 |
Publications
| 2024 |
A Knockout of Poly(ADP-Ribose) Polymerase 1 in a Human Cell Line: An Influence on Base Excision Repair Reactions in Cellular Extracts
Khodyreva S.N., Ilina E.S., Dyrkheeva N.S., Kochetkova A.S., Yamskikh A.A., Maltseva E.A., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Zakian S.M., Lavrik O.I.
[Cells]
|
|
Detection of ER stress in iPSC-derived neurons carrying the p.N370S mutation in the GBA1 gene
Yarkova E.S., Grigor’eva E.V., Medvedev S.P., Tarasevich D.A., Pavlova S.V., Valetdinova K.R., Minina J.M., Zakian S.M., Malakhova A.A.
[Biomedicines]
|
|
Generation of iPSCs from a patient with the M694V mutation in the MEFV gene associated with Familial Mediterranean fever and their differentiation into macrophages
Grigor’eva E.V., Karapetyan L.V., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Minina J.M., Hayrapetyan V.H., Vardanyan V.S., Zakian S.M., Arakelyan A., Zakharyan R.
[INT J MOL SCI]
|
|
Transcriptomic analysis of HEK293A cells with a CRISPR/Cas9-mediated TDP1 knockout
Dyrkheeva N.S., Zakharenko A.L., Malakhova A.A., Okorokova L.S., Shtokalo D.N., Medvedev S.P., Tupikin A.A., Kabilov M.R., Lavrik O.I.
[BBA-GEN SUBJECTS]
|
| 2023 |
Mutant-Huntingtin Molecular Pathways Elucidate New Targets for Drug Repurposing
Makeeva V.S., Dyrkheeva N.S., Lavrik O.I., Zakian S.M., Malakhova A.A.
[INT J MOL SCI]
|
|
An Induced Pluripotent Stem Cell Line (ICGi023-A) Obtained from a Patient with Parkinson’s Disease Associated Polymorphisms in LRRK2 and PINK1 Genes
Malakhova A.A., Pavlova S.V., Grigor’eva E.V., Medvedev S.P., Minina J.M., Vyatkin Y.V., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Kovalenko L.V., Zakian S.M.
[RUSS J DEV BIOL+]
|
|
Biochemical characteristics of iPSC-derived dopaminergic neurons from N370S GBA variant carriers with and without Parkinson's disease
Grigor’eva E.V., Kopytova A.E., Yarkova E.S., Pavlova S.V., Sorogina D.A., Malakhova A.A., Malankhanova T.B., Baydakova G.V., Zakharova E.Y., Medvedev S.P., Pchelina S.N., Zakian S.M.
[INT J MOL SCI]
|
|
Creation of Induced Pluripotent Stem Cells ICGi044-B and ICGi044-C Using Reprogramming of Peripheral Blood Mononuclear Cells of a Patient with Parkinson's Disease Associated with c.1492T>G Mutation in the GLUD2 Gene
Sorogina D.A., Grigor’eva E.V., Malakhova A.A., Pavlova S.V., Medvedev S.P., Vyatkin Y.V., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Zakian S.M.
[RUSS J DEV BIOL+]
|
|
Generation of an Induced Pluripotent Stem Cell Line, ICGi042-A, by Reprogramming Peripheral Blood Mononuclear Cells from a Parkinson’s Disease Patient with c.1000G>A Mutation in the LRRK2 Gene
Grigor’eva E.V., Pavlova S.V., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Minina J.M., Vyatkin Y.V., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Kovalenko L.V., Zakian S.M.
[RUSS J DEV BIOL+]
|
|
Generation of three induced pluripotent stem cell lines (RAUi001-A, RAUi001-B and RAUi001-C) from peripheral blood mononuclear cells of a healthy Armenian individual
Grigor’eva E.V., Malakhova A.A., Ghukasyan L., Hayrapetyan V., Atshemyan S., Vardanyan V., Zakian S.M., Zakharyan R., Arakelyan A.
[STEM CELL RES]
|
|
IPSC-derived astrocytes contribute to in vitro modeling of Parkinson’s disease caused by the GBA1 N370S mutation
Yarkova E.S., Grigor’eva E.V., Medvedev S.P., Pavlova S.V., Zakian S.M., Malakhova A.A.
[INT J MOL SCI]
|
|
PARP1 Gene Knockout Suppresses Expression of DNA Base Excision Repair Genes
Zakharenko A.L., Malakhova A.A., Dyrkheeva N.S., Okorokova L.S., Medvedev S.P., Zakian S.M., Kabilov M.R., Tupikin A.A., Lavrik O.I.
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
|
|
Transcriptomic Analysis of CRISPR/Cas9-Mediated PARP1-Knockout Cells under the Influence of Topotecan and TDP1 Inhibitor
Dyrkheeva N.S., Malakhova A.A., Zakharenko A.L., Okorokova L.S., Shtokalo D.N., Pavlova S.V., Medvedev S.P., Zakian S.M., Nushtaeva A.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Khodyreva S.N., Luzina O.A., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I.
[INT J MOL SCI]
|
|
Transgenic Lines of Human Induced Pluripotent Stem Cells ICGi022-A-6 and ICGi022-A-7 with Doxycycline-Inducible Variants of Programmable Nuclease AsCas12a
Pavlova S.V., Valetdinova K.R., Malankhanova T.B., Polivtsev D.E., Malahova A.A.,
Grigor’eva E.V., Shevchenko A.I., Zakian S.M., Medvedev S.P.
[RUSS J DEV BIOL+]
|
|
Usnic Acid Derivatives Inhibit DNA Repair Enzymes Tyrosyl-DNA Phosphodiesterases 1 and 2 and Act as Potential Anticancer Agents
Zakharenko A.L., Dyrkheeva N.S., Luzina O.A., Filimonov A.S., Mozhaitsev E.S., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Zakian S.M., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I.
[Genes]
|
|
Линия индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi023-A, полученная от пациента с полиморфизмами в генах LRRK2 и PINK1, ассоциириванными с болезнью Паркинсона
Малахова А.А., Павлова С.В., Григорьева Е.В., Медведев С.П., Минина Ю.М., Вяткин Ю.В., Хабарова Е.А., Рзаев Д.А., Коваленко Л.В., Закиян С.М.
[Онтогенез]
|
|
Нокаут по гену PARP1 подавляет экспрессию генов эксцизионной репарации оснований ДНК
Захаренко А.Л., Малахова А.А., Дырхеева Н.С., Окорокова Л.С., Медведев С.П., Закиян С.М., Кабилов М.Р., Тупикин А.А., Лаврик О.И.
[Doklady Akademii Nauk]
|
|
Создание линии индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi042-A с помощью репрограммирования мононуклеарных клеток периферической крови пациента с болезнью Паркинсона, ассоциированной с мутацией c.1000G>A в гене LRRK2
Григорьева Е.В., Павлова С.В., Малахова А.А., Медведев С.П., Минина Ю.М., Вяткин Ю.В., Хабарова Е.А., Рзаев Дж.А., Коваленко Л.В., Закиян С.М.
[Онтогенез]
|
|
Создание линии индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi043-A с помощью репрограммирования мононуклеарных клеток периферической крови пациента с болезнью Паркинсона, ассоциированной с патологическим вариантом p.G2019S LRRK2
Григорьева Е.В., Павлова С.В., Малахова А.А., Яркова Е.С., Сорогина Д.А., Минина Ю.М., Милюхина И.В., Николаев Н.А., Пчелина С.Н., Медведев С.П., Закиян С.М.
[Онтогенез]
|
|
Создание линий индуцированных плюрипотентных стволовых клеток ICGi044-B и ICGi044-C с помощью репрограммирования мононуклеарных клеток периферической крови пациента с болезнью Паркинсона, ассоциированной с мутацией c.1492T>G в гене GLUD2
Сорогина Д.А., Григорьева Е.В., Малахова А.А., Павлова С.В., Медведев С.П., Вяткин Ю.В., Хабарова Е.А., Рзаев Дж.А., Закиян С.М.
[Онтогенез]
|
|
Трансгенные линии индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека ICGI022-A-6 и ICGI022-A-7 с доксициклин-управляемыми вариантами программируемой нуклеазы AsCas12a
Павлова С.В., Валетдинова К.Р., Маланханова Т.Б., Поливцев Д.Е., Малахова А.А., Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Закиян C.М., Медведев С.П.
[Онтогенез]
|
| 2022 |
Adamantane-Monoterpenoid Conjugates Linked via Heterocyclic Linkers Enhance the Cytotoxic Effect of Topotecan
Munkuev AA, Dyrkheeva NS, Kornienko TE, Ilina ES, Ivankin DI, Suslov EV, Korchagina DV, Gatilov YV, Zakharenko AL, Malakhova AA, Reynisson J, Volcho KP, Salakhutdinov NF, Lavrik OI.
[MOLECULES]
|
|
CRISPR-Cas9 mediated knockout of AnxA6 gene enhances influenza A virus replication in low-permissive HEK293FT cell line
Komissarov A., Sergeeva M., Zhuravlev E., Medvedev S., Malakhova A., Andreeva E., Shurygina A.P., Gorshkov A., Timofeeva M., Balakhonova E., Grudinin M., Zakian S., Richter V., Stepanov G. CRISPR-Cas9 mediated knockout of AnxA6 gene enhances influenza A virus replication in low-permissive HEK293FT cell line
[GENE]
|
|
Generation of induced pluripotent stem cell line, ICGi033-A, by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with Huntington's disease
Grigor’eva E.V., Malakhova A.A., Sorogina D.A., Pavlova S.V., Malankhanova T.B., Abramycheva N.Yu., Klyushnikov S.A., Illarioshkin S.N., Zakian S.M.
[STEM CELL RES]
|
|
Generation of induced pluripotent stem cell line, ICGi034-A, by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with Parkinson’s disease associated with GBA mutation
Grigor’eva E.V., Drozdova E.S., Sorogina D.A., Malakhova A.A., Pavlova S.V., Vyatkin Y.V., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Medvedev S.P., Zakian S.M.
[STEM CELL RES]
|
|
Investigating Antisense Transcription at the HTT Locus
Eugeny A. Elisaphenko, Anastasia A. Malakhova
[8th Scientific and Practical Conference "Biotechnology: Science and Practice"]
|
|
Nanoscale Detonation Carbon Demonstrates Biosafety in Human Cell Culture
Malakhova AA, Rybin DK, Shtertser AA, Dudina DV.
[Micromachines]
|
|
Oxidative Stress Research on Huntington's Disease Neurons Using Genetically Encoded Biosensors
Tuyana Malankhanova, Dayaana Vasileva, Elena Grigor'eva, Sergey Medvedev, Suren Zakian, Anastasia Malakhova
[8th Scientific and Practical Conference "Biotechnology: Science and Practice"]
|
|
Oxidative stress monitoring in iPSC-derived motor neurons using genetically encoded biosensors of H2O2
Ustyantseva E., Pavlova S.V., Malakhova A.A., Ustyantsev K., Zakian S.M., Medvedev S.P.
[SCI REP-UK]
|
| 2021 |
Electron microscopic analysis of autophagy in neurons
with expanded CAG repeats in the huntingtin gene in patientspecific and transgenic cell model
Lyubov Suldina, Ksenia Morozova, Tuyana Malanhanova, Anastasia Malakhova, Elena Kiseleva
[Cell Death Discovery]
|
|
Generation of an induced pluripotent stem cell line ICGi030-A from a Wilson’s disease patient carrying a frameshift mutation p.Lys1013fs and missense mutation p.H1069Q in the ATP7B gene
Zhigalina D.I., Malakhova A.A., Vasilyeva O.Yu., Grigor’eva E.V., Sivtsev A.A., Kolesnikov N.A., Lopatkina M.E., Savchenko R.R., Zhalsanova I.Zh., Postrigan’ A.E., Zarubin A.A., Nikitina T.V., Bueverov A.O., Bogomolov P.O., Zakian S.M., Skryabin N.A.
[STEM CELL RES]
|
|
New Hybrid Compounds Combining Fragments of Usnic Acid and Monoterpenoids for Effective Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1 Inhibition
Dyrkheeva N.S., Filimonov A.S., Luzina O.A., Zakharenko A.L., Ilina E.S., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Reynisson J., Volcho K.P., Zakian S.M., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I.
[Biomolecules]
|
|
New Hybrid Compounds Combining Fragments of Usnic Acid and Thioether Are Inhibitors of Human Enzymes TDP1, TDP2 and PARP1
Dyrkheeva N.S., Filimonov A.S., Luzina O.A., Orlova K.A., Chernyshova I.A., Kornienko T.E., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Zakharenko A.L., Ilina E.S., Anarbaev R.O., Naumenko K.N., Klabenkova K.V., Burakova E.A., Stetsenko D.A., Zakian S.M., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I.
[INT J MOL SCI]
|
| 2020 |
Design, synthesis, and biological investigation of novel classes of 3-carene-derived potent inhibitors of TDP1
Il'ina I.V., Dyrkheeva N.S., Zakharenko A.L., Sidorenko A.Y., Li-Zhulanov N.S., Korchagina D.V., Chand R., Ayine-Tora D.M., Chepanova A.A., Zakharova O.D., Ilina E.S., Reynisson J., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Zakian S.M., Volcho K.P., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I.
[MOLECULES]
|
|
A Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived
Isogenic Model of Huntington’s Disease Based on
Neuronal Cells Has Several Relevant
Phenotypic Abnormalities
Tuyana Malankhanova, Lyubov Suldina, Elena Grigor'eva, Sergey Medvedev, Julia Minina, Ksenia Morozova, Elena Kiseleva, Suren Zakian, Anastasia Malakhova
[J. Pers. Med]
|
|
Generation of GABAergic striatal neurons by a novel iPSC differentiation protocol enabling scalability and cryopreservation of progenitor cells
Grigor’eva E.V., Malankhanova T.B., Surumbayeva A., Pavlova S.V., Minina J.M., Kizilova E.A., Suldina L.A., Morozova K.N., Kiseleva E., Sorokoumov E.D., Lebedev I.N., Zakian S.M, Malakhova A.A.
[CYTOTECHNOLOGY]
|
|
Generation of induced pluripotent stem cell line ICGi018-A from peripheral blood mononuclear cells of a patient with Huntington’s disease
Malakhova A.A., Grigor’eva E.V., Malankhanova T.B., Pavlova S.V., Valetdinova K.R., Abramycheva N.Yu., Vetchinova A.S., Illarioshkin S.N., Zakian S.M.
[STEM CELL RES]
|
|
Generation of induced pluripotent stem cell lines ICGi021-A and ICGi022-A from peripheral blood mononuclear cells of two healthy individuals from Siberian population
Malakhova A.A., Grigor'eva E.V., Pavlova S.V., Malankhanova T.B., Valetdinova K.R., Vyatkin Y.V., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Zakian S.M., Medvedev S.P.
[STEM CELL RES]
|
|
Generation of two induced pluripotent stem cell lines from peripheral blood mononuclear cells of a patient with Wilson's disease
Malakhova A.A., Grigor'eva E.V., Vasilyeva O.Yu., Zhigalina D.I., Skryabin N.A., Sivtcev A.A., Kolesnikov N.A., Bueverov A.O., Lebedev I.N., Bogomolov P.O., Zakian S.M.
[STEM CELL RES]
|
|
Introducing an Expanded Trinucleotide
Repeat Tract into the Human Genome for
Huntington’s Disease Modeling In Vitro
Tuyana Malankhanova, Michael Sorokin, Sergey Medvedev, Suren Zakian, Anastasia Malakhova
[Current protocols in human genetics.]
|
| 2019 |
Generation of induced pluripotent stem cell line, ICGi007-A, by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with Huntington’s disease
Grigor’eva E.V., Malankhanova T.B., Surumbayeva A., Minina J.M., Morozov V.V., Abramycheva N.Yu., Illarioshkin S.N., Malakhova A.A., Zakian S.M.
[STEM CELL RES]
|
|
Increase in Sensitivity of HEK293FT Cell to Influenza Infection by CRISPR-Cas9-Mediated Knockout of IRF7 Transcription Factor
A. B. Komissarov, M. V. Sergeeva, E. V. Mozhaeva, N. V. Eshchenko, A. D. Vasilyeva, K. A. Vasiliev, S. P. Medvedev, A. A. Malakhova, E. A. Balakhonova, S. Yu. Malanin,T. V. Grigorieva, E. S. Zhuravlev, D. V. Semenov, V. A. Richter, G. A. Stepanov
[RUSS J BIOORG CHEM+]
|
|
Исследование мутантного фенотипа изогенной клеточной модели болезни Хантингтона
Маланханова Т.Б., Григорьева Е.В., Сульдина Л.А., Морозова К.Н., Киселева Е.В., Закиян С.М., Малахова А.А.
[Гены и клетки]
|
| 2018 |
Impact of Xist RNA on chromatin modifications and transcriptional silencing maintenance at different stages of imprinted X chromosome inactivation in vole Microtus levis
Shevchenko A.I., Grigor'eva E.V., Medvedev S.P., Zakharova I.S., Dementyeva E.V., Elisaphenko E.A., Malakhova A.A., Pavlova S.V., Zakian S.M.
[CHROMOSOMA]
|
|
Introducing an expanded CAG tract into the huntingtin gene causes a wide spectrum of ultrastructural defects in cultured human cells.
Morozova KN, Suldina LA, Malankhanova TB, Grigor'eva EV, Zakian SM, Kiseleva E, Malakhova AA.
[PloS One]
|
|
Ultrastructural defects in isogenic lines of human cells with expanded CAG repeats in the huntingtin gene obtained via the CRISPR/Cas9 technology
K.N. Morozova, L.A. Suldina, T.B. Malankhanova, E.V. Grigor'eva, S.M. Zakian, E. Kiseleva, A.A. Malakhova
[Гены и клетки]
|
|
Исследование выживаемости и функциональной активности кардиомиоцитов, дифференцированных из ИПСК человека, при трансплантации в мышей линии SCID
Павлова С.В., Чепелева Е.В., Дементьева Е.В., Григорьева Е.В., Сорокоумов Е.Д., Слотвицкий М.М., Понаморенко А.В., Малахова А.А., Докучаева А.А., Сергеевичев Д.С., Покушалов Е.А., Закиян С.М.
[Гены и клетки]
|
| 2017 |
Modern Genome Editing Technologies in Huntington's Disease Research
Malankhanova T.B., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Zakian S.M.
[J Huntingtons Dis.]
|
|
Моделирование болезни Хантингтона на клетках линии HEK293
Шарипова Д.В., Маланханова Т.Б., Малахова А.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Оптимизация инструментов геномного редактирования для получения клеточных моделей болезни Хантингтона
Маланханова Т.Б., Малахова А.А., Закиян С.М.
[Гены и клетки]
|
|
Паттерн экспрессии и альтернативный сплайсинг гена HTT в тканях человека
Малахова А.А., Елисафенко Е.А.
[Гены и клетки]
|
|
Создание протокола направленной дифференцировки индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека в средние шипиковые нейроны с возможностью продолжительного культивирования и трансгенеза предшественников данных клеток
Григорьева Е.В., Маланханова Т.Б., Сурумбаева А., Павлова С.В., Малахова А.А., Закиян С.М.
[Гены и клетки]
|
| 2016 |
Использование методов редактирования генома для создания изогенных клеточных линий, моделирующих болезнь Хантингтона in vitro
Малахова А.А., Сорокин М.А., Сорокина А.Е., Маланханова Т.Б., Мазурок Н.А., Медведев С.П., Закиян С.М.
[Гены и клетки]
|
|
Стратегии редактирования паралогичных генов с помощью CRISPR/Cas9
Немудрый А.А., Маланханова Т.Б., Малахова А.А., Медведев С.П., Закиян С.М.
[Гены и клетки]
|
| 2015 |
Использование кардиальной культуры клеток КМК-Luc, маркированной экспрессией люциферазы, для оптимизации протокола интрамиокардиальной трансплантации
Е.А. Милевская, А.А. Немудрый, Е. В. Чепелева, А. А. Малахова, С. В. Павлова, А. А. Докучаева, Д.С. Сергеевичев, С. М. Закиян
[Патология кровообращения и кардиохирургия]
|
|
Сравнение мезенхимальных стромальных клеток костного мозга и региональных стволовых клеток сердца и фибробластов кожи человека
Павлова С.В., Сергеевичев Д.С., Чепелева Е.В., Козырева В.С., Малахова А.А., Захарова И.С., Григорьева Е.В., Покушалов Е.А., Закиян С.М.
[Патология кровообращения и кардиохирургия]
|
|
Терапия хронического кардиосклероза у крыс линии WAG культурами кардиоваскулярных клеток, обогащенными стволовыми клетками сердца
Е.В.Чепелева, С.В.Павлова, А.А.Малахова, Е.А.Милевская, Я.Л.Русакова, Н.А.Подхватилина, Д.С.Сергеевичев, Е.А.Покушалов, А.М.Караськов, Г.Т.Сухих, С.М.Закиян
[Клеточные технологии в биологии и медицине]
|
| 2013 |
Характеристика индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека с помощью ДНК-микрочипов
Медведев С.П., Сметанина М.А., Шевченко А.И., Захарова И.С., Малахова А.А., Григорьева Е.В., Дементьева Е.В., Александрова М.А., Полтавцева Р.А., Верясов В.Н., Филипенко М.Л., Сухих Г.Т., Закиян С.М.
[B EXP BIOL MED+]
|
|
Характеристика кардиальных культур клеток, полученных из экспланта сердечной мышцы человека
С.В. Павлова, П.П. Перовский, Е.В. Чепелева, А.А. Малахова, Е.В. Дементьева, Е.А. Покушалов, Г.Т. Сухих, С.М. Закиян
[B EXP BIOL MED+]
|
| 2011 |
Human induced pluripotent stem cells derived from fetal neural stem cells successfully undergo directed differentiation into cartilage
Medvedev S.P., Grigor’eva E.V., Shevchenko A.I., Malakhova A.A., Dementyeva E.V., Shilov A.A., Pokushalov E.A., Zaidman A.M., Aleksandrova M.A., Plotnikov E.Yu., Sukhikh G.T., Zakian S.M.
[STEM CELLS DEV]
|
|
Variability of sequence surrounding the Xist gene in rodents suggests taxon-specific regulation of X chromosome inactivation
Shevchenko A.I., Malakhova A.A., Elisaphenko E.A., Mazurok N.A., Nesterova T.B., Brockdorff N., Zakian S.M.
[PloS One]
|
| 2010 |
Получение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток из фибробластов кожи плода человека
Медведев С.П., Малахова А.А., Григорьева Е.В., Шевченко А.И., Дементьева Е.В., Соболев И.А., Лебедев И.Н., Шилов А.Г., Жимулев И.Ф., Закиян С.М.
[Acta Naturae]
|
|
Сравнительный анализ регуляторного района DXPas34 грызунов
Малахова А.А., Пяткова М.С., Елисафенко Е.А., Шевченко А.И., Кель А.Э., Закиян С.М.
[RUSS J GENET+]
|
|
|
