 |
|
|
Кочетов Алексей Владимирович, д. б. н.
|
Персональная информацияРабочий адрес
Г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия
Дата рождения
02.01.1967
Образование
НГУ – 1991 – специальность "биолог"
к.б.н. (по специальности "генетика") - 1998 год
доцент (по специальности "генетика") - 2004 год
д.б.н. (по специальностям "генетика" и "математическая биология и биоинформатика") - 2013 год
профессор РАН (2016 г)
член-корреспондент РАН (2016 г)
академик РАН (2022 г)
Редакционная и издательская деятельность
Главный редактор "Вавиловского журнала генетики и селекции", главный редактор сетевого издания "Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции", член редакционной коллегии журналов Gene и Plant Gene (Elsevier), "Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет) ", "Фитосанитария. Карантин растений", член редакционного совета журналов "Агроинновации", "Биотехнология и селекция растений", "Атеросклероз".
Идентификаторы
Scopus Author ID: 57221208494
РИНЦ ID: 85276
ORCID ID: 0000-0003-3151-5181
Web of Science ResearcherID: R-9689-2016
Область научных интересов
генетика, генная инженерия, молекулярная биология, биоинформатика
Публикации
| 2024 |
Reduction in Cold‑Induced Sweetening by Cas9
Endonuclease‑Mediated Knockout of the POTATO
VACUOLAR INVERTASE 1 Gene in the Cultivar ‘Symfonia’
Anastasiya A. Egorova, Tatyana E. Zykova,
Nina E. Kostina, Izatsho A. Saboiev, Kristina A. Koloshina,
Elena A. Filipenko, Iris Hoffie, Christian Hertig,
Stefan Hiekel, Jochen Kumlehn, Alex V. Kochetov,
Sophia V. Gerasimova
[POTATO RES]
|
|
Выдающиеся ученые России. Академик Владимир Константинович Шумный
Кочетов А.В., Леонова И.Н., Першина Л.А., Захаров И.К., Хлесткина Е.К., Салина Е.А., Гончаров Н.П.
[Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции]
|
| 2023 |
Assembly and Analysis of Plastomes for 15 Potato Cultivars Grown in Russia
Dmitry I. Karetnikov, Elena A. Salina, Alex V. Kochetov, Dmitry A. Afonnikov
[Agronomy]
|
|
Genotype-Specific Features of Cold-Induced Sweetening Process Regulation in Potato Varieties Nikulinsky, Symfonia, and Nevsky
Egorova A.A., Saboiev I.A., Kostina N.E., Kuvaeva D.D., Shcherban A.B., Ibragimova S.M., Salina E.A., Kochetov A.V.
[Molecular Biology]
|
|
Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato
Cultivars Grown in Russia
Dmitry I. Karetnikov, Gennady V. Vasiliev, Stepan V. Toshchakov, Nikolay A. Shmakov, Mikhail A. Genaev, Mikhail A. Nesterov, Salmaz M. Ibragimova, Daniil A. Rybakov,
Tatjana A. Gavrilenko, Elena A. Salina, Maxim V. Patrushev, Alex V. Kochetov and Dmitry A. Afonnikov
[INT J MOL SCI]
|
|
Abnormal mTOR Signaling Pathway Activity in Autism Spectrum Disorders: Prospects of Mechanism-Based Therapy
E. A. Trifonova
А. А. Kotliarova
A. V. Kochetov
[Molecular Biology]
|
|
Three Cycles of Continuous Propagation of a Severe PSTVd
Strain NicTr-3 in Solanum lycopersicum cv. Rutgers Resulted in Its Attenuation and Very Mild Disease Symptoms in Potato
Alex V. Kochetov, Nikolay Shmakov, Dmitry A. Afonnikov, Gennady V. Vasiliev, Natalja V. Shatskaya, Anastasiya A. Egorova, Nina V. Mironenko, Nina M. Lashina, Alexander V. Khiutti and Olga S. Afanasenko
[Agronomy]
|
|
WAX INDUCER 1 Regulates β-Diketone Biosynthesis by Mediating Expression of the Cer-cqu Gene Cluster in Barley
Gerasimova, S.V.; Kolosovskaya, E.V.; Vikhorev, A.V.; Korotkova, A.M.; Hertig, C.W.; Genaev, M.A.; Domrachev, D.V.; Morozov, S.V.; Chernyak, E.I.; Shmakov, N.A.; Vasiliev, G.V.; Kochetov, A.V.; Kumlehn, J.; Khlestkina, E.K.
[INT J MOL SCI]
|
|
Аномальная активность сигнального пути mTOR в расстройствах аутистического спектра: возможности механизмобоснованной терапии
Трифонова Екатерина Александровна
Котлярова Анастасия Анатольевна
Кочетов Алексей Владимирович
[Молекулярная биология]
|
| 2022 |
Abnormal mTOR Activity in Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric and MIA-Associated Autism Spectrum Disorders
Ekaterina A. Trifonova, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov
[INT J MOL SCI]
|
|
Developmental and hormonal regulation of Arabidopsis thaliana ornithine-delta-aminotransferase
A.A. Egorova, S.V. Gerasimova, A.V. Kochetov
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Molecular and Genetic Aspects of Potato Response to Late Blight Infection
T. S. Golubeva, V. A. Cherenko, O. I. Sinitsyna, A. V. Kochetov
[RUSS J GENET+]
|
|
Variability of leaf pubescence characteristics in transgenic tobacco lines with partial proline dehydrogenase gene suppression.
S.M. Ibragimova, M.A. Genaev, A.V. Kochetov, D.A. Afonnikov
[BIOL PLANTARUM]
|
|
Метаболизм крахмала у картофеля Solanum tuberosum L.
Сергеева Е.М., Ларичев К.Т., Салина Е.А., Кочетов А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2021 |
Do Autism Spectrum and Autoimmune Disorders Share Predisposition Gene Signature Due to mTOR Signaling Pathway Controlling Expression?
Ekaterina A. Trifonova, Alexandra I. Klimenko, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov
[INT J MOL SCI]
|
|
NLR Genes Related Transcript Sets in Potato Cultivars Bearing Genetic Material of Wild Mexican Solanum Species
Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Antonova O.Y., Shatskaya N.V., Glagoleva A.Y., Ibragimova S.M., Khiutti A., Afanasenko O.S., Gavrilenko T.A.
[Agronomy]
|
|
Вироид веретеновидности клубней картофеля
Кочетов, А. В., Пронозин, А. Ю., Шацкая, Н. В., Афонников, Д. А., Афанасенко, О. С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ УСТОЙЧИВОСТИ КАРТОФЕЛЯ К ФИТОФТОРОЗУ
Т. С. Фролова, В. А. Черенко, О. И. Синицына, А. В. Кочетов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Генотипирование образцов картофеля коллекции «ГенАгро» ИЦиГ СО РАН с применением ДНК-маркеров генов устойчивости к фитопатогенам
Тоцкий Игорь Васильевич, Розанова Ирина Вениаминовна, Сафонова Анна Дмитриевна, Батов Александр Сергеевич, Гуреева Юлия Александровна, Хлесткина Елена Константиновна, Кочетов Алексей Владимирович
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Рибосомное профилирование как инструмент исследования трансляции у растений: основные итоги, проблемы и перспективы
Афонников, Д. А., Синицына, О. И., Голубева, Т. С., Шмаков, Н. А., Кочетов, А. В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2020 |
Conversion of hulled into naked barley by Cas endonuclease-mediated knockout of the NUD gene
Sophia V. Gerasimova, Christian Hertig, Anna M. Korotkova, Ekaterina V. Kolosovskaya, Ingrid Otto, Stefan Hiekel, Alex V. Kochetov, Elena K. Khlestkina, Jochen Kumlehn
[BMC PLANT BIOL]
|
|
Lipophilic Metabolites from Five‐Needle Pines, Pinus armandii and Pinus kwangtungensis , Exhibiting Antibacterial Activity
Alexander V. Shpatov, Tatyana S. Frolova, Sergey A. Popov, Olga I. Sinitsyna, Olga I. Salnikova, Guangyao Zheng, Linlin Yan, Nadezhda V. Sinelnikova, Lyudmila M. Pshennikova, Alexey V. Kochetov
[CHEM BIODIVERS]
|
|
The mechanism of potato resistance to
Globodera rostochiensis: comparison of root
transcriptomes of resistant and susceptible
Solanum phureja genotypes
Alex V. Kochetov, Anastasiya A. Egorova, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina,
Sophia V. Gerasimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov,
Olga Y. Antonova, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko and Tatjana A. Gavrilenko
[BMC PLANT BIOL]
|
|
Геномные районы Solanum tuberosum L., ассоциированные с глубиной залегания глазков клубней
Тоцкий И.В., Розанова И.В., Сафонова А.Д., Батов А.С., Гуреева Ю.А., Кочетов А.В., Хлесткина Е.К.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Потенциал использования молекулярных маркеров в селекции сои
Виниченко Н.А., Салина Е.А., Кочетов А.В.
[Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции]
|
| 2019 |
Genotoxic activity of 1,2,3-triazolyl modified furocoumarins and 2,3-dihydrofurocoumarins
Stepan A. Kremis , Dmitry S. Baev, Alla V. Lipeeva, Elvira E. Shults, Tatiana G. Tolstikova, Olga I. Sinitsyna, Alexey V. Kochetov, Tatiana S. Frolova
[J BIOCHEM MOL TOXIC]
|
|
Regulatory Sequences for Constitutive, Tissue-Specific,
and Induced Expression of Transgenes in Ornamental Plants
Smirnova O.G., Shumny V.K., Kochetov A.V.
[RUSS J PLANT PHYSL+]
|
|
The mTOR Signaling Pathway Activity and Vitamin D Availability Control the Expression of Most Autism Predisposition Genes
Ekaterina A. Trifonova, Alexandra I. Klimenko, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov
[INT J MOL SCI]
|
|
Оценка количественных характеристик клубнеобразования
дикого картофеля на основе анализа изображений клубней
с использованием компьютерного приложения SeedСounter
К.А. Иванова, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, А.А. Егорова, К.А. Колошина, Н.А. Чала,
Д.А. Афонников, А.В. Кочетов, Е.В. Рогозина, С.В. Герасимова
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Приоритизация генов картофеля, вовлеченных в формирование селекционно-значимых признаков, с использованием базы знаний SOLANUM TUBEROSUM.
Деменков П.С., Сайк О.В., Иванисенко Т.В., Колчанов Н.А., Кочетов А.В., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Регуляторные последовательности для конститутивной, тканеспецифичной и индуцированной экспрессии перенесенных генов у декоративных растений
Смирнова О.Г., Шумный В.К., Кочетов А.В.
[Физиология растений]
|
| 2018 |
Converting Hulled into Naked Barley through Targeted
Knock-Out of the Nud1 Gene
S. Gerasimova, C. Hertig, A. Korotkova, I. Otto, S. Hiekel, A. Kochetov, J. Kumlehn, E. Khlestkina
[IN VITRO CELL DEV-PL]
|
|
Fluorescent labeling of ursolic acid with FITC for investigation of its cytotoxic activity using confocal microscopy
T.S. Frolova, A.V. Lipeeva, D.S. Baev, S.I. Baiborodin, K.E. Orishchenko, A.V. Kochetov, O.I. Sinitsyna
[BIOORG CHEM]
|
|
Gene Network and Database for Genes of Wheat’s Resistance to Pathogenic Fungi
O. G. Smirnova, V. K. Shumny, A. V. Kochetov
[RUSS J PLANT PHYSL+]
|
|
Ribonuclease activity as a new prospective disease resistance marker in potato
E.A. Trifonova , S.M. Ibragimova, O.A. Volkova, V.K. Shumny, A.V. Kochetov
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Targeted genome modification in protoplasts of a highly regenerable Siberian barley cultivar using RNA-guided Cas9 endonuclease
S.V. Gerasimova, A.M. Korotkova, C. Hertig, S. Hiekel, R. Hoffie, N. Budhagatapalli, I. Otto, G. Hensel,
V.K. Shumny, A.V. Kochetov, J. Kumlehn, E.K. Khlestkina
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Генная сеть и база данных генов устойчивости пшеницы к патогенным грибам
Смирнова О.Г., Шумный В.К., Кочетов А.В.
[Физиология растений]
|
|
Использование промоторов генов картофеля для регуляции экспрессии целевых генов у трансгенных растений
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля. Материалы научной конференции (Россия, Новосибирск, 1-5 августа 2018 года).]
|
|
Морфогенетический потенциал сортов картофеля сибирской селекции в культуре in vitro.
С.М. Ибрагимова , А.В. Романова, Г.Х. Мызгина, A.В. Кочетов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
Status and Prospects of Marker-Assisted and Genomic Plant Breeding
N.A. Kolchanov, A.V. Kochetov, E.A. Salina, L.A. Pershina, E.K. Khlestkina, V.K. Shumny
[HER RUSS ACAD SCI+]
|
|
AltORFev facilitates the prediction of alternative open reading frames in eukaryotic mRNAs
Kochetov Alex V., Allmer Jens, Klimenko Alexandra I., Zuraev Bulat S., Matushkin Yury G., Lashin Sergey A.
[BIOINFORMATICS]
|
|
A Database on Genes Increasing the Resistance of Wheat and its Related Species against Pathogenic Fungi
Smirnova O.G., Kochetov V.A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Achievements and Prospects of Applying High-Throughput Sequencing Techniques to Potato Genetics and Breeding
Bykova I.V., Shmakov N.A., Afonnikov D.A., Kochetov A.V., Khlestkina E.K.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots
N. A. Omelyanchuk, D. S. Wiebe, D. D. Novikova, V. G. Levitsky, N. Klimova, V. Gorelova, C. Weinholdt, G. V. Vasiliev, E. V. Zemlyanskaya, N. A. Kolchanov, A. V. Kochetov, I. Grosse, V. V. Mironova
[SCI REP-UK]
|
|
Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis
Alex V. Kochetov, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Salmaz M. Ibragimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Tatyana A. Gavrilenko, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko
[BMC PLANT BIOL]
|
|
Genome Editing System CRISPR/CAS9 and Peculiarities of Its Application in Monocots
S. V. Gerasimova, E. K. Khlestkina, A. V. Kochetov, V. K. Shumny
[RUSS J PLANT PHYSL+]
|
|
Достижения и перспективы использования методов высокопроизводительного секвенирования в генетике и селекции картофеля
Быкова И.В., Шмаков Н.А., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Хлесткина Е.К.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Механизмы устойчивости пшеницы к патогенным грибам
Смирнова О.Г., Кочетов А.В
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева.]
|
|
СИСТЕМА CRISPR/CAS9 ДЛЯ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМОВ И ОСОБЕННОСТИ ЕЕ ПРИМЕНЕНИЯ НА ОДНОДОЛЬНЫХ РАСТЕНИЯХ
С. В. Герасимова, Е. К. Хлесткина, А. В. Кочетов, В. К. Шумный
[Физиология растений]
|
|
Создание базы данных и реконструкция генной сети ответа пшеницы на патогенную инфекцию
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Генофонд и селекция растений. Тезисы докладов III международной конференции, посвященной 130-летию Н.И. Вавилова]
|
|
Состояние и перспективы использования маркер-ориентированной и геномной селекции растений
Колчанов Н.А., Кочетов А.В., Салина Е.А., Першина Л.А., Хлесткина Е.К., Шумный В.К.
[Вестник Российской Академии Наук]
|
| 2016 |
Expression of extracellular ribonuclease gene increases resistance to Cucumber mosaic virus in tobacco
Sugawara T., Trifonova E.A., Kochetov A.V., Kanayama Y.
[BMC PLANT BIOL]
|
|
Plant Cell Wall and Mechanisms of Resistance to Pathogens
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Production of recombinant proteins in plant cells
Gerasimova S.V., Smirnova O.G., Kochetov A.V., Shumny V.K.
[RUSS J PLANT PHYSL+]
|
|
Reconstruction of the gene network of the wheat response to fungal pathogens
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[Plant Genetics and Genomics For Food Security. Novosibirsk, Russia. Abstract Book]
|
|
База данных генов устойчивости пшеницы к патогенным грибам
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[50 лет ВОГиС: успехи и перспективы. Сборник тезисов Всероссийской конференции]
|
|
База данных генов, повышающих устойчивость пшеницы и родственных ей злаков к патогенным грибам
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Индуцированная экспрессия гена рибонуклеазы III Serratia marcescens в трансгенных растениях табака Nicotiana tabacum L. cv. SR1.
Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Романова А.В., Филипенко Е.А., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
|
|
Наработка рекомбинантных белков в клетках растений
С. В. Герасимова, О. Г. Смирнова, А. В. Кочетов, В. К. Шумный
[Физиология растений]
|
|
Трансгенные растения как генетические модели для изучения функций генов
Кочетов А.В., Шумный В.К.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2015 |
Promoters of Plant Genes Responsive to Pathogen Invasion.
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Вирус-индуцируемый сайленсинг как метод изучения функций генов высших растений
Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
|
|
Роль клеточной стенки растений в защитном ответе
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Трансгенная экспрессия нативной и мутантной нуклеазы Serratia marcescens модулирует устойчивость табака Nicotiana tabacum L. к вирусу табачной мозаики
Трифонова Е. А., Савельева А. В., Романова А. В., Филипенко Е. А., Сапоцкий М. В., Малиновский В. И., Кочетов А. В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
|
| 2014 |
Agrobacterium-mediated transformation of sunflower (Helianthus annuus L.) in vitro and in planta using Lba4404 strain harboring binary vector pBi2E with dsRNA-suppressor of proline dehydrogenase gene.
Tishchenko O.M., Komisarenko A.G., Mykhalska S.I., Sergeeva L.E., Adamenko N.I., Morgun B.V., Kochetov A.V.
[Цитология и генетика]
|
|
Artificial genetic constructs to direct the synthesis of transmissible self-replicating RNAs
Kochetov A.V.
[BIOESSAYS]
|
|
Промоторы генов, регулирующих ответ на патогены у растений.
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Энхансеры трансляции для генной инженерии растений.
Кочетов А.В., Филипенко Е.А., Смирнова О.Г., Шумный В.К.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2013 |
Hidden coding potential of eukaryotic genomes: non-AUG started ORFs
Kochetov A.V., Prayaga P.D., Volkova O.A., Sankararamakrishnan R.
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
PR-белки с рибонуклеазной активностью и устойчивость растений к патогенным грибам.
175. Филипенко Е.А., Кочетов А.В., Kanayama Y., Малиновский В.И., Шумный В.К.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets.
Sommer B., Kormeier B., Demenkov P., Arrigo P., Hippe K., Ates O., Kochetov A.V., Ivanisenko V., Kolchanov N.A., Hofestaedt R.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Анализ эффективности использования двухцепочечного рнк-супрессора гена пролиндегидрогеназы для повышения уровня устойчивости подсолнечника (Helianthus annuus L.) К водному дефициту и засолению.
Комисаренко А.Г., Михальская С.И., Сергеева Л.Е., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н.
[Известия Самарского научного центра РАН]
|
|
Аналіз запасних білків кукурудзи, трансформованої in planta з використанням обеззброєнних штамів Agrobacterium tumefaciens.
Матвєєва О.Ю., Сірант Л.В., Курчій В.М., Моргун Б.В., Тищенко О.М., Кочетов О.В.
[Физиология растений и генетика]
|
|
Исследование содержания свободного пролина в растениях кукурузы, трансформированных in planta с использованием LBA4404, несущего pBI2E с двухцепочечным РНК-супрессором гена пролиндегидрогеназы.
Михальская С.И., Матвеева А.Ю., Сергеева Л.Е., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н.
[Известия Самарского научного центра РАН]
|
|
Компьютерный анализ данных экспрессии генов в клетках мозга, полученных с помощью микрочипов и высокопроизводительного секвенирования
Медведева И.В., Вишневский О.В., Сафронова Н.С., Кожевникова О.С., Генаев М.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Орлов Ю.Л.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Роль ауто- и гетерологичных рибонуклеаз семейства III в механизмах устойчивости к патогенам и регуляции экспрессии генов высших растений.
Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Кочетов А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2012 |
Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA.
[ANN BOT-LONDON]
|
|
Extensive translatome remodeling during ER stress response in mammalian cells
Ventoso I., Kochetov A., Montaner D., Dopazo J., Santoyo J.
[PloS One]
|
|
Inducible expression of the gene of Zinnia elegans coding for extracellular ribonuclease in the SR1 Nicotiana tabacum plants
Trifonova E.A., Romanova A.V., Sangaev S.S., Sapotsky M.V., Malinovsky V.I., Kochetov A.V.
[BIOL PLANTARUM]
|
|
Possible link between the synthesis of GR alpha isoforms and eIF2 alpha phosphorylation state.
Kochetov AV, Merkulova TI, Merkulov VM
[MED HYPOTHESES]
|
|
Research progress on the medicinal and nutritional properties of sea buckthorn (Hippophae rhamnoides)
Kanayama Y., Kato K., Stobdan T., Galitsyn G.G., Kochetov A.V., Kanahama K.
[J HORTIC SCI BIOTECH]
|
|
Simple database to select promoters for plant transgenesis.
Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В.
[TRANSGENIC RES]
|
|
TGP – база данных промоторов для трансгенеза растений
Смирнова О.Г., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Кочетов А.В.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Wheat Promoter Sequences for Transgene Expression.
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Информационная поддержка экспериментов по трансгенезу растений в базе данных трансляционных энхансеров.
Смирнова О.Г., Рассказов Д.А., Кочетов А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Информационный портал "Биотехнология растений" - Интернет ресурс для поддержки экспериментов в области генной инженерии растений, генетики и селекции пшеницы.
Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Промоторы пшеницы для экспрессии трансгенов
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Частичная супрессия гена пролиндегидрогеназы увеличивает устойчивость растений к различным видам абиотических стрессов.
С.С. Ибрагимова, Я.С. Колодяжная, С.В. Герасимова, А.В. Кочетов
[Физиология растений]
|
| 2011 |
Alternative translation start sites are conserved in eukaryotic genomes
Bazykin G.A., Kochetov A.V.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Production of recombinan HIV-1 GAG polyprotein fused to yellow Fluorescent Protein (EYFP) in Leishmania tarentolae
156. Razumova Ju.V., Cheresiz S.V., Kochetov A.V., Beklemishev A.B.
[Вестник уральской медицинской академической науки]
|
|
Tandem termination signal in plant mRNA
Kochetov A.V., Volkova O.A., Poliakov A., Dubchak I., Rogozin I.B.
[GENE]
|
|
Активность сахаросинтетазы и инвертазы эндосперма кукурузы (Zea mays L.), инфицированной in planta обезоруженными штаммами Agrobacterium tumefaciens
Матвеева А.Ю., Сакало В.Д., Курчий В.М., Моргун Б.В., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н.
[Вісник Українського товариства генетиків та селекціонерів]
|
|
Анализ транскрипционной активности промотора гена дельта-орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana
Герасимова С.В., Горелова В.В., Дорогина О.В., Жмудь Е.В., Коваль В.С., Романова А.В., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
|
|
Метаболизм сахарозы на ранних этапах онтогенеза кукурузы (Zea mays L.), трансформированной in planta обезоруженными штаммами штаммом Agrobacterium tumefaciens
Тищенко Е.Н., Сакало В.Д., Матвеева А.Ю., Курчий В.М., Моргун Б.В., Кочетов А.В.
[Биотехнология]
|
|
Функции дельта-аминотрансферазы у растений
Герасимова С.В., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Шумный В.К.
[Успехи современной биологии]
|
| 2010 |
Interrelations between the nucleotide context of human start AUG codon, N-end amino acids of the encoded protein and initiation of translation
Volkova O.A. Kochetov A.V.
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
On nucleotide solvent accessibility in RNA structure
Singh H., Andrabi M., Kahali B., Ghosh T.C., Miziguchi K., Kochetov A.V., Ahmad S.
[GENE]
|
|
Sensibility to phytorhabdoviruses of transgenic tobacco plants
Spivak N.Ya., Kochetov A.V., Lozova O.I., Levenko B.A., Yuzvenko L.V., Nikolaychuk M.V., Levchuk O.B., Didenko L.F., Trifonova E.A., Sangaev S.S.
[Scientific Bulletin of the Uzhgorod University (Series Biology)]
|
|
Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches
Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R
[J INTEGR BIOINFORM]
|
|
Инактивация гена Nk1 в растениях табака Nicotiana tabacum SR1 за счет РНК-интерференции
Сангаев С.С., Трифонова Е.А., Титов С.Е., Романова А.В., Колодяжная Я.С., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В.
[RUSS J GENET+]
|
|
Индукция регенерации in vitro при Agrobacterium-опосредованной трансформации инбредных линий подсолнечника
Комисаренко А.Г., Михальская С.И., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н.
[Биотехнология]
|
|
Роль различных метаболитов в формировании стрессоустойчивости растений
Ибрагимова С.С., В.В. Горелова, А.В. Кочетов, В.К. Шумный
[Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина]
|
|
Роль экстраклеточных рибонуклеаз в физиологических процессах высших растений
Сангаев С.С., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Левенко Б.А., Шумный В.К.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Трансформанты табака, экспрессирующие кДНК гена орнитинаминотрансферазы Medicago truncatula
Герасимова С.В., Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Романова А.В., Коваль В.С., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2009 |
Dark and light green tissues of tobacco leaves systemically infected with tobacco mosaic virus
Burundukova O.L., Sapotsky M.V., Kochetov A.V., Trifonova E.A., Malinovsky V.I.
[BIOL PLANTARUM]
|
|
Трансгенные растения, толерантные к абиотическим стресса
Колодяжная Я.С, Куцоконь Н.К., Левенко Б.А., Cютикова О.С., Рахметов Д.Б., Кочетов А.В.
[RUSS J GENET+]
|
| 2008 |
Alternative translation and hidden coding potential of eukaryotic mRNAs
Kochetov A.V.
[BIOESSAYS]
|
|
uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs
Kochetov A.V., Ahmad S., Ivanisenko V., Volkova O.A., Kolchanov N.A., Sarai A.
[FEBS LETT]
|
|
Высокоэффективная экспрессия В-субъединицы термолабильного энтеротоксина Escherichia coli в растениях с помощью вируса-вектора на основе генома X-вируса картофеля
Равин Н.В., Куприянов В.В., Замчук Л.А., Кочетов А.В., Дорохов Ю.Л., Атабеков И.Г., Скрябин К.Г.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
| 2007 |
AUG_hairpin: prediction of a downstream secondary structure influencing the recognition of a translation start site
Kochetov A.V., Palyanov A., Titov I.I., Grigorovich D., Sarai A., Kolchanov N.A.
[BMC BIOINFORMATICS]
|
|
Protection of transgenic tobacco plants expressing bovine pancreatic ribonuclease against tobacco mosaic virus
Trifonova E. A., Sapotsky M.V., Komarova M. L., Scherban A.B., Shumny V.K., Polyakova A.M., Lapshina L.A., Kochetov A.V., Malinovsky V.I.
[PLANT CELL REP]
|
|
Молекулярные механизмы системной устойчивости растений к вирусным инфекциям и способы повышения вирусоустойчивости путем трансгенеза
Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[Успехи современной биологии]
|
|
Трансгенные растения табака Nicotiana tabacum SR1, экспрессирующие экстраклеточную рибонуклеазу Zinnia elegans
Сангаев С.С., Трифонова Е.А., Титов С.Е., Романова А.В., Колодяжная Я.С., Комарова М.Л., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
|
|
Трансформанты табака, экспрессирующие антисмысловую последовательность гена пролиндегидрогеназы, проявляют устойчивость к тяжелым металлам оследовательность гена пролиндегидрогеназы, проявляют устойчивость к тяжелым металлам
Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Кочетов А.В., Трифонова Е.А., Романова А.В., Комарова М.Л., Коваль В.С., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
|
| 2006 |
Альтернативные сайты инициации трансляции и их вклад в протеом эукариотических клеток
Кочетов А.В.
[Molecular Biology]
|
|
Взаимосвязь контекстной организации сигнала инициации трансляции и аминокислотной последовательности на N-конце белков эукариот
Волкова О.А., Титов С.Е., Кочетов А.В.
[BIOPHYSICS]
|
|
Оценка солеустойчивости растений табака Nicotiana tabacum, несущих антисмысловой супрессор гена пролиндегидрогеназы
Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Кочетов А.В., Комарова М.Л., Романова А.В., Коваль В.С., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
|
|
Потенциальные открытые рамки считывания в 5”-нетранслируемых районах эукариотических мРНК
Волкова О. А., Кочетов А. В., Титов С. Е., Колчанов Н. А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Трансгенез как способ увеличения устойчивости растений к повышенным концентрациям тяжелых металлов
Колодяжная Я.С., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[Успехи современной биологии]
|
| 2003 |
Data Mining Techniques in Bioinformatics
Zagoruiko N.G., Kolchanov N.A., Pichueva A.G., Kutnenko O.A., Borisova I.A., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Nikolaev S.V., Likhoshvai V.A., Ratushnyi A.V.
[Pattern Recognition and Image Analysis]
|
| 1999 |
GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот
Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон
[BIOPHYSICS]
|
|
Integrated databases and computer systems for studying eukaryotic gene expression.
Kolchanov N.A., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Ananko E.A., Kolpakov F.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Goryachkovskaya T.N., Stepanenko I.L., Merkulova T.I., Babenko V.N., Ponomarenko J.V., Kochetov A.V., Podkolodny N.L., Vorobyev D.G., Lavrushev S.V., Grigorovich D.A., Kondrakhin Yu.V., Milanesi L., Wingender E., Solovyev V.V., Overton G.C.
[BIOINFORMATICS]
|
|
Prediction of eukaryotic mRNA traslational properties.
Kochetov A.V., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Kisselev L.L., Kolchanov N.A.
[BIOINFORMATICS]
|
| 1998 |
Eukaryotic mRNAs encoding abundant and scarce proteins are statistically dissimilar in many structural features.
Kochetov AV, Ischenko IV, Vorobiev DG, Kel AE, Babenko VN, Kisselev LL, Kolchanov NA.
[FEBS LETT]
|
|
GeneExpress: a computer system for description, analysis, and recognition of regulatory sequences in eukaryotic genome.
N.A. Kolchanov, M.P. Ponomarenko, A.E. Kel, A.S. Frolov, F.A. Kolpakov, T.N. Goryachkovsky, O.V. Kel, E.A. Ananko, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, V.N. Babenko, I.L. Stepanenko, A.G. Romashchenko, T.I. Merkulova, D.G. Vorobiev, S.V. Lavryushev, A.V. Kochetov, G.B. Kolesov, V.V. Solovyev, L. Milanesi, N.L. Podkolodny, E. Wingender, T. Heinemeyer
[Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol]
|
Монографии
| 2020 |
Choice of the promoter for tissue and developmental stage-specific gene expression.
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
|
| 2018 |
ВЕКТОРЫ И РЕПЛИКОНЫ ДЛЯ БИОИНЖЕНЕРИИ РАСТЕНИЙ: ОТ БИОПРОДУКЦИИ К ГЕНОМНОМУ РЕДАКТИРОВАНИЮ
Герасимова С. В., Назаренко А. В., Кочетов А. В.
|
| 2017 |
Degrees of Freedom
Ponomarenko M., Babenko V., Kochetov A., Kolchanov N.
|
| 2016 |
Векторы, репликоны и биопродукция в растениях
Герасимова С.В., Назаренко А.В., Кочетов А.В.
|
| 2015 |
mRNA translational enhancers as a tool for plant gene engineering
Kochetov A.V., Filipenko E.A., Nikulin P.S
|
| 2013 |
Degrees of Freedom.
Ponomarenko M, Babenko V, Kochetov A, Kolchanov N
|
| 2010 |
Visualization and Analysis of Biological Networks combining Text Mining and Data Warehouse Approaches
Björn Sommer, Evgeny S. Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian J. Janowski, Timofey V. Ivanisenko, Anatoly O. Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel S. Demenkov, Alexey V. Kochetov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov and Ralf Hofestädt
|
| 2008 |
Компьютерная транскриптомика. Трансляция. В монографии «Системная Компьютерная Биология». Под ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А.
Кочетов А.В., Вишневский О.В., Волкова О.А., Владимиров Н.В., Лихошвай В.А. Матушкин Ю.Г., Григорович Д.А., Нишида Х., Сараи А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Пономаренко М.П., Титов И.И., Колчанов Н.А.
|
Конференции
| 2024 |
Использование геномного редактирования для улучшения сельскохозяйственных признаков культивируемых сортов пшеницы и ячменя
Киселёва А.А., Тимонова Е.М., Бережная А.А., Короткова А.М., Коложвари А.Э., Нестеров М.А., Кочетов А.В., Салина Е.А.
[XXIV Всероссийская молодежная научная конференция с международным участием «Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и сельскохозяйственной микробиологии»]
|
|
Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia
Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A.
[The 14th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2024)]
|
|
Assembly and Analysis of Plastomes for 30 Potato Cultivars Grown in Russia
Karetnikov D.I., Salina E.A., Kochetov A.V., Afonnikov D.A.
[The 14th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2024)]
|
|
Testing CAPS-markers designed on partially phased assembly of autotetraploid Solanum tuberosum genome
Larichev K., Sergeeva E., Karetnikov D., Afonnikov D., Salina E., Kochetov A.
[The 14th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2024)]
|
|
Изменение времени колошения мягкой пшеницы с помощью геномного редактирования — роль
сайтов связывания транскрипционных факторов СНЕ в промоторной области генов PPD‑1
А.А. Киселёва, Е.М. Тимонова, А.А. Бережная, А.Э. Коложвари, В.Н. Кельбин, А.В. Кочетов, Е.А. Салина
[INTERNATIONAL CONGRESS “VIII Congress of the Vavilov Society of Geneticists and Breeders, Dedicated to the 300th Anniversary of Russian Science and Higher Education”]
|
|
Эффективный способ трансформации ячменя с применением генов GRF4‑GIF1, кодирующих
регуляторы развития, для работ по редактированию генома возделываемых сортов
Е.М. Тимонова, А.А. Киселева, А.А. Бережная, М.А. Нестеров, А.М. Короткова, В.Н. Кельбин, А.В. Кочетов, Е.А. Салина
[INTERNATIONAL CONGRESS “VIII Congress of the Vavilov Society of Geneticists and Breeders, Dedicated to the 300th Anniversary of Russian Science and Higher Education”]
|
|
Исследование вариаций и структуры генома сортов картофеля Solanum tuberosum, выращиваемых в России
Д.И. Каретников, Г.В. Васильев, С.В. Тощаков, Н.А. Шмаков, М.А. Генаев, М.А. Нестеров, С.М. Ибрагимова, Д.А. Рыбаков, Т.А. Гавриленко, Е.А. Салина, М.В. Патрушев, А.В. Кочетов, Д.А. Афонников
[INTERNATIONAL CONGRESS “VIII Congress of the Vavilov Society of Geneticists and Breeders, Dedicated to the 300th Anniversary of Russian Science and Higher Education”]
|
|
Редактирование генома возделываемых сортов пшеницы и ячменя с использованием направленной нуклеазы Cas9 для улучшения сельскохозяйственных признаков
Киселёва А.А., Тимонова Е.М., Бережная А.А., Короткова А.М., Коложвари А.Э., Нестеров М.А.,
Кочетов А.В., Салина Е.А.
[7-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» (GPB 2024)]
|
| 2023 |
Analysis of the genome structure and its variations in potato cultivars grown in Russia
Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A.
[7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)]
|
|
Developing plasmid vectors with cultivar specific U6 promoter to enhance CRISPR/Cas9 genome editing efficiency in potato (Solanum tuberosum)
Larichev K.T., Sergeeva E.M., Karetnikov D.I., Afonnikov D.A., Salina E.A., Kochetov A.V.
[7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)]
|
|
Efficient CRISPR/Cas9-based genomic editing technique for Nud gene mutagenesis in commercial barley cultivar mediated by particle bombardment
Timonova E.M., Kiseleva A.A., Nesterov M.A., Sergeeva E.M., Filipenko E.A., Adonina I.G., Kochetov A.V., Salina E.A.
[7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)]
|
|
Modification of agricultural traits in cultivated varieties of barley and wheat
Timonova E.M., Kiseleva A.A., Berezhnaya A.A., Nesterov M.A., Adonina I.G., Kochetov A.V., Salina E.A.
[3rd International Conference “Genetically modified organism. The Нistory, Achievements, Social and Environmental Risks”]
|
|
Structural analysis of genes affecting the tuber starch content and properties in Russian potato varieties
Sergeeva E.M., Karetnikov D.I., Afonnikov D.A., Larichev K.T., Salina E.A., Kochetov A.V.
[7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)]
|
|
The study and modification of wheat heading and maturity genes using genome approaches including CRISPR/Cas9 gene editing technology
Kiseleva A.A., Timonova E.M., Berezhnaya A.A., Stasyuk A.I., Kolozhvari A.E., Nesterov M.A., Kelbin V.N., Leonova I.N., Kochetov A.V., Salina E.A.
[7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)]
|
|
НАПРАВЛЕНИЯ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ТЕХНОЛОГИЙ В СЕЛЕКЦИИ РАСТЕНИЙ: ОПЫТ КГЦ ИЦИГ СО РАН
Салина Е.А., Кочетов А.В.
[Международный форум природоподобных технологий. Курчатовский геномный форум 2023]
|
|
ОТ АНАЛИЗА СТРУКТУРЫ ГЕНОВ К ПОЛУЧЕНИЮ ЛИНИЙ КАРТОФЕЛЯ SOLANUM TUBEROSUM С ИЗМЕНЕННЫМИ СВОЙСТВАМИ КРАХМАЛА
Сергеева Е.М., Ларичев К.Т., Каретников Д.И., Афонников Д.А., Салина Е.А., Кочетов А.В.
[Международный форум природоподобных технологий. Курчатовский геномный форум 2023]
|
|
СОЗДАНИЕ ПЛАЗМИДНОГО
ВЕКТОРА С СОРТОСПЕЦИФИЧНЫМИ
ПРОМОТОРАМИ U6 ДЛЯ ГЕНОМНОГО
РЕДАКТИРОВАНИЯ РОССИЙСКИХ
СОРТОВ КАРТОФЕЛЯ (SOLANUM
TUBEROSUM)
Ларичев К.Т., Сергеева Е.М., Каретников Д.И.,
Афонников Д.А., Салина Е.А., Кочетов А.В.
[Международный конгресс "CRISPR-2023"]
|
| 2022 |
Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight
Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T.
[13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight
Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T.
[13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
A comprehensive study of genetic mechanisms of common wheat heading and maturity times
Antonina Kiseleva, Alina Berezhnaya, Anatoliy Stasyuk, Ekaterina Timonova, Anastasiya Kolozhvari,
Irina Leonova, Alexey Kochetov, Elena Salina
[2nd International Wheat Congress]
|
|
Development of CRISPR/Cas9-based genome editing constructs for Nevsky and Udacha potato cultivars
Larichev K., Sergeeva E., Karetnikov D., Salina E., Kochetov A.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference]
|
|
RECONSTRUCTION AND ANALYSIS OF PANGENOME OF SIBERIAN CULTIVARS OF POTATO SOLANUM TUBEROSUM
Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Shmakov N.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V.
[III Всероссийская конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике» (HSG-2022)]
|
|
Reconstruction and analysis of potato Solanum tuberosum pangenome of Siberian cultivars
Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V., Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference]
|
|
ПОЛУЧЕНИЕ НОВЫХ ГЕНОТИПОВ КАРТОФЕЛЯ С УСТОЙЧИВОСТЬЮ К ХОЛОДОВОМУ ОСАХАРИВАНИЮ
Егорова А.А., Герасимова С.В., Сабоиев И.А., Домрачев Д., Коэппель И., Хикель Ш., Хертиг К., Чамас С., Кумлен Й., Рогозина Е., Чалая Н., Салина Е.А., Кочетов А.В.
[XIX ВСЕРОССИЙСКАЯ МОЛОДЕЖНАЯ ШКОЛА-КОНФЕРЕНЦИЯ ПО АКТУАЛЬНЫМ ПРОБЛЕМАМ ХИМИИ И БИОЛОГИИ]
|
|
РЕКОНСТРУКЦИЯ И АНАЛИЗ ПАНГЕНОМА КАРТОФЕЛЯ SOLANUM TUBEROSUM СОРТОВ СИБИРСКОЙ СЕЛЕКЦИИ
Каретников Д.И., Генаев М.А., Нестеров М.А., Ибрагимова С.М., Васильев Г.В., Тощаков С.В., Гавриленко Т.А., Афонников Д.А., Салина Е.А., Патрушев М.В., Кочетов А.В.
[III Международная научно-практическая конференция "Клеточная биология и биотехнология растений"]
|
| 2021 |
Pan-transcriptomic analysis of Solanum tuberosum NLR genes regulating resistance to Phytophthora infestans
Shmakov N.A., Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Vasiliev G.V.
[PlantGen2021]
|
|
An integrated approach to study genetics of Triticum aestivum vegetation period
Kiseleva А.А., Stasyuk A.I., Bragina M.K., Berezhnaya A.A., Kolozhvari A.E., Leonova I.N., Kochetov A.V., Salina E.А.
[The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)]
|
|
Comparative assessment of sugar accumulation in commercial potato cultivars (Solanum tuberosum L.) for genome editing
Saboiev I., Ibragimova S., Egorova A., Salina E., Kochetov A.
[The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)]
|
|
Developing potato varieties with decreased cold-induced sweetening
Egorova A., Gerasimova S., Ibragimova S., Romanova A., Saboiev I., Domrachev D., Koeppel I., Hertig C., Hiekel S., Chamas S., Kumlehn J., Rogosina E., Chalaya N., Salina E., Kochetov A.
[The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)]
|
|
Regeneration capacity of potato cultivars prone to cold sweetening
Ibragimova S., Romanova A., Saboiev I., Salina E., Kochetov A.
[The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)]
|
|
The selection of efficient sgRNAs for CRISPR-Cas9 genome editing of potato (Solanum tuberosum L.) aimed to obtain the cultivars with low-amylose starch properties
Sergeeva E.M., Larichev K.T., Bragina M.K., Salina E.A., Kochetov A.V.
[The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)]
|
|
Разработка маркеров к генам биосинтеза крахмала картофеля Solanum tuberosum L.
Сергеева Е.М., Щербань А.Б., Куваева Д.Д., Афонников Д.А., Салина Е.А., Кочетов А.В.
[V Всероссийская конференция «Фундаментальная гликобиология»]
|
| 2020 |
Identification of an AP2/ERF Transcription Factor Controlling the Synthesis of Barley Epicuticular Wax
Ekaterina Kolosovskaya, Sophia Gerasimova, Anna Korotkova, Christian Hertig, Sergey Morozov, Elena Chernyak, Dmitriy Domrachev, Vikhorev Alexander, Nikolay Shmakov, Alexey Kochetov, Jochen Kumlehn, Elena Khlestkina
[12-ая Международная мультиконференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии / Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology, BGRS/SB-2020]
|
|
Идентификация регуляторного гена, контролирующего синтез кутикулярного воска ячменя
Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Короткова А.М., Хертиг К., Морозов С.В., Черняк Е.И., Домрачев Д.В., Кочетов А.В., Кумлен Й., Хлесткина Е.К.
[12-я Международная школа молодых ученых «Системная Биология и Биоинформатика» / 12th International young scientists school «System Biology and Bioinformatics», SBB-2020]
|
|
Направленный нокаут гена вакуолярной инвертазы Pain-1 в Solanum tuberosum L.
Егорова А.А., Герасимова С.В., Коэппель И., Хамаз С., Хикель Ш., Хертиг К.,
Ибрагимова С.М., Сабоиев И.А., Нестеров М.А., Кумлен Й., Салина Е.А., Кочетов А.В.
[SBB-2020]
|
| 2019 |
ALTERING PLANT DOMESTICATION TRAITS VIA SITE-DIRECTED GENOME MODIFICATION
Gerasimova S.V., Ivanova K.A., Hertig C., Korotkova A.M., Hiekel S., Kolosovskaya E., Koloshina K.A., Genaev M.A., Komyshev E.G., Egorova A.A., Domrachev D.V., Rogozina E.V., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.]
|
|
ANALYSIS OF BARLEY MUTANT POPULATIONS OBTAINED BY SIMULTANEOUS MUTAGENESIS AT FOUR GENOMIC LOCI
Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Hertig С., Korotkova A.M., Kukoeva T.V., Hiekel S., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K.
[VII International Congress of Vavilov society of geneticists and breeders and associate symposiums]
|
|
Decreasing wild potato toxicity by targeted modification of glycoalkaloid metabolism genes
Egorova A.A., Ivanova K.A., Domrachev D.V., Kochetov A.V., Khlestkina E.K., Gerasimova S.V.
[Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference 24-29 июня 2019 г., Новосибирск, Россия]
|
|
Identification and characterization of a barley gene controlling cuticle wax formation
Gerasimova S., Kolosovskaya E., Hertig C., Hiekel S., Korotkova A., Doroshkov A., Kukoeva T., Domrachev D., Kochetov A., Kumlehn J., Khlestkina E.
[Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
|
|
KNOCKOUT OF NICOTINE BIOSYNTHESIS GENES IN NICOTIANA TABACUM USING RNA-GUIDED CAS ENDONUCLEASE
Spaselnikova A.V., Egorova A.A., Tomilin M.A., Schedel S., Kumlehn J., Kochetov A.V., Gerasimova S.V.
[Международный конгресс "VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПБГУ, и ассоциированные симпозиумы"]
|
|
Targeted knockout of the PAIN-1 gene in Solanum tuberosum
Egorova A.A., Gerasimova S.V., Schedel S., Kumlehn J., Kochetov A.V.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.]
|
|
WildPetotaDB – a database for genotype and phenotype of wild tuber-bearing species of the genus Solanum L.
Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В.
[Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
|
|
Биоинформационный анализ путей регуляции экспрессии генов предрасположенности к аутизму
Клименко А.И., Трифонова Е.А., Лашин С.А., Кочетов А.В.
[Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»]
|
|
РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО
ФЕНОТИПИРОВАНИЯ РАСТЕНИЙ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ
Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы.]
|
| 2018 |
НОКАУТ КЛЮЧЕВЫХ ГЕНОВ БИОСИНТЕЗА НИКОТИНА N. TABACUM МЕТОДОМ РНК-НАПРАВЛЕННОГО МУТАГЕНЕЗА
Спасельникова А.В., Егорова А.А., Домрачев Д.В., Кочетов А.В., Герасимова С.В.
[XVIII научная конференция молодых ученых "Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии"]
|
|
Выбор целевых сайтов и направляющих РНК для нокаута генов Nud и Vrs1 ячменя при помощи РНК-направленной эндонуклеазы
Герасимова С.В., Хертиг К., Короткова А.М., Хикель С., Кумлен Й., Кочетов А.В., Хлесткина Е.К.
[Генофонд и селекция растений]
|
|
Altering Barley Agronomic Traits via Targeted Mutagenesis
Sophia V. Gerasimova, A.M. Korotkova, C. Hertig, I. Otto, S. Hiekel, J.Kumlehn, A.V. Kochetov, E.K. Khlestkina.
[BGRS-2018]
|
|
Genetic control of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in potato plants Solanum phureja
A.A.Egorova, N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya, K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov
["PLANT FUNCTIONING UNDER ENVIRONMENTAL STRESS" SEPTEMBER 12 - 15, 2018, CRACOW, POLAND.]
|
|
Genetic mechanisms of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in Solanum phureja
A.A. Egorova,
N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya,
K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology” – BGRS\SB-2018]
|
|
Анализ транскриптов, специфичных для линии картофеля, устойчивой к золотистой картофельной нематоде, из данных RNA-seq
Н.А. Шмаков, А.Ю. Глаголева, К.В. Стрыгина, А.В. Егорова, Д.А. Афонников, А.В. Кочетов
[Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля]
|
|
Гены, определяющие антоциановую пигментацию картофеля Solanum tuberosum L. как мишени для селекции сортов с высокой пищевой ценностью
К.В. Стрыгина, А.В. Кочетов, Е.К. Хлесткина
[Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля]
|
|
Изучение роли экстраклеточных рибонуклеаз в фитопатогенезе у растений на примере трансгенных
растений картофеля, несущих ген экстраклеточной рибонуклеазы цинии ZRNase.
С.М. Ибрагимова, Е.А. Трифонова, Е.А. Филипенко, А.В. Кочетов
[Механизмы устойчивости растений и микроорганизмов к неблагоприятным условиям среды.]
|
|
Использование промоторов генов картофеля для регуляции экспрессии целевых генов у трансгенных растений
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля]
|
|
НОКАУТ КЛЮЧЕВЫХ ГЕНОВ БИОСИНТЕЗА НИКОТИНА N. TABACUM МЕТОДОМ РНК-НАПРАВЛЕННОГО МУТАГЕНЕЗА
Спасельникова А.В., Егорова А.А., Кочетов А.В., Герасимова С.В.
[IV международная конференция «Генофонд и селекция растений» (4-6 апреля 2018 г., Новосибирск, россия ISBN 978-5-91291-034-0]
|
|
Перспективы использования сортов картофеля сибирской селекции в генно-инженерных работах.
С. М. Ибрагимова, А.В.Романова, Г.Х. Мызгина, А.В. Кочетов
[КПНИ ФАНО Росси, научная конференция «Развитие селекции и семеноводства картофеля» и научной конференции «Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля»]
|
|
Применение системы редактирования
генома Cas9/gRNA для доместикации
картофеля de novo
К.А. Иванова, С.В. Герасимова, А.А. Егорова,
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.В. Домрачев,
К.А. Колошина, А.В. Кочетов, Е.К. Хлесткина
[Crispr-2018]
|
|
РАЗРАБОТКА МЕТОДИК ФЕНОТИПИРОВАНИЯ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ
КОЛОШИНА К.А., ИВАНОВА К.А., КОМЫШЕВ Е.Г., ГЕНАЕВ М.А., КОЧЕТОВ А.В., ГЕРАСИМОВА С.В.
["ДЕНЬ ПОЛЯ" В РАМКАХ КПНИ ФАНО РОССИИ "РАЗВИТИЕ СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВА КАРТОФЕЛЯ" И НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ И ПРИКЛАДНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ В СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВЕ КАРТОФЕЛЯ"]
|
|
Разработка ДНК-маркеров для селекции картофеля Solanum tuberosum L. с высокой пищевой ценностью
К.В. Стрыгина, Л.М. Гвоздева, В.К. Хлесткин, А.В. Кочетов, Е.К. Хлесткина
[Международной научно-практической конференции «Состояние, проблемы и перспективы картофелеводства ХХІ века (90 лет научному картофелеводству Беларуси)»]
|
| 2017 |
Analysis of genes determining anthocyanin pigmentation in potato
Ksenia V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Alexey V. Kochetov
[The 14th Japan Solanaceae Consortium JSOL2017]
|
|
CRISPR/Cas FOR PLANT DOMESTICATION AND BREEDING
KHLESTKINA E.K., KOROTKOVA A.M., GERASIMOVA S.V., IVANOVA K.A., KOCHETOV A.V., SHUMNY V.K.
[Международная конференция, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева.]
|
|
ГЕНЫ SP И SGT ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ КАК МИШЕНИ ДЛЯ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ С ЦЕЛЬЮ ДОМЕСТИКАЦИИ DE NOVO
Иванова К.А., Герасимова С.В., Кочетов А.В., Рогозина Е.В., Киру С.Д., Хлесткина Е.К.
[IV ВАВИЛОВСКАЯ МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ИДЕИ Н. И. ВАВИЛОВА В СОВРЕМЕННОМ МИРЕ"]
|
|
Диагностические ДНК маркеры хозяйственно-ценных генов для инвентаризации сортов и гибридов картофеля
Тоцкий Игорь, Сафонова Анна Дмитриевна, Стрыгина Ксения Владимировна, Полухин Николай Иванович, Хлесткина Елена Константиновна, Кочетов Алексей Владимирович
[III МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ГЕНОФОНД И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ», ПОСВЯЩЕННАЯ 130-ЛЕТИЮ Н.И. ВАВИЛОВА (28.03. – 30.03.2017)]
|
|
Механизмы устойчивости пшеницы к патогенным грибам
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Беляевские чтения: Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева (7-10 августа 2017 г., Новосибирск, Россия)]
|
|
Создание базы данных и реконструкция генной сети ответа пшеницы на патогенную инфекцию
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Генофонд и селекция растений, 3-я Международная конференция, посвященная 130-летию Н.И. Вавилова]
|
|
ТРАНСГЕННЫЕ РАСТЕНИЯ КАРТОФЕЛЯ, НЕСУЩИЕ ГЕН ЭКСТРАКЛЕТОЧНОЙ РИБОНУКЛЕАЗЫ ЦИНИИ (ZRNaseII), КАК МОДЕЛЬ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОНТРОЛЯ УСТОЙЧИВОСТИ К ФИТОПАТОГЕНАМ
С.М. Ибрагимова, Е.А. Трифонова, Е.А. Филипенко, А.В. Кочетов
[«Беляевские чтения»: Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева.]
|
| 2016 |
Доклад по проекту СБИ «Селекционный центр». Заседание рабочей группы представителей территорий - участников программы «Сибирская биотехнологическая инициатива» (СБИ)
Колчанов Николай Александрович, Лаврюшев Сергей Вячеславович, Кочетов Алексей Владимирович
[Площадка открытых коммуникаций OPENBIO 2016 – комплекс мероприятий, посвященных коммерциализации идей и развитию бизнеса в сфере наук о жизни. Форум для бизнеса, науки, власти и инфраструктуры]
|
|
ALTORFEV: A NOVEL TOOL FOR PREDICTION OF ALTERNATIVE ORFS BASED ON THE LINEAR SCANNING MODEL
B.S. Zuraev, A.V. Kochetov, A.I. Klimenko, S.A. Lashin
[The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
Knockout of Nud and Vrs genes in barley using CRISPR/Cas system
Gerasimova S.V., Kochetov A.V., Khlestkina E.K.
[The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)]
|
|
Reconstruction of the gene network of the wheat response to fungal pathogens
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)]
|
|
The plant δOAT gene is active in proliferating tissues
Egorova A.A., Kochetov A.V., Gerasimova S.V.
[The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)]
|
|
База данных генов устойчивости пшеницы к патогенным грибам
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Всероссийская конференция с международным участием «50 лет ВОГиС: успехи и перспективы»]
|
|
Состояние и перспективы использования маркёр-ориентированной и геномной селекции растений
Н.А. Колчанов, А.В. Кочетов, Е.А. Салина, Л.А. Першина, Е.К. Хлесткина, В.К. Шумный
[Научная сессия общего собрания членов РАН на тему: «Генетические ресурсы растений, животных и микроорганизмов на службе человечества»]
|
| 2015 |
Plant promoters for specific transgene expression in tomato
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology” PlantGen 2015]
|
| 2013 |
Computer analysis of transcription factor binding sites in genome scale based on ChIP-seq data
Yuriy L. Orlov, Vladimir A. Ivanisenko, Alexey V. Kochetov, Nikolay A. Kolchanov
[German-Russian Forum Biotechnology, Rostock 2013]
|
|
Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней Arabidopsis thaliana L.
Миронова В.В., Кузнецова Л.С., Филипенко Е.А., Климова Н.В., Васильев Г.В., Кочетов А.В.
[International Conference ” High-Throughput Sequencing in Genomics”]
|
|
База данных БВИР-интернет ресурс для поддержки и планирования экспериментов по трансгенезу растений.
Ибрагимова С.М., Смирнова О.Г., Рассказов Д. А., Кочетов А.В.
[Инновационные направления современной физиологии растений]
|
|
Генно-инженерный подход к решению проблемы устойчивости растений к абиотическому стрессу.
Ибрагимова С.М., Кочетов А.В.
[X Международная конференция «Биология клеток растений in vitro и биотехнология»]
|
|
Использование информационного ресурса TGP для создания генетических конструкций с чувствительными к солевому стрессу промоторами
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Конференция ВОГиС «Проблемы генетики и селекции»]
|
| 2012 |
THE MODEL FOR AUXIN REGULATED AtPIN1 EXPRESSION IN THE ROOT APICAL MERISTEM
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, С.С. Сангаев, Н.А. Омельянчук, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[The 2nd International Conference "Plant Genetics, Genomics and Biotechnology"]
|
|
THE ROLE OF EXTRACELLULAR NUCLEASES AND RNA-BINDING ACTIVITY IN THE RESISTANCE OF HIGHER PLANTS TO PHYTOPATHOGENS
E.A. Trifonova, A.V. Savelyeva, A.V. Romanova, E.A. Filipenko, M.V. Sapotsky, V.I. Malinovsky, A.V. Kochetov
[2nd International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”]
|
|
Быстрый поиск промоторов растений для трансгенеза
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[IV Всероссийский симпозиум "ТРАНСГЕННЫЕ РАСТЕНИЯ: технология создания, биологические свойства, применение, биобезопасность"]
|
|
Исследование регуляторных районов PIN1 гена Arabidopsis thaliana L. (Study of PIN1 regulatory regions in Arabidopsis thaliana L.
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, И.В. Миронова, С.С. Сангаев, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[II (X) Международная Ботаническая Конференция молодых ученых в Санкт-Петербурге, 11-16 ноября 2012 года]
|
|
РОЛЬ РНК-СВЯЗЫВАЮЩЕЙ И ГИДРОЛИТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЕЙ В УСТОЙЧИВОСТИ РАСТЕНИЙ К ФИТОПАТОГЕНАМ
Трифонова Е.А., Романова А.В., Филипенко Е.А., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В.
[Научное наследие Н.И. Вавилова и современность]
|
| 2011 |
Computational genomics: looking for new knowledge in old data
Kochetov A.V.
[German/Russian Workshop on Integrative Biological Pathway Analysis and Simulation]
|
|
The mRNA characteristics potentially involved in recognition of non-AUG start codons in yeast mRNAs.
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 11)]
|
|
VISUALIZATION AND ANALYSIS OF A CARDIO VASCULAR DISEASE-RELATED BIOLOGICAL NETWORK COMBINING TEXT MINING AND DATA WAREHOUSE APPROACHES
Ralf Hofestädt, Björn Sommer, Evgeny Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian Janowski, Timofey Ivanisenko, Anatoly Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel Demenkov, Alexey Kochetov, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology 2011]
|
|
Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches
Hofestädt R., Sommer B., Tiys E.S., Kormeier B., Hippe K., Janowski S.J., Ivanisenko T.V., Bragin F.O., Arrigo P., Demenkov P.S., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A.
[International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 11)]
|
|
Wheat promoter sequences for transgene expression.
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[The International Conference Wheat Genetic Resources and Genomics (WGRG 2011)]
|
|
Супрессия активности гена пролиндегидрогеназы повышает неспецифическую устойчивость растений к абиотическим стрессам.
Колодяжная Я.С., Коваль В.С., Романова А.В., Титов С.Е., Кочетов А.К
[2-й Всероссийский симпозиум "Физиология трансгенного растения и проблемы биобезопасности", Москва.]
|
| 2010 |
A database of plant promoters for transgenesis.
Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В.
[International Conference Plant Genetics, Genomics and Biotechnology]
|
|
Computational genomics: searching for new proteome components
Kochetov A.V.
[Joint Indo-Russian Workshop "Predictive Biology using Systems and Integrative analysis and Methods", November 15-19, 2010, p 8-9, Chandigarh, India]
|
|
The physiological role of deltaOAT gene in plant development and stress response
Gerasimova S.V., Gorelova V.V., Romanova A.V., Koval V.S., Kochetov A.V.
[Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk]
|
|
The role of dsRNA binding and hydrolytic activities in the virus-resistance of higher plants
Trifonova E.A., Saveleva A.V., Romanova A.V., Sangaev S.S., Kochetov A.V.
[Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk]
|
| 2009 |
Interrelation between the translation initiation signal and the N-end of encoded protein in human mRNAs
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow]
|
|
TGP (Transgene Promoters): a database of biotechnologically important plant gene promoters.
Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В.
[The 5th German-Russian Forum Biotechnology]
|
|
Трансгенные растения рапса и редьки масличной с повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам
Сютикова О.С., Любинская А.В., Левенко Б.А., Рахметов Д.Б., Кочетов А.В.
[Мат. 5 Межд. Конгр. "Биотехнология:состояние и перспективы развития"]
|
| 2008 |
ANDCell: a tool for automated knowledge extraction from PubMed and reconstruction of association networks
Ivanisenko V.A., Yarkova E.E., Demenkov P.S., Kochetov A.V.
[Proceedings of the 5th International Symposium on Integrative Bioinformatics. P 327, 20-22 August 2008, Germany]
|
|
Генетически модифицированные растения картофеля (Solanum tuberosum L.), характеризующиеся повышенной устойчивостью к засолению
Кирсанова С.Н., Колодяжная Я.С., Кочетов А.В.
[Нанотехнологии в сельском хозяйстве. РГАУ-МСХА, Москва, 9-11 декабря 2008]
|
|
Генетически модифицированные растения табака с пониженной активностью пролиндегидрогеназы характеризуются повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам
Колодяжная Я.С., Левенко Б.А., Кочетов А.В.
[Тез. IX Междун. конференции "Биология клеток растений in vitro и биотехнология", Звенигород]
|
|
Получение и анализ трансгенных растений, несущих ген пирролин-5-карбоксилатсинтeтазы Medicago truncatula
Сютикова О.С., Рахметов Д.Б., Кочетов А.В., Левенко Б.А.
[Тез. IX Междун. конференции "Биология клеток растений in vitro и биотехнология", Звенигород]
|
| 2007 |
Signals influencing general translational efficiency of eukaryotic mRNAs
Ivanisenko VA, Mischenko EL, Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Titov I.I., Kolchanov N.A., Sarai A.
[3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007". July 27-31, 2007, Moscow, Russia]
|
|
Перспективы получения ГМ растений картофеля, несущих антисмысловой супрессор гена пролиндегидрогеназы и обладающих повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам
Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Кочетов А.В
[Международная научно-практическая конференция "Картофелеводство XXI века: проблемы и решения", 10-12 июля, Минск]
|
|
Повышенная устойчивость трансгенных растений табака, экспрессирующих ген панкреатической рибонуклеазы быка, к вирусу табачной мозаики
Трифонова Е.А., Сапоцкий М.В., Комарова М.Л., Кочетов А.В., Малиновский В.И.
[Материалы Международной конференции "Современная физиология растений: от молекул до экосистем" Сыктывкар]
|
|
Супрессия активности гена пролиндегидрогеназы повышает неспецифическую устойчивость растений к абиотическим стрессам
Колодяжная Я.С., Коваль В.С., Романова А.В., Титов С.Е., Кочетов А.К.
[2-й Всероссийский симпозиум "Физиология трансгенного растения и проблемы биобезопасности" (Москва 22-25 октября 2007 г.)]
|
|
Трансгенные растения табака, экспрессирующие гены экстраклеточных рибонуклеаз, как модель для изучения молекулярных механизмов неспецифической устойчивости растений к падля изучения молекулярных механизмов неспецифической устойчивости растений к патогенам
Трифонова Е.А., Сапоцкий М.В., Романова А.В., Сангаев С.С., Малиновский В.И., Кочетов А.В
[Всероссийская научная конференция "Устойчивость растений к неблагоприятным факторам внешней среды". Иркутск]
|
| 2006 |
Alternative coding potential of mammalian mRNAs
Kochetov A.V.
[Conf. on Translational Control and Non-coding RNA. Nove Hrad, Czech Rep., Nov. 8-12]
|
|
Distant education and collaborative projects: the Network www-site
Kochetov A.V.
[4th Meeting of German/Russian Virtual Network of Bioinformatics. Bielefeld, Germany, October 9-10]
|
|
TGP (Transgene Promoters): a database of biotechnologically important plant gene promoters.
Smirnova O.G., Ibragimova S.S., Grigorovich D.A., Kochetоv A.V.
[The 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)]
|
|
The contribution of alternative translation start sites to human protein diversity
Kochetov A.V., Sarai A., Kolchanov N.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
The role of alternative translation start sites in generation of eukaryotic protein diversity
Kochetov A.V.
[8th International Engelhardt Conference on Mollecular Biology "RNA-protein interactions", Moscow, August 19-24]
|
|
Компьютерные подходы к исследованию влияния полиморфизмов на экспрессию генов и функцию белков.
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Кочетов А.В., Игнатьева Е.В., Пономаренко М.П., Орлова Г.В., Меркулова Т.И., Ощепков Д.Ю., Аман Е.Э., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Деменков П.С., Пинтус С.С., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Турнаев И.И., Апасьева Н.В., Губина М.А., Ромащенко А.Г.
[International conference “Basic Science for Biotechnology and Medicine” September 3-7, 2006, Novosibirsk. Russia.]
|
Гранты
| 2017 |
Комплексный план научных исследований «Развитие селекции и семеноводства картофеля»
А.В. Кочетов, Е.А. Токпанов, Е.К. Хлесткина, Д.А. Афонников, В.А. Иванисенко, Н.И. Полухин, В.К. Хлесткин, О.Г. Смирнова, Т.Ф. Чалкова
|
| 2014 |
Идентификация и маркирование новых генов устойчивости к листовой ржавчине пшеницы
Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Леонова И.Н.
|
| 2010 |
Молекулярные механизмы стресс-специфического контроля экспрессии генов животных
Дымшиц Г.М., Меркулова Т.И., Раушенбах И.Ю., Кочетов А.В., Грунтенко Н.Е., Попова Н.А., Адоньева Н.В., Васильев Г.В., Левицкий В.Г., Вишневский О.В., Антонцева Е.В., Пахарукова М.Ю., Карпова Е.К., Богомолова Е.В., Иванов М.К., Федосеева Л.А., Ощепков Д.Ю., Шарипов Р.Н., Глушков С.А., Ведерников В.Е., Брызгалов Л.О., Климова Н.В., Сангаев С.С., Волкова О.А., Ершов Н.И., Герасимова С.В., Брагин А.Г., Прасолова М.А., Рязанова М.А., Прокопьев Р.А., Горелова В.В., Савельева А.В., Попов Е.Г., Шевелев О.Б., Климов Л.О.
|
|
Исследование роли экстраклеточных рибонуклеаз в механизме вирусоустойчивости растений
Кочетов Алексей Владимирович Волкова Оксана Анатольевна Сангаев Содном Сергеевич Трифонова Екатерина Александровна Ибрагимова Салмаз Магомедсаидовна
|
| 2009 |
Разработка программно-информационного комплекса для исследования механизмов регуляции экспрессии генов эукариот
Кочетов А.В., Подколодный Н. Л., Игнатьева Е. В., Подколодная О. А., Ананько Е. А., Рассказов Д. А., Подколодная Н. Н., Волкова О. А.
|
| 2006 |
Хромосомная и генетическая инженерия как метод изучения генома и экспрессии генов у растений
Дейнеко Елена Викторовна Першина Лидия Александровна Салина Елена Артемовна Кочетов Алексей Владимирович Загорская Алла Алексеевна Сидорчук Юрий Владимирович Пермякова Наталья Владиславовна Маренкова Татьяна Владиславовна Филипенко Елена Анатольевна Щапов Николай Семенович Щапова Антонина Ивановна Леонова Ирина Николаевна Трифонова Екатерина Александровна Хлесткина Елена Константиновна Добровольская Оксана Борисовна Бильданова Лариса Леонидовна Трубачеева Наталия Викторовна Ефремова Татьяна Тимофеевна Лайкова Людмила Ивановна Силкова Ольга Геннадьевна Адонина Ирина Григорьевна
|
Научное руководство
| 2019 |
Поиск новых чувствительных к ауксину регуляторных элементов в промоторах генов Arabidopsis thaliana L.
д.б.н., Кочетов Алексей Владимирович, к.б.н. Миронова Виктория Владимировна
[Новикова Дарья Дмитриевна]
|
| 2012 |
Трансляционно-значимые характеристики 5’-нетранслируемых районов мРНК эукариотических генов
Кочетов А.В.
[Волкова Оксана Анатольевна]
|
|
Исследование роли гена орнитинаминотрансферазы в развитии и стрессоустойчивости растений
Кочетов А.В.
[Герасимова Софья Викторовна]
|
| 2010 |
Изучение роли экстраклеточных рибонуклеаз на модели трансгенных растений табака (Nicotiana tabacum L.)
Кочетов А.В.
[Сангаев Содном Сергеевич]
|
Учебные курсы
| 2015 |
Генетика
Хлесткина Е.К., Кочетов А.В., Баттулин Н.Р., Пилипенко А.С., Шеховцов С.В.
|
| 2011 |
практикум по генной инженерии
|
| 2003 |
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем II: регуляторные геномные последовательности (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
|
Патенты
| 2016 |
Гены устойчивости к грибным патогенам (ГУГП)/ Pathogenesis-Related Genes (PRG)
Смирнова О.Г., Кочетов А.В., Рассказов Д.А.
|
| 2015 |
Программный комплекс для предсказания потенциально транслируемых открытых рамок считывания «AUGWeb»/ Software package for prediction of efficiently translated hidden alternative open reading frames «AUGWeb»
Лашин С.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Зураев Б.С., Клименко А.И.
|
| 2012 |
База данных "Внешние информационные ресурсы" (ВИР)/ DATABASE "External Information Resources" (EIR)
Ибрагимова Салмаз
|
|
База данных «Трансляционные сигналы» (ТРАНСИГ)/ Database «TRANslational SIGnals» (TRANSIG)
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
|
| 2010 |
Рекомбинантная плазмида, обеспечивающая экспрессию гена экстраклеточной рибонуклеазы Zinnia elegans в трансгенных растениях (варианты), и способ получения вирусоустойчивых форм растений
145. Трифонова Е.А., Сангаев С.С., Романова А.В., Кочетов А.В., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Шумный В.К.
|
| 2007 |
Способ получения трансгенных растений, устойчивых к вирусной инфекции
Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Комарова М.Л., Шумный В.К., Малиновский В.И., Сапоцкий М.В.
|
|
База данных: Трансген-Промотор (TGProm)
Смирнова О.Г., Ибрагимова С.М., Кочетов А.В., Григорович Д.А., Колчанов Н.А.
|
Диссертации
| 2013 |
Структурно-функциональная организация района инициации трансляции в мРНК эукариотических генов
[Доктор]
|
|
|
