 |
Publications
| 2024 |
Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks.
Artemenko N.V., Genaev M.A., Epifanov R.UI., Komyshev E.G., Kruchinina Y.V., Koval V.S., Goncharov N.P. and Afonnikov D.A.
[Frontiers in Plant Science]
|
|
Конвейер обработки гиперспектральных изображений на примере исследования зерен ячменя, содержащих меланин.
Бусов И.Д., Генаев М.А., Комышев Е.Г., Коваль В.С., Зыкова Т.E., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Новый ген опушения листа Hl1th, интрогрессированный в мягкую пшеницу от Thinopyrum ponticum, и его фенотипическое проявление при гомеологичных хромосомных замещениях
Симонов А.В., Гордеева Е.И., Генаев М.А., Ли Вэньцзянь, Булатов И.О., Пшеничникова Т.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2023 |
Determination of the melanin and anthocyanin content in barley grains by digital image analysis using machine learning methods
E.G. Komyshev, M.A. Genaev, I.D. Busov, M.V. Kozhekin, N.V. Artemenko, A.Y. Glagoleva, V.S. Koval, D.A. Afonnikov
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato
Cultivars Grown in Russia
Dmitry I. Karetnikov, Gennady V. Vasiliev, Stepan V. Toshchakov, Nikolay A. Shmakov, Mikhail A. Genaev, Mikhail A. Nesterov, Salmaz M. Ibragimova, Daniil A. Rybakov,
Tatjana A. Gavrilenko, Elena A. Salina, Maxim V. Patrushev, Alex V. Kochetov and Dmitry A. Afonnikov
[INT J MOL SCI]
|
|
WAX INDUCER 1 Regulates β-Diketone Biosynthesis by Mediating Expression of the Cer-cqu Gene Cluster in Barley
Gerasimova, S.V.; Kolosovskaya, E.V.; Vikhorev, A.V.; Korotkova, A.M.; Hertig, C.W.; Genaev, M.A.; Domrachev, D.V.; Morozov, S.V.; Chernyak, E.I.; Shmakov, N.A.; Vasiliev, G.V.; Kochetov, A.V.; Kumlehn, J.; Khlestkina, E.K.
[INT J MOL SCI]
|
| 2022 |
Wheat yield estimation based on analysis of UAV
images at low altitude
Mikhail Kozhekin, Mikhail Genaev, Vasily Koval, Andrey Slobodchikov, Dmitry Afonnikov
[BIO Web of Conferences]
|
|
Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using
Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network
Mikhail A. Genaev, Evgenii G. Komyshev, Olga D. Shishkina, Natalya V. Adonyeva, Evgenia K. Karpova, Nataly E. Gruntenko, Lyudmila P. Zakharenko, Vasily S. Koval and Dmitry A. Afonnikov
[Mathematics]
|
|
QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color
Characteristics Estimated by Digital Image Processing
Mian Abdur Rehman Arif, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Vasily S. Koval, Nikolay
A. Shmakov, Andreas Börner and Dmitry A. Afonnikov
[Plants]
|
|
Relationship between the characteristics of bread wheat grains, storage time and germination
Dmitry A. Afonnikov. Evgenii G. Komyshev, Vadim M. Efimov, Mikhail A. Genaev, Vasily S. Koval, Peter U. Gierke and Andreas Börner
[Plants]
|
|
Variability of leaf pubescence characteristics in transgenic tobacco lines with partial proline dehydrogenase gene suppression.
S.M. Ibragimova, M.A. Genaev, A.V. Kochetov, D.A. Afonnikov
[BIOL PLANTARUM]
|
| 2021 |
Automatic morphology phenotyping of tetra- and hexaploid wheat spike using computer vision methods
A.Yu. Pronozin, A.A. Paulish, E.A. Zavarzin, A.Yu. Prikhodko, N.M. Prokhoshin, Yu.V. Kruchinina,
N.P. Goncharov, E.G. Komyshev, M.A. Genaev
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Image-Based Wheat Fungi Diseases Identification by Deep Learning
Genaev M .A., Skolotneva E.S., Gultyaeva E.I., Orlova E.A., Bechtold N.P., Afonnikov D.A.
[Plants]
|
|
The identification of a new gene for leaf pubescence introgressed into bread wheat from Triticum timopheevii Zhuk. and its manifestation in a different genotypic background
Симонов Александр Владимирович
Смирнова Ольга Григорьевна
Генаев Михаил Александрович
Пшеничникова Татьяна Алексеевна
[Plant Genetic Resources]
|
|
Автоматическое фенотипирование морфологии колоса
тетра- и гексаплоидных видов пшеницы методами компьютерного зрения
А.Ю. Пронозин, А.А. Паулиш, Е.А. Заварзин, А.Ю. Приходько, Н.М. Прохошин, Ю.В. Кручинина,
Н.П. Гончаров, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2020 |
Технология структурирования и обработки транскриптомных данных на основе гибридного использования RDBMS и NoSQL подходов
Мухин А.М., Генаев М.А., Рассказов Д.А., Лашин С.А., Афонников Д.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Quantifying Drosophila adults with the use of a smartphone
Evgenia K. Karpova, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Natalya V. Adonyeva, Dmitry A. Afonnikov, Margarita A. Eremina, Nataly E. Gruntenko
[Biology Open]
|
|
Анализ цветовых и текстурных характеристик зерен злаков на цифровых изображениях
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Использование гиперспектральной камеры Specim IQ
для анализа растений
В.В. Альт, Т.А. Гурова, О.В. Елкин, Д.Н. Клименко, Л.В. Максимов, И.А. Пестунов, О.А. Дубровская,
М.А. Генаев, Т.В. Эрст, К.А. Генаев, Е.Г. Комышев, В.К. Хлесткин, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2019 |
Morphometry of the Wheat Spike by Analyzing 2D Images
Mikhail A. Genaev, Evgenii G. Komyshev, Nikolai V. Smirnov, Yuliya V. Kruchinina,
Nikolay P. Goncharov and Dmitry A. Afonnikov
[Agronomy]
|
|
New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes
Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov, Egor B. Prokhortchouk, Mariya Y. Pakharukova, Konstantin V. Gunbin, Kirill Ustyantsev, Mikhail A. Genaev, Alexander G. Blinov, Alexander Mazur, Eugenia Boulygina, Svetlana Tsygankova, Ekaterina Khrameeva, Nikolay Chekanov, Guangyi Fan, An Xiao, He Zhang, Xun Xu, Huanming Yang, Victor Solovyev, Simon Ming-Yuen Lee, Xin Liu, Dmitry A. Afonnikov, Konstantin G. Skryabin
[BMC GENOMICS]
|
|
Оценка количественных характеристик клубнеобразования
дикого картофеля на основе анализа изображений клубней
с использованием компьютерного приложения SeedСounter
К.А. Иванова, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, А.А. Егорова, К.А. Колошина, Н.А. Чала,
Д.А. Афонников, А.В. Кочетов, Е.В. Рогозина, С.В. Герасимова
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2018 |
Novel read density distribution score shows possible aligner artefacts, when mapping a single chromosome
Fedor M. Naumenko, Irina I. Abnizova, Nathan Beka, Mikhail A. Genaev, Yuriy L. Orlov
[BMC GENOMICS]
|
|
SpikeDroidDB – информационная система
для аннотации морфометрических характеристик
колоса пшеницы
М.А. Генаев, Е.Г. Комышев, Фу Хао, В.С. Коваль, Н.П. Гончаров, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Информационная Система По Биоресурсным Коллекциям Институтов ФАНО России
Лашин С.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Казанцев Ф.В., Комышев Е.Г., Ощепкова Е.А., Петров А.В., Рассказов Д.А., Смирнова А.А., Колчанов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
Evaluation of the SeedCounter, a Mobile Application for Grain Phenotyping
Komyshev E., Genaev M., Afonnikov D.
[Frontiers in Plant Science]
|
| 2016 |
Methods of high-throughput plant phenotyping for large-scale breeding and genetic experiments
D. A. Afonnikov, M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. G. Komyshev, T. A. Pshenichnikova
[RUSS J GENET+]
|
|
Протокол анализа количественных характеристик опушения листа картофеля
А.В. Дорошков, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2015 |
Computer high-throughput approaches to wheat phenotyping: application to leaf pubescence analysis
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A. Simonov A.V.
[The 3rd Intern. Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”, Abstract book]
|
| 2013 |
BioUniWA – СИСТЕМА ГЕНЕРАЦИИ WEB-СЕРВИСОВ И КОНВЕЙЕРОВ ДЛЯ УНИФИЦИРОВАННОГО ДОСТУПА К РЕСУРСАМ В ОБЛАСТИ БИОИНФОРМАТИКИ
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
The antioxidant enzymes activity in leaves of inter-varietal substituion lines of wheat (Triticum aestivum L.) with different tolerance to soil water deficit
S.V. Osipova, A.V. Permyakov, M.D. Permyakova, M.A. Genaev, A. Börner
[Acta Physiologia Plantarum]
|
|
Компьютерный анализ данных экспрессии генов в клетках мозга, полученных с помощью микрочипов и высокопроизводительного секвенирования
Медведева И.В., Вишневский О.В., Сафронова Н.С., Кожевникова О.С., Генаев М.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Орлов Ю.Л.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2012 |
BioInfoWF – система автоматической генерации веб-интерфейсов и веб-сервисов для биоинформационных исследований
М.А. Генаев, Е.Г. Комышев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes (SAMEM): Analysis of molecular evolution modes at deep inner branches of the phylogenetic tree
Gunbin KV, Suslov VV, Genaev MA, Afonnikov DA.
[In Silico Biology]
|
|
Computer approaches to wheat high-throughput phenotyping
Afonnikov D., Genaev M., Doroshkov A., Denisyuk V., Morozova E., Simonov A., Pshenichnikova T.
[Journal of Stress Physiology & Biochemistry]
|
|
Extraction of quantitative characteristics describing wheat leaf pubescence with a novel image processing technique
Mikhail A. Genaev, Alexey V. Doroshkov, Tatyana A. Pshenichnikova, Nikolay A. Kolchanov, Dmitry A. Afonnikov
[PLANTA]
|
|
RatDNA: база данных микрочиповых исследований на крысах для генов, ассоциированных с заболеваниями старения
О.С. Кожевникова, М.К. Мартыщенко, М.А. Генаев, Е.E. Корболина, Н.А. Муралева, Н.Г. Колосова, Ю.Л. Орлов
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
WheatPGE: A system for analysis of relationships among the phenotype, genotype, and environment in wheat
M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. V. Morozova, T. A. Pshenichnikova and D. A. Afonnikov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Информационная поддержка селекционно-генетического эксперимента у пшеницы в системе WheatPGE
Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Морозова Е.В., Симонов А.В., Афонников Д.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Информационный портал "Биотехнология растений" - Интернет ресурс для поддержки экспериментов в области генной инженерии растений, генетики и селекции пшеницы.
Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2011 |
КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА WheatPGE ДЛЯ АНАЛИЗА ВЗАИМОСВЯЗИ ФЕНОТИП-ГЕНОТИП-ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА У ПШЕНИЦЫ
М.А. Генаев, A.В. Дорошков, Е.В. Морозова, Т.А. Пшеничникова, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков: анализ эволюции циклинов B
Гунбин К.В., Генаев М.А., Турнаев И.И., Афонников Д.А.
[Вестник ТГУ]
|
| 2010 |
A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits
Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Moscow University Biological Sciences Bulletin]
|
|
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков
Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А.
[Труды ТГУ. Серия: Биологическая]
|
|
Компьютерная система филогенетического анализа генных сетей: изучение эволюции генной сети клеточного цикла животных
Тимонов В.С., Турнаев И.И., Генаев М.А., Гунбин К.В.
[Труды ТГУ. Серия: Биологическая]
|
|
|
