Dynamic landscape of the local translation at activated synapses. Khlebodarova T.M., Kogai V.V., Trifonova E.A., Likhoshvai V.A. MOL PSYCHIATR, 2018, V. 23(1), P. 107-114
2017
Гены сельскохозяйственных растений, модифицированные с помощью системы CRISPR/Cas. Короткова А.М., Герасимова С.В., Шумный В.К., Хлесткина Е.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 21(2):250-258. DOI 10.18699/VJ17.244
Genome Editing System CRISPR/CAS9 and Peculiarities of Its Application in Monocots S. V. Gerasimova, E. K. Khlestkina, A. V. Kochetov, V. K. Shumny RUSS J PLANT PHYSL+, 2017, Vol. 64, No. 2, pp. 141–155.
СИСТЕМА CRISPR/CAS9 ДЛЯ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМОВ И ОСОБЕННОСТИ ЕЕ ПРИМЕНЕНИЯ НА ОДНОДОЛЬНЫХ РАСТЕНИЯХ С. В. Герасимова, Е. К. Хлесткина, А. В. Кочетов, В. К. Шумный Физиология растений, 2017, том 64, № 2, с. 92–108
Apoptosis as the Basic Mechanism of Cytotoxic Action of Ursolic and Pomolic Acids in Glioma Cells Frolova T.S., Lipeeva A.V., Baev D.S., Tsepilov Y. A., Sinitsyna O.I. Molecular Biology, 2017, Vol. 51, No. 5, pp. 705–711
Апоптоз как основной механизм цитотоксического действия урсоловой и помоловой кислот в клетках глиомы Фролова Т.С., Липеева А.В., Баев Д.С., Цепилов Я.С., Синицына О.И. Molecular Biology, 2017, том 51, №5, с 61-68
ОСОБЕННОСТИ ОКИСЛИТЕЛЬНО-ВОССТАНОВИТЕЛЬНЫХ, АМИЛАЗНОЙ И АТРАЗНОЙ АКТИВНОСТЕЙ IGG АНТИТЕЛ ИЗ КРОВИ БОЛЬНЫХ ШИЗОФРЕНИЕЙ Е. А. Ермаков, А. С. Толмачева, Л. П. Смирнова, С. А. Иванова, В. Н. Бунева, Г. А. Невинский Российский иммунологический журнал, 2017, том 11 (20), №4 с. 37-50
Molecular Mechanisms of Autism as a Form of Synaptic Dysfunction E. A. Trifonova, T. M. Khlebodarova, N. E. Gruntenko Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, Vol. 7, No. 8, pp. 869–877
Crop genes modified using the CRISPR/Cas system Korotkova A.M., Gerasimova S.V., Shumny V.K., Khlestkina E.K. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, 7(8): 822–832. 10.1134/S2079059717050124
2016
Анализ наследования запасных белков эндосперма линией сорта мягкой пшеницы Саратовская 29 от ее родительских форм. Л.В. Обухова, В.К. Шумный RUSS J GENET+, 2016, Том 52, №1, с.59-65
Наработка рекомбинантных белков в клетках растений С. В. Герасимова, О. Г. Смирнова, А. В. Кочетов, В. К. Шумный Физиология растений, 2016, том 63, № 1, с. 31–43
Antioxidant and antitumor activity of trolox, trolox succinate, and α-tocopheryl succinate conjugates with nitroxides. Zakharova OD, Frolova TS, Yushkova YV, Chernyak EI, Pokrovsky AG, Pokrovsky MA, Morozov SV, Sinitsina OI, Grigor'ev IA, Nevinsky GA. EUR J MED CHEM, 2016, T. 122, P. 127-137. doi: 10.1016/j.ejmech.2016.05.051.
ОЦЕНКА ГЕНОТОКСИЧНОСТИ МАЛЫХ ДОЗ ГАММА-ИЗЛУЧЕНИЯ С ПОМОЩЬЮ SOS-ХРОМОТЕСТА И ТЕСТА ЭЙМСА А. Я. Болсуновский, О. И. Синицына, Т. С. Фролова, Е. А. Васюнина, Д. В. Дементьев Doklady Akademii Nauk, 2016, том 469, № 5, с. 742–745
Genotoxicity Assessment of Low-Level Doses of Gamma Radiation with the SOS Chromotest and the Ames Test A. Ya. Bolsunovsky, O. I. Sinitsyna, T. S. Frolova, E. A. Vasyunina, D. V. Dementyev Doklady Biochemistry and Biophysics, 2016, Vol. 469, pp. 1–4.
Натурализация Fragaria x ananassa Duch. в Западной Сибири Батурин Сергей Олегович Сибирский экологический журнал, 2016, № 3, С. 449-458.
Формирование генофонда для получения сортов F1 ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Аполинарьева И.К. Плодоводство и ягодоводство России, 2016, М.: 2016. Т. XXXXIV. С. 98-102.
Генетические ресурсы селекции розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Хапова С.А. Плодоводство и ягодоводство России, 2016, М.: 2016. Т. XXXXIV. С. 102-106.
Assessment of translational importance of mammalian mRNA sequence features based on Ribo-Seq and mRNA-Seq data Oxana A. Volkova,Yury V. Kondrakhin†, Ivan S. Yevshin, Tagir F. Valeev,Ruslan N. Sharipov Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2016, April 2016, Vol. 14, No. 02, doi: 10.1142/S0219720016410067
Low doses of gamma-radiation induce SOS response and increase mutation frequency in Escherichia coli and Salmonella typhimurium cells Alexander Bolsunovsky, Tatiana Frolova, Dmitry Dementyev, Olga Sinitsyna ECOTOX ENVIRON SAFE, 2016, V. 134, P. 233-238
Ингибирование мутагенной активации орто-аминоазотолуола повышает его канцерогенность для печени мышей Каледин В. И., Овчинникова Л. П., Ильницкая С. И., Морозкова Т. С., Попова Н. А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, т.20 № 5. Стр. 708-715
Expression of extracellular ribonuclease gene increases resistance to Cucumber mosaic virus in tobacco Sugawara T., Trifonova E.A., Kochetov A.V., Kanayama Y. BMC PLANT BIOL, 2016, 16:246
Phosphonium betaines derived from hexafluoro-1,4-naphthoquinone:Synthesis and cytotoxic and antioxidant activites. Zhivetyeva S.I.,Zakharova O.D.,Ovchinnikova L.P.,Baev D.S.,Bagryanskaya I.Yu.,Shteingarts V.D.,Tolstikova T.G.,Nevinsky G.A.,Tretyakov E.V. J FLUORINE CHEM, 2016, v 192,P. 68-77
База данных генов, повышающих устойчивость пшеницы и родственных ей злаков к патогенным грибам Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, Т. 20. № 6. С. 904-908.
Plant Cell Wall and Mechanisms of Resistance to Pathogens Smirnova O.G., Kochetov A.V. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2016, Vol. 6, No. 5, pp. 622–631
Production of recombinant proteins in plant cells Gerasimova S.V., Smirnova O.G., Kochetov A.V., Shumny V.K. RUSS J PLANT PHYSL+, 2016, 63(1): 26-37
The interitance of ednosperm storage proteins by the line of the Saratovcksaya 29 cultivar of common wheat from its parental forms L.V. Obukhova, V.K. Shumny RUSS J GENET+, 2016, 2016 V 52 №1 pp 49-55
СОЗДАНИЕ ГЕНОФОНДА СТРЕССОВОУСТОЙЧИВЫХ ГИБРИДОВ ДЛЯ СЕЛЕКЦИИ КРУПНОПЛОДНОЙ ЗЕМЛЯНИКИ (FRAGARIA Х ANANASSA DUCH.) В ЗАПАДНОЙ СИБИРИ Кузьмина А.А., Батурин С.О. В книге: Генофонд и селекция растений Тезисы докладов II Международной конференции, посвященной 80-летию СИБНИИРС., 2016, 2016. С. 35.
Оценка трансляционной значимости характеристик нуклеотидной последовательности мРНК млекопитающих на основе данных рибосомного профилирования O.A.Волкова, Ю.В. Кондрахин, Р.Н.Шарипов Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):779-786 DOI 10.18699/VJ16.195
2015
IgG abzymes with peroxidase and oxidoreductase activities from the sera of healthy humans Tolmacheva AS, Blinova EA, Ermakov EA, Buneva VN, Vasilenko Nl, Nevinsky GA J MOL RECOGNIT, 2015, 28(9):565-80. doi: 10.1002/jmr.2474
Генетический контроль ремонтантности в популяциях Fragaria vesca L. (Rosaceae) в Западной Сибири Батурин С.О. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, № 1. Т. 19. С. 69-73.
Вирус-индуцируемый сайленсинг как метод изучения функций генов высших растений Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2015, 51 558-567
Трансгенная экспрессия нативной и мутантной нуклеазы Serratia marcescens модулирует устойчивость табака Nicotiana tabacum L. к вирусу табачной мозаики Трифонова Е. А., Савельева А. В., Романова А. В., Филипенко Е. А., Сапоцкий М. В., Малиновский В. И., Кочетов А. В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2015, 51 835-840
Роль клеточной стенки растений в защитном ответе Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2015, т.19, №6, c.715-723
CONJUGATES OF TROLOX AND a-TOCOPHERYL SUCCINATE WITH NITROXIDES: SYNTHESSIS, ANTIOXIDANT AND ANTITUMOR ACTIVITY TAT’YANA S. FROLOVA, OL’GA D. ZAKHAROVA, YULIYA F. POLIENKO, YULIYA V. YUSHKOVA, ELENA I.CHERNYAK, SERGEI V.MOROZOV, OL’GA I. SINITSINA, IGOR A. GRIGOR’EV & GEORGY A. NEVINSKY International Journal of Medicine and Pharmaceutical Sciences, 2015, Vol. 5, Issue 3, Jun 2015, 9-24
Genotoxic and Mutagenic Properties of Synthetic Betulinic Acid and Betulonic Acid T. S. Frolovaa, T. P. Kukina, O. I. Sinitsyna RUSS J BIOORG CHEM+, 2015, Vol. 41, No. 4, pp. 409–413
МУТАГЕННАЯ АКТИВНОCТЬ В ТЕCТЕ ЭЙМCА ЧЕТЫPЕX АМИНОАЗОCОЕДИНЕНИЙ C PАЗЛИЧНОЙ КАНЦЕPОГЕННОCТЬЮ ДЛЯ ПЕЧЕНИ КPЫC Т.C. Фpолова, О.И. Cиницына, В.И. Каледин BIOPHYSICS, 2015, том 60, вып. 5, c. 990–994
Promoters of Plant Genes Responsive to Pathogen Invasion. Smirnova O.G., Kochetov A.V. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, 2015, Vol. 5, No. 3, pp. 254–261.
ANTIOXIDANT ACTIVITY AND CYTOTOXICITY OF POLYFLUORINATED 1,4- NAPHHOQUINONES WITH ALKYLATING FUNCTIONS IN THE QUINONE MOIETY OL'GA D.ZARHAROVA,LUDMILA P.OVCHINNIKOVA,LEONID I.GORYUNOV,NADEZHDA M.TROSHKOVA,VITALIJ D.SHTENGARTS &GEORGY A.NEVINSKY International Journal of Medicine and Pharmaceutical Sciences, 2015, Vol.5,Issue 1, 11-20
Влияние загрязнения атмосферного воздуха взвешенными веществами на сердечно-сосудистую систему. А.Ф. Колпакова, Р.Н. Шарипов, О.А. Волкова Сибирский медицинский журнал, 2015, Сибирский медицинский журнал
Disruption of Transcriptional Coactivator Sub1 Leads to Genome-Wide Re-distribution of Clustered Mutations Induced by APOBEC in Active Yeast Gene Lada AG, Kliver SF, Dhar A, Polev DE, Masharsky AE, Rogozin IB, Pavlov YI. PLOS GENET, 2015, PLoS Genet. 2015 May 5;11(5):e1005217. doi: 10.1371/journal.pgen.1005217. eCollection 2015.
An effective two-step synthesis, fluorescent properties, antioxidant activity and cytotoxicity evaluation of benzene-fluorinated 2,2-dimethyl-2,3-dihydro-1H-quinolin-4-ones Larisa V. Politanskaya, , Igor P. Chuikov, Evgeny V. Tretyakov, Vitalij D. Shteingarts, Ludmila P. Ovchinnikova, Olga D. Zakharova, Georgy A. Nevinsky J FLUORINE CHEM, 2015, , V. 178, October 2015, P. 142–153. http://dx.doi.org/10.1016/j.jfluchem.2015.07.006
2014
Перспективы получения однородного семенного потомства у ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Кузьмина А.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, № 4/1. Т. 18. С. 812-817.
Isolation of Pomolic Acid from Chamaenerion angustifolium and the Evaluation of Its Potential Genotoxicity in Bacterial Test Systems T. S. Frolovaa, O. I. Sal’nikova, T. A. Dudareva, T. P. Kukina, and O. I. Sinitsyna RUSS J BIOORG CHEM+, 2014, Vol. 40, No. 1, pp. 82–88.
Mutagen activation and carcinogenicity of aminoazodyes of ortho-aminoazotoluene and 3'-methyl- 4-dimethylaminoazobenzene in experiments on suckling mice Kaledin V.I., Il'nitskaya S.I., Ovchinnikova L.P., Popova N.A., Bogdanova L.A., Morozkova T.S. BIOPHYSICS, 2014, volume 59, issue 3, pages 527-532
Мутагенная активация и канцерогенность аминоазокрасителей орто-аминоазотолуола и 3'-метил - 4-диметилазобензола в опытах на подсосных мышатах В.И. Каледин, С.И.Ильницкая, Л.П.Овчинникова, Н.А.Попова, Л.А.Богданова, Т.С.Морозкова BIOPHYSICS, 2014, том.59, вып.3, стр.527-532
Генетический контроль строения корневой системы и её связь со скоростью развития растения у мягкой пшеницы (Triticum aestivum L). Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В., Щукина Л.В., Смирнова О.Г., Бёрнер А. Материалы VI съезда ВОГиС, Ростов-на-Дону, 15-20 июня 2014г., 2014, C. 146-147
Промоторы генов, регулирующих ответ на патогены у растений. Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, 18. №4. 765 – 775
Энхансеры трансляции для генной инженерии растений. Кочетов А.В., Филипенко Е.А., Смирнова О.Г., Шумный В.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, 18. №4. 610 - 617.
Synthesis and cytotoxicity evalution of polyfluorinated 1,4- naphthoquinones containing amino acid substituents N.M.Troshkova,L.I.Gorynov,V.D.Shteingarts,O.D.Zakharova,L.P.Ovchinnirova,G.A.Nevinsky J FLUORINE CHEM, 2014
Корреляционный анализ зависимости силы муки от запасных белков пшеницы Обухова Людмила Васильевна, Будашкина Екатерина Борисовна Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Т. 18. N. 4/1, стр. 807 - 811
RiboSeqDB – a repository of selected human and mouse ribosome footprint and RNA-seq data Sharipov R.N., Yevshin I.S., Kondrakhin Y.V., Volkova O.A. Virtual Biology, 2014, Virtual Biology, 2, 37-46,ISSN: 2306-8140, http://virtual-biology.org/vb/article/view/18
2013
SYNTHESIS AND STUDY OF MUTAGENIC PROPERTIES OF LUPANE TRITERPENOIDS CONTAINING 1,2,3-TRIAZOLE FRAGMENTS IN THE C-30 POSITION A. N. Antimonova, N. I. Petrenko, M. M. Shakirov, T. V. Rybalova, T. S. Frolova, E. E. Shults, T. P. Kukina, O. I. Sinitsyna, and G. A. Tolstikov CHEM NAT COMPD+, 2013, Vol. 49, No. 4, September, 2013
Hidden coding potential of eukaryotic genomes: non-AUG started ORFs Kochetov A.V., Prayaga P.D., Volkova O.A., Sankararamakrishnan R. Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2013, 31(1):103-114
Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Sommer B., Kormeier B., Demenkov P., Arrigo P., Hippe K., Ates O., Kochetov A.V., Ivanisenko V., Kolchanov N.A., Hofestaedt R. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, 11. 1. 1340005.
Влияние полового созревания на экспрессию гена DD2R в жировом теле самок Drosophila Андреенкова (Лаухина) Ольга Владимировна, Филипенко Елена Анатольевна, Раушенбах Инга Юрьевна RUSS J GENET+, 2013, Т.49, № 9, С.1124-1126
Соматические мутации в гене цитохрома b митохондриальной ДНК гиппокампа крыс линии Wistar Лощенова П.С., Рогозин И. Б., Роцкая У.Н., Малярчук Б.А., Невинский Г.А., Синицына О. И. Экологическая генетика, 2013, Том ХI, №2
ХАРАКТЕРИСТИКА ПУРОИНДОЛИНОВ В КОНТРОЛЕ ТЕКСТУРЫ ЭНДОСПЕРМА У ЛИНИЙ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ С ЗАМЕЩЕНИЕМ ХРОМОСОМ 5Й ГОМЕОЛОГИЧЕСКОЙ ГРУППЫ Л. В. Обухова, Т. Т. Ефремова, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2013, том 49, № 3, с. 337–342
Компьютерный анализ данных экспрессии генов в клетках мозга, полученных с помощью микрочипов и высокопроизводительного секвенирования Медведева И.В., Вишневский О.В., Сафронова Н.С., Кожевникова О.С., Генаев М.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Орлов Ю.Л. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, ТОМ 17, № 3, С.202-211
Фенологические наблюдения в семенных потомствах ремонтантной крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Аполинарьева И.К., Батурин С.О., Петрук В.А. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2013, № 3. - С.59-65
PR-белки с рибонуклеазной активностью и устойчивость растений к патогенным грибам. 175. Филипенко Е.А., Кочетов А.В., Kanayama Y., Малиновский В.И., Шумный В.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, 17. 326-334.
Роль ауто- и гетерологичных рибонуклеаз семейства III в механизмах устойчивости к патогенам и регуляции экспрессии генов высших растений. Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, 17. 558-567.
Аналіз запасних білків кукурудзи, трансформованої in planta з використанням обеззброєнних штамів Agrobacterium tumefaciens. Матвєєва О.Ю., Сірант Л.В., Курчій В.М., Моргун Б.В., Тищенко О.М., Кочетов О.В. Физиология растений и генетика, 2013, Т.45, № 4. –С. 358-364.
Анализ эффективности использования двухцепочечного рнк-супрессора гена пролиндегидрогеназы для повышения уровня устойчивости подсолнечника (Helianthus annuus L.) К водному дефициту и засолению. Комисаренко А.Г., Михальская С.И., Сергеева Л.Е., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н. Известия Самарского научного центра РАН, 2013, Т. 15. № 3-5. С. 1629-1632.
Исследование содержания свободного пролина в растениях кукурузы, трансформированных in planta с использованием LBA4404, несущего pBI2E с двухцепочечным РНК-супрессором гена пролиндегидрогеназы. Михальская С.И., Матвеева А.Ю., Сергеева Л.Е., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н. Известия Самарского научного центра РАН, 2013, Т. 15. № 3-5. С. 1662-1665.
2012
A Model of the Gene Network for Flowering Time Regulation in Winter Wheat and Barley. Smirnova O.G , Stepanenko I.L., Titov I.I. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, 2012, Vol. 2, No. 4, pp. 319–324
Wheat Promoter Sequences for Transgene Expression. Smirnova O.G., Kochetov A.V. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, 2012, Vol. 2, No. 6, pp. 434–439.
Mechanism of Action and Activity Regulation of COP1, a Constitutive Repressor of Photomorphogenesis. Smirnova O.G , Stepanenko I.L., Shumny V.K. RUSS J PLANT PHYSL+, 2012, 2012, Vol. 59, No. 2, pp. 155–166.
Simple database to select promoters for plant transgenesis. Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В. TRANSGENIC RES, 2012, 21. 429-437
Механизм действия и регуляция активности конститутивного репрессора фотоморфогенеза COP1. Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Шумный В.К. Физиология растений, 2012, том 59, № 2, с. 1–13
Частичная супрессия гена пролиндегидрогеназы увеличивает устойчивость растений к различным видам абиотических стрессов. С.С. Ибрагимова, Я.С. Колодяжная, С.В. Герасимова, А.В. Кочетов Физиология растений, 2012, т.59, №1, 99-107
Inducible expression of the gene of Zinnia elegans coding for extracellular ribonuclease in the SR1 Nicotiana tabacum plants Trifonova E.A., Romanova A.V., Sangaev S.S., Sapotsky M.V., Malinovsky V.I., Kochetov A.V. BIOL PLANTARUM, 2012, 56. 571-574
Промоторы пшеницы для экспрессии трансгенов Смирнова О.Г., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 16. 1. 224-231.
Research progress on the medicinal and nutritional properties of sea buckthorn (Hippophae rhamnoides) Kanayama Y., Kato K., Stobdan T., Galitsyn G.G., Kochetov A.V., Kanahama K. J HORTIC SCI BIOTECH, 2012, 87. 203-210
Extensive translatome remodeling during ER stress response in mammalian cells Ventoso I., Kochetov A., Montaner D., Dopazo J., Santoyo J. PloS One, 2012, 7: e35915
Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA. ANN BOT-LONDON, 2012, 110 (2): 349-360.
Модель генной сети регуляции времени цветения у озимой пшеницы и ячменя. Степаненко И.Л., Смирнова О.Г., Титов И.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т. 16, № 1, С. 99-108
Развитие и прорастание семянок у ремонтантных сортов крупноплодной земляники (Fragaria × ananassa Duch.) Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Кузнецова Л.Л. Сельскохозяйственная биология, 2012, №3
TGP – база данных промоторов для трансгенеза растений Смирнова О.Г., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Кочетов А.В. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2012, Т.7. №2. С.444-460.
Усиление общетоксического и ослабление гепатоканцерогенного действия диэтилнитрозамина при введении его в смеси с изопропанолом Каледин В.И., Багинская Н.В., Васюнина Е.А., Ильницкая С.И., Овчинникова Л.П. Вопросы онкологии, 2012, том 56, н.5, стр.658-662
Possible link between the synthesis of GR alpha isoforms and eIF2 alpha phosphorylation state. Kochetov AV, Merkulova TI, Merkulov VM MED HYPOTHESES, 2012, V 79. P. 709-712
Мутагенная активация снижает канцерогенность орто-аминоазотолуола для печени мышей Овчинникова Л.П., Богданова Л.А., Каледин В.И. B EXP BIOL MED+, 2012, № 11, Т. 154, стр.623-628
Информационная поддержка экспериментов по трансгенезу растений в базе данных трансляционных энхансеров. Смирнова О.Г., Рассказов Д.А., Кочетов А.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т.16. №4/1. С. 766-773.
Информационный портал "Биотехнология растений" - Интернет ресурс для поддержки экспериментов в области генной инженерии растений, генетики и селекции пшеницы. Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т.16. №4/1. С. 838-848.
Breeding of pink-flowering ornamental strawberries in Siberia Kuznetsova L.L., Zielke R.A., Grout B.W.W., Baturin S.O. Acta Hort. (ISHS), 2012, 937. - 2012. – Р. 469-472
2011
Alternative translation start sites are conserved in eukaryotic genomes Bazykin G.A., Kochetov A.V. NUCLEIC ACIDS RES, 2011, 39. 567-577.
Tandem termination signal in plant mRNA Kochetov A.V., Volkova O.A., Poliakov A., Dubchak I., Rogozin I.B. GENE, 2011, 481. 1-6.
Супероксидисмутазная, каталазная, пероксидазная и Н2О2-независимая оксидоредуктазная активности антител из крови здоровых крыс WISTAR. Щеглова Т.В., Толмачева А.С., Овчинникова Л.П., Синицина О.И., Василенко Н.Л., Бунева В.Н., Невинский Г.А. Российский иммунологический журнал, 2011, том 5(14), № 1, с. 11–20
The Role of the COP1, SPA, and PIF Proteins in Plant Photomorphogenesis O. G. Smirnova, I. L. Stepanenko, V. K. Shumnyia Biology Bulletin Reviews, 2011, Vol. 1, No. 4, pp. 314–324
Изменчивость в агамоспермном потомстве крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) по фертильности пыльцы Батурин С.О., Амброс Е.В. Научные ведомости БелГУ. Серия: Естественные науки, 2011, №9 (104), Вып. 15/1. – С. 204-209.
Функции дельта-аминотрансферазы у растений Герасимова С.В., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2011, т.131, № 6, 531-542
Production of recombinan HIV-1 GAG polyprotein fused to yellow Fluorescent Protein (EYFP) in Leishmania tarentolae 156. Razumova Ju.V., Cheresiz S.V., Kochetov A.V., Beklemishev A.B. Вестник уральской медицинской академической науки, 2011, 4/1 202
Репродуктивные особенности и перспективы использования розовоцветкового декоративного гибрида Fragaria x Potentilla (сорт Frel) в селекции крупноплодной земляники Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Т. 15, № 4, С. 800-807.
Cytotoxicity of new polifluorinated 1,4 - naphtoquinones with diverse substituents in the quinine moiety. Olga d Zakharova,Ludmila P.Ovchinnikova,Leonid I.Goryunov,Nadezhda M.Troshkova,Vitaliiy D.Shtengarts,Georgy A.Nevinsky Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2011, 19,pp.256-260
Интродукция розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria × ananassa Duch.) в Западной Сибири Кузнецова Л.Л., Батурин С.О. Научные ведомости БелГУ. Серия: Естественные науки, 2011, т. 104, № 9 вып. 15/2, C. 54-59
Роль белков COP1, SPA и PIF в регуляции фотоморфогенеза растений Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2011, Т.311, 1. С.3-15
Активность сахаросинтетазы и инвертазы эндосперма кукурузы (Zea mays L.), инфицированной in planta обезоруженными штаммами Agrobacterium tumefaciens Матвеева А.Ю., Сакало В.Д., Курчий В.М., Моргун Б.В., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н. Вісник Українського товариства генетиків та селекціонерів, 2011, 9. 1. 55-64
2010
Особенности прорастания семянок агамоспермных потомков Fragaria x ananassa Duch. при различных способах семенной репродукции Батурин С.О., Амброс Е.В. Сельскохозяйственная биология, 2010, № 5. С. 87-91.
Оценка всхожести семян и сортовой однородности семенного потомства ремонтантных коммерческих сортов крупноплодной земляники Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Петрук В.А. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2010, № 1. С. 40-45.
Перспективы использования сеянцев агамоспермного происхождения в селекции крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) Амброс Е.В., Батурин С.О. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2010, № 9. С.36-42.
Роль различных метаболитов в формировании стрессоустойчивости растений Ибрагимова С.С., В.В. Горелова, А.В. Кочетов, В.К. Шумный Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2010, т.8, вып.3, с.98-103
Роль экстраклеточных рибонуклеаз в физиологических процессах высших растений Сангаев С.С., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Левенко Б.А., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, №2, т.14, с.232-242
Состояние и перспективы селекции розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria x ananassa Duch.) в Западной Сибири Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. Информационный вестник ВОГИС, 2010, № 1, Т. 14, С. 165-171.
Cytotoxicity of new n-butylamino and sulfur-containing derivatives of polyfluorinated 1,4-naphthoquinone Olga A.Zakharova,Leonid I.Goryunov,Nadezhda M.Troshkova,Ludmila P.Ovchinnikova,Vitaliy D.Shteeingarts,Georgy A.Nevinsky EUR J MED CHEM, 2010, 45,270-274
Трансгенные растения Nicotiana tabacum как генетическая модель для изучения роли нуклеаз в противовирусном иммунитете растений Савельева А. В., Трифонова Е. А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Т. 275. С. 309-311
Evaluation of Cytotoxity and Efficiency of Antioxidant Protection of Hidrophilic Derivatives of 2,4,6-Trialkylphenols in E coli Cellscherichia U.N.Rotskaya, L.P.Ovchinnikova, E.A.Vasunina, O.I.Sinitsina, N.V.Kandalintseva, E.A.Prosenko, G.A.Nevinsky. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2010, 4, 4, 377-382
High frequency of somatic mutations in rat liver mitochondrial DNA Rotskaya U.N, Rogozin IB, Vasyunina EA, Malyarchuk BA, Nevinsky GA, Sinitsyna OI. MUTAT RES-FUND MOL M, 2010, 685(1-2):97-102
Interrelations between the nucleotide context of human start AUG codon, N-end amino acids of the encoded protein and initiation of translation Volkova O.A. Kochetov A.V. Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2010, 27(5) 611-618
On nucleotide solvent accessibility in RNA structure Singh H., Andrabi M., Kahali B., Ghosh T.C., Miziguchi K., Kochetov A.V., Ahmad S. GENE, 2010, 463, 41-48
Sensibility to phytorhabdoviruses of transgenic tobacco plants Spivak N.Ya., Kochetov A.V., Lozova O.I., Levenko B.A., Yuzvenko L.V., Nikolaychuk M.V., Levchuk O.B., Didenko L.F., Trifonova E.A., Sangaev S.S. Scientific Bulletin of the Uzhgorod University (Series Biology), 2010, Vol. 27. P. 37-39
Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R J INTEGR BIOINFORM, 2010, 7(1):148. doi: 10.2390/biecoll-jib-2010-148
Анализ запасных белков (проламинов, пуроиндолинов и Waxy) у линий мягкой пшеницы Triticum aestivum L. x (Triticum timopheevii Zhuk. x Triticum tauschii) с комплексной устойчивостью к грибным инфекциям Обухова Л.В., Лайкова Л.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2010, №6, Т. 46, стр. 764-768
Состояние и перспективы селекции розовоцветковой крупноплодной земляники (Fragaria × ananassa Duch.) в Западной Сибири Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т.14., № 1
Некоторые достижения в решении проблем семенной репродукции ремонтантных сортов крупноплодной земляники Батурин С.О., Аполинарьева И.К., Кузнецова Л.Л. Материалы Международной научно-методической дистанционной конференции «Актуальные проблемы размножения ягодных культур и пути их решения», 2010
Матроклинное наследование при скрещиваниях Fragaria x Potentilla Батурин С.О., Амброс Е.В., Кузнецова Л.Л. Фактори експериментальноiй еволюцiп органiзмiв, 2010, т8, 303-306
Генетический контроль формирования окраски корнеплода у кормовой свеклы Мглинец А. В., Осипова З. А. Информационный вестник ВОГИС, 2010, № 4, Т. 14, С. 720-728.
Зависимость цитотоксичности и антиокислительной активности аммониевых производных алкилфенолов от особенностей их структуры Роцкая У.Н., Овчинникова Л.П., Васюнина Е.А., Синицына О.И.,Дюбченко О.И., Кандалинцева Н.В., Просенко А.Е., Невинский Г.А. RUSS J BIOORG CHEM+, 2010, №4,36,563-569
Инактивация гена Nk1 в растениях табака Nicotiana tabacum SR1 за счет РНК-интерференции Сангаев С.С., Трифонова Е.А., Титов С.Е., Романова А.В., Колодяжная Я.С., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В. RUSS J GENET+, 2010, Т.46. №1. С. 131-134
Индукция регенерации in vitro при Agrobacterium-опосредованной трансформации инбредных линий подсолнечника Комисаренко А.Г., Михальская С.И., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н. Биотехнология, 2010, 3, 67 - 74
2009
Исследование запасных белков у интрогрессивных линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L. х Triticum timopheevi Zhuk.), устойчивых к листовой ржавчине Л. В. Обухова, Е. Б. Будашкина, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2009, т.45, №3, с. 313-321
Особенности прорастания семян Fragaria vesca L. из нетипичных экотопов в Западной Сибири Батурин С.О. Сибирский экологический журнал, 2009, № 6. С.863-868.
Поиск высокомолекулярных субъединиц глютенина Triticum timopheevi Zhuk. у линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L. x Triticum timopheevi Zhuk.) Л. В. Обухова, Е. Б. Будашкина, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2009, № 9. Т.45. С. 1292-1295
Проявление агамоспермии при аутбридинге у Fragaria vesca L Батурин С.О. RUSS J GENET+, 2009, № 3, Т. 45, С. 369-374.
Dark and light green tissues of tobacco leaves systemically infected with tobacco mosaic virus Burundukova O.L., Sapotsky M.V., Kochetov A.V., Trifonova E.A., Malinovsky V.I. BIOL PLANTARUM, 2009, V. 52. P. 294-300
PMAP: databases for analyzing proteolytic events and pathways Igarashi Y., Heureux E., Doctor K.S., Talwar P., Gramatikova S., Gramatikoff K, Zhang NUCLEIC ACIDS RES, 2009, 37 (Database issue):D611-618
Анализ спектров соматических мутаций митохондриальной ДНК крыс линий OXYS и WISTAR Роцкая У. Н., Рогозин И. Б., Васюнина Е. А., Колосова Н.Г., Невинский Г. А., Синицына О. И. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, том 74, вып. 4, с. 532-541
Иммуноглобулины класса G из крови здоровых крыс Wistar окисляют амины А.С. Толмачева, Н.Л. Василенко, Н.П. Заксас, О.И. Синицина, В.Н. Бунева, Г.А. Невинский Российский иммунологический журнал, 2009, 1, 3(12), 39-49
Oxidoreductase activities of polyclonal IgGs from the sera of Wistar rats are better activated by combinations of different metal ions Anna S.Tolmacheva, Nataliya P. Zaksas, Valentina N. Buneva, Nataliya L. Vasilenko, Georgy A. Nevinsky J. molecular recognit, 2009, 22(1):26-37. doi: 10.1002/jmr.923.
2008
Качество зерна и муки интрогрессированных линий мягкой пшеницы с генами устойчивости к листовой ржавчине от Triticum timofeevi Л.В. Обухова Е.Б. Будашкина М.Ф. Ермакова Н.П. Калинина В.К. Шумный Сельскохозяйственная биология, 2008, №5, с. 38-42
Молекулярные основы закона рядов гомологической изменчивости Н.И.Вавилова Рогозин И.Б., Глазко В.И., Кунин Е.В. Информационный вестник ВОГИС, 2008, т.12, N 3, 362-371
A Dual Origin of the Xist Gene from a Protein-Coding Gene and a Set of Transposable Elements E.A. Elisaphenko, N.N. Kolesnikov, A.I. Shevchenko, I.B. Rogozin, T.B. Nesterova, N. Brockdorff, S.M. Zakian PloS One, 2008, Jun 25;3(6):e2521
Identification of murine B cell lines that undergo somatic hypermutation focused to A:T and G:C residues Bhattacharya P., Grigera F., Rogozin I.B., McCarty T., Morse H.C. III, Kenter A.L. EUR J IMMUNOL, 2008, V. 38, N 1, 227-239
Alternative translation and hidden coding potential of eukaryotic mRNAs Kochetov A.V. BIOESSAYS, 2008, 30, 683-691
uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs Kochetov A.V., Ahmad S., Ivanisenko V., Volkova O.A., Kolchanov N.A., Sarai A. FEBS LETT, 2008, 582. 1293-1297
Анализ серий семян сахарной свеклы при апозиготоической репродукции Малецкий С.С., Малецкая Е.И., Юданова С.С., Колодяжная Я.С. RUSS J GENET+, 2008, том 74, вып. 4, с. 532-541
Высокомолекулярные субъединицы глютенина у образцов пшениц - доноров иммунитета к грибным инфекциям Л.В.Обухова Информационный вестник ВОГИС, 2008, №4, т.12, с.734-738
Высокоэффективная экспрессия В-субъединицы термолабильного энтеротоксина Escherichia coli в растениях с помощью вируса-вектора на основе генома X-вируса картофеля Равин Н.В., Куприянов В.В., Замчук Л.А., Кочетов А.В., Дорохов Ю.Л., Атабеков И.Г., Скрябин К.Г. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2008, 73, 1382-1389
Изучение структуры популяций амаранта (Amaranthus L.) по изоферментным локусам Р. С. Юдина, С. С. Ибрагимова, Н. Б. Железнова Информационный вестник ВОГИС, 2008, № 3, Т. 12, С. 385-391
2007
Молекулярные механизмы системной устойчивости растений к вирусным инфекциям и способы повышения вирусоустойчивости путем трансгенеза Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2007, Т.127. С.13-24
Наследование мутации ps у сахарной свеклы Мглинец А. В., Осипова З. А RUSS J GENET+, 2007, № 5, Т.V. 43, С. 647-652.
Completion of the mapping of transcription start sites for the five-gene block subgenomic RNAs of beet yellows closterovirus and identification of putative subgenomic promoters Vitushkina M.V., Rogozin I.B., Jelkmann W., Koonin E.V., Agranovsky A.A. VIRUS RES, 2007, V. 128, N 1-2, 153-158
Evolution and diversification of lamprey antigen receptors: evidence for involvement of an AID-APOBEC family cytosine deaminase Rogozin IB, Iyer LM, Liang L, Glazko GV, Liston VG, Pavlov YI, Aravind L, Pancer Z. NAT IMMUNOL, 2007, V. 8, N 6, 647-656.
Protection of transgenic tobacco plants expressing bovine pancreatic ribonuclease against tobacco mosaic virus Trifonova E. A., Sapotsky M.V., Komarova M. L., Scherban A.B., Shumny V.K., Polyakova A.M., Lapshina L.A., Kochetov A.V., Malinovsky V.I. PLANT CELL REP, 2007, V.26, P.1121-1126
Наследование розовой окраски венчика у полиплоидов земляники (Fragaria L.) Батурин С.О., Кузнецова Л.Л. Досягнення i проблеми генетики, селекцiп та бпотехнологiп, 2007
AUG_hairpin: prediction of a downstream secondary structure influencing the recognition of a translation start site Kochetov A.V., Palyanov A., Titov I.I., Grigorovich D., Sarai A., Kolchanov N.A. BMC BIOINFORMATICS, 2007, 8(1):318
Воплощение классических механизмов мутагенеза у про- и эукариот в гипермутагенезе и иммунном ответе у позвоночных Лада А.Г., Иер Л.М., Рогозин И.Б., Аравинд Л., Павлов Ю.И. RUSS J GENET+, 2007, V. 43, N 10, 1311-1327
Индукция диплоидного партеногенеза у Fragaria vesca L Батурин С.О. Сибирский экологический журнал, 2007, № 6. С. 987-991
2006
ИЦиГ СО РАН и международные программы по генетике пшеницы Пшеничникова Т.А., Смирнова О.Г. Информационный вестник ВОГИС, 2006, №1, т. 10, 203-206
Потенциальные открытые рамки считывания в 5”-нетранслируемых районах эукариотических мРНК Волкова О. А., Кочетов А. В., Титов С. Е., Колчанов Н. А. BIOPHYSICS, 2006, 51(4), 615-21
Трансгенез как способ увеличения устойчивости растений к повышенным концентрациям тяжелых металлов Колодяжная Я.С., Кочетов А.В., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2006, Т. 126, № 5, С. 456–461
Use of Transgenic Carrot Plants Producing Human Interleukin-18 for Modulation of Mous Immune Reactions Якушенко У.В., Храпов Ю.А., Дейнеко Е.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Шумный В.К., Сенников Ы.В., Козлов В.А. In Book: New research on Biotechnology and Medicine. Eds.: Egorov A.M., Zaikov G.E. Nova Science Publishers, 2006, P.97-107
Roles of DNA polymerases in replication, repair, and recombination in eukaryotes Pavlov YI, Shcherbakova PV, Rogozin IB INT REV CYTOL, 2006, vol. 255, pp. 41-132
Альтернативные сайты инициации трансляции и их вклад в протеом эукариотических клеток Кочетов А.В. Molecular Biology, 2006, 40. 788-795
Signs of positive selection of somatic mutations in human cancers detected by EST sequence analysis Babenko VN, Basu MK, Kondrashov FA, Rogozin IB, Koonin EV. BMC CANCER, 2006, 6:36
Взаимосвязь контекстной организации сигнала инициации трансляции и аминокислотной последовательности на N-конце белков эукариот Волкова О.А., Титов С.Е., Кочетов А.В. BIOPHYSICS, 2006, 51(7)
Генетический контроль признака "красная пигментация листа" у сахарной свеклы Мглинец А. В., Осипова З. А. Информационный вестник ВОГИС, 2006, № 3, Т.10, С. 588-593
Генетическое изучение новой окраски у свеклы Beta vulgaris L. Мглинец А.В., Осипова З.А. RUSS J GENET+, 2006, №7. Т. 42. С. 936-938
2005
Analysis of evolution of exon-intron structure of eukaryotic genes Rogozin IB, Sverdlov AV, Babenko VN, Koonin EV BRIEF BIOINFORM, 2005, 6(2):118-134
Conservation versus parallel gains in intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2005, 33(6):1741-1748
2004
Идентификация апомиксиса у Роа pratensis L. при помощи SDS-электрофореза запасных белков эндосперма Агафонов А.В., Сухарева Н.Б., Батурин С.О., Стружкина О.А. BIOL BULL+(RUS), 2004, № 1, 2004. С. 42-48.
Reconstruction of ancestral protosplice sites Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2004, 4(16):1505-1508
Preferential loss and gain of introns in 3' portions of genes suggests a reverse-transcription mechanism of intron insertion Sverdlov AV, Babenko VN, Rogozin IB, Koonin EV GENE, 2004, 338(1):85-91
Prevalence of intron gain over intron loss in the evolution of paralogous gene families Babenko VN, Rogozin IB, Mekhedov SL, Koonin EV NUCLEIC ACIDS RES, 2004, 32(12):3724-3733
2003
Evidence of splice signal migration from exon to intron during intron evolution Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV CURR BIOL, 2003, 13(24):2170-2174
Computational analysis of mutation spectra Rogozin IB, Babenko VN, Milanesi L, Pavlov YI BRIEF BIOINFORM, 2003, 4(3):210-227
Application of filter technology in photomorphogenesis gene network Smirnova O.G., Stepanenko I.L. In Silico Biology, 2003, N.1-2. P. 117-125
2002
Iduction of apomixis in Fragaria x vescana Sukhareva N.B., Baturin S.O., Trajkovski K. Acta Hort. (ISHS), 2002, V. 567. P. 231-234.
2001
SDS-электрофорез белков эндосперма индивидуальных семян Poa pratensis L. (Poaceae) в эколого-генетических исследованиях Агафонов А.В., Стружкина О.А., Батурин С.О. Сибирский экологический журнал, 2001, № 6. 2001. С. 723-728.
Сравнительно-морфологический анализ апомиктического потомства крупноплодной земляники Батурин С.О. Сельскохозяйственная биология, 2001, № 1. 2001. С. 39-43.
1999
The experimental apomixis in garden strawberry (Fragaria x ananassa Duch.) Baturin S.O., Sukhareva N.B. Apomixis newsletters, 1999, N 11. P. 15-17.
Use of a rank correlation coefficient for comparing mutational spectra Babenko VN, Rogozin IB BIOPHYSICS, 1999, 44(4):632-638
1995
Перспективы улучшения биохимического состава плода Земляники крупноплодной при апомиксисе Батурин С.О., Сухарева Н.Б., Солоненко Л.П., Пфейфер В.И. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 1995, N 3-4. С.32-37.
Использование апомиксиса для изучения наследования ремонтантности у Земляники крупноплодной (Fragaria x ananassa Duch.) Батурин С.О., Сухарева Н.Б., Малецкий С.И. Информационный вестник ВОГИС, 1995, Т. 31, N 10. С.1418-1424.
1994
Наследование пола у апомиктических сеянцев Земляники крупноплодной (Fragaria x ananassa Duch.) Малецкий С.И., Сухарева Н.Б., Батурин С.О. Информационный вестник ВОГИС, 1994, Т.30. N 2. С. 237-243.
Усовершенствование методики приготовления постоянных цитологических препаратов Сухарева Н.Б., Батурин С.О. Ботанический журнал, 1994, Т.79, N 7. С. 131-133.
