 |
|
|
Игнатьева Елена Васильевна, к. б. н.
|
Scopus: https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=6603769806РИНЦ: https://elibrary.ru/author_profile.asp?authorid=88911Индекс рецензентов publons.com: M-2507-2019Персональная информацияРабочий адрес
Г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия
Дата рождения
09.05.1963
Образование
НГУ – 1985 – специалист (биолог, физиолог)
Награды
Звание "Заслуженный ветеран СО РАН"
Область научных интересов
Биоинформатика, базы данных, регуляция транскрипции, генные сети.
Область рабочих интересов
Хобби
Контакты в социальных сетях, блогах и т.д.
ScopusID = 6603769806
ORCID ID: 0000-0002-8588-6511
(Publons) Web of Science ResearcherID is *M-2507-2019*
РИНЦ AuthorID: 88911
SPIN-код: 3057-5557
Публикации
| 2024 |
Peak Scores Significantly Depend on the Relationships between Contextual Signals in ChIP-Seq Peaks.
Vishnevsky OV, Bocharnikov AV, Ignatieva EV.
[INT J MOL SCI]
|
| 2023 |
Compilation and functional classification of telomere length-associated genes in humans and other animal species
Ignatieva E.V., Yudin N.S., Larkin D.M.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Evolution of human genes encoding cell surface receptors involved in the regulation of appetite: an analysis based on the phylostratigraphic age and divergence indexes
Ignatieva E.V., Lashin S.A., Mustafin Z.S., Kolchanov N.A.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Анализ особенностей эволюции генов рецепторов клеточной поверхности человека, участвующих в регуляции аппетита, на основе индексов филостратиграфического возраста и микроэволюционной изменчивости
Игнатьева Е.В., Лашин С.А., Мустафин З.С., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Компиляция и функциональная классификация генов, ассоциированных с длиной теломер, у человека и других видов животных
Игнатьева Е.В., Юдин Н.С., Ларкин Д.М.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2021 |
A catalogue of human genes associated with pathozoospermia and functional characteristics of these genes
Ignatieva E.V., Osadchuk A.V., Kleshchev M.A., Bogomolov A.G., Osadchuk L.V.
[Frontiers in Genetics]
|
|
Disease-associated genetic variants in the regulatory regions of human genes: mechanisms of action on transcription and genomic resources for dissecting these mechanisms.
Ignatieva E.V., Matrosova E.A.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Геномная изменчивость в регуляторных районах генов, ассоциированная с заболеваниями человека: механизмы влияния на транскрипцию генов и полногеномные информационные ресурсы, обеспечивающие исследование этих механизмов.
Игнатьева Е.В., Матросова Е.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2020 |
Disruptive natural selection by male reproductive potential prevents underexpression of protein-coding genes on the human Y chromosome as a self-domestication syndrome.
Ponomarenko M., Kleshchev M., Ponomarenko P., Chadaeva I., Sharypova E., Rasskazov D., Kolmykov S., Drachkova I., Vasiliev G., Gutorova N., Ignatieva E., Savinkova L., Bogomolov A., Osadchuk L., Osadchuk A., Oshchepkov D.
[BMC GENET]
|
| 2019 |
A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive
analysis of motifs co-occurrence with MCOT package
Levitsky V., Zemlyanskaya E., Oshchepkov D., Podkolodnaya O., Ignatieva E.,
Grosse I., Mironova V., Merkulova T.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Exome-wide search and functional annotation of genes associated in patients with severe tick-borne encephalitis in a Russian population
Ignatieva E.V., Yurchenko A.A., Voevoda M.I., Yudin N.S.
[BMC MED GENOMICS]
|
|
Ассоциация однонуклеотидного полиморфизма rs110861313 в межгенном районе хромосомы 23 с развитием лейкоза у крупного рогатого скота черно-пестрой породы
Айтназаров Р.Б., Игнатьева Е.В., Агаркова Т.А., Двоеглазов Н.Г., Осипова Н.А., Храмцов В.В., Юдин Н.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Использование графических ускорителей для выявления функциональных сигналов в регуляторных районах дифференциально экспрессирующихся генов AGRP нейронов гипоталамуса мыши в ответ на голодание
А. В. Бочарников, Е. В. Игнатьева, О. В. Вишневский
[Вестник СибГУТИ]
|
| 2018 |
A matrix metalloproteinase 9 (MMP9) gene single nucleotide polymorphism is associated with predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced severe central nervous system disease
Barkhash A.V., Yurchenko A.A., Yudin N.S., Ignatieva E.V., Kozlova I.V., Borishchuk I.A., Pozdnyakova L.L., Voevoda M.I., Romaschenko A.G.
[TICKS TICK-BORNE DIS]
|
|
Haplotype analysis of Apoe SNPs in ADNI dataset.
Babenko VN, Afonnikov DA, Ignatieva EV, Klimov AV, Gusev FE, Rogaev EI
[BMC NEUROSCI]
|
|
Генетическая предрасположенность человека к заболеваниям, вызываемым вирусами семейства Flaviviridae
Юдин Н.С., Бархаш А.В., Максимов В.Н., Игнатьева Е.В., Ромащенко А.Г.
[Molecular Biology]
|
|
Приоритизация генов, ассоциированных с патогенезом лейкоза у крупного рогатого скота
Н.С. Юдин , Н.Л. Подколодный, Т.А. Агаркова, Е.В. Игнатьева
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
A compendium and functional characterization of mammalian genes involved in adaptation to Arctic or Antarctic environments
Yudin N.S., Larkin D.M., Ignatieva E.V.
[BMC GENET]
|
|
A database of human genes and a gene network involved in response to tick-borne encephalitis virus infection
Ignatieva E.V., Igoshin A.V., Yudin N.S.
[BMC EVOL BIOL]
|
|
Интернет-доступные информационные ресурсы по генным сетям, включающие данные по человеку и животным.
Игнатьева Е.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2016 |
A compendium of human genes regulating feeding behavior and body weight, its functional characterization and identification of GWAS genes involved in brain-specific PPI network
Elena V. Ignatieva, Dmitry A. Afonnikov, Olga V. Saik, Evgeny I. Rogaev and Nikolay A. Kolchanov
[BMC GENET]
|
|
Estimation of the Role of Single Nucleotide Polymorphism in Lymphotoxin Beta Gene during Pig Domestication Based on the Bioinformatic and Experimental Approaches
R. B. Aitnazarov, E. V. Ignatieva, N. E. Bazarova, V. G. Levitsky, S. P. Knyazevd, Y. Gon, and N. S. Yudin
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Hidden Heterogeneity of Transcription Factor Binding Sites: A Case Study of SF-1
V.G. Levitsky, D.Yu. Oshchepkov, N.V. Klimova, E.V Ignatieva, G.V. Vasiliev, V.M. Merkulov, T.I. Merkulova
[COMPUT BIOL CHEM]
|
| 2015 |
Association of Dopamine Receptor D4 (DRD4) Gene Polymorphism with Cardiovascular Disease Risk Factors
N. S. Yudin, T. M. Mishakova, E. V. Ignatieva, V. N. Maksimov, V. V. Gafarov, S. K. Malyutina, and M. I. Voevoda
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Effect of flanking sequences on the accuracy of the recognition of transcription factor binding sites.
Khlebodarova T. M., Oshchepkov D. Yu., Levitsky V. G., Podkolodnaya O. A., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Stepanenko I. L., Kolchanov N. A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Human Genes Encoding Transcription Factors and Chromatin-Modifying Proteins Have Low Levels of Promoter Polymorphism: A Study of 1000 Genomes Project Data
Ignatieva EV, Levitsky VG, Kolchanov NA
[International Journal of Genomics]
|
|
Оценка роли однонуклеотидного полиморфизма в гене лимфотоксина бета при доместикации свиньи на основе биоинформационного и экспериментального подходов
Р.Б. Айтназаров, Е.В. Игнатьева, Н.Э. Базарова, В.Г.Левицкий, С.П. Князев, Я. Гон, Н.С. Юдин
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Регуляторная геномика – экспериментально-компьютерные подходы
Е. В. Игнатьева, О. А. Подколодная, Ю. Л. Орлов, Г. В. Васильев, Н. А. Колчанов
[RUSS J GENET+]
|
| 2014 |
Genetic basis of olfactory cognition: extremely high level of DNA sequence polymorphism in promoter regions of the human olfactory receptor genes revealed using the 1000 Genomes Project dataset
Ignatieva E.V., Levitsky V.G., Yudin N.S., Moshkin M.P., Kolchanov N.A.
[Front Psychol]
|
|
Ассоциация полиморфизма гена DRD4 с некоторыми факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний
Юдин Н.С., Мишакова Т.М., Игнатьева Е.В., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Малютина С.К., Воевода М.И.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Влияние фланкирующих последовательностей на точность распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов.
Хлебодарова Т.М., Ощепков Д.Ю., Левицкий В.Г., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Колчанов Н. А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Гены, контролирующие пищевое поведение и массу тела человека, и их функциональные и геномные характеристики
Е.В. Игнатьева, Д.А. Афонников, Е.И. Рогаев, Н.А. Колчанов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2013 |
Генные сети
Н.А. Колчанов, Е.В. Игнатьева, О.А. Подколодная, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Регуляторные коды транскрипции геномов эукариот
Т. И. Меркулова, Е. А. Ананько, Е. В. Игнатьева, Н. А. Колчанов
[RUSS J GENET+]
|
| 2012 |
A single nucleotide polymorphism in the promoter region of the mink tumor necrosis factor-alpha gene.
Yudin N.S., Aitnazarov R.B., Kulikov I.V., Ignatieva E.V., Trapezov O.V.
[Scientifur]
|
|
ExpertDiscovery and UGENE integrated system for intelligent analysis of regulatory regions of genes
Vaskin Y.Y., Khomicheva I.V., Ignatieva E.V., Vityaev E.E.
[In Silico Biology]
|
|
Finding biomarkers in non-model species: literature mining of transcription factors involved in bovine embryo development.
Turenne N, Tiys E, Ivanisenko V, Yudin N, Ignatieva E, Valour D, Degrelle S, Hue I
[BioData Mining]
|
|
Routes of nanoparticle uptake into mammalian organisms, their biocompatibility and cellular effect
O. A. Podkolodnaya, E. V. Ignatieva, N. L. Podkolodnyy, N. A. Kolchanov
[Biology Bulletin Reviews]
|
|
Анализ последовательностей регуляторных районов генов реляционной системой EXPERT DISCOVERY, встроенной в пакет UGENE.
Васькин Ю.Ю., Хомичева И.В., Игнатьева Е.В., Витяев Е.Е.
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
|
|
Информационная поддержка исследования механизмов регуляции транскрипции: онтологический подход
Подколодный Николай Леонтьевич Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Пути поступления наночастиц в организм млекопитающих, их биосовместимость и клеточные эффекты.
Подколодная О. А., Игнатьева Е. В. , Подколодный Н. Л. , Колчанов Н. А. .
[Успехи современной биологии]
|
|
Распределенная система RESTful-web-сервисов для реконструкции и анализа генных сетей
Подколодный Николай Леонтьевич Семенычев Александр Владимирович Рассказов Дмитрий Александрович Боровский Виктор Геннадьевич Ананько Елена Анатольевна Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Наталья Николаевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2011 |
Извлечение знаний из текстов научных публикаций и создание баз знаний в области нанобиотехнологии
В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов
[Российские нанотехнологии]
|
| 2010 |
Применение программной системы ExpertDiscovery для поиска закономерностей структурно-функциональной организации регуляторных районов генов
Хомичева И.В., Витяев Е.Е., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Шипилов Т.И.
[Вестник НГУ. Серия: математика, механика, информатика.]
|
|
Редкое сочетание двух новых однонуклеотидных полиморфизмов в интроне 16 гена рецептора рианодина RYR1 у свиней кемеровской породы
Юдин Н.С., Князев С.П., Айтназаров Р.Б., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Игнатьева Е.В., Никитин С.В., Ермолаев В.И.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2009 |
Выявление новых сайтов транскрипционных факторов SREBP в промоторных районах генов позвоночных на основе комбинации биоинформационного и экспериментального подходов
Е.В. Игнатьева, Т.И. Меркулова, Д.Ю. Ощепков, Н.В. Климова, Г.В. Васильев, И.И. Турнаев, В.Ф. Кобзев, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2008 |
Genetic algorithm and optimized weight matrix application for peroxisome proliferator response elements recognition: Prerequisites of accuracy growth for wide genome research
Victor G. Levitsky, Elena V. Ignatieva, Eugenia Aman, Tatyana I. Merkulova, Nikolay A. Kolchanov, T. Charles Hodgman
[INTELL DATA ANAL]
|
|
TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes
N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko
[INTELL DATA ANAL]
|
|
Анализ структуры инсулин-зависимых регуляторных контуров зрелых адипоцитов
Кузнецова Т.Н., Е.В. Игнатьева, В.А. Мордвинов, А.В. Катохин, М.Ю. Шаманина, Д.Ю. Ощепков, Н.А. Колчанов
[Успехи физиологических наук]
|
| 2007 |
Combined experimental and computational approaches to study the regulatory elements in eukaryotic genes
Kolchanov NA, Merkulova TI, Ignatieva EV, Ananko EA, Oshchepkov DY, Levitsky VG, Vasiliev GV, Klimova NV, Merkulov VM, Hodgman TC
[BRIEF BIOINFORM]
|
|
Effective transcription factor binding site prediction using a combination of optimization, a genetic algorithm and discriminant analysis to capture distant interactions
Levitsky V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Turnaev I.I., Merkulova T.I., Kolchanov N.A., Hodgman T.C.
[BMC BIOINFORMATICS]
|
|
Search for new binding sites for the transcription factor SF-1 by the SITECON method: experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes
Ignat'eva EV, Klimova NV, Oshchepkov DY, Vasil'ev GV, Merkulova TI, Kolchanov NA.
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Поиск новых сайтов связывания транскрипционного фактора SF1 методом SITECON: экспериментальная проверка и анализ регуляторных районов генов-ортологов.
Игнатьева Е. В., Климова Н. В., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А.
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах
Меркулова Т. И., Ощепков Д. Ю., Игнатьева Е. В., Ананько Е.В., Левицкий В.Г., Васильев Г. В., Климова Н. В., Меркулов В.М., Колчанов Н.А.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
| 2006 |
Potential binding sites for SF-1: Recognition by the SiteGA method, experimental verification, and search for new target genes
Klimova NV, Levitsky VG, Ignatieva EV, Vasiliev GV, Kobzev VF, Busygina TV, Merkulova TI, Kolchanov NA
[Molecular Biology]
|
|
Выявление потенциальных сайтов связывания транскрипционного фактора SF-1 методом SiteGA, их экспериментальная проверка и поиск новых генов-мишеней этого фактора
Климова Н.В., Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А.
[Molecular Biology]
|
|
Генные сети липидного метаболизма
Колчанов Н.А., Воевода М.И., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Игнатьева Е.В.
[Бюллетень СО РАМН]
|
|
Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов с помощью метода SiteGA
Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В.,Ананько Е.А.,Меркулова Т.И., Колчанов Н.А.,Ходжман Ч.
[BIOPHYSICS]
|
| 2005 |
Binding Sites for Transcription Factor SF-1 in Promoter Regions of Genes Encoding Mouse Steroidogenesis Enzymes 3βHSDI and P450c17
T.V. Busygina, G.V. Vasiliev, N.V. Klimova, E.V. Ignatieva, A.V. Osadchuk
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Cаийты связывания транскрипционного фактора SF1 в промоторных районах генов, кодирующих ферменты стероидогенеза 3бетаГСДI и Р450с17 мыши
Бусыгина Т.В., Васильев Г.В., Климова Н.В., Игнатьева Е.В., Осадчук А.В.
[Биохимия]
|
|
Интеграция генных сетей, контролирующих физиологические функции организма
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Суслов В.В., Хлебодарова Т.М., Проскура А.Л., Воронич Е.С., Дубовенко Е.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2004 |
SITECON: a tool for detecting conservative conformational and physicochemical properties in transcription factor binding site alignments and for site recognition.
Oshchepkov D.Y., Vityaev E.E., Grigorovich D.A., Ignatieva E.V., Khlebodarova T.M.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Интегрированная компьютерная система по регуляции экспрессии генов эукариот.
Н. А. Колчанов, О. А Подколодная, Е. А. Ананько, Д. А. Афонников, О. В. Вишневский, Д. В. Воробьев, Е. В. Игнатьева, В. Г. Левицкий, В. А. Лихошвай, Н.А.Омельянчук, Н.Л. Подколодный, А. В. Ратушный
[Molecular Biology]
|
| 2002 |
GeneNet database: Description and Modeling of Gene Networks.
Kolchanov N.A., Nedosekina E.A., Ananko E.A., Likhoshvai V.A., Podkolodny N.L., Ratushny A.V., Stepanenko I.L., Podkolodnaya O.A., Ignatieva E.V., Matushkin Yu.G.
[In Silico Biology]
|
|
GeneNet: a database on structure and functional organisation of gene networks.
Ananko E.A., Podkolodny N.L., Stepanenko I.L., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Kolchanov N.A.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
Transcription Regulatory Regions Database (TRRD): its status in 2002
Kolchanov NA, Ignatieva EV, Ananko EA, Podkolodnaya OA, Stepanenko IL, Merkulova TI, Pozdnyakov MA, Podkolodny NL, Naumochkin AN, Romashchenko AG
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
| 2001 |
Сравнительный анализ методов распознавания потенциальных сайтов связывания транскрипционных факторов.
М.А. Поздняков, Е.Е. Витяев, Е.А. Ананько, Е.В. Игнатьева, О.А. Подколодная, Н.Л. Подколодный, С.В. Лаврюшев, Н.А. Колчанов
[Molecular Biology]
|
| 1999 |
GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот
Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон
[BIOPHYSICS]
|
|
Integrated databases and computer systems for studying eukaryotic gene expression.
Kolchanov N.A., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Ananko E.A., Kolpakov F.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Goryachkovskaya T.N., Stepanenko I.L., Merkulova T.I., Babenko V.N., Ponomarenko J.V., Kochetov A.V., Podkolodny N.L., Vorobyev D.G., Lavrushev S.V., Grigorovich D.A., Kondrakhin Yu.V., Milanesi L., Wingender E., Solovyev V.V., Overton G.C.
[BIOINFORMATICS]
|
| 1998 |
GeneExpress: a computer system for description, analysis, and recognition of regulatory sequences in eukaryotic genome.
N.A. Kolchanov, M.P. Ponomarenko, A.E. Kel, A.S. Frolov, F.A. Kolpakov, T.N. Goryachkovsky, O.V. Kel, E.A. Ananko, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, V.N. Babenko, I.L. Stepanenko, A.G. Romashchenko, T.I. Merkulova, D.G. Vorobiev, S.V. Lavryushev, A.V. Kochetov, G.B. Kolesov, V.V. Solovyev, L. Milanesi, N.L. Podkolodny, E. Wingender, T. Heinemeyer
[Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol]
|
Монографии
| 2022 |
A Catalog of Human Genes Associated With Pathozoospermia and Functional Characteristics of These Genes.
Ignatieva E.V., Osadchuk A.V., Kleshchev M.A., Bogomolov A.G., Osadchuk L.V.
|
| 2012 |
Разработка методов, алгоритмов и программ параллельного моделирования в биоинформатике
Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, К.В. Гунбин, М.А. Генаев, Ю.Л. Орлов, Е.В. Игнатьева, О.В. Вишневский, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, Н.А. Колчанов
|
| 2008 |
Регуляторные последовательности ДНК: исследование компьютерными методами.
Ощепков Д.Ю., Бугреев Д.В., Невинский Г.А., Колчанов Н.А., Игнатьева Е.В., Климова Н.В., Васильев Г.В., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Воробьев Ю.Н., Емельянов Д.Ю., Левицкий В.Г., Ананько Е.А., Вишневский О.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В.
|
|
Регуляторные последовательности ДНК: описание в базах данных.
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Степаненко И.Л., Хлебодарова Т.М., Меркулова Т.И., Меркулов В.М., Мищенко Е.Л., Ибрагимова С.С., Смирнова О.Г., Подколодный Н.Л., Ромащенко А.Г., Ощепков Д.Ю., Мигинский Д.С.
|
| 2006 |
ARTSITE DATABASE: COMPARISON OF IN VITRO SELECTED AND NATURAL BINDING SITES OF EUKARYOTIC TRANSCRIPTION FACTORS
Khlebodarova, O. Podkolodnaya, D. Oshchepkov, D. Miginsky, E. Ananko, E. Ignatieva
|
|
TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS DATABASE (TRRD): A SOURCE OF EXPERIMENTALLY CONFIRMED DATA ON TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS OF EUKARYOTIC GENES
N. Kolchanov, E. Ignatieva, O. Podkolodnaya, E. Ananko, I. Stepanenko, T. Merkulova, T. Khlebodarova, V. Merkulov, N. Podkolodny, D. Grigorovich, A. Poplavsky, A. Romashchenko
|
Конференции
| 2022 |
Functional and evolutionary characteristics of the gene network
controlling appetite in mice: lessons from knockout or
knockdown animals
Ignatieva E.V., Mustafin Z.S., Lashin S.A.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022)]
|
| 2020 |
Reconstruction and analysis of regulatory gene networks involving human genes associated with main forms of pathozoospermia
Ignatieva E.V., Osadchuk A.V., Kleshev M.A., Osadchuk L.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020)]
|
|
Software pipeline for the analysis of the functional role of nucleotide substitutions in regulatory regions of genes and its testing on polymorphisms associated with obesity
Matrosova E.A., Efimov V.M., Ignatieva E.V.
[12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology»]
|
|
Towards a comprehensive catalog of human genes associated with main forms of pathoszoopermia and its functional annotation.
Ignatieva E.V., Osadchuk A.V., Kleshev M.A., Osadchuk L.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020)]
|
| 2019 |
Context analysis of the core promoter region of mouse genes differently expressed in hypothalamic energy-sensing neurons in response to weight-loss.
Vishnevsky O.V., Bocharnikov A.V., Efimov V.M., Ignatieva E.V.
[Proceedings of 9-th Moscow Conference on Computational Molecular Biology]
|
|
Gene networks in a post-genomic era.
Ignatieva E.V.
[Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019) The Eleventh International Young Scientists School.]
|
|
Reconstruction and analysis of the network of interactions between genes that regulate human body weight
Matrosova E.A., Ignatieva E.V.
[Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019) The Eleventh International Young Scientists School.]
|
|
Reconstruction and analysis of the of protein-protein interaction network involved in the human body weight regulation.
Matrosova E.A, Ignatieva E.V.
[Proceedings of 9-th Moscow Conference on Computational Molecular Biology]
|
| 2018 |
A catalog of human genes and a gene network controlling feeding behavior and body weight.
E.V. Ignatieva
[BGRS\SB-2018]
|
|
Evolutionary analysis and mathematical modeling of gene networks of energy
metabolism disorders
S.A. Lashin, Z.S. Mustafin, V.A. Manevich,
D.A. Afonnikov, E.V. Ignatieva, Yu.G. Matushkin, V.V. Klimontov
[BGRS\SB-2018 The 11th International Conference Systems Biology and Biomedicine, SBioMed-2018 Symposium]
|
|
Evolutionary analysis and mathematical modeling of gene networks of energy metabolism disorders
Lashin S.A., Mustafin Z.S., Manevich V.A., Afonnikov D.A., Ignatieva E.V., Matushkin Yu.G., Klimontov V.V.
[Systems Biology and Biomedicine (SBioMed-2018): Symposium]
|
|
Exome-wide search and functional annotation of genes associated with severe forms of tick-borne encephalitis in Russians.
N.S. Yudin, A.A. Yurchenko, M.I. Voevoda, E.V. Ignatieva
[SBioMed-2018]
|
|
Gene networks of human hearing impairments: reconstruction and analysis.
Zamyatin V.I., Mustafin Z.S., Ignatieva E.V., Matushkin Yu.G., Posukh O.L., Lashin S.A.
[The Tenth International Young Scientists School Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2018).]
|
|
The overlapped motifs co-occurrence in ChIP-seq data.
V.G. Levitsky,D.Y. Oshchepkov, E.V. Zemlyanskaya, V.V. Mironova, E.V. Ignatieva,O.A. Podkolodnaya, T.I. Merkulova
[The 11th International Conference “On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB'2018)]
|
| 2017 |
Reconstruction and analysis of the human protein-protein interaction network involved in response to tick-borne encephalitis virus infection
Ignatieva E.V., Igoshin A.V., Yudin N.S.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB’17)]
|
|
THEORETICAL ANALYSIS OF THE NETWORK INTEGRATING HUMAN GENES INVOLVED IN RESPONSE TO TICK-BORNE ENCEPHALITIS VIRUS INFECTION
Yudin N.S., Igoshin A.V., Ignatieva E.V.
[Беляевские чтения. Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
|
|
Поиск вариантов генов, детерминирующих предрасположенность человека к тяжелым формам клещевого энцефалита
Бархаш А.В., Юрченко А.А., Юдин Н.С., Игнатьева Е.В., Козлова И.В., Борищук И.А., Позднякова Л.Л., Воевода М.И., Ромащенко А.Г.
[Российская научная конференция, посвященная 80-летию открытия вируса клещевого энцефалита "Клещевой энцефалит и другие переносимые клещами инфекции"]
|
| 2016 |
Identification of new candidate genes for elevated body mass index near GWAS SNPs using transcript annotations from Ensembl and HAVANA projects.
Ignatieva E.V., V.G. Levitsky
[The Tenth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems biology BGRS/SB2016]
|
|
Reconstruction and analysis of a network of protein-protein inter actions functioning in mature mammalian adipocyte
Ignatieva E.V.
[The Eighth International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics” – SBB-2016]
|
|
The compendium of human genes controlling feeding behavior or body weight, reconstruction of networks and analysis of their properties.
Ignatieva E.V., O.V. Saik, D.A. Afonnikov
[The Tenth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems biology BGRS/SB2016]
|
| 2015 |
Functional characterization of genes controlling mature mammalian adipocyte network.
Elena V. Ignatieva
[Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB 2015]
|
| 2014 |
Controlled vocabularies and information tables for the knowledge base on epigenetic control of human embryonic stem cells
Ignatieva E.V.
[The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS/SB-2014)]
|
|
Functional characteristics of human genes containing low level of promoter polymorphism revealed from the 1000 genomes project dataset.
Ignatieva E.V., V.G. Levitsky, N.A. Kolchanov
[The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS/SB-2014)]
|
|
The compellation of human genes controlling feeding behavior or associated with body mass index and its functional and genomic characteristics
Ignatieva E.V.
[International Symposium “Human Genetics” (ISHG-2014)]
|
|
The knowledge base on molecular genetics mechanisms controlling human lipid metabolism
Ignatieva E.V.
[The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS/SB-2014)]
|
|
The Сompilation of Human Gene Networks Controlling Feeding Behavior and Thermoregulation
E.V. Ignatieva, O.V.Saik, O.A. Podkolodnaya, N.N. Podkolodnaya, P.S. Demenkov, E.S. Tiys, E.A. Oshchepkova, E.A. Ananko, N.V. Ivanisenko, O.V. Popik, N.L. Podkolodny, V.A. Ivanisenko, D.A. Afonnikov, N.A. Kolchanov, E.I. Rogaev
[The first international scientific conference "Science of the Future"]
|
| 2012 |
A single nucleotide polymorphism in the promoter region of the mink tumor necrosis factor-alpha gene.
Yudin N.S., Aitnazarov R.B., Kulikov I.V., Ignatieva E.V., Trapezov O.V.
[X International Scientific Congress in Fur Animal Production.]
|
|
Analysis of SNP distribution and inter-SNP distance in the human genome
E.V. Ignatieva, V.G. Levitsky, N.S. Yudin
[The Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS/SB'12)]
|
|
Application of the ANDVisio computer system to the interpretation of biological functions of proteins, differentially expressed in bronchoalveolar lavage of mice after a one-time intranasal administration of SiO2 nanoparticles.
E.V. Ignatieva, V.A. Ivanisenko, E.S. Tiys, P.S. Demenkov, M.P. Moshkin, S.E. Peltek.
[The Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS/SB'12)]
|
|
Distributed RESTFUL-WEB-services for the recognition and analysis of gene networks.
Podkolodnyy N.L., Semenychev A.V., Borovsky V.G., Rasskazov D.A., Ananko E.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya N.N. Podkolodnaya O.A.
[The Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS'2012)]
|
|
In silico reconstruction of multi-protein complex interacting with the common regulatory regions in the human CYP1A1/1A2 intergenic sequence.
E.V. Ignatieva E.V. Kashina, M.Yu. Shamanina, V.A. Mordvinov
[The Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS/SB'12)]
|
|
TrDB: a database of the human, mouse, and rat transcriptional regulators and its potential applications in systems biology.
E.V. Ignatieva
[The Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS/SB'12)]
|
|
Распределенная система RESTful-web-сервисов для реконструкции и анализа генных сетей
Подколодный Н.Л., Семенычев А.В., Рассказов Д.А., Деменков П.С., Боровский В.Г., Подколодная Н.Н., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А.
[XIV Российская конференция с международным участием "Распределенные информационные и вычислительные ресурсы" (DICR-2012)]
|
| 2011 |
Inter-SNP distances and SNP distribution in the human genome
Ignatieva Elena, Victor Levitsky, Nikolay Yudin
[Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB’11]
|
|
База знаний по регуляции транскрипции генов эукариот
ИгнатьеваЕ.В., Н.Л.Подколодный
[Международная конференция "Современные проблемы математики, информатики и биоинформатики", посвященная 100-летию со дня рождения члена-корреспондента АН СССР Алексея Андреевича Ляпунова]
|
|
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияние мутаций на молекулярно-генетические системы организмов
Пономаренко М.П., Игнатьева Е.В., Левицкий В.Г., Савинкова Л.К., Захаренко Л.П., Пинтус С.С., Суслов В.В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
[Программа фундаментальных исследований Президиума РАН. № 11. “Биологическое разнообразие”. Подпрограмма “Генофонды и генетическое разнообразие”. Сборник материалов. – Москва: ИОГен. 2011. С. 100-104.]
|
|
Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов SF-1 и SREBP в геномах позвоночных с помощью нового подхода, сочетающего экспериментальные и биоинформатические методы
Климова Н.В., Левицкий В.Г., Ощепков Д.Ю., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Меркулова Т.И.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика и биоинформатика»]
|
|
Распределение однонуклеотидных полиморфизмов в геноме человека
ИгнатьеваЕ.В., В.Г.Левицкий, Н.С.Юдин
[Международная конференция "Современные проблемы математики, информатики и биоинформатики", посвященная 100-летию со дня рождения члена-корреспондента АН СССР Алексея Андреевича Ляпунова]
|
| 2010 |
Bioinformatic analysis of rare single-nucleotide polymorphism combinations in the human genome.
Yudin N.S., Ignatieva E.V., Efimov V.M.
[The Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS'2010)]
|
|
Computer system for analysis of mechanisms of transcription regulation in eukaryotes
Podkolodnyy N.L., Ignatieva E.V., Rasskazov D.A., Ananko E.A., Podkolodnaya O.A., Podkolodnaya N.N., Zalevsky E.M.
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
The nanobiotechnology database
V.A. Ivanisenko, N.L. Podkolodnyy, P.S. Demenkov, T.V. Ivanisenko, N.N. Podkolodnaya, T.M. Khlebodarova, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, and N.A. Kolchanov
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'2010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
Интегрированная система для информационной поддержки исследования механизмов регуляции транскрипции
Н.Л. Подколодный, Е.В. Игнатьева, Д.А. Рассказов, О.А. Подколодная, Е.А. Ананько, Н.Н. Подколодная, Е.М. Залевский
[Всероссийская научная конференция "Электронные библиотеки: перспективные методы и технологии, электронные коллекции" – RCDL’2010, Казань, Россия, 2010]
|
|
Компьютерно-экспериментальное изучение сайтов связывания транскрипционных факторов.
Ощепков Д.Ю., Климова Н.В., Антонцева Е.В., Левицкий В.Г., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Пономаренко М.П., Драчкова И.А., Савинкова Л.К., Фурман Д.П., Мордвинов В.А., Меркулова Т.И.
[I международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»]
|
| 2009 |
Transcriptional regulation in eukaryotes
Ignatieva E
[3rd Virtual Training Workshop on Bioinformatics]
|
| 2008 |
A database for analysis of the organizational features of the transcriptional regulatory regions in the co-expressed groups of genes.
N.L. Podkolodnyy, S.S.Nechkin, E.V. Ignatieva, E.A. Ananko, O.A. Podkolodnaya.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
Computer identification of gene transcription start sites positions in human, mouse, rat whole genome sequences using data, annotated in TRRD.
IgnatievaE.V. , S.S.Nechkin, N.L. Podkolodnyy
[Proceedings of the sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008)]
|
|
Nucleosoma formation potential estimation via dinucleotide periodicity preferences.
Levitsky V.G., Podkolodnaya O.A., Ignatieva E.V., Ananko E.A.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
Nucleosome formation potential estimation via dinucleotide periodicity preferences
Levitsky V.G., Podkolodnaya O.A., Ignatieva E.V., Ananko E.A.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
SITECON: a quality tool for prediction of new potential SREBP binding sites. experimental verification and analysis of regulatory regions of vertebrate genes.
D.Y. Oshchepkov, E.V. Ignatieva, G.V.Vasiliev, N.V. Klimova, T.I. Merkulova
[Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
|
| 2006 |
A database designed for the polymorphisms of the human CCR2 gene.
Apasyeva N.V., Yudin N.S., Ignatieva E.V., Voevoda M.I., Romashenko A.G.
[fifth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure]
|
|
A gene network of adipocyte lipid metabolism: coordinated interactions between the transcription factors SREBP, LXRa AND PPARg.
Kouznetsova T.N., Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Kondrakhin Y.V., Katokhin A.V., Shamanina M.Y., Mordvinov V.A.
[Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)]
|
|
Association study of SNP of the TNF-alpha gene with bovine leukosis and evaluation of its functional significance
Yudin N.S., Vasil’eva L.A., Kobzev V.F., Kuznetsova T.N., Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Voevoda M.I., Romaschenko A.G.
[Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)]
|
|
Bioinformatics and mechanisms of molecular pathology
N.A. Kolchanov, V. Ivanisenko, M. Ponomarenko, E. Aman, E. Ignatieva, T. Kuznetsova, V. Mordvinov, P. Demenkov, A. Ratushny, V.Likhoshvai, E. Ananko, N. Podkolodny, N. Podkolodnaya, A.. Romaschenko
[Геномика, протеомика, биоинформатика и нанотехнологии для медицины – GPMB-2006 Новосибирск, июль 2006]
|
|
Development of a computer system for the automated reconstruction of molecular-genetic interaction networks.
Aman E.E., Demenkov P.S., Pintus S.S., Nemiatov A.I., Apasieva N.V., Dubovenko E.A., Ignatieva E.V., Podkolodny N.L., Ivanisenko V.A.
[Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)]
|
|
In silico cell II. Information sources for modeling Escherichia coli metabolic pathways.
Khlebodarova T.M., Ananko E.A., Nedosekina (Oschepkova) E.A. Podkolodnaya O.A., Poplavsky A.S., Smirnova O.G., Ibragimova S.M., Mishenko E.L., Stepanenko I.L., Ignatieva E.V., Proskura A.L., Nishio Imaizumi, Usuda Matsui, Podkolodny N.L.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
Reconstruction and computer analysis of the fatty acid β-oxidation gene network regulated by the PPAR transcription factors.
Aman E.E., Levitsky V.G., Ignatieva E.V.
[Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)]
|
|
SITECON: a quality tool for prediction of transcription factor binding sites now handles those for SF-1. Experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes.
Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Klimova N.V., Vasiliev G.V., Merkulova T.I.
[Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)]
|
|
System computer biology in Institute of Cytology of SB RAS
Yu. Matushkin, E. Ananko, D. Afonnikov, V. Golomolzin, V. Ivanisenko, E. Ignat’eva, A. Katokhin, V.Likhoshvai, D. Miginskii, N. Omelyanchuk, S. Peltek, T. Khlebodarova, N. Kolchanov
[Saint-Petersburg International Workshop on NanoBiotechnologies]
|
|
TRRD - the database on transcription regulatory regions of eukaryotic genes
Ignatieva E.V.
[First Virtual Training Workshop on Bioinformatics organized by the Asian Bioinformatics Research and Education Network (ABREN) May,8-July, 8, 2006]
|
|
TRRD: a database on experimentally identified transcription regulatory regions and transcription factor binding sites.
Kolchanov N.A., Podkolodnaya O.A., Ananko E.A., Ignatieva E.V., Stepanenko I.L., Khlebodarova T.M., Merkulov V.M., Merkulova T.I., Podkolodny N.L., Romashchenko A.G.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
The SITEGA and PWM methods application for transcription factor binding sites recognition in EPD promoters
Levitsky V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Merkulova T.I
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
The analysis of SREBP binding sites distribution in gene regions by combined SiteGA and PWM approach.
Proskura A.L., Levitsky V.G., Ignatieva E.V.
[Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)]
|
|
Компьютерные подходы к исследованию влияния полиморфизмов на экспрессию генов и функцию белков.
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Кочетов А.В., Игнатьева Е.В., Пономаренко М.П., Орлова Г.В., Меркулова Т.И., Ощепков Д.Ю., Аман Е.Э., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Деменков П.С., Пинтус С.С., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Турнаев И.И., Апасьева Н.В., Губина М.А., Ромащенко А.Г.
[International conference “Basic Science for Biotechnology and Medicine” September 3-7, 2006, Novosibirsk. Russia.]
|
Гранты
| 2022 |
Анализ длины теломер с использованием
отсеквенированных геномов российских пород крупного рогатого скота
Юдин Н.С., Игнатьева Е.В., Игошин А.В., Ромашев Г.А.
|
| 2019 |
Популяционное исследование мужского репродуктивного потенциала: оценка возможностей полно-экзомного секвенирования и идентификация новых генов, ассоциированных с ослабленным сперматогенезом
Осадчук Людмила Владимировна, Осадчук Александр Владимирович, Пономаренко Михаил Павлович, Васильев Геннадий Владимирович, Игнатьева Елена Васильевна, Клещев Максим Александрович, Богомолов Антон Геннадьевич, Чадаева Ирина Витальевна, Колмыков Семен Константинович, Даниленко Анна Дмитриевна
|
| 2018 |
Мета-анализ полногеномных данных на основе выявления и аннотации различных структурно-функциональных типов сайтов связывания транскрипционных факторов в составе композиционных элементов
Левицкий Виктор Георгиевич (Р)
Брызгалов Леонид Олегович
Миронова Виктория Владимировна
Игнатьева Елена Васильевна
Ощепков Дмитрий Юрьевич
Новикова Дарья Дмитриевна
Вибе Даниил Станиславович
Землянская Елена Васильевна
Мухин Алексей Максимович
|
| 2011 |
Проектирование и разработка RESTful-веб-сервисов для создания распределенной инфраструктуры, ориентированной на решения задач реконструкции и анализа генных сетей
Н.А. Колчанов, Н.Л. Подколодный, В.С. Тимонов, И.Р. Акбердин, Е.А. Ананько, М.А. Генаев, Е.В. Игнатьева, Ф.В. Казанцев, Н.Н. Подколодная, О.А. Подколодная, Д.А. Рассказов, А.В. Семенычев
|
| 2010 |
Разработка алгоритмов для биоинформационного анализа комплексных метаболических и молекулярно-генетических сетей
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Иванисенко Н.В., Медведева И.В., Тийс Е.С., Брагин А.О., Игнатьева Е.В., Ананько Е.В., Мищенко Е.Л., Сайл О.В.
|
| 2009 |
Разработка Веб-ориентированной экспертной системы, предназначенной для распознавания взаимосвязанных белков, выявленных с применением постгеномных методов
Колчанов Н.А., Подколодный Н.Л., Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Медведева И.В., Тийс Е.С., Брагин А.О., Игнатьева Е.В., Ананько Е.В., Подколодная Н.Н., Подколодная О.А., Хлебодарова Т.М.
|
|
Разработка программно-информационного комплекса для исследования механизмов регуляции экспрессии генов эукариот
Кочетов А.В., Подколодный Н. Л., Игнатьева Е. В., Подколодная О. А., Ананько Е. А., Рассказов Д. А., Подколодная Н. Н., Волкова О. А.
|
|
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов
Акбердин Илья Ринатович, Гунбин Константин Владимирович, Захаренко Л.П., Иванисенко Владимир Александрович, Игнатьева Елена Васильевна, Казанцев Федор Владимирович, Левицкий Виктор Георгиевич, Лихошвай Виталий Александрович, Омельянчук Надежда Анатольевна, Ощепков Дмитрий Юрьевич, Пинтус Сергей Сергеевич, Пономаренко Михаил Павлович, Пономаренко Петр Михайлович, Ри Максим Тексенович, Савинкова Людмила Кузминична, Суслов Валентин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович, Хлебодарова Тамара Михайловна
|
|
ПОСТГЕНОМНАЯ БИОИНФОРМАТИКА: КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ
76 человек
|
| 2008 |
Создание баз данных в области нанобиотехнологии как элементов информационной составляющей инфраструктуры наноиндустрии
В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов
|
|
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов.
Савенкова Л.А., Пономаренко М.П., Игнатьева Е.В., Левицкий В.Г., Акбердин И.Р., Миронова, Титов
|
|
Проекты Программы фундаментальных исследований Президиума РАН Б.26 Биологическое разнообразие (координатор ак. Павлов Д.С.)
Колчанов Николай Александрович Савенкова Людмила Александровна Пономаренко Михаил Павлович Игнатьева Елена Васильевна Левицкий Виктор Георгиевич Захаренко Людмила Павловна Акбердин Илья Ринатович Титов Игорь Иванович Миронова
|
Учебные курсы
| 2018 |
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем II: регуляторные геномные последовательности (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
Игнатьева Е.В., Вишневский О.В., Ощепков Д.Ю.
|
|
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем IV: генные сети (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
Игнатьева Е.В., Сайк О.В.
|
| 2017 |
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем II: регуляторные геномные последовательности (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
Игнатьева Е.В., Вишневский О.В., Ощепков Д.Ю.
|
|
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем IV: генные сети (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
Игнатьева Е.В., Сайк О.В.
|
| 2012 |
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем II: регуляторные геномные последовательности (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
|
| 2011 |
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем II: регуляторные геномные последовательности (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.
Игнатьева Е.В.
|
| 2010 |
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем II: регуляторные геномные последовательности (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
Игнатьева Е.В.
|
| 2004 |
Генные сети
|
| 2003 |
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем II: регуляторные геномные последовательности (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)
|
Патенты
| 2023 |
База данных по генам рецепторов клеточной поверхности, участвующих в регуляции аппетита (ГРРегАпп)/ A database of on cell surface receptor genes involved in the regulation of appetite (RGRegApp)
Игнатьева Е.В.
|
| 2019 |
База данных генов человека, вовлеченных в ответ на инфекцию вирусного клещевого энцефалита (ЭнцеГенХост) / Database of human genes involved in response to tick-borne encephalitis virus infection (TBEVHostDB)
Игнатьева Е.В., Игошин А.В., Юдин Н.С.
|
| 2012 |
Интегрированная база данных молекулярно-генетических систем (МГСБаза)/Integrated molecular genetic systems database (MGSBase)
Подколодный Н.Л., Семенычев А.В., Рассказов Д.А., Деменков П.С., Подколодная Н.Н., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А.
|
| 2010 |
База данных нанобиоматериалов (НАНОБИОБАЗА)/Nanobiomaterial database (NANOBIOBASE)
Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Колчанов Н.А.
|
|
База данных нанобиотехнологий (НАНОБИОТЕХБАЗЕ)/Nanobiotechnology database (NANOBIOTECHBASE)
Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Колчанов Н.А.
|
| 2009 |
База данных: Матрицы функциональных сайтов связывания транскрипционных факторов про- и эукариот (RealSite)
Хлебодарова Т.М., Степаненко И.Л., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Подколодная О.А.
|
| 2007 |
База данных: Сайты связывания транскрипционных факторов (ТФСАЙТ)/ Transcription factor sites database (TFSITE).
Степаненко И.Л., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А., Хлебодарова Т.М., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
|
База данных: Транскрипционный Фактор-Ген Млекопитающих взаимодействия (ТФГМВ)/ Transcription Factor- Mammalian Gene Interactions (TFMGI)
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Игнатьева Е.В., Генаев М.А.
|
|
База данных: Экспрессия эукариотических генов (ЭуГенЭксп) / Eukaryotic Gene Expression Database (EuGenExp)
Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А., Степаненко И.Л., Хлебодарова Т.М., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
| 2006 |
База данных: Регуляторные районы генов прокариот (ProkaTEX)
Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Поплавский А.С., Наумочкин А.Н., Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
|
База кинетических данных (KiNET)
Недосекина Е.А., Хлебодарова Т.М., Поплавский А.С., Смирнова О.Г., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
|
|
