Telomeric DNA in chromosomes of five opisthorchid species. Zadesenets KS, Katokhin AV, Mordvinov VA, Rubtsov NB PARASITOL INT, 2012, V. 61. No. 1. P. 81-83
Distribution of repetitive DNA sequences in chromosomes of five opisthorchid species (Trematoda, Opisthorchiidae) Zadesenets KS, Karamysheva TV, Katokhin AV, Mordvinov VA, Rubtsov NB PARASITOL INT, 2012, V. 61. No. 1. P. 84-86
Comparative cytogenetics of opisthorchid species (Trematoda, Opisthorchiidae). Zadesenets KS, Katokhin AV, Mordvinov VA, Rubtsov NB PARASITOL INT, 2012, V. 61. No. 1. P. 87-89
Computer modeling of genome complexity variation trends in prokaryotic communities under varying habitat conditions Lashin S.A., Matushkin Yu.G., Suslov V.V., Kolchanov N.A. ECOL MODEL, 2012, Volume/issue:224C, pp. 124-129, doi: 10.1016/j.ecolmodel.2011.11.004
Cytochrome P450 in fluke Opisthorchis felineus: Identification and characterization. Pakharukova MY, Ershov NI, Vorontsova EV, Katokhin AV, Merkulova TI, Mordvinov VA MOL BIOCHEM PARASIT, 2012, V. 181. No. 2. P. 190–194
2011
Парадоксы "Проблем происхождения жизни" Колчанов Н.А., Суслов В.В. Наука в России, 2011, 5, 41-48
Подход и программные средства для описания макро- и микродинамики экосистем Тимонов В.С., Суслов В.В., Брянская А.В., Ефимов В.М., Колчанов Н.А. Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2011, Т.9. Вып. 1. С. 38-43.
Protein Structure Discovery: пакет программ для решения задач компьютерной протеомики Иванисенко В. А., Деменков П. С., Иванисенко Т. В., Колчанов Н. А. Биоорганическая химия, 2011, 2011, Т. 37, № 1, С. 22–35
Application of the ANDCell Computer System to Reconstruction and Analysis of Associative Networks Describing Potential Relationships between Myopia and Glaucoma O. A. Podkolodnaya, E. E. Yarkova, P. S. Demenkov, O. S. Konovalova, V. A. Ivanisenko, and N. A. Kolchanov Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, 2011, Vol. 1, No. 1, pp. 21–28.
Извлечение знаний из текстов научных публикаций и создание баз знаний в области нанобиотехнологии В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов Российские нанотехнологии, 2011, 2011 . Т. 6 № 7- 8, с. 14-21.
Исследование генетической гетерогенности альфа-субъединицы эпителиального натриевого канала в коре почки крысы. Н.С. Логвиненко, Ю.Э. Гербек, Л.Н. Иванова. B EXP BIOL MED+, 2011, Стр. 655-658, т.151, № 6, 2011.
From published expression and phenotype data to structured knowledge: The Arabidopsis gene net supplementary database and its applications Denis Ponomaryov, Nadezhda Omelianchuk, Victoria Mironova, Evgeny Zalevsky, Nikolay Podkolodny, Eric Mjolsness, and Nikolay Kolchanov Lecture Notes in Artificial Intelligence, 2011, 6581, 101-120
PROMEDIA – база данных химических соединений, потенциальных биомаркеров заболеваний, имеющих значение для неинвазивной диагностики Сайк О.В., Мошкин М.П., Балдин М.Н., Грузнов В.М., Козлов В.А., Самороков С.Н., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2011, №2, Т.6, С.250-263
Разработка методов распознования сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA, их экспериментальная верификация и использование для анализа данных массовой иммунопреципитации хроматина Левицкий В. Г., Ощепков Д. Ю., Ершов Н. И., Брызгалов Л. О., Антонцева Е. В., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А. Doklady Akademii Nauk, 2011, Т. 436, № 3, - С.417-421.
Pattern of MHC class I and immune proteasome expression in Walker 256 tumor during growth and regression in Brattleboro rats with the hereditary defect of arginine-vasopressin synthesis Zakharova L.A., Khegai I.I., Sharova N.P.,Melnikova V.I.,Karpova Y.D., Astakhova T.M., Popova N.A., Ivanova L.N. CELL IMMUNOL, 2011, 2011. 271:385-391
Symbiogenetics and Breeding of a Macrosymbiont for Increased Nitrogen Fixation Capacity with Special Reference to the Pea (Pisum sativum L.) K.K.Sidorova, V.K.Shumny, E.Yu.Vlasova, M.N.Glyanenko, T.M.Mishchenko, G.G.Maystrenko Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, Vol. 1, No. 1, pp. 73–87
Изменение сродства ТАТА-связывающего белка к олигонуклеотидам, соответствующим ТАТА-боксам промоторов генов человека, несущим полиморфизмы, ассоциированные с наследственными заболеваниями Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, № 3, т. 15, стр. 439-447
In vitro examining the existing prognoses how TBP binds to TATA with SNP associated with human diseases Drachkova I.A., Ponomarenko P.M., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Suslov V.V., Savinkova L.K., Kolchanov N.A. Health, 2011, 3, 9, 577-583
Patterns of meiosis in ABDR amphihaploids depend on the specific type of univalent chromosome division Silkova O.G., Shchapova A.I., Shumny V.K. EUPHYTICA, 2011, V.178.P. 415-426. doi: 10.1007/s10681-010-0325-6.
Мейотическая реституция у амфигаплоидов в трибе Triticeae Силкова О.Г., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2011, Т.47. № 4. С. 437-448.
Особенности передачи хромосомы ржи 2R при бэккроссировании пшенично-ржаных замещенных линий 2R(2D) различными сортами мягкой пшеницы Красилова Н.М., Адонина И.Г., Силкова О.Г. Шумный В.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Т.15.№3. С. 585-596
Регуляция объема клеток эпителия собирательных трубок почки крысы в гипотонической среде Соленов Е.И., Батурина Г.С., Иляскин А.В., Каткова Л.Е., академик Иванова Л.Н Doklady Akademii Nauk, 2011, том 436, № 1, с. 13–15
Эволюционные тренды в системах “прокариотическое сообщество” и “прокариотическое сообщество–фаг” Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Суслов В.В., Колчанов Н.А. RUSS J GENET+, 2011, т.47, №12, с. 1676–1685
Формирование хозяйственно-ценных признаков у линий гексаплоидных тритикале с интрогрессиями от видов эгилопсов в зависимости от геномного состава. И.Г. Адонина, О.А. Орловская, О.Ю. Терещенко, Л.В. Корень, Л.В. Хотылева, В.К. Шумный, Е.А. Салина RUSS J GENET+, 2011, том 47, № 4, с. 516–526.
A method for generating selective DNA probes for the analysis of C-negative regions in human chromosomes. Morozkin ES, Loseva EM, Karamysheva TV, Babenko VN, Laktionov PP, Vlassov VV, Rubtsov NB. CYTOGENET GENOME RES, 2011, 135(1):1-11
Использование компьютерной системы ANDCell для реконструкции и анализа ассоциативных сетей потенциальных механизмов взаимосвязи миопии и глаукомы О.А.Подколодная, Е.Э. Яркова, П.С.Деменков, О.С.Коновалова,. В.А.Иванисенко, Н.А.Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14, № 1. — С. 106–115.
Использование симбиотических мутантов гороха для повышения нодуляции и азотфиксации К. К. Сидорова, В. К. Шумный, А. В. Гончарова, П. Л. Гончаров Doklady Akademii Nauk, 2010, 3, 434, 427–429
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учётом деления клеток Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И., Мйолснесс Э., Колчанов Н.А. Сибирский журнал индустриальной математики, 2010, том 13, № 4 (44) С. 70-82
Исследование состава внеклеточной ДНК в культуре клеток человека с помощью FISH Е.С. Морозкин, Е.М. Лосева, К.С. Задесенец, Н.Б. Рубцов, В.В. Власов, П.П. Лактионов Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2010, Том 8, выпуск 1, стр. 3-10.
Молекулярная филогения видов моллюсков семейства Bithyniidae на основе митохондриальных и ядерных последовательностей Романов К.В., Балышева В.И., Катохин А.В., Мордвинов В.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Том 275 C. 391-395
Молекулярно-цитогенетический анализ двух новых de novo возникших сверхчисленных маркерных хромосом, выявленных при пренатальной диагностике. Карамышева Т.В., Лукаш Е.Н., Гилярова М.В., Базанов П.А., Василькова Н.Ю.,Сосницкая С.В., Морозкин Е.С., Лактионов П.П., Рубцов Н.Б. Медицинская генетика, 2010, №2,стр.38-41
Мономорфность изоферментных локусов в природных и культивируемых популяциях амаранта (Amaranthus L.) Р. С. Юдина, А. В. Железнов, В. К. Шумный CYTOL GENET+, 2010, № 6. С.32-39
Новая форма Мискантуса Китайского (Веерника Китайского miscanthus sinensis anders.) как перспективный источник целлюлозосодержащего сырья Шумный, С.Г. Вепрев, Н.Н. Нечипоренко, Т.Н. Горячковская, Н.М. Слынько, Н.А. Колчанов, С.Е. Пельтек Информационный вестник ВОГИС, 2010, том 14, №1, стр. 122-126
A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2010, 4, 65, 143-145
Особенности организации Т-ДНК-встройки у трансгенных растений табака линии Nu 21 Логинова Д.Б., В.К. Шумный, Е.В. Дейнеко Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14. - №1. - С. 659- 665.
Особенности строения центромерных районов политенных хромосом хирономид (Diptera, Chironomidae) Голыгина В.В., Кикнадзе И.И., Брошков А.Д., Карамышева Т.В., Рубцов Н.Б. Информационный вестник ВОГИС, 2010, 14(4): 622 – 631
Особенности формирования цитомиктических каналов в материнских клетках пыльцы Nicotiana tabacum L Мурсалимов С.Р., Байбородин С.И., Сидорчук Ю.В., Шумный В.К., Дейнеко Е.В. CYTOL GENET+, 2010, Т. 44. №1. С. 19-24
Поиск возобновляемых источников целлюлозы для многоцелевого использования Шумный В.К., Н.А. Колчанов, Г.В. Сакович, В.Н. Пармон, С.Г. Вепрев, Н.Н. Нечипоренко, Т.Н. Горячковская, А.В. Брянская, В.В. Будаева, А.В. Железнов, Н.Б. Железнова, В.Н. Золотухин, Р.Ю. Митрофанов, А.С. Розанов, К.Н. Сорокина, Н.М. Слынько, В.А. Яковлев, Информационный вестник ВОГИС, 2010, № 3. Т. 14. С. 569-578
Полиморфизмы ТАТА-боксов генов хозяйственно важных и лабораторных животных и растений, ассоциированные с их селекционно-ценными признаками Суслов В.В., Пономаренко П.М, Пономаренко М.П, Драчкова И.А., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. RUSS J GENET+, 2010, 4, 46, 448-457
Профессор Ия Ивановна Кикнадзе: к 80-летию со дня рождения и к 55-летию научно-педагогической деятельности Захаров И.К., Колчанов Н.А., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14. № 1. С. 11-21.
Cross-hybridization of repetitive sequences from the pericentric heterochromatic region of Chorthippus apricarius (L.) with the chromosomes of grasshoppers from the Gomphocerini tribe Jetybayev I.E., Karamysheva T.V., Bugrov A.G., Rubtsov N.B. EUROA Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 433–436 + III
Роль различных метаболитов в формировании стрессоустойчивости растений Ибрагимова С.С., В.В. Горелова, А.В. Кочетов, В.К. Шумный Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2010, т.8, вып.3, с.98-103
Роль экстраклеточных рибонуклеаз в физиологических процессах высших растений Сангаев С.С., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Левенко Б.А., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, №2, т.14, с.232-242
Симбиогенетика и селекция макросимбионта на повышение азотфиксации на примере гороха (Pisum sativum L.) К.К.Сидорова, В.К.Шумный, Е.Ю.Власова, М.Н.Гляненко, Т.М.Мищенко, Г.Г.Майстренко Информационный вестник ВОГИС, 2010, 2, 14, 357-374
Сравнительный FISH анализ С-позитивных блоков прицентромерных районов хромосом малых лесных мышей Sylvaemus uralensis (Rodentia, Muridae) Т. В. Карамышева, А. С. Богданов, И. В. Картавцева, Т. В. Лихошвай, М. Н. Бочкарёв, Н. Е. Колчева, В. В. Марочкина, Н. Б. Рубцов Информационный вестник ВОГИС, 2010, т.46. №6. 1-12
Сравнительный анализ кариотипов Opisthorchis felineus из Западной Сибири Поляков А.В., Катохин А.В., Бочарова Т.А., Романов К.В., Львова М.Н., Бонина О.М., Юрлова Н.И., Мордвинов В.А. Cибирский экологический журнал, 2010, Т. 1. С. 3-6.
Структура длинных теломер в хромосомах бурозубки иберийской Н. С. Жданова, Ю. М. Минина, Т. В. Карамышева, Н. Б. Рубцов, Ж.-А. Лондоно-Валледжо Информационный вестник ВОГИС, 2010, 9, 46, 1084–1086
Тетраплоидная рожь: эндогенная изменчивость псевдосовместимости Попова И.С., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14. - № 1. С. - 155 - 164
Точное уравнение равновесия для четырех шагов связывания ТВР с ТАТА-боксом для предсказания фенотипической экспрессии при мутациях Пономаренко П.М., Суслов В.В.,Савинкова Л.К., Пономаренко М.П.,Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2010, 3, 55, 400-414
Цитогенетик, доктор биологических наук Антонина Ивановна Щапова: к 80-летию со дня рождения и к 60-летию начала трудовой деятельности Захаров И.К., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14. № 4. С. 603-611.
Экспериментальная проверка функциональной активности потенциальных DRE-сайтов, обнаруженных в промоторах IRF1, REL и IL12A генов человека Е.В. Кашина, Е.В. Антонцева, М.Ю. Шаманина, Е.А. Ощепкова, Д.Ю. Ощепков, А.В. Катохин, А.Ю. Гришанова, Д.П. Фурман, В.А. Мордвинов Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Том 275. С. 353-356.
Эффективность связывания TBP c промотором ARF-генов растений коррелирует с характером влияния ARF белков на транскрипцию (активатор/репрессор) В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, П.М. Пономаренко, М.П. Пономаренко, Н.А. Колчанов Doklady Biochemistry and Biophysics, 2010, 4, 433, 549–554
Expression and molecular characterization of the Mycobacterium tuberculosis PII protein Bandyopadhyay A, Arora A, Jain S, Laskar A, Mandal C, Ivanisenko VA, Fomin ES, Pintus SS, Kolchanov NA, Maiti S, Ramachandran S. J BIOCHEM, 2010, 147(2):279-89.
A new form of Miscanthus (Chinese silver grass, Miscanthus sinensis - Andersson) as a promising source of cellulosic biomass Vladimir K. Shumny, Sergey G.Veprev, Nikolay N. Nechiporenko, Tatiana N. Goryachkovskaya, Nikolay M. Slynko, Nikolay A. Kolchanov, Sergey E. Peltek. Advances in Bioscience and Biotechnology, 2010, Vol.1 No.3, PP.167-170
Human embryonic stem cell lines isolation, cultivation, and characterization Lagarkova MA, Eremeev AV, Svetlakov AV, Rubtsov NB, Kiselev SL. IN VITRO CELL DEV-AN, 2010, V.46, 3-4, 284-293,
A plausible mechanism for auxin patterning along the developing root Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Yosiphon G, Fadeev S.I., Kolchanov N.A., Mjolsness E., Likhoshvai V.A. BMC SYST BIOL, 2010, 4:98 2010
Генная сеть активации макрофага: участие ксенобиотков в регуляции экспрессии генов цитокинов. Ощепкова Е.А., Ощепков Д.Ю., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Цитокины и воспаление, 2010, Т.9, №3, с.49.
Presence of harmless small supernumerary marker chromosomes hampers molecular genetic diagnosis: a case report H Nelle, I Schreyer, Elisabeth Ewers, K Mrasek, N Kosyakova, Martina Merkas, Ahmed Basheer Hamid, R Fahsold, A Ujfalusi, J Anderson, N Rubtsov, A Küchler, F von Eggeling, J Hentschel, A Weise, T Liehr. MOL MED REP, 2010, 3: 571-574
SNPs in the HIV-1 and HIV-2 TATA Box and the AIDS pandemic Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Savinkova L.K., Ponomarenko P.M., Efimov V.M., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2010, 3, 8, 607-625.
Supernumerary chromosomes as markers of population structure evolution in the grasshopper Eyprepocnemis plorans Charpantier, 1825 (Orthoptera, Acrididae) Dzubenko V.V., Bugrov A.G., Jetybayev I.E., Rubtsov N.B. Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 437–440 + IV
The complete mitochondrial genomes of the liver flukes Opisthorchis felineus and Clonorchis sinensis (Trematoda). Shekhovtsov SV, Katokhin AV, Kolchanov NA, Mordvinov VA. PARASITOL INT, 2010, V. 59. No. 1. P. 100–103
The Digenea Parasite Opisthorchis felineus: a Target for the Discovery and Development of Novel Drugs Mordvinov V.A., Furman D.P. Infect Disord Drug Targets, 2010, V. 10. No. 5. P. 385-401
The Structure of Long Telomeres in Chromosomes of the Iberian Shrew Zhdanova N.S., Minina Yu.M., Karamisheva T.V., Rubtsov N.B., Londono-Vallejo J-A. RUSS J GENET+, 2010, N.9, V. 46., P: 1222-1225
Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R J INTEGR BIOINFORM, 2010, 7(1):148. doi: 10.2390/biecoll-jib-2010-148
Анализ запасных белков (проламинов, пуроиндолинов и Waxy) у линий мягкой пшеницы Triticum aestivum L. x (Triticum timopheevii Zhuk. x Triticum tauschii) с комплексной устойчивостью к грибным инфекциям Обухова Л.В., Лайкова Л.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2010, №6, Т. 46, стр. 764-768
Влияние полиморфизмов ТАТА-бокса промотора гена бета-глобина человека, ассоциированный с бета-талассемией, на взаимодействие ТАТА-связывающего белка Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А., Савинкова Л.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, т.14, с. 698-705
ДНК-диагностика микст-инвазий Opisthorchis felineus и Metorchis bilis с помощью метода ПЦР Брусенцов И.И., Катохин А.В., Сахаровская З.В., Сазонов А.Э., Огородова Л.М., Федорова О.С., Колчанов Н.А., Мордвинов В.А. Медицинская паразитология и паразитарные болезни, 2010, №2. С. 10-13.
Исследование запасных белков у интрогрессивных линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L. х Triticum timopheevi Zhuk.), устойчивых к листовой ржавчине Л. В. Обухова, Е. Б. Будашкина, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2009, т.45, №3, с. 313-321
Математическая модель внутриклеточного размножения вируса гриппа С.И. Бажан, Н.А. Кашеварова (Ри), Т. М. Хлебодарова, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов BIOPHYSICS, 2009, Т.54, № 6, С.1066-1080
Математическое моделирование действия потенциальных противовирусных препаратов на репликацию субгеномного репликона вируса гепатита С в клетке Е.Л. Мищенко, K.Д. Безматерных, В.А. Иванисенко, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2009, №1, Том 13, 208-218
Chromosomal differentiation among bisexual European species of Saga (Orthoptera: Tettigoniidae: Saginae) detected by both classical and molecular methods Warchloska-Sliiva, B. Grzywacz, A. Maryanska-Nadachwska, T.V. Karamysheva, N.B. Rubtsov and D. P. Chobanov EUR J ENTOMOL, 2009, 106: 1–9
Межлинейные различия в социальном доминировании и паттернах агонистического поведения у самцов лабораторных мышей Осадчук Л.В., Брагин А.В., Осадчук А.В. Журнал высшей нервной деятельности, 2009, № 3, Т. 59, С. 322-330
Механизмы возникновения и эволюции В-хромосом у восточноазиатских мышей Apodemus peninsulae (Mammalia, Rodentia) Н. Б. Рубцов, Ю. М. Борисов, Т. В. Карамышева, М. Н. Бочкарев RUSS J GENET+, 2009, том 45, № 4, С. 449-457
Молекулярно-цитогенетическое изучение днк прицентромерного гетерохроматина хромосомы 2l у малярийного комара Anopheles beklemishevi (Culicidae, Diptera) Сайджафарова А.О., Артемов Г.Н., Карамышева Т.В., Рубцов Н.Б., Стегний В.Н. RUSS J GENET+, 2009, Т. 45. № 1. С. 59-63
Молекулярно-цитогенетическое исследование маркерных хромосом у двух пациентов с нарушением репродуктивной функции Зотова Н.В., Маркова Е.В., Тимофеева И.Ю., Казанцева О.М., Светлаков А.В., Рубцов Н.Б., Карамышева Т. Медицинская генетика, 2009, №2,стр.37-42
Особенности районов встраивания Т-ДНК у трансгенных растений Филипенко Е.А., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2009, №11, том 45. С.1477-1491.
Особенности регуляции мейотической реституции у андрогенных гаплоидов пшенично-ржаных замещенных линий 2R(2D)1, 2R(2D)3, 6R(6A) (T. aestivum L. сорт Саратовская 29 /S. cereale L. сорт Онохойская) Силкова О.Г., Добровольская О.Б., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2009, Т.45. №9. С.1211-1246.
Поиск высокомолекулярных субъединиц глютенина Triticum timopheevi Zhuk. у линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L. x Triticum timopheevi Zhuk.) Л. В. Обухова, Е. Б. Будашкина, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2009, № 9. Т.45. С. 1292-1295
Полиморфизмы ТАТА-боксов промоторов генов человека и ассоциированные с ними наследственные патологии Cавинкова Л.К., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Колчанов Н.А. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, 2, 74, 149-163
Предисловие: 200 лет со дня рождения Чарлза Дарвина Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К., Суслов В.В. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13. № 2. С. 246-248.
Предсказание влияния полиморфных замен нуклеотидов в ТАТА-боксах промоторов генов человека на сродство к ним ТАТА-связывающего белка Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К.,Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2009, 3, 43, 512-520
Симметричные территориальные условия и доминантно-субординантные отношения у самцов лабораторных мышей (Mus Musculus) в модели социального доминирования Брагин А.В., Осадчук Л.В., Осадчук А.В. ZOOL ZH, 2009, Т. 88, № 3, С. 344-356
Сравнительный анализ иммуногенности трансгенной моркови, продуцирующей S или M антигены вируса гепатита В при оральной иммунизации мышей Щелкунов С.Н., Нестеров А.Е., С.Г.Поздняков, Г.А.Щелкунова, А.А.Загорская, Е.А.Филипенко, Н.В.Пермякова, Л.Д.Позднякова, В.В.Власов, В.К.Шумный, Е.В.Дейнеко Российский иммунологический журнал, 2009, Т. 3(12), № 3-4. С. 235-245
Сравнительный анализ кариотипов Opisthorchis felineus из Западной Сибири Поляков А.В., Катохин А.В., Бочарова Т.А., Романов К.В., Львова М.Н., Бонина О.М., Юрлова Н.И., Мордвинов В.А. Сибирский экологический журнал, 2009, Т. 1. С. 3-6.
Учёный и селекционер Иван Васильевич Чёрный (23.05.1934-11.09.2009) Шумный В.К., Колчанов Н.А., Ефименко А.В., Захаров И.К. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13. № 4. С. 865-874.
Цитокины: биологические свойства и регуляция экспрессии гена интерлейкина-5 человека В.А. Мордвинов, Д.П. Фурман Информационный вестник ВОГИС, 2009, т.13, №1, стр. 53-67
Математическая модель внутриклеточного размножения вируса гриппа Бажан С. И., Кашеварова Н. А., Хлебодарова Т. М., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2009, 54(6):1066-80
A novel nuclear marker, Pm-int9, for phylogenetic studies of Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini and Clonorchis sinensis (Opisthorchiidae, Trematoda). S.V. Shekhovtsov, A.V. Katokhin, K.V. Romanov, V.V. Besprozvannykh, K.P. Fedorov, N.I. Yurlova, E.A. Serbina, P. Sithithaworn, N.A. Kolchanov, V.A. Mordvinov PARASITOL RES, 2009, V. 106. No. 1. P. 293-297
Is there a difference between T- and B-lymphocyte morphology? Strokotov D.I., Yurkin M.A., Gilev K.V., van Bockstaele D.R., Hoekstra A.G., Rubtsov N.B., and Maltsev V.P. J BIOMED OPT, 2009, v.14(6), pp.064036-12
Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA BMC GENOMICS, 2009, V. 1, 10, 639
Adaptive evolution of genes of archaea belonging to the genus Pyrococcus associated with adaptation to life under high-pressure conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Boldyreva EV, Kolchanov NA Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, №1,425,91-93
Plant developmental genetics: Integrating data from different experiments in databases Omelyanchuk NA, Mironova VV, Kolchanov NA RUSS J GENET+, 2009, №11,45,1302-1316
Prediction of the affinity of the TATA-binding protein to TATA boxes with single nucleotide polymorphisms Ponomarenko PM, Ponomarenko MP, Drachkova IA, Lysova MV, Arshinova TV, Savinkova LK, Kolchanov NA Molecular Biology, 2009, №3,43,472-479
Promoters of the Genes Encoding the Transcription Factors Regulating the Cytokine Gene Expression in Macrophages Contain Putative Binding Sites for Aryl Hydrocarbon Receptor D. P. Furman, E.A. Oshchepkova, D.Yu. Oshchepkov, M.Yu. Shamanina, V.A. Mordvinov COMPUT BIOL CHEM, 2009, V. 33. №6. P. 465-468.
TATA box polymorphisms in human gene promoters and associated hereditary pathologies Savinkova LK, Ponomarenko MP, Ponomarenko PM, Drachkova IA, Lysova MV, Arshinova TV, Kolchanov NA BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, №2, 74, 117-129
Telomeric DNA Allocation in Chromosomes of Common Shrew (Sorex araneus, Eulipotyphla) N. S. Zhdanova, Y. I. Rogozina, Y. M. Minina, P. M. Borodin, and N. B. Rubtsov Cell and Tissue Biology, 2009, Vol. 3, No. 4, pp. 323–329
The evolution of key cell cycle proteins correlates with an increase in the complexity of eukaryotic organisms Turnaev II, Gunbin KV, Kolchanov NA Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, №1,426, 147-151
Агробактериальная трансформация растений: перенос фрагментов векторной ДНК в растительный геном Пермякова Н.В., Шумный В.К., Дейнеко Е.В. RUSS J GENET+, 2009, №3, том 45. С.305-317
Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 4, 425, 546-548
Академик Сергей Георгиевич Инге–Вечтомов: 70 лет со дня рождения и 45 лет научной и педагогической деятельности Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13. № 2. С. 495-497.
Анализ продукции М-антигена вируса гепатита В в листьях трансгенных растений моркови Дейнеко Е.В., Загорская А.А., Поздняков С.Г., Филипенко Е.А., Пермякова Н.В., Сидорчук Ю.В., Уварова Е.А., Позднякова Л.Д., Шумный В.К., Власов В.В., Хэммонд Р.В., Щелкунов С.Н. Doklady Akademii Nauk, 2009, №3, том 425. С.400-403
Аргутинская Светлана Владимировна (7.04.1923-28.06.2009) Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13. № 4. С. 861-864.
Влияние пола и порядка генов на частоту и распределение рекомбинационных событий в хромосоме 1 домовой мыши Торгашева А.А., Железова А.И., Рубцов Н.Б., Бородин П.М. Doklady Akademii Nauk, 2009, том 429, № 5, с. 710–712
Выявление новых DRE в регуляторной области генов человека, кодирующих компоненты цитозольного комплекса арил-гидрокарбонового рецептора Д.Ю. Ощепков, Д.П. Фурман, Е.А. Ощепкова, А.В. Катохин, М.Ю. Шаманина, В.А. Мордвинов Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т.13. № 1. С. 46-52.
Выявление новых сайтов транскрипционных факторов SREBP в промоторных районах генов позвоночных на основе комбинации биоинформационного и экспериментального подходов Е.В. Игнатьева, Т.И. Меркулова, Д.Ю. Ощепков, Н.В. Климова, Г.В. Васильев, И.И. Турнаев, В.Ф. Кобзев, Н.А. Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2009, №1, Т.13, С.37-45
Генетика развития растений: интеграция информации из различных наблюдений и экспериментов в базах данных Омельячук НА., Миронова ВВ., Колчанов НА RUSS J GENET+, 2009, Т. 45, No. 11, pp. 1476–1492
Дарвиновская эволюция и регуляторные генетические системы В.В. Cуслов, Н.А. Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2009, №2, Том 13, с.410-439
Динамика ИУК и цитокининов в тканях цветков трансгенных растений табака с мутантным фенотипом Загорская А.А., Сидорчук Ю.В., Шумный В.К., Дейнеко Е.В. Физиология растений, 2009, Т. 56. №6. С. 917–925.
Изучение влияния делеции BTB/kelch –генов вируса оспы коров на некоторые характеристики инфекции in vitro Кочнева Г.В., Таранов О.С., Лупан Т.А., Юдин П.В., Рубцов Н.Б., Байбородин С.И., Колосова И.В., Щелкунов С.Н., Дроздов И.Г., Рябчикова Е.И. Вопросы вирусологии, 2009, том 45, № 4, С. 449-457
2008
Использование трансгенных растений моркови-продуцентов интерлейкина-18 человека для модуляции иммунных реакций у мышей Якушенко Е.В., Лопатникова Ю.А., Сенников С.В., Шаталина М.Н., Филипенко Е.А., Дейнеко Е.В., Воронина Е.Н., Храпов Е.А., Филипенко М.Л., Шумный В.К., Козлов В.А. Бюллетень СО РАМН, 2008, №3(131) С.70-75
Качество зерна и муки интрогрессированных линий мягкой пшеницы с генами устойчивости к листовой ржавчине от Triticum timofeevi Л.В. Обухова Е.Б. Будашкина М.Ф. Ермакова Н.П. Калинина В.К. Шумный Сельскохозяйственная биология, 2008, №5, с. 38-42
Математическое моделирование морфогенеза растений Г.Г. Лазарева, В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, И.В. Шваб, В.А. Вшивков, Д.Н. Горпинченко, С.В. Николаев, Н.А.Колчанов. Журнал вычислительной математики и математической физики, 2008, Т.11. №2., c.151-166
Микрофлюидные системы в биологии и конструирование геносенсоров С.Е. Пельтек, Т.Н. Горячковская, В.М. Попик, В.Ф. Пиндюрин, В.С. Елисеев, Б.Г. Гольденберг, М.А. Щеглов, Н.В. Тикунова, Т.М. Хлебодарова, Н.Б. Рубцов, Г.Н. Кулипанов, Н.А. Колчанов Российские нанотехнологии, 2008, Т 3 вып 9-10 , с 136-145
Онтогенез полового поведения у самцов лабораторных мышей: роль генотипа Осадчук Л.В., Саломачева И.Н., Брагин А.В., Осадчук А.В. Журнал высшей нервной деятельности, 2008, № 1, Том 58, С. 66-74.
От сохранения генетических коллекций к национальной системе хранения генофондов растений в вечной мерзлоте Гончаров Н.П., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2008, Т.12, № 4. С.509-523.
Передача генетического материала ржи в геном мягкой пшеницы методом межгеномного замещения хромосом Силкова О.Г., Щапова А.И., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2008, Т.12. № 4. С. 654-661.
Пошаговая модель связывания ТВР/ТАТА бокс позволяет предсказать наследственные заболевания человека по точечным полиморфизмам Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2008, 6, 419, 828-832
Преждевременный цитокинез в материнских клетках пыльцы трансгенных растений табака (Nicotiana tabacum L.) Сидорчук Ю.В., Дорогова Н.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. Cell and Tissue Biology, 2008, Т. 50. № 5. С.447-451.
Реорганизация генома тритикале Хотылева Л., Шумный В., Каминская Л., Салина Е., Леонова И., Корень Л., Орловская О. Наука и инновация, 2008, № 12, с. 26-30
Содержание микроРНК В Arabidopsis thaliana коррелирует с наличием в последовательностях тетрануклеотидов WRHW и DRYD Пономаренко М.П., Омельянчук Н.А., Катохин А.В., Савинская С.А., Колчанов Н.А Doklady Biochemistry and Biophysics, 2008, 5, 420, 703-707
Тетраплоидная рожь: динамика псевдосовместимости Попова И.С., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2008, №3, том 12, С. 378-384
Трехмерная организация интерфазных ядер фибробластов у двух близкородственных видов бурозубок, различающихся структурой терминальных районов хромосом Н.Б. Рубцов, Т.В. Карамышева, Ю.М. Минина, Н.С. Жданова Cell and Tissue Biology, 2008, №5, том 50, стр.430-438
Триппинг и семенная продуктивность у многолетних видов люцерны Medicago L Коваленко В. И., Шумный В. К. Информационный вестник ВОГИС, 2008, Т. 12. С.740-748
Эволюционный конструктор: методика и комплекс программ для моделирования эволюции трофически связанных популяций одноклеточных гаплоидных организмов Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А. Вычислительные технологии, 2008, №6, т 13, 91-101
Differences in ribosomal DNA distribution on A and B chromosomes between eastern and western populations of the grasshopper Eyprepocnemis plorans plorans M.D. Lopez-Leon, J. Cabrero, V.V. Dzyubenko, A.G. Bugrov, T.V. Karamysheva, N.B. Rubtsov, J.P.M. Camacho CYTOGENET GENOME RES, 2008, 121:260–265
Genetic algorithm and optimized weight matrix application for peroxisome proliferator response elements recognition: Prerequisites of accuracy growth for wide genome research Victor G. Levitsky, Elena V. Ignatieva, Eugenia Aman, Tatyana I. Merkulova, Nikolay A. Kolchanov, T. Charles Hodgman INTELL DATA ANAL, 2008, 12(5): 513-526
Genetic Systems of Development: Functional Dynamics and Molecular Evolution Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2008, V. 73, N 2, P. 219-230.
Recombination map of the common shrew, Sorex araneus (Eulipotyphla, Mammalia) Borodin PM, Karamysheva TV, Belonogova NM, Torgasheva AA, Rubtsov NB, Searle JB. GENETICS, 2008, Feb;178(2):621-32.
Sarai uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs Kochetov AV, Ahmad S, Ivanisenko V, Volkova OA, Kolchanov NA FEBS LETT, 2008, 9, 582, 1293-7
Small supernumerary marker chromosomes (sSMC) in humans; are there B chromosomes hidden among them Thomas Liehr, Kristin Mrasek, Nadezda Kosyakova, Caroline Mackie Ogilvie, Joris Vermeesch, Vladimir Trifonov and Nikolai Rubtsov Mol Cytogen, 2008, 1:12 (04 Jun 2008)
TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko INTELL DATA ANAL, 2008, No. 5, Vol. 12, P. 443-461
uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs Kochetov A.V., Ahmad S., Ivanisenko V., Volkova O.A., Kolchanov N.A., Sarai A. FEBS LETT, 2008, 582. 1293-1297
Анализ структуры инсулин-зависимых регуляторных контуров зрелых адипоцитов Кузнецова Т.Н., Е.В. Игнатьева, В.А. Мордвинов, А.В. Катохин, М.Ю. Шаманина, Д.Ю. Ощепков, Н.А. Колчанов Успехи физиологических наук, 2008, Т. 39. №1. С. 3-22.
Взаимодействие двух симбиотических генов nod3 и Nod5 в одном генотипе гороха Pisum sativum L Сидорова К.К., Шумный В.К., Власова Е.Ю., Гляненко М.Н., Мищенко Т.М. Doklady Akademii Nauk, 2008, № 4, Т. 419, С. 569-571.
Генетическая регуляция деления центромерных районов унивалентных хромосом ржи и пшеницы в анафазе I мейоза ди-моносомиков Силкова О.Г., Перемыслова Е.Э., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2008, Т.44. №1.С.85-93.
Изготовление LIGA-шаблонов для создания микрофлюидных аналитических систем Гольденберг Б.Г., Горячковская Т.Н., Елисеев В.С., Колчанов Н.А., Кондратьев В.И., Кулипанов Г.Н., Попик В.М., Пельтек С.Е., Петрова Е.В., Пиндюрин В.Ф. Поверхность. Рентгеновские, синхротронные и нейтронные исследования, 2008, 8 с 1-4
2007
К 90-летию Дмитрия Константиновича Беляева (1917-1985) Трут Л.Н., Маркель А.Л., Бородин П.М., Аргутинская С.В., Захаров И.К., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, № 7. Т. 43. С. 869-872.,
Компьютерно-экспериментальный подход к дизайну полифункционального геносенсора, полученного на основе промотора гена yfiA Escherichia coli Тикунова Н.В., Хлебодарова Т.М., Крачко А.В., Степаненко И.Л., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2007, 417, №6 , 835-839
Конкурентные отношения за лимитированные ресурсы среды у лабораторных мышей в модели социального доминирования Брагин А.В., Осадчук Л.В., Осадчук А.В. Журнал высшей нервной деятельности, 2007, № 3, Том 57, С. 358-365.
Математическая модель паттерна распределения ауксина в корне растения Лихошвай В. А., Омельянчук Н. А., Миронова В. В., Фадеев С. И., Мелснесс Э. М., Колчанов Н. А. RUSS J DEV BIOL+, 2007, Т. 38, №. 6, стр. 446–456, 2007
Модельное изучение роли CLV1, CLV2, CLV3 И WUS в регуляции структуры апикальной меристемы побега Николаев С. В., Пененко A. В., Лавреха В. В., Мелснесс Э. Д., Колчанов Н. А. RUSS J DEV BIOL+, 2007, 38 №6, 457-462
Молекулярные механизмы системной устойчивости растений к вирусным инфекциям и способы повышения вирусоустойчивости путем трансгенеза Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2007, Т.127. С.13-24
Combined experimental and computational approaches to study the regulatory elements in eukaryotic genes Kolchanov NA, Merkulova TI, Ignatieva EV, Ananko EA, Oshchepkov DY, Levitsky VG, Vasiliev GV, Klimova NV, Merkulov VM, Hodgman TC BRIEF BIOINFORM, 2007, 8(4), 266-274
Особенности встраивания векторных последовательностей в геном трансгенных растений Пермякова Н.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, Т.43. № 11. С.1501-1510
Особенности цитомиксиса в материнских клетках пыльцы у трансгенных растений табака (Nicotiana tabacum L.) с мутантным фенотипом Сидорчук Ю.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. Cell and Tissue Biology, 2007, Т.49,№10, С.870-875
Получение пшенично-ржаных замещенных линий на основе озимых сортов ржи с идентификацией кариотипов методами С-бэндинга, GISH и SSR-маркеров Силкова О.Г., Добровольская О.Б., Дубовец Н.И., Адонина И.Г., Кравцова Л.А., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, 43, 8, стр.1149-1152
Репродуктивные корреляты социальной иерархии у самцов лабораторных мышей Осадчук Л.В., Саломачева И.Н., Брагин А.В., Осадчук А.В. Журнал высшей нервной деятельности, 2007, № 5, Том 57, С. 604-612.
Роль микротрубочкового цитоскелета и каллозных оболочек в проявлении цитомиксиса в материнских клетках пыльцы растений табака (Nicotiana tabacum L.) Сидорчук Ю.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. Cell and Tissue Biology, 2007, Т. 49. № 10. С. 876-880.
Роль хромосомы ржи 2R пшенично-ржаной замещенной линии 2R(2D)1 (T. aestivum L. сорт Саратовская 29 /S. cereale L. сорт Онохойская) в генетической регуляции мейотической реституции у пшенично-ржаных полигаплоидов Силкова О.Г., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, Т.43. №7.С. 971-981
Сетевое описание биосистем: проблемы и подходы Колчанов Н.А., Мигинский Д.С., Подколодный Н.Л., Рассказов Д.А., Суслов В.В., Тимонов В.С., Сергеев М.Г. Вычислительные технологии, 2007, Т. 12, Специальный выпуск 2, С. 107-122
Т-ДНК индуцированные мутации у трансгенных растений Дейнеко Е.В., Загорская А.А., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, №1, т.43, с.5-17
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах Меркулова Т. И., Ощепков Д. Ю., Игнатьева Е. В., Ананько Е.В., Левицкий В.Г., Васильев Г. В., Климова Н. В., Меркулов В.М., Колчанов Н.А. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2007, 11, 72, 1459-1467
Effective transcription factor binding site prediction using a combination of optimization, a genetic algorithm and discriminant analysis to capture distant interactions Levitsky V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Turnaev I.I., Merkulova T.I., Kolchanov N.A., Hodgman T.C. BMC BIOINFORMATICS, 2007, Vol. 8:481. PMID: 18093302
Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure-BGRS'2006 Rodin S. N., Kolchanov N. A. In Silico Biology, 2007, 7: 0040
Genes flanking Xist in mouse and human are separated on the X chromosome in American marsupials Shevchenko AI, Zakharova IS, Elisaphenko EA, Kolesnikov NN, Whitehead S, Bird C, Ross M, Weidman JR, Jirtle RL, Karamysheva TV, Rubtsov NB, Vandeberg JL, Mazurok NA, Nesterova TB, Brockdorff N, Zakian SM CHROMOSOME RES, 2007, V. 15. N. 2. P. 127-136.
Mathematical model for suppression of subgenomic hepatitis C virus RNA replication in cell culture Mishchenko E.L., Bezmaternykh K.D., Likhoshvai V.A., Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Sournina N. Yu., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, Vol. 5, No. 02B pp.593-609
Model of the reception of hedgehog morphogen concentration gradient: comparison with an extended range of experimental data Gunbin K.V., Omelyanchuk L.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, 2b, 5, 491-507
Mosaic expression pattern of the nptII gene in transgenic tobacco plants Nu21 Marenkova T.V., Deineko E.V., ShumnyV.K. RUSS J GENET+, 2007, №7,V43, pp780-790
Мозаичный характер проявления гена nptII у трансгенных растений табака линии Nu21 Маренкова Т.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, Том 43, №1, С.943-954
Поиск новых сайтов связывания транскрипционного фактора SF1 методом SITECON: экспериментальная проверка и анализ регуляторных районов генов-ортологов. Игнатьева Е. В., Климова Н. В., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А. Doklady Akademii Nauk, 2007, 415(1):120-124
Protection of transgenic tobacco plants expressing bovine pancreatic ribonuclease against tobacco mosaic virus Trifonova E. A., Sapotsky M.V., Komarova M. L., Scherban A.B., Shumny V.K., Polyakova A.M., Lapshina L.A., Kochetov A.V., Malinovsky V.I. PLANT CELL REP, 2007, V.26, P.1121-1126
Recognition of interferon-inducible sites, promoters, and enhancers Ananko E.A., Kondrakhin Y.V., Merkulova T.I., Kolchanov N.A BMC BIOINFORMATICS, 2007, v.8 p.56
Search for new binding sites for the transcription factor SF-1 by the SITECON method: experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes Ignat'eva EV, Klimova NV, Oshchepkov DY, Vasil'ev GV, Merkulova TI, Kolchanov NA. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2007, V.415, c.165-169
Simulation of coevolution in community by using the "Evolutionary Constructor" program. In Silico Biology (Special Issue: 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS 2006)) Lashin S.A., Suslov V.V., Kolchanov N.A., Matushkin Yu.G In Silico Biology, 2007, № 7, vol. 42. p. 20-30.
The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A. In Silico Biology, 2007, 3, 7, 333-354
Web-based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Post-translational Modifications of Proteins Ivanisenko V.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Methods in Molecular Biology, 2007, 446, 363-384.
А cellular automaton to model the development of primary shoot meristems of Arabidopsis Thaliana Ilya Akberdin, Evgeniy Ozonov, Victoria Mironova, Nadezda Omelyanchuk, Vitaly Likhoshvai, Dmytry Gorpinchenko, Nikolay Kolchanov Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, Vol. 5, 02B, pp. 641-650
Азотный режим почв различных генотипов макросимбионта Назарюк В.М., Сидорова К.К., Шумный В.К., Калимуллина Ф.Р., Кленова М.И Почвоведение, 2007, № 2, с. 189-196
Академик Николай Петрович Дубинин: к 100-летию со дня рождения Шумный В.К., Захаров И.К. Информационный вестник ВОГИС, 2007, № 1.Т. 11. С. 5-15.
Анализ сайтов встраивания Т-ДНК инсерций у трансгенных растений табака Филипенко Е.А., Филипенко М.Л., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. CYTOL GENET+, 2007, №4, т.41, с.3-8, 2007
Application of bioinformatics resources for genosensor design Khlebodarova T.M., Tikunova N.V., Kachko A.V., Stepanenko I.L., Podkolodny N.L., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, V.5. P.507-520
Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 2, 11, 373-400
Aromorphoses and the adaptive molecular evolution Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 11(2):373-400
AUG_hairpin: prediction of a downstream secondary structure influencing the recognition of a translation start site Kochetov A.V., Palyanov A., Titov I.I., Grigorovich D., Sarai A., Kolchanov N.A. BMC BIOINFORMATICS, 2007, 8(1):318
Bioinformatical and experimental approaches to investigation of transcription factor binding sites in vertebrate gene Merkulova T. I., Oshchepkov D. Yu., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Levitsky V. G., Vasiliev G. V., Klimova N. V. , Merkulov V. M., Kolchanov N. A. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2007, 72 (11):1187-1193
Доместикация злаков Старого Света: поиск новых подходов для решения старой проблемы Гончаров Н.П., Глушков С.А., Шумный В.К. Журнал Общей Биологии, 2007, №2, т.68, с.126-148
2006
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани Николаев С.В., Колчанов Н.А., Фадеев С.И., Когай В.В., Мйолснесс Э. Вычислительные технологии, 2006, Том 11, № 2, с. 67 - 81
Методы генетики в селекции растений Гончаров Н.П., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2006, №2, Т.10. С.395-403.
Моделирование морфогенеза Arabidopsis thaliana в терминах клеточного автомата Акбердин И. Р., Озонов Е. А., Миронова В. В., Горпинченко Д.Н., Омельянчук Н. А., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, т. 51, выпуск N7
О ранних стадиях эволюции геосферы и биосферы Добрецов Н.Л., Колчанов Н.А., Суслов В.В. PALEONTOL J+(RUS), 2006, Vol. 40. Suppl. 4. Pp. S407-S424.
Pattern of locally positioned dinucleotides correlates with microRNA abundance in plants Khomicheva I.V., Levitsky V.G., Omelyanchuk N.A., Kolchanov N.A., Savinskaya S.A. BIOPHYSICS, 2006, Suppl 1, 51, S7-S10
Потенциальные открытые рамки считывания в 5”-нетранслируемых районах эукариотических мРНК Волкова О. А., Кочетов А. В., Титов С. Е., Колчанов Н. А. BIOPHYSICS, 2006, 51(4), 615-21
Потенциальные сайты связывания фактора транскрипции SF-1: выявление методом SiteGA, экспериментальная проверка и поиск новых генов-мишени Н.В.Климова, В.Г.Левицкий, Е.В.Игнатьева, Г.В.Васильев, В.Ф.Кобзев, Т.В.Бусыгина, Т.И.Меркулова, Н.А.Колчанов Molecular Biology, 2006, Т.40, №3, стр.512-523
Предсказание контактных чисел аминокислотных остатков c использованием алгоритма нейросетевой регрессии Д.А.Афонников, А.С.Морозов, Н.А.Колчанов BIOPHYSICS, 2006, 51, N7.
Раиса Львовна Берг (27.03.1913-1.03.2006) Захаров И.К., Колосова Л.Д., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2006, Т. 42. № 12. С. 1739-1742.
Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов с помощью метода SiteGA Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В.,Ананько Е.А.,Меркулова Т.И., Колчанов Н.А.,Ходжман Ч. BIOPHYSICS, 2006, 4, 51, 633-639
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: I. База данных AGNS Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Шамов И.С.,Поплавский А.С., Подколодный Н.Л., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Мелснесс Э.Д., Мейеровитц Е.M., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, выпуск N7, т. 51
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: II. Моделирование регуляции структуры апикальной меристемы побега Николаев С.В., Фадеев С.И., Пененко A.В., Лавреха В.В., Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Мелснесс Э.Д., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, 51, N7.
Содержание микроРНК в Arabidopsis thaliana коррелирует с встречаемостью тетрануклеотидов WRHW и DRYD Пономаренко М.П., Омельянчук Н.А., Катохин А.В., Колчанов Н.А Информационный вестник ВОГИС, 2006, 2, 10, 304-311
Создание пшенично-ржаных замещенных линий с идентификацией хромосомного состава кариотипов методами C-бэндинга, GISH и SSR-маркеров Силкова О.Г., Добровольская О.Б., Дубовец Н.И., Адонина И.Г., Кравцова Л.А., Родер М.С., Салина Е.А., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2006, №46, т.42, с. 793-802
Трансгенез как способ увеличения устойчивости растений к повышенным концентрациям тяжелых металлов Колодяжная Я.С., Кочетов А.В., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2006, Т. 126, № 5, С. 456–461
Физиологические и агрохимические особенности разных симбиотических генотипов гороха (Pisum sativum L.) Назарюк В.М., Сидорова К.К., Шумный В.К., Калимуллина Ф.Р., Кленова М.И BIOL BULL+(RUS), 2006, 6, , 688-697
Филогенетический анализ семейства p53 Пинтус С.С., Фомин Э.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, т.51, вып.4, с.640-649
Численное исследование модели рецепции градиента концентрации морфогена Hedgehog В.В.Когай, К.В.Гунбин, Л.В.Омельянчук, С.И. Фадеев, Н.А.Колчанов Сибирский журнал индустриальной математики, 2006, 3(27), IX, 66-79
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах Климова Н.В., Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2006, т.40, стр. 512-523.
A model of Arabidopsis thaliana morphogenesis in cellular automaton terms I. R. Akberdin, E. A. Ozonov, V.V. Mironova, D. N. Gorpinchenko,N. A. Omelyanchuk, V. A. Likhoshvai, N. A. Kolchanov BIOPHYSICS, 2006, т. 51, выпуск N7., s91-94
A Systems Approach to Morphogenesis in Arabidopsis thaliana: II. Modeling of the Regulation of Shoot Apical Meristem Structure S. V. Nikolaev, S. I. Fadeev, A. V. Penenko, V. V. Lavrekha, V. V. Mironova, E. D. Mjolsness, N. A. Omel’yanchuk, N. A. Kolchanov BIOPHYSICS, 2006, №7, V. 51
Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck GENOMICS, 2006, V. 88, № 6, P. 752-761.
On the Early Stages of the Evolution of the Geosphere and Biosphere Dobretsov N.L., Kolchanov N.A., Suslov V.V. PALEONTOL J+(RUS), 2006, 4, 40, S407-S424
Use of Transgenic Carrot Plants Producing Human Interleukin-18 for Modulation of Mous Immune Reactions Якушенко У.В., Храпов Ю.А., Дейнеко Е.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Шумный В.К., Сенников Ы.В., Козлов В.А. In Book: New research on Biotechnology and Medicine. Eds.: Egorov A.M., Zaikov G.E. Nova Science Publishers, 2006, P.97-107
Potential binding sites for SF-1: Recognition by the SiteGA method, experimental verification, and search for new target genes Klimova NV, Levitsky VG, Ignatieva EV, Vasiliev GV, Kobzev VF, Busygina TV, Merkulova TI, Kolchanov NA Molecular Biology, 2006, V.40, № 3. P.1-12.
Prediction of Contact Numbers of Amino Acid Residues Using a Neural Network Regression Algorithm D. A. Afonnikov, A. V. Morozov, N. A. Kolchanov BIOPHYSICS, 2006, 7,51,
WebProAnalyst: an interactive tool for analysis of quantitative structure-activity relationships in protein families Ivanisenko V.A., Eroshkin A.M., Kolchanov N.A. NUCLEIC ACIDS RES, 2005, V. 33, W99-W104
PDBSite: a database of the 3D structure of protein functional sites Ivanisenko VA, Pintus SS, Grigorovich DA, Kolchanov NA. NUCLEIC ACIDS RES, 2005, V33, D183–D187
2003
Data Mining Techniques in Bioinformatics Zagoruiko N.G., Kolchanov N.A., Pichueva A.G., Kutnenko O.A., Borisova I.A., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Nikolaev S.V., Likhoshvai V.A., Ratushnyi A.V. Pattern Recognition and Image Analysis, 2003, N. 4, V. 13, P. 550-555
2002
Быстрый генетический алгоритм для анализа вторичной структуры РНК Титов И.И., Воробьев Д.Г., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А. RUSS CHEM B+, 2002, N7, c. 1047-1056
rSNP_Guide, a database system for analysis of transcription factor binding to target sequences: application to SNPs and site-directed mutations Ponomarenko JV, Merkulova TI, Vasiliev GV, Levashova ZB, Orlova GV, Lavryushev SV, Fokin ON, Ponomarenko MP, Frolov AS, Sarai A. NUCLEIC ACIDS RES, 2001, 1, 29, 312-316.
Detection of conserved physico-chemical characteristics of proteins by analyzing clusters of positions with coadaptive substitutions D.A. Afonnikov , D. Yu. Oshchepkov, and N.A. Kolchanov BIOINFORMATICS, 2001, V.17(11):1-12.
2000
Methods for integration of heterogeneous information resources in molecular biology in the digital library GeneExpress F. A. Kolpakov, N. L. Podkolodnyi, S. V. Lavryushev, D. A. Grigorovich, M. P. Ponomarenko, N. A. Kolchanov PROGRAM COMPUT SOFT+, 2000, 3, 26, 170-176
Точковые мутации в районе 663-666 п.н. интрона 6 гена триптофаноксигеназы, связанные с рядом психических расстройств, разрушают сайт связывания фактора транскрипции YY1. Васильев Г.В., Меркулов В.М., Кобзев В.Ф., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Подколодная О.А., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2000, 2, 34, 214-222
1999
Усреднее результатов распознавания сайтов может увеличить точность аннотации генома человека Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Подколодная О.А., Фролов А.С., Воробьев Д.В., Колчанов Н.А., Овертон K. BIOPHYSICS, 1999, 4, 44, 649-654
WWWMGS: интегрированный сервер для молекулярно-генетических исследований А.С.Фролов, С.В.Лаврюшев, Д.А.Григорович, А.Э.Кель, А.А.Птицын, Н.А.Колчанов, Н.Л.Подколодный, В.В.Соловьев, Л.Миланези, П.Борн, Э.Вингендер, К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, том 44, вып. 5, с.832-836
GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, 5, 44, 837-841
Вклад сигналов и антисигналов в мутационный спектр сайта встраивания td-интрона. Пономаренко М.П, Пономаренко Ю.В., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 1999, 4, 44, 655-663
1998
Предпочтительность RecA-филамента к последовательностям ДНК коррелирует с генетическим кодом Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Титов И.И., Колчанов Н.А., Мазин А.В., Ковальчиковски С. Doklady Akademii Nauk, 1998, 1, 363, 122-125
