The Mutation Spectrum of Maturity Onset Diabetes
of the Young (MODY)-Associated Genes amongWestern Siberia Patients Dinara E. Ivanoshchuk, Elena V. Shakhtshneider, Oksana D. Rymar, Alla K. Ovsyannikova, Svetlana V. Mikhailova, Veniamin S. Fishman, Emil S. Valeev, Pavel S. Orlov and Mikhail I. Voevoda J. Pers. Med, 2021, 11, 57-71
Predicting Genome Architecture: Challenges and Solutions P. Belokopytova, V. Fishman Frontiers in Genetics, 2021, 11:617202
2020
Quantitative prediction of enhancer-promoter interactions Polina Belokopytova, Miroslav Nuriddinov, Evgeniy Mozheiko, Daniil Fishman, Veniamin Fishman GENOME RES, 2020, 30(1):72-84
DNA barcoding reveals that injected transgenes are predominantly processed by homologous recombination in mouse zygote Alexander Smirnov, Veniamin Fishman, Anastasia Yunusova, Alexey Korablev, Irina Serova, Boris V Skryabin, Timofey S Rozhdestvensky, Nariman Battulin NUCLEIC ACIDS RES, 2020, Volume 48, Issue 2, 24 January 2020, Pages 719–735
Effect of the THBS1 Gene Knockout on the Radiation-Induced Cellular Response in a Model System In Vitro R. R. Savchenko, S. A. Vasilyev, V. S. Fishman, E. S. Sukhikh, L. G. Sukhikh, A. A. Murashkin, I. N. Lebedev RUSS J GENET+, 2020, Vol. 56, No. 5, pp. 618–626
Postsynthetic On-Column 2' Functionalization of RNA by Convenient Versatile Method Olga A Krasheninina, Veniamin S Fishman, Alexander A Lomzov, Alexey V Ustinov, Alya G Venyaminova INT J MOL SCI, 2020
Establishment of an induced pluripotent stem cell line (ICGi025-A) from fibroblasts of a patient with 46,XY,r(8)/45,XY,–8 mosaicism M.M.Gridina, T.V.Nikitina, P.A.Orlova, J.M.Minina, A.A.Kashevarova, Yu.S.Yakovleva, M.E.Lopatkina, S.A.Vasilyev, D.A.Fedotov, L.I.Mikhailik, L.P.Nazarenko, I.N.Lebedev, O.L.Serov STEM CELL RES, 2020, V. 49. December 2020, 102024
Establishment of an induced pluripotent stem cell line (ICGi026-A) from peripheral blood mononuclear cells of a patient with fragile X syndrome M M Gridina, P A Orlova, J M Minina, E M Shitik, N A Lemskaya, I V Grishchenko, A A Dolskiy, A R Shorina, Y V Maksimova, D V Yudkin, O L Serov STEM CELL RES, 2020, Dec;49:102070
Generation of iPSC line ICGi024-A from human skin fibroblasts of a patient with ring chromosome 18 AA Khabarova, IE Pristyazhnyuk, PA Orlova, TV Nikitina, AA Kashevarova, ME Lopatkina, EO Belyaeva, NN Sukhanova, LP Nazarenko, IN Lebedev, OL Serov STEM CELL RES, 2020
2019
Induced pluripotent stem cell line, ICAGi001-A, derived from human skin fibroblasts of a patient with 2p25.3 deletion and 2p25.3-p23.3 inverted duplication KhabarovaA.A, Pristyazhnyuk I.E., NikitinaT.V., GaynerT.A., TorkhovaN.B., SkryabinN.A., KashevarovaA.A., BabushkinaN.P., MarkovaZh.G., MinzhenkovaM.E., NazarenkoL.P., ShilovaN.V., ShorinaA.R., LebedevI.N., SerovO.L. STEM CELL RES, 2019, V.34, 101377
3D organization of chicken genome demonstrates evolutionary conservation of topologically associated domains and highlights unique architecture of erythrocytes' chromatin. Fishman V., Battulin N., Nuriddinov M., Maslova A., Zlotina A., Strunov A., Chervyakova D.,
Korablev A., Serov O., Krasikova A. NUCLEIC ACIDS RES, 2019
Способы повышения эффективности knock-in в геном плюрипотентных клеток человека при помощи системы CRISPR/Cas9 М.М. Гридина Vavilov journal of genetics and breeding, 2019
Реорганизация хроматина в процессе эритроидной дифференцировки А. А. Хабарова, А. С. Рыжкова, Н. Р. Баттулин Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, Т.23 , № 1 (2019)
Targeted genomic integration of EGFP under tubulin beta 3 class III promoter and mEos2 under tryptophan hydroxylase 2 promoter does not produce sufficient levels of reporter gene expression Aleksei G. Menzorov
Konstantin E. Orishchenko
Veniamin S. Fishman
Anastasia A. Shevtsova
Roman V. Mungalov
Inna E. Pristyazhnyuk
Elena A. Kizilova
Natalia M. Matveeva
Natalia Alenina
Michael Bader
Nikolai B. Rubtsov
Oleg L. Serov J CELL BIOCHEM, 2019, 120(10):17208-17218
Germline-restricted chromosome (GRC) is widespread among songbirds Torgasheva AA, Malinovskaya LP, Zadesenets KS, Karamysheva TV, Kizilova EA, Akberdina EA, Pristyazhnyuk IE, Shnaider EP, Volodkina VA, Saifitdinova AF,Galkina SA, Larkin DM, Rubtsov NB, Borodin PM. 2019, 116: 11845-11850. P NATL ACAD SCI USA, 2019, 116: 11845-11850.
Generation of four iPSC lines from two siblings with a microdeletion at the CNTN6 gene and intellectual disability T.A.Shnaider,I.E.Pristyazhnyuk, A.G.Menzorov, N.M.Matveeva, A.AKhabarova, N.A.Skryabin, A.A.Kashevarova, M.E.Lopatkina, L.P.Nazarenko, I.N.Lebedev, O.L.Serov STEM CELL RES, 2019
Time origin and structural analysis of the induced CRISPR/cas9 megabase-sized deletions and duplications involving the Cntn6 gene in mice. Inna E. Pristyazhnyuk, Julia Minina, Alexey Korablev, Irina Serova, Veniamin Fishman, Maria Gridina, Timofey S. Rozhdestvensky, Leonid Gubar, Boris V. Skryabin, and Oleg L. Serov SCI REP-UK, 2019, 9: 14161
Использование тимидинкиназы для отрицательной селекции индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Алексей Гавриилович Мензоров, Константин
Евгеньевич Орищенко, Мария Михайловна
Гридина, Вениамин Семенович Фишман,
Олег Леонидович Серов, Анна Александровна
Кашеварова, Татьяна Владимировна
Никитина, Игорь Николаевич Лебедев Гены и клетки, 2019, Том XIV, Приложение, 2019, С. 150-151
ДифференциальнАя стабильность кольцевых хромосом в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках Татьяна Владимировна Никитина, Анна Александровна Кашеварова, Алексей Гавриилович Мензоров, Станислав Анатольевич
Васильев, Мария Михайловна Гридина, Анна Александровна Хабарова, Юлия Сергеевна Яковлева, Мария Евгеньевна Лопаткина, Марина Алексеевна Распопова, Дмитрий Александрович Дериглазов, Олег Леонидович Серов, Игорь Николаевич Лебедев Гены и клетки, 2019, Том XIV, Приложение, 2019, С. 166-167
Создание репортерного лентивирусного вектора Lego-REX1-EGFP для отбора индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Артем Рустамович Нурисламов, Вениамин Семенович Фишман, Алексей Гавриилович Мензоров Гены и клетки, 2019, Том XIV, Приложение, 2019, С. 170-171
C-InterSecture—a computational tool for interspecies comparison of genome architecture Нуриддинов Мирослав Абдурахимович
Фишман Вениамин Семёнович BIOINFORMATICS, 2019, Volume 35, Issue 23, 1 December 2019, Pages 4912–4921,
Происхождение и судьба масштабных хромосомных перестроек, индуцированных технологией CRISPR/Cas9 у мышей: от зигот до соматических клеток Алексей Николаевич Кораблев, Инна Евгеньевна Пристяжнюк, Юлия Михайловна Минина, Ирина Александровна Серова, Вениамин Семенович Фишман, Мария Михайловна Гридина, Timofey Rozhdestvensky, Leonid Gubar, Boris Skryabin, Олег Леонидович Серов Гены и клетки, 2019
Detection of Point Mutations and Chromosomal Translocations Based on Massive Parallel Sequencing of Enriched 3C Libraries Mozheiko E.A., Fishman V.S. RUSS J GENET+, 2019
2018
Ring chromosomes: from formation to clinical potential Pristyazhnyuk I.E., Menzorov A.G. PROTOPLASMA, 2018, 255(2); 439-449 doi: 10.1007/s00709-017-1165-1
Allele-Specific Biased Expression of the CNTN6 Gene in iPS Cell-Derived Neurons from a Patient with Intellectual Disability and 3p26.3 Microduplication Involving the CNTN6 Gene Maria M. Gridina, Natalia M. Matveeva, Veniamin S. Fishman, Aleksei G. Menzorov, Helen A. Kizilova, Nikolay A. Beregovoy, Igor I. Kovrigin, Inna E. Pristyazhnyuk, Igor P. Oscorbin, Maxim L. Filipenko, Anna A. Kashevarova, Nikolay A. Skryabin, Tatyana V. Nikitina, Elena A. Sazhenova, Ludmila P. Nazarenko, Igor N. Lebedev, Oleg L. Serov MOL NEUROBIOL, 2018, 55:6533-6546
Generation of two iPSC lines (IMGTi001-A and IMGTi001-B) from human skin fibroblasts with ring chromosome 22 Nikitina TV, Menzorov AG, Kashevarova AA, Gridina MM, Khabarova AA, Yakovleva YS, Lopatkina ME, Kizilova EA, Vasilyev SA, Serov OL, Lebedev IN. STEM CELL RES, 2018, 31, 244–248
АНАЛИЗ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ЭКСПРЕССИИ МАТРИКСНЫХ МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗ
В СТАБИЛЬНОЙ И НЕСТАБИЛЬНОЙ АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИХ БЛЯШКАХ МЕТОДОМ
ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК: ПИЛОТНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ Иванощук Д.Е., Рагино Ю. И.
, Шахтшнейдер Е.В., Михайлова С.В.
, Фишман В. С., Полонская Я.В.
, Каштанова Е.В., Чернявский А.М.
, Мурашов И.С., Воевода М.И. Российский Кардиологический Журнал, 2018, №8, С.52-58
Induced pluripotent stem cell line, IMGTi003-A, derived from skin fibroblasts of an intellectually disabled patient with ring chromosome 13 Nikitina T.V., Menzorov A.G., Kashevarova A.A., Gridina M.M., Khabarova A.A., Yakovleva Yu.S., Lopatkina M.E., Pristyazhnyuk I.E., Vasilyev S.A., Serov O.L.,
Lebedev I.N. STEM CELL RES, 2018, 33:260–264
Intragenic Microduplication of LAMA1 and a Constitutional 18p11.32 Microduplication in a Patient with Keratosis Pilaris and Intellectual Disability. Anna A. Kashevarova, Lyudmila P. Nazarenko, Nikolay A. Skryabin, Tatyana V. Nikitina, Stanislav
A. Vasilyev, Ekaterina N. Tolmacheva, Mariya E. Lopatkina, Olga A. Salyukova, Nataliya N.
Chechetkina, Ekaterina A. Vorotelyak, Ekaterina, P. Kalabusheva, Veniamin S. Fishman, Julia
Kzhyshkowska, Claudio Graziano, Pamela Magini, Giovanni Romeo, Igor N. Lebedev AM J MED GENET A, 2018
Interpreting chromosomal rearrangements in the context
of 3-dimentional genome organization: a practical guide for medical genetics V.S. Fishman, P.A. Salnikov, N.R. Battulin BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2018
Церебральные органоиды – перспективная модель в клеточных технологиях Т. А. Шнайдер Vavilov journal of genetics and breeding, 2018
2017
5’-биспиренильные зонды типа «молекулярный маяк» для детекции РНК. Крашенинина О.А., Фишман В.С., Новопашина Д.С., Веньяминова А.Г. Биоорганическая химия, 2017, №3, Том 43
Rational design and studies of excimer forming novel dual probes to target RNA Krasheninina OA, Lomzov AA, Fishman VS, Novopashina DS, Venyaminova AG. Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2017, Apr 1;25(7):2244-2250
Deterministic versus stochastic model of reprogramming: new evidence from cellular barcoding technique Anastasia M. Yunusova, Veniamin S. Fishman, Gennady V. Vasiliev, Nariman R. Battulin. OPEN BIOL, 2017, 7 (4)
Спонтанная хромосомная нестабильность в клетках с кольцевой хромосомой как основа хромосомной терапии Кашеварова А.А., Беляева Е.О., Никонов А.М., Плотникова О.В., Гергерт И.Г., Никитина Т.В., Скрябин Н.А., Мензоров А.Г., Гридина М.М., Васильев С.А., Лопаткина М.Е., Савченко Р.Р., Чурилова А.В., Толмачева Е.Н., Серов О.Л., Назаренко Л.П., Лебедев И.Н. Медицинская генетика, 2017, 12:18-26
Получение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток американской норки: протокол Пристяжнюк Инна Евгеньевна, Мензоров Алексей Гаврилович Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 2017;21(6):701-709 DOI 10.18699/VJ17.288
Изучение инактивации Х-хромосом в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках американской норки Пристяжнюк И.Е., Мензоров А.Г. Цитология, 2017, 2017;59(11):783
Получение ИПСК с кольцевыми хромосомами и анализ их стабильности в соматических и плюрипотентных клетках Никитина Т.В., Васильев С.А., Мензоров А.Г., Кашеварова А.А., Чурилова А.В., Гридина М.М., Беляева Е.О., Лебедев И.Н. Гены и клетки, 2017, 2017;12(3):177
Нарушение экспрессии аллелей гена CNTN6 в нейронах, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток пациента с 3p26.3 микродупликацией Гридина М.М., Матвеева Н.М., Фишман В.С., Мензоров А.Г., Кизилова Е.А., Ковригин И.И., Пристяжнюк И.Е., Никитина Т.В., Кашеварова А.А., Скрябин Н.А., Назаренко Л.П., Лебедев И.Н., Серов О.Л. Гены и клетки, 2017, 12(3):76-77
Alternative dominance of the parental genomes in hybrid cells generated through the fusion of mouse embryonic stem cells with fibroblasts Matveeva N.M., Fishman V.S., Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Pristyazhnyuk I.E., Menzorov A.G., Serov O.L. SCI REP-UK, 2017, 7(1):18094.
Установление границ хромосомных перестроек у пациентов с микроделециями и микродупликациями 3p26.3 Гридина М.М., Шнайдер Т.А., Ковригин И.И., Мензоров А.Г., Фишман В.С. Acta Naturae, 2017, 9(1):84
Identical phenotypes of inherited reciprocal chromosomal microdeletions and microduplications are explained by similar expression levels of genes affected by CNVs Lebedev I.N., Gridina M.M., Menzorov A.G., Matveeva N.M., Pristyazhnyuk I.E., Shnaider T.A., Nazarenko L.P., Skryabin N.A., Nikitina T.V., Sazhenova E.A., Kashevarova A.A., Serov O.L. Mol Cytogen, 2017, 10(Suppl 1):1.P15
2016
Erratum to: comparison of the three-dimensional organization of sperm and fibroblast genomes using the Hi-C approach Nariman Battulin, Veniamin S Fishman, Alexander M Mazur, Mikhail Pomaznoy, Anna A Khabarova, Dmitry A Afonnikov, Egor B Prokhortchouk, Oleg L Serov GENOME BIOL, 2016
2005
Видимая и «скрытая» сегрегация родительских хромосом в эмбриональных стволовых гибридных клетках Пристяжнюк И.Е., Темирова С.А., Мензоров А.Г., Круглова А.А., Матвеева Н.М., Серов О.Л. RUSS J DEV BIOL+, 2005, Онтогенез. 2005. Т. 36(2):151-8.
