 |
|
|
Кириченко Анатолий Владимирович, к. б. н.
|
Персональная информацияРабочий адрес
Г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия
Дата рождения
01.07.1976
Образование
НГУ – 1999 – специалист (биология, генетика)
ИЦиГ - 2003 - кандидат биологических наук
Область научных интересов
Биология, генетика
Область рабочих интересов
Хобби
Контакты в социальных сетях, блогах и т.д.
Публикации
| 2024 |
Реконструкция матрицы генотипических корреляций между вариантами внутри гена для совместного анализа импутированных и секвентрованных данных
Г.Р. Свищева, А.В. Кириченко, Н.М. Белоногова, Е.Е. Елгаева, Я.А. Цепилов, И.В. Зоркольцева, Т.И. Аксенович
[Генетика]
|
| 2023 |
Multi-Trait Exome-Wide Association Study of Back Pain-Related Phenotypes
Zorkoltseva IV
Elgaeva EE
Belonogova NM
Kirichenko AV
Svishcheva GR
Freidin MB
Williams FMK
Suri P
Tsepilov YA
Axenovich TI
[Genes]
|
| 2022 |
Noncoding rare variants in PANX3 are associated with chronic back pain
Nadezhda M Belonogova, Anatoly V Kirichenko, Maxim B Freidin, Frances M K Williams, Pradeep Suri, Yurii S Aulchenko, Tatiana I Axenovich, Yakov A Tsepilov
[PAIN]
|
|
In silico genome-wide gene-based association analysis reveals new genes predisposing to coronary artery disease
Zorkoltseva I, Shadrina A, Belonogova N, Kirichenko A, Tsepilov Y, Axenovich T.
[CLIN GENET]
|
|
sumSTAAR: A flexible framework for gene-based association studies using GWAS summary statistics
Nadezhda M. Belonogova, Gulnara R. Svishcheva, Anatoly V. Kirichenko, Irina V. Zorkoltseva, Yakov A. Tsepilov, Tatiana I. Axenovich
[PLOS COMPUT BIOL]
|
|
Платформа GWAS-MAP|ovis для хранения и анализа результатов полногеномных ассоциативных исследований овец
А. В. Кириченко, А. С. Злобин, Т. И. Шашкова, Н. А. Волкова, Б. С. Иолчиев, В. А. Багиров, П. М. Бородин, Л. С. Карссен, Я. А. Цепилов, Ю. С. Аульченко
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2019 |
Gene-based association tests using GWAS summary statistics
Gulnara R Svishcheva, Nadezhda M Belonogova, Irina V Zorkoltseva, Anatoly V Kirichenko, Tatiana I Axenovich
[BIOINFORMATICS]
|
|
In silico поиск генов, контролирующих ишемическую болезнь сердца
Зоркольцева И.В., Белоногова Н.М., Свищёва Г.Р., Кириченко А.В., Аксенович Т.И.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2018 |
A combined linkage, microarray and exome analysis suggests MAP3K11 as a candidate gene for left ventricular hypertrophy
Claudia Tamar Silva
Irina Zorkoltseva
Marieke Niemeijer
Marten E. van den Berg
Najaf Amin
Ayşe Demirkan
Elisa van Leeuwen
Adriana I. Iglesias
Laura B. Piñeros-Hernández
Carlos M. Restrepo
Jan A. Kors
Anatoly Kirichenko
Rob Willemsen
Ben A. Oostra
Bruno H. Stricker
André G. Uitterlinden
Tatiana I. Axenovich
Cornelia M. van Duijn
Aaron Isaacs
[BMC MED GENOMICS]
|
|
Использование генотипов распространенных вариантов для полногеномного регионального анализа ассоциаций
А. Кириченко
И. Зоркольцева
Н. Белоногова
Т. Аксенович
[Генетика]
|
| 2017 |
Non-synonymous variation in NKPD1 increases depressive symptoms in the European populations
Najaf Amin, Nadezhda M. Belonogova, Olivera Jovanova, Rutger W.W. Brouwer, Jeroen G.J. van Rooij, Mirjam C.G.N. van den Hout, Gulnara R. Svishcheva, Robert Kraaij, Irina V. Zorkoltseva, Anatoly V. Kirichenko, Albert Hofman, André G. Uitterlinden, Wilfred F.J. van IJcken, Henning Tiemeier, Tatiana I. Axenovich, Cornelia M. van Duijn
[BIOL PSYCHIAT]
|
| 2016 |
A combined linkage and exome sequencing analysis for electrocardiogram parameters in the Erasmus Rucphen Family study.
Claudia T. Silva, Irina Zorkoltseva, Najaf Amin, Ayse Demirkan, Elisabeth M. Van Leeuwen, Jan Kors, Marten van den Berg, Bruno Stricker, André Uitterlinden, Anatoly Kirichenko, Jacqueline C.M. Witteman, Rob Willemsen, Ben Oostra, Tatiana Axenovich, Cornelia M. Van Duijn, Aaron Isaacs
[Frontiers in Genetics]
|
| 2013 |
Refining genome-wide linkage intervals using a meta-analysis of genome-wide association studies identifies loci influencing personality dimensions
Amin N, Hottenga JJ, Hansell NK, Janssens AC, de Moor MH, Madden PA, Zorkoltseva IV, Penninx BW, Terracciano A, Uda M, Tanaka T, Esko T, Realo A, Ferrucci L, Luciano M, Davies G, Metspalu A, Abecasis GR, Deary IJ, Raikkonen K, Bierut LJ, Costa PT, Saviouk V, Zhu G, Kirichenko AV, Isaacs A, Aulchenko YS, Willemsen G, Heath AC, Pergadia ML, Medland SE, Axenovich TI, de Geus E, Montgomery GW, Wright MJ, Oostra BA, Martin NG, Boomsma DI, van Duijn CM.
[EUR J HUM GENET]
|
| 2012 |
A genome-wide linkage study of individuals with high scores on NEO personality traits.
Amin N, Schuur M, Gusareva ES, Isaacs A, Aulchenko YS, Kirichenko AV, Zorkoltseva IV, Axenovich TI, Oostra BA, Janssens AC, van Duijn CM.
[MOL PSYCHIATR]
|
|
Genome-wide association study identifies novel loci associated with circulating phospho- and sphingolipid concentrations
Demirkan A, van Duijn CM, Ugocsai P, Isaacs A, Pramstaller PP, Liebisch G, Wilson JF, Johansson Å, Rudan I, Aulchenko YS, Kirichenko AV, Janssens AC, Jansen RC, Gnewuch C, Domingues FS, Pattaro C, Wild SH, Jonasson I, Polasek O, Zorkoltseva IV, Hofman A, Karssen LC, Struchalin M, Floyd J, Igl W, Biloglav Z, Broer L, Pfeufer A, Pichler I, Campbell S, Zaboli G, Kolcic I, Rivadeneira F, Huffman J, Hastie ND, Uitterlinden A, Franke L, Franklin CS, Vitart V; DIAGRAM Consortium, Nelson CP, Preuss M; CARDIoGRAM Consortium, Bis JC, O'Donnell CJ, Franceschini N; CHARGE Consortium, Witteman JC, Axenovich T, Oostra BA, Meitinger T, Hicks AA, Hayward C, Wright AF, Gyllensten U, Campbell H, Schmitz G; EUROSPAN consortium
[PLOS GENET]
|
| 2011 |
Linkage and association analyses of glaucoma related traits in a large pedigree from a Dutch genetically isolated population
Axenovich T, Zorkoltseva I, Belonogova N, van Koolwijk L, Borodin P, Kirichenko A, Babenko V, Ramdas W, Amin N, Despriet D, Vingerling J, Lemij H, Oostra BA, Klaver C, Aulchenko Y, van Duijn C.
[J MED GENET]
|
| 2010 |
Linkage and Genome-wide Association Analysis of Obesity-related Phenotypes: Association of Weight With the MGAT1 Gene OBESITY
Johansson A, Marroni F, Hayward C, Franklin CS, Kirichenko AV, Jonasson I, Hicks AA, Vitart V, Isaacs A, Axenovich T, Campbell S, Floyd J, Hastie N, Knott S, Lauc G, Pichler I, Rotim K, Wild SH, Zorkoltseva IV, Wilson JF, Rudan I, Campbell H, Pattaro C, P
[OBESITY]
|
| 2009 |
Common variants in the JAZF1 gene associated with height identified by linkage and genome-wide association analysis
Johansson A, Marroni F, Hayward C, Franklin CS, Kirichenko AV, Jonasson I, Hicks AA, Vitart V, Isaacs A, Axenovich T, Campbell S, Dunlop MG, Floyd J, Hastie N, Hofman A, Knott S, Kolcic I, Pichler I, Polasek O, Rivadeneira F, Tenesa A, Uitterlinden AG, Wi
[HUM MOL GENET]
|
|
Genetic Determinants of Circulating Sphingolipid Concentrations in European Populations
Hicks AA, Pramstaller PP, Johansson A, Vitart V, Rudan I, Ugocsai P, Aulchenko Y, Franklin CS, Liebisch G, Erdmann J, Jonasson I, Zorkoltseva IV, Pattaro C, Hayward C, Isaacs A, Hengstenberg C, Campbell S, Gnewuch C, Janssens AC, Kirichenko AV, König
[PLOS GENET]
|
|
Linkage analysis of adult height in a large pedigree from a Dutch genetically isolated population
Axenovich T.I., Zorkoltseva I.V., Belonogova N.M. Struchalin, MV; Kirichenko, AV); Kayser, M); Oostra, BA; van Duijn, CM; Aulchenko, YS .
[HUM GENET]
|
|
PedStr Software for Cutting Large Pedigrees for Haplotyping, IBD Computation and Multipoint Linkage Analysis
Kirichenko A.V., Belonogova N.M., Aulchenko Y.S., Axenovich, TI
[ANN HUM GENET]
|
| 2008 |
Breaking loops in large complex pedigrees
Axenovich TI, Zorkoltseva IV, Liu F, Kirichenko AV, Aulchenko YS
[HUM HERED]
|
| 2006 |
Diversity of wild and domestic pig populations estimated by a set of serum allotypes
Nikitin SV, Knyazev SP, Nikolaev AG, Voloch AM, Kirichenko AV, Savina MA, Yermolaev VI, Yudina OP, Bekenev VA, Aytnazarov RB
[RUSS J GENET+]
|
Конференции
| 2024 |
Efficiency of a new multi-trait approach applied
to back pain-related phenotypes
Belonogova N.M., Elgaeva E.E., Zorkoltseva I.V., Kirichenko A.V.,Svishcheva G.R., Freidin M.B., Williams F.M.K., Suri P., Axenovich T.I.,Tsepilov Y.A.
[BGRS/SB-2024]
|
|
Efficient completion of genotype correlation
matrix combining imputed and sequenced data
Svishcheva GR, Kirichenko AB, Belonogova NM, Tsepilov YaA, Zorkoltseva IV, Axenovich TI
[52nd European Mathematical Genetics Meeting]
|
|
New genes for back pain-related phenotypes identified by multi-trait gene-based association analysis
Nadezhda M. Belonogova, Elizaveta E. Elgaeva, Irina V. Zorkoltseva, Anatoliy V. Kirichenko,
Gulnara R. Svishcheva, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Pradeep Suri, Tatiana
I. Axenovich, and Yakov A. Tsepilov
[European Human Genetics Conference ESHG Hybrid Conference 2024. Berlin, Germany. 2024]
|
| 2023 |
Exome sequencing association analysis replicated the role of rare variants of SLC13A1 in back pain
Zorkoltseva IV, Elgaeva EE, Kirichenko AV, Belonogova NM, Svishcheva GR, Tsepilov YA, Axenovich TI
[European Human Genetics Conference, Hybrid Conference]
|
| 2022 |
Association of PANX3 with chronic back pain discovered using gene-based analysis.
Belonogova N.M., Kirichenko A.V., Freidin M.B., Williams F. M. K., Suri P., Aulchenko Y. S., Axenovich T. I., Tsepilov Y. A.
[BGRS/SB-2022 The Thirteenth International Multiconference]
|
|
A fast algorithm for analysing genes with a large number of SNPs and an effective polygene pruning procedure in sumFREGAT
Svishcheva GR, Belonogova NM, Kirichenko FV, TsepilovYaA , Axenovich TI
[European Mathematical Genetics Meeting]
|
|
New framework for gene-based association analysis using GWAS summary statistics and functional annotations
Svishcheva G., Belonogova N., Kirichenko A., Zorloltseva I., Tsepilov Ya., Axenovich T.
[BGRS/SB-2022 The Thirteenth International Multiconference ,04–08 July, 2022, Novosibirsk, Russia]
|
|
New genes predisposing to coronary artery disease detected by genome-wide gene-based association analysis
Zorkoltseva I., Belonogova N., Shadrina A., Kirichenko A., Tsepilov Y., Axenovich T.
[BGRS/SB-2022 The Thirteenth International Multiconference ,04–08 July, 2022, Novosibirsk, Russia]
|
|
New opportunities for gene-based association analysis using GWAS summary statistics
Gulnara R. Svishcheva, Nadezhda M. Belonogova, Anatoly V. Kirichenko, Yakov A. Tsepilov, Tatiana I. Axenovich
[European Conference of Human Genetics]
|
| 2021 |
New genes for coronary artery disease detected via gene-based association analysis
Irina Zorkoltseva, Nadezhda Belonogova, Alexandra Shadrina, Anatoly Kirichenko, Yakov Tsepilov, Tatyana
Axenovich
[European Human Genetics Virtual Conference 2021]
|
| 2019 |
ГЕНЫ ДЛЯ ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНИ СЕРДЦА, ВЫЯВЛЕННЫЕ С ПОМОЩЬЮ НОВЫХ МЕТОДОВ АНАЛИЗА АССОЦИАЦИЙ
Зоркольцева И.В., Белоногова Н.М., Свищева Г.Р., Кириченко А.В., Аксенович Т.И.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы]
|
|
КАК ПОЛУЧИТЬ НОВЫЕ ЗНАНИЯ О ГЕНЕТИЧЕСКОЙ АРХИТЕКТУРЕ ПРИЗНАКОВ, НЕ РАСПОЛАГАЯ ИНФОРМАЦИЕЙ ОБ ИНДИВИДУАЛЬНЫХ ФЕНОТИПАХ И ГЕНОТИПАХ
Белоногова Н.М., Свищева Г.Р., Зоркольцева И.В., Кириченко А.В., Аксенович Т.И.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы]
|
| 2013 |
Genomewide linkage scan for principal components of phospho- and sphingolipids level in blood
I. Zorkoltseva, N. Belonogova, A. Demirkan, N. Amin, A. Kirichenko, Y. Aulchenko, C. M. van Duijn2, T. Axenovich
[Annual meeting of European Society of Human Genetics, Paris, France, 8-11 June, 2013.]
|
| 2011 |
New glaucoma related locus on chromosome 20p13.
Zorkoltseva I, Belonogova N, van Koowijk L, Kirichenko A, Axenovich T, van Duijn C.
[Annual meeting of European Society of Human Genetics, Amsterdam, the Netherlands, 25-28 May, 2011.]
|
|
Генетический контроль уровня бета-амилоидных пептидов – биомаркеров болезни Альцгеймера.
Зоркольцева И.В., Ибрагим-Вербаас К.А., Кириченко А.В., ван Дуин К.М., Аксенович Т.И.
[Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика, г. Новосибирск, 14-17 ноября 2011 г.]
|
| 2009 |
Genome-wide linkage scan of human cognitive abilities in a large Dutch pedigree.
Zorkoltseva IV, Schuur M, Kirichenko A, van Swieten J, de Koning I, Oostra B, Aulchenko Y, Axenovitch T, van Duijn C.
[Annual meeting of European Society of Human Genetics, Vienna, Austria, 23-26 May, 2009.]
|
|
Genome-wide parametric linkage analysis of adult height.
Axenovitch TI, Zorkoltseva IV, Belonogova NM, Kirichenko AV, Oostra BA, van Duijn CM, Aulchenko YS.
[Annual meeting of European Society of Human Genetics, Vienna, Austria, 23-26 May, 2009.]
|
| 2006 |
Сравнение MySQL и альтернативной СУБД для хранения генетических данных.
Кириченко А.В.
[VII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. Красноярск. 2006]
|
Гранты
| 2020 |
Разработка теоретических и прикладных основ использования больших данных для картирования генов
Свищева Гульнара Рустамовна (Р)
Белоногова Надежда Михайловна
Зоркольцева Ирина Витальевна
Аксенович Татьяна Иосифовна
Кириченко Анатолий Владимирович
Елгаева Елизавета Евгеньевна
|
|
Разработка теоретических и прикладных основ использования больших данных для картирования генов
Шарапов Содбо Жамбалович
Свищёва Гульнара Рустамовна
Белоногова Надежда Михайловна
Кириченко Анатолий Владимирович
Елгаева Елизавета Евгеньевна
|
| 2019 |
Гены - регуляторы гликозилирования белков человека
Аульченко Юрий Сергеевич
Шарапов Содбо Жамбалович
Торгашева Анна Александровна
Шадрина Александра Сергеевна
Елгаева Елизавета Евгеньевна
Белоногова Надежда Михайловна
Кириченко Анатолий Владимирович
Пахомов Евгений Дмитриевич
Шашкова Татьяна Игоревна
|
| 2015 |
Разработка статистических методов картирования генов c плейотропным эффектом
Цепилов Яков Александрович Свищева Гульнара Рустамовна Белоногова Надежда Михайловна Аксенович Татьяна Иосифовна Кириченко Анатолий Владимирович
|
| 2014 |
Поиск редких генетических вариантов, контролирующих обмен липидов, с помощью секвенирования экзома.
Аксенович Татьяна Иосифовна Зоркольцева Ирина Витальевна Свищёва Гульнара Рустамовна Белоногова Надежда Михайловна Кириченко Анатолий Владимирович
|
| 2013 |
Поиск редких и распространенных генетических вариантов, вовлеченных в контроль депрессии
Зоркольцева Ирина Витальевна
Белоногова Надежда Михайловна
Кириченко Анатолий Владимирович
Шарапов Содбо Жамбалович
|
| 2012 |
Разработка методов регионального картирования распространенных и редких вариантов генома с учетом генетической структуры выборок
Аксенович Татьяна Иосифовна, Белоногова Надежда Михайловна, Кириченко Анатолий Владимирович , Свищева Гульнара Рустамовна, Цепилов Яков Александрович
|
| 2011 |
Изучение молекулярно-генетического контроля наследуемых форм нейросенсорной тугоухости/глухоты и анализ их распространенности в популяциях Сибири
Посух Ольга Леонидовна, Бады-Хоо Марита Сергеевна, Барашков Николай Алексеевич, Зоркольцева Ирина Витальевна, Зыцарь Марина Вячеславовна, Кириченко Анатолий Владимирович, Михальская Валерия Юрьевна, Морозов Игорь Владимирович
|
|
Поиск генов, контролирующих уровень фосфо- и сфинголипидов в плазме крови
Аксенович Татьяна Иосифовна, Аульченко Юрий Сергеевич, Белоногова Надежда Михайловна, Зоркольцева Ирина Витальевна, Кириченко Анатолий Владимирович, Свищева Гульнара Рустамовна
|
| 2010 |
Изучение генетического контроля когнитивных функций человека с помощью сканирования генома
Зоркольцева Ирина Витальевна
Аксенович Татьяна Иосифовна
Белоногова Надежда Михайловна
Кириченко Анатолий Владимирович
Свищёва Гульнара Рустамовна
|
| 2007 |
Анализ генетической природы болезни Альцгеймера и когнитивных функций
Аксенович Татьяна Иосифовна, Белоногова Надежда Михайловна, Бородин Павел Михайлович, Зоркольцева Ирина Витальевна, Кириченко Анатолий Владимирович, Аульченко Юрий Сергеевич
|
|
Генетико-статистические аспекты картирования количественных признаков человека и животных
Аульченко Юрий Сергеевич, Зоркольцева Ирина Витальевна, Кириченко Анатолий Владимирович, Свищева Гульнара Рустамовна, Стручалин Максим Владимирович
|
|
Социальные и популяционно-генетические аспекты наследственной глухоты в Республике Алтай
Посух Ольга Леонидовна Тадинова Вера Николаевна Зоркольцева Ирина Витальевна Кириченко Анатолий Владимирович Посух Ольга Витальевна Попошева Галина Табачиновна
|
| 2004 |
Изменение генетической структуры сложных признаков млекопитающих в ходе отбора
Аксенович Татьяна Иосифовна, Акбердин Илья Ринатович, Аульченко Юрий Сергеевич, Данильченко Наталья Викторовна, Зоркольцева Ирина Витальевна, Зыкович Артем Сергеевич, Кириченко Анатолий Владимирович, Никитин Сергей Вячеславович, Степика Анна Владимировна
|
Патенты
| 2021 |
База данных генетических ассоциаций признаков овец (ГАПО)
Аульченко Ю.С., Шашкова Т.И., Цепилов Я.А., Кириченко А.В., Злобин А.С.
|
|
|
