 |
Publications
| 2024 |
Developmental and housekeeping genes: two types of genetic organization in the Drosophila genome
Igor Zhimulev, Tatyana Vatolina, Victor Levitsky, Anton Tsukanov
[INT J MOL SCI]
|
|
Genomic background sequences systematically outperform synthetic ones in de novo motif discovery for ChIP-seq data
Vladimir V. Raditsa,
Anton V. Tsukanov,
Anton G. Bogomolov,
Victor G. Levitsky
[NAR Genomics and Bioinformatics]
|
|
Программный комплекс MetArea для анализа взаимоисключающей встречаемости в парах мотивов сайтов связывания транскрипционных факторов по данным ChIP-seq
Левицкий В.Г., Цуканов А.В., Меркулова Т.И
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2023 |
РАЗВИТИЕ ИДЕИ Н.К. КОЛЬЦОВА О ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ОРГАНИЗАЦИИ
МЕЖДИСКОВ ПОЛИТЕННЫХ ХРОМОСОМ DROSOPHILA MELANOGASTER
И. Ф. Жимулев, Т. Ю. Ватолина, В. Г. Левицкий,
Т. Д. Колесникова, А. В. Цуканов
[Онтогенез]
|
| 2022 |
CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana
Lavrekha VV, Levitsky VG, Tsukanov AV, Bogomolov AG, Grigorovich DA, Omelyanchuk N, Ubogoeva EV, Zemlyanskaya EV, Mironova V
[Frontiers in Plant Science]
|
|
Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis
Tsukanov, A. V., Mironova V. V., Levitsky V. G.
[Frontiers in Plant Science]
|
|
Transcription Factors as Important Regulators of Changes in Behavior through Domestication of Gray Rats: Quantitative Data from RNA Sequencing
Oshchepkov, D., Chadaeva I., Kozhemyakina R., Shikhevich S., Sharypova E., Savinkova L., Klimova N.V., Tsukanov A., Levitsky V.G., Markel A.L.
[INT J MOL SCI]
|
| 2021 |
Метод поиска структурной гетерогенности сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием альтернативных de novo моделей на примере FOXA2
А.В. Цуканов , В.Г. Левицкий, Т.И. Меркулова
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2018 |
Компьютерная база данных для анализа дифференциально экспрессирующихся генов, связанных с агрессивным поведением, на моделях лабораторных животных
Анатолий Олегович Брагин, Кирилл Александрович Табанюхов, Ирина Витальевна Чадаева, Антон Витальевич Цуканов, Роман Олегович Бабенко, Ирина Вадимовна Медведева, Антон Геннадьевич Богомолов, Владимир Николаевич Бабенко, Юрий Львович Орлов
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
|
|
Компьютерные средства анализа регуляции экспрессии генов и альтернативного сплайсинга
Дергилев А.И., Табанюхов К.А., Цуканов А.В., Брагин А.О., Орлов Ю.Л.
[Гены и клетки]
|
|
Компьютерный анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq
С. С. Ковалев, Е. Ю. Леберфарб, Н. В. Губанова, А. О. Брагин, А. Г. Галиева,А. В. Цуканов, В. Н. Бабенко, Ю. Л. Орлов
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
|
|
Программы статистической обработки, кластеризации и визуализации распределения сайтов связывания транскрипционных факторов в геноме
Цуканов А.В., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Орлов Ю.Л
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
|
|
Реконструкция геномного распределения кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов, связанных с поддержанием плюрипотентности.
Цуканов А.В., Дергилев А.И., Богомолов А.Г., Орлов Ю.Л.
[Гены и клетки]
|
| 2017 |
Компьютерные методы анализа хромосомных контактов в ядре клетки по данным технологий секвенирования
Орлов Ю.Л., Тьерри О., Богомолов А.Г., Цуканов А.В., Кулакова Е.В., Галиева Э.Р., Брагин А.О., Ли Г.
[Биомедицинская химия]
|
|
Компьютерный анализ кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов в эмбриональных стволовых клетках
Дергилев А.И., Цуканов А.В., Орлов Ю.Л.
[Гены и клетки]
|
|
|
