Single nucleotide polymorphism in the promoter region of the CD209 gene is associated with human predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Brinton M.A., Voevoda M.I. ANTIVIR RES, 2012, Vol. 93, No. 1. P. 64-68.
Detection of mitochondrial DNA from domestic cattle in European bison (Bison bonasus) from the Altai Republic in Russia Yudin N.S., Kulikov I.V., Gunbin K.V., Aitnazarov R.B., Kushnir A.V., Sipko T.P., Moshkin M.P. ANIM GENET, 2012, Vol. 43, No. 3, P. 362.
2011
Полиморфизм гена HFE у населения Северной Азии Михайлова С.В., Ромащенко А.Г., Бабенко В.Н., Губина М.А., Соболева Д.Е., Кобзев В.Ф., Воевода М.И Вестник РАМН, 2011
АССОЦИАТИВНЫЙ АНАЛИЗ НЕКОТОРЫХ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФНЫХ МАРКЕРОВ САХАРНОГО ДИАБЕТА ВТОРОГО ТИПА С ИНФАРКТОМ МИОКАРДА Павел Сергеевич ОРЛОВ, Игорь Вячеславович КУЛИКОВ,Сергей Николаевич УСТИНОВ, Валерий Васильевич ГАФАРОВ,Софья Константиновна МАЛЮТИНА, Аида Герасимовна РОМАЩЕНКО, Михаил Иванович ВОЕВОДА, Владимир Николаевич МАКСИМОВ Бюллетень СО РАМН, 2011, том 31 №5 с19-24
Полиморфизм второго интрона гена SDF1 у галловейской, герефордской и черно-пестрой пород крупного рогатого скота Юдин Н.С., Нефедова М.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2011, Том 47, № 2, стр. 279-283
Ассоциация полиморфизма гена холодового рецептора TRPM8 с липидными показателями крови и антропометрическими параметрами у шорцев Потапова Т.А., Юдин Н.С., Пилипенко И.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Шахтшнейдер Е.В., Огарков М.Ю., Воевода М.И. B EXP BIOL MED+, 2011, №2, стр. 186-190
Protein composition of interband regions in polytene and cell line chromosomes of Drosophila melanogaster. Demakov SA, Vatolina TY, Babenko VN, Semeshin VF, Belyaeva ES, Zhimulev IF. BMC GENOMICS, 2011, 12(1):566
Identical Functional Organization of Nonpolytene and Polytene Chromosomes in Drosophila melanogaster. Vatolina TY, Boldyreva LV, Demakova OV, Demakov SA, Kokoza EB, Semeshin VF, Babenko VN, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF. PloS One, 2011, 6(10):e25960
Linkage and association analyses of glaucoma related traits in a large pedigree from a Dutch genetically isolated population Axenovich T, Zorkoltseva I, Belonogova N, van Koolwijk L, Borodin P, Kirichenko A, Babenko V, Ramdas W, Amin N, Despriet D, Vingerling J, Lemij H, Oostra BA, Klaver C, Aulchenko Y, van Duijn C. J MED GENET, 2011, 48(12):802-9
A method for generating selective DNA probes for the analysis of C-negative regions in human chromosomes. Morozkin ES, Loseva EM, Karamysheva TV, Babenko VN, Laktionov PP, Vlassov VV, Rubtsov NB. CYTOGENET GENOME RES, 2011, 135(1):1-11
Identification and molecular genetic characterization of the polytene chromosome interbands in Drosophila melanogaster Vatolina TIu, Demakov SA, Semeshin VF, Makunin IV, Babenko VN, Beliaeva ES, Zhimulev IF. RUSS J GENET+, 2011, 47(5):597-609
Геном Drosophila melanogaster: cвязь состояния хроматина с регуляцией сплайсинга и транскрипции Бабенко ВН, Матвиенко ВФ, Зыков ИА Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, т.13 N. 3 579-591
Связь однонуклеотидного полиморфизма rs11562975 гена термочувствительного ионного канала TRPM8 с чувствительностью к холоду и ментолу Козырева Т.В.,Ткаченко Е.Я., Потапова Т.А., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Физиология человека, 2011, №2, Т.37, С.71-76
Роль транскрипционного фактора Sp4 и коннексина-40 в генезе суправентрикулярных аритмий Воевода М.И., Казаринова Ю.Л., Максимов В.Н., Куликов И.В., Малютина С.К., Никулина С.Ю., Ромащенко А.Г., Исаченко О.О., Чернова А.А., Шульман В.А. Вестник аритмологии, 2011, № 63, С. 32-35.
CCL5/RANTES gene polymorphisms in Slavonic patients with myocardial infarction Tereshchenko IP, Petrkova J, Voevoda MI, Taborsky M, Navratilova Z, Romaschenko AG, Maksimov VN, Mrazek F, Petrek M. MEDIAT INFLAMM, 2011, р. 1-6.
Митохондриальная ДНК женщины из пещеры Каминная (Горный Алтай) эпохи позднего неолита Пилипенко А.С., Молодин В.И., Ромащенко А.Г. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Том 15, № 4, стр. 633-643
Полиморфизм гена дофамин-β гидроксилазы, параметры вегетативной регуляции и клинико патологические характеристики злокачественного процесса у больных раком желудка Соловьева И.Г., Губина М.А., Ромащенко А.Г., Черенкова М.М.,Понебратец О.Ю., Широков Р.В., Абрамова Т.Я., Сидоров С.В.,Чердынцева Н.В., Козлов В.А. Сибирский онкологический журнал, 2011, №5.-с.46-51.
2010
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, 275:337-339
Компьютерная система филогенетического анализа генных сетей: изучение эволюции генной сети клеточного цикла животных Тимонов В.С., Турнаев И.И., Генаев М.А., Гунбин К.В. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Т. 275, 412–414.
Ландшафт альтернативного сплайсинга в геноме Drosophila melanogaster Бабенко В.Н., Айтназаров Р.Б., Гончаров Ф.В., Жимулев И.Ф. RUSS J GENET+, 2010, № 9,т. 46, с. 1168-1170
A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2010, 4, 65, 143-145
Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека, связанный с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита, в популяциях Северной Евразии Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Molecular Biology, 2010, Т.44, №6. С. 985-993.
Триолигонуклеотидные реагенты: адресованная модификация РНК. Ошевский С. И. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2010, №1, V430, pp53-56
Does drive toward canonic exonic splicing sites exist in mammals Babenko V, Ward W, Ruvinsky A J MOL EVOL, 2010, 70(4):387-394
Gene density profile reveals the marking of late replicated domains in the Drosophila melanogaster genome Belyakin SN, Babenko VN, Maksimov DA, Shloma VV, Kvon EZ, Belyaeva ES, Zhimulev IF. CHROMOSOME RES, 2010, 119(6):589-600
Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
Paucity and preferential suppression of transgenes in late replication domains of the D. melanogaster genome Babenko V.N., Makunin I.V., Brusentsova I.V., Belyaeva E.S., Maksimov D.A., Belyakin S.N., Maroy P., Vasil’eva L.A., Zhimulev I.F. BMC GENOMICS, 2010, V. 11. P. 318-332
Адаптация к бездне Афонников Д.А., Гунбин В.К., Суслов В.В. Химия и жизнь, 2010, №3, 38-41
The ethnospecific distribution of the HFE haplotypes for IVS2(+4)t/c, IVS(-44)t/c, and IVS5(-47)g/a in populations of Russia and possible effects of these single-nucleotide polymorphisms in splicing Mikhailova S.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romashchenko A.G. GENET TEST, 2010, V. 14, N. 4, P. 461–469
Variability in the 2'-5'-oligoadenylate synthetase gene cluster is associated with human predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced disease Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Myasnikova N.G., Pilipenko P.I., Romaschenko A.G., Voevoda M.I., Brinton M.A. J INFECT DIS, 2010, Vol. 202, No. 12, P. 1813-1818
Анализ вырожденных олигонуклеотидных мотивов в промоторах генов миРНК, экспрессирующихся в различных тканях млекопитающих О.В.Вишневский, К.В.Гунбин, А.В.Бочарников, Е.В.Березиков Вестник МГУ, 2010, No. 4, pp. 73–75
Анализ полиморфизма генов матриксных металлопротеиназ 2 и 9 у пациентов с ишемической болезнью сердца. Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачёва О.М., Максимов В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. TERAPEVT ARKH, 2010, 2010, № 1, С. 31-34.
Анализ полиморфизма трех позиций промоторного региона гена TNF-a у пациентов с ишемической болезнью сердца, нестабильной стенокардией и инфарктом миокарда Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачева О.М., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Воевода М.И. KARDIOLOGIYA, 2010, Т. 50, № 2, стр. 9-14
Молекулярно-генетические аспекты психонейроиммунных взаимоотношений у здоровых европеоидов Соловьева И. Г., Губина М. А., Стенина А. С., Абрамова Т. Я., Соболева Д. Е., Кожевников В. С., Ромащенко А. Г., Короленко Ц. П., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, 2 (53). - С. 10-13
Психоэмоциональные особенности и полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы 444G/A у больных раком желудка Соловьева И. Г., Короленко Ц. П., Губина М. А., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, 2 (53). - С. 78-80.
Роль полиморфизма С(-260)-Т гена CD14 в течении и исходе нозокомиальной пневмонии Байгозина Е.А., Совалкин В.И., Куликов И.В., Потапова Т.А., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Пульмонология, 2009, № 5, стр.65-67
Характеристика молекулярно-генетической организации интеркалярного гетерохроматина в районе 10А-В D. melanogaster Бабенко ВН, Похолкова ГС, Кокоза ЕВ, Андреенкова НС, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, 424:27-30
Эволюция ключевых белков клеточного цикла коррелирует с увеличением сложности эукариотических организмов Турнаев И.И., Гунбин К.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 2, 426, 265-269
Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA BMC GENOMICS, 2009, V. 1, 10, 639
Молекулярно-генетические аспекты психонейроиммунных взаимоотношений у здоровых европеоидов Соловьева И. Г., Губина М. А., Стенина А. С., Абрамова Т. Я., Соболева Д. Е., Кожевников В. С., Ромащенко А. Г., Короленко Ц. П., Абрамов В. В Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, №2 (53), с 10-13
Полиморфизм гена аполипопротеина Е в популяции коренных жителей Горной Шории и его ассоциация с параметрами углеводного обмена Шахтшнейдер Е.В., Воевода М.И., Огарков М.Ю., Барбараш О.Л., Поликутина О.М., Казачек Я.В., Баум В.А., Юдин Н.С., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г. Атеросклероз, 2009, Том 5, №1, стр. 28-32
Психоэмоциональные особенности и полиморфизм гена дофамин-β-гидроксилазы 444G/A у больных раком желудка Соловьева И. Г., Короленко Ц. П., Губина М. А., Абрамов В. В. Сибирский вестник психиатрии и наркологии, 2009, - 2 (53). - С. 78-80
The macrophage migration inhibitory factor (MIF) gene polymorphism in Czech and Russian patients with myocardial infarction Tereshchenko IP, Petrkova J, Mrazek F, Lukl J, Maksimov VN, Romaschenko AG, Voevoda MI, Petrek M. CLIN CHIM ACTA, 2009, V. 402, No. 1-2, P.199-202
Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 4, 425, 546-548
Изучение генетико-антропологического состава населения древних историко-культурных общностей Алтая Чикишева Т.А., Поздняков Д.В., Губина М.А., Куликов И.В. Вестник РГНФ, 2009, 3(56) с.46-57.
Мутации в гене филаггрина у больных с вульгарным ихтиозом в популяции Новосибирска Максимов В.Н., Куликов И.В., Семаев С.Е., Максимова Ю.В., Аллахвердян А.А., Простякова Е.М., Батина О.В., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Бюллетень сибирской медицины, 2008, № 1, стр. 173-176
Особенности захоронения младенцев в жилищах городища Чича-1 в Баабинской лесостепи по данным анализа структуры ДНК Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2008, № 2, Т. 34, С. 57-67
Genetic variation in the enigmatic Altaian Kazakhs of South-Central Russia: Insights into Turkic population history Gokcumen O, Dulik MC, Pai AA, Zhadanov SI, Rubinstein S, Osipova LP, Andreenkov OV, Tabikhanova LE, Gubina MA, Labuda D, Schurr TG AM J PHYS ANTHROPOL, 2008, 136(3), P. 278-293
Russian Old Believers: genetic consequences of their persecution and exile, as shown by mitochondrial DNA evidence Rubinstein S, Dulik MC, Gokcumen O, Zhadanov S, Osipova L, Cocca M, Mehta N, Gubina M, Posukh O, Schurr TG HUM BIOL, 2008, Jun;80(3):203-37
TG Russian Old Believers: genetic consequences of their persecution and exile, as shown by mitochondrial DNA evidence Rubinstein S, Dulik MC, Gokcumen O, Zhadanov S, Osipova L, Cocca M, Mehta N, Gubina M, Posukh O, Schurr TG HUM BIOL, 2008, Jun;80(3):203-37
TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko INTELL DATA ANAL, 2008, No. 5, Vol. 12, P. 443-461
2007
Консервативность ДНК 3’-нетранслируемой области гена GRO1 северного оленя Юдин Н.С., Потапова Т.А., Кобзев В.Ф., Южаков А.А., Кушнир А.В. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2007, № 9, стр. 93-97
Палеогенетическое исследование древнего населения Горного Алтая Чикишева Т.А., Губина М.А., Куликов И.В., Карафет Т.М., ВоеводаМ.И., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2007, N4 (32) c 130-142
A counter clockwise northern route of the Y-chromosome haplogroup N from Southeast Asia towards Europe Siiri Rootsi, Lev A. Zhivotovsky, Marian Baldovic, Manfred Kayser, Ildus A. Kutuev, Rita Khusainova, Marina A. Bermisheva, Marina Gubina, Sardana A. Fedorova, Anne-Mai Ilum, Elza K. Khusnutdinova, Mikhail I. Voevoda, Ludmila P. EUR J HUM GENET, 2007, Feb;15(2):204-11
Long-term trends in evolution of indels in protein sequences Wolf Y, Madej T, Babenko V, Shoemaker B, Panchenko AR. BMC EVOL BIOL, 2007, 7,19
Model of the reception of hedgehog morphogen concentration gradient: comparison with an extended range of experimental data Gunbin K.V., Omelyanchuk L.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, 2b, 5, 491-507
Accumulation of slightly deleterious mutations in mitochondrial protein-coding genes of large versus small mammals Popadin K., Polishchuk L.V., Mamirova L., Knorre D., Gunbin K. P NATL ACAD SCI USA, 2007, 33, 104, 13390-13395
The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A. In Silico Biology, 2007, 3, 7, 333-354
Vasa-related genes and their expression in stem cells of colonial parasitic rhizocephalan barnacle Polyascus polygenea (Arthropoda: Crustacea: Cirripedia: Rhizocephala) Shukalyuk A.I., Golovnina K.A., Baiborodin S.I., Gunbin K.V., Blinov A.G., Isaeva V.V. CELL BIOL INT, 2007, 31(2):97-108
The location of the gene regions under selective pressures: PLATO algorithm parallelization Vyatkin Yu. V., Gunbin K.V., Snytnikov A.V., Afonnikov D.A. Lect Notes Comput Sci, 2007, V. 4671, P. 184-187.
Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 2, 11, 373-400
Ассоциация аллелей гена IL10(G-1087A) с уровнем пролактина и инсулина в периферической крови у здоровых европеоидов Соловьева И.Г., Смольникова М.В., Губина М.А., Дортман В.В., Кожевников В.С., Меняева Е.В., Коненков В.И., Абрамов В.В. Омский научный вестник, 2007, №3 (61), приложение 2.
Beringian standstill and spread of Native American founders Tamm E., Kivisild T., Reidla M., Metspalu M., Smith D.G., Mulligan C.J., Bravi C.M., Rickards O., Martinez-Labarga C., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A., Golubenko M.V., Stepanov V.A., Gubina M.A., Zhadanov S.I., Osipova L.P., Damba L., Voevoda M.I., Dipi PloS One, 2007, 2(9):e829
Делеция 2282del4 в гене филаггрина в популяции жителей Новосибирска и у больных вульгарным ихтиозом Максимов В.Н., Куликов И.В., Семаев С.Е., Максимова Ю.В., Простякова Е.М., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Медицинская генетика, 2007, № 8, С. 21-23
2006
Полиморфизм гена аполипопротеина Е, желчно-каменная болезнь и панкреатит Григорьева И.Н., Никитенко Т.М., Романова Т.И., Осипенко М.Ф., Егошина М.А., Сединина Е.В., Венжина Ю.Ю., Шахтшнейдер Е.В., Куликов И.В., Максимов В.Н., Усов С.А., Мироненко Т.В., Данильчева Т.В., Иванова М.В., Потапова Т.А., Ромащенко А.Г. Малютина С. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 4, С. 80-88.
Численное исследование модели рецепции градиента концентрации морфогена Hedgehog В.В.Когай, К.В.Гунбин, Л.В.Омельянчук, С.И. Фадеев, Н.А.Колчанов Сибирский журнал индустриальной математики, 2006, 3(27), IX, 66-79
Этногенетические особенности подверженности атеросклерозу в этнических группах Сибири (на примере гена аполипопротеина Е) Воевода М.И., Степанов В.А., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 2, С. 63-72.
Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck GENOMICS, 2006, V. 88, № 6, P. 752-761.
Палеогенетические исследования носителей Пазырыкской культуры IV-II вв до н.э. Куликов И.В., Нефёдова М.В., Губина М.А., Шульгина Е.О., Дамба Л.Д., Молодин В.И., Чикишева Т.А., Воевода М.И. 1, Ромащенко А.Г. Всероссийский археологический съезд "Современные проблемы Археологии России, 2006, 264-266
The phylogeography of mtDNA variation in Altaian Kazakh populations Gokсumen O, Osipova LP, Zhadanov SI, Andreenkov O, Tabikhanova L, Gubina M, Schurr TG AM J PHYS ANTHROPOL, 2006, Suppl. 42:93
Signs of positive selection of somatic mutations in human cancers detected by EST sequence analysis Babenko VN, Basu MK, Kondrashov FA, Rogozin IB, Koonin EV. BMC CANCER, 2006, 6:36
Гаплотипический анализ гена HFE в популяции русских и среди пациентов с мультифакториальными заболеваниями Михайлова СВ, Онопченко О.В., Суханов А.В., Максимов В.Н., Гаскина Т.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т. 10, №3, С. 504-513.
Долгожительство – модель изучения процесса старения. Шабалин А.В., Воевода М.И., Черных Н.И., Пентегова В.А., Рагино Ю.И., Иванова М.В., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н., Шахтшнейдер Е.В. Бюллетень СО РАМН, 2006, № 4, С. 11-21
Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И., Богданова Ю.О, Морозова О.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т.10, №3. С.565-571
2005
Полиморфизм гена HFE у больных хроническим гепатитом С Кулагина Е.А., Михайлова С.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И., Курилович С.А. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии, 2005, №4, С.29-34
Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2005, Т.9, N2, май 2005, 232-261
Analysis of evolution of exon-intron structure of eukaryotic genes Rogozin IB, Sverdlov AV, Babenko VN, Koonin EV BRIEF BIOINFORM, 2005, 6(2):118-134
Conservation versus parallel gains in intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2005, 33(6):1741-1748
2004
Моделирование биологической эволюции: регуляторные генетические системы и кодирование сложности биологической организации Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин К.В. Информационный вестник ВОГИС, 2004, № 29. С.: 86-99.
Генетические механизмы кодирования биологической сложности Суслов В.В., Гунбин К.В., Колчанов Н.А. Экологическая генетика, 2004, Т. II. № 1. С. 13-26.
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть I. Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А. Сибирский экологический журнал, 2004, 11(5):599-610
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть II. Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А. Сибирский экологический журнал, 2004, 11(5):611-621
Reconstruction of ancestral protosplice sites Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2004, 4(16):1505-1508
Preferential loss and gain of introns in 3' portions of genes suggests a reverse-transcription mechanism of intron insertion Sverdlov AV, Babenko VN, Rogozin IB, Koonin EV GENE, 2004, 338(1):85-91
Prevalence of intron gain over intron loss in the evolution of paralogous gene families Babenko VN, Rogozin IB, Mekhedov SL, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2004, 32(12):3724-3733
Comparative analysis of complete genomes reveals gene loss, acquisition and acceleration of evolutionary rates in Metazoa, suggests a prevalence of evolution via gene acquisition and indicates that the evolutionary rates in animals tend to be conserved. Babenko VN, Krylov DM NUCLEIC ACIDS RES, 2004, 32(17):5029-5035
2003
Полиморфизм гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом, в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Хаснулин В.И., Воевода М.И. RUSS J GENET+, 2003, Т.39 № 7C. 988-995
Evidence of splice signal migration from exon to intron during intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2003, 13(24):2170-2174
Computational analysis of mutation spectra Rogozin IB, Babenko VN, Milanesi L, Pavlov YI BRIEF BIOINFORM, 2003, 4(3):210-227
2001
Распространение аллелей C282Y, H63D и S65C гена HFE и предрасположенности к нарушениям метаболизма железа в популяциях России Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Хаснулин, Воевода М.И Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии, 2001, Т.XI, №4, С.13-17
The contribution of exon-skipping events on chromosome 22 to protein coding diversity. Hide WA, Babenko VN, van Heusden PA, Seoighe C, Kelso JF GENOME RES, 2001, 1(11):1848-1853
2000
Хронические диффузные заболевания печени с синдромом перегрузки железом Кулагина Е.А., Михайлова С.В. Бюллетень СО РАМН, 2000, №2 (96), С. 74-77
1999
GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, 5, 44, 837-841
Recognition of NFATp/AP-1 composite elements within genes induced upon the activation of immune cells. Kel A, Kel-Margoulis O, Babenko V, Wingender E. J MOL BIOL, 1999, 288(3):353-376
Investigating extended regulatory regions of genomic DNA sequences Babenko VN, Kosarev PS, Vishnevsky OV, Levitsky VG, Basin VV, Frolov AS BIOINFORMATICS, 1999, 15(7-8):644-653
Use of a rank correlation coefficient for comparing mutational spectra Babenko VN, Rogozin IB BIOPHYSICS, 1999, 44(4):632-638
1998
Eukaryotic mRNAs encoding abundant and scarce proteins are statistically dissimilar in many structural features. Kochetov AV, Ischenko IV, Vorobiev DG, Kel AE, Babenko VN, Kisselev LL, Kolchanov NA. FEBS LETT, 1998, 440(3):351-355
A genetic algorithm for designing gene family-specific oligonucleotide sets used for hybridization: the G protein-coupled receptor protein superfamily Kel A, Ptitsyn A, Babenko V, Meier-Ewert S, Lehrach H. BIOINFORMATICS, 1998, 4(3):259-270
1995
Распределение транскриптов Bsp-повторов Canidae в почке песца: структурное сходство Bsp-повторов с SINEs Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Ромащенко А.Г., Беляева Т.А., Мелиди Н.Н., Лавриненко В.А., Гувакова Т.В., Иванова Л.Н. Доклады АН СССР, 1995, Т.343,№2, С.160-164
