 |
|
|
Колчанов Николай Александрович, д. б. н.
|
Персональная информацияСтепень, звание: академик РАН, доктор биологических наук, профессор
Должность по месту работы:научный руководитель Федерального исследовательского центра Институт цитологии и генетики СО РАН, заведующий Отделом системной биологии ИЦиГ СО РАН
Должность в НГУ: заведующий кафедрой информационной биологии ФЕН, профессор кафедр информационной биологии, цитологии и генетики
Адрес: Новосибирск-90, пр. акад. Лаврентьева д. 10, ИЦиГ СО РАН;
Идентификаторы: ScopusID; ORCID
Основные научные интересы: информационная биология, молекулярная биология, молекулярная генетика, компьютерный анализ структурно-функциональной организации и эволюции геномов, генетических макромолекул - ДНК, РНК и белков и молекулярно-генетических систем геномов.
Основные научные результаты. Созданы программно-информационные комплексы для решения задач биоинформатики и системной компьютерной биологии: интеграции, хранения и анализа экспериментальных данных по структурно-функциональной организации молекулярно-генетических систем; анализа и компьютерной аннотации геномных последовательностей, высокоточного распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов; предсказания структуры и функции белков, поиска в них фармакологических мишеней; реконструкции и моделирования генных сетей, контролирующих процессы метаболизма в клетке и процессы морфогенеза растений; исследованы молекулярные механизмы функционирования и эволюции регуляторных генетических систем и мутационного процесса; разработаны компьютерно-экспериментальные подходы к конструированию геносенсоров, позиционируемых в микро/нанофлюидных системах, создаваемых на основе лигатехнологий с использованием синхротронного излучения. Исследовано применение терагерцового излучения для перехода ДНК и белков в форме наночастиц в аэрозольную фазу.
Публикации: Автор и соавтор более чем 640 публикаций в отечественной и зарубежной печати, в том числе - 9 монографий, 4 учебных пособия, 18 авторских свидетельств и 8 патентов.
Н.А. Колчанов является:
- членом Совета по грантам Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых российских ученых и по государственной поддержке ведущих научных школ Российской Федерации
- вице-президентом Центрального Совета Вавиловского общества генетиков и селекционеров
- членом Совета Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ)
- заместителем председателя Научного совета РАН по генетике и селекции
- заместителем председателя Научного совета РАН по математической биологии и биоинформатике
- председателем Научного совета СО РАН по биоинформатике
- членом Научного совета РАН по молекулярной биологии и генетике
- членом Бюро Объединенного ученого совета по биологическим наукам СО РАН
- членом Научного экспертного совета при Правительстве Новосибирской области
- председателем Ученого Совета ИЦиГ СО РАН
- заместителем председателя Диссертационного Совета ИЦиГ СО РАН по защитам кандидатских и докторских диссертаций
- членом Ученых советов ФЕН НГУ и Медико-биологического факультета НГУ
- членом редколлегий журналов «Генетика», «Сибирский экологический журнал», «Экологическая генетика», «Вавиловский журнал генетики и селекции» (зам. главного редактора).
Публикации
| 2024 |
AI-Assisted Identification of Primary and Secondary Metabolomic Markers for Postoperative Delirium
Ivanisenko VA, Rogachev AD, Makarova A-LA, Basov NV, Gaisler EV, Kuzmicheva IN, Demenkov PS, Venzel AS, Ivanisenko TV, Antropova EA, Kolchanov NA, Plesko VV, Moroz GB, Lomivorotov VV, Pokrovsky AG
[INT J MOL SCI]
|
|
Production of GcMAF with anti-inflammatory properties and its effect on models of induced arthritis in mice and cystitis in rats
Kirikovich SS, Levites EV, Proskurina AS, Ritter GS, Dolgova EV, Ruzanova VS, Oshihmina SG, Snegireva JS, Gamaley SG, Sysoeva GM, Danilenko ED, Taranov OS, Ostanin AA, Chernykh ER, Kolchanov NA, Bogachev SS
[CURR ISSUES MOL BIOL]
|
|
Stimulation of mouse hematopoietic stem cells by angiogenin and DNA preparations
Potter EA, Dolgova EV, Proskurina AS, Ruzanova VS, Efremov YR, Kirikovich SS, Oshikhmina SG, Mamaev AL, Taranov OS, Bryukhovetskiy AS, Grivtsova LU, Kolchanov NA, Ostanin AA, Chernykh ER, Bogachev SS
[BRAZ J MED BIOL RES]
|
|
Концепция природной реконструкции генома. Часть 1. Основные положения концепции природной реконструкции генома. Изменение генома гемопоэтических стволовых клеток с использованием нескольких природных клеточных механизмов, имманентно присущих гемопоэтической стволовой клетке и определяющих ее биологический статус как «источник репаративного потенциала организма»
Якубов Л.А., Таранов О.С., Сидоров С.В., Никонов С.Д., Останин А.А., Черных Е.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Концепция природной реконструкции генома. Часть 2. Влияние фрагментов экстраклеточной двуцепочечной ДНК на гемопоэтические стволовые клетки
Рузанова В.С., Ошихмина С.Г., Проскурина А.С., Риттер Г.С., Кирикович С.С., Левитес Е.В., Ефремов Я.Р., Карамышева Т.В., Мещанинова М.И., Мамаев А.Л., Таранов О.С., Богачев А.С., Сидоров С.В., Никонов С.Д., Леплина О.Ю., Останин А.А., Черных Е.Р., Колчанов Н.А., Долгова Е.В., Богачев С.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2023 |
Candidate SNP markers significantly altering the affinity of TATA-binding protein for the promoters of human hub genes for atherogenesis, atherosclerosis and atheroprotection.
Bogomolov A, Filonov S, Chadaeva I, Rasskazov D, Khandaev B, Zolotareva K, Kazachek A, Oshchepkov D, Ivanisenko VA, Demenkov P, Podkolodnyy N, Kondratyuk E, Ponomarenko P, Podkolodnaya O, Mustafin Z, Savinkova L, Kolchanov N, Tverdokhleb N, Ponomarenko M.
[INT J MOL SCI]
|
|
Differentially expressed genes and molecular susceptibility to human age-related diseases
Shikhevich S, Chadaeva I, Khandaev B, Kozhemyakina R, Zolotareva K, Kazachek A, Oshchepkov D, Bogomolov A, Klimova NV, Ivanisenko VA, Demenkov P, Mustafin Z, Markel A, Savinkova L, Kolchanov NA, Kozlov V, Ponomarenko M
[INT J MOL SCI]
|
|
Evolution of human genes encoding cell surface receptors involved in the regulation of appetite: an analysis based on the phylostratigraphic age and divergence indexes
Ignatieva E.V., Lashin S.A., Mustafin Z.S., Kolchanov N.A.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Gene networks for use in metabolomic data analysis of blood plasma from patients with postoperative delirium
Ivanisenko V.A., Basov N.V., Makarova A.A., Venzel A.S., Rogachev A.D., Demenkov P.S., Ivanisenko T.V., Kleshchev M.A., Gaisler E.V., Moroz G.B., Plesko V.V., Sotnikova Y.S., Patrushev Y.V., Lomivorotov V.V., Kolchanov N.A., Pokrovsky A.G.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Impact of Double-Stranded RNA Internalization on Hematopoietic Progenitors and Krebs-2 Cells and Mechanism
Ritter GS, Proskurina AS, Meschaninova MI, Potter EA, Petrova DD, Ruzanova VS, Dolgova EV, Kirikovich SS, Levites EV, Efremov YR, Nikolin VP, Popova NA, Venyaminova AG, Taranov OS, Ostanin AA, Chernykh ER, Kolchanov NA, Bogachev SS.
[INT J MOL SCI]
|
|
On the Role of TATA Boxes and TATA-Binding Protein in Arabidopsis thaliana
L. K. Savinkova, E. B. Sharypova and N. A. Kolchanov
[Plants]
|
|
Reconstruction of the regulatory hypermethylation network controlling hepatocellular carcinoma development during hepatitis C viral infection
Evgeniya A. Antropova, Tamara M. Khlebodarova, Pavel S. Demenkov, Anastasiia R.
Volianskaia, Artur S. Venzel, Nikita V. Ivanisenko, Alexandr D. Gavrilenko, Timofey V.
Ivanisenko, Anna V. Adamovskaya, Polina M. Revva, Nikolay A. Kolchanov, Inna N. Lavrik
and Vladimir A. Ivanisenko
[J INTEGR BIOINFORM]
|
|
The Molecular Aspects of Functional Activity of Macrophage-Activating Factor GcMAF
Kirikovich SS, Levites EV, Proskurina AS, Ritter GS, Peltek SE, Vasilieva AR, Ruzanova VS, Dolgova EV, Oshihmina SG, Sysoev AV, Koleno DI, Danilenko ED, Taranov OS, Ostanin AA, Chernykh ER, Kolchanov NA, Bogachev SS
[INT J MOL SCI]
|
|
Анализ особенностей эволюции генов рецепторов клеточной поверхности человека, участвующих в регуляции аппетита, на основе индексов филостратиграфического возраста и микроэволюционной изменчивости
Игнатьева Е.В., Лашин С.А., Мустафин З.С., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Молекулярные механизмы оптимизации элонгации трансляции существенно различаются у бактерий, имеющих и не имеющих кластеры генов биосинтеза нерибосомных пептидов
А. И. Клименко, С. А. Лашин, Н. А. Колчанов, Д. А. Афонников, Ю. Г. Матушкин
[Молекулярная биология]
|
|
Развитие сибирской школы
математической (системной) биологии
Н.А. Колчанов, С.А. Лашин, Ф.В. Казанцев, Ю.Г. Матушкин
[Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции]
|
|
Реконструкция и анализ регуляторной генной сети функционирования клеточной стенки листьев Arabidopsis thaliana L. при ответе на водный дефицит
A.R. Volyanskaya, E.A. Antropova, U.S. Zubairova, P.S. Demenkov, A.S. Venzel, Y.L. Orlov, A.A. Makarova,
T.V. Ivanisenko, T.A. Gorshkova, A.R. Aglyamova, N.A. Kolchanov, M. Chen, V.A. Ivanisenko
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2022 |
Algorithm for the Reconstruction of Mathematical Frame
Models of Bacterial Transcription Regulation
Tatiana N. Lakhova, Fedor V. Kazantsev, Aleksey M. Mukhin, Nikolay A. Kolchanov, Yury G. Matushkin, Sergey A. Lashin
[Mathematics]
|
|
Changes in the number and morphology of blood cells in mice pretreated with RNA preparations and exposed to 8 Gy of gamma radiation
Dubatolova TD, Ritter GS, Proskurina AS, Kisaretova PE, Nikolin VP, Popova NA, Ruzanova VS, Taranov OS, Kolchanov NA, Bogachev SS
[International Journal of Radiation Research]
|
|
Plant_SNP_TATA_Z-tester: a Web service that unequivocally estimates the impact of proximal promoter mutations on plant gene expression
Rasskazov D, Chadaeva I, Sharypova E, Zolotareva K, Khandaev B, Ponomarenko P, Podkolodnyy N, Tverdokhleb N, Vishnevsky O, Bogomolov A, Podkolodnaya O, Savinkova L, Zemlyanskaya E, Golubyatnikov V, Kolchanov N, Ponomarenko M.
[INT J MOL SCI]
|
|
Plasma metabolomics and gene regulatory networks analysis reveal the role of nonstructural SARS-CoV-2 viral proteins in metabolic dysregulation in COVID-19 patients
V. A. Ivanisenko, E. V. Gaisler, N. V. Basov, A. D. Rogachev, S. V. Cheresiz, T. V. Ivanisenko, P. S. Demenkov, E. L. Mishchenko, O. P. Khripko, Yu. I. Khripko, S. M. Voevoda, T. N. Karpenko, A. J. Velichko, M. I. Voevoda, N. A. Kolchanov, A. G. Pokrovsky
[SCI REP-UK]
|
|
Rational metabolic engineering of Corynebacterium glutamicum to create a producer of L-valine.
Sheremetieva M.E., Anufriev K.E., Khlebodarova T.M., Kolchanov N.A., Yanenko A.S.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Stress reactivity, susceptibility to hypertension, and differential expression of genes in hypertensive compared to normotensive patients
Oshchepkov D, Chadaeva I, Kozhemyakina R, Zolotareva K, Khandaev B, Sharypova E, Ponomarenko P, Bogomolov A, Klimova NV, Shikhevich S, Redina O, Kolosova NG, Nazarenko M, Kolchanov NA, Markel A, Ponomarenko M.
[INT J MOL SCI]
|
|
The New General Biological Property of Stem-like Tumor Cells (Part II: Surface Molecules, Which Belongs to Distinctive Groups with Particular Functions, Form a Unique Pattern Characteristic of a Certain Type of Tumor Stem-like Cells)
Petrova DD, Dolgova EV, Proskurina AS, Ritter GS, Ruzanova VS, Efremov YR, Potter EA, Kirikovich SS, Levites EV, Taranov OS, Ostanin AA, Chernykh ER, Kolchanov NA, Bogachev SS
[INT J MOL SCI]
|
|
The New Version of the ANDDigest Tool with Improved AI-Based Short Names Recognition
Timofey V. Ivanisenko, Pavel S. Demenkov, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko
[INT J MOL SCI]
|
|
The new general biological property of stem-like tumor cells Part I. Peculiarities of the process of the double-stranded DNA fragments internalization into stem-like tumor cells
Ritter GS, Dolgova EV, Petrova DD, Efremov YR, Proskurina AS, Potter EA, Ruzanova VS, Kirikovich SS, Levites EV, Taranov OS, Ostanin AA, Chernykh ER, Kolchanov NA, Bogachev SS
[Frontiers in Genetics]
|
|
Рациональная метаболическая инженерия Corynebacterium glutamicum для продукции L-валина.
Шереметьева М.Е., Ануфриев К.Э., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А., Яненко А.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Технология лечения злокачественных новообразований «Каранахан»
Колчанов Н.А., Богачев С.С., Долгова Е.В., Поттер Е.А., Проскурина А.С., Черных Е.Р., Останин А.А., Таранов О.С., Сидоров С.В.
[Наука и Технологии Сибири]
|
| 2021 |
A bioinformatics model of human diseases on the basis of differentially expressed genes (of domestic versus wild animals) that are orthologs of human genes associated with reproductive-potential changes.
Vasiliev G, Chadaeva I, Rasskazov D, Ponomarenko P, Sharypova E, Drachkova I, Bogomolov A, Savinkova L, Ponomarenko M, Kolchanov N, Osadchuk A, Oshchepkov D, Osadchuk L.
[INT J MOL SCI]
|
|
Disruptive selection of human immunostimulatory and immunosuppressive genes both provokes and prevents rheumatoid arthritis, respectively, as a self-domestication syndrome.
Klimova N.V., Oshchepkova E., Chadaeva I., Sharypova E., Ponomarenko P., Drachkova I., Rasskazov D., Oshchepkov D., Ponomarenko M., Savinkova L., Kolchanov N.A., Kozlov V.A.
[Frontiers in Genetics]
|
|
Domestication explains two-thirds of differential-gene-expression variance between domestic and wild animals; the remaining one-third reflects intraspecific and interspecific variation
Chadaeva I, Ponomarenko P, Kozhemyakina R, Suslov V, Bogomolov A, Klimova N, Shikhevich S, Savinkova L, Oshchepkov D, Kolchanov N, Markel A, Ponomarenko M.
[Animals]
|
|
Leave or Stay: Simulating Motility and Fitness of Microorganisms in Dynamic Aquatic Ecosystems
Alexandra Klimenko, Yury Matushkin, Nikolay Kolchanov, Sergey Lashin
[Biology]
|
| 2020 |
Candidate SNP markers of atherogenesis significantly shifting the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters show stabilizing natural selection as a sum of neutral drift accelerating atherogenesis and directional natural selection slowing it.
Ponomarenko M, Rasskazov D, Chadaeva I, Sharypova E, Drachkova I, Oshchepkov D, Ponomarenko P, Savinkova L, Oshchepkova E, Nazarenko M, Kolchanov N.
[INT J MOL SCI]
|
|
Characterization of biological peculiarities of the radioprotective activity of double-stranded RNA isolated from Saccharomyces сerevisiae
Ritter GS, Nikolin VP, Popova NA, Proskurina AS, Kisaretova PE, Taranov OS, Dubatolova TD, Dolgova EV, Potter EA, Kirikovich SS, Efremov YR, Bayborodin SI, Romanenko MV, Meschaninova MI, Venyaminova AG, Kolchanov NA, Shurdov MA, Bogachev SS.
[INT J RADIAT BIOL]
|
|
Dissecting DISC regulation via pharmacological targeting of caspase-8/c-FLIPL heterodimer
Laura K. Hillert, Nikita V. Ivanisenko, Denise Busse, Johannes Espe, Corinna König, Sergey E. Peltek, Nikolai A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik
[CELL DEATH DIFFER]
|
|
Meta-Analysis of Transcriptome Data Detected New Potential Players in Response to Dioxin Exposure in Humans
Evgeniya Oshchepkova, Yana Sizentsova, Daniil Wiebe, Victoria Mironova and Nikolay Kolchanov
[INT J MOL SCI]
|
|
The Phylogeny of Class B Flavoprotein Monooxygenases and the Origin of the YUCCA Protein Family
Turnaev I.I., Gunbin K.V., Suslov V.V., Akberdin I.R., Kolchanov N.A., Afonnikov D.A.
[Plants]
|
|
The role of death domain proteins in host response upon SARS-CoV-2 infection: modulation of programmed cell death and translational applications
Nikita V. Ivanisenko, Kamil Seyrek, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko, Inna N. Lavrik
[Cell Death Discovery]
|
|
Unannotated single nucleotide polymorphisms in the TATA box of erythropoiesis genes show in vitro positive involvements in cognitive and mental disorders.
Ponomarenko M., Sharypova E., Drachkova I., Chadaeva I., Arkova O., Podkolodnaya O., Ponomarenko P., Kolchanov N., Savinkova L.
[BMC MED GENET]
|
|
Young «oil site» of the Uzon Caldera as a habitat for unique microbial life
Sergey E. Peltek, Alla V. Bryanskaya, Yuliya E. Uvarova, Aleksey S. Rozanov, Timofey V. Ivanisenko, Vladimir A. Ivanisenko, Elena V. Lazareva, Olga V. Saik, Vadim M. Efimov, Sergey M. Zhmodik, Oxana P. Taran, Nikolay M. Slynko, Sergey V. Shekhovtsov, Valentin N. Parmon, Nikolay L. Dobretsov, Nikolay A. Kolchanov
[BMC MICROBIOL]
|
|
Изменение транскриптома генов гиппокампа мышей в модели депрессии при интраназальном введении биоактивных факторов М2 макрофагов
Шевела Е.Я., Маркова Е.В., Княжева М.А., Проскурина А.С., Ефремов Я.Р., Молодцов В.В., Селедцов И.А., Останин А.А., Богачев С.С., Колчанов Н.А., Черных Е.Р.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Методы in vitro, используемые для изучения ДНК-белковых взаимодействий.
Л.К. Савинкова, Е.Б. Шарыпова, Н.А. Колчанов
[Успехи современной биологии]
|
|
Характеристика активной субстанции препарата дрожжей Saccharomyces сerevisiae, обладающей радиопротекторными свойствами
Риттер Г.С., Николин В.П., Попова Н.А., Проскурина А.С., Кисаретова П.Э., Таранов О.С., Дубатолова Т.Д., Долгова Е.В., Поттер Е.А., Кирикович С.С., Ефремов Я.Р., Байбородин С.И., Романенко М.В., Мещанинова М.И., Веньяминова А.Г., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2019 |
Natural selection equally supports the human tendencies in subordination and domination: a genome-wide study with in silico confirmation and in vivo validation in mice.
Chadaeva I., Ponomarenko P., Rasskazov D., Sharypova E., Kashina E., Kleshchev M., Ponomarenko M., Naumenko V., Savinkova L., Kolchanov N., Osadchuk L., Osadchuk A.
[Frontiers in Genetics]
|
|
Spatial heterogeneity promotes antagonistic evolutionary scenarios in microbial community explained by ecological stratification: a simulation study
Klimenko A.I., Matushkin Y.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A.
[ECOL MODEL]
|
|
Web-Based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Posttranslational Modifications of Proteins
Ivanisenko VA, Ivanisenko TV, Saik OV, Demenkov PS, Afonnikov DA, Kolchanov NA.
[Methods in Molecular Biology]
|
|
Изменения липидного обмена мыши при одновременном воздействии антисмысловыми олигонуклеотидными производными к мРНК генов апоВ, PCSK9 и апоCIII
С.И. Ошевский, Ю.И. Рагино, Е.В. Каштанова, Я.В. Полонская, Е.М. Стахнева, В.П. Николин, Н.А. Попова, Н.А. Колчанов, М.И. Воевода
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Инь и янь плюрипотентности: результаты анализа генов, демонстрирующих повышенную экспрессию в инициирующих опухолевых клетках асцитной карциномы Кребс-2
Ефремов Я.Р., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Долгова Е.В., Ефремова О.В., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Кандидатные SNP-маркеры атеросклероза, которые способны достоверно изменять сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека
Пономаренко М.П., Рассказов Д.А., Чадаева И.В., Шарыпова Е.Б., Драчкова И.А., Пономаренко П.М., Ощепкова Е.А., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А.
[Генетика]
|
|
Кандидатные SNP-маркеры ревматоидного полиартрита, которые могут достоверно изменять сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека
Чадаева И.В., Рассказов Д.А., Шарыпова Е.Б., Драчкова И.А., Ощепкова Е.А., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А., Козлов В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Приоритизация генов картофеля, вовлеченных в формирование селекционно-значимых признаков, с использованием базы знаний SOLANUM TUBEROSUM.
Деменков П.С., Сайк О.В., Иванисенко Т.В., Колчанов Н.А., Кочетов А.В., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Стволовые раковые клетки: «служба спасения» для опухолей в условиях генерализованного клеточного стресса
Ефремов Я.Р., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Долгова Е.В., Ефремова О.В., Ощепков Д.Ю., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
| 2018 |
ARGO_CUDA: EXHAUSTIVE GPU BASED APPROACH FOR MOTIF DISCOVERY IN LARGE DNA DATASETS
Vishnevsky O.V., Bocharnikov A.V., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Cancer stem cells: Emergent nature of tumor emergency
Efremov YR, Proskurina AS, Potter EA, Dolgova EV, Efremova OV, Taranov OS, Ostanin AA, Chernykh ER, Kolchanov NA, Bogachev SS
[Frontiers in Genetics]
|
|
Candidate SNP markers of reproductive potential are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters
Chadaeva IV, Ponomarenko PM, Rasskazov DA, Sharypova EB, Kashina EV, Zhechev DA, Drachkova IA, Arkova AV, Savinkova LK, Ponomarenko MP, Kolchanov NA, Osadchuk LV, Osadchuk AV.
[BMC GENOMICS]
|
|
Efficacy of a new cancer treatment strategy based on eradication of tumor-initiating stem cells in a mouse model of Krebs-2 solid adenocarcinoma
Potter ЕА, Proskurina AS, Ritter GS, Dolgova ЕV, Nikolin VP, Popova NA, Taranov OS, Efremov YR, Bayborodin SI, Ostanin АА, Chernykh ЕR, Kolchanov NA, Bogachev SS
[ONCOTARGET]
|
|
High temperature and pressure influence the interdomain orientation of Nip7 proteins from P. abyssi and P. furiosus: MD simulations
Medvedev, K.E., Kolchanov, N.A., Afonnikov, D.A.
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
Introduction to the 9th Young Scientists School on Systems Biology and Bioinformatics (SBB'2017)
Orlov Y.L., Tatarinova T.V., Zakhartsev M.V., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Pluripotency gene network dynamics: system views from parametric analysis.
Akberdin I.R., Omelyanchuk N.A., Fadeev S.I., Leskova N.E., Oschepkova E.A., Kazantsev F.V., Matushkin Yu.G., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[PloS One]
|
|
Review of direct chemical and biochemical transformations of starch
Vadim K. Khlestkin, Sergey E. Peltek, Nicolay A. Kolchanov
[CARBOHYD POLYM]
|
|
База знаний SOLANUM TUBEROSUM: раздел по молекулярно-генетической регуляции метаболических путей
Т.В. Иванисенко, О.В. Сайк, П.С. Деменков, В.К. Хлесткин, Е.К. Хлесткина, Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Информационная Система По Биоресурсным Коллекциям Институтов ФАНО России
Лашин С.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Казанцев Ф.В., Комышев Е.Г., Ощепкова Е.А., Петров А.В., Рассказов Д.А., Смирнова А.А., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Оценка эффективности эрадикации стволовых инициирующих раковых клеток на примере асцитной формы гепатокарциномы мыши Г-29
Поттер Е.А., Риттер Г.С., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Кисаретова П.Э., Ефремов Я.Р., Николин В.П., Попова Н.А., Таранов О.С., Останин А.А., Черных Е.Р., Сидоров С.В., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[Вопросы онкологии]
|
|
Экспериментальное изучение влияния редких полиморфизмов ТАТА-боксов промоторов генов HBB, HBD и F9 человека на кинетику взаимодействия с ТАТА-связывающим белком
Шарыпова Е.Б., Драчкова И.А., Кашина Е.В., Рассказов Д.А., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А., Савинкова Л.К.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
Genetics at Belyaev Conference – 2017: introductory note
Orlov Y.L., Baranova A.V., Tatarinova T.V., Kolchanov N.A.
[BMC GENET]
|
|
Status and Prospects of Marker-Assisted and Genomic Plant Breeding
N.A. Kolchanov, A.V. Kochetov, E.A. Salina, L.A. Pershina, E.K. Khlestkina, V.K. Shumny
[HER RUSS ACAD SCI+]
|
|
Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots
N. A. Omelyanchuk, D. S. Wiebe, D. D. Novikova, V. G. Levitsky, N. Klimova, V. Gorelova, C. Weinholdt, G. V. Vasiliev, E. V. Zemlyanskaya, N. A. Kolchanov, A. V. Kochetov, I. Grosse, V. V. Mironova
[SCI REP-UK]
|
|
Candidate SNP markers of familial and sporadic Alzheimer's diseases are predicted by a significant change in the affinity of TATA-Binding protein for human gene promoters.
Ponomarenko P, Chadaeva I, Rasskazov DA, Sharypova E, Kashina EV, Drachkova I, Zhechev D, Ponomarenko MP, Savinkova LK, Kolchanov N
[Frontiers in Aging Neuroscience]
|
|
Gene expression profiling of tumor-initiating stem cells from mouse Krebs-2 carcinoma using a novel marker of poorly differentiated cells
Potter EA, Dolgova EV, Proskurina AS, Efremov YR, Minkevich AM, Rozanov AS, Peltek SE, Nikolin VP, Popova NA, Seledtsov IA, Molodtsov VV, Zavyalov EL, Taranov OS, Baiborodin SI, Ostanin AA, Chernykh ER, Kolchanov NA, Bogachev SS
[ONCOTARGET]
|
|
Identification of residues of the archaeal RNA-binding Nip7 proteins specific to environmental conditions
Medvedev, K.E., Kolchanov, N.A., Afonnikov, D.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Molecular mechanisms of the interaction between the processes of the cell response to mechanical stress and neuronal apoptosis in primary open-angle glaucoma
O. V. Saik, N. A. Konovalova, P. S. Demenkov, N. V. Ivanisenko, T. V. Ivanisenko, D. E. Ivanoshchuk, O. S. Konovalova, O. A. Podkolodnaya, I. N. Lavrik, N. A. Kolchanov, V. A. Ivanisenko
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
SNP_TATA_Comparator: genomewide landmarks for preventive personalized medicine.
Ponomarenko M, Rasskazov D, Chadaeva I, Sharypova E, Ponomarenko P, Arkova O, Kashina E, Ivanisenko N, Zhechev D, Savinkova L, Kolchanov N.
[Front Biosci (Schol Ed)]
|
|
АНТИСМЫСЛОВОЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДНОЕ ПРОИЗВОДНОЕ К МРНК ГЕНА SCN5A НАТРИЕВОГО КАНАЛА NAV1.5 СНИЖАЕТ ЧАСТОТУ СЕРДЕЧНЫХ СОКРАЩЕНИЙ
Ошевский С.И., Рагино Ю.И., Каштанова Е.В., Полонская Я.В., Стахнева Е.М., Николин В.П., Попова Н.А., Колчанов Н.А., Воевода М.И.
[Атеросклероз]
|
|
ГЕНЫ-МИШЕНИ ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ СОРТОВ КАРТОФЕЛЯ (Solanum tuberosum L.) С ЗАДАННЫМИ СВОЙСТВАМИ КРАХМАЛА
В.К. Хлесткин, С.Е. Пельтек, Н.А. Колчанов
[Сельскохозяйственная биология]
|
|
Интернет-доступные информационные ресурсы по генным сетям, включающие данные по человеку и животным.
Игнатьева Е.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ АВТОМАТИЧЕСКОГО ИЗВЛЕЧЕНИЯ ЗНАНИЙ ИЗ ТЕКСТОВ НАУЧНЫХ ПУБЛИКАЦИЙ ДЛЯ СОЗДАНИЯ БАЗЫ ЗНАНИЙ SOLANUM TUBEROSUM
О.В. САЙК, П.С. ДЕМЕНКОВ, Т.В. ИВАНИСЕНКО, Н.А. КОЛЧАНОВ, В.А. ИВАНИСЕНКО
[Сельскохозяйственная биология]
|
|
Состояние и перспективы использования маркер-ориентированной и геномной селекции растений
Колчанов Н.А., Кочетов А.В., Салина Е.А., Першина Л.А., Хлесткина Е.К., Шумный В.К.
[Вестник Российской Академии Наук]
|
| 2016 |
Dynamic properties of SOD1 mutants can predict survival time of patients carrying familial amyotrophic lateral sclerosis
Nikolay A. Alemasova, Nikita V. Ivanisenko, Sergey P. Medvedev, Suren M. Zakian, Nikolay A. Kolchanov & Vladimir A. Ivanisenko
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
A compendium of human genes regulating feeding behavior and body weight, its functional characterization and identification of GWAS genes involved in brain-specific PPI network
Elena V. Ignatieva, Dmitry A. Afonnikov, Olga V. Saik, Evgeny I. Rogaev and Nikolay A. Kolchanov
[BMC GENET]
|
|
A quantitative method for determination of PPDK concentration in miscanthus leaves
Irina A. Meshcheryakova, Svetlana V. Bannikova, Aleksey S. Rozanov, Elisaveta V. Demidova, Evgeniy A. Demidov, Tatiana N. Goryachkovskaya, Natalya V. Burmakina, Sergey V. Shekhovtsov, Alla V. Bryanskaya, Nikolay A. Kolchanov, Sergey E. Peltek
[GCB BIOENERGY]
|
|
Bacteriophages affect evolution of bacterial communities in spatially distributed habitats: a simulation study
Klimenko A.I., Matushkin Yu.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A.
[BMC MICROBIOL]
|
|
Candidate SNP markers of aggressiveness-related complications and comorbidities of genetic diseases are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters.
Chadaeva I.V., Ponomarenko M.P., Rasskazov D.A., Sharypova E.B., Kashina E.V. Matveeva M.Yu., Arshinova T.V., Ponomarenko P.M., Arkova O.V., Bondar N.P. Savinkova L.K., Kolchanov N.A.
[BMC GENOMICS]
|
|
Candidate SNP markers of chronopathologies are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters
Petr Ponomarenko, Dmitry Rasskazov, Valentin Suslov, Ekaterina Sharypova, Ludmila Savinkova, Olga Podkolodnaya, Nikolay Podkolodny, Natalya Tverdokhleb, Irina Chadaeva, Mikhail Ponomarenko, Nikolay Kolchanov
[Biomed Res Int]
|
|
Candidate SNP markers of gender-biased autoimmune complications of monogenic diseases are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters
Mikhail Ponomarenko, Olga Arkova, Dmitry Rasskazov, Petr Ponomarenko, Ludmila Savinkova, Nikolay Kolchanov
[Frontiers in Immunology]
|
|
Computational genomics at BGRS\SB-2016: Introductory note
Orlov Y.L., Baranova A.V., Hofestädt R., Kolchanov N.A.
[BMC GENOMICS]
|
|
Impact of terahertz radiation on stress-sensitive genes of E.coli cell
Elizaveta V. Demidova, Tatiana N. Goryachkovskaya ; Irina A. Mescheryakova ; Tatiana K. Malup ; Artem I. Semenov ; Nikolay A. Vinokurov ; Nikolay A. Kolchanov ; Vasiliy M. Popik ; Sergey E. Peltek
[IEEE Transactions on Terahertz Science and Technology]
|
|
Mechanical Behavior of Cells within a Cell-Based Model of Wheat Leaf Growth
Zubairova U, Nikolaev S, Penenko A, Podkolodnyy N, Golushko S, Afonnikov D, Kolchanov N
[Frontiers in Plant Science]
|
|
Molecular associations of Primary Open-Angle Glaucoma with potential comorbid diseases (POAG-associome)
Olga V Saik, Natalia A Konovalova, Pavel S Demenkov, Timofey V Ivanisenko, Evgeny D Petrovskiy, Nikita V Ivanisenko, Dinara E Ivanoshchuk, Maria N Ponomareva, Olga S Konovalova, Inna N. Lavrik, Nikolay A Kolchanov, Vladimir A Ivanisenko
[Biotecnología Aplicada]
|
|
Prediction and verification of the influence of the rs367781716 SNP on the interaction of the ТАТА-binding protein with the promoter of the human АВСА9 gene
Arkova OV, Drachkova IA, Arshinova TV, Rasskazov DA, Suslov VV, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP, Kolchanov NA, Savinkova LK
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Properties of internalization factors contributing to the uptake of extracellular DNA into tumor-initiating stem cells of mouse Krebs-2 cell line
Evgeniya V. Dolgova, Ekaterina A. Potter, Anastasiya S. Proskurina, Alexandra M. Minkevich, Elena R. Chernych, Alexandr A. Ostanin, Yaroslav R. Efremov, Sergey I. Bayborodin, Valeriy P. Nikolin, Nelly A. Popova, Nikolay A. Kolchanov, Sergey S. Bogachev
[STEM CELL RES THER]
|
|
Гипотетические SNP-маркеры, значимо изменяющие оценки сродства ТАТА-связывающего белка к промоторам онкогенов VEGFA, ERBB2, IGF1R, FLT1, KDR и MET – мишеней для химиотерапии.
Турнаев И.И., Рассказов Д.А., Аркова О.В., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А.
[Molecular Biology]
|
|
ИЗУЧЕНИЕ ОТВЕТА БАКТЕРИАЛЬНЫХ КЛЕТОК НА НЕТЕРМИЧЕСКОЕ ВОЗДЕЙСТВИЕ ТЕРАГЕРЦОВОГО ИЗЛУЧЕНИЯ
С.Е. Пельтек, И.А. Мещерякова, Е.В. Демидова, Т.Н. Горячковская, А.И. Семенов, Е.А. Демидов, В.М. Попик, Г.Н. Кулипанов, Н.А. Колчанов
[Acta Naturae]
|
|
МИКРОБНЫЕ СООБЩЕСТВА ЭКСТРЕМАЛЬНЫХ ЭКОСИСТЕМ; МЕТАГЕНОМНЫЙ ПОДХОД
С.Е. Пельтек, А.В. Брянская, Ю.Е. Уварова, А.С. Розанов, Т.В. Иванисенко, Т.К. Малуп, В.А. Иванисенко, Е.В. Лазарева, О.В. Сайк, С.М. Жмодик, О.П. Таран, Н.М. Слынько, С.В. Шеховцов, В.Н. Пармон, Н.Л. Добрецов, Н.А. Колчанов
[Acta Naturae]
|
|
Маркёр-ориентированная селекция и примеры ее использования в мировом картофелеводстве
Хлесткина Е.К., Шумный В.К., Колчанов Н.А.
[Достижения науки и техники АПК]
|
|
Молекулярно-генетические механизмы взаимодействия процессов ответа клетки на механический стресс и нейронального апоптоза при первичной открытоугольной глаукоме
Сайк О.В., Коновалова Н.А., Деменков П.С., Иванисенко Н.В., Иванисенко Т.В., Иванощук Д.Е., Пономарева М.Н., Коновалова О.С., Подколодная О.А., Лаврик И.Н., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Оценка количественных характеристик опушения листьев картофеля с использованием анализа цифровых микроизображений
А.В. Дорошков, А.В. Симонов, А.Д. Сафонова, Д.А. Афонников, И.Е. Лихенко, Н.А. Колчанов
[Достижения науки и техники АПК]
|
|
Разработка регламента терапевтического режима, основанного на синергичном действии циклофосфана и препаратов двуцепочечной ДНК, приводящего к полному вылечиванию экпериментальных животных от асцитной формы опухоли мыши Кребс-2
Поттер Е.А., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Ефремов Я.Р., Таранов О.С., Николин В.П., Попова Н.А., Дубатолова Т.Д., Петрова Д.Д., Верещагин Е.И., Минкевич А.М., Андрушкевич О.М., Байбородин С.И., Рогачев В.А., Останин А.А., Черных Е.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Режим однократной инъекции препарата двуцепочечной ДНК после каждой инъекции циклофосфана, приводящий к эрадикации первичного асцита Кребс-2.
Поттер Е.А., Долгова Е.В., Минкевич А.М., Николин В.П., Попова Н.А., Ефремов Я.Р., Байбородин С.И., Рогачев В.А., Проскурина А.С., Таранов О.С., Верещагин Е.И., Останин А.А., Черных Е.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Системно-биологический анализ гена WOX5 и его функций в нише стволовых клеток корня
Е.А. Ощепкова, Н.А. Омельянчук, М.С. Савина, Т. Пастернак, Н.А. Колчанов, Е.В. Землянская
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
“Soranovskii”: A New Miscanthus Cultivar Developed in Russia
Tatiana Goryachkovskaya, Nikolay Slynko, Eugenia Golubeva,Sergei Shekhovtsov, Nikolay Nechiporenko, Sergey Veprev, Irina Meshcheryakova, Konstantin Starostin, Natalya Burmakina, Alla Bryanskaya, Nikolay Kolchanov, Vladimir Shumny, Sergey Peltek
[Perennial Biomass Crops for a Resource-Constrained World]
|
| 2015 |
Molecular association of pathogenetic contributors to pre-eclampsia (pre-eclampsia associome)
Glotov AS, Tiys ES, Vashukova ES, Pakin VS, Demenkov PS, Saik OV, Ivanisenko TV, Arzhanova ON, Mozgovaya EV, Zainulina MS, Kolchanov NA, Baranov VS, Ivanisenko VA
[BMC SYST BIOL]
|
|
ANDSystem: an Associative Network Discovery System for automated literature mining in the field of biology
Vladimir A Ivanisenko, Olga V Saik, Nikita V Ivanisenko, Evgeny S Tiys, Timofey V Ivanisenko, Pavel S Demenkov and Nikolay A Kolchanov
[BMC SYST BIOL]
|
|
Dependence of a DNA globule size in a gas phase on the chain length
Goryachkovskaya T. N., Kozlov A. S., Popik V. M., Kolchanov N. A., Peltek S. E.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Effect of flanking sequences on the accuracy of the recognition of transcription factor binding sites.
Khlebodarova T. M., Oshchepkov D. Yu., Levitsky V. G., Podkolodnaya O. A., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Stepanenko I. L., Kolchanov N. A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
How to use SNP_TATA_Comparator to find a significant change in gene expression caused by the regulatory SNP of this gene’s promoter via a change in affinity of the TATA-binding protein for this promoter
Mikhail Ponomarenko, Dmitry Rasskazov, Olga Arkova, Petr Ponomarenko, Valentin Suslov, Ludmila Savinkova, Nikolay Kolchanov
[Biomed Res Int]
|
|
Human Genes Encoding Transcription Factors and Chromatin-Modifying Proteins Have Low Levels of Promoter Polymorphism: A Study of 1000 Genomes Project Data
Ignatieva EV, Levitsky VG, Kolchanov NA
[International Journal of Genomics]
|
|
Identification of the relationship between the variability of the expression of signaling pathway genes in the human brain and the affinity of TATA-binding protein to their promoters.
Ponomarenko MP, Suslov VV, Gunbin KV, Ponomarenko PM, Vishnevsky OV, Kolchanov NA.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Introductory note for BGRS\SB-2014 special issue
Orlov Y.L., Hofestädt R.M., Kolchanov N.A
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Isolation of prospective microalgal strains with high saturated fatty acid content for biofuel production
A.V. Piligaev , K.N. Sorokina, A.V. Bryanskaya, S.E. Peltek, N.A. Kolchanov, V.N. Parmon
[Algal Research]
|
|
Mechanisms of the Formation and Propagation of Sociobiological Interactions: a Computer Simulation Study
Lashin S. A., Mamontova E. A., Matushkin Yu. G., Kolchanov N. A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Modeling evolution of spatially distributed bacterial communities: a simulation with the haploid evolutionary constructor»
Klimenko A.I., Matushkin Yu.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A.
[BMC EVOL BIOL]
|
|
Neurometabolic Effect of Altaian Fungus Ganoderma lucidum (Reishi Mushroom) in Rats Under Moderate Alcohol Consumption
Shevelev OB, Akulov AE, Dotsenko AS, Kontsevaya GV, Zolotykh MA, Gerlinskaya LA, Veprev SG, Goryachkovskaya TN, Zhukova NA, Kolchanov NA, Pel'tek SE, Moshkin MP.
[ALCOHOL CLIN EXP RES]
|
|
No DNA damage response and negligible genome-wide transcriptional changes in human embryonic stem cells exposed to terahertz radiation
Bogomazova,A. N., Vassina E. M., Goryachkovskaya T. N., Popik V. M., Sokolov A. S., Kolchanov N. A., Lagarkova M. A., Kiselev S. L., Peltek S. E.
[SCI REP-UK]
|
|
Obesity-related known and candidate SNP markers can significantly change affinity of TATA-binding protein for human gene promoters
Arkova OV, Ponomarenko MP, Rasskazov DA, Drachkova IA, Arshinova TV, Ponomarenko PM, Savinkova LK, Kolchanov NA
[BMC GENOMICS]
|
|
Permanent proteins in the urine of healthy humans during the Mars-500 experiment
Larina IM, Pastushkova LKh, Tiys ES, Kireev KS, Kononikhin AS, Starodubtseva NL, Popov IA, Custaud MA, Dobrokhotov IV, Nikolaev EN, Kolchanov NA, Ivanisenko VA
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Prediction of tissue-specific effects of gene knockout on apoptosis in different anatomical structures of human brain.
Petrovskiy E.D., Saik O.V., Tiys E.S., Lavrik I.N., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[BMC GENOMICS]
|
|
TNF-Binding Domain of the Variola Virus CrmB Protein Synthesized in Escherichia coli Cells Effectively Interacts with Human TNF
T. V. Tregubchak, S. V. Shekhovtsov, T. S. Nepomnyashchikh, S. E. Peltek, Academician N. A. Kolchanov, and S. N. Shchelkunov,
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
The evolution of Homo sapiens denisova and Homo sapiens neanderthalensis miRNA targeting genes in the prenatal and postnatal brain
Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A., Derevianko A.P. and Rogaev E.I.
[BMC GENOMICS]
|
|
Одновременное воздействие несколькими антисмысловыми олигонуклеотидными производными, его эффективность на примере липидного обмена мыши
Ошевский С.И., Рагино Ю.И., Каштанова Е.В., Полонская Я.В., Стахнёва Е.М., Николин В.П., Попова Н.А., Кораблев А.Н.. Колчанов Н.А., Воевода М.И.
[Атеросклероз]
|
|
ПРОГНОЗ И ВЕРИФИКАЦИЯ ВЛИЯНИЯ SNP rs367781716 НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ТАТА-СВЯЗЫВАЮЩЕГО БЕЛКА С ПРОМОТОРОМ ГЕНА АВСА9 ЧЕЛОВЕКА
Аркова ОВ., Драчкова ИА., Аршинова ТВ., Рассказов ДА., Суслов ВВ., Пономаренко ПМ., Пономаренко МП., Колчанов НА., Савинква ЛК.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Применение репродуктивных технологий для повышения эффективности геномной селекции молочного крупного рогатого скота
Юдин Н.С., Лукьянов К.И., Воевода, Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Регуляторная геномика – экспериментально-компьютерные подходы
Е. В. Игнатьева, О. А. Подколодная, Ю. Л. Орлов, Г. В. Васильев, Н. А. Колчанов
[RUSS J GENET+]
|
|
Суперкомпьютерные технологии в решении задач биоинформатики
Глинский Б.М., Кучин Н.В., Черных И.Г., Орлов Ю.Л., Подколодный Н.Л., Лихошвай В.А., Колчанов Н.А.
[Программные системы: теория и приложения]
|
| 2014 |
A New Stochastic Model for Subgenomic Hepatitis C Virus Replication Considers Drug Resistant Mutants
Nikita V. Ivanisenko, Elena L. Mishchenko, Ilya R. Akberdin, Pavel S. Demenkov, Vitaly A. Likhoshvai, Konstantin N. Kozlov, Dmitry I. Todorov, Vitaly V. Gursky, Maria G. Samsonova, Alexander M. Samsonov, Diana Clausznitzer, Lars Kaderali, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko
[PloS One]
|
|
ChIP-seq данные и их анализ
Орлов Ю.Л., Васильев Г.В., Кулакова Е.В., Колчанов Н.А.
[Молекулярная и прикладная генетика]
|
|
Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag (ChIA-PET) sequencing technology and application
Guoliang Li, Liuyang Cai, Huidan Chang, Ping Hong, Qiangwei Zhou, Ekaterina V Kulakova, Nikolay A Kolchanov, Yijun Ruan
[BMC GENOMICS]
|
|
Genetic basis of olfactory cognition: extremely high level of DNA sequence polymorphism in promoter regions of the human olfactory receptor genes revealed using the 1000 Genomes Project dataset
Ignatieva E.V., Levitsky V.G., Yudin N.S., Moshkin M.P., Kolchanov N.A.
[Front Psychol]
|
|
HEC 2.0: improved simulation of the evolution of prokaryotic communities
Lashin S.A., Klimenko A.I., Mustafin Z.S., Kolchanov N.A., Matushkin Yu.G.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Insights into pathophysiology of dystropy through the analysis of gene networks: an example of bronchial asthma and tuberculosis
Bragina Elena Yu, Evgeny S. Tiys, Maxim B. Freidin, Lada A. Koneva, Pavel S. Demenkov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov, Valery P. Puzyrev
[IMMUNOGENETICS]
|
|
Molecular Analysis of the Benthos Microbial Community in Zavarzin Thermal Spring (Uzon Caldera, Kamchatka, Russia)
Rozanov A.S., Bryanskaya A.V., Malup T.K., Lasareva E.V., Taran O.P., Ivanisenko T.V., Ivanisenko V.A., Zhmodik S.M., Kolchanov N.A., Peltek S.E.
[BMC GENOMICS]
|
|
Molecular dynamics simulations of the Nip7 proteins from the marine deep- and shallow-water Pyrococcus species
Kirill E Medvedev, Nikolay A Alemasov, Yuri N Vorobjev, Elena V Boldyreva, Nikolay A Kolchanov, Dmitry A Afonnikov
[BMC STRUCT BIOL]
|
|
Nasal aerodynamics protects brain and lung from inhaled dust in subterranean diggers, Ellobius talpinus
M. P. Moshkin, D. V. Petrovski, A. E. Akulov, A. V. Romashchenko, L. A. Gerlinskaya, V. L. Ganimedov, M. I. Muchnaya, A. S. Sadovsky, I. V. Koptyug, A. A. Savelov, S. Yu Troitsky, Y. M. Moshkn, V. I. Bukhtiyarov, N. A. Kolchanov, R. Z. Sagdeev and V. M. Fomin
[P ROY SOC B-BIOL SCI]
|
|
Program complex SNP-MED for analysis of single-nucleotide polymorphism (SNP) effects on the function of genes associated with socially significant diseases
N. L. Podkolodnyy, D. A. Afonnikov, Yu. Yu. Vaskin, L.O. Bryzgalov, V. A. Ivanisenko, P. S. Demenkov, M.P. Ponomarenko, D.A. Rasskazov, K. V. Gunbin, I. V. Protsyuk, I.Yu. Shutov, P.N. Leontyev, M.Yu. Fursov, N.P. Bondar, E.V. Antontseva, T.I. Merkulova, and N.A. Kolchanov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Real-Time Interaction between ТВР and the TATA Box of the Human Triosephosphate Isomerase Gene Promoter in the Norm and Pathology
Arkova OV, Kuznetsov NA, Fedorova OS, Kolchanov NA, Savinkova LK
[Acta Naturae]
|
|
The mechanism by which TATA-box polymorphisms associated with human hereditary diseases influence interactions with the TATA-binding protein.
Drachkova I.A., Savinkova L.K., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Peltek S.E., Kolchanov N.A.
[HUM MUTAT]
|
|
Взаимосвязь уровня тревожности с полиморфными вариантами гена серотонинового транспортера у русских и тувинцев
Савостьянов А.Н., Науменко В.С., Синякова Н.А., Львова М.Н., Левин Е.А., Залешин М.С., Кавай-оол У.Т., Мордвинов В.А., Колчанов Н.А., Афтанас Л.И.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Влияние полиморфизма аллелей серотонинового транспортера на индивидуальные особенности мозговой гемодинамики у людей в условиях экспериментальной парадигмы «стоп-сигнал»
Петровский Е.Д., Савостьянов А.Н., Савелов А.А., Науменко В.С., Синякова Н.А., Левин Е.А., Таможников С.С., Тулупов А.А., Мордвинов В.А., Колчанов Н.А., Афтанас Л.И.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Влияние фланкирующих последовательностей на точность распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов.
Хлебодарова Т.М., Ощепков Д.Ю., Левицкий В.Г., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Колчанов Н. А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Выявление связи вариабельности экспрессии генов путей передачи сигналов в мозге человека со сродством ТАТА-связывающего белка к промоторам этих генов
М.П. Пономаренко, В.В. Суслов, К.В. Гунбин, П.М. Пономаренко, О.В. Вишневский, Н.А. Колчанов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Гены, контролирующие пищевое поведение и массу тела человека, и их функциональные и геномные характеристики
Е.В. Игнатьева, Д.А. Афонников, Е.И. Рогаев, Н.А. Колчанов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
ЗАВИСИМОСТЬ РАЗМЕРОВ ГЛОБУЛЫ ДНК В ГАЗОВОЙ ФАЗЕ ОТ ДЛИНЫ ЦЕПИ
Горячковская Т.Н., Козлов А.С., Попик В.М., Колчанов Н.А., Пельтек С.Е.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Компьютерное моделирование механизмов формирования и распространения социально-биологических связей и динамики поведения
Лашин С.А., Мамонтова Е.А., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Моделирование пространственного распределения эффекта нокаута генов, связанных с агрессивностью глиомы низкой степени злокачественности, в тканях мозга человека с помощью методов машинного обучения
Петровский Е.Д., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Осаждение аэрозолей в носовых ходах норных и наземных грызунов при дыхании в запыленной среде
Мошкин М.П., Петровский Д.В., Акулов А.Е., Ромащенко А.В., Герлинская Л.А., Мучная М.И., Ганимедов В.Л., Садовский А.С., Савелов А.А., Коптюг И.В., Троицкий С.Ю., Бухтияров В.И., Колчанов Н.А., Сагдеев Р.З., Фомин В.М.
[Журнал Общей Биологии]
|
|
Постоянные белки мочи здорового человека в эксперименте с 520-суточной изоляцией
Пастушкова ЛХ, Киреев КС, Кононихин АС, Тийс ЕС, Попов ИА, Доброхотов ИВ, Кусто МА, Иванисенко ВА, Колчанов НА, Николаев ЕН, Почуев ВИ, Ларина ИМ
[Aviakosm Ekolog Med.]
|
|
Предсказание генов маркеров агрессивности глиомы низкой степени злокачественности по экспрессионным данным TCGA
Иванисенко Н.В., Губанова Н.В., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
| 2013 |
Abundances of microRNAs in human cells can be estimated as a function of the abundances of YRHB and RHHK tetranucleotides in these microRNAs as an ill-posed inverse problem solution
Ponomarenko MP, Suslov VV, Ponomarenko PM, Gunbin KV, Stepanenko IL, Vishnevsky OL, Kolchanov NA
[Frontiers in Genetics]
|
|
Accuracy of protein allergenicity prediction can be improved by taking into account data on allergenic protein discontinuous peptides.
Bragin AO, Demenkov PS, Kolchanov NA, Ivanisenko VA.
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
An experimental verification of the predicted effects of promoter TATA-box polymorphisms associated with human diseases on interactions between the TATA-boxes and TATA-binding protein.
Savinkova L.K., Drachkova I.A., Arshinova T.V., Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A.
[PloS One]
|
|
Detection of Renal Tissue and Urinary Tract Proteins in the Human Urine after Space Flight.
Pastushkova L.Kh, Kireev R.S., Kononikhin A.S., Tiys E.S., Popov I.A., Starodubtseva N.L., Dobrokhotov I.V., Ivanisenko V.A., Larina I.M., Kolchanov N.A., Nikolaev E.N.
[PloS One]
|
|
Enhanced Differential Evolution Entirely Parallel Method for Biomedical Applications
Konstantin Kozlov, Nikita Ivanisenko, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov, Maria Samsonova, Alexander M. Samsonov
[Lect Notes Comput Sci]
|
|
How multiple auxin responsive elements may interact in plant promoters: a reverse problem solution
Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Savina M.S., Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Introductory note for BGRS-2012 special issue
Kolchanov N.A., Orlov Y.L.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Model of Structuring the Stem Cell Niche in Shoot Apical Meristem of Arabidopsis thaliana
S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, E. D. Mjolsness, B. E. Shapiro, and Academician N. A. Kolchanov
[Doklady Biological Sciences]
|
|
Modeling of plant embryo morphodynamics at early developmental stages
S. V. Nikolaev, N. A. Kolchanov, S. K. Golushko, J. -C. Palauqui, A. Urban, E. V. Amelina, A. V. Yurchenko, K. S. Golushko, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, A. Trubuil
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
PЕПЛИКАЦИЯ CУБГЕНОМНОГО PЕПЛИКОНА ВИPУCА ГЕПАТИТА C В ПPИCУТCТВИИ ИНГИБИТОPОВ NS3-ПPОТЕАЗЫ: CТОXАCТИЧЕCКАЯ МОДЕЛЬ
Н.В. Иваниcенко, Е.Л. Мищенко, И.P. Акбеpдин, П.C. Деменков, В.А. Лиxошвай, К.Н. Козлов, Д.И. Тодоpов, М.Г. Cамcонова, А.М. Cамcонов, Н.А. Колчанов, В.А. Иваниcенко
[МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОФИЗИКА]
|
|
RESEARCH ON THE BIODIVERSITY OF WESTERN SIBERIA MICROALGAE FOR THIRD-GENERATION BIOFUEL PRODUCTION PROCESSES
Пилигаев Александр Васильевич
Сорокина Ксения Николаевна
Брянская Алла Викторовна
Демидов Евгений Александрович
Кукушкин Роман Геннадьевич
Колчанов Николай Александрович
Пармон Валентин Николаевич
Пельтек Сергей Евгеньевич
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Studying the non-thermal effects of terahertz radiation on E. coli/pKatG-gfp biosensor cells
Elizaveta V. Demidova, Tatiana N. Goryachkovskaya, Tatiana K. Malup, Svetlana V. Bannikova, Artem I. Semenov, Nikolay A. Vinokurov, Nikolay A. Kolchanov, Vasiliy M. Popik, Sergey E. Peltek
[BIOELECTROMAGNETICS]
|
|
Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets.
Sommer B., Kormeier B., Demenkov P., Arrigo P., Hippe K., Ates O., Kochetov A.V., Ivanisenko V., Kolchanov N.A., Hofestaedt R.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
The substitutions G245C and G245D in the Zn(2+)-binding pocket of the p53 protein result in differences of conformational flexibility of the DNA-binding domain.
Pintus SS, Ivanisenko NV, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Ramachandran S, Kolchanov NA, Ivanisenko VA.
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
Translation efficiency in yeasts correlates with nucleosome formation in promoters
Matushkin YG, Levitsky VG, Orlov YL, Likhoshvai VA, Kolchanov NA.
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
|
|
Биотехнологический потенциал новой технической культуры – мискантус сорт сорановский
Слынько Н.М., Горячковская Т.Н., Шеховцов С.В., Банникова С.В., Бурмакина Н.В., Старостин К.В.,Розанов А.С., Нечипоренко Н.Н.,Вепрев С.Г., Шумный В.К., Колчанов Н.А., Пельтек С.Е.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Генные сети
Н.А. Колчанов, Е.В. Игнатьева, О.А. Подколодная, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Исследование биоразнообразия микроводорослей Западной Сибири для применения в процессах получения биотоплива третьего поколения/
Пилигаев А.В., Брянская А.В., Сорокина К.Н., Демидов Е.А., Кукушкин Р.Г., Колчанов Н.А., Пармон В.Н., Пельтек С.Е.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Математическое моделирование синтеза биоэтанола и молочной кислоты термофильными бактериями рода Geobacillus
М.А. Нуриддинов, Ф.В. Казанцев, А.С. Розанов, К.Н. Козлов, С.Е. Пельтек, Н.А. Колчанов, И.Р. Акбердин
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Модель регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега Arabidopsis thaliana
С. В. Николаев, У. С. Зубаирова, А. В. Пененко, Э. Д. Мелснесс (E. D. Mjolsness), Б. Е. Шапиро (B. E. Shapiro), Н. А. Колчанов
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Молекулярные механизмы взаимодействия белков CrmB вируса оспы коров и вируса натуральной оспы с фактором некроза опухолей человека
Иванисенко Н.В., Трегубчак Т.В., Сайк О.В., Иванисенко В.А., Щелкунов С.Н., Колчанов Н.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Программный комплекс SNP-MED для анализа влияния однонуклеотидных полиморфизмов на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний
Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, Ю.Ю. Васькин, Л.О. Брызгалов, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, М.П. Пономаренко, Д.А. Рассказов, К.В. Гунбин, И.В. Процук, И.Ю. Шутов, П.Н. Леонтьев, М.Ю. Фурсов, Н.П. Бондарь, Е.В. Антонцева, Т.И. Меркулова, Н.А. Колчанов.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Регуляторные коды транскрипции геномов эукариот
Т. И. Меркулова, Е. А. Ананько, Е. В. Игнатьева, Н. А. Колчанов
[RUSS J GENET+]
|
| 2012 |
ANDVisio: a new tool for graphic visualization and analysis of literature mined associative gene networks in the ANDSystem
P.S. Demenkov, T.V. Ivanisenko, N.A. Kolchanov, V.A. Ivanisenko
[In Silico Biology]
|
|
Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA.
[ANN BOT-LONDON]
|
|
Computer analysis of metagenomic data--prediction of quantitative value of specific activity of proteins.
Ivanisenko VA, Demenkov PS, Pintus SS, Ivanisenko TV, Podkolodny NL, Ivanisenko LN, Rozanov AS, Bryanskaya AV, Kostrjukova ES, Levizkiy SA, Selezneva OV, Chukin MM, Larin AK, Kondratov IG, Lazarev VN, Peltek SE, Govorun VM, Kolchanov NA
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Computer modeling of genome complexity variation trends in prokaryotic communities under varying habitat conditions
Lashin S.A., Matushkin Yu.G., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
[ECOL MODEL]
|
|
Extraction of quantitative characteristics describing wheat leaf pubescence with a novel image processing technique
Mikhail A. Genaev, Alexey V. Doroshkov, Tatyana A. Pshenichnikova, Nikolay A. Kolchanov, Dmitry A. Afonnikov
[PLANTA]
|
|
ICGenomics: программный комплекс анализа символьных последовательностей геномики
Ю.Л. Орлов, А.О. Брагин, И.В. Медведева, К.В. Гунбин, П.С. Деменков, О.В. Вишневский, В.Г. Левицкий, Д.Ю. Ощепков, Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, И. Гроссе, Н.А. Колчанов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Reconstruction of associative protein networks connected with processes of sodium exchange' regulation and sodium deposition in healthy volunteers by urine proteome analysis
Larina IM, Kolchanov NA, Dobrokhotov IV, Ivanisenko VA, Demenkov PS, Tiĭs ES, Valeeva OA, Pastushkova LKh, Nikolaev EN
[Human Physiology]
|
|
Routes of nanoparticle uptake into mammalian organisms, their biocompatibility and cellular effect
O. A. Podkolodnaya, E. V. Ignatieva, N. L. Podkolodnyy, N. A. Kolchanov
[Biology Bulletin Reviews]
|
|
SPF-виварий: научно-технологический комплекс для исследований в области нанобиобезопасности
Пельтек С.Е., Мошкин М.П., Герлинская Л.А., Горячковская Т.Н., Банникова С.В., Подколодная О.А, Попик В.М., Колчанов Н.А.
[Нанотехнологии Экология Производство]
|
|
SitEx: a computer system for analysis of projections of protein functional sites on eukaryotic genes
Irina Medvedeva, Pavel Demenkov, Nikolay Kolchanov and Vladimir Ivanisenko
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Анализ белковых взаимодействий на основе изучения протеома мочи человека в эксперименте со 105-суточной изоляцией.
Пастушкова Л.Х., Валеева О.А., Кононихин А.С., Ларина И.М., Николаев Е.Н., Попов И.А., Доброхотов И.В., Иванисенко В.А., Тийс Е.С., Колчанов Н.А.
[Авиакосмическая и экологическая медицина]
|
|
Важная роль изменений микроРНК в эволюции Homo neanderthalensis и Homo Denisova.
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А., Деревянко А.П.
[Археология, этнография и антропология Евразии]
|
|
Изучение взаимодействия TBP человека с ТАТА-элементом промотора гена NOS2A с использованием метода поверхностного плазмонного резонанса
И.А. Драчкова, C.В. Шеховцов, С.Е. Пельтек, П.М. Пономаренко, Т.В. Аршинова, М.П. Пономаренко, Т.И. Меркулова, Л.К. Савинкова, Н.А. Колчанов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Информационная поддержка исследования механизмов регуляции транскрипции: онтологический подход
Подколодный Николай Леонтьевич Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Компьютерный анализ взаимосвязи аллергенности микроорганизмов и среды их обитания
Брагин А.О., Деменков П.С., Тийс Е.С., Хофештадт Р., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Компьютерный анализ метагеномных данных – предсказание количественной величины специфической активности белков
Иванисенко В. А., Деменков П. С., Пинтус С. С., Иванисенко Т. В., Подколодный Н. Л., Иванисенко Л. Н., Розанов А. С., Брянская А. В., Кострюкова Е. С., Левицкий С. А., Селезнева О. В., Чукин М. М., Ларин А. К., Кондратов И. Г., Лазарев В. Н., Пельтек С. Е., Говорун В. М., Колчанов Н. А.
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Контекстные характеристики ДНК, значимые для ее повреждения ультрафиолетовым лазерным излучением с длиной волны 193 нм
Н.Н. Втюрина, С.Л. Гроховский, А.Б. Васильев, И.И. Титов, П.М. Пономаренко, М.П. Пономаренко, С.Е. Пельтек, Ю.Д. Нечипуренко, академик Н.А. Колчанов
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Моделирование морфодинамики на ранних стадиях эмбриогенеза растения
Николаев С.В., Колчанов Н.А., Голушко С.К., Палаки Ж.-К., Урбан О., Амелина Е.В., Юрченко А.В., Голушко К.С., Зубаирова У.С., Пененко А.В., Трубюй А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
ПОДАВЛЕНИЕ РЕПЛИКАЦИИ СУБГЕНОМНОГО РНК РЕПЛИКОНА ВИРУСА ГЕПАТИТА С ИНГИБИТОРОМ NS3 ПРОТЕАЗЫ SCH 503034 В HUH-7 КЛЕТКАХ: СТОХАСТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ
Е.Л. Мищенко, Н.В. Иванисенко, И.Р. Акбердин, П.С. Деменков, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Потенциал применения микроводорослей в качестве сырья для биоэнергетики.
Сорокина К.Н., Яковлев В.А., Пилигаев А.В., Кукушкин Р.Г., Пельтек С.Е., Колчанов Н.А., Пармон В.Н.
[Катализ в промышленности]
|
|
Пути поступления наночастиц в организм млекопитающих, их биосовместимость и клеточные эффекты.
Подколодная О. А., Игнатьева Е. В. , Подколодный Н. Л. , Колчанов Н. А. .
[Успехи современной биологии]
|
|
Распределенная система RESTful-web-сервисов для реконструкции и анализа генных сетей
Подколодный Николай Леонтьевич Семенычев Александр Владимирович Рассказов Дмитрий Александрович Боровский Виктор Геннадьевич Ананько Елена Анатольевна Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Наталья Николаевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Реконструкция ассоциативных белковых сетей, связанных с процессами регуляции обмена и депонирования натрия в организме здорового человека на основе изучения протеома мочи.
Ларина И.М., Колчанов Н.А., Доброхотов И.В., Тийс Е.С., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Валеева О.А., Пастушкова Л.Х., Николаев Е.Н.
[Физиология человека]
|
|
Система детекции биоаналитического комплекса нового поколения
Сысоев Е.В., Поташников А.К., Обидин Ю.В.,Горячковская Т.Н., Базин В.С., Попик В.М., Пельтек С.Е., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2011 |
A Study of a One-Dimensional Model of Regulation of the Renewing Zone Size in a Biological Tissue Accounting for Cell Division
S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, S. I. Fadeev, E. Mjolsness, N. A. Kolchanov
[Journal of Applied and Industrial Mathematics]
|
|
Application of the ANDCell Computer System to Reconstruction and Analysis of Associative Networks Describing Potential Relationships between Myopia and Glaucoma
O. A. Podkolodnaya, E. E. Yarkova, P. S. Demenkov, O. S. Konovalova, V. A. Ivanisenko, and N. A. Kolchanov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Evolutionary Trends in the Prokaryotic Community and Prokaryotic Community–Phage Systems
S. A. Lashin, Yu. G. Matushkin, V. V. Suslov, N. A. Kolchanov
[RUSS J GENET+]
|
|
From published expression and phenotype data to structured knowledge: The Arabidopsis gene net supplementary database and its applications
Denis Ponomaryov, Nadezhda Omelianchuk, Victoria Mironova, Evgeny Zalevsky, Nikolay Podkolodny, Eric Mjolsness, and Nikolay Kolchanov
[Lecture Notes in Artificial Intelligence]
|
|
In vitro examining the existing prognoses how TBP binds to TATA with SNP associated with human diseases
Drachkova I.A., Ponomarenko P.M., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Suslov V.V., Savinkova L.K., Kolchanov N.A.
[Health]
|
|
Molecular evolution of cyclin proteins in animals and fungi.
Gunbin K.V., Suslov V.V., Turnaev I.I., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[BMC EVOL BIOL]
|
|
PROMEDIA – база данных химических соединений, потенциальных биомаркеров заболеваний, имеющих значение для неинвазивной диагностики
Сайк О.В., Мошкин М.П., Балдин М.Н., Грузнов В.М., Козлов В.А., Самороков С.Н., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Protein Structure Discovery: software package to perform computational proteomics tasks
Ivanisenko VA, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Kolchanov NA
[RUSS J BIOORG CHEM+]
|
|
Protein Structure Discovery: пакет программ для решения задач компьютерной протеомики
Иванисенко В. А., Деменков П. С., Иванисенко Т. В., Колчанов Н. А.
[Биоорганическая химия]
|
|
Важная роль гидрофобных взаимодействий при адаптации белков к высоким давлениям
Афонников Д.А., Медведев К.Е., Гунбин К.В., Колчанов Н.А.
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Извлечение знаний из текстов научных публикаций и создание баз знаний в области нанобиотехнологии
В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов
[Российские нанотехнологии]
|
|
Изменение сродства ТАТА-связывающего белка к олигонуклеотидам, соответствующим ТАТА-боксам промоторов генов человека, несущим полиморфизмы, ассоциированные с наследственными заболеваниями
Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Острая иммуно-физиологическая реакция мышей разных генотипов на поступление наночастиц SiO2 (Таркосил 25) в верхние дыхательные пути
Мошкин М.П., Пельтек С.Е., Герлинская Л.А., Горячковская Т.Н., Концевая Г.В., Масленникова С.О., Попик В.В., Колчанов Н.А.
[Российские нанотехнологии]
|
|
Парадоксы "Проблем происхождения жизни"
Колчанов Н.А., Суслов В.В.
[Наука в России]
|
|
Подход и программные средства для описания макро- и микродинамики экосистем
Тимонов В.С., Суслов В.В., Брянская А.В., Ефимов В.М., Колчанов Н.А.
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
|
|
Разработка методов распознования сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA, их экспериментальная верификация и использование для анализа данных массовой иммунопреципитации хроматина
Левицкий В. Г., Ощепков Д. Ю., Ершов Н. И., Брызгалов Л. О., Антонцева Е. В., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А.
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Сибирский центр генетических ресурсов – три года спустя
Колчанов Н.А., Мошкин М.П., Сагдеев Р.З., Шумный В.К.
[Наука из первых рук]
|
|
Эволюционные тренды в системах “прокариотическое сообщество” и “прокариотическое сообщество–фаг”
Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
[RUSS J GENET+]
|
| 2010 |
A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits
Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Moscow University Biological Sciences Bulletin]
|
|
A new form of Miscanthus (Chinese silver grass, Miscanthus sinensis - Andersson) as a promising source of cellulosic biomass
Vladimir K. Shumny, Sergey G.Veprev, Nikolay N. Nechiporenko, Tatiana N. Goryachkovskaya, Nikolay M. Slynko, Nikolay A. Kolchanov, Sergey E. Peltek.
[Advances in Bioscience and Biotechnology]
|
|
A plausible mechanism for auxin patterning along the developing root
Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Yosiphon G, Fadeev S.I., Kolchanov N.A., Mjolsness E., Likhoshvai V.A.
[BMC SYST BIOL]
|
|
Expression and molecular characterization of the Mycobacterium tuberculosis PII protein
Bandyopadhyay A, Arora A, Jain S, Laskar A, Mandal C, Ivanisenko VA, Fomin ES, Pintus SS, Kolchanov NA, Maiti S, Ramachandran S.
[J BIOCHEM]
|
|
Metabolic Engineering in Silico
Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Ree M.T., Kolchanov N.A.
[APPL BIOCHEM MICRO+]
|
|
Possibility spaces and evolution
Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A.
[PALEONTOL J+(RUS)]
|
|
SNPs in the HIV-1 and HIV-2 TATA Box and the AIDS pandemic
Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Savinkova L.K., Ponomarenko P.M., Efimov V.M., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
The complete mitochondrial genomes of the liver flukes Opisthorchis felineus and Clonorchis sinensis (Trematoda).
Shekhovtsov SV, Katokhin AV, Kolchanov NA, Mordvinov VA.
[PARASITOL INT]
|
|
Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches
Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R
[J INTEGR BIOINFORM]
|
|
Влияние полиморфизмов ТАТА-бокса промотора гена бета-глобина человека, ассоциированный с бета-талассемией, на взаимодействие ТАТА-связывающего белка
Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А., Савинкова Л.К.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
ДНК-диагностика микст-инвазий Opisthorchis felineus и Metorchis bilis с помощью метода ПЦР
Брусенцов И.И., Катохин А.В., Сахаровская З.В., Сазонов А.Э., Огородова Л.М., Федорова О.С., Колчанов Н.А., Мордвинов В.А.
[Медицинская паразитология и паразитарные болезни]
|
|
Использование компьютерной системы ANDCell для реконструкции и анализа ассоциативных сетей потенциальных механизмов взаимосвязи миопии и глаукомы
О.А.Подколодная, Е.Э. Яркова, П.С.Деменков, О.С.Коновалова,. В.А.Иванисенко, Н.А.Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учётом деления клеток
Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И., Мйолснесс Э., Колчанов Н.А.
[Сибирский журнал индустриальной математики]
|
|
К вопросу биологической переработки Российского мискантуса
Пельтек С.Е., Брянская А.В., Горячковская Т.Н., Шумный В.К., Колчанов Н.А., Будаева В.В., Митрофанов Р.Ю., Золотухин В.Н., Скиба Е.А., Сакович Г.В.
[Ползуновский Вестник]
|
|
Микрофлюидные системы в биологии и конструирование геносенсоров
Пельтек С.Е., Горячковская Т.Н., Рубцов Н.Б., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А., Попик В.М., Пиндюрин В.Ф., Гольденберг Б.Г., Щеглов М.А., Кулипанов Г.Н.
[Нанотехнологии Экология Производство]
|
|
Новая форма Мискантуса Китайского (Веерника Китайского miscanthus sinensis anders.) как перспективный источник целлюлозосодержащего сырья
Шумный, С.Г. Вепрев, Н.Н. Нечипоренко, Т.Н. Горячковская, Н.М. Слынько, Н.А. Колчанов, С.Е. Пельтек
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Поиск возобновляемых источников целлюлозы для многоцелевого использования
Шумный В.К., Н.А. Колчанов, Г.В. Сакович, В.Н. Пармон, С.Г. Вепрев, Н.Н. Нечипоренко, Т.Н. Горячковская, А.В. Брянская, В.В. Будаева, А.В. Железнов, Н.Б. Железнова, В.Н. Золотухин, Р.Ю. Митрофанов, А.С. Розанов, К.Н. Сорокина, Н.М. Слынько, В.А. Яковлев,
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Полиморфизмы ТАТА-боксов генов хозяйственно важных и лабораторных животных и растений, ассоциированные с их селекционно-ценными признаками
Суслов В.В., Пономаренко П.М, Пономаренко М.П, Драчкова И.А., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К., Колчанов Н.А.
[RUSS J GENET+]
|
|
Профессор Ия Ивановна Кикнадзе: к 80-летию со дня рождения и к 55-летию научно-педагогической деятельности
Захаров И.К., Колчанов Н.А., Шумный В.К.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Точное уравнение равновесия для четырех шагов связывания ТВР с ТАТА-боксом для предсказания фенотипической экспрессии при мутациях
Пономаренко П.М., Суслов В.В.,Савинкова Л.К., Пономаренко М.П.,Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Эффективность связывания TBP c промотором ARF-генов растений коррелирует с характером влияния ARF белков на транскрипцию (активатор/репрессор)
В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, П.М. Пономаренко, М.П. Пономаренко, Н.А. Колчанов
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
| 2009 |
A novel nuclear marker, Pm-int9, for phylogenetic studies of Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini and Clonorchis sinensis (Opisthorchiidae, Trematoda).
S.V. Shekhovtsov, A.V. Katokhin, K.V. Romanov, V.V. Besprozvannykh, K.P. Fedorov, N.I. Yurlova, E.A. Serbina, P. Sithithaworn, N.A. Kolchanov, V.A. Mordvinov
[PARASITOL RES]
|
|
Adaptive evolution of genes of archaea belonging to the genus Pyrococcus associated with adaptation to life under high-pressure conditions
Gunbin KV, Afonnikov DA, Boldyreva EV, Kolchanov NA
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions
Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA
[BMC GENOMICS]
|
|
Plant developmental genetics: Integrating data from different experiments in databases
Omelyanchuk NA, Mironova VV, Kolchanov NA
[RUSS J GENET+]
|
|
Prediction of the affinity of the TATA-binding protein to TATA boxes with single nucleotide polymorphisms
Ponomarenko PM, Ponomarenko MP, Drachkova IA, Lysova MV, Arshinova TV, Savinkova LK, Kolchanov NA
[Molecular Biology]
|
|
TATA box polymorphisms in human gene promoters and associated hereditary pathologies
Savinkova LK, Ponomarenko MP, Ponomarenko PM, Drachkova IA, Lysova MV, Arshinova TV, Kolchanov NA
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
The evolution of key cell cycle proteins correlates with an increase in the complexity of eukaryotic organisms
Turnaev II, Gunbin KV, Kolchanov NA
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А.
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Академик Сергей Георгиевич Инге–Вечтомов: 70 лет со дня рождения и 45 лет научной и педагогической деятельности
Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Аргутинская Светлана Владимировна (7.04.1923-28.06.2009)
Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Выявление новых сайтов транскрипционных факторов SREBP в промоторных районах генов позвоночных на основе комбинации биоинформационного и экспериментального подходов
Е.В. Игнатьева, Т.И. Меркулова, Д.Ю. Ощепков, Н.В. Климова, Г.В. Васильев, И.И. Турнаев, В.Ф. Кобзев, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Генетика развития растений: интеграция информации из различных наблюдений и экспериментов в базах данных
Омельячук НА., Миронова ВВ., Колчанов НА
[RUSS J GENET+]
|
|
Дарвиновская эволюция и регуляторные генетические системы
В.В. Cуслов, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Математическая модель внутриклеточного размножения вируса гриппа
Бажан С. И., Кашеварова Н. А., Хлебодарова Т. М., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Математическая модель внутриклеточного размножения вируса гриппа
С.И. Бажан, Н.А. Кашеварова (Ри), Т. М. Хлебодарова, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов
[BIOPHYSICS]
|
|
Математическое моделирование действия потенциальных противовирусных препаратов на репликацию субгеномного репликона вируса гепатита С в клетке
Е.Л. Мищенко, K.Д. Безматерных, В.А. Иванисенко, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Метаболическая инженерия in silico
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Ри М.Т., Колчанов Н.А.
[Биотехнология]
|
|
Моделирование регуляции ауксином инициации латеральных органов у Arabidopsis thaliana
В.А. Лихошвай, Н.А. Омельянчук, В.В. Миронова, Ф.В. Казанцев, И.Р. Акбердин, В.К. Королев, С.И. Фадеев, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Определение полной нуклеотидной последовательности митохондриального генома возбудителя описторхоза, Opisthorchis felineus
В.А. Мордвинов, А.В. Марданов, Н.В. Равин, С.В. Шеховцов, С.А. Демаков, А.В. Катохин, Н.А. Колчанов, Г.К. Скрябин
[Acta Naturae]
|
|
Полиморфизмы ТАТА-боксов промоторов генов человека и ассоциированные с ними наследственные патологии
Cавинкова Л.К., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Колчанов Н.А.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Предисловие: 200 лет со дня рождения Чарлза Дарвина
Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К., Суслов В.В.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Предсказание влияния полиморфных замен нуклеотидов в ТАТА-боксах промоторов генов человека на сродство к ним ТАТА-связывающего белка
Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К.,Колчанов Н.А.
[Molecular Biology]
|
|
Учёный и селекционер Иван Васильевич Чёрный (23.05.1934-11.09.2009)
Шумный В.К., Колчанов Н.А., Ефименко А.В., Захаров И.К.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2008 |
Genetic Systems of Development: Functional Dynamics and Molecular Evolution
Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Genetic algorithm and optimized weight matrix application for peroxisome proliferator response elements recognition: Prerequisites of accuracy growth for wide genome research
Victor G. Levitsky, Elena V. Ignatieva, Eugenia Aman, Tatyana I. Merkulova, Nikolay A. Kolchanov, T. Charles Hodgman
[INTELL DATA ANAL]
|
|
Sarai uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs
Kochetov AV, Ahmad S, Ivanisenko V, Volkova OA, Kolchanov NA
[FEBS LETT]
|
|
TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes
N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko
[INTELL DATA ANAL]
|
|
Web-based computational tools for the prediction and analysis of post-translational modifications of proteins.
Ivanisenko V.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Methods in Molecular Biology]
|
|
uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs
Kochetov A.V., Ahmad S., Ivanisenko V., Volkova O.A., Kolchanov N.A., Sarai A.
[FEBS LETT]
|
|
Анализ структуры инсулин-зависимых регуляторных контуров зрелых адипоцитов
Кузнецова Т.Н., Е.В. Игнатьева, В.А. Мордвинов, А.В. Катохин, М.Ю. Шаманина, Д.Ю. Ощепков, Н.А. Колчанов
[Успехи физиологических наук]
|
|
Изготовление LIGA-шаблонов для создания микрофлюидных аналитических систем
Гольденберг Б.Г., Горячковская Т.Н., Елисеев В.С., Колчанов Н.А., Кондратьев В.И., Кулипанов Г.Н., Попик В.М., Пельтек С.Е., Петрова Е.В., Пиндюрин В.Ф.
[Поверхность. Рентгеновские, синхротронные и нейтронные исследования]
|
|
Математическое моделирование морфогенеза растений
Г.Г. Лазарева, В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, И.В. Шваб, В.А. Вшивков, Д.Н. Горпинченко, С.В. Николаев, Н.А.Колчанов.
[Журнал вычислительной математики и математической физики]
|
|
Микрофлюидные системы в биологии и конструирование геносенсоров
С.Е. Пельтек, Т.Н. Горячковская, В.М. Попик, В.Ф. Пиндюрин, В.С. Елисеев, Б.Г. Гольденберг, М.А. Щеглов, Н.В. Тикунова, Т.М. Хлебодарова, Н.Б. Рубцов, Г.Н. Кулипанов, Н.А. Колчанов
[Российские нанотехнологии]
|
|
Молекулярно-генетические системы развития: динамика функционирования и молекулярная эволюция
Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Пошаговая модель связывания ТВР/ТАТА бокс позволяет предсказать наследственные заболевания человека по точечным полиморфизмам
Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А.
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Содержание микроРНК В Arabidopsis thaliana коррелирует с наличием в последовательностях тетрануклеотидов WRHW и DRYD
Пономаренко М.П., Омельянчук Н.А., Катохин А.В., Савинская С.А., Колчанов Н.А
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Эволюционный конструктор: методика и комплекс программ для моделирования эволюции трофически связанных популяций одноклеточных гаплоидных организмов
Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
[Вычислительные технологии]
|
| 2007 |
AUG_hairpin: prediction of a downstream secondary structure influencing the recognition of a translation start site
Kochetov A.V., Palyanov A., Titov I.I., Grigorovich D., Sarai A., Kolchanov N.A.
[BMC BIOINFORMATICS]
|
|
Application of bioinformatics resources for genosensor design
Khlebodarova T.M., Tikunova N.V., Kachko A.V., Stepanenko I.L., Podkolodny N.L., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Aromorphoses and the adaptive molecular evolution
Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Bioinformatical and experimental approaches to investigation of transcription factor binding sites in vertebrate gene
Merkulova T. I., Oshchepkov D. Yu., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Levitsky V. G., Vasiliev G. V., Klimova N. V. , Merkulov V. M., Kolchanov N. A.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Combined experimental and computational approaches to study the regulatory elements in eukaryotic genes
Kolchanov NA, Merkulova TI, Ignatieva EV, Ananko EA, Oshchepkov DY, Levitsky VG, Vasiliev GV, Klimova NV, Merkulov VM, Hodgman TC
[BRIEF BIOINFORM]
|
|
Effective transcription factor binding site prediction using a combination of optimization, a genetic algorithm and discriminant analysis to capture distant interactions
Levitsky V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Turnaev I.I., Merkulova T.I., Kolchanov N.A., Hodgman T.C.
[BMC BIOINFORMATICS]
|
|
Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure-BGRS'2006
Rodin S. N., Kolchanov N. A.
[In Silico Biology]
|
|
Mathematical model for suppression of subgenomic hepatitis C virus RNA replication in cell culture
Mishchenko E.L., Bezmaternykh K.D., Likhoshvai V.A., Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Sournina N. Yu., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Model of the reception of hedgehog morphogen concentration gradient: comparison with an extended range of experimental data
Gunbin K.V., Omelyanchuk L.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Recognition of interferon-inducible sites, promoters, and enhancers
Ananko E.A., Kondrakhin Y.V., Merkulova T.I., Kolchanov N.A
[BMC BIOINFORMATICS]
|
|
Search for new binding sites for the transcription factor SF-1 by the SITECON method: experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes
Ignat'eva EV, Klimova NV, Oshchepkov DY, Vasil'ev GV, Merkulova TI, Kolchanov NA.
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Simulation of coevolution in community by using the "Evolutionary Constructor" program. In Silico Biology (Special Issue: 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS 2006))
Lashin S.A., Suslov V.V., Kolchanov N.A., Matushkin Yu.G
[In Silico Biology]
|
|
The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study
Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A.
[In Silico Biology]
|
|
Web-based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Post-translational Modifications of Proteins
Ivanisenko V.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Methods in Molecular Biology]
|
|
А cellular automaton to model the development of primary shoot meristems of Arabidopsis Thaliana
Ilya Akberdin, Evgeniy Ozonov, Victoria Mironova, Nadezda Omelyanchuk, Vitaly Likhoshvai, Dmytry Gorpinchenko, Nikolay Kolchanov
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция
Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Взаимодействие рекомбинантного ТАТА-связывающего белка с ТАТА-боксами промоторов генов млекопитающих
Савинкова Л.К., Драчкова И.А., Пономаренко М.П., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Колчанов Н.А.
[Экологическая генетика]
|
|
Компьютерно-экспериментальный подход к дизайну полифункционального геносенсора, полученного на основе промотора гена yfiA Escherichia coli
Тикунова Н.В., Хлебодарова Т.М., Крачко А.В., Степаненко И.Л., Колчанов Н.А.
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Математическая модель паттерна распределения ауксина в корне растения
Лихошвай В. А., Омельянчук Н. А., Миронова В. В., Фадеев С. И., Мелснесс Э. М., Колчанов Н. А.
[RUSS J DEV BIOL+]
|
|
Модельное изучение роли CLV1, CLV2, CLV3 И WUS в регуляции структуры апикальной меристемы побега
Николаев С. В., Пененко A. В., Лавреха В. В., Мелснесс Э. Д., Колчанов Н. А.
[RUSS J DEV BIOL+]
|
|
Поиск новых сайтов связывания транскрипционного фактора SF1 методом SITECON: экспериментальная проверка и анализ регуляторных районов генов-ортологов.
Игнатьева Е. В., Климова Н. В., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А.
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Сетевое описание биосистем: проблемы и подходы
Колчанов Н.А., Мигинский Д.С., Подколодный Н.Л., Рассказов Д.А., Суслов В.В., Тимонов В.С., Сергеев М.Г.
[Вычислительные технологии]
|
|
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах
Меркулова Т. И., Ощепков Д. Ю., Игнатьева Е. В., Ананько Е.В., Левицкий В.Г., Васильев Г. В., Климова Н. В., Меркулов В.М., Колчанов Н.А.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
| 2006 |
A Systems Approach to Morphogenesis in Arabidopsis thaliana: II. Modeling of the Regulation of Shoot Apical Meristem Structure
S. V. Nikolaev, S. I. Fadeev, A. V. Penenko, V. V. Lavrekha, V. V. Mironova, E. D. Mjolsness, N. A. Omel’yanchuk, N. A. Kolchanov
[BIOPHYSICS]
|
|
A model of Arabidopsis thaliana morphogenesis in cellular automaton terms
I. R. Akberdin, E. A. Ozonov, V.V. Mironova, D. N. Gorpinchenko,N. A. Omelyanchuk, V. A. Likhoshvai, N. A. Kolchanov
[BIOPHYSICS]
|
|
Method SiteGA for transcription factor binding sites recognition
Levitsky, V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Merkulova T.I., Kolchanov N.A., Hodgman T.C.
[BIOPHYSICS]
|
|
Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas
Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck
[GENOMICS]
|
|
On the Early Stages of the Evolution of the Geosphere and Biosphere
Dobretsov N.L., Kolchanov N.A., Suslov V.V.
[PALEONTOL J+(RUS)]
|
|
Pattern of locally positioned dinucleotides correlates with microRNA abundance in plants
Khomicheva I.V., Levitsky V.G., Omelyanchuk N.A., Kolchanov N.A., Savinskaya S.A.
[BIOPHYSICS]
|
|
Potential binding sites for SF-1: Recognition by the SiteGA method, experimental verification, and search for new target genes
Klimova NV, Levitsky VG, Ignatieva EV, Vasiliev GV, Kobzev VF, Busygina TV, Merkulova TI, Kolchanov NA
[Molecular Biology]
|
|
Prediction of Contact Numbers of Amino Acid Residues Using a Neural Network Regression Algorithm
D. A. Afonnikov, A. V. Morozov, N. A. Kolchanov
[BIOPHYSICS]
|
|
Statistical analysis of nucleosome formation sites
Orlov IuL, Levitskii VG, Smirnova OG, Podkolodnaia OA, Khlebodarova TM, Kolchanov NA.
[BIOPHYSICS]
|
|
Выявление потенциальных сайтов связывания транскрипционного фактора SF-1 методом SiteGA, их экспериментальная проверка и поиск новых генов-мишеней этого фактора
Климова Н.В., Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А.
[Molecular Biology]
|
|
Генные сети липидного метаболизма
Колчанов Н.А., Воевода М.И., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Игнатьева Е.В.
[Бюллетень СО РАМН]
|
|
Интерстициальные теломерные повторы, как маркеры эволюционных преобразований кариотипа млекопитающих: хромосома 2 человека
Воробьева Н.В., Билтуева Л.С., Орлов Ю.Л., Графодатский А.С., Колчанов Н.А
[BIOPHYSICS]
|
|
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани
Николаев С.В., Колчанов Н.А., Фадеев С.И., Когай В.В., Мйолснесс Э.
[Вычислительные технологии]
|
|
Метод SiteGA для распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов
Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А., Ходжман Т.С.
[BIOPHYSICS]
|
|
Моделирование морфогенеза Arabidopsis thaliana в терминах клеточного автомата
Акбердин И. Р., Озонов Е. А., Миронова В. В., Горпинченко Д.Н., Омельянчук Н. А., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
|
О ранних стадиях эволюции геосферы и биосферы
Добрецов Н.Л., Колчанов Н.А., Суслов В.В.
[PALEONTOL J+(RUS)]
|
|
Паттерн определенных динуклеотидов микроРНК арабидопсиса связан с уровнем их содержания в растении.
Левицкий В.Г., Хомичева И.В., Омельянчук Н.А., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Потенциальные открытые рамки считывания в 5”-нетранслируемых районах эукариотических мРНК
Волкова О. А., Кочетов А. В., Титов С. Е., Колчанов Н. А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Потенциальные сайты связывания фактора транскрипции SF-1: выявление методом SiteGA, экспериментальная проверка и поиск новых генов-мишени
Н.В.Климова, В.Г.Левицкий, Е.В.Игнатьева, Г.В.Васильев, В.Ф.Кобзев, Т.В.Бусыгина, Т.И.Меркулова, Н.А.Колчанов
[Molecular Biology]
|
|
Предсказание контактных чисел аминокислотных остатков c использованием алгоритма нейросетевой регрессии
Д.А.Афонников, А.С.Морозов, Н.А.Колчанов
[BIOPHYSICS]
|
|
Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов с помощью метода SiteGA
Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В.,Ананько Е.А.,Меркулова Т.И., Колчанов Н.А.,Ходжман Ч.
[BIOPHYSICS]
|
|
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: I. База данных AGNS
Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Шамов И.С.,Поплавский А.С., Подколодный Н.Л., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Мелснесс Э.Д., Мейеровитц Е.M., Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: II. Моделирование регуляции структуры апикальной меристемы побега
Николаев С.В., Фадеев С.И., Пененко A.В., Лавреха В.В., Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Мелснесс Э.Д., Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Содержание микроРНК в Arabidopsis thaliana коррелирует с встречаемостью тетрануклеотидов WRHW и DRYD
Пономаренко М.П., Омельянчук Н.А., Катохин А.В., Колчанов Н.А
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Статистический анализ последовательностей ДНК, содержащих сайты формирования нуклеосом
Орлов Ю.Л., Левицкий В.Г., Смирнова О.Г., Подколодная О.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А
[BIOPHYSICS]
|
|
Филогенетический анализ семейства p53
Пинтус С.С., Фомин Э.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Численное исследование модели рецепции градиента концентрации морфогена Hedgehog
В.В.Когай, К.В.Гунбин, Л.В.Омельянчук, С.И. Фадеев, Н.А.Колчанов
[Сибирский журнал индустриальной математики]
|
|
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах
Климова Н.В., Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А.
[Molecular Biology]
|
| 2005 |
GeneNet in 2005.
E.A. Ananko, N.L. Podkolodny, I.L. Stepanenko, O.A. Podkolodnaya, D.A. Rasskazov, D.S. Miginsky, V.A. Likhoshvai, A.V. Ratushny, N.N. Podkolodnaya, and N.A. Kolchanov.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
PDBSite: a database of the 3D structure of protein functional sites
Ivanisenko VA, Pintus SS, Grigorovich DA, Kolchanov NA.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
WebProAnalyst: an interactive tool for analysis of quantitative structure-activity relationships in protein families
Ivanisenko V.A., Eroshkin A.M., Kolchanov N.A.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Интеграция генных сетей, контролирующих физиологические функции организма
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Суслов В.В., Хлебодарова Т.М., Проскура А.Л., Воронич Е.С., Дубовенко Е.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
|
Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития
Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2004 |
Генетические механизмы кодирования биологической сложности
Суслов В.В., Гунбин К.В., Колчанов Н.А.
[Экологическая генетика]
|
|
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть I.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А.
[Сибирский экологический журнал]
|
|
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть II.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А.
[Сибирский экологический журнал]
|
|
Интегрированная компьютерная система по регуляции экспрессии генов эукариот.
Н. А. Колчанов, О. А Подколодная, Е. А. Ананько, Д. А. Афонников, О. В. Вишневский, Д. В. Воробьев, Е. В. Игнатьева, В. Г. Левицкий, В. А. Лихошвай, Н.А.Омельянчук, Н.Л. Подколодный, А. В. Ратушный
[Molecular Biology]
|
|
Моделирование биологической эволюции: регуляторные генетические системы и кодирование сложности биологической организации
Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин К.В.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2003 |
Apoptosis Gene Network: description in the GeneNet and TRRD databases
Stepanenko I., Kolchanov N.
[Ann.N.Y.Acad.Sci.]
|
|
Data Mining Techniques in Bioinformatics
Zagoruiko N.G., Kolchanov N.A., Pichueva A.G., Kutnenko O.A., Borisova I.A., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Nikolaev S.V., Likhoshvai V.A., Ratushnyi A.V.
[Pattern Recognition and Image Analysis]
|
| 2002 |
ASPD (Artificially Selected Proteins/Peptides Database): a database of proteins and peptides evolved in vitro.
Valuev V.P., Afonnikov D.A., Ponomarenko M.P., Milanesi L., Kolchanov N.A.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
GeneNet database: Description and Modeling of Gene Networks.
Kolchanov N.A., Nedosekina E.A., Ananko E.A., Likhoshvai V.A., Podkolodny N.L., Ratushny A.V., Stepanenko I.L., Podkolodnaya O.A., Ignatieva E.V., Matushkin Yu.G.
[In Silico Biology]
|
|
GeneNet: a database on structure and functional organisation of gene networks.
Ananko E.A., Podkolodny N.L., Stepanenko I.L., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Kolchanov N.A.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Transcription Regulatory Regions Database (TRRD): its status in 2002
Kolchanov NA, Ignatieva EV, Ananko EA, Podkolodnaya OA, Stepanenko IL, Merkulova TI, Pozdnyakov MA, Podkolodny NL, Naumochkin AN, Romashchenko AG
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Быстрый генетический алгоритм для анализа вторичной структуры РНК
Титов И.И., Воробьев Д.Г., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А.
[RUSS CHEM B+]
|
| 2001 |
ACTIVITY: a database on DNA/RNA sites activity adapted to apply sequence-activity relationships from one system to another.
Ponomarenko J.V., Furman D.P., Frolov A.S., Podkolodny N.L., Orlova G.V., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A., Sarai A.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Detection of conserved physico-chemical characteristics of proteins by analyzing clusters of positions with coadaptive substitutions
D.A. Afonnikov , D. Yu. Oshchepkov, and N.A. Kolchanov
[BIOINFORMATICS]
|
|
Сравнительный анализ методов распознавания потенциальных сайтов связывания транскрипционных факторов.
М.А. Поздняков, Е.Е. Витяев, Е.А. Ананько, Е.В. Игнатьева, О.А. Подколодная, Н.Л. Подколодный, С.В. Лаврюшев, Н.А. Колчанов
[Molecular Biology]
|
| 2000 |
Methods for integration of heterogeneous information resources in molecular biology in the digital library GeneExpress
F. A. Kolpakov, N. L. Podkolodnyi, S. V. Lavryushev, D. A. Grigorovich, M. P. Ponomarenko, N. A. Kolchanov
[PROGRAM COMPUT SOFT+]
|
|
SELEX_DB: an activated database on selected randomized DNA/RNA sequences addressed to genomic sequence annotation
Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Ponomarenko M.P., Lavryushev S.V., Frolov A.S., Zybova S.V., Kolchanov N.A.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Точковые мутации в районе 663-666 п.н. интрона 6 гена триптофаноксигеназы, связанные с рядом психических расстройств, разрушают сайт связывания фактора транскрипции YY1.
Васильев Г.В., Меркулов В.М., Кобзев В.Ф., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Подколодная О.А., Колчанов Н.А.
[Molecular Biology]
|
| 1999 |
Conformational and physicochemical DNA features specific for transcription factor binding sites.
Ponomarenko J.V., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Vorobyev D.G., Overton G.C., Kolchanov N.A.
[BIOINFORMATICS]
|
|
GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот
Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон
[BIOPHYSICS]
|
|
Identification of sequence-dependent features correlating to activity of DNA sites interacting with proteins
Ponomarenko M.P., Ponomarenko J.V., Frolov A.S., Podkolodny N.L., Savinkova L.K., Kolchanov N.A., Overton G.C.
[BIOINFORMATICS]
|
|
Integrated databases and computer systems for studying eukaryotic gene expression.
Kolchanov N.A., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Ananko E.A., Kolpakov F.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Goryachkovskaya T.N., Stepanenko I.L., Merkulova T.I., Babenko V.N., Ponomarenko J.V., Kochetov A.V., Podkolodny N.L., Vorobyev D.G., Lavrushev S.V., Grigorovich D.A., Kondrakhin Yu.V., Milanesi L., Wingender E., Solovyev V.V., Overton G.C.
[BIOINFORMATICS]
|
|
Nucleosomal DNA property database.
Levitsky V.G., Ponomarenko M.P., Ponomarenko J.V., Frolov A.S., Kolchanov N.A.
[BIOINFORMATICS]
|
|
Oligonucleotide frequency matrices addressed to recognizing functional DNA sites.
Ponomarenko M.P., Ponomarenko J.V., Frolov A.S., Podkolodnaya O.A., Vorobyev D.G., Kolchanov N.A., Overton G.C.
[BIOINFORMATICS]
|
|
Point mutations within 663-666 bp of intron 6 of the human TDO2 gene, associated with a number of psychiatric disorders, damage the YY-1 transcription factor binding site.
Vasiliev G.V., Merkulov V.M., Kobzev V.F., Merkulova T.I., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A.
[FEBS LETT]
|
|
Prediction of eukaryotic mRNA traslational properties.
Kochetov A.V., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Kisselev L.L., Kolchanov N.A.
[BIOINFORMATICS]
|
|
WWWMGS: интегрированный сервер для молекулярно-генетических исследований
А.С.Фролов, С.В.Лаврюшев, Д.А.Григорович, А.Э.Кель, А.А.Птицын, Н.А.Колчанов, Н.Л.Подколодный, В.В.Соловьев, Л.Миланези, П.Борн, Э.Вингендер, К.Овертон
[BIOPHYSICS]
|
|
Вклад сигналов и антисигналов в мутационный спектр сайта встраивания td-интрона.
Пономаренко М.П, Пономаренко Ю.В., Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Усреднее результатов распознавания сайтов может увеличить точность аннотации генома человека
Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Подколодная О.А., Фролов А.С., Воробьев Д.В., Колчанов Н.А., Овертон K.
[BIOPHYSICS]
|
| 1998 |
Eukaryotic mRNAs encoding abundant and scarce proteins are statistically dissimilar in many structural features.
Kochetov AV, Ischenko IV, Vorobiev DG, Kel AE, Babenko VN, Kisselev LL, Kolchanov NA.
[FEBS LETT]
|
|
GeneExpress: a computer system for description, analysis, and recognition of regulatory sequences in eukaryotic genome.
N.A. Kolchanov, M.P. Ponomarenko, A.E. Kel, A.S. Frolov, F.A. Kolpakov, T.N. Goryachkovsky, O.V. Kel, E.A. Ananko, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, V.N. Babenko, I.L. Stepanenko, A.G. Romashchenko, T.I. Merkulova, D.G. Vorobiev, S.V. Lavryushev, A.V. Kochetov, G.B. Kolesov, V.V. Solovyev, L. Milanesi, N.L. Podkolodny, E. Wingender, T. Heinemeyer
[Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol]
|
|
Предпочтительность RecA-филамента к последовательностям ДНК коррелирует с генетическим кодом
Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Титов И.И., Колчанов Н.А., Мазин А.В., Ковальчиковски С.
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Функциональные сайты геномов про- и эукариот: компьютерное моделирование и предсказание активности
Колчанов Н.А., Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Фролов А.С., Подколодный Н.Л.
[Molecular Biology]
|
| 1997 |
Generating programs for predicting the activity of functional sites.
Ponomarenko M.P., Kolchanova A.N., Kolchanov N.A.
[J COMPUT BIOL]
|
|
TRRD and COMPEL databases on transcription linked to TRANSFACAS as tools for analysis and recognition of regulatory sequences
Kel A.E., Kel O.V., Vishnevsky O.V., Ponomarenko M.P., Ischenko I.V., Karas H., Kolchanov N.A., Sklenar H., Wingender E.
[Lect Notes Comput Sci]
|
|
Компьютерный анализ конформационных особенностей ДНК ТАТА-боксов промоторов эукариот
Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Кель А.Э., Колчанов Н.А., Карас Х., Вингендер Э., Скленар Х.
[Molecular Biology]
|
|
Моделирование последовательностей ТАТА-боксов генов эукариот
Пономаренко М.П., Савинкова Л.К., Пономаренко Ю.В, Кель А.Э., Титов И.И., Колчанов Н.А.
[Molecular Biology]
|
| 1996 |
Олигонуклеотидные словари изофункциональных семейств генов, кодирующих белок
Колчанов Н.А., Бабенко В.Н., Вишневский О.В., Кель А.Э.
[Doklady Akademii Nauk]
|
| 1995 |
Identification of cDNA sequences by specific oligonucleotide sets. Computer tool and application.
Kolchanov NA, Vishnevsky OV, Kel AE, Shindyalov IN
[Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol]
|
| 1993 |
SITEVIDEO: a computer system for functional site analysis and recognition. Investigation of the human splice sites.
Kel A.E., Ponomarenko M.P., Likhachev .EA., Orlov Yu.L., Ischenko I.V., Milanesi L., Kolchanov N.A.
[Comput. Appl. Biosci.]
|
Монографии
| 2019 |
Web-Based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Posttranslational Modifications of Proteins
Ivanisenko, V. A., Ivanisenko, T. V., Saik, O. V., Demenkov, P. S., Afonnikov, D. A. and Kolchanov, N. A.
|
| 2018 |
Initiation Factors
Ponomarenko M., Savinkova L., Ponomarenko P., Kolchanov N.
|
| 2017 |
Cladogenesis
Ponomarenko M., Gunbin K., Doroshkov A., Suslov V., Kolchanov N.
|
|
Degrees of Freedom
Ponomarenko M., Babenko V., Kochetov A., Kolchanov N.
|
|
Heat Shock Proteins
Ponomarenko M., Stepanenko I., Kolchanov N.
|
|
Unique DNA
Ponomarenko M., Orlova G., Kolchanov N.
|
| 2016 |
The Animal Domestication Experiment as a Model of the Evolutionary Process: A New Insight into Evolution Under Selection Targeting Regulatory Systems.
Trut, L. N., Herbek, Y. E., Trapezov, O. V., Lashin, S. A., Matushkin, Y. G., Markel, A. L., Kolchanov, N. A.
|
|
“Soranovskii”: A New Miscanthus Cultivar Developed in Russia
Tatiana Goryachkovskaya, Nikolay Slynko, Eugenia Golubeva,Sergei Shekhovtsov, Nikolay Nechiporenko, Sergey Veprev, Irina Meshcheryakova, Konstantin Starostin, Natalya Burmakina, Alla Bryanskaya, Nikolay Kolchanov, Vladimir Shumny, Sergey Peltek
|
| 2014 |
Evolution, Biodiversity and Ecology in Microbial Communities: Mathematical Modeling and Simulation with the “Haploid Evolutionary Constructor” Software Tool
Lashin S.A., Matushkin Yu.G., Klimenko A.I., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
|
| 2013 |
Cladogenesis.
Ponomarenko M, Gunbin K, Doroshkov A, Kolchanov N
|
|
Degrees of Freedom.
Ponomarenko M, Babenko V, Kochetov A, Kolchanov N
|
|
Heat Shock Proteins.
Ponomarenko M, Stepanenko I., Kolchanov N
|
|
Initiation Factors.
Ponomarenko M, Savinkova L, Kolchanov N
|
|
Unique DNA.
Ponomarenko M, Orlova G, Kolchanov N
|
| 2012 |
Разработка методов, алгоритмов и программ параллельного моделирования в биоинформатике
Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, К.В. Гунбин, М.А. Генаев, Ю.Л. Орлов, Е.В. Игнатьева, О.В. Вишневский, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, Н.А. Колчанов
|
| 2011 |
Компьютерный анализ эволюции генных сетей морфогенеза
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Суслов В.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
|
|
Моделирование коэволюции одноклеточных гаплоидных организмов с помощью программного комплекса «Эволюционный конструктор»
Лашин С.А., Суслов В.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
|
| 2010 |
Nandbook of Drug Targeting and Monitoring. B.Andreev and V. Egorov ( Eds).
E.L. Mishchenko, K.D. Bezmaternykh, V.A. Likhoshvai, V.A. Ivanisenko, N.A. Kolchanov
|
|
Visualization and Analysis of Biological Networks combining Text Mining and Data Warehouse Approaches
Björn Sommer, Evgeny S. Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian J. Janowski, Timofey V. Ivanisenko, Anatoly O. Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel S. Demenkov, Alexey V. Kochetov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov and Ralf Hofestädt
|
|
Анализ эволюции в семействах белоккодирующих генов у архей рода Pyrococcus при адаптации к высоким давлениям океанических глубин
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А.
|
|
Возможности применения микроорганизмов в переработке отходов производства биодизельного топлива с целью получения химических веществ
Сорокина К.Н. Розанов А.С. Пельтек С.Е. Колчанов Н.А. Пармон В.Н.
|
|
Компьютерный генетический конструктор для моделирования молекулярно-генетических процессов в бактериальной клетке: анализ циклической генной сети Изд-во СО РАН, Новосибирск. 2010, Глава 6.5, С. 392-404.
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
|
|
Компьютерный генетический конструктор: математическое моделирование генетических и метаболических подсистем E. coli
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Ратушный А.В., Лашин С.А., Турнаев И.И., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Колчанов Н.А.
|
|
Роль микроорганизмов в функционировании живых систем: фундаментальные проблемы и биоинженерные приложения
И. С. Андреева, А. В. Брянская, С. М. Жмодик, В. А. Лихошвай, Б. Б. Намсараев, Д. Ю. Рогозин, О. П. Таран, С. Е. Ткачев, Е. А. Ананько, K. Aсано, Д. А. Афонников, Т. Г. Банзаракцаева, Д. Д. Бархутова, Ж. Батаа, В. В. Бахвалова, С. И. Беликов, В. М. Белолипецкий, П. В. Белолипецкий, Т. К. Белянин, А. А. Богуш, Е. В. Болдырева, Е. Н. Болдарева, A. В. Брушков, Л. И. Бурцева, С. П. Бурюхаев, В. В. Власов, С. Н. Генова, Н. А. Гольцова, В. М. Горленко, К. В. Гунбин, Э. В. Данилова, А. Г. Дегерменджи, М. А. Дымова, Е. К. Емельянова, В. И. Жираковский, А. В. Задорожный, С. С. Ибрагимова, Л. И. Иванов, Г. В. Калмыкова, Т. П. Камынина, А. В. Качко, И. В. Козлова, Л. П. Козырева, Ю. П. Колмогоров, Н. А. Колчанов, В. Н. Компаниченко, Е. В. Лаврентьева, Е. В. Лазарева, С. А. Лашин, С. Г. Ливанов, Н. Н. Ливанова, Ю. Г. Матушкин, И. B. Морозов, О. В. Морозова, З. Б. Намсараев, С. Ф. Орешкова, Д. Ю. Ощепков, В. В. Панов, В. Н. Пармон, С. Е. Пельтек, Н. И. Печуркина, О. А. Подколодная, В. А. Пономарчук, И. Г. Прокопкин, В. Г. Пугачев, Н. М. Пуховская, Л. И. Пучкова, В. А. Рар, А. В. Ратушный, В. Е. Репин, А. С. Розанов, Е. И. Рябчикова, Ю. В. Сабитова, И. В. Саранина, Д. В. Семенова, В. А. Симонов, О. Г. Смирнова, К. Н. Сорокина, Т. Ю. Степанова, О. В. Стронин, В. В. Суслов, M. Taнака, О. С. Таранов, Н. В. Тикунова, И. И. Турнаев, Т. Торок, О. Д. Тотменина, М. Ю. Трусова, M. Утсуми, М. Л. Филипенко, Н. В. Фоменко, M. Фукуда, М. А. Хаснатинов, Т. М. Хлебодарова, Д. Д. Цыренова
|
|
Экспериментально-компьютерное конструирование и анализ бактериальных геносенсоров для детекции токсичности окружающей среды
Хлебодарова Т.М., Тикунова Н.В., Лихошвай В.А., Качко А.В., Степанова Т.Ю., Ощепков Д.Ю., Задорожный А.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
|
| 2008 |
Cистемная компьютерная биология. Ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А., Изд-во СО РАН, Новосибирск
Хлебодарова Т.М., Тикунова Н.В., Качко А.В., Степаненко И.Л., Колчанов Н.А.
|
|
«Системная компьютерная биология». Отв. Редакторы: Н.А.Колчанов, С.С.Гончаров., В.А. Лихошвай, В.А. Иванисенко , Н: Изд. СО РАН, , 2008, 761с
Н.А.Колчанов, С.С.Гончаров., В.А. Лихошвай, В.А. Иванисенко
|
|
Анализ режима адаптивной эволюции в белках вируса гепатита С. В Системная компьютерная биология, под ред. Колчанова Н.А., Гончарова С.С., Лихошвая, В.А., Иванисенко В.А., Новисибирск, 2008, Изд-во СО РАН, с. 602-610.
Варламова Е.С., Афонников Д.А., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
|
|
Глава 6. Компьютерная биология развития. Раздел 6.3. Морфогенез растений: реконструкция в базах данных и моделирование.
Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Подколодный Н.А., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Пененко А.В., Лавреха В.В., Зубаирова У.С., Колчанов Н.А.
|
|
Исследование эволюции генов Hh-каскада сигналов
Гунбин К.В., Колчанов Н.А.
|
|
Классификация локального пространственного окружения аминокислотных остатков по физико-химическим свойствам. В Системная компьютерная биология, под ред. Колчанова Н.А., Гончарова С.С., Лихошвая, В.А., Иванисенко В.А., Новисибирск, 2008, Изд-во СО РАН, с. 281-289.
Афонников Д.А., Колчанов Н.А.
|
|
Компьютерная транскриптомика. Трансляция. В монографии «Системная Компьютерная Биология». Под ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А.
Кочетов А.В., Вишневский О.В., Волкова О.А., Владимиров Н.В., Лихошвай В.А. Матушкин Ю.Г., Григорович Д.А., Нишида Х., Сараи А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Пономаренко М.П., Титов И.И., Колчанов Н.А.
|
|
Методы моделирования динамики молекулярно-генетических систем
Лихошвай В.А., Ратушный А.В., Бажан. С.И., Ощепкова Е.А., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
|
|
Моделирование эволюции сообществ: программа “Эволюционный конструктор” // В монографии: Системная компьютерная биология. Ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А.
Лашин С.А., Суслов В.В., Лихошвай В.А., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
|
|
Морфогенез животных: реконструкция в базах данных и моделирование
Гунбин К.В., Омельянчук Л.В., Ананько Е.А., Когай В.В., Фадеев С.И., Колчанов Н.А.
|
|
Понятие о генных сетях. База данных GeneNet.
Ананько Е.А., Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
|
|
Процессы морфогенеза и подходы к их моделированию
Николаев С.В., Гунбин К.В., Омельянчук Н.А., Суслов В.В., Омельянчук Л.В., Колчанов Н.А.
|
|
Распознавание функциональных сайтов в пространственных структурах белков
Иванисенко В.А., Деменков П.С., Фомин Э.С., Крестьянова М.А., Ощурков И.С., Иванисенко Т.В., Иванисенко Н.В., Пинтус С.С., Яркова Е.Э., Степаненко И.Л., Сурнина Н.Ю., Гончаров С.С., Колчанов Н.А.
|
|
Регуляторные последовательности ДНК: исследование компьютерными методами.
Ощепков Д.Ю., Бугреев Д.В., Невинский Г.А., Колчанов Н.А., Игнатьева Е.В., Климова Н.В., Васильев Г.В., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Воробьев Ю.Н., Емельянов Д.Ю., Левицкий В.Г., Ананько Е.А., Вишневский О.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В.
|
|
Регуляторные последовательности ДНК: описание в базах данных.
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Степаненко И.Л., Хлебодарова Т.М., Меркулова Т.И., Меркулов В.М., Мищенко Е.Л., Ибрагимова С.С., Смирнова О.Г., Подколодный Н.Л., Ромащенко А.Г., Ощепков Д.Ю., Мигинский Д.С.
|
| 2007 |
The Hedgehog Signaling Cascade System: Evolution and Functional Dynamics
Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Omelyanchuk L.V., Kolchanov N.A.
|
| 2006 |
STUDY OF THE INTERACTIONS BETWEEN VIRAL AND HUMAN GENOMES DURING TRANSFORMATION OF B CELLS WITH EPSTEIN-BARR VIRUS
E. Ananko, D. Oshchepkov, E. Nedosekina, V. Levitsky, I. Lokhova, O. Smirnova, V. Likhoshvai, N. Kolchanov.
|
|
TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS DATABASE (TRRD): A SOURCE OF EXPERIMENTALLY CONFIRMED DATA ON TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS OF EUKARYOTIC GENES
N. Kolchanov, E. Ignatieva, O. Podkolodnaya, E. Ananko, I. Stepanenko, T. Merkulova, T. Khlebodarova, V. Merkulov, N. Podkolodny, D. Grigorovich, A. Poplavsky, A. Romashchenko
|
| 2004 |
Bioinformatics of genome regulation and structure. N.Kolchanov and R.Hofestaedt (ed.)
Oshchepkov D.Yu., Turnaev I.I., Pozdnyakov M.A., Milanesi L., Vityaev E.E., Kolchanov N.A
|
Конференции
| 2024 |
Онтологический подход к анализу дифференциальной экспрессии генов на основе больших транскриптомных данных
Ощепков Д.Ю., Чадаева И.В. , Кожемякина Р.В., Золотарева К., Хандаев Б., Шарыпова Е.Б., Пономаренко П.М., Богомолов А.Г., Климова Н.В., Шихевич С.Г., Редина О.Е., Колосова Н.Г., Назаренко М., Колчанов Н.А., Маркель А.Л., Пономаренко М.П.
[Международный Конгресс «VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы»]
|
| 2022 |
Domestication explains 2/3 of differential gene expression variance between domestic and wild animals; the remaining 1/3 reflects intraspecific and interspecific variation
Irina Chadaeva, Petr Ponomarenko, Rimma Kozhemyakina, Valentin Suslov, Anton Bogomolov, Natalya Klimova, Svetlana Shikhevich, Ludmila Savinkova, Dmitry Oshchepkov, Nikolay A. Kolchanov, Arcady Markel, Mikhail Ponomarenko
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference]
|
|
Metabolic engineering of corynebacteria to create a producer of L-valine.
Sheremetieva M.E., Khlebodarova T.M., Anufriev K.E., Ryabchenko L.E., Leonova T.E., Kalinina T.I., Gerasimova T.V., Rozantseva V.V., Kolchanov N.A., Yanenko A.S.
[13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Modelling of eco-evolutionary dynamics in microbial
communities with haploid evolutionary constructor
Klimenko A.I., Matushkin Yu.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
On organizing a software platform for seeking
biotechnologically important features in bacteria
Lashin S., Demenkov P., Ivanisenko V., Kazantsev F., Mukhin A.,
Kolchanov N
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
| 2021 |
A feedback loop enrchment analysis in gene network of bronchial asthma and pulmonary tuberculosis interaction
Evgeny S. Tiys, Pavel S. Demenkov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov
[BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
| 2020 |
ANDDIGEST: A TEXT-MINING BASED COMPUTER SYSTEM FOR GENERATING DIGESTS IN THE FIELD OF BIOLOGY
IVANISENKO TIMOFEY, DEMENKOV PAVEL, IVANISENKO VLADIMIR, KOLCHANOV NIKOLAY
[BGRS/SB-2020. THE 12TH INTERNATIONAL MULTICONFERENCE]
|
| 2019 |
Наночастицы и мозг
Мошкин М.П., Колчанов Н.А.
[Научная сессия Отделения нанотехнологий и информационных технологий Российской академии наук (ОНИТ РАН) «Наночастицы в медицине и биологии».]
|
|
Antagonistic evolutionary scenarios in microbial communities are played out under ecological stratification fostered by spatial gradients
A.I. Klimenko, Yu.G. Matushkin, N.A. Kolchanov, S.A. Lashin
[The International Society for Ecological Modelling Global Conference 2019]
|
|
Новый маркерный признак низкодифференцированных клеток эукариот и области его применения в биологии и медицине
Богачев С.С., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Долгова Е.В., Риттер Г.С., Андрушкевич О.М., Ефремов Я.Р., Байбородин С.И., Николин В.П., Попова Н.А., Леплина О.Ю., Останин А.А., Черных Е.Р., Мишинов С.В., Ступак В.В., Таранов О.С., Сидоров С.В., Колчанов Н.А.
[Международный конгресс «VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы»]
|
|
Препарат двуцепочечной РНК из дрожжей Saccharomyces сerevisiae как новое радиопротекторное средство
Риттер Г.С., Николин В.П., Попова Н.А., Кисаретова П.Э., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Кирикович С.С., Байбородин С.И., Таранов О.С., Ефремов Я.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[Международный конгресс «VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы»]
|
| 2018 |
Системная компьютерная биология и биоинформатика: моделирование и компьютерный дизайн экспериментов по созданию штаммов с целевыми свойствами
Колчанов Н.А., Пельтек С.Е., Розанов А.С., Лашин С.А.
[Генетика микроорганизмов: от геномики к биоэкономике]
|
|
Systems biology research at the SBB young scientists school series
Orlov Y.L., Wong L., Tatarinova T.V., Hofestädt R., Kolchanov N.A.
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
|
|
Изучение радиопротекторного действия двуцепочечной РНК, выделенной из дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Риттер Г.С., Николин В.П., Попова Н.А., Кисаретова П.Э., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Кирикович С.С., Байбородин С.И., Таранов О.С., Ефремов Я.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[Четвертый междисциплинарный научный форум с международным участием «Новые материалы и перспективные технологии»]
|
|
Новый подход к поиску радиопротекторов
Риттер Г.С., Николин В.П., Попова Н.А., Кисаретова П.Э., Долгова Е.В., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Кирикович С.С., Байбородин С.И., Таранов О.С., Ефремов Я.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С.
[V МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОТЕХНОЛОГОВ, МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ И ВИРУСОЛОГОВ OpenBio-2018]
|
|
Программные средства для комплексного анализа генных сетей
С.А. Лашин, З.С. Мустафин, В.И. Замятин, Д.А. Афонников, Ю.Г. Матушкин, Н.А. Колчанов
[V Международная конференция. «Постгеном 2018». В поисках моделей персонализированной медицины]
|
|
Программные средства для построения и анализа сложных моделей микробного метаболизма и микробных сообществ
Лашин С.А, Матушкин Ю.Г., Клименко А.И., Афонников Д.А.,
Казанцев Ф.В., Лихошвай В.А., Мустафин З.С., Колчанов Н.А.
[Школа-конференция «Генетика микроорганизмов: от геномики к биоэкономике»]
|
| 2017 |
Regulatory circuits in gene networks: organization and evolution
Колчанов Н.А., Лашин С.А.
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
|
|
Фаговая инфекция замедляет видообразование, вызванное горизонтальным переносом и потерей генов метаболизма в моделях пространственно гетерогенных микробных сообществ
Ю.Г. Матушкин, А.И. Клименко, Н.А. Колчанов, С.А. Лашин
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
|
|
The Genome of Opisthorchis felineus
N. Ershov, M. Pomaznoy, D. Afonnikov, K. Gunbin, M. Genaev, K. Ustiantsev, M. Pakharukova, E. Prokhortchouk, A. Mazur, N. Chekanov, K. Skryabin, N. Kolchanov, et al., V. Mordvinov
[Asian Neglected Tropical Disease Conference 2017 (NTDASIA2017)]
|
|
Изучение механического поведения клеток в рамках клеточно-ориентированной модели роста листа пшеницы
Зубаирова У.С., Николаев С.В., Пененко А.В., Подколодный Н.Л., Голушко С.К., Афонников Д.А., Колчанов Н.А.
[Девятая международная молодежная научная школа-конференция "Теория и численные методы решения обратных и некорректных задач", посвященная 85-летию со дня рождения академика М.М. Лаврентьева]
|
|
Сахарный диабет в эпоху «омиксных технологий»
О.В. Сайк, П.С. Деменков, Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко
[II Междисциплинарная конференция "Сахарный диабет-2017: от мониторинга к управлению"]
|
| 2016 |
Доклад по проекту СБИ «Селекционный центр». Заседание рабочей группы представителей территорий - участников программы «Сибирская биотехнологическая инициатива» (СБИ)
Колчанов Николай Александрович, Лаврюшев Сергей Вячеславович, Кочетов Алексей Владимирович
[Площадка открытых коммуникаций OPENBIO 2016 – комплекс мероприятий, посвященных коммерциализации идей и развитию бизнеса в сфере наук о жизни. Форум для бизнеса, науки, власти и инфраструктуры]
|
|
ANDSystem: система автоматического извлечения знаний и интеграции омиксных данных.
В.А. Иванисенко, О.В. Сайк, Н.В. Иванисенко, Т.В. Иванисенко, П.С. Деменков, Н.А. Колчанов
[V СЪЕЗД ФИЗИОЛОГОВ СНГ и V СЪЕЗД БИОХИМИКОВ РОССИИ]
|
|
ASSOCIATIVE NETWORKS OF GLAUCOMA AND APOPTOSIS
O.V. Saik, P.S. Demenkov, O.S. Konovalova, M.N. Ponomareva, N.A. Konovalova, N.A. Kolchanov, I.N. Lavrik, V.A. Ivanisenko
[BGRS\SB-2016]
|
|
Argo-CUDA: a full-exhaustive GPU based approach for a motif discovery in the large DNA datasets.
O.V. Vishnevsky, A.V. Bocharnikov, N.A. Kolchanov
[Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology]
|
|
Candidate SNP markers of aggressiveness-related complications and comorbidities of hereditary diseases predicted by a significant alteration in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters
M.P. Ponomarenko, D.A. Rasskazov, E.B. Sharypova, I.V. Chadaeva, P.M. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov
[BGRS\SB-2016: the International Satellite Symposium “Systems Biology and Biomedicine, SBioMed-2016"]
|
|
Computer simulation of the trichome patterning on growing wheat leaf taking into account the biomechanics of cells
U.S. Zubairova, S.V. Nikolaev, A.V. Penenko, N.L. Podkolodnyy, S.K. Golushko, D.A. Afonnikov, and N.A. Kolchanov
[BGRS\SB-2016]
|
|
Microbial Community of the Extremal Ecosystems of the Uzon Caldera (Kamchatka)
S.E. Peltek, A.V. Bryanskaya, Y.E. Uvarova, A.S. Rozanov, T.V. Ivanisenko, T.K. Malup, V.A. Ivanisenko, E.V. Lazareva, O.V. Saik, V.M. Efimov, S.M. Zhmodik, O.P. Taran, N.M. Slynko, S.V. Shekhovtsov, V.N. Parmon, N.L. Dobretsov, N.A. Kolchanov
[7th World Congress onMicrobiology]
|
|
Microbial community of the oil site of the Uzon caldera (Kamchatka)
S.E. Peltek, A.V. Bryanskaya, Y.E. Uvarova, A.S. Rozanov, T.V. Ivanisenko, T.K. Malup, V.A. Ivanisenko, E.V. Lazareva, O.V. Saik, S.M. Zhmodik, O.P. Taran, N.M. Slynko, S.V. Shekhovtsov, V.N. Parmon, N.L. Dobretsov, N.A. Kolchanov
[10th anniversary International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology»]
|
|
Nonthermal impact terahertz radiation on the living systems
I.A.Mescheryakova, E.V.Demidova, T.N.Goryachkovskaya, E.A.Demidov, A.V.Bryanskaya, S.V.Sergeeva, S.L.Kiselev, M.A. Lagarkova, G.N.Kulipanov, A.I.Semenov, N.A.Vinokurov, N.A.Kolchanov, V.M.Popik, S.E.Peltek
[Десятая Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology), BGRS\SB-2016]
|
|
PHAGE INFECTION SLOWS DOWN SPECIATION CAUSED BY GENE LOSS AND HORIZONTAL GENE TRANSFER OF METABOLIC GENES IN MODELS OF SPATIALLY DISTRIBUTED BACTERIAL COMMUNITIES
A. I. Klimenko, Yu.G. Matushkin, N.A. Kolchanov, S.A. Lashin
[The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
Thermophilic Microbial Community of the Extremal Ecosystems
S.E. Peltek, A.V. Bryanskaya, Y.E. Uvarova, A.S. Rozanov, T.V. Ivanisenko, T.K. Malup, V.A. Ivanisenko, E.V. Lazareva, O.V. Saik, V.M. Efimov, S.M. Zhmodik, O.P. Taran, N.M. Slynko, S.V. Shekhovtsov, V.N. Parmon, N.L. Dobretsov, N.A. Kolchanov
[The Fifth International Conference on Sustainable Utilization of Tropical Plant Biomass - Bioproducts, Biocatalysts, and Biorefinery (SUTB4), 17th to 18th November 2016 Coimbatore, Tamilnadu, India]
|
|
Микробные сообщества экстремальных экосистем; метагеномный подход
С.Е. Пельтек, А.В. Брянская, Ю.Е. Уварова, А.С. Розанов, Т.В. Иванисенко, Т.К. Малуп, В.А. Иванисенко, Е.В. Лазарева, О.В. Сайк, С.М. Жмодик, О.П. Таран, Н.М. Слынько, С.В. Шеховцов, В.Н. Пармон, Н.Л. Добрецов, Н.А. Колчанов
[V Съезд биохимиков России]
|
|
Состояние и перспективы использования маркёр-ориентированной и геномной селекции растений
Н.А. Колчанов, А.В. Кочетов, Е.А. Салина, Л.А. Першина, Е.К. Хлесткина, В.К. Шумный
[Научная сессия общего собрания членов РАН на тему: «Генетические ресурсы растений, животных и микроорганизмов на службе человечества»]
|
|
УПРАВЛЕНИЕ БИОСИНТЕЗОМ КРАХМАЛА В КЛУБНЯХ КАРТОФЕЛЯ: ПОТЕНЦИАЛЬНЫЕ ГЕНЫ-МИШЕНИ
В.К. Хлесткин, С.Е. Пельтек, Н.А. Колчанов
[Проблемы систематики и селекции картофеля]
|
| 2015 |
«Информация и модели её целенаправленного распространения в Интернет»
Зыбарев Ю.М., Колчанов Н.А., Лаврюшев C.В.
[Vll Сибирский форум Индустрии Информационных Систем - 2015]
|
|
ANDSystem: automated literature mining and protein interactome networks reconstruction
Saik O.V., Demenkov P.S., Tiys E.S., Ivanisenko T.V., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[VII РОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ «БЕЛКИ И ПЕПТИДЫ»]
|
|
TATA-BOX AS GENOME WIDE VARIABILITY VARIATOR
M.P. Ponomarenko, V.V. Suslov, K.V. Gunbin, P.M. Ponomarenko, O.V. Vishnevsky, N.A. Kolchanov
[IV международная Конференция, посвященная Н.В.Тимофееву-Ресовскому “Современные проблемы генетики, радиобиологии, радиоэкологии и эволюции”]
|
|
Многомерная модель голосования для описания динамики социальной группы
Титов И.И., Колчанов Н.А.
[Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2015 (AMCA 2015)]
|
|
Системная компьютерная биология: анализ и моделирование структурно- функциональной организации и эволюции генных сетей
Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, В.А. Иванисенко, Ю.Г. Матушкин, Н.А. Колчанов
[Международная конференция «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2015»]
|
|
Центры генетических ресурсов лабораторных животных в инфраструктурном обеспечении трансляционных исследований
Мошкин М.П., Колчанов Н.А.
[Конференция «Центры коллективного пользования и уникальные научные установки в организациях, подведомственных ФАНО России"]
|
|
Экспериментально-компьютерная инженерия метаболических путей при создании суперпродуцентов бактерий и дрожжей
Акбердин И.Р., Котенко А.В., Розанов А.С., Колчанов Н.А., Пельтек С.Е.
[VIII Московский международный конгресс "БИОТЕХНОЛОГИЯ:СОСТОЯНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ"]
|
| 2014 |
The modeling of regulatory mechanisms for mESC self-renewal: kinetic and stochastic approaches
Akberdin I.R., Ivanisenko N.V., Oschepkova E.A., Omelyanchuk N.A., Matushkin Yu.G., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине]
|
|
A machine learning analysis of urine proteomics in space-flight simulations
Binder H., Wirth H., Arakelyan A., Lembcke K., Tiys E.S., Ivanishenko V., Kolchanov N.A., Kononikhin A., Popov I., Nikolaev E.N., Pastushkova L., Larina I.M
[BGRS\SB-2014]
|
|
ANDSystem: automated literature mining and interactome networks reconstruction in the area of biology
O.V. Saik, E.S. Tiys, T.V. Ivanisenko, P.S. Demenkov, N.A. Kolchanov, V.A. Ivanisenko
[HUPO2014 the 13th World Congress of the Human Proteome Organization]
|
|
Functional characteristics of human genes containing low level of promoter polymorphism revealed from the 1000 genomes project dataset.
Ignatieva E.V., V.G. Levitsky, N.A. Kolchanov
[The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS/SB-2014)]
|
|
Mathematical model for subgenomic Hepatitis C Virus replication: impact of drug resistance emergence on long-term kinetics of NS3 protease inhibitors action
Ivanisenko N., Mishchenko E., Akberdin I., Demenkov P., Kozlov K., Todorov D., Gursky V.V., Samsonova M.G., Samsonov A.M., Clausznitzer D., Kaderali L., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[9th BGRS\SB-2014]
|
|
Mathematical modeling of the interactions between molecular genetic systems based on the data about perturbations of the systems elements
Popik O.V., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A
[9th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
|
|
Microbial Communities of the Thermal Springs of the Geyser Valley and Uzon Caldera (Kamchatka) Using Pyrosequencing
A.V. Bryanskaya, A. S. Rozanov, T. K. Malup, E. V. Lasareva, O. P. Taran, T. V. Ivanisenko, V. A. Ivanisenko, N. A. Kolchanov, S. E. Peltek
[10th International Congress on Extremophiles]
|
|
Regulatory mechanisms for mESC self-renewal: kinetic and stochastic modeling
Akberdin I.R., Ivanisenko N.V., Oshchepkova E.A., Omelyanchuk N.A., Matushkin Yu.G., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[9th BGRS\SB-2014]
|
|
The Сompilation of Human Gene Networks Controlling Feeding Behavior and Thermoregulation
E.V. Ignatieva, O.V.Saik, O.A. Podkolodnaya, N.N. Podkolodnaya, P.S. Demenkov, E.S. Tiys, E.A. Oshchepkova, E.A. Ananko, N.V. Ivanisenko, O.V. Popik, N.L. Podkolodny, V.A. Ivanisenko, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov, E.I. Rogaev
[The first international scientific conference "Science of the Future"]
|
|
Using ANDSystem for automated literature mining and protein interactome networks reconstruction
O.V. Saik, E.S. Tiys, T.V. Ivanisenko, P.S. Demenkov, L.H. Pastushkova, I.M. Larina, E.N. Nikolaev, N.A. Kolchanov, V.A. Ivanisenko
[HUPO2014 the 13th World Congress of the Human Proteome Organization]
|
|
Интеграция геномных и транскриптомных данных о хромосомных контактах в геноме человека, полученных по методу ChIA-PET // Сборник трудов IV международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» Постгеном-2014, 29 октября – 1 ноября 2014, г.Казань. Издательство Казанского (Приволжского) Федерального Университета (ISBN 987-5-00019-293-1) S05-24, С.150.
Орлов Ю.Л., Кулакова Е.В, Спицина А.М., Дергилев А.И., Свичкарев А.В., Афонников Д.А., Чен М., Ли Г., Руан Й., Колчанов Н.А.
[Постгеном-2014 «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»]
|
|
К ПРОБЛЕМЕ ДИСТРОПИИ: ТУБЕРКУЛЕЗ И БРОНХИАЛЬНАЯ АСТМА
ЕЮ Брагина, ЕС Тийс, МБ Фрейдин, ЛА Конева, ВА Иванисенко, ПС Деменков, НА Колчанов, ВП Пузырёв
[ГЕНЕТИКА ЧЕЛОВЕКА И ПАТОЛОГИЯ Проблемы эволюционной медицины]
|
|
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ БЕЛКОВ CRMB ВИРУСА ОСПЫ КОРОВ И ВИРУСА НАТУРАЛЬНОЙ ОСПЫ С ФАКТОРОМ НЕКРОЗА ОПУХОЛЕЙ ЧЕЛОВЕКА
Иванисенко Никита Владимирович, Трегубчак Т.В., Сайк О.В., Щелкунов С.Н., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[XXI Российский национальный конгресс "Человек и Лекарство"]
|
|
Суперкомпьютерные технологии в решении задач биоинформатики
Глинский Б.М., Кучин Н.В., Черных И.Г., Орлов Ю.Л., Подколодный Н.Л., Лихошвай В.А., Колчанов Н.А.
[Национальный Суперкомпьютерный форум-2014 (НСКФ-2014)]
|
| 2013 |
3D organization of chromosomes mediated by RNAPII complex contacts in human genome
Y.L. Orlov, D.A. Afonnikov, N.R. Battulin, O.L. Serov, N.A. Kolchanov, Guoliang Li, Yijun Ruan
[MCCMB-2013 (Московская конференция по компьютерной молекулярной биологии)]
|
|
Computer analysis of transcription factor binding sites in genome scale based on ChIP-seq data
Yuriy L. Orlov, Vladimir A. Ivanisenko, Alexey V. Kochetov, Nikolay A. Kolchanov
[German-Russian Forum Biotechnology, Rostock 2013]
|
|
Биоинформационный анализ экспрессии генов в клетках мозга
Орлов Ю.Л., Вишневский О.В., Витяев Е.Е., Кожевникова О.С., Афонников Д.А., Колчанов Н.А.
[«Нейроинформатика-2013», XV Всероссийская научно-техническая конференция]
|
|
Сравнительный анализ состава микробного сообщества воды и бентоса термального источника Заварзина, кальдера Узон, Камчатка
Розанов А.С., Брянская А.В., Малуп Т.К., Лазарева Е.В., Таран О.П., Иванисенко Т.В., Иванисенко В.А., Жмодик С.М., Колчанов Н.А., Пельтек С.Е.
[международная научная конференция «Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний»]
|
|
ТАТА Box as molecular markers of Human origin and evolution
Nikolay Kolchanov, Konstantin Gunbin
[Federation of European Biochemical Societies CONGRESS 2013 “Mechanisms in Biology”]
|
| 2012 |
Реконструкция процессов антропогенеза: анализ геномов представителей древнего и современного населения Сибири
Колчанов Н.А., Мордвинов В.А., Афонников Д.А., Гунбин К.В., Пилипенко А.С., Молодин В.И., Деревянко А.П.
[Мега-структура евразийского мира: основные этапы сложения]
|
|
WHOLE GENOME ANALYSIS OF THE DEVELOPMENT GENES REGULATED BY TRANSCRIPTION FACTORS IN MICE AND D. RERIO USING THE CHIP-SEQ TECHNOLOGY
Orlov Yu., Ershov N., Vinata S., Kondrikhin I., Matavan I., Afonnikov D., Kolchanov N.
[III международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» (Postgenome-2012).]
|
|
Computer analysis of 3D chromosome contacts mediated by RNA Pol II in human
Yuriy L. Orlov, Guoliang Li, Kuljeet S. Sandhu, Melissa J. Fullwood, Dmitriy A. Afonnikov, Chialin Wei, Oleg L. Serov, Nikolay A. Kolchanov, Yijun Ruan
[Международный симпозиум «SysPatho-Системная биология и медицина»]
|
|
Modeling and analysis of dynamics of the gene networks: automatic generation and storage in a new database
Akberdin I.R., Kazantsev F.V., Ree N.A., Timonov V.S., Oshchepkova E.A., Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Fadeev S.I., Kolchanov N.A., Likhoshvai V.A.
[Международный симпозиум "Syspatho-Системная биология и медицина"]
|
|
A stochastic model for suppression of subgenomic hepatitis C virus replication in Huh-7 cells.
N.V. Ivanisenko, E.L. Mishchenko, I.R. Akberdin, P.S. Demenkov, V.A. Likhoshvai, M.G. Samsonova, D. Clausznitzer, L. Kaderali, N.A. Kolchanov and V.A. Ivanisenko
[Международный симпозиум "Syspatho-Системная биология и медицина"]
|
|
HIGH PERFORMANCE COMPUTING IN BIOINFORMATICS: CASE STUDIES
N. L. Podkolodnyy, P.S. Demenkov, K.V. Gunbin, Y.L. Orlov, E.S. Fomin, N.A. Alemasov, F.A. Kazantsev, O.V. Vishnevsky, V.A.Ivanisenko, D.A. Afonnikov, N.V. Kuchin, B.M. Glinsky, N.A. Kolchanov
[The eighth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure \ System biology (BGRS\SB'2012)]
|
|
Human brain origin and the evolution of regulatory and coding regions of protein-coding genes expressed in brain.
Kolchanov N.A., Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Ponomarenko M.P., Derevyanko A.P.
[SysPatho Workshop “SYSTEMS BIOLOGY AND MEDICINE”]
|
|
Human brain origin and the evolution of regulatory and coding regions of proteincoding genes expressed in brain
K.V. Gunbin, M.P. Ponomarenko, D.A. Afonnikov, N.A Kolchanov
[III Moscow Conference «Molecular Phylogenetics» (MolPhy-3)]
|
|
IMPORTANT ROLE OF THE miRNA CHANGES IN THE HOMO NEANDERTHALENSIS AND HOMO DENISOVA EVOLUTION
K.V. Gunbin, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov, A.P. Derevyanko
[EIGHTH INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE\SYSTEMS BIOLOGY BGRS\SB’12]
|
|
Important role of the miRNA changes in the Homo neanderthalensis and Homo denisova evolution
K.V. Gunbin, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov, A.P. Derevyanko
[III Moscow Conference «Molecular Phylogenetics» (MolPhy-3)]
|
|
SUPPRESSION OF SUBGENOMIC HCV RNA BY NS3 PROTEASE ANTIVIRALS IN CELLS: A BASIC STOCHASTIC MATHEMATICAL MODEL
Ivanisenko N.V., Mishchenko E.L., Akberdin I.R., Demenkov P.S., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
Исследование закономерностей развития самоорганизующихся социально-биологических систем
Подколодный Н.Л., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Лашин С.А., Семенычев А.В., Рассказов Д.А., Титов И.И., Колчанов Н.А.
[XIV Российская конференция с международным участием "Распределенные информационные и вычислительные ресурсы" (DICR-2012)]
|
|
Нанобиобезопасность. Мультидисциплинарный подход к изучению биологических эффектов наноаэрозолей
Колчанов Н.А., Мошкин М.П., Герлинская Л.А., Пельтек С.Е., Петровский Д.В., Акулов А.Е., Ромащенко А.В., Горячковская Т.Н., Концевая Г.В., Сагдеев Р.З., Коптюг И.В., Савелов А., Фомин В., Ганимедов В., Садовский А., Мучная М., Бухтияров В., Троицкий С.Ю., Попик В.
[III международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» (Postgenome-2012).]
|
|
Протеомный ответ бактериальных клеток на нетермическое воздействие терагерцового излучения
Пельтек С.Е., Горячковская Т.Н, Демидова Е. В., Мещерякова И.А., Семенов А.И, Демидов Е.А., Попик В.М., Кулипанов Г.Н., Колчанов Н.А.
[Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине]
|
| 2011 |
A mathematical model for the suppression of subgenomic Hepatitis C virus replication in Huh-7 cells in the presence of the NS3 protease inhibitors
Мищенко Е., Иванисенко Н., Акбердин И., Лихошвай В., Козлов К., Гурский В., Самсонова М., Колчанов Н., Иванисенко В.
[International Conference on Systems Biology (ICSB 2011), Хайдельберг, Германия, 28 августа-1 сентября]
|
|
Gene networks and the evolution of biological systems.
Kolchanov N.A., Afonnikov D.A., Gunbin K.V., Suslov V.V.
[III International Conference “Biosphere origin and evolution”]
|
|
Human and Neanderthal miRNA genes are not so similar.
Gunbin K., Afonnikov D., Kolchanov N.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology, MCCMB’11]
|
|
Novosibirsk FEL terahertz emission for biological application
Peltek S.E., Demidov E.A., Demidova E.V., Goryachkovskaya T.N., Kolchanov N.A., Kulipanov G.N., Mesheryakova I.A., Popik V.M., Scheglov M.A., Vinokurov N.A.
[2nd International THz-Bio Workshop]
|
|
The visual reconstruction and analysis of biomolecular systems: The GeneNet software in 2011
Vladimir Timonov, Fedor Kazantsev, Konstantin Gunbin, Ilya Akberdin, Pavel Demenkov, Elena Ananko, Nikolay Podkolodny, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov
[International German/Russian Summer School on Integrative Biological Pathway Analysis and Simulation]
|
|
VISUALIZATION AND ANALYSIS OF A CARDIO VASCULAR DISEASE-RELATED BIOLOGICAL NETWORK COMBINING TEXT MINING AND DATA WAREHOUSE APPROACHES
Ralf Hofestädt, Björn Sommer, Evgeny Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian Janowski, Timofey Ivanisenko, Anatoly Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel Demenkov, Alexey Kochetov, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology 2011]
|
|
Автоматическая реконструкция ассоциативных генных сетей на примере анализа протеома мочи
Тийс Е.С., Деменков П.С., Доброхотов И.В., Валеева О.А., Пастушкова Л.Х., Николаев Е.Н., Ларина И.М., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А.
[Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика, г. Новосибирск, 14-17 ноября 2011 г.]
|
|
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияние мутаций на молекулярно-генетические системы организмов
Пономаренко М.П., Игнатьева Е.В., Левицкий В.Г., Савинкова Л.К., Захаренко Л.П., Пинтус С.С., Суслов В.В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
[Программа фундаментальных исследований Президиума РАН. № 11. “Биологическое разнообразие”. Подпрограмма “Генофонды и генетическое разнообразие”. Сборник материалов. – Москва: ИОГен. 2011. С. 100-104.]
|
|
Влияние полиморфизмов ТАТА-боксов, ассоциированных с наследственными заболеваниями человека, на взаимодействие с hТВР
Драчкова И.А.. Савинкова Л.К., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А.
[II-nd International conference Physico-Chemical Biology dedicated to the 85th anniversary of academician Dmitri G. Knorre.]
|
|
Выявление регуляторных SNP, ассоциированных с различными заболеваниями, с использованием данных ChIP-seq.
Меркулова Т.И., Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Пономаренко М.П., Савинкова Л.К., Васильев Г.В., Драчкова И.А., Матвеева М.Ю., Колчанов Н.А.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»]
|
|
Компьютерный анализ эволюции генных сетей морфогенеза.
Колчанов Н.А., Гунбин К.В., Суслов В.В., Афонников Д.А.
[Морфогенез в индивидуальном и историческом развитии]
|
|
МЕТОДЫ и СРЕДСТВА ВИЗУАЛЬНОЙ РЕКОНСТРУКЦИИ И АНАЛИЗА СЕТЕВЫХ МОДЕЛЕЙ ЭКОЛОГИЧЕСКИХ СИСТЕМ.
В.С. Тимонов, А.В. Семенычев, В.В. Суслов, Н.А. Колчанов.
[IV Международная конференция "Актуальные проблемы биологии, нанотехнологий и медицины"]
|
|
Математическая модель подавления репликации субгеномного репликона вируса гепатита С в клетке с ингибитором NS3 протеазы SCH503034
Мищенко Е., Иванисенко Н., Акбердин И., Лихошвай В., Козлов К., Гурский В., Самсонова М., Колчанов Н., Иванисенко В.
[Санкт-Петербургский научный форум “Наука и общество. Физиология и медицина 21 века. VI Петербургская встреча лауреатов нобелевской премии”, Санкт-Петербург, Россия, 19-23 сентября]
|
|
Метагеном озера «Кротовья ляга»
Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Розанов А.С., Брянская А.В., Кострюкова Е.С., Левицкий С.А., Селезнева О.В., Чукин М.М., Ларин А.К., Кондратов И.Г., Лазарев В.Н., Пельтек С.Е., Говорун В.М., Колчанов Н.А.
[Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине]
|
|
Моделирование генных сетей: система GeneNet в 2011 году.
Тимонов В.С., Гунбин К.В., Казанцев Ф.В., Акбердин И.Р., Деменков П.С., Лашин С.А., Ананько Е.А., Иванисенко В.А., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
[Международная конференция "Современные проблемы математики, информатики и биоинформатики"]
|
|
Персонализированная геномная медицина и современные информационные технологии
Воевода М.И., Максимов В.Н., Ромащенко А.Г., Орлова Г.В., Колчанов Н.А.
[Санкт-Петербурского научного форума «Наука и общество. Физиология и медицина XXI века»]
|
| 2010 |
Molecular evolution of the Wolbachia wRi, wMel and wPip genomes
Gunbin K.V., Ilinsky Yu.Yu., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Crimean Meeting: Third International Conference, Dedicated N.V. Timofeeff-Ressovsky “Modern Problems of Genetics, Radiobiology, Radioecology and Evolution”; Third Readings after V.I. Korogodin and V.A. Shevchenko; NATO Advanced Research Workshop “Radiobio]
|
|
A Model of Shoot Apocal Meristem Compartmentalization Based on CLV/WUS Interplay
Nikolaev SV, Zubairova US, Mjolsness ED, Shapiro BE, Smal PA, Kolchanov NA
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
A reaction-diffusion model of shoot apical meristem compartmentalization based on CLV/WUS interplay
Nikolaev S.V., Zubairova U.S., Mjolsness E., Smal P.A., Shapiro B., Kolchanov N.A.
[Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia]
|
|
Automatic knowledge extraction on structural and functional
Kolchanov N.A.
[5th International Conference "Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanobiotechnologies for Medicine", May 31-June 5, 2010. St.Petersburg-Mandrogi-Kizhi-Konevets-Valaam-St.Petersburg]
|
|
Computational systems biology
Kolchanov N.A., Podkolodnyy N.L.
[III международный форум по нанотехнологиям, 1-3 ноября 2010]
|
|
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes of protein-coding genes: relation of molecular evolution with the phenotypical features of organisms
Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Genaev M.A., Kolchanov N.A.
[2nd Moscow International Сonference "Molecular phylogenetics" (MolPhy-2)]
|
|
E.coli proteom expression under terahertz irradiation
Peltek S.E., Mesheryakova I.A., Goryachkovskaya T.N., Demidova E.V., Demidov E.A., Khlebodarova T.M., Oschepkov D.Yu., Kolchanov N.A., Popik V.M., Scheglov M.A., Vinokurov N.A., Kulipanov G.N., Nikolaev E.N.
[Terahertz radiation: generation and application]
|
|
Experimental verification of the prognosis human TBP/TATA affinity change as a result of polymorphisms associated with hereditary pathologies
I.A. Drachkova., P.M. Ponomarenko., T.V. Arshinova., M.P. Ponomarenko., L.K. Savinkova., N.A. Kolchanov.
[BGRS]
|
|
High performance computing complex of "bioinformatics" collective center of SB RAS
Podkolodnyy NL, Yudin AV, Kolchanov NA
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
Microbial metagenome annotation with bioinformatics and computational systems biology methods
Ivanisenko, Demenkov, Pintus, Ivanisenko, Goncharova, Kostjukova, Levitski, Selezneva, .... Kolchanov
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
Modified French Flag model: instability of the structure under cell growth and division
Zubairova U.S., Nikolaev S.V., Fadeev S.I., Mjolsness E., Kolchanov N.A.
[Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia]
|
|
Perspectives of the Russian-French Co-operation in Genomics, Bioinformatics and Life Sciences Modeling
Nikolay Kolchanov, Guy Riba
[the Joint Russian-French seminar "Genomics, Bioinformatics and Life Science Modeling" 18-21 June, Novosibirsk]
|
|
SNP ТАТА-бокса ВИЧ-1 и пандемия СПИД
Суслов В.В., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Ефимов В.М., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А.
[Проблемы экологии. Чтения памяти проф. М.М.Кожова. Иркутск, 2010]
|
|
SNPs IN THE HIV-1 TATA BOX AND THE AIDS PANDEMIC
V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov (6)
[IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky Crimean meeting."Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution".]
|
|
SNPs in the hiv-1 TATA box and the aids pandemic
V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov
[Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010]
|
|
The cell growth and division can destroy stem cell niche in a reaction-diffusion model
S. Nikolaev, U. Zubairova, S. Fadeev, E. Mjolsness, N. Kolchanov
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
The nanobiotechnology database
V.A. Ivanisenko, N.L. Podkolodnyy, P.S. Demenkov, T.V. Ivanisenko, N.N. Podkolodnaya, T.M. Khlebodarova, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, and N.A. Kolchanov
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'2010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
Tree Raw Material from Siberia as a Source of Immune System, Growth and Development Stimulators for Use on Plants
Kolchanov N.A.
[2nd Annual Russian-Korean Conference "Current Issues of Natural Products Chemistry and Biotechnology" which will be held from March 15th to 18th, 2010 in Novosibirsk, Russia.]
|
|
prognosis and verification of the TATA SNP effects
V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, I.A. Drachkova, N.A. Kolchanov
[Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010]
|
|
«Прогноз и экспериментальная проверка изменения сродства ТВР к ТАТА-боксам промотров генов человека, содержащим полиморфизмы».
– Драчкова ИА., Пономаренко РМ., Пономаренко МП., Аршинова ТВ., Савинкова ЛК., Колчанов НА.
[«Первые Международные Беккеровские чтения» (27-29 мая 2010)]
|
|
Возмущения за счет деления клеток в пространственно‐распределенной модели регуляции структуры ниши стволовых клеток
Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мелснесс Э., Колчанов Н.А.
[Международная конференция "Стохастические модели в биологии и предельные алгебры", 2—7 августа 2010 Омск Россия]
|
|
Генные сети: компьютерный анализ и моделирование
Колчанов. Н.А.
[Всероссийская научная конференция "Молекулярно-генетические основы функционирования цитокиновой сети в норме и при патологии", 15-17 сентября 2010г.]
|
|
Компьютерная биология
Н.А. Колчанов, Н.Л. Подколодный
[День суперкомпьютерных технологий intel в Новосибирске 22 июня 2010 г]
|
|
Компьютерное моделирование и экспериментальное конструирование генных сетей
Колчанов Н. А.
[Отчетная конференция по программе фундаментальных исследований Президиума РАН "Молекулярная и клеточная биология", 15 апреля 2010]
|
|
Модель типа реакция-диффузия механизма регуляции пространственной структуры апикальной меристемы побега
Николаев С. В. , Зубаирова У.С., Мьолснесс Э., Смаль П.А., Шапиро Б., Колчанов Н.А.
[III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино]
|
|
Молекулярная эволюция циклинов животных и грибов: зависимость между изменением белков и ростом сложности организмов
Турнаев И.И., Гунбин К.В., Суслов В.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А.
[Первая международная научно-практическая конференция. Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине]
|
|
Нестабильность структуры клеточного ансамбля в модифицированной модели трехцветного флага в результате роста и деления клеток
Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мьолснесс Э., Колчанов Н.А.
[III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино]
|
|
Подход и программные средства для описания макро- и микродинамики экосистем
Тимонов В.С., Суслов В.В., Брянская А.В., Ефимов В.М., Колчанов Н.А.
[XIII Российская конференция с участием иностранных ученых "Распределенные информационные и вычислительные ресурсы"(DICR'2010). Новосибирск, ИВТ СО РАН, 30 ноября - 4 декабря 2010 г. № гос. регистрации 0321100051]
|
|
Системная компьютерная биология
Колчанов Н.А.
[I международная научно-практической конференции "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине", ноябрь 2010, МГУ, Москва]
|
| 2009 |
A novel promoter of the Escherichia coli yfiA gene and pathways of its regulation under oxidative stress conditions
T.M. Khlebodarova, A.V. Zadorozhny, V.A. Likhoshvai, N.V. Tikunova, D.Yu. Oschepkov, N.A. Kolchanov.
[International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 09)]
|
|
Bioinformatics and systems biology
N.A. Kolchanov
[Совместное рабочее совещание Университета Тохоку и Российской Академии наук по продвижению совместных научных исследований, в рабочем совещании Японского центра по интернациональной науке и технологии]
|
|
Computational systems biology
N.A.Kolchanov
[16th session of indo-Russian joint council (ILTP)]
|
|
Detection of genes that underwent positive selection in deep-sea archaea of Pyrococcus genus
K.V. Gunbin, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov
[International Autumn School for Young Scientists on Computational Systems Biology and Bioinformatics]
|
|
Detection of genes that underwent positive selection in deep-sea archaebacteria of Pyrococcus genus
K.V. Gunbin, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov
[4th Moscow Conference on Computational Molecular Biology]
|
|
From basic genetics to biomedical applications
V.A.Mordvinov, N.Yu.Sournina, N.A.Kolchanov.
[9th LEIBNIZ CONFERENCE OF ADVANCED SCIENCE (NANOSCIENCE 2009) „Convergences of Nanoscience and Bioscience" 15-17 October 2009, Lichtenwalde, Germany]
|
|
Introduction of the host Institute of Cytology & Genetics
N.A.Kolchanov
[Российско-Геманский форум по биотехнологии]
|
|
Opisthorchis felineus and Metorchis bilis: development of ITS-2 based multiplex PCR assay for their identification and discrimination
I. I. Brusentsov, A.V. Katokhin, M.N. Lvova, Z. Sacharovskaja, A. E. Sazonov, L.M. Ogorodova, O. Fedorova, N.A. Kolchanov, V.A. Mordvinov
[Joint International Tropical Medicine Meeting 2009 (6th Seminar on Food- and Water-borne Parasitic Zoonoses (FBPZ6))]
|
|
Адаптивная эволюция археобактерий рода Pyrococcus: приспособления к обитанию в условиях высоких давлений на уровне генов и белков
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А.
[5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина]
|
|
Биоинформатика и системная биология
Колчанов Н.А.
[Международный форум Россия и германия в едином европейском пространстве. российско-германский биотехнологический кооперационный союз]
|
|
Биоинформатика: организация, функционирование и эволюция молекулярно-генетических систем
Н.А.Колчанов
[Актуальные проблемы биологии – 2009 Юбилейная научная конференция посвященная 10-летию Координационного совета "Науки о жизни" МГУ и 50-летию научной и педагогической деятельности председателя совета академика Сергея Васильевича Шестакова]
|
|
Моделирование эволюционно-популяционных процессов с помощью "Эволюционного конструктора"
Ю.Г. Матушкин, С.А. Лашин, В.В. Суслов, Н.А.Колчанов
[5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.]
|
|
Нанобиотехнология: извлечение знаний методами text-mining
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Деменков П.С., Подколодный Н.Л.
[Конференция "Химическая биология – Фундаментальные проблемы бионанотехнологии", 10 – 14 июня 2009 г., Новосибирск]
|
|
Нанобиотехнология: извлечение знаний методами text-mining
Иванисенко В.А., Деменков П. С., Подколодный Н.Л., Яркова Е. Э., Иванисенко Т. В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
[Пятый московский международный конгресс “Биотехнология: состояние и перспективы развития”]
|
|
Системная биология и биоинформатика
Колчанов Н.А.
[Петербургского научного форума "Наука и общество. Информационные технологии"]
|
|
Системная компьютерная биология
Н.А. Колчанов
[Роль организации и экспрессии генетического материала в наследственной и ненаследственной изменчивости, посвященной 90-летию кафедры генетики и селекции Санкт-Петербургского государственного университета, 24-25 сентября 2009 года.]
|
|
Терагерцовое излучение: проблемы и перспективы применения в биологии
Пельтек С.Е., Попик В.М., Колчанов Н.А., Кулипанов Г.Н., Петров А.К., Горячковская Т.Н., Козлов А.С., Мордвинов В.А., Банникова С.В., Малуп Т.К., Демидов Е.А., Дужак Т.Г., Щеглов М.А.
[Химическая биология – фундаментальные проблемы бионанотехнологии»]
|
|
Эволюция молекулярно-генетических систем
Колчанов Н.А.
[5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.]
|
| 2008 |
A MODEL STUDY OF THE ROLE OF PROTEINS CLV1, CLV2, CLV3, AND WUS IN REGULATION OF THE STRUCTURE OF THE SHOOT APICAL MERISTEM
Nikolaev S.V., Penenko A.V., Lavreha V.V., Smal P.A., Mjolsness E.D., Kolchanov N.A.
[The Sixth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008)]
|
|
AGNS (Arabidopsis genenet supplementary database), release 4.0
Omelyanchuk N.A., Mironova V.V., Zalevsky E.M., Novoselova E.S., Podkolodny N.L., Kolchanov N.A.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
Acropetal auxin transport mediates root patterning in plants
Mironova V., Likhoshvai V., Omelyanchuk N.A., Mjolsness E., Kolchanov N.A.
[In Proceeding of GARNet-SEB Symposium. Nottingham. England]
|
|
Arabidopsis thaliana miRNA abundance range correlates with the TBP/TATA-affinity of microRNA genes
Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Omelyanchuk N.A., Kolchanov N.A.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
Computer system for modelling and analysis of plant tissue growth and development
Lavreha V.V., Penenko A.V., Nikolaev S.V., Kolchanov N.A.
[The Sixth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008)]
|
|
Computer system for modelling and analysis of plant tissue growth and development
V.V. Lavreha, A.V.Penenko, S.V. Nikolaev, N.A. Kolchanov
[The European conference on Computational Biology (ECCB'08)]
|
|
Molecular evolution of the key regulatory genes in the eukaryotic cell cycle gene network
Turnaev I.I., Gunbin K.V., Kolchanov N.A.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008]
|
|
Technology for Gene Network Reconstruction and Analysis
Kolchanov N.A., Podkolodnyy N.L., Ivanisenko V.A., Ananko E.A., Demenkov P.S., Yarkova E.E.
[II-ая Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика" г. Пущино Московской области 7-13 сентября 2008 г.]
|
|
Why TATA-box hides at GLI gene molecular evolution?
Gunbin K.V., Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
the precise equilibrium equation of TBP/TATA-binding predicts human familial diseases upon mutations
Ponomarenko P.M., Savinkova L.K., Drachkova I.A., Lysova M.V., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
Компьютерный анализ, распознавание и моделировании функциональных сайтов в пространственной структуре белков
Н.А.Колчанов, В.А.Иванисенко
[XIII Национальная конференция по росту кристаллов. С 17 по 21 ноября 2008 года в Москве, Институт кристаллографии РАН]
|
| 2007 |
2d modelling and analysis of spatially distributed cells types of primary shoot apical meristem (SAM) of Arabidopsis thaliana
Ilya R. AKBERDIN, Evgeny A. OZONOV, Victorya V. MIRONOVA, Dmitry N. GORPINCHENKO, Nadezda A. OMELYANCHUK, Vitaly A. LIKHOSHVAI, Denis S. MIGINSKY, Nikolai A. KOLCHANOV
[Proceedings of the 3-rd Moscow conference on computional molecular biology. Moscow, Russia]
|
|
Adaptive evolution of genetic systems
Kolchanov N.A., Suslov V.V., Gunbin K.V.
[II International Conference "Biosphere Origin and Evolution"]
|
|
Associative network and protein structure discovery: a software complex for facilitating search of targets for drugs, drug design, and evaluation of molecular toxicity
Ivanisenko V.A., Demenkov P.S., Aman E.E., S.S. Pintus S.S., Kolchanov N.A.
[3-rd International Conference "Basic Science for Medicine", September 2-8, 2007, Novosibirsk, Russia]
|
|
Computer system for analysis and modeling 2D plant tissue
Lavreha V.V., Nikolaev S.V., Kolchanov N.A., Penenko A.V.
[3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007". July 27-31, 2007, Moscow, Russia]
|
|
Introduction of the biotechnology-scene in Novosibirsk, involved companies and potential cooperation fields
Kolchanov N.A.
[8th Meeting German / Russian Virtual Network on Computational Systems Biology Datamining and metabolic network reconstruction 5th and 6th November 2007, Germany]
|
|
Mathematical model of the Arabidopsis thaliana L. morphogenesis in a cellular automaton terms
Akberdin I.R., Ozonov E.A., Mironova V.V., Gorpinchenko D.N., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A., D.N., Kolchanov N.A.
[7th YSF "Molecular Networks", Vienna, Austria, 5 – 7 July 2007]
|
|
Modeling of the Shoot Apical Meristem Structure Regulation Based on CLV1, CLV2, CLV3 and WUS Interactions
Nikolaev S.V., Penenko A.V., Lavreha V.V., Smal P.A., Mjolsness E.D., Kolchanov N.A.
[The Eighth International Conference On Systems Biology (ICSB-2007)]
|
|
Signals influencing general translational efficiency of eukaryotic mRNAs
Ivanisenko VA, Mischenko EL, Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Titov I.I., Kolchanov N.A., Sarai A.
[3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007". July 27-31, 2007, Moscow, Russia]
|
|
The Hedgehog Signaling Cascade System: Evolution and Functional Dynamics
Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Omelyanchuk L.V., Kolchanov N.A.
[3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007"]
|
|
The origin and evolution of the biosphere: an interdisciplinary view
Kolchanov N.A., Dobretsov N.L., Zavarzin G.A., Rozanov A.Yu.
[II International Conference "Biosphere Origin and Evolution" October 28 - November 2, 2007, Loutraki, Greece]
|
|
Генные сети и эволюция регуляторных генетических систем
Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин Л.В.
[Current Evolutionary Thinking in Biology, Medicine and Sociology. International Conference Dedicated to 90 Anniversary of Prof. Dmitry K. Belyaev 7-9 August 2007, Novosibirsk, Russia]
|
|
Интеграция биоинформатических средств компьютерной протеомики и системной
Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко
[The Fifth Moscow International Congress "Biotechnology: State of the Art and Prospects of Development" 14-18 марта 2007 года]
|
|
Компьютерный анализ и моделирование бактериальных молекулярно-генетических
Николай Колчанов, Виталий Лихошвай, Александр Ратушный
[The Fifth Moscow International Congress "Biotechnology: State of the Art and Prospects of Development" 14-18 марта 2007 года]
|
|
Математическая модель репликации РНК репликона вируса гепатита С в клетке. Построение и варианты использования
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Иванисенко В.А., Лихошвай В.А., Колчанов Н.А.
[III Международная конференция "Фундаментальные науки - медицине", г. Новосибирск, 2-8 сентября 2007 г.]
|
|
Молекулярная эволюция регуляторных генетических систем и корреляция биогеологических событий
Колчанов Н.А., Гунбин К.В., Суслов В.В.
[Круглый стол "Происхождение и эволюция биосферы" (в рамках программы мероприятий, посвященных 50-летию Сибирского Отделения РАН) Новосибирск, Россия, 2 июня 2007 г.]
|
|
Молекулярно-генетические системы развития: динамика функционирования и молекулярная эволюция
Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин К.В.
[Международная научная конференция "Вычислительная филогенетика и геносистематика, ВФГС-2007" , Москва, Россия, 16-19 ноября 2007 г.]
|
|
Применение терагерцового излучения для анализа биологических объектов
Горячковская Т.Н., Козлов А.С., Колчанов Н.А., Малышкин С.Б., Пельтек С.Е., Петров А.К., Попик В.М., Тарабан М.Б., Тикунова Н.В., Хлебодарова Т.М., Щеглов М.А.
[Всероссийский семинар по радиофизике миллиметровых и субмиллиметровых волн]
|
| 2006 |
A one-dimensional model for the regulation of the size of the renewable zone in biological tissue
Nikolaev S.V., Fadeev S.I., Kogay V.V., Mjolsness E., Kolchanov N.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
A system for simulation of 2D plant tissue growth and development
Nikolaev S.V., Penenko A.V., Belavskaya V.V., Mjolsness E., N.A. Kolchanov N.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
AGNS (arabidopsis genenet supplementary database), release 3.0
Omelianchuk N.A., Mironova V.V., Poplavsky A.S., Pavlov K.S., Savinskaya S.A., Podkolodny N.L., Mjolsness E.D., Meyerowitz E.M., Kolchanov N.A
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
Architecture of software toolkit for storing and operating with biosystems models
Miginsky D.S., Suslov V.V., Rasskazov D.A., Podkolodny N.L., Kolchanov N.A
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
Aromorphoses and adaptive molecular evolution: morphogens and signaling cascade genes
Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)]
|
|
Bioinformatics and mechanisms of molecular pathology
N.A. Kolchanov, V. Ivanisenko, M. Ponomarenko, E. Aman, E. Ignatieva, T. Kuznetsova, V. Mordvinov, P. Demenkov, A. Ratushny, V.Likhoshvai, E. Ananko, N. Podkolodny, N. Podkolodnaya, A.. Romaschenko
[3rd International conference "Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnologies for Medicine" July 12-16, 2006, Novosibirsk, Russia]
|
|
Bioinformatics and mechanisms of molecular pathology
N.A. Kolchanov, V. Ivanisenko, M. Ponomarenko, E. Aman, E. Ignatieva, T. Kuznetsova, V. Mordvinov, P. Demenkov, A. Ratushny, V.Likhoshvai, E. Ananko, N. Podkolodny, N. Podkolodnaya, A.. Romaschenko
[Геномика, протеомика, биоинформатика и нанотехнологии для медицины – GPMB-2006 Новосибирск, июль 2006]
|
|
EPI-GIS: GIS assisted computer tools for data accumulation, computer analysis and modeling in molecular epidemiology
Kolchanov N.A., Orlova G.V., Bachinsky A.G., Bazhan S.I., Shvarts Ya.Sh., Golomolzin V.V., Popov D.Yu., Efimov V.M., Tololo I.V., Ananko E.A., Podkolodnaya O.A., Il’ina E.N., Rogov S.I., Tretiakov V.E., Kubanova A.A., Govorun V.M.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
EPI-GIS: gis assisted computer tools for data accumulation, computer analysis and modeling in molecular epidemiology
Kolchanov N.A., Orlova G.V., Bachinsky A.G., Bazhan S.I., Shvarts Ya.Sh., Golomolzin V.V., Popov D.Yu., Efimov V.M., Tololo I.V., Ananko E.A., Podkolodnaya O.A., Il’ina E.N., Rogov S.I., Tretiakov V.E., Kubanova A.A., Govorun V.M.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
Nano/microfluid bio-analytical systems
Pel'tek S.E., Pindyurin V.F., Popik V.M., Scheglov M.A., Goldenberg B.G., Eliseev V.S., Petrova E.V., Tikunova N.V., Rubtsov N.B., Goraychkovskaya T.N., Khlebodarova T.M., Govorun V.M., Kulipanov G.N., Kolchanov N.A.
[The XVI Intern. Synchrotron Radiation Conference (SR-2006), July 10-14, 2006, BINP, Novosibirsk, Russia]
|
|
Optimal control tasks in terms of the gene network models
Bezmaternykh K.D., Nikulichev Yu.V., Likhoshvai V.A., Matushkin Yu.G., Latipov A.F., Kolchanov N.A
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
PROGRAM METHOD OF CONSTRUCTING ONTOLOGY OF PHENOTYPIC ABNORMALITIES FOR ARABIDOPSIS THALIANA
Ponomaryov D., Omelianchuk N., Mironova V., Kolchanov N., Mjolsness E., Meyerowitz E A
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
Reconstruction of bacterial gene networks, metabolic pathways and transcription regulation
Колчанов Н.А.
[French-Russian workshop on annotation of bacterial genomes. Франция, Тулуза 2006, октябрь]
|
|
System computer biology in Institute of Cytology of SB RAS
Yu. Matushkin, E. Ananko, D. Afonnikov, V. Golomolzin, V. Ivanisenko, E. Ignat’eva, A. Katokhin, V.Likhoshvai, D. Miginskii, N. Omelyanchuk, S. Peltek, T. Khlebodarova, N. Kolchanov
[Saint-Petersburg International Workshop on NanoBiotechnologies]
|
|
TRRD: a database on experimentally identified transcription regulatory regions and transcription factor binding sites.
Kolchanov N.A., Podkolodnaya O.A., Ananko E.A., Ignatieva E.V., Stepanenko I.L., Khlebodarova T.M., Merkulov V.M., Merkulova T.I., Podkolodny N.L., Romashchenko A.G.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
The contribution of alternative translation start sites to human protein diversity
Kochetov A.V., Sarai A., Kolchanov N.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
Компьютерные подходы к исследованию влияния полиморфизмов на экспрессию генов и функцию белков
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Кочетов А.В., Игнатьева Е.В., Пономаренко М.П., Орлова Г.В., Меркулова Т.И., Ощепков Д.Ю., Аман Е.Э., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Деменков П.С., Пинтус С.С., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Подколодный Н.Л.,
[International conference "Basic science for Biotechnology and medicine", Novosibirsk, Russia]
|
|
Компьютерные подходы к исследованию влияния полиморфизмов на экспрессию генов и функцию белков.
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Кочетов А.В., Игнатьева Е.В., Пономаренко М.П., Орлова Г.В., Меркулова Т.И., Ощепков Д.Ю., Аман Е.Э., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Деменков П.С., Пинтус С.С., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Турнаев И.И., Апасьева Н.В., Губина М.А., Ромащенко А.Г.
[International conference “Basic Science for Biotechnology and Medicine” September 3-7, 2006, Novosibirsk. Russia.]
|
|
Молекулярно-генетические механизмы заболеваний человека: компьютерный анализ и моделирование
Колчанов Н.А., Игнатьева Е.В., Иванисенко В.А., Аман Е.Э.
[Международная конференция "Физико-химическая биология", посвященная 80-летию со дня рождения академика Д.Г. Кнорре. Новосибирск, июль 2006]
|
|
Системная компьютерная биология
Колчанов Н.А.
[Иркутск, Инфокоммуникационные вычислительные технологии. Июнь 2006]
|
| 2005 |
Modelling of signal transduction and gene expression regulation in immune system cells.
Nedosekina E.A., Ananko E.A., Likhoshvai V.A., Oshchepkov D.Yu., Kolchanov N.A.
[Сonference on modeling and simulation in biology, medicine and biomedical engineering. Linkoping, Sweden, 2005, May 26-27]
|
Гранты
| 2015 |
Компьютерное исследование геномов эукариот
20 человек
|
| 2014 |
Изучение молекулярных механизмов развития органов растений методами системной биологии
Афонников Д.А., Голушко С.К., Дорошков А.В., Зубаирова У.С., Казанцев Ф.В., Колчанов Н.А., Лавреха В.В., Миронова В.В., Николаев С.В., Новикова Д.Д., Омельянчук Н.А., Пененко А.В., Пшеничникова Т.А., Савина М.С., Саженков С.А., Симонов А.В., Чернова В.В.
|
| 2013 |
Разработка программного комплекса для анализа влияния SNP на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний
Колчанов Николай Александрович, Подколодный Николай Леонтьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Брызгалов Леонид Олегович, Рассказов Дмитрий Александрович, Васькин Юрий Юрьевич, Данилова Юлия
|
|
Организация и проведение пятой Международной школы молодых ученых «Системная биология и биоинформатика»
Колчанов Николай Александрович
|
| 2012 |
Исследование трехмерной организации генома половых и соматических клеток методом Hi-C
Баттулин Нариман Рашитович Серов Олег Леонидович Колчанов Николай Александрович Рубцов Николай Борисович Орлов Юрий Львович Афонников Дмитрий Аркадьевич Медведев Кирилл Евгеньевич Карамышева Татьяна Витальевна Юнусова Анастасия Маратовна Шнайдер Татьяна Александровна Фишман Вениамин Семенович Мензоров Алексей Гавриилович Хабарова Анна Александровна
|
|
Междисциплинаный интеграционный проект «Суперкомпьтерная реализация стохастической эволюции ансамблей взаимодействующих частиц различной природы для решения естественно-научных и нанотехнологичных задач»
Подколодный Николай Леонтьевич, Колчанов Николай Александрович, Лашин Сергей Александрович, Николаев Сергей Васильевич
|
|
Междисциплинарный интеграционный проект "Исследование закономерностей и тенденций развития самоорганизующихся систем на примере веб-пространства и биологических сообществ"
Подколодный Николай Леонтьевич, Колчанов Николай Александрович, Деменков Павел Сергеевич, Рассказов Дмитрий Александрович, Подколодная Наталья Николаевна, Иванисенко Владимир Александрович, Титов Игорь Иванович, Лашин Сергей Александрович, Суслов Валентин Владимирович
|
|
Междисциплинарный интеграционный проект «Математические модели, числен-ные методы и параллельные алго-ритмы для решения больших задач СО РАН и их реализация на мно-гопроцессорных СуперЭВМ»
Подколодный Николай Леонтьевич Колчанов Николай Александрович Фомин Эдуард Станиславович Алемасов Николай Александрович Казанцев Федор Владимирович Афонников Дмитрий Аркадьевич Гунбин Константин Владимирович Генаев Михаил Александрович Вишневский Олег Владимирович
|
|
Междисциплинарный интеграционный проект «Методы параллельной обработки данных и моделирование на распределенных вычислительных системах»
Подколодный Николай Леонтьевич, Колчанов Николай Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Генаев Михаил Александрович, Гунбин Константин Владимирович, Казанцев Федор Владимирович, Рассказов Дмитрий Александрович
|
| 2011 |
Компьютерный анализ и моделирование процессов развития апикальной меристемы побега
Колчанов Николай Александрович, Акбердин Илья Ринатович , Деменков Павел Сергеевич, Зубаирова Ульяна Станиславовна, Николаев Сергей Васильевич, Пененко Алексей Владимирович, Смаль Павел Александрович, Турнаев Игорь Иванович
|
|
Проектирование и разработка RESTful-веб-сервисов для создания распределенной инфраструктуры, ориентированной на решения задач реконструкции и анализа генных сетей
Н.А. Колчанов, Н.Л. Подколодный, В.С. Тимонов, И.Р. Акбердин, Е.А. Ананько, М.А. Генаев, Е.В. Игнатьева, Ф.В. Казанцев, Н.Н. Подколодная, О.А. Подколодная, Д.А. Рассказов, А.В. Семенычев
|
|
Разработка алгоритмов и программных систем для решения задач анализа последовательностей, возникающих в теоретической и прикладной геномике
Орлов Юрий Львович, Колчанов Николай Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Вишневский Олег Владимирович, Левицкий Виктор Георгиевич, Ощепков Дмитрий Юрьевич, Иванисенко Владимир Александрович, Иванисенко Тимофей Владимирович, Деменков Павел Сергеевич, Брагин Анатолий Олегович, Медведева Ирина Вадимовна, Гунбин Константин Владимирович
|
|
Создание коллекции микроводорослей, продуцирующих липиды
Сорокина Ксения Николаевна, Колчанов Николай Александрович, Пельтек Сергей Евгеньевич, Демидов Евгений Александрович, Демидова Елизавета Вячеславовна, Шеховцов Сергей Викторович, Розанов Алексей Сергеевич, Брянская Алла Викторовна, Пилигаев Александр Васильевич
|
|
Формирование билатеральной симметрии в зародышах двудольных растений
Колчанов Николай Александрович, Голушко Сергей Кузьмич, Зубаирова Ульяна Станиславовна, Николаев Сергей Васильевич, Пененко Алексей Владимирович, Смаль Павел Александрович, Юрченко Андрей Васильевич
|
| 2010 |
EU-FP7 Research Project SysPatho
Акбердин И.Р., Мищенко Е.Л., Иванисенко Н.В., Деменков П.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А., Колчанова Н.А.
|
|
Разработка алгоритмов для биоинформационного анализа комплексных метаболических и молекулярно-генетических сетей
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Иванисенко Н.В., Медведева И.В., Тийс Е.С., Брагин А.О., Игнатьева Е.В., Ананько Е.В., Мищенко Е.Л., Сайл О.В.
|
|
Интеграционный проект, выполняемый по заказу Президиума СО РАН "ОСВОЕНИЕ БАЗОВЫХ ТЕХНОЛОГИЙ РАБОТЫ ЦКП «SPF-ВИВАРИЙ ИЦиГ СО РАН» НА ПРИМЕРЕ ИССЛЕДОВАНИЙ ПО БИОБЕЗОПАСНОСТИ НАНОМАТЕРИАЛОВ"
Колчанов Н.А., Мошкин М.П., Герлинская Л.А., Пельтек С.Е., Напримеров В.А., Амстиславский С.Я., Щапов Е.Н., Петровский Д.В., Завьялов Е.Л., Концевая Г.В., Масленникова С.О., Акулов А.Е., Колосова И.Е., Шнайдер Е.П.
|
| 2009 |
Разработка Веб-ориентированной экспертной системы, предназначенной для распознавания взаимосвязанных белков, выявленных с применением постгеномных методов
Колчанов Н.А., Подколодный Н.Л., Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Медведева И.В., Тийс Е.С., Брагин А.О., Игнатьева Е.В., Ананько Е.В., Подколодная Н.Н., Подколодная О.А., Хлебодарова Т.М.
|
|
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов
Акбердин Илья Ринатович, Гунбин Константин Владимирович, Захаренко Л.П., Иванисенко Владимир Александрович, Игнатьева Елена Васильевна, Казанцев Федор Владимирович, Левицкий Виктор Георгиевич, Лихошвай Виталий Александрович, Омельянчук Надежда Анатольевна, Ощепков Дмитрий Юрьевич, Пинтус Сергей Сергеевич, Пономаренко Михаил Павлович, Пономаренко Петр Михайлович, Ри Максим Тексенович, Савинкова Людмила Кузминична, Суслов Валентин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович, Хлебодарова Тамара Михайловна
|
|
ПОСТГЕНОМНАЯ БИОИНФОРМАТИКА: КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ
76 человек
|
|
Поиск, селекция и изучение перспективных бактериальных штаммов-продуцентов для переработки глицерина
Колчанов Николай Александрович, Пельтек Сергей Евгеньевич, Иванисенко Владимир Александрович, Сорокина Ксения Николаевна
|
|
Структура и свойства молекулярных органических кристаллов в условиях высоких давлений и низких температур
Колчанов Николай Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Гунбин Константин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович, Суслов Валентин Владимирович, Медведев Кирилл Евгеньевич, Генаев Михаил Александрович
|
|
Уникальные устройства и стенды для развития исследовательской инфраструктуры СО РАН, обеспечивающей возможность проведения нестандартных исследований в области химии и биологии. Радиационный крекинг тяжелого нефтяного и альтернативного углеводородного сырья
Колчанов Николай Александрович, Пельтек Сергей Евгеньевич, Сорокина Ксения Николаевна
|
|
Фундаментальные основы биотехнологического получения целевых продуктов и препаратов
Колчанов Николай Александрович, Пельтек Сергей Евгеньевич, Розанов Алексей Сергеевич, Сорокина К.Н.
|
| 2008 |
Создание баз данных в области нанобиотехнологии как элементов информационной составляющей инфраструктуры наноиндустрии
В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов
|
|
Компьютерное моделирование и анализ механизма гомеостаза структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме Arabidopsis thaliana
Колчанов Н.А. , Омельянчук Н.А., н.с. Николаев С.В., Ананько Е.А., Вишневский О.В., Хомичева И.В., Миронова В.В., Лавреха В.В.
|
|
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов.
Савенкова Л.А., Пономаренко М.П., Игнатьева Е.В., Левицкий В.Г., Акбердин И.Р., Миронова, Титов
|
|
Проекты Программы фундаментальных исследований Президиума РАН Б.26 Биологическое разнообразие (координатор ак. Павлов Д.С.)
Колчанов Николай Александрович Савенкова Людмила Александровна Пономаренко Михаил Павлович Игнатьева Елена Васильевна Левицкий Виктор Георгиевич Захаренко Людмила Павловна Акбердин Илья Ринатович Титов Игорь Иванович Миронова
|
| 2007 |
Конструирование геносенсоров и оценка их чувствительности к токсическим воздействиям
Колчанов Н.А., Хлебодарова Т.М., Афонников Д.А., Кучумова Л.Я., Качко А.В., Тикунова Н.В.
|
|
Разработка универсальных геносенсоров для детекции общей токсичности, мутагенности и техногенных стрессов
Д.А.Афонников В.А.Лихошвай О.В. Ефремова Т.М.Хлебодарова И.Л.Степаненко Ю.Г.Матушкин Н.В.Тикунова И.В. Бабкин А.В. Качко Л.Я. Кучумова
|
| 2006 |
РОЛЬ МИКРООРГАНИЗМОВ В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ И БИОИНЖЕНЕРНЫЕ ПРИЛОЖЕНИЯ
113 исполнителей из 10 Институтов СО РАН
|
Научное руководство
| 2014 |
Методы и средства визуальной реконструкции и анализа сетевых моделей экологических систем (первоначальная формулировка)
[Семенычев Александр Владимирович]
|
Учебные курсы
| 2017 |
Введение в информационную биологию
Колчанов Н.А., Лашин С.А., Фурман Д.П., Афонников Д.А., Землянская Е.В., Дорошков А.В., Бухарина Т.А.
|
Патенты
| 2013 |
Мискантус Сорановский
Шумный В.К., Вепрев С.Г., Нечипоренко Н.Н., Горячковская Т.Н., Слынько Н.М., Колчанов Н.А., Пельтек С.Е.
|
| 2010 |
СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К ИШЕМИЧЕСКОЙ НЕЙРООПТИКОПАТИИ
Пономарева М.Н., Коновалова Н.А., Скляр Л.В., Руднева Л.Ф., Ромащенко А.Г., Губина М.А., Соболева Д.Е., Колчанов Н.А.
|
|
Рекомбинантная плазмидная ДНК pYfi-gfp, кодирующая продукцию флюоресцентного белка GFPaav и штамм бактерий Escherichia coli JM109-pYfi продуцирующий флюоресцентный белок GFPaav в присутствии токсических агентов
Хлебодарова Т.М., Тикунова Н.В., Качко А.В., Лихошвай В.А., Колчанов Н.А.
|
|
База данных нанобиоматериалов (НАНОБИОБАЗА)/Nanobiomaterial database (NANOBIOBASE)
Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Колчанов Н.А.
|
|
База данных нанобиотехнологий (НАНОБИОТЕХБАЗЕ)/Nanobiotechnology database (NANOBIOTECHBASE)
Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Колчанов Н.А.
|
| 2009 |
Штамм бактерий Escherichia coli для тестирования присутствия в среде фенола и перекиси водорода.
Качко А.В., Тикунова Н.В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
|
| 2007 |
База данных: Сайты связывания транскрипционных факторов (ТФСАЙТ)/ Transcription factor sites database (TFSITE).
Степаненко И.Л., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А., Хлебодарова Т.М., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
|
База данных: Транскрипционный Фактор-Ген Млекопитающих взаимодействия (ТФГМВ)/ Transcription Factor- Mammalian Gene Interactions (TFMGI)
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Игнатьева Е.В., Генаев М.А.
|
|
База данных: Экспрессия эукариотических генов (ЭуГенЭксп) / Eukaryotic Gene Expression Database (EuGenExp)
Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А., Степаненко И.Л., Хлебодарова Т.М., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
|
База данных: Биотехнологически значимые продукты (BiotechPro)
Ибрагимова С.М., Смирнова О.Г., Григорович Д.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
|
|
База данных: Трансген-Промотор (TGProm)
Смирнова О.Г., Ибрагимова С.М., Кочетов А.В., Григорович Д.А., Колчанов Н.А.
|
| 2006 |
Генные сети Арабидопсиса (ГСА)/Arabidopsis GeneNet Supplementary (AGNS)
Омельянчук Н.А., Поплавский А.С., Миронова В.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
|
База данных: Регуляторные районы генов прокариот (ProkaTEX)
Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Поплавский А.С., Наумочкин А.Н., Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
|
База кинетических данных (KiNET)
Недосекина Е.А., Хлебодарова Т.М., Поплавский А.С., Смирнова О.Г., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
|
База данных: Районы позиционирования нуклеосом (NPRD).
Левицкий В.Г., Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Фурман Д.П., Катохин А.В., Смирнова О.Г., Хлебодарова Т.М.
|
|
|
