 |
|
|
Лукьянчикова Варвара Алексеевна, к. б. н.
В данный момент не является сотрудником института
|
Публикации
| 2022 |
Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects
Varvara Lukyanchikova*, Miroslav Nuriddinov*, Polina Belokopytova, Alena Taskina, Jiangtao Liang, Maarten Reijnders, Livio Ruzzante, Romain Feron, Robert Waterhouse, Yang Wu, Chunhong Mao, Zhijian Tu, Igor Sharakhov, and Veniamin Fishman
* authors contributed equally
[NAT COMMUN]
|
| 2021 |
Chromosome-level genome assemblies of the malaria vectors Anopheles coluzzii and Anopheles arabiensis
Zamyatin Anton, Pavel Avdeyev, Jiangtao Liang, Atashi Sharma, Chujia Chen, Varvara Lukyanchikova, Nikita Alexeev, Zhijian Tu, Max A. Alekseyev, Igor V. Sharakhov
[GigaScience]
|
|
Evaluation of the OsTIR1 and AtAFB2 AID Systems for Genome Architectural Protein Degradation in Mammalian Cells
Anastasia Yunusova*, Alexander Smirnov, Tatiana Shnaider, Varvara Lukyanchikova, Svetlana Afonnikova and Nariman Battulin*
[Front Mol Biosci]
|
| 2020 |
On-target CRISPR/Cas9 activity can cause undesigned large deletion in mouse zygotes
Alexey Korablev, Varvara Lukyanchikova, Irina Serova, Nariman Battulin
[INT J MOL SCI]
|
|
The Beginning of the End: A Chromosomal Assembly of the New World Malaria Mosquito Ends with a Novel Telomere
Austin Compton, Jiangtao Liang, Chujia Chen, Varvara Lukyanchikova, Yumin Qi, Mark Potters, Robert Settlage, Dustin Miller, Stephane Deschamps, Chunhong Mao, Victor Llaca, Igor V. Sharakhov, Zhijian Tu
[G3-Genes Genomes Genetics]
|
| 2016 |
Практическое руководство по редактированию геномов системой CRISPR/Cas9
Мензоров А.Г., Лукьянчикова В.А., Кораблев А.Н., Серова И.А., Фишман В.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Система CRISPR/Cas9 – универсальный инструмент геномной инженерии
Смирнов Александр Васильевич Юнусова Анастасия Маратовна Лукьянчикова Варвара Алексеевна Баттулин Нариман Рашитович
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
Конференции
| 2024 |
Tissue-specific effect of the TADs border disruption on the Kdr gene expression
E.Kabirova, A.Ryzhkova, V.Lukyanchikova, A.Khabarova, N.Battulin
[Cold Spring Harbor Asia «Chromatin, Epigenetics & Transcription»]
|
| 2023 |
Взаимосвязь регуляции генов с 3D архитектурой генома на модели локуса Kit/Kdr мыши
Кабирова Э.М., Рыжкова А.С., Лукьянчикова В.А., Хабарова А.А., Баттулин Н.Р.
[INTERNATIONAL CONFERENCE CHROMOSOME 2023]
|
| 2022 |
3D organization of the genome tissue-specifically regulates activity of the development genes Pdgfra, Kit, Kdr in mouse
Kabirova E., Lukyanchikova V., Ryzhkova A., Khabarova A., Battulin N.
[ISCOMS 2022 "29th International Student Congress Of (bio)Medical Sciences"]
|
|
Influence of TADs boundary disruption on 3D genome
organisation and genes expression at the mouse
Pdgfra/Kit/Kdr locus
Kabirova E., Lukyanchikova V., Ryzhkova A., Khabarova A., Battulin N.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
| 2020 |
Unraveling the 3D genome of human malaria vectors
Varvara Lukyanchikova, Miroslav Nuriddinov, Veniamin Fishman, Polina Belokopytova, Alexander Tyapkin, Nariman Battulin, Igor Sharakhov
[XXVI International Congress of Entomology (ICE 2020)]
|
| 2019 |
Hi-C analysis and physical mapping identify inversions in the Aedes aegypti genome.
Atashi Sharma
Varvara Lukyanchikova
Ilja Brusentsov
Igor V. Sharakhov
Maria V. Sharakhova
[Annual Meeting of the Eastern Branch of Entomological Society of America]
|
|
Revealing the principles of 3D genome organization and improving the accuracy of genome assemblies of malaria mosquitoes using Hi-C approach
Varvara Lukyanchikova, Igor V. Sharakhov, Veniamin Fishman, Miroslav Nuriddinov, Nariman Battulin, Oleg L. Serov
[EMBO Workshop "The Genome in Three Dimensions"]
|
|
The Hi-C approach revealed new principles of 3D genome organization in malaria vectors
Igor Sharakhov, Varvara Lukyanchikova, Veniamin Fishman, Miroslav Nuriddinov, Nariman Battulin, Oleg L. Serov
[90th Annual Meeting of the Eastern Branch of the Entomological Society of America]
|
|
The effect of TAD border disruption at the Pdgfra/Kit/Kdr locus on 3D-chromatin structure and gene expression
Varvara Lukyanchikova, Anna Khabarova, Anastasia Ryzhkova, Alexey Korablev, Irina Serova, Nariman Battulin
[Joint Annual Meeting on Epigenetics]
|
|
Uncovering secrets of mosquito Y chromosomes, starting with Anopheles albimanus
Austin Compton, Chunhong Mao, Jiangtao Liang, Varvara Lukyanchikova, Yang Wu, Yumin Qi, Igor Sharakov, Zhijian Tu
[90th Annual Meeting of the Eastern Branch of the Entomological Society of America]
|
| 2018 |
Improving the accuracy of genome assemblies of Anopheles species and revealing the principles of 3D genome organization in dipteran insects using the Hi-C approach
Varvara Lukyanchikova, Veniamin Fishman, Miroslav Nuriddinov, Nariman Battulin, Oleg L Serov, Igor V Sharakhov
[2018 ESA, ESC, and ESBC Joint Annual Meeting]
|
|
The Hi-C approach improved genome assemblies of Anopheles species and revealed principles of 3D genome organization in dipteran insects
Varvara Lukyanchikova, Veniamin Fishman, Miroslav Nuriddinov, Nariman Battulin, Oleg L Serov, Igor V Sharakhov
[CSH Meeting: Nuclear Organization & Function]
|
| 2017 |
Directed modifications in structure of topologically associating domains in mice by CRISPR/Cas9-mediated editing
Varvara Lukyanchikova, Alexey Korablev, Veniamin Fishman, Nariman Battulin
[Genome Engineering: The CRISPR/Cas Revolution]
|
|
Targeted modification of topological domains in mice
Veniamin Fishman, Varvara Lukyanchikova, Oleg Serov, Nariman Battulin
[25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus]
|
| 2016 |
Targeted genome modifications in topologically associating domain's structure in mouse embryonic stem cells
Lukyanchikova V.A., Battulin N.R., Serov O.L.
[From Functional Genomics to Systems Biology]
|
|
Targeted spatial genome modification in topologically associating domains structure in mouse embryonic stem cells
V.A. Lukyanchikova, N.R. Battulin, O.L. Serov
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology]
|
| 2014 |
Producing of mouse embryonic stem cell lines carrying deletions of non-coding chromosomal regions for study of a spatial genome organization
Lukyanchikova V.
[Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2014»]
|
|
The influence of deletions related to non-coding chromosomal region on a spatial genome organization in mouse embryonic stem cells
Lukyanchikova V.
[52я Международная научная студенческая конференция «Студент и научно-технический прогресс» (МНСК-2014г.)]
|
Гранты
| 2020 |
Фундаментальные принципы пространственной организации генома малярийных комаров
Игорь Валентинович Шарахов, Лукьянчикова Варвара Алексеевна
|
| 2019 |
Популяционная геномика и эволюционная история комаров переносчиков заболеваний человека в России
Алексеева Светлана Сергеевна, Артемов Глеб Николаевич, Богомолов Антон Геннадьевич, Брусенцов Илья Иванович, Бурлак Владимир Александрович, Карагодин Дмитрий Александрович, Лукьянчикова Варвара Алексеевна, Мария Владимировна Шарахова, Шарахов Игорь Валентинович, Юрченко Андрей Александрович
|
|
Популяционная геномика и эволюционная история комаров-переносчиков заболеваний человека в России
Шарахова Мария Владимировна
Карагодин Дмитрий Александрович
Брусенцов Илья Иванович
Юрченко Андрей Александрович
Алексеева Светлана Сергеевна
Артемов Глеб Николаевич
Темников Андрей Андреевич
Рязанский Сергей Сергеевич
Шарахов Игорь Валентинович
Лукьянчикова Варвара Алексеевна
|
| 2018 |
Исследование роли пространственной организации генома в регуляции активности генов на примере локуса Pdgfra/Kit/Kdr, с использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9
Фишман Вениамин Семенович
Юнусова Анастасия Маратовна
Хабарова Анна Александровна
Кораблев Алексей Николаевич
Рыжкова Анастасия Сергеевна
Лукьянчикова Варвара Алексеевна
Смирнов Александр Васильевич
Гридина Мария Михайловна
Баттулин Нариман Рашитович
|
|
Исследование реорганизации 3D архитектуры генома в процессе терминальной дифференцировки эритробластов мыши
Лукьянчикова Варвара Алексеевна, Рыжкова Анастасия Сергеевна, Хабарова Анна Александровна, Баттулин Нариман Рашитович, Фишман Вениамин Семенович
|
|
|
