Сравнительный анализ гаплотипов, несущих патогенные варианты c.1545T>G, c.2027T>A и c.919-2A>G гена SLC26A4, у пациентов с потерей слуха из Республики Тыва (Южная Сибирь) В.Ю. Данильченко, М.В. Зыцарь, Е.А. Панина, К.Е. Орищенко, О.Л. Посух Vavilov journal of genetics and breeding, 2025, 29(1): 144-152
Полвека популяционной генетики народов Сибири: исследования Людмилы Павловны Осиповой Захаров ИК, Посух ОЛ Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2025, Т.11, №1, стр 17-28
Analysis by Minigene Assay of the Splicing Effect of a Novel Variant c.1545T>G in the SLC26A4 Gene Associated with Hearing Loss E. A. Panina, V. Yu. Danilchenko, M. V. Zytsar, K. E. Orishchenko, and O. L. Posukh RUSS J GENET+, 2025
2024
Diagnosis of Familial Hypercholesterolemia in Children and Young Adults Olga Timoshchenko, Dinara Ivanoshchuk, Sergey Semaev, Pavel Orlov, Valentina Zorina, Elena Shakhtshneider INT J MOL SCI, 2024, 25(1), 314
Ассоциация вариантов генов АРОЕ, СЕТР и хромосомного региона 9Р21.3 с ишемической болезнью сердца, инфарктом миокарда и острой сердечной недостаточностью Семаев С.Е., Щербакова Л.В., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Малютина С.К., Гафаров В.В., Воевода М.И., Рагино Ю.И., Шахтшнейдер Е.В. Атеросклероз, 2024, 20(2):121-135
GCK-MODY у молодых мужчин: значение поведенческих и кардиометаболических факторов риска в развитии осложнений Рымар О.Д., Галенок Р.Б., Иванощук Д.Е., Долинская Ю.А., Дудина М.В., Каширина А.П., Овсянникова А.К., Мельникова П.М., Смолеусова В.Г., Шахтшнейдер Е.В. Доктор.Ру., 2024, Том 23, № 4, стр. 60-66
Сравнение наборов для измерения концентрации ДНК
методом флюоресценции на нижней границе
диапазона измерений П.С. Орлов, О.П. Хрипко, Т.C. Кокорина, М.И. Воевода Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2024, N3 ТОМ 10 страницы 42-46
Whole-exome sequencing reveals an association of rs112065068 in TGOLN2 gene with distant metastasis of non-small cell lung cancer Whole-exome sequencing reveals an association of rs112065068 in TGOLN2 gene with distant metastasis of non-small cell lung cancer.
Gerashchenko T, Skitchenko R, Korobeynikova A, Kuanysheva K, Khozyainova A, Vorobiev R, Rodionov E, Miller S, Topolnitsky E, Shefer N, Anisimenko M, Zhuikova L, Vashisth M, Pankova O, Perelmuter V, Rezapova V, Artomov M, Denisov E. GENE, 2024, Gene . 2024 Aug 20:920:148507. doi: 10.1016/j.gene.2024.148507.
Взаимодействие генетических и средовых детерминант в формировании
липидного профиля у подростков Михайлова С.В., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Шахтшнейдер Е.В., Денисова Д.В. Атеросклероз, 2024, Атеросклероз, 2024; 20 (4): 342–354.
Исследование полиморфного варианта гена холодового рецептора TRPM8 (rs7593557) в 15 популяциях Алтае-Саянского региона, Западной Сибири и Дальнего Востока М. А. Губина, В. Н. Бабенко, Е. Ю. Губина Генетика, 2024, том 60, № 8, с. 74–81
Rare Variants Of Obesity-Associated Genes In Young Adults With Abdominal Obesity Bairqdar A., Shakhtshneider E., Ivanoshchuk D., Mikhailova S., Kashtanova E., Shramko V., Polonskaya Ya.V., Ragino Y.I. J. Pers. Med, 2023, 13(10), 1500
Searching for new genes associated with the familial hypercholesterolemia phenotype using whole-genome sequencing and machine learning D.E. Ivanoshchuk, A.B. Kolker, O.V. Timoshchenko, S.E. Semaev, E.V. Shakhtshneider Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, Том 27/ Номер 5. Страницы 522-529
Prevalence of Common Alleles of Some Stress Resilience Genes among Adolescents Born in Different Periods Relative to the Socioeconomic Crisis of the 1990s in Russia Mikhailova, S.V.; Ivanoshchuk, D.E.; Yushkevich, E.A.; Bairqdar, A.; Anisimenko, M.S.; Shcherbakova, L.V.; Denisova, D.V.; Orlov, P.S. CURR ISSUES MOL BIOL, 2023, 2023, 45(1), 51-65
СИГНАЛЫ НАПРАВЛЕННОГО ОТБОРА В ПОПУЛЯЦИЯХ КОРЕННОГО НАСЕЛЕНИЯ СИБИРИ Колесников Н.А., Харьков В.Н., Зарубин А.А., Воевода М.И., Губина М.А., Штыгашева О.В., Максимова Н.Р., Сухомясова А.Л., Степанов В.А. Генетика, 2023, 2022. Т. 58. № 4. С. 473-477.
Leukocyte telomere length and mitochondrial DNA copy number association with colorectal cancer risk in an ageing population Malyutina S.K., Maximov V.N., Chervova O., Orlov P., Voloshin V., Ryabikov A.N., Voevoda M.I,, Nikitenko T.M. Global Translational Medicine, 2023, 2(1):184
The Mutation Spectrum of Rare Variants in the Gene of Adenosine Triphosphate (ATP)-Binding Cassette Subfamily C Member 8 in Patients with a MODY Phenotype in Western Siberia Dinara Ivanoshchuk, Elena Shakhtshneider, Svetlana Mikhailova, Alla Ovsyannikova, Oksana Rymar, Emil Valeeva, Pavel Orlov, Mikhail Voevoda J. Pers. Med, 2023, 13(2), 172
Effects of Positive Fighting Experience and Its Subsequent Deprivation on the Expression Profile of Mouse Hippocampal Genes Associated with Neurogenesis Redina O.E., Babenko V.N., Smagin D.A., Kovalenko I.L., Galyamina A.G., Efimov V.M., Kudryavtseva N.N. INT J MOL SCI, 2023, Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 3040
Functionally Significant Variants in Genes Associated with
Abdominal Obesity: A Review Bairqdar A., Ivanoshchuk D., Shakhtshneider E. J. Pers. Med, 2023, 13, 460
Анализ ассоциации вариантов генов аполипопротеинов APOA2, APOA5 и APOH с гиперлипидемией С. В. Михайлова, Д. Е. Иванощук, Н. С. Широкова, П. С. Орлов, А. Бейркдар, Е. В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2023, Том 19, № 1 (2023), С. 6-18
Insight into the Natural History of Pathogenic Variant c.919-2A>G in the SLC26A4 Gene Involved in Hearing Loss: The Evidence for Its Common Origin in Southern Siberia (Russia) Danilchenko V. Y., Zytsar M. V., Maslova E. A., Orishchenko K.E, Posukh O.L. Genes, 2023, 14, 928.
RESULTS OF TARGETED SEQUENCING OF PRL, PRLR, AND PRLHR GENES IN YOUNG WOMEN WITH NONNEOPLASTIC HYPERPROLACTINEMIA SHAKHTSHNEIDER E.V., IVANOSHCHUK D.E., VOEVODA S.M., RYMAR O.D. Cell and Tissue Biology, 2023
Association of Common Variants of APOE, CETP, and the 9p21.3 Chromosomal Region with the Risk of Myocardial Infarction: A Prospective Study Sergey Semaev, Elena Shakhtshneider, Liliya Shcherbakova, Pavel Orlov, Dinara Ivanoshchuk, Sophia Malyutina, Valery Gafarov, Mikhail Voevoda, Yuliya Ragino INT J MOL SCI, 2023, 24(13)
Анализ полиморфизма генов рецепторов врожденного иммунитета у пациентов с коронарным атеросклерозом и в популяционной выборке г. Новосибирска. Михайлова С.В., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Латынцева Л.Д., Каштанова Е.В., Полон-
ская Я.В., Рагино Ю.И., Шахтшнейдер Е.В. Siberian scientific medical journal, 2023, 2023;43(4):97–109
АССОЦИАЦИЯ НАРУШЕНИЯ СНА С РАЗЛИЧНЫМИ ПОЛИМОРФНЫМИ ВАРИАНТАМИ ГЕНА 5-HTTLPR SNP RS25531 A>G У ЛИЦ 25-44 ЛЕТ ГАФАРОВ В.В, ГРОМОВА Е.А., ГАГУЛИН И.В., ПАНОВ Д.О., МАКСИМОВ В.Н., ГУБИНА М.А., ГАФАРОВА А.В. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика, 2023, Том: 15Номер: 1 Год: 2023 Страницы: 43-49
Проблемы изучения направленного естественного отбора у человека С.В. Михайлова Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(6):684-693
Functional Consequences of Pathogenic Variants of the GJB2 Gene (Cx26) Localized in Different Cx26 Domains Olga L. Posukh, Ekaterina A. Maslova, Valeriia Yu. Danilchenko, Marina V. Zytsar, Konstantin E. Orishchenko Biomolecules, 2023, 13(10):1521
The GJB2 (Cx26) Gene Variants in Patients with Hearing Impairment in the Baikal Lake Region (Russia). Pshennikova VG, Teryutin FM, Cherdonova AM, Borisova TV, Solovyev AV, Romanov GP, Morozov IV, Bondar AA, Posukh OL, Fedorova SA, Barashkov NA. Genes, 2023, 14(5):1001
Problems with studying directional natural selection in humans S.V. Mikhailova Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, 27(6):684-693.
Assessment of the Genetic Characteristics of a Generation Born during a Long-Term Socioeconomic Crisis Svetlana V. Mikhailova; Dinara E. Ivanoshchuk; Pavel S. Orlov; Ahmad Bairqdar; Maksim S. Anisimenko; Diana V. Denisova Genes, 2023, Volume 14, Issue 11, 2064
The Relationship between All-Cause Natural Mortality and Copy Number of Mitochondrial DNA in a 15-Year Follow-Up Study Malyutina S.K., Maximov V.N., Chervova O., Orlov P., Ivanova A.A., Mazdorova E.V., Ryabikov A.N., Simonova G.I., Voevoda M.I. INT J MOL SCI, 2023, 24(13): 10469
Serum matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) as a biomarker in paediatric and adult tick-borne encephalitis patients Fortova A., Hönig V., Salat J., Palus M., Pychova M., Krbkova L., Barkhash A. V., Kriha M. F., Chrdle A., Lipoldova M., Ruzek D. VIRUS RES, 2023, Vol. 324, p.199020
Genetic polymorphisms in innate immunity genes influence predisposition to tick‑borne encephalitis Fortova A., Barkhash A. V., Pychova M., Krbkova L., Palus M., Salat J., Ruzek D. J NEUROVIROL, 2023, Vol. 29, pp. 699-705
The leukocyte telomere length, mtDNA copy number and acute coronary syndrome in a 15-year follow-up Maximov V.N., Orlov P., Gurazeva A., Shabanova E., Gafarov V.V., Chervova O., Malyutina S.K. ATHEROSCLEROSIS, 2023, 379(Suppl 1): s44
2022
Анализ ассоциации распространенного варианта rs13107325
гена транспортера двухвалентных катионов SLC39A8 с показателями липидного обмена подростков г. Новосибирска С.В. Михайлова, Д.Е. Иванощук, П.С. Орлов, Д.В. Денисова, Е.В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2022, . Т. 18, No 4. С. 354-361
Генетическая предрасположенность человека и лабораторных животных к различным инфекциям, передающимся иксодовыми клещами Бархаш А.В. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2022, Т.40, №2, с.3-13
Dorsal Striatum Transcriptome Profile Profound Shift in Repeated Aggression Mouse Model Converged to Networks of 12 Transcription Factors after Fighting Deprivation Vladimir Babenko, Olga Redina, Dmitry Smagin, Irina Kovalenko, Anna Galyamina, Roman Babenko, Natalia Kudryavtseva Genes, 2022
Agent‐Based Modeling of Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A) Prevalence with Regard to Intensity of Selection Pressure in Isolated Human Population Georgii P. Romanov , Anna A. Smirnova , Vladimir I. Zamyatin, Aleksey M. Mukhin, Fedor V. Kazantsev,
Vera G. Pshennikova, Fedor M. Teryutin, Aisen V. Solovyev, Sardana A. Fedorova, Olga L. Posukh,
Sergey A. Lashin and Nikolay A. Barashkov Biology, 2022, Biology 2022, 11, 257. https://doi.org/10.3390/biology11020257
ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК И ШЕСТИ ГЕНОВ
ЯДЕРНОГО ГЕНОМА В ПОПУЛЯЦИИ АМУРСКИХ ЭВЕНКОВ М. А. Губина, В. Н. Бабенко, В. А. Бацевич, Н. А. Лейбова, А. П. Забияко Генетика, 2022, том 58, № 1, с. 52–67
LPS Administration Impacts Glial Immune Programs by Alternative Splicing Vladimir N. Babenko
Galina T. Shishkina
Dmitriy A. Lanshakov
Ekaterina V. Sukhareva
Nikolay N. Dygalo Biomolecules, 2022, Spec Edition Biomolecules and Biomarkers in Head and Neck Medicine
Молекулярно-генетическая диагностика гетерозиготной формы семейной гиперхолестеринемии в молодом возрасте: клинический случай О.В. Тимощенко, Д.Е. Иванощук, С.Е. Семаев,
Л.Д. Латынцева, Е.В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2022, Т. 18, №1, с. 76-80
Associations of APOE Gene Variants rs429358 and rs7412 with Parameters of the Blood Lipid Profile and the Risk of Myocardial Infarction and Death in a White Population of Western Siberia Semaev S.E., Shakhtshneider E.V., Shcherbakova L.V., Ivanoshchuk D.E., Orlov P.S., Malyutina S.K., Gafarov V.V., Ragino Yu.I., Voevoda M.I. CURR ISSUES MOL BIOL, 2022, 44(4), 1713-1724
Результаты таргетного секвенирования генов PRL, PRLR, PRLHR у молодых женщин с гиперпролактинемией неопухолевого генеза Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Воевода С.М., Рымар О.Д. Siberian scientific medical journal, 2022, № 4
Selection of Diagnostically Significant Regions of the SLC26A4 Gene Involved in Hearing Loss Danilchenko V.Y.; Zytsar M.V.; Maslova E.A.; Posukh O.L. INT J MOL SCI, 2022, 23(21):13453
Анализ ассоциаций артериальной гипертензии с 16 генетическими маркерами, отобранными по данным полногеномных исследований Маздорова Е.В., Максимов В.Н., Орлов П.С., Шахматов С.Г., Рябиков А.Н., Воевода М.И., Малютина С.К. Артериальная гипертензия, 2022, 28(1): С.46-57
Результаты секвенирования нового поколения у мужчин с пограничным удлинением интервала QT (пилотное исследование) Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Нестерец А.М., Кузнецов А.А., Иванова А.А., Малютина С.К., Денисова Д.В., Стрюкова Е.В., Максимов В.Н., Максимова С.В. КОМПЛЕКСНЫЕ ПРОБЛЕМЫ СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, 2022, 11(2): 98-106
Ассоциация относительной длины теломер лейкоцитов и количества копий мтДНК с острым коронарным синдромом при 15-летнем наблюдении Максимов В.Н., Орлов П.С., Гуражева А.А., Мельникова Е.С., Гафаров В.В., Чернова О.А., Воевода М.И., Малютина С.К. Успехи геронтологии, 2022, 35(3): 351-360
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ ИНТЕРЛЕЙКИНОВ
IL-17A G197A И IL-17F A7488G У БОЛЬНЫХ РАКОМ ЖЕЛУДКА
В ЗАПАДНО-СИБИРСКОМ РЕГИОНЕ М. А. Губина, И. Г. Соловьева, В. Н. Бабенко, А. В. Соколов, Е. Ю. Губина Генетика, 2022, ГЕНЕТИКА, 2022, том 58, № 7, с. 808–814
Анализ частоты встречаемости гаплотипов гена
дофамин-ß-гидроксилазы у зависимых от синтетических наркотиков Губина М.А., Соловьева И.Г., Бабенко В.Н., Патрикеева О.Н., Губина А.Ю., Щеглова Л.Л. Наркология, 2022, Наркология 2022. Том 21. Номер 8 с. 20-29
The association between genetic markers from GWAS and essential hypertension in a case-control study (Siberian population) E.V. Mazdorova, A. Ryabikov, V.N. Maksomov, P.S.Orlov, S.Malyutina ATHEROSCLEROSIS, 2022, Vol.355, P177, August 2022
The Genetic Predisposition of Human and Laboratory Animals to Different Infections Transmitted by Ixodid Ticks Barkhash A.V. MOL GENET MICROBIOL+, 2022, Vol. 37, No. 2, pp. 55–64.
Внезапная сердечная смерть у молодых мужчин: результаты экзомного секвенирования. Иванова А.А., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Родина И.А., Хамович О.В., Малютина С.К., Новоселов В.П., Максимов В.Н. Атеросклероз, 2022, 18(4): 317-337
2021
Autophagy genes expression profiling in secondary glioblastoma cells transcriptome Gubanova N., Bragin A., Vasiliev G., Babenko V., Ponomarenko M., Orlov Y. Cell Death Discovery, 2021, 7 (SUPPL 1), pp.5-5
Different Rates of the SLC26A4-Related Hearing Loss in Two Indigenous Peoples of Southern Siberia (Russia) Valeriia Yu. Danilchenko, Marina V. Zytsar, Ekaterina A. Maslova, Marita S. Bady-Khoo, Nikolay A. Barashkov, Igor V. Morozov, Alexander A. Bondar, Olga L. Posukh Diagnostics, 2021, 11(12), 2378
Functional Evaluation of a Rare Variant c.516G>C (p.Trp172Cys) in the GJB2 (Connexin 26) Gene Associated with Nonsyndromic Hearing Loss. Maslova E.A., Orishchenko K.E., Posukh O.L. Biomolecules, 2021, 11(1), 61
Биопсихосоциальные предпосылки развития наркотической зависимости в подростковом возрасте. Соловьева И.Г., Патрикеева О.Н., Губина М.А., Рецер Р.А., Ларин А.В., Карпенко Д.А., Cундуева Д.Е . Казанский педагогический журнал, 2021, 2020; (1): 249-254.
The Mutation Spectrum of Maturity Onset Diabetes
of the Young (MODY)-Associated Genes amongWestern Siberia Patients Dinara E. Ivanoshchuk, Elena V. Shakhtshneider, Oksana D. Rymar, Alla K. Ovsyannikova, Svetlana V. Mikhailova, Veniamin S. Fishman, Emil S. Valeev, Pavel S. Orlov and Mikhail I. Voevoda J. Pers. Med, 2021, 11, 57-71
Анализ полиморфизма гена f5 у мужчин с коронарным атеросклерозом с использованием метода полноэкзомного секвенирования Е. В. Стрюкова, Е. В. Шахтшнейдер, Д. Е. Иванощук, Ю. И. Рагино, Я. В. Полонская, И. С. Мурашов, А. М. Волков, А. В. Кургузов, А. М. Чернявский, Э. С. Валеев, В. Н. Максимов, Е. В. Каштанова Атеросклероз, 2021, 17(1):29-37
Polymorphism of genes associated with infectious lung diseases in Northern Asian populations and in patients
with community-acquired pneumonia S.V. Mikhailova , L.V. Shcherbakova, N.I. Logvinenko, I.I. Logvinenko, M.I. Voevoda Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, 25(3):301-309
Autosomal recessive cataract (CTRCT18) in the Yakut population isolate of Eastern Siberia: a novel founder variant in the FYCO1 gene. Barashkov NA, Konovalov FA, Borisova TV, Teryutin FM, Solovyev AV, Pshennikova VG, Sapojnikova NV, Vychuzhina LS, Romanov GP, Gotovtsev NN, Morozov IV, Bondar AA, Platonov FA, Burtseva TE, Khusnutdinova EK, Posukh OL, Fedorova SA. EUR J HUM GENET, 2021, 29(6):965-976.
Genetic etiology of hearing loss in Russia Posukh OL HUM GENET, 2021
АССОЦИАЦИЯ МЕЖДУ ЭВОЛЮЦИОННОЙ КОНСЕРВАТИВНОСТЬЮ
ДЛИННЫХ НЕКОДИРУЮЩИХ РНК И ПРИСУТСТВИЕМ
CPG-ОСТРОВОВ Сидоренко ИА, Рогозин ИБ, Бабенко ВН Успехи современной биологии, 2021, том 141, No 2, с. 107–117
Innate-Immunity Genes in Obesity S.V. Mikhailova, D.E. Ivanoshchuk J. Pers. Med, 2021, 11(11):1201. https://doi.org/10.3390/jpm11111201
Analysis of Rare Variants in Genes Related to Lipid Metabolism in Patients with Familial Hypercholesterolemia in Western Siberia (Russia) Elena Shakhtshneider, Dinara Ivanoshchuk, Olga Timoshchenko, Pavel Orlov, Sergey Semaev, Emil Valeev, Andrew Goonko, Nataliya Ladygina and Mikhail Voevoda J. Pers. Med, 2021, 11, 1232-1245
НЕКОТОРЫЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ ТЯЖЕСТИ ТЕЧЕНИЯ ИНФАРКТА МИОКАРДА Орлов П.С., Ложкина Н.Г., Максимов В.Н., Малютина С.К., Гафаров В.В., Воевода М.И. Атеросклероз, 2021, Т. 17. № 2. С. 5-11.
A common founder effect of the splice site variant c.‑23+1G>A in GJB2 gene causing autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) in Eurasia Solovyev AV, Kushniarevich A, Bliznetz E, Bady-Khoo M, Lalayants MR, Markova TG, Minárik G, Kádasi L, Metspalu E, Pshennikova VG, Teryutin FM, Khusnutdinova EK, Poliakov A, Мetspalu M, Posukh OL, Barashkov NA, Fedorova SA. HUM GENET, 2021
Особенности геномного распределения регионов высокой гомозиготности у
коренного населения Северной Евразии на индивидуальном и популяционном
уровне на основе анализа SNP высокой плотности Н. А. Колесников, В. Н. Харьков, А.А. Зарубин, М.О. Раджабов, М.И.
Воевода, М.А. Губина, Э.К. Хуснутдинова, С.С. Литвинов, Н. В. Екомасова,
О. В. Штыгашева, Н. Р. Максимова, А. Л. Сухомясова, . А. Степанов. Генетика, 2021, Т57, N11, c.1261-1275
Вариант G319S гена HNF1A при семейной форме сахарного диабета. Д.Е. Иванощук, С.В. Михайлова, А.К. Овсянникова, Е.В. Шахтшнейдер, И.В. Друк, О.Д. Рымар, М.И. Воевода. Терапия, 2021, 2021; 9: 148–154.
Высокопроизводительные молекулярно-генетические технологии для поиска новых этиопатогенетических факторов развития атеросклероза Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Валеев Э.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И. Атеросклероз, 2021, 17(3):83-84
Течение GCK-MODY диабета у лиц старше 18 лет: данные проспективного наблюдения Овсянникова А.К., Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Воевода М.И., Рымар О.Д. Сахарный диабет, 2021, 24(2):133-140.
Анализ дифференциальной экспрессии генов
липидного обмена в атеросклеротических бляшках
у пациентов с коронарным атеросклерозом Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Фишман В.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И. Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины, 2021, 36(4):156–163
Варианты генов HNF4A и HNF1A у пациентов с дисрегуляцией метаболизма глюкозы и дислипидемией. Иванощук Д.Е., Овсянникова А.К., Михайлова С.В., Шахтшнейдер Е.В., Валеев Э.С., Рымар О.Д., Орлов П.С., Воевода М.И. Атеросклероз, 2021, №4, 11-19
Новый этап палеогенетического исследования носителей одиновской культуры (Барабинская лесостепь): первые результаты Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пристяжнюк М.С., Пилипенко И.В., Нестерова М.С., Поздняков Д.В., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2021, Т. XXVII. - С. 690-695.
2020
A rare splice site mutation in the gene encoding
glucokinase/hexokinase 4 in a patient
with MODY type 2 D.E. Ivanoshchuk, E.V. Shakhtshneider, A.K. Ovsyannikova, S.V. Mikhailova, O.D. Rymar, V.I. Oblaukhova, A.A. Yurchenko, M.I. Voevoda Vavilov journal of genetics and breeding, 2020
Burial ground of the Afanasievo culture Bertek-33 on the Ukok plateau (Altai Mountains): results of a paleogenetic study. Pilipenko A.S., Trapezov R.O., Cherdantsev S.V., Pilipenko I.V., Zhuravlev A.A., Pristyazhnyuk M.S., Molodin V.I. Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2020, Принята в печать
Полиморфизм гена APOA5 у пациентов с первичной гиперлипидемией С.В. Михайлова, Д.Е. Иванощук, Н.С. Широкова, Е.В. Шахтшнейдер КОМПЛЕКСНЫЕ ПРОБЛЕМЫ СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, 2020, Том 9, № 2, C. 38-44
Молекулярно-генетический анализ гена CYP1B1 при первичной врожденной глаукоме: клинический случай ИВАНОЩУК Д. Е., ФЕНЬКОВА О. Г., ШАХТШНЕЙДЕР Е. В., МИХАЙЛОВА С. В., ФУРСОВА А. Ж., ВОЕВОДА М. И. Сибирское медицинское обозрение, 2020, №2, С.87-91
High rates of three common GJB2 mutations c.516G>C, c.-23+1G>A, c.235delC in deaf patients from Southern Siberia are due to the founder effect. Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Y., Maslova E.A., Barashkov N.A., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L. Genes, 2020, 11, 833-850.
Analysis of APPL1 Gene Polymorphisms in Patients with a Phenotype of Maturity Onset Diabetes of the Young Dinara E. Ivanoshchuk,Elena V. Shakhtshneider,Oksana D. Rymar,Alla K. Ovsyannikova,Svetlana V. Mikhailova,Pavel S. Orlov,Yuliya I. Ragino andMikhail I. Voevoda J. Pers. Med, 2020, 2020, 10(3), 100
Gene Expression Changes in the Ventral Tegmental
Area of Male Mice with Alternative Social Behavior
Experience in Chronic Agonistic Interactions Olga Redina, Vladimir Babenko, Dmitry Smagin, Irina Kovalenko, Anna Galyamina, Vadim Efimov and Natalia Kudryavtseva INT J MOL SCI, 2020, 21: 6599; Q1
ГЕНЫ АПОЛИПРОТЕИНОВ APOA5 И APOH КАК РЕГУЛЯТОРЫ МЕТАБОЛИЗМА ЛИПОПРОТЕИНОВ Н.С. Широкова, С.В. Михайлова, Д.Е. Иванощук, Е.В. Шахтшнейдер Атеросклероз, 2020, №3 С. 53-60
Анализ мутационного спектра гена SLC26A4 и его вклада в этиологию наследуемой потери слуха у коренного населения Южной Сибири. Данильченко В.Ю., Зыцарь М.В., Маслова Е.А., Бады-Хоо М.С., Морозов И.В., Бондарь А.А., Посух О.Л. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). С.43-45
Изучение функциональной значимости варианта с.516G>C (p.Trp172Cys) гена GJB2, ассоциированного с потерей слуха у коренного населения Южной Сибири Маслова Е.А., Зыцарь М.В., Данильченко В.Ю., Орищенко К.Е., Посух О.Л. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). С.51-53
Распространенность языка жестов в качестве источника данных для генетической эпидемиологии наследуемых форм потери слуха. Романов Г.П., Пшенникова В.Г., Лашин С.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Сазонов Н.Н., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А., Барашков Н.А. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). 54-56
Copy Number of the Mitochondrial DNA of Leucocytes as an Aging Marker and Risk Factors for the Development of Age-Related Diseases in Humans Maximov V., Malyutina S.K., Orlov P., Ivanoschuk D., Mikhailova S.V., ShapkinaM.Y., Hubacek J., Holmes M.,Bobak M., Voevoda M. Adv. Gerontol, 2020, 10(1): 1-8
A new approach to estimating the prevalence of hereditary hearing loss: an analysis of the distribution of sign language users based on census data in Russia. Romanov G.P., Pshennikova V.G., Lashin S.A., Solovyev A.V., Teryutin F.M., Cherdonova A.M., Borisova T.V., Sazonov N.N., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A., Barashkov N.A. PloS One, 2020, 15(11):e0242219
Differentially Expressed Genes of the Slc6a Family as Markers of Altered Brain Neurotransmitter System Function in Pathological States in Mice Babenko V. N., Smagin D. A., Kovalenko I. L., Galyamina A. G., Kudryavtseva N. N. Neuroscience Behavioral Physiology, 2020, 50(2): 199-209
Screening of West Siberian patients with primary сongenital glaucoma for CYP1B1 gene mutations D.E. Ivanoshchuk, S.V. Mikhailova, O.G. Fenkova, E.V. Shakhtshneider, A.Z. Fursova, I.Y. Bychkov, M.I. Voevoda Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(8):861-867
Сравнительный анализ молекулярно- генетических, когнитивных и аффективных характеристик у лиц, употребляющих разные виды синтетических наркотиков. Наркология 2020 Том 19 №9. с.52 Соловьева И.Г., Патрикеева О.Н., Губина М.А., Рецер Р.А., Ларин А.В., Кормилина О.М. Наркология, 2020, Том 19 №9. с.52-60
Первые результаты секвенирования панели генов при внезапной сердечной смерти молодых мужчин Максимов В.Н., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Иванова А.А., Малютина С.К., Максимова С.В., Родина И.А., Хамович О.В., Новосёлов В.П. Медицинская генетика, 2020, Т. 19. № 5 (214). С. 36-38
Секвенирование нового поколения при внезапной сердечной смерти (пилотное исследование) Максимов В.Н., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Иванова А.А., Малютина С.К., Максимова С.В., Родина И.А., Хамович О.В., Новосёлов В.П., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2020, Т. 25, №. 10, С. 24-30
Погребальный памятник афанасьевской культуры Бертек-33 на плато Укок (Горный Алтай): результаты палеогенетического исследования Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Журавлев А.А., Пристяжнюк М.С., Молодин В.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2020, Т. 48, № 4
Генетический состав домашних животных, как маркер миграций человека Пилипенко А.С., Пилипенко И.В., Черданцев С.В., Трапезов Р.О. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2020, Т.XXVI, С. 571-578
Recombination Events in Leishmania donovani: Mining Population Data Rogozin IB, Charyyeva A, Sidorenko IA, Babenko VN, Yurchenko V Pathogens and Disease, 2020, 9(7):572
Ethnicity-specific distribution of TRPM8 gene variants in Eurasian populations: signs of selection T.A. Potapova, A.G. Romashchenko, N.S. Yudin, M.I. Voevoda Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(3):292-298
Analyzing a putative enhancer of optic disc morphology Babenko V
Babenko O
Orlov Yu BMC GENET, 2020, 21:1; SI; Q3
2019
FTO haplotyping underlines high obesity risk for European populations Babenko VN, Babenko RO, Gamieldien G, Markel AL BMC MED GENOMICS, 2019, BMC Genetics 2019
Связь полиморфизма генов ABCB9 и COL22A1 с предрасположенностью человека к тяжелым формам клещевого энцефалита Бархаш А.В., Юрченко А.А., Юдин Н.С., Козлова И.В., Борищук И.А., Смольникова М.В., Зайцева О.И., Позднякова Л.Л., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. RUSS J GENET+, 2019, Т.55, №3, С. 337-347.
Новый генетический маркер предрасположенности человека к тяжелым формам клещевого энцефалита Бархаш А.В., Козлова И.В., Позднякова Л.Л.,
Юдин Н.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Molecular Biology, 2019, Т.53, №3, С. 388-392
New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes Nikita I. Ershov, Viatcheslav A. Mordvinov, Egor B. Prokhortchouk, Mariya Y. Pakharukova, Konstantin V. Gunbin, Kirill Ustyantsev, Mikhail A. Genaev, Alexander G. Blinov, Alexander Mazur, Eugenia Boulygina, Svetlana Tsygankova, Ekaterina Khrameeva, Nikolay Chekanov, Guangyi Fan, An Xiao, He Zhang, Xun Xu, Huanming Yang, Victor Solovyev, Simon Ming-Yuen Lee, Xin Liu, Dmitry A. Afonnikov, Konstantin G. Skryabin BMC GENOMICS, 2019, 20:399
The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development. Doroshkov AV, Konstantinov DK, Afonnikov DA, Gunbin KV. BMC PLANT BIOL, 2019
mtProtEvol: the resource presenting molecular evolution analysis of proteins involved in the function of Vertebrate mitochondria. Kuzminkova AA, Sokol AD, Ushakova KE, Popadin KY, Gunbin KV. BMC EVOL BIOL, 2019
ImtRDB: a database and software for mitochondrial imperfect interspersed repeats annotation Shamanskiy VN, Timonina VN, Popadin KY, Gunbin KV. BMC GENOMICS, 2019
Unique mutational spectrum of the GJB2 gene and its pathogenic contribution to deafness in Tuvinians (Southern Siberia, Russia): a high prevalence of rare variant c.516G>C (p.Trp172Cys). Posukh O.L., Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Bondar A.A., Morozov I.V., Maximov V.N., Voevoda M.I. Genes, 2019, Jun 5;10(6). pii: E429
A rare case of Waardenburg syndrome with unilateral hearing loss caused by nonsense variant c.772C>T (p.Arg259*) in the MITF gene in Yakut patient from the Eastern Siberia (Sakha Republic, Russia). Barashkov NA, Romanov GP, Borisova UP, Solovyev AV, Pshennikova VG, Teryutin FM, Bondar AA, Morozov IV, Khusnutdinova EK, Posukh OL, Burtseva TE, Odland JØ, Fedorova SA. INT J CIRCUMPOL HEAL, 2019, 78(1):1630219.
Comparison of prediction in silico tools on missense variants in GJB2, GJB6 and GJB3 genes associated with autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) Pshennikova V.G., Barashkov N.A., Romanov G.P., Teryutin F.M., Solov’ev A.V., Gotovtsev N.N., Nikanorova A.A., Nakhodkin S.S., Sazonov N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. The Scientific World Journal, 2019, Mar 20;2019:5198931
Analysis of Polymorphism rs1333049 (Located at 9P21.3) in the White Population of Western Siberia and Associations with Clinical and Biochemical Markers Elena Shakhtshneider, Pavel Orlov, Sergey Semaev, Dinara Ivanoshchuk,Sofia Malyutina, Valery Gafarov, Yuliya Ragino and Mikhail Voevoda Biomolecules, 2019, 9, 290
Использование миРНК в качестве диагностических маркеров острого инфаркта миокарда и ремоделирования сердечной мышцы. Иванощук Д.Е., Розанов А.С., Орлов П.С., Михайлова С.В., Шахтшнейдер Е.В., Кручинина М.В., Воевода М.И. Атеросклероз, 2019, Том 15.- №2. – с. 68-77.
Searching for Signatures of Cold Climate Adaptation in TRPM8 Gene in Populations of East Asian Ancestry Alexander V. Igoshin, Konstantin V. Gunbin, Nikolay S. Yudin, Mikhail I. Voevoda Frontiers in Genetics, 2019
Genes Potentially Associated with Familial Hypercholesterolemia Mikhailova S., Ivanoshchuk D., Timoshchenko O. and Shakhtshneider E. Biomolecules, 2019, 9(12), 807;
Новая нонсенс-мутация с.1121G>A (p.Trp374*) гена CLIC5 – основная причина ювенильной аутосомно-рецессивной формы глухоты (DFNB103), очаги накопления которой обнаружены в арктических районах Якутии. Пшенникова В.Г., Романов Г.П., Николаева Т.М., Терютин Ф.М., Борисова Т.В., Комарьков И.Ф., Антонец А.В., Соловьев А.В., Кларов Л.А., Бондарь А.А., Морозов И.В., Посух О.Л., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А., Барашков Н.А. Медицинская генетика, 2019, 18(10): 36-48
Volatile Evolution of Long Non-Coding RNA Repertoire in Retinal Pigment Epithelium: Insights from Comparison of Bovine and Human RNA Expression Profiles. Postnikova OA, Rogozin IB, Samuel W, Nudelman G, Babenko VN, Poliakov E, Redmond TM Genes, 2019, 10(3). pii: E205
Nucleotide Weight Matrices Reveal Ubiquitous Mutational Footprints of AID/APOBEC Deaminases in Human Cancer Genomes. Rogozin IB, Roche-Lima A, Lada AG, Belinky F, Sidorenko IA, Glazko GV, Babenko VN, Cooper DN, Pavlov YI CANCER-AM CANCER SOC, 2019, 11(2). pii: E211
Evolution of Exons and the Exon–Intron Structure of Long
Intergenic Noncoding RNA Genes in Placental Mammals Sidorenko IA, Rogozin IB, Babenko VN Biology Bulletin Reviews, 2019, Vol. 9, No. 6, pp. 491–502
ЭВОЛЮЦИЯ ЭКЗОНОВ И ЭКЗОН-ИНТРОННОЙ СТРУКТУРЫ ГЕНОВ ДЛИННЫХ МЕЖГЕННЫХ НЕКОДИРУЮЩИХ РНК У ПЛАЦЕНТАРНЫХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ Сидоренко ИА, Рогозин ИБ, Бабенко ВН Успехи современной биологии, 2019, том 139, № 3, с. 221–234
Число копий митохондриальной ДНК лейкоцитов как маркёр старения и риска развития возраст-зависимых заболеваний у человека Максимов В.Н., Малютина С.К., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Михайлова C.В., Шапкина М.Ю., Hubacek J., Holmes M., Bobak М., Воевода М.И. Успехи геронтологии, 2019, 32(3):422-430
Сравнительный анализ количества копий митохондриальной ДНК в ткани миокарда при внезапной сердечной и несердечной смерти Максимов В.Н., Гуражева А.А., Орлов П.С., Малютина С.К., Иванова А.А., Максимова С.В., Родина И.А., Хамович О.В., Новоселов В.П. Атеросклероз, 2019, 15(3):36-41
Изменения липидного обмена мыши при одновременном воздействии антисмысловыми олигонуклеотидными производными к мРНК генов апоВ, PCSK9 и апоCIII С.И. Ошевский, Ю.И. Рагино, Е.В. Каштанова, Я.В. Полонская, Е.М. Стахнева, В.П. Николин, Н.А. Попова, Н.А. Колчанов, М.И. Воевода Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(8):1020-1025
Клинико-патологические характеристики наркозависимости и полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы у потребителей синтетических наркотиков Соловьева И.Г., Губина М.А., Патрикеева О.Н., Кунгурцева О.Н., Кормилина О.М., Рецер Р.А. Наркология, 2019, 2019.N 01. стр. 18-24
Ассоциация длины теломер лейкоцитов и уровня специфических антител после вакцинации против клещевого энцефалита Юдин Н.С., Белявская В.А., Максимов В.Н., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, Том 23, № 8, стр. 1026-1031.
ПИЛОТНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ TRPA1 И TRPV1 С ИНФАРКТОМ МИОКАРДА Орлов П.С., Максимов В.Н., Михайлова С.В., Иванощук Д.Е., Малютина С.К., Воевода М.И. Атеросклероз, 2019, Т. 15. № 3. С. 50-55.
2018
CpG islands’ clustering uncovers early development genes in the human genome Babenko V.N. , Bogomolov A.G., Babenko R.O., Galieva E.R., Orlov Y.L. COMPUT SCI INF SYST, 2018, V 15 N2
Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak Archaeological and Anthropological Sciences, 2018, Vol. 10, Issue 7, P. 1557-1570.
Haplotype analysis of Apoe SNPs in ADNI dataset. Babenko VN, Afonnikov DA, Ignatieva EV, Klimov AV, Gusev FE, Rogaev EI BMC NEUROSCI, 2018, 19(Suppl 1):16
Single nucleotide polymorphism rs1800872 in the promoter region of the IL10 gene is associated with predisposition to chronic hepatitis C in Russian population Barkhash A.V., Kochneva G.V., Chub E.V., Romaschenko A.G. MICROBES INFECT, 2018, Vol. 20, No. 3. P. 212-216.
A case of maturity-onset diabetes of the young in a family with a novel HNF1Agene mutation in five generations Ovsyannikova A., Rymar O., Ivanoshchuk D., Mikhailova S., Shakhtshneider E., Orlov P, Malakhina E., Voevoda M. A Diabetes Therapy, 2018
Polymorphism of the GLIS3 gene in a Caucasian population and among individuals with carbohydrate metabolism disorders in Russia E. V. Shakhtshneider, S. V. Mikhailova, D. E. Ivanoshchuk, P. S. Orlov, A. K. Ovsyannikova, O. D. Rymar, Yu. I. Ragino, M. I. Voevoda BMC Research Notes, 2018, BMC Research Notes 2018 11:211
Генетическая предрасположенность человека к заболеваниям, вызываемым вирусами семейства Flaviviridae Юдин Н.С., Бархаш А.В., Максимов В.Н., Игнатьева Е.В., Ромащенко А.Г. Molecular Biology, 2018, Т.52, №2. С. 190-209.
A matrix metalloproteinase 9 (MMP9) gene single nucleotide polymorphism is associated with predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced severe central nervous system disease Barkhash A.V., Yurchenko A.A., Yudin N.S., Ignatieva E.V., Kozlova I.V., Borishchuk I.A., Pozdnyakova L.L., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. TICKS TICK-BORNE DIS, 2018, Vol. 9, No. 4. P. 763-767
Дифференциально экспрессирующиеся гены нейромедиаторных систем в дорсальном стриатуме самцов мышей с двигательными нарушениями Смагин Д.А., Галямина А.Г., Коваленко И.Л., Бабенко В.Н., Тамкович Н.В., Борисов С.А., Толстикова Т.Г., Кудрявцева Н.Н. Журнал высшей нервной деятельности, 2018, т.68, №2, с. 227-249
A novel pathogenic variant c.975G>A (p.Trp325*) in the POU3F4 gene in Yakut family (Eastern Siberia, Russia) with the X-linked deafness-2 (DFNX2). Barashkov N.A., Klarov L.A., Teryutin F.M., Solovyev A.V., Pshennikova V.G., Konnikova E.E., Romanov G.P., Tobokhov A.V., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Tomsky M.I., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. INT J PEDIATR OTORHI, 2018, 104: 94–97.
Updated carrier rates for c.35delG (GJB2) associated with hearing loss in Russia and common c.35delG haplotypes in Siberia. Zytsar M.V., Barashkov N.A., Bady-Khoo M.S., Shubina-Olejnik O.A., Danilenko N.G., Bondar A.A., Morozov I.V., Solovyev A.V., Danilchenko V.Yu., Maximov V.N., Posukh O.L. BMC MED GENET, 2018, Aug 7;19(1):138
АНАЛИЗ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ЭКСПРЕССИИ МАТРИКСНЫХ МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗ
В СТАБИЛЬНОЙ И НЕСТАБИЛЬНОЙ АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШКАХ МЕТОДОМ
ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК: ПИЛОТНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ Иванощук Д.Е., Рагино Ю. И.
, Шахтшнейдер Е.В., Михайлова С.В.
, Фишман В. С., Полонская Я.В.
, Каштанова Е.В., Чернявский А.М.
, Мурашов И.С., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2018, №8, С.52-58
Сytoscape – плагин для построения структурных моделей биологических сетей в виде случайных графов Подколодный Н.Л., Гаврилов Д.А., Твердохлеб Н.Н., Подколодная О.А. Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, номер 3, том 16, стр. 37-50.
Genes reveal traces of common recent demographic history for most of the Uralic-speaking populations Kristiina Tambets, Bayazit Yunusbayev, Georgi Hudjashov, Anne-Mai Ilumäe, Siiri Rootsi, Terhi Honkola, Outi Vesakoski, Quentin Atkinson, Pontus Skoglund, Alena Kushniarevich, Sergey Litvinov, Maere Reidla, Ene Metspalu, Lehti Saag, Timo Rantanen, Monika Karmin, Jüri Parik, Sergey I. Zhadanov, Marina Gubina, Larisa D. Damba, Marina Bermisheva, Tuuli Reisberg, Khadizhat Dibirova, Irina Evseeva, Mari Nelis, Janis Klovins, Andres Metspalu, Tõnu Esko, Oleg Balanovsky, Elena Balanovska, Elza K. Khusnutdinova, Ludmila P. Osipova, Mikhail Voevoda, Richard Villems, Toomas Kivisild, Mait Metspalu GENOME BIOL, 2018, (2018) 19:139
Компьютерный анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq С. С. Ковалев, Е. Ю. Леберфарб, Н. В. Губанова, А. О. Брагин, А. Г. Галиева,А. В. Цуканов, В. Н. Бабенко, Ю. Л. Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, Том 16, № 3, С.22-36
Компьютерная база данных для анализа дифференциально экспрессирующихся генов, связанных с агрессивным поведением, на моделях лабораторных животных Анатолий Олегович Брагин, Кирилл Александрович Табанюхов, Ирина Витальевна Чадаева, Антон Витальевич Цуканов, Роман Олегович Бабенко, Ирина Вадимовна Медведева, Антон Геннадьевич Богомолов, Владимир Николаевич Бабенко, Юрий Львович Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, 2018. - Том 16, Выпуск № 3. - С. 7-21. - DOI 10.25205/1818-7900-2018-16-3-7-21. - ISSN 1818-7900
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ ТЕРМОРЕЦЕПТОРОВ TRPV1 И TRPA1 ЧЕЛОВЕКА В ПОПУЛЯЦИЯХ АЛТАЕ-САЯНСКОГО РЕГИОНА И ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА М. А. Губина, П. С. Орлов, В. Н. БабенкоА. П. Забияко, Д. Е. Иванощук, М. И. Воевода Генетика, 2018, том 54, № 2, с. 243–252
ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК В ПОПУЛЯЦИИ СИБИРСКИХ ТАТАР БАРАБИНСКОЙ ЛЕСОСТЕПИ М. А. Губина, В. Н. Бабенко, М. И. Воевода Генетика, 2018, том 54, № 6, с. 694–709
ГЕНЕТИКО-ДЕМОГРАФИЧЕСКИЕ ПАРАМЕТРЫ НАСЕЛЕНИЯ г. НОВОСИБИРСКА О. Л. Курбатова, И. Г. Удина, А. С. Грачева, Е. Ю. Победоносцева, М. А. Губина, М. И. Воевода Генетика, 2018, том 54, ПРИЛОЖЕНИЕ, с. S74–S84
Maternal genetic features of the Iron Age Tagar population from Southern Siberia (1st millennium BC) Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Stepan V. Cherdantsev, Vladimir N. Babenko, Marina S. Nesterova, Dmitri V. Pozdnyakov, Vyacheslav I. Molodin, Natalia V. Polosmak PloS One, 2018, 13(9): e0204062
Leukocyte telomere length and risk of coronary heart disease and stroke mortality: prospective evidence from a Russian cohort Stefler D., Malyutina S.K., Maximov V.N., Orlov P.S., Ivanoschuk D., Nikitin Yu.P., Gafarov V.V., Ryabikov A.N., Voevoda M.I., Bobak M., Holmes M.V. SCI REP-UK, 2018, 8(1):16627
Проверка ассоциации новых полиморфизмов с внезапной сердечной смертью у мужчин Максимов В. Н., Иванова А. А., Орлов П. С., Иванощук Д. Е., Малютина С. К., Новосёлов В. П., Воевода М. И. Российский Кардиологический Журнал, 2018, (10):70-75
Исследование ассоциаций полиморфизмов генов KCNN2 и NOS1AP с внезапной сердечной смертью Орлов П. С., Иванощук Д. Е., Иванова А. А., Малютина С. К., Новоселов В. П., Воевода М. И., Максимов В. Н. Российский Кардиологический Журнал, 2018, (10):59-63.
Ассоциации артериального давления и артериальной гипертензии с генетическими маркерами, отобранными по данным полногеномных исследований Малютина С.К., Максимов В.Н., Орлов П.С., Маздорова Е.В., Рябиков А.Н., Никитин Ю.П., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2018, 23(10):8-13
Количество копий митохондриальной ДНК лейкоцитов как маркёр старения и риска развития возраст-зависимых заболеваний у человека Максимов В.Н., Малютина С.К., Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Михайлова C.В., Шапкина М.Ю., Hubacek J., Holmes M., Bobak М., Воевода М.И. Успехи геронтологии, 2018
The association between progression of carotid atherosclerosis and telomere length: serial measurements in follow-up in ageing cohort Ryabikov A.N., Malyutina S.K., Maximov V.N., Holmes M., Palekhina Yu.Yu., Ryabikov M.N., Orlov P.S., Ivanoschuk D., Munz I.V., Voevoda M.I., Bobak M. EUR HEART J, 2018
Altered Slc25 family gene expression as markers of mitochondrial dysfunction in brain regions under experimental mixed anxiety/depression-like disorder. Babenko VN, Smagin DA, Galyamina AG, Kovalenko IL, Kudryavtseva NN BMC NEUROSCI, 2018, 2018
Purifying and positive selection in the evolution of stop codons. Belinky F, Babenko VN, Rogozin IB, Koonin EV SCI REP-UK, 2018, 8(1):9260
Characteristics of MODY-GCK Diabetes in Children and Adolescents in Siberia Ovsyannikova A.K., Rymar O.D., Shakhtshneider E.V., Ivanoshchuk D.E. HORM RES PAEDIAT, 2018, Volume: 90 Pages: 261
2017
Between Lake Baikal and the Baltic Sea: genomic history of the gateway to Europe. Triska P, Chekanov N, Stepanov V, Khusnutdinova EK, Kumar GPA, Akhmetova V, Babalyan K, Boulygina E, Kharkov V, Gubina M, Khidiyatova I, Khitrinskaya I, Khrameeva EE, Khusainova R, Konovalova N, Litvinov S, Marusin A, Mazur AM, Puzyrev V, Ivanoshchuk D, Spiridonova M, Teslyuk A, Tsygankova S, Triska M, Trofimova N, Vajda E, Balanovsky O, Baranova A, Skryabin K, Tatarinova TV, Prokhortchouk E. BMC GENET, 2017, 18(Suppl 1)
Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки, по данным полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е.В., Спицина А.М., Богомолов А.Г., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Программные системы: теория и приложения, 2017, 8:1(32), 219–242
Genomic landscape of CpG rich elements in human genome Babenko V.N., Chadaeva I.V., Orlov Y.L. BMC EVOL BIOL, 2017, 2017; Vol 17(Suppl 1):19 DOI: 10.1186/s12862-016-0864-0
Opinions of hearing parents about the causes of hearing impairment of their children with biallelic GJB2 mutations. Solovyev A.V., Dzhemileva L.U., Posukh O.L., Barashkov N.A., Bady-Khoo M.S., Lobov S.L., Popova N.Yu., Romanov G.P., Sazonov N.N., Bondar A.A., Morozov I.V., Tomsky M.I., Fedorova S.A., Khusnutdinova E.K. J Community Genet, 2017, 8(3): 167-171
Analysis of GJB6 (Сx30) and GJB3 (Сx31) genes in deaf patients with monoallelic mutations in GJB2 (Сx26) gene in the Sakha Republic (Yakutia). Pshennikova V.G., Barashkov N.A., Solovyev A.V., Romanov G.P., Diakonov E.E., Sazonov N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Tomsky M.I., Fedorova S.A. RUSS J GENET+, 2017, V.53, 6: 688–697.
Molecular mechanisms of the interaction between the processes of the cell response to mechanical stress and neuronal apoptosis in primary open-angle glaucoma O. V. Saik, N. A. Konovalova, P. S. Demenkov, N. V. Ivanisenko, T. V. Ivanisenko, D. E. Ivanoshchuk, O. S. Konovalova, O. A. Podkolodnaya, I. N. Lavrik, N. A. Kolchanov, V. A. Ivanisenko Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, ISSN 2079-0597, 2017, Vol. 7, No. 5, pp. 558–564
Анализ информативности компьютерных in silico предсказательных программ при оценке клинической значимости миссенс-замен гена GJB2 (Сx26). Пшенникова В.Г., Барашков Н.А., Соловьев А.В., Романов Г.П., Терютин Ф.М., Посух О.Л., Сазонов Н.Н., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Томский М.И., Федорова С.А. Якутский медицинский журнал, 2017, №3, С.40-46.
Альтернативный сплайсинг в отделах головного мозга селектированных по агрессивности крыс В. Н. Бабенко, А. О. Брагин, И. В. Чадаева, А. Л. Маркель, Ю. Л. Орлов Molecular Biology, 2017, 2017 г., том 51, № 5, с. 870-880
RNA-Seq Mouse Brain Regions Expression Data Analysis: Focus on ApoE Functional Network. BAbenko VN, Smagin DA, Kudryavtseva NN J INTEGR BIOINFORM, 2017, Sep 13;14(3). pii: /j/jib.2017.14.issue-3/jib-2017-0024/jib-2017-0024
Дифференциальная экспрессия и альтернативный сплайсинг в культурах клеток глиом по данным RNA-seq Губанова Н.В., Брагин А.О., Бабенко В.Н., Гайтан А.С., Кривошапкин А.Л., Орлов Ю.Л. Acta Naturae, 2017, Том 9(1). С.19
Reconstruction of SNP haplotypes with mutation c.-23+1G>A in human gene GJB2 (Chromosome 13) in some populations of Eurasia. Solovyev A.V., Barashkov N.A., Bady-Khoo M.S., Zytsar M.V., Posukh O.L., Romanov G.P., Rafailov A.M., Sazonov N.N., Alexeev A.N., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. RUSS J GENET+, 2017, V.53, 8, pp. 936–941.
Анализ циркадного ритма биологических процессов в печени и почках мыши Подколодный Н.Л. Твердохлеб Н.Н. Подколодная О.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, Т. 21, N 8, с. 903-910
2016
Impact of socio-demographic structure of the deaf people communities in prevalence of hereditary hearing loss. Posukh O.L., Bady-Khoo M.S., Zytsar M.V., Mikhalskaia V.Yu., Lashin S.A., Barashkov N.A., Romanov G.P. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, Vol. 6, No. 8, pp. 854–863
Association of IL28B and IL10 gene polymorphism with predisposition to tick-borne encephalitis in a Russian population Barkhash A.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. TICKS TICK-BORNE DIS, 2016, Vol. 7, No. 5. P. 808-812
Полиморфизм генов CD209 и TLR3 в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. RUSS J GENET+, 2016, Т.52, №6, С. 697-704.
Полиморфизм генов c-fms, ITGB3, CCR2 и DBH в популяциях староверов Тюмени и русских Новосибирска Губина М.А., Бабенко В.Н., Иванощук Д.Е., Шуряева А.К., Латыева О.О., Соловьева И.Г., Пономарева М.Н., Коновалова Н.А., Максимов В.Н., Воевода М.И. Molecular Biology, 2016, 2016 год, №2, том 50, с.246-254
Whole Exome Sequencing Reveals Homozygous Mutations in RAI1, OTOF, and SLC26A4 Genes Associated with Nonsyndromic Hearing Loss in Altaian Families (South Siberia) Сhurbanov AY, Karafet TM, Morozov IV, Mikhalskaia VY, Zytsar MV, Bondar AA, Posukh OL. PloS One, 2016, 2016 Apr 15;11(4):e0153841. doi: 10.1371/journal.pone.0153841. eCollection 2016
Spectrum and Frequency of the GJB2 Gene Pathogenic Variants in a Large Cohort of Patients with Hearing Impairment Living in a Subarctic Region of Russia (the Sakha Republic) Barashkov NA, Pshennikova VG, Posukh OL, Teryutin FM, Solovyev AV, Klarov LA, Romanov GP, Gotovtsev NN, Kozhevnikov AA, Kirillina EV, Sidorova OG, Vasilyevа LM, Fedotova EE, Morozov IV, Bondar AA, Solovyevа NA, Kononova SK, Rafailov AM, Sazonov NN, Alekseev AN, Tomsky MI, Dzhemileva LU, Khusnutdinova EK, Fedorova SA PloS One, 2016, 2016 May 25;11(5):e0156300. doi: 10.1371/journal.pone.0156300
[Gene Polymorphism of the c-fms, ITGB3,CCR2, and DBH genes in the populations of old believers of the Tyumen oblast and Russian residents of Novosibirsk]. Gubina MA, Babenko VN, Ivanoshchuk DE, Shuryaeva AK, Latieva OO, Solov'eva IG, Ponomareva MN, Konovalova NA, Maksimov VN, Voevoda MI. Molecular Biology, 2016, 50(2):246-254
The Dynamics of the Composition of mtDNA Haplotypes of the Ancient Population of the Altai Mountains from the Early Bronze Age (3rd Millennium BC) to the Iron Age (2nd-1st Centuries BC) Gubina MA, Kulikov IV, Babenko VN, Chikisheva TA, Romaschenko AG, Voevoda MI, Molodin VI. GENETICA, 2016, 52(1):106-119
ДИНАМИКА СОСТАВА ГАПЛОТИПОВ мтДНК ДРЕВНЕГО НАСЕЛЕНИЯ ГОРНОГО АЛТАЯ ОТ ЭПОХИ РАННЕЙ БРОНЗЫ (III тыс. до н. э.) ДО ЖЕЛЕЗНОГО ВЕКА (II–I вв. до н. э.) Губина МА Куликов ИВ, Бабенко ВН, Чикишева ТА, Ромащенко АГ Воевода МИ, Молодин ВИ Генетика, 2016, 52(1):106-119
Haplotype analysis of the HFE gene among populations of Northern Eurasia, in patients with metabolic disorders or stomach cancer, and in long-lived people Mikhailova SV, Babenko VN, Ivanoshchuk DE, Gubina MA, Maksimov VN, Solovjova IG, Voevoda MI. BMC GENET, 2016, 17(1):83. doi: 10.1186/s12863-016-0396-z.
Candidate SNP markers of chronopathologies are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters Petr Ponomarenko, Dmitry Rasskazov, Valentin Suslov, Ekaterina Sharypova, Ludmila Savinkova, Olga Podkolodnaya, Nikolay Podkolodny, Natalya Tverdokhleb, Irina Chadaeva, Mikhail Ponomarenko, Nikolay Kolchanov Biomed Res Int, 2016, vol. 2016, Article ID 8642703. doi:10.1155/2016/8642703
The Simons Genome Diversity Project: 300 genomes from 142 diverse populations. Mallick S., Li H., Lipson M., Mathieson I., Gymrek M. Racimo F., Zhao M., Chennagiri N., Nordenfelt S., Tandon A., Skoglund P., Lazaridis I., Sankararaman S., Fu Q., Rohland N., Renaud G., Erlich Y., Willems T., Gallo C., Spence J.P., Song Y.S., Poletti G., Balloux F., van Driem G., de Knijff P., Romero I.G., Jha A.R., Behar D.M., Bravi C.M., Capelli C., Hervig T., Moreno-Estrada A., Posukh O.L., Balanovska E., Balanovsky O., Karachanak-Yankova S., Sahakyan H., Toncheva D., Yepiskoposyan L., Tyler-Smith C., Xue Y., Abdullah M.S., Ruiz-Linares A., Beall C.M., Di Rienzo A., Jeong C., Starikovskaya E.B., Metspalu E., Parik J., Villems R., Henn B.M., Hodoglugil U., Mahley R., Sajantila A., Stamatoyannopoulos G., Wee J.T., Khusainova R., Khusnutdinova E., Litvinov S., Ayodo G., Comas D., Hammer M.F., Kivisild T., Klitz W., Winkler C.A., Labuda D., Bamshad M., Jorde L.B., Tishkoff S.A., Watkins W.S., Metspalu M., Dryomov S., Sukernik R., Singh L., Thangaraj K., Pääbo S., Kelso J., Patterson N., Reich D. NATURE, 2016, 2016 Sep 21;538(7624):201-206. doi: 10.1038/nature18964
Biomedical and candidate SNP markers of chronopathologies can significantly change the affinity of the ТАТА-binding protein to the promoters of human genes. Rasskazov DA, Podkolodnyy NL, Podkolodnaya OA, Tverdokhleb NN, Suslov VV, Savinkova LK, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, 7, 6, 738-748
Effects of SNPs in the positioning regions of RNA polymerase II on the TBP/promoter affinity in genes of the human circadian clock. Podkolodnaya OA, Rasskazov DA, Podkolodnyy NL, Podkolodnaya NN, Suslov VV, Savinkova LK, Ponomarenko PM, Ponomarenko MP. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, 7, 6, 759-770
Genomic analyses inform on migration events during the peopling of Eurasia Pagani L, Lawson DJ, Jagoda E, Mörseburg A, Eriksson A, Mitt M, Clemente F, Hudjashov G, DeGiorgio M, Saag L, Wall JD, Cardona A, Mägi R, Sayres MA, Kaewert S, Inchley C, Scheib CL, Järve M, Karmin M, Jacobs GS, Antao T, Iliescu FM, Kushniarevich A, Ayub Q, Tyler-Smith C, Xue Y, Yunusbayev B, Tambets K, Mallick CB, Saag L, Pocheshkhova E, Andriadze G, Muller C, Westaway MC, Lambert DM, Zoraqi G, Turdikulova S, Dalimova D, Sabitov Z, Sultana GN, Lachance J, Tishkoff S, Momynaliev K, Isakova J, Damba LD, Gubina M, Nymadawa P, Evseeva I, Atramentova L, Utevska O, Ricaut FX, Brucato N, Sudoyo H, Letellier T, Cox MP, Barashkov NA, Škaro V, Mulahasanovic L, Primorac D, Sahakyan H, Mormina M, Eichstaedt CA, Lichman DV, Abdullah S, Chaubey G, Wee JT, Mihailov E, Karunas A, Litvinov S, Khusainova R, Ekomasova N, Akhmetova V, Khidiyatova I, Marjanović D, Yepiskoposyan L, Behar DM, Balanovska E, Metspalu A, Derenko M, Malyarchuk B, Voevoda M, Fedorova SA, Osipova LP, Lahr MM, Gerbault P, Leavesley M, Migliano AB, Petraglia M, Balanovsky O, Khusnutdinova EK, Metspalu E, Thomas MG, Manica A, Nielsen R, Villems R, Willerslev E, Kivisild T, Metspalu M NATURE, 2016, 2016 Sep 21;538(7624):238-242. [Epub ahead of print]
Новая транзиция c.1621C>T (p.Gln541*) гена FYCO1 – основная причина аутосомно-рецессивной формы катаракты (CTRCT18) в Якутии: результаты полноэкзомного секвенирования. Барашков Н.А., Коновалов Ф.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Пшенникова В.Г., Сапожникова Н.В., Вытюжина Л.С., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А. Медицинская генетика, 2016, Т.15. №10. С. 25-33.
Математическая модель циркадного осциллятора млекопитающих: взаимодействие с системой NAD+/SIRT1 и возрастные изменения экспрессии генов циркадного осциллятора Подколодный Н.Л., Твердохлеб Н.Н., Подколодная О.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(6):848-856
Analysis of differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals Babenko V.N., Bragin A.O., Spitsina A.M., Chadaeva I.V., Galieva E.R., Orlova G.V., Medvedeva I.V., Orlov Y.L. J INTEGR BIOINFORM, 2016, 13(4):292. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-292
Эволюция CpG-островов путем тандемных дупликаций Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л., Исакова Ж.И., Антонов Д.А., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016; 20(6):746-755 DOI 10.18699/VJ16.191
Полиморфизм регуляторной области гена LCT в некоторых тюркоязычных популяциях Алтае-Саянского региона. И.В. Пилипенко, М.С. Пристяжнюк, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода, А.С. Пилипенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):887-893
Молекулярная генетика MODY. М. И. Воевода, А. А. Иванова, Е. В. Шахтшнейдер, А. К. Овсянникова, С. В. Михайлова, К. С. Астракова, С. М. Воевода, О. Д. Рымар TERAPEVT ARKH, 2016
2015
MtDNA Haplogroup A10 Lineages in Bronze Age Samples Suggest That Ancient Autochthonous Human Groups Contributed to the Specificity of the Indigenous West Siberian Population Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vyacheslav I. Molodin, Aida G. Romaschenko PloS One, 2015
Influence of Polymorphisms -824 A/G Gene of Tumor Necrosis Factor Alpha on the Basic Economic Useful Traits of Cattle Kochnev N.N., Krytsyna T.I., Smirnova A.M., Yudin N.S. biotech asia, 2015, V. 12, No. 1, P. 243-248.
Effect of flanking sequences on the accuracy of the recognition of transcription factor binding sites. Khlebodarova T. M., Oshchepkov D. Yu., Levitsky V. G., Podkolodnaya O. A., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Stepanenko I. L., Kolchanov N. A. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, Vol. 5, No. 4, p. 322–329
Применение репродуктивных технологий для повышения эффективности геномной селекции молочного крупного рогатого скота Юдин Н.С., Лукьянов К.И., Воевода, Колчанов Н.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, Том 19, № 3, стр. 77-85.
ИССЛЕДОВАНИЕ АССОЦИАЦИЙ НОВЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ САХАРНОГО ДИАБЕТА 2 ТИПА НА ЗАПАДНО-СИБИРСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ ЕВРОПЕОИДОВ Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Михайлова С.В., Максимов В.Н., Воевода М.И. Siberian scientific medical journal, 2015, Т. 35. № 2. С. 74-79.
ПРОВЕРКА 8 ОНП НА ПРИГОДНОСТЬ В КАЧЕСТВЕ МАРКЕРОВ РИСКА РАЗВИТИЯ ИНФАРКТА МИОКАРДА У ЖИТЕЛЕЙ НОВОСИБИРСКА Орлов П.С., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Атеросклероз, 2015
Association Analysis of Genetic Variants with Type Diabetes in a Mongolian Population in China. Bai H, Liu H, Suyalatu S, Guo X, Chu S, Chen Y, Lan T, Borjigin B, Orlov YL, Posukh OL, Yang X, Guilan G, Osipova LP, Wu Q, Narisu N. Journal of Diabetes Research, 2015, 2015: 613236. doi: 10.1155/2015/613236. Epub 2015 Jul 28.
Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans. Raghavan M, Steinrücken M, Harris K, Schiffels S, Rasmussen S, DeGiorgio M, Albrechtsen A, Valdiosera C, Ávila-Arcos MC, Malaspinas AS, Eriksson A, Moltke I, Metspalu M, Homburger JR, Wall J, Cornejo OE, Moreno-Mayar JV, Korneliussen TS, Pierre T, Rasmussen M, Campos PF, Damgaard Pde B, Allentoft ME, Lindo J, Metspalu E, Rodríguez-Varela R, Mansilla J, Henrickson C, Seguin-Orlando A, Malmström H, Stafford T Jr, Shringarpure SS, Moreno-Estrada A, Karmin M, Tambets K, Bergström A, Xue Y, Warmuth V, Friend AD, Singarayer J, Valdes P, Balloux F, Leboreiro I, Vera JL, Rangel-Villalobos H, Pettener D, Luiselli D, Davis LG, Heyer E, Zollikofer CP, Ponce de León MS, Smith CI, Grimes V, Pike KA, Deal M, Fuller BT, Arriaza B, Standen V, Luz MF, Ricaut F, Guidon N, Osipova L, Voevoda MI, Posukh OL, Balanovsky O, Lavryashina M, Bogunov Y, Khusnutdinova E, Gubina M, Balanovska E, Fedorova S, Litvinov S, Malyarchuk B, Derenko M, Mosher MJ, Archer D, Cybulski J, Petzelt B, Mitchell J, Worl R, Norman PJ, Parham P, Kemp BM, Kivisild T, Tyler-Smith C, Sandhu MS, Crawford M, Villems R, Smith DG, Waters MR, Goebel T, Johnson JR, Malhi RS, Jakobsson M, Meltzer DJ, Manica A, Durbin R, Bustamante CD, Song YS, Nielsen R, Willerslev E. SCIENCE, 2015, 349(6250):aab3884. doi: 10.1126/science.aab3884. Epub 2015 Jul 21.
Global diversity, population stratification, and selection of human copy-number variation. Sudmant PH, Mallick S, Nelson BJ, Hormozdiari F, Krumm N, Huddleston J, Coe BP, Baker C, Nordenfelt S, Bamshad M, Jorde LB, Posukh OL, Sahakyan H, Watkins WS, Yepiskoposyan L, Abdullah MS, Bravi CM, Capelli C, Hervig T, Wee JT, Tyler-Smith C, van Driem G, Romero IG, Jha AR, Karachanak-Yankova S, Toncheva D, Comas D, Henn B, Kivisild T, Ruiz-Linares A, Sajantila A, Metspalu E, Parik J, Villems R, Starikovskaya EB, Ayodo G, Beall CM, Di Rienzo A, Hammer M, Khusainova R, Khusnutdinova E, Klitz W, Winkler C, Labuda D, Metspalu M, Tishkoff SA, Dryomov S, Sukernik R, Patterson N, Reich D, Eichler EE. SCIENCE, 2015, 349(6253):aab3761. doi: 10.1126/science.aab3761. Epub 2015 Aug 6.
Полиморфизм гена TRPM8 в кыргызской популяции:возможная связь с высокогорной адаптацией. Бабенко ВН., Исакова ЖТ., Талайбекова ЭТ., Асамбаева ДА., Кобзев ВФ., Потапова ТА., Воевода МИ., Алдашев АА. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 19(5), 630-637
117 Analysis of SNP containing sites in human genome using text complexity estimates Nataly S. Safronova, Vladimir N. Babenko, Yuriy L. Orlov Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2015, 33:sup1, 73-74, DOI:10.1080/07391102.2015.1032750
19 Implication of transposons distribution on chromatin state and genome architecture in human Vladimir N. Babenko, Vladimir F. Matvienko, Nataly S. Safronova Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2015, sup1, 10-11, DOI: 10.1080/07391102.2015.1032559
The Mammalian Circadian Clock: Gene Regulatory Network and Computer Analysis O.A. Podkolodnaya, N.N. Podkolodnaya, N.L. Podkolodnyy Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, Vol. 5, No. 4, pp. 354–362
Association of Dopamine Receptor D4 (DRD4) Gene Polymorphism with Cardiovascular Disease Risk Factors N. S. Yudin, T. M. Mishakova, E. V. Ignatieva, V. N. Maksimov, V. V. Gafarov, S. K. Malyutina, and M. I. Voevoda Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, Vol. 5, No. 6, pp. 650–655. doi: 10.1134/S2079059715060192
АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА ADRA2B С ФАКТОРАМИ РИСКА СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ В ПОПУЛЯЦИИ КОРЕННЫХ ЖИТЕЛЕЙ ГОРНОЙ ШОРИИ Мулерова Т.А., Янкин А.Ю., Рубцова Е.В., Кузьмина А.А., Орлов П.С., Татарникова Н.П., Максимов В.Н., Воевода М.И., Огарков М.Ю. Бюллетень сибирской медицины, 2015, Т. 14. № 2. С. 29-34.
Оценка роли однонуклеотидного полиморфизма в гене лимфотоксина бета при доместикации свиньи на основе биоинформационного и экспериментального подходов Р.Б. Айтназаров, Е.В. Игнатьева, Н.Э. Базарова, В.Г.Левицкий, С.П. Князев, Я. Гон, Н.С. Юдин Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, Т.19, №6 Стр.699-706
Биомедицинские и кандидатные SNP-маркеры для хронопатологий могут достоверно изменять сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека. Рассказов Д.А., Подколодный Н.Л., Подколодная О.А., Подколодная Н.Н., Суслов В.В., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 6, 19, 691-698
Влияние однонуклеотидных полиморфных замен в районах позиционирования РНК-полимеразы II на сродство к ним TBP в генах циркадных часов человека Подколодная О.А., Рассказов Д.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Суслов В.В., Савинкова Л.К., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, 6, 19, 682-690
Проверка ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов генов KIF6, PALLD, SNX19, MYH15, VAMP8 генетического рискометра ишемической болезни сердца с внезапной сердечной смертью Максимов В.Н., Иванова А.А., Орлов П.С., Савченко С.В., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2015, Том 10, № 126, стр. 12-18.
The extent of linkage disequilibrium in the ancient Ukrainian grey cattle breed Boussaha M., Letaief R., Yudin N., Voevoda M., Rocha D. Global Journal of Animal Breeding and Genetics, 2015, Vol. 3, No. 4, P. 159-163
Мировые тенденции в селекции молочного скота Лукьянов К.И., Солошенко В.А., Клименок И.И., Юдин Н.С. Генетика и разведение животных, 2015, № 3, стр. 63-69.
Transient receptor potential melastatin 8 gene polymorphism is associated with cold-induced airway hyperresponsiveness in bronchial asthma. Naumov DE, Perelman JM, Kolosov VP, Potapova TA, Maksimov VN, Zhou X RESPIROLOGY, 2015, 20(8):1192-7
Одновременное воздействие несколькими антисмысловыми олигонуклеотидными производными, его эффективность на примере липидного обмена мыши Ошевский С.И., Рагино Ю.И., Каштанова Е.В., Полонская Я.В., Стахнёва Е.М., Николин В.П., Попова Н.А., Кораблев А.Н.. Колчанов Н.А., Воевода М.И. Атеросклероз, 2015, 3 (том 11), с. 72-78
ОЦЕНКА ЗНАЧИМОСТИ ЛИПИДНОГО МАРКЕРА ЛИПОПРОТЕИН (А) В ДИАГНОСТИКЕ БОЛЬНЫХ ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНИ СЕРДЦА Маздорова Е.В., Николаев К.Ю., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Максимов В.Н., Рагино Ю.И., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2015, 2015. Т. 55. № 8. С. 49.
Оценка значимости липидного маркера липопротеина (а) в диагностике больных ишемической болезнью сердца Маздорова Е.В., Николаев К.Ю., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Иванощук Д.Е., Орлов П.С., Максимов В.Н., Рагино Ю.И., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2015, Т. 55, № 8: 49.
Проверка 8 ОНП на пригодность в качестве маркеров риска развития инфаркта миокарда у жителей Новосибирска П.С. Орлов, В.Н. Максимов, В.В. Гафаров, С.К. Малютина, А.Г. Ромащенко, М.И. Воевода. Атеросклероз, 2015, №1 (11): 14-19.
Sleep disorders and the TNF-α/G-308A polymorphism in program WHO MONICA MOPSY V. Gafarov, M. Voevoda, E. Gromova, I. Gagulin, A. Gafarova, V. Maximov, N. Judin, T. Mishakova Somnologie, 2015, Suppl 1: 13.
The spread of porcine endogenous retroviruses among different populations of wild boar and domestic pig. Knyazev S., Yudin N., Aitnazarov R., Nikitin S., Ermolaev V. Suiform Soundings, 2015, V. 13, No. 2, P. 33-36.
Регуляторная геномика – экспериментально-компьютерные подходы Е. В. Игнатьева, О. А. Подколодная, Ю. Л. Орлов, Г. В. Васильев, Н. А. Колчанов RUSS J GENET+, 2015, Т. 51, № 4, с. 409–429 (Vol. 51, No. 4, pp. 334–352)
Полиморфизм -824 А/G гена фактора некроза опухоли альфа и показатели воспроизводства коров Крыцына Т.И., Кочнев Н.Н., Айтназаров Р.Б., Юдин Н.С., Печурин С.Н. Достижения науки и техники АПК, 2015, Том 29, № 1, стр. 39-41.
Молекулярно-генетические маркеры экономически важных признаков у молочного скота Юдин Н.С., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2015, Том 51, № 5, стр. 600-612.
2014
Анализ ассоциаций однонуклеотидных полиморфизмов гена холодового рецептора TRPM8 с липидными показателями плазмы крови и антропометрическими параметрами у русских. Потапова Т.А, Бабенко В.Н, Кобзев В.Ф, Ромащенко А.Г, Максимов В.Н, Воевода М.И. B EXP BIOL MED+, 2014, т.157. №6. стр.728-733
Реакция респираторной системы на локальное охлаждение у людей с однонуклеотидным полиморфизмом rs11562975 гена термочувствительного ионного канала TRPM8 Козырева Т.В., Ткаченко Е.Я., Потапова Т.А., Воевода М.И Физиология человека, 2014, т.40, №2, с.94-98
The roles of the monomer length and nucleotide context of plant tandem repeats in nucleosome positioning Levitsky VG, Babenko VN, Vershinin AV Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2014, 32(1):115-126.
Анализ анкетирования родителей детей-инвалидов по слуху в Якутии, Туве и Башкортостане: мнение слышащих родителей о причинах потери слуха у ребенка с последующим сравнением с результатами ДНК-тестирования гена GJB2 (Сх26). Барашков Н.А., Джемилева Л.У., Посух О.Л., Соловьев А.В., Бады-Хоо М.С., Пшенникова В.Г., Терютин Ф.М., Лобов С.Л., Неустроева А.Б., Куртанов Х.А., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Рафаилов А.М., Соловьева Н.А., Кононова С.К., Алексеев А.Н., Федорова С.А., Хуснутдинова Э.К. Медицинская генетика, 2014, Т.13. №1. С.8-16.
Изучение наследственных форм тугоухости / глухоты в Республике Тыва. Cообщение I. Эпидемиология нарушений слуха в Республике Тыва. Бады-Хоо М.С., Посух О.Л., Зоркольцева И.В., Скиданова О.В., Барашков Н.А., Омзар О.С., Монгуш Р.Ш., Бамба О.М., Тукар В.М., Зыцарь М.В., Михальская В.Ю. Медицинская генетика, 2014, Т.13. №1. С.17-26.
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ЦИРКАДНЫХ ЧАСОВ И МЕТАБОЛИЗМА ЭНЕРГЕТИЧЕСКИХ СУБСТРАТОВ МЛЕКОПИТАЮЩИХ Подколодная Ольга Александровна RUSS J GENET+, 2014, № 2, том 50, № 2, с. 125–137
Association between polymorphisms in OAS2 and CD209 genes and predisposition to chronic hepatitis C in Russian population Barkhash A.V., Kochneva G.V., Chub E.V., Mikhailova S.V., Romaschenko A.G. MICROBES INFECT, 2014, Vol. 16, No. 5, P. 445-449.
Genetic basis of olfactory cognition: extremely high level of DNA sequence polymorphism in promoter regions of the human olfactory receptor genes revealed using the 1000 Genomes Project dataset Ignatieva E.V., Levitsky V.G., Yudin N.S., Moshkin M.P., Kolchanov N.A. Front Psychol, 2014, published: 24 March 2014 doi: 10.3389/fpsyg.2014.00247
Анализ аутосомных микросателлитных ДНК-локусов в геноме кыргызов. Исакова ЖТ, Бабенко ВН, Асамбаева ДА, Талайбекова ЭТ, Алдашев АА Доклады нациаональной академии наук Кыргызской Распублики, 2014, 2914, N1, с. 64-68
Насыщенность генома свиньи эндогенными ретровирусами: влияние наследственности и среды. Айтназаров Р.Б., Никитин С.В., Князев С.П., Юдин Н.С. Инновации и продовольственная безопасность, 2014, № 2, стр.41-49.
Влияние полиморфизма гена ассоциированного с пролиферацией ядерного элемента PANE1 на репродуктивные показатели у свиней. Юдин Н.С., Айтназаров Р.Б., Князев С.П., Бекенев В.А., Подоба Ю.В., Бердибаева А.В., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 2, стр. 258-262.
Однонуклеотидный полиморфизм в популяции крупного рогатого скота красной степной породы. Люханов M.П., Koроткевич O.С., Себежкo O.И., Юдин Н.С. Современные проблемы науки и образования, 2014, № 1, стр. 326.
Age-related hearing impairment (ARHI) associated with GJB2 single mutation IVS1+1G>A in the Yakut population isolate in Eastern Siberia. Barashkov N.A., Teryutin F.M., Pshennikova V.G., Solovyev A.V., Klarov L.A., Solovyeva N.A., Kozhevnikov A.A., Vasilyeva L.M., Fedotova E.E., Pak M.V., Lekhanova S.N., Zakharova E.V., Savvinova K.E., Gotovtsev N.N., Rafailov A.M., Luginov N.V., Alexeev A.N., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. PloS One, 2014
Идентификация полноразмерных геномов эндогенных ретровирусов у сибирских мини-свиней. Айтназаров Р.Б., Юдин Н.С., Никитин С.В., Ермолаев В.И., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 2, стр. 294-297.
Отбор по поведению и состояние систем макроглобулинов и липопротеинов у американской норки (Neovison vison). Ермолаев В.И., Савина М.А., Юдин Н.С., Айтназаров Р.Б., Никитин С.В., Трапезова Л.И., Трапезов О.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 2, стр. 235-239.
Genetic Organization of Interphase Chromosome Bands and Interbands in Drosophila melanogaster. Zhimulev IF, Zykova TY, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Babenko VN, Demakov SA, Belyaeva ES. PloS One, 2014, 9(7):e101631. doi: 10.1371/journal.pone.0101631
Extremely high carrier frequency of the GJB2 splice site IVS1+1G>A mutation in Eastern Siberia is comparable to the carrier frequency of the sickle cell anemia in Africa. Barashkov N.A., Solovyev A.V., Teryutin, F.M. Pshennikova V.G., Klarov L. A., Romanov G. P., Nakhodkin S.S., Savvinova K.E., Gotovtsev N.N., Solovyeva N.A., Kozhevnikov A.A., Vasilyeva L.M., Fedotova E.E., Pak M.V., Lekhanova S.N., Zakharova E.V., Rafailov A.M., Luginov N.V., Alexeev A.N., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. J Genet Genome Res, 2014, 1:1
Создание панели ДНК пород крупного рогатого скота России для геномных исследований. Юдин Н.С., Васильева Л.А., Белявская В.А., Айтназаров Р.Б., Смирнов П.Н., Хитон М., Легрейд У., Орлова Г.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 3, стр. 202-207
Полиморфизм гена MYOC у пациентов Западной Сибири с первичной открытоугольной глаукомой Иванощук Д.Е., Бычков И.Ю., Михайлова С.В., Коновалова Н.А., Еремина А.В., Пономарева М.Н., Коновалова О.С., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Бюллетень СО РАМН, 2014, №3, том 34, с. 24-29
Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Iosif Lazaridis, Nick Patterson, Alissa Mittnik, Gabriel Renaud, Swapan Mallick, Karola Kirsanow, Peter H. Sudmant, Joshua G. Schraiber, Sergi Castellano, Mark Lipson, Bonnie Berger, Christos Economou, Ruth Bollongino, Qiaomei Fu, Kirsten I. Bos, Susanne Nordenfelt, Heng Li, Cesare de Filippo, Kay Prüfer, Susanna Sawyer, Cosimo Posth, Wolfgang Haak, Fredrik Hallgren, Elin Fornander, Nadin Rohland, Dominique Delsate, Michael Francken, Jean-Michel Guinet, Joachim Wahl, George Ayodo, Hamza A. Babiker, Graciela Bailliet, Elena Balanovska, Oleg Balanovsky, Ramiro Barrantes, Gabriel Bedoya, Haim Ben-Ami, Judit Bene, Fouad Berrada, Claudio M. Bravi, Francesca Brisighelli, George B. J. Busby, Francesco Cali, Mikhail Churnosov, David E. C. Cole, Daniel Corach, Larissa Damba, George van Driem, Stanislav Dryomov, Jean-Michel Dugoujon, Sardana A. Fedorova, Irene Gallego Romero, Marina Gubina, Michael Hammer, Brenna M. Henn, Tor Hervig, Ugur Hodoglugil, Aashish R. Jha, Sena Karachanak-Yankova, Rita Khusainova, Elza Khusnutdinova, Rick Kittles, Toomas Kivisild, William Klitz, Vaidutis Kučinskas, Alena Kushniarevich, Leila Laredj, Sergey Litvinov, Theologos Loukidis, Robert W. Mahley, Béla Melegh, Ene Metspalu, Julio Molina, Joanna Mountain, Klemetti Näkkäläjärvi, Desislava Nesheva, Thomas Nyambo, Ludmila Osipova, Jüri Parik, Fedor Platonov, Olga Posukh, Valentino Romano, Francisco Rothhammer, Igor Rudan, Ruslan Ruizbakiev, Hovhannes Sahakyan, Antti Sajantila, Antonio Salas, Elena B. Starikovskaya, Ayele Tarekegn, Draga Toncheva, Shahlo Turdikulova, Ingrida Uktveryte, Olga Utevska, René Vasquez, Mercedes Villena, Mikhail Voevoda, Cheryl A. Winkler, Levon Yepiskoposyan, Pierre Zalloua, Tatijana Zemunik, Alan Cooper, Cristian Capelli, Mark G. Thomas, Andres Ruiz-Linares, Sarah A. Tishkoff, Lalji Singh, Kumarasamy Thangaraj, Richard Villems, David Comas, Rem Sukernik, Mait Metspalu, Matthias Meyer, Evan E. Eichler, Joachim Burger, Montgomery Slatkin, Svante Pääbo, Janet Kelso, David Reich, Johannes Krause. NATURE, 2014, 2014 Sep 18;513(7518):409-13. doi: 10.1038/nature13673.
Влияние фланкирующих последовательностей на точность распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов. Хлебодарова Т.М., Ощепков Д.Ю., Левицкий В.Г., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Колчанов Н. А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, т.18, № 4/2, с.876-886.
ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК У СТАРОВЕРОВ СИБИРИ М. А. Губина, В. Н. Бабенко, Л. Д. Дамба, М. Н. Пономарева, Н. А. Коновалова, М. И. Воевода RUSS J GENET+, 2014, том 50, № 6, с. 729–744
Изучение наследственных форм тугоухости / глухоты в Республике Тыва. Cообщение II. Оценка спектра мутаций гена GJB2 (Cx26) и их вклада в этиологию потери слуха. Бады-Хоо М.С., Бондарь А.А., Морозов И.В., Зыцарь М.В., Михальская В.Ю., Скиданова О.В., Барашков Н.А., Монгуш Р.Ш., Омзар О.С., Тукар В.М., Посух О.Л. Медицинская генетика, 2014, №11. С.ХХ
Влияние полиморфизма -824A/G гена фактора некроза опухоли на молочную продуктивность коров красной степной породы. Кочнев Н.Н., Крыцына Т.И., Айтназаров Р.Б., Гончаренко Г.М., Юдин Н.С. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2014, № 4, стр. 68-73.
Ассоциация полиморфизма -824A/G гена фактора некроза опухоли альфа с показателями роста телят красной степной породы. Крыцына Т.И., Кочнев Н.Н., Голубева Е.Б., Айтназаров Р.Б., Гончаренко Г.М., Юдин Н.С. Вестник НГАУ, 2014, № 3, стр. 71-75.
ПОЛНОГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ ПУЛИРОВАННЫХ ВЫБОРОК ДНК КОГОРТ ЧЕЛОВЕКА В.Н. Бабенко, В.Н. Максимов, Е.В. Кулакова, Н.С. Сафронова, М.И. Воевода, Е.И. Рогаев Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Т. 18. N. 4/2, с. 847-855
Ассоциация полиморфизмов TRPM8 с липидами крови и антропометрическими показателями в русской популяции. Potapova TA, Babenko VN, Kobzev VF, Romashchenko AG, Maksimov VN, Voevoda MI. B EXP BIOL MED+, 2014, 157, № 6, 757-761.
ЦИРКАДНЫЕ ЧАСЫ МЛЕКОПИТАЮЩИХ: ГЕННАЯ СЕТЬ И КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ Подколодная О.А., Подколодная Н.Н., Подколодный Н.Л. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Т. 18. N. 4/2. стр. 928-938
Ассоциация полиморфизма гена DRD4 с некоторыми факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний Юдин Н.С., Мишакова Т.М., Игнатьева Е.В., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Малютина С.К., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, №4/3, стр. 1237-1245.
2013
Эффект суппрессии P-элементов с маркерным геном mini-white в межгенных районах DROSOPHILA MELANOGASTER Бабенко В.Н., Матвиенко В. ф. Цитология, 2013, том55, N3, 181-184
Association of single nucleotide polymorphism rs3775291 in the coding region of the TLR3 gene with predisposition to tick-borne encephalitis in a Russian population Barkhash A.V., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. ANTIVIR RES, 2013, Vol. 99, Issue 2, P. 136-138
Гаплотипическое разнообразие мтДНК и У-хромосомы в популяциях Алтай- Саянского района Губина МА, Дамба ЛВ, Бабенко ВН, Ромащенко АГ, Воевода МИ RUSS J GENET+, 2013, 49(3):329-343
Эпидемиология нарушений слуха и результаты первого этапа молекулярно-генетических исследований наследуемых форм нейросенсорной тугоухости/глухоты в Республике Тыва М.С. Бады-Хоо, О.В. Скиданова, О.С. Омзар, Р.Ш. Монгуш, Н.А. Барашков, О.М. Бамба, В.М. Тукар, Е.В. Дувак, О.Л. Посух Здоровье и благополучие в Туве, 2013, №2(6) (май 2013), С.26-35
CCR5, CCR2, apoe, p53, ITGB3 and HFE gene polymorphism in Western Siberia long-livers Ivanoshchuk DE, Mikhaĭlova SV, Kulikov IV, Maksimov VN, Voevoda MI, Romashchenko AG. Adv. Gerontol, 2013, vol.3 № 2, pp.89-92
Adult Opisthorchis felineus major protein fractions deduced from transcripts: Comparison with liver flukes Opisthorchis viverrini and Clonorchis sinensis. Pomaznoy M., Tatkov S., Katokhin A., Afonnikov D., Babenko V., Furman D., Brusentsov I., Belavin P., Najakshin A., Guselnikov S., Vasiliev G., Sivkov A., Prokhortchouk E., Skryabin K., Mordvinov V. EXP PARASITOL, 2013, 135, 297-306. doi:10.1016/j.exppara.2013.07.011
Генетические предикторы инфаркта миокарда у лиц молодого возраста Шестерня П.А., Никулина С.Ю., Шульман В.А., Мартынова Е.А., Демкина А.И., Орлов П.С., Максимов В.Н., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2013, №7 стр.4-8
Ассоциация генетических маркёров со сниженной сократительной функцией сердца у больных с острым коронарным синдромом Ложкина Н.Г., Максимов В.Н., Куликов И.В., Орлов П.С., Куимов А.Д., Воевода М.И. Медицина и образование в Сибири, 2013
Генетические маркёры тяжести поражения коронарных сосудов у больных с острым коронарным синдромом Куликов И.В., Ложкина Н.Г., Максимов В.Н., Орлов П.С., Куимов А.Д., Воевода М.И. Бюллетень СО РАМН, 2013, Т. 33 № 4, С. 65-70.
ПРОФЕССИОНАЛЬНАЯ ХРОНИЧЕСКАЯ ОБСТРУКТИВНАЯ БОЛЕЗНЬ ЛЕГКИХ С ПОЗИЦИЙ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ Шпагина Л.А., Воевода М.И., Котова О.С., Максимов В.Н., Орлов П.С., Шпагин И.С., Герасименко О.Н., Бобров С.В. Бюллетень физиологии и патологии дыхания, 2013, 2013. № 49. С. 8-15.
Пролактин как эндогенный фактор ремиелинизации. Предтеченская Е. В., Попова Н. А., Ходаков А. А., Ромащенко А. А. Практическая медицина, 2013, №1-1 (68)С.44-47
Study of swine alpha-macroglobulin gene-family polymorphism in the context of some problems of animal breeding Yermolaev V.I., Savina M.A., Knyazev S.P., Yudin N.S., Aitnazarov R.B., Bekenev V.A., Deeva V.S., Nikitin S. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2013, Vol. 3, No. 3, p. 225-232
ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК В ПОПУЛЯЦИЯХ КОРЕННЫХ ЖИТЕЛЕЙ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА М. А. Губина, Л. А. Гырголькау, В. Н. Бабенко, Л. Д. Дамба, В. Н. Максимов, М. И. Воевода RUSS J GENET+, 2013, ГЕНЕТИКА, 2013, том 49, № 7, с. 862–876
Association of polymorphism harbored by tumor necrosis factor alpha gene and sex of calf with lactation performance in cattle Yudin N.S., Aitnazarov R.B., Voevoda M.I., Gerlinskaya L.A., Moshkin M.P. ASIAN AUSTRAL J ANIM, 2013, Vol. 26, No. 10, P. 1379-1387
Генетические маркеры личностной тревожности как один из факторов риска развития сердечно-сосудистых заболеваний (программа ВОЗ «MONICA», подпрограмма «MONICA-психосоциальная») Гафаров В.В., Воевода М.И., Громова Е.А., Максимов В.Н., Гагулин И.В., Юдин Н.С., Гафарова А.В., Мишакова Т.М. TERAPEVT ARKH, 2013, № 4, стр. 38-47.
Риск сердечно-сосудистых заболеваний, психосоциальные факторы и их биологические детерминанты (программа ВОЗ “MONICA-психосоциальная») Гафаров В.В., Воевода М.И., Громова Е.А., Максимов В.Н., Гафарова А.В., Гагулин И.В., Юдин Н.С., Мишакова Т.М. Мир науки, культуры, образования, 2013, № 1. С. 252-255.
Экстремально высокая частота гетерозиготных носителей аутосомно-рецессивной глухоты 1А типа в Восточной Сибири сопоставима с частотой гетерозиготного носительства серповидно-клеточной анемии в Африке. Барашков Н.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Соловьева Н.А., Пшенникова В.Г., Кларов Л.А., Сидорова О.Г., Григорьева Л.В., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Саввинова К.Е., Находкин С.С., Кожевников А.А., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Пак М.В., Леханова С.Н., Кононова С.К., Рафаилов А.М., Алексеев А.Н., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А. Якутский медицинский журнал, 2013, №4 (44). С.27-30
Генные сети Н.А. Колчанов, Е.В. Игнатьева, О.А. Подколодная, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Т.17, N4/2, 833-849
Effect of genotype structure for 5 MYOC gene SNPs on its frequency in patients with adult-onset Primary Open Angle Glaucoma (POAG) Ivanoshchuk, DE (Ivanoshchuk, D. E.); Konovalova, NA (Konovalova, N. A.); Konovalova, OS (Konovalova, O. S.); Voevoda, MI (Voevoda, M.I.); Romashchenko, AG (Romashchenko, A. G.) FEBS J, 2013, Volume: 280 Special Issue: SI Pages: 432-432 Supplement: 1 Published: JUL 2013
2012
ПРЕДИКТОРНАЯ РОЛЬ ПОЛИМОРФИЗМОВ ХРОМОСОМЫ 9Sр21.3 И ИХ ВЗАИМОСВЯЗЬ С ОТЯГОЩЕННОЙ НАСЛЕДСТВЕННОСТЬЮ В РАЗВИТИИ ИНФАРКТА МИОКАРДА Шестерня Л.А., Шульман В.А., Никулина С.Ю., Мартынова Е.А., Демкина А.И., Орлов П.С., Максимов В.Н.,Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2012, №6(68) ст.14-18
Routes of nanoparticle uptake into mammalian organisms, their biocompatibility and cellular effect O. A. Podkolodnaya, E. V. Ignatieva, N. L. Podkolodnyy, N. A. Kolchanov Biology Bulletin Reviews, 2012, Volume 2, Issue 4, pp 279–289
Single nucleotide polymorphism in the promoter region of the CD209 gene is associated with human predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Brinton M.A., Voevoda M.I. ANTIVIR RES, 2012, Vol. 93, No. 1. P. 64-68.
Detection of mitochondrial DNA from domestic cattle in European bison (Bison bonasus) from the Altai Republic in Russia Yudin N.S., Kulikov I.V., Gunbin K.V., Aitnazarov R.B., Kushnir A.V., Sipko T.P., Moshkin M.P. ANIM GENET, 2012, Vol. 43, No. 3, P. 362.
Drosophila melanogaster Genome: Correlation of Chromatin State with Splicing and Transcription Regulation Babenko VN, Matvienko VF, Zykov IA Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, Vol. 2, No. 1, pp. 85–96;
Пути поступления наночастиц в организм млекопитающих, их биосовместимость и клеточные эффекты. Подколодная О. А., Игнатьева Е. В. , Подколодный Н. Л. , Колчанов Н. А. . Успехи современной биологии, 2012, Т. 132, № 1, с. 3–15
Патогенетическое значение полиморфизма генов дофаминергической системы, ассоциированных с формированием нарушения сна, в открытой популяции среди мужчин 25—64 лет мегаполиса Западной Сибири Гафаров В.В., Воевода М.И., Громова Е.А., Максимов В.Н., Гафарова А.В., Гагулин И.В., Юдин Н.С., Мишакова Т.М. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2012, № 2 (71), С. 12-18.
SPF-виварий: научно-технологический комплекс для исследований в области нанобиобезопасности Пельтек С.Е., Мошкин М.П., Герлинская Л.А., Горячковская Т.Н., Банникова С.В., Подколодная О.А, Попик В.М., Колчанов Н.А. Нанотехнологии Экология Производство, 2012, №2 (15) март 2012 http://www.nanoprom.net/journal/archive/15.html\
Проверка взаимосвязи между девятью однонуклеотидными полиморфизмами и инфарктом миокарда на сибирской популяции Максимов В. Н.,Куликов И.В., Орлов П.С., Гафаров В.В. Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Вестник РАМН, 2012, №5 страницы с 24-29
A single nucleotide polymorphism in the promoter region of the mink tumor necrosis factor-alpha gene. Yudin N.S., Aitnazarov R.B., Kulikov I.V., Ignatieva E.V., Trapezov O.V. Scientifur, 2012, Vol. 36, No. 3/4, P. 300-304.
Finding biomarkers in non-model species: literature mining of transcription factors involved in bovine embryo development. Turenne N, Tiys E, Ivanisenko V, Yudin N, Ignatieva E, Valour D, Degrelle S, Hue I BioData Mining, 2012, Aug 29;5(1):12
Ассоциация полиморфизма генов дофаминергической системы (DRD4, DAT) с жизненным истощением в открытой популяции среди мужчин 25–64 лет (Новосибирск). Эпидемиологическое исследование по программе ВОЗ «MONICA-psychosocial» Гафаров В.В., Воевода М.И., Громова Е.А., Максимов В.Н., Гафарова А.В., Гагулин И.В., Юдин Н.С., Мишакова Т.М. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика, 2012, № 1, 2012 С. 57-63.
Ассоциация VNTR-полиморфизма генов дофаминергической системы с враждебностью среди мужчин 25–64 лет в открытой популяции мегаполиса Западной Сибири (Новосибирск) Гафаров В.В., Громова Е.А., Максимов В.Н., Юдин Н.С., Мишакова Т.М., Гагулин И.В., Воевода М.И. Медицинская генетика, 2012, Том 11, № 8 (122), 2012. С. 37-42.
Nucleosome Organization in Plant DNA Satellite Sequences Babenko VN, Kutashev KO, Matvienko VF Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, Vol. 2, No. 6, pp. 501–507; http://www.springerlink.com/openurl.asp?genre=article&id=doi:10.1134/S2079059712060020
Полиморфизм генов CCR5, CCR2, apoE, р53, ITGB3 и HFE у долгожителей Западной Сибири Д.Е. Иванощук, С.В. Михайлова, И.В.Куликов, В.Н. Максимов, М.И. Воевода,А.Г. Ромащенко Успехи геронтологии, 2012, № 3, С.394-397
Информационная поддержка исследования механизмов регуляции транскрипции: онтологический подход Подколодный Николай Леонтьевич Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 4/1, т. 16, С. 742-755
Распределенная система RESTful-web-сервисов для реконструкции и анализа генных сетей Подколодный Николай Леонтьевич Семенычев Александр Владимирович Рассказов Дмитрий Александрович Боровский Виктор Геннадьевич Ананько Елена Анатольевна Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Наталья Николаевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 4/1, Т.16, 791-798
Клинико-функциональные и молекулярно-генетические особенности хронической обструктивной болезни легких в условиях высокого профессионального риска. Шпагина Л.А., Воевода М.И., Бобров С.В., Максимов В.Н., Орлов П.С., Шпагин И.С., Герасименко О.Н Пульмонология, 2012, №4 стр. 10-14
НУКЛЕОСОМНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ В САТЕЛЛИТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ ДНК РАСТЕНИЙ В.Н. Бабенко К.О. Куташев В.Ф. Матвиенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 2012, 16(1), 271-278
Генофонд мтДНК населения восточного варианта пахомовской культуры Молодин В.И., Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2012, № 4 (52). С. 62-69.
2011
Полиморфизм гена HFE у населения Северной Азии Михайлова С.В., Ромащенко А.Г., Бабенко В.Н., Губина М.А., Соболева Д.Е., Кобзев В.Ф., Воевода М.И Вестник РАМН, 2011
АССОЦИАТИВНЫЙ АНАЛИЗ НЕКОТОРЫХ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФНЫХ МАРКЕРОВ САХАРНОГО ДИАБЕТА ВТОРОГО ТИПА С ИНФАРКТОМ МИОКАРДА Павел Сергеевич ОРЛОВ, Игорь Вячеславович КУЛИКОВ,Сергей Николаевич УСТИНОВ, Валерий Васильевич ГАФАРОВ,Софья Константиновна МАЛЮТИНА, Аида Герасимовна РОМАЩЕНКО, Михаил Иванович ВОЕВОДА, Владимир Николаевич МАКСИМОВ Бюллетень СО РАМН, 2011, том 31 №5 с19-24
Полиморфизм второго интрона гена SDF1 у галловейской, герефордской и черно-пестрой пород крупного рогатого скота Юдин Н.С., Нефедова М.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2011, Том 47, № 2, стр. 279-283
Ассоциация полиморфизма гена холодового рецептора TRPM8 с липидными показателями крови и антропометрическими параметрами у шорцев Потапова Т.А., Юдин Н.С., Пилипенко И.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Шахтшнейдер Е.В., Огарков М.Ю., Воевода М.И. B EXP BIOL MED+, 2011, №2, стр. 186-190
Protein composition of interband regions in polytene and cell line chromosomes of Drosophila melanogaster. Demakov SA, Vatolina TY, Babenko VN, Semeshin VF, Belyaeva ES, Zhimulev IF. BMC GENOMICS, 2011, 12(1):566
Identical Functional Organization of Nonpolytene and Polytene Chromosomes in Drosophila melanogaster. Vatolina TY, Boldyreva LV, Demakova OV, Demakov SA, Kokoza EB, Semeshin VF, Babenko VN, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF. PloS One, 2011, 6(10):e25960
Linkage and association analyses of glaucoma related traits in a large pedigree from a Dutch genetically isolated population Axenovich T, Zorkoltseva I, Belonogova N, van Koolwijk L, Borodin P, Kirichenko A, Babenko V, Ramdas W, Amin N, Despriet D, Vingerling J, Lemij H, Oostra BA, Klaver C, Aulchenko Y, van Duijn C. J MED GENET, 2011, 48(12):802-9
A method for generating selective DNA probes for the analysis of C-negative regions in human chromosomes. Morozkin ES, Loseva EM, Karamysheva TV, Babenko VN, Laktionov PP, Vlassov VV, Rubtsov NB. CYTOGENET GENOME RES, 2011, 135(1):1-11
Identification and molecular genetic characterization of the polytene chromosome interbands in Drosophila melanogaster Vatolina TIu, Demakov SA, Semeshin VF, Makunin IV, Babenko VN, Beliaeva ES, Zhimulev IF. RUSS J GENET+, 2011, 47(5):597-609
Геном Drosophila melanogaster: cвязь состояния хроматина с регуляцией сплайсинга и транскрипции Бабенко ВН, Матвиенко ВФ, Зыков ИА Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, т.13 N. 3 579-591
Связь однонуклеотидного полиморфизма rs11562975 гена термочувствительного ионного канала TRPM8 с чувствительностью к холоду и ментолу Козырева Т.В.,Ткаченко Е.Я., Потапова Т.А., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Физиология человека, 2011, №2, Т.37, С.71-76
Роль транскрипционного фактора Sp4 и коннексина-40 в генезе суправентрикулярных аритмий Воевода М.И., Казаринова Ю.Л., Максимов В.Н., Куликов И.В., Малютина С.К., Никулина С.Ю., Ромащенко А.Г., Исаченко О.О., Чернова А.А., Шульман В.А. Вестник аритмологии, 2011, № 63, С. 32-35.
CCL5/RANTES gene polymorphisms in Slavonic patients with myocardial infarction Tereshchenko IP, Petrkova J, Voevoda MI, Taborsky M, Navratilova Z, Romaschenko AG, Maksimov VN, Mrazek F, Petrek M. MEDIAT INFLAMM, 2011, р. 1-6.
Митохондриальная ДНК женщины из пещеры Каминная (Горный Алтай) эпохи позднего неолита Пилипенко А.С., Молодин В.И., Ромащенко А.Г. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Том 15, № 4, стр. 633-643
Полиморфизм гена дофамин-β гидроксилазы, параметры вегетативной регуляции и клинико патологические характеристики злокачественного процесса у больных раком желудка Соловьева И.Г., Губина М.А., Ромащенко А.Г., Черенкова М.М.,Понебратец О.Ю., Широков Р.В., Абрамова Т.Я., Сидоров С.В.,Чердынцева Н.В., Козлов В.А. Сибирский онкологический журнал, 2011, №5.-с.46-51.
2010
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, 275:337-339
Компьютерная система филогенетического анализа генных сетей: изучение эволюции генной сети клеточного цикла животных Тимонов В.С., Турнаев И.И., Генаев М.А., Гунбин К.В. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Т. 275, 412–414.
Ландшафт альтернативного сплайсинга в геноме Drosophila melanogaster Бабенко В.Н., Айтназаров Р.Б., Гончаров Ф.В., Жимулев И.Ф. RUSS J GENET+, 2010, № 9,т. 46, с. 1168-1170
A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2010, 4, 65, 143-145
Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека, связанный с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита, в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Molecular Biology, 2010, Т.44, №6. С. 985-993.
Триолигонуклеотидные реагенты: адресованная модификация РНК. Ошевский С. И. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2010, №1, V430, pp53-56
Does drive toward canonic exonic splicing sites exist in mammals Babenko V, Ward W, Ruvinsky A J MOL EVOL, 2010, 70(4):387-394
Gene density profile reveals the marking of late replicated domains in the Drosophila melanogaster genome Belyakin SN, Babenko VN, Maksimov DA, Shloma VV, Kvon EZ, Belyaeva ES, Zhimulev IF. CHROMOSOME RES, 2010, 119(6):589-600
Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
Paucity and preferential suppression of transgenes in late replication domains of the D. melanogaster genome Babenko V.N., Makunin I.V., Brusentsova I.V., Belyaeva E.S., Maksimov D.A., Belyakin S.N., Maroy P., Vasil’eva L.A., Zhimulev I.F. BMC GENOMICS, 2010, V. 11. P. 318-332
Адаптация к бездне Афонников Д.А., Гунбин В.К., Суслов В.В. Химия и жизнь, 2010, №3, 38-41
The ethnospecific distribution of the HFE haplotypes for IVS2(+4)t/c, IVS(-44)t/c, and IVS5(-47)g/a in populations of Russia and possible effects of these single-nucleotide polymorphisms in splicing Mikhailova S.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romashchenko A.G. GENET TEST, 2010, V. 14, N. 4, P. 461–469
Variability in the 2'-5'-oligoadenylate synthetase gene cluster is associated with human predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced disease Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Myasnikova N.G., Pilipenko P.I., Romaschenko A.G., Voevoda M.I., Brinton M.A. J INFECT DIS, 2010, Vol. 202, No. 12, P. 1813-1818
Анализ вырожденных олигонуклеотидных мотивов в промоторах генов миРНК, экспрессирующихся в различных тканях млекопитающих О.В.Вишневский, К.В.Гунбин, А.В.Бочарников, Е.В.Березиков Вестник МГУ, 2010, No. 4, pp. 73–75
Анализ полиморфизма генов матриксных металлопротеиназ 2 и 9 у пациентов с ишемической болезнью сердца. Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачёва О.М., Максимов В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. TERAPEVT ARKH, 2010, 2010, № 1, С. 31-34.
Анализ полиморфизма трех позиций промоторного региона гена TNF-a у пациентов с ишемической болезнью сердца, нестабильной стенокардией и инфарктом миокарда Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачева О.М., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2010, Т. 50, № 2, стр. 9-14
Молекулярно-генетические аспекты психонейроиммунных взаимоотношений у здоровых европеоидов Соловьева И. Г., Губина М. А., Стенина А. С., Абрамова Т. Я., Соболева Д. Е., Кожевников В. С., Ромащенко А. Г., Короленко Ц. П., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, 2 (53). - С. 10-13
Психоэмоциональные особенности и полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы 444G/A у больных раком желудка Соловьева И. Г., Короленко Ц. П., Губина М. А., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, 2 (53). - С. 78-80.
Роль полиморфизма С(-260)-Т гена CD14 в течении и исходе нозокомиальной пневмонии Байгозина Е.А., Совалкин В.И., Куликов И.В., Потапова Т.А., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Пульмонология, 2009, № 5, стр.65-67
Характеристика молекулярно-генетической организации интеркалярного гетерохроматина в районе 10А-В D. melanogaster Бабенко ВН, Похолкова ГС, Кокоза ЕВ, Андреенкова НС, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, 424:27-30
Эволюция ключевых белков клеточного цикла коррелирует с увеличением сложности эукариотических организмов Турнаев И.И., Гунбин К.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 2, 426, 265-269
Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA BMC GENOMICS, 2009, V. 1, 10, 639
Молекулярно-генетические аспекты психонейроиммунных взаимоотношений у здоровых европеоидов Соловьева И. Г., Губина М. А., Стенина А. С., Абрамова Т. Я., Соболева Д. Е., Кожевников В. С., Ромащенко А. Г., Короленко Ц. П., Абрамов В. В Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, №2 (53), с 10-13
Полиморфизм гена аполипопротеина Е в популяции коренных жителей Горной Шории и его ассоциация с параметрами углеводного обмена Шахтшнейдер Е.В., Воевода М.И., Огарков М.Ю., Барбараш О.Л., Поликутина О.М., Казачек Я.В., Баум В.А., Юдин Н.С., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Атеросклероз, 2009, Том 5, №1, стр. 28-32
Психоэмоциональные особенности и полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы 444G/A у больных раком желудка Соловьева И. Г., Короленко Ц. П., Губина М. А., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, - 2 (53). - С. 78-80
The macrophage migration inhibitory factor (MIF) gene polymorphism in Czech and Russian patients with myocardial infarction Tereshchenko IP, Petrkova J, Mrazek F, Lukl J, Maksimov VN, Romaschenko AG, Voevoda MI, Petrek M. CLIN CHIM ACTA, 2009, V. 402, No. 1-2, P.199-202
Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 4, 425, 546-548
Изучение генетико-антропологического состава населения древних историко-культурных общностей Алтая Чикишева Т.А., Поздняков Д.В., Губина М.А., Куликов И.В. Вестник РГНФ, 2009, 3(56) с.46-57.
Мутации в гене филаггрина у больных с вульгарным ихтиозом в популяции Новосибирска Максимов В.Н., Куликов И.В., Семаев С.Е., Максимова Ю.В., Аллахвердян А.А., Простякова Е.М., Батина О.В., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Бюллетень сибирской медицины, 2008, № 1, стр. 173-176
Особенности захоронения младенцев в жилищах городища Чича-1 в Баабинской лесостепи по данным анализа структуры ДНК Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2008, № 2, Т. 34, С. 57-67
АССОЦИАТИВНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ P53 И C-FMS С РАЗВИТИЕМ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ У РУССКИХ ЖЕНЩИН И.В. Пилипенко, О.В. Горчакова, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода,Н.Н. Бабышкина, Н.В. Чугунова, А.В. Дорошенко, А.Г. Ромащенко Сибирский онкологический журнал, 2008
Genetic variation in the enigmatic Altaian Kazakhs of South-Central Russia: Insights into Turkic population history Gokcumen O, Dulik MC, Pai AA, Zhadanov SI, Rubinstein S, Osipova LP, Andreenkov OV, Tabikhanova LE, Gubina MA, Labuda D, Schurr TG AM J PHYS ANTHROPOL, 2008, 136(3), P. 278-293
Russian Old Believers: genetic consequences of their persecution and exile, as shown by mitochondrial DNA evidence Rubinstein S, Dulik MC, Gokcumen O, Zhadanov S, Osipova L, Cocca M, Mehta N, Gubina M, Posukh O, Schurr TG HUM BIOL, 2008, Jun;80(3):203-37
TG Russian Old Believers: genetic consequences of their persecution and exile, as shown by mitochondrial DNA evidence Rubinstein S, Dulik MC, Gokcumen O, Zhadanov S, Osipova L, Cocca M, Mehta N, Gubina M, Posukh O, Schurr TG HUM BIOL, 2008, Jun;80(3):203-37
TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko INTELL DATA ANAL, 2008, No. 5, Vol. 12, P. 443-461
2007
Консервативность ДНК 3’-нетранслируемой области гена GRO1 северного оленя Юдин Н.С., Потапова Т.А., Кобзев В.Ф., Южаков А.А., Кушнир А.В. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2007, № 9, стр. 93-97
Палеогенетическое исследование древнего населения Горного Алтая Чикишева Т.А., Губина М.А., Куликов И.В., Карафет Т.М., ВоеводаМ.И., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2007, N4 (32) c 130-142
A counter clockwise northern route of the Y-chromosome haplogroup N from Southeast Asia towards Europe Siiri Rootsi, Lev A. Zhivotovsky, Marian Baldovic, Manfred Kayser, Ildus A. Kutuev, Rita Khusainova, Marina A. Bermisheva, Marina Gubina, Sardana A. Fedorova, Anne-Mai Ilum, Elza K. Khusnutdinova, Mikhail I. Voevoda, Ludmila P. EUR J HUM GENET, 2007, Feb;15(2):204-11
Long-term trends in evolution of indels in protein sequences Wolf Y, Madej T, Babenko V, Shoemaker B, Panchenko AR. BMC EVOL BIOL, 2007, 7,19
Model of the reception of hedgehog morphogen concentration gradient: comparison with an extended range of experimental data Gunbin K.V., Omelyanchuk L.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, 2b, 5, 491-507
Accumulation of slightly deleterious mutations in mitochondrial protein-coding genes of large versus small mammals Popadin K., Polishchuk L.V., Mamirova L., Knorre D., Gunbin K. P NATL ACAD SCI USA, 2007, 33, 104, 13390-13395
The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A. In Silico Biology, 2007, 3, 7, 333-354
Vasa-related genes and their expression in stem cells of colonial parasitic rhizocephalan barnacle Polyascus polygenea (Arthropoda: Crustacea: Cirripedia: Rhizocephala) Shukalyuk A.I., Golovnina K.A., Baiborodin S.I., Gunbin K.V., Blinov A.G., Isaeva V.V. CELL BIOL INT, 2007, 31(2):97-108
The location of the gene regions under selective pressures: PLATO algorithm parallelization Vyatkin Yu. V., Gunbin K.V., Snytnikov A.V., Afonnikov D.A. Lect Notes Comput Sci, 2007, V. 4671, P. 184-187.
Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 2, 11, 373-400
Ассоциация аллелей гена IL10(G-1087A) с уровнем пролактина и инсулина в периферической крови у здоровых европеоидов Соловьева И.Г., Смольникова М.В., Губина М.А., Дортман В.В., Кожевников В.С., Меняева Е.В., Коненков В.И., Абрамов В.В. Омский научный вестник, 2007, №3 (61), приложение 2.
Beringian standstill and spread of Native American founders Tamm E., Kivisild T., Reidla M., Metspalu M., Smith D.G., Mulligan C.J., Bravi C.M., Rickards O., Martinez-Labarga C., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A., Golubenko M.V., Stepanov V.A., Gubina M.A., Zhadanov S.I., Osipova L.P., Damba L., Voevoda M.I., Dipi PloS One, 2007, 2(9):e829
Делеция 2282del4 в гене филаггрина в популяции жителей Новосибирска и у больных вульгарным ихтиозом Максимов В.Н., Куликов И.В., Семаев С.Е., Максимова Ю.В., Простякова Е.М., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Медицинская генетика, 2007, № 8, С. 21-23
2006
Полиморфизм гена аполипопротеина Е, желчно-каменная болезнь и панкреатит Григорьева И.Н., Никитенко Т.М., Романова Т.И., Осипенко М.Ф., Егошина М.А., Сединина Е.В., Венжина Ю.Ю., Шахтшнейдер Е.В., Куликов И.В., Максимов В.Н., Усов С.А., Мироненко Т.В., Данильчева Т.В., Иванова М.В., Потапова Т.А., Ромащенко А.Г. Малютина С. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 4, С. 80-88.
Численное исследование модели рецепции градиента концентрации морфогена Hedgehog В.В.Когай, К.В.Гунбин, Л.В.Омельянчук, С.И. Фадеев, Н.А.Колчанов Сибирский журнал индустриальной математики, 2006, 3(27), IX, 66-79
Этногенетические особенности подверженности атеросклерозу в этнических группах Сибири (на примере гена аполипопротеина Е) Воевода М.И., Степанов В.А., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 2, С. 63-72.
Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck GENOMICS, 2006, V. 88, № 6, P. 752-761.
Палеогенетические исследования носителей Пазырыкской культуры IV-II вв до н.э. Куликов И.В., Нефёдова М.В., Губина М.А., Шульгина Е.О., Дамба Л.Д., Молодин В.И., Чикишева Т.А., Воевода М.И. 1, Ромащенко А.Г. Всероссийский археологический съезд "Современные проблемы Археологии России, 2006, 264-266
The phylogeography of mtDNA variation in Altaian Kazakh populations Gokсumen O, Osipova LP, Zhadanov SI, Andreenkov O, Tabikhanova L, Gubina M, Schurr TG AM J PHYS ANTHROPOL, 2006, Suppl. 42:93
Signs of positive selection of somatic mutations in human cancers detected by EST sequence analysis Babenko VN, Basu MK, Kondrashov FA, Rogozin IB, Koonin EV. BMC CANCER, 2006, 6:36
Гаплотипический анализ гена HFE в популяции русских и среди пациентов с мультифакториальными заболеваниями Михайлова СВ, Онопченко О.В., Суханов А.В., Максимов В.Н., Гаскина Т.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т. 10, №3, С. 504-513.
Долгожительство – модель изучения процесса старения. Шабалин А.В., Воевода М.И., Черных Н.И., Пентегова В.А., Рагино Ю.И., Иванова М.В., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Шахтшнейдер Е.В. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 4, С. 11-21
Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О, Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т.10, №3. С.565-571
2005
Полиморфизм гена HFE у больных хроническим гепатитом С Кулагина Е.А., Михайлова С.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И., Курилович С.А. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии, 2005, №4, С.29-34
Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2005, Т.9, N2, май 2005, 232-261
Analysis of evolution of exon-intron structure of eukaryotic genes Rogozin IB, Sverdlov AV, Babenko VN, Koonin EV BRIEF BIOINFORM, 2005, 6(2):118-134
Conservation versus parallel gains in intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2005, 33(6):1741-1748
2004
Моделирование биологической эволюции: регуляторные генетические системы и кодирование сложности биологической организации Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин К.В. Информационный вестник ВОГИС, 2004, № 29. С.: 86-99.
Генетические механизмы кодирования биологической сложности Суслов В.В., Гунбин К.В., Колчанов Н.А. Экологическая генетика, 2004, Т. II. № 1. С. 13-26.
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть I. Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А. Сибирский экологический журнал, 2004, 11(5):599-610
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть II. Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А. Сибирский экологический журнал, 2004, 11(5):611-621
Reconstruction of ancestral protosplice sites Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2004, 4(16):1505-1508
Preferential loss and gain of introns in 3' portions of genes suggests a reverse-transcription mechanism of intron insertion Sverdlov AV, Babenko VN, Rogozin IB, Koonin EV GENE, 2004, 338(1):85-91
Prevalence of intron gain over intron loss in the evolution of paralogous gene families Babenko VN, Rogozin IB, Mekhedov SL, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2004, 32(12):3724-3733
Comparative analysis of complete genomes reveals gene loss, acquisition and acceleration of evolutionary rates in Metazoa, suggests a prevalence of evolution via gene acquisition and indicates that the evolutionary rates in animals tend to be conserved. Babenko VN, Krylov DM NUCLEIC ACIDS RES, 2004, 32(17):5029-5035
2003
Полиморфизм гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом, в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Хаснулин В.И., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2003, Т.39 № 7C. 988-995
Evidence of splice signal migration from exon to intron during intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2003, 13(24):2170-2174
Computational analysis of mutation spectra Rogozin IB, Babenko VN, Milanesi L, Pavlov YI BRIEF BIOINFORM, 2003, 4(3):210-227
2002
Transcription Regulatory Regions Database (TRRD): its status in 2002 Kolchanov NA, Ignatieva EV, Ananko EA, Podkolodnaya OA, Stepanenko IL, Merkulova TI, Pozdnyakov MA, Podkolodny NL, Naumochkin AN, Romashchenko AG NUCLEIC ACIDS RES, 2002, Jan 1;30(1):312-317
2001
Распространение аллелей C282Y, H63D и S65C гена HFE и предрасположенности к нарушениям метаболизма железа в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Хаснулин, Воевода М.И Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии, 2001, Т.XI, №4, С.13-17
The contribution of exon-skipping events on chromosome 22 to protein coding diversity. Hide WA, Babenko VN, van Heusden PA, Seoighe C, Kelso JF GENOME RES, 2001, 1(11):1848-1853
2000
Хронические диффузные заболевания печени с синдромом перегрузки железом Кулагина Е.А., Михайлова С.В. Бюллетень СО РАМН, 2000, №2 (96), С. 74-77
1999
GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, 5, 44, 837-841
Recognition of NFATp/AP-1 composite elements within genes induced upon the activation of immune cells. Kel A, Kel-Margoulis O, Babenko V, Wingender E. J MOL BIOL, 1999, 288(3):353-376
Investigating extended regulatory regions of genomic DNA sequences Babenko VN, Kosarev PS, Vishnevsky OV, Levitsky VG, Basin VV, Frolov AS BIOINFORMATICS, 1999, 15(7-8):644-653
Use of a rank correlation coefficient for comparing mutational spectra Babenko VN, Rogozin IB BIOPHYSICS, 1999, 44(4):632-638
1998
Eukaryotic mRNAs encoding abundant and scarce proteins are statistically dissimilar in many structural features. Kochetov AV, Ischenko IV, Vorobiev DG, Kel AE, Babenko VN, Kisselev LL, Kolchanov NA. FEBS LETT, 1998, 440(3):351-355
A genetic algorithm for designing gene family-specific oligonucleotide sets used for hybridization: the G protein-coupled receptor protein superfamily Kel A, Ptitsyn A, Babenko V, Meier-Ewert S, Lehrach H. BIOINFORMATICS, 1998, 4(3):259-270
GeneExpress: a computer system for description, analysis, and recognition of regulatory sequences in eukaryotic genome. N.A. Kolchanov, M.P. Ponomarenko, A.E. Kel, A.S. Frolov, F.A. Kolpakov, T.N. Goryachkovsky, O.V. Kel, E.A. Ananko, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, V.N. Babenko, I.L. Stepanenko, A.G. Romashchenko, T.I. Merkulova, D.G. Vorobiev, S.V. Lavryushev, A.V. Kochetov, G.B. Kolesov, V.V. Solovyev, L. Milanesi, N.L. Podkolodny, E. Wingender, T. Heinemeyer Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol, 1998, 6, 95-104
Распределение транскриптов Bsp-повторов Canidae в почке песца: структурное сходство Bsp-повторов с SINEs Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Ромащенко А.Г., Беляева Т.А., Мелиди Н.Н., Лавриненко В.А., Гувакова Т.В., Иванова Л.Н. Доклады АН СССР, 1995, Т.343,№2, С.160-164
Identification of cDNA sequences by specific oligonucleotide sets. Computer tool and application. Kolchanov NA, Vishnevsky OV, Kel AE, Shindyalov IN Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol, 1995, 3:206-214
1991
Comparison of asymptotic tests of the Hardy-Weinberg distribution. Ginzburg E.Kh, Axenovich TI, Babenko VN ANN HUM GENET, 1991, 55(Pt 4):329-338.
