 |
|
|
Клименко Александра Игоревна, к. б. н.
|
Scopus: 56988827400РИНЦ: 2437-7560Гугл-академия: https://orcid.org/0000-0003-1877-9107Индекс WOS: F-2291-2019
Публикации
| 2024 |
Biocontrol Potential of the New Codling Moth Granulovirus (CpGV) Strains
Aleksandra A. Tsygichko, Anzhela M. Asaturova, Tatiana N. Lakhova, Alexandra I. Klimenko, Sergey A. Lashin and Gennady V. Vasiliev
[Microorganisms]
|
|
Analysis of the effects of the Vrn-1 and Ppd-1 alleles on adaptive and agronomic traits in common wheat (Triticum aestivum L.)
Plotnikov K.O., Klimenko A.I., Ovchinnikova E.S., Lashin S.A., Goncharov N.P.
[Plants]
|
|
Assembly and Genome Annotation of Different Strains of Apple Fruit Moth Virus (Cydia pomonella granulovirus)
Tatiana N. Lakhova, Aleksandra A. Tsygichko, Alexandra I. Klimenko, Vladimir Y. Ismailov, Gennady V. Vasiliev, Anzhela M. Asaturova, Sergey A. Lashin
[INT J MOL SCI]
|
|
New Cydia pomonella granulovirus strain with high entomopathogenic activity
Aleksandra A. Tsygichko, Anzhela M. Asaturova, Gennady V. Vasiliev, Alexandra I. Klimenko, Sergey A. Lashin, Tatiana N. Lakhova
[Microbiol Resour Announc]
|
| 2023 |
Trait-Based Method of Quantitative Assessment of Ecological Functional Groups in the Human Intestinal Microbiome
Andrew I. Kropochev, Sergey A. Lashin, Yury G. Matushkin, Alexandra I. Klimenko
[Biology]
|
|
A New Visualization and Analysis Method for a Convolved Representation of Mass Computational Experiments with Biological Models
Klimenko A.I., Vorobeva D.A., Lashin S.A.
[Mathematics]
|
|
Bioinformatic Analysis Reveals the Role of Translation Elongation Efficiency Optimisation in the Evolution of Ralstonia Genus
Korenskaia A.Y., Matushkin Y.G., Mustafin Z.S., Lashin S.A., Klimenko A.I.
[Biology]
|
|
Молекулярные механизмы оптимизации элонгации трансляции существенно различаются у бактерий, имеющих и не имеющих кластеры генов биосинтеза нерибосомных пептидов
А. И. Клименко, С. А. Лашин, Н. А. Колчанов, Д. А. Афонников, Ю. Г. Матушкин
[Молекулярная биология]
|
| 2022 |
Bioinformatic Assessment of Factors Affecting the Correlation between Protein Abundance and Elongation Efficiency in Prokaryotes
Aleksandra E. Korenskaia, Yury G. Matushkin, Sergey A. Lashin, Alexandra I. Klimenko
[INT J MOL SCI]
|
|
ICBrainDB: An Integrated Database for Finding Associations between Genetic Factors and EEG Markers of
Depressive Disorders
Роман Иванов;
Федор Казанцев;
Евгений Заварзин;
Александра Клименко;
Наталья Милахина;
Юрий Матушкин;
Александр Савостьянов;
Сергей Лашин.
[J. Pers. Med]
|
|
Easy and Effective Method for Extracting and Purifying Wolbachia Genomic DNA
Andreenkova O.V., Shishkina O.D., Klimenko A.I., Korenskaia A.E., Bobrovskikh M.A., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E.
[INT J MOL SCI]
|
|
New Wolbachia pipientis Genotype Increasing Heat Stress Resistance of Drosophila melanogaster Host Is Characterized by a Large Chromosomal Inversion
Korenskaia A.E., Shishkina O.D., Klimenko A.I., Andreenkova O.V., Bobrovskikh M.A., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E.
[INT J MOL SCI]
|
| 2021 |
Do Autism Spectrum and Autoimmune Disorders Share Predisposition Gene Signature Due to mTOR Signaling Pathway Controlling Expression?
Ekaterina A. Trifonova, Alexandra I. Klimenko, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov
[INT J MOL SCI]
|
|
Leave or Stay: Simulating Motility and Fitness of Microorganisms in Dynamic Aquatic Ecosystems
Alexandra Klimenko, Yury Matushkin, Nikolay Kolchanov, Sergey Lashin
[Biology]
|
|
The Web Platform for Storing Biotechnologically Significant Properties of Bacterial Strains
Aleksey M. Mukhin, Fedor V. Kazantsev, Alexandra I. Klimenko, Tatiana N. Lakhova, Pavel S. Demenkov, Sergey A. Lashin
[Lect Notes Comput Sci]
|
| 2020 |
В.А. Лихошвай: учитель, ученый, собеседник
Клименко А.И.
[Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции]
|
|
Компьютерное моделирование эволюции микробной популяции: преодоление локальных минимумов при достижении пика на ландшафте приспособленности
С. А. Лашин, З. С. Мустафин, А. И. Клименко, Д. А. Афонников, Ю. Г. Матушкин
[Генетика]
|
| 2019 |
Reconstruction and Analysis of Gene Networks of Human Neurotransmitter Systems Reveal Genes with Contentious Manifestation for Anxiety, Depression, and Intellectual Disabilities
Иванов Роман Артемович
Замятин Владимир
Клименко Александра Игоревна
Матушкин Юрий Георгиевич
Савостьянов Александр Николаевич
Лашин Сергей Александрович
[Genes]
|
|
Spatial heterogeneity promotes antagonistic evolutionary scenarios in microbial community explained by ecological stratification: a simulation study
Klimenko A.I., Matushkin Y.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A.
[ECOL MODEL]
|
|
The mTOR Signaling Pathway Activity and Vitamin D Availability Control the Expression of Most Autism Predisposition Genes
Ekaterina A. Trifonova, Alexandra I. Klimenko, Zakhar S. Mustafin, Sergey A. Lashin, Alex V. Kochetov
[INT J MOL SCI]
|
| 2018 |
Биоинформатический анализ кластеров генов биосинтеза нерибосомных пептидов бактерий на основе предсказания. эффективности элонгации трансляции
А.И. Клименко, Ю.Г. Матушкин, Д.А. Афонников
[V МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ “ПОСТГЕНОМ’2018”. В ПОИСКАХ МОДЕЛЕЙ ПЕРСОНАЛИЗИРОВАННОЙ МЕДИЦИНЫ]
|
|
Моделирование эволюции усложнения и упрощения метаболизма прокариот в пространственно-гетерогенных средах
Клименко А.И., Мустафин З.С., Лашин С.А., Матушкин Ю.Г.
[Доклады Международной конференции “Математическая биология и биоинформатика”]
|
| 2017 |
AltORFev facilitates the prediction of alternative open reading frames in eukaryotic mRNAs
Kochetov Alex V., Allmer Jens, Klimenko Alexandra I., Zuraev Bulat S., Matushkin Yury G., Lashin Sergey A.
[BIOINFORMATICS]
|
| 2016 |
A Review of Simulation and Modeling Approaches in Microbiology
A. I. Klimenko, Z. S. Mustafin, A. D. Chekantsev, R. K. Zudin, Yu. G. Matushkin, S. A. Lashin
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Bacteriophages affect evolution of bacterial communities in spatially distributed habitats: a simulation study
Klimenko A.I., Matushkin Yu.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A.
[BMC MICROBIOL]
|
| 2015 |
Modeling evolution of spatially distributed bacterial communities: a simulation with the haploid evolutionary constructor»
Klimenko A.I., Matushkin Yu.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A.
[BMC EVOL BIOL]
|
|
Современные подходы к математическому и компьютерному моделированию в микробиологии
Клименко А.И., Мустафин З.С., Чеканцев А.Д., Зудин Р.К., Матушкин Ю.Г., Лашин С.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2014 |
HEC 2.0: improved simulation of the evolution of prokaryotic communities
Lashin S.A., Klimenko A.I., Mustafin Z.S., Kolchanov N.A., Matushkin Yu.G.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
Монографии
| 2021 |
The Web Platform for Storing Biotechnologically Significant Properties of Bacterial Strains
Mukhin A. M., Kazantsev F.V., Klimenko A.I., Lakhova T.N., Demenkov P.S., Lashin S.A.
|
| 2014 |
Evolution, Biodiversity and Ecology in Microbial Communities: Mathematical Modeling and Simulation with the “Haploid Evolutionary Constructor” Software Tool
Lashin S.A., Matushkin Yu.G., Klimenko A.I., Suslov V.V., Kolchanov N.A.
|
Конференции
| 2024 |
Genome analysis of novel strains of Cydia
pomonella granulovirus from Russia
Lakhova T., Klimenko A., Tsygichko A., Ismailov V., Vasiliev G., Asaturova A., Lashin S.
[14th International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology]
|
|
Анализ адаптационно‑значимого для хозяина штамма wMelPlus эндосимбиотической бактерии Wolbachia и его влияния на транскриптом Drosophila melanogaster
О. Д. Шишкина, М. А. Дерюженко, О. В. Андреенкова, М. А. Бобровских, Н. В. Шацкая, Г. В. Васильев, А. И. Клименко, А. Е. Коренская, Н. Е. Грунтенко
[VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы]
|
| 2023 |
Методы математического и компьютерного моделирования в исследование метаболизма L-аминокислот бактерии C. glutamicum
Казанцев Ф.В., Трофимова М.Ф., Клименко А.И., Лашин С.А.
[IX Пущинская конференция «Биохимия, физиология и биосферная роль микроорганизмов»]
|
|
Геномный анализ штаммов-эндофитов рода Bacillus: поиск генов, участвующих в осуществлении антифунгальной активности и взаимодействии с растением
Александра Коренская, Cecile Ben, Laurent Gentzbittel, Сергей Лашин, Александра Клименко
[III Международная конференция «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов»]
|
|
Анализ штамма Wolbachia wMelPlus, повышающего
стрессоустойчивость Drosophila melanogaster
Шишкина О.Д., Андреенкова О.В., Шацкая Н.В., Клименко А.И., Коренская А.Е., Грунтенко Н.Е.
[Всероссийская конференция с международным участием «Дрозофила 2023»]
|
| 2022 |
Bioinformatic assessment of factors affecting the correlation between protein abundance and elongation efficiency in prokaryotes
Korenskaia A.E., Matushkin Yu.G., Lashin S.A., Klimenko A.I.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Data lake platform of the bacterial strain properties
for microbiology
Mukhin A., Demenkov P., Kazantsev F., Lakhova T., Klimenko A.,
Lashin S
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Finding the ways for potential increasing of L-valine
biosynthesis yield in C. glutamicum with mathematical modeling
Kazantsev F., Klimenko A., Kropochev A., Trofimova M., Lashin S
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Genetic markers and neurophysiological correlates
of the psychological personality traits among people
from different regions of Siberia
Savostyanov A., Tamozhnikov S., Karpova A., Kavai-Ool U., Ivanov A.,
Kazantsev F., Klimenko A., Lashin S.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Genome assembly of a new Wolbachia pipientis strain:
a promising source for studying Drosophila melanogaster
endosymbiosis
Klimenko A.I., Korenskaia A.E., Shishkina O.D., Andreenkova O.V., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Integration of transcriptomic, genomic, and proteomic data in order to assess the impact of translation efficiency features on protein abundance for various prokaryotes
Korenskaia A.E., Matushkin Yu.G., Lashin S.A., Klimenko A.I.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Modelling of eco-evolutionary dynamics in microbial
communities with haploid evolutionary constructor
Klimenko A.I., Matushkin Yu.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Synthetic community analysis by the trait-based method
of quantitative assessment of ecological functional groups
Kropochev A., Lashin S., Klimenko A.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ ГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ ШТАММОВ WOLBACHIA PIPIENTIS, РАЗЛИЧАЮЩИХСЯ ПО ВЛИЯНИЮ НА СТРЕССОУСТОЙЧИВОСТЬ DROSOPHILA MELANOGASTER
Шишкина О.Д., Андреенкова О.В., Клименко А.И., Коренская А.Е., Васильев Г.В., Шацкая Н.В., Грунтенко Н.Е.
[HSG-2022: III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике"]
|
| 2021 |
The method of computer reconstruction of the ecological
structure of intestinal microbiota communities based
on metatranscriptome data
Kropochev A., Lashin S.A., Klimenko A.I.
[SBB-2021 The 13th International Young Scientists School Systems Biology and Bioinformatics]
|
|
ICBrainDB: Database With EEG Activity and Associated Gene Mutations
Kazantsev F.V., Ivanov R.A., Klimenko A.I., Zavarzin E.A., Saprigyn A.E., Lashin S.A.
[The 20th World Congress of Psychophysiology (IOP2021) . Chengdu, China, Online (September 7-11, 2021)]
|
|
Computer reconstruction of the ecological structure of intestinal microbiota communities based on high-throughput sequencing data
Кропочев А.И., Клименко А.И., Лашин С.А.
[12 международная мультиконференция BGRS/SB-2020]
|
|
ICBrainDB: database with EEG activity and associated gene mutations
Иванов Роман Артемович
Казанцев Федор Владимирович
[13 Международная Школа молодых ученых «Системная биология и Биоинформатика» SBB-2021]
|
|
ROLE OF THE ALLELIC POLYMORPHISM OF THE BRAIN NEUROTRANSMITTERS SYSTEMS IN A FORMATION OF PERSONALITY FEATURES OF SOCIAL BEHAVIOR IN PEOPLE, LIVING IN DIFFERENT REGIONS OF SIBERIA AND MONGOLIA
Савостьянов Александр Николаевич
Лашин Сергей Александрович
Клименко Александра Игоревна
Таможников Сергей Сергеевич
Милахина Наталья Сергеевна
Бочаров Андрей В.
Ефимов Вадим Михайлович
Матушкин Юрий Георгиевич
Васильев Геннадий Владимирович
Иванов Роман Артемович
Князев Геннадий Георгиевич
[XVII INTERNATIONAL INTERDISCIPLINARY CONGRESS NEUROSCIENCE FOR MEDICINE AND PSYCHOLOGY]
|
|
The Web Platform for Storing Biotechnologically Significant Properties of Bacterial Strains
Aleksey M. Mukhin , Fedor V. Kazantsev, Alexandra I. Klimenko, Tatiana N. Lakhova, Pavel S. Demenkov, and Sergey A. Lashin
[International Conference on Parallel Computing Technologies]
|
|
МОДЕЛИРОВАНИЕ ИЗМЕНЕНИЙ ПРИСПОСОБЛЕННОСТИ
И ПОДВИЖНОСТИ МИКРООРГАНИЗМОВ
В ИЗМЕНЯЮЩИХСЯ ВОДНЫХ ЭКОСИСТЕМАХ
Клименко А.И., Лашин С.А., Матушкин Ю.Г.
[Международный конгресс Биотехнология: состояние и перспективы развития.]
|
|
Метод компьютерной реконструкции экологической структуры сообществ
кишечной микробиоты на основе данных высокопроизводительного
секвенирования
Кропочев Андрей Игоревич, Клименко Александра Игоревна
[Конференция «Ломоносов 2021»]
|
| 2020 |
Motility and fitness of microorganisms in dynamic aquatic ecosystems: a simulation study
Клименко А.И., Матушкин Ю.Г., Лашин С.А.
[12 международная мультиконференция BGRS/SB-2020]
|
|
Predicting elongation efficiency of gene translation for annotation of bacterial genomes: a case study for biosynthetic gene clusters of nonribosomal peptides
Клименко А.И., Матушкин Ю.Г., Афонников Д.А.
[12 международная мультиконференция BGRS/SB-2020]
|
|
Компьютерная реконструкция экологической структуры сообщества кишечной микробиоты на основе высокопроизводительного секвенирования
Кропочев А.И., Клименко А.И., Лашин С.А.
[12 межд. конф. BGRS/SB-2020]
|
| 2019 |
Antagonistic evolutionary scenarios in microbial communities are played out under ecological stratification fostered by spatial gradients
A.I. Klimenko, Yu.G. Matushkin, N.A. Kolchanov, S.A. Lashin
[The International Society for Ecological Modelling Global Conference 2019]
|
|
Dysregulation of postsynaptic translation in autism spectrum disorder: reconstruction of gene network associated with autism and mtor signaling.
Rifonova E.A., Klimenko A.I., Saik O.V., Orlov Y.L., Lashin S.A., Ivanisenko V.A.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.]
|
|
Биоинформационный анализ путей регуляции экспрессии генов предрасположенности к аутизму
Клименко А.И., Трифонова Е.А., Лашин С.А., Кочетов А.В.
[Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»]
|
|
Компьютерная реконструкция экологической структуры синтетического микробного сообщества, моделирующего ядро микробиоты кишечника человека
Кропочев А.И., Клименко А.И., Лашин С.А.
[11 международная школа молодых ученых SBB-2019]
|
|
Методы компьютерного моделирования иерархических биологических систем
Лашин С. А., Матушкин Ю. Г., Клименко А. И., Казанцев Ф. В., Лахова Т. Н., Смирнова А. А.
[«Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)]
|
|
Реконструкция генных сетей нейротрансмиттерных систем человека
Р.А. Иванов, А. И. Клименко, А. Н. Савостьянов, С.А. Лашин
[«Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики 2019» (АПВПМ-2019)]
|
| 2018 |
Биоинформатический анализ кластеров генов биосинтеза нерибосомных пептидов бактерий на основе предсказания эффективности элонгации трансляции
А.И. Клименко, Ю.Г. Матушкин, Д.А. Афонников
[V МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ “ПОСТГЕНОМ’2018” В ПОИСКАХ МОДЕЛЕЙ ПЕРСОНАЛИЗИРОВАННОЙ МЕДИЦИНЫ]
|
|
Adaptive strategies of motile bacteria in dynamic aquatic ecosystems. A simulation study.
A.I. Klimenko, Yu.G. Matushkin, S.A. Lashin
[BGRS 2018]
|
|
Spatial heterogeneity influences evolutionary scenarios in microbial communities explained by ecological stratification: a simulation study
A.I. Klimenko,Yu.G. Matushkin, S.A. Lashin
[Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology (MM-HPC-BBB-2018)]
|
|
Моделирование эволюции усложнения и упрощения метаболизма прокариот в пространственно-гетерогенных средах
Клименко А.И., Мустафин З.С., Лашин С.А., Матушкин Ю.Г.
[VII Международная конференция «Математическая биология и биоинформатика»]
|
|
Программные средства для построения и анализа сложных моделей микробного метаболизма и микробных сообществ
Лашин С.А, Матушкин Ю.Г., Клименко А.И., Афонников Д.А.,
Казанцев Ф.В., Лихошвай В.А., Мустафин З.С., Колчанов Н.А.
[Школа-конференция «Генетика микроорганизмов: от геномики к биоэкономике»]
|
| 2017 |
Пространственная гетерогенность способствует локальному поддержанию антагонистических эволюционных сценариев в моделях микробных сообществ
А.И. Клименко, Ю.Г. Матушкин, С.А. Лашин
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
|
|
Фаговая инфекция замедляет видообразование, вызванное горизонтальным переносом и потерей генов метаболизма в моделях пространственно гетерогенных микробных сообществ
Ю.Г. Матушкин, А.И. Клименко, Н.А. Колчанов, С.А. Лашин
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
|
| 2016 |
ALTORFEV: A NOVEL TOOL FOR PREDICTION OF ALTERNATIVE ORFS BASED ON THE LINEAR SCANNING MODEL
B.S. Zuraev, A.V. Kochetov, A.I. Klimenko, S.A. Lashin
[The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
HAPLOID EVOLUTIONARY CONSTRUCTOR 3D: A TOOL FOR MULTILAYER MODELING OF SPATIALLY DISTRIBUTED MICROBIAL COMMUNITIES
A.I. Klimenko, Yu.G. Matushkin, Z.S. Mustafin, A.D. Chekantsev, R.K. Zudin, S.A. Lashin
[The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
HEC 3D: A TOOL FOR MULTILAYER MODELING OF SPATIALLY DISTRIBUTED MICROBIAL COMMUNITIES
Клименко А.И., Матушкин Ю.Г., Мустафин З.С., Чеканцев А.Д., Зудин Р.К., Лашин С.А.
[Systems Biology and Bioinformatics (SBBI’2016)]
|
|
PHAGE INFECTION SLOWS DOWN SPECIATION CAUSED BY GENE LOSS AND HORIZONTAL GENE TRANSFER OF METABOLIC GENES IN MODELS OF SPATIALLY DISTRIBUTED BACTERIAL COMMUNITIES
A. I. Klimenko, Yu.G. Matushkin, N.A. Kolchanov, S.A. Lashin
[The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
ГЭК 3D: инструмент для многоуровневого моделирования пространственно распределённых микробных сообществ
Клименко А. И., Мустафин З.С., Матушкин Ю. Г., Лашин С. А.
[XVII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям (YM2016)]
|
| 2015 |
Комплексные модели микробных сообществ
Лашин С.А., Клименко А.И., Мустафин З.С., Зудин Р.К., Чеканцев А.Д., Матушкин Ю.Г.
[Международная конференция «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики – 2015»]
|
|
Haploid evolutionary constructor 3D: a software for simulation of spatially distributed microbial communities
Lashin S.A., Klimenko A.I., Mustafin Z.S., Chekantsev A.D., Zudin R.K., Matushkin Yu.G.
[EMBO | EMBL Symposium “New Approaches and Concepts in Microbiology”]
|
|
Исследование моделей эволюции геномов одноклеточных организмов для пространственно распределённых популяций
Матушкин Ю.Г., Клименко А.И., Лашин С.А.
[VIII Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития»]
|
| 2014 |
Haploid Evolutionary Constructor 3D: a tool for simulation of spatially distributed prokaryotic communities
Lashin S.A., Klimenko A.I., Mustafin Z.S., Chekantsev A.D., Zudin R.K., Matushkin Yu.G.
[The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
Spatially distributed bacterial communities: simulation with «Haploid Evolutionary Constructor»
Klimenko A.I., Matushkin Yu.G., Lashin S.A.
[The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
|
|
Модели коэволюции в трофических сообществах одноклеточных организмов: влияние пространственной неоднородности
Ю.Г.Матушкин, А.И.Клименко, С.А.Лашин
[V международная конференция «Математическая биология и биоинформатика»]
|
|
Проблемы эволюции путем горизонтального переноса генов
Клименко А.И., Лашин С.А., Суслов В.В.
[Развитие жизни в процессе абиотических изменений на Земле]
|
|
Пространственно распределенные модели эволюции в симбиотических/антагонистических прокариотических сообществах
Матушкин Ю.Г., Клименко А.И., Лашин С.А.
[VI Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров и ассоциированные генетические симпозиумы]
|
| 2012 |
Haploid evolutionary constructor: a graphical user interface for simulating bacterial communities evolution
Klimenko A.I., Lashin S.A.
[The Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS'2012)]
|
|
Гаплоидный эволюционный конструктор: графический интерфейс для моделирования эволюции бактериальных сообществ
Клименко А.И., Лашин С.А., Матушкин Ю.Г.
[XIII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям]
|
Гранты
| 2022 |
Разработка биоинформатических методов количественного функционального анализа экологической структуры симбиотической микробиоты кишечника человека на основе данных высокопроизводительного секвенирования
Клименко Александра Игоревна, Кропочев Андрей Игоревич
|
| 2021 |
Исследование возможного механизма регуляции
стрессоустойчивости насекомых внутриклеточным
симбионтом на модели Wolbachia pipientis - Drosophila
melanogaster
Андреенкова Ольга Владимировна, Бурдина Елена Владимировна, Грунтенко Наталия Евгеньевна, Бобровских Маргарита Александровна, Клименко Александра Игоревна, Коренская Александра Евгеньевна, Шишкина Ольга Дмитриевна, Шацкая Наталья Владиславовна, Дерюженко Максим Александрович
|
Научное руководство
| 2023 |
Анализ параметрической чувствительности моделей динамических систем на основе данных численного моделирования
Клименко Александра Игоревна
[Воробьева Диана Александровна]
|
|
Анализ характеристик элонгации трансляции
генов сети биосинтеза валина у бактерий рода Corynebacterium
Клименко Александра Игоревна
[Чижонков Иван Игоревич]
|
|
Разработка биоинформатических методов геномного анализа эндосимбиотических
бактерий
Клименко Александра Игоревна
[Коренская Александра Евгеньевна]
|
| 2021 |
Биоинформатический анализ характеристик элонгации трансляции у бактерий рода Ralstonia
Клименко Александра Игоревна
[Коренская Александра Евгеньевна]
|
| 2020 |
РАЗРАБОТКА МЕТОДА КОМПЬЮТЕРНОЙ РЕКОНСТРУКЦИИ ЭКОЛОГИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ СООБЩЕСТВ КИШЕЧНОЙ МИКРОБИОТЫ НА ОСНОВЕ ДАННЫХ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ
[Кропочев Андрей Игоревич]
|
Патенты
| 2023 |
Программа для анализа экологической структуры симбиотической микробиоты кишечника человека (ЭкоСтруктСМКЧ) / Program for the analysis of the ecological structure of the symbiotic human gut microbiota (EcoStructSHGM)
Кропочев Андрей Игоревич, Клименко Александра Игоревна
|
| 2022 |
База данных по аллельным полиморфизмам генов нейромедиаторных систем, показателям психологических тестов и параметрам электроэнцефалограмм (ЭЭГен) / Database of allelic polymorphisms of genes of neurotransmitter systems, indicators of psychological tests and parameters of electroencephalograms (ICBrainDB)
Заварзин Е.А., Иванов Р.А., Казанцев Ф.В., Клименко А.И., Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Милахина Н.С., Савостьянов А.Н.
|
| 2021 |
Биотехнологически значимые штаммы бактерий (МикроБиотех) / Biotechnologically significant strains of bacteria (MicroBiotech)
Мухин А.М., Лахова Т.Н., Клименко А.И., Казанцев Ф.В., Деменков П.С., Лашин С.А.
|
| 2015 |
Программный комплекс «Гаплоидный эволюционный конструктор» для моделирования популяционно-экологических процессов в микробных сообществах (ГЭК) / Software package «Haploid Evolutionary Constructor” for simulation populational-ecological processes in microbial communities (HEC)»
Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Афонников Д.А., Мустафин З.С., Чеканцев А.Д., Клименко А.И., Зудин Р.К.
|
|
Программный комплекс для предсказания потенциально транслируемых открытых рамок считывания «AUGWeb»/ Software package for prediction of efficiently translated hidden alternative open reading frames «AUGWeb»
Лашин С.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Зураев Б.С., Клименко А.И.
|
Диссертации
| 2018 |
Компьютерное моделирование генетической изменчивости в пространственно-распределённых микробных сообществах
[Кандидат]
|
|
|
