Diagnosis of Familial Hypercholesterolemia in Children and Young Adults Olga Timoshchenko, Dinara Ivanoshchuk, Sergey Semaev, Pavel Orlov, Valentina Zorina, Elena Shakhtshneider INT J MOL SCI, 2024, 25(1), 314
Search for Metabolomic Markers of Hypertensive Conditions of Different Genesis: Experimental Study А. А. Seryapina, А. А. Sorokoumova, Yu. K. Polityko, L. V. Yanshole, Yu. P. Tsentalovich, М. А. Gilinsky, А. L. Markel J EVOL BIOCHEM PHYS+, 2024, Volume 60, pages 10–21
TAD border deletion at the Kit locus causes tissue-specific ectopic activation of a neighboring gene. Kabirova E, Ryzhkova A, Lukyanchikova V, Khabarova A, Korablev A, Shnaider T, Nuriddinov M, Belokopytova P, Smirnov A, Khotskin NV, Kontsevaya G, Serova I, Battulin N. NAT COMMUN, 2024
Alterations in the brain serotonin system and serotonin-regulated behavior during aging in zebrafish males and females Evsiukova V.S., Sorokin I.E., Kulikov P.A., Kulikov A.V. BEHAV BRAIN RES, 2024, V. 466, P.115000
Ассоциация вариантов генов АРОЕ, СЕТР и хромосомного региона 9Р21.3 с ишемической болезнью сердца, инфарктом миокарда и острой сердечной недостаточностью Семаев С.Е., Щербакова Л.В., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Малютина С.К., Гафаров В.В., Воевода М.И., Рагино Ю.И., Шахтшнейдер Е.В. Атеросклероз, 2024, 20(2):121-135
The relationship between rs35089892 CAMK2B gene and atrial fibrillation in a case-control study based on prospective cohort Shapkina M.Yu., Ivanova A.A., Semaev S., Shcherbakova L.V., Maximov V.N., Malyutina S.K. ATHEROSCLEROSIS, 2024, 395(Suppl1): 117761
Catching the Big Fish in Big Data: A Meta-Analysis of Zebrafish Kidney scRNA-Seq Datasets Highlights Conserved Molecular Profiles of Macrophages and Neutrophils in Vertebrates Aleksandr V Bobrovskikh, Ulyana S Zubairova, Ludmila G Naumenko, Alexey V Doroshkov Biology, 2024, 13(10):773
Nitrogen deficiency differentially affects lignin biosynthesis genes and flavanols accumulation in tolerant and susceptible tea genotypes (Camellia sinensis (L.) Kuntze) Lidiia Samarina, Lyudmila Malyukova, Songbo Wang, Yang Li, Alexey Doroshkov, Aleksandr Bobrovskikh, Ruset Shkhalakhova, Natalia Koninskaya, Alexandra Matskiv, Andrey Velikiy, Alexey Ryndin, Elena Khlestkina Plant Stress, 2024
In Vitro vs. In Vivo Transcriptomic Approach Revealed Core Pathways of Nitrogen Deficiency Response in Tea Plant (Camellia sinensis (L.) Kuntze) Lidiia Samarina, Lyudmila Malyukova, Songbo Wang, Aleksandr Bobrovskikh, Alexey Doroshkov, Ruset Shkhalakhova, Karina Manakhova, Natalia Koninskaya, Alexandra Matskiv, Alexey Ryndin, Elena Khlestkina, Yuriy Orlov INT J MOL SCI, 2024
Rare Variants Of Obesity-Associated Genes In Young Adults With Abdominal Obesity Bairqdar A., Shakhtshneider E., Ivanoshchuk D., Mikhailova S., Kashtanova E., Shramko V., Polonskaya Ya.V., Ragino Y.I. J. Pers. Med, 2023, 13(10), 1500
Searching for new genes associated with the familial hypercholesterolemia phenotype using whole-genome sequencing and machine learning D.E. Ivanoshchuk, A.B. Kolker, O.V. Timoshchenko, S.E. Semaev, E.V. Shakhtshneider Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, Том 27/ Номер 5. Страницы 522-529
Prevalence of Common Alleles of Some Stress Resilience Genes among Adolescents Born in Different Periods Relative to the Socioeconomic Crisis of the 1990s in Russia Mikhailova, S.V.; Ivanoshchuk, D.E.; Yushkevich, E.A.; Bairqdar, A.; Anisimenko, M.S.; Shcherbakova, L.V.; Denisova, D.V.; Orlov, P.S. CURR ISSUES MOL BIOL, 2023, 2023, 45(1), 51-65
Длительная непрерывная компьютерная регистрация и анализ двигательной активности группы лабораторных рыб вида Danio rerio Куликов П.А., Сорокин И.Е., Евсюкова В.С., Куликов А.В. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2023, Т. 175, Выпуск 1, С. 122-127
Functionally Significant Variants in Genes Associated with
Abdominal Obesity: A Review Bairqdar A., Ivanoshchuk D., Shakhtshneider E. J. Pers. Med, 2023, 13, 460
Анализ ассоциации вариантов генов аполипопротеинов APOA2, APOA5 и APOH с гиперлипидемией С. В. Михайлова, Д. Е. Иванощук, Н. С. Широкова, П. С. Орлов, А. Бейркдар, Е. В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2023, Том 19, № 1 (2023), С. 6-18
Insight into the Natural History of Pathogenic Variant c.919-2A>G in the SLC26A4 Gene Involved in Hearing Loss: The Evidence for Its Common Origin in Southern Siberia (Russia) Danilchenko V. Y., Zytsar M. V., Maslova E. A., Orishchenko K.E, Posukh O.L. Genes, 2023, 14, 928.
Association of Common Variants of APOE, CETP, and the 9p21.3 Chromosomal Region with the Risk of Myocardial Infarction: A Prospective Study Sergey Semaev, Elena Shakhtshneider, Liliya Shcherbakova, Pavel Orlov, Dinara Ivanoshchuk, Sophia Malyutina, Valery Gafarov, Mikhail Voevoda, Yuliya Ragino INT J MOL SCI, 2023, 24(13)
Functional Consequences of Pathogenic Variants of the GJB2 Gene (Cx26) Localized in Different Cx26 Domains Olga L. Posukh, Ekaterina A. Maslova, Valeriia Yu. Danilchenko, Marina V. Zytsar, Konstantin E. Orishchenko Biomolecules, 2023, 13(10):1521
Assessment of the Genetic Characteristics of a Generation Born during a Long-Term Socioeconomic Crisis Svetlana V. Mikhailova; Dinara E. Ivanoshchuk; Pavel S. Orlov; Ahmad Bairqdar; Maksim S. Anisimenko; Diana V. Denisova Genes, 2023, Volume 14, Issue 11, 2064
Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei Aleksandr V. Bobrovskikh, Ulyana S. Zubairova, Alexey V. Doroshkov Biology, 2023, 12(12),1516
Исследование ассоциации морбидного ожирения у жительниц Кировского и Октябрьского районов города Новосибирска с вариантами нуклеотидной последовательности генов TCF7L2, FABP2, FTO. Зорина В.В., Мельникова Е.С., Иванова А.А., Гуражева А.А., Максимов В.Н. Терапия, 2023
Метаболомный профиль сыворотки крови при экспериментальной артериальной гипертензии А. А. Серяпина, А. А. Малявко, Ю. К. Политыко, Л. В. Яньшоле, Ю. П. Центалович, А. Л. Маркель Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, Том 27, № 5, стр. 530-538
Некоторые генетические маркеры, ассоциированные с тяжестью течения COVID-19 у человека. Зорина В.В., Худякова А.Д., Гарбузова Е.В ПРОФИЛАКТИЧЕСКАЯ МЕДИЦИНА, 2023
Длительное воздействие короткого светового дня и ингибитора триптофангидроксилазы на поведение и серотониновую систему мозга Danio rerio И.Е.Сорокин, В.С.Евсюкова, А.Б.Арефьева, В.В.Сачкова, П.А.Куликов, А.В.Куликов Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2023, Т. 175 (6), с. 778-785
Age-Related Alterations in the Level and Metabolism of Serotonin in the Brain of Males and Females of Annual Turquoise Killifish (Nothobranchius furzeri) Evsiukova V.S., Arefieva A.B., Sorokin I.E., Kulikov A.V. INT J MOL SCI, 2023, Int. J. Mol. Sci. 2023, 24(4), 3185;
2022
Transcriptomic Data Meta-Analysis Sheds Light on High Light Response in Arabidopsis thaliana L. Бобровских Александр Владимирович
Зубаирова Ульяна Станиславовна
Бондарь Евгения Ивановна
Лавреха Виктория Вадимовна
Дорошков Алексей Владимирович INT J MOL SCI, 2022, 23(8), 4455
Молекулярно-генетическая диагностика гетерозиготной формы семейной гиперхолестеринемии в молодом возрасте: клинический случай О.В. Тимощенко, Д.Е. Иванощук, С.Е. Семаев,
Л.Д. Латынцева, Е.В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2022, Т. 18, №1, с. 76-80
Associations of APOE Gene Variants rs429358 and rs7412 with Parameters of the Blood Lipid Profile and the Risk of Myocardial Infarction and Death in a White Population of Western Siberia Semaev S.E., Shakhtshneider E.V., Shcherbakova L.V., Ivanoshchuk D.E., Orlov P.S., Malyutina S.K., Gafarov V.V., Ragino Yu.I., Voevoda M.I. CURR ISSUES MOL BIOL, 2022, 44(4), 1713-1724
Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus Ulyana S. Zubairova, Aleksandra Yu. Kravtsova, Alexander V. Romashchenko, Anastasiia A. Pushkareva, Alexey V. Doroshkov Plants, 2022, https://www.mdpi.com/2223-7747/11/12/1533/htm
Результаты таргетного секвенирования генов PRL, PRLR, PRLHR у молодых женщин с гиперпролактинемией неопухолевого генеза Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Воевода С.М., Рымар О.Д. Siberian scientific medical journal, 2022, № 4
Selection of Diagnostically Significant Regions of the SLC26A4 Gene Involved in Hearing Loss Danilchenko V.Y.; Zytsar M.V.; Maslova E.A.; Posukh O.L. INT J MOL SCI, 2022, 23(21):13453
Plasma metabolomics and gene regulatory networks analysis reveal the role of nonstructural SARS-CoV-2 viral proteins in metabolic dysregulation in COVID-19 patients V. A. Ivanisenko, E. V. Gaisler, N. V. Basov, A. D. Rogachev, S. V. Cheresiz, T. V. Ivanisenko, P. S. Demenkov, E. L. Mishchenko, O. P. Khripko, Yu. I. Khripko, S. M. Voevoda, T. N. Karpenko, A. J. Velichko, M. I. Voevoda, N. A. Kolchanov, A. G. Pokrovsky SCI REP-UK, 2022, 12, 19977
Isolation and transcriptome analysis of a biotechnologically promising Black Sea protist, Thraustochytrium aureum ssp. strugatskii Dmitrii K. Konstantinov, Aleksei Menzorov, Olga Krivenko, Alexey V. Doroshkov PeerJ, 2022, 10:e12737
Влияние короткого светового дня на поведение и серотониновую систему головного мозга рыб вида Danio rerio Сорокин И.Е., Евсюкова В.С., Куликов А.В. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2022, Т. 173, Выпуск 3, С. 279-284
АССОЦИАЦИЯ ТИРЕОТРОПНОГО ГОРМОНА, ПРОЛАКТИНА И ЛЕПТИНА С МЕТАБОЛИЧЕСКИМ СТАТУСОМ У МОЛОДЫХ ЖЕНЩИН 25-44 ЛЕТ ЗАПАДНОЙ СИБИРИ МУСТАФИНА С.В., АЛФЁРОВА В.И., ВОЕВОДА С.М., ДЕНИСОВА Д.В., ЩЕРБАКОВА Л.В., СТАХНЁВА Е.М., РЫМАР О.Д. Клиническая и экспериментальная тиреоидология, 2022
2021
Different Rates of the SLC26A4-Related Hearing Loss in Two Indigenous Peoples of Southern Siberia (Russia) Valeriia Yu. Danilchenko, Marina V. Zytsar, Ekaterina A. Maslova, Marita S. Bady-Khoo, Nikolay A. Barashkov, Igor V. Morozov, Alexander A. Bondar, Olga L. Posukh Diagnostics, 2021, 11(12), 2378
Comparative transcriptome profiling of a resistant vs susceptible bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivar in response to water deficit and cold stress Dmitrii K. Konstantinov, Ulyana S. Zubairova, Anton A. Ermakov, Alexey V. Doroshkov PeerJ, 2021, PeerJ 9:e11428
A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis Aleksandr Bobrovskikh, Alexey Doroshkov, Stefano Mazzoleni, Fabrizio Cartenì, Francesco Giannino, Ulyana Zubairova Frontiers in Genetics, 2021, Front. Genet. 12:652974
Белок Клото в крови у мужчин с сахарным диабетом 2 типа и его ассоциации с кардиометаболическими факторами риска Тимощенко О.В., Стахнева Е.М., Рагино Ю.И., Никитин Ю.П. Siberian scientific medical journal, 2021, 41 (2): 21–27
Частота метаболического синдрома и его отдельных компонентов у женщин 25–45 лет в зависимости от уровня пролактина Рымар О.Д., Воевода С.М., Шахтшнейдер Е.В., Стахнёва Е.М., Мустафина С.В., Щербакова Л.В. Ожирение и метаболизм, 2021, 18(2):180-189
Analysis of Rare Variants in Genes Related to Lipid Metabolism in Patients with Familial Hypercholesterolemia in Western Siberia (Russia) Elena Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Olga Timoshchenko, Pavel Orlov, Sergey Semaev, Emil Valeev, Andrew Goonko, Nataliya Ladygina and Mikhail Voevoda J. Pers. Med, 2021, 11, 1232-1245
Ассоциация некоторых полиморфизмов с длительностью интервала QT у мужчин Нестерец А.М., Кузнецов А.А., Иванова А.А., Гуражева А.А., Малютина С.К., Денисова Д.В., Максимов В.Н. Терапия, 2021, 2021. - № 9. - С.38-44
ВЛИЯНИЕ КОНТАКТА С ЧЕЛОВЕКОМ И СОДЕРЖАНИЯ В УВЕЛИЧЕННОЙ КЛЕТКЕ НА ПОВЕДЕНИЕ ДОМЕСТИЦИРУЕМЫХ СЕРЕБРИСТО-ЧЁРНЫХ ЛИСИЦ (VULPES VULPES) ШЕПЕЛЕВА Д.В., МАЛЯВКО А.А., МЕЙСТЕР Л.В., ГЕРБЕК Ю.Э. Кролиководство и звероводство, 2021, Номер: 3, Страницы: 22-32
ОКСИТОЦИН: ПЕРВИЧНЫЙ МЕХАНИЗМ ДОМЕСТИКАЦИИ ИЛИ ЕЁ ТОРМОЗ? Гербек Ю.Э., Малявко А.А., Шепелева Д.В., Владимирова А.В. Кролиководство и звероводство, 2021, № 5. С. 31-39.
The frequency of metabolic
syndrome and its individual components in women aged 25–45 years, depending on the level of prolactin. Rymar OD, Voevoda SM, Shachtshneider EV, Stakhneva EM, Mustafina SV, Shcherbakova LV. Ожирение и метаболизм, 2021, 18(2):180-189
2020
Ассоциация вариантов гена СЕТР с изменениями липидного профиля при различных типах питания Н.В. Ожиганова, С.В. Мустафина, Е.В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2020, Т. 16, №1, стр. 53-58
High rates of three common GJB2 mutations c.516G>C, c.-23+1G>A, c.235delC in deaf patients from Southern Siberia are due to the founder effect. Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Y., Maslova E.A., Barashkov N.A., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L. Genes, 2020, 11, 833-850.
Анализ мутационного спектра гена SLC26A4 и его вклада в этиологию наследуемой потери слуха у коренного населения Южной Сибири. Данильченко В.Ю., Зыцарь М.В., Маслова Е.А., Бады-Хоо М.С., Морозов И.В., Бондарь А.А., Посух О.Л. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). С.43-45
Изучение функциональной значимости варианта с.516G>C (p.Trp172Cys) гена GJB2, ассоциированного с потерей слуха у коренного населения Южной Сибири Маслова Е.А., Зыцарь М.В., Данильченко В.Ю., Орищенко К.Е., Посух О.Л. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). С.51-53
БЕЛОК КЛОТО В КРОВИ У МУЖЧИН С ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНЬЮ СЕРДЦА И ЕГО АССОЦИАЦИИ С ЛИПИДНЫМ ПРОФИЛЕМ Тимощенко О.В., Рагино Ю.И., Стахнёва Е.М., Каштанова Е.В., Никитин Ю.П. Атеросклероз, 2020, Т. 16. № 1. С. 5-8.
Associations of separate working memory parameters with Apolipoprotein E gene polymorphism at the Siberian adolescents: the population-based study Sukhanov A., Semaev S., Denisova D., Maksimov V. EUR J NEUROL, 2020, Vol. 27, S1, P. 1064
Associations of separate working memory parameters with COMT genotypes in Western Siberia Sukhanov A., Semaev S., Maksimov V. EUR J NEUROL, 2020, Vol. 27, S1, P. 1064
Genetic Risk Score for Coronary Heart Disease: Review Sergey Semaev and Elena Shakhtshneider J. Pers. Med, 2020, 10(4), 239, 1-18
Сердечно-сосудистые осложнения и эффективность гиполипидемической терапии у пациентов с семейной гиперхолестеринемией и пациентов очень высокого сердечно- сосудистого риска: три года наблюдения регистра ренессанс. Чубыкина У.В., Ежов М.В., Дупляков Д.В., Садыкова Д.И., Сластникова Е.С., Ершова А.И., Мешков А.Н., Рожкова Т.А., Близнюк С.А., Тмоян Н.А., Качковский М.А., Генкель В.В., Гуревич В.С., Уразгильдеева С.А., Трегубов А.В., Коновалова Т.В., Воевода М.И., Бажан С.С., Тимощенко О.В., Воробьев А.С. и др. Кардиологический вестник, 2020, Т. 15. № 3. С. 27-36.
2019
АССОЦИАЦИИ МЕТАБОЛИЧЕСКИХ ФАКТОРОВ РИСКА ТЕРАПЕВТИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ С РАЗНЫМ УРОВНЕМ ПОТРЕБЛЕНИЯ ПРОСТЫХ УГЛЕВОДОВ Мустафина С.В., Симонова Г.И., Облаухова В.И., Кунцевич А.К., Рагино Ю.И., Щербакова Л.В., Рымар О.Д. Атеросклероз, 2019, Т. 15, № 1, С. 41-48.
Unique mutational spectrum of the GJB2 gene and its pathogenic contribution to deafness in Tuvinians (Southern Siberia, Russia): a high prevalence of rare variant c.516G>C (p.Trp172Cys). Posukh O.L., Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Bondar A.A., Morozov I.V., Maximov V.N., Voevoda M.I. Genes, 2019, Jun 5;10(6). pii: E429
Analysis of Polymorphism rs1333049 (Located at 9P21.3) in the White Population of Western Siberia and Associations with Clinical and Biochemical Markers Elena Shakhtshneider, Pavel Orlov, Sergey Semaev, Dinara Ivanoshchuk,Sofia Malyutina, Valery Gafarov, Yuliya Ragino and Mikhail Voevoda Biomolecules, 2019, 9, 290
Ассоциации отдельных параметров оперативной памяти с генотипами СОМТ в Западной Сибири Суханов А.В., Семаев С.Е., Максимов В.Н. Медицинская генетика, 2019, Т. 18, №6, С. 43-49
Association of RS708272 (CETP Gene Variant) with Lipid Profile Parameters and the Risk of Myocardial Infarction in the White Population of Western Siberia Sergey Semaev, Elena Shakhtshneider, Pavel Orlov, Dinara Ivanoshchuk, Sophia Malyutina, Valery Gafarov, Yuliya Ragino and Mikhail Voevoda Biomolecules, 2019, Biomolecules 2019, 9(11), 739
Genes Potentially Associated with Familial Hypercholesterolemia Mikhailova S., Ivanoshchuk D., Timoshchenko O. and Shakhtshneider E. Biomolecules, 2019, 9(12), 807;
РЕГИСТР ПАЦИЕНТОВ С СЕМЕЙНОЙ ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИЕЙ И ПАЦИЕНТОВ ОЧЕНЬ ВЫСОКОГО СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТОГО РИСКА С НЕДОСТАТОЧНОЙ ЭФФЕКТИВНОСТЬЮ ПРОВОДИМОЙ ГИПОЛИПИДЕМИЧЕСКОЙ ТЕРАПИИ (РЕНЕССАНС). Ежов М.В., Близнюк С.А., Тмоян Н.А., Рожкова Т.А., Дупляков Д.В., Сальченко В.А., Качковский М.А., Шапошник И.И., Генкель В.В., Гуревич В.С., Уразгильдеева С.А., Трегубов А.В., Музалевская М.В., Бажан С.С., Тимощенко О.В., Урванцева И.А., Кожокарь К.Г., Соколов А.А., Тишко В.В., Боева О.И. и Российский Кардиологический Журнал, 2019
Влияние потребления красного мяса и мясной продукции на заболеваемость колоректальным раком Н.В. Ожиганова, С.В. Мустафина Интерактивная наука, 2019, 2019. – № 12 (46), 1-8.
Показатели тиреотропного гормона
и пролактина в популяционной выборке женщин
в возрасте 25–45 лет О.Д. Рымар, С.М. Воевода, Д.В. Денисова, Е.В.Шахтшнейдер,Е.М. Стахнёва,Л.В. Щербакова Доктор.Ру., 2019, 46-51
2011
КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА WheatPGE ДЛЯ АНАЛИЗА ВЗАИМОСВЯЗИ ФЕНОТИП-ГЕНОТИП-ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА У ПШЕНИЦЫ М.А. Генаев, A.В. Дорошков, Е.В. Морозова, Т.А. Пшеничникова, Д.А. Афонников Vavilov journal of genetics and breeding, 2011
Анализ особенностей морфологии и наследования опушения листа пшеницы Triticum aestivum L. с помощью компьютерных методов фенотипирования. Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А. RUSS J GENET+, 2011, Т. 47, № 6, с. 839–843.
2009
Применение компьютерного анализа микроизображений листа для оценки характеристик опушения листа пшеницы Triticum Aestivum L Дорошков А.В., Арсенина С.И., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А. Информационный вестник ВОГИС, 2009, №13, Том1, с 218-226
