 |
|
|
Дорошков Алексей Владимирович, к. б. н.
|
Публикации
| 2024 |
Catching the Big Fish in Big Data: A Meta-Analysis of Zebrafish Kidney scRNA-Seq Datasets Highlights Conserved Molecular Profiles of Macrophages and Neutrophils in Vertebrates
Aleksandr V Bobrovskikh, Ulyana S Zubairova, Ludmila G Naumenko, Alexey V Doroshkov
[Biology]
|
|
Image-Based Quantitative Analysis of Epidermal Morphology in Wild Potato Leaves
Zubairova U.S., Fomin I.N., Koloshina K.A., Barchuk A.I., Erst T.V., Chalaya N.A., Gerasimova S.V., Doroshkov A.V.
[Plants]
|
|
In Vitro vs. In Vivo Transcriptomic Approach Revealed Core Pathways of Nitrogen Deficiency Response in Tea Plant (Camellia sinensis (L.) Kuntze)
Lidiia Samarina, Lyudmila Malyukova, Songbo Wang, Aleksandr Bobrovskikh, Alexey Doroshkov, Ruset Shkhalakhova, Karina Manakhova, Natalia Koninskaya, Alexandra Matskiv, Alexey Ryndin, Elena Khlestkina, Yuriy Orlov
[INT J MOL SCI]
|
|
Nitrogen deficiency differentially affects lignin biosynthesis genes and flavanols accumulation in tolerant and susceptible tea genotypes (Camellia sinensis (L.) Kuntze)
Lidiia Samarina, Lyudmila Malyukova, Songbo Wang, Yang Li, Alexey Doroshkov, Aleksandr Bobrovskikh, Ruset Shkhalakhova, Natalia Koninskaya, Alexandra Matskiv, Andrey Velikiy, Alexey Ryndin, Elena Khlestkina
[Plant Stress]
|
|
Thraustochytrids: Evolution, Ultrastructure, Biotechnology, and Modeling
Menzorov A.G., Iukhtanov D.A., Naumenko L.G., Bobrovskikh A.V., Zubairova U.S., Morozova K.N., Doroshkov A.V.
[INT J MOL SCI]
|
| 2023 |
Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei
Aleksandr V. Bobrovskikh, Ulyana S. Zubairova, Alexey V. Doroshkov
[Biology]
|
| 2022 |
Isolation and transcriptome analysis of a biotechnologically promising Black Sea protist, Thraustochytrium aureum ssp. strugatskii
Dmitrii K. Konstantinov, Aleksei Menzorov, Olga Krivenko, Alexey V. Doroshkov
[PeerJ]
|
|
Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus
Ulyana S. Zubairova, Aleksandra Yu. Kravtsova, Alexander V. Romashchenko, Anastasiia A. Pushkareva, Alexey V. Doroshkov
[Plants]
|
|
Transcriptomic Data Meta-Analysis Sheds Light on High Light Response in Arabidopsis thaliana L.
Бобровских Александр Владимирович
Зубаирова Ульяна Станиславовна
Бондарь Евгения Ивановна
Лавреха Виктория Вадимовна
Дорошков Алексей Владимирович
[INT J MOL SCI]
|
| 2021 |
A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis
Aleksandr Bobrovskikh, Alexey Doroshkov, Stefano Mazzoleni, Fabrizio Cartenì, Francesco Giannino, Ulyana Zubairova
[Frontiers in Genetics]
|
|
Comparative transcriptome profiling of a resistant vs susceptible bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivar in response to water deficit and cold stress
Dmitrii K. Konstantinov, Ulyana S. Zubairova, Anton A. Ermakov, Alexey V. Doroshkov
[PeerJ]
|
| 2020 |
Comparative Expression Analysis of Stress-Inducible Candidate Genes in Response to Cold and Drought in Tea Plant
Lidiia S. Samarina, Alexandr V. Bobrovskikh, Alexey V. Doroshkov,Lyudmila S. Malyukova, Alexandra O. Matskiv, Ruslan S. Rakhmangulov, Natalia G. Koninskaya, Valentina I. Malyarovskaya, Wei Tong, Enhua Xia, Karina A. Manakhova, Alexey V. Ryndin, Yuriy L. Orlov
[Frontiers in Genetics]
|
|
Subcellular compartmentalization of the plant antioxidant system: an integrated overview
Aleksandr Bobrovskikh, Ulyana Zubairova, Alexey Kolodkin, Alexey Doroshkov
[PeerJ]
|
| 2019 |
LSM-W2: Laser Scanning Microscopy Worker for Wheat Leaf Surface Morphology
Zubairova U.S., Verman P.Yu., Oshchepkova P.S., Elsukova A.S., Doroshkov A.V.
[BMC SYST BIOL]
|
|
Phylostratigraphic Analysis Shows the Earliest Origination of the Abiotic Stress Associated Genes in A. thaliana
Zakhar S. Mustafin, Vladimir I. Zamyatin, Dmitrii K. Konstantinov, Aleksej V. Doroshkov, Sergey A. Lashin, Dmitry A. Afonnikov
[Genes]
|
|
Quantitative characteristics of pubescence in wheat (Triticum aestivum L.) are associated with photosynthetic parameters under conditions of normal and limited water supply
Tatyana A. Pshenichnikova, Alexey V. Doroshkov, Svetlana V. Osipova, Alexey V. Permyakov,
Marina D. Permyakova, Vadim M. Efimov, Dmitry A. Afonnikov
[PLANTA]
|
|
Stress-induced changes in the expression of antioxidant system genes for rice (Oryza sativa L.) and bread wheat (Triticum aestivum L.)
Anton Ermakov, Aleksandr Bobrovskikh, Ulyana Zubairova, Dmitrii Konstantinov, Alexey Doroshkov
[PeerJ]
|
|
The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development.
Doroshkov AV, Konstantinov DK, Afonnikov DA, Gunbin KV.
[BMC PLANT BIOL]
|
| 2018 |
Опушение листа у картофеля Solanum tuberosum: морфология, функциональная роль и методы исследования.
Дорошков А.В., Афонников Д.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Паттерн эпидермиса листа пшеницы как модель для изучения влияния стрессовых условий на морфогенез
Зубаирова У. С., Дорошков А. В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Предсказание методами системной биологии наиболее перспективных генов-мишеней для селекции на устойчивость к окислительному стрессу С3 и С4 культурных злаков
А. В. Дорошков, А. В. Бобровских
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
Diversity of leaf pubescence in bread wheat and relative species
Tatyana A. Pshenichnikova, Alexey V. Doroshkov, Alexander V. Simonov, Dmitry A. Afonnikov, Andreas Bo¨rner
[Genetic Resources and Crop Evolution]
|
| 2016 |
Identification of nuclear genes controlling chlorophyll synthesis in barley by RNA-seq
Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Doroshkov A.V., Gordeeva E.I., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K.
[BMC PLANT BIOL]
|
|
Interactions between leaf pubescence genes in bread wheat as assessed by high throughput phenotyping.
Doroshkov A.V., Afonnikov D.A., Dobrovolskaya O.B., Pshenichnikova T.A.
[EUPHYTICA]
|
|
Methods of high-throughput plant phenotyping for large-scale breeding and genetic experiments
D. A. Afonnikov, M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. G. Komyshev, T. A. Pshenichnikova
[RUSS J GENET+]
|
|
Regions of the bread wheat D genome associated with variation in key photosynthesis traits and shoot biomass under both well watered and water deficient conditions
Svetlana Osipova, Alexey Permyakov, Marina Permyakova, Tatyana Pshenichnikova, Vasiliy Verkhoturov, Alexandr Rudikovsky, Elena Rudikovskaya, Alexandr Shishparenok, Alexey Doroshkov, Andreas Börner
[J APPL GENET]
|
|
Оценка количественных характеристик опушения листьев картофеля с использованием анализа цифровых микроизображений
А.В. Дорошков, А.В. Симонов, А.Д. Сафонова, Д.А. Афонников, И.Е. Лихенко, Н.А. Колчанов
[Достижения науки и техники АПК]
|
|
Протокол анализа количественных характеристик опушения листа картофеля
А.В. Дорошков, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2015 |
Computer high-throughput approaches to wheat phenotyping: application to leaf pubescence analysis
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A. Simonov A.V.
[The 3rd Intern. Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”, Abstract book]
|
|
Genetic dissection of earliness by analysis of a recombinant chromosome substitution double haploid mapping population of bread wheat (Triticum aestivum L.) in different geographic regions
Tatyana A. Pshenichnikova, Elena K. Khlestkina, Svetlana Landjeva, Alexey V. Doroshkov, Tanya Kartseva, Andreas Bo¨rner, Alexander V. Simonov, Ludmila V. Shchukina, Evgeniya V. Morozova
[EUPHYTICA]
|
|
The effect of plant hormones on the manifestation of leaf pubescence genes in bread wheat.
Doroshkov A.V., Simonov A.V., Afonnikov D.A., Kasyanov N.S., Pshenichnikova T.A.
[The 3rd Intern. Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”, Abstract book]
|
| 2013 |
Генетический контроль опушения листа у изогенных линий мягкой пшеницы сорта Новосибирская 67
Дорошков А.В., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[RUSS J GENET+]
|
| 2012 |
Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA.
[ANN BOT-LONDON]
|
|
Computer approaches to wheat high-throughput phenotyping
Afonnikov D., Genaev M., Doroshkov A., Denisyuk V., Morozova E., Simonov A., Pshenichnikova T.
[Journal of Stress Physiology & Biochemistry]
|
|
Extraction of quantitative characteristics describing wheat leaf pubescence with a novel image processing technique
Mikhail A. Genaev, Alexey V. Doroshkov, Tatyana A. Pshenichnikova, Nikolay A. Kolchanov, Dmitry A. Afonnikov
[PLANTA]
|
|
WheatPGE: A system for analysis of relationships among the phenotype, genotype, and environment in wheat
M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. V. Morozova, T. A. Pshenichnikova and D. A. Afonnikov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Информационная поддержка селекционно-генетического эксперимента у пшеницы в системе WheatPGE
Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Морозова Е.В., Симонов А.В., Афонников Д.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
|
Информационный портал "Биотехнология растений" - Интернет ресурс для поддержки экспериментов в области генной инженерии растений, генетики и селекции пшеницы.
Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2011 |
Анализ особенностей морфологии и наследования опушения листа пшеницы Triticum aestivum L. с помощью компьютерных методов фенотипирования.
Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[RUSS J GENET+]
|
|
КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА WheatPGE ДЛЯ АНАЛИЗА ВЗАИМОСВЯЗИ ФЕНОТИП-ГЕНОТИП-ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА У ПШЕНИЦЫ
М.А. Генаев, A.В. Дорошков, Е.В. Морозова, Т.А. Пшеничникова, Д.А. Афонников
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2009 |
Применение компьютерного анализа микроизображений листа для оценки характеристик опушения листа пшеницы Triticum Aestivum L
Дорошков А.В., Арсенина С.И., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
Монографии
| 2017 |
Cladogenesis
Ponomarenko M., Gunbin K., Doroshkov A., Suslov V., Kolchanov N.
|
| 2014 |
Wheat leaf pubescence analysis: methods of computer phenomics
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A.
|
| 2013 |
Cladogenesis.
Ponomarenko M, Gunbin K, Doroshkov A, Kolchanov N
|
Конференции
| 2023 |
Электронно-микроскопический анализ одноклеточного эукариота Thraustochytrium aureum ssp. strugatskii на разных стадиях жизненного цикла.
Юхтанов Д.А., Науменко Л.Г. Мензоров А.Г., Дорошков А.В., Сульдина Л.А., Киселева Е.В., Морозова К.Н.
[Chromosome-2023]
|
|
Электронно-микроскопический портрет одноклеточного эукариота Thraustochytrium aureum ssp. Strugatskii.
Юхтанов Д.А., Науменко Л.Г. Мензоров А.Г., Дорошков А.В., Сульдина Л.А., Киселева Е.В., Морозова К.Н.
[XX Всероссийская молодежная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии]
|
| 2020 |
Выявление контекстных сигналов в промоторах генов, регулирующих ответ на световой стресс у Arabidopsis thaliana
А. В. Бобровских, А. Б. Левина, Д. К. Константинов, А. А. Ермаков , У. С. Зубаирова, А. В. Дорошков
[Марчуковские научные чтения - 2020]
|
|
Выявление контекстных сигналов цис-регуляторных элементов транскрипционного ответа на солевой стресс у Arabidopsis thaliana
А. В. Бобровских , Д. К. Константинов , А. А. Ермаков , У. С. Зубаирова , А. В. Дорошков
[Марчуковские научные чтения - 2020]
|
|
Генетические механизмы ответа растений на световой стресс: реконструкция генных сетей и эволюционная перспектива
Бобровских А. В., Ермаков А. А., Зубаирова У. С., Константинов Д. К., Левина А.Б., Колодкин А.Н., Хейдари С., Дорошков А.В.
[Генофонд и селекция растений 2020]
|
|
Реконструкция регуляторных генных сетей ответа на солевой стресс Arabidopsis thaliana и Zea mays
Бобровских А. В., Ермаков А. А., Зубаирова У. С., Константинов Д. К., Левина А.Б., Дорошков А.В.
[Генофонд и селекция растений 2020]
|
| 2019 |
ОПУШЕНИЕ ЛИСТА ПШЕНИЦЫ: ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОЕ
ФЕНОТИПИРОВАНИЕ, ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОНТРОЛЬ И
ФИЗИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ
Афонников Д.А, Дорошков А.В., Генаев М.А., Симонов А.В., Осипова С.В.,Пермяков А.В., Пермякова М.Д., Ефимов В.М., Пшеничникова Т.А.
[«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮ КАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ, И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»]
|
|
Identification and characterization of a barley gene controlling cuticle wax formation
Gerasimova S., Kolosovskaya E., Hertig C., Hiekel S., Korotkova A., Doroshkov A., Kukoeva T., Domrachev D., Kochetov A., Kumlehn J., Khlestkina E.
[Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
|
|
MODELING OF ANTIOXIDANT SYSTEM OF A PLANT CELL IN CONTROL AND STRESS CONDITIONS
Aleksandr V. Bobrovskikh, Alexey N. Kolodkin and Alexey V. Doroshkov
[DSABNS2019]
|
|
Mapping of loci associated with drought tolerance in chromosomes 2A and 2D of bread wheat and the search for responsible candidate genes
Pshenichnikova T.A., Osipova S.V., Permyakova M.D., Permyakov A.V., Shishparenok A.A., Rudikovskaya E.G., Doroshkov A.V., Konstantinov D.K., Leonova I.N., Lohwasser U., Börner A.
[PlantGen2019]
|
|
The wheat leaf epidermal pattern as a model for studying the effect of stress conditions on morphogenesis
Zubairova U., Doroshkov A.
[PlantGen]
|
|
Изучение структуры и динамики антиоксидантной системы растений методами системной биологии
Бобровских А. В., Дорошков А. В.
[МНСК-2019, г. Новосибирск]
|
|
РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО
ФЕНОТИПИРОВАНИЯ РАСТЕНИЙ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ
Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы.]
|
|
Эволюционный анализ генных сетей абиотического стресса растений
Лашин С.А., Мустафин З.С., Замятин В.И., Константинов Д.К., Дорошков А.В., Афонников Д.А.
[VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы]
|
| 2018 |
Leaf hairiness in wheat: genetic, evolutional and physiological aspects
T. A. Pshenichnikova,
A. V. Doroshkov,
A. V. Simonov,
M. A. Yudina,
D. A. Afonnikov,
M. D. Permyakova,
A. V. Permyakov,
S. V. Osipova,
A. Börner
[17th International EWAC Conference]
|
|
Investigating genetic control of pigmentation in mutant barley lines with RNA-seq. BGRS, 2018
N.Shmakov, A.Glagoleva, A.Doroshkov, G.Vasiliev, N.Shatskaya, D.Afonnikov, E.Khlestkina
[BGRS\SB-2018 The 11th International Conference Systems Biology and Biomedicine, SBioMed-2018 Symposium]
|
|
Molecular evolution analysis of genetic network components related to plant trichome
development
A.V. Doroshkov, D.K. Konstantinov, K. V. Gunbin, D. A. Afonnikov
[BGRS/SB 2018]
|
|
Using a mathematical modeling to access the abiotic stress response of plant antioxidant system
Alexander V.}{Bobrovskikh, Alexey V. Doroshkov
[ECMTB 2018]
|
|
Using the mathematical modeling approach to access the behavior of plant antioxidant system under abiotic stress conditions
A. Bobrovskikh, A. Doroshkov
[BGRS 2018]
|
|
Кандидатные гены для регуляции активности липоксигеназы
Пермякова М.Д., Осипова С.В., Пермяков А.В., Пшеничникова Т.А., Рудиковская Е.Г., Дорошков А.А., Леонова И.Н., Верхотуров В.В., Lohwasser U.
[Годичное собрание общества физиологов растений России "Механизмы устойчивости растений и микроорганизмов к неблагоприятным условиям среды"]
|
|
Кластеры генов, регулирующие ответные реакции на водный стресс я ядерном геноме Triticum aestivum L.
Осипова С.В., Пшеничникова Т.А., Пермяков А.В., Пермякова М.Д., Рудиковская Е.Г., Дорошков А.В., Верхотуров В.В., Леонова И.Н., Лохвассер У., Бернер А.
[Механизмы регуляции функций органелл эукариотической клетки]
|
|
Роль хромосом второй гомеологической группы в засухоустойчивости пшеницы Triticum aestivum L.
Осипова С.В., Пшеничникова Т.А., Пермяков А.В., Пермякова М.Д., Рудиковская Е.Г., Дорошков А.А., Леонова И.Н., Верхотуров В.В., Lohwasser U.
[Годичное собрание общества физиологов растений России "Механизмы устойчивости растений и микроорганизмов к неблагоприятным условиям среды"]
|
|
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МОРФОЛОГИЧЕСКИХ ПРИЗНАКОВ ГРАНУЛ КРАХМАЛА S. tuberosum, ИЗ РАСТЕНИЙ, ВЫРАЩЕННЫХ В 2016/2017 ГОДАХ
Эрст Татьяна Владимировна
Дорошков Алексей Владимирович
Хлесткин Вадим Камильевич
[Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля]
|
| 2017 |
Комплексный анализ опушения листа, интрогрессированного в мягкую пшеницу из геномов сородичей
Симонов Александр Владимирович, Юдина Мария Александровна, Дорошков Алексей Владимирович, Пшеничникова Татьяна Алексеевна
[III МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ГЕНОФОНД И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ», ПОСВЯЩЕННАЯ 130-ЛЕТИЮ Н.И. ВАВИЛОВА (28.03. – 30.03.2017)]
|
|
Wheat leaf trichomes pattern formation: from image analysis to computational modeling
U.S. Zubairova, A.V. Doroshkov
[9th Young Scientists School "Systems Biology and Bioinformatics" (SBB-2017)]
|
| 2016 |
An ImageJ plugin for detection of wheat leaf epidermis cellular structure from confocal laser scanning microscopy
U.S. Zubairova, P.Yu. Verman, and A.V. Doroshkov
[BGRS\SB-2016]
|
| 2015 |
Monosomic analysis of leaf hairiness in isogenic lines of bread wheat Novosibirskaya 67
A. V. Doroshkov, D. A. Afonnikov, T. A. Pshenichnikova, A. V. Simonov
[EWAC – The European Cereals Genetics Co-operative EUCARPIA Cereals Section International Conference]
|
| 2014 |
A model of trichome spacing pattern formation on growing wheat leaf
Zubairova U., Nikolaev S.V., Doroshkov A., Afonnikov D.
[BGRS/SB-2014]
|
|
Генетическое разнообразие опушения листа мягкой пшеницы: описание методом высокопроизводительного фенотипирования
Дорошков А.В., Генаев М.А., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[VI Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров и ассоциированные генетические симпозиумы]
|
| 2013 |
Компьютерная технология фенотипирования пшеницы.
Афонников Д.А., Дорошков А.В., Генаев М.А., Пшеничникова Т.А., Тарасова И.А., Морозова Е.В. , Симонов А.В.
[Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 19-22 марта 2013]
|
| 2012 |
ANALYSIS OF TRANSCRIPTIONAL AND POSTTRANSCRIPTIONAL REGULATION OF AUXIN CARRIER AtPIN1
Chernova V.V., Ermakov A.A., Doroshkov A.V., Omelyanchuk N.A., Mironova V.V.
[VIII Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2012)]
|
|
Computer approaches ti wheat high-throughput phenotyping
Afonnikov D., Genaev M., Doroshkov A., Denisyuk V., Morozova E., Simonov A., Pshenichnikova T.
[The 2nd International Conference "Plant Genetics Genomics and Biotechnology"]
|
|
Prediction of the structure and localization of genes controlling leaf pubescence in wheat Triticum aestivum L. and barley Hordeum vulgare L. based on Arabidopsis thaliana (L.) Henh. genes data
Doroshkov AV, Pshenichnikova TA, Afonnikov DA
[2nd International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”]
|
|
THE MODEL FOR AUXIN REGULATED AtPIN1 EXPRESSION IN THE ROOT APICAL MERISTEM
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, С.С. Сангаев, Н.А. Омельянчук, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[The 2nd International Conference "Plant Genetics, Genomics and Biotechnology"]
|
|
Исследование регуляторных районов PIN1 гена Arabidopsis thaliana L. (Study of PIN1 regulatory regions in Arabidopsis thaliana L.
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, И.В. Миронова, С.С. Сангаев, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[II (X) Международная Ботаническая Конференция молодых ученых в Санкт-Петербурге, 11-16 ноября 2012 года]
|
| 2011 |
Analysis of leaf hairiness morphology wheat: computational approaches using image processing technique.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova, D.A. Afonnikov.
[The International Conference “Wheat Genetics Resources and Genomics”.]
|
|
Hight througput phenotyping approach to analysis of the leaf hairiness in wheat.
D.A. Afonnikov, A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova.
[The International Conference “Wheat Genetics Resources and Genomics”.]
|
| 2010 |
Analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L. using the high throughput phenotyping approach.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A. Pshenichnikova, D.A. Afonnikov
[The International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”]
|
|
Using a computer-base image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Trticum aestivum L.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova, D.A. Afonnikov.
[The 7th International Conference on Bioinformatics of Genome regulation and Structure.]
|
|
Using the computer-based image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L.
Дорошков А.В.
[The Young Scientists School "Bioinformatics and system biology", Novosibirsk, Russia, 28-29 June 2010]
|
|
WheatDB - база данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск]
|
|
WheatPGE - компьютерная система анализа взаимосвязи признаков фенотипа генотипа и окружающей среды у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[Электронные библиотеки:перспективные методы и технологии, электронные коллекции. XII Всероссийская научная конференция RCDL'2010. Казань]
|
|
WheatPGE — система анализа взаимосвязей фенотип-генотип-окружающая среда у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[Молодежный научный форум "ЛОМОНОСОВ - 2010" г. Москва]
|
|
Анализ морфологии опушения листа у пшеницы: компьютерный подход с использованием анализа изображений
Афонников Д.А. Дорошков А.В., Генаев М.А.
[Российско-Французского семинар "Геномика, биоинформатика и моделирование в науках о жизни", 18-21 июня 2010]
|
|
Визуализация схем скрещивания пшеницы в рамках разработки системы WheatDB
Генев М.А. Дорошков А.В.
[XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.]
|
|
Исследование опушения листа пшеницы Triticum aestivum L. с помошью высокоэффективных методов фенотипирования
Дорoшков А.В., Генаев М.А., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.]
|
|
Методы компьютерного анализа в исследовании опушения листа пшеницы TRITICUM AESTIVUM L.
Дорошков А.В., Генаев М.А., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск]
|
| 2009 |
Using the computer-based image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L.
Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[1st Workshop on plant molecular biotechnology - XV Biotechnology summer school. 5-12 july, Gdansk, Poland]
|
|
АНАЛИЗ МОРФОЛОГИИ И НАСЛЕДОВАНИЯ ОПУШЕНИЯ ЛИСТА У ЯРОВЫХ СОРТОВ И ГИБРИДОВ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ TRITICUM AESTIVUM L.
Дорошков А.В.
[XLVII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-47) г.Новосибирск, 11 – 15 апреля 2009 г.]
|
| 2008 |
Development of the computer approach for defining leaf hairiness in wheat based on its microscope image processing.
D.A. Afonnikov, S.I. Arsenina, A.V. Doroshkov, T.A.Pshenichnikova.
[The Russian-French Conference “Problems and Prospects in Plant Biotechnology”.]
|
|
Структурные и функциональные различия гетерохроматиновых районов политенных хромосом клеток слюнных желёз и слепых придатков желудка Drosophila Melanogaster
Дорошков А.В.
[XLVI Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-46) г.Новосибирск 26 – 30 апреля 2008 г.]
|
Гранты
| 2020 |
Системное изучение механизмов морфогенеза растений на основе данных секвенирования транскриптомов одиночных клеток
Зубаирова У.С., Дорошков А.В., Ермаков А.А., Константинов Д.К., Айриянц К.А., Бобровских А.В.
|
| 2019 |
Системное изучение взаимной регуляции ростовых процессов и водного режима злаков
Зубаирова Ульяна Станиславовна,
Дорошков Алексей Владимирович,
Николаев Сергей Васильевич,
Ромащенко Александр Викторович,
Константинов Дмитрий Константинович,
Бобровских Александр Владимирович,
Ермаков Антон Александрович,
Панихин Павел Александрович
|
|
Экспериментально-теоретическое изучение механизмов устойчивости к солевому стрессу у кукурузы
Ермаков Антон Александрович, Бобровских Александр Владимирович, Дорошков Алексей Владимирович, Зубаирова Ульяна Станиславовна
|
| 2017 |
Изучение особенностей формирования клеточной структуры эпидермиса листа пшеницы при холодовом стрессе
Зубаирова Ульяна Станиславовна, Дорошков Алексей Владимирович
|
| 2016 |
Изучение механизмов формирования клеточной структуры эпидермиса листа однодольных растений на основе автоматической обработки конфокальных изображений
Зубаирова Ульяна Станиславовна Дорошков Алексей Владимирович
|
| 2015 |
Транскрипционная и посттранскрипционная регуляция ауксином и этиленом экспрессии генов в корне Arabidopsis thaliana
Вибе Даниил Станиславович Дорошков Алексей Владимирович Климова Наталья Викторовна Лавреха Виктория Вадимовна Левицкий Виктор Георгиевич Миронова Виктория Владимировна, руководитель, Новикова Дарья Дмитриевна Ощепков Дмитрий Юрьевич Чернова Василина Владимировна Черных Ольга Александровна
|
|
Картирование локусов количественных признаков (QTL), ассоциированных с активностью ферментов антиоксидантной защиты и их связь с физиологическими функциями растения в условиях засухи
Дорошков Алексей Владимирович Морозова Евгения Викторовна Осипова Светлана Владимировна Пермяков Алексей Викторович Пермякова Марина Диомидовна Рудиковская Елена Георгиевна Симонов Александр Владимирович Шишпарѐнок Александр Александрович Щукина Людмила Васильевна
|
| 2014 |
Изучение молекулярных механизмов развития органов растений методами системной биологии
Афонников Д.А., Голушко С.К., Дорошков А.В., Зубаирова У.С., Казанцев Ф.В., Колчанов Н.А., Лавреха В.В., Миронова В.В., Николаев С.В., Новикова Д.Д., Омельянчук Н.А., Пененко А.В., Пшеничникова Т.А., Савина М.С., Саженков С.А., Симонов А.В., Чернова В.В.
|
| 2013 |
Роль ауксина и этилена в регуляции активности генов в корне проростка Arabidopsis thaliana L.: полногеномный подход
Миронова Виктория Владимировна Ермаков Антон Александрович Дорошков Алексей Владимирович Васильев Геннадий Владимирович Казанцев Федор Владимирович Климова Наталья Викторовна Левицкий Виктор Георгиевич Новоселова Екатерина Сергеевна Пономаренко Петр Михайлович Чернова Василина Владимировна
|
Учебные курсы
| 2017 |
Введение в информационную биологию
Колчанов Н.А., Лашин С.А., Фурман Д.П., Афонников Д.А., Землянская Е.В., Дорошков А.В., Бухарина Т.А.
|
| 2015 |
Практикум по начальной специализации "Биоинформатика и системная биология"
|
| 2013 |
Биоинформатика и компьютерная геномика
Миронова В.В., Дорошков А.В.
|
Патенты
| 2018 |
Программа для изучения морфологии и взаимного расположения клеток в эпидермисе листьев злаковых растений (ЛСМ-В) / Program for studying the morphology and relative position of cells in the epidermis of the leaves of cereal plants (LSM-W)
Зубаирова У.С., Верман П.Ю., Дорошков А.В.
|
| 2012 |
Программа автоматического определения количественных характеристик опушения листа (ОЛДетект2) / Software tool for automatically determination of the quantitative characteristics of leaf hairiness in plants (LHDetect2)
Генаев Михаил Александрович, Дорошков Алексей Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Пшеничникова Татьяна Алексеевна
|
| 2010 |
База данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы (ВитПГЕ).
Генаев М.А., Дорошков А.В., Афонников Д.А.
|
Диссертации
| 2012 |
Анализ морфологии и наследования опушения листа у яровых сортов и гибридов мягкой пшеницы Triticum aestivum L.
[Кандидат]
|
|
|
