TIM29 is required for enhanced stem cell activity during regeneration in the flatworm Macrostomum lignano Mouton S., Ustyantsev K., Beltman F., Glazenburg L., Berezikov E. SCI REP-UK, 2021
Diversity and Phenotypical Effect of the Allele Variants of Dwarfing Rht Genes in Wheat. Sukhikh I.S., Vavilova V.Y., Blinov A.G., Goncharov N.P. RUSS J GENET+, 2021, Vol. 57(2):127-138.
Computational Analysis of Spliced Leader Trans-Splicing in the Regenerative Flatworm Macrostomum lignano Reveals its Prevalence in Conserved and Stem Cell Related Genes Ustyantsev K., Berezikov E. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021
Macrostomum lignano as a model to study genetics and genomics of parasitic flatworms Ustyantsev K., Vavilova V., Blinov A., Berezikov E. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021
Proof of principle for piggyBac-mediated transgenesis in the flatworm Macrostomum lignano Kirill Ustyantsev, Jakub Wudarski, Igor Sukhikh, Filipa Reinoite, Stijn Mouton, Eugene Berezikov GENETICS, 2021
2020
Evolution of Btr1-А Gene in Diploid Wheat Species of the Genus Triticum L. Vavilova V., Konopatskaia I., Blinov A., Goncharov N.P. RUSS J GENET+, 2020, Vol. 56, No. 5. P. 633–637.
Classification of LTR retrotransposons in the flatworm Macrostomum lignano M. Biryukov, E. Berezikov, K. Ustyantsev Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2020, 6(2), 54-59
Green revolution ‘stumbles’ in a dry environment: Dwarf wheat with Rht genes fails to produce higher grain yield than taller plants under drought S. Jatayev, I. Sukhikh, V. Vavilova, S. E. Smolenskaya, N. P. Goncharov, A. Kurishbayev, L. Zotova, A. Absattarova, D. Serikbay, Y.‐G. Hu, N. Borisjuk, N. K. Gupta, B. Jacobs, S. de Groot, F. Koekemoer, B. Alharthi, K. Lethola, D. T. Cu, C. Schramm, P. Anderson, C. L. D. Jenkins, K. L. Soole, Y. Shavrukov, P. Langridge PLANT CELL ENVIRON, 2020, Vol. 43. P. 2355–2364.
Genetic variability of spelt factor gene in Triticum and Aegilops species Vavilova V., Konopatskaia I., Blinov A., Kondratenko E.Ya., Kruchinina Y.V., Goncharov N.P. BMC PLANT BIOL, 2020, Vol. 21. (Suppl. 1):310
TaDrAp1 and TaDrAp2, Partner genes of a transcription repressor, coordinate plant development and drought tolerance in spelt and bread wheat Zotova L., Shamambaeva N., Lethola K., Alharthi B., Vavilova V., Smolenskaya S.E., Goncharov N.P., Jatayev S., Kurishbayev A., Gupta N.K., Gupta S., Schramm C., Anderson P., Jenkins C.L.D., Soole K.L., Shavrukov Yu. INT J MOL SCI, 2020, Vol. 21. P. 8296
Эволюция гена Btr1-А у диплоидных видов пшениц рода Triticum L. Вавилова В.Ю., Конопацкая И.Д., Блинов А.Г., Гончаров Н.П. Генетика, 2020, Т. 56, №5. С. 609-614.
2016
Genetic diversity of aboriginal and invasive populations of four-eyed fir bark beetle Polygraphus proximus Blandford (Coleoptera, Curculionidae, Scolytinae) Alexandr Kononov, Kirill Ustyantsev, Alexandr Blinov, Victor Fet, Yuri N. Baranchikov AGR FOREST ENTOMOL, 2016, DOI: 10.1111/afe.12161
Genetic diversity among eight Dendrolimus species in Eurasia (Lepidoptera: Lasiocampidae) inferred from mitochondrial COI and COII, and nuclear ITS2 markers Alexander Kononov, Kirill Ustyantsev, Baode Wang, Victor C Mastro, Victor Fet, Alexander Blinov, Yuri Baranchikov BMC GENET, 2016, 3, 17, 173
2015
Convergent evolution of ribonuclease H in LTR retrotransposons and retroviruses Kirill Ustyantsev, Olga Novikova, Alexander Blinov and Georgy Smyshlyaev MOL BIOL EVOL, 2015
2010
Анализ вырожденных олигонуклеотидных мотивов в промоторах генов миРНК, экспрессирующихся в различных тканях млекопитающих О.В.Вишневский, К.В.Гунбин, А.В.Бочарников, Е.В.Березиков Вестник МГУ, 2010, No. 4, pp. 73–75
2008
dUTPase-содержащие Metaviridae LTR ретротранспозоны из генома Phanerochaete chrysosporium (Fungi: Basidiomycota) Новикова ОС, Блинов АГ Doklady Biochemistry and Biophysics, 2008, Т. 420, С. 699-702
Novel clades of chromodomain-containing Gypsy LTR retrotransposons from mosses (Bryophyta) Novikova O, Mayorov V, Smyshlyaev G, Fursov M, Adkison L, Pisarenko O, Blinov A PLANT J, 2008, V. 56, P. 562-574
2007
CR1 clade of non-LTR retrotransposons from Maculinea butterflies (Lepidoptera: Lycaenidae): evidence for recent horizontal transmission Novikova O, Sliwinska E, Fet V, Settele J, Blinov A, Woyciechowski M BMC EVOL BIOL, 2007, V. 7, P. 93
LTR РЕТРОТРАНСПОЗОНЫ ИЗ ГЕНОМОВ Aspergillus fumigatus И Aspergillus nidulans. О. Новикова, В. Фет, А. Блинов Molecular Biology, 2007, Т. 41, С. 830-838
Molecular phylogeny of the genus Triticum L K. A. Golovnina, S. A. Glushkov, A. G. Blinov, V. I. Mayorov, L. R. Adkison and N. P. Goncharov PLANT SYST EVOL, 2007, V. 264, P. 195-216
Vasa-related genes and their expression in stem cells of colonial parasitic rhizocephalan barnacle Polyascus polygenea (Arthropoda: Crustacea: Cirripedia: Rhizocephala) Shukalyuk A.I., Golovnina K.A., Baiborodin S.I., Gunbin K.V., Blinov A.G., Isaeva V.V. CELL BIOL INT, 2007, 31(2):97-108
ГОМОЛОГ-ЗАВИСИМАЯ ИНАКТИВАЦИЯ LTR РЕТРОТРАНСПОЗОНОВ В ГЕНОМАХ Aspergillus fumigatus И A. Nidulans О. Новикова, В. Фет, А. Блинов Molecular Biology, 2007, Т. 41, С. 973-981
2006
Divergent non-LTR retrotransposon lineages from the genomes of scorpions (Arachnida: Scorpiones) Glushkov S., Novikova O., Blinov A., Fet V. MOL GENET GENOMICS, 2006, V. 275. P. 288-296.
Molecular phylogeny of Palaearctic genera of Gomphocerinae grasshoppers (Orthoptera, Acrididae) Bugrov A., Novikova O., Mayorov V., Adkison L., Blinov A. SYST ENTOMOL, 2006, V. 31. P. 362-368.
Synthtic species are donors to increase wheat biodiversityn N.P. Goncharov, E.Ja. Kondratenko, M.A. Khrabrova, A.A. Konovalov, L.I. Laikova, A.G. Blinov, K.A. Golovnina, S.A. Glushkov Агромеридиан., 2006, V. 3(4), P.86-91.
Evolutionary history of wheats - the main cereal of mankind Goncharov N.P., Golovnina K.A., Kilian B., Glushkov S., Blinov A., Shumny V.K.
Конференции
2020
Genome and karyotype evolution after whole genome duplication in free-living flatworms of the genus Macrostomum. Zadesenets K., Ershov N., Oshchepkov D., Berezikov E., Schaerer L., Rubtsov N.B. BGRS/SB-2020. July 6-10, 2020 Novosibirsk
LTR retrotransposons in green plants show multiple examples of convergent evolution Biryukov M., Ustyantsev K. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2020)
Development of a platform for piggyBac-mediated mutagenesis in a regenerative free-living flatworm Macrostomum lignano K. Ustyantsev, J. Wudarski, F. Reinoite , S. Mouton, E. Berezikov 4th Uppsala Transposon Symposium
A study of genes controlling carcinogenesis in a regenerative model flatworm Macrostomum lignano Ustyantsev K., Vavilova V., Biryukov M., Berezikov E. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology“
MLIG-SKP1 IS REQUIRED FOR CORRECT SPERM DEVELOPMENT IN THE REGENERATIVE FREE-LIVING FLATWORM MACROSTOMUM LIGNANO V. Vavilova, E. Bazarova, M. Biryukov, K. Ustyantsev, E. Berezikov OpenBIO2020
DEVELOPING AN EXPERIMENTAL PLATFORM TO STUDY
MECHANISMS OF STEM CELL DIFFERENTIATION USING
A MODEL REGENERATIVE FLATWORM MACROSTOMUM LIGNANO K. V. Ustyantsev, V. Yu. Vavilova, M. Yu. Biryukov,
F. Reinoite, J. Wudarski, S. Mouton, E. V. Berezikov OpenBIO2020
Diversity and evolution of Tat LTR retrotransposon structures in non-flowering plants Mikhail Biryukov, Kirill Ustyantsev Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020)
2018
Establishing free-living flatworm Macrostomum lignano as a model to study links between regeneration and cancer M. Biryukov, I. Sukhikh, V. Vavilova, K. Ustyantsev, E. Berezikov The Tenth International Young Scientists School Systems Biology and Bioinformatics
2016
DIVERSITY OF MARINER-LIKE DNA TRANSPOSONS IN THE GENOME OF LOCUSTA MIGRATORIA I. Sukhih, K. Ustyantsev, A. Kononov, I. Konopatskaia THE TENTh INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE\systems biology (BGRS\SB-2016)
2015
Convergent evolution of Ribonuclease H in LTR Retrotransposons and Retroviruses Smyshlyaev G., Ustyantsev K., Novikova O., Blinov A. EMBO | EMBL Symposium: The Mobile Genome: Genetic and Physiological Impacts of Transposable Elements
Diversity and distribution of DNA transposons in five neoblast-containing organisms Ustyantsev Kirill, Sormacheva Irina, Blinov Alexandr and Berezikov Eugene 8th International Macrostomum Meeting
2013
Уникальный домен РНКазы Н и дополнительные рамки считывания Tat-LTR-ретротранспозонов растений. Смышляев Г. А., Устьянцев К. В. мнск 2013 г. новосибирск
2010
Analysis of the degenerate motifs in promoters of miRNA genes, expressed in different tissues of mammalians Vishnevsky O.V., Gunbin K.V., Bocharnikov A.V., Berezikov E.V. 14-th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles
Analysis of the conservative motifs in promoters of miRNA genes, expressed in different tissues of mammalians O.V.Vishnevsky, K.V. Gunbin, A.V.Bocharnikov, E.V. Berezikov Evolutionary Biology Concepts, Molecular and Morphological Evolution
Analysis of the degenerate motifs in 5’- regulatory regions of brain-specific miRNA genes of primates Vishnevsky O.V., Gunbin K.V., Bocharnikov A.V., Berezikov E.V. Molecular Phylogenetics: Contributions to the 2nd Moscow International Conference "Molecular Phylogenetics" (Moskow, Russia, May 18-21, 2010)
2007
Доместикация растений, или формирование цивилизаций посредством селекции злаков. Программа: Происхождения культурных растений и их эволюции: на примере пшениц Гончаров Н.П., Блинов А.Г., Головнина К.А., Шумный В.К. Круглый стол «Происхождение и эволюция жизни на Земле», посв. 50-летию СО РАН
Молекулярная филогения рода Triticum L. Гончаров Н.П., Головнина К.А., Блинов А.Г. Школа молод. селекц. им. С.А. Кунакбаева
2006
Molecular phylogeny of the genus Triticum L. Golovnina K., Glushkov S., Blinov A., Mayorov V., Adkison L., Goncharov N. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
Гранты
2020
Происхождение и эволюция структурных вариантов Тat LTR-ретротранспозонов зелёных растений РФФИ, номер гранта РФФИ 20-34-90114 Аспиранты
Разработка экспериментальной платформы для исследования механизмов дифференцировки стволовых клеток на основе регенерирующего плоского червя Macrostomum lignano в качестве модельного организма РНФ, номер гранта 20-14-00147
2018
Молекулярные механизмы контроля регенерации и канцерогенеза у Макростомид РФФИ, номер гранта 18-04-01011
2016
Разнообразие и эволюция Tc1/mariner ДНК транспозонов в геномах насекомых отряда Orthoptera РФФИ
2015
Разнообразие, распространение и практическое применение ДНК транспозонов в геномах некоторых свободноживущих билатеральных животных типов Xenacoelomorpha и Platyhelminthes, обладающих высокой способностью к регенерации Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 15-04-08003
2014
Функциональная и эволюционная характеристика ретровирусов растений Российский фонд фундаментальных исследований, номер гранта 14-04-01498
2012
Мониторинг распространения и генетического разнообразия паразитических микроспоридий рода Nosema в природных популяциях шмелей (род Bombus) и пчел (род Apis) Министерство образования и науки Российской Федерации, номер гранта 8124
2005
The Role of Drosophila Merlin in the Control of Mitosis Exit and Development. Министерство Безопасности США, номер гранта W81XWH-04-1-0509
Генетический контроль пролиферации клеток РФФИ, номер гранта РФФИ 05-04-48316-а
Научное руководство
2020
Филогенетический анализ видов саранчовых семейств Acrididae и Pamphagidae на основе митохондриальных и ядерных маркеров Сухих Игорь Сергеевич 03.02.07 - генетика, 2020-12-02
Учебные курсы
2008
Организация и функционирование молекулярно-генетических систем I: геном про- и эукариот Блинов Александр Геннадьевич Новосибирский национальный исследовательский государственный Университет (НГУ), Факультет Естественных Наук, Кафедра информационной биологии, семестров: 1