 |
|
|
Мищенко Елена Леонидовна, к. х. н.
|
Персональная информацияРабочий адрес
Г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия
Дата рождения
05.12. 1954
Образование
1972-1977 (НГУ, факультет Естественных Наук)
2001 г. Защита кандидатской диссертации.
Область научных интересов
Биология, вирусология, биоинформатика, мат. моделирование.
Публикации
| 2023 |
Accurate noise-robust classification of
Bacillus species from MALDI-TOF MS spectra
using a denoising autoencoder
Yulia E. Uvarova, Pavel S. Demenkov, Irina N. Kuzmicheva, Artur S. Venzel, Elena L.
Mischenko, Timofey V. Ivanisenko, Vadim M. Efimov, Svetlana V. Bannikova, Asya R.
Vasilieva, Vladimir A. Ivanisenko and Sergey E. Peltek
[J INTEGR BIOINFORM]
|
|
Prioritization of potential pharmacological targets for thedevelopment of anti-hepatocarcinoma drugs modulating the extrinsic apoptosis pathway: the reconstruction andanalysis of associative gene networks help.
Demenkov P.S., Antropova E.A., Adamovskaya A.V., Mishchenko E.L., Khlebodarova T.M., Ivanisenko T.V., Ivanisenko N.V., Venzel A.S., Lavrik I.N., Ivanisenko V.A.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Молекулярно-генетические пути регуляции вирусом гепатита С экспрессии клеточных факторов PREB и PLA2G4C, играющих важную роль для репликации вируса
Е.Л. Мищенко, А.А. Макарова, Е.А. Антропова, А.С. Вензель, Т.В. Иванисенко, П.С. Деменков, В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Приоритизация потенциальных фармакологических мишеней для создания лекарств против гепатокарциномы, модулирующих внешний путь апоптоза, на основе реконструкции и анализа ассоциативных генных сетей
П. С. Деменков, Е. А. Антропова, А. В. Адамовская, Е. Л. Мищенко, Т. М. Хлебодарова, Т. В. Иванисенко, Н. В. Иванисенко, А. С. Вензель, И. Н. Лаврик, В. А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2022 |
Plasma metabolomics and gene regulatory networks analysis reveal the role of nonstructural SARS-CoV-2 viral proteins in metabolic dysregulation in COVID-19 patients
V. A. Ivanisenko, E. V. Gaisler, N. V. Basov, A. D. Rogachev, S. V. Cheresiz, T. V. Ivanisenko, P. S. Demenkov, E. L. Mishchenko, O. P. Khripko, Yu. I. Khripko, S. M. Voevoda, T. N. Karpenko, A. J. Velichko, M. I. Voevoda, N. A. Kolchanov, A. G. Pokrovsky
[SCI REP-UK]
|
|
Репликационно-транскрипционный комплекс коронавирусов: функции индивидуальных вирусных неструктурных субъединиц, свойства и архитектура их комплексов
Е.Л. Мищенко., В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2021 |
Mechanosensitive molecular interactions in atherogenic regions of the arteries: development of atherosclerosis.
Mishchenko EL, Mishchenko AM, Ivanisenko VA
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Механочувствительные молекулярные взаимодействия в атерогенных районах артерий: развитие атеросклероза
Мищенко Е.Л., Мищенко А.М., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2019 |
A new version of the ANDSystem tool for automatic extraction of knowledge from scientific publications with expanded functionality for reconstruction of associative gene networks by considering tissue-specific gene expression
Vladimir A. Ivanisenko, Pavel S. Demenkov, Timofey V. Ivanisenko, Elena L. Mishchenko, Olga V. Saik
[BMC BIOINFORMATICS]
|
| 2018 |
Распределение сдвиговых напряжений на стенках артерий как главный фактор атерогенеза: численные и клинические исследования
Мищенко Е.Л., Мищенко А.М., Иванисенко В.А.
[Дневник науки]
|
| 2017 |
Integrated mathematical models for describing complex biological processes.
Mishchenko E. L., Petrovskaya O. V., Mishchenko A. M., Petrovskiy E. D., Ivanisenko N. V., Ivanisenko V. A.
[BIOPHYSICS]
|
| 2016 |
Mosaic gene network modelling identified new regulatory mechanisms in HCV infection.
Popik OV, Petrovskiy ED, Mishchenko EL, Lavrik IN, Ivanisenko VA.
[VIRUS RES]
|
| 2014 |
A New Stochastic Model for Subgenomic Hepatitis C Virus Replication Considers Drug Resistant Mutants
Nikita V. Ivanisenko, Elena L. Mishchenko, Ilya R. Akberdin, Pavel S. Demenkov, Vitaly A. Likhoshvai, Konstantin N. Kozlov, Dmitry I. Todorov, Vitaly V. Gursky, Maria G. Samsonova, Alexander M. Samsonov, Diana Clausznitzer, Lars Kaderali, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko
[PloS One]
|
| 2013 |
PЕПЛИКАЦИЯ CУБГЕНОМНОГО PЕПЛИКОНА ВИPУCА ГЕПАТИТА C В ПPИCУТCТВИИ ИНГИБИТОPОВ NS3-ПPОТЕАЗЫ: CТОXАCТИЧЕCКАЯ МОДЕЛЬ
Н.В. Иваниcенко, Е.Л. Мищенко, И.P. Акбеpдин, П.C. Деменков, В.А. Лиxошвай, К.Н. Козлов, Д.И. Тодоpов, М.Г. Cамcонова, А.М. Cамcонов, Н.А. Колчанов, В.А. Иваниcенко
[МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОФИЗИКА]
|
| 2012 |
ПОДАВЛЕНИЕ РЕПЛИКАЦИИ СУБГЕНОМНОГО РНК РЕПЛИКОНА ВИРУСА ГЕПАТИТА С ИНГИБИТОРОМ NS3 ПРОТЕАЗЫ SCH 503034 В HUH-7 КЛЕТКАХ: СТОХАСТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ
Е.Л. Мищенко, Н.В. Иванисенко, И.Р. Акбердин, П.С. Деменков, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2009 |
Математическое моделирование действия потенциальных противовирусных препаратов на репликацию субгеномного репликона вируса гепатита С в клетке
Е.Л. Мищенко, K.Д. Безматерных, В.А. Иванисенко, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2007 |
Mathematical model for suppression of subgenomic hepatitis C virus RNA replication in cell culture
Mishchenko E.L., Bezmaternykh K.D., Likhoshvai V.A., Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Sournina N. Yu., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
| 2006 |
Математическая модель репликации РНК репликона вируса гепатита С в клеточной культуре. Моделирование действия потенциальных лекарственных препаратов
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.,Иванисенко В.А.
[BIOPHYSICS]
|
Монографии
| 2010 |
German/Russian Network of Computational Systems Biology. R. Hofestadt and N. Kolchanov (Eds).
E.L. Mishchenko, N.V. Ivanisenko, A.M.Mishchenko, V.A.Likhoshvai, V.A. Ivanisenko, R. Hofestadt, N.A. Kolchanov
|
|
Nandbook of Drug Targeting and Monitoring. B.Andreev and V. Egorov ( Eds).
E.L. Mishchenko, K.D. Bezmaternykh, V.A. Likhoshvai, V.A. Ivanisenko, N.A. Kolchanov
|
| 2009 |
Viral Genomes: Diversity, Properties and Parameters. Zhi Feng and Ming Long (Eds).
E.L. Mishchenko, K.D. Bezmaternykh, V.A. Likhoshvai, V.A. Ivanisenko, N.A. Kolchanov
|
| 2008 |
IV Международная конференция "Фундаментальные науки - медицине". Сборник трудов конференции.
Е.Л. Мищенко, К.Д.Безматерных, В.А. Лихошвай, В.А. Иванисенко
|
|
Регуляторные последовательности ДНК: описание в базах данных.
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Степаненко И.Л., Хлебодарова Т.М., Меркулова Т.И., Меркулов В.М., Мищенко Е.Л., Ибрагимова С.С., Смирнова О.Г., Подколодный Н.Л., Ромащенко А.Г., Ощепков Д.Ю., Мигинский Д.С.
|
Конференции
| 2016 |
MOSAIC GENE NETWORK MODELLING IDENTIFIED NEW REGULATORT MEChANISMS IN HCVINFECTION
O.V. Petroskaya, E.D. Petrovskiy, E.L. Mishchenko, I.N. Lavrik, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2016]
|
| 2014 |
HCV replication modeling: drug resistance phenomenon
Иванисенко Никита Владимирович, Мищенко Елена Леонидовна, Иванисенко Владимир Александрович
[International Symposium on Integrative Bioinformatics 2013]
|
|
KINET 1.0 - a new web database on kinetics data and parameters for E.coli metabolic pathways
Ermak T.V., Akberdin I.R., Timonov V.S., Mischenko E.L., Oshchepkova E.A., Perfilyeva O.A., Smirnova O.G., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[9th BGRS\SB-2014]
|
|
Mathematical model for subgenomic Hepatitis C Virus replication: impact of drug resistance emergence on long-term kinetics of NS3 protease inhibitors action
Ivanisenko N., Mishchenko E., Akberdin I., Demenkov P., Kozlov K., Todorov D., Gursky V.V., Samsonova M.G., Samsonov A.M., Clausznitzer D., Kaderali L., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[9th BGRS\SB-2014]
|
| 2012 |
A stochastic model for suppression of subgenomic hepatitis C virus replication in Huh-7 cells.
N.V. Ivanisenko, E.L. Mishchenko, I.R. Akberdin, P.S. Demenkov, V.A. Likhoshvai, M.G. Samsonova, D. Clausznitzer, L. Kaderali, N.A. Kolchanov and V.A. Ivanisenko
[Международный симпозиум "Syspatho-Системная биология и медицина"]
|
|
SUPPRESSION OF SUBGENOMIC HCV RNA BY NS3 PROTEASE ANTIVIRALS IN CELLS: A BASIC STOCHASTIC MATHEMATICAL MODEL
Ivanisenko N.V., Mishchenko E.L., Akberdin I.R., Demenkov P.S., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
| 2011 |
A mathematical model for the suppression of subgenomic Hepatitis C virus replication in Huh-7 cells in the presence of the NS3 protease inhibitors
Мищенко Е., Иванисенко Н., Акбердин И., Лихошвай В., Козлов К., Гурский В., Самсонова М., Колчанов Н., Иванисенко В.
[International Conference on Systems Biology (ICSB 2011), Хайдельберг, Германия, 28 августа-1 сентября]
|
|
Математическая модель подавления репликации субгеномного репликона вируса гепатита С в клетке с ингибитором NS3 протеазы SCH503034
Мищенко Е., Иванисенко Н., Акбердин И., Лихошвай В., Козлов К., Гурский В., Самсонова М., Колчанов Н., Иванисенко В.
[Санкт-Петербургский научный форум “Наука и общество. Физиология и медицина 21 века. VI Петербургская встреча лауреатов нобелевской премии”, Санкт-Петербург, Россия, 19-23 сентября]
|
| 2010 |
Modeling of the suppressive effect of NS3 protease inhibitor on HCV subgenomic replicon replication in Huh-7 cells
Bezmaternykh K.D., Mishchenko E.L.,Likhoshvai V.A., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A.
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
Математическое моделирвание репликации репликона вируса гепатита С: предсказание эффетивности действия новых потенциальных лекарств
Мищенко Е.Л., Иванисенко Н.В., Мищенко А.М., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А.
[Международная научно-практическая конференция "Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии и медицине" 23-26 ноября, 2010, г. Санкт-Петербург]
|
| 2009 |
Suppressive effect of potencial individual drugs or their combinations on HCV replication in cells: a mathematical model
Mishchenko E.L.
[International Autumn School for Young Scientists on Computational Systems Biology and Bioinformatics]
|
| 2008 |
Estimation of minimal drug treatment duration for clearance of an Huh-7 cell from hepatitis C virus replicon based on mathematical modeling
Mishchenko E.L., Bezmaternykh K.D., Likhoshvai V.A., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
Hepatitis C virus life cycle: mathematical models and prospect for effective therapy
Mishchenko E.L.
[International Autumn School for Young Scientist on Computational Systems Biology and Bioinformatics]
|
|
Modeling of drug effects on hepatitis C virus replication in an Huh-7 cell
Mishchenko E.L., Bezmaternykh K.D., Likhoshvai V.A., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
Математическое моделирование репликации репликона ВГС в клетке. Исследование возможных клеточных факторов
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Иванисенко В.А., Лихошвай В.А
[IV съезд микробиологов Узбекистана, тезисы докладов, г. Ташкент, 9-10 октября 2008]
|
|
Эффект потенциальных лекарственных препаратов на репликацию субгеномного репликона вируса гепатита C в клетке: математическая модель
Е.Л. Мищенко, К.Д.Безматерных, В.А. Лихошвай, В.А. Иванисенко
[IV Международная конференция "Фундаментальные науки - медицине", г. Новосибирск, 2008 г.]
|
| 2007 |
Математическая модель репликации РНК репликона вируса гепатита С в клетке. Построение и варианты использования
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Иванисенко В.А., Лихошвай В.А., Колчанов Н.А.
[III Международная конференция "Фундаментальные науки - медицине", г. Новосибирск, 2-8 сентября 2007 г.]
|
|
Математическая модель репликации репликона вируса гепатита С в клетках Huh-7
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Иванисенко В.А., Лихошвай В.А.
[XLV международная научная студенческая конференция: Студент и научно-технический прогресс, Новосибирск 10-12 апреля 2007г.]
|
|
Математическое моделирование комбинационного действия лекарственных препаратов против вируса гепатита С.
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Иванисенко В.А., Лихошвай В.А.
[Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск]
|
| 2006 |
A minimum mathematical model for suppression HCV RNA replication in cell culture
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Иванисенко В.А.
[The 2d All-Russian Conference "Infocommunication and Computing Technologies and Systems", Ulan-Ude]
|
|
A minimum mathematical model for suppression HCV RNA replication in cell culture.
Bezmaternikh K.D., Mishenko E.L., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Ivanisenko V.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
Hepatitis C virus: application of gene networks technology to searching for perspective pharmacological targets
Ivanisenko VA, Mischenko EL, Bezmaternikh KD, Ratushny AV, Likhoshvai VA,Titov II, Korotkov RO, Khlebodarova TM, Kolchanov NA.
[3rd International conference "Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnologies for Medicine" July 12-16, 2006, Novosibirsk, Russia]
|
|
In silico cell II. Information sources for modeling Escherichia coli metabolic pathways.
Khlebodarova T.M., Ananko E.A., Nedosekina (Oschepkova) E.A. Podkolodnaya O.A., Poplavsky A.S., Smirnova O.G., Ibragimova S.M., Mishenko E.L., Stepanenko I.L., Ignatieva E.V., Proskura A.L., Nishio Imaizumi, Usuda Matsui, Podkolodny N.L.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
Mathematical model for suppression of hepatitis C virus RNA replicon replication in cell culture
Bezmaternikh K.D., Mishchenko E.L., Ratushny A.V., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Ivanisenko V.A.
[The VII All-Russian young scientists conference on mathematical modeling and informatics technology (with foreign participants), Krasnoyarsk]
|
Гранты
| 2012 |
Изучение механизмов функционирования репликона вируса гепатита C в клетке хозяина методами системной биологии
Самсонова Мария Георгиевна, Тодоров Дмитрий Игоревич, Березин Сергей Васильевич, Гурский Виталий Валериевич, Мясникова Екатерина Марковна, Суркова Светлана Юрьевна, Козлов Константин Николаевич, Акбердин Илья Ринатович, Брагин Анатолий Олегович, Деменков Павел Сергеевич, Иванисенко Владимир Александрович, Иванисенко Н.В., Иванисенко Тимофей Владимирович, Медведева Ирина Вадимовна, Мищенко Елена Леонидовна, Сайк Ольга Владимировна, Тийс Евгений Сергеевич
|
| 2010 |
EU-FP7 Research Project SysPatho
Акбердин И.Р., Мищенко Е.Л., Иванисенко Н.В., Деменков П.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А., Колчанова Н.А.
|
|
Разработка алгоритмов для биоинформационного анализа комплексных метаболических и молекулярно-генетических сетей
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Иванисенко Н.В., Медведева И.В., Тийс Е.С., Брагин А.О., Игнатьева Е.В., Ананько Е.В., Мищенко Е.Л., Сайл О.В.
|
Патенты
| 2006 |
База данных: Регуляторные районы генов прокариот (ProkaTEX)
Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Поплавский А.С., Наумочкин А.Н., Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
|
База кинетических данных (KiNET)
Недосекина Е.А., Хлебодарова Т.М., Поплавский А.С., Смирнова О.Г., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
Диссертации
| 2001 |
Фотомодификация тирозина и триптофана арилазидами в условиях сближения реакционных центров
[Кандидат]
|
|
|
