Identification of Key Differentially Expressed Genes in Arabidopsis thaliana Under Short- and Long-Term High Light Stress Aleksandr V. Bobrovskikh, Ulyana S. Zubairova, Alexey V. Doroshkov INT J MOL SCI, 2025, Том 26, № 16, Стр. 7790
Transcriptome analysis reveals significant discrepancies between two in vitro models of host-trematode interaction Ekaterina A. Lishai, Dmitry V. Ponomarev, Oxana G. Zaparina, Maria Y. Pakharukova ACTA TROP, 2025
The C1473G Mutation in the Mouse Tph2 Gene: From Molecular Mechanism to Biological Consequence Nikita V. Khotskin, Polina D. Komleva, Alla B. Arefieva,Vitalii S. Moskaliuk, Anna Khotskina,
Ghofran Alhalabi, Arseniy E. Izyurov, Nadezhda A. Sinyakova, Daniil Sherbakov, Elizabeth A. Kulikova,
Daria V. Bazovkina, and Alexander V. Kulikov Biomolecules, 2025, Volume 15, Issue 4
На пути к созданию надёжных линий наивных плюрипотентных клеток человека
№ 69. С. 184–193. doi:
10.17223/19988591/69/21 Шевченко А.И., Арссан А.М., Захарова И.С. Вестник Томского государственного университета. Биология., 2025, № 69. С. 184–193
Влияние вспомогательных репродуктивных технологий на поведение и развитие мозга у мышей с моделью болезни Паркинсона Рожкова ИН, Козенева ВС, Брусенцев ЕЮ, Рахманова ТА, Шавшаева НА, Афанасова СГ, Игонина ТН, Окотруб СВ, Напримеров ВА, Амстиславский СЯ Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2025, Т. 111, No 5, С. 729–743.
Full-term in vivo development of frozen-thawed mammalian diapausing embryos Amstislavsky SYa, Rozhkova IN, Rakhmanova TA, Kozeneva VS, Brusentsev EYu REPROD DOMEST ANIM, 2025, V. 60. e70123.
Созревание неонатальных рефлексов и особенности поведения мышей 5xFAD – модели болезни Альцгеймера Рожкова ИН, Брусенцев ЕЮ, Рахманова ТА, Козенева ВС, Хоцкин НВ, Амстиславский СЯ Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2025
2024
Comparative liver transcriptome analysis in hamsters infected with food-borne trematodes Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini, or Clonorchis sinensis Ekaterina A Lishai, Oxana G Zaparina, Yaroslav K Kapushchak, Banchob Sripa, Sun-Jong Hong, Guofeng Cheng, Maria Y Pakharukova PLOS NEGLECT TROP D, 2024, 18(12):e0012685.
Species-specific renal and liver responses during infection with food-borne trematodes Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini, or Clonorchis sinensis О.Г. Запарина, Я.К. Капущак, Е.А. Лишай, S-J Hong, B.Sripa, М.Ю. Пахарукова PloS One, 2024, 19(12):e0311481
Влияние стеариновой кислоты на эффективность криоконсервации эмбрионов домашней кошки (Felis silvestris catus) Брусенцев Е.Ю., Окотруб С.В., Лебедева Д.А., Окотруб К.А., Рахманова Т.А., Амстиславский С.Я. Известия РАН. Серия биологическая, 2024, № 1, с. 76–89.
Effects of stearic acid on the embryo cryopreservation in the mouse Igonina TN, Rakhmanova TA, Omelchenko AN, Okotrub KA, Brusentsev EYu, Rozhkova IN, Amstislavsky SYa CRYOLETTERS, 2024, V. 45. № 1. P. 28-35.
Program freezing of diapausing embryos in the mouse Amstislavsky S.Ya., Okotrub S.V., Rozhkova I.N., Rakhmanova T.A., Igonina T.N., Brusentsev E.Yu., Kozeneva V.S., Lebedeva D.A., Omelchenko A.N., Okotrub K.A. THERIOGENOLOGY, 2024, 217, 1–10.
Effect of cryopreservation on Odc1 and RhoA genes expression in diapausing mouse blastocysts Amstislavsky S., Brusentsev E., Lebedeva D., Rozhkova I., Rakhmanova T., Okotrub S., Kozeneva V., Igonina T., Babochkina T. REPROD DOMEST ANIM, 2024, V. 59. e14576.
Experimental approaches to controlled diapause in mammals Brusentsev E.Yu., Rakhmanova T.A., Rozhkova I.N., Okotrub S.V., Kozeneva V.S., Amstislavsky S.Ya. RUSS J ECOL+, 2024, Vol. 55, No. 4, pp. 308–318.
Probing metabolism in mouse embryos using Raman spectroscopy and deuterium tags A.N. Omelchenko, K.A. Okotrub, T.N. Igonina, T.A. Rakhmanova, S.V. Okotrub, I.N. Rozhkova, V.S. Kozeneva, S.Ya. Amstislavsky, N.V. Surovtsev SPECTROCHIM ACTA A, 2024
Catching the Big Fish in Big Data: A Meta-Analysis of Zebrafish Kidney scRNA-Seq Datasets Highlights Conserved Molecular Profiles of Macrophages and Neutrophils in Vertebrates Aleksandr V Bobrovskikh, Ulyana S Zubairova, Ludmila G Naumenko, Alexey V Doroshkov Biology, 2024, 13(10):773
Genotype imputation in human genomic studies Berdnikova AA, Zorkoltseva IV, Tsepilov YA, Elgaeva EE Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, 28(6):628-639
Image-Based Quantitative Analysis of Epidermal Morphology in Wild Potato Leaves Zubairova U.S., Fomin I.N., Koloshina K.A., Barchuk A.I., Erst T.V., Chalaya N.A., Gerasimova S.V., Doroshkov A.V. Plants, 2024
Изменения в черной субстанции головного мозга у мышей, моделирующих болезнь Паркинсона Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Брусенцев Е.Ю., Рахманова Т.А., Лебедева Д.А., Козенева В.С., Шавшаева Н.А., Хоцкин Н.В., Амстиславский С.Я. Vavilov journal of genetics and breeding, 2024, 28(7):744-751.
Репродуктивные технологии и болезнь Паркинсона: экспериментальное исследование черной субстанции мозга и моторных функций на мышах C57BL/6 и B6.Cg-Tg Козенева В.С., Рожкова И.Н., Брусенцев Е.Ю., Рахманова Т.А., Шавшаева Н.А., Афанасова С.Г., Лебедева Д.А., Окотруб С.В., Игонина Т.Н., Амстиславский С.Я. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2024, Т. 110. №11.
Разнообразие митохондриальной ДНК на средневековом могильнике Заречно-Убинское-1 в Барабинской лесостепи (предварительные результаты исследования) Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Нестерова М.С., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2024, Т. XXX. – С. 808–816.
Первые данные о разнообразии митохондриальной ДНК у населения басандайской культуры (по материалам могильников Ташара-Карьер-2, Ташара-1, Ташара-14) Томилин М.А., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Нестерова М.С., Новиков А.В., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2024, Т. XXX. – С. 801–807.
Этногенетические реконструкции методами палеогенети-ки: история, современное состояние и перспективы. Опыт Новосибирского научного центра Пилипенко А.С. Антропологии, 2024, N. 2. – С. 28-43
The association of lumbar intervertebral disc degeneration with low back pain is modified by underlying genetic propensity to pain Suri P, Naeini MK, Heagerty PJ, Freidin MB, Smith IG, Elgaeva EE, Compte R, Tsepilov YA, Williams FMK SPINE J, 2024
A Mendelian randomization study finds no evidence for causal effects of C-reactive protein (CRP) on chronic pain conditions Suri P, Tsepilov YA, Elgaeva EE, Williams FMK, Freidin MB, Stanaway IB PAIN MED, 2024
Embryonic Diapause in Mammals: Current State of the Problem Amstislavsky S.Ya., Okotrub S.V., Brusentsev E.Yu., Rakhmanova T.A., Koseneva V.S., Babochkina T.I., Rozhkova I.N. RUSS J DEV BIOL+, 2024, Vol. 55, No. 5, pp. 261–283.
2023
Alterations in the Level of mRNA of TPH1, TPH2 Genes, Tryptophan Hydroxylase Activity and Serotonin Metabolism in Mouse Brain Five Days after Lipopolysaccharide Administration D. V. Sherbakov, A. B. Arefieva, P. D. Komleva, A. E. Iz’urov, N. V. Khotskin,
D. V. Bazovkina, and A. V. Kulikov Molecular Biology, 2023, Volume 57, pages 284–290, (2023)
Эффекты вспомогательных репродуктивных технологий на социальное поведение мышей линии BTBR – модели расстройств аутистического спектра Рожкова И.Н., Окотруб С.В., Брусенцев Е.Ю., Игонина Т.Н., Рахманова Т.А., Лебедева Д.А., Яцук Т.А., Козенева В.С., Напримеров В.А., Амстиславский С.Я. Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2023, Т. 109. № 3. С. 315–333.
Effects of forskolin on cryopreservation and embryo development in the domestic cat Rakhmanova TA, Mokrousova VI, Okotrub SV, Kizilova EA, Brusentsev EYu, Amstislavsky SYa THERIOGENOLOGY, 2023, V. 210, P. 192–198.
Multi-Trait Exome-Wide Association Study of Back Pain-Related Phenotypes Zorkoltseva IV
Elgaeva EE
Belonogova NM
Kirichenko AV
Svishcheva GR
Freidin MB
Williams FMK
Suri P
Tsepilov YA
Axenovich TI Genes, 2023, 14(10):1962
Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei Aleksandr V. Bobrovskikh, Ulyana S. Zubairova, Alexey V. Doroshkov Biology, 2023, 12(12),1516
Профиль экспрессии генов, связанных с регуляцией стресса, поведения и нейрогенеза, вдоль дорзовентральной оси в гиппокампе у взрослых ручных и агрессивных лисиц Ю. В. Александрович, Е. В. Антонов, С. Г. Шихевич, А. В. Харламова, Л. В. Мейстер, Ю. В. Маковка, Д. В. Шепелева, Р. Г. Гулевич, Ю. Э. Гербек Vavilov journal of genetics and breeding, 2023, т.27, № 6, 651-661
Реконструкция и анализ регуляторной генной сети функционирования клеточной стенки листьев Arabidopsis thaliana L. при ответе на водный дефицит A.R. Volyanskaya, E.A. Antropova, U.S. Zubairova, P.S. Demenkov, A.S. Venzel, Y.L. Orlov, A.A. Makarova,
T.V. Ivanisenko, T.A. Gorshkova, A.R. Aglyamova, N.A. Kolchanov, M. Chen, V.A. Ivanisenko Vavilov journal of genetics and breeding, 2023
Repurposing Antihypertensive and Statin Medications for Spinal Pain: A Mendelian Randomization Study Suri P, Elgaeva EE, Williams FMK, Freidin MB, Verzun DA, Tsepilov YA SPINE, 2023
Development and Replication of a Genome-Wide Polygenic Risk Score for Chronic Back Pain Tsepilov YA, Elgaeva EE, Nostaeva AV, Compte R, Kuznetsov I, Karssen LC, Freidin MB, Suri P, Williams FMK, Aulchenko YS J. Pers. Med, 2023
Bidirectional Mendelian Randomization Study of Personality Traits Reveals a Positive Feedback Loop Between Neuroticism and Back Pain Elgaeva EE, Williams FMK, Zaytseva OO, Freidin MB, Aulchenko YS, Suri P, Tsepilov YA J PAIN, 2023
Evidence of causal effects of blood pressure on back pain and back pain on type II diabetes provided by a bidirectional Mendelian randomization study Suri P, Elgaeva EE, Williams FMK, Freidin MB, Zaytseva OO, Aulchenko YS, Tsepilov YA SPINE J, 2023
Изменения уровня мРНК генов Tph1, Tph2, активности триптофангидроксилазы и метаболизма серотонина в мозге мышей через 5 суток после введения липополисахарида Д. В. Щербаков, А. Б. Арефьева, П. Д. Комлева, А. Е. Изъюров, Н. В. Хоцкин , Д. В. Базовкина, А. В. Куликов Молекулярная биология, 2023, T. 57. № 2, стр. 299-306
Реконструкция генетической истории населения Западной Сибири: палеогенетический анализ средневековых антропологических материалов Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Томилин М.А., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Молодин В.И., Нестерова М.С., Журавлев А.А., Рыкун М.П. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2023, Т.29. - С. 806-812.
Мультидисциплинарные исследования могильника Вахрушево-1 в Новосибирском Приобье (археология, антропология, палеогенетика) Молодин В.И., Кобелева Л.С., Поздняков Д.В., Дураков И.А., Трапезов Р.О., Пилипенко А.С., Черданцев С.В. Уральский исторический вестник, 2023, N. 4(81). - С. 164-176.
Погребение "жрицы" из Филипповки: опыт комплексного исследования Аникеева О.В., Балабанова М.А., Клепиков В.М., Пилипенко А.С. Stratum plus, 2023, N. 3. - С. 341-367.
Современное состояние этногенетических реконструкций популяций эпохи бронзы Юго-Западной Сибири (некоторые итоги и перспективы) Молодин В.И., Пилипенко А.С., Поздняков Д.В. Российская археология, 2023, N.1 - C.41-52
2022
Transcriptomic Data Meta-Analysis Sheds Light on High Light Response in Arabidopsis thaliana L. Бобровских Александр Владимирович
Зубаирова Ульяна Станиславовна
Бондарь Евгения Ивановна
Лавреха Виктория Вадимовна
Дорошков Алексей Владимирович INT J MOL SCI, 2022, 23(8), 4455
Changes in Glial Support of the Hippocampus during the Development of an Alzheimer’s Disease-Like Pathology and Their Correction by Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1 Ekaterina A. Rudnitskaya, Alena O. Burnyasheva, Tatiana A. Kozlova, Daniil A. Peunov , Nataliya G. Kolosova, Natalia A. Stefanova. INT J MOL SCI, 2022, 23, 1134.
Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus Ulyana S. Zubairova, Aleksandra Yu. Kravtsova, Alexander V. Romashchenko, Anastasiia A. Pushkareva, Alexey V. Doroshkov Plants, 2022, https://www.mdpi.com/2223-7747/11/12/1533/htm
A protocol for recruiting and analyzing the disease-oriented Russian disc degeneration study (RuDDS) biobank for functional omics studies of lumbar disc degeneration Olga N. Leonova, Elizaveta E. Elgaeva, Tatiana S. Golubeva, Alexey V. Peleganchuk, Aleksandr V. Krutko, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov PloS One, 2022
Mlig-SKP1 gene is required for spermatogenesis in the flatworm Macrostomum lignano Biryukov M., Dmitrieva A., Vavilova V., Ustyantsev K., Bazarova E., Sukhikh I., Berezikov E., Blinov A. INT J MOL SCI, 2022, 23(23), 15110
Исследование миграционных процессов в Евразии методами палеогенетики Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В. Археология, этнография и антропология Евразии, 2022, Т. 50. - № 2. - С. 140-149
Планиграфические особенности распределения вариантов митохондриальной ДНК в комплексах андроновского времени могильника Тартас-1 (предварительные результаты) Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пристяжнюк М.С., Пилипенко И.В., Поздняков Д.В., Кобелева Л.С., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Археология, этнография и антропология Евразии, 2022, Т. 50. № 4. С. 137-144
Разнообразие вариантов митохондриальной ДНК у носителей окуневской культуры из могильника Сыда V (Минусинская котловина) Пилипенко И.В., Пристяжнюк М.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Вестник НГУ. Серия: История, филология, 2022, Т. 21. - № 7. - С. 53-71
Разнообразие вариантов мтДНК и Y-хромосомы в генофонде носителей староалейской культуры (могильник Фирсово-XIV) Черданцев С.В., Трапезов Р.О., Томилин М.А., Пилипенко И.В., Папин Д.В., Федорук А.С., Тур С.С., Пилипенко А.С. Теория и практика археологических исследований, 2022, Т. 34 - № 1. - С. 125-145
Первые результаты палеогенетического исследования носителей андроновской (федоровской) культуры из могильников Чекановский лог-2, 10 Трапезов Р.О., Пилипенко А.С., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пилипенко И.В., Журавлев А.А., Пристяжнюк М.С., Демин М.А., Савко И.А., Папин Д.В. Народы и религии Евразии, 2022, Т. 27. - С. 690-695
Mendelian randomization analysis of plasma levels of CD209 and MICB proteins and the risk of varicose veins of lower extremities Alexandra S Shadrina, Elizaveta E Elgaeva, Ian B Stanaway, Gail P Jarvik, Bahram Namjou, Wei-Qi Wei, Joe Glessner, Hakon Hakonarson, Pradeep Suri, Yakov A Tsepilov PloS One, 2022
Расширение ареала вьюна Никольского Misgurnus nikolskyi (Cobitidae) на юге Западной Сибири Интересова ЕА, Романов ВИ, Давлетшина ГИ, Федорова ВС, Трифонов ВА Российский Журнал Биологических Инвазий, 2022, 15(2): 38-42
The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with fluorescence in situ localization of major repetitive DNAs Romanenko SA, Prokopov DY, Proskuryakova AA, Davletshina GI, Tupikin AE, Kasai F, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA INT J MOL SCI, 2022, 23(21): 13063
Identification of Iguania ancestral syntenic blocks and putative sex chromosomes in the veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Chamaeleonidae, Iguania) Tishakova KV, Prokopov DY, Davletshina GI, Rumyantsev AV, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Giovannotti M, Lisachov AP, Trifonov VA INT J MOL SCI, 2022, 23(24): 15838
New data on small lampreys of the genus Lethenteron (Petromyzontidae) of the Tom river, a typical habitat of the Siberian brook lamprey Lethenteron kessleri Interesova EA, Babkina IB, Romanov VI, Pozdnyak IV, Davletshina GI, Trifonov VA Journal of Ichthyology, 2022, 62(7): 1230-1236
2021
Amplified Fragments of an Autosome-Borne Gene Constitute a Significant Component of the W Sex Chromosome of Eremias velox (Reptilia, Lacertidae). Lisachov Artem
Andreyushkova Daria
Davletshina Guzel
Prokopov Dmitry
Romanenko Svetlana
Galkina Svetlana
Saifitdinova Alsu
Simonov Evgeniy
Borodin Pavel
Trifonov Vladimir Genes, 2021, 12(5), 779
Comparative transcriptome profiling of a resistant vs susceptible bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivar in response to water deficit and cold stress Dmitrii K. Konstantinov, Ulyana S. Zubairova, Anton A. Ermakov, Alexey V. Doroshkov PeerJ, 2021, PeerJ 9:e11428
Regulatory SNPs: Altered Transcription Factor Binding Sites Implicated in Complex Traits and Diseases. Degtyareva, A.O.;
Antontseva, E.V.; Merkulova, T.I. INT J MOL SCI, 2021, 22, 6454.
A computational model of the cereal leaves hydraulics S V Nikolaev, U S Zubairova JPCS, 2021, 2099 (2021) 012039
DARTS: An Algorithm for
Domain-Associated Retrotransposon Search in Genome Assemblies Mikhail Biryukov, Kirill Ustyantsev Genes, 2021
Эксперимент по доместикации лисиц и эволюция собак с позиции современных молекулярно-генетических и археологических данных Трут Л.Н., Харламова А.В., Пилипенко А.С., Гербек Ю.Э. Генетика, 2021, Т. 57. – №. 7. – С. 767-785
Генетический состав носителей тагарской культуры: современное состояние и перспективы исследований Черданцев С.В., Трапезов Р.О., Пристяжнюк М.С., Томилин М.А., Журавлев А.А., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2021, Т. XXVII. - С. 723-729
Новый этап палеогенетического исследования носителей одиновской культуры (Барабинская лесостепь): первые результаты Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Пристяжнюк М.С., Пилипенко И.В., Нестерова М.С., Поздняков Д.В., Молодин В.И., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2021, Т. XXVII. - С. 690-695.
2020
Candidate genes for age at menarche are associated with endometriosis Irina Ponomarenko, Evgeny Reshetnikov, Alexey Polonikov, Irina Verzilina, Inna Sorokina, Elizaveta E Elgaeva, Yakov A Tsepilov, Anna Yermachenko, Volodymyr Dvornyk, Mikhail Churnosov REPROD BIOMED ONLINE, 2020
Полиморфизм rs2072580 T>A в перекрывающихся промоторных областях генов SART3 и ISCU, связанный с риском развития рака молочной железы А.О.Дегтярева, Е.Ю.Леберфарб, Е.Г.Ефимова, И.И.Брусенцов, А.В.Усова, Е.Л.Лушникова, Т.И.Меркулова Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2020, Т.169, № 1, с.88-91
Classification of LTR retrotransposons in the flatworm Macrostomum lignano M. Biryukov, E. Berezikov, K. Ustyantsev Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции, 2020, 6(2), 54-59
ОСОБЕННОСТИ ГЕНОФОНДА
ТУВИНСКОГО ЭТНОСА НА ОСНОВЕ
ИЗУЧЕНИЯ АНТИГЕНОВ ГРУПП КРОВИ
В СРАВНИТЕЛЬНОМ АСПЕКТЕ Л.Э. Табиханова, Л.П. Осипова, С.С.Ковалёв, У.Н. Кавай-оол, А.Н. Сарыглар, Т.В. Чуркина, М.Р. Хантемирова Якутский медицинский журнал, 2020, №2, с.84-87
FEATURES OF THE GENE POOL
OF THE TUVINIAN ETHNOS BASED
ON THE STUDY OF BLOOD GROUP ANTIGENS IN COMPARATIVE PERSPECTIVE L.E. Tabikhanova, L.P. Osipova, S.S. Kovalev, U.N. Kavai-ool,
A.N. Sariglar, T.V. Churkina, M.R. Khantemirova Якутский медицинский журнал, 2020, №2, с.84-87
Green revolution ‘stumbles’ in a dry environment: Dwarf wheat with Rht genes fails to produce higher grain yield than taller plants under drought S. Jatayev, I. Sukhikh, V. Vavilova, S. E. Smolenskaya, N. P. Goncharov, A. Kurishbayev, L. Zotova, A. Absattarova, D. Serikbay, Y.‐G. Hu, N. Borisjuk, N. K. Gupta, B. Jacobs, S. de Groot, F. Koekemoer, B. Alharthi, K. Lethola, D. T. Cu, C. Schramm, P. Anderson, C. L. D. Jenkins, K. L. Soole, Y. Shavrukov, P. Langridge PLANT CELL ENVIRON, 2020, Vol. 43. P. 2355–2364.
Replication of 15 loci involved in human plasma protein N-glycosylation in 4,802 samples from four cohorts Sharapov SZ, Shadrina AS, Tsepilov YA, Elgaeva EE, Tiys ES, Feoktistova SG, Zaytseva OO, Vuckovic F, Cuadrat R, Jäger S, Wittenbecher C, Karssen LC, Timofeeva M, Tillin T, Trbojević-Akmačić I, Štambuk T, Rudman N, Krištić J, Šimunović J, Momčilović A, Vilaj M, Jurić J, Slana A, Gudelj I, Klarić T, Puljak L, Skelin A, Kadić AJ, Van Zundert J, Chaturvedi N, Campbell H, Dunlop M, Farrington SM, Doherty M, Dagostino C, Gieger C, Allegri M, Williams F, Schulze MB, Lauc G, Aulchenko YS. GLYCOBIOLOGY, 2020, cwaa053
Analysis of genetically independent phenotypes identifies shared genetic factors associated with chronic musculoskeletal pain conditions Tsepilov Y. A., Freidin M. B., Shadrina A. S., Sharapov S. Z., Elgaeva E. E., van Zundert J., Karssen L. С., Suri P., Williams F. M. K., Aulchenko Y. S. Commun. biolog., 2020, 3, Article number: 329
Два мужских погребения из кургана саргатской культуры: биоархеологический и палеогенетический обзор Шарапова С.В., Пилипенко А.С., Ражев Д.И., Трапезов Р.О., Черданцев С. В. Stratum plus, 2020, №3, стр. 353-378
Two Male Burials from the Sargat Culture Kurgan: Bio-archaeological and Paleogenetic Review Sharapova S.V., Pilipenko A.S., Razhev D.I., Trapezov R.O., Cherdantsev S.V. Stratum plus, 2020, № 3, Pp. 353-378
Исследование генетического состава носителей староалейской культуры: постановка проблемы и первые результаты анализа вариабельности мтДНК Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Тур С.С., Федорук А.С., Фролов Я.В., Папин Д.В. Теория и практика археологических исследований, 2020, Т. 32, С. 111-134
Погребальный памятник афанасьевской культуры Бертек-33 на плато Укок (Горный Алтай): результаты палеогенетического исследования Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Журавлев А.А., Пристяжнюк М.С., Молодин В.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2020, Т. 48, № 4
К вопросу о генетическом составе сарматского населения Нижнего Поволжья (данные палеогенетики) Пилипенко А. С., Черданцев С. В., Трапезов Р. О., Томилин М. А., Балабанова М. А., Пристяжнюк М. С., Журавлев А. А. Вестник ВГУ. Серия 4., 2020, Т. 25, № 4, С. 17–50
Генетический состав домашних животных, как маркер миграций человека Пилипенко А.С., Пилипенко И.В., Черданцев С.В., Трапезов Р.О. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2020, Т.XXVI, С. 571-578
Новые данные о генетическом составе андроновского населения юга Сибири (Верхнее Приобье и Кулунда) Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Томилин М.А., Папин Д.В., Пилипенко А.С. Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий, 2020, Т.XXVI, С. 671-677
Антиоксиданты разного механизма действия снижают неоплазию эпителия желчных протоков при экспериментальном описторхозе Запарина О.Г., Ковнер А.В. Гены и клетки, 2020
Genomics and proteomics of the liver fluke Opisthorchis felineus Mordvinov V.A., Ershov N.I., Zaparina O.G., Pakharukova M.Y. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020
Нейрогенез в зрелом головном мозге: изменения при старении и развитии болезни Альцгеймера Бурняшева А.О., Стефанова Н.А., Рудницкая Е.А. Успехи геронтологии, 2020
Внеклеточные везикулы возбудителя описторхоза трематоды Opisthorchis felineus увеличивают скорость миграции и пролиферации холангиоцитов человека H69 Д.В. Пономарев, Е.С. Савина, О.Г. Запарина Гены и клетки, 2020
rs2072580T>A Polymorphism in the Overlapping Promoter Regions of the SART3 and ISCU Genes Associated with the Risk of Breast Cancer Degtyareva AO, Leberfarb EY, Efimova EG, Brusentsov II, Usova AV, Lushnikova EL, Merkulova TI B EXP BIOL MED+, 2020
2019
The role of long non-coding RNAs in the pathogenesis of hereditary diseases. Sparber P., Filatova A., Khantemirova M., Skoblov M. BMC MED GENOMICS, 2019
Unique mutational spectrum of the GJB2 gene and its pathogenic contribution to deafness in Tuvinians (Southern Siberia, Russia): a high prevalence of rare variant c.516G>C (p.Trp172Cys). Posukh O.L., Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Bondar A.A., Morozov I.V., Maximov V.N., Voevoda M.I. Genes, 2019, Jun 5;10(6). pii: E429
The Evaluation of Genetic Relationships within Acridid Grasshoppers (Orthoptera, Caelifera, Acrididae) on the Subfamily Level Using Molecular Markers Sukhikh I., Ustyantsev K., Bugrov A., Sergeev M., Fet V., Blinov A. FOLIA BIOL-KRAKOW, 2019, 67(3):119-126
Diversity of mariner-like elements in Orthoptera K. Ustyantsev, M. Biryukov, I. Sukhikh, N.V. Shatskaya, V. Fet, A. Blinov, I. Konopatskaia Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(8):1059-1066
Examining causal effects of body mass index on back pain: a Mendelian randomization study Elizaveta E. Elgaeva, Yakov Tsepilov, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Yurii Aulchenko, Pradeep Suri EUR SPINE J, 2019
2018
An Unusual Burial of a Xiongnu-Sarmatian Era Warrior in the Western Siberian Forest-Steppe: Results of a Paleogenetic Analysis Pilipenko A.S., Cherdantsev S.V., Trapezov R.O., Pozdnyakov D.V., Chikisheva T.A., Molodin V.I. Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2018, Vol. 46, N. 4, P. 123-131.
Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak Archaeological and Anthropological Sciences, 2018, Vol. 10, Issue 7, P. 1557-1570.
Maternal genetic features of the Iron Age Tagar population from Southern Siberia (1st millennium BC) Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Stepan V. Cherdantsev, Vladimir N. Babenko, Marina S. Nesterova, Dmitri V. Pozdnyakov, Vyacheslav I. Molodin, Natalia V. Polosmak PloS One, 2018, 13(9): e0204062
2017
Ancestry and demography and descendants of Iron Age nomads of the Eurasian Steppe Martina Unterländer, Friso Palstra, Iosif Lazaridis, Aleksandr Pilipenko, Zuzana Hofmanová, Melanie Groß, Christian Sell, Jens Blöcher, Karola Kirsanow, Nadin Rohland, Benjamin Rieger, Elke Kaiser, Wolfram Schier, Dimitri Pozdniakov, Aleksandr Khokhlov, Myriam Georges, Sandra Wilde, Adam Powell, Evelyne Heyer, Mathias Currat, David Reich, Zainolla Samashev, Hermann Parzinger, Vyacheslav I. Molodin, and Joachim Burger NAT COMMUN, 2017
Палеогенетическое исследование родства погребенных из курганов саргатской культуры в Барабинской лесостепи (Западная Сибирь) А.С. Пилипенко, С.В. Черданцев, Р.О. Трапезов, В.И. Молодин, Л.С. Кобелева, Д.В. Поздняков, Н.В. Полосьмак Археология, этнография и антропология Евразии, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016
Stress and hypertensive disease: adrenals as a link. Experimental study on hypertensive ISIAH rat strain Yegor V. Antonov, Yuriy V. Alexandrovich, Olga E. Redina, Michael A. Gilinsky & Arcady L. Markel Clinical and Experimental Hypertension, 2016, Volume 38, Issue 5, 415-423
Molecular determinants of the adrenal gland functioning related to stress-sensitive hypertension in ISIAH rats Larisa A. Fedoseeva, Leonid O. Klimov, Nikita I. Ershov, Yury V. Alexandrovich, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel, Olga E. Redina BMC GENOMICS, 2016, 2016, 17(Suppl 14):989
Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56 (II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия) А.С. Пилипенко, В.И. Молодин, Р.О. Трапезов, С.В. Черданцев, А.А. Журавлев Археология, этнография и антропология Евразии, 2016, Том 44, № 4, С. 141-149
Полиморфизм регуляторной области гена LCT в некоторых тюркоязычных популяциях Алтае-Саянского региона. И.В. Пилипенко, М.С. Пристяжнюк, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода, А.С. Пилипенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):887-893
2015
MtDNA Haplogroup A10 Lineages in Bronze Age Samples Suggest That Ancient Autochthonous Human Groups Contributed to the Specificity of the Indigenous West Siberian Population Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vyacheslav I. Molodin, Aida G. Romaschenko PloS One, 2015
Mitochondrial DNA diversity in the gene pool of the Neolithic and Early Bronze Age Cisbaikalian human population R. O. Trapezov, A. S. Pilipenko, V. I. Molodin Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, January 2015, Volume 5, Issue 1, pp 26-32
Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребения 1 кургана 1 могильника Ак-Алаха-3 А.С. Пилипенко, Р.О. Трапезов, Н.В. Полосьмак Археология, этнография и антропология Евразии, 2015, Том 43 № 2, стр. 138-145
Палеогенетическое исследование носителей пазырыкской культуры из могильника Ак-Алаха-1 (Горный Алтай) Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Полосьмак Н.В. Археология, этнография и антропология Евразии, 2015, Том 43, № 4, стр. 144 - 150
Применение сопряжённых уравнений для исследования чувствительности в модели симпластного роста клеток линейного листа А.В. Пененко, У.С. Зубаирова, С.В. Николаев Труды Международной конференции АКТУАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНОЙ И ПРИКЛАДНОЙ МАТЕМАТИКИ – 2015 посвященной 90-летию со дня рождения академика Г. И. Марчука, 2015, С.562-572
A computational model of the effect of symplastic growth on cell mechanics in a linear leaf blade Zubairova U., Golushko S., Penenko A., Nikolaev S. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2015, Vol. 13, No. 1 1540005
2014
Разнообразие линий митохондриальной ДНК в генофонде населения Прибайкалья эпохи неолита и ранней бронзы Трапезов Р.О., Пилипенко А.С., Молодин В.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, 2014 год, том 18, №3, стр. 469-477
2013
Разнообразие микроорганизмов в образцах из археологических комплексов пазырыкской культуры (IV-III вв. до н.э.) Северо-Западной Монголии Ханаева Т.А., Суслова М.Ю., Земская Т.И., Молодин В.И., Пилипенко А.С., Парцингер Г. Микробиология, 2013
Modeling of plant embryo morphodynamics at early developmental stages S. V. Nikolaev, N. A. Kolchanov, S. K. Golushko, J. -C. Palauqui, A. Urban, E. V. Amelina, A. V. Yurchenko, K. S. Golushko, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, A. Trubuil Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2013, May 2013, Volume 3, Issue 3, pp 176-183
Модель регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега Arabidopsis thaliana С. В. Николаев, У. С. Зубаирова, А. В. Пененко, Э. Д. Мелснесс (E. D. Mjolsness), Б. Е. Шапиро (B. E. Shapiro), Н. А. Колчанов Doklady Akademii Nauk, 2013, том 452, № 3, с. 336–338
Model of Structuring the Stem Cell Niche in Shoot Apical Meristem of Arabidopsis thaliana S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, E. D. Mjolsness, B. E. Shapiro, and Academician N. A. Kolchanov Doklady Biological Sciences, 2013, Vol. 452, pp. 316–319
Модели регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега У.С. Зубаирова, С.В. Николаев Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, том 17, № 4/1, с. 738-747
2012
Моделирование роста и развития растительных тканей в формализме L-систем Зубаирова У.С., Пененко А.В., Николаев С.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, том 16, №4/1, С. 816-824
Моделирование морфодинамики на ранних стадиях эмбриогенеза растения Николаев С.В., Колчанов Н.А., Голушко С.К., Палаки Ж.-К., Урбан О., Амелина Е.В., Юрченко А.В., Голушко К.С., Зубаирова У.С., Пененко А.В., Трубюй А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, том 16, №4/1, С. 805-815
Генофонд мтДНК населения восточного варианта пахомовской культуры Молодин В.И., Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2012, № 4 (52). С. 62-69.
Древняя ДНК заговорила Пилипенко А.С. Наука из первых рук, 2012, № 1. С. 38-39.
2011
ASSOCIATION OF COLD RECEPTOR TRPM8 GENE POLYMORPHISM WITH BLOOD LIPID INDICES AND ANTHROPOMETRIC PARAMETERS IN SHORIANS POTAPOVA T.A., YUDIN N.S., PILIPENKO I.V., KOBSEV V.F., ROMASHCHENKO A.G., SHAKHTSHNEIDER E.V., OGARKOV M.Y., VOEVODA M.I B EXP BIOL MED+, 2011, Т. 151, № 2, Р. 223-226
Paleogenetic analysis in archeological studies Pilipenko A.S., Molodin V.I. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, Volume 1, Number 1, 51-72
Митохондриальная ДНК женщины из пещеры Каминная (Горный Алтай) эпохи позднего неолита Пилипенко А.С., Молодин В.И., Ромащенко А.Г. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Том 15, № 4, стр. 633-643
A Study of a One-Dimensional Model of Regulation of the Renewing Zone Size in a Biological Tissue Accounting for Cell Division S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, S. I. Fadeev, E. Mjolsness, N. A. Kolchanov Journal of Applied and Industrial Mathematics, 2011, Vol. 5, No. 4, pp. 1–14.
2010
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учётом деления клеток Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И., Мйолснесс Э., Колчанов Н.А. Сибирский журнал индустриальной математики, 2010, том 13, № 4 (44) С. 70-82
Палеогенетический анализ в археологических исследованиях Пилипенко А.С., Молодин В.И. Информационный вестник ВОГИС, 2010, T. 14. № 2. С. 280-311.
Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
Древняя ДНК и стабильные изотопы – новые ответы на старые вопросы Молодин В.И., Пилипенко А.С. Наука из первых рук, 2010, № 2. С. 72-81.
2009
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ ИЛ-18 И ИЛ-1β У БОЛЬНЫХ РАКОМ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ СИЛКОВ А.Н., ГОРЕВА Е.П., ЖОВМЕР А.С., КИРЕЕВ Ф.Д., МАКСИМОВ В.Н., ПИЛИПЕНКО И.В., МАЛИНОВСКАЯ Е.А., БАБЫШКИНА Н.Н., ЛИТВЯКОВ Н.В., СЕННИКОВ С.В., КОЗЛОВ В.А. Российский иммунологический журнал, 2009
2008
Особенности захоронения младенцев в жилищах городища Чича-1 в Баабинской лесостепи по данным анализа структуры ДНК Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2008, № 2, Т. 34, С. 57-67
Полиморфизм гена холодового рецептора TRPM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока Потапова Т.А., Юдин Н.С., Бабенко В.Н., Пилипенко И.В., В.Ф. Кобзев И.В., Гырголькау Л.А., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2008, №4, Том 12, С. 749-754
Спектр мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в российской популяции М.И. Воевода, И.В. Куликов, Е.В. Шахтшнейдер, В.Н. Максимов, И.В. Пилипенко, И.П. Терещенко, В.Ф. Кобзев, А.Г. Ромащенко, Ю.П. Никитин RUSS J GENET+, 2008, №10, том 44, с. 1374-1378
Взаимосвязь полиморфных вариантов гена-онкосупрессора р53 и хемокинового рецептора CCR5 с риском возникновения рака молочной железы у женщин репродуктивного периода и менопаузы. Е.С. Григорьева, Н.Н. Бабышкина, Е.А. Малиновская, Н.В. Чугунова, М.В. Завьялова, И.В. Пилипенко Сибирский онкологический журнал, 2008
АССОЦИАТИВНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ P53 И C-FMS С РАЗВИТИЕМ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ У РУССКИХ ЖЕНЩИН И.В. Пилипенко, О.В. Горчакова, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода,Н.Н. Бабышкина, Н.В. Чугунова, А.В. Дорошенко, А.Г. Ромащенко Сибирский онкологический журнал, 2008
СУБФРАКЦИОННЫЙ ПРОФИЛЬ ЧАСТИЦ ЛИПОПРОТЕИНОВ НИЗКОЙ ПЛОТНОСТИ И СПЕКТР МУТАЦИЙ ГЕНА LDLR ПРИ ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИИ ШАХТШНЕЙДЕР Е.В., КУЛИКОВ И.В., РАГИНО Ю.И., ПОЛОНСКАЯ Я.В., ПИЛИПЕНКО И.В., ТЕРЕЩЕНКО И.П., КОБЗЕВ В.Ф., РОМАЩЕНКО А.Г., НИКИТИН Ю.П., ВОЕВОДА М.И. Кардиоваскулярная терапия и профилактика, 2008, Т. 7, N 6 S1, P. 411-412
2007
ИССЛЕДОВАНИЕ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ IL-18 И IL-1β У БОЛЬНЫХ РАКОМ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ЖОВМЕР А.С., СИЛКОВ А.Н., ПИСКУНОВ А.А., МАКСИМОВ В.Н., ПИЛИПЕНКО И.В., МАЛИНОВСКАЯ Е.А., СЛОНИМСКАЯ Е.М., ЧЕРДЫНЦЕВ Н.В., СЕННИКОВ С.В., КОЗЛОВ В.А. Омский научный вестник, 2007
