 |
|
|
Сайк Ольга Владимировна, к. б. н.
В данный момент не является сотрудником института
|
Персональная информацияРабочий адрес
Г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия
Образование
НГУ – 2010 – специалист (биология)
Награды
Область научных интересов
Метаболиты, белки, генетическая регуляция, базы данных
Область рабочих интересов
Хобби
Контакты в социальных сетях, блогах и т.д.
Публикации
| 2021 |
Hypoglycemia, Vascular Disease and Cognitive Dysfunction in Diabetes: Insights from Text Mining-Based Reconstruction and Bioinformatics Analysis of the Gene Networks
Saik O.V., Klimontov V.V.
[INT J MOL SCI]
|
|
384-P: Text Mining and Bioinformatic Identification of Genes Linking Glycemic Variability and Impaired Angiogenesis in Diabetes
Saik O.V., Klimontov V.
[DIABETES]
|
|
Glucose Variability: How Does It Work?
Klimontov V.V., Saik O.V., Korbut A.I.
[INT J MOL SCI]
|
|
Искусственный интеллект в диабетологии
Климонтов В.В., Бериков В.Б., Сайк О.В.
[Сахарный диабет]
|
| 2020 |
ANDDigest: a new web-based module of ANDSystem for the search of knowledge in the scientific literature
Timofey V. Ivanisenko, Olga V. Saik, Pavel S. Demenkov, Nikita V. Ivanisenko, Alexander N. Savostianov, Vladimir A. Ivanisenko
[BMC BIOINFORMATICS]
|
|
Bioinformatic reconstruction and analysis of gene networks related to glucose variability in diabetes and its complications
Olga V Saik, Vadim V Klimontov
[INT J MOL SCI]
|
|
Reflection of Heart Rate Physiological Regulation Parameters in the Urinary Proteome in Healthy Young Males
V. B. Rusanov, L. H. Pastushkova, A. G. Goncharova, A. G. Chernikova, A. M. Nosovsky, O. V. Saik, D. N. Kashirina, A. G. Brzhozovskiy, A. S. Kononikhin, A. G. Lubisheva, I. M. Larina
[Human Physiology]
|
|
Young «oil site» of the Uzon Caldera as a habitat for unique microbial life
Sergey E. Peltek, Alla V. Bryanskaya, Yuliya E. Uvarova, Aleksey S. Rozanov, Timofey V. Ivanisenko, Vladimir A. Ivanisenko, Elena V. Lazareva, Olga V. Saik, Vadim M. Efimov, Sergey M. Zhmodik, Oxana P. Taran, Nikolay M. Slynko, Sergey V. Shekhovtsov, Valentin N. Parmon, Nikolay L. Dobretsov, Nikolay A. Kolchanov
[BMC MICROBIOL]
|
|
Отражение особенностей физиологической регуляции сердечного ритма в протеоме мочи практически здоровых молодых мужчин
В. Б. Русанов, Л. Х. Пастушкова, А. Г. Гончарова,
А. Г. Черникова, А. М. Носовский, О. В. Сайк, Д. Н. Каширина, А. Г. Бржзовский, А. С. Кононихин, А. Г. Любишева, И. М. Ларина
[Физиология человека]
|
| 2019 |
A new version of the ANDSystem tool for automatic extraction of knowledge from scientific publications with expanded functionality for reconstruction of associative gene networks by considering tissue-specific gene expression
Vladimir A. Ivanisenko, Pavel S. Demenkov, Timofey V. Ivanisenko, Elena L. Mishchenko, Olga V. Saik
[BMC BIOINFORMATICS]
|
|
Comorbidity of asthma and hypertension may be mediated by shared genetic dysregulation and drug side effects.
Zolotareva O, Saik OV, Königs C, Bragina EY, Goncharova IA, Freidin MB, Dosenko VE, Ivanisenko VA, Hofestädt R.
[SCI REP-UK]
|
|
Prioritization of genes involved in endothelial cell apoptosis by their implication in lymphedema using an analysis of associative gene networks with ANDSystem
Olga V. Saik, Vadim V. Nimaev, Dilovarkhuja B. Usmonov, Pavel S. Demenkov, Timofey V. Ivanisenko, Inna N. Lavrik, Vladimir A. Ivanisenko
[BMC MED GENOMICS]
|
|
Search for Blood Proteome Proteins Involved in the Regulation of Bone Remodeling in Astronauts
L. Kh. Pastushkovaa, A. G. Goncharovaa, G. Yu. Vasilyevaa, S. K. Tagirovaa, D. N. Kashirinaa, O. V. Saik, J. Rittwegerd, I. M. Larina
[Human Physiology]
|
|
Web-Based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Posttranslational Modifications of Proteins
Ivanisenko VA, Ivanisenko TV, Saik OV, Demenkov PS, Afonnikov DA, Kolchanov NA.
[Methods in Molecular Biology]
|
|
Поиск белков протеома крови-регуляторов костного ремоделирования у космонавтов
Л. Х. Пастушкова, А. Г. Гончарова, Г. Ю. Васильева, С. К. Тагирова, Д. Н. Каширина, О. В. Сайк, Й. Риттвегер, И. М. Ларина
[Физиология человека]
|
|
Приоритизация генов картофеля, вовлеченных в формирование селекционно-значимых признаков, с использованием базы знаний SOLANUM TUBEROSUM.
Деменков П.С., Сайк О.В., Иванисенко Т.В., Колчанов Н.А., Кочетов А.В., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2018 |
Evaluation of Prioritization Methods of Extrinsic Apoptotic Signaling Pathway Genes for Retrieval of the New Candidates Associated with Major Depressive Disorder
Yankina, M. A.; Saik, O. V.; Ivanisenko, V. A.; Demenkov, P. S. & Khusnutdinova, E. K.
[RUSS J GENET+]
|
|
Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases
Elena Yu. Bragina, Irina A. Goncharova, Anna F. Garaeva, Evgeniy V. Nemerov, Anastasija A. Babovskaya, Andrey B. Karpov, Yulia V. Semenova, Irina Z. Zhalsanova, Densema E. Gomboeva, Olga V. Saik, Olga I. Zolotareva, Vladimir A. Ivanisenko, Victor E. Dosenko, Ralf Hofestaedt, Maxim B. Freidin
[J INTEGR BIOINFORM]
|
|
Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks
Olga V. Saik, Pavel S. Demenkov, Timofey V. Ivanisenko, Elena Yu Bragina, Maxim B. Freidin, Irina A. Goncharova, Victor E. Dosenko, Olga I. Zolotareva, Ralf Hofestaedt, Inna N. Lavrik, Evgeny I. Rogaev, Vladimir A. Ivanisenko
[BMC MED GENOMICS]
|
|
Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature
Olga V. Saik, Pavel S. Demenkov, Timofey V. Ivanisenko, Elena Yu., Maxim B. Freidin, Victor E. Dosenko, Olga I. Zolotareva, Evgeniy L. Choynzonov, Ralf Hofestaedt, Vladimir A. Ivanisenko
[J INTEGR BIOINFORM]
|
|
АНАЛИЗ ОСОБЕННОСТЕЙ ГЕННОЙ СЕТИ ВНЕШНЕГО ПУТИ АПОПТОЗА ПРИ УЧЕТЕ ТКАНЕСПЕЦИФИЧНОЙ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ С ПОМОЩЬЮ СИСТЕМЫ ANDSYSTEM
Сайк О.В., Деменков П.С., Иванисенко В.А.
[АЛЛЕЯ НАУКИ]
|
|
Анализ взаимодействия генов нейронального апоптоза в ассоциативной генной сети болезни Паркинсона
М.А. Янкина, О.В. Сайк, П.С. Деменков, Э.К. Хуснутдинова, Е.И. Рогаев, И.Н. Лаврик, В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Ассоциативная генная сеть апоптоза и ее роль в механизмах коморбидности астмы и гипертонии
Сайк О.В., Деменков П.С., Лаврик И.Н., Иванисенко В.А.
[Дневник науки]
|
|
База знаний SOLANUM TUBEROSUM: раздел по молекулярно-генетической регуляции метаболических путей
Т.В. Иванисенко, О.В. Сайк, П.С. Деменков, В.К. Хлесткин, Е.К. Хлесткина, Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
ГЕНЫ ЭНДОТЕЛИАЛЬНОГО АПОПТОЗА КАК КАНДИДАТЫ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ИХ СВЯЗИ С ЛИМФЕДЕМОЙ
О.В. Сайк, В.В. Нимаев, Д.Б. Усмонов, П.С. Деменков, И.Н. Лаврик, В.А. Иванисенко
[Международный журнал гуманитарных и естественных наук]
|
|
Оценка методов приоритизации генов внешнего пути апоптоза в качестве кандидатов, ассоциированных с большим депрессивным расстройством
М. А. Янкина, О. В. Сайк, В. А. Иванисенко, П. С. Деменков, Э. К. Хуснутдинова
[Генетика]
|
|
Поиск микроРНК, потенциально задействованных в поддержании самообновления плюрипотентных клеток лабораторной крысы
Шерстюк В.В., Медведев С.П., Ри М.Т., Вяткин Ю.В., Сайк О.В., Штокало Д.Н., Закиян С.М.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
Genome-wide profiling and differential expression of microRNA in rat pluripotent stem cells
Sherstyuk V.V., Medvedev S.P., Elisaphenko E.A., Vaskova E.A., Ri M.T., Vyatkin Y.V., Saik O.V., Shtokalo D.N., Pokushalov E.A., Zakian S.M.
[SCI REP-UK]
|
|
Molecular mechanisms of the interaction between the processes of the cell response to mechanical stress and neuronal apoptosis in primary open-angle glaucoma
O. V. Saik, N. A. Konovalova, P. S. Demenkov, N. V. Ivanisenko, T. V. Ivanisenko, D. E. Ivanoshchuk, O. S. Konovalova, O. A. Podkolodnaya, I. N. Lavrik, N. A. Kolchanov, V. A. Ivanisenko
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Search of MicroRNAs Regulating the Receptor Status of Breast Cancer In Silico and Experimental Confirmation of Their Expression in Tumors
V. S. Chernyi, P. V. Tarasova, V. V. Kozlov, O. V. Saik, N. E. Kushlinskii, L. F. Gulyaeva
[B EXP BIOL MED+]
|
|
Анализ взаимодействия генов нейронального апоптоза и генов большого депрессивного расстройства в его ассоциативной генной сети
Янкина М.А., Сайк О.В., Деменков П.С., Хуснутдинова Э.К., Лаврик И.Н., Иванисенко В.А.
[Дневник науки]
|
|
ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ДАННЫХ В ПОИСКЕ НОВЫХ МИШЕНЕЙ ПАТОГЕНЕЗА ЛИМФЕДЕМЫ
Усманов Д.Б. , Сайк О.В. , Нимаев В.В.
[Трансляционная медицина]
|
|
ПОИСК ГЕНОВ-КАНДИДАТОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ТРЕВОЖНЫМ НЕВРОЗОМ, НА ОСНОВЕ АВТОМАТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА НАУЧНЫХ ТЕКСТОВ С ПОМОЩЬЮ ANDSYSTEM
Янкина М.А.,Сайк О.В.,Деменков П.С.,Хуснутдинова Э.К.,Иванисенко В.А.
[АЛЛЕЯ НАУКИ]
|
|
Приоритезация генов нейронального апоптоза по их структурной роли в ассоциативной генной сети нарушений аутического спектра с помощью подходов ANDsystem
И.Н. Лаврик, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, О.В. Сайк, М.А. Янкина
[Международный журнал гуманитарных и естественных наук]
|
|
РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ АВТОМАТИЧЕСКОГО ИЗВЛЕЧЕНИЯ ЗНАНИЙ ИЗ ТЕКСТОВ НАУЧНЫХ ПУБЛИКАЦИЙ ДЛЯ СОЗДАНИЯ БАЗЫ ЗНАНИЙ SOLANUM TUBEROSUM
О.В. САЙК, П.С. ДЕМЕНКОВ, Т.В. ИВАНИСЕНКО, Н.А. КОЛЧАНОВ, В.А. ИВАНИСЕНКО
[Сельскохозяйственная биология]
|
|
Роль генов апоптоза в контроле агрессивного поведения, выявленная с помощью комбинированного анализа ассоциативных генных сетей, экспрессионных и геномных данных по серым крысам с агрессивным поведением
А.О. Брагин, О.В. Сайк, И.В. Чадаева, П.С. Деменков, А.Л. Маркель, Ю.Л. Орлов, Е.И. Рогаев, И.Н. Лаврик, В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2016 |
A compendium of human genes regulating feeding behavior and body weight, its functional characterization and identification of GWAS genes involved in brain-specific PPI network
Elena V. Ignatieva, Dmitry A. Afonnikov, Olga V. Saik, Evgeny I. Rogaev and Nikolay A. Kolchanov
[BMC GENET]
|
|
Functional annotation of the vlinc class of non-coding RNAs using systems biology approach.
Laurent GS, Vyatkin Y, Antonets D, Ri M, Qi Y, Saik O, Shtokalo D, de Hoon MJ, Kawaji H, Itoh M, Lassmann T, Arner E, Forrest AR; FANTOM consortium, Nicolas E, McCaffrey TA, Carninci P, Hayashizaki Y, Wahlestedt C, Kapranov P.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Interactome of the hepatitis C virus: Literature mining with ANDSystem
Saik OV, Ivanisenko TV, Demenkov PS, Ivanisenko VA
[VIRUS RES]
|
|
Molecular associations of Primary Open-Angle Glaucoma with potential comorbid diseases (POAG-associome)
Olga V Saik, Natalia A Konovalova, Pavel S Demenkov, Timofey V Ivanisenko, Evgeny D Petrovskiy, Nikita V Ivanisenko, Dinara E Ivanoshchuk, Maria N Ponomareva, Olga S Konovalova, Inna N. Lavrik, Nikolay A Kolchanov, Vladimir A Ivanisenko
[Biotecnología Aplicada]
|
|
NACE: A web-based tool for prediction of intercompartmental efficiency of human molecular genetic networks
Olga V. Popik, Timofey V. Ivanisenko, Olga V. Saik, Evgeny D. Petrovskiy, Inna N. Lavrik, Vladimir A. Ivanisenko
[VIRUS RES]
|
|
МИКРОБНЫЕ СООБЩЕСТВА ЭКСТРЕМАЛЬНЫХ ЭКОСИСТЕМ; МЕТАГЕНОМНЫЙ ПОДХОД
С.Е. Пельтек, А.В. Брянская, Ю.Е. Уварова, А.С. Розанов, Т.В. Иванисенко, Т.К. Малуп, В.А. Иванисенко, Е.В. Лазарева, О.В. Сайк, С.М. Жмодик, О.П. Таран, Н.М. Слынько, С.В. Шеховцов, В.Н. Пармон, Н.Л. Добрецов, Н.А. Колчанов
[Acta Naturae]
|
|
Молекулярно-генетические механизмы взаимодействия процессов ответа клетки на механический стресс и нейронального апоптоза при первичной открытоугольной глаукоме
Сайк О.В., Коновалова Н.А., Деменков П.С., Иванисенко Н.В., Иванисенко Т.В., Иванощук Д.Е., Пономарева М.Н., Коновалова О.С., Подколодная О.А., Лаврик И.Н., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Молекулярно-генетические механизмы регуляции процессов апоптоза белками вируса гепатита С.
Сайк О. В., Деменков П. С., Иванисенко Н. В., Иванисенко Т. В., Лаврик И. Н., Иванисенко В. А.
[Проблемы современной науки и образования]
|
| 2015 |
Molecular association of pathogenetic contributors to pre-eclampsia (pre-eclampsia associome)
Glotov AS, Tiys ES, Vashukova ES, Pakin VS, Demenkov PS, Saik OV, Ivanisenko TV, Arzhanova ON, Mozgovaya EV, Zainulina MS, Kolchanov NA, Baranov VS, Ivanisenko VA
[BMC SYST BIOL]
|
|
ANDSystem: an Associative Network Discovery System for automated literature mining in the field of biology
Vladimir A Ivanisenko, Olga V Saik, Nikita V Ivanisenko, Evgeny S Tiys, Timofey V Ivanisenko, Pavel S Demenkov and Nikolay A Kolchanov
[BMC SYST BIOL]
|
|
Prediction of tissue-specific effects of gene knockout on apoptosis in different anatomical structures of human brain.
Petrovskiy E.D., Saik O.V., Tiys E.S., Lavrik I.N., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[BMC GENOMICS]
|
| 2014 |
Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions
Popik, O. V., Saik, O. V., Petrovskiy, E. D., Sommer, B., Hofestädt, R., Lavrik, I. N., Ivanisenko, V. A.
[BMC GENOMICS]
|
|
Bioinformatics analysis of the genome of Geobacillus stearothermophilus 22 Strain isolated from the Garga hot spring, Baikal Region
Rozanov A.S., Ivanisenko T.V., Bryanskaya A.V., Shekhovtsov S.V., Logacheva M.D., Saik O.V., Malup T.K., Demenkov P.S., Goryachkovskaya T.N., Ivanisenko V.A., Peltek S.E.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Exploring Interaction of TNF and Orthopoxviral CrmB Protein by Surface Plasmon Resonance and Free Energy Calculation.
Ivanisenko NV, Tregubchak TV, Saik OV, Ivanisenko VA, Shchelkunov SN
[PROTEIN PEPTIDE LETT]
|
|
Proton magnetic resonance spectroscopy of brain metabolic shifts induced by acute administration of 2-deoxy-d-glucose and lipopolysaccharides
Moshkin M.P., Akulov A.E., Petrovski D.V., Saik O.V., Petrovskiy E.D., Savelov A.A., Koptyug I.V.
[NMR BIOMED]
|
| 2013 |
Биоинформатический анализ генома штамма Geobacilus stearothermophilus 22, выделенного из горячего источника Гарга (Прибайкалье).
Розанов А.С., Иванисенко Т.В., Брянская А.В., Шеховцев С.В., Логачева М.Д., Сайк О.В., Малуп Т.К., Деменков П.С., Горячковская Т.Н., Иванисенко В.А., Пельтек С.Е.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Математическая модель регуляторного контура Rob, MarR и MarA генной сети Escherichia coli
М.Т. Ри, С.С. Хайрулин, О.В. Сайк
[Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. Науки]
|
|
Молекулярные механизмы взаимодействия белков CrmB вируса оспы коров и вируса натуральной оспы с фактором некроза опухолей человека
Иванисенко Н.В., Трегубчак Т.В., Сайк О.В., Иванисенко В.А., Щелкунов С.Н., Колчанов Н.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
| 2012 |
Магнитно–резонансная спектроскопия метаболических изменений в мозге мышей при введении 2–дезокси–D–глюкозы и липополисахарида
Мошкин М.П., Акулов А.Е., Петровский Д.В., Сайк О.В., Петровский Е.Д., Савелов А.А., Коптюг И.В.
[Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова]
|
| 2011 |
PROMEDIA – база данных химических соединений, потенциальных биомаркеров заболеваний, имеющих значение для неинвазивной диагностики
Сайк О.В., Мошкин М.П., Балдин М.Н., Грузнов В.М., Козлов В.А., Самороков С.Н., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
| 2010 |
База данных химических соединений, имеющих потенциальное значение для неинвазивной диагностики заболеваний
Сайк О.В., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Мошкин М.П., Иванисенко В.А.
[В мире научных открытий]
|
Монографии
| 2019 |
Web-Based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Posttranslational Modifications of Proteins
Ivanisenko, V. A., Ivanisenko, T. V., Saik, O. V., Demenkov, P. S., Afonnikov, D. A. and Kolchanov, N. A.
|
| 2016 |
Создание малых химических соединений, направленно действующих на внешний путь апоптоза с помощью компьютерного моделирования и экспериментальных подходов.
И.Н. Лаврик, Л. Хиллерт, Н.В. Иванисенко, О.В. Попик, О.В. Сайк, Т.В. Иванисенко, П.С. Деменков, Е.Д. Петровский, В.А. Иванисенко
|
Конференции
| 2022 |
Генетические исследования и клиническая лимфология
Нимаев В.В.
Сайк О.В.
[XIV Научно-практическая конференция Ассоциации флебологов России с международным участием «Актуальные вопросы флебологии»]
|
| 2021 |
Bioinformatic analysis by ANDSystem revealed members of IL-6 signaling pathway initiated by glucose variability and involved in diabetic retinopathy
Olga Saik, Vadim Klimontov
[2021 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB)]
|
|
Text Mining and Bioinformatic Identification of Genes Linking Glycemic Variability and Impaired Angiogenesis in Diabetes
Olga V. Saik, Vadim V. Klimontov
[81st Scientific Sessions of American Diabetes Association (ADA)]
|
|
ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ ОДНОВРЕМЕННО С ОЖИРЕНИЕМ И ЛИМФЕДЕМОЙ, С ПОМОЩЬЮ СИСТЕМЫ ANDSYSTEM
Сайк О.В., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Нимаев В.В.
[Международная научно-практическая конференция «Лимфология: от фундаментальных исследований к медицинским технологиям»]
|
|
Гены сигнального пути IL-6, ассоциированные с диабетической ретинопатиейи вариабельностью гликемии
Сайк О.В., Климонтов В.В.
[IV Российская междисциплинарная научно-практическая конференция с международным участием «Сахарный диабет: от мониторинга к управлению»]
|
| 2020 |
Melatonin as a key regulator in molecular-genetic network of glucose variability related to circadian rhythm
Cайк О., Деменков П., Иванисенко В., Климонтов В.
[BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”,Symposium “Systems biology and biomedicine” (SbioMed-2020)]
|
|
Выявление ключевых участников молекулярно-генетических сетей, ассоциированных с лимфедемой, с помощью биоинформатических методов
Сайк О.В., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Нимаев В.В.
[7-й съезд лимфологов России и 8-я международная научно-практическая конференция по клинической лимфологии "ЛИМФА-2020"]
|
| 2019 |
Dysregulation of postsynaptic translation in autism spectrum disorder: reconstruction of gene network associated with autism and mtor signaling.
Rifonova E.A., Klimenko A.I., Saik O.V., Orlov Y.L., Lashin S.A., Ivanisenko V.A.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.]
|
| 2018 |
Поиск генов, потенциально ассоциированных с лимфедемой, из числа генов, вовлеченных в эндотелиальный апоптоз, с использованием анализа ассоциативных генных сетей ANDSYSTEM
Сайк О.В., Нимаев В.В., Усмонов Д.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Лаврик И.Н., Иванисенко В.А.
[XIII международная научно-практическая конференция «Лимфология: от фундаментальных исследований к медицинским технологиям»]
|
|
Analysis of Clinical Forms of Leg Lymphedema. Single-Center Experience
D. Usmonov, O. Saik, V. Nimaev
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology — BGRS\SB-2018 Symposium Systems Biology and Biomedicine (SBioMed-2018)]
|
|
Analysis of Programmed Cell Death in Associative Gene Network of Glaucoma Reconstructed Using ANDSystem
O.V. Saik, P.S. Demenkov, O.S. Konovalova, N.A. Konovalova, I.N. Lavrik, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2018]
|
|
Reconstruction of Gene Networks Associated with Autism and Related to mTOR Signaling Pathway using ANDSystem
O.V. Saik, E.A. Trifonova, T.M. Khlebodarova, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2018]
|
|
ПРОВЕРКА ВЫПОЛНЕНИЯ СВОЙСТВА ТРАНЗИТИВНОСТИ В ФРЕЙМОВЫХ МОДЕЛЯХ, ОПИСЫВАЮЩИХ СВЯЗЬ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ РЕГУЛЯЦИИ МЕТАБОЛИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ С ЗАБОЛЕВАНИЯМИ
Сайк О.В., Деменков П.С., Иванисенко В.А.
[Международная научно-практическая конференция «Экспериментальные и теоретические исследования в современной науке»]
|
| 2017 |
ANDSystem: a tool for automated literature mining in the field of biology
Ivanisenko V.A., Saik O.V., Tiys E.S., Ivanisenko T.V., Demenkov P.S.
[Международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития"]
|
|
Analysis of microRNA expression in rat pluripotent stem cells using genome-wide sequencing technologies
Sherstyuk V.V., Medvedev S.P., Elisaphenko E.A., Vaskova E.A., Ri M.T., Vyatkin Y.V., Saik O.V., Shtokalo D.N., Pokushalov E.A., Zakian S.M.
[15th Annual Meeting of the International Society for Stem Cell Research]
|
|
RECONSTRUCTION OF ASSOCIATIVE GENE NETWORK RELATED TO AGGRESSIVE BEHAVIOR IN RATS USING TRANSCRIPTOME DATA
O.V. Petrovskaya, I.V.Chadaeva, O.V. Saik, A.O. Bragin, E.S. Tyis
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
|
|
ПОИСК ГЕНОВ, ОТВЕТСТВЕННЫХ ЗА КОМОРБИДНОСТЬ ПЕРВИЧНОЙ ОТКРЫТО-УГОЛЬНОЙ ГЛАУКОМЫ И ДИАБЕТИЧЕСКОЙ РЕТИНОПАТИИ, С ПОМОЩЬЮ СТРУКТУРНОГО АНАЛИЗА ГЕННЫХ СЕТЕЙ
Е.С. Тийс, О.В. Сайк, В.А. Иванисенко
[Беляевские чтения: междунар. конф., посвященная 100-летию со дня рождения акад. АН СССР Д.К.Беляева]
|
|
Реконструкция генных сетей, ассоциированных с первичной открытоугольной глаукомой с помощью системы ANDSystem.
Сайк О.В., Деменков П.С., Коновалова Н.А., Коновалова О.С., Иванисенко В.А.
[Беляевские чтения: Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
|
|
Сахарный диабет в эпоху «омиксных технологий»
О.В. Сайк, П.С. Деменков, Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко
[II Междисциплинарная конференция "Сахарный диабет-2017: от мониторинга к управлению"]
|
| 2016 |
AIMEDICA - INTELLIGENT SYSTEM FOR DISEASE DIAGNOSTICS BASED ON TEXT-MINING ANALYSIS OF SCIENTIFIC PUBLICATIONS AND DIFFERENT MEDICAL DATA SOURCES
O.V. Saik, P.S. Demenkov, A.V. Starkov, T.V. Ivanisenko, E.V, Gaisler, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2016]
|
|
ANDSystem: система автоматического извлечения знаний и интеграции омиксных данных.
В.А. Иванисенко, О.В. Сайк, Н.В. Иванисенко, Т.В. Иванисенко, П.С. Деменков, Н.А. Колчанов
[V СЪЕЗД ФИЗИОЛОГОВ СНГ и V СЪЕЗД БИОХИМИКОВ РОССИИ]
|
|
ASSOCIATIVE NETWORKS OF GLAUCOMA AND APOPTOSIS
O.V. Saik, P.S. Demenkov, O.S. Konovalova, M.N. Ponomareva, N.A. Konovalova, N.A. Kolchanov, I.N. Lavrik, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2016]
|
|
Gene ontology analysis and network reconstruction for genes related to aging diseases and behavior
I.V. Chadaeva, O.V. Saik, V.N. Babenko
[BGRS 2016]
|
|
Microbial Community of the Extremal Ecosystems of the Uzon Caldera (Kamchatka)
S.E. Peltek, A.V. Bryanskaya, Y.E. Uvarova, A.S. Rozanov, T.V. Ivanisenko, T.K. Malup, V.A. Ivanisenko, E.V. Lazareva, O.V. Saik, V.M. Efimov, S.M. Zhmodik, O.P. Taran, N.M. Slynko, S.V. Shekhovtsov, V.N. Parmon, N.L. Dobretsov, N.A. Kolchanov
[7th World Congress onMicrobiology]
|
|
Microbial community of the oil site of the Uzon caldera (Kamchatka)
S.E. Peltek, A.V. Bryanskaya, Y.E. Uvarova, A.S. Rozanov, T.V. Ivanisenko, T.K. Malup, V.A. Ivanisenko, E.V. Lazareva, O.V. Saik, S.M. Zhmodik, O.P. Taran, N.M. Slynko, S.V. Shekhovtsov, V.N. Parmon, N.L. Dobretsov, N.A. Kolchanov
[10th anniversary International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology»]
|
|
Reconstruction of molecular-genetic networks common for Alzheimer's disease
O.V. Saik, V.A. Ivanisenko, P.S. Demenkov, E.I. Rogaev
[BGRS\SB-2016]
|
|
SEARCH FOR GENE MUTATIONS THAT CAN POTENTIALLY AFFECT THE SUSCEPTIBILITY TO TUBERCULOSIS
O.V. Saik, P.S. Demenkov, E.U. Bragina, M. Freidin, A. El-Seedy, R. Hofestaedt, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2016]
|
|
The compendium of human genes controlling feeding behavior or body weight, reconstruction of networks and analysis of their properties.
Ignatieva E.V., O.V. Saik, D.A. Afonnikov
[The Tenth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems biology BGRS/SB2016]
|
|
Thermophilic Microbial Community of the Extremal Ecosystems
S.E. Peltek, A.V. Bryanskaya, Y.E. Uvarova, A.S. Rozanov, T.V. Ivanisenko, T.K. Malup, V.A. Ivanisenko, E.V. Lazareva, O.V. Saik, V.M. Efimov, S.M. Zhmodik, O.P. Taran, N.M. Slynko, S.V. Shekhovtsov, V.N. Parmon, N.L. Dobretsov, N.A. Kolchanov
[The Fifth International Conference on Sustainable Utilization of Tropical Plant Biomass - Bioproducts, Biocatalysts, and Biorefinery (SUTB4), 17th to 18th November 2016 Coimbatore, Tamilnadu, India]
|
|
Микробные сообщества экстремальных экосистем; метагеномный подход
С.Е. Пельтек, А.В. Брянская, Ю.Е. Уварова, А.С. Розанов, Т.В. Иванисенко, Т.К. Малуп, В.А. Иванисенко, Е.В. Лазарева, О.В. Сайк, С.М. Жмодик, О.П. Таран, Н.М. Слынько, С.В. Шеховцов, В.Н. Пармон, Н.Л. Добрецов, Н.А. Колчанов
[V Съезд биохимиков России]
|
| 2015 |
Применение методов анализа текстов для построения онтологий
Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Сайк О.В., Иванисенко В.А.
["Знания-Онтологии-Теории" 2015]
|
|
Автоматический анализ текстов в задачах биологии и медицины
Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Сайк О.В., Иванисенко В.А.
[Форум – 2015: «Big Data в медицине: лучшие практики»]
|
|
ANDSystem: automated literature mining and protein interactome networks reconstruction
Saik O.V., Demenkov P.S., Tiys E.S., Ivanisenko T.V., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[VII РОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ «БЕЛКИ И ПЕПТИДЫ»]
|
|
Promedia a database containing frame models of genetic regulation of the enzymatic processes associated with diseases
Saik O.V., Demenkov P.S., Ivanisenko V.A.
[VII РОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ «БЕЛКИ И ПЕПТИДЫ»]
|
|
Контекстный анализ научных публикаций по биологии и извлечение знаний
В. А. Иванисенко, Т.В. Иванисенко, П. С. Деменков, О.В. Сайк
[Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2015 (AMCA 2015)]
|
|
“Application of ANDSystem for the reconstruction and analysis of molecular-genetics networks, associated with diseases and phenotypic traits” (“Применение ANDSystem для реконструкции и анализа молекулярно-генетических сетей, связанных с фенотипическими признаками и развитием заболеваний”)
О.В. Сайк, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, Е.С. Тийс, В.А. Иванисенко.
[СИМБИОЗ – РОССИЯ 2015 (VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов)]
|
| 2014 |
ANDSystem: associative network discovery system for automated literature mining in the area of biology
V.A. Ivanisenko, O.V. Saik, E.S. Tiys, T.V. Ivanisenko, P.S. Demenkov
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014]
|
|
ANDSystem: automated literature mining and interactome networks reconstruction in the area of biology
O.V. Saik, E.S. Tiys, T.V. Ivanisenko, P.S. Demenkov, N.A. Kolchanov, V.A. Ivanisenko
[HUPO2014 the 13th World Congress of the Human Proteome Organization]
|
|
Database of frame models of genetic regulation of the metabolic processes associated with diseases
O.V.Saik, P.S. Demenkov, V.A. Ivanisenko
[Девятая Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры генома и системной биологии [Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014]]
|
|
Promedia — база данных, интегрирующая информацию о молекулярно-генетических путях, в которых участвуют летучие соединения – потенциальные биомаркеры заболеваний, имеющие значение для неинвазивной диагностики
Сайк О.В., Деменков П.С., Мошкин М.П., Иванисенко В.А.
[8-я Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИАГНОСТИКА 2014»]
|
|
RECONSTRUCTION OF ASSOCIATIVE GENE NETWORKS SPECIFIC TO TARGET BIOLOGICAL PROCESSES AND PHENOTYPIC TRAITS
E.S. Tiys, P.S. Demenkov, O.V. Saik, O.V. Popik, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2014]
|
|
The Сompilation of Human Gene Networks Controlling Feeding Behavior and Thermoregulation
E.V. Ignatieva, O.V.Saik, O.A. Podkolodnaya, N.N. Podkolodnaya, P.S. Demenkov, E.S. Tiys, E.A. Oshchepkova, E.A. Ananko, N.V. Ivanisenko, O.V. Popik, N.L. Podkolodny, V.A. Ivanisenko, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov, E.I. Rogaev
[The first international scientific conference "Science of the Future"]
|
|
Using ANDSystem for automated literature mining and protein interactome networks reconstruction
O.V. Saik, E.S. Tiys, T.V. Ivanisenko, P.S. Demenkov, L.H. Pastushkova, I.M. Larina, E.N. Nikolaev, N.A. Kolchanov, V.A. Ivanisenko
[HUPO2014 the 13th World Congress of the Human Proteome Organization]
|
|
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ БЕЛКОВ CRMB ВИРУСА ОСПЫ КОРОВ И ВИРУСА НАТУРАЛЬНОЙ ОСПЫ С ФАКТОРОМ НЕКРОЗА ОПУХОЛЕЙ ЧЕЛОВЕКА
Иванисенко Никита Владимирович, Трегубчак Т.В., Сайк О.В., Щелкунов С.Н., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[XXI Российский национальный конгресс "Человек и Лекарство"]
|
| 2013 |
Analysis of RNAseq digital gene expression for expanding disease “associome” reconstructed based on information stored in databases
Saik O.V., Demenkov P.S., Ivanisenko V.A.
[Международная конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", Новосибирск, 2013.]
|
|
Analysis of hepatitis C associative networks
Saik O.V., Demenkov P.S., Tiys E.S., Ivanisenko V.A.
[Международная научная конференция "Влияние научных исследований/ Wplyw badan naukowych", Быдгощ, 2013]
|
|
Reconstruction of squamous cell carcinoma “associome” based on analysis of differential gene expression according to RNAseq data and information stored in databases
O.V. Saik, P.S. Demenkov, V.A. Ivanisenko
[Школа молодых ученых "Системная биология и биоинформатика", Новосибирск, 2013.]
|
|
Анализ принадлежности белков к функциональным группам Gene Ontology, имеющих динамику присутственности в моче космонавтов
Сайк Ольга Владимировна, Тийс Евгений Сергеевич, Доброхотов Игорь Владимирович, Образцова Ольга Анатольевна, Пастушкова Людмила Ханифовна, Иванисенко Владимир Александрович
[Международная научно-практическая конференция "Медицина XXI века", Смоленск, 2013.]
|
| 2012 |
PATTERNS OF MIRNA BINDING SITES LOCATION IN 3`UTRs OF HUMAN TRANSCRIPTS
D.N. Shtokalo, O.V. Saik, G.St.Laurent III, A.Kel
[BGRS/SB’2012, Novosibirsk]
|
|
Promedia — база данных белков, генов, метаболитов, молекулярно-генетических путей, имеющих значение для разработки средств диагностики и лечения заболеваний
Сайк Ольга Владимировна, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович
[II Российский конгресс с международным участием «Молекулярные основы клинической медицины – возможное и реальное»]
|
| 2011 |
Database of metabolites, enzymes, transcription factors associated with diseases
Olga Saik, Vladimir Ivanisenko, Pavel Demenkov
[RCIBC, Новосибирск, 2011]
|
|
PROMEDIA – база данных химических соединений потенциальных биомаркеров заболеваний
Сайк Ольга Владимировна, Иванисенко Владимир Александрович, Деменков Павел Сергеевич
[Interra, секция биоинформатика и системная биология, Новосибирск, 2011]
|
|
Создание базы данных летучих соединений, потенциальных маркеров заболеваний
Сайк Ольга Владимировна, Иванисенко Владимир Александрович, Деменков Павел Сергеевич
[Interra, секция биомедицина, Новосибирск, 2011]
|
| 2010 |
БАЗА ДАННЫХ ХИМИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ, ИМЕЮЩИХ ПОТЕНЦИАЛЬНОЕ ЗНАЧЕНИЕ ДЛЯ НЕИНВАЗИВНОЙ ДИАГНОСТИКИ ЗАБОЛЕВАНИЙ
О.В. Сайк, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, М.П. Мошкин, В.А. Иванисенко
[II Всероссийская научная конференция с международным участием "Научное творчество ХХI века"]
|
|
БАЗА ДАННЫХ ХИМИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ, ПОТЕНЦИАЛЬНЫХ БИОМАРКЕРОВ ЗАБОЛЕВАНИЙ
О.В. Сайк, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, М.П. Мошкин, В.А. Иванисенко
[Десятая всероссийская научно-практическая конференция «Интеллектуальный потенциал ученых России»]
|
|
Разработка базы данных химических соединений - потенциальных маркеров заболеваний
Иванисенко В.А., Сайк О.В., Деменков П.С., Мошкин П.М.
[XVII Российский национальный конгресс "Человек и лекарство"., Москва, 16 апреля 2010 г.]
|
Гранты
| 2020 |
Разработка персонализированных подходов к оценке вариабельности гликемии у больных сахарным диабетом 1 типа на основе математических методов и искусственного интеллекта
Климонтов В.В., Корбут А.И., Сайк О.В., Бериков В.Б.
|
| 2017 |
Оценочная функция ранжирования результатов молекулярного докинга и ее применение для дизайна ингибиторов дигидродипиколинат синтазы (DapA) из Mycobacterium tuberculosis и супероксиддисмутазы (SOD1), ассоциированной с боковым амиотрофическим склерозом человека
Сайк Ольга Владимировна Иванисенко Тимофей Владимирович Афонников Дмитрий Аркадьевич Иванисенко Никита Владимирович Иванисенко Владимир Александрович (Р) Алемасов Николай Александрович
|
| 2012 |
Изучение механизмов функционирования репликона вируса гепатита C в клетке хозяина методами системной биологии
Самсонова Мария Георгиевна, Тодоров Дмитрий Игоревич, Березин Сергей Васильевич, Гурский Виталий Валериевич, Мясникова Екатерина Марковна, Суркова Светлана Юрьевна, Козлов Константин Николаевич, Акбердин Илья Ринатович, Брагин Анатолий Олегович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович, Иванисенко Н.В., Иванисенко Тимофей Владимирович, Медведева Ирина Вадимовна, Мищенко Елена Леонидовна, Сайк Ольга Владимировна, Тийс Евгений Сергеевич
|
| 2010 |
Разработка алгоритмов для биоинформационного анализа комплексных метаболических и молекулярно-генетических сетей
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Иванисенко Н.В., Медведева И.В., Тийс Е.С., Брагин А.О., Игнатьева Е.В., Ананько Е.В., Мищенко Е.Л., Сайл О.В.
|
Учебные курсы
| 2018 |
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем IV: генные сети (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
Игнатьева Е.В., Сайк О.В.
|
| 2017 |
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем IV: генные сети (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
Игнатьева Е.В., Сайк О.В.
|
|
|
