 |
|
|
Миронова Виктория Владимировна, к. б. н.
В данный момент не является сотрудником института
|
Персональная информацияРабочий адрес
Г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия
Дата рождения
03.05.1983
Образование
НГУ – 2005 – специалист (биология, информационная биология)
ИЦиГ – 2010 – кандидат биологических наук (математическая биология, биоинформатика)
Область научных интересов
Биология развития растений, фитогормоны, математическое моделирование.
Публикации
| 2023 |
DyCeModel: a tool for 1D simulation
for distribution of plant hormones controlling tissue patterning
Азарова Дарья Сергеевна,
Омельянчук Надежда Анатольевна,
Миронова Виктория Владимировна,
Землянская Елена Васильевна,
Лавреха Виктория Вадимовна
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2022 |
CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana
Lavrekha VV, Levitsky VG, Tsukanov AV, Bogomolov AG, Grigorovich DA, Omelyanchuk N, Ubogoeva EV, Zemlyanskaya EV, Mironova V
[Frontiers in Plant Science]
|
|
Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis
Tsukanov, A. V., Mironova V. V., Levitsky V. G.
[Frontiers in Plant Science]
|
| 2021 |
Mechanisms of stress response in the root stem cell niche
Elena V Ubogoeva, Elena V Zemlyanskaya, Jian Xu, Victoria Mironova
[J EXP BOT]
|
|
Meet your MAKR: the membrane-associated kinase regulator protein family in the regulation of plant development
D.D. Novikova, A.L. Korosteleva,V. Mironova,Y. Jaillais
[FEBS J]
|
|
Tissue-specific transcriptome profiling of the Arabidopsis inflorescence stem reveals local cellular signatures
Dongbo Shi, Virginie Jouannet, Javier Agustí, Verena Kaul, Victor Levitsky, Pablo Sanchez, Victoria V Mironova, Thomas Greb
[PLANT CELL]
|
|
Transcriptional regulation in plants: Using omics data to crack the cis-regulatory code
Elena V. Zemlyanskaya, Vladislav A. Dolgikh, Victor G. Levitsky, Victoria Mironova
[CURR OPIN PLANT BIOL]
|
| 2020 |
3D analysis of mitosis distribution pattern in the plant root tip with iRoCS Toolbox
Lavrekha V.V., Pasternak T., Palme K., Mironova V.V.
[Plant Stem Cells - Methods and Protocols. Ed: Naseem N. and Dandekar T.]
|
|
Architecture of DNA elements mediating ARF transcription factor binding and auxin-responsive gene expression in Arabidopsis
Alejandra Freire-Rios, Keita Tanaka, Isidro Crespo, Elmar van der Wijk, Yana Sizentsova, Victor Levitsky, Simon Lindhoud, Mattia Fontana, Johannes Hohlbein, D. Roeland Boer, Victoria Mironova, and Dolf Weijers
[P NATL ACAD SCI USA]
|
|
Cell Dynamics in WOX5-Overexpressing Root Tips: The Impact of Local Auxin Biosynthesis
Maria S. Savina,
Taras Pasternak,
Nadya A. Omelyanchuk,
Daria D. Novikova,
Klaus Palme,
Victoria V. Mironova,
Viktoriya V. Lavrekha
[Frontiers in Plant Science]
|
|
Fold-Change-Specific Enrichment Analysis (FSEA): Quantification of Transcriptional Response Magnitude
for Functional Gene Groups
Wiebe D.S., Omelyanchuk N.A., Mukhin A.M., Grosse I., Lashin S.A., Zemlyanskaya E.V., Mironova V.V.
[Genes]
|
|
Meta-Analysis of Transcriptome Data Detected New Potential Players in Response to Dioxin Exposure in Humans
Evgeniya Oshchepkova, Yana Sizentsova, Daniil Wiebe, Victoria Mironova and Nikolay Kolchanov
[INT J MOL SCI]
|
|
PlantLayout – программное средство для моделирования распределения веществ в тканях различной структуры
Савина М.С., Миронова В.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Rocks in the auxin stream:
Wound induced auxin accumulation and ERF115 expression synergistically drive
stem cell regeneration
Canher B., Heyman J., Savina M., Devendran A., Eekhout T., Vercauteren I., Prinsen
E., Matosevich R., Xu J., Mironova V., De Veylder L.
[P NATL ACAD SCI USA]
|
|
Specification and regulation of vascular tissue identity in the Arabidopsis embryo
Margot E. Smit, Cristina I. Llavata-Peris, Mark Roosjen, Henriette van Beijnum, Daria Novikova, Victor Levitsky, Iris Sevilem, Pawel Roszak, Daniel Slane, Gerd Jürgens, Victoria Mironova, Siobhan M. Brady, Dolf Weijers
[DEVELOPMENT]
|
|
metaRE R Package for Meta-Analysis of Transcriptome Data to Identify the
cis-Regulatory Code behind the Transcriptional Reprogramming
Novikova D.D., Cherenkov P.A., Sizentsova Y.G., Mironova V.V.
[Genes]
|
|
Памяти Виталия Александровича Лихошвая: уроки, беседы
и воспоминания
М.С. Савина , Ф.В. Казанцев , К.Д. Безматерных, Д.Н. Штокало, В.В. Миронова, И.Р. Акбердин
[Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции]
|
| 2019 |
A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive
analysis of motifs co-occurrence with MCOT package
Levitsky V., Zemlyanskaya E., Oshchepkov D., Podkolodnaya O., Ignatieva E.,
Grosse I., Mironova V., Merkulova T.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
|
A single-cell view of tissue regeneration in plants
Mironova V. and Xu J.
[CURR OPIN PLANT BIOL]
|
|
Capturing auxin response factors syntax using DNA binding models
Stigliani A, Martin-Arevalillo R, Lucas J, Bessy A, Vinos-Poyo T, Mironova V, Vernoux T, Dumas R, Parcy F
[MOL PLANT]
|
|
Salicylic acid affects root meristem patterning via auxin distribution in a concentration-dependent manner
Taras Pasternak, Edwin P Groot, Fedor Kazantsev, William Teale, Nadya Omelyanchuk, Vasilina Kovrizhnykh, Klaus Palme, Victoria V Mironova
[PLANT PHYSIOL]
|
| 2018 |
Deciphering Auxin-Ethylene Crosstalk at a Systems Level
Elena V. Zemlyanskaya, Nadya A. Omelyanchuk, Elena V. Ubogoeva, Victoria V. Mironova
[INT J MOL SCI]
|
|
Diversity of cis-regulatory elements associated with auxin response in Arabidopsis thaliana
Pavel Cherenkov, Daria Novikova, Nadya Omelyanchuk, Victor Levitsky, Ivo Grosse, Dolf Weijers, Victoria Mironova
[J EXP BOT]
|
| 2017 |
3D analysis of mitosis distribution highlights the longitudinal zonation and diarch symmetry in proliferation activity of the Arabidopsis thaliana root meristem
Lavrekha V.V., Pasternak T., Ivanov V.B., Palme K., Mironova V.V.
[PLANT J]
|
|
A sacrifice-for-survival mechanism protects Root Stem Cell Niche from Chilling Stress
Jing Han Hong, Maria Savina, Jing Du, Ajay Devendran, Karthikbabu Kannivadi Ramakanth, Xin Tian, Wei Shi Sim, Victoria V. Mironova, and Jian Xu
[CELL]
|
|
Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots
N. A. Omelyanchuk, D. S. Wiebe, D. D. Novikova, V. G. Levitsky, N. Klimova, V. Gorelova, C. Weinholdt, G. V. Vasiliev, E. V. Zemlyanskaya, N. A. Kolchanov, A. V. Kochetov, I. Grosse, V. V. Mironova
[SCI REP-UK]
|
|
The Interplay of Chromatin Landscape and DNA-Binding Context Suggests Distinct Modes of EIN3 Regulation in Arabidopsis thaliana
Zemlyanskaya EV, Levitsky VG, Oshchepkov DY, Grosse I, Mironova VV
[Frontiers in Plant Science]
|
|
The systems biology of auxin in developing embryos.
V. Mironova, W. Teale, M. Shahriari, J. Dawson, K. Palme.
[TRENDS PLANT SCI]
|
| 2016 |
A detailed expression map of the PIN1 auxin transporter in Arabidopsis thaliana root
N.A. Omelyanchuk, V.V. Kovrizhnykh, E.A. Oshchepkova, T. Pasternak, K. Palme, V.V. Mironova.
[BMC PLANT BIOL]
|
|
Meta-analysis of transcriptome data identified TGTCNN motif variants associated with the response to plant hormone auxin in Arabidopsis thaliana L.
Zemlyanskaya EV, Wiebe DS, Omelyanchuk NA, Levitsky VG, Mironova VV.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Механизмы регуляции передачи этиленового сигнала у растений
Землянская Е.В., Омельянчук Н.А., Ермаков А.А., Миронова В.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2015 |
On the distribution of auxin concentrations in root horizontal layer cells.
Novoselova E.S., Mironova V.V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
| 2014 |
Computational analysis of auxin responsive elements in the Arabidopsis thaliana L. genome
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Wiebe DS, Levitsky VG
[BMC GENOMICS]
|
|
КЛЮЧЕВАЯ РОЛЬ PIN-БЕЛКОВ В ТРАНСПОРТЕ АУКСИНА В КОРНЕ ARABIDOPSIS THALIANA L.
В.В. Коврижных, Н.А. Омельянчук, Т.П. Пастернак, В.В. Миронова
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Математическая модель регуляции фитогормонами формирования меристематической зоны корня
Лавреха В.В., Омельянчук Н.А., Миронова В.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
О распределениях концентраций ауксина в клетках горизонтального слоя корня
Новоселова Е.С., Миронова В.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Системная биология
Д.А. Афонников, В.В. Миронова
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2013 |
Deformable Cell Model and its Application to Growth of Plant Meristem
N. Bessonov, V. Mironova, V. Volpert
[MATH MODEL NAT PHENO]
|
|
How multiple auxin responsive elements may interact in plant promoters: a reverse problem solution
Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Savina M.S., Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
MATHEMATICAL MODELING OF AUXIN TRANSPORT IN PROTOXYLEM AND PROTOPHLOEM OF ARABIDOPSIS THALIANA ROOT TIPS
Novoselova ES, Mironova VV, Omelyanchuk NA, Kazantsev FV, Likhoshvai VA
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Исследование математической модели перераспределения вещества в кольцевом ансамбле клеток
С. И. Фадеев, В. В. Когай, В. В. Миронова, Н. А. Омельянчук, В. А. Лихошвай
[Сибирский журнал вычислительной математики]
|
| 2012 |
Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA.
[ANN BOT-LONDON]
|
| 2011 |
From published expression and phenotype data to structured knowledge: The Arabidopsis gene net supplementary database and its applications
Denis Ponomaryov, Nadezhda Omelianchuk, Victoria Mironova, Evgeny Zalevsky, Nikolay Podkolodny, Eric Mjolsness, and Nikolay Kolchanov
[Lecture Notes in Artificial Intelligence]
|
| 2010 |
A plausible mechanism for auxin patterning along the developing root
Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Yosiphon G, Fadeev S.I., Kolchanov N.A., Mjolsness E., Likhoshvai V.A.
[BMC SYST BIOL]
|
|
Математическое моделирование распределения ауксина в проводящих тканях Arabidopsis thaliana
2. E.C. Новоселова, В.В. Миронова
[Труды ТГУ. Серия: Биологическая]
|
|
Эффективность связывания TBP c промотором ARF-генов растений коррелирует с характером влияния ARF белков на транскрипцию (активатор/репрессор)
В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, П.М. Пономаренко, М.П. Пономаренко, Н.А. Колчанов
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
| 2009 |
Генетика развития растений: интеграция информации из различных наблюдений и экспериментов в базах данных
Омельячук НА., Миронова ВВ., Колчанов НА
[RUSS J GENET+]
|
|
Моделирование регуляции ауксином инициации латеральных органов у Arabidopsis thaliana
В.А. Лихошвай, Н.А. Омельянчук, В.В. Миронова, Ф.В. Казанцев, И.Р. Акбердин, В.К. Королев, С.И. Фадеев, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2008 |
Математическое моделирование морфогенеза растений
Г.Г. Лазарева, В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, И.В. Шваб, В.А. Вшивков, Д.Н. Горпинченко, С.В. Николаев, Н.А.Колчанов.
[Журнал вычислительной математики и математической физики]
|
| 2007 |
А cellular automaton to model the development of primary shoot meristems of Arabidopsis Thaliana
Ilya Akberdin, Evgeniy Ozonov, Victoria Mironova, Nadezda Omelyanchuk, Vitaly Likhoshvai, Dmytry Gorpinchenko, Nikolay Kolchanov
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Математическая модель паттерна распределения ауксина в корне растения
Лихошвай В. А., Омельянчук Н. А., Миронова В. В., Фадеев С. И., Мелснесс Э. М., Колчанов Н. А.
[RUSS J DEV BIOL+]
|
| 2006 |
A model of Arabidopsis thaliana morphogenesis in cellular automaton terms
I. R. Akberdin, E. A. Ozonov, V.V. Mironova, D. N. Gorpinchenko,N. A. Omelyanchuk, V. A. Likhoshvai, N. A. Kolchanov
[BIOPHYSICS]
|
|
Моделирование морфогенеза Arabidopsis thaliana в терминах клеточного автомата
Акбердин И. Р., Озонов Е. А., Миронова В. В., Горпинченко Д.Н., Омельянчук Н. А., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: I. База данных AGNS
Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Шамов И.С.,Поплавский А.С., Подколодный Н.Л., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Мелснесс Э.Д., Мейеровитц Е.M., Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
|
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: II. Моделирование регуляции структуры апикальной меристемы побега
Николаев С.В., Фадеев С.И., Пененко A.В., Лавреха В.В., Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Мелснесс Э.Д., Колчанов Н.А.
[BIOPHYSICS]
|
Монографии
| 2017 |
Hogness Box
Ponomarenko M., Mironova V., Gunbin K., Ponomarenko P., Suslov V., Savinkova L.
|
| 2015 |
RNA-seq data analysis for studying abiotic stress in horticultural plants. Chapter 14.
Mironova V.V., Weinholdt C., Grosse I.
|
| 2013 |
Hogness Box.
Ponomarenko M, Mironova V, Gunbin K, Savinkova L
|
| 2008 |
Глава 6. Компьютерная биология развития. Раздел 6.3. Морфогенез растений: реконструкция в базах данных и моделирование.
Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Подколодный Н.А., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Пененко А.В., Лавреха В.В., Зубаирова У.С., Колчанов Н.А.
|
Конференции
| 2022 |
CisCross web service: a gene set enrichment analysis to predict the upstream regulators for Arabidopsis thaliana
Lavrekha V.V., Tsukanov A.V., Bogomolov A.G. , Omelyanchuk N., Zemlyanskaya E.V., Levitsky V.G., Mironova V.V.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
| 2021 |
WOX5 поддерживает баланс в распределении ауксина между проксимальной и дистальной меристемами корня у Arabidopsis thaliana L.
Савина М.С.
Омельянчук Н.А.
Пастернак Т.П.
Миронова В.В.
Лавреха В.В.
[Всероссийская научная конференция с международным участием "Экспериментальная биология растений и биотехнология: история и взгляд в будущее]
|
| 2020 |
FoldGO - программный комплекс для выявления фолд-специфичных ГО категорий в данных транскриптомных экспериментов
Вибе Д.С., Мухин А.М., Омельянчук Н.А., Миронова В.В.
[Симпозиум Биофизика сложных систем. Вычислительная и системная биология. Молекулярное моделирование”]
|
|
Diversity of cis-elements in response to dioxin in human
Oshcepkova Evgenia, Sizentsova Yana, Mironova Victoriya
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology - BGRS/SB-2020]
|
|
Keeping the gate closed: WOX5 supports the balance between the proximal and distal root meristems via auxin biosynthesis in Arabidopsis thaliana L.
Savina M.S., Pasternak T., Omelyanchuk N., Mironova V.V., Lavrekha V.V.
[BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Meta-analysis of transcriptome data clarified hormonal regulation of cold stress response in Arabidopsis thaliana L
Omelyanchuk Nadezda, Sizentsova Yana, Mironova Victoria
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology - BGRS/SB-2020]
|
| 2019 |
Search for cis-elements associated with response to dioxin in human
Evgeniya Oshchepkova, Yana Sizentsova, Daniil Wiebe, Viktoria Mironova.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB)]
|
|
Diversity of AuxREs
Novikova DD, Weijers D, Mironova VV
[Experimental Plant Sciences Meeting]
|
|
Diversity of AuxREs in Arabidopsis thaliana L.
Novikova DD, Weijers D, Mironova VV
[The International Plant Growth Substances Association (IPGSA) Conference]
|
|
FoldGO - новый метод анализа функционального обогащения с учетом степени изменения транскрипционной активности.
Вибе Д.С., Омельянчук Н.А., Мухин А.М., Лашин С.А., Миронова В.В.
[7ой съезд ВОГиС]
|
|
FoldGO: a web server to identify functional gene groups responding to a factor within specific ranges of fold changes
Nadya Omelyanchuk, Daniil Wiebe, Victoria Mironova
[30th International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2019)]
|
|
Mitosis and DNA replication events define the boundaries of transition zone in Arabidopsis thaliana root tip
Viktoriya V. Lavrekha, Taras P. Pasternak, Uliyana S. Zubairova, Victoria V. Mironova
[International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2019),]
|
|
Systems analysis of chilling stress induced transcriptomes in Arabidopsis thaliana
Sizentsova Y.G., Omelyanchuk N.A., Mironova V.V
[Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
|
|
Systems biology study on the WOX5 role in the distal part of the root meristem in Arabidopsis thaliana
Savina M.S., Lavrekha V.V., Pasternak T., Mironova V.V.
[Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
|
|
The comprehensive analysis of motifs co-occurrence in ChIP-seq data with MCOT package
Левицкий Виктор Георгиевич
Миронова Виктория Владимировна
Землянская Елена Васильевна
Ощепков Дмитрий Юрьевич
Меркулова Татьяна Ивановна
[9-ая Московская конференция по вычислительной молекулярной биологии МССМВ'19]
|
|
The comprehensive analysis of motifs co-occurrence in ChIP-seq data with MCOT package
Левицкий Виктор Георгиевич
Ощепков Дмитрий Юрьевич
Землянская Елена Васильевна
Миронова Виктория Владимировна
Меркулова Татьяна Ивановна
[VII International Congress of Vavilov society of geneticists and breeders and associate symposiums]
|
|
What can we learn about stress-induced root growth by mathematical modeling of auxin distribution?
Savina M.S., Kazantsev F.V., MironovaV.V.
[Plant Organ Growth Symposium 2019]
|
|
Моделирование распределения ауксина при регенерации меристемы корня Arabidopsis thaliana
Савина М.С., Миронова В.В.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров]
|
| 2018 |
3D map of proliferation activity in Arabidopsis thaliana root tips: longitudinal zonation and symmetries in the wild type and mutants
Lavrekha V.V., Pasternak T., Mironova V.V.
[29 International Conference on Arabidopsis research (ICAR’2018)]
|
|
Developing FoldGO, the tools for multifactorial functional enrichment analysis
A.M. Mukhin, D.S. Wiebe, I. Grosse, S.A. Lashin, V.V. Mironova
[Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology (MM-HPC-BBB-2018)]
|
|
Dissecting the mechanisms of EIN3-dependent regulation of ethylene response in Arabidopsis thaliana
E.V. Zemlyanskaya, D.Y. Oshchepkov, V.V. Mironova, V.G. Levitsky
[The 11th International Conference “On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB'2018)]
|
|
Early and late transcriptional responses to the low concentration of salicylic acid
in Arabidopsis thaliana L. root
E. Elgaeva, E. Zemlyanskaya, D. Novikova, V. Mironova
[Systems Biology And Bioinformatics (SBB-2018) | The Tenth International Young Scientists School]
|
|
FoldGO - the new method for functional enrichment analysis of transcriptome data to identify fold-change-specific GO terms
Wiebe D.S., Mironova V.V.
[17TH EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY (ECCB 2018)]
|
|
FoldGO for functional annotation of transcriptome data to identify fold-change-specific GO categories
D.S. Wiebe, A.M. Mukhin, N.A. Omelyanchuk, V.V. Mironova
[Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology]
|
|
Longitudinal zonation and symmetries in proliferation activity of the Arabidopsis thaliana root meristem in cytokinin deficient and auxin overproducing mutants
Viktoriya Lavrekha, Taras Pasternak, Klaus Palme, Victoria Mironova
[International Symposium “Auxins and Cytokinins in Plant Development ... and Interactions with Other Phytohormones"]
|
|
MATHEMATICAL MODELING OF CHILLING STRESS EFFECT ON THE PLANT ROOT MERISTEM
Maria Savina, Jing Han Hong, Jian Xu, Victoria Mironova
[The first international Plant Systems Biology meeting]
|
|
Mathematical modeling of chilling stress induced changes in Arabidopsis thaliana root meristem
M.S. Savina, J.H. Hong, Jian Xu, V.V. Mironova
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
Mathematical modeling of formation and supporting of the structure of the root apical meristem Arabidopsis thaliana L.
V.V. Lavrekha, V.V. Mironova
[Eleventh International Conference “BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE\systems biology”]
|
|
Mathematical modeling of the effects of chilling stress on Arabidopsis thaliana root stem cell niche
Maria Savina, Jing Han Hong, Jian Xu, Victoria Mironova
[International Symposium “Auxins and Cytokinins in Plant Development ... and Interactions with Other Phytohormones]
|
|
The overlapped motifs co-occurrence in ChIP-seq data.
V.G. Levitsky,D.Y. Oshchepkov, E.V. Zemlyanskaya, V.V. Mironova, E.V. Ignatieva,O.A. Podkolodnaya, T.I. Merkulova
[The 11th International Conference “On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB'2018)]
|
|
Математическое моделирование формирования и поддержания структуры апикальной меристемы корня Arabidopsis thaliana L.
Лавреха В.В., Миронова В.В.
[ХХV международная конференция Математика Компьютер Образование]
|
| 2017 |
Математическая модель самоорганизации потоков ауксина в корне
Ф.В. Казанцев, В.В. Миронова
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
|
|
3D analysis of mitosis distribution highlights the longitudinal zonation and bilateral symmetry of the Arabidopsis thaliana root meristem
Lavrekha VV, Pasternak T, Mironova VV
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева]
|
|
ИССЛЕДОВАНИЕ РОЛИ ЭПИГЕНЕТИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК ХРОМАТИНА В РЕГУЛЯЦИИ ПЕРВИЧНОГО ОТВЕТА НА ЭТИЛЕН УARABIDOPSIS THALIANA НА ОСНОВАНИИ КОМПЬЮТЕРНОГО АНАЛИЗАПОЛНОГЕНОМНЫХ ДАННЫХ
Землянская Е.В., Левицкий В.Г., Ощепков Д.Ю., Миронова В.В.
[БИОТЕХНОЛОГИЯ: СОСТОЯНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ]
|
| 2016 |
ТРЕХМЕРНАЯ КАРТА ПРОЛИФЕРАЦИОННОЙ АКТИВНОСТИ В КОНЧИКЕ КОРНЯ ARABIDOPSIS THALIANA: РАДИАЛЬНАЯ, БИЛАТЕРАЛЬНАЯ И ПРОДОЛЬНАЯ СИММЕТРИИ
В.В. Лавреха, Т. Пастернак, В.В. Миронова
[V Международная Школа для молодых ученых «Эмбриология, генетика и биотехнология»]
|
|
High resolution map of key cell cycle events in Arabidopsis root tips: radial, bilateral and longitudinal symmetry
Lavrekha VV, Pasternak T, Omelyanchuk NA, Ivanov VB, Mironova VV
[International Conference on Systems Biology (ICSB 2016) 16-22 september]
|
|
3D map of proliferation activity in Arabidopsis thaliana root tips: transition domain boundaries and its bilateral symmetry
Lavrekha V.V., Pasternak T., Omelyanchuk N.A., Ivanov V.B., Mironova V.V.
[BGRS/SB’16, Novosibirsk]
|
|
Expression map of PIN transporters in the root meristem of Arabidopsis thaliana
V.V. Kovrizhnykh, T. Pasternak, N.A. Omelyanchuk, V.V. Mironova
[Plant signaling and behavior]
|
|
MATHEMATICAL MODELING OF ACTIVE SUBSTANSES AND FACTORS INFLUENCE ON FUNCTIONING OF PLANT ROOT MERISTEM
M.S. Savina, F.V. Kazantsev, V.V. Mironova
[MM-HPC-BBB-2016]
|
|
MATHEMATICAL MODELING OF ACTIVE SUBSTANSES AND FACTORS INFLUENCE ON FUNCTIONING OF PLANT ROOT MERISTEM
M.S. Savina, F.V. Kazantsev, V.V. Mironova
[SBB-2016]
|
|
Mathematical modeling a reciprocal interactions between auxin and its PIN transporters in the root tip of A. thalina L.
Коврижных В.В., Казанцев Ф.В., Омельянчук Н.А., Миронова В.В.
[BGRS 2016]
|
|
Meta-analysis of transcriptome data to investigate auxin response mechanisms in Arabidopsis thaliana L.
Novikova D.D.,Mironova V.V.,Omelyanchuk N.A., Cherenkov P.A.
[International Conference on Systems Biology]
|
|
Phylogeny and Expression of MAKR family genes in Arabidopsis thaliana L
Novikova D.D.,Mironova V.V., Jaillais Y.,Omelyanchuk N.A.
[The 10th International Conference on the Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
Моделирование воздействия холода на физиологическое распределение ауксина в корне A. thaliana
Савина М.С., Казанцев Ф.В., Миронова В.В.
[XXIII международная конференция "математика. компьютер. образование"]
|
|
Моделирование распределения ауксина в корне A. thaliana в мутантах по генам, кодирующим PIN белки-транспортеры
Казанцев Ф.В., Миронова В.В.
[XXIII международная конференция "математика. компьютер. образование"]
|
| 2015 |
Mathematical modeling of morphogenetic regulation of the meristem zone formation in the plant root
Лавреха В.В., Миронова В.В., Омельянчук Н.А.
[MCCMB-2015 (Московская конференция по компьютерной молекулярной биологии)]
|
|
The compensatory mechanism providing for auxin transport in pin mutants of Arabidopsis thaliana L
Vasilina Kovrizhnykh, Victoria Mironova, Fedor Kazantsev, Nadezda Omelyanchuk, Taras Pasternak.
[Plant genetics, genomics, bioinformatics and biotechnology]
|
|
Математическое моделирование распределения концентрации ауксина в клетках горизонтального слоя корня
Е.С. Новоселова, В.В. Миронова
[XII Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Перспективы развития фундаментальных наук"]
|
|
Поиск ассоциированных с ответом на ауксин TGTCnn - содержащих регуляторных мотивов и их повторов у Arabidopsis thaliana L.
Вибе Даниил Станиславович, Миронова Виктория Владимировна
[МНСК 2015 г. Новосибирск]
|
| 2014 |
The tool to study plant hormone auxin distribution in the plant root
F. Kazantsev, V. V. Mironova
[ECMTB 2014]
|
|
Auxin-responsive transcriptome of Arabidopsis thaliana roots
Миронова Виктория Владимировна Новикова Дарья Дмитриевна Омельянчук Надежда Анатольевна Васильев Геннадий Владимирович Климова Наталья Викторовна
[BGRS-2014]
|
|
Computation modeling of vascular patterning in plant roots
ES Novoselova, VV Mironova, FV Kazantsev, NA Omelyanchuk, VA Likhoshvai
[The 9th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB’14)]
|
|
How the plant root deals with missing of a PIN auxin transporter
Victoria Mironova, Fedor Kazantsev, Vasilina Chernova, Nadezda Omelyanchuk, Taras Pasternak
[9th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology]
|
|
Increasing the number of paralogs for enzymes involved in tryptophan biosynthesis during the evolution of land plants
Turnaev I.I., Gunbin K.V., Akberdin I.R., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Afonnikov D.A.
[9th BGRS\SB-2014]
|
|
Modeling of cell dynamics in the root apical meristem with dynamical grammar
Lavrekha V.V., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A.
[The Ninth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems biology (BGRS\SB-2014)]
|
|
Modeling of cell dynamics in the root apical meristem with dynamical grammar
Lavrekha V.V., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A.
[6th International Young Scientists School «Systems biology and Bioinformatics», SBB’2014]
|
|
Гены семейства MAKR у Arabidopsis thaliana L
Новикова Д. Д., Миронова В. В.
[Перспективы развития и проблемы современной ботаники]
|
|
Математическое моделирование влияния ауксина на формирование сосудистого паттерна корня растения.
Новоселова Е.С., Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Казанцев Ф.В., Лихошвай В.А.
[18-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых "Биология - наука XXI века"]
|
|
Филогения генов семейства MAKR и их экспрессия у Arabidopsis thaliana L.
Новикова Д. Д., Миронова В. В.
[Высокопроизводительное секвенирование: получение, анализ данных и их использование в филогенетике]
|
|
Филогения и особенности экспрессии генов семейства MAKR у Arabidopsis thaliana
Новикова Д. Д., Миронова В. В.
[МНСК 2014 г.]
|
| 2013 |
The mathematical model of auxin distribution in the plant root meristem
Kazantsev F.V., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A.
[Regional Interdisciplinary Conference – Humboldt Kolleg «Magnetic resonance as a tool for interdisciplinary research»]
|
|
Анализ распределения ауксин-чувствительных элементов в геноме Arabidopsis thaliana L.
Вибе Даниил Станиславович, Миронова Виктория Владимировна
[мнск 2013 г. новосибирск]
|
|
Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней Arabidopsis thaliana L.
Миронова В.В., Кузнецова Л.С., Филипенко Е.А., Климова Н.В., Васильев Г.В., Кочетов А.В.
[International Conference ” High-Throughput Sequencing in Genomics”]
|
| 2012 |
ANALYSIS OF TRANSCRIPTIONAL AND POSTTRANSCRIPTIONAL REGULATION OF AUXIN CARRIER AtPIN1
Chernova V.V., Ermakov A.A., Doroshkov A.V., Omelyanchuk N.A., Mironova V.V.
[VIII Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2012)]
|
|
HIGH PERFORMANCE COMPUTING WITH MGSMODELLER
Kazantsev F.V., Akberdin I.R., Mironova V.V., Podkolodnyy N.L., Likhoshvai V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
MATHEMATICAL MODEL OF AUXIN RESPONSIVE REPORTER DR5 ACTIVITY IN PLANT CELL
Savina M.S., Mironova V.V., Akberdin I.R., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
MOLECULAR EVOLUTION OF PROTEINS BELONGING TO AUXIN BIOSYNTHESIS GENE NETWORK IN PLANTS
Turnaev I.A., Akberdin I.R., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Afonnikov D.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
Molecular evolution of proteins belonging to auxin biosynthesis gene network in plants
Turnaev I.I., Akberdin I.R., Mironova V.V., Omelianchuk N.A., Afonnikov D.A.
[Molecular Phylogenetics, Contributions to the 3rd Moskow International Conference “Molecular Phylogenetics” (MolPhy-3)]
|
|
Role of auxin dose-dependent control in specification of root vascular cells
Новоселова ЕС., Миронова ВВ, Казанцев ФВ, Омельянчук НА, Лихошвай ВА
[Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB’12)]
|
|
THE MODEL FOR AUXIN REGULATED AtPIN1 EXPRESSION IN THE ROOT APICAL MERISTEM
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, С.С. Сангаев, Н.А. Омельянчук, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[The 2nd International Conference "Plant Genetics, Genomics and Biotechnology"]
|
|
Исследование регуляторных районов PIN1 гена Arabidopsis thaliana L. (Study of PIN1 regulatory regions in Arabidopsis thaliana L.
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, И.В. Миронова, С.С. Сангаев, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[II (X) Международная Ботаническая Конференция молодых ученых в Санкт-Петербурге, 11-16 ноября 2012 года]
|
|
Математическое моделирование ауксин зависимого контроля дифференцировки сосудистых клеток корня
Новоселова ЕС, Миронова ВВ, Омельянчук НА, Казанцев ФВ, Лихошвай ВА
[II(X) Международная Ботаническая Конференция молодых ученых в Санкт-Петербурге]
|
|
Язык моделирования молекулярно-генетических систем SiBML
Ф.В. Казанцев, В.В. Миронова, Е.С. Новоселова, Н.Л. Подколодный, В.А. Лихошвай
["Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ) 2012"]
|
| 2011 |
A plausible mechanism for the root apical meristem patterning.
V.V. Mironova, E.S. Novoselova, S.S. Sangaev, F.V. Kazantsev, N.A. Omelyanchuk, V.A. Likhoshvai
[7th International Conference on Structure and Function of Roots]
|
|
A plausible mechanism for the root apical meristem self-organization
Victoria Mironova, Ekaterina Novoselova, Nadya Omelyanchuk, Vitaly Likhoshvai
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow]
|
|
Computer simulation confirmed auxin dose-dependent control of root vascular cells specification
E.S. Novoselova, V.V. Mironova, S.S. Sangaev, F.V. Kazantsev, N.A. Omelyanchuk, V.A. Likhoshvai
[7th International Symposium on Structure and Function of Roots]
|
|
Modelling auxin transport in root provascular tissue.
Novoselova E.S., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A.
[8th European conference on mathematical and theoretical biology (ECMTB-2011)]
|
|
Quantitative sequence /activity relationships of auxin response elements (Aux RE) in plant promoters
V.V. Mironova, P.M. Ponomarenko, N.A. Omelyanchuk, M.P. Ponomarenko
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow]
|
|
The combined mechanisms of the reverse fountain and the reflected flow provide for self-organization and maintenance of the root apical meristem.
Mironova V.V., Novoselova E.S., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A.
[8th European conference on mathematical and theoretical biology (ECMTB-2011)]
|
|
Изучение механизмов регуляции ауксином роста и развития растений
Миронова ВВ
[семинар по экологии, физиологии и биофизике растений "Молекулярные, клеточные и тканевые механизмы координации процессов роста и развития растений", Красноярск]
|
|
Математическая модель распределения ауксина в корне растений
Миронова В.В., Новоселова Е.С., Лихошвай В.А.
[Современные проблемы математики, информатики и биоинформатики, Новосибирск]
|
|
Математическая модель распределения ауксина в корне растений
Миронова В.В., Новоселова Е.С., Лихошвай В.А.
[Международная конференция "Современные проблемы математики, информатики и биоинформатики"]
|
|
Математическое моделирование транспорта ауксина в центральном цилиндре корня A. Thaliana
Новоселова Е.С., Миронова В.В., Казанцев Ф.В., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[Третья школа молодых ученых “Биоинформатика и системная биология”]
|
| 2010 |
Analysis of the degenerate motifs in promoters of auxin responsive genes
Вишневский Олег Владимирович Миронова Виктория Владимировна Ананько Анатолий Григорьевич Лаврентьев Михаил Михайлович
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
|
|
In silico analysis of auxin-regulated root apical meristem patterning
Mironova V.V., N.A. Omelyanchuk, E.S. Novoselova, V.A. Likhoshvai
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
Prediction for AtARF family transcription factors, mediating primary response to auxin
V.V. Mironova, N.A. Omelyanchuk, D.Yu. Oschepkov, V.G. Levitsky
[Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk]
|
|
The mathematical model for investigation of auxin-regulated root patterning in wild type and under treatments
V.V. Mironova, E.S. Novoselova, N.A. Omelyanchuk, V.A. Likhoshvai.
[the Joint Russian-French seminar "Genomics, Bioinformatics and Life Science Modeling" 18-21 June, Novosibirsk]
|
|
Математическое моделирование влияния ауксина на ризотаксис у arabidopsis thaliana
Новоселова Е.С., Миронова В.В.
[Международная научная студенческая конференция, НГУ, Новосибирск]
|
|
Математическое моделирование распределения ауксина в проводящих тканях Arabidopsis thaliana
Новоселова Е.С., Миронова В.В.
[1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии", Томск, 6-9 октября 2010]
|
|
Механизмы поддержания ниши стволовых клеток в корнях растений: математическая модель распределения ауксина в корне и ее анализ
Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[Биология развития: морфогенез репродуктивных структур и роль стволовых клеток в онтогенезе. Санкт-Петербург, 13-16 декабря 2010 г.]
|
| 2009 |
Auxin regulated root patterning: the mathematical model and key genetic mechanisms
V.V. Mironova, M.P. Ponomarenko, N.A. Omelyanchuk, V.A. Likhoshvai
[German-Russian forum Biotechnology GRFB'09, Novosibirsk]
|
| 2008 |
Auxin regulation of its own transport determines the root tip structure in plants
V.V. Mironova, N.A. Omelyanchuk, S.I. Fadeev, V.V Koga2, G. Yosiphon, E. Mjolsness, V.A.Likhoshvai
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
|
|
Mathematical model of auxin-mediated root patterning
Mironova V.V., Likhoshvai V.A.
[International Autumn School for Young Scientists on Computational Systems Biology and Bioinformatics]
|
|
Математическая модель поддержания тотипотентности и дифференцировки клеток при развитии меристемы побега Arabidopsis thaliana
Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Миронова В.В., Казанцев Ф.В., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[Сборник материалов Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2008"!", Москва, Россия]
|
| 2007 |
2d modelling and analysis of spatially distributed cells types of primary shoot apical meristem (SAM) of Arabidopsis thaliana
Ilya R. AKBERDIN, Evgeny A. OZONOV, Victorya V. MIRONOVA, Dmitry N. GORPINCHENKO, Nadezda A. OMELYANCHUK, Vitaly A. LIKHOSHVAI, Denis S. MIGINSKY, Nikolai A. KOLCHANOV
[Proceedings of the 3-rd Moscow conference on computional molecular biology. Moscow, Russia]
|
|
Mathematical model of the Arabidopsis thaliana L. morphogenesis in a cellular automaton terms
Akberdin I.R., Ozonov E.A., Mironova V.V., Gorpinchenko D.N., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A., D.N., Kolchanov N.A.
[7th YSF "Molecular Networks", Vienna, Austria, 5 – 7 July 2007]
|
|
Modelling and analysis of spatially distributed systems regulation in apical meristem of Arabidopsis thaliana
Akberdin I.R., Ozonov E.A., Mironova V.V., Gorpinchenko D.N., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A
[3-rd International Conference "Basic Science for Medicine", September 2-8, 2007, Novosibirsk, Russia]
|
|
Извлечение знаний из опубликованных данных по генетике растений: база данных AGNS и ее приложения
Н.А. Омельянчук, В.В. Миронова, Д.К. Пономарев, Е.М. Залевский, И.С. Шамов, Н.Л. Подколодный, Н.А. Колчанов
[Материалы Всероссийской конференции с международным участием "Знания – Онтологии – Теории" (ЗОНТ-07), 14-16 сентября 2007, Новосибирск]
|
|
Моделирование морфогенеза зародыша Arabidopsis thaliana в терминах клеточного автомата
Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Миронова В.В., Горпинченко Д.Н., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[Сборник материалов Международной молодёжной научно-методической конференции "Проблемы молекулярной и клеточной биологии" г. Томск]
|
|
Моделирование морфогенеза зародыша Arabidopsis thaliana в терминах клеточных автоматов
Озонов Е.А., Акбердин И.Р., Миронова В.В., Горпинченко, Д.Н, Лихошвай В.А
[Всероссийская научная конференция студентов физиков ВНКСФ-13]
|
|
Моделирование морфогенеза зародыша Arbidopsis thaliana в терминах клеточного автомата
Акбердин ИР, Озонов ЕА, Миронова ВВ, Горпинченко ДН, Омельянчук НА, Лихошвай ВА
[Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск]
|
|
Подходы к моделированию регуляции развития корня растения
Горпинченко Д., Миронова В.
[Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК) Новосибирск]
|
| 2006 |
AGNS (arabidopsis genenet supplementary database), release 3.0
Omelianchuk N.A., Mironova V.V., Poplavsky A.S., Pavlov K.S., Savinskaya S.A., Podkolodny N.L., Mjolsness E.D., Meyerowitz E.M., Kolchanov N.A
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
AGNS database and cellular automaton to model the development of shoot meristems of Arabidopsis thaliana
Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[II Всероссийская конференция "Инфокоммуникационные и компьютерные технологии и системы", Улан-Удэ, Россия (Июль 1-4)]
|
|
Modeling of morphogenesis of Arabidopsis thaliana in cellular automaton terms
Akberdin I. R., Evgeniy A. Ozonov, Victoria V. Mironova, Nadezda A. Omelyanchuk, Vitaly A. Likhoshvai
[VII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. Красноярск. 2006]
|
|
Моделирование морфогенеза растения в терминах клеточного автомата
Акбердин И.Р, Озонов Е.А, Миронова В.В, Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А
[VII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. Красноярск. 2006]
|
|
Онтология развития растения базы данных по экспрессии генов Арабидопсиса AGNS (Arabidopsis GeneNet Supplementary DataBase)
Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Поплавский А.С.
[Материалы II всероссийской конференции с международным участием "Инфокоммуникационные и вычислительные технологии и системы". г. Улан-Удэ]
|
Гранты
| 2021 |
Поиск, декомпозиция и верификация регуляторных модулей, обеспечивающих формирование пространственно-временных паттернов экспрессии генов растений
Левицкий Виктор Георгиевич,
Миронова Виктория Владимировна,
Лавреха Виктория Вадимовна,
Сизенцова Яна Геннадьевна,
Коврижных Василина Владимировна,
Долгих Владислав Андреевич,
Омельянчук Надежда Анатольевна,
Цуканов Антон Витальевич,
Вибе Даниил Станиславович,
Коростелева Анастасия Леонидовна
|
| 2019 |
Поддержка и развитие центра коллективного пользования научным оборудованием Центр генетических ресурсов лабораторных животных путем инструментального развития исследований для обеспечения реализации приоритетов научно-технологического развития
Мошкин М.П., Васильев Г.В., Завьялов Е.Л., Землянская Е.В., Максимов В.Н., Миронова В.В., Орищенко К.Е., Пилипенко А.С., Розанов А.С., Рубцов Н.Б.
|
|
Системный анализ механизмов дифференцировки камбия у Arabidopsis thaliana L.
Савина Мария Сергеевна
Левицкий Виктор Георгиевич
Казанцев Федор Владимирович
Ощепков Дмитрий Юрьевич
Омельянчук Надежда Анатольевна
Лавреха Виктория Вадимовна
Новикова Дарья Дмитриевна
Землянская Елена Васильевна
|
| 2018 |
Мета-анализ полногеномных данных на основе выявления и аннотации различных структурно-функциональных типов сайтов связывания транскрипционных факторов в составе композиционных элементов
Левицкий Виктор Георгиевич (Р)
Брызгалов Леонид Олегович
Миронова Виктория Владимировна
Игнатьева Елена Васильевна
Ощепков Дмитрий Юрьевич
Новикова Дарья Дмитриевна
Вибе Даниил Станиславович
Землянская Елена Васильевна
Мухин Алексей Максимович
|
|
Системный анализ генов, обеспечивающих устойчивость корня растений к низким положительным температурам
Вибе Даниил Станиславович, Долгих Владислав Андреевич, Землянская Елена Васильевна, Лавреха Виктория Вадимовна, Миронова Виктория Владимировна, Новикова Дарья Дмитриевна, Сизенцова Яна Геннадьевна, Убогоева Елена Вячеславовна
|
|
Разработка и апробация метода поиска и функциональной аннотации цис-регуляторных элементов, ассоциированных с ответом организма на изменение внешних условий
Коврижных Василина Владимировна Миронова Виктория Владимировна (Р) Омельянчук Надежда Анатольевна Вибе Даниил Станиславович Ощепкова Евгения Александровна Злобин Александр Сергеевич Мухин Алексей Максимович Ткачев Кирилл Юрьевич
|
| 2015 |
Транскрипционная и посттранскрипционная регуляция ауксином и этиленом экспрессии генов в корне Arabidopsis thaliana
Вибе Даниил Станиславович Дорошков Алексей Владимирович Климова Наталья Викторовна Лавреха Виктория Вадимовна Левицкий Виктор Георгиевич Миронова Виктория Владимировна, руководитель, Новикова Дарья Дмитриевна Ощепков Дмитрий Юрьевич Чернова Василина Владимировна Черных Ольга Александровна
|
| 2013 |
Роль ауксина и этилена в регуляции активности генов в корне проростка Arabidopsis thaliana L.: полногеномный подход
Миронова Виктория Владимировна Ермаков Антон Александрович Дорошков Алексей Владимирович Васильев Геннадий Владимирович Казанцев Федор Владимирович Климова Наталья Викторовна Левицкий Виктор Георгиевич Новоселова Екатерина Сергеевна Пономаренко Петр Михайлович Чернова Василина Владимировна
|
| 2012 |
Investigation of molecular-genetic mechanisms of auxin actions in the root meristem of Arabidopsis thaliana
Миронова В.В.
|
|
ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНО-РАЗНОСТНЫЕ И ИНТЕГРОДИФФЕРЕНЦИАЛЬНЫЕ УРАВНЕНИЯ. ПРИЛОЖЕНИЯ К ЗАДАЧАМ ЕСТЕСТВОЗНАНИЯ
общее кол-во = 72 человека
|
| 2011 |
Экспериментально-теоретическое изучение молекулярно-генетических механизмов распределения ауксина в корне растений
Миронова Виктория Владимировна Лихошвай Виталий Александрович Омельянчук Надежда Анатольевна Новоселова Екатерина Сергеевна Казанцев Фёдор Владимирович Сангаев Содном Сергеевич Ибрагимова Салмаз Магомедсаидовна Пономаренко Михаил Павлович
|
|
Участие в 8-ой Европейской конференции по математической и теоретической биологии (ECMTB11)
Миронова Виктория Владимировна
|
| 2009 |
Participation to miniprogram “Morphodynamics in Plants, Animals and Beyond"
Миронова В.В., Омельянчук Н.А.
|
|
Методы исследования дифференциально-разностных уравнений и приложения к задачам биологии и химии
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Омельянчук Н.А., Акбердин И.Р., Безматерных К.Д., Миронова В.В., Ри М.Т., Казанцев Ф.В., Новоселова Е.С. и др.
|
|
ПОСТГЕНОМНАЯ БИОИНФОРМАТИКА: КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ
76 человек
|
| 2008 |
Компьютерное моделирование и анализ механизма гомеостаза структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме Arabidopsis thaliana
Колчанов Н.А. , Омельянчук Н.А., н.с. Николаев С.В., Ананько Е.А., Вишневский О.В., Хомичева И.В., Миронова В.В., Лавреха В.В.
|
|
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов.
Савенкова Л.А., Пономаренко М.П., Игнатьева Е.В., Левицкий В.Г., Акбердин И.Р., Миронова, Титов
|
Научное руководство
| 2019 |
Компьютерное моделирование распределения ауксина в апикальной меристеме корня Arabidopsis thaliana с учетом анатомии корневого чехлика и нарушений в его структуре
к.б.н. Миронова Виктория Владимировна
[Савина Мария Сергеевна]
|
|
Поиск новых чувствительных к ауксину регуляторных элементов в промоторах генов Arabidopsis thaliana L.
д.б.н., Кочетов Алексей Владимирович, к.б.н. Миронова Виктория Владимировна
[Новикова Дарья Дмитриевна]
|
| 2017 |
Разработка программного комплекса для функциональной аннотации цис-регуляторных элементов и его апробация на ауксин-чувствительных элементах Arabidopsis thaliana
[Черенков Павел Андреевич]
|
|
Компьютерный анализ особенностей экспрессии транспортеров ауксина семейства PIN в корне Arabidopsis thaliana L
[Коврижных Василина Владимировна]
|
Учебные курсы
| 2015 |
Практикум по начальной специализации "Биоинформатика и системная биология"
|
| 2013 |
Биоинформатика и компьютерная геномика
Миронова В.В., Дорошков А.В.
|
Патенты
| 2021 |
Программный комплекс для выявления обогащения цис-регуляторных элементов в выборке функциональных районов генома (CisCross)
Левицкий Виктор Георгиевич,
Миронова Виктория Владимировна,
Лавреха Виктория Вадимовна
|
| 2019 |
Программный комплекс для предсказания совместной встречаемости мотивов с учетом их перекрывания на основе данных массового секвенирования ChIP-seq (MCOT)
Левицкий Виктор Георгиевич
Землянская Елена Васильевна
Ощепков Дмитрий Юрьевич
Миронова Виктория Владимировна
|
| 2018 |
Функциональная аннотация дифференциально экспрессирующихся генов с учетом степени изменения экспрессии (FoldGO)
Вибе Даниил Станиславович, Омельянчук Надежда Анатольевна, Миронова Виктория Владимировна
|
|
Cоздание двумерных моделей тканей растений (PlantLayout)
Савина Мария Сергеевна
Миронова Виктория Владимировна
|
| 2010 |
Растения, Паттерны, Фенотипы (3П-ДБ)/Plants, Patterns, Phenotypes (3P-DB)
Миронова В.В., Залевский Е.М., Омельянчук Н.А.
|
| 2006 |
Генные сети Арабидопсиса (ГСА)/Arabidopsis GeneNet Supplementary (AGNS)
Омельянчук Н.А., Поплавский А.С., Миронова В.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.
|
Диссертации
| 2010 |
Компьютерное исследование молекулярно-генетических механизмов регуляции ауксином развития корня растений
[Кандидат]
|
|
|
