1.     Основное направление исследований

• Механизмы процесса инактивации Х-хромосомы у самок млекопитающих
• Эмбриональные и региональные стволовые клетки
• Репрограммирование дифференцированных соматических клеток к плюрипотентному состоянию

2.     Задачи, решаемые в рамках основного направления на данном этапе:

1. Исследование динамики изменений, происходящих в смысловой и антисмысловой транскрипции, модификациях хроматина, локализации и частоте использования ориджинов репликации ДНК и связывании транскрипционных факторов в центре инактивации обыкновенных полевок.
2. Импринтированная инактивация Х-хромосомы у грызунов: модификации хроматина и природа импринтинга.
3. Разработка и применение эффективных методов получения региональных стволовых клеток и индуцированных плюрипотентных клеток для генетической и клеточной терапии заболеваний человека.
4.  Создание панели изогенных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека, несущих мутации, связанные с развитием различных форм амиотрофического бокового склероза.
5. Поиск подходов к коррекции мутантного фенотипа крыс Браттлборо с наследственным несахарным диабетом посредством применения плюрипотентных клеток с искусственно исправленным генотипом.
6. Разработка подходов для тканевой инженерии сосудов.

Аннотация базового бюджетного проекта подразделения

Бюджетный проект VI.60.2 «Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки. Экспериментальное использование клеточных технологий для воспроизводства и коррекции патологических состояний» (координатор проекта: д.б.н. проф. С.М.Закиян). 

Цель проекта – создание клеточных моделей для моделирования и коррекции заболеваний человека, а также исследование статуса Х-хромосомы в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках.

3.     При наличии прикладных результатов (что желательно) должен быть введен еще один раздел «Прикладные разработки».

Прикладных разработок нет.

4.     Иллюстрированное описание лучших результатов, полученных подразделением за последние 5 лет  

Впервые получены трофобластные стволовые (ТС) клеточные линии обыкновенной полевки в отсутствие фактора FGF4.

Из бластоцист обыкновенной полевки M.rossiaemeridionalis с использованием полевочьего фактора LIF, ингибирующего дифференцировку, и питающего (фидерного) слоя клеток, в отсутствие фактора FGF4 были получены три независимые ТС клеточные линии. Полевочьи ТС клетки похожи на мышиные по морфологии, по экспрессии генов транскрипционных факторов, по способности при дифференцировке in vitro давать производные трофэктодермальной зародышевой линии, по способности инвазировать и разрушать ткани хозяина с образованием героррагических опухолей после инъекции ТС клеток мышам nude (рис.1). В полевочьих ТС клетках наблюдается импринтированная инактивация отцовской Х-хромосомы, что характерно для трофобластной зародышевой линии. Было показано, что у мыши фактор FGF4 и его рецептор FGFR2 являются эмбриональными сигнальными факторами, ответственными за поддержание недифференцированного состояния мультипотентных ТС клеток. Наши данные говорят о возможности существования другого сигнального пути, ответственного за установление и стабильную пролиферацию полевочьих ТС клеток.

Рисунок 1. Образование опухоли после инъекции ТС клеток полевки в мышь nude. (А) Общий вид опухоли. (B-D) Гистологические срезы гематомы. Окрашивание гематоксилином-эозином. (В) Поперечный срез центральной части гематомы через 35 дней после инъекции. (С) Увеличенное изображение отмеченного участка опухоли на рис.B; гистологический срез гематомы через кровеносный капилляр (D). (А) зона некроза, (В) пролиферирующие клетки, (С) гигантские клетки, (С₁) дифференцирующиеся гигантские клетки, (C₂) дегенерирующие гигантские клетки, (T_R) ткани реципиента, (V) кровеносный сосуд.

Изучено распределение модификаций хроматина на неактивной Х-хромосоме у обыкновенной полевки.

Проведено сравнение распределения некоторых гистоновых модификаций на метафазных пластинках клеток экстраэмбриональной эндодермы и фибробластов полевки M.rossiaemeridionalis, которые являются примерами импринтированной и случайной инактивации Х-хромосомы. Х-хромосома M.rossiaemeridionalis несет большой блок конститутивного гетерохроматина, обогащенный повторяющейся ДНК, что делает данный вид хорошей моделью для изучения структуры хроматина. В фибробластах полевки и в большинстве клеток экстраэмбриональной эндодермы в молчание неактивной Х-хромосомы, по-видимому, включено два типа факультативного гетерохроматина (рис.2). Первый обогащен триметилированием H3K27 и убиквитинированием H2A и солокализуется с бэндингом Xist РНК, тогда как второй тип гетерохроматина связан с триметилированием H3K9 и гетерохроматиновым белком HP1. Блок конститутивного гетерохроматина на Х-хромосоме M.rossiaemeridionalis имеет такой же распределение модификаций, как и второй тип факультативного хроматина. Распределение гистоновых модификаций, белка HP1 и Xist РНК на неактивной Х-хромосоме полевки одинаково в случае импринтированной и случайной инактивации Х-хромосомы.

Рисунок 2. Два типа факультативного гетерохроматина на неактивной Х-хромосоме в XEN клетках M.rossiaemeridionalis.a H3K27me3 (зеленый). b H3K9me3 (зеленый). с HP1ß (зеленый) и FK2 (красный). Метафазные пластинки окрашены DAPI (синий). Активная (X_a) и неактивная (X_i) Х-хромосомы показаны головками стрелок и стрелками соответственно. d Распределение HP1ß на активной и неактивной хромосомах. e Увеличенное изображение неактивной Х-хромосомы с линейным сканированием интенсивности DAPI (синий), HP1ß (зеленый) и FK2 (красный).

Обнаружено, что у грызунов основным репрессором гена Xist (ключевого гена процесса инактивации Х-хромосомы у самок млекопитающих) является транскрипция антисмыслового гена Tsix.

Известно, что у мыши регуляция ключевого гена центра инактивации Xist, запускающего процесс инактивации Х-хромосомы, во многом зависит от транскрипции окружающих его некодирующих ядерных РНК Enox, Tsix, Xite (Lee et al., 1999, 2001, 2010). В данной работе восстановлена полная картина экзон-интронной структуры и границ транскриптов в ближайшем окружении гена Xist у полевки и крысы, и проведено сравнение с аналогичными данными, полученными на мыши (Рис. 3А). Установлено, что у полевок и крысы значительно изменены экзон-интронная структура, промоторные районы, точки старта и терминации транскрипции ядерной РНК Enox, а также отсутствует транскрипция, соответствующая регуляторному элементу Xite, которые у мыши играют важную роль в регуляции гена Xist. Показано, что основной промотор, структура и паттерн экспрессии гена Tsix консервативны у полевки, крысы и мыши, что позволяет предполагать его основную роль в регуляции гена Xist у грызунов. Показано, что большая часть РНК гена Tsix полевки и крысы, также как и у мыши, не подвергается сплайсингу (Рис. 3Б) и, вероятно, осуществляет репрессию гена Xist за счет транскрипции в районе его промотора.

Рисунок 3. (А) Экзон-интронная структура и границы некодирующих ядерных РНК (Enox, Xist, Tsix, Xite) и белок-кодирующих генов (Lrrrn, Slc7a3) в центре инактивации Х-хромосомы у грызунов: мыши, крысы и полевки. (Б) Нозерн-блот анализ паттерна экспрессии гена Tsix у тринадцатидневных эмбрионов полевки и крысы.

Впервые показано, что экспрессия гена Xist, инициирующего процесс инактивации Х-хромосомы у самок млекопитающих, находится под контролем гормона эстрогена.

В промоторе гена Xist, обнаружены консервативные сайты связывания эстрогенового рецептора. В экспериментах с использованием люциферазных конструкций, содержащих промоторную область гена Xist мыши, показано, что при индукции эстрадиолом экспрессия репортерного гена статистически значимо усиливается в дифференцированных соматическим клетках и не изменяется в эмбриональных стволовых клетках (Рис.4). Полученные результаты позволяют заключить, что экспрессия гена Xist может находиться под влиянием эстрогена в момент запуска процесса инактивации.

Получены доказательства, что импринтированная инактивация Х-хромосомы у самок млекопитающих имеет происхождения от процесса мейотического сайленсинга половых хромосом в сперматогенезе.

Показано, что у мыши и полевки неактивная структура Х-хромосомы на постмейотических стадиях развития в сперматогенезе самцов и на ранних этапах процесса импринтированной инактивации Х-хромосомы в эмбриогенезе самок обеспечивается.

Рисунок 4. Влияние эстрадиола (E2) на активность промотора гена Xist в эмбриональных стволовых клетках (ЭСК) и фибробластах. На схеме отмечены границы двух репортерных конструкций 12 и 3 (зелеными скобками), расположение консервативных сайтов рецептора эстрогена (ER), старта транскрипции гена Xist и района минимального промотора (P min). На гистограммах отражена относительная люциферазная активность репортерных конструкций 12 и 3 в эмбриональных стволовых клетках и фибробластах мыши, обработанных (+E2) и необработанных эстрадиолом.

Рисунок 5. Сходство модификаций хроматина, используемых при инактивации Х и Y-хромосом в мейотической инактивации (А, Б) и на ранних стадиях импринированной инактивации Х-хромосомы в TS-клетках мыши(В) и полевки (Г). HP1, H3K9me3 – модификации неактивного хроматина. Стрелкой показаны неактивные Х-хромосомы.

Единой системой сайленсинга: HP1/3meH3K9. Единство спектра и паттерна модификаций хроматина на постмейотических стадиях сперматогенеза и на ранних этапах импринтированной инактивации Х-хромосомы свидетельствуют в пользу того, что половой хроматин в сперматогенезе и инактивация Х-хромосомы на ранних этапах импринтированной инактивации могут осуществляться за счет сходных механизмов, и подтверждает предположение о том, что мейотическая инактивация может представлять собой исходный механизм импринтированной инактивации Х-хромосомы.

Впервые показано, что в репрессии гена Xist на активной Х-хромосоме принимает участие фактор CTCF, который связывается с его промоторной областью и играет роль инсулятора.

В инактивации гена Xist на активной Х-хромосоме принимает участие фактор CTCF, который связывается с промоторной областью и играет роль инсулятора (рис.6). Консервативный сайт связывания фактора CTCF выявляется в 5' районе гена Xist у грызунов и человека, что свидетельствует об его функциональной значимости.

Рисунок 6. CTCF взаимодействует с промотором гена Xist на активной X-хромосоме.

Показано, что механизмы и динамика процесса импринтированной инактивации Х-хромосомы в предымплантационном развитии у грызунов имеют значительные видоспецифические отличия.

Обнаружены существенные отличия в составе и картине распределения репрессивных модификаций хроматина в процессе импринтированной инактивации Х-хромосомы у полевки и мыши (рис.9). Эти данные свидетельствуют о значительном разнообразии механизмов регуляции процесса импринтированной инактивации и свидетельствуют о различных потребностях в дозовой компенсации генов Х-хромосомы на ранних стадиях эмбрионального развития у грызунов. 

Рисунок 7. Видоспецифические особенности хроматина неактивной Х-хромосомы при импринтированной инактивации на предимплантационных стадиях развития у полевки M. levis. Иммунофлуоресцентное окрашивание модификаций неактивного хроматина (H3K9me3 – зеленый и H3K27me3 - серый) совместно с РНК FISH (Xist РНК – красный) на стадии бластоцисты.

Разработан эффективный протокол направленной дифференцировки плюрипотентных стволовых клеток человека в предшественники васкулярных клеток.

Для этого предложено проводить направленное получение васкулярных предшественников, дифференцируя плюрипотентные клетки в монослое на культуральной поверхности, обработанной коллагеном четвертого типа.

Рисунок 8. Направленная дифференцировка плюрипотентных клеток человека в предшественники васкулярных клеток и далее их дифференцировка в эндотелиальные и гладкомышечные клетки. Полученные дифференцированные производные экспрессируют характерные поверхностные (CD31, CD34, PDGFRα, CD146) антигены, выявляемые с помощью проточной цитофлуориметрии и флуоресцентного окрашивания. 

Рисунок 9. Оценка функциональности эндотелиальных клеток. Эндотелиальные клетки (CD31, vWF) нарабатывают компоненты внеклеточного матрикса: фибронектин, коллаген, эластин (А), и поглощают ацетилированную форму липопротеина низкой плотности (Б).

Рисунок 10. Пролиферация эндотелиальных клеток на различных типах матриксов, лазерная сканирующая конфокальная микроскопия. А – эндотелиальные клетки, меченные красителем митохондрий (красный), пролиферирующие на поверхности децеллюляризированого скэфолда сосуда человека (зеленый), окрашенного антителами к фибронектину; Б – эндотелиальные клетки на поверхности из поликапролактона, покрытого коллагеном 4 типа, окраска антителами к коллагену 1 типа (красный) и фибронектину (зеленый); В – эндотелиальные клетки на поверхности из лавсана, покрытого желатином, окраска антителами к CD31(зеленый), коллагену 1 типа (красный) и фибронектину (желтый), справа – распределение активно пролиферирующих клеток, окраска митохондриальным красителем TMRM (красный).

Разработка высокоэффективных технологий получения индуцированных плюрипотентных клеток (ИПСК) человека без генетической модификации геномов клеток.

Показано, что полноценные ИПСК человека можно получить из фетальных нейральных стволовых клеток с помощью временной сверхэкспрессии гена OCT4 без интеграции плазмидной ДНК в геном клетки. Было обнаружено, что репрограммирование ФНСК, имеющих набор половых хромосом ХХ, не сопровождается эпигенетической реактивацией неактивной Х-хромосомы.

Рисунок 11. Иммуноцитохимический анализ клеток полученных в результате дифференцировки ИПСК in vitro. Синий цвет – окраска ядер клеток красителем DAPI, зеленый цвет - окраска клеток с помощью антител к коллагену I (А), β-III-тубулину (Б), фибронектину (В), цитокератину 18 (Г), транскрипционному фактору GATA6 (Д) и нестину (Е). Иммуноцитохимический анализ показал, что полученные в результате выполнения проекта ИПСК являются плюрипотентными, то есть, способны дифференцироваться в производные всех трех примитивных зародышевых листков.

5.     Задачи, планируемые на перспективу: 

• Создание и исследование изогенной модели бокового амиотрофического склероза, на основе плюрипотентных клеток человека, несущих миссенс-мутации в гене SOD1;
• Изучение эффективности и безопасности коррекции мутантного фенотипа крыс линии Браттлеборо с помощью плюрипотентных клеток с отредактированным генотипом;
• Создание и исследование изогенной модели болезни Паркинсона с ранним началом, на основе плюрипотентных клеток человека несущих делецию третьего экзона гена PARKIN (PARK2);
• Эпигенетический и транскрипционный статус Х-хромосомы человека в плюрипотентных стволовых клетках и их дифференцированных производных;
• Создание и использование клеточных моделей для сравнительного анализа процесса нейродегенерации при наследственной и спорадической форме болезни Альцгеймера.

Бывшие сотрудники

Совместители

Публикации

2018	A New Look at Etiological Factors of Idiopathic Scoliosis: Neural Crest Cells Zaydman A.M., Strokova E.L., Kiseleva E.V., Suldina L.A., Strunov A.A.,Shevchenko A.I., Laktionov P.P., Subbotin V.M. INT J MED SCI, 2018, 15(5): 436-446
	Impact of Xist RNA on chromatin modifications and transcriptional silencing maintenance at different stages of imprinted X chromosome inactivation in vole Microtus levis Shevchenko A.I., Grigor'eva E.V., Medvedev S.P., Zakharova I.S., Dementyeva E.V., Elisaphenko E.A., Malakhova A.A., Pavlova S.V., Zakian S.M. CHROMOSOMA, 2018, V. 127; № 1; P. 129-139.
	Noncoding RNAs in the Regulation of Pluripotency and Reprogramming Sherstyuk VV, Medvedev SP, Zakian SM STEM CELL REV REP, 2018, V. 14. - № 1. - P. 58-70
2017	Что на роду написано, того не миновать? Редактирование генома в терапии наследственных заболеваний Немудрый А.А., Закиян С.М. Наука из первых рук, 2017, том 75, №4
	Био- и гемосвместимость тканеинженерных конструкций из поликапролактона, заселенных человеческими эндотелиальными и гладкомышечными клетками, после имплантации в брюшную аорту мышам SCID Саая Ш.Б., Захарова И.С., Живень М.К., Шевченко А.И., Смирнова А.М., Лактионов П.П., Степанова А.О., Ромащенко А.В., Волков А.М., Завьялов Е.Л., Покушалов Е.А., Иванова Л.Н., Закиян С.М., Карпенко А.А. КОМПЛЕКСНЫЕ ПРОБЛЕМЫ СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, 2017, № 3. С. 47-63.
	Endothelial and smooth muscle cells derived from human cardiac explants demonstrate angiogenic potential and suitable for design of cell-containing vascular grafts I. S. Zakharova, M. K. Zhiven’, Sh. B. Saaya, A. I. Shevchenko, A. M. Smirnova,A. Strunov, A. A. Karpenko,3 E. A. Pokushalov, L. N. Ivanova, P. I. Makarevich, Y. V. Parfyonova, E. Aboian, and S. M. Zakian J TRANSL MED, 2017, V. 15. № 54.
	Genome-wide profiling and differential expression of microRNA in rat pluripotent stem cells Sherstyuk V.V., Medvedev S.P., Elisaphenko E.A., Vaskova E.A., Ri M.T., Vyatkin Y.V., Saik O.V., Shtokalo D.N., Pokushalov E.A., Zakian S.M. SCI REP-UK, 2017, V. 7. - № 1. - P. 2787
	Исследование мутагенного действия нового противотуберкулезного средства «Декстразид» А. В. Троицкий, Е. П. Гуляева, В. С. Медведев, А. А. Старостенко, Т. Н. Быстрова, В. А. Шкурупий, Н. Б. Рубцов, Т. В. Карамышева, М. Н. Бочкарев, Л. А. Герлинская, Д. В. Петровский Экспериментальная и клиническая фармакология, 2017, Т. 80. – №. 8. – С. 31-34.
	Клеточные модели, геномные технологии и клиническая практика: синтез знаний для исследования механизмов, диагностики и терапии болезни Паркинсона В.Р. Коваленко, Е.А. Хабарова, Д.А. Рзаев, С.П. Медведев Гены и клетки, 2017, Том XII, № 2, С. 11-28.
	Modern Genome Editing Technologies in Huntington's Disease Research Malankhanova T.B., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Zakian S.M. J Huntingtons Dis., 2017, V.6(1). P. 19-31.
	Моделирование болезни Хантингтона на клетках линии HEK293 Шарипова Д.В., Маланханова Т.Б., Малахова А.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 21(7):856-861
	Паттерн экспрессии и альтернативный сплайсинг гена HTT в тканях человека Малахова А.А., Елисафенко Е.А. Гены и клетки, 2017, №4, С. 26-32.
	Ecological preferences of Metarhizium spp. from Russia and neighboring territories and their activity against Colorado potato beetle larvae Vadim Kryukov, Olga Yaroslavtseva , Maksim Tyurin, Yuriy Akhanaev, Evgeniy Elisaphenko, Ting-Chi Wen, Oksana Tomilova, Yuri Tokarev, Viktor Glupov J INVERTEBR PATHOL, 2017, Oct;149:1-7
	ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ И ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИЗМЕНЕНИЯ ЭНТОМОПАРАЗИТИЧЕСКОГО АСКОМИЦЕТА BEAUVERIA BASSIANA ПРИ ПАССИРОВАНИИ ЧЕРЕЗ РАЗНЫХ ХОЗЯЕВ В. Ю. Крюков, У. Н. Роцкая, О. Н. Ярославцева, Е. А. Елисафенко, Б. А. Дуйсембеков, В. В. Глупов Паразитология, 2017, Т.51,№ 1,с.3-14
	Перспективы создания пейсмейкерной сердечной ткани с использованием современных генетических и тканеинженерных технологий Байрамова С.А., Стрельников А.Г., Романов А.Б., Якубов А.А., Лосик Д.В., Павлова С.В., Агладзе К.Г., Покушалов Е.А. Гены и клетки, 2017, Гены и Клетки: Том XII, №2, 2017 год, стр.: 29-36
	Chromosomal assignment of centromere-specific histone CENH3 genes in rye (Secale cereale L.) and their phylogeny Yulia A. Lipikhina, Elena V. Evtushenko, Evgeny A. Elisafenko, Alexander V. Vershinin COMP CYTOGENET, 2017, v11, i4, p. 821–832 (2017)
	Conserved molecular structure of the centromeric histone CENH3 in Secale and its phylogenetic relationships E. V. Evtushenko, E. A. Elisafenko, S. S. Gatzkaya, Y. A. Lipikhina, A. Houben & A. V. Vershinin SCI REP-UK, 2017, N 7, Article number: 17628 (2017)
	Alternative dominance of the parental genomes in hybrid cells generated through the fusion of mouse embryonic stem cells with fibroblasts Matveeva N.M., Fishman V.S., Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Pristyazhnyuk I.E., Menzorov A.G., Serov O.L. SCI REP-UK, 2017, 7(1):18094.
	Мониторинг трансплантации клеток кардиосфер в фибриновом геле в зону ишемического повреждения миокарда с использованием люциферазной репортерной системы С.В. Павлова, Е.А. Леонова, Е.В. Чепелева, А.А. Докучаева, Д.С. Сергеевичев, Е.А. Покушалов Гены и клетки, 2017, Том XII, №4, стр.69-75
	ИССЛЕДОВАНИЕ БИОЛОГИЧЕСКОЙ СОВМЕСТИМОСТИ ПОЛИЛАКТИДНЫХ НАНОВОЛОКОННЫХ МАТРИКСОВ, ЗАСЕЛЕННЫХ ФИБРОБЛАСТАМИ СЕРДЦА, В ЭКСПЕРИМЕНТЕ НА МИНИ-СВИНЬЯХ Е.В. Чепелева, В.А. Балашов, А.А. Докучаева, А.А. Коробейников, А.Г. Стрельников, С.О. Лепендин, С.В. Павлова, К.И. Агладзе, Д.С. Сергеевичев, Е.А. Покушалов Гены и клетки, 2017, Том XII, №4, стр.62-68
	Использование системы CRISPR/Cas9 для изучения клеточной модели спинальной мышечной атрофии Валетдинова К.Р., Овечкина В.С., Григорьева Е.В., Маретина М.А., Киселев А.В., Баранов В.С., Медведев С.П., Закиян С.М. Гены и клетки, 2017, Т. XII. № 3. 2017. С.54-55.
	Создание протокола направленной дифференцировки индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека в средние шипиковые нейроны с возможностью продолжительного культивирования и трансгенеза предшественников данных клеток Григорьева Е.В., Маланханова Т.Б., Сурумбаева А., Павлова С.В., Малахова А.А., Закиян С.М. Гены и клетки, 2017, Том XII, No 3, 2017, стр. 76.
	Оптимизация инструментов геномного редактирования для получения клеточных моделей болезни Хантингтона Маланханова Т.Б., Малахова А.А., Закиян С.М. Гены и клетки, 2017, Том 12, №3. С. 155.
2016	Dynamic properties of SOD1 mutants can predict survival time of patients carrying familial amyotrophic lateral sclerosis Nikolay A. Alemasova, Nikita V. Ivanisenko, Sergey P. Medvedev, Suren M. Zakian, Nikolay A. Kolchanov & Vladimir A. Ivanisenko Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2016, 2017, Volume 35, Issue 3, Pages 645-656
	The expansion of heterochromatin blocks in rye reflects the co-amplification of tandem repeats and adjacent transposable elements. Evtushenko EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Šafář J, Doležel J, Vershinin AV. BMC GENOMICS, 2016, 17(1):337
	Применение системы CRISPR/Cas9 для создания и исследования клеточных моделей наследственных заболеваний человека Валетдинова К.Р. Гены и клетки, 2016, Т. XI. № 2. С. 10-20.
	Дифференцировка в нейральном направлении пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток от больных с наследственной формой спинальной мышечной атрофии Григорьева Е.В., Валетдинова К.Р., Устьянцева Е.И., Шевченко А.И., Медведев С.П., Мазурок Н.И., Маретина М.А., Куранова М.Л., Киселев А.В., Баранов В.С., Закиян С.М. Гены и клетки, 2016, Т. XI. № 2. С. 70-81.
	Использование методов редактирования генома для создания изогенных клеточных линий, моделирующих болезнь Хантингтона in vitro Малахова А.А., Сорокин М.А., Сорокина А.Е., Маланханова Т.Б., Мазурок Н.А., Медведев С.П., Закиян С.М. Гены и клетки, 2016, Том XI, №2, С. 106-113
	Стратегии редактирования паралогичных генов с помощью CRISPR/Cas9 Немудрый А.А., Маланханова Т.Б., Малахова А.А., Медведев С.П., Закиян С.М. Гены и клетки, 2016, Том XI, №2, С. 87-94
	Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Afford New Opportunities in Inherited Cardiovascular Disease Modeling Bayzigitov D.R, Medvedev S.P, Dementyeva E.V, Bayramova S.A, Pokushalov E.A, Karaskov AM, Zakian S.M. Cardiol Res Pract, 2016, 2016:3582380. doi: 10.1155/2016/3582380.
	The Molecular Mechanisms of Heterochromatin Expansion in Rye Chromosomes Evtushenko EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Safar J, Dolezel J, Vershinin AV CYTOGENET GENOME RES, 2016, 148(2-3), 91-91 I.14 , 21st International Chromosome Conference (ICC), Foz do Iguacu, BRAZIL
	Феномен инактивации Х-хромосомы и заболевания человека Шевченко А.И. Гены и клетки, 2016, Том XI. № 2. С. 61-68.
	Профили экспрессии нетранслируемых РНК в центре инактивации у мышевидных грызунов Елисафенко Е.А., Шевченко А.И., Закиян С.М. Гены и клетки, 2016, Том XI. № 2. С. 82-86.
	СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ИММУННОГО ОТВЕТА ЛИЧИНОК КОЛОРАДСКОГО ЖУКА ПРИ РАЗВИТИИ МИКОЗОВ, ВЫЗВАННЫХ METARHIZIUM ROBERTSII, M. BRUNNEUM И M. PEMPHIGI М. В. Тюрин, В. Ю. Крюков, О. Н. Ярославцева, Е. А. Елисафенко, И. М. Дубовский, В. В. Глупов Журнал эволюционной биохимии и физиологии, 2016, 2016, Т. 52, №. 3, стр. 252—260
	Участие LIF-STAT3 каскада в поддержании самообновления и плюрипотентного состояния в клетках крысы Е.А. Васькова, В.В. Шерстюк, С.М. Закиян Гены и клетки, 2016, Т. XI, № 3, С. 47-53
	Оценка функциональных свойств человеческих эндотелиальных и гладкомышечных клеток после заселения на поверхности из естественных и синтетических материалов Саая Ш.Б., Захарова И.С., Живень М.К., Шевченко А.И., Карпенко А.А., Покушалов Е.А., Иванова Л.Н., Закиян С.М. Вестник трансплантологии и искусственных органов, 2016, Т. XVIII. № 3. С. 94-101.
	Разработка тканеинженерных конструкций на основе смеси хитозана и поликапролактона для сосудистой хирургии. Захарова И.С., А.М. Смирнова, М.К. Живень, Ш.Б. Саая, А.И. Шевченко, С.М. Закиян, Е.А., Л.Н. Иванова Гены и клетки, 2016
	Сравнительный анализ миграционной активности популяций клеток костного мозга в лимфоидные и нелимфоидные органы в норме и на модели экспериментального сахарного диабета Повещенко А.Ф., Миллер Т.В., Лыков А.П., Повещенко О.В., Бондаренко Н.А., Петровская И.Ф., Завьялов Е.Л., Дементьева Е.В., Захарова И.С., Грицык О.Б., Шурлыгина А.В., Коненков В.И. Современные проблемы науки и образования, 2016, №2-0, с.137
2015	Mapping of Replication Origins in the X Inactivation Center of Vole Microtus levis Reveals Extended Replication Initiation Zone Sherstyuk VV, Shevchenko AI, Zakian SM PloS One, 2015, V. 10. - №6. - P.e0128497. - doi:10.1371/journal.pone.0128497
	Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки гибридов полёвок Microtus levis × Microtus arvalis: условия, необходимые для получения и поддержания Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Медведев С.П., Мазурок Н.А., Железова А.И., Закиян С.М. Acta Naturae, 2015, Т. 7. № 4(27). С. 64-78.
	Терапия хронического кардиосклероза у крыс линии WAG культурами кардиоваскулярных клеток, обогащенными стволовыми клетками сердца Е.В.Чепелева, С.В.Павлова, А.А.Малахова, Е.А.Милевская, Я.Л.Русакова, Н.А.Подхватилина, Д.С.Сергеевичев, Е.А.Покушалов, А.М.Караськов, Г.Т.Сухих, С.М.Закиян Клеточные технологии в биологии и медицине, 2015, № 3, с. 191-201
	Модельные системы болезней двигательных нейронов – платформа для изучения механизмов патогенеза и поиска терапевтических средств Валетдинова К.Р., Медведев С.П., Закиян С.М. Acta Naturae, 2015, Т.7. №1(24). С. 92-109.
	Инструменты геномной инженерии, предназначенные для создания изогенной модели бокового амиотрофического склероза Валетдинова К.Р., Устьянцева Е.И., Елисафенко Е.А., Жарков Д.О., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р., Медведев С.П., Закиян С.М. Медицинская генетика, 2015, Т. 14. № 6 (156). С. 3-9.
	Эктопическая локализация клеток нервного гребня – этиологический фактор сколиотической болезни Зайдман А.М., Строкова Е.Л., Киселева Е.В., Агеева Т. А., Сульдина Л.А., Струнов А. А., Шевченко А.И., Садовой М.А. Хирургия позвоночника, 2015, № 4. Т.12. С. 88-97.
	Transcriptome characteristics and X-chromosome inactivation status in cultured rat pluripotent stem cells Vaskova E.A., Medvedev S.P., Sorokina A.E., Nemudryy A.A., Elisaphenko E.A., Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Kizilova E.A., Zhelezova A.I., Evshin I.S., Sharipov R.N., Minina J.M., Zhdanova N.S., Khegay I.I., Kolpakov F.A., Sukhikh G.T., Pokushalov E.A., Karaskov A.M., Vlasov V.V. Ivanova L.N., Zakian S.M. STEM CELLS DEV, 2015, V. 24. No.24. P. 2912-2924.
	Система CRISPR/Cas9 - инструмент для исследования наследственных сердечно-сосудистых заболеваний Медведев С.П., Закиян С.М. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Т. 19. № 4-2, С. 113-117
	Применение технологии индуцированных плюрипотентных стволовых клеток для моделирования синдрома удлиненного интервала QT Вялкова А.В., Дементьева Е.В, Медведев С.П., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, T. 19. № 4-2. С. 85-94.
	Моделирование наследственных кардиомиопатий человека на основе дифференцированных производных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Байзигитов Д.Р., Медведев С.П., Дементьева Е.В., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Т. 19. № 4-2. С. 95-103.
	Сравнение мезенхимальных стромальных клеток костного мозга и региональных стволовых клеток сердца и фибробластов кожи человека Павлова С.В., Сергеевичев Д.С., Чепелева Е.В., Козырева В.С., Малахова А.А., Захарова И.С., Григорьева Е.В., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Том 19, № 4-2. С. 12-19.
	Разработка клеточных технологий для создания клеточно-наполненных сосудистых трансплантатов Захарова И.С., Живень М.К., Саая Ш.Б., Шевченко А.И., Струнов А.А., Иванова Л.Н., Карпенко А.А., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Том 19 №4-2 С. 43-54
	Гетерогенность клеток эндотелия Живень М.К., Захарова И.С., Шевченко А.И., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Т. 19. № 4-2. С. 104-112.
	Ангиогенный потенциал кардиальных стволовых и мезенхимальных стромальных клеток костного мозга крысы Павлова С. В., Розанова И.А., Чепелева Е. В., Малахова А. А., Лыков А.П., Покушалов Е.А., Закиян С. М. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Т.19, №4-2 77-84
	Оптимизация протокола интрамиокардиальной трансплантации с использованием люминесценции кардиальных мезенхимальных клеток, маркированных экспрессией люциферазы Милевская Е.А., Немудрый А.А., Чепелева Е. В., Малахова А. А., Павлова С.В., Докучаева А.А., Сергеевичев Д.С., Закиян С.М. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Т.19. № 4-2. 2015. С. 69-76.
	Получение культуры клеток из скелетной мускулатуры крысы для применения в клеточной терапии ишемических поражений сердца Чепелева Е. В., Павлова С. В., Малахова А. А., Покушалов Е. А., Закиян С. М. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, № 4-2. 2015. С. 28-32.
	Разработка и изучение in vitro тканеинженерной конструкции на основе политетрафторэтилена и мезенхимальных мультипотентных стромальных клеток. Розанова И.А., Повещенко О.В., Карпенко А.А., Павлова С.В., Сергеевичев Д.С., Лыков А.П.,Бондаренко Н.А., Докучаева А.В. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Т.19, №4-2 20-27
	Сравнительное исследование трех типов протезов, изготовленных методом электроспиннинга в эксперименте in vitro и in vivo ПОПОВА И.В. СТЕПАНОВА А.О. СЕРГЕЕВИЧЕВ Д.С. АКУЛОВ А.Е. ЗАХАРОВА И.С. ПОКУШАЛОВ А.А. ЛАКТИОНОВ П.П. КАРПЕНКО А.А. Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Выпуск № 4 / том 19 / 2015. Стр. 63-71
	Использование кардиальной культуры клеток КМК-Luc, маркированной экспрессией люциферазы, для оптимизации протокола интрамиокардиальной трансплантации Е.А. Милевская, А.А. Немудрый, Е. В. Чепелева, А. А. Малахова, С. В. Павлова, А. А. Докучаева, Д.С. Сергеевичев, С. М. Закиян Патология кровообращения и кардиохирургия, 2015, Т. 19 (S4-2), С. 69-76
2014	Клонировать эмбрион человека помог...кофеин Васькова Е.А, Дементьева Е.В. Наука из первых рук, 2014, №1(55), 2014
	СИСТЕМЫ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМОВ TALEN И CRISPR/CAS ИНСТРУМЕНТЫ ОТКРЫТИЙ Немудрый А.А., Валетдинова К.Р., Медведев С.П., Закиян С.М. Acta Naturae, 2014, том 6, № 3(22), с. 20-42
	Epigenetic landscape for initiation of DNA replication Sherstyuk VV, Shevchenko AI, Zakian SM CHROMOSOMA, 2014, V. 123. № 3. Р. 183-199. doi:10.1007/s00412-013-0448-3
	Dynamics of the two heterochromatin types during imprinted X chromosome inactivation in vole Microtus levis Vaskova E.A., Dementyeva E.V., Shevchenko A.I., Pavlova S.V., Grigor’eva E.V., Zhelezova A.I., VandeBerg J.L., Zakian S.M. PloS One, 2014, 9(2):e88256
2013	Структурно-функциональный анализ 5'-регуляторной области гена Nanog полёвки Сорокин М.А., Елисафенко Е.А., Мазурок Н.А., Закиян С.М. Doklady Akademii Nauk, 2013, т. 452, № 1, С. 100-105.
	Характеристика кардиальных культур клеток, полученных из экспланта сердечной мышцы человека С.В. Павлова, П.П. Перовский, Е.В. Чепелева, А.А. Малахова, Е.В. Дементьева, Е.А. Покушалов, Г.Т. Сухих, С.М. Закиян B EXP BIOL MED+, 2013, №4, C.132-141
	Характеристика индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека с помощью ДНК-микрочипов Медведев С.П., Сметанина М.А., Шевченко А.И., Захарова И.С., Малахова А.А., Григорьева Е.В., Дементьева Е.В., Александрова М.А., Полтавцева Р.А., Верясов В.Н., Филипенко М.Л., Сухих Г.Т., Закиян С.М. B EXP BIOL MED+, 2013, №1, стр. 3-10
	Коррекция паталогических изменений межпозвоночного диска методами тканевой инженерии в эксперименте Зайдман А.М., Щелкунова Е.И., Строкова Е.Л., Шевченко А.И., Ластевский А.Д., Рерих В.В. Хирургия позвоночника, 2013, N 1 C. 80-88.
	Активность ориджинов репликации в центре инактивации Х-хромосомы полевки в различных типах клеток. Шерстюк Владимир Владимирович, Шевченко Александр Игоревич, Мазурок Нина Алексеевна, Закиян Сурен Минасович Doklady Akademii Nauk, 2013, т.450, № 5, C. 606-608.
	Эволюционный путь процесса инактивации Х-хромосомы у млекопитающих Шевченко А.И., Захарова И.С., Закиян С.М. Acta Naturae, 2013, Т.5 № 2 (17). C. 18-32.
	Феномен "эпигенетической памяти" индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Е.А.Васькова, А.Е.Стекленева, С.П.Медведев, С.М.Закиян Acta Naturae, 2013, том 5 №3(18), стр.19-27
	СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ 5'-РЕГУЛЯТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА NANOG ПОЛЕВКИ М. А. Сорокин, Е. А. Елисафенко, Н. А. Мазурок, С. М. Закиян Doklady Akademii Nauk, 2013, том 452, № 1,стр.100-105
	МикроРНК, эволюция и рак. Колесников Н.Н., Титов С.Е., Веряскина Ю.А., Карпинская Е.В., Шевченко C.П., Ахмерова Л.Г., Иванов М.К., Козлов В.В., Елисафенко Е.А., Гуляева Л.Ф., Жимулев И.Ф. Цитология, 2013, №55. С. 159–164
	ОРГАНИЗАЦИЯ И ЭВОЛЮЦИЯ СУБТЕЛОМЕРНЫХ РАЙОНОВ ХРОМОСОМ РЖИ Евтушенко Е.В., Елисафенко Е.А., Вершинин А.В. Цитология, 2013, N 4.С.230-233
2012	A regulatory potential of the Xist gene promoter in vole M. rossiaemeridionalis. Orishchenko KE, Pavlova SV, Elisaphenko EA, Sherstyuk VV, Prinz AV, Shevchenko AI, Dementyeva EV, Zakian SM PloS One, 2012, 2012;7(5):e33994. Epub 2012 May 11.
	ИЗМЕНЕНИЕ ТЕМПЕРАТУРНЫХ ПРЕФЕРЕНДУМОВ ИЗОЛЯТОВ BEAUVERIA BASSIANA В ШИРОТНОМ ГРАДИЕНТЕ СИБИРИ И КАЗАХСТАНА В. Ю. Крюков, О. Н. Ярославцева, Е. А. Елисафенко, П. В. Митьковец, Г. Р. Леднев, Б. А. Дуйсембеков, С. М. Закиян, В. В. Глупов MICROBIOLOGY+, 2012, том 81, No 4, с. 453-459
	Эпигенетика плюрипотентных клеток Медведев С.П., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Acta Naturae, 2012, Т. 4. № 4(15). С. 26-45.
	Трехмерный хондротрансплантат - пластический материал для замещения дефектов костной ткани Зайдман А.М., Щелкунова Е.И., Строкова Е.Л., Корель А.В., Рахматиллаев Ш.Н., Шевченко А.И. Хирургия позвоночника, 2012, № 4. С. 65-72.
	Дозовая компенсация: регуляция экспрессии генов половых хромосом Дементьева Е.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т. 16. № 3. С. 202-213.
2011	Human induced pluripotent stem cells derived from fetal neural stem cells successfully undergo directed differentiation into cartilage Medvedev S.P., Grigor’eva E.V., Shevchenko A.I., Malakhova A.A., Dementyeva E.V., Shilov A.A., Pokushalov E.A., Zaidman A.M., Aleksandrova M.A., Plotnikov E.Yu., Sukhikh G.T., Zakian S.M. STEM CELLS DEV, 2011, V. 20. № 6. P. 1099-1112.
	Нарушение клеточного цикла в тимусе и селезенке у самцов мышей под влиянием хронического социального стресса: эффекты диазепама. Кудрявцева Н.Н., Шурлыгина А.В., Мельникова Е.В., Тендитник М.В., Бондарь Н.П., Пантелеева Н.Г., Смагин Д.А., Колесников Н.Н., Труфакин В.А. B EXP BIOL MED+, 2011, 2011 г., Том 151, № 4, 391-394
	Variability of sequence surrounding the Xist gene in rodents suggests taxon-specific regulation of X chromosome inactivation Shevchenko A.I., Malakhova A.A., Elisaphenko E.A., Mazurok N.A., Nesterova T.B., Brockdorff N., Zakian S.M. PloS One, 2011, V. 6. № 8. e22771
	Histone H3 trimethylation at lysine 9 marks the inactive metaphase X chromosome in the marsupial Monodelphis domestica Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Shilov A.G., Nesterova T.B., Vandeberg J.L., Zakian S.M. CHROMOSOMA, 2011, V. 120. №2. P. 177-183.
	Functional Analysis of the Xist Promoter Region in Mouse Mus musculus A. M. Korotkova, E. A. Elisaphenko, and S. M. Zakian RUSS J GENET+, 2011, Т.47, №1, стр.140-144
2010	Исследование регуляторной области гена Tsix полевки Microtus rossiaemeridionalis Жукова О.А., Елисафенко Е.А., Закиян С.М. RUSS J GENET+, 2010, Т. 46. № 9. С. 1392-1396.
	Мейотическая инактивация половых хромосом у млекопитающих Васькова Е.А., Павлова С.В.,Шевченко А.И., Закиян С.М. RUSS J GENET+, 2010, №4, Том 46, 437-447
	Молекулярные основы поддержания самообновления и плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток млекопитающих Медведев С.П., Шевченко А.И., Закиян С.М. Acta Naturae, 2010, Т. 2. № 3(6). С. 38-57
	Получение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток из фибробластов кожи плода человека Медведев С.П., Малахова А.А., Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Дементьева Е.В., Соболев И.А., Лебедев И.Н., Шилов А.Г., Жимулев И.Ф., Закиян С.М. Acta Naturae, 2010, № 2(5), Т. 2, С. 108-110
	Равенство полов по Х-хромосоме Павлова С.В., Шевченко А.И., Закиян С.М. Природа, 2010, № 1. С. 22-28.
	Роль замены G(-43)A в промоторном районе гена Xist при неслучайной инактивации Х-хромосомы у межвидовых гибридов обыкновенных полевок Орищенко К.Е. , Елисафенко Е.А., Закиян С.М. RUSS J GENET+, 2010, т.46, № 10, с. 1397-1400.
	Сравнительная организация и происхождение некодирующих регуляторных РНК генов центра инактивации Х-хромосомы человека и мыши Колесников Н. Н. и Елисафенко Е. А. RUSS J GENET+, 2010, Т. 46. № 9. С. 1386-1391.
	Сравнительный анализ регуляторного района DXPas34 грызунов Малахова А.А., Пяткова М.С., Елисафенко Е.А., Шевченко А.И., Кель А.Э., Закиян С.М. RUSS J GENET+, 2010, № 10, С. 1236-1239.
	Экзон-интронная структура гена Xist слона, броненосца и предка плацентарных млекопитающих  Колесников Н. Н. и Елисафенко Е. А. RUSS J GENET+, 2010, Т. 46. № 9. С. 1379- 1385.
	Экспрессия генов раннего развития у полевки Microtus rossiaemeridionalis Сорокин М.А., Медведев С.П., Шевченко А.И., Слынько Н.М., Закиян С.М. RUSS J GENET+, 2010, Т. 46. № 2. С. 282-286.
	Difference between random and imprinted X inactivation in common voles E.V. Dementyeva, A.I. Shevchenko, O.V. Anopriyenko, N.A. Mazurok, E.A. Elisaphenko, T.B. Nesterova, N. Brockdorff, S.M. Zakian. CHROMOSOMA, 2010, V. 119, № 5. P. 541-552.
	Стволовые клетки, участвующие в образовании внезародышевых тканей. Е.В.Григорьева, А.И.Шевченко, А.И.Железова, А.Г.Шилов, Н.А.Мазурок, П.А.Дыбан, А.П.Дыбан, С.М.Закиян. Клеточные технологии в биологии и медицине, 2010, №4, с.183-194
	Взаимное расположение двух семейств тандемных повторов в гетерохроматине ржи Евтушенко Е.В., Елисафенко Е.А., Вершинин А.В. Molecular Biology, 2010, Т.44, №1, с.5-12
	Дозовая компенсация генов половых хромосом у эукариот Дементьева Е.В., Закиян С.М. Acta Naturae, 2010, № 4(7), Т. 2, С. 6-14
	Изучение молекулярного состава прицентромерного гетерохроматина хромосомы 2 малярийных комаров (Diptera, Culicidae) Сайджафарова А. О., Елисафенко Е. А., Стегний В. Н. RUSS J GENET+, 2010, Т. 46. № 9, С. 1307-1310.
	Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки: проблемы и перспективы применения в заместительной клеточной терапии Медведев С.П., Шевченко А.И., Закиян С.М. Acta Naturae, 2010, Т. 2. № 2(5). С. 18-28.
2009	Молекулярно-генетическая организация и особенности экспрессии гена Nanog у полевки Microtus rossiaemeridionalis С.П. Медведев, Е.А.Елисафенко, А.И. Шевченко, Н.А. Мазурок, С.М. Закиян Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, т.425, №5, с.688-691
	Молекулярно-генетическая характеристика регуляторного района гена xist полевки microtus rossiaemeridionalis К. Е. Орищенко, Е. А. Елисафенко, А. Э. Кель, С. М. Закиян RUSS J GENET+, 2009, 10, 45, 1341-1352
	FGF4 independent derivation of trophoblast stem cells from the common vole Grigor'eva EV, Shevchenko AI, Mazurok NA, Elisaphenko EA, Zhelezova AI, Shilov AG, Dyban PA, Dyban AP, Noniashvili EM, Slobodyanyuk SY, Nesterova TB, Brockdorff N, Zakian SM PloS One, 2009, 4(9): e7161.
	Monoallelic gene expression in mammals Zakharova IS, Shevchenko AI, Zakian SM CHROMOSOMA, 2009, V. 118. №3. Р. 279-290.
	Mosaic heterochromatin of the inactive X chromosome in vole Microtus rossiaemeridionalis A.I. Shevchenko, S.V.Pavlova, E.V. Dementyeva, S.M. Zakian. MAMM GENOME, 2009, № 9-10, V. 20, P. 644-653
	X-chromosome upregulation and inactivation two sides of the dosage compensation mechanism in mammals E.V. Dementyeva, A.I. Shevchenko, S.M. Zakian. BIOESSAYS, 2009, № 1, V. 31, P. 21-28.
	Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки А.И. Шевченко, С.П. Медведев, Н.А. Мазурок, С.М. Закиян RUSS J GENET+, 2009, т.45, №2, с.160-168.
2008	Линии стволовых клеток экстраэмбриональной эндодермы обыкновенных полевок рода Microtus А. И. Шевченко, В. В.Демина, Н. А. Мазурок, А. И. Железова, Я. Р. Ефремов, А. Г. Шилов, А. И. Шевела, А. В. Белеванцева, В. В. Власов, С. М. Закиян RUSS J GENET+, 2008, Т. 44. N 11. С. 1477-1485
	Реконструкция предкового гена XIST и пути его эволюции у млекопитающих Елисафенко Е. А., Колесников Н.Н., Шевченко А. И., Закиян С. М. Информационный вестник ВОГИС, 2008, № 1, Том 12, 186-196
	A Dual Origin of the Xist Gene from a Protein-Coding Gene and a Set of Transposable Elements E.A. Elisaphenko, N.N. Kolesnikov, A.I. Shevchenko, I.B. Rogozin, T.B. Nesterova, N. Brockdorff, S.M. Zakian PloS One, 2008, Jun 25;3(6):e2521
	Oct4 и Nanog – ключевые гены в системе поддержания плюрипотентности клеток млекопитающих Медведев С.П., Шевченко А.И., Мазурок Н.А., Закиян С.М. RUSS J GENET+, 2008, Т 44. № 12. С. 1589-1608.
	Structure and expression pattern of Oct4 gene are conserved in vole Microtus rossiaemeridionalis Medvedev SP, Shevchenko AI, Elisaphenko EA, Nesterova TB, Brockdorff N, Zakian SM. BMC GENOMICS, 2008, V. 9. N 162. doi:10.1186/1471-2164-9-162
2007	СТРУКТУРА И ЭВОЛЮЦИЯ ГЕНА MaSMC4 ПОЛЕВКИ Microtus arvalis (Arvicolidae, Rodentia) С. В. Павлова, Е. А. Елисафенко, С. М. Закиян RUSS J GENET+, 2007, том 43, № 2, С. 159-169
	DNA content of the B chromosomes in grasshopper Podisma kanoi Storozh. (Orthoptera, Acrididae) Bugrov AG, Karamysheva TV, Perepelov EA, Elisaphenko EA, Rubtsov DN, Warchalowska-Sliwa E, Tatsuta H, Rubtsov NB CHROMOSOME RES, 2007, 15(3):315-25
	Genes flanking Xist in mouse and human are separated on the X chromosome in American marsupials Shevchenko AI, Zakharova IS, Elisaphenko EA, Kolesnikov NN, Whitehead S, Bird C, Ross M, Weidman JR, Jirtle RL, Karamysheva TV, Rubtsov NB, Vandeberg JL, Mazurok NA, Nesterova TB, Brockdorff N, Zakian SM CHROMOSOME RES, 2007, V. 15. N. 2. P. 127-136.
	The structure and evolution of the MaSMC4 gene of common vole Microtus arvalis (Arvicolidae, Rodentia) Pavlova SV, Elisafenko EA, Zakiian SM RUSS J GENET+, 2007, 43,2,159-169
2006	Модификации хроматина в процессе инактивации Х-хромосомы у самок млекопитающих Шевченко А.И., Павлова С.В., Дементьева Е.В., Голубева Д.В., Закиян С.М. RUSS J GENET+, 2006, № 9, Т. 42, C. 1225-1234
	Эпигенетика специфических районов хромосом А.В.Вершинин RUSS J GENET+, 2006, т.42, №9, стр. 1200-1214
	Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck GENOMICS, 2006, V. 88, № 6, P. 752-761.
	Памяти Л.И. Корочкина Жимулёв И.Ф., Васильева Л.А., Закиян С.М. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т. 10. № 3. С. 604-607.

Монографии

2017	Models of Hereditary Neurodegenerative, Neurological, and Psychiatric Diseases Based on Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Neurons S.P. Medvedev, S.M. Zakian
2016	Глава 9. Применение системы CRISPR/Cas9 для создания и исследования клеточных моделей наследственных и приобретенных заболеваний человека. Валетдинова К.Р.
	Глава 13. Актуальные проблемы при редактировании генома: доставка ZFN, TALEN, CRISPR/Cas9 и низкая эффективность гомологичной рекомбинации. Маланханова Т.Б., Валетдинова К.Р.
	Система CRISPR/Cas9 - инструмент "обратной" геномики Медведев С.П., Закиян С.М.
	Глава 5. Использование искусственных нуклеаз TALEN для модификации геномов культивируемых клеток человека Маланханова Т.Б.
	Система CRISPR/Cas9 как инструмент для создания новых модельных систем на основе лабораторных животных Шерстюк В.В.
2014	Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки, - 2-е издание, расширенное и дополненное. С.П. Медведев, А.И. Шевченко, Г.Т. Сухих, С.М. Закиян
2013	Evolution of X Chromosome Inactivation Shevchenko AI, ZakianSM
2012	Структура и функционирование центра инактивации Х-хромосомы млекопитающих Малахова А.А., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Павлова С.В., Закиян С.М.
	Эволюция и организация кластеров генов с импринтированной моноаллельной экспрессией Короткова А.М., Захарова И.С.
	Мейотическая инактивация половых хромосом. Васькова Е.А., Шевченко А.И., Павлова С.В., Закиян С.М.
	Модификации хроматина в процессе инактивации Х-хромосомы у самок млекопитающих. Павлова С.В., Дементьева Е.В., Шевченко А.И.
	Регуляция экспрессии генов Х-хромосомы у млекопитающих Дементьева Е.В., Шевченко А.И., Закиян С.М.
	Стволовые клетки Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Мазурок Н.А., Покушалов Е.А., Закиян С.М.
	Эпигенетические механизмы в регуляции самообновления и плюрипотентности клеток млекопитающих Медведев С.П., Покушалов Е.А., Закиян С.М.
	Эволюция процесса инактивации Х-хромосомы. Елисафенко Е.А., Колесников Н.Н., Шевченко А.И., Закиян С.М.
	Генетические и эпигенетические механизмы предымплантационного развития мыши. Сорокин Михаил Алексеевич
2011	Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки Медведев С.П., Шевченко А.И., Сухих Г.Т.,Закиян С.М.

Конференции

2017	ОПТИМИЗАЦИЯ ИНСТРУМЕНТОВ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ КЛЕТОЧНЫХ МОДЕЛЕЙ БОЛЕЗНИ ХАНТИНГТОНА Маланханова Туяна Баировна, Малахова Анастасия Александровна, Закиян Сурен Минасович III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Получение генетически-модифицированной линии плюрипотентных стволовых клеток человека, экспрессирующей HIF-фактор, индуцируемый гипоксией Захарова И.С., Смирнова А.М.,Живень М.К., Шевченко А.И., Григорьева Е.В., Елисафенко Е.А., Закиян С.М. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Использование системы CRISPR/Cas9 для изучения клеточной модели спинальной мышечной атрофии Валетдинова К.Р., Овечкина В.С., Григорьева Е.В., Маретина М.А., Киселев А.В., Баранов В.С., Медведев С.П., Закиян С.М. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Создание клеточной платформы для изучения молекулярно-генетических механизмов патогенеза болезни Паркинсона. III Национальный конгресс по регенеративной медицине Коваленко В.Р., Вяткин Ю.В., Медведев С.П. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Мониторинг трансплантации кардиальных мезенхимальных клеток крысы в периинфарктную зону миокарда с использованием люциферазной репортерной системы Павлова С.В., Милевская Е.А., Дементьева Е.В., Чепелева Е.В., Сергеевичев Д.С., Закиян С.М. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Создание протокола направленной дифференцировки индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека в средние шипиковые нейроны с возможностью продолжительного культивирования и трансгенеза предшественников данных клеток Е.В. Григорьева, Т.Б. Маланханова, А. Сурумбаева, С.В. Павлова, А.А. Малахова, С.М. Закиян III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Моделирование наследственных сердечно-сосудистых заболеваний с помощью индуцированных плюрипотентных стволовых клеток: успехи, проблемы и перспективы Дементьева Е.В., Медведев С.П., Елисафенко Е.А., Вяткин Ю.В., Штокало Д.Н., Байрамова С.А., Кретов Е.И., Покушалов Е.А., Караськов А.М., Закиян С.М. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	CRISPR/Cas9 in Huntington’s disease modeling Маланханова Т.Б., Малахова А.А., Павлова С.В., Медведев С.П., Закиян С.М. CRISPR: From Biology to Technology and Novel Therapeutics
	CRISPR/Cas9 for targeted genome editing of paralogous genes in Brattleboro rats A.A. Nemudryi, T.B. Malankhanova, S.P. Medvedev, S.M. Zakian Cell Symposia. CRISPR: From Biology to Technology and Novel Therapeutics
	Предшественники средних шипиковых нейронов, полученные из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека, являются ещё одним инструментом для изучения патологии болезни Хантингтона Е.В. Григорьева, А. Сурумбаева, Т.Б. Маланханова, С.В. Павлова, К.Н. Морозова, А.А. Малахова, С.М. Закиян IV Национальный конгресс по болезни Паркинсона и расстройствам движений (с международным участием)
	Создание клеточной платформы для исследования молекулярно-генетических механизмов патогенеза болезни Паркинсона Коваленко В.Р., Вяткин Ю.В., Медведев С.П., Закиян С.М. IV Национальный конгресс по болезни Паркинсона и расстройствам движений (с международным участием)
	Современные подходы, используемые для изучения болезней двигательного нейрона Валетдинова К.Р., Устьянцева Е.И., Григорьева Е.В., Маретина М.А., Куранова М.Л., Киселев А.В., Баранов В.С., Сорокоумов Е.Д.,Ратушняк А.С., Кизилова Е.А., Минина Ю.М., Ветчинова А.С., Иллариошкин С.Н., Медведев С.П., Закиян С.М. IV Национальный конгресс по болезни Паркинсона и расстройствам движений (с международным участием)
	Дифференцировка индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека в нейроны стриатума для создания модели in vitro болезни Хантингтона Е.В. Григорьева, А. Сурумбаева, Т.Б. Маланханова, С.В. Павлова, Л.А. Сульдина, С.М. Закиян БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	Xist gene and chromatin modifications during imprinted X chromosome inactivation in vole M. levis A.I. Shevchenko, E.V. Grigor’eva, I.S. Zakharova, S.M. Zakian БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	Электронно-микроскопический анализ ультраструктурной реорганизации клеток с делециями и встройками в ген хантингтина К.Н. Морозова, Л.А. Сульдина, Т.Б. Маланханова, А.А. Малахова, С.И. Закиян, Е.В. Киселева Международная конференция «Беляевские чтения», посвященная 100-летию академика АН СССР Д.К. Беляева
	Analysis of microRNA expression in rat pluripotent stem cells using genome-wide sequencing technologies Sherstyuk V.V., Medvedev S.P., Elisaphenko E.A., Vaskova E.A., Ri M.T., Vyatkin Y.V., Saik O.V., Shtokalo D.N., Pokushalov E.A., Zakian S.M. 15th Annual Meeting of the International Society for Stem Cell Research
	The studying of activation effects of HIF transcription factor in human pluripotent stem cells on the potential of endothelial angiogenic derivatives Smirnova A., Zakharova I., Jiven M., Shevchenko A., Zakian S. IX international congress «Biotechnology: state of the art and perspectives».
	The study of activation effects of HIF transcription factor on the potential of endothelial angiogenic derivatives in human pluripotent stem cells Smirnova A., Zakharova I., Zhiven M., Shevchenko A., Elisaphenko E., Zakian S. 25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus.
	Исследование эффектов активации фактора, индуцируемого гипоксией, на ангиогенный потенциал эндотелиальных производных плюрипотентных стволовых клеток человека Смирнова А.М., Живень М.К., Захарова И.С., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Закиян С.М. Беляевские чтения : Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика AН СССР Д.К. Беляева
	Сравнительный анализ экспериментальных опухолей, происходящих из ЭСК и ИПСК человека (по результатам тератомного теста) Кизилова Е.А., Валетдинова К.Р., Захарова И.С. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Экспрессия генов OXA1l и BCS1l, определяющих метаболизм АТФ, задействованных в патогенезе варикозной болезни вен, клетками венозной стенки Сметанина М.А., Захарова И.С., Севостьянова К.С., Филиппенко М.Л. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Направленное внесение делеций в геном фибробластов крысы для изучения функций микроРНК в процессе перепрограммирования к плюрипотентному состоянию Давлетшина Г.И., Шерстюк В.В., Закиян С.М. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
2016	Получение модельной системы спинальной мышечной атрофии на основе индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Валетдинова К.Р., Григорьева Е.В., Закиян С.М. Биомедицина-2016
	Использование индуцированных плюрипотентных стволовых клеток в моделировании нейродегенеративных заболеваний Григорьева Е.В. Биомедицина-2016
	Generation of isogenic cell model to study mechanisms of Huntington’s disease in vitro Anastasia A. Malakhova, Michael A. Sorokin, Anastasia E. Sorokina, Tuyana B. Malankhanova, Sergey P. Medvedev, Suren M. Zakian Neuroscience 2016
	СОЗДАНИЕ КЛЕТОЧНОЙ МОДЕЛИ БОЛЕЗНИ ХАНТИНГТОНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА Малахова А.А., Маланханова Т.Б., Сорокин М.А., Сорокина А.Е., Закиян С.М. Биомедицина-2016
	Generation of isogenic cell model of Huntington's disease using genome editing approach Anastasia A. Malakhova, Michael A. Sorokin, Tuyana B. Malankhanova, Anastasia E. Sorokina, Sergey P. Medvedev, Suren M. Zakian International Conference Cell Technologies at The Edge: Research & Practice
	ИНДУЦИРОВАННЫЕ ПЛЮРИПОТЕНТНЫЕ СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ МОДЕЛЬНЫХ ЖИВОТНЫХ КАК ОБЪЕКТЫ БИОМЕДИЦИНСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ Васькова Е.А. Биомедицина-2016
	РЕДАКТИРОВАНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА AVP КРЫС ЛИНИИ BRATTLEBORO С ПОМОЩЬЮ СИСТЕМЫ CRISPR/CAS Немудрый А.А., Маланханова Т.Б., Васькова Е.А., Медведев С.П., Закиян С.М. Биомедицина-2016
	CRISPR-революция в биологии и медицине Медведев С.П. Биомедицина-2016
	Modeling long QT syndrome using patient-specific induced pluripotent stem cells Dementyeva E.V., Grigor’eva E.V., Vyalkova A.V., Medvedev S.P., Shevchenko A.I., Elisaphenko E.A., Bairamova S.A., Pokushalov E.A., Karaskov A.M., Zakian S.M. Cell technologies at the edge: research & practice
	Применение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека для моделирования сердечно-сосудистых заболеваний Дементьева Е.В. форум "Биомедицина-2016"
	Возможности создания биологического водителя ритма сердца Якубов А.А., Лосик Д.В., Медведев С.П., Байрамова С.А., Стрельников А.Г., Романов А.Б., Дементьева Е.В., Покушалов Е.А. форум "Биомедицина-2016"
	The molecular mechanisms of the heterochromatin expansion in the rye chromosomes Evtushenko EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Safar J, Dolezel J, Vershinin AV 21st International Chromosome Conference (ICC)
	Generation of iPSC-based model of Huntington's disease using CRISPR/Cas9 technique Malankhanova B.T. (Tuyana), Malakhova A.A. (Anastasia) International student congress of (bio)medical sciences
	Создание панели изогенных линий клеток, моделирующих болезнь Хантингтона in vitro Шарипова Д.В., Маланханова Т.Б. Международная научная студенческая конференция, НГУ, Новосибирск
	Мониторинг трансплантации кардиальных стромальных клеток крысы в зону ишемического поражения миокарда с использованием люциферазной репортерной системы. Милевская Е. А., Чепелева Е. В., Павлова С. В. Форум «Биомедицина-2016»
	Регенерация миокарда: источник кардиомиоцитов в постнатальном сердце Павлова С.В. форум "Биомедицина-2016"
	Development of tissue-engineering cell-seeded chitosan-polycaprolactone blends for vascular surgery Smirnova A., Zakharova I.S. The tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology
	Development of tissue-engineered chitosan-polycaprolactone blends for vascular surgery Smirnova A., Zakharova I.S., Zhiven’ M.K., Saaya S.B., Strunov A.A., Zakian S.M. 12nd International Congress of cell biology
	Изменение организации эмбриональных стволовых клеток человека под действием гипоксии, индуцированной СoСl2 Сульдина Л.А., Захарова И.С., Стригина (Идимишева) Е.В., Шевченко А.И., Киселева Е.В. Форум «Биомедицина-2016»
	Разработка клеточных технологий для создания клеточно-наполненных сосудистых трансплантатов Захарова И.С., Саая Ш.Б., Живень М.К., Шевченко А.И., Струнов А.А., Смирнова А.М., Карпенко А.А., Покушалов Е.А., Иванова Л.Н., Закиян С.М. Форум «Биомедицина-2016».
	Эпигенетический статус х-хромосом в плюрипотентных стволовых клетках человека Стригина (Идимишева) Е.В., Шевченко А. И., Захарова И.С., Закиян С.М. Всероссийской конференция с международным участием «StemCellBio-2016: фундаментальная наука как основа клеточных технологий»
	Neural differentiation of induced pluripotent stem cells derived from patients with spinal muscular atrophy type I E.V. Grigor’eva, K.R. Valetdinova, Е.I. Ustyantseva,S.M. Zakian Neuroscience 2016
2015	Получение модельных систем болезней моторных нейронов на основе плюрипотентных клеток человека Валетдинова К.Р., Устьянцева Е.И., Медведев С.П., Закиян С.М. II Национальный конгресс по регенеративной медицине
	Условия, необходимые для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток обыкновенных полёвок рода Microtus Григорьева Е.В., Шевченко А.И. Международная конференция «Хромосома-2015»
	СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ТРАНСКРИПТОМА СОМАТИЧЕСКИХ И ПЛЮРИПОТЕНТНЫХ КЛЕТОК КРЫСЫ Васькова Е.А., Шерстюк В.В., Медведев С.П., Гопаненко А.В., Малыгин А.А., Кабилов М.Р., Карпова Г.Г., Закиян С.М. Хромосома 2015
	Ориджины репликации Х-хромосомы центра инактивации Х-хромосомы полевки Microtus levis Шерстюк В.В., Шевченко А.И., Закиян С.М. Международная конференция «Хромосома-2015»
	Использование пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток для моделирования синдрома удлиненного интервала QT Дементьева Е.В., Григорьева Е.В., Вялкова А.В., Медведев С.П., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Байрамова С.А., Иванисенко Н.В., Иванисенко В.А., Покушалов Е.А., Караськов А.М., Закиян С.М. VI Всероссийский съезд аритмологов
	Новые методы геномной инженерии в биомедицинских исследованиях. Медведев С.П., Закиян С.М. VII Съезд Российского общества медицинских генетиков
	Модельные системы болезней моторных нейронов на основе плюрипотентных клеток человека Валетдинова К.Р., Медведев С.П., Закиян С.М. СИМБИОЗ – РОССИЯ 2015 (VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов)
	Создание и характеристика инструментов, предназначенных для внесения мутаций в ген SOD1, на основе систем TALENs и CRISPR/Cas9 Устьянцева Е.И., Валетдинова К.Р., Медведев С.П. Биология - наука 21 века
	Создание клеточной модели для изучения синдрома удлиненного интервала QT Дементьева Е.В., Вялкова А.В., Григорьева Е.В., Медведев С.П., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Байрамова С.А., Покушалов Е.А., Караськов А.М., Закиян С.М. 2-ой Национальный конгресс по регенеративной медицине
	Создание системы для исправления мутации в культивируемых клетках крыс линии Brattleboro Маланханова Т.Б., Немудрый А.А., Васькова Е.А., Медведев С.П. 19-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых "Биология - наука XXI века"
	Сравнение региональных стволовых клеток сердца, кожи и костного мозга человека Павлова С.В., Сергеевичев Д.С., Малахова А.А., Захарова И.С., Григорьева Е.В., Покушалов Е.А., Закиян С.М. II Национальный конгресс по регенеративной медицине
	СОЗДАНИЕ СОСУДИСТЫХ ТРАНСПЛАНТАТОВ С КЛЕТОЧНЫМ ЗАСЕЛЕНИЕМ Саая Ш.Б., Захарова И.С., Живень М.К., Карпенко А.А., Покушалов Е.А., Иванова Л.Н., Шевченко А.И., Закиян С.М. XXX Международная конференция Российского общества ангиологов и сосудистых хирургов
	Получение функциональных эндотелиальных и гладкомышечных клеток из материала кардиальных эксплантов человека Захарова И.С., Шевченко А.И., Живень М.К., Саая Ш.Б., Струнов А.А., Смирнова А.М., Карпенко А.А., Покушалов Е.А., Закиян С.М., Иванова Л.Н. II Национальный конгресс по регенеративной медицине
	Возможности использования индуцированных плюрипотентных стволовых клеток с исправленным генотипом в области заместительной клеточной терапии на модели крыс Brattleboro Васькова Е.А., Медведев С.П., Шерстюк В.В., Немудрый А.А., Сорокина А.Е., Елисафенко Е.А., Иванова Л.Н., Закиян С.М. II Национальный конгресс по регенеративной медицине
	Сравнение региональных стволовых клеток сердца, кожи и костного мозга человека Павлова С.В., Сергеевичев Д.С., Малахова А.А., Захарова И.С., Григорьева Е.В., Покушалов Е.А. Закиян С.М. II Национальный конгресс по регенеративной медицине 2015 г. 3–5 декабря, Москва, ФГБУ «НЦАГиП им. В.И. Кулакова» Минздрава России
2014	Разработка подхода к получению клеточно-наполненного сосудистого трансплантата Захарова И.С., Шевченко А.И., Живень М.К., Саая Ш.Б., Карпенко А.А., Покушалов Е.А., Иванова Л.Н., Караськов А.М., Сухих Г.Т., Закиян С.М. Международная конференция по биопринтингу и биофабрикации
	ПОДХОДЫ К ПОЛУЧЕНИЮ ВАСКУЛЯРНЫХ КЛЕТОК И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ В ТКАНЕВОЙ ИНЖЕНЕРИИ СОСУДОВ Захарова И.С., Шевченко А.И., Живень М.К., Саая Ш.Б., Карпенко А.А., Покушалов Е.А., Иванова Л.Н., Караськов А.М., Сухих Г.Т., Закиян С.М. симпозиум "Новейшие методы клеточных технологий в медицине"
	Клеточные технологии в регенеративной медицине и моделировании заболеваний человека. Медведев С.П. Международная молодежная научная конференция "Современные проблемы генетики, клеточной биологии и биотехнологии"
	Применение современных систем редактирования генома для получения клеточной модели бокового амиотрофического склероза на основе изогенных линий эмбриональных стволовых клеток человека, несущих мутации в гене SOD1 Валетдинова К.Р., Устьянцева Е.И., Медведев С.П., Васькова Е.А., Закиян С.М. Современные проблемы генетики, клеточной биологии и биотехнологии
	Конструкция межвидовых «мышь---крыса» химерных бластоцист для in vivo оценки плюрипотентности стволовых клеток крысы Казак* Е.А., Васькова Е.А., Кизилова Е.А., Байбородин С.И., Голубица А.Н., Железова А.И. VII Школа-Конференция «Актуальные проблемы биологии развития»
	Creating a family-based model system for studying long QT syndrome Dementyeva E., Grigor’eva E., Vyalkova A., Medvedev S., Shevchenko A., Elisaphenko E., Bairamova S., Pokushalov E., Ivanova L., Zakian S. 12th Annual Meeting of the International Society for Stem Cell Research
	Моделирование сердечно-сосудистых заболеваний с использованием индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Дементьева Е.В., Григорьева Е.В., Вялкова А.В., Медведев С.П., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Байрамова С.А., Покушалов Е.А., Иванисенко Н.В., Иванисенко В.А., Караськов А.М., Сухих Г.Т., Закиян С.М. Первый всероссийский симпозиум «Новейшие методы клеточных технологий в медицине»
	Создание модели синдрома удлиненного интервала QT при помощи индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Вялкова А.В., Григорьева Е.В., Дементьева Е.В., Медведев С.П., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Байрамова С.А., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Первый всероссийский симпозиум «Новейшие методы клеточных технологий в медицине»
	Application of human induced pluripotent stem cells for modelling long QT syndrome Dementyeva E.V., Grigor’eva E.V., Vyalkova A.V., Medvedev S.P., Shevchenko A.I., Elisaphenko E.A., Bairamova S.A., Pokushalov E.A., Ivanisenko N.V., Ivanisenko V.A., Karaskov A.M., Sukhikh G.T., Zakian S.M. IV Международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»
	Разработка методов терапии инфаркта миокарда у крыс линии WAG, основанных на трансплантации клеток кардиальной культуры Е. В. Чепелева, С. В.Павлова, А. А. Малахова, Е. А. Милевская, Я. Л. Русакова, Н. А. Подхватилина, Д. С. Сергеевичев, Е.А. Покушалов, А. М. Караськов, Г. Т. Сухих, С. М. Закиян Симпозиум “Новейшие методы клеточных технологий в медицине”
	Отличия в ультраструктурной организации эмбриональных и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Сульдина Л.А., Павлова С.В., Малахова А.А., Стекленева А.Е., Васькова Е.А., Закиян С.М., Киселева Е.В. Симпозиум “Новейшие методы клеточных технологий в медицине”
	Создание клеточной модели болезни Хантингтона с использованием технологии редактирования генома Малахова А.А., Сорокин М.А., Стекленёва А.Е., Закиян С.М. Международная молодежная научная конференция «Современные проблемы генетики, клеточной биологии и биотехнологии»
	Исправление мутантного генотипа в клетках крыс линии Brattleboro с помощью современных методов геномной инженерии Немудрый А.А., Сорокина А.Е., Васькова Е.А., Медведев С.П., Иванова Л.Н., Закиян С.М. VI съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС) и ассоциированные генетические симпозиумы
2013	Контроль транскрипционного статуса генов Х-хромосомы человека в клеточной терапии с использованием линий плюрипотентных стволовых клеток и их дифференцированных производных Шевченко А.И., Захарова И.С., Сметанина М.А., Закиян С.М. 1 национальный конгресс по регенеративной медицине
	РАЗРАБОТКА МЕТОДА ПОЛУЧЕНИЯ КЛЕТОЧНО-НАПОЛНЕННОГО СОСУДИСТОГО ТРАНСПЛАНТАТА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ НАПРАВЛЕННОЙ ВАСКУЛЯРНОЙ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК ЧЕЛОВЕКА Захарова И.С., Шевченко А.И., Живень М.К., Саая Ш.Б., Карпенко А.А., Покушалов Е.А., Иванова Л.Н., Сухих Г.Т., Закиян С.М. 1 национальный конгресс по регенеративной медицине
	Регенеративный потенциал кардиальных клеток из экспланта сердечной мышцы человека Чепелева Е.В., Павлова С.В., Малахова А.А., Перовский П.П., Дементьева Е.В., Покушалов Е.А., Закиян С.М. 1 национальный конгресс по регенеративной медицине
	Исследование транскриптомов плюрипотентных клеток крысы с помощью метода RNA-seq Стекленева А.Е. Васькова Е.А. Немудрый А.А. Евшин И.С. Шарипов Р.Н. Колпаков Ф.А. Медведев С.П. XX МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ СТУДЕНТОВ, АСПИРАНТОВ И МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ "ЛОМОНОСОВ"
	Направленная васкулярная дифференцировка стволовых клеток человека и их применение в разработке клеточно-наполненных сосудистых трансплантатов Захарова И.С., Шевченко А.И., Закиян С.М. Пятая Международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика» («System Biology and Bioinformatics, SBB’2013)
	Характеристика синдрома удлиненного интервала QT при помощи пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Вялкова А.В., Григорьева Е.В., Дементьева Е.В. XIX Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов-2013»
	Studying long QT syndrome using patient-specific induced pluripotent stem cells Dementyeva E.V., Grigor’eva E.V., Vyalkova A.V., Medvedev S.P., Shevchenko A.I., Zakian S.M. The 5th International Young Scientists School “Systems Biology & Bioinformatics”
	INTENSIVE RECOMBINATIONS HAVE LED TO TANDEM REPEAT EXPANSION AND ENLARGEMENT OF RYE SUBTELOMERIC HETEROCHROMATIN VERSHININ A.V., EVTUSHENKO E.V., ELISAFENKO A.E., GUNBIN K., LEVITSKY V.G. The 19th International Chromosome Conference
	Создание модели синдрома удлиненного интервала QT с использованием семейного подхода Дементьева Е.В., Григорьева Е.В., Вялкова А.В., Медведев С.П., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Байрамова С.А., Покушалов Е.А., Караськов А.М., Сухих Г.Т., Закиян С.М. 1-ый Национальный конгресс по регенеративной медицине
	Паттерн транскрипции белок-кодирующих и регуляторных РНК в плюрипотентных клетках крысы Стекленева А.Е., Медведев С.П., Васькова Е.А., Немудрый А.А., Елисафенко Е.А., Евшин И.С., Шарипов Р.Н., Сайфутдинова С.Г., Кизилова Е.А., Железова А.И., Иванова Л.Н., Покушалов Е.А., Закиян С.М. V ВСЕРОССИЙСКАЯ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ И РЕГЕНЕРАТИВНАЯ МЕДИЦИНА»
	In vivo оценка плюрипотентности ЭСК и ИПСК крысы на модели первичного межвидового химеризма "мышь---крыса" Васькова Е.А., Кизилова* Е.А., Голубица А.Н., Железова А.И. VII Школа-Конференция «Актуальные проблемы биологии развития
2012	ИССЛЕДОВАНИЕ ЭПИГЕНЕТИЧЕСКОГО СТАТУСА Х-ХРОМОСОМЫ В ЛИНИЯХ ПЛЮРИПОТЕНТНЫХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК ЧЕЛОВЕКА Захарова Ирина Сергеевна, Шевченко Александр Игоревич, Григорьева Елена Викторовна, Малахова Анастасия Александрона, Сметанина Мария Александровна, Закиян Сурен Минасович ХРОСОМОМА 2012
	Получение и характеристика плюрипотентных стволовых клеток крыс линий Brattleboro и WAG Немудрый А.А., Стекленева А.Е., Васькова Е.А. мнск 2012 г. новосибирск
	Получение модели наследственного гипоталамического несахарного диабета на основе плюрипотентных стволовых клеток крыс линии Brattleboro Немудрый А.А., Стекленева А.Е., Васькова Е.А. Ломоносов-2012
	Создание плазмидных и аденовирусных векторов, предназначенных для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Ковлягина И.С., Дементьева Е.В. 50-я юбилейная Международная научная студенческая конференция «Студент и научно-технический прогресс»
	Модификации неактивного хроматина при различных формах сайленсинга Х-хромосомы у грызунов Шевченко А.И., Дементьева Е.В., Павлова С.В., Григорьева Е.В., Закиян С.М. Хромосома 2012, Новосибирск, 2-7 сентября
	Сравнительная характеристика эмбриональных стволовых и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток крысы Стекленева А.Е., Васькова Е.А., Немудрый А.А., Минина Ю. М., Медведев С. П. Ломоносов 2012: XIX Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых
	Создание плазмидных и аденовирусных векторов, предназначенных для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Ковлягина И.С., Дементьева Е.В. XIX Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов-2012»
2011	Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки - модели для изучения патогенеза заболеваний и источник материала для заместительной клеточной терапии Медведев С.П. IX научная конференция "Генетика человека и патология: актуальные проблемы современной цитогенетики"
	Paternal X-chromosome is preinactivated at early stages of imprinted X-inactivation in rodents Dementyeva E.V., Vaskova E.A., Shevchenko A.I., Pavlova S.V., Zakian S.M. EMBO Workshop "50 YEARS OF X INACTIVATION RESEARCH" (3rd X-inactivation Conference), July 20-24, 2011, Oxford, UK
	Epigenetic status of X chromosome in female human induced pluripotent stem cells Evgeniya A. Vaskova, Alexander I. Shevchenko, Ekaterina A. Gracheva, Sergey P. Medvedev, Elena V. Grigor'eva, Anastasiya A. Malakhova, Suren M.Zakian EMBO Workshop "50 YEARS OF X INACTIVATION RESEARCH" (3rd X-inactivation Conference), July 20-24, 2011, Oxford, UK
	Репрограммирование нейральных стволовых клеток крысы к плюрипотентному состоянию Стекленева Анастасия Евгеньевна XIII МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ СТУДЕНТОВ, АСПИРАНТОВ И МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ "ЛОМОНОСОВ"
2010	Получение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток из фетальных нейральных стволовых клеток человека Медведев С.П., Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Малахова А.А., Дементьева Е.В., Соболев И.А., Александрова М.А., Плотников Е.Ю., Сухих Г.Т., Закиян С.М. IV Всероссийский симпозиум с международным участием "Актуальные вопросы тканевой и клеточной трансплантологии" (Санкт-Петербург, 21-22 апреля 2010 г.)
	Дозовая компенсация генов половых хромосом у эукариот Дементьева Е.В. V Международная конференция по кариосистематике беспозвоночных животных (KARYO V) с 16 по 20 августа 2010 г. г. Новосибирск
	От изоферментов до эмбриональных стволовых клеток Закиян С.М. Конференция "Генетика развития и нейрогенетика", Москва, 25-27 мая 2010 г.
	Структура хроматина неактивной Х-хромосомы у обыкновенных полевок Васькова Е.А., Шевченко А.И., Павлова С.В., Дементьева Е.В., Григорьева Е.В., Закиян С.М. XVI Всероссийский симпозиум "СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ КЛЕТОЧНОГО ЯДРА" 5–7 октября 2010 г.С-Петербург
2009	Статусы экспрессии и метилирования генов Х-хромосомы в соматических и экстраэмбриональных тканях обыкновенных полевок Дементьева Е.В., Шевченко А.И., Вагнер Т.В., Закиян С.М. Международная конференция "Хромосома 2009", Новосибирск, 31 августа-6 сентября
	Трофобластные стволовые клетки обыкновенной полевки рода Microtus – модель для изучения импринтированной инактивации Х-хромосомы Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Закиян С.М. Международная конференция "Хромосома 2009", Новосибирск, 31 августа-6 сентября
	Экспрессия генов раннего развития у обыкновенной полевки Microtus rossiaemeridionalis Сорокин М.А. Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов-2009", г. Москва
	Изучение статуса экспрессии генов Х-хромосомы у обыкновенных полевок рода Microtus Вагнер Т.В., Дементьева Е.В. Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов-2009", г. Москва
	Сходный паттерн распределения модификаций хроматина на неактивной Х-хромосоме в процессе мейотической и импринтированной инактивации у обыкновенных полевок Васькова Е.А. Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов-2009", г. Москва
	Модификации хроматина неактивной Х-хромосомы у обыкновенных полевок Васькова Е.А., Шевченко А.И., Павлова С.В., Дементьева Е.В., Григорьева Е.В., Закиян С.М. Международная конференция "Хромосома 2009", Новосибирск, 31 августа-6 сентября
	Трофобластные стволовые клетки полевок рода Microtus Григорьева ЕВ, Шевченко АИ, Мазурок НА, Закиян СМ Хромосома 2009, Новосибирск, 31 августа - 6 сентября
	Особенности организации и инактивации Х-хромосомы у сумчатых опоссумов Захарова И.С., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Шилов А.Г., Закиян С.М. Хромосома 2009, Новосибирск, 31 августа - 6 сентября
	Исследование транскрипционной регуляции и происхождения гена Tsix Жукова О.А., Елисафенко Е.А., Закиян С.М. Хромосома 2009, Новосибирск, 31 августа - 6 сентября
	Молекулярная структура субтеломерного гетерохроматина ржи Евтушенко Е.В., Елисафенко Е.А., Вершинин А.В. Хромосома 2009, Новосибирск, 31 августа - 6 сентября
	Некодирующие регуляторные РНК Х хромосомы млекопитающих. Происхождение и эволюция Колесников Н.Н., Елисафенко Е.А. Хромосома 2009, Новосибирск, 31 августа - 6 сентября
	Структурно-функциональная организация регуляторных районов гена Xist полевки Microtus Rosiaemeridionalis Орищенко К.Е., Елисафенко Е.А. Хромосома 2009, Новосибирск, 31 августа - 6 сентября
	Модификации хроматина неактивной Х-хромосомы в процессе мейотической и импринтированной инактивации у обыкновенных полевок Васькова Е.А. XLVII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-47) г.Новосибирск, 11 – 15 апреля 2009 г.
	Получение плюрипоентных линий гибридных клеток для изучения процесса инактивации Х-хромосомы обыкновенных полевок рода Microtus Малахова А.А., Григорьева Е.В., Шевченко А.И. Ломоносов-2009: Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых; секция «Биология»
	Экспрессия последовательностей района центра инактивации Х-хромосомы полевок рода Microtus Малахова А.А., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Закиян С.М. «Хромосома 2009»
	Характеристика трофобластных стволовых клеток полевок рода Microtus. Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Мазурок Н.А., Закиян С.М. Пятый Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров Москва, 21-28 июня 2009
	Получение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека С.П. Медведев, Е.В. Григорьева, А.А. Малахова, А.И. Шевченко, Д.А. Савушкина, В.В. Бернвальд, И.А. Соболев, С.М. Закиян. Материалы Всероссийской научной школы-конференции для молодежи «Аутологичные стволовые клетки: экспериментальные и клинические исследования»
2008	X-chromosome inactivation, mobile elements and ncRNA genes Kolesnikov N.N., Elisafenko E.A. 6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28
	Модификации хроматина и статус экспрессии генов при импринтированной и случайной инактивации X-хромосомы у млекопитающих Шевченко АИ, Закиян С.М. IV съезд Российского Общества биохимиков и молекулярных биологов, 10-15 мая, Новосибирск, 2008
	Вклад мобильных элементов генома в образование и эволюцию нкРНК гена Xist млекопитающих Колесников Н.Н., Елисафенко Е.А., Шевченко А.И, Закиян С.М. (4) IV съезд Российского Общества биохимиков и молекулярных биологов, 10-15 мая, Новосибирск, 2008
	Специализированные районы хромосом: гетерогенные ДНК, консервативные функции Вершинин А.В., Евтушенко Е.В. IV съезд Российского Общества биохимиков и молекулярных биологов, 10-15 мая, Новосибирск, 2008
	Сравнение модификаций хроматина неактивной Х-хромосомы фибробластов и трофобластных стволовых клеток обыкновенных полевок Васькова Е.А., Дементьева Е.В Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (26-30 апреля, г. Новосибирск)
	Исследование регуляторной области гена Tsix полевки Microtus rossiaemeridionalis Жукова О.А., Орищенко К.Е. Международная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс"
	Закономерности и парадоксы эволюции теломерных районов хромосом Вершинин А.В. Симпозиум "Хромосомы и Эволюция" Памяти ГА Левитского, Санкт-Петербург, 26-27 ноября 2008 г
2007	Как происходит инактивация Х хромосомы у сумчатых млекопитающих Захарова И.С., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А. Междунар. молодежная научно-методическая конф. "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", посвященная 50-летию СО РАН, Томск 10-12 мая 2007
	Oct4 и Nanog – ключевые гены в системе поддержания плюрипотентности клеток млекопитающих Медведев С.П., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Закиян С.М. Междунар. молодежная научно-методическая конф. "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", посвященная 50-летию СО РАН, Томск 10-12 мая 2007
	Исследование регуляторной области гена Xist полевки Microtus rossiaemeridionalis Орищенко К.Е., Елисафенко Е.А. Междунар. молодежная научно-методическая конф. "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", посвященная 50-летию СО РАН, Томск 10-12 мая 2007
	Эволюция и происхождение центра инактивации половых хромосом млекопитающих Колесников Н.Н., Елисафенко Е.А., Шевченко А.И. и Закиян С.М. Международная конференция "Развитие эволюционной идеи в биологии, социологии и медицине". Конференция посвящена 90-летию со дня рождения академика Д.К.Беляева 7 - 9 августа 2007 года
	Идентификация гена Xist и исследование модификаций хроматина неактивной Х-хромосомы у самок Sorex araneus L. Сорокин М.А., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А., Захарова И.С., Медведев С.П., Орищенко К.Е. Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск
	Модификации хроматина неактивной Х-хромосомы у обыкновенных полевок рода Microtus Шевченко А.И., Павлова С.В., Дементьева Е.В. Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск
	Получение и характеристика стволовых клеток экстраэмбриональной энтодермы полевок рода Microtus Демина ВВ, Шевченко АИ, Григорьева ЕВ, Шилов АГ, Павлова СВ Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск
	Центр инактивации Х-хромосомы обыкновенных полевок: Характеристика последовательностей ДНК и анализ экспрессии генов А.А.Малахова, А.И.Шевченко Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск
	Картирование и статус экспрессии генов Х-хромосомы у обыкновенных полевок Дементьева Е.В., Шевченко А.И., Аноприенко О.В., Мазурок Н.А., Закиян С.М. Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск
	Получение трофобластных стволовых клеток обыкновенных полевок рода Microtus в отсутствие фактора Fgf2 Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Мазурок Н.А. Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск
	Теломеры и центромеры: консервативные функции, гетерогенные ДНК Вершинин А.В. Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск
	Трофобластные стволовые клетки обыкновенных полевок как модель для изучения in vitro процессов имплантации и плацентации Е.В.Григорьева, А.И.Шевченко, П.А.Дыбан, А.П.Дыбан, Н.А.Мазурок, С.М.Закиян Симпозиум с международным участием "Клеточные, молекулярные и эволюционные аспекты морфогенеза", Москва
2006	B chromosomes of the grasshopper Podisma kanoi Storozh. (Orthoptera, Acridi-dae): distribution and DNA contents Rubtsov N., Karamysheva T., Perepelov E., Elisaphenko E., Warchaowska-liwa E., Tatsuta H., Bugrov A. 17th European Colloquium on Animal Cytogenetic and Gene Mapping, Lissbon (Portugal), 18-21 June, 2006
	Evolution of the structure of the XIST locus in mammals Kolesnikov N.N., Elisaphenko E.A., Zakian S.M. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
	Эволюция половых хромосом и происхождение центра инактивации X-хромосом млекопитающих Колесников Н.Н. IV Международная конференция " Проблема вида и видообразование". 25-28 сентября 2006. г. Томск. Томский Государственный Университет
	Эволюция системы дозовой компенсации у млекопитающих Закиян С.М. IV Международная конференция " Проблема вида и видообразование". 25-28 сентября 2006. г. Томск. Томский Государственный Университет
	The X-inactivation centre in common voles Shevchenko A., Malakhova A., Pavlova M., S. Slobodyanyuk S., Elisaphenko E., Mazurok N., Shilov A., Nesterova T., Brockdorff N., Zakian S. Вторая международная конференция по инактивации Х-хромосомы, Париж, Франция, 2006
	Эмбриональные стволовые клетки: свойства и особенности Закиян С.М. Международная конференции "Фундаментальные науки – биотехнологии и медицине" Новосибирск, Россия
	О свойствах стволовых эмбриональных клеток Шевченко А.И., Мазурок Н.А., Шилов А.Г., Дёмина В.В., Дыбан П.А., Дыбан А.П., Закиян С.М. Международная конференция "Стволовые клетки и перспектива их использования в здравоохранении" Москва, Россия
	Эволюция структурной организации Xist локуса у млекопитающих Колесников Н.Н., Елисафенко Е.А., Закиян С.М. Новосибирск, июль 16-22, 2006 год. Международная конференция по биоинформатике, регуляции и структуре генома.
	X-linked genes mapping and expression status analysis in common voles Dementyeva E.V., Shevchenko A.I., Anopriyenko O.V., Mazurok N.A., Nesterova T.B., Zakian S.M. 2nd Conference on X-inactivation
	Protein-coding genes surrounding Xist in mouse and human are separated in the American marsupials Monodelphis domestica and Didelphis virginiana Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Elisaphenko E.A., Ross M., Weidman J., Jirtle R., Vandeberg J., Nesterova T., Karamysheva T., Rubtsov N., Zakian S, Brockdorff N. 2nd Conference on X-inactivation
	X chromosome inactivation in trophoblast stem cells of common vole M.rossiaemeridionalis (Arvicolidae, Rodentia) N.A. Mazurok, E.V. Grigoreva, A.I. Shevchenko, P.A. Dyban, A.P. Dyban, S.M. Zakian. Вторая международная конференция по инактивации Х-хромосомы

Гранты

2017	«Исследование молекулярных механизмов HIF-зависимого ангиогенеза на модели эндотелиальных производных плюрипотентных стволовых клеток человека». РНФ, номер гранта РНФ № 17-75-10047
2016	Создание клеточных моделей болезни Хантингтона для изучения молекулярных механизмов развития патологии РНФ, номер гранта 16-15-10128
	Анализ микроРНК, участвующих в регуляции самообновления плюрипотентных клеток крысы и процесса репрограммирования к плюрипотентному состоянию. РНФ, номер гранта 16-14-10084
	Получение и характеристика модельных систем бокового амиотрофического склероза с помощью плюрипотентных клеток человека, несущих мутации, связанные с развитием различных форм данного заболевания РФФИ, номер гранта 16-34-00762 мол_а
	Получение вазопрессинэргических нейронов в результате направленной дифференцировки плюрипотентных стволовых клеток крыс линии Brattleboro с исправленным генотипом РФФИ, номер гранта 16-34-00887
2015	Высокоточное картирование динамики молекулярно-генетических и эпигенетических событий, сопровождающих процессы инактивации и реактивации Х-хромосомы РФФИ, номер гранта 15-04-03947 А
2014	Разработка клеточных технологий для создания клеточно-наполненных сосудистых трансплантатов РФФИ, номер гранта 14-04-00082 А
	Профиль инактивации транскрипции Х-хромосомы и роль гена Xist при импринтированной инактивации у грызунов РФФИ, номер гранта 14-04-00710 А
	Изучение синдрома удлиненного QT-интервала сердечного ритма с помощью пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток РФФИ, номер гранта 14-04-31906 мол_а
2012	Исследование эпигенетического статуса Х-хромосомы в линиях плюрипотентных стволовых клеток человека РФФИ, номер гранта 12-04-31465 мол_а
	Импринтировнная инактивация Х-хромосомы у грызунов: модификации хроматина и природа импринтинга РФФИ, номер гранта 12-04-31704
	Исследование феномена эпигенетической памяти при репрограммировании соматических клеток человека к плюрипотентному состоянию РФФИ, номер гранта 12-04-00185
	Создание клеточных моделей болезней экспансии тринуклеотидных повторов с применением новейших технологий геномной инженерии Номер гранта ФНМ-09
	Поиск подходов к коррекции мутантного фенотипа крыс Браттлборо с наследственным несахарным диабетом посредством применения плюрипотентных клеток с искусственно исправленным генотипом РФФИ, номер гранта 12-04-00208-a
2011	Регуляция инактивации Х-хромосомы у грызунов РФФИ, номер гранта 11-04-00799-а
	Участие в 2-ой международной конференции по Х-инактивации с докладом «Инактивация Х-хромосомы в трофобластных стволовых клетках обыкновенной полевки M.rossiaemeridionalis (Arvicolidae, Rodentia)» РФФИ, номер гранта 06-04-58917-з
	Участие в международном симпозиуме "50 лет исследования инактивации Х-хромосомы" РФФИ, номер гранта 11-04-09493
	Репрограммирование дифференцированных соматических клеток человека к плюрипотентному состоянию РФФИ, номер гранта 11-04-00847
2009	Развитие технологии получения индуцированных стволовых клеток человека, пригодных для клеточной и генной терапии Президиум СО РАН
	Федеральная целевая программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы. Научно-исследовательские работы по теме: «Исследование влияния экзогенной двуцепочечной ДНК человека на активацию и формирование противоракового адаптивного иммунитета и разработка принципиально новых подходов в использовании препарата нового поколения Панаген» Номер гранта Гос.контракт №02.740.11.0091
	Направленные изменения структуры генома - новый подход к управлению активностью генов Государственный контракт «Роснаука», номер гранта 02.512.11.2065
	Эпигенетические механизмы регуляции экспрессии генов эукариот в ходе онтогенеза Грант по программе «Молекулярная и клеточная биология», номер гранта Грант по программе «Молекулярная и клеточная биология» по проекту институтов СО РАН в программах РАН №22, подраздел 22.11 (№ А.II.6 в 2011 г.)
	Изучение механизмов пространственно-временной устойчивости популяций филлофагов и разработка методов регуляции численности насекомых вредителей сельского и лесного хозяйства Грант по интеграционному междисциплинарному проекту СО РАН, номер гранта 46
	Трехмерные культуры клеток: исследование культивирования стволовых и первичных клеток с целью получения дифференцированной хрящевой ткани, пригодной для заместительной терапии Грант по проекту СО РАН, выполняемому совместно со сторонними организациями, номер гранта 59
2008	Изменения структуры хроматина в процессе инактивации Х-хромосомы у обыкновенных полевок РФФИ, номер гранта 08-04-00346
2007	Равенство полов или дозовая компенсация генов Х хромосом у самок плацентарных млекопитающих РФФИ, номер гранта 07-04-11508
	Разработка новых способов регуляции экспрессии генов у эукариот Государственный контракт, номер гранта 02.512.12.2018
2006	Поиск и анализ центра инактивации X-хромосомы у сумчатых и насекомоядных РФФИ, номер гранта 06-04-48337-а
	Структура и эволюция центра инактивации XIC/Xic X-хромосом млекопитающих Направление исследований №7 – «Генетические механизмы биологической эволюции и корреляция биогеологических событий», в рамках программы №18 «Происхождение и эволюция биосферы» (подпрограмма 2)
	Стволовые клетки - основа клеточных биотехнологий будущего Междисциплинарный интеграционный проект фундаментальных исследований СО РАН, номер гранта 14.1
2005	Анализ функционирования антисмысловых генов Xist/Tsix и их регуляторных элементов в центре инактивации Х-хромосомы у обыкновенных полевок Грант по программе «Молекулярная и клеточная биология»
	Исследование экспрессии генов Oct4 и Nanog в плюрипотентных клетках обыкновенных полевок рода Microtus РФФИ, номер гранта 05-04-48692
2004	Сравнительный анализ структурной организации терминальных районов хромосом ржи РФФИ, номер гранта 04-04-48813

Научное руководство

2017	Применение геномной инженерии для прижизненной визуализации экспрессии маркеров нейральной дифференцировки плюрипотентных стволовых клеток человека Александров Андрей Алексеевич 2017-06-20
	«Мониторинг трансплантации кардиальных клеток в зону ишемического повреждения миокарда с использованием люциферазной репортерной системы» Милевская Елизавета Андреевна специалист, 2017-06-19
	Создание клеточной модели болезни Хантингтона с использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9 Шарипова Динара Витальевна 2017-06-05
2016	Создание модели наследственной гипертрофической кардиомиопатии на основе пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Коваленко Виктория Романовна 2016-06-22
	Эпигенетический статус Х-хромосом в плюрипотентных стволовых клетках человека Стригина Евгения Валерьевна Генетика, 2016-06-01
	Разработка тканеинженерных конструкций, заселенных эндотелиальными и муральными клетками человека Смирнова Анна Михайловна 06.03.01 Биология, 2016-05-30
2015	Создание системы исправления мутации di в культивируемых клетках крыс линии Brattleboro. Маланханова Туяна Баировна 2015-06-05
	Получение и характеристика эндотелиальных и муральных клеток человека и их использование на естественных и искусственных графтах сосудов Живень Мария Константиновна биолог, 2015-06-04
2014	Дифференцировка плюрипотентных стволовых клеток крысы и динамика процесса инактивации Х-хромосомы Герасимова К.В. Генетика, 2014-06-09
2012	Исследование регенеративного потенциала культур клеток, полученных из экспланта сердечной мышцы человека Перовский Петр Петрович 2012-06-20
	Создание плазмидных и аденовирусных векторов, предназначенных для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Ковлягина Ирина Сергеевна Биология, 2012-06-05
2011	Центр инактивации Х-хромосомы обыкновенных полевок: характеристика последовательнгостей ДНК и анализ экспрессии генов Малахова Анастасия Александровна 03.02.07 - генетика, 2011-11-29
	Регуляция транскрипции гена Tsix у домовой мыши и восточноевропейской полевки. Кузнецова Татьяна Олеговна Генетика, 2011-11-15
	Репрограмирование дифференцированных клеток крысы линии Wistar к состоянию плюрипотентности Стекленева Анастасия Евгеньевна Генетика, 2011-06-03
	Паттерн метилирования ДНК регуляторных областей генов Oct4 и Nanog полевки Microtus rossiaemeridionalis Филатова Анна Владимировна 2011-06-02
	Картирование сайтов инициации репликации в центре инактивации Х-хромосомы полевки Microtus rossiaemeridionalis Шерстюк В.В. Клеточная биология, цитология, гистология, 2011-06-01
	Эпигенетический статус Х-хромосом в линиях индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Грачева Е.А. Генетика, 2011-06-01
	Определение и анализ регуляторных районов гена Xist полевки Microtus rossiaemerisionalis Орищенко Константин Евгеньевич 03.02.07 - генетика, 2011-04-06
2010	Получение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека из нейральных стволовых клеток Соболев Иван Андреевич 2010-06-03
	Гены центра инактивации и модификации хроматина активной и неактивной Х-хромосом у сумчатых Захарова Ирина Сергеевна 03.02.07 - генетика, 2010-04-29
	Получение и характеристика трофобластных стволовых клеток обыкновенных полевок рода Microtus (Arvicolidae, Rodentia) Григорьева Елена Викторовна 03.02.07 - генетика, 2010-04-28
	Статус экспрессии генов и модификации хроматина на активной и неактивной Х-хромосоме у обыкновенных полевок Дементьева Елена Вячеславовна 03.02.07 - генетика, 2010-04-28
2009	Экспрессия генов ранненго развития у обыкновенных полевок Сорокин М.А. Генетика, 2009-06-01
	Модификации хроматина неактивной Х-хромосомы у полевки Microtus rossiaemeridionalis Васькова Е.А. Генетика, 2009-06-01
	Статус экспрессии генов Х-хромосомы у обыкновенных полевок рода Microtus Вагнер Т.В. Генетика, 2009-06-01
	Функциональный анализ промоторной области гена Xist мыши (Mus musculus) Короткова Анна Михайловна Генетика, 2009-06-01
	Стуктура, регуляция и экспрессия генов Oct4 и Nanog у обыкновенных полевок рода Microtus (Arvicolidae, Rodentia) Медведев Сергей Петрович Генетика - 03.00.15, 2009-01-28
2008	ИССЛЕДОВАНИЕ РЕГУЛЯТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА TSIX ПОЛЁВКИ MICROTUS ROSSIAEMERIDIONALIS Жукова Ольга Андреевна Генетика, 2008-06-02
2007	Картирование точек инициации репликации в центре инактивации обыкновенных полевок Камнев А.Н. Генетика, 2007-06-01
2006	ИССЛЕДОВАНИЕ РЕГУЛЯТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА XIST ПОЛЁВКИ MICROTUS ROSSIAEMERIDIONALIS Орищенко Константин Евгеньевич Генетика, 2006-06-03
2004	Получение эмбриональных стволовых (ЭС) клеток полевок рода Microtus и гибридов ЭС клеток мыши с соматическими клетками полевок Ситникова Наталья Анатольевна , 2004-06-01

Учебные курсы

2015	Плюрипотентные клетки животных и человека Медведев С.П. ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Научно-образовательный отдел, семестров: 2

Патенты

2012	Рекомбинантная плазмида pSN-ZsGreen, кодирующая белки SOX2 и NANOG человека и флуоресцентный белок ZsGreen, предназначенная для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Медведев С.П., Шевченко А.И., Покушалов Е.А., Закиян С.М.
	Рекомбинантная плазмида pOK-DsRed2, кодирующая белки OCT4 и KLF4 человека и флуоресцентный белок DsRed2, предназначенная для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Медведев С.П., Шевченко А.И., Покушалов Е.А., Закиян С.М.
	Рекомбинантная плазмида pOL-DsRed2, кодирующая белки OCT4 и LIN28 человека и флуоресцентный белок DsRed2, предназначенная для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Медведев С.П., Шевченко А.И., Покушалов Е.А., Закиян С.М.
	Рекомбинантная плазмида pAd-SM, кодирующая белки SOX2 и C-MYC человека, являющаяся основой для получения вирулентных аденовирусов, предназначенных для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Медведев С.П., Шевченко А.И., Покушалов Е.А., Закиян С.М.
	Рекомбинантная плазмида pSM-ZsGreen, кодирующая белки SOX2 и C-MYC человека и флуоресцентный белок ZsGreen, предназначенная для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека Медведев С.П., Шевченко А.И., Покушалов Е.А., Закиян С.М.