CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana Lavrekha VV, Levitsky VG, Tsukanov AV, Bogomolov AG, Grigorovich DA, Omelyanchuk N, Ubogoeva EV, Zemlyanskaya EV, Mironova V Frontiers in Plant Science, 2022, 13:942710
2007
AUG_hairpin: prediction of a downstream secondary structure influencing the recognition of a translation start site Kochetov A.V., Palyanov A., Titov I.I., Grigorovich D., Sarai A., Kolchanov N.A. BMC BIOINFORMATICS, 2007, 8(1):318
2005
PDBSite: a database of the 3D structure of protein functional sites Ivanisenko VA, Pintus SS, Grigorovich DA, Kolchanov NA. NUCLEIC ACIDS RES, 2005, V33, D183–D187
2004
SITECON: a tool for detecting conservative conformational and physicochemical properties in transcription factor binding site alignments and for site recognition. Oshchepkov D.Y., Vityaev E.E., Grigorovich D.A., Ignatieva E.V., Khlebodarova T.M. NUCLEIC ACIDS RES, 2004, 1;32: 208-12.
2000
Methods for integration of heterogeneous information resources in molecular biology in the digital library GeneExpress F. A. Kolpakov, N. L. Podkolodnyi, S. V. Lavryushev, D. A. Grigorovich, M. P. Ponomarenko, N. A. Kolchanov PROGRAM COMPUT SOFT+, 2000, 3, 26, 170-176
1999
WWWMGS: интегрированный сервер для молекулярно-генетических исследований А.С.Фролов, С.В.Лаврюшев, Д.А.Григорович, А.Э.Кель, А.А.Птицын, Н.А.Колчанов, Н.Л.Подколодный, В.В.Соловьев, Л.Миланези, П.Борн, Э.Вингендер, К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, том 44, вып. 5, с.832-836
TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS DATABASE (TRRD): A SOURCE OF EXPERIMENTALLY CONFIRMED DATA ON TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS OF EUKARYOTIC GENES N. Kolchanov, E. Ignatieva, O. Podkolodnaya, E. Ananko, I. Stepanenko, T. Merkulova, T. Khlebodarova, V. Merkulov, N. Podkolodny, D. Grigorovich, A. Poplavsky, A. Romashchenko
Конференции
2006
BiotechPro: a database for microbiologically synthesized products of biotechnological value. Ibragimova S.S., Smirnova O.G., Grigorovich D.A., Khlebodarova T.M. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
TGP (Transgene Promoters): a database of biotechnologically important plant gene promoters. Smirnova O.G., Ibragimova S.S., Grigorovich D.A., Kochetоv A.V. The 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)
2004
PDBSITE, PDBLIGAND and PDBSITESCAN: a computational workbench for the recognition of the structural and functional determinants in protein tertiary structures combined with protein draft docking Ivanisenko V.A., Pintus S.S., Krestyanova M.A., Demenkov P.S., Znobisheva E.K., Ivanov E.E., Grigorovich D.A. 2. Fourth Intern. Conf. on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
1999
Электронная версия информационного вестника ВОГиС Лаврюшев С.В., Григорович Д.А. IV рабочее совещание по электронным публикациям - EL-PUB-99
Компьютерная система ГЕНЭКСПРЕСС как электронная библиотека по структурам и функциям ДНК, РНК и белков Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Григорович Д.А., Пономаренко М.П., Фролов А.С., Подколодный Н.Л., Колпаков Ф.А., Куропатов Д.А., Пономаренко Ю.В., Лаврюшев С.В., Кочетов А.В., Ананько Е.А., Фокин О.Н., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Афонников Д.А. IV рабочее совещание по электронным публикациям - EL-PUB-99
Григорович Д.А., Лаврюшев С.В. Создание WWW-сайта конференции BGRS-98 Григорович Д.А., Лаврюшев С.В. IV рабочее совещание по электронным публикациям - EL-PUB-99
Гранты
2019
5-я Международная научная конференция «Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений» (PlantGen2019) РФФИ, номер гранта 19-04-20015
2015
Организация 3-ей Международной конференции «Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений» РФФИ, номер гранта 15-04-20430
2013
Организация и проведение пятой Международной школы молодых ученых «Системная биология и биоинформатика» РФФИ, номер гранта 13-04-06827мол_г
2005
Теоретическое исследование особенностей эволюции белков, обусловленных координированными заменами аминокислотных остатков РФФИ, номер гранта 05-04-49141
Компьютерный анализ структурной организации и эволюции функциональных сайтов глобулярных белков РФФИ, номер гранта 05-04-49283
Патенты
2007
База данных: Биотехнологически значимые продукты (BiotechPro) Ибрагимова С.М., Смирнова О.Г., Григорович Д.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А. Номер патента №2007620105
База данных: Трансген-Промотор (TGProm) Смирнова О.Г., Ибрагимова С.М., Кочетов А.В., Григорович Д.А., Колчанов Н.А. Номер патента № 2007620101