 |
|
|
Васильев Геннадий Владимирович, к. б. н.
|
Scopus: 6603544860РИНЦ: 83034Индекс WOS: U-7686-2018Персональная информацияРабочий адрес
Г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия к. 2211
Дата рождения
06.11.1964
Образование
НГУ – 1989 – специалист
Награды
Область научных интересов
Высокопроизводительное секвенирование, регуляция транскрипции
Публикации
| 2024 |
Accumulation of anthocyanin in the aleurone of barley grains by targeted restoration of the MYC2 gene
Egorova A. A., Zykova T. E., Hertig C. W., Hoffie I., Morozov S. V., Chernyak E. I., Rogachev A. D., Korotkova A. M., Vikhorev A. V., Vasiliev G. V., Shoeva O. Y., Kumlehn J., Gerasimova S. V., Khlestkina E. K.
[INT J MOL SCI]
|
|
Biocontrol Potential of the New Codling Moth Granulovirus (CpGV) Strains
Aleksandra A. Tsygichko, Anzhela M. Asaturova, Tatiana N. Lakhova, Alexandra I. Klimenko, Sergey A. Lashin and Gennady V. Vasiliev
[Microorganisms]
|
|
AEGILOPS TAUSCHII (POACEAE, POALES) PHYLOGENETIC TREE BASED ON TRANSCRIPTOMES SEQUENCING
A. J. Dudnikov, G. V. Vasiliev, M. Hao, D.-C. Liu, F. Xing,
M. Mansouri, D. A. Afonnikov, N. A. Shmakov
[Acta Botanica Hungarica]
|
|
Assembly and Genome Annotation of Different Strains of Apple Fruit Moth Virus (Cydia pomonella granulovirus)
Tatiana N. Lakhova, Aleksandra A. Tsygichko, Alexandra I. Klimenko, Vladimir Y. Ismailov, Gennady V. Vasiliev, Anzhela M. Asaturova, Sergey A. Lashin
[INT J MOL SCI]
|
|
Associations between CAG repeat polymorphism in the androgen receptor gene with sex steroid levels and anthropometrics among men: a role of ethnic factor.
Osadchuk L.V., Vasiliev G.V., Osadchuk A.V.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Enrichment of Grain Anthocyanin Content through Marker-Assisted Breeding for Ant1, Ant2 or HvMyc2 Genes in Barley (Hordeum vulgare L.)
Kukoeva T.V., Molobekova C.A., Totsky I.V., Vasiliev G.V., Pronozin A.Y., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K., Shoeva O.Y.
[Agronomy]
|
|
New Cydia pomonella granulovirus strain with high entomopathogenic activity
Aleksandra A. Tsygichko, Anzhela M. Asaturova, Gennady V. Vasiliev, Alexandra I. Klimenko, Sergey A. Lashin, Tatiana N. Lakhova
[Microbiol Resour Announc]
|
|
TauL1, TauL2 and TauL3 gene-pools of Aegilops tauschii essentially differ in their genetic expression patterns
Alexander Ju. Dudnikov, Gennady V. Vasiliev, Ming Hao, Deng-Cai Liu, Fan Xing, Mehdi Mansouri, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov
[Botanica Serbica]
|
|
The Transcriptomic Response of Cells of the Thermophilic Bacterium Geobacillus icigianus to Terahertz Irradiation
Sergey Peltek, Svetlana Bannikova,Tamara M. Khlebodarova, Yulia Uvarova, Aleksey M. Mukhin, Gennady Vasiliev, Mikhail Scheglov, Aleksandra Shipova, Asya Vasilieva, Dmitry Oshchepkov, Alla Bryanskaya, Vasily Popik
[INT J MOL SCI]
|
|
Ассоциации CAG-полиморфизма гена андрогенового рецептора с уровнем стероидных гормонов и антропометрическими показателями у мужчин: роль этнического фактора.
Осадчук Л.В., Васильев Г.В., Осадчук А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Митохондриальный геном Eisenia altaica (Lumbricidae, Annelida)
П.А. Леонов, Г.В. Юрлова, Т.В. Полубоярова, Г.В. Васильев, А.А. Шипова, Е.В. Голованова, С.В. Шеховцов, К.С. Зубко
[Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции]
|
|
Распространенность микроделеций AZFc региона Y-хромосомы и влияние на сперматогенез у российских мужчин из общей популяции.
Осадчук Л.В., Васильев Г.В., Иванов М.К., Прасолова М.А., Клещев М.А., Осадчук А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2023 |
Population Structure and Genetic Diversity of the 175 Soybean Breeding Lines and Varieties Cultivated in West Siberia and Other Regions of Russia
Nadezhda A. Potapova, Alexander S. Zlobin, Roman N. Perfil’ev, Gennady V. Vasiliev, Elena A. Salina, Yakov A. Tsepilov
[Plants]
|
|
Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato
Cultivars Grown in Russia
Dmitry I. Karetnikov, Gennady V. Vasiliev, Stepan V. Toshchakov, Nikolay A. Shmakov, Mikhail A. Genaev, Mikhail A. Nesterov, Salmaz M. Ibragimova, Daniil A. Rybakov,
Tatjana A. Gavrilenko, Elena A. Salina, Maxim V. Patrushev, Alex V. Kochetov and Dmitry A. Afonnikov
[INT J MOL SCI]
|
|
Cases of paternal inheritance and recombination of mitochondrial DNA in peas (Pisum L.)
Bulgakova (Bogdanova) V.S., Shatskaya N.V., Kosterin O.E., Vasiliev G.V.
[EUPHYTICA]
|
|
Drosophila melanogaster Transcriptome Response to Different Wolbachia Strains
Gruntenko, N.E.; Deryuzhenko, M.A.; Andreenkova, O.V.; Shishkina, O.D.; Bobrovskikh, M.A.; Shatskaya, N.V.; Vasiliev, G.V.
[INT J MOL SCI]
|
|
New insights into plastid and mitochondria evolution in wild peas (Pisum L.)
Shatskaya N.V., Bogdanova V.S., Kosterin O.E., Vasiliev G.V.
[Diversity]
|
|
The Expression of miRNAs Involved in Long-Term Memory Formation in the CNS of the Mollusk Helix lucorum
Gennady V. Vasiliev, Vladimir Y. Ovchinnikov, Pavel D. Lisachev, Natalia P. Bondar, and Larisa N. Grinkevich
[INT J MOL SCI]
|
|
Three Cycles of Continuous Propagation of a Severe PSTVd
Strain NicTr-3 in Solanum lycopersicum cv. Rutgers Resulted in Its Attenuation and Very Mild Disease Symptoms in Potato
Alex V. Kochetov, Nikolay Shmakov, Dmitry A. Afonnikov, Gennady V. Vasiliev, Natalja V. Shatskaya, Anastasiya A. Egorova, Nina V. Mironenko, Nina M. Lashina, Alexander V. Khiutti and Olga S. Afanasenko
[Agronomy]
|
|
WAX INDUCER 1 Regulates β-Diketone Biosynthesis by Mediating Expression of the Cer-cqu Gene Cluster in Barley
Gerasimova, S.V.; Kolosovskaya, E.V.; Vikhorev, A.V.; Korotkova, A.M.; Hertig, C.W.; Genaev, M.A.; Domrachev, D.V.; Morozov, S.V.; Chernyak, E.I.; Shmakov, N.A.; Vasiliev, G.V.; Kochetov, A.V.; Kumlehn, J.; Khlestkina, E.K.
[INT J MOL SCI]
|
| 2022 |
Androgen receptor gene CAG repeat length varies and affects semen quality in an ethnic-specific fashion in young men from Russia
Osadchuk L., Vasiliev G., Kleshchev M., Osadchuk A.
[INT J MOL SCI]
|
|
Easy and Effective Method for Extracting and Purifying Wolbachia Genomic DNA
Andreenkova O.V., Shishkina O.D., Klimenko A.I., Korenskaia A.E., Bobrovskikh M.A., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E.
[INT J MOL SCI]
|
|
Features of activity of the phenylpropanoid biosynthesis pathway in melanin-accumulating barley grains
Anastasiia Y. Glagoleva, Alexander V. Vikhorev, Nikolay A. Shmakov, Sergey V. Morozov, Elena I. Chernyak, Gennady V. Vasiliev, Natalia V. Shatskaya, Elena K. Khlestkina, Olesya Y. Shoeva
[Frontiers in Plant Science]
|
|
New Wolbachia pipientis Genotype Increasing Heat Stress Resistance of Drosophila melanogaster Host Is Characterized by a Large Chromosomal Inversion
Korenskaia A.E., Shishkina O.D., Klimenko A.I., Andreenkova O.V., Bobrovskikh M.A., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E.
[INT J MOL SCI]
|
| 2021 |
Autophagy genes expression profiling in secondary glioblastoma cells transcriptome
Gubanova N., Bragin A., Vasiliev G., Babenko V., Ponomarenko M., Orlov Y.
[Cell Death Discovery]
|
|
Fitness Analysis and Transcriptome Profiling Following Repeated Mild Heat Stress of Varying Frequency in Drosophila melanogaster Females
Gruntenko NE, Karpova EK, Babenko VN, Vasiliev GV, Andreenkova OV, Bobrovskikh MA, Menshanov PN, Babenko RO, Rauschenbach IY.
[Biology]
|
|
A bioinformatics model of human diseases on the basis of differentially expressed genes (of domestic versus wild animals) that are orthologs of human genes associated with reproductive-potential changes.
Vasiliev G, Chadaeva I, Rasskazov D, Ponomarenko P, Sharypova E, Drachkova I, Bogomolov A, Savinkova L, Ponomarenko M, Kolchanov N, Osadchuk A, Oshchepkov D, Osadchuk L.
[INT J MOL SCI]
|
|
Discordant evolution of organellar genomes in peas (Pisum L.)
Bogdanova V.S., Shatskaya N.V., Mglinets a.v., Kosterin O.E., Vasiliev G.V.
[MOL PHYLOGENET EVOL]
|
|
E. coli aggregation and impaired cell division after terahertz irradiation.
1. Peltek S, Meshcheryakova I, Kiseleva E, Oshchepkov D, Rozanov A, Serdyukov D, Demidov E, Vasiliev G, Vinokurov N, Bryanskaya A, Bannikova S, Popik V, Goryachkovskaya T.
[SCI REP-UK]
|
|
Microorganisms of two thermal pools on Kunashir Island, Russia
Rozanov A.S., Korzhuk A.V., Shekhovtsov S.V., Vasiliev G.V., Peltek S.E.
[Biology]
|
|
NLR Genes Related Transcript Sets in Potato Cultivars Bearing Genetic Material of Wild Mexican Solanum Species
Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Antonova O.Y., Shatskaya N.V., Glagoleva A.Y., Ibragimova S.M., Khiutti A., Afanasenko O.S., Gavrilenko T.A.
[Agronomy]
|
|
Whole-exome sequencing analysis of human semen quality in Russian multiethnic population
Kolmykov S., Vasiliev G., Osadchuk L., Kleshchev M., Osadchuk A.
[Frontiers in Genetics]
|
| 2020 |
Disruptive natural selection by male reproductive potential prevents underexpression of protein-coding genes on the human Y chromosome as a self-domestication syndrome.
Ponomarenko M., Kleshchev M., Ponomarenko P., Chadaeva I., Sharypova E., Rasskazov D., Kolmykov S., Drachkova I., Vasiliev G., Gutorova N., Ignatieva E., Savinkova L., Bogomolov A., Osadchuk L., Osadchuk A., Oshchepkov D.
[BMC GENET]
|
|
Species Delimitation of the Eisenia nordenskioldi Complex (Oligochaeta, Lumbricidae) Using Transcriptomic Data
Sergei V. Shekhovtsov, Aleksandra A. Shipova, Tatiana V. Poluboyarova, Gennady V. Vasiliev, Elena V. Golovanova, Anna P. Geraskina, Nina A. Bulakhova, Tímea Szederjesi, Sergei E. Peltek
[Frontiers in Genetics]
|
|
The first mitochondrial genome of the relic Acanthobdella peledina (Annelida, Acanthobdellida)
Alexander Bolbat, Gennady Vasiliev and Irina Kaygorodova
[MITOCHONDR DNA]
|
|
The mechanism of potato resistance to
Globodera rostochiensis: comparison of root
transcriptomes of resistant and susceptible
Solanum phureja genotypes
Alex V. Kochetov, Anastasiya A. Egorova, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina,
Sophia V. Gerasimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov,
Olga Y. Antonova, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko and Tatjana A. Gavrilenko
[BMC PLANT BIOL]
|
| 2019 |
The plastid and mitochondrial genomes of Vavilovia formosa (Stev.) Fed. and the phylogeny of related legume genera
Shatskaya N.V., Bogdanova V.S., Kosterin O.E., Vasiliev G.V., Kimeklis A.K., Andronov E.E., Provorov E.A.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Transcriptomic analysis confirms differences among nuclear genomes of cryptic earthworm lineages living in sympatry
Shekhovtsov S.V., Ershov N.I., Vasiliev G.N., Peltek S.E.
[BMC EVOL BIOL]
|
| 2018 |
Cryptic divergences in the genus Pisum L. (peas), as revealed by phylogenetic analysis of plastid genomes
Bogdanova V.S., Mglinets A.V., Shatskaya N.V., Kosterin O.E., Solovyev V.I., Vasiliev G.V.
[MOL PHYLOGENET EVOL]
|
|
Исследование экспрессии генов рецептора глюкокортикоидов и микроРНК в гиппокампе и концентрации кортизола в крови у лисиц, селекционируемых по реакции на человека
(Hippocampal glucocorticoid receptor and microRNA gene expression and serum cortisol concentration in foxes selected for behavior toward humans)
В.Ю. Овчинников, Е.В. Антонов, Г.В. Васильев, С.Г. Шихевич, Д.В. Шепелева, Ю.Э. Гербек
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots
N. A. Omelyanchuk, D. S. Wiebe, D. D. Novikova, V. G. Levitsky, N. Klimova, V. Gorelova, C. Weinholdt, G. V. Vasiliev, E. V. Zemlyanskaya, N. A. Kolchanov, A. V. Kochetov, I. Grosse, V. V. Mironova
[SCI REP-UK]
|
|
Computer Analysis of Glioma Transcriptome Profiling: Alternative Splicing Events
Babenko V.N., Gubanova N.V., Bragin A.O, Chadaeva I.V., Vasiliev G.V., Medvedeva I.V., Gaytan A.S., Krivoshapkin A.L., Orlov Yu.L.
[J INTEGR BIOINFORM]
|
|
Deterministic versus stochastic model of reprogramming: new evidence from cellular barcoding technique
Anastasia M. Yunusova, Veniamin S. Fishman, Gennady V. Vasiliev, Nariman R. Battulin.
[OPEN BIOL]
|
|
Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis
Alex V. Kochetov, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Salmaz M. Ibragimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Tatyana A. Gavrilenko, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko
[BMC PLANT BIOL]
|
|
Metabolic pathways and genes identified by RNA-seq analysis of barley near-isogenic lines differing by allelic state of the Black lemma and pericarp (Blp) gene
Anastasiya Y. Glagoleva, Nikolay A. Shmakov, Olesya Y. Shoeva, Gennady V. Vasiliev, Natalia V. Shatskaya, Andreas Börner, Dmitry A. Afonnikov, Elena K. Khlestkina
[BMC PLANT BIOL]
|
|
RNAseq-BASED DECIFERING OF MOLECULAR MECHANISMS UNDERLYING TRAIT FORMATION: NON-ALTERNATIVE WAY IN CASE OF IMPEDED METABOLITE IDENTIFICATION
Glagoleva A.Y., Shmakov N.A., Shoeva O. Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Börner A., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K.
[Acta Naturae]
|
|
Статистические оценки ошибок коротких прочтений ДНК при высокопроизводительном секвенировании
Васильев Г.В., Орлова Н.Г., Абнизова И.И., те Боекхорст Р., Орлов Ю.Л.
[Acta Naturae]
|
| 2016 |
Identification of microsatellite loci based on BAC sequencing data and their physical mapping into the soft wheat 5B chromosome
Nesterov M.A., Afonnikov D.A., Sergeeva E.M., Miroshnichenko L.A., Bragina M.K., Bragin A.O., Vasiliev G.V., Salina E.A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Hidden Heterogeneity of Transcription Factor Binding Sites: A Case Study of SF-1
V.G. Levitsky, D.Yu. Oshchepkov, N.V. Klimova, E.V Ignatieva, G.V. Vasiliev, V.M. Merkulov, T.I. Merkulova
[COMPUT BIOL CHEM]
|
|
Identification of nuclear genes controlling chlorophyll synthesis in barley by RNA-seq
Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Doroshkov A.V., Gordeeva E.I., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K.
[BMC PLANT BIOL]
|
| 2015 |
Identification of microRNA genes in three opisthorchiids
Ovchinnikov VY, Afonnikov DA, Vasiliev GV, Kashina EV, Sripa B, Mordvinov VA, Katokhin AV.
[PLOS NEGLECT TROP D]
|
|
Nuclear-cytoplasmic conflict in pea (Pisum sativum L.) is associated with nuclear and plastidic candidate genes encoding Acetyl-CoA carboxylase subunits
Bogdanova V.S., Zaytseva O.O., Mglinets A.V., Shatskaya N.V., Kosterin O.E., Vasiliev G.V.
[PloS One]
|
|
Идентификация микросателлитных локусов по данным секвенирования ВАС-клонов и их физическое картирование на хромосому 5B мягкой пшеницы.
М.А. Нестеров, Д.А. Афонников, Е.М. Сергеева, Л.А. Мирошниченко, М.К. Брагина, А.О. Брагин, Г.В. Васильев, Е.А. Салина.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Регуляторная геномика – экспериментально-компьютерные подходы
Е. В. Игнатьева, О. А. Подколодная, Ю. Л. Орлов, Г. В. Васильев, Н. А. Колчанов
[RUSS J GENET+]
|
| 2014 |
ChIP-seq данные и их анализ
Орлов Ю.Л., Васильев Г.В., Кулакова Е.В., Колчанов Н.А.
[Молекулярная и прикладная генетика]
|
|
Геномика
Васильев Геннадий Владимирович
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2013 |
Adult Opisthorchis felineus major protein fractions deduced from transcripts: Comparison with liver flukes Opisthorchis viverrini and Clonorchis sinensis.
Pomaznoy M., Tatkov S., Katokhin A., Afonnikov D., Babenko V., Furman D., Brusentsov I., Belavin P., Najakshin A., Guselnikov S., Vasiliev G., Sivkov A., Prokhortchouk E., Skryabin K., Mordvinov V.
[EXP PARASITOL]
|
| 2012 |
Unbiased approach to profile the variety of small non-coding RNA of human blood plasma with massively parallel sequencing technology.
Semenov DV, Baryakin DN, Brenner EV, Kurilshikov AM, Vasiliev GV, Bryzgalov LA(LO), Chikova ED, Filippova JA, Kuligina EV, Richter VA.
[Expert Opin Biol Ther.]
|
|
Метаболит циклофосфамида, запускающий апоптоз в клетках лимфосаркомы мыши RLS, является субстратом для Р-гликопротеина.
Патутина О., Миронова Н., Логашенко Е., Попова Н., Николин В., Васильев Г., Каледин В., Зенкова М., Власов В.
[B EXP BIOL MED+]
|
| 2011 |
Analysis of Data on Large Scale Chromatin Immunoprecipitation by Recognition of Transcription Factor Binding Sites
VG Levitskii, GV Vasil’ev, DYu Oshchepkov, NI Ershov, and TI Merkulova
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Разработка методов распознования сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA, их экспериментальная верификация и использование для анализа данных массовой иммунопреципитации хроматина
Левицкий В. Г., Ощепков Д. Ю., Ершов Н. И., Брызгалов Л. О., Антонцева Е. В., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А.
[Doklady Akademii Nauk]
|
| 2010 |
Анализ результатов эксперимента по массовой иммунопреципитации хроматина с помощью методов распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов
Левицкий В.Г., Васильев Г.В., Ощепков Д.Ю., Ершов Н.И., Меркулова Т.И.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2009 |
Выявление новых сайтов транскрипционных факторов SREBP в промоторных районах генов позвоночных на основе комбинации биоинформационного и экспериментального подходов
Е.В. Игнатьева, Т.И. Меркулова, Д.Ю. Ощепков, Н.В. Климова, Г.В. Васильев, И.И. Турнаев, В.Ф. Кобзев, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2008 |
Expression of MAP/ERK kinase cascade corresponds to the ability to develop food aversion in terrestrial snail at different stages of ontogenesis
Grinkevich LN, Lisachev PD, Kharchenko OA, Vasil'ev GV
[BRAIN RES]
|
|
Нарушение функционирования соматических клеток в яйцевых камерах Drosophila melanogaster у мутантов по гену trithorax-like
Огиенко А.А., Лаухина О.В., Васильев Г.В., Баричева Э.М.
[Информационный вестник ВОГИС]
|
| 2007 |
Bioinformatical and experimental approaches to investigation of transcription factor binding sites in vertebrate gene
Merkulova T. I., Oshchepkov D. Yu., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Levitsky V. G., Vasiliev G. V., Klimova N. V. , Merkulov V. M., Kolchanov N. A.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Combined experimental and computational approaches to study the regulatory elements in eukaryotic genes
Kolchanov NA, Merkulova TI, Ignatieva EV, Ananko EA, Oshchepkov DY, Levitsky VG, Vasiliev GV, Klimova NV, Merkulov VM, Hodgman TC
[BRIEF BIOINFORM]
|
|
Search for new binding sites for the transcription factor SF-1 by the SITECON method: experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes
Ignat'eva EV, Klimova NV, Oshchepkov DY, Vasil'ev GV, Merkulova TI, Kolchanov NA.
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Поиск новых сайтов связывания транскрипционного фактора SF1 методом SITECON: экспериментальная проверка и анализ регуляторных районов генов-ортологов.
Игнатьева Е. В., Климова Н. В., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А.
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах
Меркулова Т. И., Ощепков Д. Ю., Игнатьева Е. В., Ананько Е.В., Левицкий В.Г., Васильев Г. В., Климова Н. В., Меркулов В.М., Колчанов Н.А.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
| 2006 |
Potential binding sites for SF-1: Recognition by the SiteGA method, experimental verification, and search for new target genes
Klimova NV, Levitsky VG, Ignatieva EV, Vasiliev GV, Kobzev VF, Busygina TV, Merkulova TI, Kolchanov NA
[Molecular Biology]
|
|
Потенциальные сайты связывания фактора транскрипции SF-1: выявление методом SiteGA, экспериментальная проверка и поиск новых генов-мишеней
Н.В.Климова, В.Г.Левицкий, Е.В.Игнатьева, Г.В.Васильев, В.Ф.Кобзев, Т.В.Бусыгина, Т.И.Меркулова, Н.А.Колчанов
[Molecular Biology]
|
| 2005 |
Binding Sites for Transcription Factor SF-1 in Promoter Regions of Genes Encoding Mouse Steroidogenesis Enzymes 3βHSDI and P450c17
T.V. Busygina, G.V. Vasiliev, N.V. Klimova, E.V. Ignatieva, A.V. Osadchuk
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
|
|
Cаийты связывания транскрипционного фактора SF1 в промоторных районах генов, кодирующих ферменты стероидогенеза 3бетаГСДI и Р450с17 мыши
Бусыгина Т.В., Васильев Г.В., Климова Н.В., Игнатьева Е.В., Осадчук А.В.
[Биохимия]
|
|
Mining genome variation to associate genetic disease with mutation alterations and ortho/paralogous polimorphysms in transcription factor binding site.
Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Merkulova T.M., Vasiliev G.V., and Ponomarenko M.P.
[INT J ARTIF INTELL T]
|
| 2003 |
Predisposition to alcoholism, tryptophan oxygenase activity, and structure of intron 6 in the corresponding gene of C57BL/6J, CC57BR/Mv, and BALB/cJ mice
Kaledin V.I., Klimova N.V., Vasil'ev G.V.Ivanova E.A., Vasil'eva E.D., Il'nitskaya S.I.
[B EXP BIOL MED+]
|
|
Изучение предрасположенности к алкоголизму, активности триптофаноксигеназы и структуры интрона 6 соответствующего гена у мышей линий C57BL/6J, CC57BR/Mv и BALB/cJ
Каледин В.И., Климова Н.В., Васильев Г.В., Иванова Е.А., Васильева Е.Д., Ильницкая С.И.
[B EXP BIOL MED+]
|
| 2002 |
rSNP_Guide: an integrated database-tools system for studying SNPs and site-directed mutations in transcription factor binding sites
Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Merkulova T.I., Gorshkova (Antontseva) E.V., Fokin O.N., Vasiliev G.V., Frolov A.S., Ponomarenko M.P.
[HUM MUTAT]
|
| 2001 |
rSNP_Guide, a database system for analysis of transcription factor binding to target sequences: application to SNPs and site-directed mutations
Ponomarenko JV, Merkulova TI, Vasiliev GV, Levashova ZB, Orlova GV, Lavryushev SV, Fokin ON, Ponomarenko MP, Frolov AS, Sarai A.
[NUCLEIC ACIDS RES]
|
| 2000 |
Точковые мутации в районе 663-666 п.н. интрона 6 гена триптофаноксигеназы, связанные с рядом психических расстройств, разрушают сайт связывания фактора транскрипции YY1.
Васильев Г.В., Меркулов В.М., Кобзев В.Ф., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Подколодная О.А., Колчанов Н.А.
[Molecular Biology]
|
| 1999 |
Point mutations within 663-666 bp of intron 6 of the human TDO2 gene, associated with a number of psychiatric disorders, damage the YY-1 transcription factor binding site.
Vasiliev G.V., Merkulov V.M., Kobzev V.F., Merkulova T.I., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A.
[FEBS LETT]
|
Монографии
| 2008 |
Регуляторные последовательности ДНК: исследование компьютерными методами.
Ощепков Д.Ю., Бугреев Д.В., Невинский Г.А., Колчанов Н.А., Игнатьева Е.В., Климова Н.В., Васильев Г.В., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Воробьев Ю.Н., Емельянов Д.Ю., Левицкий В.Г., Ананько Е.А., Вишневский О.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В.
|
| 2006 |
In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (Eds. N.Kolchanov and R. Hofestaedt) Springer Science+Business Media. Inc.
Levitsky V., Ignatieva E., Vasiliev G., Klimova N., Busygina T., Merkulova T., Kolchanov N.
|
|
Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. Под ред. А.Б. Масленникова. Вып. 9
Воевода М.И., Юдин Н.С., Васильев Г.В., Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Бархаш А.В., Ромащенко А.Г.
|
Конференции
| 2024 |
Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia
Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A.
[The 14th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2024)]
|
|
Genome analysis of novel strains of Cydia
pomonella granulovirus from Russia
Lakhova T., Klimenko A., Tsygichko A., Ismailov V., Vasiliev G., Asaturova A., Lashin S.
[14th International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology]
|
|
Исследование вариаций и структуры генома сортов картофеля Solanum tuberosum, выращиваемых в России
Д.И. Каретников, Г.В. Васильев, С.В. Тощаков, Н.А. Шмаков, М.А. Генаев, М.А. Нестеров, С.М. Ибрагимова, Д.А. Рыбаков, Т.А. Гавриленко, Е.А. Салина, М.В. Патрушев, А.В. Кочетов, Д.А. Афонников
[INTERNATIONAL CONGRESS “VIII Congress of the Vavilov Society of Geneticists and Breeders, Dedicated to the 300th Anniversary of Russian Science and Higher Education”]
|
|
Анализ адаптационно‑значимого для хозяина штамма wMelPlus эндосимбиотической бактерии Wolbachia и его влияния на транскриптом Drosophila melanogaster
О. Д. Шишкина, М. А. Дерюженко, О. В. Андреенкова, М. А. Бобровских, Н. В. Шацкая, Г. В. Васильев, А. И. Клименко, А. Е. Коренская, Н. Е. Грунтенко
[VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы]
|
|
Влияние эндосимбиотической бактерии Wolbachia на дифференциальную
экспрессию генов, метаболизм и поведение Drosophila melanogaster
Н. Е. Грунтенко, М. А. Дерюженко, О. В. Андреенкова, О. Д. Шишкина, Е. К. Карпова, Е. В. Бурдина,
М.А. Бобровских, Л. П. Захаренко, Г. В. Васильев, Н. В. Шацкая
[VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы]
|
|
Этнозависимый характер полно-экзомных ассоциаций с параметрами мужской фертильности
А.В. Осадчук, С.К. Колмыков, Г.В. Васильев, М.А. Клещев, Л.В. Осадчук
[XXXIV Ежегодная международная конференция РАРЧ «Репродуктивные технологии сегодня и завтра»]
|
| 2023 |
Analysis of the genome structure and its variations in potato cultivars grown in Russia
Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A.
[7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)]
|
|
The impact of terahertz radiation on stress response systems of prokaryotes
Peltek S., Bannikova S., Mesheryakova I., Bryanskaya A., Oshchepkov D., Vasiliev G., Vasilievа A., Uvarova Y., Kiseleva E., Popik V., Khlebodarova T.M., Goryachkovskaya T
[THE 5-TH INTERNATIONAL CONFERENCE “TERAHERTZ AND MICROWAVE RADIATION: GENERATION, DETECTION AND APPLICATIONS” (TERA-2023)]
|
|
Ассоциации CAG-полиморфизма гена андрогенового рецептора с параметрами сперматогенеза и уровнем стероидных гормонов у российских мужчин.
Осадчук Л.В., Васильев Г.В., Клещев М.А., Осадчук А.В.
[XXXIII Ежегодная международная конференция РАРЧ «Репродуктивные технологии сегодня и завтра»]
|
|
Евразийский тренд фенотипической и генетической изменчивости мужского репродуктивного потенциала в популяциях Российской Федерации и Республики Беларусь
Осадчук А.В., Васильев Г.В., Колмыков С.К., Иванов М.К., Прасолова М.А., Клещев М.А., Осадчук Л.В.
[XXIV съезд физиологического общества им. И.П. Павлова]
|
|
МикроРНК в механизмах пластичности ЦНС
Гринкевич Л.Н., Васильев Г.В., Лисачев П.Д., Бондарь Н.П.
[XXIV съезд физиологического общества им. И.П. Павлова]
|
|
Поиск ассоциаций генов fam71f1, ppp1r15a, tex11 с параметрами сперматогенеза в урбанизированных популяциях: роль этнического фактора.
Осадчук А.В., Васильев Г.В., Иванов М.К., Клещев М.А., Осадчук Л.В.
[XXXIII Ежегодная международная конференция РАРЧ «Репродуктивные технологии сегодня и завтра»]
|
| 2022 |
Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight
Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T.
[13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight
Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T.
[13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
Genome assembly of a new Wolbachia pipientis strain:
a promising source for studying Drosophila melanogaster
endosymbiosis
Klimenko A.I., Korenskaia A.E., Shishkina O.D., Andreenkova O.V., Shatskaya N.V., Vasiliev G.V., Gruntenko N.E.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
|
|
RECONSTRUCTION AND ANALYSIS OF PANGENOME OF SIBERIAN CULTIVARS OF POTATO SOLANUM TUBEROSUM
Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Shmakov N.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V.
[III Всероссийская конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике» (HSG-2022)]
|
|
Reconstruction and analysis of potato Solanum tuberosum pangenome of Siberian cultivars
Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V., Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference]
|
|
РЕКОНСТРУКЦИЯ И АНАЛИЗ ПАНГЕНОМА КАРТОФЕЛЯ SOLANUM TUBEROSUM СОРТОВ СИБИРСКОЙ СЕЛЕКЦИИ
Каретников Д.И., Генаев М.А., Нестеров М.А., Ибрагимова С.М., Васильев Г.В., Тощаков С.В., Гавриленко Т.А., Афонников Д.А., Салина Е.А., Патрушев М.В., Кочетов А.В.
[III Международная научно-практическая конференция "Клеточная биология и биотехнология растений"]
|
|
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ ГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ ШТАММОВ WOLBACHIA PIPIENTIS, РАЗЛИЧАЮЩИХСЯ ПО ВЛИЯНИЮ НА СТРЕССОУСТОЙЧИВОСТЬ DROSOPHILA MELANOGASTER
Шишкина О.Д., Андреенкова О.В., Клименко А.И., Коренская А.Е., Васильев Г.В., Шацкая Н.В., Грунтенко Н.Е.
[HSG-2022: III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике"]
|
|
Этнические различия длины CAG-повторов в гене андрогенового рецептора и уровня тестостерона у молодых мужчин Сибирского региона России.
Онопченко М.А., Васильев Г.В., Осадчук А.В., Осадчук Л.В.
[I Международный Конгресс «Новейшие и достижения в области медицины, здравоохранения и здоровьесберегающих технологий.]
|
|
Этнический тренд генетической изменчивости мужской фертильности в популяциях Российской Федерации и Республики Беларусь.
Осадчук А.В., Васильев Г.В., Колмыков С.К., Иванов М.К., Прасолова М.А., Клещев М.А., Осадчук Л.В.
[XXXII ежегодная международная конференция РАРЧ «Репродуктивные технологии сегодня и завтра».]
|
| 2021 |
Pan-transcriptomic analysis of Solanum tuberosum NLR genes regulating resistance to Phytophthora infestans
Shmakov N.A., Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Vasiliev G.V.
[PlantGen2021]
|
|
ROLE OF THE ALLELIC POLYMORPHISM OF THE BRAIN NEUROTRANSMITTERS SYSTEMS IN A FORMATION OF PERSONALITY FEATURES OF SOCIAL BEHAVIOR IN PEOPLE, LIVING IN DIFFERENT REGIONS OF SIBERIA AND MONGOLIA
Савостьянов Александр Николаевич
Лашин Сергей Александрович
Клименко Александра Игоревна
Таможников Сергей Сергеевич
Милахина Наталья Сергеевна
Бочаров Андрей В.
Ефимов Вадим Михайлович
Матушкин Юрий Георгиевич
Васильев Геннадий Владимирович
Иванов Роман Артемович
Князев Геннадий Георгиевич
[XVII INTERNATIONAL INTERDISCIPLINARY CONGRESS NEUROSCIENCE FOR MEDICINE AND PSYCHOLOGY]
|
|
Полиморфизм CAG повторов гена андрогенового рецептора у российских мужчин: роль этнической принадлежности и связь с нарушениями сперматогенеза
Осадчук Л.В., Васильев Г.В., Клещев М.А., Осадчук А.В.
[20-й конгресс по андрологии Профессиональной ассоциации андрологов России]
|
|
Полноэкзомный анализ сперматогенеза в преселектированной выборке из
российских мультиэтнических популяций
Осадчук А.В., Колмыков С.К., Васильев Г.В., Клещев М.А., Осадчук Л.В.
[NGS в медицинской генетике. Пятая международная научно-практическая конференция.]
|
|
Экспансия AZF микроделеций Y-хромосомы и их ассоциации с ослабленным сперматогенезом в российских и белорусских урбанизированных популяциях.
4. Осадчук А.В., Васильев Г.В., Иванов М.К., Прасолова М.А., Кульчитский В.А., Линник А.И., Шантанова Л.Н., Троев И.П., Типисова Е.В., Клещев М.А., Осадчук Л.В.
[20-й конгресс по андрологии Профессиональной ассоциации андрологов России.]
|
| 2020 |
Whole-exome sequencing association studies on impaired spermatogenesis in different ethnic groups in Russia.
Kolmykov S.K. Vasiliev G.V. Ponomarenko M.P. Kleshev M.A. Osadchuk A.V. Osadchuk L.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/ Systems Biology The 12th International Multiconference]
|
| 2019 |
Study of the leaf rust resistance gene Lr52 by targeted sequencing
Bragina M.K., Afonnikov D.A., Vasiliev G.V., Salina E.A.
[5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)]
|
|
Phylogenetic analysis of high-throughput sequencing data
for a non-transcribed spacer 5S rDNA of Triticum aestivum relatives
Nesterov M.A., Sergeeva E.M., Vasiliev G.V., Salina E.A.
[5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)]
|
|
Novel genomic marker for the Alm locus in barley identified based on transcriptome analysis
N.A. Shmakov, A.Yu. Glagoleva, G.V. Vasiliev, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina
[PlantGen2019]
|
|
Transcriptomic analysis of barley partial albinism
Nickolay Shmakov, Anastasiya Glagoleva, Gennadiy Vasiliev, Dmitry Afonnikov, Elena Khlestkina
[5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding]
|
|
ИССЛЕДОВАНИЕ ИЗМЕНЕНИЙ ПРОТЕОМА И ТРАНСКРИПТОМА ДРОЖЖЕЙ SACCHAROMYCES CEREVISIAE ПРИ ПЕРЕХОДЕ К АНАЭРОБНЫМ УСЛОВИЯМ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ
Мещерякова И. А., Банникова С. В., Розанов А. С., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Демидов Е. А., Слынько Н.М., Старостин К. В., Пельтек С. Е.
[МЕЖДУНАРОДНЫЙ КОНГРЕСС«VII СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ, ПОСВЯЩЕННЫЙ 100-ЛЕТИЮКАФЕДРЫ ГЕНЕТИКИ СПБГУ,И АССОЦИИРОВАННЫЕ СИМПОЗИУМЫ»]
|
| 2018 |
Hippocampal differentially expressed genes between tame and
aggressive foxes are included in pathways associated with stress,
behavior and adult neurogenesis
Гербек Ю.Э., Генаев М.А., Васильев Г.В., Гулевич Р.Г., Шихевич С.Г., Шепелева Д.В., Афонников Д.А., Трут Л.Н.
[The 11th International Multiconference BGRS\SB-2018]
|
|
Computer analysis of alternative splicing events by RNA-seq data in brain cells
V.N. Babenko, N.V. Gubanova, A.V. Tsukanov, S.S. Kovalev, A.O. Bragin,G.V. Vasiliev, Yu.L. Orlov
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
|
|
Dynamics of S. cerevisiae proteomic and transcriptomic response to changes in aeration conditions
A. Rozanov, I. Meshcheryakova, S. Bannikova, D. Oshchepkov, G. Vasiliev, S. Peltek
[11th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology” — BGRS\SB-2018]
|
|
Genetic control of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in potato plants Solanum phureja
A.A.Egorova, N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya, K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov
["PLANT FUNCTIONING UNDER ENVIRONMENTAL STRESS" SEPTEMBER 12 - 15, 2018, CRACOW, POLAND.]
|
|
Genetic mechanisms of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in Solanum phureja
A.A. Egorova,
N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya,
K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology” – BGRS\SB-2018]
|
|
Identification of genes, associated with black pigmentation of seeds in cereals, based on transcriptomic analysis.
A.Yu. Glagoleva, N.A. Shmakov, O.Yu. Shoeva, G.V. Vasiliev, N.V. Shatskaya, A. Börner, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina
[The Tenth International Young Scientists School (SBB-2018)]
|
|
Inferring phylogeny among cryptic lineages of Eisenia nordenskioldi nordenskioldi (Lumbricidae) based on transcriptomic data
Shekhovtsov S.V., Ershov N.I., Vasiliev G.N., Peltek S.E.
[Biodiversity: Genomics and Evolution (BioGenEvo-2018)]
|
|
Investigating genetic control of pigmentation in mutant barley lines with RNA-seq. BGRS, 2018
N.Shmakov, A.Glagoleva, A.Doroshkov, G.Vasiliev, N.Shatskaya, D.Afonnikov, E.Khlestkina
[BGRS\SB-2018 The 11th International Conference Systems Biology and Biomedicine, SBioMed-2018 Symposium]
|
|
Влияние изменения режима аэрации на транскриптом и протеом S.cerevisiae
А.С. Розанов, И.А. Мещерякова, С.В. Банникова, Д.Ю. Ощепков, Г.В. Васильев, С.Е. Пельтек
[Астана Биотех 2018]
|
| 2017 |
GENE EXPRESSION ANALYSIS OF EGR1, GRIA2, MAPK1, BY qPCR IN BRAIN AREAS OF RATS SELECTED BY AGGRESSIVE BEHAVIOR
Chadaeva I.V., Klimova N.V., Markel A.L., Vasiliev G.V.
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
|
|
Expression of genes related with stress and behavioral regulation in dorsal hippocampus of the experimentally domesticated foxes.
Herbeck Y, Genaev M, Vasiliev G, Gulevich R, Shikhevich S, Shepeleva D, Afonnikov D, Trut L.
[BNA international Festival of Neuroscience 2017]
|
|
GENETICS AND OMICS APPROACHES TO BETTER UNDERSTANDING REGULATION OF METABOLI C PATHWAYS UNDERLYING PIGMENTATION IN WHEAT AND BARLEY
O.Y. Shoeva, E.I. Gordeeva, N.A. Shmakov, K.V. Strygina, A.Y. Glagoleva, T.V. Kukoeva , N.V. Shatskaya , G.V. Vasiljev , A. Börner, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina*
[4-ая международная научная конференция "Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений" (PlantGen2017)]
|
|
IDENTIFICATION OF GENES CONTROLLING BLACK PIGMENTATION IN CEREALS
Glagoleva A.Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N. V., Shmakov N.A., Afonnikov D.A., Shoeva O. Y., Börner A., Khlestkina E.K.
[4th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)]
|
|
RNAseq-BASED DECIFERING OF MOLECULAR MECHANISMS UNDERLYING TRAIT FORMATION: NON-ALTERNATIVE WAY IN CASE OF IMPEDED METABOLITE IDENTIFICATION
Glagoleva A.Y., Shmakov N.A., Shoeva O. Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Börner A., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K.
[II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике" (HSG-2017)]
|
|
ЗНАЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ КОЛЛЕКЦИЙ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ЗАДАЧ ПРЯМОЙ И ОБРАТНОЙ ГЕНЕТИКИ РАСТЕНИЙ
Хлесткина Е.К.*, Афонников Д.А., Бернер А., Быкова И.В., Васильев Г.В., Герасимова С.В., Глаголева А.Ю., Гордеева Е.И., Григорьев Ю.Н., Короткова А.М., Пшеничникова Т.А., Стрыгина К.В., Шацкая Н.В., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Юдина Р.С.
[III МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ГЕНОФОНД И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ», ПОСВЯЩЕННАЯ 130-ЛЕТИЮ Н.И. ВАВИЛОВА (28.03. – 30.03.2017)]
|
|
ИДЕНТИФИКАЦИЯ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ЧЕРНОЙ ОКРАСКОЙ КОЛОСА У ЗЛАКОВ, НА ОСНОВЕ ТРАНСКРИПТОМНОГО АНАЛИЗА
Глаголева А.Ю., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Васильев Г.В., Шацкая Н.В., Бернер А., Афонников Д.А., Хлесткина Е.К.
[IV Вавиловская международная конференция «Идеи Н. И. Вавилова в современном мире»]
|
|
Компьютерные оценки ошибок коротких прочтений ДНК при высокопроизводительном секвенировании
Васильев Г.В., Абнизова И.И., те Боекхорст Р., Галиева Э.Р., Орлов Ю.Л.
[Вторая Международная научно-практическая конференция «NGS в медицинской генетике 2017».]
|
|
Экспрессия генов, связанных с поведением, стрессом и фотопериодизмом, в дорзальном гиппокампе доместицируемых лисиц.
Гербек Ю.Э., Генаев М.А., Васильев Г.В., Гулевич Р.Г., Шихевич С.Г., Шепелева Д.В., Афонников Д.А., Трут Л.Н.
[Международная конференция "Беляевские чтения".]
|
| 2016 |
Development of Microsatellite Markers According to BAC Sequencing Data and Their Physical Mapping to the Bread Wheat 5B Chromosome
M.A. Nesterov, D.A. Afonnikov, E.M. Sergeeva, L.A. Miroshnichenko, M.K. Bragina, A.O. Bragin, G.V. Vasiliev, E.A. Salina
[The Tenth International Conference on the Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2016)]
|
|
Mutations spectra of major oncogenes in patients with multiple primary neoplasia
Vasiliev GV, Savkova AV, Gerasimov AV
[BGRS\SB-2016]
|
| 2015 |
DEVELOPMENT AND PHYSICAL MAPPING OF SSR MARKERS ON CHROMOSOME 5BS OF THE HEXAPLOID WHEAT (Triticum aestivum L.)
Nesterov M.A., Sergeeva E.M., Miroshnichenko L.A., Koltunova M., Vasiliev G.V., Salina E.A.
[The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”]
|
|
SYNTENY AND PHYSICAL MAP OF THE SHORT ARM OF CHROMOSOME 5B OF COMMON WHEAT
Salina E.A., Sergeeva E.M., Nesterov M.A., Kiseleva A.A., Timonova E.M., Vasiliev G.V., Frenkel Z., Korol A., Safar J., Dolezel J., International Wheat Genomic Sequencing Consortium
[The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”]
|
| 2014 |
Идентификация микроРНК генов плоских червей семейства Opisthorchiidae
В.Ю. Овчинников, Д.А. Афонников, Г.В. Васильев, Е.В. Кашина, B. Sripa, В.А. Мордвинов, А.В. Катохин
[Международная конференция молодых ученых биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов]
|
|
Auxin-responsive transcriptome of Arabidopsis thaliana roots
Миронова Виктория Владимировна Новикова Дарья Дмитриевна Омельянчук Надежда Анатольевна Васильев Геннадий Владимирович Климова Наталья Викторовна
[BGRS-2014]
|
|
The structural organization and evolution of 5S rDNA of wheat 5BS chromosome by data of partial sequencing
Sergeeva E.M., Koltunova M.K., Afonnikov D.A., Vasiliev G.V., Salina E.A.
[The 9th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014]
|
| 2013 |
Computational and experimental analysis of miRNA genes of Opisthorchiidae family liver flukes
Овчинников Владимир Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Васильев Геннадий Владимирович, Катохин Алексей Вадимович, Кашина Елена Валентиновна, Мордвинов Вячеслав Алексеевич
[MCCMB-2013 (Московская конференция по компьютерной молекулярной биологии)]
|
|
Computational and experimental analysis of miRNA genes of Opisthorchiidae family liver flukes
Овчинников Владимир Юрьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Васильев Геннадий Владимирович, Катохин Алексей Вадимович, Кашина Елена Валентиновна, Мордвинов Вячеслав Алексеевич
[International Conference ” High-Throughput Sequencing in Genomics”]
|
|
Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней Arabidopsis thaliana L.
Миронова В.В., Кузнецова Л.С., Филипенко Е.А., Климова Н.В., Васильев Г.В., Кочетов А.В.
[International Conference ” High-Throughput Sequencing in Genomics”]
|
|
Короткие некодирующие РНК плазмы крови человека
Барякин Д.Н., Семенов Д.В., Бреннер Е.В., Курильщиков А.М., Козлов В.В., Наров Ю.Э., Васильев Г.В., Чикова Е.Д., Филиппова Ю.А., Брызгалов Л.О., Кулигина Е.В., Рихтер В.А.
[High-throughput Sequencing in Genomics]
|
| 2012 |
Expressed Sequence Tag Analysis of Adult Opisthorchis felineus
M. Yu. Pomaznoy, S. I. Tat’kov, D. A. Afonnikov, D. P. Furman, P. A. Belavin, A. M. Nayakshin, S. V. Gusel’nikov, G. V. Vasil’ev, A. Yu. Sivkov, A. V. Katokhin, and V. A. Mordvinov
[BREW 2012: Bioinformatics Research and Education Workshop]
|
|
In silico verification of TFBS in ChIP-Seq data
V.G. Levitsky, D.Y. Oshchepkov, G.V. Vasiliev, N.I. Ershov, T.I. Merkulova, Kulakovskiy I.V., Makeev V.J.
[The eighth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure \ System biology (BGRS\SB'2012)]
|
|
In silico verification of TFBS in ChIP-Seq data.
V.G. Levitsky, D.Y. Oshchepkov, G.V. Vasiliev, N.I. Ershov, T.I. Merkulova, Kulakovskiy, Makeev V.J.
[SysPatho workshop «Systems biology and medicine»]
|
| 2011 |
PROFILE OF THE CIRCULATING RNA IN APPARENTLY HEALTHY INDIVIDUALS OBTAINED WITH MASSIVE PARALLEL SEQUENCING OF TOTAL PLASMA RNA ON SOLID PLATFORM
D.V. Semenov, D.A. Baryakin, E.V. Brenner, A.M. Kuril’shikov, G.V. Vasiliev, L.A. Bryzgalov, E.D. Chikova, J.A. Fillipova, E.V. Kuligina, V.A. Richter
[CIRCULATING NUCLEIC ACIDS IN PLASMA AND SERUM]
|
|
Анализ данных массовой иммунопреципитации хроматина с помощью экспериментально верифицированных методов распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA
Ощепков Д. Ю., Левицкий В. Г. , Кулаковский И. В., Ершов Н. И., Васильев Г.В., Меркулова Т. И.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика»]
|
|
Выявление регуляторных SNP, ассоциированных с различными заболеваниями, с использованием данных ChIP-seq.
Меркулова Т.И., Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Пономаренко М.П., Савинкова Л.К., Васильев Г.В., Драчкова И.А., Матвеева М.Ю., Колчанов Н.А.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»]
|
|
Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов SF-1 и SREBP в геномах позвоночных с помощью нового подхода, сочетающего экспериментальные и биоинформатические методы
Климова Н.В., Левицкий В.Г., Ощепков Д.Ю., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Меркулова Т.И.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика и биоинформатика»]
|
| 2010 |
Investigation of Opisthorchosis felineus transcription profile by direct sequencing cDNA library’s clones
S.I. Tatkov, I. I. Brusentsov, M.Yu. Pomaznoy, O.V. Nosareva, A.M. Nayakshin, S. V. Guselnikov, E. V. Brenner, G. V. Vasiliev, A.V. Katokhin, V. A. Mordvinov
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
|
|
Компьютерно-экспериментальное изучение сайтов связывания транскрипционных факторов.
Ощепков Д.Ю., Климова Н.В., Антонцева Е.В., Левицкий В.Г., Ощепкова Е.А., Кашина Е.В., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Пономаренко М.П., Драчкова И.А., Савинкова Л.К., Фурман Д.П., Мордвинов В.А., Меркулова Т.И.
[I международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»]
|
|
Поиск потенциальных мишеней для диагностики паразита Opisthorchis felineus
Помазной М. Ю., Татьков С. И., Брусенцов И. И., Сивков А.Ю., Наякшин А.М., Гусельников С.В., Бреннер Е.В., Васильев Г.В., Катохин А.В., Мордвинов В.А.
[Молекулярная диагностика 22-25 ноября 2010, Москва]
|
| 2009 |
Гены предрасположенности к ИБС в популяции Сибири
Толкачёва О.М., Максимов В.Н., Куликов И.В., Завьялова Л.Г., Денисова Д.В., Васильев Г.В., Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г.
[Вопросы патогенеза типовых патологических процессов]
|
|
Гены предрасположенности к ИБС в популяции Сибири
Максимов В.Н., Толкачёва О.М., Куликов И.В., Завьялова Л.Г., Денисова Д.В., Васильев Г.В., Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г.
[Всероссийская научно-практическая конференция «Перспективы кардиологии России в XXI веке»]
|
| 2008 |
SITECON: a quality tool for prediction of new potential SREBP binding sites. experimental verification and analysis of regulatory regions of vertebrate genes.
D.Y. Oshchepkov, E.V. Ignatieva, G.V.Vasiliev, N.V. Klimova, T.I. Merkulova
[Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
|
| 2006 |
Experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes
Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Klimova N.V., Vasiliev G.V., Merkulova T.I.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
|
|
SITECON: a quality tool for prediction of transcription factor binding sites now handles those for SF-1. Experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes.
Ignatieva E.V., Oshchepkov D.Yu., Klimova N.V., Vasiliev G.V., Merkulova T.I.
[Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure (BGRS'2006)]
|
|
Выявление генов предрасположенности к распространенным сердечно-сосудистым заболеваниям: принципы, достижения и перспективы
Воевода М.И., Юдин Н.С., Васильев Г.В., Максимов В.Н., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Бархаш А.В., Ромащенко А.Г.
[Международная конференция "Фундаментальные науки – биотехнологии и медицине"]
|
Гранты
| 2022 |
Популяционное исследование мужского
репродуктивного потенциала: оценка возможностей
полно-экзомного секвенирования и идентификация
новых генов, ассоциированных с ослабленным
сперматогенезом
Осадчук Людмила Владимировна
Осадчук Александр Владимирович
Клещев Максим Александрович
Васильев Геннадий Владимирович
Богомолов Антон Геннадьевич
Онопченко Маргарита Андреевна
Колмыков Семён Константинович
Прасолова Мария Анатольевна
|
| 2021 |
Генетический потенциал сортов мягкой пшеницы и культурной сои и его использование в селекции на адаптивность и высокое содержание белка
Салина Е.А., Киселёва А.А., Леонова И.Н., Сергеева Е.М., Щербань А.Б., Адонина И.Г., Мутерко А.Ф., Тимонова Е.М., Силкова О.Г., Нестеров М.А., Стасюк А.И., Иванова Ю.Н., Кельбин В.Н., Брагина М.К., Зорина М.В., Бережная А.А., Куваева Д.Д., Перфильев Р.Н., Полюдина Р.И., Потапов Д.А., Васильев Г.В., Агеева Е.В., Максименко К.В., Осипова А.А., Бадаева Е.Д.
|
| 2019 |
Поддержка и развитие центра коллективного пользования научным оборудованием Центр генетических ресурсов лабораторных животных путем инструментального развития исследований для обеспечения реализации приоритетов научно-технологического развития
Мошкин М.П., Васильев Г.В., Завьялов Е.Л., Землянская Е.В., Максимов В.Н., Миронова В.В., Орищенко К.Е., Пилипенко А.С., Розанов А.С., Рубцов Н.Б.
|
|
Популяционное исследование мужского репродуктивного потенциала: оценка возможностей полно-экзомного секвенирования и идентификация новых генов, ассоциированных с ослабленным сперматогенезом
Осадчук Людмила Владимировна, Осадчук Александр Владимирович, Пономаренко Михаил Павлович, Васильев Геннадий Владимирович, Игнатьева Елена Васильевна, Клещев Максим Александрович, Богомолов Антон Геннадьевич, Чадаева Ирина Витальевна, Колмыков Семен Константинович, Даниленко Анна Дмитриевна
|
|
Влияние частых стрессов на репродуктивную функцию насекомых: молекулярно-генетические механизмы
Грунтенко Наталия Евгеньевна, Адоньева Наталья Васильевна, Андреенкова Ольга Владимировна, Бабенко Владимир Николаевич, Бурдина Елена Владимировна, Васильев Геннадий Владимирович, Гусельникова Светлана Владимировна, Фаддеева Наталья Владимировна, Карпова Евгения Константиновна, Бобровских Маргарита Александровна
|
| 2016 |
Комплексный анализ экспрессии генов в мозге ручных лисиц: исследование на уникальной селекционной модели доместикации
Трут Людмила Николаевна Гербек Юрий Эмильевич Гулевич Римма Глебовна Васильев Геннадий Владимирович Шихевич Светлана Геннадьевна Шепелева Дарья Владимировна Антонов Егор Владимирович Орищенко Константин Евгеньевич Овчинников Владимир Юрьевич
|
| 2014 |
Разработка регламента детекции и маркирования новых генов комплексной устойчивости к грибным патогенам пшеницы на основе геномного секвенирования.
Салина Елена Артемовна, Васильев Геннадий Владимирович, Щербань Андрей Борисович, Сергеева Екатерина Михайловна, Нестеров Михаил Алексеевич, Иванова Юлия Николаевна, Мильхина Наталья Николаевна, Стасюк Анатолий Иванович
|
|
Экспериментальные генетические модели агрессивного и толерантного поведения: исследование молекулярно-генетических механизмов с использованием технологий секвенирования следующего поколения (RNA-Seq)
17 человек
|
| 2013 |
Роль ауксина и этилена в регуляции активности генов в корне проростка Arabidopsis thaliana L.: полногеномный подход
Миронова Виктория Владимировна Ермаков Антон Александрович Дорошков Алексей Владимирович Васильев Геннадий Владимирович Казанцев Федор Владимирович Климова Наталья Викторовна Левицкий Виктор Георгиевич Новоселова Екатерина Сергеевна Пономаренко Петр Михайлович Чернова Василина Владимировна
|
| 2011 |
Реконструкция процессов антропогенеза: анализ митохондриальных геномов представителей древнего и современного населения Сибири
Колчанов Николай Александрович,Афонников Дмитрий Аркадьевич, Васильев Геннадий Владимирович, Губина Марина Александровна, Гунбин Константин Владимирович, Мордвинов Вячеслав Алексеевич, Осипова Людмила Павловна, Пилипенко Александр Сергеевич, Трапезов Ростислав Олегович, Шуньков Михаил Васильевич
|
|
Экспериментально-компьютерное исследование механизмов метаболизма ксенобиотиков у печеночных сосальщиков семейства Opisthorchiidae
Пахарукова М.Ю., Васильев Г.В., Афонников Д.А., Ершов Н.И, Воронцова Е.В., Львова М.Н.
|
| 2010 |
Молекулярные механизмы стресс-специфического контроля экспрессии генов животных
Дымшиц Г.М., Меркулова Т.И., Раушенбах И.Ю., Кочетов А.В., Грунтенко Н.Е., Попова Н.А., Адоньева Н.В., Васильев Г.В., Левицкий В.Г., Вишневский О.В., Антонцева Е.В., Пахарукова М.Ю., Карпова Е.К., Богомолова Е.В., Иванов М.К., Федосеева Л.А., Ощепков Д.Ю., Шарипов Р.Н., Глушков С.А., Ведерников В.Е., Брызгалов Л.О., Климова Н.В., Сангаев С.С., Волкова О.А., Ершов Н.И., Герасимова С.В., Брагин А.Г., Прасолова М.А., Рязанова М.А., Прокопьев Р.А., Горелова В.В., Савельева А.В., Попов Е.Г., Шевелев О.Б., Климов Л.О.
|
| 2009 |
Изучение конкурентных взаимоотношений транскрипционных факторов семейства Fox в регуляции экспресии генов печени и их роли в гепатоканцерогенезе
Васильев Геннадий Владимирович Антонцева Елена Вячеславовна Брызгалов Леонид Олегович Ершов Никита Игоревич Климова Наталья Викторовна Левицкий Виктор Георгиевич Ощепков Дмитрий Юрьевич
|
| 2007 |
Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов HNF3, обеспечивающих реализацию опухолесупрессорного действия этих белков в печени
Амстиславский В.С., Васильев Г.В., Ефимов В.М., Климова Н.В., Кузнецова Т.Н., Левицкий В.Г., Ощепков Д.Ю., Сметанина М.А.
|
| 2006 |
Изучение регуляции экспрессии гена Trithorax-like и его роли в онтогенезе D. melanogaster
Васильев Геннадий Владимирович
Баттулина Надежда Викторовна
Баричева Элина Михайловна
Голыгина Вероника Вилорьевна
Карагодин Дмитрий Александрович
Климова Наталья Викторовна
Огиенко Анна Александровна
Федорова Елена Владимировна
Сокуева Наталья Александровна
|
| 2004 |
Изучение механизма возникновения сайт-направленных мутаций в протоонкогенах семейства ras
Меркулова Татьяна Ивановна, Антонцева Елена Вячеславовна, Васильев Геннадий Владимирович, Каледин Василий Иванович, Меркулов Василий Михайлович, Огиенко Анна Александровна, Пивоварова Елена Николаевна, Решетова Ольга Валерьевна
|
Научное руководство
| 2011 |
Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов SF-1 и SREBP на днк с помощью экспериментально-компьютерного подхода
[Климова Наталья Викторовна]
|
|
|
