 |
Publications
| 2024 |
Catching the Big Fish in Big Data: A Meta-Analysis of Zebrafish Kidney scRNA-Seq Datasets Highlights Conserved Molecular Profiles of Macrophages and Neutrophils in Vertebrates
Aleksandr V Bobrovskikh, Ulyana S Zubairova, Ludmila G Naumenko, Alexey V Doroshkov
[Biology]
|
|
Image-Based Quantitative Analysis of Epidermal Morphology in Wild Potato Leaves
Zubairova U.S., Fomin I.N., Koloshina K.A., Barchuk A.I., Erst T.V., Chalaya N.A., Gerasimova S.V., Doroshkov A.V.
[Plants]
|
|
Thraustochytrids: Evolution, Ultrastructure, Biotechnology, and Modeling
Menzorov A.G., Iukhtanov D.A., Naumenko L.G., Bobrovskikh A.V., Zubairova U.S., Morozova K.N., Doroshkov A.V.
[INT J MOL SCI]
|
| 2023 |
Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei
Aleksandr V. Bobrovskikh, Ulyana S. Zubairova, Alexey V. Doroshkov
[Biology]
|
|
Реконструкция и анализ регуляторной генной сети функционирования клеточной стенки листьев Arabidopsis thaliana L. при ответе на водный дефицит
A.R. Volyanskaya, E.A. Antropova, U.S. Zubairova, P.S. Demenkov, A.S. Venzel, Y.L. Orlov, A.A. Makarova,
T.V. Ivanisenko, T.A. Gorshkova, A.R. Aglyamova, N.A. Kolchanov, M. Chen, V.A. Ivanisenko
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2022 |
Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus
Ulyana S. Zubairova, Aleksandra Yu. Kravtsova, Alexander V. Romashchenko, Anastasiia A. Pushkareva, Alexey V. Doroshkov
[Plants]
|
|
Transcriptomic Data Meta-Analysis Sheds Light on High Light Response in Arabidopsis thaliana L.
Бобровских Александр Владимирович
Зубаирова Ульяна Станиславовна
Бондарь Евгения Ивановна
Лавреха Виктория Вадимовна
Дорошков Алексей Владимирович
[INT J MOL SCI]
|
| 2021 |
A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis
Aleksandr Bobrovskikh, Alexey Doroshkov, Stefano Mazzoleni, Fabrizio Cartenì, Francesco Giannino, Ulyana Zubairova
[Frontiers in Genetics]
|
|
A computational model of the cereal leaves hydraulics
S V Nikolaev, U S Zubairova
[JPCS]
|
|
Comparative transcriptome profiling of a resistant vs susceptible bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivar in response to water deficit and cold stress
Dmitrii K. Konstantinov, Ulyana S. Zubairova, Anton A. Ermakov, Alexey V. Doroshkov
[PeerJ]
|
| 2020 |
Subcellular compartmentalization of the plant antioxidant system: an integrated overview
Aleksandr Bobrovskikh, Ulyana Zubairova, Alexey Kolodkin, Alexey Doroshkov
[PeerJ]
|
| 2019 |
LSM-W2: Laser Scanning Microscopy Worker for Wheat Leaf Surface Morphology
Zubairova U.S., Verman P.Yu., Oshchepkova P.S., Elsukova A.S., Doroshkov A.V.
[BMC SYST BIOL]
|
|
Numerical Algorithm for Morphogen Synthesis Region Identification with Indirect Image-Type Measurement Data
Penenko A.V., Zubairova U.S., Mukatova Z., Nikolaev S.V.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Stress-induced changes in the expression of antioxidant system genes for rice (Oryza sativa L.) and bread wheat (Triticum aestivum L.)
Anton Ermakov, Aleksandr Bobrovskikh, Ulyana Zubairova, Dmitrii Konstantinov, Alexey Doroshkov
[PeerJ]
|
|
Системный подход к моделированию развития листостебельных грибных инфекций пшеницы
Николаев С.В., Зубаирова У.С., Сколотнева Е.С., Орлова Е.А., Афонников Д.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2018 |
Analysis of the Basic Characteristics of Osteogenic and Chondrogenic Cell Lines Important for Tissue Engineering Implants
Astakhova N.M., Korel’ A.V., Shchelkunova E.I., Orishchenko K.E., Nikolaev S.V., Zubairova U.S., Kirilova I.A.
[B EXP BIOL MED+]
|
|
Паттерн эпидермиса листа пшеницы как модель для изучения влияния стрессовых условий на морфогенез
Зубаирова У. С., Дорошков А. В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2017 |
Изучение базовых характеристик клеток остеогенного и хондрогенного рядов, значимых для тканевой инженерии имплантов
Астахова Н.М., Корель А.В., Щелкунова Е.И., Орищенко К.Е., Николаев С.В., Зубаирова У.С, Кирилова И.А.
[Клеточные технологии в биологии и медицине]
|
| 2016 |
Mechanical Behavior of Cells within a Cell-Based Model of Wheat Leaf Growth
Zubairova U, Nikolaev S, Penenko A, Podkolodnyy N, Golushko S, Afonnikov D, Kolchanov N
[Frontiers in Plant Science]
|
| 2015 |
A computational model of the effect of symplastic growth on cell mechanics in a linear leaf blade
Zubairova U., Golushko S., Penenko A., Nikolaev S.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
|
|
Применение сопряжённых уравнений для исследования чувствительности в модели симпластного роста клеток линейного листа
А.В. Пененко, У.С. Зубаирова, С.В. Николаев
[Труды Международной конференции АКТУАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНОЙ И ПРИКЛАДНОЙ МАТЕМАТИКИ – 2015 посвященной 90-летию со дня рождения академика Г. И. Марчука]
|
| 2014 |
L-Система для моделирования плоских одномерно растущих растительных тканей
Зубаирова У.С., Голушко С.К., Пененко А.В., Николаев С.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Models of Regulation of Stem Cell Niche Structure in Shoot Apical Meristem
U. S. Zubairova, S. V. Nikolaev
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Применение технологии CUDA для моделирования процессов реакции-диффузии на двумерном клеточном ансамбле
Пененко А.В., Троеглазова Т.С, Зубаирова У.С., Байшибаев Д.Ж., Николаев С.В.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
|
| 2013 |
Model of Structuring the Stem Cell Niche in Shoot Apical Meristem of Arabidopsis thaliana
S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, E. D. Mjolsness, B. E. Shapiro, and Academician N. A. Kolchanov
[Doklady Biological Sciences]
|
|
Modeling of plant embryo morphodynamics at early developmental stages
S. V. Nikolaev, N. A. Kolchanov, S. K. Golushko, J. -C. Palauqui, A. Urban, E. V. Amelina, A. V. Yurchenko, K. S. Golushko, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, A. Trubuil
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
|
|
Модели регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега
У.С. Зубаирова, С.В. Николаев
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Модель регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега Arabidopsis thaliana
С. В. Николаев, У. С. Зубаирова, А. В. Пененко, Э. Д. Мелснесс (E. D. Mjolsness), Б. Е. Шапиро (B. E. Shapiro), Н. А. Колчанов
[Doklady Akademii Nauk]
|
| 2012 |
Моделирование морфодинамики на ранних стадиях эмбриогенеза растения
Николаев С.В., Колчанов Н.А., Голушко С.К., Палаки Ж.-К., Урбан О., Амелина Е.В., Юрченко А.В., Голушко К.С., Зубаирова У.С., Пененко А.В., Трубюй А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
|
Моделирование роста и развития растительных тканей в формализме L-систем
Зубаирова У.С., Пененко А.В., Николаев С.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
|
| 2011 |
A Study of a One-Dimensional Model of Regulation of the Renewing Zone Size in a Biological Tissue Accounting for Cell Division
S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, S. I. Fadeev, E. Mjolsness, N. A. Kolchanov
[Journal of Applied and Industrial Mathematics]
|
| 2010 |
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учётом деления клеток
Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И., Мйолснесс Э., Колчанов Н.А.
[Сибирский журнал индустриальной математики]
|
|
|
