Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, 275:337-339
Компьютерная система филогенетического анализа генных сетей: изучение эволюции генной сети клеточного цикла животных Тимонов В.С., Турнаев И.И., Генаев М.А., Гунбин К.В. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Т. 275, 412–414.
Ландшафт альтернативного сплайсинга в геноме Drosophila melanogaster Бабенко В.Н., Айтназаров Р.Б., Гончаров Ф.В., Жимулев И.Ф. RUSS J GENET+, 2010, № 9,т. 46, с. 1168-1170
A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2010, 4, 65, 143-145
Does drive toward canonic exonic splicing sites exist in mammals Babenko V, Ward W, Ruvinsky A J MOL EVOL, 2010, 70(4):387-394
Gene density profile reveals the marking of late replicated domains in the Drosophila melanogaster genome Belyakin SN, Babenko VN, Maksimov DA, Shloma VV, Kvon EZ, Belyaeva ES, Zhimulev IF. CHROMOSOME RES, 2010, 119(6):589-600
Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
Paucity and preferential suppression of transgenes in late replication domains of the D. melanogaster genome Babenko V.N., Makunin I.V., Brusentsova I.V., Belyaeva E.S., Maksimov D.A., Belyakin S.N., Maroy P., Vasil’eva L.A., Zhimulev I.F. BMC GENOMICS, 2010, V. 11. P. 318-332
The ethnospecific distribution of the HFE haplotypes for IVS2(+4)t/c, IVS(-44)t/c, and IVS5(-47)g/a in populations of Russia and possible effects of these single-nucleotide polymorphisms in splicing Mikhailova S.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romashchenko A.G. GENET TEST, 2010, V. 14, N. 4, P. 461–469
Variability in the 2'-5'-oligoadenylate synthetase gene cluster is associated with human predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced disease Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Myasnikova N.G., Pilipenko P.I., Romaschenko A.G., Voevoda M.I., Brinton M.A. J INFECT DIS, 2010, Vol. 202, No. 12, P. 1813-1818
Анализ вырожденных олигонуклеотидных мотивов в промоторах генов миРНК, экспрессирующихся в различных тканях млекопитающих О.В.Вишневский, К.В.Гунбин, А.В.Бочарников, Е.В.Березиков Вестник МГУ, 2010, No. 4, pp. 73–75
Анализ полиморфизма трех позиций промоторного региона гена TNF-a у пациентов с ишемической болезнью сердца, нестабильной стенокардией и инфарктом миокарда Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачева О.М., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2010, Т. 50, № 2, стр. 9-14
Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA BMC GENOMICS, 2009, V. 1, 10, 639
The macrophage migration inhibitory factor (MIF) gene polymorphism in Czech and Russian patients with myocardial infarction Tereshchenko IP, Petrkova J, Mrazek F, Lukl J, Maksimov VN, Romaschenko AG, Voevoda MI, Petrek M. CLIN CHIM ACTA, 2009, V. 402, No. 1-2, P.199-202
Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 4, 425, 546-548
Внезапная сердечная смерть и полиморфизм генов-кандидатов сердечно-сосудистых заболеваний Воевода М.И., Куликов И.В., Максимов В.Н., Малютина С.К., Шахтшнейдер Е.В., Кулишова Л.М., Новоселов В.П., Ромащенко А.Г. KARDIOLOGIYA, 2009, № 4, С. 52-57
Изучение генетико-антропологического состава населения древних историко-культурных общностей Алтая Чикишева Т.А., Поздняков Д.В., Губина М.А., Куликов И.В. Вестник РГНФ, 2009, 3(56) с.46-57.
2008
Genetic variation in the enigmatic Altaian Kazakhs of South-Central Russia: Insights into Turkic population history Gokcumen O, Dulik MC, Pai AA, Zhadanov SI, Rubinstein S, Osipova LP, Andreenkov OV, Tabikhanova LE, Gubina MA, Labuda D, Schurr TG AM J PHYS ANTHROPOL, 2008, 136(3), P. 278-293
Russian Old Believers: genetic consequences of their persecution and exile, as shown by mitochondrial DNA evidence Rubinstein S, Dulik MC, Gokcumen O, Zhadanov S, Osipova L, Cocca M, Mehta N, Gubina M, Posukh O, Schurr TG HUM BIOL, 2008, Jun;80(3):203-37
TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko INTELL DATA ANAL, 2008, No. 5, Vol. 12, P. 443-461
2007
Консервативность ДНК 3’-нетранслируемой области гена GRO1 северного оленя Юдин Н.С., Потапова Т.А., Кобзев В.Ф., Южаков А.А., Кушнир А.В. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2007, № 9, стр. 93-97
A counter clockwise northern route of the Y-chromosome haplogroup N from Southeast Asia towards Europe Siiri Rootsi, Lev A. Zhivotovsky, Marian Baldovic, Manfred Kayser, Ildus A. Kutuev, Rita Khusainova, Marina A. Bermisheva, Marina Gubina, Sardana A. Fedorova, Anne-Mai Ilum, Elza K. Khusnutdinova, Mikhail I. Voevoda, Ludmila P. EUR J HUM GENET, 2007, Feb;15(2):204-11
Long-term trends in evolution of indels in protein sequences Wolf Y, Madej T, Babenko V, Shoemaker B, Panchenko AR. BMC EVOL BIOL, 2007, 7,19
Model of the reception of hedgehog morphogen concentration gradient: comparison with an extended range of experimental data Gunbin K.V., Omelyanchuk L.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, 2b, 5, 491-507
Accumulation of slightly deleterious mutations in mitochondrial protein-coding genes of large versus small mammals Popadin K., Polishchuk L.V., Mamirova L., Knorre D., Gunbin K. P NATL ACAD SCI USA, 2007, 33, 104, 13390-13395
The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A. In Silico Biology, 2007, 3, 7, 333-354
Vasa-related genes and their expression in stem cells of colonial parasitic rhizocephalan barnacle Polyascus polygenea (Arthropoda: Crustacea: Cirripedia: Rhizocephala) Shukalyuk A.I., Golovnina K.A., Baiborodin S.I., Gunbin K.V., Blinov A.G., Isaeva V.V. CELL BIOL INT, 2007, 31(2):97-108
Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 2, 11, 373-400
Ассоциация аллелей гена IL10(G-1087A) с уровнем пролактина и инсулина в периферической крови у здоровых европеоидов Соловьева И.Г., Смольникова М.В., Губина М.А., Дортман В.В., Кожевников В.С., Меняева Е.В., Коненков В.И., Абрамов В.В. Омский научный вестник, 2007, №3 (61), приложение 2.
Beringian standstill and spread of Native American founders Tamm E., Kivisild T., Reidla M., Metspalu M., Smith D.G., Mulligan C.J., Bravi C.M., Rickards O., Martinez-Labarga C., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A., Golubenko M.V., Stepanov V.A., Gubina M.A., Zhadanov S.I., Osipova L.P., Damba L., Voevoda M.I., Dipi PloS One, 2007, 2(9):e829
Делеция 2282del4 в гене филаггрина в популяции жителей Новосибирска и у больных вульгарным ихтиозом Максимов В.Н., Куликов И.В., Семаев С.Е., Максимова Ю.В., Простякова Е.М., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Медицинская генетика, 2007, № 8, С. 21-23
2006
Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck GENOMICS, 2006, V. 88, № 6, P. 752-761.
Гаплотипический анализ гена HFE в популяции русских и среди пациентов с мультифакториальными заболеваниями Михайлова СВ, Онопченко О.В., Суханов А.В., Максимов В.Н., Гаскина Т.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т. 10, №3, С. 504-513.
Долгожительство – модель изучения процесса старения. Шабалин А.В., Воевода М.И., Черных Н.И., Пентегова В.А., Рагино Ю.И., Иванова М.В., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Шахтшнейдер Е.В. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 4, С. 11-21
Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О, Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т.10, №3. С.565-571