Колчанов Николай Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Гунбин Константин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович, Суслов Валентин Владимирович, Медведев Кирилл Евгеньевич, Генаев Михаил Александрович
|
| 2006 |
РОЛЬ МИКРООРГАНИЗМОВ В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ И БИОИНЖЕНЕРНЫЕ ПРИЛОЖЕНИЯ
113 исполнителей из 10 Институтов СО РАН
|
Учебные курсы
| 2004 |
Генные сети
|
|
|
