Denis Larkin Department: - Head: Mammalian genomics and evolution Pluralist: Kurchatov Genomic Center of the Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the RAS Room: Дистанционная работа Email: larkin@bionet.nsc.ru

Publications

2024	Influence of breed and environment on leukocyte telomere length in cattle N.S. Yudin, A.V. Igoshin, G.A. Romashov, A.A. Martynov, D.M. Larkin [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Scans for Signatures of Selection in Genomes of Wagyu and Buryat Cattle Breeds Reveal Candidate Genes and Genetic Variants for Adaptive Phenotypes and Production Traits Alexander V. Igoshin, Grigorii A. Romashov, Andrey A. Yurchenko, Nikolay S. Yudin, Denis M. Larkin [Animals]
	Ассоциация трех однонуклеотидных полиморфизмов в гене LPIN1 с показателями молочной продуктивности у коров ярославской породы А.В. Игошин, Т.М. Мишакова, Р.Б. Айтназаров, А.В. Ильина, Д.М. Ларкин, Н.С. Юдин [Vavilov journal of genetics and breeding]
2023	A Multibreed Genome-Wide Association Study for Cattle Leukocyte Telomere Length Alexander V. Igoshin, Nikolay S. Yudin, Grigorii A. Romashov, Denis M. Larkin [Genes]
	Compilation and functional classification of telomere length-associated genes in humans and other animal species Ignatieva E.V., Yudin N.S., Larkin D.M. [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Компиляция и функциональная классификация генов, ассоциированных с длиной теломер, у человека и других видов животных Игнатьева Е.В., Юдин Н.С., Ларкин Д.М. [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Молекулярные маркеры адаптации к холодному климату у крупного рогатого скота Н.С. Юдин, А.В. Игошин, Д.М. Ларкин [Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции]
2022	Resequencing the Yaroslavl cattle genomes reveals signatures of selection and a rare haplotype on BTA28 likely to be related to breed phenotypes Ruvinskiy D.E., Igoshin A.V., Yurchenko A.A., Ilina A.V., Larkin D.M. [ANIM GENET]
	Сравнительный анализ частот ДНК-полиморфизмов, ассоциированных с заболеваниями и хозяйственно важными признаками, в геномах российских и зарубежных пород крупного рогатого скота А.В. Игошин, Г.А. Ромашов, Е.Н. Черняева, Н.П. Елаткин, Н.C. Юдин, Д.M. Ларкин [Vavilov journal of genetics and breeding]
2021	Copy number variants in genomes of local sheep breeds from Russia A.V. Igoshin, T.E. Deniskova, A.A. Yurchenko, N.S. Yudin, A.V. Dotsev, M.I. Selionova, N.A. Zinovieva, D.M. Larkin [ANIM GENET]
	Whole-Genome Resequencing Points to Candidate DNA Loci Affecting Body Temperature under Cold Stress in Siberian Cattle Populations Alexander Igoshin, Nikolay Yudin, Ruslan Aitnazarov, Andrey A. Yurchenko, Denis M. Larkin [Life]
2020	Resequencing and signatures of selection scan in two Siberian native sheep breeds point to candidate genetic variants for adaptation and economically important traits J. Sweet‐Jones, A. A. Yurchenko, A. V. Igoshin, N. S. Yudin, M. T. Swain, D. M. Larkin [ANIM GENET]
2019	A Near Chromosome Assembly of the Dromedary Camel Genome. Ruvinskiy D, Larkin DM, Farré M. [Frontiers in Genetics]
	An integrated chromosome-scale genome assembly of the Masai giraffe (Giraffa camelopardalis tippelskirchi). Farré M, Li Q, Darolti I, Zhou Y, Damas J, Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Chemnick LG, Kim J, Ryder OA, Ma J, Graphodatsky AS, Zhang G, Larkin DM, Lewin HA. [GigaScience]
	Comparative Chromosome Mapping of Musk Ox and the X Chromosome among Some Bovidae Species Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Yudkin DV, Lemskaya NA, Okhlopkov IM, Kirillin EV, Farré M, Larkin DM, Roelke-Parker ME, O'Brien SJ, Bush M, Graphodatsky AS. [Genes]
	Evolution of gene regulation in ruminants differs between evolutionary breakpoint regions and homologous synteny blocks Farré M, Kim J, Proskuryakova AA, Zhang Y, Kulemzina AI, Li Q, Zhou Y, Xiong Y, Johnson JL, Perelman PL, Johnson WE, Warren WC, Kukekova AV, Zhang G, O'Brien SJ, Ryder OA, Graphodatsky AS, Ma J, Lewin HA, Larkin DM. [GENOME RES]
	Genome-wide association study and scan for signatures of selection point to candidate genes for body temperature maintenance under the cold stress in Siberian cattle populations Alexander V. Igoshin, Andrey A. Yurchenko, Nadezhda M. Belonogova, Dmitry V. Petrovsky, Ruslan B. Aitnazarov, Vladimir A. Soloshenko, Nikolay S. Yudin, Denis M. Larkin [BMC GENET]
	Genome‐wide association study for body weight in cattle populations from Siberia A. V. Igoshin, N. S. Yudin, N. M. Belonogova, D. M. Larkin [ANIM GENET]
	Germline-restricted chromosome (GRC) is widespread among songbirds Torgasheva AA, Malinovskaya LP, Zadesenets KS, Karamysheva TV, Kizilova EA, Akberdina EA, Pristyazhnyuk IE, Shnaider EP, Volodkina VA, Saifitdinova AF,Galkina SA, Larkin DM, Rubtsov NB, Borodin PM. 2019, 116: 11845-11850. [P NATL ACAD SCI USA]
	High-density genotyping reveals signatures of selection related to acclimation and economically important traits in 15 local sheep breeds from Russia Yurchenko A.A., Deniskova T.E., Yudin N.S., Dotsev A.V., Khamiruev T.N., Selionova M.I., Egorov S.V., Reyer H., Wimmers K., Brem G., Zinovieva N.A., Larkin D.M. [BMC GENOMICS]
	Patterns of microchromosome organization remain highly conserved throughout avian evolution. O'Connor RE, Kiazim L, Skinner B, Fonseka G, Joseph S, Jennings R, Larkin DM, Griffin DK. [CHROMOSOMA]
	История «певчей» хромосомы Бородин, П. М. Торгашева, А. А. Малиновская, Л. П. Рубцов, Н. Б. Галкина, С. А. Ларкин, Д. М [Наука из первых рук]
	Общие признаки селекции и гены, связанные с адаптацией и акклиматизацией, в геномах российских пород крупного рогатого скота и овец Юдин Н.С., Ларкин Д.М. [RUSS J GENET+]
	Происхождение, селекция и адаптация российских пород крупного рогатого скота по данным полногеномных исследований. Юдин Н.С., Ларкин Д.М. [Vavilov journal of genetics and breeding]
2018	Genome-wide genotyping uncovers genetic profiles and history of the Russian cattle breeds. Yurchenko A., Yudin N., Aitnazarov R., Plyusnina A., Brukhin V., Soloshenko V., Lhasaranov B., Popov R., Paronyan I.A., Plemyashov K.V., Larkin D.M. [HEREDITY]
	Scans for signatures of selection in Russian cattle breed genomes reveal new candidate genes for environmental acclimation and adaptation Yurchenko A., Daetwyler H.D., Yudin N., Schnabel R.D., Vander Jagt C.D., Soloshenko V., Lhasaranov B., Popov R., Taylor J.F., Larkin D.M. [SCI REP-UK]
	Выявление генов, вовлеченных в контроль белой окраски головы, с использованием полногеномного анализа ассоциаций Юдин Н.С., Белоногова Н.М., Ларкин Д.М. [Vavilov journal of genetics and breeding]
2017	A compendium and functional characterization of mammalian genes involved in adaptation to Arctic or Antarctic environments Yudin N.S., Larkin D.M., Ignatieva E.V. [BMC GENET]
2016	ЗНАЧИМОСТЬ ГЕНОМНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ В ИСТОРИИ ФОРМИРОВАНИЯ ДОМАШНИХ ЖИВОТНЫХ Ларкин Д.М., Юдин Н.С. [Молекулярная генетика, микробиология и вирусология]
2008	Судьба родительских митохондрий в эмбриональных стволовых гибридных клетках А. Г. Мензоров, Н. М. Матвеева, Д. М. Ларкин, Д. В. Зайкин, О. Л. Серов [Cell and Tissue Biology]
2006	Comparative mapping of cattle chromosome 19: cytogenetic localization of 19 BAC clones Larkin D.M., Astakhova N.M., Prokhorovich M.A., Lewin H.A., Zhdanova N.S. [CYTOGENET GENOME RES]
	Comparative mapping of mink chromosome 8p: in situ hybridization of seven cattle BAC clones Larkin D.M., Prokhorovich M.A., Astakhova N.M., Zhdanova N.S [ANIM GENET]