Симбиотические мутанты гороха (Pisum sativum L.) – важный генетический источник для селекции на повышение азотфиксации Сидорова К.К., Шумный В.К. Doklady Akademii Nauk, 2014, №5, Т.454, С. 612-614
Ultrastructure of spermatozoa in the seminal receptacle of the liver fluke Opisthorchis felineus (Rivolta, 1884) Zhukova M.V., Mordvinov V.A., Kiseleva E. PARASITOL RES, 2014, 113(3):1093-101.
Study of Nodulation and Nitrogen Fixation in Introduced Cultivars and Candidate Lines of Pea (Pisum sativum L.) Grown at Two Nitrogenous Nutrition Levels L. V. Omel’yanuk, K. K. Sidorova, V. K. Shumny Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2014, № 1, v. 4, p. 19-22
Symbiotic Mutants of Pea (Pisum sativum L.), an Important Genetic Source for Selection for Increased Nitrogen Fixation K. K. Sidorova, V. K. Shumnyi Doklady Akademii Nauk, 2014, № 5, v. 454, p. 612-614
A New Stochastic Model for Subgenomic Hepatitis C Virus Replication Considers Drug Resistant Mutants Nikita V. Ivanisenko, Elena L. Mishchenko, Ilya R. Akberdin, Pavel S. Demenkov, Vitaly A. Likhoshvai, Konstantin N. Kozlov, Dmitry I. Todorov, Vitaly V. Gursky, Maria G. Samsonova, Alexander M. Samsonov, Diana Clausznitzer, Lars Kaderali, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko PloS One, 2014, Volume 9 | Issue 3 | e91502
Genetic basis of olfactory cognition: extremely high level of DNA sequence polymorphism in promoter regions of the human olfactory receptor genes revealed using the 1000 Genomes Project dataset Ignatieva E.V., Levitsky V.G., Yudin N.S., Moshkin M.P., Kolchanov N.A. Front Psychol, 2014, published: 24 March 2014 doi: 10.3389/fpsyg.2014.00247
Осаждение аэрозолей в носовых ходах норных и наземных грызунов при дыхании в запыленной среде Мошкин М.П., Петровский Д.В., Акулов А.Е., Ромащенко А.В., Герлинская Л.А., Мучная М.И., Ганимедов В.Л., Садовский А.С., Савелов А.А., Коптюг И.В., Троицкий С.Ю., Бухтияров В.И., Колчанов Н.А., Сагдеев Р.З., Фомин В.М. Журнал общей биологии, 2014, том 75, № 2, с.104-115.
The mechanism by which TATA-box polymorphisms associated with human hereditary diseases influence interactions with the TATA-binding protein. Drachkova I.A., Savinkova L.K., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Peltek S.E., Kolchanov N.A. HUM MUTAT, 2014, 5, 35, 601-608
Identification of thyroid hormone receptor homologs in the fluke Opisthorchis felineus (Platyhelminthes). Pakharukova MY, Ershov NI, Vorontsova EV, Shilov AG, Merkulova TI, Mordvinov VA. MOL BIOCHEM PARASIT, 2014, 194, 64–68
ФИЗИКО ХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА И ПРОТИВООПИСТОРХОЗНОЕ ДЕЙСТВИЕ МЕХАНОХИМИЧЕСКИ СИНТЕЗИРОВАННЫХ СУПРАМОЛЕКУЛЯРНЫХ КОМПЛЕКСОВ АЛБЕНДАЗОЛА И ПОЛИСАХАРИДА АРАБИНОГАЛАКТАНА ИЗ ЛИСТВЕННИЦ LARIX SIBIRICA И LARIX GMELINII Ю.С. Чистяченко, М. В. Хвостов, А. И. Белоусов, Н. А. Жукова, М. Ю. Пахарукова, А. В. Катохин, С. С. Халиков, Т. Г. Толстикова, А. В. Душкин, В. А. Мордвинов, Н. З. Ляхов Doklady Akademii Nauk, 2014, 2014, том 456, № 6, с. 1–3
Флуоресцентная гибридизация in situ ДНК-проб, полученных из индивидуальных хромосом и хромосомных районов. Богомолов А.Г. Карамышева Т.В. Рубцов Н.Б. Molecular Biology, 2014, том 48, № 6, с. 881–890
Position of an Active Thiosulfonate Group in New Phenolic Antioxidants is Critical for ARE-Mediated Induction of GSTP1 and NQO1 V.A. Vavilin, A.B. Shintyapina, O.G. Safronova, E.V. Antontseva, V.A. Mordvinov, M.V. Nikishina, N.V. Kandalintseva, A.E. Prosenko, V.V. Lyakhovich JPSR, 2014, 6(4), 178-183
Создание панели ДНК пород крупного рогатого скота России для геномных исследований. Юдин Н.С., Васильева Л.А., Белявская В.А., Айтназаров Р.Б., Смирнов П.Н., Хитон М., Легрейд У., Орлова Г.В., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, Том 18, № 3, стр. 202-207
Molecular dynamics simulations of the Nip7 proteins from the marine deep- and shallow-water Pyrococcus species Kirill E Medvedev, Nikolay A Alemasov, Yuri N Vorobjev, Elena V Boldyreva, Nikolay A Kolchanov, Dmitry A Afonnikov BMC STRUCT BIOL, 2014, 14:23
2013
Translation efficiency in yeasts correlates with nucleosome formation in promoters Matushkin YG, Levitsky VG, Orlov YL, Likhoshvai VA, Kolchanov NA. Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2013, 31(1):96-102
The substitutions G245C and G245D in the Zn(2+)-binding pocket of the p53 protein result in differences of conformational flexibility of the DNA-binding domain. Pintus SS, Ivanisenko NV, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Ramachandran S, Kolchanov NA, Ivanisenko VA. Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2013, 31:1, 78-86
Studying the non-thermal effects of terahertz radiation on E. coli/pKatG-gfp biosensor cells Elizaveta V. Demidova, Tatiana N. Goryachkovskaya, Tatiana K. Malup, Svetlana V. Bannikova, Artem I. Semenov, Nikolay A. Vinokurov, Nikolay A. Kolchanov, Vasiliy M. Popik, Sergey E. Peltek BIOELECTROMAGNETICS, 2013, Volume: 34 Issue: 1 Pages: 15-21
Организация хромосом эукариот: от работ Н.К. Кольцова до наших дней Рубцов Николай Борисович RUSS J GENET+, 2013, т. 49, №1, 16-29
Регуляторные коды транскрипции геномов эукариот Т. И. Меркулова, Е. А. Ананько, Е. В. Игнатьева, Н. А. Колчанов RUSS J GENET+, 2013, том 49, № 1, с. 37–54
Recombination and synaptic adjustment in oocytes of mice heterozygous for a large paracentric inversion Torgasheva A.A., Rubtsov N.B., Borodin P.M. CHROMOSOME RES, 2013, V.21, I. 1, Page 37-48
An experimental verification of the predicted effects of promoter TATA-box polymorphisms associated with human diseases on interactions between the TATA-boxes and TATA-binding protein. Savinkova L.K., Drachkova I.A., Arshinova T.V., Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A. PloS One, 2013, 2, 8, e54626
How multiple auxin responsive elements may interact in plant promoters: a reverse problem solution Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Savina M.S., Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, 1, 11, 1340011 (DOI: 10.1142/S0219720013400118)
Chromosome pairing in meiosis of partially fertile wheat/rye hybrids Silkova O.G., Adonina I.G., Krivosheina E.A., Shchapova A.I., Shumny V.K. SEX PLANT REPROD, 2013, V.26. P.33-41. DOI: 10.1007/s00497-012-0207-2
Low genetic diversity in wide-spread Eurasian liver fluke Opisthorchis felineus suggests special demographic history of this trematode species Ilja I. Brusentsov, Alexey V. Katokhin, Irina V. Brusentsova, Sergei V. Shekhovtsov, Sergei N. Borovikov, Grigoriy G. Goncharenko, Lyudmila A. Lider, Boris V. Romashov, Olga T. Rusinek, Samat K. Shibitov, Marat M. Suleymanov, Andrey V. Yevtushenko, Viatcheslav A. Mordvinov PloS One, 2013, 8(4) e62453
Влияние гипоосмотического шока на объем клеток эпителия собирательных трубок почки крыс Браттлборо с наследственным дефектом синтеза вазопрессина. Батурина Г. С., Каткова Л. Е., Иляскин А. В.,Соленов Е. И., Иванова Л. Н. Doklady Akademii Nauk, 2013, том 449, № 5, с. 598–600
«Обская болезнь» – недооцененная опасность В.А. Мордвинов, Д.П. Фурман Наука в России, 2013, №3(195), стр. 15-21
Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Sommer B., Kormeier B., Demenkov P., Arrigo P., Hippe K., Ates O., Kochetov A.V., Ivanisenko V., Kolchanov N.A., Hofestaedt R. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, 11. 1. 1340005.
Introductory note for BGRS-2012 special issue Kolchanov N.A., Orlov Y.L. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, Vol. 11, No. 1: 1302001.
Modeling of plant embryo morphodynamics at early developmental stages S. V. Nikolaev, N. A. Kolchanov, S. K. Golushko, J. -C. Palauqui, A. Urban, E. V. Amelina, A. V. Yurchenko, K. S. Golushko, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, A. Trubuil Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2013, May 2013, Volume 3, Issue 3, pp 176-183
Main Properties and Evolutionary Features of Antifreeze Proteins. L. L. Bildanova, E. A. Salina, V. K. Shumny Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2013, Vol. 3, No. 1, pp. 66–82
Abundances of microRNAs in human cells can be estimated as a function of the abundances of YRHB and RHHK tetranucleotides in these microRNAs as an ill-posed inverse problem solution Ponomarenko MP, Suslov VV, Ponomarenko PM, Gunbin KV, Stepanenko IL, Vishnevsky OL, Kolchanov NA Frontiers in Genetics, 2013, , 4, 122
PЕПЛИКАЦИЯ CУБГЕНОМНОГО PЕПЛИКОНА ВИPУCА ГЕПАТИТА C В ПPИCУТCТВИИ ИНГИБИТОPОВ NS3-ПPОТЕАЗЫ: CТОXАCТИЧЕCКАЯ МОДЕЛЬ Н.В. Иваниcенко, Е.Л. Мищенко, И.P. Акбеpдин, П.C. Деменков, В.А. Лиxошвай, К.Н. Козлов, Д.И. Тодоpов, М.Г. Cамcонова, А.М. Cамcонов, Н.А. Колчанов, В.А. Иваниcенко МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОФИЗИКА, 2013, БИОФИЗИКА, 2013, том 58, вып. 5, c. 758–774
Accuracy of protein allergenicity prediction can be improved by taking into account data on allergenic protein discontinuous peptides. Bragin AO, Demenkov PS, Kolchanov NA, Ivanisenko VA. Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics, 2013, 31(1):59-64.
Detection of Renal Tissue and Urinary Tract Proteins in the Human Urine after Space Flight. Pastushkova L.Kh, Kireev R.S., Kononikhin A.S., Tiys E.S., Popov I.A., Starodubtseva N.L., Dobrokhotov I.V., Ivanisenko V.A., Larina I.M., Kolchanov N.A., Nikolaev E.N. PloS One, 2013, V8, e71652
Из личного дела описторхов В.А. Мордвинов, Д.П. Фурман Наука из первых рук, 2013, №2, стр. 70-79
Adult Opisthorchis felineus major protein fractions deduced from transcripts: Comparison with liver flukes Opisthorchis viverrini and Clonorchis sinensis. Pomaznoy M., Tatkov S., Katokhin A., Afonnikov D., Babenko V., Furman D., Brusentsov I., Belavin P., Najakshin A., Guselnikov S., Vasiliev G., Sivkov A., Prokhortchouk E., Skryabin K., Mordvinov V. EXP PARASITOL, 2013, 135, 297-306. doi:10.1016/j.exppara.2013.07.011
Effect of vasopressin on the expression of genes for key enzymes of hyaluronan turnover in WAG and Brattleboro rat kidneys. Ivanova LN, Babina AV, Baturina GS, Katkova LE. EXP PHYSIOL, 2013, Exp Physiol. 2013 Nov;98(11):1608-19. doi: 10.1113/expphysiol.2013.073163. Epub 2013 Aug 16.
Модель регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега Arabidopsis thaliana С. В. Николаев, У. С. Зубаирова, А. В. Пененко, Э. Д. Мелснесс (E. D. Mjolsness), Б. Е. Шапиро (B. E. Shapiro), Н. А. Колчанов Doklady Akademii Nauk, 2013, том 452, № 3, с. 336–338
Создание и изучение сорта яровой мягкой пшеницы "Памяти Майстренко" с интрогрессией генетического материала от синтетического гексаплоида Triticum timopheevii Zhuk. x Aegilops tauschii Coss. Лайкова Л.И., Белан И.А., Бадаева Е.Д., Россеева Л.П., Шепелев С.С., Шумный В.К., Першина Л.А. RUSS J GENET+, 2013, т.49, №1, с. 103-112
Enhanced Differential Evolution Entirely Parallel Method for Biomedical Applications Konstantin Kozlov, Nikita Ivanisenko, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov, Maria Samsonova, Alexander M. Samsonov Lect Notes Comput Sci, 2013, Lecture Notes in Computer Science Volume 7979, 2013, pp 409-416
Молекулярные механизмы взаимодействия белков CrmB вируса оспы коров и вируса натуральной оспы с фактором некроза опухолей человека Иванисенко Н.В., Трегубчак Т.В., Сайк О.В., Иванисенко В.А., Щелкунов С.Н., Колчанов Н.А. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2013, Т. 8. № 2. С. 467–479.
Model of Structuring the Stem Cell Niche in Shoot Apical Meristem of Arabidopsis thaliana S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, E. D. Mjolsness, B. E. Shapiro, and Academician N. A. Kolchanov Doklady Biological Sciences, 2013, Vol. 452, pp. 316–319
Detection of Regulatory SNPs in Human Genome Using ChIP-seq ENCODE Data Leonid O. Bryzgalov, Elena V. Antontseva, Marina Yu. Matveeva, Alexander G. Shilov, Elena V. Kashina, Viatcheslav A. Mordvinov, Tatyana I. Merkulova PloS One, 2013, Volume 8, Issue 10, e78833
Изучение симбиотических признаков – нодуляции и азотфиксации – у районированных сортов и перспективных линий гороха (Pisum Sativum L.) при выращивании растений на двух фонах питания азотом Л.В. Омельянюк, К.К. Сидорова, В.К. Шумный Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Т. 17, № 3, С. 202-207
Auxins: Biosynthesis, Metabolism, and Transport Rozov S.M., Zagorskaya A.A., Deineko E.V., Shumny V.K. Biology Bulletin Reviews, 2013, v. 3, №4, p. 286-295
Auxin: Regulation and Its Modulation Pathways Rozov S.M., Zagorskaya A.A., Deineko E.V., Shymny V.K. Biology Bulletin Reviews, 2013, v. 3. №6. p. 423-430
Dioxin-mediated regulation of genes involved in cytokines production by macrophages. E.V.Kashina, D.Y. Oshchepkov, E.V.Antontseva, E.A. Oshchepkova, M.Y. Shamanina, D.P. Furman and V.A. Mordvinov. FEBS J, 2013, 280 (Suppl. 1) p. 459–460
Сравнительная характеристика гибридных линий Triticum aestivum/Triticum durum и Triticum aestivum/Triticum dicoccum по геномному составу и устойчивости к грибным болезням в различных экологических условиях И.Н. Леонова, Е.Б. Бадаева, О.А. Орловская, М.С. Родер, Л.В. Хотылева, Е.А. Салина, В.К. Шумный RUSS J GENET+, 2013, т.49, №11, с. 1276-1283
ХАРАКТЕРИСТИКА ПУРОИНДОЛИНОВ В КОНТРОЛЕ ТЕКСТУРЫ ЭНДОСПЕРМА У ЛИНИЙ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ С ЗАМЕЩЕНИЕМ ХРОМОСОМ 5Й ГОМЕОЛОГИЧЕСКОЙ ГРУППЫ Л. В. Обухова, Т. Т. Ефремова, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2013, том 49, № 3, с. 337–342
Математическое моделирование синтеза биоэтанола и молочной кислоты термофильными бактериями рода Geobacillus М.А. Нуриддинов, Ф.В. Казанцев, А.С. Розанов, К.Н. Козлов, С.Е. Пельтек, Н.А. Колчанов, И.Р. Акбердин Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Том 17, №4/1, стр. 686-704
DNA probes for FISH analysis of C-negative regions in human chromosomes. Morozkin ES, Karamysheva TV, Laktionov PP, Vlassov VV, Rubtsov NB Methods in Molecular Biology, 2013, 2013;1039:233-42. doi: 10.1007/978-1-62703-535-4_19.
Экспрессия RT1A-молекулы главного комплекса гистосовместимости класса I в опухоли Walker 256 после трансплантации крысам Brattleboro с генетическим дефектом синтеза аргинин-вазопрессина В.И. Мельникова, И.И. Хегай, М.А. Афанасьева, Л.Н. Иванова, Л.А. Захарова. Известия РАН. Серия биологическая, 2013, Т. 40, № 1, С. 99-102.
Role of Epithelial Sodium Channel in the Realization of Homeostatic Effects of Aldosterone on the Volume of Principal Cells of Cortical Collecting Ducts in Rats after Hypoosmotic Stress N. S. Logvinenko, E. I. Solenov, and L. N. Ivanova B EXP BIOL MED+, 2013, Vol. 155, No. 5, pp. 562-564, May, 2013
Адаптационные возможности микроорганизмов соленых озер Алтайского края в условиях раннего Марса Брянская А.В., Бережной A.A., Розанов A.С., Пельтек С.E., Павлов A.K. Палеонтологический журнал, 2013
Исследование токсичности сточных вод, поступающих в Новосибирское водохранилище А.В. Брянская, С.Я. Двуреченская, А.В. Пузанов, С.Е. Пельтек Вода: химия и экология, 2013
Анализ химических элементов, ассоциированных с микробными сообществами, основанный на корреляции оптических и рентгеновских изображений А.А. Легкодымов, А.В. Брянская, Rolf Simon, В.Р. Альтапова, В.И. Кондратьев, М.Р. Машковцев, Т.Е. Алешина, Т.К. Малуп, Г.Н. Кулипанов, С.Е. Пельтек ИЗВЕСТИЯ РАН. СЕРИЯ ФИЗИЧЕСКАЯ, 2013
Оценка токсичности растворов модельных токсикантов и степени их очистки методами каталитической окислительной деструкции Брянская А.В., Таран О.П., Аюшеев А.Б., Пельтек С.Е. Монография «Каталитические, сорбционные, микробиологические и интегрированные методы для защиты и ремедиации окружающей среды», 2013
Оценка токсичности сточных вод, поступающих в Новосибирское водохранилище, и эффективность их очистки Брянская А.В., Двуреченская С.Я., Пузанов А.В., Пельтек С.Е. Монография «Каталитические, сорбционные, микробиологические и интегрированные методы для защиты и ремедиации окружающей среды», 2013
Оценка токсичности дренажных растворов Урского хвостохранилища (Кемеровская область) и степени их очистки Брянская А.В., Лазарева Е.В., Пельтек С.Е. Монография «Каталитические, сорбционные, микробиологические и интегрированные методы для защиты и ремедиации окружающей среды», 2013
Проблемы контроля качества очистки вод Брянская А.В., Пельтек С.Е. Монография «Каталитические, сорбционные, микробиологические и интегрированные методы для защиты и ремедиации окружающей среды», 2013
Исследование воспроизводимости результатов идентификации микроорганизмов с помощью МАЛДИ времяпролетной масс-спектрометрии в зависимости от условий культивирования на примере Geobacillus stearothermophilus Старостин К.В., Демидов Е.А, Розанов А.С., Малуп Т.К., Шеховцов С.В., Брянская А.В., Пельтек С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013
Выделение и исследование свойств бактерий термальных источников Северного Прибайкалья, обладающих липолитической активностью Сорокина К.Н., Брянская А.В., Розанов А.С., Пельтек С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013
Биотехнологический потенциал новой технической культуры – мискантус сорт сорановский Слынько Н.М., Горячковская Т.Н., Шеховцов С.В., Банникова С.В., Бурмакина Н.В., Старостин К.В.,Розанов А.С., Нечипоренко Н.Н.,Вепрев С.Г., Шумный В.К., Колчанов Н.А., Пельтек С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, ТОМ 17, № 4/1, С. 202 - 208
Исследование биоразнообразия микроводорослей Западной Сибири для применения в процессах получения биотоплива третьего поколения/ Пилигаев А.В., Брянская А.В., Сорокина К.Н., Демидов Е.А., Кукушкин Р.Г., Колчанов Н.А., Пармон В.Н., Пельтек С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Т. 17. - № 2. – С. 202-210
ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ И ФИЛОГЕОГРАФИЯ КИТАЙСКОГО ПЕЧЕНОЧНОГО СОСАЛЬЩИКА (Clonorchis sinensis, Cobbold, 1875) НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ И.И. Брусенцов, И.В. Брусенцова, А.В. Катохин, В.В. Беспрозванных, Н.Н. Семенченко, А.Э. Сазонов, В.А. Мордвинов Вестник ТГУ, 2013, 3(23)
Исследование реакции свободной иммунодиффузии в каналах микрофлюидного модуля Пельтек С. Е., Горячковская Т. Н., Банникова С. В., Шеховцов С. В., Гольденберг Б. Г., Поташников А. К., Попик В. М. ИЗВЕСТИЯ РАН. СЕРИЯ ФИЗИЧЕСКАЯ, 2013, том 77, № 9, с. 1341-1344
Влияние повышенного потребления NaCl на транспорт ионов Na+ и K+ через плазматичекую мембрану главных клеток эпителия собирательных трубок почки крысы Иляскин А.В. Батурина.Г.С. Каткова Л.Е. Соленов Е.И. Иванова Л.Н. Doklady Akademii Nauk, 2013, 453(№ 1), с. 102–105.
Оценка онколитической активности ряда ортопоксвирусов, аденовирусов и парвовируса в отношении клеток глиом человека. Разумов И.А., Святченко В.А., Протопопова Е.В., Кочнева Г.А., Киселёв Н.Н., Губанова Н.В., Шилов А.Г., Мордвинов В.А., Нетёсов С.В., Чумаков П.М., Локтев В.Б. Вестник РАМН, 2013, №4, стр 4-8
Chromosome rearrangements in sublines of human embryonic stem cell lines hESM01 and hESM03. Karamysheva T.V., Prokhorovich M.A., Lagarkova M.A., Kiselev S.L., Liehr T., Rubtsov N.B. BioDiscovery, 2013, 2013; 7: P. 1-7
Восстановление экспрессии антигенов ГКГ класса I в опухоли WALKER 256 после трансплантации крысам Brattleboro с генетическим дефектом синтеза вазопрессина (AVP) Мельникова В.И., Хегай И.И., Шарова Н.П., Попова Н.А., Иванова Л.Н., Захарова Л.А. Российский иммунологический журнал, 2013, Т. 7, № 3, С. 293.
Программный комплекс SNP-MED для анализа влияния однонуклеотидных полиморфизмов на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, Ю.Ю. Васькин, Л.О. Брызгалов, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, М.П. Пономаренко, Д.А. Рассказов, К.В. Гунбин, И.В. Процук, И.Ю. Шутов, П.Н. Леонтьев, М.Ю. Фурсов, Н.П. Бондарь, Е.В. Антонцева, Т.И. Меркулова, Н.А. Колчанов. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, том 17, №4/1, с.577-588
Из личного дела описторхов В.А. Мордвинов, Д.П. Фурман Новые технологии в медицине, 2013, Новосибирск: ИНФОЛИО, 128 с., стр. 80-89.
ОЦЕНКА ПО ТЕХНОЛОГИИ rSNP_Guide SNPs ПРОМОТОРОВ ГЕНОВ АРС И МLH1 ЧЕЛОВЕКА, СВЯЗАННЫХ С РАКОМ ТОЛСТОГО КИШЕЧНИКА Д.А. Рассказов, Е.В. Антонцева, Л.О. Брызгалов,М.Ю. Матвеева, Е.В. Кашина, П.М. Пономаренко, Г.В. Орлова, М.П. Пономаренко, Д.А. Афонников, Т.И. Меркулова Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Том 17, No 4/1, 589-598
Role of Opisthorchis felineus in the induction of bile duct cancer in experimental opisthorchiasis Maksimova G. A., Zhukova N. A., Kashina E. V., Lvova M. N., Tolstikova T. G., Katokhin A. V., Mordvinov V. A. FEBS J, 2013, 280 (Suppl. 1) p. 395
Биоинформатический анализ генома штамма Geobacilus stearothermophilus 22, выделенного из горячего источника Гарга (Прибайкалье). Розанов А.С., Иванисенко Т.В., Брянская А.В., Шеховцев С.В., Логачева М.Д., Сайк О.В., Малуп Т.К., Деменков П.С., Горячковская Т.Н., Иванисенко В.А., Пельтек С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Т.17, С. 659-664
Компьютерный анализ структуры липаз бактерий рода Geobacillus и выявление мотивов, влияющих на их термостабильность. Сорокина К.Н., Нуриддинов М.А., Розанов А.С., Иванисенко В.А., Пельтек С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Т.17, С. 666-674
Генные сети Н.А. Колчанов, Е.В. Игнатьева, О.А. Подколодная, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Т.17, N4/2, 833-849
PR-белки с рибонуклеазной активностью и устойчивость растений к патогенным грибам. 175. Филипенко Е.А., Кочетов А.В., Kanayama Y., Малиновский В.И., Шумный В.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, 17. 326-334.
2012
Chromosomal Localization of Ribosomal and Telomeric DNA Provides New Insights on the Evolution of Gomphocerinae Grasshoppers I.E. Jetybayev, A.G. Bugrov, T.V. Karamysheva, J.P.M. Camacho, N.B. Rubtsov CYTOGENET GENOME RES, 2012, DOI: 10.1159/000341571
Telomeric DNA in chromosomes of five opisthorchid species. Zadesenets KS, Katokhin AV, Mordvinov VA, Rubtsov NB PARASITOL INT, 2012, V. 61. No. 1. P. 81-83
Distribution of repetitive DNA sequences in chromosomes of five opisthorchid species (Trematoda, Opisthorchiidae) Zadesenets KS, Karamysheva TV, Katokhin AV, Mordvinov VA, Rubtsov NB PARASITOL INT, 2012, V. 61. No. 1. P. 84-86
Comparative cytogenetics of opisthorchid species (Trematoda, Opisthorchiidae). Zadesenets KS, Katokhin AV, Mordvinov VA, Rubtsov NB PARASITOL INT, 2012, V. 61. No. 1. P. 87-89
Computer modeling of genome complexity variation trends in prokaryotic communities under varying habitat conditions Lashin S.A., Matushkin Yu.G., Suslov V.V., Kolchanov N.A. ECOL MODEL, 2012, Volume/issue:224C, pp. 124-129, doi: 10.1016/j.ecolmodel.2011.11.004
Cytochrome P450 in fluke Opisthorchis felineus: Identification and characterization. Pakharukova MY, Ershov NI, Vorontsova EV, Katokhin AV, Merkulova TI, Mordvinov VA MOL BIOCHEM PARASIT, 2012, V. 181. No. 2. P. 190–194
SitEx: a computer system for analysis of projections of protein functional sites on eukaryotic genes Irina Medvedeva, Pavel Demenkov, Nikolay Kolchanov and Vladimir Ivanisenko NUCLEIC ACIDS RES, 2012, V. 40(Database issue):D278-83.
Механизм действия и регуляция активности конститутивного репрессора фотоморфогенеза COP1. Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Шумный В.К. Физиология растений, 2012, том 59, № 2, с. 1–13
Пути поступления наночастиц в организм млекопитающих, их биосовместимость и клеточные эффекты. Подколодная О. А., Игнатьева Е. В. , Подколодный Н. Л. , Колчанов Н. А. . Успехи современной биологии, 2012, Т. 132, № 1, с. 3–15
Спаривание хромосом у пшенично-ржаных гибридов ABDR зависит от паттерна микроспорогенеза Силкова О.Г., Адонина И.Г., Красилова Н.М., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2012, Т.48. №6. С.592-598.
Получение высокоморозостойких форм пшенично-пырейных гибридов Размахнин Е.П., Размахнина Т.М., Козлов В.Е., Гордеева Е.И., Гончаров Н.П., Галицын Ю.Г., Вепрев С.Г., Чекуров В.М. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т. 16, №1. C.240-249.
Визуализация хромосомоспецифичных последовательностей ДНК при проведении FISH микродиссекционных ДНК-проб с метафазными хромосомами. А.Г. Богомолов, К.С. Задесенец, Т.В. Карамышева, Н.Л. Подколодный, Н.Б. Рубцов Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, No 2, Том 16, с. 348-358
Phylogeny of Siberian species of Carex sect. Vesicariae based on nuclear and plastid markers Shekhovtsov S.V., Shekhovtsova I.N., Peltek S.E. NORD J BOT, 2012, V. 30 Issue 3. P. 343-351
SPF-виварий: научно-технологический комплекс для исследований в области нанобиобезопасности Пельтек С.Е., Мошкин М.П., Герлинская Л.А., Горячковская Т.Н., Банникова С.В., Подколодная О.А, Попик В.М., Колчанов Н.А. Нанотехнологии Экология Производство, 2012, №2 (15) март 2012 http://www.nanoprom.net/journal/archive/15.html\
Исследование распределения элементов между компонентами системы солёного озера методом РФА СИ Лазарева Е.В., Брянская А.В., Таран О.П., Колмогоров Ю.П., Малуп Т.К, Пельтек С.Е., Жмодик С.М. Поверхность. Рентгеновские, синхротронные и нейтронные исследования, 2012, т. 12, 70-80
Компьютерный анализ метагеномных данных – предсказание количественной величины специфической активности белков Иванисенко В. А., Деменков П. С., Пинтус С. С., Иванисенко Т. В., Подколодный Н. Л., Иванисенко Л. Н., Розанов А. С., Брянская А. В., Кострюкова Е. С., Левицкий С. А., Селезнева О. В., Чукин М. М., Ларин А. К., Кондратов И. Г., Лазарев В. Н., Пельтек С. Е., Говорун В. М., Колчанов Н. А. Doklady Akademii Nauk, 2012, 443(2), 248-252
Comparison of propagation of atrial excitation with the cardiopotential distribution on the body surface of hypertensive rats. Svetlana Smirnova, Lyudmila Ivanova, Arkady Markel, Irina Roshchevskaya, Michail Roshchevsky. ANADOLU KARDIYOL DER, 2012, 2012 May 1; 12(3):
Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA. ANN BOT-LONDON, 2012, 110 (2): 349-360.
Основные свойства и особенности эволюции антифризных белков. Бильданова Л.Л., Салина Е.А., Шумный В.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т.16, №1 С.250-270.
Биология теломер млекопитающих Н.С. Жданова, Ю.М. Минина, Н.Б. Рубцов Molecular Biology, 2012, Т. 46., № 4., С. 539-555
Особенности экспрессии генов Egf и Egfr в ткани почки гипертензивных крыс линии НИСАГ (ISIAH) Т.О. Пыльник, О.Е. Редина, С.Э. Смоленская, А.Л. Маркель, Л.Н. Иванова. , 2012, Т.98, № 3, с. 69-76.
Extraction of quantitative characteristics describing wheat leaf pubescence with a novel image processing technique Mikhail A. Genaev, Alexey V. Doroshkov, Tatyana A. Pshenichnikova, Nikolay A. Kolchanov, Dmitry A. Afonnikov PLANTA, 2012, v.236, pp. 1943–1954
Рецензия на книгу Л.А. Лутовой, Т.А. Ежовой, И.Е. Додуевой и М.А. Осиповой “Генетика развития растений” Дейнеко Е.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2012, том 48, №6, с. 789
ICGenomics: программный комплекс анализа символьных последовательностей геномики Ю.Л. Орлов, А.О. Брагин, И.В. Медведева, К.В. Гунбин, П.С. Деменков, О.В. Вишневский, В.Г. Левицкий, Д.Ю. Ощепков, Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, И. Гроссе, Н.А. Колчанов Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Том 16, 4/1, 732-741.
ОНКОЛИТИЧЕСКИЕ ВИРУСЫ В ТЕРАПИИ ГЛИОМ Н. В. Губанова, А. С. Гайтан, И. А. Разумов, В. А. Мордвинов, А. Л. Кривошапкин, С. В. Нетесов, П. М. Чумаков Molecular Biology, 2012, том 46, №6, стр. 874-886
ПОДАВЛЕНИЕ РЕПЛИКАЦИИ СУБГЕНОМНОГО РНК РЕПЛИКОНА ВИРУСА ГЕПАТИТА С ИНГИБИТОРОМ NS3 ПРОТЕАЗЫ SCH 503034 В HUH-7 КЛЕТКАХ: СТОХАСТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ Е.Л. Мищенко, Н.В. Иванисенко, И.Р. Акбердин, П.С. Деменков, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 16(2), стр. 339-347
Применение эллипсометрии для исследования биоорганических сред Воевода М. И., Пельтек С. Е., Кручинина М. В., Курилович С. А., Кручинин В. Н., Рыхлицкий С.В., Могильников К.П. Автометрия, 2012, Автометрия. – 2011. – Т.47. - №. 5. - С.114-121.
Анализ белковых взаимодействий на основе изучения протеома мочи человека в эксперименте со 105-суточной изоляцией. Пастушкова Л.Х., Валеева О.А., Кононихин А.С., Ларина И.М., Николаев Е.Н., Попов И.А., Доброхотов И.В., Иванисенко В.А., Тийс Е.С., Колчанов Н.А. Авиакосмическая и экологическая медицина, 2012, Т. 46. № 2. С. 37-43
Реконструкция ассоциативных белковых сетей, связанных с процессами регуляции обмена и депонирования натрия в организме здорового человека на основе изучения протеома мочи. Ларина И.М., Колчанов Н.А., Доброхотов И.В., Тийс Е.С., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Валеева О.А., Пастушкова Л.Х., Николаев Е.Н. Физиология человека, 2012, т38, N3, 107-115
Селекция кормового гороха (Pisum sativum L) на повышение азотфиксации с использованием симбиотических мутантов К.К.Сидорова, А.В.Гончарова, П.Л.Гончаров, В.К.Шумный Сельскохозяйственная биология, 2012, №1, С. 105-109
Identification of the NtFZY gene family in Tobacco (Nicotiana tabacum) involved in the tryptophan-dependent auxin biosynthesis pathway. S. M. Rozov, A. A. Zagorskaya, D. N. Shcherbakov, P. A. Belavin, E. V. Deineko, V. K. Shumnyi Doklady Biochemistry and Biophysics, 2012, Volume 444. Number 1 (2012). P. 140-143.
Компьютерный анализ взаимосвязи аллергенности микроорганизмов и среды их обитания Брагин А.О., Деменков П.С., Тийс Е.С., Хофештадт Р., Иванисенко В.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, том 16 №4/1 784-790
Важная роль изменений микроРНК в эволюции Homo neanderthalensis и Homo Denisova. Гунбин К.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А., Деревянко А.П. Археология, этнография и антропология Евразии, 2012, 2012. №3(51):22-30.
Николай Иванович Вавилов - год 2012 Шумный В.К., Захаров И.К., Гончаров Н.П. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, Т.16, №3. С.499-501.
Изучение взаимодействия TBP человека с ТАТА-элементом промотора гена NOS2A с использованием метода поверхностного плазмонного резонанса И.А. Драчкова, C.В. Шеховцов, С.Е. Пельтек, П.М. Пономаренко, Т.В. Аршинова, М.П. Пономаренко, Т.И. Меркулова, Л.К. Савинкова, Н.А. Колчанов Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 2, 16, 391-396
Гиалуронидазная активность плазмы крови крыс вистар: влияние дегидратации и вазопрессина. Дзгоев С.Г., Иванова Л.Н. , 2012, т. 98, № 6, стр.777 - 781
Vasopressin: molecular mechanisms of its antidiuretic effect. Ivanova LN. Neuroscience Behavioral Physiology, 2012, v. 42, № 7, р. 661-677
Информационная поддержка исследования механизмов регуляции транскрипции: онтологический подход Подколодный Николай Леонтьевич Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 4/1, т. 16, С. 742-755
Распределенная система RESTful-web-сервисов для реконструкции и анализа генных сетей Подколодный Николай Леонтьевич Семенычев Александр Владимирович Рассказов Дмитрий Александрович Боровский Виктор Геннадьевич Ананько Елена Анатольевна Игнатьева Елена Васильевна Подколодная Наталья Николаевна Подколодная Ольга Александровна Колчанов Николай Александрович Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 4/1, Т.16, 791-798
Гетеро- и гомоплазматическое состояние районов митохондриальной и хлоропластной ДНК у потомков отдаленных гибридов мягкой пшеницы разного происхождения Трубачеева Н.В., Кравцова Л.А., Девяткина Э.П., Ефремова Т.Т., Синявская М.Г., Шумный В.К., Першина Л.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, том 12, №1, С. 160-169
Heteroplasmic and homoplasmic states of mitochondrial and chloroplast DNA regions in progenies of distant common wheat hybrids of different origins Trubacheeva N.V., Kravtsova L.A., Devyatkina E.P., Efremova T.T., Sinyavskaya M.G., Shumny V.K., Pershina L.A. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, V.2, №6, P. 494-500
ANDVisio: a new tool for graphic visualization and analysis of literature mined associative gene networks in the ANDSystem P.S. Demenkov, T.V. Ivanisenko, N.A. Kolchanov, V.A. Ivanisenko In Silico Biology, 2012, 11(3), 149-161
Контекстные характеристики ДНК, значимые для ее повреждения ультрафиолетовым лазерным излучением с длиной волны 193 нм Н.Н. Втюрина, С.Л. Гроховский, А.Б. Васильев, И.И. Титов, П.М. Пономаренко, М.П. Пономаренко, С.Е. Пельтек, Ю.Д. Нечипуренко, академик Н.А. Колчанов Doklady Akademii Nauk, 2012, 2, 447, 217-222.
Моделирование морфодинамики на ранних стадиях эмбриогенеза растения Николаев С.В., Колчанов Н.А., Голушко С.К., Палаки Ж.-К., Урбан О., Амелина Е.В., Юрченко А.В., Голушко К.С., Зубаирова У.С., Пененко А.В., Трубюй А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, том 16, №4/1, С. 805-815
A comparative study of cell-free apoptotic and genomic DNA using FISH and massive parallel sequencing Morozkin E.S., Loseva E.M., Morozov I.V., Kurilshikov A.M., Bondar A.A., Rykova E.Yu., Rubtsov N.B., Vlassov V.V., Laktionov, P.P. ЕXPERT OPINION ON BIOLOGICAL THERAPY, 2012, V.12, P. 11-17, 2012
Организация хромосом: 70 лет спустя. Рубцов Н.Б. Природа, 2012, 138: 36-45, 2012
ТРЕМАТОДА OPISTHORCHIS FELINEUS АКТИВИРУЕТ ЭКСПРЕССИЮ ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ С/EBPβ И REL В МАКРОФАГЕ ЛЬВОВА М.Н., КАШИНА Е.В., ШИЛОВ А.Г., РАЗУМОВ И.А., КАТОХИН А.В., МОРДВИНОВ В.А. Медицинский академический журнал, 2012, Приложение МАТЕРИАЛЫ II ВСЕРОССИЙСКОЙ НАУЧНОЙ КОНФЕРЕНЦИИ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ «ПРОБЛЕМЫ БИОМЕДИЦИНСКОЙ НАУКИ ТРЕТЬЕГО ТЫСЯЧЕЛЕТИЯ» 12‒14 НОЯБРЯ 2012 Г. Стр 223-225
Потенциал применения микроводорослей в качестве сырья для биоэнергетики. Сорокина К.Н., Яковлев В.А., Пилигаев А.В., Кукушкин Р.Г., Пельтек С.Е., Колчанов Н.А., Пармон В.Н. Катализ в промышленности, 2012, № 2, С. 63-72.
Влияние 2,3,7,8-тетрахлордибензо-пара-диоксина на регуляцию экспрессии IL12A, IL12B и IL4 генов человека, экспрессирующихся в макрофаге. Кашина Е.В., Ощепков Д.Ю., Антонцева Е.В., Ощепкова Е.А., Фурман Д.П., Мордвинов В.А Медицинский академический журнал, 2012, Приложение 2012. С. 380-382.
Opisthorchis felineus and Metorchis bilis are the main agents of liver fluke infection of humans in Russia. Mordvinov VA, Yurlova NI, Ogorodova LM, Katokhin AV. PARASITOL INT, 2012, 61(1):25-31
Comparative histopathology of Opisthorchis felineus and Opisthorchis viverrini in a hamster model: an implication of high pathogenicity of the European liver fluke. Lvova MN, Tangkawattana S, Balthaisong S, Katokhin AV, Mordvinov VA, Sripa B. PARASITOL INT, 2012, V. 61. No. 1. P. 167-172.
Изменения в печени сирийских хомяков, индуцированные диметилнитрозамином на фоне описторхоза Максимова Г.А., Жукова Н.А., Кашина Е.В., Львова М.Н., Катохин А.В., Толстикова Т.Г., Мордвинов В.А. Медицинский академический журнал, 2012, Т. 12, приложение, с. 160-162
Изучение нодуляции и азотфиксации у разных однолетних видов и сортов чины, род lathyrus К.К.Сидорова, Г.Д.Левко, В.К.Шумный Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 4/2, 16, 887-893
Экспериментальная модель описторхоза на хомяках (Mesocricetus auratus) Максимова Г.А., Жукова Н.А., Кашина Е.В., Львова М.Н., Катохин А.В., Толстикова Т.Г., Огородова Л.М., Каминский И.П., Сазонов А.Э., Мордвинов В. А. Бюллетень сибирской медицины, 2012, Т. 11, № 6, стр. 59-63
Microbial Diversity in Salt Lakes of Novosibirsk Region. Molecular Identification and Biotyping Bryanskaya, AV ; Rozanov, AS; Kuklin, AL; Malup, TK; Lazareva, EV; Taran, OP; Peltek, SE PALEONTOL J+(RUS), 2012
Effects of sodium diclofenac on the concentration function in animals with different neurohypophyseal status Lavrinenko VA, Babina AV, Shestopalova LV, Beizel NF, Ivanova LN B EXP BIOL MED+, 2012, Apr;152(6). – P.728-30
Computer analysis of metagenomic data--prediction of quantitative value of specific activity of proteins. Ivanisenko VA, Demenkov PS, Pintus SS, Ivanisenko TV, Podkolodny NL, Ivanisenko LN, Rozanov AS, Bryanskaya AV, Kostrjukova ES, Levizkiy SA, Selezneva OV, Chukin MM, Larin AK, Kondratov IG, Lazarev VN, Peltek SE, Govorun VM, Kolchanov NA Doklady Biochemistry and Biophysics, 2012, Mar-Apr;443:76-80.
Reconstruction of associative protein networks connected with processes of sodium exchange' regulation and sodium deposition in healthy volunteers by urine proteome analysis Larina IM, Kolchanov NA, Dobrokhotov IV, Ivanisenko VA, Demenkov PS, Tiĭs ES, Valeeva OA, Pastushkova LKh, Nikolaev EN Human Physiology, 2012, May-Jun;38(3):316-23
Система детекции биоаналитического комплекса нового поколения Сысоев Е.В., Поташников А.К., Обидин Ю.В.,Горячковская Т.Н., Базин В.С., Попик В.М., Пельтек С.Е., Колчанов Н.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, 16, No 4/1, С. 858-865
2011
Парадоксы "Проблем происхождения жизни" Колчанов Н.А., Суслов В.В. Наука в России, 2011, 5, 41-48
Подход и программные средства для описания макро- и микродинамики экосистем Тимонов В.С., Суслов В.В., Брянская А.В., Ефимов В.М., Колчанов Н.А. Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2011, Т.9. Вып. 1. С. 38-43.
Protein Structure Discovery: пакет программ для решения задач компьютерной протеомики Иванисенко В. А., Деменков П. С., Иванисенко Т. В., Колчанов Н. А. Биоорганическая химия, 2011, 2011, Т. 37, № 1, С. 22–35
Application of the ANDCell Computer System to Reconstruction and Analysis of Associative Networks Describing Potential Relationships between Myopia and Glaucoma O. A. Podkolodnaya, E. E. Yarkova, P. S. Demenkov, O. S. Konovalova, V. A. Ivanisenko, and N. A. Kolchanov Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, 2011, Vol. 1, No. 1, pp. 21–28.
Извлечение знаний из текстов научных публикаций и создание баз знаний в области нанобиотехнологии В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов Российские нанотехнологии, 2011, 2011 . Т. 6 № 7- 8, с. 14-21.
Исследование генетической гетерогенности альфа-субъединицы эпителиального натриевого канала в коре почки крысы. Н.С. Логвиненко, Ю.Э. Гербек, Л.Н. Иванова. B EXP BIOL MED+, 2011, Стр. 655-658, т.151, № 6, 2011.
From published expression and phenotype data to structured knowledge: The Arabidopsis gene net supplementary database and its applications Denis Ponomaryov, Nadezhda Omelianchuk, Victoria Mironova, Evgeny Zalevsky, Nikolay Podkolodny, Eric Mjolsness, and Nikolay Kolchanov Lecture Notes in Artificial Intelligence, 2011, 6581, 101-120
PROMEDIA – база данных химических соединений, потенциальных биомаркеров заболеваний, имеющих значение для неинвазивной диагностики Сайк О.В., Мошкин М.П., Балдин М.Н., Грузнов В.М., Козлов В.А., Самороков С.Н., Деменков П.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А. Mathematical Biology & Bioinformatics, 2011, №2, Т.6, С.250-263
Разработка методов распознования сайтов связывания транскрипционных факторов FoxA, их экспериментальная верификация и использование для анализа данных массовой иммунопреципитации хроматина Левицкий В. Г., Ощепков Д. Ю., Ершов Н. И., Брызгалов Л. О., Антонцева Е. В., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А. Doklady Akademii Nauk, 2011, Т. 436, № 3, - С.417-421.
Pattern of MHC class I and immune proteasome expression in Walker 256 tumor during growth and regression in Brattleboro rats with the hereditary defect of arginine-vasopressin synthesis Zakharova L.A., Khegai I.I., Sharova N.P.,Melnikova V.I.,Karpova Y.D., Astakhova T.M., Popova N.A., Ivanova L.N. CELL IMMUNOL, 2011, 2011. 271:385-391
Symbiogenetics and Breeding of a Macrosymbiont for Increased Nitrogen Fixation Capacity with Special Reference to the Pea (Pisum sativum L.) K.K.Sidorova, V.K.Shumny, E.Yu.Vlasova, M.N.Glyanenko, T.M.Mishchenko, G.G.Maystrenko Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, Vol. 1, No. 1, pp. 73–87
Изменение сродства ТАТА-связывающего белка к олигонуклеотидам, соответствующим ТАТА-боксам промоторов генов человека, несущим полиморфизмы, ассоциированные с наследственными заболеваниями Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, № 3, т. 15, стр. 439-447
In vitro examining the existing prognoses how TBP binds to TATA with SNP associated with human diseases Drachkova I.A., Ponomarenko P.M., Arshinova T.V., Ponomarenko M.P., Suslov V.V., Savinkova L.K., Kolchanov N.A. Health, 2011, 3, 9, 577-583
Patterns of meiosis in ABDR amphihaploids depend on the specific type of univalent chromosome division Silkova O.G., Shchapova A.I., Shumny V.K. EUPHYTICA, 2011, V.178.P. 415-426. doi: 10.1007/s10681-010-0325-6.
Мейотическая реституция у амфигаплоидов в трибе Triticeae Силкова О.Г., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2011, Т.47. № 4. С. 437-448.
Особенности передачи хромосомы ржи 2R при бэккроссировании пшенично-ржаных замещенных линий 2R(2D) различными сортами мягкой пшеницы Красилова Н.М., Адонина И.Г., Силкова О.Г. Шумный В.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Т.15.№3. С. 585-596
Регуляция объема клеток эпителия собирательных трубок почки крысы в гипотонической среде Соленов Е.И., Батурина Г.С., Иляскин А.В., Каткова Л.Е., академик Иванова Л.Н Doklady Akademii Nauk, 2011, том 436, № 1, с. 13–15
Эволюционные тренды в системах “прокариотическое сообщество” и “прокариотическое сообщество–фаг” Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Суслов В.В., Колчанов Н.А. RUSS J GENET+, 2011, т.47, №12, с. 1676–1685
Формирование хозяйственно-ценных признаков у линий гексаплоидных тритикале с интрогрессиями от видов эгилопсов в зависимости от геномного состава. И.Г. Адонина, О.А. Орловская, О.Ю. Терещенко, Л.В. Корень, Л.В. Хотылева, В.К. Шумный, Е.А. Салина RUSS J GENET+, 2011, том 47, № 4, с. 516–526.
A method for generating selective DNA probes for the analysis of C-negative regions in human chromosomes. Morozkin ES, Loseva EM, Karamysheva TV, Babenko VN, Laktionov PP, Vlassov VV, Rubtsov NB. CYTOGENET GENOME RES, 2011, 135(1):1-11
Molecular evolution of cyclin proteins in animals and fungi. Gunbin K.V., Suslov V.V., Turnaev I.I., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. BMC EVOL BIOL, 2011, 11:224
Важная роль гидрофобных взаимодействий при адаптации белков к высоким давлениям Афонников Д.А., Медведев К.Е., Гунбин К.В., Колчанов Н.А. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2011, 438(3):412–415
К нашим читателям Шумный В.К., Захаров И.К. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Т. 15. № 1. С. 5-6.
The Role of the COP1, SPA, and PIF Proteins in Plant Photomorphogenesis O. G. Smirnova, I. L. Stepanenko, V. K. Shumnyia Biology Bulletin Reviews, 2011, Vol. 1, No. 4, pp. 314–324
Влияние эмоционального стресса на экспрессию мРНК гена α-ENaC в почке гипертензивных крыс линии НИСАГ. Т.О. Пыльник, Л.С. Плетнева, О.Е. Редина, С.Э.Смоленская, А.Л. Маркель, Л.Н. Иванова. Doklady Akademii Nauk, 2011, Т. 439, № 4, с. 563–565.
Функции дельта-аминотрансферазы у растений Герасимова С.В., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2011, т.131, № 6, 531-542
Влияние диклофенака натрия на концентрирующую функцию у животных с разным нейрогипофизарным статусом. Лавриненко В.А., Бабина А.В., Шестопалова Л.В., Бейзель Н.Ф., Иванова Л.Н. B EXP BIOL MED+, 2011, № 12, т. 151, с. 671-676
Вазопрессин: молекулярные основы антидиуретического эффекта. Иванова Л.Н. Физиологический журнал, 2011, №5, т. 57, стр. 39-41
Морфологические особенности внутренней мозговой зоны почек крыс Браттлборо и Вистар в условиях блокады синтеза простагландинов. Бабина А.В., Лавриненко В.А., Шестопалова Л.В., Иванова Л.Н. B EXP BIOL MED+, 2011, №2, т. 151, стр. 234-239
Evolutionary Trends in the Prokaryotic Community and Prokaryotic Community–Phage Systems S. A. Lashin, Yu. G. Matushkin, V. V. Suslov, N. A. Kolchanov RUSS J GENET+, 2011, Vol. 47, No. 12, pp. 1487–1495.
Острая иммуно-физиологическая реакция мышей разных генотипов на поступление наночастиц SiO2 (Таркосил 25) в верхние дыхательные пути Мошкин М.П., Пельтек С.Е., Герлинская Л.А., Горячковская Т.Н., Концевая Г.В., Масленникова С.О., Попик В.В., Колчанов Н.А. Российские нанотехнологии, 2011, 6 (9-10): 47-54
A Study of a One-Dimensional Model of Regulation of the Renewing Zone Size in a Biological Tissue Accounting for Cell Division S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, S. I. Fadeev, E. Mjolsness, N. A. Kolchanov Journal of Applied and Industrial Mathematics, 2011, Vol. 5, No. 4, pp. 1–14.
Сибирский центр генетических ресурсов – три года спустя Колчанов Н.А., Мошкин М.П., Сагдеев Р.З., Шумный В.К. Наука из первых рук, 2011, N 2, с.76-89.
Comparative Study of Extracellular DNA by FISH Morozkin E.S., Loseva E.M., Mileiko V.A., Zadesenets K.S., Rubtsov N.B., Vlassov V.V., Laktionov V.V. Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum, 2011, P. 143-146.
Роль белков COP1, SPA и PIF в регуляции фотоморфогенеза растений Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2011, Т.311, 1. С.3-15
Morphological characteristics of the inner medullary zone in the kidneys of Brattleboro and Wistar rats during blockade of prostaglandin synthesis Babina A.V., Lavrinenko V.A., Shestopalova L.V., Ivanova L.N. B EXP BIOL MED+, 2011, Vol. 151. – № 2. – PP. 268-272
Protein Structure Discovery: software package to perform computational proteomics tasks Ivanisenko VA, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Kolchanov NA RUSS J BIOORG CHEM+, 2011, Jan-Feb;37(1):22-35.
2010
Использование компьютерной системы ANDCell для реконструкции и анализа ассоциативных сетей потенциальных механизмов взаимосвязи миопии и глаукомы О.А.Подколодная, Е.Э. Яркова, П.С.Деменков, О.С.Коновалова,. В.А.Иванисенко, Н.А.Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14, № 1. — С. 106–115.
Использование симбиотических мутантов гороха для повышения нодуляции и азотфиксации К. К. Сидорова, В. К. Шумный, А. В. Гончарова, П. Л. Гончаров Doklady Akademii Nauk, 2010, 3, 434, 427–429
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учётом деления клеток Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И., Мйолснесс Э., Колчанов Н.А. Сибирский журнал индустриальной математики, 2010, том 13, № 4 (44) С. 70-82
Исследование состава внеклеточной ДНК в культуре клеток человека с помощью FISH Е.С. Морозкин, Е.М. Лосева, К.С. Задесенец, Н.Б. Рубцов, В.В. Власов, П.П. Лактионов Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2010, Том 8, выпуск 1, стр. 3-10.
Молекулярная филогения видов моллюсков семейства Bithyniidae на основе митохондриальных и ядерных последовательностей Романов К.В., Балышева В.И., Катохин А.В., Мордвинов В.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Том 275 C. 391-395
Молекулярно-цитогенетический анализ двух новых de novo возникших сверхчисленных маркерных хромосом, выявленных при пренатальной диагностике. Карамышева Т.В., Лукаш Е.Н., Гилярова М.В., Базанов П.А., Василькова Н.Ю.,Сосницкая С.В., Морозкин Е.С., Лактионов П.П., Рубцов Н.Б. Медицинская генетика, 2010, №2,стр.38-41
Мономорфность изоферментных локусов в природных и культивируемых популяциях амаранта (Amaranthus L.) Р. С. Юдина, А. В. Железнов, В. К. Шумный CYTOL GENET+, 2010, № 6. С.32-39
Новая форма Мискантуса Китайского (Веерника Китайского miscanthus sinensis anders.) как перспективный источник целлюлозосодержащего сырья Шумный, С.Г. Вепрев, Н.Н. Нечипоренко, Т.Н. Горячковская, Н.М. Слынько, Н.А. Колчанов, С.Е. Пельтек Информационный вестник ВОГИС, 2010, том 14, №1, стр. 122-126
A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2010, 4, 65, 143-145
Особенности организации Т-ДНК-встройки у трансгенных растений табака линии Nu 21 Логинова Д.Б., В.К. Шумный, Е.В. Дейнеко Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14. - №1. - С. 659- 665.
Особенности строения центромерных районов политенных хромосом хирономид (Diptera, Chironomidae) Голыгина В.В., Кикнадзе И.И., Брошков А.Д., Карамышева Т.В., Рубцов Н.Б. Информационный вестник ВОГИС, 2010, 14(4): 622 – 631
Особенности формирования цитомиктических каналов в материнских клетках пыльцы Nicotiana tabacum L Мурсалимов С.Р., Байбородин С.И., Сидорчук Ю.В., Шумный В.К., Дейнеко Е.В. CYTOL GENET+, 2010, Т. 44. №1. С. 19-24
Поиск возобновляемых источников целлюлозы для многоцелевого использования Шумный В.К., Н.А. Колчанов, Г.В. Сакович, В.Н. Пармон, С.Г. Вепрев, Н.Н. Нечипоренко, Т.Н. Горячковская, А.В. Брянская, В.В. Будаева, А.В. Железнов, Н.Б. Железнова, В.Н. Золотухин, Р.Ю. Митрофанов, А.С. Розанов, К.Н. Сорокина, Н.М. Слынько, В.А. Яковлев, Информационный вестник ВОГИС, 2010, № 3. Т. 14. С. 569-578
Полиморфизмы ТАТА-боксов генов хозяйственно важных и лабораторных животных и растений, ассоциированные с их селекционно-ценными признаками Суслов В.В., Пономаренко П.М, Пономаренко М.П, Драчкова И.А., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К., Колчанов Н.А. RUSS J GENET+, 2010, 4, 46, 448-457
Профессор Ия Ивановна Кикнадзе: к 80-летию со дня рождения и к 55-летию научно-педагогической деятельности Захаров И.К., Колчанов Н.А., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14. № 1. С. 11-21.
Cross-hybridization of repetitive sequences from the pericentric heterochromatic region of Chorthippus apricarius (L.) with the chromosomes of grasshoppers from the Gomphocerini tribe Jetybayev I.E., Karamysheva T.V., Bugrov A.G., Rubtsov N.B. EUROA Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 433–436 + III
Роль различных метаболитов в формировании стрессоустойчивости растений Ибрагимова С.С., В.В. Горелова, А.В. Кочетов, В.К. Шумный Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2010, т.8, вып.3, с.98-103
Роль экстраклеточных рибонуклеаз в физиологических процессах высших растений Сангаев С.С., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Левенко Б.А., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, №2, т.14, с.232-242
Симбиогенетика и селекция макросимбионта на повышение азотфиксации на примере гороха (Pisum sativum L.) К.К.Сидорова, В.К.Шумный, Е.Ю.Власова, М.Н.Гляненко, Т.М.Мищенко, Г.Г.Майстренко Информационный вестник ВОГИС, 2010, 2, 14, 357-374
Сравнительный FISH анализ С-позитивных блоков прицентромерных районов хромосом малых лесных мышей Sylvaemus uralensis (Rodentia, Muridae) Т. В. Карамышева, А. С. Богданов, И. В. Картавцева, Т. В. Лихошвай, М. Н. Бочкарёв, Н. Е. Колчева, В. В. Марочкина, Н. Б. Рубцов Информационный вестник ВОГИС, 2010, т.46. №6. 1-12
Сравнительный анализ кариотипов Opisthorchis felineus из Западной Сибири Поляков А.В., Катохин А.В., Бочарова Т.А., Романов К.В., Львова М.Н., Бонина О.М., Юрлова Н.И., Мордвинов В.А. Cибирский экологический журнал, 2010, Т. 1. С. 3-6.
Структура длинных теломер в хромосомах бурозубки иберийской Н. С. Жданова, Ю. М. Минина, Т. В. Карамышева, Н. Б. Рубцов, Ж.-А. Лондоно-Валледжо Информационный вестник ВОГИС, 2010, 9, 46, 1084–1086
Тетраплоидная рожь: эндогенная изменчивость псевдосовместимости Попова И.С., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14. - № 1. С. - 155 - 164
Точное уравнение равновесия для четырех шагов связывания ТВР с ТАТА-боксом для предсказания фенотипической экспрессии при мутациях Пономаренко П.М., Суслов В.В.,Савинкова Л.К., Пономаренко М.П.,Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2010, 3, 55, 400-414
Цитогенетик, доктор биологических наук Антонина Ивановна Щапова: к 80-летию со дня рождения и к 60-летию начала трудовой деятельности Захаров И.К., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14. № 4. С. 603-611.
Экспериментальная проверка функциональной активности потенциальных DRE-сайтов, обнаруженных в промоторах IRF1, REL и IL12A генов человека Е.В. Кашина, Е.В. Антонцева, М.Ю. Шаманина, Е.А. Ощепкова, Д.Ю. Ощепков, А.В. Катохин, А.Ю. Гришанова, Д.П. Фурман, В.А. Мордвинов Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, Том 275. С. 353-356.
Эффективность связывания TBP c промотором ARF-генов растений коррелирует с характером влияния ARF белков на транскрипцию (активатор/репрессор) В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, П.М. Пономаренко, М.П. Пономаренко, Н.А. Колчанов Doklady Biochemistry and Biophysics, 2010, 4, 433, 549–554
Expression and molecular characterization of the Mycobacterium tuberculosis PII protein Bandyopadhyay A, Arora A, Jain S, Laskar A, Mandal C, Ivanisenko VA, Fomin ES, Pintus SS, Kolchanov NA, Maiti S, Ramachandran S. J BIOCHEM, 2010, 147(2):279-89.
A new form of Miscanthus (Chinese silver grass, Miscanthus sinensis - Andersson) as a promising source of cellulosic biomass Vladimir K. Shumny, Sergey G.Veprev, Nikolay N. Nechiporenko, Tatiana N. Goryachkovskaya, Nikolay M. Slynko, Nikolay A. Kolchanov, Sergey E. Peltek. Advances in Bioscience and Biotechnology, 2010, Vol.1 No.3, PP.167-170
Human embryonic stem cell lines isolation, cultivation, and characterization Lagarkova MA, Eremeev AV, Svetlakov AV, Rubtsov NB, Kiselev SL. IN VITRO CELL DEV-AN, 2010, V.46, 3-4, 284-293,
A plausible mechanism for auxin patterning along the developing root Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Yosiphon G, Fadeev S.I., Kolchanov N.A., Mjolsness E., Likhoshvai V.A. BMC SYST BIOL, 2010, 4:98 2010
Генная сеть активации макрофага: участие ксенобиотков в регуляции экспрессии генов цитокинов. Ощепкова Е.А., Ощепков Д.Ю., Кашина Е.В., Антонцева Е.В., Фурман Д.П., Мордвинов В.А. Цитокины и воспаление, 2010, Т.9, №3, с.49.
Presence of harmless small supernumerary marker chromosomes hampers molecular genetic diagnosis: a case report H Nelle, I Schreyer, Elisabeth Ewers, K Mrasek, N Kosyakova, Martina Merkas, Ahmed Basheer Hamid, R Fahsold, A Ujfalusi, J Anderson, N Rubtsov, A Küchler, F von Eggeling, J Hentschel, A Weise, T Liehr. MOL MED REP, 2010, 3: 571-574
SNPs in the HIV-1 and HIV-2 TATA Box and the AIDS pandemic Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Savinkova L.K., Ponomarenko P.M., Efimov V.M., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2010, 3, 8, 607-625.
Supernumerary chromosomes as markers of population structure evolution in the grasshopper Eyprepocnemis plorans Charpantier, 1825 (Orthoptera, Acrididae) Dzubenko V.V., Bugrov A.G., Jetybayev I.E., Rubtsov N.B. Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 437–440 + IV
The complete mitochondrial genomes of the liver flukes Opisthorchis felineus and Clonorchis sinensis (Trematoda). Shekhovtsov SV, Katokhin AV, Kolchanov NA, Mordvinov VA. PARASITOL INT, 2010, V. 59. No. 1. P. 100–103
The Digenea Parasite Opisthorchis felineus: a Target for the Discovery and Development of Novel Drugs Mordvinov V.A., Furman D.P. Infect Disord Drug Targets, 2010, V. 10. No. 5. P. 385-401
The Structure of Long Telomeres in Chromosomes of the Iberian Shrew Zhdanova N.S., Minina Yu.M., Karamisheva T.V., Rubtsov N.B., Londono-Vallejo J-A. RUSS J GENET+, 2010, N.9, V. 46., P: 1222-1225
Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R J INTEGR BIOINFORM, 2010, 7(1):148. doi: 10.2390/biecoll-jib-2010-148
Анализ запасных белков (проламинов, пуроиндолинов и Waxy) у линий мягкой пшеницы Triticum aestivum L. x (Triticum timopheevii Zhuk. x Triticum tauschii) с комплексной устойчивостью к грибным инфекциям Обухова Л.В., Лайкова Л.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2010, №6, Т. 46, стр. 764-768
Кросс-гибридизация повторенных последовательностей ДНК прицентромерного гетерохроматина Chorthippus apricarius (L.) с хромосомами саранчовых трибы Gomphocerini. Джетыбаев И. Е., Карамышева Т.В., Бугров А.Г., Рубцов Н.Б Евразиатский энтомологический журнал, 2010, Т. 9, №3 стр. 433-436
Добавочные хромосомы как маркёры формирования популяционной структуры плавучей кобылки Eyprepocnemis plorans Charpantier, 1825 (Orthoptera, Acrididae) Дзюбенко В.В., Бугров А.Г., Джетыбаев И.Е., Рубцов Н.Б. Евразиатский энтомологический журнал, 2010, Т. 9, №3 стр. 437-440
Влияние полиморфизмов ТАТА-бокса промотора гена бета-глобина человека, ассоциированный с бета-талассемией, на взаимодействие ТАТА-связывающего белка Драчкова И.А., Аршинова Т.В., Пономаренко П.М., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А., Савинкова Л.К. Информационный вестник ВОГИС, 2010, т.14, с. 698-705
ДНК-диагностика микст-инвазий Opisthorchis felineus и Metorchis bilis с помощью метода ПЦР Брусенцов И.И., Катохин А.В., Сахаровская З.В., Сазонов А.Э., Огородова Л.М., Федорова О.С., Колчанов Н.А., Мордвинов В.А. Медицинская паразитология и паразитарные болезни, 2010, №2. С. 10-13.
Исследование запасных белков у интрогрессивных линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L. х Triticum timopheevi Zhuk.), устойчивых к листовой ржавчине Л. В. Обухова, Е. Б. Будашкина, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2009, т.45, №3, с. 313-321
Математическая модель внутриклеточного размножения вируса гриппа С.И. Бажан, Н.А. Кашеварова (Ри), Т. М. Хлебодарова, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов BIOPHYSICS, 2009, Т.54, № 6, С.1066-1080
Математическое моделирование действия потенциальных противовирусных препаратов на репликацию субгеномного репликона вируса гепатита С в клетке Е.Л. Мищенко, K.Д. Безматерных, В.А. Иванисенко, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2009, №1, Том 13, 208-218
Chromosomal differentiation among bisexual European species of Saga (Orthoptera: Tettigoniidae: Saginae) detected by both classical and molecular methods Warchloska-Sliiva, B. Grzywacz, A. Maryanska-Nadachwska, T.V. Karamysheva, N.B. Rubtsov and D. P. Chobanov EUR J ENTOMOL, 2009, 106: 1–9
Межлинейные различия в социальном доминировании и паттернах агонистического поведения у самцов лабораторных мышей Осадчук Л.В., Брагин А.В., Осадчук А.В. Журнал высшей нервной деятельности, 2009, № 3, Т. 59, С. 322-330
Механизмы возникновения и эволюции В-хромосом у восточноазиатских мышей Apodemus peninsulae (Mammalia, Rodentia) Н. Б. Рубцов, Ю. М. Борисов, Т. В. Карамышева, М. Н. Бочкарев RUSS J GENET+, 2009, том 45, № 4, С. 449-457
Молекулярно-цитогенетическое изучение днк прицентромерного гетерохроматина хромосомы 2l у малярийного комара Anopheles beklemishevi (Culicidae, Diptera) Сайджафарова А.О., Артемов Г.Н., Карамышева Т.В., Рубцов Н.Б., Стегний В.Н. RUSS J GENET+, 2009, Т. 45. № 1. С. 59-63
Молекулярно-цитогенетическое исследование маркерных хромосом у двух пациентов с нарушением репродуктивной функции Зотова Н.В., Маркова Е.В., Тимофеева И.Ю., Казанцева О.М., Светлаков А.В., Рубцов Н.Б., Карамышева Т. Медицинская генетика, 2009, №2,стр.37-42
Особенности районов встраивания Т-ДНК у трансгенных растений Филипенко Е.А., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2009, №11, том 45. С.1477-1491.
Особенности регуляции мейотической реституции у андрогенных гаплоидов пшенично-ржаных замещенных линий 2R(2D)1, 2R(2D)3, 6R(6A) (T. aestivum L. сорт Саратовская 29 /S. cereale L. сорт Онохойская) Силкова О.Г., Добровольская О.Б., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2009, Т.45. №9. С.1211-1246.
Поиск высокомолекулярных субъединиц глютенина Triticum timopheevi Zhuk. у линий мягкой пшеницы (Triticum aestivum L. x Triticum timopheevi Zhuk.) Л. В. Обухова, Е. Б. Будашкина, В. К. Шумный RUSS J GENET+, 2009, № 9. Т.45. С. 1292-1295
Полиморфизмы ТАТА-боксов промоторов генов человека и ассоциированные с ними наследственные патологии Cавинкова Л.К., Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Колчанов Н.А. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, 2, 74, 149-163
Предисловие: 200 лет со дня рождения Чарлза Дарвина Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К., Суслов В.В. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13. № 2. С. 246-248.
Предсказание влияния полиморфных замен нуклеотидов в ТАТА-боксах промоторов генов человека на сродство к ним ТАТА-связывающего белка Пономаренко М.П., Пономаренко П.М., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В.,Савинкова Л.К.,Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2009, 3, 43, 512-520
Симметричные территориальные условия и доминантно-субординантные отношения у самцов лабораторных мышей (Mus Musculus) в модели социального доминирования Брагин А.В., Осадчук Л.В., Осадчук А.В. ZOOL ZH, 2009, Т. 88, № 3, С. 344-356
Сравнительный анализ иммуногенности трансгенной моркови, продуцирующей S или M антигены вируса гепатита В при оральной иммунизации мышей Щелкунов С.Н., Нестеров А.Е., С.Г.Поздняков, Г.А.Щелкунова, А.А.Загорская, Е.А.Филипенко, Н.В.Пермякова, Л.Д.Позднякова, В.В.Власов, В.К.Шумный, Е.В.Дейнеко Российский иммунологический журнал, 2009, Т. 3(12), № 3-4. С. 235-245
Сравнительный анализ кариотипов Opisthorchis felineus из Западной Сибири Поляков А.В., Катохин А.В., Бочарова Т.А., Романов К.В., Львова М.Н., Бонина О.М., Юрлова Н.И., Мордвинов В.А. Сибирский экологический журнал, 2009, Т. 1. С. 3-6.
Учёный и селекционер Иван Васильевич Чёрный (23.05.1934-11.09.2009) Шумный В.К., Колчанов Н.А., Ефименко А.В., Захаров И.К. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13. № 4. С. 865-874.
Цитокины: биологические свойства и регуляция экспрессии гена интерлейкина-5 человека В.А. Мордвинов, Д.П. Фурман Информационный вестник ВОГИС, 2009, т.13, №1, стр. 53-67
Математическая модель внутриклеточного размножения вируса гриппа Бажан С. И., Кашеварова Н. А., Хлебодарова Т. М., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2009, 54(6):1066-80
A novel nuclear marker, Pm-int9, for phylogenetic studies of Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini and Clonorchis sinensis (Opisthorchiidae, Trematoda). S.V. Shekhovtsov, A.V. Katokhin, K.V. Romanov, V.V. Besprozvannykh, K.P. Fedorov, N.I. Yurlova, E.A. Serbina, P. Sithithaworn, N.A. Kolchanov, V.A. Mordvinov PARASITOL RES, 2009, V. 106. No. 1. P. 293-297
Is there a difference between T- and B-lymphocyte morphology? Strokotov D.I., Yurkin M.A., Gilev K.V., van Bockstaele D.R., Hoekstra A.G., Rubtsov N.B., and Maltsev V.P. J BIOMED OPT, 2009, v.14(6), pp.064036-12
Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA BMC GENOMICS, 2009, V. 1, 10, 639
Adaptive evolution of genes of archaea belonging to the genus Pyrococcus associated with adaptation to life under high-pressure conditions Gunbin KV, Afonnikov DA, Boldyreva EV, Kolchanov NA Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, №1,425,91-93
Plant developmental genetics: Integrating data from different experiments in databases Omelyanchuk NA, Mironova VV, Kolchanov NA RUSS J GENET+, 2009, №11,45,1302-1316
Prediction of the affinity of the TATA-binding protein to TATA boxes with single nucleotide polymorphisms Ponomarenko PM, Ponomarenko MP, Drachkova IA, Lysova MV, Arshinova TV, Savinkova LK, Kolchanov NA Molecular Biology, 2009, №3,43,472-479
Promoters of the Genes Encoding the Transcription Factors Regulating the Cytokine Gene Expression in Macrophages Contain Putative Binding Sites for Aryl Hydrocarbon Receptor D. P. Furman, E.A. Oshchepkova, D.Yu. Oshchepkov, M.Yu. Shamanina, V.A. Mordvinov COMPUT BIOL CHEM, 2009, V. 33. №6. P. 465-468.
TATA box polymorphisms in human gene promoters and associated hereditary pathologies Savinkova LK, Ponomarenko MP, Ponomarenko PM, Drachkova IA, Lysova MV, Arshinova TV, Kolchanov NA BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2009, №2, 74, 117-129
Telomeric DNA Allocation in Chromosomes of Common Shrew (Sorex araneus, Eulipotyphla) N. S. Zhdanova, Y. I. Rogozina, Y. M. Minina, P. M. Borodin, and N. B. Rubtsov Cell and Tissue Biology, 2009, Vol. 3, No. 4, pp. 323–329
The evolution of key cell cycle proteins correlates with an increase in the complexity of eukaryotic organisms Turnaev II, Gunbin KV, Kolchanov NA Doklady Biochemistry and Biophysics, 2009, №1,426, 147-151
Агробактериальная трансформация растений: перенос фрагментов векторной ДНК в растительный геном Пермякова Н.В., Шумный В.К., Дейнеко Е.В. RUSS J GENET+, 2009, №3, том 45. С.305-317
Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2009, 4, 425, 546-548
Академик Сергей Георгиевич Инге–Вечтомов: 70 лет со дня рождения и 45 лет научной и педагогической деятельности Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13. № 2. С. 495-497.
Анализ продукции М-антигена вируса гепатита В в листьях трансгенных растений моркови Дейнеко Е.В., Загорская А.А., Поздняков С.Г., Филипенко Е.А., Пермякова Н.В., Сидорчук Ю.В., Уварова Е.А., Позднякова Л.Д., Шумный В.К., Власов В.В., Хэммонд Р.В., Щелкунов С.Н. Doklady Akademii Nauk, 2009, №3, том 425. С.400-403
Аргутинская Светлана Владимировна (7.04.1923-28.06.2009) Шумный В.К., Колчанов Н.А., Захаров И.К. Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т. 13. № 4. С. 861-864.
Влияние пола и порядка генов на частоту и распределение рекомбинационных событий в хромосоме 1 домовой мыши Торгашева А.А., Железова А.И., Рубцов Н.Б., Бородин П.М. Doklady Akademii Nauk, 2009, том 429, № 5, с. 710–712
Выявление новых DRE в регуляторной области генов человека, кодирующих компоненты цитозольного комплекса арил-гидрокарбонового рецептора Д.Ю. Ощепков, Д.П. Фурман, Е.А. Ощепкова, А.В. Катохин, М.Ю. Шаманина, В.А. Мордвинов Информационный вестник ВОГИС, 2009, Т.13. № 1. С. 46-52.
Выявление новых сайтов транскрипционных факторов SREBP в промоторных районах генов позвоночных на основе комбинации биоинформационного и экспериментального подходов Е.В. Игнатьева, Т.И. Меркулова, Д.Ю. Ощепков, Н.В. Климова, Г.В. Васильев, И.И. Турнаев, В.Ф. Кобзев, Н.А. Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2009, №1, Т.13, С.37-45
Генетика развития растений: интеграция информации из различных наблюдений и экспериментов в базах данных Омельячук НА., Миронова ВВ., Колчанов НА RUSS J GENET+, 2009, Т. 45, No. 11, pp. 1476–1492
Дарвиновская эволюция и регуляторные генетические системы В.В. Cуслов, Н.А. Колчанов Информационный вестник ВОГИС, 2009, №2, Том 13, с.410-439
Динамика ИУК и цитокининов в тканях цветков трансгенных растений табака с мутантным фенотипом Загорская А.А., Сидорчук Ю.В., Шумный В.К., Дейнеко Е.В. Физиология растений, 2009, Т. 56. №6. С. 917–925.
Изучение влияния делеции BTB/kelch –генов вируса оспы коров на некоторые характеристики инфекции in vitro Кочнева Г.В., Таранов О.С., Лупан Т.А., Юдин П.В., Рубцов Н.Б., Байбородин С.И., Колосова И.В., Щелкунов С.Н., Дроздов И.Г., Рябчикова Е.И. Вопросы вирусологии, 2009, том 45, № 4, С. 449-457
2008
Использование трансгенных растений моркови-продуцентов интерлейкина-18 человека для модуляции иммунных реакций у мышей Якушенко Е.В., Лопатникова Ю.А., Сенников С.В., Шаталина М.Н., Филипенко Е.А., Дейнеко Е.В., Воронина Е.Н., Храпов Е.А., Филипенко М.Л., Шумный В.К., Козлов В.А. Бюллетень СО РАМН, 2008, №3(131) С.70-75
Качество зерна и муки интрогрессированных линий мягкой пшеницы с генами устойчивости к листовой ржавчине от Triticum timofeevi Л.В. Обухова Е.Б. Будашкина М.Ф. Ермакова Н.П. Калинина В.К. Шумный Сельскохозяйственная биология, 2008, №5, с. 38-42
Математическое моделирование морфогенеза растений Г.Г. Лазарева, В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, И.В. Шваб, В.А. Вшивков, Д.Н. Горпинченко, С.В. Николаев, Н.А.Колчанов. Журнал вычислительной математики и математической физики, 2008, Т.11. №2., c.151-166
Микрофлюидные системы в биологии и конструирование геносенсоров С.Е. Пельтек, Т.Н. Горячковская, В.М. Попик, В.Ф. Пиндюрин, В.С. Елисеев, Б.Г. Гольденберг, М.А. Щеглов, Н.В. Тикунова, Т.М. Хлебодарова, Н.Б. Рубцов, Г.Н. Кулипанов, Н.А. Колчанов Российские нанотехнологии, 2008, Т 3 вып 9-10 , с 136-145
Онтогенез полового поведения у самцов лабораторных мышей: роль генотипа Осадчук Л.В., Саломачева И.Н., Брагин А.В., Осадчук А.В. Журнал высшей нервной деятельности, 2008, № 1, Том 58, С. 66-74.
От сохранения генетических коллекций к национальной системе хранения генофондов растений в вечной мерзлоте Гончаров Н.П., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2008, Т.12, № 4. С.509-523.
Передача генетического материала ржи в геном мягкой пшеницы методом межгеномного замещения хромосом Силкова О.Г., Щапова А.И., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2008, Т.12. № 4. С. 654-661.
Пошаговая модель связывания ТВР/ТАТА бокс позволяет предсказать наследственные заболевания человека по точечным полиморфизмам Пономаренко П.М., Савинкова Л.К., Драчкова И.А., Лысова М.В., Аршинова Т.В., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2008, 6, 419, 828-832
Преждевременный цитокинез в материнских клетках пыльцы трансгенных растений табака (Nicotiana tabacum L.) Сидорчук Ю.В., Дорогова Н.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. Cell and Tissue Biology, 2008, Т. 50. № 5. С.447-451.
Реорганизация генома тритикале Хотылева Л., Шумный В., Каминская Л., Салина Е., Леонова И., Корень Л., Орловская О. Наука и инновация, 2008, № 12, с. 26-30
Содержание микроРНК В Arabidopsis thaliana коррелирует с наличием в последовательностях тетрануклеотидов WRHW и DRYD Пономаренко М.П., Омельянчук Н.А., Катохин А.В., Савинская С.А., Колчанов Н.А Doklady Biochemistry and Biophysics, 2008, 5, 420, 703-707
Тетраплоидная рожь: динамика псевдосовместимости Попова И.С., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2008, №3, том 12, С. 378-384
Трехмерная организация интерфазных ядер фибробластов у двух близкородственных видов бурозубок, различающихся структурой терминальных районов хромосом Н.Б. Рубцов, Т.В. Карамышева, Ю.М. Минина, Н.С. Жданова Cell and Tissue Biology, 2008, №5, том 50, стр.430-438
Триппинг и семенная продуктивность у многолетних видов люцерны Medicago L Коваленко В. И., Шумный В. К. Информационный вестник ВОГИС, 2008, Т. 12. С.740-748
Эволюционный конструктор: методика и комплекс программ для моделирования эволюции трофически связанных популяций одноклеточных гаплоидных организмов Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А. Вычислительные технологии, 2008, №6, т 13, 91-101
Differences in ribosomal DNA distribution on A and B chromosomes between eastern and western populations of the grasshopper Eyprepocnemis plorans plorans M.D. Lopez-Leon, J. Cabrero, V.V. Dzyubenko, A.G. Bugrov, T.V. Karamysheva, N.B. Rubtsov, J.P.M. Camacho CYTOGENET GENOME RES, 2008, 121:260–265
Genetic algorithm and optimized weight matrix application for peroxisome proliferator response elements recognition: Prerequisites of accuracy growth for wide genome research Victor G. Levitsky, Elena V. Ignatieva, Eugenia Aman, Tatyana I. Merkulova, Nikolay A. Kolchanov, T. Charles Hodgman INTELL DATA ANAL, 2008, 12(5): 513-526
Genetic Systems of Development: Functional Dynamics and Molecular Evolution Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2008, V. 73, N 2, P. 219-230.
Recombination map of the common shrew, Sorex araneus (Eulipotyphla, Mammalia) Borodin PM, Karamysheva TV, Belonogova NM, Torgasheva AA, Rubtsov NB, Searle JB. GENETICS, 2008, Feb;178(2):621-32.
Sarai uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs Kochetov AV, Ahmad S, Ivanisenko V, Volkova OA, Kolchanov NA FEBS LETT, 2008, 9, 582, 1293-7
Small supernumerary marker chromosomes (sSMC) in humans; are there B chromosomes hidden among them Thomas Liehr, Kristin Mrasek, Nadezda Kosyakova, Caroline Mackie Ogilvie, Joris Vermeesch, Vladimir Trifonov and Nikolai Rubtsov Mol Cytogen, 2008, 1:12 (04 Jun 2008)
Web-based computational tools for the prediction and analysis of post-translational modifications of proteins. Ivanisenko V.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Methods in Molecular Biology, 2008, V. 446, P. 363-384.
TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko INTELL DATA ANAL, 2008, No. 5, Vol. 12, P. 443-461
uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs Kochetov A.V., Ahmad S., Ivanisenko V., Volkova O.A., Kolchanov N.A., Sarai A. FEBS LETT, 2008, 582. 1293-1297
Анализ структуры инсулин-зависимых регуляторных контуров зрелых адипоцитов Кузнецова Т.Н., Е.В. Игнатьева, В.А. Мордвинов, А.В. Катохин, М.Ю. Шаманина, Д.Ю. Ощепков, Н.А. Колчанов Успехи физиологических наук, 2008, Т. 39. №1. С. 3-22.
Взаимодействие двух симбиотических генов nod3 и Nod5 в одном генотипе гороха Pisum sativum L Сидорова К.К., Шумный В.К., Власова Е.Ю., Гляненко М.Н., Мищенко Т.М. Doklady Akademii Nauk, 2008, № 4, Т. 419, С. 569-571.
Генетическая регуляция деления центромерных районов унивалентных хромосом ржи и пшеницы в анафазе I мейоза ди-моносомиков Силкова О.Г., Перемыслова Е.Э., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2008, Т.44. №1.С.85-93.
Изготовление LIGA-шаблонов для создания микрофлюидных аналитических систем Гольденберг Б.Г., Горячковская Т.Н., Елисеев В.С., Колчанов Н.А., Кондратьев В.И., Кулипанов Г.Н., Попик В.М., Пельтек С.Е., Петрова Е.В., Пиндюрин В.Ф. Поверхность. Рентгеновские, синхротронные и нейтронные исследования, 2008, 8 с 1-4
2007
К 90-летию Дмитрия Константиновича Беляева (1917-1985) Трут Л.Н., Маркель А.Л., Бородин П.М., Аргутинская С.В., Захаров И.К., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, № 7. Т. 43. С. 869-872.,
Компьютерно-экспериментальный подход к дизайну полифункционального геносенсора, полученного на основе промотора гена yfiA Escherichia coli Тикунова Н.В., Хлебодарова Т.М., Крачко А.В., Степаненко И.Л., Колчанов Н.А. Doklady Akademii Nauk, 2007, 417, №6 , 835-839
Конкурентные отношения за лимитированные ресурсы среды у лабораторных мышей в модели социального доминирования Брагин А.В., Осадчук Л.В., Осадчук А.В. Журнал высшей нервной деятельности, 2007, № 3, Том 57, С. 358-365.
Математическая модель паттерна распределения ауксина в корне растения Лихошвай В. А., Омельянчук Н. А., Миронова В. В., Фадеев С. И., Мелснесс Э. М., Колчанов Н. А. RUSS J DEV BIOL+, 2007, Т. 38, №. 6, стр. 446–456, 2007
Модельное изучение роли CLV1, CLV2, CLV3 И WUS в регуляции структуры апикальной меристемы побега Николаев С. В., Пененко A. В., Лавреха В. В., Мелснесс Э. Д., Колчанов Н. А. RUSS J DEV BIOL+, 2007, 38 №6, 457-462
Молекулярные механизмы системной устойчивости растений к вирусным инфекциям и способы повышения вирусоустойчивости путем трансгенеза Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2007, Т.127. С.13-24
Combined experimental and computational approaches to study the regulatory elements in eukaryotic genes Kolchanov NA, Merkulova TI, Ignatieva EV, Ananko EA, Oshchepkov DY, Levitsky VG, Vasiliev GV, Klimova NV, Merkulov VM, Hodgman TC BRIEF BIOINFORM, 2007, 8(4), 266-274
Особенности встраивания векторных последовательностей в геном трансгенных растений Пермякова Н.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, Т.43. № 11. С.1501-1510
Особенности цитомиксиса в материнских клетках пыльцы у трансгенных растений табака (Nicotiana tabacum L.) с мутантным фенотипом Сидорчук Ю.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. Cell and Tissue Biology, 2007, Т.49,№10, С.870-875
Получение пшенично-ржаных замещенных линий на основе озимых сортов ржи с идентификацией кариотипов методами С-бэндинга, GISH и SSR-маркеров Силкова О.Г., Добровольская О.Б., Дубовец Н.И., Адонина И.Г., Кравцова Л.А., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, 43, 8, стр.1149-1152
Репродуктивные корреляты социальной иерархии у самцов лабораторных мышей Осадчук Л.В., Саломачева И.Н., Брагин А.В., Осадчук А.В. Журнал высшей нервной деятельности, 2007, № 5, Том 57, С. 604-612.
Роль микротрубочкового цитоскелета и каллозных оболочек в проявлении цитомиксиса в материнских клетках пыльцы растений табака (Nicotiana tabacum L.) Сидорчук Ю.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. Cell and Tissue Biology, 2007, Т. 49. № 10. С. 876-880.
Роль хромосомы ржи 2R пшенично-ржаной замещенной линии 2R(2D)1 (T. aestivum L. сорт Саратовская 29 /S. cereale L. сорт Онохойская) в генетической регуляции мейотической реституции у пшенично-ржаных полигаплоидов Силкова О.Г., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, Т.43. №7.С. 971-981
Сетевое описание биосистем: проблемы и подходы Колчанов Н.А., Мигинский Д.С., Подколодный Н.Л., Рассказов Д.А., Суслов В.В., Тимонов В.С., Сергеев М.Г. Вычислительные технологии, 2007, Т. 12, Специальный выпуск 2, С. 107-122
Т-ДНК индуцированные мутации у трансгенных растений Дейнеко Е.В., Загорская А.А., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, №1, т.43, с.5-17
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах Меркулова Т. И., Ощепков Д. Ю., Игнатьева Е. В., Ананько Е.В., Левицкий В.Г., Васильев Г. В., Климова Н. В., Меркулов В.М., Колчанов Н.А. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2007, 11, 72, 1459-1467
Effective transcription factor binding site prediction using a combination of optimization, a genetic algorithm and discriminant analysis to capture distant interactions Levitsky V.G., Ignatieva E.V., Ananko E.A., Turnaev I.I., Merkulova T.I., Kolchanov N.A., Hodgman T.C. BMC BIOINFORMATICS, 2007, Vol. 8:481. PMID: 18093302
Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure-BGRS'2006 Rodin S. N., Kolchanov N. A. In Silico Biology, 2007, 7: 0040
Genes flanking Xist in mouse and human are separated on the X chromosome in American marsupials Shevchenko AI, Zakharova IS, Elisaphenko EA, Kolesnikov NN, Whitehead S, Bird C, Ross M, Weidman JR, Jirtle RL, Karamysheva TV, Rubtsov NB, Vandeberg JL, Mazurok NA, Nesterova TB, Brockdorff N, Zakian SM CHROMOSOME RES, 2007, V. 15. N. 2. P. 127-136.
Mathematical model for suppression of subgenomic hepatitis C virus RNA replication in cell culture Mishchenko E.L., Bezmaternykh K.D., Likhoshvai V.A., Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Sournina N. Yu., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, Vol. 5, No. 02B pp.593-609
Model of the reception of hedgehog morphogen concentration gradient: comparison with an extended range of experimental data Gunbin K.V., Omelyanchuk L.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, 2b, 5, 491-507
Mosaic expression pattern of the nptII gene in transgenic tobacco plants Nu21 Marenkova T.V., Deineko E.V., ShumnyV.K. RUSS J GENET+, 2007, №7,V43, pp780-790
Мозаичный характер проявления гена nptII у трансгенных растений табака линии Nu21 Маренкова Т.В., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, Том 43, №1, С.943-954
Поиск новых сайтов связывания транскрипционного фактора SF1 методом SITECON: экспериментальная проверка и анализ регуляторных районов генов-ортологов. Игнатьева Е. В., Климова Н. В., Ощепков Д. Ю., Васильев Г. В., Меркулова Т. И., Колчанов Н. А. Doklady Akademii Nauk, 2007, 415(1):120-124
Protection of transgenic tobacco plants expressing bovine pancreatic ribonuclease against tobacco mosaic virus Trifonova E. A., Sapotsky M.V., Komarova M. L., Scherban A.B., Shumny V.K., Polyakova A.M., Lapshina L.A., Kochetov A.V., Malinovsky V.I. PLANT CELL REP, 2007, V.26, P.1121-1126
Recognition of interferon-inducible sites, promoters, and enhancers Ananko E.A., Kondrakhin Y.V., Merkulova T.I., Kolchanov N.A BMC BIOINFORMATICS, 2007, v.8 p.56
Search for new binding sites for the transcription factor SF-1 by the SITECON method: experimental verification and analysis of regulatory regions of orthologous genes Ignat'eva EV, Klimova NV, Oshchepkov DY, Vasil'ev GV, Merkulova TI, Kolchanov NA. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2007, V.415, c.165-169
Simulation of coevolution in community by using the "Evolutionary Constructor" program. In Silico Biology (Special Issue: 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS 2006)) Lashin S.A., Suslov V.V., Kolchanov N.A., Matushkin Yu.G In Silico Biology, 2007, № 7, vol. 42. p. 20-30.
Академик Николай Петрович Дубинин: к 100-летию со дня рождения Шумный В.К., Захаров И.К. Информационный вестник ВОГИС, 2007, Т. 11. № 1. С. 5-15.
The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A. In Silico Biology, 2007, 3, 7, 333-354
Web-based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Post-translational Modifications of Proteins Ivanisenko V.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A. Methods in Molecular Biology, 2007, 446, 363-384.
А cellular automaton to model the development of primary shoot meristems of Arabidopsis Thaliana Ilya Akberdin, Evgeniy Ozonov, Victoria Mironova, Nadezda Omelyanchuk, Vitaly Likhoshvai, Dmytry Gorpinchenko, Nikolay Kolchanov Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, Vol. 5, 02B, pp. 641-650
Азотный режим почв различных генотипов макросимбионта Назарюк В.М., Сидорова К.К., Шумный В.К., Калимуллина Ф.Р., Кленова М.И Почвоведение, 2007, № 2, с. 189-196
Академик Николай Петрович Дубинин: к 100-летию со дня рождения Шумный В.К., Захаров И.К. Информационный вестник ВОГИС, 2007, № 1.Т. 11. С. 5-15.
Анализ сайтов встраивания Т-ДНК инсерций у трансгенных растений табака Филипенко Е.А., Филипенко М.Л., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. CYTOL GENET+, 2007, №4, т.41, с.3-8, 2007
Application of bioinformatics resources for genosensor design Khlebodarova T.M., Tikunova N.V., Kachko A.V., Stepanenko I.L., Podkolodny N.L., Kolchanov N.A. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, V.5. P.507-520
Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 2, 11, 373-400
Aromorphoses and the adaptive molecular evolution Gunbin K.V., Suslov V.V., Kolchanov N.A. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 11(2):373-400
AUG_hairpin: prediction of a downstream secondary structure influencing the recognition of a translation start site Kochetov A.V., Palyanov A., Titov I.I., Grigorovich D., Sarai A., Kolchanov N.A. BMC BIOINFORMATICS, 2007, 8(1):318
Bioinformatical and experimental approaches to investigation of transcription factor binding sites in vertebrate gene Merkulova T. I., Oshchepkov D. Yu., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Levitsky V. G., Vasiliev G. V., Klimova N. V. , Merkulov V. M., Kolchanov N. A. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2007, 72 (11):1187-1193
Доместикация злаков Старого Света: поиск новых подходов для решения старой проблемы Гончаров Н.П., Глушков С.А., Шумный В.К. Журнал общей биологии, 2007, №2, т.68, с.126-148
2006
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани Николаев С.В., Колчанов Н.А., Фадеев С.И., Когай В.В., Мйолснесс Э. Вычислительные технологии, 2006, Том 11, № 2, с. 67 - 81
Методы генетики в селекции растений Гончаров Н.П., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2006, №2, Т.10. С.395-403.
Моделирование морфогенеза Arabidopsis thaliana в терминах клеточного автомата Акбердин И. Р., Озонов Е. А., Миронова В. В., Горпинченко Д.Н., Омельянчук Н. А., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, т. 51, выпуск N7
О ранних стадиях эволюции геосферы и биосферы Добрецов Н.Л., Колчанов Н.А., Суслов В.В. PALEONTOL J+(RUS), 2006, Vol. 40. Suppl. 4. Pp. S407-S424.
Pattern of locally positioned dinucleotides correlates with microRNA abundance in plants Khomicheva I.V., Levitsky V.G., Omelyanchuk N.A., Kolchanov N.A., Savinskaya S.A. BIOPHYSICS, 2006, Suppl 1, 51, S7-S10
Потенциальные открытые рамки считывания в 5”-нетранслируемых районах эукариотических мРНК Волкова О. А., Кочетов А. В., Титов С. Е., Колчанов Н. А. BIOPHYSICS, 2006, 51(4), 615-21
Потенциальные сайты связывания фактора транскрипции SF-1: выявление методом SiteGA, экспериментальная проверка и поиск новых генов-мишени Н.В.Климова, В.Г.Левицкий, Е.В.Игнатьева, Г.В.Васильев, В.Ф.Кобзев, Т.В.Бусыгина, Т.И.Меркулова, Н.А.Колчанов Molecular Biology, 2006, Т.40, №3, стр.512-523
Предсказание контактных чисел аминокислотных остатков c использованием алгоритма нейросетевой регрессии Д.А.Афонников, А.С.Морозов, Н.А.Колчанов BIOPHYSICS, 2006, 51, N7.
Раиса Львовна Берг (27.03.1913-1.03.2006) Захаров И.К., Колосова Л.Д., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2006, Т. 42. № 12. С. 1739-1742.
Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов с помощью метода SiteGA Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В.,Ананько Е.А.,Меркулова Т.И., Колчанов Н.А.,Ходжман Ч. BIOPHYSICS, 2006, 4, 51, 633-639
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: I. База данных AGNS Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Шамов И.С.,Поплавский А.С., Подколодный Н.Л., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Мелснесс Э.Д., Мейеровитц Е.M., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, выпуск N7, т. 51
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: II. Моделирование регуляции структуры апикальной меристемы побега Николаев С.В., Фадеев С.И., Пененко A.В., Лавреха В.В., Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Мелснесс Э.Д., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, 51, N7.
Содержание микроРНК в Arabidopsis thaliana коррелирует с встречаемостью тетрануклеотидов WRHW и DRYD Пономаренко М.П., Омельянчук Н.А., Катохин А.В., Колчанов Н.А Информационный вестник ВОГИС, 2006, 2, 10, 304-311
Создание пшенично-ржаных замещенных линий с идентификацией хромосомного состава кариотипов методами C-бэндинга, GISH и SSR-маркеров Силкова О.Г., Добровольская О.Б., Дубовец Н.И., Адонина И.Г., Кравцова Л.А., Родер М.С., Салина Е.А., Щапова А.И., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2006, №46, т.42, с. 793-802
Трансгенез как способ увеличения устойчивости растений к повышенным концентрациям тяжелых металлов Колодяжная Я.С., Кочетов А.В., Шумный В.К. Успехи современной биологии, 2006, Т. 126, № 5, С. 456–461
Физиологические и агрохимические особенности разных симбиотических генотипов гороха (Pisum sativum L.) Назарюк В.М., Сидорова К.К., Шумный В.К., Калимуллина Ф.Р., Кленова М.И BIOL BULL+(RUS), 2006, 6, , 688-697
Филогенетический анализ семейства p53 Пинтус С.С., Фомин Э.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, т.51, вып.4, с.640-649
Численное исследование модели рецепции градиента концентрации морфогена Hedgehog В.В.Когай, К.В.Гунбин, Л.В.Омельянчук, С.И. Фадеев, Н.А.Колчанов Сибирский журнал индустриальной математики, 2006, 3(27), IX, 66-79
Экспериментальные и компьютерные подходы к изучению регуляторных элементов в эукариотических генах Климова Н.В., Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2006, т.40, стр. 512-523.
A model of Arabidopsis thaliana morphogenesis in cellular automaton terms I. R. Akberdin, E. A. Ozonov, V.V. Mironova, D. N. Gorpinchenko,N. A. Omelyanchuk, V. A. Likhoshvai, N. A. Kolchanov BIOPHYSICS, 2006, т. 51, выпуск N7., s91-94
A Systems Approach to Morphogenesis in Arabidopsis thaliana: II. Modeling of the Regulation of Shoot Apical Meristem Structure S. V. Nikolaev, S. I. Fadeev, A. V. Penenko, V. V. Lavrekha, V. V. Mironova, E. D. Mjolsness, N. A. Omel’yanchuk, N. A. Kolchanov BIOPHYSICS, 2006, №7, V. 51
Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck GENOMICS, 2006, V. 88, № 6, P. 752-761.
On the Early Stages of the Evolution of the Geosphere and Biosphere Dobretsov N.L., Kolchanov N.A., Suslov V.V. PALEONTOL J+(RUS), 2006, 4, 40, S407-S424
Use of Transgenic Carrot Plants Producing Human Interleukin-18 for Modulation of Mous Immune Reactions Якушенко У.В., Храпов Ю.А., Дейнеко Е.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Шумный В.К., Сенников Ы.В., Козлов В.А. In Book: New research on Biotechnology and Medicine. Eds.: Egorov A.M., Zaikov G.E. Nova Science Publishers, 2006, P.97-107
Potential binding sites for SF-1: Recognition by the SiteGA method, experimental verification, and search for new target genes Klimova NV, Levitsky VG, Ignatieva EV, Vasiliev GV, Kobzev VF, Busygina TV, Merkulova TI, Kolchanov NA Molecular Biology, 2006, V.40, № 3. P.1-12.
Prediction of Contact Numbers of Amino Acid Residues Using a Neural Network Regression Algorithm D. A. Afonnikov, A. V. Morozov, N. A. Kolchanov BIOPHYSICS, 2006, 7,51,
Шёлковая нить жизни: академик Владимир Александрович Струнников (1914-2005) Захаров И.К., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т. 10. № 1. С. 213-218
Век Шкварникова Захаров И.К., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2006, 2006. Т. 10. № 2. С. 418-425.
Раиса Львовна Берг (27.03.1913-1.03.2006) Захаров И.К., Колосова Л.Д., Шумный В.К. Информационный вестник ВОГИС, 2006, Т. 10. № 2. С. 426-434.
Паттерн определенных динуклеотидов микроРНК арабидопсиса связан с уровнем их содержания в растении. Левицкий В.Г., Хомичева И.В., Омельянчук Н.А., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2006, 2, 10, 298-303
Выявление потенциальных сайтов связывания транскрипционного фактора SF-1 методом SiteGA, их экспериментальная проверка и поиск новых генов-мишеней этого фактора Климова Н.В., Левицкий В.Г., Игнатьева Е.В., Васильев Г.В., Кобзев В.Ф., Бусыгина Т.В., Меркулова Т.И., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2006, 3, 40,512-523
WebProAnalyst: an interactive tool for analysis of quantitative structure-activity relationships in protein families Ivanisenko V.A., Eroshkin A.M., Kolchanov N.A. NUCLEIC ACIDS RES, 2005, V. 33, W99-W104
PDBSite: a database of the 3D structure of protein functional sites Ivanisenko VA, Pintus SS, Grigorovich DA, Kolchanov NA. NUCLEIC ACIDS RES, 2005, V33, D183–D187
Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2005, Т.9, N2, май 2005, 232-261
Mining genome variation to associate genetic disease with mutation alterations and ortho/paralogous polimorphysms in transcription factor binding site. Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Merkulova T.M., Vasiliev G.V., and Ponomarenko M.P. INT J ARTIF INTELL T, 2005, 4, 14, 599-620
GeneNet in 2005. E.A. Ananko, N.L. Podkolodny, I.L. Stepanenko, O.A. Podkolodnaya, D.A. Rasskazov, D.S. Miginsky, V.A. Likhoshvai, A.V. Ratushny, N.N. Podkolodnaya, and N.A. Kolchanov. NUCLEIC ACIDS RES, 2005, V. 33. P. D425-D427
2004
Моделирование биологической эволюции: регуляторные генетические системы и кодирование сложности биологической организации Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин К.В. Информационный вестник ВОГИС, 2004, № 29. С.: 86-99.
Генетические механизмы кодирования биологической сложности Суслов В.В., Гунбин К.В., Колчанов Н.А. Экологическая генетика, 2004, Т. II. № 1. С. 13-26.
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть I. Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А. Сибирский экологический журнал, 2004, 11(5):599-610
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть II. Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А. Сибирский экологический журнал, 2004, 11(5):611-621
Интегрированная компьютерная система по регуляции экспрессии генов эукариот. Н. А. Колчанов, О. А Подколодная, Е. А. Ананько, Д. А. Афонников, О. В. Вишневский, Д. В. Воробьев, Е. В. Игнатьева, В. Г. Левицкий, В. А. Лихошвай, Н.А.Омельянчук, Н.Л. Подколодный, А. В. Ратушный Molecular Biology, 2004, Молекулярная биология 2004, т.38, №1, с.69-81.
2003
Data Mining Techniques in Bioinformatics Zagoruiko N.G., Kolchanov N.A., Pichueva A.G., Kutnenko O.A., Borisova I.A., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Nikolaev S.V., Likhoshvai V.A., Ratushnyi A.V. Pattern Recognition and Image Analysis, 2003, N. 4, V. 13, P. 550-555
rSNP_Guide, a database system for analysis of transcription factor binding to DNA with variations: application to genome annotation. Ponomarenko J.V., Merkulova T.I., Orlova G.V., Fokin O.N., Gorshkova (Antontseva) E.V., Frolov A.S., Valuev V.P., Ponomarenko M.P. NUCLEIC ACIDS RES, 2003, 1, 31, 118-121
Apoptosis Gene Network: description in the GeneNet and TRRD databases Stepanenko I., Kolchanov N. Ann.N.Y.Acad.Sci., 2003, V.1010. P.16-18
2002
Быстрый генетический алгоритм для анализа вторичной структуры РНК Титов И.И., Воробьев Д.Г., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А. RUSS CHEM B+, 2002, N7, c. 1047-1056
SELEX_DB: a database on in vitro selected oligomers adapted for recognizing natural sites and for analyzing both SNPs and site-directed mutagenesis data. Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Frolov A.S., Gelfand M.S., Ponomarenko M.P. NUCLEIC ACIDS RES, 2002, 1, 30, 195-199
ASPD (Artificially Selected Proteins/Peptides Database): a database of proteins and peptides evolved in vitro. Valuev V.P., Afonnikov D.A., Ponomarenko M.P., Milanesi L., Kolchanov N.A. NUCLEIC ACIDS RES, 2002, 1, 30, 200-202
Mining DNA sequences to predict sites which mutations cause genetic diseases. Ponomarenko J.V., Merkulova T.I., Orlova G.V., Fokin O.N., Gorshkova (Antontseva) E.V., Ponomarenko M.P. Knowl-Based Syst. J., 2002, 4, 15, 225-233
rSNP_Guide: an integrated database-tools system for studying SNPs and site-directed mutations in transcription factor binding sites Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Merkulova T.I., Gorshkova (Antontseva) E.V., Fokin O.N., Vasiliev G.V., Frolov A.S., Ponomarenko M.P. HUM MUTAT, 2002, 4, 20, 239-248
GeneNet database: Description and Modeling of Gene Networks. Kolchanov N.A., Nedosekina E.A., Ananko E.A., Likhoshvai V.A., Podkolodny N.L., Ratushny A.V., Stepanenko I.L., Podkolodnaya O.A., Ignatieva E.V., Matushkin Yu.G. In Silico Biology, 2002, V.2, p. 97-110
GeneNet: a database on structure and functional organisation of gene networks. Ananko E.A., Podkolodny N.L., Stepanenko I.L., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Kolchanov N.A. NUCLEIC ACIDS RES, 2002, V. 30, No. 1 P. 398-401.
Transcription Regulatory Regions Database (TRRD): its status in 2002 Kolchanov NA, Ignatieva EV, Ananko EA, Podkolodnaya OA, Stepanenko IL, Merkulova TI, Pozdnyakov MA, Podkolodny NL, Naumochkin AN, Romashchenko AG NUCLEIC ACIDS RES, 2002, Jan 1;30(1):312-317
rSNP_Guide, a database system for analysis of transcription factor binding to target sequences: application to SNPs and site-directed mutations Ponomarenko JV, Merkulova TI, Vasiliev GV, Levashova ZB, Orlova GV, Lavryushev SV, Fokin ON, Ponomarenko MP, Frolov AS, Sarai A. NUCLEIC ACIDS RES, 2001, 1, 29, 312-316.
Detection of conserved physico-chemical characteristics of proteins by analyzing clusters of positions with coadaptive substitutions D.A. Afonnikov , D. Yu. Oshchepkov, and N.A. Kolchanov BIOINFORMATICS, 2001, V.17(11):1-12.
ACTIVITY: a database on DNA/RNA sites activity adapted to apply sequence-activity relationships from one system to another. Ponomarenko J.V., Furman D.P., Frolov A.S., Podkolodny N.L., Orlova G.V., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A., Sarai A. NUCLEIC ACIDS RES, 2001, 1, 29, 284-287
2000
Methods for integration of heterogeneous information resources in molecular biology in the digital library GeneExpress F. A. Kolpakov, N. L. Podkolodnyi, S. V. Lavryushev, D. A. Grigorovich, M. P. Ponomarenko, N. A. Kolchanov PROGRAM COMPUT SOFT+, 2000, 3, 26, 170-176
Точковые мутации в районе 663-666 п.н. интрона 6 гена триптофаноксигеназы, связанные с рядом психических расстройств, разрушают сайт связывания фактора транскрипции YY1. Васильев Г.В., Меркулов В.М., Кобзев В.Ф., Меркулова Т.И., Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Подколодная О.А., Колчанов Н.А. Molecular Biology, 2000, 2, 34, 214-222
1999
Усреднее результатов распознавания сайтов может увеличить точность аннотации генома человека Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Подколодная О.А., Фролов А.С., Воробьев Д.В., Колчанов Н.А., Овертон K. BIOPHYSICS, 1999, 4, 44, 649-654
WWWMGS: интегрированный сервер для молекулярно-генетических исследований А.С.Фролов, С.В.Лаврюшев, Д.А.Григорович, А.Э.Кель, А.А.Птицын, Н.А.Колчанов, Н.Л.Подколодный, В.В.Соловьев, Л.Миланези, П.Борн, Э.Вингендер, К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, том 44, вып. 5, с.832-836
GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон BIOPHYSICS, 1999, 5, 44, 837-841
Вклад сигналов и антисигналов в мутационный спектр сайта встраивания td-интрона. Пономаренко М.П, Пономаренко Ю.В., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 1999, 4, 44, 655-663
Point mutations within 663-666 bp of intron 6 of the human TDO2 gene, associated with a number of psychiatric disorders, damage the YY-1 transcription factor binding site. Vasiliev G.V., Merkulov V.M., Kobzev V.F., Merkulova T.I., Ponomarenko M.P., Kolchanov N.A. FEBS LETT, 1999, 1/2, 462, 85-88
Oligonucleotide frequency matrices addressed to recognizing functional DNA sites. Ponomarenko M.P., Ponomarenko J.V., Frolov A.S., Podkolodnaya O.A., Vorobyev D.G., Kolchanov N.A., Overton G.C. BIOINFORMATICS, 1999, 7/8, 15, 631-643
Identification of sequence-dependent features correlating to activity of DNA sites interacting with proteins Ponomarenko M.P., Ponomarenko J.V., Frolov A.S., Podkolodny N.L., Savinkova L.K., Kolchanov N.A., Overton G.C. BIOINFORMATICS, 1999, 7/8, 15, 687-703
Conformational and physicochemical DNA features specific for transcription factor binding sites. Ponomarenko J.V., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Vorobyev D.G., Overton G.C., Kolchanov N.A. BIOINFORMATICS, 1999, 7/8, 15, 654-668
Функциональные сайты геномов про- и эукариот: компьютерное моделирование и предсказание активности Колчанов Н.А., Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Фролов А.С., Подколодный Н.Л. Molecular Biology, 1998, 2, 32, 255-267
Eukaryotic mRNAs encoding abundant and scarce proteins are statistically dissimilar in many structural features. Kochetov AV, Ischenko IV, Vorobiev DG, Kel AE, Babenko VN, Kisselev LL, Kolchanov NA. FEBS LETT, 1998, 440(3):351-355
Предпочтительность RecA-филамента к последовательностям ДНК коррелирует с генетическим кодом Пономаренко М.П., Пономаренко Ю.В., Титов И.И., Колчанов Н.А., Мазин А.В., Ковальчиковски С. Doklady Akademii Nauk, 1998, 1, 363, 122-125
GeneExpress: a computer system for description, analysis, and recognition of regulatory sequences in eukaryotic genome. N.A. Kolchanov, M.P. Ponomarenko, A.E. Kel, A.S. Frolov, F.A. Kolpakov, T.N. Goryachkovsky, O.V. Kel, E.A. Ananko, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, V.N. Babenko, I.L. Stepanenko, A.G. Romashchenko, T.I. Merkulova, D.G. Vorobiev, S.V. Lavryushev, A.V. Kochetov, G.B. Kolesov, V.V. Solovyev, L. Milanesi, N.L. Podkolodny, E. Wingender, T. Heinemeyer Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol, 1998, 6, 95-104
1997
Generating programs for predicting the activity of functional sites. Ponomarenko M.P., Kolchanova A.N., Kolchanov N.A. J COMPUT BIOL, 1997, 1, 4, 83-90
TRRD and COMPEL databases on transcription linked to TRANSFACAS as tools for analysis and recognition of regulatory sequences Kel A.E., Kel O.V., Vishnevsky O.V., Ponomarenko M.P., Ischenko I.V., Karas H., Kolchanov N.A., Sklenar H., Wingender E. Lect Notes Comput Sci, 1997, Вioinformatics, 1278, 99-105
Identification of cDNA sequences by specific oligonucleotide sets. Computer tool and application. Kolchanov NA, Vishnevsky OV, Kel AE, Shindyalov IN Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol, 1995, 3:206-214
1993
SITEVIDEO: a computer system for functional site analysis and recognition. Investigation of the human splice sites. Kel A.E., Ponomarenko M.P., Likhachev .EA., Orlov Yu.L., Ischenko I.V., Milanesi L., Kolchanov N.A. Comput. Appl. Biosci., 1993, 6, 9, 617-627
