 |
|
|
Лавреха Виктория Вадимовна, к. б. н.
|
Публикации
| 2024 |
Computational Reconstruction of the Transcription Factor Regulatory Network Induced by Auxin in Arabidopsis thaliana L.
Омельянчук Надежда Анатольевна, Лавреха Виктория Вадимовна, Богомолов Антон Геннадьевич, Долгих Владислав Андреевич, Сидоренко Александра Дмитриевна, Землянская Елена Васильевна
[Plants]
|
| 2023 |
DyCeModel: a tool for 1D simulation
for distribution of plant hormones controlling tissue patterning
Азарова Дарья Сергеевна,
Омельянчук Надежда Анатольевна,
Миронова Виктория Владимировна,
Землянская Елена Васильевна,
Лавреха Виктория Вадимовна
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
InterTransViewer: сравнительное описание профилей дифференциальной экспрессии генов из разных экспериментов
А.В. Тяпкин, В.В. Лавреха, Е.В. Убогоева, Д.Ю. Ощепков, Н.А. Омельянчук, Е.В. Землянская
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2022 |
CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana
Lavrekha VV, Levitsky VG, Tsukanov AV, Bogomolov AG, Grigorovich DA, Omelyanchuk N, Ubogoeva EV, Zemlyanskaya EV, Mironova V
[Frontiers in Plant Science]
|
|
Salicylic Acid in Root Growth and Development
Zulfira Z. Bagautdinova, Nadya Omelyanchuk, Aleksandr V. Tyapkin, Vasilina V. Kovrizhnykh,
Viktoriya V. Lavrekha, Elena V. Zemlyanskaya
[INT J MOL SCI]
|
|
Transcriptomic Data Meta-Analysis Sheds Light on High Light Response in Arabidopsis thaliana L.
Бобровских Александр Владимирович
Зубаирова Ульяна Станиславовна
Бондарь Евгения Ивановна
Лавреха Виктория Вадимовна
Дорошков Алексей Владимирович
[INT J MOL SCI]
|
| 2020 |
3D analysis of mitosis distribution pattern in the plant root tip with iRoCS Toolbox
Lavrekha V.V., Pasternak T., Palme K., Mironova V.V.
[Plant Stem Cells - Methods and Protocols. Ed: Naseem N. and Dandekar T.]
|
|
Cell Dynamics in WOX5-Overexpressing Root Tips: The Impact of Local Auxin Biosynthesis
Maria S. Savina,
Taras Pasternak,
Nadya A. Omelyanchuk,
Daria D. Novikova,
Klaus Palme,
Victoria V. Mironova,
Viktoriya V. Lavrekha
[Frontiers in Plant Science]
|
| 2017 |
3D analysis of mitosis distribution highlights the longitudinal zonation and diarch symmetry in proliferation activity of the Arabidopsis thaliana root meristem
Lavrekha V.V., Pasternak T., Ivanov V.B., Palme K., Mironova V.V.
[PLANT J]
|
| 2014 |
Математическая модель регуляции фитогормонами формирования меристематической зоны корня
Лавреха В.В., Омельянчук Н.А., Миронова В.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2007 |
Модельное изучение роли CLV1, CLV2, CLV3 И WUS в регуляции структуры апикальной меристемы побега
Николаев С. В., Пененко A. В., Лавреха В. В., Мелснесс Э. Д., Колчанов Н. А.
[RUSS J DEV BIOL+]
|
| 2006 |
A Systems Approach to Morphogenesis in Arabidopsis thaliana: II. Modeling of the Regulation of Shoot Apical Meristem Structure
S. V. Nikolaev, S. I. Fadeev, A. V. Penenko, V. V. Lavrekha, V. V. Mironova, E. D. Mjolsness, N. A. Omel’yanchuk, N. A. Kolchanov
[BIOPHYSICS]
|
Монографии
| 2008 |
Глава 6. Компьютерная биология развития. Раздел 6.3. Морфогенез растений: реконструкция в базах данных и моделирование.
Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Подколодный Н.А., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Пененко А.В., Лавреха В.В., Зубаирова У.С., Колчанов Н.А.
|
Конференции
| 2024 |
DyCeModel: a tool for 1D simulation for plant hormones
control of tissue patterning using shoot and root apical
meristems of Arabidopsis thaliana as examples
Азарова Дарья Сергеевна, Землянская Елена Васильевна, Лавреха Виктория Вадимовна
[BGRS/SB-2024: 14th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
FindTFnet: a tool for reconstruction of Arabidopsis
transcription factor networks from transcriptome data
Омельянчук Надежда Анатольевна,
Лавреха Виктория Вадимовна,
Богомолов Антон Геннадьевич,
Землянская Елена Васильевна
[BGRS/SB-2024: 14th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
InterTransViewer: a comparative analysis of differential
gene expression profiles
Тяпкин Александр Вячеславович, Омельянчук Надежда Анатольевна, Лавреха Виктория Вадимовна, Землянская Елена Васильевна
[BGRS/SB-2024: 14th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
| 2023 |
CisCross web server: a gene set enrichment analysis to predict the upstream regulators in Arabidopsis thaliana
Lavrekha V.V., Levitsky V., Tsukanov A.V., Bogomolov A.G., Omelyanchuk N., Zemlyanskaya E.V., Mironova V.
[Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology (PlantGen 2023)]
|
|
Computational reconstruction
of transcriptional cascades induced
by plant hormones
Землянская Е.В., Омельянчук Н.А., Лавреха В.В.
[PlantGen]
|
| 2022 |
CisCross web service: a gene set enrichment analysis to predict the upstream regulators for Arabidopsis thaliana
Lavrekha V.V., Tsukanov A.V., Bogomolov A.G. , Omelyanchuk N., Zemlyanskaya E.V., Levitsky V.G., Mironova V.V.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
| 2021 |
WOX5 поддерживает баланс в распределении ауксина между проксимальной и дистальной меристемами корня у Arabidopsis thaliana L.
Савина М.С.
Омельянчук Н.А.
Пастернак Т.П.
Миронова В.В.
Лавреха В.В.
[Всероссийская научная конференция с международным участием "Экспериментальная биология растений и биотехнология: история и взгляд в будущее]
|
| 2020 |
Keeping the gate closed: WOX5 supports the balance between the proximal and distal root meristems via auxin biosynthesis in Arabidopsis thaliana L.
Savina M.S., Pasternak T., Omelyanchuk N., Mironova V.V., Lavrekha V.V.
[BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
| 2019 |
Mitosis and DNA replication events define the boundaries of transition zone in Arabidopsis thaliana root tip
Viktoriya V. Lavrekha, Taras P. Pasternak, Uliyana S. Zubairova, Victoria V. Mironova
[International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2019),]
|
|
Systems biology study on the WOX5 role in the distal part of the root meristem in Arabidopsis thaliana
Savina M.S., Lavrekha V.V., Pasternak T., Mironova V.V.
[Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
|
| 2018 |
3D map of proliferation activity in Arabidopsis thaliana root tips: longitudinal zonation and symmetries in the wild type and mutants
Lavrekha V.V., Pasternak T., Mironova V.V.
[29 International Conference on Arabidopsis research (ICAR’2018)]
|
|
Longitudinal zonation and symmetries in proliferation activity of the Arabidopsis thaliana root meristem in cytokinin deficient and auxin overproducing mutants
Viktoriya Lavrekha, Taras Pasternak, Klaus Palme, Victoria Mironova
[International Symposium “Auxins and Cytokinins in Plant Development ... and Interactions with Other Phytohormones"]
|
|
Mathematical modeling of formation and supporting of the structure of the root apical meristem Arabidopsis thaliana L.
V.V. Lavrekha, V.V. Mironova
[Eleventh International Conference “BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE\systems biology”]
|
|
Математическое моделирование формирования и поддержания структуры апикальной меристемы корня Arabidopsis thaliana L.
Лавреха В.В., Миронова В.В.
[ХХV международная конференция Математика Компьютер Образование]
|
| 2017 |
3D analysis of mitosis distribution highlights the longitudinal zonation and bilateral symmetry of the Arabidopsis thaliana root meristem
Lavrekha VV, Pasternak T, Mironova VV
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева]
|
| 2016 |
ТРЕХМЕРНАЯ КАРТА ПРОЛИФЕРАЦИОННОЙ АКТИВНОСТИ В КОНЧИКЕ КОРНЯ ARABIDOPSIS THALIANA: РАДИАЛЬНАЯ, БИЛАТЕРАЛЬНАЯ И ПРОДОЛЬНАЯ СИММЕТРИИ
В.В. Лавреха, Т. Пастернак, В.В. Миронова
[V Международная Школа для молодых ученых «Эмбриология, генетика и биотехнология»]
|
|
High resolution map of key cell cycle events in Arabidopsis root tips: radial, bilateral and longitudinal symmetry
Lavrekha VV, Pasternak T, Omelyanchuk NA, Ivanov VB, Mironova VV
[International Conference on Systems Biology (ICSB 2016) 16-22 september]
|
|
3D map of proliferation activity in Arabidopsis thaliana root tips: transition domain boundaries and its bilateral symmetry
Lavrekha V.V., Pasternak T., Omelyanchuk N.A., Ivanov V.B., Mironova V.V.
[BGRS/SB’16, Novosibirsk]
|
| 2015 |
Mathematical modeling of morphogenetic regulation of the meristem zone formation in the plant root
Лавреха В.В., Миронова В.В., Омельянчук Н.А.
[MCCMB-2015 (Московская конференция по компьютерной молекулярной биологии)]
|
| 2014 |
Modeling of cell dynamics in the root apical meristem with dynamical grammar
Lavrekha V.V., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A.
[The Ninth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems biology (BGRS\SB-2014)]
|
|
Modeling of cell dynamics in the root apical meristem with dynamical grammar
Lavrekha V.V., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A.
[6th International Young Scientists School «Systems biology and Bioinformatics», SBB’2014]
|
| 2008 |
A MODEL STUDY OF THE ROLE OF PROTEINS CLV1, CLV2, CLV3, AND WUS IN REGULATION OF THE STRUCTURE OF THE SHOOT APICAL MERISTEM
Nikolaev S.V., Penenko A.V., Lavreha V.V., Smal P.A., Mjolsness E.D., Kolchanov N.A.
[The Sixth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008)]
|
|
Computer system for modelling and analysis of plant tissue growth and development
V.V. Lavreha, A.V.Penenko, S.V. Nikolaev, N.A. Kolchanov
[The European conference on Computational Biology (ECCB'08)]
|
|
Computer system for modelling and analysis of plant tissue growth and development
Lavreha V.V., Penenko A.V., Nikolaev S.V., Kolchanov N.A.
[The Sixth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008)]
|
| 2007 |
Computer system for analysis and modeling 2D plant tissue
Lavreha V.V., Nikolaev S.V., Kolchanov N.A., Penenko A.V.
[3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007". July 27-31, 2007, Moscow, Russia]
|
|
Modeling of the Shoot Apical Meristem Structure Regulation Based on CLV1, CLV2, CLV3 and WUS Interactions
Nikolaev S.V., Penenko A.V., Lavreha V.V., Smal P.A., Mjolsness E.D., Kolchanov N.A.
[The Eighth International Conference On Systems Biology (ICSB-2007)]
|
|
Компьютерная система для моделирования и анализа растительных тканей
Лавреха В.В., Пененко А.В., Шерин Д.С., Николаев С.В.
[VIII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, Новосибирск, 27-29 ноября 2007]
|
|
Моделирование механизма позиционирования зоны деления стволовых клеток в апикальной меристеме побега растения
Пененко A.В., Николаев С.В., Смаль П.А., Лавреха В.В.
[VIII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, Новосибирск, 27-29 ноября 2007]
|
| 2006 |
A system for simulation of 2D plant tissue growth and development
Nikolaev S.V., Penenko A.V., Belavskaya V.V., Mjolsness E., N.A. Kolchanov N.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
Гранты
| 2021 |
Поиск, декомпозиция и верификация регуляторных модулей, обеспечивающих формирование пространственно-временных паттернов экспрессии генов растений
Левицкий Виктор Георгиевич,
Миронова Виктория Владимировна,
Лавреха Виктория Вадимовна,
Сизенцова Яна Геннадьевна,
Коврижных Василина Владимировна,
Долгих Владислав Андреевич,
Омельянчук Надежда Анатольевна,
Цуканов Антон Витальевич,
Вибе Даниил Станиславович,
Коростелева Анастасия Леонидовна
|
| 2019 |
Выявление и экспериментальная проверка ауксин-чувствительных композиционных элементов в промоторах генов Arabidopsis thaliana L.
Новикова Дарья Дмитриевна
Лавреха Виктория Вадимовна
Коростелёва Анастасия Леонидовна
Пуховая Евгения Максимовна
|
| 2018 |
Системный анализ генов, обеспечивающих устойчивость корня растений к низким положительным температурам
Вибе Даниил Станиславович, Долгих Владислав Андреевич, Землянская Елена Васильевна, Лавреха Виктория Вадимовна, Миронова Виктория Владимировна, Новикова Дарья Дмитриевна, Сизенцова Яна Геннадьевна, Убогоева Елена Вячеславовна
|
|
Исследование молекулярно-генетических механизмов формирования позиционной информации в апикальной меристеме корня Arabidopsis thaliana с использованием портретной математической модели
Савина Мария Сергеевна
Лавреха Виктория Вадимовна
Казанцев Федор Владимирович
|
| 2015 |
Транскрипционная и посттранскрипционная регуляция ауксином и этиленом экспрессии генов в корне Arabidopsis thaliana
Вибе Даниил Станиславович Дорошков Алексей Владимирович Климова Наталья Викторовна Лавреха Виктория Вадимовна Левицкий Виктор Георгиевич Миронова Виктория Владимировна, руководитель, Новикова Дарья Дмитриевна Ощепков Дмитрий Юрьевич Чернова Василина Владимировна Черных Ольга Александровна
|
| 2014 |
Изучение молекулярных механизмов развития органов растений методами системной биологии
Афонников Д.А., Голушко С.К., Дорошков А.В., Зубаирова У.С., Казанцев Ф.В., Колчанов Н.А., Лавреха В.В., Миронова В.В., Николаев С.В., Новикова Д.Д., Омельянчук Н.А., Пененко А.В., Пшеничникова Т.А., Савина М.С., Саженков С.А., Симонов А.В., Чернова В.В.
|
| 2008 |
Компьютерное моделирование и анализ механизма гомеостаза структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме Arabidopsis thaliana
Колчанов Н.А. , Омельянчук Н.А., н.с. Николаев С.В., Ананько Е.А., Вишневский О.В., Хомичева И.В., Миронова В.В., Лавреха В.В.
|
Патенты
| 2021 |
Программный комплекс для выявления обогащения цис-регуляторных элементов в выборке функциональных районов генома (CisCross)
Левицкий Виктор Георгиевич,
Миронова Виктория Владимировна,
Лавреха Виктория Вадимовна
|
Диссертации
| 2018 |
Компьютерный анализ и моделирование процессов формирования и поддержания структуры апикальной меристемы корня Arabidopsis thaliana L.
[Кандидат]
|
|
|
