Genome-wide association study revealed some new candidate genes associated with flowering and maturity time of soybean in Central and West Siberian regions of Russia Perfil`ev R, Shcherban A, Potapov D, Maksimenko K, Kiryukhin S, Gurinovich S, Panarina V, Polyudina R, Salina E Frontiers in Plant Science, 2024, 15:1463121
Identification of QTLs associated with grain-filling duration and heading date in wheat A.A. Berezhnaya, A.A. Kiseleva, A.I. Stasyuk, I.N. Leonova, E.A. Salina BRAZ J BIOL, 2024, vol. 84, e279154
Biochemical, Genetic, and Grain Digital Evaluation of Soft Winter Wheat Varieties with Different Germination Index. A.V. Fedyaeva, S.D. Afonnikova, D.A. Afonnikov, O.G. Smirnova, V.N. Deeva, A.I. Pryanishnikov, E.A. Salina RUSS J PLANT PHYSL+, 2024, Volume 71, article number 56
Identification of novel loci precisely modulating pre-harvest sprouting resistance and red color components of the seed coat in T. aestivum L. Afonnikova S.D., Kiseleva A.A., Fedyaeva A.V., Komyshev E.G., Koval V.S., Afonnikov D.A., Salina E.A. Plants, 2024, т. 13, № 10, с. 1309
2023
Impact of Allelic Variation in Maturity Genes E1–E4 on Soybean Adaptation to Central and West Siberian Regions of Russia Perfil’ev R., Shcherban A., Potapov D., Maksimenko K., Kiryukhin S., Gurinovich S., Panarina V., Polyudina R., Salina E. Agriculture, 2023, vol. 13, no. 6: article 1251, https://doi.org/10.3390/agriculture13061251, IF=3.408, Received: 16 May 2023, Revised: 11 June 2023, Accepted: 13 June 2023, Published: 15 June 2023
Finding needles in a haystack: identification of inter-specific introgressions in wheat genebank collections using low-coverage sequencing data Jens Keilwagen, Heike Lehnert, Ekaterina D. Badaeva,
Hakan Özkan, Shivali Sharma, Peter Civan, Benjamin Kilian Frontiers in Plant Science, 2023, Front. Plant Sci., Volume 14, Article 1166854, Q1, RECEIVED 15 February 2023, ACCEPTED 02 May 2023, PUBLISHED 06 June 2023
ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА ПРОРАСТАНИЕ ЗЕРНА НА КОРНЮ У МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ (TRITICUM AESTIVUM L.), И МЕТОДЫ ИХ ОЦЕНКИ А.В. Федяева, Е.А. Салина, В.К. Шумный Генетика, 2023, T. 59, № 1, стр. 5-17, DOI: 10.31857/S0016675823010058
Создание скороспелых линий сои (GLYCINE MAX (L.) MERR.) в условиях Западной Сибири Потапов Д.А., Перфильев Р.Н., Максименко К.В., Щербань А.Б., Полюдина Р.И., Салина Е.А. Агронаука, 2023, Том 1. No 1. C.23–27
Effect of Expression of the NDB2 Heterologous Gene of Arabidopsis thaliana on Growth and Respiratory Activity of Nicotiana tabacum N. E. Korotaeva, A. M. Shigarova, A. I. Katyshev, I. V. Fedoseeva, A. V. Fedyaeva, D. V. Sauchyn, A. M. Shyshlova-Sokolovskaya, O. Yu. Urbanovich, G. B. Borovskii RUSS J PLANT PHYSL+, 2023, Т. 70. – №. 5. – С. 93.
2022
Dissection of Structural Reorganization of Wheat 5B Сhromosome Associated With Interspecies Кecombination Suppression Elena Salina, Alexander Muterko, Antonina Kiseleva, Zhiyong Liu, Abraham Korol Frontiers in Plant Science, 2022, Volume 13, Article 884632
Detecting major introgressions in wheat and their putative origins using coverage analysis Jens Keilwagen, Heike Lehnert, Thomas Berner, Ekaterina Badaeva, Axel Himmelbach, Andreas Börner, Benjamin Kilian SCI REP-UK, 2022, volume 12, Article number: 1908
Митохондрии и гибель клеток суспензионной культуры Saccharum officinarum L. при отрицательной температуре Любушкина И. В., Степанов А. В., Федяева А. В., Федосеева И. В., Побежимова Т. П., Грабельных О. И. Физиология растений, 2022
2021
Allelic Variation Analysis at the Vernalization Response and Photoperiod Genes in Russian Wheat Varieties Identified Two Novel Alleles of Vrn-B3 Berezhnaya A., Kiseleva A., Leonova I., Salina E. Biomolecules, 2021, 11(12), 1897; https://doi.org/10.3390/biom11121897, IF=4.879, Q2
Features of transcriptional dynamics of the duplicated
Vernalization-B1 gene in wheat (Triticum spp.) Muterko A., Salina E. Plant Breeding, 2021, 140(6), 1023–1031
Targeting the B1 Gene and Analysis of Its Polymorphism Associated with Awned/Awnless Trait in Russian Germplasm Collections of Common Wheat Shcherban A.B., Kuvaeva D.D., Mitrofanova O.P., Khverenets S.E., Pryanishnikov A.I., Salina, E.A. Plants, 2021, 10(11), 2285
Introducing Beneficial Alleles from Plant Genetic Resources into the Wheat Germplasm Sharma S., Schulthess A.W., Bassi F.M., Badaeva E.D.,
Neumann K., Graner A., Özkan H., Werner P., Knüpffer H., Kilian B. Biology, 2021, 10(10), 982. https://doi.org/10.3390/biology10100982
Разработка панели маркеров для генотипирования отечественных сортов сои по генам, контролирующим
срок вегетации и реакцию на фотопериод Перфильев Р.Н., Щербань А.Б., Салина Е.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(7):761-769
Повышенные температуры вызывают образование АФК
и нарушения дыхания в клетках
суспензионной культуры Saccharum officinarum Любушкина, И. В., Федяева, А. В., Степанов, А. В., Грабельных, О. И. Журнал Сибирского федерального университета. Биология, 2021
Характеристика суспензионных культур клеток Arabidopsis thaliana (L.) Heynh с изменённой экспрессией гена альтернативной оксидазы митохондрий АOX1a и анализ их морозоустойчивости А. В. Степанов, С. А. Кашин, Н. С. Забанова, О. А. Федотова, А. В. Федяева, И. В. Любушкина,Т. П. Побежимова, О. И. Грабельных Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология», 2021
АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ В КЛЕТКАХ СУСПЕНЗИОННОЙ КУЛЬТУРЫ ARABIDOPSIS THALIANA С ПОНИЖЕННОЙ ЭКСПРЕССИЕЙ ГЕНА NDB2 Fedoseeva I., Katyshev A., Fedyaeva A., Stepanov A., Borovskii G. Sib J Life Sci Agric, 2021
Конференции
2024
Поиск генов, ассоциированных с продолжительностью цветения и созревания сои в условиях Центральной России и Западной Сибири Перфильев Р. Н., Потапов Д. А., Максименко К. В., Кирюхин С. В., Гуринович С. О., Панарина В. И., Полюдина Р. И., Салина Е. А. IV Международная научно-практическая конференция "Геномика и современные биотехнологии в размножении, селекции и сохранении растений", GenBio2024
Использование геномного редактирования для улучшения сельскохозяйственных признаков культивируемых сортов пшеницы и ячменя Киселёва А.А., Тимонова Е.М., Бережная А.А., Короткова А.М., Коложвари А.Э., Нестеров М.А., Кочетов А.В., Салина Е.А. XXIV Всероссийская молодежная научная конференция с международным участием «Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и сельскохозяйственной микробиологии»
Genome-wide association study reveals novel loci modulating pre-harvest sprouting and grain color in red-grained winter wheat T. aestivum L. Afonnikova S., Kiseleva A., Fedyaeva A., Komyshev E., Koval V., Afonnikov D., Salina E. The 14th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2024)
Поиск локусов, ассоциированных с продолжительностью вегетационного периода сои
в условиях Центральной России и Западной Сибири Р.Н. Перфильев, Д.А. Потапов, К.В. Максименко, С.В. Кирюхин, С.О. Гуринович, В.И. Панарина,
Р.И. Полюдина, Е.А. Салина INTERNATIONAL CONGRESS “VIII Congress of the Vavilov Society of Geneticists and Breeders, Dedicated to the 300th Anniversary of Russian Science and Higher Education”
Изменение времени колошения мягкой пшеницы с помощью геномного редактирования — роль
сайтов связывания транскрипционных факторов СНЕ в промоторной области генов PPD‑1 А.А. Киселёва, Е.М. Тимонова, А.А. Бережная, А.Э. Коложвари, В.Н. Кельбин, А.В. Кочетов, Е.А. Салина INTERNATIONAL CONGRESS “VIII Congress of the Vavilov Society of Geneticists and Breeders, Dedicated to the 300th Anniversary of Russian Science and Higher Education”
Изучение коллекции растений пшеницы с мутациями в промоторной области гена PPD‑1 А.А. Бережная, А.А. Киселева, А.Э. Коложвари, Е.А. Салина INTERNATIONAL CONGRESS “VIII Congress of the Vavilov Society of Geneticists and Breeders, Dedicated to the 300th Anniversary of Russian Science and Higher Education”
FINE-TUNING WHEAT HEADING TIME THROUGH GENOME EDITING: INVESTIGATING THE IMPACT OF TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITES IN PPD-1 GENE PROMOTER REGION Kiseleva A.A., Timonova E.M., Berezhnaya A.A., Kolozhvari A.E., Kelbin V.N., Salina E.A. International Conference on Plant Biology and Biotechnology (ICPBB 2024)
Поиск локусов и генов-кандидатов, ассоциированных с окраской и предуборочным прорастанием зерна у краснозерной озимой мягкой пшеницы Афонникова С.Д., Киселёва А.А., Федяева А.В., Комышев Е.Г., Афонников Д.А., Салина Е.А. 7-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» (GPB 2024)
Редактирование генома возделываемых сортов пшеницы и ячменя с использованием направленной нуклеазы Cas9 для улучшения сельскохозяйственных признаков Киселёва А.А., Тимонова Е.М., Бережная А.А., Короткова А.М., Коложвари А.Э., Нестеров М.А.,
Кочетов А.В., Салина Е.А. 7-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» (GPB 2024)
Изучение коллекции сои (Glycine max (L.) Merr.) для селекции на урожайность и содержание белка в зерне
в условиях Западной Сибири Потапов Д.А., Перфильев Р.Н., Салина Е.А., Полюдина Р.И. 7-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» (GPB 2024)
2023
The use of a genome substituted form of Avrodes to expand the genetic diversity of common wheat Davoyan R.O., Bebykina I.V., Davoyan E.R., Zubanova Y.S., Boldakov D.M., Zinchenco A.N., Salina E.A., Badaeva E.D., Adonina I.G. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
Study of grain shape, color and pre-harvest sprouting in population of winter bread wheat cultivated in Russia Afonnikova S.D., Kiseleva A.A., Fedyaeva A.V., Afonnikov D.A., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
The study and modification of wheat heading and maturity genes using genome approaches including CRISPR/Cas9 gene editing technology Kiseleva A.A., Timonova E.M., Berezhnaya A.A., Stasyuk A.I., Kolozhvari A.E., Nesterov M.A., Kelbin V.N., Leonova I.N., Kochetov A.V., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
The study of the influence of various factors on the germination index in the collection of soft winter wheat (Triticum aestivum L.) Fedyaeva A.V., Afonnikova S.D., Afonnikov D.A., Deeva V.N., Pryanishnikov A.I., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
Influence of allelic variability of photoperiod genes on soybean maturity time in central Russia and West Siberian Pervf`lev R.N., Shcherban A.B., Potapov D.A., Maksimenko K.V., Kiryukhin S.V., Gurinovich S.O, Panarina V.I., Polyudina R.I., Salina E.A. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
ПОЛНОГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ АССОЦИАЦИЙ ПРИЗНАКОВ ПРЕДУБОРОЧНОГО ПРОРАСТАНИЯ И ЦВЕТА ЗЕРНА У ОЗИМОЙ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ Афонникова С.Д., Киселёва А.А., Федяева А.В., Афонников Д.А., Салина Е.А. Международный форум природоподобных технологий. Курчатовский геномный форум 2023. II международная молодежная конференция "Генетические и радиационные технологии в сельском хозяйстве"
Suspension cell cultures as a model for investigation of mitochondria participant in extreme temperatures plant response Lyubushkina I. V., Fedyaeva A. V., Stepanov A. V., Grabelnych O. I., Pobezhimova T. P., Zabanova N. S., Voinikov V. K. 7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)
Влияние экспрессии гетерологичного гена NDB2 Arabidopsis thaliana на рост, устойчивость к низкой температуре и дыхательную активность Nicotiana tabacum Боровский Г. Б., Коротаева Н. Е., Шигарова А. М., Катышев А. И., Федосеева И. В., Полякова Е. А., Федяева А. В., Савчин Д. В., Шишлова-Соколовская А. М., Урбанович О. Ю. VI Всероссийская научная конференция с международным участием. Устойчивость растений и микроорганизмов к неблагоприятным факторам среды.
Оценка полиморфизма коллекции озимой пшеницы по устойчивости к прорастанию зерна на корню Федяева А.В., Салина Е.А. 6-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений»
SSR генотипирование коллекции монопустульных изолятов Puccinia graminis f. sp. tritici Сколотнева Е.С., Кельбин В.Н., Лаприна Ю.В., Салина Е.А. 6-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений»
Natural variation of E1-E4, E9, GmFT5a genes in 180 soybean accessions adapted to Novosibirsk regions Perfl`ev R., Shcherban A., Potapov D., Maksimenko K., Polyudina R., Salina E. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference
A comprehensive study of genetic mechanisms of common wheat heading and maturity times Antonina Kiseleva, Alina Berezhnaya, Anatoliy Stasyuk, Ekaterina Timonova, Anastasiya Kolozhvari,
Irina Leonova, Alexey Kochetov, Elena Salina 2nd International Wheat Congress
ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МЕХАНИЗМОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В ФОРМИРОВАНИИ ПРОДОЛЖИТЕЛЬНОСТИ МЕЖФАЗНЫХ ПЕРИОДОВ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ А. А. Киселёва, А. А. Бережная, А. И. Стасюк, Е. М. Тимонова, А. Э. Коложвари, И. Н. Леонова, Е. А. Салина V Вавиловская международная конференция
2021
Microsatellite markers for regional differentiation of Puccinia graminis f. sp. tritici populations Laprina Yu.V., Kelbin V.N., Skolotneva E.S., Kolomiets T.M., Kiseleva M.I., Baranova O.A. The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)
Высокие температуры вызывают образование АФК и нарушение дыха-ния в клетках суспензи-онной культуры saccharumofficinarum И. В. Любушкина, А. В. Федяева, А. В. Степанов, О. И. Грабельных III Международный симпозиум "Молекулярные аспекты редокс-метаболизма растений". Школа молодых учёных "Роль активных форм кислорода в жизни растений"
The overexpression of the Arabidopsis NDB2 gene in tobacco plants affects the expression of genes encoding the alternative mitochondrial electron transport pathways and stress proteins Borovskii G.B., Korotaeva N.E., Katyshev A.I., Fedoseeva I.V., Fedyaeva A.V., Kondakova M.A., Rikhvanov E.G., Shyshlova-Sokolovskaya A.M., Sauchyn D.G., Urbanovich O.Yu. Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology. The 6th International Scientific Conference
The phytotoxic effect of herbicide diuron on Arabidopsis cell culture is accompanied by increasing of mitochondrial membrane potential and intensifying of ROS production A. Fedyaeva, I. Li, I. Lyubushkina, I. Fedoseeva,
A. Sidorov, E. Rikhvanov FEBS Congress
Гранты
2023
Влияние инновационных биологических средств защиты растений на устойчивость мягкой пшеницы к грибным заболеваниям Российский научный фонд, номер гранта 23-16-00119
2021
Генетический потенциал сортов мягкой пшеницы и культурной сои и его использование в селекции на адаптивность и высокое содержание белка Российский научный фонд, номер гранта 21-76-30003
Патенты
2024
Молекула РНК-проводника sgRNA для внесения мутаций в консервативный участок промоторной области гена PPD-D1 мягкой пшеницы с применением системы редактирования генома CRISPR/Cas9 Киселёва Антонина Андреевна, Тимонова Екатерина Михайловна, Коложвари Анастасия Эдуардовна, Салина Елена Артемовна Номер патента 2822358
2022
Способ получения оздоровленного посадочного
материала гладиолуса гибридного (Gladiolus hybridus
Hort.) Федяева А.В., Кондакова М.А. Номер патента 2764188