Leonid Bryzgalov Department: - Pluralist: Laboratory of diabetes pharmacogenomics Laboratory of Gene Expression Regulation Room: 4105 Email: leon_l@bionet.nsc.ru

Publications

2024	The Search for and Functional Analysis of Genetic Variants in microRNA-Binding Sites using Massively Parallel Reporter Assay E Yu Rykova, N I Ershov, A O Degtyareva, L O Bryzgalov, E L Lushnikova [B EXP BIOL MED+]
2022	The functional insight into the genetics of cardiovascular disease: results from the post-GWAS study L.O. Bryzgalov, E.E. Korbolina, I.S. Damarov, T.I. Merkulova [Vavilov journal of genetics and breeding]
2021	A Panel of rSNPs Demonstrating Allelic Asymmetry in Both ChIP-seq and RNA-seq Data and the Search for Their Phenotypic Outcomes through Analysis of DEGs Elena E Korbolina, Leonid O Bryzgalov, Diana Z Ustrokhanova, Sergey N Postovalov, Dmitry V Poverin, Igor S Damarov, Tatiana I Merkulova [INT J MOL SCI]
2020	Accessing the impact of functional variants on human phenotypes by transcriptome analysis in individuals carrying different rSNP alleles Korbolina Elena, Bryzgalov Leonid, Postovalov Sergey, Nedelko Victor, Berikov Vladimir, Merkulova Tatiana [IEEE Xplore digital library]
	On the Relationship between Regulatory and Exomic DNA Markers Postovalov Sergey, Berikov Vladimir, Bryzgalov Leonid, Korbolina Elena [IEEE Xplore digital library]
2018	Molecular adaptations to social defeat stress and induced depression in mice Natalya Bondar, Leonid Bryzgalov, Nikita Ershov, Fedor Gusev, Vasiliy Reshetnikov, Damira Avgustinovich, Mikhail Tenditnik, Evgeny Rogaev, Tatiana Merkulova [MOL NEUROBIOL]
	Novel Approach to Functional SNPs Discovery from Genome-Wide Data Reveals Promising Variants for Colon Cancer Risk Elena E. Korbolina, Ilja I. Brusentsov, Leonid O. Bryzgalov, Elena Yu. Leberfarb, Arina O. Degtyareva and Tatyana I. Merkulova [HUM MUTAT]
	Novel functional variants at the GWAS-implicated loci might confer risk to major depressive disorder, bipolar affective disorder and schizophrenia. Bryzgalov L.O., Korbolina E.E., Brusentsov I.I., Leberfarb E.Y., Bondar N.P., Merkulova T.I. [BMC NEUROSCI]
2017	Circulating DNA in rheumatoid arthritis: pathological changes and association with clinically used serological markers. Rykova E, Sizikov A, Roggenbuck D, Antonenko O, Bryzgalov L, Morozkin E, Skvortsova K, Vlassov V, Laktionov P, Kozlov V. [ARTHRITIS RES THER]
2016	Regulatory single nucleotide polymorphisms (rSNPs) at the promoters 1A and 1B of the human APC gene Marina Yu Matveeva, Elena V. Kashina, Vasily V. Reshetnikov, Leonid O. Bryzgalov, Elena V. Antontseva, Natalia P. Bondar and Tatiana I. Merkulova [BMC GENET]
	Выявление новых регуляторных SNP-маркеров, ассоциированных с предрасположенностью к развитию колоректального рака Леберфарб Е.Ю., Брызгалов Л.О., Брусенцов И.И., Меркулова Т.И. [Vavilov journal of genetics and breeding]
2015	Regulatory single nucleotide polymorphisms at the beginning of intron 2 of the human KRAS gene Elena V Antontseva, Marina Yu Matveeva , Natalia P Bondar, Elena V Kashina, Elena Yu Leberfarb, Leonid O Bryzgalov, Polina A Gervas, Anastasia A Ponomareva, Nadezhda V Cherdyntseva, Yury L Orlov, Tatiana I Merkulova [J BIOSCIENCES]
	Выявление и функциональный анализ регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстого кишечника Леберфарб Е.Ю., Брызгалов Л.О., Брусенцов И.И., Дегтярева А.О., Меркулова Т.И. [Медицинская генетика]
	Изучение потенциально регуляторных SNPs в промоторных районах гена АРС человека Матвеева М.Ю., Кашина Е.В., Брызгалов Л.О., Антонцева Е.В., Бондарь Н.П., Решетников В.В., Меркулова Т.И. [Медицинская генетика]
	Эпигенетические «зонды» для мониторинга рака легкого: профиль метилирования элементов LINE-1 в циркулирующей ДНК крови А. А. Пономарева, Е. Ю. Рыкова, Н. В. Чердынцева, А. А. Бондарь, А. Ю. Добродеев, А. А. Завьялов, С. А. Тузиков, Л. О. Брызгалов, Т. И. Меркулова, В. В. Власов, П. П. Лактионов [Vavilov journal of genetics and breeding]
2014	Application of quantitative trait locus mapping and transcriptomics to studies of the senescence-accelerated phenotype in rats. Korbolina EE, Ershov NI, Bryzgalov LO, Kolosova NG [BMC GENOMICS]
	Program complex SNP-MED for analysis of single-nucleotide polymorphism (SNP) effects on the function of genes associated with socially significant diseases N. L. Podkolodnyy, D. A. Afonnikov, Yu. Yu. Vaskin, L.O. Bryzgalov, V. A. Ivanisenko, P. S. Demenkov, M.P. Ponomarenko, D.A. Rasskazov, K. V. Gunbin, I. V. Protsyuk, I.Yu. Shutov, P.N. Leontyev, M.Yu. Fursov, N.P. Bondar, E.V. Antontseva, T.I. Merkulova, and N.A. Kolchanov [Russian Journal of Genetics: Applied Research]
	rSNP_Guide-based evaluation of SNPs in promoters of the human APC and MLH1 genes associated with colon cancer D. A. Rasskazov, E. V. Antontseva, L. O. Bryzgalov, M. Yu. Matveeva, E. V. Kashina, P. M. Ponomarenko, G. V. Orlova, M. P. Ponomarenko, D. A. Afonnikov, T. I. Merkulova [Russian Journal of Genetics: Applied Research]
2013	Detection of Regulatory SNPs in Human Genome Using ChIP-seq ENCODE Data Leonid O. Bryzgalov, Elena V. Antontseva, Marina Yu. Matveeva, Alexander G. Shilov, Elena V. Kashina, Viatcheslav A. Mordvinov, Tatyana I. Merkulova [PloS One]
	From binding motifs in ChIP-Seq data to improved models of transcription factor binding sites. Kulakovskiy I, Levitsky V, Oshchepkov D, Bryzgalov L, Vorontsov I, Makeev V. [Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
	Potentialities of aberrantly methylated circulating DNA for diagnostics and post-treatment follow-up of lung cancer patients. Ponomaryova AA, Rykova EY, Cherdyntseva NV, Skvortsova TE, Dobrodeev AY, Zav'yalov AA, Bryzgalov LO, Tuzikov SA, Vlassov VV, Laktionov PP. [LUNG CANCER]
	ОЦЕНКА ПО ТЕХНОЛОГИИ rSNP_Guide SNPs ПРОМОТОРОВ ГЕНОВ АРС И МLH1 ЧЕЛОВЕКА, СВЯЗАННЫХ С РАКОМ ТОЛСТОГО КИШЕЧНИКА Д.А. Рассказов, Е.В. Антонцева, Л.О. Брызгалов,М.Ю. Матвеева, Е.В. Кашина, П.М. Пономаренко, Г.В. Орлова, М.П. Пономаренко, Д.А. Афонников, Т.И. Меркулова [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Программный комплекс SNP-MED для анализа влияния однонуклеотидных полиморфизмов на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, Ю.Ю. Васькин, Л.О. Брызгалов, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, М.П. Пономаренко, Д.А. Рассказов, К.В. Гунбин, И.В. Процук, И.Ю. Шутов, П.Н. Леонтьев, М.Ю. Фурсов, Н.П. Бондарь, Е.В. Антонцева, Т.И. Меркулова, Н.А. Колчанов. [Vavilov journal of genetics and breeding]
2012	Search for regulatory SNPs associated with colon cancer in the APC and MLH1 genes E. V. Antontseva, L. O. Bryzgalov, M. Yu. Matveeva, E. V. Kashina, N. V. Cherdyntseva and T. I. Merkulova [Russian Journal of Genetics: Applied Research]
	Unbiased approach to profile the variety of small non-coding RNA of human blood plasma with massively parallel sequencing technology. Semenov DV, Baryakin DN, Brenner EV, Kurilshikov AM, Vasiliev GV, Bryzgalov LA(LO), Chikova ED, Filippova JA, Kuligina EV, Richter VA. [Expert Opin Biol Ther.]
2011	Поиск регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстой кишки, в генах АРС и МLH1. Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Матвеева М.Ю., Кашина Е.В., Чердынцева Н.В., Меркулова Т.И. [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Разработка методов распознования сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA, их экспериментальная верификация и использование для анализа данных массовой иммунопреципитации хроматина Левицкий В. Г., Ощепков Д. Ю., Ершов Н. И., Брызгалов Л. О., Антонцева Е. В., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А. [Doklady Akademii Nauk]
2009	Изменения транскриптома печени крысы под действием гепатоканцерогенного для этих животных 3МЕДАБ и неканцерогенного ОАТ Н.И. Ершов, В.Г. Левицкий, Д.Ю. Ощепков, О.В. Вишневский, Л.О. Брызгалов, Е.В. Антонцева, Т.И. Меркулова. [Информационный вестник ВОГИС]
2008	Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов FOXA, связанных с регуляцией пролиферации Брызгалов Л.О., Ершов Н.И., Ощепков Д.Ю., Каледин В.И., Меркулова Т.И. [BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
2007	Транскрипционные факторы FOXA определяют амплитуду глюкокортикоидной индукции тирозинаминотрансферазы у мышей Брызгалов Л.О., Ершов Н.И., Ильницкая С.И. [B EXP BIOL MED+]