Сравнительный анализ гаплотипов, несущих патогенные варианты c.1545T>G, c.2027T>A и c.919-2A>G гена SLC26A4, у пациентов с потерей слуха из Республики Тыва (Южная Сибирь) В.Ю. Данильченко, М.В. Зыцарь, Е.А. Панина, К.Е. Орищенко, О.Л. Посух Vavilov journal of genetics and breeding, 2025, 29(1): 144-152
Analysis by Minigene Assay of the Splicing Effect of a Novel Variant c.1545T>G in the SLC26A4 Gene Associated with Hearing Loss E. A. Panina, V. Yu. Danilchenko, M. V. Zytsar, K. E. Orishchenko, and O. L. Posukh RUSS J GENET+, 2025
Анализ методом минигенов влияния на сплайсинг нового варианта c.1545T>G в гене SLC26A4, ассоциированного с потерей слуха Е.А. Панина, В.Ю. Данильченко, М.В. Зыцарь, К.Е. Орищенко, О.Л. Посух Генетика, 2025, том 61, № 5, с. 103–109
2024
A case report of Pallister-Killian syndrome with an unusual mosaic supernumerary marker chromosome 12 with interstitial 12p13.1-p12.1 duplication Karamysheva T.V., Lebedev I.N., Minaycheva L.I., Nazarenko L.P., Kashevarova A.A., Fedotov D.A., Skryabin N.A., Lopatkina M.E., Cheremnykh A.D., Fonova E.A., Nikitina T.V., Sazhenova E.A., Skleimova M.M., Kolesnikov N.A., Drozdov G.V., Yakovleva Y.S., Seitova G.N., Orishchenko K.E., Rubtsov N.B. Frontiers in Genetics, 2024, Front. Genet. 15:1331066
Crosstalk between BER and NHEJ in XRCC4-deficient cells depending on hTERT overexpression Svetlana V. Sergeeva,Polina S. Loshchenova, Dmitry Yu. Oshchepkov, Konstantin E. Orishchenko INT J MOL SCI, 2024, Int. J. Mol. Sci. 2024, 25(19), 10405
2023
Insight into the Natural History of Pathogenic Variant c.919-2A>G in the SLC26A4 Gene Involved in Hearing Loss: The Evidence for Its Common Origin in Southern Siberia (Russia) Danilchenko V. Y., Zytsar M. V., Maslova E. A., Orishchenko K.E, Posukh O.L. Genes, 2023, 14, 928.
Functional Consequences of Pathogenic Variants of the GJB2 Gene (Cx26) Localized in Different Cx26 Domains Olga L. Posukh, Ekaterina A. Maslova, Valeriia Yu. Danilchenko, Marina V. Zytsar, Konstantin E. Orishchenko Biomolecules, 2023, 13(10):1521
Изучение пролиферативной активности популяций стромальных клеток роговицы человека Н.А.Бондаренко, М.А.Суровцева, И.И.Ким, К.Ю.Краснер, К.Е.Орищенко, А.Н.Трунов, В.В.Черных, О.В.Повещенко Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2023, Том: 176 Номер: 7 Год: 2023 Страницы: 122-127
2022
Escherichia coli JM109 in LB as a model bacterial system to study magnetic field effect in recombination of non-correlated pair of biologically relevant radicals nitric oxide and superoxide anion in high magnetic fields Svetlana V.Sergeeva, Dmitri V.Petrovsky, Tatiana V.Kobzeva, Dmitri V.Stass BIOPHYS J, 2022, Volume 121, Issue 3, Supplement 1, 11 February 2022, Pages 407a-408a
The Precise Breakpoint Mapping in Paracentric Inversion 10q22.2q23.3 by Comprehensive Cytogenomic Analysis, Multicolor Banding, and Single-Copy Chromosome Sequencing Tatyana V. Karamysheva, Tatyana A. Gayner, Eugeny A. Elisaphenko, Vladimir A. Trifonov, Elvira G. Zakirova, Konstantin E. Orishchenko, Mariya A. Prokhorovich, Maria E. Lopatkina, Nikolay A. Skryabin, Igor N. Lebedev, Nikolay B. Rubtsov Biomedicines, 2022, 10, 3255
2021
Functional Evaluation of a Rare Variant c.516G>C (p.Trp172Cys) in the GJB2 (Connexin 26) Gene Associated with Nonsyndromic Hearing Loss. Maslova E.A., Orishchenko K.E., Posukh O.L. Biomolecules, 2021, 11(1), 61
Natural and Artificial Mechanisms of Mitochondrial Genome Elimination Elvira G. Zakirova,Vladimir V. Muzyka,Ilya O. Mazunin and Konstantin E. Orishchenko Life, 2021, Life 2021, 11(2), 76
Recent Advances in the Development of Exogenous dsRNA for the Induction of RNA Interference in Cancer Therapy Tatiana S. Golubeva, Viktoria A. Cherenko, Konstantin E. Orishchenko MOLECULES, 2021
Adaptation of CRISPR/Cas9 system for directed elimination of mitochondrial DNA copies with mutations Zakirova, E., Mazunin, I., Orishchenko K. FEBS Open Bio, 2021, 11: P-01.1-40
Модельная бактериальная система для исследования
возможного влияния сильного магнитного поля на биохимические реакции с
участием свободных радикалов на клеточном уровне С.В. Сергеева, Д.В. Петровский, Т.В. Кобзева, Д.В. Стась Известия АН. Серия химическая, 2021, №12
A Method for Assessing the Efficiency of the Nucleotide Excision Repair System Ex Vivo A A Popov, K E Orishchenko, K N Naumenko, A N Evdokimov, I O Petruseva, O I Lavrik Acta Naturae, 2021, Jul-Sep 2021;13(3):122-125.
New Data on Organization and Spatial Localization of B-Chromosomes in Cell Nuclei of the Yellow-Necked Mouse Apodemus flavicollis Karamysheva T, Romanenko S, Makunin A, Rajičić M, Bogdanov A, Trifonov V, Blagojević J, Vujošević M, Orishchenko K, Rubtsov N. Cells, 2021, 2021 Jul 19;10(7):1819
Boron-containing nucleosides as tools for boron-neutron capture therapy Zharkov, D. O., Yudkina, A., Riesebeck, T., Loshchenova, P. S., Mostovich, E. A. & Dianov, G. L. American Journal of Cancer Research, 2021, том 11, выпуск 10, стр. 4668-4682
Model bacterial system to study the possible eff ect of strong magnetic fi elds
on biochemical reactions involving free radicals at the cellular level S. V. Sergeeva, D. V. Petrovsky, T. V. Kobzeva, and D. V. Stass RUSS CHEM B+, 2021, Vol. 70, No. 12, pp. 2332—2338, December, 2021
Genetic interplay between transcription factor Pou4f1/Brn3a and neurotrophin receptor Ret in retinal ganglion cell type specification Muzyka VV, Badea TC NEURAL DEV, 2021, 16:5
Получение рекомбинантного штамма Komagataella phaffi – продуцента протеиназы К из Tritirachium album А. Б. Беклемишев, М. Б. Пыхтина, Я. М. Куликов, Т. Н. Горячковская, Д. В. Бочков, С. В. Сергеева, А. Р. Васильева, В. П. Романов, Д. С. Новикова, С. Е. Пельтек Vavilov journal of genetics and breeding, 2021, Том 25, № 8 (2021)
2020
Two Separate Cases: Complex Chromosomal Abnormality Involving Three Chromosomes and Small Supernumerary Marker Chromosome in Patients with Impaired Reproductive Function. Karamysheva T.V., Gayner T.A., Muzyka V.V., Orishchenko K.E., Rubtsov N.B. Genes, 2020, Genes 2020, 11, 1511
Effects
of prolonged subchronic benzo(α)pyrene exposure on rat liver morphology
and CYP1A expression during treatment with menadione, quercetin, or
tocopherol M. L. Perepechaeva , N. V. Gubanova, A. Y. Grishanova DRUG CHEM TOXICOL, 2020
The role of Sp1 in the detection and elimination of cells with persistent DNA strand breaks. Polina S. Loshchenova, Svetlana V. Sergeeva, Sally C. Fletcher and Grigory L. Dianov. NAR Cancer, 2020, Vol. 2, No. 2
Sp1-independent downregulation of NHEJ in response to BER deficiency. Loshchenova PS, Sergeeva SV, Limonov DV, Guo Z, Dianov GL. DNA REPAIR, 2020, 2020 Feb;86:102740. Epub 2019 Nov 11.
Получение и характеристика эмбриональных стволовых клеток человека с повышенной экспрессией HIF-2A Живень М.К., Захарова И.С., Шевченко А.И., Елисафенко Е., Орищенко К.Е., Закиян С.М. Гены и клетки, 2020, Т. 15. № 1. С. 29-36.
Изучение влияния детерминант митохондриального импорта в структуре нРНК на активность комплекса нРНК/SpCas9 in vitro. Закирова Э.Г., Вяткин Ю.В., Верещагина Н.А., Музыка В.В., Мазунин И.О., Орищенко К.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 2020;24(5):512-518
Study of the effect of the introduction of mitochondrial import determinants into the gRNA structure on the activity of the gRNA/SpCas9 complex in vitro. Zakirova E.G., Vyatkin Y.V., Verechshagina N.A., Muzyka V.V., Mazunin I.O., Orishchenko K.E. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 2020;24(5):512-518
Изучение функциональной значимости варианта с.516G>C (p.Trp172Cys) гена GJB2, ассоциированного с потерей слуха у коренного населения Южной Сибири Маслова Е.А., Зыцарь М.В., Данильченко В.Ю., Орищенко К.Е., Посух О.Л. Медицинская генетика, 2020, Т.19. №7(216). С.51-53
2019
Future of human mitochondrial DNA editing technologies Verechshagina N, Nikitchina N, Yamada Y, Harashima Н, Tanaka M, Orishchenko K, Mazunin I. Mitochondrial DNA Part A: DNA Mapping, Sequencing, and Analysis, 2019, Mar;30(2):214-221
Targeted genomic integration of EGFP under tubulin beta 3 class III promoter and mEos2 under tryptophan hydroxylase 2 promoter does not produce sufficient levels of reporter gene expression Aleksei G. Menzorov
Konstantin E. Orishchenko
Veniamin S. Fishman
Anastasia A. Shevtsova
Roman V. Mungalov
Inna E. Pristyazhnyuk
Elena A. Kizilova
Natalia M. Matveeva
Natalia Alenina
Michael Bader
Nikolai B. Rubtsov
Oleg L. Serov J CELL BIOCHEM, 2019, 120(10):17208-17218
Использование тимидинкиназы для отрицательной селекции индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Алексей Гавриилович Мензоров, Константин
Евгеньевич Орищенко, Мария Михайловна
Гридина, Вениамин Семенович Фишман,
Олег Леонидович Серов, Анна Александровна
Кашеварова, Татьяна Владимировна
Никитина, Игорь Николаевич Лебедев Гены и клетки, 2019, Том XIV, Приложение, 2019, С. 150-151
Исследование цитотоксического эффекта магниевых сплавов на клеточные культуры Т.С. Фролова, А.А. Бойков, А.Р. Таркова, К.Е. Орищенко, А.А. Прохорихин, Д.У. Малаев, О.И. Синицина, В.И. Байструков, Е.И. Кретов, М.В. Прямов, Д.Л. Мерсон, А.Ю. Виноградов Патология кровообращения и кардиохирургия, 2019
2018
Analysis of the Basic Characteristics of Osteogenic and Chondrogenic Cell Lines Important for Tissue Engineering Implants Astakhova N.M., Korel’ A.V., Shchelkunova E.I., Orishchenko K.E., Nikolaev S.V., Zubairova U.S., Kirilova I.A. B EXP BIOL MED+, 2018, 5 March 2018, Pages 1-8
Анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным транскриптомного секвенирования. Ковалев С.С., Губанова Н.В., Леберфарб Е.Ю., Брагин А.О., Орлов Ю.Л. Гены и клетки, 2018, Приложение, No 1, стр.71-72
Компьютерный анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq С. С. Ковалев, Е. Ю. Леберфарб, Н. В. Губанова, А. О. Брагин, А. Г. Галиева,А. В. Цуканов, В. Н. Бабенко, Ю. Л. Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, Том 16, № 3, С.22-36
Оценка эффективности эрадикации стволовых инициирующих раковых клеток на примере первичных культур глиобластомы человека Долгова Е.В., Проскурина А.С., Поттер Е.А., Тыринова Т.В., Николин В.П., Попова Н.А., Таранов О.С., Ефремов Я.Р., Орищенко К.Е., Завьялов Е.Л., Мишинов С.В., Ступак В.В., Останин А.А., Черных Е.Р., Богачев С.С. Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, Т. 19. – №. 6. – С. 1-11
2017
Экспрессия генов цитокинов, антигенов дифференцировки и факторов транскрипции в дендритных клетках человека, активированных двуцепочечной ДНК Проскурина А.С., Орищенко К.Е., Поттер Е.А., Долгова Е.В., Спасельникова А.В., Риттер Г.С., Вараксин Н.А., Рябичева Т.Г., Леплина О.Ю., Останин А.А., Черных Е.Р., Богачев С.С. Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, Т. 21, № 6, стр. 717-727
Дифференциальная экспрессия и альтернативный сплайсинг в культурах клеток глиом по данным RNA-seq Губанова Н.В., Брагин А.О., Бабенко В.Н., Гайтан А.С., Кривошапкин А.Л., Орлов Ю.Л. Acta Naturae, 2017, Том 9(1). С.19
Изучение базовых характеристик клеток остеогенного и хондрогенного рядов, значимых для тканевой инженерии имплантов Астахова Н.М., Корель А.В., Щелкунова Е.И., Орищенко К.Е., Николаев С.В., Зубаирова У.С, Кирилова И.А. Клеточные технологии в биологии и медицине, 2017, №4, С. 249-257
2016
2.3 THz radiation: Absence of genotoxicity/mutagenicity in Escherichia coli and Salmonella typhimurium Svetlana Sergeeva, Elisaveta Demidova, Olga Sinitsyna, Tatiana Goryachkovskaya, Alla Bryanskaya, Artem Semenov, Irina Meshcheryakova, Grigory Dianov, Vasiliy Popik, Sergey Peltek MUTAT RES-GEN TOX EN, 2016
Импорт нуклеазы Cas9 в митохондрии К.Е. Орищенко, Ю.К. Софронова, Е.Г. Чупахин, Е.А. Лунeв, И.О. Мазунин Гены и клетки, 2016, №2, Том XI, 100-105
Five-year disease-free survival among stage II-IV breast cancer patients receiving FAC and AC chemotherapy in phase II clinical trials of Panagen Proskurina AS, Gvozdeva TS, Potter EA, Dolgova EV, Orishchenko KE, Nikolin VP, Popova NA, Sidorov SV, Chernykh ER, Ostanin AA, Leplina OY, Dvornichenko VV, Ponomarenko DM, Soldatova GS, Varaksin NA, Ryabicheva TG, Uchakin PN, Rogachev VA, Shurdov MA, Bogachev SS. BMC CANCER, 2016, 16:651. doi: 10.1186/s12885-016-2711-5
Detection of Mutations in Mitochondrial DNA by Droplet Digital PCR J. K. Sofronova, Y. Y. Ilinsky, K. E. Orishchenko, E. G. Chupakhin, E. A. Lunev, I. O. Mazunin BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2016, Vol. 81, No. 10, pp. 1031-1037.
Characterization of avian paramyxovirus type 6 isolated from a Eurasian teal in the intersection of migratory flyways in Russia Sobolev I.A., Sharshov K., Yurchenko K., Korneev D., Glushchenko A., Alikina T., Kabilov M., Bi Y., Liu W., Gubanova N., Shestopalov A. ARCH VIROL, 2016, 161(11), pp. 3275-9
Complete genome sequences of two Newcastle disease virus strains isolated from a wild duck and a pigeon in Russia Kabilov M.R., Alikina T.Y., Yurchenko K.S., Glushenko A.V., Gunbin K.V., Shestopalov A.M., Gubanova N.V. Genome Announcements, 2016, 4(6):e01348-16
2015
Онколитические свойства вируса болезни Ньюкасла Юрченко К.С., Губанова Н.В., Шестопалова Л.В., Шестопалов А.М. Тихоокеанский медицинский журнал, 2015, №3. С.: 14-18.
Возможности бор-нейтронозахватной терапии в лечении злокачественных опухолей головного мозга Каныгин В.В., Кичигин А.И., Губанова Н.В., Таскаев С.Ю. Вестник Рентгенологии и Радиологии, 2015, №6. С.: 36-42.
Influence of Antioxidant SkQ1 on Accumulation of Mitochondrial DNA Deletions in the Hippocampus of Senescence-Accelerated OXYS Rats P. S. Loshchenova, O. I. Sinitsyna, L. A. Fedoseeva, N. A. Stefanova, and N. G. Kolosova BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2015, V ol. 80, No. 5, pp. 596-603
Activity of Heat Shock Genes’ Promoters in Thermally Contrasting Animal Species Lyubov N. Astakhova, Olga G. Zatsepina, Sergei Yu. Funikov, Elena S. Zelentsova, Natalia G. Schostak, Konstantin E. Orishchenko, Michael B. Evgen’ev, David G. Garbuz PloS One, 2015, V.10, p. e0115536
Cell divisions are not essential for the direct conversion of fibroblasts into neuronal cells VS Fishman, TA Shnayder, KE Orishchenko, M Bader, N Alenina and OL Serov CELL CYCLE, 2015, 14 (8) 1188-1196
Results of multicenter double-blind placebocontrolled phase II clinical trial of Panagen preparation to evaluate its leukostimulatory activity and formation of the adaptive immune response in patients with stage II-IV breast cancer Anastasia S Proskurina, Tatiana S Gvozdeva, Ekaterina A Alyamkina, Evgenia V Dolgova, Konstantin E Orishchenko, Valeriy P Nikolin, Nelly A Popova, Sergey V Sidorov, Elena R Chernykh, Alexandr A Ostanin, Olga Y Leplina, Victoria V Dvornichenko, Dmitriy M Ponomarenko, Galina S Soldatova, Nikolay A Varaksin, Tatiana G Ryabicheva, Stanislav N Zagrebelniy, Vladimir A Rogachev, Sergey S Bogachev and Mikhail A Shurdov BMC CANCER, 2015, 15:122 DOI 10.1186/s12885-015-1142-z
2014
The study of oncolytic properties of Newcastle disease virus strains isolated from birds Yurchenko K. S., Glushchenko A. V., Romaschenko A. V., Shestopalova L. V., Shestopalov A. M., Gubanova N. V. HUM GENE THER, 2014, Vol. 25, Iss. 12, P.: 9-10
Изучение онколитических свойств природных изолятов вируса болезни Ньюкасла Юрченко К.С., Глущенко А.В., Губанова Н.В., Ромащенко А.В. Сибирский онкологический журнал, 2014, № S1. С. 133-134.
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛНЫХ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК КРЫС ЛИНИЙ WISTAR И OXYS ПИТОМНИКА ЛАБОРАТОРНЫХ ЖИВОТНЫХ ИЦИГ СО РАН Р.А. Максютов, Е.В. Гаврилова, Т.С. Непомнящих, У.Н. Роцкая, П.С. Лощенова, Н.Г. Колосова, О.И. Синицина, С.Н. Щелкунов Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, том 18, No 3, с. 437-445
2013
Структурно-функциональные основы ускоренной инволюции тимуса у крыс OXYS Л. А. Обухова, В. Б. Вайс, Л. Е. Бакеева, С. В. Сергеева, Н. Г. Колосова Успехи геронтологии, 2013, Т. 26. № 2. С. 229–235
Соматические мутации в гене цитохрома b митохондриальной ДНК гиппокампа крыс линии Wistar Лощенова П.С., Рогозин И. Б., Роцкая У.Н., Малярчук Б.А., Невинский Г.А., Синицына О. И. Экологическая генетика, 2013, Том ХI, №2
2011
Stability and reactivity of free radicals: a physicochemical perspective with biological implications. Tatiana Yu. Karogodina, Svetlana V. Sergeeva, and Dmitri V. Stass. HEMOGLOBIN, 2011, Volume 35, Number 3, pp 262-275, ISSN: 0363-0269 print/1532-432X
Kinetic magnetic field effect involving small biologically relevant inorganic radicals NO and O2-- T.Yu. Karogodina, I. G. Dranov, S.V. Sergeeva, U. E. Steiner, and D. V. Stass. PHYS CHEM CHEM PHYS, 2011, 12(9):1714-28
Магнитный эффект в реакции рекомбинации радикалов оксида азота и супероксид-аниона в сильном поле Т. Ю. Карогодина, С. В. Сергеева, Д. В. Стась, У. E. Штайнер (U.E.Steiner) Doklady Akademii Nauk, 2011, том 436, № 2, с. 207–209
Magnetic Field Effect on Recombination of Nitric Oxide and Superoxide Anion in High Magnetic Field. T.Yu. Karogodina, S.V.Sergeeva, D.V. Stass, and U. E. Steiner DOKL PHYS CHEM, 2011, Doklady Physical Chemistry, 2011, Vol. 436, Part 1, pp. 5–7. ISSN 0012_5016, Pleiades Publishing, Ltd., 2011. Published in Russian in Doklady Akademii Nauk, 2011, Vol. 436, No. 2, pp. 207–209.
2009
Magnetic Field Effect in the Reaction of Recombination of Nitric Oxide and Superoxide Anion Karogodina TY, Sergeeva SV, Stass DV APPL MAGN RESON, 2009, V.36 I:2-4 P: 195-208
2007
Early-life hypoxia in the development of behavioral dysfunctions in accelerated-senescence OXYS rats and its correction with antioxidants Korbolina E.E., Agafonova I.G., Sergeeva S.V., Trofimova N.A., Mishenko N.P., Kolosova N.G. Adv. Gerontol, 2007, Vol. 20. N 3. P. 46-48.
2006
Development of behavioural dysfunctions in accelerated-senescence OXYS rats is associated with early postnatal alterations in brain phosphate metabolism Sergeeva S.V., Bagryanskaya E.G., Korbolina E.E., Kolosova N.G. EXP GERONTOL, 2006, 41(2):141-50.
19F NMR measurements of NO production in hypertensive ISIAH and OXYS rats. Bobko AA, Sergeeva SV, Bagryanskaya EG, Markel AL, Khramtsov VV, Reznikov VA, Kolosova NG Biochem Biophys Res Commun, 2005, 330(2):367-70.
Increased stress reactivity as a possible factor of early degenerative changes in OXYS rats. Kolosova NG, Trofimova NA, Shcheglova TV, Sergeeva SV. B EXP BIOL MED+, 2005, 139(4):397-9.
