Герасимова Софья Викторовна, к. б. н. Подразделение: 152. Сект. биотех. культурных растений Заведующий: 152. Сект. биотех. культурных растений Должность: старший научный сотрудник Комната: Дистанционная работа Email: gerson@bionet.nsc.ru

Публикации

2024	Accumulation of anthocyanin in the aleurone of barley grains by targeted restoration of the MYC2 gene Egorova A. A., Zykova T. E., Hertig C. W., Hoffie I., Morozov S. V., Chernyak E. I., Rogachev A. D., Korotkova A. M., Vikhorev A. V., Vasiliev G. V., Shoeva O. Y., Kumlehn J., Gerasimova S. V., Khlestkina E. K. [INT J MOL SCI]
	Germination and Growth Characteristics of nud Knockout and win1 Knockout Barley Lines under Salt Stress Antonova, E.V.; Shimalina, N.S.; Korotkova, A.M.; Kolosovskaya, E.V.; Gerasimova, S.V.; Khlestkina, E.K. [Plants]
	Image-Based Quantitative Analysis of Epidermal Morphology in Wild Potato Leaves Zubairova U.S., Fomin I.N., Koloshina K.A., Barchuk A.I., Erst T.V., Chalaya N.A., Gerasimova S.V., Doroshkov A.V. [Plants]
	Reduction in Cold‑Induced Sweetening by Cas9 Endonuclease‑Mediated Knockout of the POTATO VACUOLAR INVERTASE 1 Gene in the Cultivar ‘Symfonia’ Anastasiya A. Egorova, Tatyana E. Zykova, Nina E. Kostina, Izatsho A. Saboiev, Kristina A. Koloshina, Elena A. Filipenko, Iris Hoffie, Christian Hertig, Stefan Hiekel, Jochen Kumlehn, Alex V. Kochetov, Sophia V. Gerasimova [POTATO RES]
2023	WAX INDUCER 1 Regulates β-Diketone Biosynthesis by Mediating Expression of the Cer-cqu Gene Cluster in Barley Gerasimova, S.V.; Kolosovskaya, E.V.; Vikhorev, A.V.; Korotkova, A.M.; Hertig, C.W.; Genaev, M.A.; Domrachev, D.V.; Morozov, S.V.; Chernyak, E.I.; Shmakov, N.A.; Vasiliev, G.V.; Kochetov, A.V.; Kumlehn, J.; Khlestkina, E.K. [INT J MOL SCI]
2022	De Novo Domestication Concept for Potato Germplasm Enhancement Anastasiya A. Egorova, Nadezhda A. Chalaya, Ivan N. Fomin, Alisa I. Barchuk, Sophia V. Gerasimova [Agronomy]
	Developmental and hormonal regulation of Arabidopsis thaliana ornithine-delta-aminotransferase A.A. Egorova, S.V. Gerasimova, A.V. Kochetov [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Seedling Biometry of nud Knockout and win1 Knockout Barley Lines under Ionizing Radiation Antonova E.V., Shimalina N.S., Korotkova A.M., Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Khlestkina E.K. [Plants]
2020	Conversion of hulled into naked barley by Cas endonuclease-mediated knockout of the NUD gene Sophia V. Gerasimova, Christian Hertig, Anna M. Korotkova, Ekaterina V. Kolosovskaya, Ingrid Otto, Stefan Hiekel, Alex V. Kochetov, Elena K. Khlestkina, Jochen Kumlehn [BMC PLANT BIOL]
	Kmasker plants – a tool for assessing complex sequence space in plant species Sebastian Beier, Chris Ulpinnis, Markus Schwalbe, Thomas Münch, Robert Hoffie, Iris Koeppel, Christian Hertig, Nagaveni Budhagatapalli, Stefan Hiekel, Krishna M. Pathi, Goetz Hensel, Martin Grosse, Sindy Chamas, Sophia Gerasimova, Jochen Kumlehn, Uwe Scholz, Thomas Schmutzer [PLANT J]
	The mechanism of potato resistance to Globodera rostochiensis: comparison of root transcriptomes of resistant and susceptible Solanum phureja genotypes Alex V. Kochetov, Anastasiya A. Egorova, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko and Tatjana A. Gavrilenko [BMC PLANT BIOL]
	Создание линии табака со сниженными антифидантными свойствами по отношению к колорадскому жуку. Костина Н.Е., Спасельникова А.В., Егорова А. А., Колосовская Е.В., Домрачев Д.В., Романова А.В., Туманян С.Р., Хамас С., Кумлен Й., Дубовский И.М., Герасимова С.В. [Биология в сельском хозяйстве]
2019	Current achievements in modifying crop genes using CRISPR/Cas system A.M. Korotkova, S.V. Gerasimova, E.K. Khlestkina. [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Оценка количественных характеристик клубнеобразования дикого картофеля на основе анализа изображений клубней с использованием компьютерного приложения SeedСounter К.А. Иванова, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, А.А. Егорова, К.А. Колошина, Н.А. Чала, Д.А. Афонников, А.В. Кочетов, Е.В. Рогозина, С.В. Герасимова [Vavilov journal of genetics and breeding]
2018	Converting Hulled into Naked Barley through Targeted Knock-Out of the Nud1 Gene S. Gerasimova, C. Hertig, A. Korotkova, I. Otto, S. Hiekel, A. Kochetov, J. Kumlehn, E. Khlestkina [IN VITRO CELL DEV-PL]
	Targeted genome modification in protoplasts of a highly regenerable Siberian barley cultivar using RNA-guided Cas9 endonuclease S.V. Gerasimova, A.M. Korotkova, C. Hertig, S. Hiekel, R. Hoffie, N. Budhagatapalli, I. Otto, G. Hensel, V.K. Shumny, A.V. Kochetov, J. Kumlehn, E.K. Khlestkina [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Гены-мишени для метаболической инженерии представителей семейства Solanaceae: эволюция и структурная организация Иванова К.А., Спасельникова А.В., Шумный В.К., Герасимова С.В. [Биология в сельском хозяйстве]
	Регуляция биосинтеза стероидных гликоалкалоидов картофеля К.А. Иванова, С.В. Герасимова, Е.К. Хлесткина [Vavilov journal of genetics and breeding]
2017	Crop genes modified using the CRISPR/Cas system Korotkova A.M., Gerasimova S.V., Shumny V.K., Khlestkina E.K. [Russian Journal of Genetics: Applied Research]
	Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis Alex V. Kochetov, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Salmaz M. Ibragimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Tatyana A. Gavrilenko, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko [BMC PLANT BIOL]
	Genome Editing System CRISPR/CAS9 and Peculiarities of Its Application in Monocots S. V. Gerasimova, E. K. Khlestkina, A. V. Kochetov, V. K. Shumny [RUSS J PLANT PHYSL+]
	Гены сельскохозяйственных растений, модифицированные с помощью системы CRISPR/Cas. Короткова А.М., Герасимова С.В., Шумный В.К., Хлесткина Е.К. [Vavilov journal of genetics and breeding]
	СИСТЕМА CRISPR/CAS9 ДЛЯ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМОВ И ОСОБЕННОСТИ ЕЕ ПРИМЕНЕНИЯ НА ОДНОДОЛЬНЫХ РАСТЕНИЯХ С. В. Герасимова, Е. К. Хлесткина, А. В. Кочетов, В. К. Шумный [Физиология растений]
2016	Production of recombinant proteins in plant cells Gerasimova S.V., Smirnova O.G., Kochetov A.V., Shumny V.K. [RUSS J PLANT PHYSL+]
	Наработка рекомбинантных белков в клетках растений С. В. Герасимова, О. Г. Смирнова, А. В. Кочетов, В. К. Шумный [Физиология растений]
2012	Частичная супрессия гена пролиндегидрогеназы увеличивает устойчивость растений к различным видам абиотических стрессов. С.С. Ибрагимова, Я.С. Колодяжная, С.В. Герасимова, А.В. Кочетов [Физиология растений]
2011	Анализ транскрипционной активности промотора гена дельта-орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana Герасимова С.В., Горелова В.В., Дорогина О.В., Жмудь Е.В., Коваль В.С., Романова А.В., Кочетов А.В., Шумный В.К. [RUSS J GENET+]
	Функции дельта-аминотрансферазы у растений Герасимова С.В., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Шумный В.К. [Успехи современной биологии]
2010	Трансформанты табака, экспрессирующие кДНК гена орнитинаминотрансферазы Medicago truncatula Герасимова С.В., Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Романова А.В., Коваль В.С., Кочетов А.В., Шумный В.К. [Информационный вестник ВОГИС]

Монографии

2020	Изоляция протопластов Solanum tuberosum и Solanum verrucosum и их PEG‑опосредованная трансформация, Егорова А. А., Иванова К. А., Герасимова С. В.
2018	CRISPR/CAS ДЛЯ СЕЛЕКЦИИ И ДОМЕСТИКАЦИИ РАСТЕНИЙ Хлесткина Е. К., Короткова А. М., Иванова К. А., Герасимова С. В.
	ВЕКТОРЫ И РЕПЛИКОНЫ ДЛЯ БИОИНЖЕНЕРИИ РАСТЕНИЙ: ОТ БИОПРОДУКЦИИ К ГЕНОМНОМУ РЕДАКТИРОВАНИЮ Герасимова С. В., Назаренко А. В., Кочетов А. В.
2016	Векторы, репликоны и биопродукция в растениях Герасимова С.В., Назаренко А.В., Кочетов А.В.

Конференции

2024	Направленная модификация гена HvMyc2, связанного с голубой окраской зерна ячменя Т. Е. Зыкова, А. А. Егорова, О. Ю. Шоева, К. Хертиг, С. В. Герасимова, И. Коэппель, Ш. Хикель, А. М. Короткова, Й. Кумлен, Е. К. Хлесткина [VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы]
2023	ИССЛЕДОВАНИЕ МЕХАНИЗМОВ ФОРМИРОВАНИЯ ПРИЗНАКА ПЛЕНЧАТОСТИ / ГОЛОЗЕРНОСТИ ЯЧМЕНЯ НА МОДЕЛИ ИЗОГЕННЫХ ЛИНИЙ,ПОЛУЧЕННЫХ МЕТОДОМ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА А.М. Короткова, А. Скрипилева, А.B. Вихорев, Е.В. Колосовская, С.В. Герасимова, Е.К. Хлесткина [CRISPR-2023]
2022	Поиск дифференциально экспрессирующихся генов в мутантах по гену nud ячменя Короткова А.М., Скрипилева А.И., Вихорев А.В., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Хлесткина Е.К. [Генофонд и селекция растений, 6-я Международная конференция посвященная 135-летию Н. И. Вавилова]
	ПОИСК ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНО ЭКСПРЕССИРУЮЩИХСЯ ГЕНОВ В МУТАНТАХ ПО ГЕНУ NUD ЯЧМЕНЯ Короткова Анна Михайловна, Скрипилева Анастасия Ивановна, Вихорев Александр Викторович, Колосовская Екатерина Вадимовна, Герасимова Софья Викторовна, Хлесткина Елена Константиновна. [ГЕНОМИКА И СОВРЕМЕННЫЕ БИОТЕХНОЛОГИИ В РАЗМНОЖЕНИИ, СЕЛЕКЦИИ И СОХРАНЕНИИ РАСТЕНИЙ (GenBio2022)]
	Differential gene expression analysis in barley Nud gene mutants Korotkova A.M., Skripileva A.I., Vihorev A.V., Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Khlestkina E.K. [13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” – BGRS/SB-2022]
	ПОЛУЧЕНИЕ НОВЫХ ГЕНОТИПОВ КАРТОФЕЛЯ С УСТОЙЧИВОСТЬЮ К ХОЛОДОВОМУ ОСАХАРИВАНИЮ Егорова А.А., Герасимова С.В., Сабоиев И.А., Домрачев Д., Коэппель И., Хикель Ш., Хертиг К., Чамас С., Кумлен Й., Рогозина Е., Чалая Н., Салина Е.А., Кочетов А.В. [XIX ВСЕРОССИЙСКАЯ МОЛОДЕЖНАЯ ШКОЛА-КОНФЕРЕНЦИЯ ПО АКТУАЛЬНЫМ ПРОБЛЕМАМ ХИМИИ И БИОЛОГИИ]
2021	Developing potato varieties with decreased cold-induced sweetening Egorova A., Gerasimova S., Ibragimova S., Romanova A., Saboiev I., Domrachev D., Koeppel I., Hertig C., Hiekel S., Chamas S., Kumlehn J., Rogosina E., Chalaya N., Salina E., Kochetov A. [The 6th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2021)]
	Targeted knockout of the NUD gene in Siberian barley Korotkova A.M., Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Hertig C., Otto I., Kumlehn J., Khlestkina E.K. [PlantGen2021]
	Transcriptome analysis of Nud transgene mutant barley Korotkova A.M., Kolosovskaya E.V. , Gerasimova S.V. , Khlestkina E.K. [SBB-2021 The 13th International Young Scientists School Systems Biology and Bioinformatics]
2020	Identification of an AP2/ERF Transcription Factor Controlling the Synthesis of Barley Epicuticular Wax Ekaterina Kolosovskaya, Sophia Gerasimova, Anna Korotkova, Christian Hertig, Sergey Morozov, Elena Chernyak, Dmitriy Domrachev, Vikhorev Alexander, Nikolay Shmakov, Alexey Kochetov, Jochen Kumlehn, Elena Khlestkina [12-ая Международная мультиконференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии / Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology, BGRS/SB-2020]
	Targeted mutagenesis of the HvMyc2 and HvAnt2 genes in Hordeum vulgare L. Anastasiya Egorova, Ksenia Strygina, Olesya Shoeva, Christian Hertig, Iris Koeppel, Stefan Hiekel, Alexander Vikhorev, Sophia Gerasimova, Jochen Kumlehn, Elena Khlestkina [BGRS-2020]
	АНАЛИЗ ПОПУЛЯЦИИ МУТАНТОВ И ПОЛУЧЕНИЕ ЛИНИЙ РАСТЕНИЙ ПОСЛЕ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ПО ГЕНУ NUD У ЯЧМЕНЯ Короткова А.М., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. [ХХ-я научная конференция молодых ученых «Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и сельскохозяйственной микробиологии»]
	Идентификация регуляторного гена, контролирующего синтез кутикулярного воска ячменя Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Короткова А.М., Хертиг К., Морозов С.В., Черняк Е.И., Домрачев Д.В., Кочетов А.В., Кумлен Й., Хлесткина Е.К. [12-я Международная школа молодых ученых «Системная Биология и Биоинформатика» / 12th International young scientists school «System Biology and Bioinformatics», SBB-2020]
	Изучение генетической регуляции накопления кутику-лярного воска ячменя при помощи анализа данных RNA-seq Вихорев А., Шмаков Н., Колосовская Е., Короткова А., Герасимова С., Хлесткина Е. [12-я Международная школа молодых ученых «Системная Биология и Биоинформатика» / 12th International young scientists school «System Biology and Bioinformatics», SBB-2020]
	Изучение особенностей культивирования и регенерации iv vitro диких видов картофеля Колошина К.А., Иванова К.А., Герасимова С.В. [Генофонд и селекция растений]
	Направленный нокаут гена вакуолярной инвертазы Pain-1 в Solanum tuberosum L. Егорова А.А., Герасимова С.В., Коэппель И., Хамаз С., Хикель Ш., Хертиг К., Ибрагимова С.М., Сабоиев И.А., Нестеров М.А., Кумлен Й., Салина Е.А., Кочетов А.В. [SBB-2020]
	Получение голозерных линий ячменя после направленной модификации гена Nud методом CRISPR/CAS. Короткова А.М., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. [Генофонд и селекция растений]
	Получение линий растений мутантов и анализ полученных популяций после геномного редактирования по гену Nud у ячменя Короткова А.М., Колосовская Е.В., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. [Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2020)]
2019	Fine tuning of anthocyanin synthesis in barley grain by targeted mutagenesis Alexandr Vikhorev, Ksenia Strygina, Sofia Gerasimova, Elena Khlestkina [5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding (CBB 5)]
	ALTERING PLANT DOMESTICATION TRAITS VIA SITE-DIRECTED GENOME MODIFICATION Gerasimova S.V., Ivanova K.A., Hertig C., Korotkova A.M., Hiekel S., Kolosovskaya E., Koloshina K.A., Genaev M.A., Komyshev E.G., Egorova A.A., Domrachev D.V., Rogozina E.V., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K. [VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.]
	ANALYSIS OF BARLEY MUTANT POPULATIONS OBTAINED BY SIMULTANEOUS MUTAGENESIS AT FOUR GENOMIC LOCI Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Hertig С., Korotkova A.M., Kukoeva T.V., Hiekel S., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K. [VII International Congress of Vavilov society of geneticists and breeders and associate symposiums]
	CYP75 gene family in barley Vikhorev A.V., Gerasimova S.V., Strygina K.V., Khlestkina E.K. [Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019): The Eleventh International Young Scientists School]
	Decreasing wild potato toxicity by targeted modification of glycoalkaloid metabolism genes Egorova A.A., Ivanova K.A., Domrachev D.V., Kochetov A.V., Khlestkina E.K., Gerasimova S.V. [Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference 24-29 июня 2019 г., Новосибирск, Россия]
	Identification and characterization of a barley gene controlling cuticle wax formation Gerasimova S., Kolosovskaya E., Hertig C., Hiekel S., Korotkova A., Doroshkov A., Kukoeva T., Domrachev D., Kochetov A., Kumlehn J., Khlestkina E. [Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
	KNOCKOUT OF NICOTINE BIOSYNTHESIS GENES IN NICOTIANA TABACUM USING RNA-GUIDED CAS ENDONUCLEASE Spaselnikova A.V., Egorova A.A., Tomilin M.A., Schedel S., Kumlehn J., Kochetov A.V., Gerasimova S.V. [Международный конгресс "VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПБГУ, и ассоциированные симпозиумы"]
	Targeted knockout of the PAIN-1 gene in Solanum tuberosum Egorova A.A., Gerasimova S.V., Schedel S., Kumlehn J., Kochetov A.V. [VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.]
	WildPetotaDB – a database for genotype and phenotype of wild tuber-bearing species of the genus Solanum L. Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В. [Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference]
	ВЫРАЩИВАНИЕ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ В КЛИМАТИЧЕСКИХ УСЛОВИЯХ СИБИРСКОГО РЕГИОНА Колошина К.А., Иванова К.А., Герасимова С.В. [МЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «РАЗВИТИЕ СЕЛЬСКОГО ХОЗЯЙСТВА НА ОСНОВЕ СОВРЕМЕННЫХ НАУЧНЫХ ДОСТИЖЕНИЙ И ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНЫХ ЦИФРОВЫХ ТЕХНОЛОГИЙ «СИБИРЬ – АГРОБИОТЕХНОЛОГИИ» («САБИТ-2019»), ПОСВЯЩЕННАЯ 50-ЛЕТИЮ СО ДНЯ СОЗДАНИЯ СО ВАСХНИЛ (СО РО]
	ИССЛЕДОВАНИЕ РЕГЕНЕРАЦИОННОГО ПОТЕНЦИАЛА СОРТОВ ЯЧМЕНЯ Короткова А.М., Герасимова С.В., КукоеваТ.В., ХлесткинаЕ.К. [VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы]
	РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО ФЕНОТИПИРОВАНИЯ РАСТЕНИЙ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ Иванова К.А., Комышев Е.Г., Генаев М.А., Колошина К.А., Эрст Т.В., Егорова А.В., Чалая Н.А., Ибрагимова С.М., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Монахова Ю.А, Алексеев Я.И., Хлесткина Е.К., Герасимова С.В. [VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы.]
2018	НОКАУТ КЛЮЧЕВЫХ ГЕНОВ БИОСИНТЕЗА НИКОТИНА N. TABACUM МЕТОДОМ РНК-НАПРАВЛЕННОГО МУТАГЕНЕЗА Спасельникова А.В., Егорова А.А., Домрачев Д.В., Кочетов А.В., Герасимова С.В. [XVIII научная конференция молодых ученых "Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии"]
	Выбор целевых сайтов и направляющих РНК для нокаута генов Nud и Vrs1 ячменя при помощи РНК-направленной эндонуклеазы Герасимова С.В., Хертиг К., Короткова А.М., Хикель С., Кумлен Й., Кочетов А.В., Хлесткина Е.К. [Генофонд и селекция растений]
	Altering Barley Agronomic Traits via Targeted Mutagenesis Sophia V. Gerasimova, A.M. Korotkova, C. Hertig, I. Otto, S. Hiekel, J.Kumlehn, A.V. Kochetov, E.K. Khlestkina. [BGRS-2018]
	Genetic control of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in potato plants Solanum phureja A.A.Egorova, N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya, K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov ["PLANT FUNCTIONING UNDER ENVIRONMENTAL STRESS" SEPTEMBER 12 - 15, 2018, CRACOW, POLAND.]
	Genetic mechanisms of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in Solanum phureja A.A. Egorova, N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya, K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov [Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology” – BGRS\SB-2018]
	THE GAME GENES AS A TARGET FOR DE NOVO DOMESTICATION OF WILD POTATO GERASIMOVA S.V., IVANOVA K.A., KHLESTKINA E.K. [10-ая ШКОЛА МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ «Системная биология и Биоинформатика», SBB-2018]
	МИКРОСАТЕЛЛИТНЫЙ АНАЛИЗ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ ЕГОРОВА А.А., ИВАНОВА К.А., КОЛОШИНА К.А., ГЕРАСИМОВА С.В. [БИОТЕХНОЛОГИЯ В РАСТЕНИЕВОДСТВЕ, ЖИВОТНОВОДСТВЕ И ВЕТЕРИНАРИИ]
	НОКАУТ КЛЮЧЕВЫХ ГЕНОВ БИОСИНТЕЗА НИКОТИНА N. TABACUM МЕТОДОМ РНК-НАПРАВЛЕННОГО МУТАГЕНЕЗА Спасельникова А.В., Егорова А.А., Кочетов А.В., Герасимова С.В. [IV международная конференция «Генофонд и селекция растений» (4-6 апреля 2018 г., Новосибирск, россия ISBN 978-5-91291-034-0]
	Применение системы редактирования генома Cas9/gRNA для доместикации картофеля de novo К.А. Иванова, С.В. Герасимова, А.А. Егорова, Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, Д.В. Домрачев, К.А. Колошина, А.В. Кочетов, Е.К. Хлесткина [Crispr-2018]
	РАЗРАБОТКА МЕТОДИК ФЕНОТИПИРОВАНИЯ ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ КОЛОШИНА К.А., ИВАНОВА К.А., КОМЫШЕВ Е.Г., ГЕНАЕВ М.А., КОЧЕТОВ А.В., ГЕРАСИМОВА С.В. ["ДЕНЬ ПОЛЯ" В РАМКАХ КПНИ ФАНО РОССИИ "РАЗВИТИЕ СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВА КАРТОФЕЛЯ" И НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ И ПРИКЛАДНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ В СЕЛЕКЦИИ И СЕМЕНОВОДСТВЕ КАРТОФЕЛЯ"]
	ФЕНОТИПИЧЕСКИЙ И ГЕНОТИПИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ СИБИРСКИХ ЯРОВЫХ СОРТОВ ЯЧМЕНЯ С РАЗЛИЧНЫМ РЕГЕНЕРАЦИОННЫМ ПОТЕНЦИАЛОМ Короткова А.М., Герасимова С.В., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К. [Генофонд и селекция растений]
2017	SCREENING OF THE RUSSIAN SPRING BARLEY COLLECTION TO SELECT TARGET CULTIVARS AND TARGET GENES FOR FURTHER CRISPR/CAS9-EDITING A.M. Korotkova, S.V. Gerasimova, T.V. Kukoeva, E.K. Khlestkina [Systems Biology and Bioinformatics THE NINTH INTERNATIONAL YOUNG SCIENTISTS SCHOOL SBB-2017]
	CROP GENES MODIFIED USING CRISPR/CAS9 SYSTEM: SYSTEMATIC ANALYSIS OF PUBLISHED REPORTS Korotkova A.M., Gerasimova S.V., Shumny V.K., Khlestkina E.K. [the 4th International conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)]
	СКРИНИНГ КОЛЛЕКЦИИ ЯРОВОГО ЯЧМЕНЯ НА СПОСОБНОСТЬ К КАЛЛУСООБРАЗОВАНИЮ, РЕГЕНЕРАЦИИ, ТРАНСФОРМАЦИИ И РАЗРАБОТКА ДИАГНОСТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ДЛЯ ГЕНОВ NUD И VRS1 Короткова А.М., Герасимова С.В., Кукоева T.В., Хлесткина E.K. [Генофонд и селекция растений, 3-я Международная конференция, посвященная 130-летию Н.И. Вавилова]
	CRISPR/Cas FOR PLANT DOMESTICATION AND BREEDING KHLESTKINA E.K., KOROTKOVA A.M., GERASIMOVA S.V., IVANOVA K.A., KOCHETOV A.V., SHUMNY V.K. [Международная конференция, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева.]
	Genome editing in Siberian barley. Gerasimova S.V., Korotkova A.M., Khlestkina E.K. [the 4th International conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)]
	Анализ транскрипционной регуляции промотора гена орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana A.A. Егорова, В.В. Горелова, С.В. Герасимова [БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева]
	ГЕНЫ SP И SGT ДИКИХ ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ КАК МИШЕНИ ДЛЯ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ С ЦЕЛЬЮ ДОМЕСТИКАЦИИ DE NOVO Иванова К.А., Герасимова С.В., Кочетов А.В., Рогозина Е.В., Киру С.Д., Хлесткина Е.К. [IV ВАВИЛОВСКАЯ МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ "ИДЕИ Н. И. ВАВИЛОВА В СОВРЕМЕННОМ МИРЕ"]
	ЗНАЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ КОЛЛЕКЦИЙ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ЗАДАЧ ПРЯМОЙ И ОБРАТНОЙ ГЕНЕТИКИ РАСТЕНИЙ Хлесткина Е.К.*, Афонников Д.А., Бернер А., Быкова И.В., Васильев Г.В., Герасимова С.В., Глаголева А.Ю., Гордеева Е.И., Григорьев Ю.Н., Короткова А.М., Пшеничникова Т.А., Стрыгина К.В., Шацкая Н.В., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Юдина Р.С. [III МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ГЕНОФОНД И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ», ПОСВЯЩЕННАЯ 130-ЛЕТИЮ Н.И. ВАВИЛОВА (28.03. – 30.03.2017)]
	ПОСТАНОВКА МЕТОДА ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ДЛЯ СИБИРСКИХ СОРТОВ ЯРОВОГО ЯЧМЕНЯ С.В. Герасимова, А.М. Короткова, Е.К. Хлесткина [БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева]
2016	Identification and tagging of allelic variants of the Nud gene in the siberin barley collection Korotkova A., Kukoeva T., Gerasimova S., Khlestkina E. [The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)]
	Knockout of Nud and Vrs genes in barley using CRISPR/Cas system Gerasimova S.V., Kochetov A.V., Khlestkina E.K. [The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)]
	The plant δOAT gene is active in proliferating tissues Egorova A.A., Kochetov A.V., Gerasimova S.V. [The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)]
2010	The physiological role of deltaOAT gene in plant development and stress response Gerasimova S.V., Gorelova V.V., Romanova A.V., Koval V.S., Kochetov A.V. [Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk]

Гранты

2020	Создание новых доноров для селекции картофеля методом редактирования геномов Герасимова Софья Викторовна, Домрачев Дмитрий Васильевич, Егорова Анастасия Александровна, Иванова Ксения Анатольевна, Филипенко Елена Анатольевна, Чалая Надежда Александровна, Эрст Татьяна Владимировна
2018	Новый подход к созданию безопасных растительных систем экспрессии чужеродных белков: снижение природной токсичности табака методом геномного редактирования Герасимова Софья Викторовна Домрачев Дмитрий Васильевич Егорова Анастасия Александровна Спасельникова Алиса Валерьевна
	Разработка платформы для доместикации картофеля de novo Герасимова Софья Викторовна Домрачев Дмитрий Васильевич Иванова Ксения Анатольевна Егорова Анастасия Александровна Колошина Кристина Андреевна
2016	Поиск целевых генов и оптимизация подходов по модификации геномов для получения новых форм злаков с заранее заданными свойствами Хлесткина Елена Константиновна, Герасимова Софья Викторовна, Гордеева Елена Ивановна, Шоева Олеся Юрьевна, Амстиславская Тамара Геннадьевна, Короткова Анна Михайловна, Кукоева Татьяна Владимировна, Глаголева Анастасия Юрьевна, Павлов Константин Сергеевич, Стрыгина Ксения Владимировна
2010	Молекулярные механизмы стресс-специфического контроля экспрессии генов животных Дымшиц Г.М., Меркулова Т.И., Раушенбах И.Ю., Кочетов А.В., Грунтенко Н.Е., Попова Н.А., Адоньева Н.В., Васильев Г.В., Левицкий В.Г., Вишневский О.В., Антонцева Е.В., Пахарукова М.Ю., Карпова Е.К., Богомолова Е.В., Иванов М.К., Федосеева Л.А., Ощепков Д.Ю., Шарипов Р.Н., Глушков С.А., Ведерников В.Е., Брызгалов Л.О., Климова Н.В., Сангаев С.С., Волкова О.А., Ершов Н.И., Герасимова С.В., Брагин А.Г., Прасолова М.А., Рязанова М.А., Прокопьев Р.А., Горелова В.В., Савельева А.В., Попов Е.Г., Шевелев О.Б., Климов Л.О.

Научное руководство

2023	Влияние мутаций в гене вакуолярной инвертазы Pain-1 на метаболизм сахаров в клубнях картофеля [Зыкова Татьяна Евгеньевна]
2019	Анализ молекулярных процессов, происходящих в корнях картофеля Solanum phureja при заражении золотистой картофельной нематодой Globodera rostochiensis Герасимова Софья Викторовна [Егорова Анастасия Александровна]
	Гены метаболизма алкалоидов табака как мишени для геномного редактирования Герасимова Софья Викторовна [Спасельникова Алиса Валерьевна]
	Анализ генотипа и фенотипа линий ячменя, мутантных по генам транскрипционных факторов типа AP2/ERF Герасимова Софья Викторовна [Колосовская Екатерина Вадимовна]
	Нокаут генов семейства РМТ в растениях Nicotiana tabacum Герасимова Софья Викторовна [Томилин Матвей Алексеевич]
	Получение трансгенных растений Nicotiana tabacum, стабильно экспрессирующих ген белка оболочки бактериофага MS2 Герасимова Софья Викторовна [Байрамова Дарья Олеговна]
2017	Исследование участия гена орнитинаминотрансферазы в ростовых процессах растений Герасимова Софья Викторовна [Егорова Анастасия Александровна]

Учебные курсы

2021	Молекулярная генетика развития растений
2018	Генетика развития растений с основами физиологии Герасимова С.В.

Патенты

2023	Способ получения нетрансгенных мутантных растений табака со сниженным содержанием никотина Костина Н.Е., Томилин М.А., Домрачев Д.В., Фомин И.Н., Егорова А.А., Герасимова
2021	База данных генотипа и фенотипа диких видов картофеля (WildPetotaDB) / A database of the genotype and phenotype of wild potato species (WildPetotaDB) Комышев Е.Г., Колошина К.А., Фомин И.В., Колосовская Е.В., Генаев М.А., Эрст Т.В., Егорова А.А., Чалая Н.А., Рогозина Е.В., Герасимова С.В.