Effects of Prolonged Exposure to Manganese Chloride on the Brain Serotonin Metabolism and Serotonin-Regulated Behavior in Zebrafish A. E. Izyurov, I. E. Sorokin, V. S. Evsiukova, D. A. Zolotova, P. A. Kulikov, and A. V. Kulikov NEUROCHEM J+, 2025, Volume 18, pages 674–681, (2024)
The C1473G Mutation in the Mouse Tph2 Gene: From Molecular Mechanism to Biological Consequence Nikita V. Khotskin, Polina D. Komleva, Alla B. Arefieva,Vitalii S. Moskaliuk, Anna Khotskina,
Ghofran Alhalabi, Arseniy E. Izyurov, Nadezhda A. Sinyakova, Daniil Sherbakov, Elizabeth A. Kulikova,
Daria V. Bazovkina, and Alexander V. Kulikov Biomolecules, 2025, Volume 15, Issue 4
Combining chromosome conformation capture and exome sequencing for simultaneous detection of structural and single-nucleotide variants Maria Gridina, Timofey Lagunov, Polina Belokopytova, Nikita Torgunakov, Miroslav Nuriddinov, Artem Nurislamov, Lyudmila P Nazarenko, Anna A Kashevarova, Maria E Lopatkina, Stanislav Vasilyev, Andrey Zuev, Elena O Belyaeva, Olga A Salyukova, Aleksandr D Cheremnykh, Natalia N Sukhanova, Marina E Minzhenkova, Zhanna G Markova, Nina A Demina, Yana Stepanchuk, Anna Khabarova, Alexandra Yan, Emil Valeev, Galina Koksharova, Elena V Grigor’eva, Natalia Kokh, Tatiana Lukjanova, Yulia Maximova, Elizaveta Musatova, Elena Shabanova, Andrey Kechin, Evgeniy Khrapov, Uliana Boyarskih, Oxana Ryzhkova, Maria Suntsova, Alina Matrosova, Mikhail Karoli, Andrey Manakhov, Maxim Filipenko, Evgeny Rogaev, Nadezhda V Shilova, Igor N Lebedev, Veniamin Fishman GENOME MED, 2025, May 7;17:47
2024
ВЛИЯНИЕ ДЛИТЕЛЬНОГО ВОЗДЕЙСТВИЯ ХЛОРИДА МАРГАНЦА НА МЕТАБОЛИЗМ СЕРОТОНИНА В МОЗГЕ И РЕГУЛИРУЕМОЕ СЕРОТОНИНОМ ПОВЕДЕНИЕ РЫБ ВИДА DANIO RERIO А.Е.Изъюров, И.Е.Сорокин, В.С.Евсюкова, Д.Золотова, П.А.Куликов, А.В.Куликов Нейрохимия, 2024, Т.41, вып. 3, С.276–284
Structural variants in the Epb41l4a locus: TAD disruption and Nrep gene misregulation as hypothetical drivers of neurodevelopmental outcomes Paul Salnikov, Alexey Korablev, Irina Serova, Polina Belokopytova, Aleksandra Yan, Yana Stepanchuk, Savelii Tikhomirov, Veniamin Fishman SCI REP-UK, 2024, Article number: 5288
Modification of the Hi-C Technology for Molecular Genetic Analysis of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Sections of Tumor Tissues Maria M Gridina, Yana K Stepanchuk, Miroslav A Nurridinov, Timofey A Lagunov, Nikita Yu Torgunakov, Artem A Shadsky, Anastasia I Ryabova, Nikolay V Vasiliev, Sergey V Vtorushin, Tatyana S Gerashchenko, Evgeny V Denisov, Mikhail A Travin, Maxim A Korolev, Veniamin S Fishman BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2024
TAD border deletion at the Kit locus causes tissue-specific ectopic activation of a neighboring gene. Kabirova E, Ryzhkova A, Lukyanchikova V, Khabarova A, Korablev A, Shnaider T, Nuriddinov M, Belokopytova P, Smirnov A, Khotskin NV, Kontsevaya G, Serova I, Battulin N. NAT COMMUN, 2024
Irreversible lipid phase transition detected in a porcine oocyte at chilling Okotrub K.A., Omelchenko A.N., Chuyko E.A., Amstislavsky S.Y., Surovtsev N.V. CRYOBIOLOGY, 2024, 114, 104850
Characterizing a Lethal CAG-ACE2 Transgenic Mouse Model for SARS-CoV-2 infection with Using Cas9-Enhanced Nanopore Sequencing Smirnov A, Nurislamov A, Galina Koncevaya G, Serova I, Kabirova E, Chuyko E, Maltceva E, Savoskin M, Zadorozhny D, Svyatchenko VA, Protopopova EV, Taranov OS, Legostaev SS, Loktev VB, Serov O, Battulin N TRANSGENIC RES, 2024, 33(5):453-466
2023
Alterations in the Level of mRNA of TPH1, TPH2 Genes, Tryptophan Hydroxylase Activity and Serotonin Metabolism in Mouse Brain Five Days after Lipopolysaccharide Administration D. V. Sherbakov, A. B. Arefieva, P. D. Komleva, A. E. Iz’urov, N. V. Khotskin,
D. V. Bazovkina, and A. V. Kulikov Molecular Biology, 2023, Volume 57, pages 284–290, (2023)
Изменения в социальном предпочтении места и плотность дофаминергических нейронов в вентральном тегментуме у Clsnt2-KO мышей Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Брусенцев Е.Ю., Ульданова Е.Е., Чуйко Э.А., Напримеров В.А., Липина Т.В., Амстиславская Т.Г., Амстиславский С.Я. Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, Т. 27. № 2. С. 177-184.
Hi-C analysis of genomic contacts revealed karyotype abnormalities in chicken HD3 cell line Maslova A, Plotnikov V, Nuriddinov M, Gridina M, Fishman V, Krasikova BMC GENOMICS, 2023
Lethal Yellow Mutation Causes Anxiety, Obsessive-compulsive Behavior and Affects the Brain Melanocortin System in Males and Females of Mice Arseniy E. Izyurov, Alexandra V. Plyusnina, Elizabeth A. Kulikova, Alexander V. Kulikov, Nikita V. Khotskin CURR PROTEIN PEPT SC, 2023
Effects of the Combination of the C1473G Mutation in the Tph2 Gene and Lethal Yellow Mutations in the Raly-Agouti Locus on Behavior, Brain 5-HT and Melanocortin Systems in Mice Komleva P.D., Alhalabi G., Izyurov A.E., Khotskin N.V., Kulikov A.V. Biomolecules, 2023, V. 13, N 6, P.963
Изменения уровня мРНК генов Tph1, Tph2, активности триптофангидроксилазы и метаболизма серотонина в мозге мышей через 5 суток после введения липополисахарида Д. В. Щербаков, А. Б. Арефьева, П. Д. Комлева, А. Е. Изъюров, Н. В. Хоцкин , Д. В. Базовкина, А. В. Куликов Молекулярная биология, 2023, T. 57. № 2, стр. 299-306
2022
ВЛИЯНИЕ ЛИНОЛЕВОЙ КИСЛОТЫ НА ЭФФЕКТИВНОСТЬ ВИТРИФИКАЦИИ ЭМБРИОНОВ МЫШЕЙ Е.Ю. Брусенцев, Т.Н. Игонина, С.В. Окотруб, Э.А. Чуйко, С.Я. Амстиславский Онтогенез, 2022, Т. 53, № 1, С. 58–62
ЭФФЕКТЫ ПРЕНАТАЛЬНОГО ВОЗДЕЙСТВИЯ ЭКЗОГЕННОГО ГОНАДОТРОПИНА НА РАЗВИТИЕ МОЗГА У МЫШЕЙ С.В. Окотруб, И.Н. Рожкова, Е.Ю. Брусенцев, А.М. Горностаева, Д.С. Рагаева, Э.А. Чуйко, С.Я. Амстиславский Журнал высшей нервной деятельности, 2022, Т. 72, № 1, С. 119–131
Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects Varvara Lukyanchikova*, Miroslav Nuriddinov*, Polina Belokopytova, Alena Taskina, Jiangtao Liang, Maarten Reijnders, Livio Ruzzante, Romain Feron, Robert Waterhouse, Yang Wu, Chunhong Mao, Zhijian Tu, Igor Sharakhov, and Veniamin Fishman
* authors contributed equally NAT COMMUN, 2022
Плотность нейронов в коре головного мозга и гиппокампе мышей линии Clsnt2-KO – модели расстройств аутистического спектра Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Брусенцев Е.Ю., Ульданова Е.Е., Чуйко Э.А., Липина Т.В., Амстиславская Т.Г., Амстиславский С.Я. Vavilov journal of genetics and breeding, 2022, 26(4):365-370
Влияние линолевой кислоты на криоконсервацию полученных путем ЭКО эмбрионов домашней кошки Окотруб С.В., Лебедева Д.А., Окотруб К.А., Чуйко Э.А., Брусенцев Е.Ю., Рахманова Т.А., Амстиславский С.Я. Онтогенез, 2022, Т. 53, № 5, С. 345–357.
A Newly Identified Monoterpenoid-Based Small
Molecule Able to Support the Survival of Primary Cultured Dopamine Neurons and Alleviate MPTP-Induced Toxicity <i>In Vivo</i>. Kotliarova A, Podturkina AV, Pavlova AV, Gorina DS, Lastovka AV, Ardashov OV, Rogachev AD, Izyurov AE, Arefieva AB, Kulikov AV, Tolstikova TG, Volcho KP,
Salakhutdinov NF, Sidorova Y. MOLECULES, 2022, V.27, 23:8286
2021
Alteration of the lipid phase transition during mouse embryos freezing after in vitro culture with linoleic acid T.N. Igonina, K.A. Okotrub, E.Yu. Brusentsev, E.A. Chuyko, D.S. Ragaeva, S.V. Ranneva, S.Ya. Amstislavsky CRYOBIOLOGY, 2021, S0011-2240(21)00014-6.
Effects of neonatal dexamethasone and CpdA on the expression of genes for apoptosis regulator proteins in the neonatal hippocampus Ланшаков Д. А., Сухарева Е. В., Булыгина В. В., Лагунов Т. А., Калинина Т. С. Интегративная физиология, 2021
2020
Quantitative prediction of enhancer-promoter interactions Polina Belokopytova, Miroslav Nuriddinov, Evgeniy Mozheiko, Daniil Fishman, Veniamin Fishman GENOME RES, 2020, 30(1):72-84
2019
3D organization of chicken genome demonstrates evolutionary conservation of topologically associated domains and highlights unique architecture of erythrocytes' chromatin. Fishman V., Battulin N., Nuriddinov M., Maslova A., Zlotina A., Strunov A., Chervyakova D.,
Korablev A., Serov O., Krasikova A. NUCLEIC ACIDS RES, 2019
C-InterSecture—a computational tool for interspecies comparison of genome architecture Нуриддинов Мирослав Абдурахимович
Фишман Вениамин Семёнович BIOINFORMATICS, 2019, Volume 35, Issue 23, 1 December 2019, Pages 4912–4921,
2018
Interpreting chromosomal rearrangements in the context
of 3-dimentional genome organization: a practical guide for medical genetics V.S. Fishman, P.A. Salnikov, N.R. Battulin BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2018
2013
Математическое моделирование синтеза биоэтанола и молочной кислоты термофильными бактериями рода Geobacillus М.А. Нуриддинов, Ф.В. Казанцев, А.С. Розанов, К.Н. Козлов, С.Е. Пельтек, Н.А. Колчанов, И.Р. Акбердин Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Том 17, №4/1, стр. 686-704
Компьютерный анализ структуры липаз бактерий рода Geobacillus и выявление мотивов, влияющих на их термостабильность. Сорокина К.Н., Нуриддинов М.А., Розанов А.С., Иванисенко В.А., Пельтек С.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, Т.17, С. 666-674
